The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
125
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structure length |
125
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Chain Sequence |
SWQTYVDTNLVGTGAVTQAAILGLDGNTWATSAGFAVTPAQGQTLASAFNNADPIRASGFDLAGVHYVTLRADDRSIYGKKGSAGVITVKTSKSILVGVYNEKIQPGTAANVVEKLADYLIGQGF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Actin-binding
|
| source organism |
Acanthamoeba sp.
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| publication title |
Three-dimensional solution structure of Acanthamoeba profilin-I.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PROFILIN IA
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| total genus |
11
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| structure length |
125
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| sequence length |
125
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1994-01-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YPR A; 1VEU B; 3U4L P; 1Z09 A; 5EM1 A; 3D9Y A; 2ZL1 B; 1J3W A; 3KYE A; 1ACF A; 1PFL A; 5EM0 A; 1Y4O A; 2JKF A; 1AWI A; 1VET A; 4FUW A; 5EVE A; 1CQA A; 5FEF A; 3MS6 A; 4D60 A; 1G5U A; 4X1L A; 3T1R A; 2VK3 A; 3T12 B; 3CHW P; 4X25 A; 3UB5 P; 1FIL A; 5FDS A; 1FIK A; 3CPT A; 2PAV P; 2E8J A; 1SKO A; 3MSH A; 2JKG A; 5FEG A; 1VET B; 2PRF A; 3NUL A; 3LGO A; 2ACG A; 1F2K A; 4QWO A; 3DAV A; 5EV0 A; 1SZV A; 2V8C A; 3T1S A; 1D1J A; 1VEU A; 1HLU P; 4ESP A; 2B95 A; 3T1Q B; 1K0K A; 3NEC A; 3T1X A; 4X1M A; 2V8F A; 3CPT B; 2ZL1 A; 1CJF A; 1SKO B; 2BTF P; 3L9K A; 2PBD P; 1CF0 A; 4FTX A; 1A0K A; 3L7H A; 1PRQ A; 3LEQ A; 2HZ5 A; 1PNE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1NZO A; 2KOI A; 3UB8 A; 1GSW A; 3HJK A; 1QME A; 5IU1 A; 1BUE A; 1ERO A; 1YAX A; 4BBU A; 4LRZ E; 2W1T B; 1LL5 A; 2ZQ7 A; 2V1Z A; 5FAO A; 1O07 A; 3G34 A; 4QPR A; 4Q0J A; 5EVE A; 5HAP A; 3A0R A; 1OJ5 A; 3PAG A; 5MC7 A; 3PTE A; 4WEK A; 4KZA A; 2K2N A; 5LBR A; 4EQI A; 3CMZ A; 3ISG A; 1GA9 A; 4K0W A; 5HL6 A; 2WKR A; 2OOL A; 2H0Y A; 1FIK A; 1XJ3 A; 3CPT A; 