2PT2A

Structure of futa1 with iron(ii)
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
QEINLYSSRHYNTDNELYAKFTAETGIKVNLIEGKADELLERIKSEGANSPADVLLTVDLARLWRAEEDGIFQPVQSEILETNVPEYLRSPDGMWFGFTKRARVIMYNKGKVKPEELSTYEELADPKWKGRVIIRSSSNEYNQSLVASLVVADGEESTLAWAKGFVSNFAREPQGNDTAQIEAVSSGEADLTLANTYYMGRLLESEDPAQKAIAENVGVFFPNQEGRGTHVNVSGVGVVKTAPNREGAVKFIEFLVSEPAQAFLAQNNYEYPVLAGVPLNKSVASFGEFKSDTTSLDKLGPALAPATKIMNEAGWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal transport
source organism Synechocystis sp.
publication title The structure of the iron-binding protein, FutA1, from Synechocystis 6803.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iron transport protein
total genus 124
structure length 316
sequence length 316
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2pt2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2pt2A02
3MVYA 1MY4A 3C31A 1T0KA 1AIVA 5H8HB 1HSJA 3TKDA 3MZBA 1AL3A 3T66A 3TTRA 2F7CA 4YKJA 1EZOA 3G7WA 3TCHA 1B32A 4O3CA 5LOMA 3TUSA 1AH5A 3LSLA 1JETA 1N76A 3FUZA 1QW0A 4Q8RA 3K1MA 2A5SA 3KGCA 2D5WA 2KLFA 4XKPA 3SKPA 3CG1A 5H8SA 2XXRA 4X48A 3K6UA 5CMCA 3HHFA 5L9MA 1SW4A 4ELOA 1M5BA 3H4ZA 5I57A 2BJJX 2Z8DA 4OQOA 3MWBA 2P0SA 5H8QA 4PE5B 2DE4A 3O6IA 3L6GA 3TFLA 2DVZA 4ND9A 4H0WA 3O29A 1PB7A 4RNSA 5ICTA 1XT8A 2Y84A 3BFUA 1URGA 3EHTA 4TOZA 4IO7A 3FJGA 2F97A 2ABHA 4KHZE 1OMPA 5B70A 2XD2A 4MF3A 1N3XA 3TCFA 3OO7A 1B2HA 1HSLA 5IKBA 1BIYA 3PPNA 2O84X 2DS9A 2R6GE 2I4BA 2H98A 5I2KA 3VLUA 3K4UA 1JEUA 4QSCA 4F3BA 4JXIA 2AL5A 3E3KA 4GIZA 1SW1A 1LSTA 1M5CA 4OFOA 1J1NA 1JW4A 1LBCA 4NF4B 4I9DA 2F8DA 4ZECA 5A5XB 2UXAA 5HBCA 1WVJA 2B3BA 1F9BA 4KQPA 1N7XA 5J1DA 5JTYB 4Q0CA 2HZLA 1IXGA 1SDXA 1A7LA 1PB8A 1PB9A 3P7IA 1BTJA 4XKNA 5B7DA 3A09A 4QFNA 3LUYA 3H6VA 3LC8A 4AB5A 3EF7A 5AA3A 3ZSFA 2ALUA 2V3UA 1US4A 4MLQA 3C32A 1S7YA 5ISUA 3K1PA 4WEPA 1B9JA 4HCYA 1RYXA 2OZZA 2GHAA 3QSLA 1YCJA 5CM6A 2VP1A 1RYOA 2RF1A 1GGGA 1VE4A 2REJA 1KWHA 4ELPA 2VD2A 1YPNA 1ZKBA 3MVZA 3CIJA 2Q88A 1O64A 2OCUA 1GV8A 1MPDA 3JZJA 