2PT2A

Structure of futa1 with iron(ii)
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
QEINLYSSRHYNTDNELYAKFTAETGIKVNLIEGKADELLERIKSEGANSPADVLLTVDLARLWRAEEDGIFQPVQSEILETNVPEYLRSPDGMWFGFTKRARVIMYNKGKVKPEELSTYEELADPKWKGRVIIRSSSNEYNQSLVASLVVADGEESTLAWAKGFVSNFAREPQGNDTAQIEAVSSGEADLTLANTYYMGRLLESEDPAQKAIAENVGVFFPNQEGRGTHVNVSGVGVVKTAPNREGAVKFIEFLVSEPAQAFLAQNNYEYPVLAGVPLNKSVASFGEFKSDTTSLDKLGPALAPATKIMNEAGWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The structure of the iron-binding protein, FutA1, from Synechocystis 6803.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iron transport protein
molecule tags Metal transport
source organism Synechocystis sp.
total genus 124
structure length 316
sequence length 316
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2pt2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2pt2A02
5M2VA 4ONYA 4OYVA 3WAEA 3TTMA 5L9MA 2FYIA 3FXRA 3QSLA 3U1OA 4H0WA 5CRYA 3PGFA 2F36A 4WEPA 4KHZE 3U72A 4GF8A 3MUQA 3E13X 2D21A 3HHFA 5CMCA 4NWCA 3HPIA 1N0TA 3KEIA 3M8UA 2XXHA 1FW0A 3UP9A 3RQTA 1N76A 3MP1A 4H5FA 2O51A 4LVQA 4KD5A 4DXBA 3BFUA 4H67A 3C9HA 1OIBA 3IOVA 1NMUA 4ELPA 3BFTA 3P7IA 2OK2A 4F3BA 1SW1A 3H6UA 3FIRA 1UTHA 3Q25A 2F35A 2Z8FA 5ITOA 3VDFA 1Y20A 5I58B 3MC2A 1SW4A 4ZEBA 4NF8B 3DP8A 4C1UA 4KYEA 2NVUB 2F5XA 3CR9A 3QK6A 1POTA 4E0XA 5L9OA 4IB2A 3Q28A 2HQ0A 3DLNA 1IUDA 1Y4CA 3FATA 4GLIA 4DDDA 1OLCA 2F7BA 3D4CA 1B58A 3MZ1A 5I84A 4OEUA 5B7DA 1N3XA 4O3CA 4NF5B 5H8FA 3CFXA 5J1DA 2GH9A 3OXNA 1I6QA 2F97A 3IOUA 3O2AA 1FQFA 2I3WA 1SYHA 2H99A 1ZJLA 4KYSA 3W15C 1FQDA 3JZJA 1SI0A 1USYH 5HM4B 3EHTA 4HCYA 1LBBA 1H44A 2Q2AA 4IY6A 3MZ9A 2DS9A 3KOTA 4GXSB 1SD3A 4NMYA 4ND9A 1LFIA 3VLUA 2QJEA 2REGA 3KN3A 4QF9A 4I8CA 1HSLA 1AOVA 4LA9A 4ZE8A 3UK4A 4DCYA 3CRBA 3HSTA 1DPEA 1MS7A 