The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
125
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structure length |
125
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Chain Sequence |
SWQTYVDTNLVGTGAVTQAAILGLDGNTWATSAGFAVTPAQGQTLASAFNNADPIRASGFDLAGVHYVTLRADDRSIYGKKGSAGVITVKTSKSILVGVYNEKIQPGTAANVVEKLADYLIGQGF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Three-dimensional solution structure of Acanthamoeba profilin-I.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PROFILIN IA
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| molecule tags |
Actin-binding
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| source organism |
Acanthamoeba sp.
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| total genus |
11
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| structure length |
125
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| sequence length |
125
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1994-01-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3L7H A; 3NUL A; 2E8J A; 3CHW P; 3T1S A; 3T1X A; 1G5U A; 1PNE A; 3MSH A; 1PRQ A; 1SKO B; 4QWO A; 5FDS A; 1FIK A; 1VET B; 1Y4O A; 3L9K A; 3LEQ A; 4ESP A; 2BTF P; 4D60 A; 1A0K A; 2ZL1 B; 3KYE A; 1HLU P; 2HZ5 A; 2B95 A; 1CJF A; 3U4L P; 5EV0 A; 2VK3 A; 2JKG A; 1PFL A; 2ACG A; 4FUW A; 1J3W A; 1FIL A; 1SZV A; 5EM0 A; 3DAV A; 4FTX A; 3UB5 P; 2V8F A; 2PRF A; 3D9Y A; 2V8C A; 3CPT B; 3CPT A; 3T1Q B; 3NEC A; 1ACF A; 4X1M A; 1CQA A; 5FEG A; 2PAV P; 2PBD P; 3T1R A; 1K0K A; 4X1L A; 5FEF A; 4X25 A; 2JKF A; 1AWI A; 1F2K A; 1Z09 A; 5EM1 A; 3T12 B; 3MS6 A; 1VEU B; 1VEU A; 1CF0 A; 1SKO A; 1D1J A; 3LGO A; 1VET A; 5EVE A; 1YPR A; 2ZL1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2V20 A; 3L7H A; 4WLA A; 4NET A; 4PM5 A; 3EGX C; 1UWP X; 3H7W A; 2V2F F; 4OQ0 A; 1ZKJ A; 3T4O A; 1SKO B; 4JKT A; 1NXY A; 2GZA A; 2ZC3 B; 2OLU A; 3NOT C; 5FQM A; 1XXM A; 4HES A; 5CTN A; 2NUT C; 2Y55 A; 5TGF A; 2BAS A; 2L4R A; 1I2S A; 5I5L A; 4OKP A; 2XD1 A; 4F3L A; 5F6A A; 1S0W A; 2IWC A; 2ZLY A; 2X01 A; 5DKL A; 1BSG A; 3MBZ A; 2EX9 A; 3FWL A; 4EWF A; 3AGF A; 4CLC C; 4ZBE A; 3IXH A; 3HLD A; 2XDM A; 4OQG A; 5CER A; 1FCN A; 2V1A A; 4PPR A; 3OC2 A; 1CQA A; 1FOF A; 4EET B; 1Q2Q A; 4OVD A; 4WZ4 A; 4BBT A; 1HTZ A; 5HWW A; 1TDL A; 5AVF A; 3TOI A; 4E3I A; 