1Y1MA 5CI5A 2I3VA 3IR1A 2QSXA 1LFGA 4OHNA 4YB5A 4THIA 3KN8A 1XOCA 1B5HA 3ECRA 3L6HA 4NE4A 4XTCQ 1MQJA 3FJMA 4UA8A 3FXQA 5I56A 2ANJA 3TCGA 5CMKA 3O9PA 4MFIA 5CMMA 4Z7EA 3E9XA 1N84A 3JV9A 2Y7IA 4OWDA 3E13X 1QKBA 4H65A 2H25A 2NXOA 3WAFA 1OIBA 2VOZA 3TMGA 2OBGA 3QUFA 1OLCA 5AA2D 3I5OA 3N94A 3OEKA 5AE4A 5H8HA 3IO4A 4NF5A 1US5A 4NF6B 1LFIA 4NEDA 4XXUA 4RY1A 4F31B 4MLVA 5FTIA 4YMBA 3FV1A 4G8NA 3OD7A 1MY1A 4YKPA 3IOWA 1UTBB 2V84A 3MZ9A 4DCYA 4DXUA 4I62A 4R2FA 1MY2A 1MH3A 4LP2B 3HN0A 4EQBA 2DYXA 3B6TA 3IOTA 1TWYA 4OYVA 3FZVA 1O63A 4EXKA 3TYHA 1NFTA 1S50A 2Z22A 4AQ4A 4E0WA 1LAHE 1A54A 4I1DA 4XIGQ 4PETA 1IUDA 2O6AA 4ZEBA 3OENA 3O6HA 1Y1ZA 5H8NB 1GVCA 4KI0E 2PBWA 5KCJA 3LSFB 4YZZA 4GL8A 4JSDA 1ZU0A 5H8FB 3DP8A 2I3WA 3VV5A 1B3FA 1FQEA 2XXWA 2O1MA 4F1VA 1POTA 1N04A 4ZZAA 1LCTA 4Q5TA 3U1OA 3VFJA 4C1TA 3C36A 1BP5A 2F35A 3D4CA 4BDMA 1UIUA 2QS4A 4YICA 1IXCA 3MAMA 1CB6A 3C35A 4MH5A 2DP8A 5L9SA 1WODA 4RPNA 1A99A 2PT1A 2Q2AA 2WKYA 1MXUA 2P1SA 1M5FA 4K3FA 4ZEKA 1FTLA 1SI0A 3O6GA 5DVJA 3U94A 4LQ5A 2ONRA 4C0RA 3UN6A 3DM0A 5EHSA 1VFDA 2X7PA 2ZXTA 2I58A 4P11A 1VR5A 2YPNA 3W9WA 4YKKA 1A55A 3RTFB 3PUZE 1B52A 5I84A 1EZ9A 4QRZA 3FASA 4GF8A 3MVWA 1Z7ME 1Q1KA 2XXTA 1L5TA 3LSXA 3PD8A 4X1BA 1PBPA 2H5YA 2OJTA 5F1QA 4ZEFA 2O68A 5KZTA 4H8JA 1DPEA 2RCAA 4OENA 1P1OA 1ZTYA 1OQHA 3RQTA 3VE1B 3PMWA 2ZYNA 1EH3A 4U2RA 4EQ9A 2R71A 4RYAA 5HM4B 1SYIA 2XXHA 4YMAA 4GWOA 3VDFA 4IO2A 3OSQA 1UTHB 3MBPA 1ZLQA 2DE3A 1LB9A 5AA2A 1B7HA 5DVFA 2HAUA 3PUXE 2QJEA 3DELB 1SYHA 1H3DA 5I58B 5TP9B 1XS5A 4OMBA 1GTKA 5I59A 1SW2A 2O51A 1YAEA 3G3FA 3I6VA 4R74A 3PPPA 1MXZA 4H5FA 2IA4A 3QIMA 3QAXA 1OVBA 3EHUA 1R6ZA 5BUUA 3MVXA 5CBRA 4DDDA 5KDTA 4G68C 2OWSA 5JK4A 1P99A 3PPRA 4NF8B 1POY1 1SW5A 1EZPA 4EUOA 1B4HA 3U93A 4G4PA 3K00A 4MBPA 1H76A 1P1NA 2QL3A 1QVSA 3RY3A 4JSOA 2V25A 3MZ1A 3PUWE 4F2QA 1FCKA 3IL1B 3LR1A 1IITA 3VLWA 1MG1A 3IOUA 1MXVA 3IJXB 1IZ1A 2Y7PA 2QMWA 1H44A 3RLFE 2PX1A 3EHSA 4F29A 2Y7WA 1LAXA 3H6WA 3KEIA 1OLAA 3RTWB 2DOJA 3FVGA 1Y9UA 1B0LA 3RPWA 4N07A 5CRYA 4QFOA 