1MY0A 1A7LA 5H8HB 3N94A 4RJZA 1B40A 3FXUA 3PUZE 3K6XA 3RTWB 1POY1 2Q89A 1IZ1A 2B65A 1M5BA 4PQJA 1SVXB 4POWA 4U1ZA 1EZPA 1B0LA 2HAVA 1EU8A 2VP1A 4NF4B 3LSXA 3CFZA 1LCFA 1OVBA 3CG3A 1B1XA 5CC2A 3IOTA 5ICQA 1LSTA 2FA7A 3G3GA 4EF2A 4FEBA 2G93A 3MPLA 4KCDA 3FJGA 2V93A 4F31B 3DELB 3TCGA 1VSOA 4KR5A 2IA4A 4BDNA 1MQJA 2I6EA 3G3IA 2AL5A 3ECRA 3LSLA 2OCUA 2UVHA 4R6HA 4ELQA 4LZ7A 1BLFA 2DOJA 1SI1A 4UACA 2HAUA 2XXQA 2KLFA 4NF6A 4C1TA 4EDPA 2QS1A 3DP6A 4LATA 3EN3A 5CBRA 3MZBA 3S2VA 1O7TA 1NH7A 2DE3A 4F2QA 3ZKLA 1QJMA 4F3GA 4MLQA 5JTYB 3KN8A 1MXVA 2XXIA 4KPTA 1M5DA 3B6WA 5DEXB 3THIA 4K3FA 1B7UA 4OFOA 2Q2CA 4FEDA 3UIFA 5AA2B 3LBSA 1D9VA 3B6TA 4R6KA 3KFMA 3I6VA 1WDNA 1FTLA 1B2HA 3H6TA 2H5YA 3T96B 4DE8A 3IOWA 1URDA 4GIZA 1MY1A 1ZKBA 2AIXA 1B32A 4TLMB 2THIA 1YAEA 3TZAA 5I56A 2OWTA 2XXTA 1MDP1 3DP4A 4EUOA 1ZLQA 3C32A 4LZ5A 4FE8A 2AYSA 1LCTA 1QVSA 5I2NA 3QIMA 4FJPA 3WAFA 4F3SA 3TTNA 3N26A 1B3FA 5FHMA 1KWHA 3MAMA 4RA1A 3PPNA 3IJXB 3VVEA 3V8XB 1ZIUA 1Y3NA 1MQIA 3TELA 1OLAA 3RNNA 3H4ZA 4FECA 1B9JA 4Q8RA 3PV0E 1A99A 2CMOA 1ANFA 1JQFA 4U4SA 1DTZA 2DXRA 1XHYA 1B7HA 3TODA 2UYEA 4N07A 1EZOA 2VD2A 3FUZA 2RC9A 4Q5TA 3TFLA 4GD5A 1IXGA 4YICA 1TT1A 3M3KA 3S9NC 1NNFA 3E4RA 5I58A 1N84A 2REJA 1FQBA 3BBRA 4NF8A 3R7XA 1LAFE 3K2DA 3TTRA 1PBPA 4QFLA 3G3FA 4BDRA 2VHAA 3OO8A 1US5A 3LR1A 4OVJA 1B3HA 2H98A 2B3FA 4QSEA 2RCAA 3B7DA 2XXYA 4NF5A 1Y9UA 1JW5A 4NEDA 4H65A 1GTKA 1AMFA 4YMAA 1B4HA 2NUVA 4KQPA 3C33A 4BDLA 1MY4A 3K00A 3TCFA 2GHAA 4PETA 5HPQA 1Y3QA 2F7AA 5ICTA 2P2AA 1IITA 2PT1A 4MBPA 3IAZA 1GVCA 1UTBB 2YPNA 4G8MA 1B3EA 3IL1B 2ZNSA 2O68A 5JK4A 4GWOA 4OFJA 1JEVA 3V5AA 4YB7A 4GL8A 3VVFA 3CVGA 4G77A 1PB9A 1YPNA 1EZ9A 4WEDA 1N04A 3IB2A 4X9TA 1GGGA 1A8FA 3GZGA 4U21A 4QFPA 3DM0A 3OO7A 4XTCQ 1LB9A 2XX7A 1EH3A 3VV5A 1RYXA 4EQBA 1QKBA 3N6UA 4BDOA 2QL3A 