4S2N C; 4KG6 A; 3MR0 A; 1SKO A; 3LI8 A; 3IF6 C; 3MFD A; 3O3V A; 4R1G A; 1PIO A; 3VSL A; 1T1A A; 3BLM A; 1ESU A; 1XA7 A; 3Q7V A; 4GD6 A; 2O99 A; 5CEB A; 1ZTU A; 3F1O B; 3OPR A; 4MCW A; 3BYD A; 5EV0 A; 1LLB A; 5EFW A; 3TJZ C; 1L0E A; 2P7J A; 3PBQ A; 3PAE A; 4UA7 A; 2OV5 A; 5EVL A; 4FD8 A; 2FFF B; 4X53 A; 3EEH A; 3K3C A; 4RYE A; 3G2Y A; 2ZD8 A; 1GSX A; 2P9V A; 4XUZ A; 3DTE A; 1K4F A; 2GJ3 A; 2P74 A; 2HDR A; 1F9I A; 5CX7 A; 5HZH A; 4MBK A; 1W8Q A; 1XP4 A; 3ZVT A; 5G18 A; 2M7V A; 4PM7 A; 1LSX A; 4PM5 A; 1OT9 A; 2XRN A; 4NXE A; 4I5S A; 4IBX A; 1MBL A; 4M4X A; 4XT2 B; 3FZC A; 3IBR A; 5FQ9 A; 4EUZ A; 3LEZ A; 4ME4 A; 1MWU A; 3C30 A; 1N9B A; 4UEY A; 3QHY A; 4IUH A; 4U0X A; 2MJ6 A; 3UDF A; 1YSP A; 3ZFZ A; 3BLS A; 4C6Y A; 5CHU A; 3FV7 A; 1K6S A; 4FUW A; 3MXR A; 2WUQ A; 3IS2 B; 5DF8 A; 1CI9 A; 2Y2I A; 4BLM A; 2IWB A; 5DTT A; 4KQR A; 1EW0 A; 2VGL S; 5FAP A; 2ZMV A; 4Y5F A; 5F1G A; 3SW1 A; 2EXB A; 3P01 A; 2PAV P; 1YLT A; 4RX2 A; 4H6J A; 1FCM A; 3GR2 A; 1S4S A; 2DNS A; 1IKG A; 1JWP A; 2W3G A; 4HHD A; 3MMH A; 4RQ9 A; 2W0N A; 3Q81 A; 1KVM A; 1K56 D; 3B42 A; 1NY0 A; 2BTF P; 2PBD P; 2Q9N A; 1A0K A; 5J4E A; 4KEN B; 3N6I A; 2JE5 A; 4NEE D; 5L10 A; 1DP9 A; 4NG2 A; 5HSQ A; 3DW0 A; 4KZ4 A; 5FI2 A; 3P7N A; 4JLF A; 1VEU B; 4PHT A; 2NUT C; 4QB8 A; 1MY8 A; 4MDZ A; 1OPX A; 3KSH A; 4EWF A; 3NJA A; 2D01 A; 4WL9 A; 3MZE A; 1ACF A; 1JTG A; 1PZO A; 1MWT A; 3FPV A; 4WZ5 C; 1HD8 A; 4BMW A; 3H82 B; 4HJ4 A; 1VET A; 3UY6 A; 3GTC A; 4HJ3 A; 1CQA A; 1UWP X; 2JCH A; 5EVI B; 1F5M A; 5HWV A; 3B33 A; 2JKT M; 4MN6 A; 3WRT A; 2Y2N A; 1MZU A; 1PZP A; 2ZOI A; 2AVX A; 1Q2Q A; 1KOU A; 3WS1 A; 3UE0 A; 4HJ6 A; 3UO9 A; 1W63 M; 3VE3 A; 5AVE A; 5FDS A; 1GSV A; 1NRJ A; 5D3O A; 3MSH A; 1FCN A; 3ULF A; 3JYI A; 2EX8 A; 1LL8 A; 4GNU A; 5DJT A; 5TGF A; 2OWJ A; 2J3W A; 3DAV A; 5BOH A; 5E2E A; 2XD1 A; 3VOL A; 5HAQ A; 3S7Q A; 1XGI A; 4JXS A; 5FQK A; 3OBF A; 4KZ6 A; 3N4I A; 2HV1 A; 3PYP A; 3GMW A; 2W3F A; 1T19 A; 1IYP A; 1D7E A; 3A3E A; 3T4K A; 5CHJ A; 2L4R A; 4R3A A; 1PRQ A; 1MKM A; 2XQZ A; 1E4D A; 4KZ3 A; 5M1A A; 4DN0 A; 3R7W B; 1H3Q