1FW0A 1BKAA 2DWIA 4YU0A 3KZGA 3PU5A 5I2NA 1PC3A 1ZMGA 4OZ9A 4ESWA 3FVNA 3EPEA 4F19A 5AA1A 1Y3NA 4ESXA 3OXNA 2XX7A 1P1QA 3OO6A 3IK6B 3N6TA 3MJNA 3FVKA 4FEDA 1FQCA 3H03A 3PGFA 4F3SA 1MQDA 1MM6A 3K6VA 3D4GA 1IEJA 2F36A 1FQFA 4ELQA 3Q28A 2UVJA 3SEVA 5EYFA 1TXFA 3SETA 1B7ZA 1BLFA 3MC2A 3MP1A 5AA4B 3T9XB 4R6HA 2Q8JA 2DWAA 4NWCA 1QUJA 2ONSA 4HTGA 1H43A 2R9JA 3TODA 2OLBA 1WDNA 4H6DA 1NNKA 3QK6A 3ONMA 4EQ7A 3W9VA 3UP9A 4RK2A 1TFAA 2DWHA 3H6UA 2A5TA 3PMVA 4KPTA 2YJPA 3LBSA 2UYEA 3FXRA 3CR9A 1N3WA 3G3HA 4JWOA 3GZGA 2V93A 4F1UA 1D3KA 1LAGE 1NH7A 4F39A 2XX8A 4F2OA 4LA9A 4OTEA 1USYE 4TQUQ 4H67A 4LZ5A 1M5DA 4OFLA 1ZIUA 4TLLB 1B3HA 5TPAB 3DLNA 1QJMA 3PUVE 4WXJA 4IO4A 3KJ7A 2YLNA 5DEXB 2X7QA 1LFHA 1FQDA 2O69A 2DE2A 3IB0A 2AL4A 4GOTA 3IO6A 4PFTA 1VFEA 2HQ0A 4DXBA 3FJ7A 2HFBA 2RCBA 2VD3A 3TPAA 3V8XB 4G68A 3UA8A 3BBRA 3U72A 1DPPA 4N6PA 4BDOA 2ZNTA 4OERA 5K2XA 3R7XA 3K6XA 4U21A 2AIXA 3CSGA 3MP8A 1B3GA 1MQIA 4JWXA 3BFTA 1R1NA 1SVXB 1R9LA 3H7MA 3MUQA 4U4SA 4DE8A 4L17A 4KFQA 3O97A 4AB6A 1QUKA 4QF9A 4U1OA 4EF2A 3UORA 1OQGA 2DQVA 1JQFA 4XKQA 4U23A 2DSFA 2I4CA 1B1XA 1H45A 4KYEA 4FJPA 3KN3A 3OOAA 5I57B 4IB2A 3KJTA 4ZEDA 3ZKKA 5H8QB 2ESNA 4LZ8A 1MDP1 4U22A 5EHMA 2PT2A 2CMOA 3KN7A 1MRPA 4ONYA 4JBZA 5DYHA 2O1LA 4FATA 1B58A 2QS2A 1MPBA 3SDFA 1B4ZA 3CG3A 4RK9A 3H3GA 2QS3A 4RXLA 3VVDA 1QUIA 5FHMA 4KD5A 3K6WA 4RJZA 4U1ZA 2GH9A 4G8MA 1DOTA 4KYDA 1LGBC 4LVQA 2THIA 5I2KB 4KYSA 2ZNUA 1DMBA 4NF4A 4R6KA 3TEPA 5ICQA 2UVGA 2P2AA 2RKMA 3HHGA 5A5XA 3T9HB 4RA1A 2GFEA 4KR5A 3PV0E 2HEUA 2HXWA 4GL0A 2F6PA 3KOTA 4Z0IA 5JTYA 4IGRA 4DCXA 3CRBA 4X9TA 1ELJA 1QKAA 2F6GA 4GRKA 3WAEA 2ONKE 4HS7A 2F7BA 1JEVA 2Q9TA 2UVHA 3OMBA 4RPOA 5FTHA 4EF1A 5K2YA 4OXVA 3TTLA 3V83A 3IB2A 3VXBA 4POWA 3Q26A 4R73A 3A3UA 1B46A 1N0TA 2XXQA 4ISUA 4JDFA 3H06B 2HCAA 2XXVA 3QYTA 3B6WA 1SQYA 1FQAA 1SD3A 3EQ1A 2GRVA 3M3KA 3TQLA 2I48A 4UACA 4FIMA 1M5EA 4HCWA 5IAIA 3U92A 2M8CA 3R6UA 4PQJA 2Y7RA 4LQ2A 4QSEA 4F3PA 4ZDMA 3RNNA 2Z8FA 3UK4A 3IB1A 1MS7A 3FGSA 1B6HA 3N5LA 4O3BA 3RT8A 2NOOA 3IOVA 