3PD8A 5H8HA 4XKQA 1FTKA 4MH5A 5DVFA 3N5LA 3Q27A 2RKMA 1B05A 3C35A 2H4IA 1MG1A 4LZ8A 1WODA 2F7CA 3G3KA 4GFRA 4QHQA 4WXJA 3G7WA 1Z7ME 1DSNA 2R9JA 4F29A 4F18A 2YLNA 4NF4A 4RPOA 1NNPA 1O63A 3PPQA 4U23A 5L8DA 4YKJA 1NNKA 5ISUA 4R74A 3M3LA 1Y3PA 4LQ5A 2I48A 5EHSA 4EXLA 3Q26A 3K4UA 3UORA 1MXUA 2HZKA 3PU5A 2QRYA 1JW4A 3F11A 5AE4A 1XS5A 1PB8A 4O3BA 1QW0A 3T66A 1MXYA 3TEPA 3L6HA 4YU0A 2DQVA 3OOAA 5TPAB 2XHDA 3SDFA 3FJ7A 3SERA 2PVUA 1MXXA 3H06B 4EXKA 1TFAA 4U1OA 4G8NA 5DT6A 5A5XB 4ZEKA 2Q8JA 3RN8A 4F3PA 4HS7A 3V89B 5ELVA 4IO6A 4ZS9A 3LSWA 3TCHA 4JSDA 2G29A 4RK2A 1JETA 3HO7A 4F1YA 4ECFA 1BTJA 3T9HB 5I59B 3TYHA 1P99A 2O7IA 4R75A 1IIWA 3VLVA 3CSBA 4F39A 5HBCA 3GBBA 5DEXA 4TQUQ 2Y7KA 4PFWA 4IO7A 2O84X 3H7MA 5H8QB 3TQLA 4ZECA 1RYOA 5AA2A 4HW8A 4RNSA 4Z7EA 3K0VA 1S50A 2M8CA 4G4PA 3T9XB 4MF3A 1R6ZA 4ELRA 1ELJA 4KFQA 5I57B 3KZGA 1A8EA 4DXCA 4F19A 4JB7A 1F9BA 4F1VA 4PP0A 4QSCA 3O29A 5H8SA 1B3GA 2HXWA 1Y1MA 4P0GA 5F1QA 1MQGA 3FV2A 5FTHA 5KCJB 4H5GA 1OQHA 5B70A 1I69A 1PC3A 4GL0A 3EHUA 3HV1A 4G68C 3M3FA 3OO9A 2Z23A 3PPOA 3MP6A 4Z0IA 2RC8A 3I3VA 4QFKA 3K6VA 4LP2B 3U93A 3ILTB 1DTGA 5H8NA 2O1MA 5CMKA 3OD7A 1BIYA 3IORA 5CMMA 5AA3A 2PT2A 4X1BA 1VR5A 3OEKA 1B5IA 4DLDA 1FTJA 3ZS6A 2VOZA 3D4GA 1XVXA 4M1VA 3KN7A 5TP9A 1Q35A 2Y7PA 3OENA 4ZZAA 1NFTA 1M5EA 4FATA 3OSRA 1MQDA 5IKBA 1H76A 1TWYA 2XD3A 1MRPA 2H25A 3O66A 1OVTA 4HTGA 4R2FA 4PFTA 3OELA 3OMBA 3O6HA 4G8HA 2ALUA 5KDTB 5FTIA 2HZLA 3EQ1A 4R73A 3G3JA 3TMGA 3USDA 3VE1B 1B6HA 2OJTA 3PUWE 1PBQA 3SEVA 3EPEA 2XXXA 2RINA 4P0IA 2DWIA 1HSEA 5AA1A 2PYYA 3V83A 2F6GA 1B46A 3JYRA 4YB5A 5I2KB 4XKNA 2ANJA 1USYE 3MBPA 3PMXA 4H6DA 1ZBMA 3UN6A 4OEVA 2A5TB 4OMBA 1LFGA 4N6PA 1D9YA 2P0SA 3E3KA 4OESA 4IO5A 1IXIA 1YCJA 2F34A 2RF1A 1PB7A 2CZLA 2XXUA 4U4XA 2HFBA 4RK9A 2ONSA 1JW1A 2R6GE 3IO4A 1MXZA 3EHSA 