3MXQ A; 3JYI A; 5F83 A; 3NBL A; 1FSW A; 2WGV A; 1GHI A; 1JNU A; 1LI9 A; 3SS5 A; 2GX5 A; 4P6Z S; 2VV6 A; 2JKR M; 4H6J B; 1ERM A; 3RH8 B; 3MFX A; 1TS8 A; 3NC8 A; 4QJG A; 2WZZ A; 3IWO A; 4K0W A; 2ZQD A; 4JXG A; 4L0L A; 3CJM A; 3WS5 A; 1NJ4 A; 2VKS A; 3KO6 A; 5HWT A; 4Q0I A; 2XFT A; 5HAP A; 2B02 A; 3S4X A; 4MDZ A; 4GS9 B; 5AJG A; 2XD5 A; 2ZBB A; 2ZC5 B; 5E43 A; 3T1X A; 4R70 A; 3VV4 A; 1S1Y A; 5HFO A; 4S2N C; 1YQS A; 1LHY A; 2H10 A; 4MLL A; 3IX4 A; 4NXE A; 5J7E A; 1FQG A; 3N6I A; 1PI5 A; 5E2F A; 4HY8 A; 3ZG7 B; 1NYM A; 1VET B; 4P6B A; 1N9B A; 4GZB A; 2Y2O A; 1DP8 A; 2OOL A; 1W63 M; 3EQU A; 4QPR A; 5DJU A; 4LRY C; 1BUE A; 2EWW A; 3IXG A; 2A49 A; 1KOU A; 2UWX A; 4BBU A; 3MZE A; 3N4I A; 1DRM A; 3BWL A; 5DF8 A; 3BFF A; 4M4X A; 1J3W A; 1FIL A; 3BFD A; 4R23 A; 3FYZ A; 3LIE A; 1OT9 A; 3QP6 A; 4KQQ A; 3C4O A; 5IT5 A; 2V8C A; 5FAS A; 3ZGA B; 3C8C A; 1IKG A; 5FEG A; 4B93 A; 2PAV P; 3UPN A; 1ALQ A; 3I7J A; 5F5Y A; 3P98 A; 2Z2L B; 3IWQ A; 1N9N A; 3MQO A; 4X1L A; 3IX8 A; 3ZDJ A; 2P9V A; 1NY0 A; 3JPU A; 2O0Y A; 1AWI A; 3Q7V A; 1XP4 A; 4XT2 A; 1MZU A; 4HJ6 A; 3E0Y A; 3FPV A; 1VEU B; 3MXR A; 4OPZ A; 3UN7 A; 2BG1 A; 1SKO A; 4B4Z A; 5EVI C; 1BT5 A; 2Z6D A; 4KQR A; 5FAT A; 5FQI A; 3BFG A; 2J9O A; 3KYQ A; 4X56 A; 1OME A; 4MEZ A; 4LCM A; 5DVA A; 4DDS A; 3A0S A; 3UDF A; 3DW0 A; 1PW8 A; 3M6H A; 1XJ2 A; 1K4E A; 2VEA A; 4CQH A; 5CXW A; 1NRF A; 2JN7 A; 1KDW A; 1T18 A; 4HI4 A; 1YLP A; 1E3U D; 4R1G A; 2OSU A; 4Y0U A; 3LEZ A; 4LGW A; 3U4L P; 2OAP 1; 4S2N A; 5DF9 A; 3MKE A; 5GLD A; 1ESU A; 2Y2Q A; 2RCX A; 5KZH A; 2ZC4 B; 5FQ9 A; 3VP0 A; 1YKD A; 1TS6 A; 3M6B A; 5DJT A; 4FUW A; 2EX6 A; 2VGK A; 1VHM A; 1TD5 A; 2PRF A; 4KG5 A; 3UE6 A; 4H6J A; 5KSC A; 4BQM A; 3UO9 A; 3UMD A; 2JBF A; 2W3E A; 3ZHH A; 1IYP A; 4HJ3 A; 2EX8 A; 1XPB A; 2KX6 A; 4JGP A; 2V0U A; 3B42 A; 4DE2 A; 4II7 A; 1K57 C; 1TDG A; 4BL3 A; 1N9O A; 4E3K A; 4KZ5 A; 4RYE A; 4RX2 A; 4EQ1 A; 3RXW A; 1CF0 A; 2HPB A; 1I2W A; 4Y3I A; 4P6Z M; 4M3K A; 1D1J A; 4WMC D; 2XA7 S; 4F94 A; 1FCM A; 1VET A; 3BQ8 A; 3NOU C; 3G6O A; 2Y2L A; 2IA2 A; 2E8J A; 3GTC A; 3V5M A; 5HX9 A; 1L0F A; 1NZU A; 1L3L A; 2XK1 A; 3NOP C; 2W3H A; 1BTL A; 3BFC A; 3K3D A; 4BL2 A; 5EVI A; 1GHP A; 1FIK A; 1K56 D; 3LR0 A; 1PZO A; 1T1A A; 3LEQ A; 2JKT I; 4KQO A; 2GDN A; 2HZ5 A; 4CJN A; 1F5M A; 2NUP C; 2EWV A; 1YSQ A; 2Y91 A; 4E6X A; 1OPX A; 2W1T