4FE8A 2VGQA 1JNFA 1SI1A 5I56B 4EDPA 3PD9A 1A8FA 4R75A 3TZAA 3B6QA 4H1XA 4KCCA 2O7UA 3C4MA 3IJOB 2Z23A 3K0VA 2PVUA 4LZ7A 1FTKA 1NNFA 3HCQA 4NF5B 4NF6A 2NVUB 4TLMB 3KBRA 4M1VA 2V3TA 1MQGA 2FYIA 2F7AA 3HPIA 1Y4TA 3KFMA 4YB6A 1JW1A 2XXYA 4FAJA 2XX9A 1B51A 1NNTA 2ZNSA 1UTBA 3HSTA 4ZEIA 1DSNA 4OEVA 1PDAA 5HPQA 4NWDA 3IAZA 1FQBA 2X26A 3GBAA 4GFRA 4F18A 3Q25A 4ZE9A 3S9LC 4GVOA 1MXXA 3UGWA 3OO8A 3ILUB 3C9HA 5DVIA 1LBBA 3OEMA 2H99A 4BLAA 1I6AA 2G29A 1DTZA 5JEIA 4R9GA 4F3GA 3TTNA 3W15C 4H5GA 1MY0A 4ECFA 2XXPA 3THIA 4QHQA 5H8NA 1B40A 1XVYA 3G3IA 3VVEA 4EXLA 5KCJB 2H4IA 1TFDA 5H8FA 4QFPA 3ZKLA 2ZYKA 4M4GA 2RC7A 4OESA 4X1DA 1O7TA 1B05A 3SEXA 3EN3A 4G2ZA 4QFLA 5CC2A 4ZE8A 3GBBA 4OFJA 1P1WA 3S9MC 3TELA 3M3LA 3S4UA 4ZZEA 3SEWA 3RGYA 2HAVA 2Y7KA 5BWJA 3MPKA 3PMXA 1B1HA 2NWJA 1TT1A 4DZ1A 3T93B 3O28A 4IO5A 3V89B 3QUJA 1YTVA 3S9EA 2E0SA 4ELRA 4PFUA 3CFLA 2Q89A 3G3KA 1MH4A 2QMXA 1ANFA 1MXWA 2Q2CA 1UIVA 3FXUA 1B5IA 3MQ9A 3QXMA 3VXCA 2UYFA 4OETA 3DP4A 4GXAA 5F7VA 4PFYA 1D9VA 3ODBA 2QS1A 3V5AA 2LAOA 3MP6A 4BDRA 4R72A 1D9YA 1S9TA 2FNCA 4POXA 4IO3A 1QULA 3ZS6A 3TDJA 3TTKA 2VHAA 5M2VA 1I6BA 1JW5A 2PYYA 3G3JA 5L8DA 3B7DA 4YB7A 3SEYA 2QPQA 4GXSB 1II5A 4PFWA 1NNPA 3U8QA 1MPCA 2CZLA 1USYH 3T96B 1NKXA 2W7YA 4LONB 4HW8A 1P1UA 2B65A 1B7UA 4XKRA 1MY3A 1ZBMA 4GLIA 3BKIB 4GD5A 1UTHA 4GQOA 3T9UA 2I6EA 4P0GA 3TAJA 3PPQA 5TU0A 1IXIA 2XD3A 4C1UA 1B0HA 3MW0A 2REGA 1URSA 2XXUA 2UVIA 1B5JA 3O66A 5AA2B 1Y3QA 2Z8EA 1LLSA 4NTLA 3SERA 5I58A 5TP9A 5FHOA 2QRYA 4PP0A 1ZJLA 4F22A 1PBQA 3N26A 5I59B 3TQWA 4IY5A 3KSJA 1VSOA 4DIGA 4WEDA 1N7WA 1A8EA 4BDQA 4OEUA 3FATA 1SBPA 4NMYA 5ITPA 1Q35A 2ZYOA 5KDTB 4NF8A 2F34A 3G3GA 1Y3PA 4IY6A 1D4NA 1AMFA 1XHYA 2OK2A 4LUBA 3RN8A 2E1SA 5CBSA 4G8HA 3E4RA 3K1NA 4R6YA 2AYSA 3GXAA 2XXIA 4O3AA 4OVJA 4E0XA 1LAFE 4ZS9A 3Q29A 5ELVA 1EU8A 3C34A 1LB8A 3C33A 2I0BA 3CFXA 2DVCA 1NMUA 4FECA 1URDA 4JWYA 2F78A 4I8CA 4DLDA 2DWJA 3TTMA 2I49A 1NL5A 1FTMA 2DXRA 3LSWA 1Z7NE 3K02A 3Q27A 2NUVA 3RT6B 3CVGA 1MDQA 5FHNA 3FIRA 5I2NB 1FTOA 2GHBA 1HSEA 4Q30B 