A; 3ZG5 A; 2VV6 A; 3BEB A; 1TD5 A; 2QYB A; 4DDY A; 4KZ9 A; 3LI9 A; 3IX3 A; 3D9Y A; 4B4Z A; 3RXW A; 3S7O A; 4X69 A; 1NLY A; 1JVJ A; 4HI4 A; 4PMA A; 3DTM A; 3CUE A; 5DKK A; 3PBO A; 2V0U A; 2A2L A; 5CEC A; 2Y55 A; 2Y2L A; 4ARZ A; 3HBR A; 4FCF A; 3CG5 A; 4MBF A; 3RXX A; 2XA7 M; 1ESI A; 1LL9 A; 4EEP A; 5EOE A; 4R0Q A; 4ZTK A; 3PHY A; 2VJW A; 5KMW A; 3T1R A; 2VEA A; 4JGP A; 1ZG4 A; 3NDE A; 1C3B A; 4IUK A; 4E3K A; 2EWV A; 4QU3 A; 3ZVW A; 1VQQ A; 1MPL A; 4BJP A; 5FL3 A; 4QWO A; 5FQJ A; 4UQI M; 1NYY A; 1BLS A; 3K3D A; 2J8Y A; 1OTE A; 2Y8H A; 2B95 A; 4NK3 A; 2XSS A; 2Y2H A; 3C2W A; 5C5K A; 4LRY C; 3ZGA B; 1Q2P A; 4MBH A; 4WEL A; 2ZC6 B; 5CED A; 3LY4 A; 3QP4 A; 1CEG A; 2WKP A; 1EI5 A; 4HIA A; 1K25 A; 4ZDX A; 5A93 A; 2FH5 A; 2PU2 A; 2XFS A; 3B3X A; 5JYO A; 1OME A; 1Z09 A; 4ZJ3 A; 2J3T C; 1PI5 A; 5EOO A; 1J3W A; 2QPN A; 1P9R A; 4PM9 A; 1L0G A; 3IX8 A; 2PD8 A; 3PBT A; 4OQ0 A; 1FR6 A; 4MEZ A; 3UE6 A; 3WS0 A; 3Q1F A; 2V1B A; 4HH3 A; 3ZDJ A; 3OOV A; 3T4T A; 3LFV A; 2ZJ9 A; 3HLG A; 3ICY A; 5FAT A; 1L0F A; 3F1O A; 2UWX A; 5F6A A; 5GL9 A; 2IWD A; 5AVF A; 2O0Y A; 1IOU A; 4IVI A; 4RX3 A; 4N9L A; 2HPB A; 3TW8 A; 5CHM A; 4MNR A; 1DP8 A; 3T12 B; 3MZD A; 2HDU A; 3O5Y A; 1FIL A; 4I39 A; 2Y2K A; 4HBT A; 4EER A; 4HP4 A; 5F83 A; 3U2A A; 2PRF A; 4EV4 A; 3A3D A; 4X56 A; 2C5W B; 2W3E A; 5DTK A; 2PU4 A; 3VE4 A; 1L3L A; 1TF1 A; 2XF3 A; 4WLA A; 2I9V A; 1OTB A; 3T1S A; 1NRF A; 1NYM A; 4GD8 A; 1H8Y A; 3NEC A; 4LV2 A; 2J3T D; 2V8F A; 1IEL A; 4EEU A; 4HP9 A; 4ARZ B; 1U60 A; 3FG8 A; 2X01 A; 3N8R A; 1ZG6 A; 3KSF A; 1NXY A; 5CTN A; 4L9E A; 3UB7 A; 3ITA A; 3V67 A; 2IWC A; 3BFG A; 4HEF A; 4BEN A; 4B88 A; 3LY3 A; 5TJJ A; 4JKT A; 4OPZ A; 4WBG A; 4DE3 A; 3W4P A; 4BWI A; 4BBT A; 3R4K A; 4CQH A; 2W27 A; 4LV3 A; 4GDB A; 5A92 A; 2V0W A; 4WEJ A; 3SH8 A; 3FYZ A; 3N8S A; 4EXO A; 3LYX A; 4B93 A; 2ZC4 B; 2NUP C; 2J9P A; 2PDR A; 1GA0 A; 4X1L A; 3CHW P; 1I5Q A; 5E2H A; 1UWN X; 3BY8 A; 4GHI B; 3UE1 A; 5KSC A; 4O7D A; 4CLC D; 5G4Y A; 1JNU A; 3MBZ A; 4EUV A; 2JKG A; 3ZHH A; 3LCE A; 4R6L A; 3HVF A; 1S67 L; 4E6X A; 1F2K A; 3T4J A; 3A0V