3O6GA 5CM6A 4EQ9A 1MY2A 1UTBA 4X48A 1LB8A 1MY3A 3K1MA 3LSFB 1A54A 2ZXTA 3KJTA 1N7WA 1BKAA 2Y7RA 3OO6A 4N13A 1URGA 4OFLA 4BDQA 2Q9TA 1Z7NE 3H6VA 5FHNA 1D4NA 4Q30B 3FASA 2QS3A 4DIGA 4F2OA 3K6WA 3CSGA 3CG1A 1LBCA 1P1WA 4NF6B 2LAOA 1SYIA 2DWJA 3CI8A 4OXVA 4H8JA 1GV8A 3VVDA 4ELOA 1B5JA 2I4CA 3PPRA 4IY5A 1B51A 1RKMA 2OBGA 4GRKA 1FQCA 3RY3A 2Z22A 3K01A 1URSA 1MPDA 1B5HA 4PFYA 3IB1A 5IAIA 2ZMBA 2V84A 4QRZA 4MFIA 3B6QA 3FJMA 4YKKA 2ZYNA 3BKIB 4U2RA 4JXIA 3SEUA 2O6AA 3KSXA 3RUMA 4C0RA 3LC8A 5CMBA 3GBAA 1MDQA 2E0SA 2F8DA 3SESA 2ZYKA 3U92A 1ATGA 4I1DA 3RGYA 1OQGA 2ZYOA 2BJJX 4I62A 3H3GA 1LAXA 2X7PA 4RYAA 5TPAA 4IO2A 2D3IA 2O1LA 4JBZA 3KG2A 3JV9A 4OENA 5I56B 5BWJA 3HHGA 4YZZA 2OZZA 4JWXA 4G68B 1JNFA 1R9LA 3SETA 4XIGQ 1VFDA 3FZVA 4OERA 3PUVE 2O7UA 2O69A 3PPPA 3RPWA 5I2NB 2X7QA 3FXQA 2UVGA 2UYFA 3TKDA 1NH8A 3O9PA 4X1DA 4KCCA 3RT8A 4IGTA 4ZEDA 4E0WA 3L6GA 4OWDA 4NWDA 5I59A 4AB6A 3FVGA 5JEIA 2DYXA 4ISUA 3OSQA 2YJPA 2QMXA 3TTKA 1H45A 1D3KA 4NE4A 4OQOA 1IXCA 4FORA 3S9MC 3PMVA 1XT8A 2ZNTA 2H9BA 4IGRA 4BDMA 5H8QA 5AA4B 1MH4A 1SW2A 4F1UA 2P1SA 3PUXE 1II5A 1LLSA 4DXUA 5DYHA 4THIA 4L17A 4JDFA 3PMWA 4ZZEA 3N6TA 4JWOA 3EF7A 4IO4A 5I57A 1MXWA 1P1QA 5CI5A 3QUJA 4LUBA 1B0HA 3A3CA 1R1NA 5L9SA 2PBWA 1SW5A 1FQEA 1SQYA 5KCJA 1QULA 1O64A 2DE2A 4ESWA 4P11A 2ABHA 3KOSA 1NNTA 3ILUB 1B7ZA 1TFDA 1IQ7A 4R72A 2Y7WA 1T0KA 4HCWA 4GQOA 1UQWA 1MQHA 3O6IA 3KGCA 3RTFB 1QKAA 4M4GA 1JVYA 3AXFA 1MM7A 3U94A 3TPAA 3S9EA 3K1NA 2DVCA 3T93B 3K1PA 3MPKA 1LGBC 1P1NA 2F78A 3C31A 1XC1A 1PDAA 4H1XA 3K02A 2WKYA 4WKMA 3IR1A 2ONRA 4OHNA 5EYFA 2PX1A 3KBRA 3VLWA 4NTLA 2QPQA 1Y4TA 1ZMGA 2X26A 4PE5B 1FCKA 5JTYA 2NOOA 4KYDA 2Z8EA 4R6YA 1AL3A 5KDTA 5F7VA 2ESNA 2NWJA 2XD2A 4XXUA 3H03A 2Y84A 2I58A 3MVZA 3KJ7A 3LUYA 1FQAA 1A55A 5BUUA 1B1HA 3U8QA 2E1SA 1AH5A 3MVWA 3TUSA 