4KCDA 3N6UA 4F1YA 3M8UA 2IEEA 4H8IA 3T9VA 3DP6A 4N13A 2O7IA 3K01A 4YKIA 2D21A 1UQWA 1I6QA 2D3IA 4U4XA 3FD3A 4IO6A 3KOSA 3S9NC 2PMSA 2RINA 4P0IA 1IQ7A 3CFZA 1RKMA 3OSRA 2V3QA 3GLBA 2DXYA 3IX1A 4BDLA 4FORA 5DT6A 3OO9A 3F11A 1JVXA 5AA4A 2B3FA 3MPLA 1NH8A 1OVTA 3PPOA 2F5XA 1XC1A 4R9FA 3OELA 1MM7A 3JYRA 3CI8A 3A3CA 3SEUA 4WKMA 4BDNA 2I0CA 1FTJA 1MXYA 2ZYMA 3S2VA 3FVOA 3VLVA 2H9BA 3ILTB 3KSXA 1DTGA 5ITOA 1GR2A 1XVXA 2A5TB 4JB7A 1B3LA 4DXCA 1B3EA 1LCFA 4FEBA 2XHDA 4QFKA 3HV1A 2HZKA 3USDA 3UIFA 4IGTA 4LATA 3M3FA 2OWTA 1AOVA 3R26A 3I3VA 1IXHA 2G93A 3H6TA 4YAHX 5CMBA 3AXFA 1PEBA 3IORA 3O2AA 3RUMA 1Y4CA 5TPAA 3HO7A 1MQHA 1Y20A 1IIWA 3PUYE 3CSBA 5DEXA 1A40A 5DTBA 2FA7A 5L9OA 4QSDA 1ATGA 2RC9A 2XXXA 3T22A 3KG2A 3VVFA 3FV2A 2RC8A 1R9QA 3K2DA 4G68B 4G77A 2ZMBA 1I69A 1CE2A 3SESA 4R2BA 1JVYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MVYA 1MY4A 3C31A 1T0KA 1AIVA 4H46A 5H8HB 4QBAA 1HSJA 4NG7A 3TKDA 3MZBA 1AL3A 4N6KA 3T66A 3TTRA 2F7CA 4YKJA 1EZOA 3G7WA 3TCHA 3E79A 4GWYA 2FIEA 1B32A 4O3CA 5LOMA 3TUSA 1AH5A 3LSLA 1JETA 1N76A 1YXIA 3FUZA 2XA5A 1QW0A 1FPGA 4Q8RA 5A5LA 3K1MA 2A5SA 1NUYA 3KGCA 2D5WA 5EQ9A 2KLFA 4XKPA 3SKPA 3CG1A 5H8SA 2XXRA 4X48A 5IZ3B 3K6UA 5CMCA 3HHFA 5L9MA 1SW4A 4ELOA 1M5BA 3H4ZA 5I57A 5IZ1A 2BJJX 2Z8DA 4OQOA 3MWBA 2P0SA 5H8QA 1IMFA 4PE5B 2DE4A 2BJIA 3O6IA 3L6GA 3TFLA 2DVZA 4ND9A 4H0WA 3O29A 1PB7A 4RNSA 5ICTA 1XT8A 2Y84A 3BFUA 1URGA 4P47A 3EHTA 4MNIA 4TOZA 4IO7A 3FJGA 2F97A 2ABHA 4KHZE 1OMPA 5B70A 2XD2A 4MF3A 1N3XA 3TCFA 3OO7A 1B2HA 1HSLA 5IKBA 1BIYA 3PPNA 1IMDA 2O84X 2DS9A 2R6GE 2I4BA 2H98A 5I2KA 3VLUA 3K4UA 3PTYA 1JEUA 4QSCA 4F3BA 4JXIA 2AL5A 3E3KA 4GIZA 1SW1A 1LSTA 1M5CA 4OFOA 1J1NA 1JW4A 1LBCA 4NF4B 4I9DA 2F8DA 4ZECA 5A5XB 5EYHA 4P3LA 2UXAA 5HBCA 5ET5A 1WVJA 2B3BA 1F9BA 4KQPA 2Y5LA 1N7XA 5ESYA 5JTYB 5J1DA 2CZHA 4Q0CA 2HZLA 1KA1A 1IXGA 1SDXA 5EQ7A 1A7LA 1PB8A 2XWKA 1PB9A 3P7IA 3T0JA 1BTJA 4XKNA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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