A; 3IQA A; 4OKP A; 1PWD A; 2V8C A; 2O9C A; 1IEM A; 5E2F A; 2RCX A; 1D1J A; 4II7 A; 1ERQ A; 1VEU A; 4ESP A; 3NC8 A; 3S1Y A; 4JGO A; 3KSI A; 4N1H A; 1BTL A; 3OPP A; 3QP2 A; 1XJ2 A; 3MQQ A; 3RJU A; 2WKI A; 4KG2 A; 2ZMF A; 3VP1 A; 3H82 A; 5FQI A; 1I2S A; 1BLH A; 1YPR A; 3NIA A; 2ZQC A; 3U4L P; 2OSU A; 3EEA A; 5EVI A; 3CWF A; 2BAS A; 4ZJ1 A; 3SZT A; 5CGX A; 3NOU C; 5G4Z A; 4WN5 A; 4S2I A; 2EX6 A; 4P85 A; 4OP8 A; 5AJG A; 5CGW A; 3NBL A; 3H9W A; 1L0D A; 3QP8 A; 5FI7 A; 1WYC A; 5F82 A; 3ZG9 B; 4OVD A; 1MC0 A; 4OOL A; 2V1A A; 4UA6 A; 3BFE A; 4L9F A; 4GW9 A; 3MXQ A; 4P87 A; 3LR5 A; 2WZX A; 3DTK A; 4A5R A; 4WM9 A; 4MMN A; 4DF6 A; 4FSF A; 2UV0 E; 2ACG A; 3UDX A; 4LRX C; 1YLP A; 3UPN A; 3M6H A; 3QP5 A; 3M2K A; 1P0Z A; 1XGJ A; 3R7W A; 3Q07 A; 1P9W A; 4WZ4 A; 4Z9Q A; 1LI9 A; 3P98 A; 3T1Q B; 3FPW A; 5IS1 A; 3OCL A; 2EA9 A; 4E3M A; 2K7S A; 2ZM8 A; 2HP9 A; 2PT7 A; 2Q0O A; 5E43 A; 4DJ2 A; 4R4S A; 4PPR A; 2ZC3 B; 3JVU A; 3UME A; 3LEQ A; 1KGG A; 5TR7 A; 3EQU A; 2JKT I; 2HZ5 A; 1TS7 A; 2EWW A; 3UDI A; 3E4O A; 3CJM A; 1K55 A; 1MWS A; 3PXP A; 4EU0 A; 4LLO B; 1BZA A; 1K54 A; 4YNR A; 4Y3I A; 1ERM A; 3G2Z A; 5HX9 A; 4G3K A; 1PFL A; 4BD1 A; 3BW6 A; 3CUE C; 4OQH A; 1TEM A; 1TS0 A; 2XH9 A; 1ZC2 A; 3MFX A; 4JXV A; 2WAF A; 3VSK A; 2O9A A; 3EQV A; 3PBN A; 4L9G A; 2PD7 A; 1G68 A; 1T1C A; 3MS6 A; 4I3J A; 4DMZ A; 2EFX A; 1V9Z A; 1N9O A; 2CMN A; 5L8M A; 3V3R A; 3IT9 A; 3WS4 A; 1W63 Q; 2H5S A; 2DRW A; 4EW7 A; 4E3I A; 3HLD A; 2V9A A; 1VB6 A; 4UQI S; 1SZV A; 2EXA A; 3LR3 A; 3RFB A; 1DJC A; 2D02 A; 3OCN A; 3CIT A; 2PR6 A; 3HUN A; 1G6O A; 4IVK A; 4LCL A; 3VOZ A; 1W5D A; 2XK1 A; 1H0M A; 4R3B A; 3GQZ A; 3RTY A; 4KZ5 A; 2QMI A; 4HH2 A; 3W8K A; 1WYB A; 2H28 A; 5IHV A; 1O7E A; 1STZ A; 1TS6 A; 2XD5 A; 1NLZ A; 2GX5 A; 3NY4 A; 3TRC A; 1KDS A; 5EUA A; 1CK3 A; 3S4X A; 1KVL A; 4F3L B; 4I38 A; 1OT6 A; 2P04 A; 2DCF A; 1YM1 A; 3BWL A; 3E4P A; 5DKL A; 2J80 A; 1K4E A; 2GZA A; 3E0Y A; 5DFY A; 1DP6 A; 4MN5 A; 2OLU A; 2YKH A; 4OON A; 4QJG A; 2Y2J A; 1RGZ A; 4QD4 A; 5EEC A; 3PR6 A; 1ALQ A; 4EBP A; 2V2F F; 4G3V A; 3CAX A; 1NWZ A; 2BG1 