A; 3VOY A; 3OCL A; 4QY6 A; 1Z6F A; 3IH9 A; 1IOU A; 1SHV A; 1FSY A; 2VGL S; 5DTK A; 2O9A A; 1S1Z A; 4HIA A; 1CK3 A; 4DJ2 A; 1K38 A; 3ZVW A; 1IYO A; 5EPH A; 2J3T D; 2BLS A; 3GSG A; 1BZA A; 1YMX A; 2W1R A; 1IEL A; 1CEF A; 2O9B A; 3IF6 C; 1P97 A; 3SH7 A; 4X25 A; 4MBF A; 2JKF A; 4HBU A; 4IVI A; 3C30 A; 3NIA A; 3O86 A; 4GD6 A; 4EEU A; 1OTD A; 5DKK A; 2Y2K A; 5E2H A; 1G68 A; 2ZC7 A; 1NLY A; 3B33 A; 1ZG4 A; 1EWZ A; 4WBG A; 1MKI A; 5DFX A; 5F69 A; 3UME A; 4IUH A; 5CEB A; 3T4Q A; 3LIC A; 2PBY A; 3D4F A; 1K57 A; 3TJZ C; 3DTE A; 4GDB A; 4KUO A; 1AXB A; 1MWT A; 4I3A A; 1L2S A; 4X68 A; 2CC1 A; 2A3U A; 2HGV A; 1W63 Q; 3IF5 A; 1D06 A; 4P85 A; 4B4X A; 3UE1 A; 2Q9N A; 5GLA A; 3UDI A; 2WGI A; 4K08 A; 4I39 A; 3VP3 A; 2ZD8 A; 2Q9M A; 3N8R A; 1OTE A; 3H82 A; 1PYY A; 3M2K A; 3GQZ A; 1YSP A; 3CMZ A; 4OPQ A; 4BLM A; 3LO7 A; 2PU2 A; 4BEN A; 3D72 A; 4E3N A; 4GB7 A; 1H3Q A; 3LI9 A; 2Y2G A; 3DTK A; 2ZOI A; 4E3O A; 1MY8 A; 4O01 A; 4OPY A; 1QMF A; 1GHM A; 1ONH A; 4C75 A; 2XR0 A; 2YKF A; 3KSF A; 4ZJ2 A; 2B18 A; 2KOI A; 1T19 A; 3CPT A; 5EOE A; 3VFH A; 1CI9 A; 3SS3 A; 2P7J A; 4DJ3 A; 2J8Y A; 4GHI A; 2P08 A; 1ACF A; 2I72 A; 4I3I A; 2PBD P; 4QY5 A; 1STZ A; 1T1C A; 1ODV A; 4DXC A; 2XLN A; 4FSF A; 4OOM A; 2PD7 A; 1DJA A; 5CRF A; 4PHT A; 1XJ3 A; 3Q82 A; 2E8I A; 5KMW A; 3UY6 A; 1DJB A; 2ZMA A; 1EI5 A; 4FH4 A; 5AQ9 A; 2XA7 M; 3NUL A; 5EFW A; 3HJI A; 4S2L A; 4HH3 A; 3EEH A; 3VP1 A; 4OPR A; 2P04 A; 2Y8H A; 3RXX A; 1CI8 A; 2VJW A; 3LIA A; 3U2A A; 3R7W B; 2JKR I; 4QWO A; 5M18 A; 5DTS A; 1KVM A; 4JPM A; 3L9K A; 2BTF P; 3QP4 A; 1EW0 A; 1C3B A; 5CHM A; 3E4Q A; 4ZDX A; 3BFE A; 4UA6 A; 3O88 A; 1PFL A; 2G2W A; 3DWK A; 5FSR A; 2B5R A; 2Z2M B; 1L0D A; 4NG2 A; 1V9Y A; 2DMW A; 4ZRR A; 3DAV A; 3O5Y A; 5I94 A; 2VGL M; 4JBF A; 2WKH A; 4DRT A; 3TSG A; 4HNB A; 3TW8 A; 3KYZ A; 1JVJ A; 3C5A A; 4QU3 A; 4Y5F A; 3E2L A; 1K0K A; 3IH8 A; 1UWN X; 4HP4 A; 1ERQ A; 1IEM A; 5FEF A; 2Y2H A; 4S2K A; 3LIF A; 4WEJ A; 1F2K A; 1KGE A; 4U0T A; 5FAP A; 3PBS A; 1PW1 A; 1J9M A; 5FAQ A; 1K6R A; 4MNR A; 5F82 A; 4ZTK A; 1H0M A; 3HLB A; 2WKP A; 3BLS A; 1WYC A; 2R9X A; 4I38 A; 2C6W B; 4EES A; 2I9V A; 3HL9 A; 4KZA A; 1YLT A; 1H8Z A; 3WS2 A; 1W8Y A; 5FQQ A; 4X69 A; 5FI2 A; 4X55 A; 5U47 A; 1XFQ A; 4YIN A; 1PNE A; 2PU4 A; 5G18 A; 2Y79 A; 4GOG A; 3QP5 A; 1RP5 A; 2O9C A; 4GCZ A; 4ESP A; 5GLB A; 4MCW A; 2B95 