5I2KA 1I6AA 1N3WA 3VFJA 1JEUA 1UTHB 3E9XA 1SDXA 4XKRA 1WVJA 4GXAA 3RT6B 4QSDA 3I5OA 1ZU0A 2A5TA 3MQ9A 3TTLA 2I3VA 4FAJA 2ZYMA 3T9UA 2I49A 1HSJA 1VE4A 2A5SA 2GRVA 3C34A 4PFUA 1H43A 3SKPA 4R9FA 3FVKA 1FTMA 1FTOA 3HCQA 3R6UA 2IEEA 4R9GA 3VXCA 1L5TA 1M5CA 2B3BA 2RC7A 3W9WA 4IO3A 3TDJA 4JSOA 5H8FB 3PUYE 3IB0A 4LQ2A 3K6UA 2Y7IA 3OEMA 4GOTA 4EQ7A 2OLBA 1US4A 2HCAA 5CBSA 4EF1A 4U22A 2FNCA 1AIVA 1VFEA 5KZTA 5DVIA 5DTBA 4OETA 1DOTA 1MPCA 1MH3A 3QXMA 2QS4A 3CIJA 4QFNA 3MW0A 2PMSA 2W7YA 3ONMA 4RPNA 4UA8A 1QUJA 2DWAA 2V3QA 4ESXA 3MVXA 2DWHA 2UVIA 1MPBA 2DXYA 1NKXA 4ZDMA 5EHMA 1UIVA 2V3UA 3IO6A 3Q29A 1I6BA 1LAHE 1P1OA 3IK6B 1N7XA 2AL4A 1DPPA 3ZSFA 1TXFA 2XX8A 1R9QA 3KSJA 3FV1A 4YMBA 4I9DA 3CFLA 1H3DA 2GHBA 2Q88A 2DSFA 1S9TA 3TQWA 1IEJA 2QS2A 3C4MA 4MLVA 4TOZA 2I0BA 3S9LC 1QUIA 3R26A 5ITPA 3UA8A 3O28A 2UVJA 4ZEIA 3RLFE 2DE4A 1A40A 4DCXA 1QUKA 1S7YA 2XXPA 5K2XA 4G68A 4POXA 3H6WA 3SEWA 3FVOA 5AA2D 1B52A 3UGWA 3G3HA 4AQ4A 1GR2A 5TU0A 2F6PA 2XXVA 2I4BA 2D5WA 3TAJA 3SEXA 3IX1A 4O3AA 3S4UA 1NL5A 1OMPA 1B3LA 3A09A 2OWSA 5H8NB 1PEBA 2UXAA 1ZTYA 4YB6A 3VXBA 1UIUA 3QUFA 5LOMA 2RCBA 3MVYA 2ZNUA 5K2YA 2QMWA 4JWYA 1MM6A 2GFEA 1Q1KA 3MWBA 1IXHA 4YAHX 4Q0CA 1J1NA 3PD9A 1JVXA 4RY1A 3QAXA 5AA4A 2DP8A 5TP9B 3A3UA 2I0CA 3MP8A 4XKPA 4YKPA 2NXOA 4OTEA 3GXAA 2DVZA 2VD3A 3GLBA 2R71A 1M5FA 1BP5A 2QSXA 3IJOB 1DMBA 4H8IA 1XOCA 2VGQA 4QFOA 4YKIA 4DZ1A 3FD3A 3ZKKA 3T9VA 4F22A 2ONKE 3SEYA 1LFHA 3O97A 4ZEFA 2XX9A 2Z8DA 4AB5A 1CE2A 4ZE9A 2XXRA 3W9VA 1P1UA 4FIMA 1XVYA 5FHOA 4GVOA 3C36A 3FGSA 3T22A 3FVNA 1YTVA 1SBPA 4LONB 4G2ZA 1Y1ZA 3HN0A 4RXLA 1CB6A 4OZ9A 5DVJA 2V25A 2V3TA 4KI0E 1B4ZA 4BLAA 3MJNA 2HEUA 1LAGE 5A5XA 3ODBA 2XXWA 4TLLB 3QYTA 4R2BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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