A; 4P6B A; 5KSH A; 4HOI A; 4LGW A; 1J9M A; 4KQO A; 1VM1 A; 4DE0 A; 4GLQ A; 5IT5 A; 2VK3 A; 2P08 A; 3UNW A; 3GVB A; 3WS5 A; 1S1Z A; 4O8G A; 3BQA A; 5HDD A; 3OPH A; 1TDL A; 1I2W A; 4DXC A; 1NZU A; 2ZC5 B; 2O9B A; 3W2Z A; 1PYY A; 2KLI A; 1H8Z A; 2OWH A; 1CI8 A; 4K91 A; 4O0P A; 3E4Q A; 3G30 A; 4EQ1 A; 4YFM A; 3MQ0 A; 1YT4 A; 4S2O A; 3IF6 B; 3BQ8 A; 3ZG8 B; 3S7P A; 5M18 A; 2E8I A; 3EOI A; 3A3J A; 5HFO A; 3OPL A; 4Y15 A; 1DJA A; 2VX8 A; 4Q0H A; 3G35 A; 2VKS A; 4KG5 A; 4DE1 A; 4RVA A; 5FQQ A; 3LIA A; 4CJN A; 4JXG A; 4S2K A; 3GRJ A; 3MKF A; 2G2U A; 1OJG A; 3M2J A; 4Y0O A; 3WWX A; 4Q8I A; 5FQM A; 1YLY A; 2EFU A; 2ZBB A; 4Z1W A; 1H8M A; 1KGF A; 1W8Y A; 5AQA A; 3LIE A; 3LIB A; 3C7U A; 4GHI A; 4JXW A; 4Y0U A; 5HL1 A; 5GLA A; 4N9K A; 5HD3 A; 2EX9 A; 1AWI A; 5CGS A; 4ZBE A; 4F94 A; 1V9Y A; 4ZJ2 A; 3UB9 A; 4DRT A; 2ZM2 A; 4S2P A; 1D06 A; 3IXD A; 4D60 A; 1S0W A; 2WKQ A; 2QKP A; 5GLB A; 4JGR A; 1GHM A; 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3LID A; 2BLS A; 3BM6 A; 3NUL A; 5TBM B; 4WMC A; 2A24 B; 2INW A; 3UPO A; 4JF4 A; 4XXR A; 1SDE A; 4JF5 A; 2J7V A; 1N9L A; 2VLG A; 5HWT A; 2C6W B; 4QY5 A; 4Q0I A; 3CI6 A; 1LI0 A; 4PM8 A; 4S2J A; 5EVI D; 3H7W B; 3ZNT A; 1W7F A; 2V20 A; 2JN7 A; 3KYQ A; 3SS5 A; 3SS3 A; 3MKE A; 4OH0 A; 1IFQ A; 4Y0T A; 1NJ4 A; 5A91 A; 3C38 A; 3T4L A; 4E3J A; 3BFD A; 3G4P A; 4YOF A; 2WGV A; 3IWQ A; 3HLC A; 1W79 A; 1X0O A; 3CLO A; 3QP1 A; 3VMA A; 5JYP A; 1TDG A; 3F1P B; 1K55 C; 1KE4 A; 5DFX A; 1HVB A; 1K54 C; 4PKY A; 3C8C A; 1YLZ A; 5A90 A; 1ES3 A; 5A8B A; 5HD5 A; 2Y2Q A; 4DXB A; 4GS9 B; 3V50 A; 5DJU A; 4BL2 A; 3CZD A; 1RGY A; 4YWZ A; 4GKU A; 3EGD C; 4DKI A; 2WGW B; 1M6K A; 2X02 A; 4K08 A; 1LSW A; 3G6O A; 4JF6 A; 4PKY G; 4RA7 A; 4KZB A; 4X68 A; 3UB5 P; 4GB7 A; 3TOI A; 4R23 A; 2DMW A; 1Y54 A; 4CLC A; 2A49 A; 3OLO A; 4OOM A; 1RCJ A; 3ZCZ A; 1HZO A; 1ONG A; 3BEC A; 3B47 A; 3LR0 A; 2HJE A; 4WF0 A; 3JVV A; 4F3L A; 2XFT A; 4EES A; 2ZQ8 A; 4P6Z M; 2WK0 A; 2XRO A; 3UN7 A; 3M6B A; 2WYX A; 1JWZ A; 4OLG A; 2Z6C A; 3BFC A; 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