A; 4KZ9 A; 5EE8 A; 1S4R A; 4O8G A; 5FQK A; 2VGJ A; 1XA1 A; 1L0G A; 1O07 A; 4IVK A; 1K6S A; 1OTI A; 2XGN A; 4KZ8 A; 1MKM A; 5A92 A; 1DP9 A; 1SZV A; 4R4R A; 5EM0 A; 5FAO A; 4R38 A; 2J3T C; 2C5W B; 2V8F A; 4ETZ A; 3QNC A; 5CX7 A; 4HHD A; 5A93 A; 4O0P A; 1XGJ A; 4X1M A; 4I5S A; 1H8M A; 1CEG A; 1BLH A; 1BLS A; 2A24 B; 4MBK A; 3IXB A; 3C7V A; 2V0W A; 3LI8 A; 3IXD A; 4LFU A; 1MWU A; 4DDY A; 4N92 A; 4NKP A; 2O99 A; 3IQA A; 4OH0 A; 2QJ7 A; 2ZQ9 A; 3P01 A; 4UA7 A; 3NY4 A; 3DTM A; 3H9W A; 4K0X A; 2HF6 A; 2Y2P A; 3GMW A; 3MXS A; 2VA0 A; 4KUK A; 1ES5 A; 4EXO A; 1DP6 A; 3S7O A; 3UE0 A; 3T1S A; 1ZTU A; 3EEA A; 4QD4 A; 3MQQ A; 2OWH A; 1ERO A; 2QYB A; 3V39 A; 4WMC A; 4GD8 A; 1DY6 A; 2XF3 A; 1MC0 A; 1FR1 A; 1H5X A; 3KSI A; 3ZNY A; 1N4O A; 2HDR A; 3ZYT A; 4JGO A; 5IS1 A; 3MKF A; 1XGI A; 1NWZ A; 3CUE A; 4E3M A; 1ES2 A; 2EX2 A; 1FR6 A; 2Y2N A; 1PZP A; 5D3O A; 5FI7 A; 1RGZ A; 2IWD A; 4EQI A; 3MMH A; 3PBT A; 3PR6 A; 1K56 A; 4ID4 A; 3LCE A; 3ZVT A; 2JKG A; 3OPP A; 3ZG9 B; 3VP4 A; 3WRZ A; 2UV0 E; 2R9W A; 1LT0 A; 3CAX A; 4G3K A; 3NEC A; 3HJK A; 3MFD A; 4RVA A; 3S1Y A; 4EW7 A; 3UDX A; 1O7E A; 4JF4 A; 3T4T A; 4ZAM A; 1YLW A; 5HDC A; 2IWB A; 3IHA A; 2K2N A; 2PR6 A; 4WZ5 C; 1M6K A; 4XUX A; 4R3J A; 3S7N A; 5JYP A; 2KLI A; 4HEF A; 5TBM B; 2J80 A; 4RX3 A; 3MF0 A; 1IYQ A; 3FPW A; 4Y17 A; 3EQV A; 2D01 A; 1H8Y A; 2KDK A; 1KGF A; 4MN5 A; 3PHY A; 4YFM A; 2ZJ9 A; 3JVU A; 5TFQ A; 3BM6 A; 5EOO A; 3TRC A; 3QP8 A; 4IJG A; 4WEL A; 5AVE A; 4LV2 A; 2OAQ 1; 3OLO A; 1YLZ A; 3VP2 A; 4GS9 A; 2R78 A; 5G4Y A; 4LCL A; 2PHY A; 4BD0 A; 1LSW A; 5HAR A; 2ZC6 B; 2HP5 A; 1K54 A; 3ZCZ A; 4EBL A; 4GJ4 A; 4I3J A; 5EEC A; 5CHU A; 1SDN A; 3G32 A; 5GL9 A; 5KIZ A; 2PD8 A; 4CLC D; 3GVB A; 1M40 A; 4QB8 A; 2G2U A; 5E2G A; 5MC7 A; 3GRJ A; 2VK3 A; 1BYW A; 3PBR A; 3PAG A; 5A8B A; 3NI9 A; 4NEE D; 1SKF A; 2WKQ A; 3A3I A; 4IHQ A; 2W3F A; 5DFY A; 3KSH A; 2VZW A; 5KSH A; 1PI4 A; 3T1R A; 2WKI A; 5HD5 A; 2QWS A; 3HUN A; 5HD3 A; 1KE0 A; 1K55 C; 3F1N B; 1YT4 A; 5EUA A; 2XH9 A; 3HLW A; 3V67 A; 2WUQ A; 4DF6 A; 4EUZ A; 3MS6 A; 1VEU A; 4PM6 A; 2H5S A; 2WZX A; 2DCF A; 3D3O A; 3FKW A; 3UE3 A; 4NXG A; 4XXR A; 2EFU A; 1Y54 A; 3A0R A; 4WZ5 A; 3MZF A; 5HSQ A; 1PIO A; 1GA0 A; 5DF7 A; 4LEN A; 1QME A; 3V50 A; 3F1O B; 3VE4 A; 2HDQ A; 1XA7 A; 2PYR A; 1G5U A; 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