2PUKC

Crystal structure of the binary complex between ferredoxin: thioredoxin reductase and thioredoxin m
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
EVQDVNDSSWKEFVLESEVPVMVDFWAPWCGPSKLIAPVIDELAKEYSGKIAVYKLNTDEAPGIATQYNIRSIPTVLFFKNGERKESIIGAVPKSTLTDSIEKYLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural snapshots along the reaction pathway of ferredoxin-thioredoxin reductase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Synechocystis sp.
molecule keywords Ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic chain
total genus 27
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence G
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2pukC00
2H6YA 2K8SA 4OCFA 3H4KA 5DAKA 2C0GA 3QFAC 3GYKA 3RHBA 1URMA 2IMKA 5KN2A 2P5RA 3W8JA 1EP7A 1TI1A 4MK3A 2FCHA 5IO0A 1NHYA 4MZBA 1JZWA 5HR0A 1B8XA 2OACA 3CTFA 2V32A 4ZL8A 1PKWA 6GSWA 2FWGA 1HQOA 4PQ1A 5ECIB 2DJ0A 4N30A 4PURA 2CAQA 4RQRA 3A2XA 3FKFA 2H66A 3JCML 1Y25A 4NWYA 1ZCPA 2ZCTA 2VM1A 2EIOA 3ERGA 4EF0A 1AIUA 3UBLA 4NHWA 1FHEA 3LGCA 3LJRA 2MMZA 2YZHA 3IXRA 3GTUA 1ACVA 2OADA 3P2AA 1GP1A 3C71A 4MF7A 1MD3A 4TXOB 2E2MA 3ZYWA 1O8XA 3QOUA 1GTBA 2CX3A 2CZ2A 2ES7A 1VRSD 2C3NA 3VI5A 5J4UA 2BMXA 5G1KA 3BCIA 1AW9A 2N5AA 1OAZA 5DJLA 1TJDA 2HLSA 4TW5A 3RPNA 4NHZA 3KJYA 4IGJA 13GSA 1XWGA 5IM9A 3C73A 1SKSB 1GSSA 4OO5A 1OYJA 1NSWA 2VCVA 4X43A 1GL8A 3DMLA 4H86A 1RK4A 3M9KA 2LSTA 1YF0A 4V2NA 3TRQA 1XW9A 1Z6NA 5GAND 3HVSA 2N5FA 1S3CA 5DAKB 2DSAA 5CRWA 1FW1A 2H01A 1VGLA 2F8FA 2MMNA 1TRUA 2VLVA 2H74A 12GSA 2QKEA 1QFNA 5H5RA 2EC4A 4LA1A 6GSYA 3LG6A 3LFLA 3ZMKA 3GN3A 1JLWA 2DJJA 3C1SA 3E9JB 5CRDA 3IR4A 4NPBA 5JCUA 5DCGA 3FZ4A 4POMA 1FB0A 3WGXA 4KSMA 2V6OA 2GQLA 3N5OA 4TR4A 4FYCA 3H8QA 1AC1A 1Z3EA 1OC9B 2HZEA 3C7MA 1LJRA 3EU4A 2VLUA 1AQWA 2GSQA 2IMEA 1T4ZA 2N5BA 3BBYA 1VF4A 5IIZA 4KUNA 2X8CA 2MYGA 2YN1A 3I69A 1ZL9A 5AGYA 1U3IA 3TJGA 1ZYQB 1FAAA 2B7KA 3FZAA 2R4VA 1LBKA 4IS0A 1MDKA 3ZREA 4RI7A 3GRXA 2H70A 5D8IA 1Y6EA 3DVWA 5HR2A 3D4MA 3VFIA 3TGZA 5A4VA 3RHCA 4FH8A 2H75A 4G9HA 3KEBA 5D9WA 2M72A 2B3SA 2GVPA 3GSSA 2RIIA 4KNDA 4ZILA 2KP2A 3GKNA 3KTLA 5IMDA 4LLRA 2H1DA 2VL2C 4HQZA 4IJ3A 2GT5A 1A2MA 2HXKA 2OE3A 3DD3A 4JE1A 4GRFA 3HDCA 2G0FA 1QQ2A 5FHIA 1XIYA 4K0GA 3ZFBA 5H5SA 5G31A 4O32A 1M7TA 5B6NA 5J3RA 5J5NA 2YWMA 5ABRA 3GFKA 4MMMA 6GSUA 2CVBA 2FNOA 4WBJA 1ON4A 4DVCA 1OE7A 1XFLA 1OC8A 4AGSA 4MP4A 3ISOA 5KEJA 3LYPA 2VIMA 2VL9A 5HFGA 1HNBA 3VWXA 1TI3A 2JZTA 3DYRA 4RQXA 2C0DA 3DIEA 4G19A 4EDZA 4GF0A 3CXGA 1SK1A 1XWBA 2TRXA 3TRPA 2C0FA 2J9HA 3WGEA 4PUFC 4YH2A 1Z6MA 5EVOA 1OE8A 2NBSA 2FA4A 3GL5A 3DEXA 4KH7A 2NPBA 3IK9A 4EKZA 1X5DA 4IQAA 2OJLA 4ZXGA 2IFQA 1VF2A 2VCZA 1FO5A 3P8WA 2VCTA 1WIKA 1MD4A 4J57E 3D21A 2H0GA 1JZOA 3TKSE 2HZFA 3FZ5A 2H8LA 2YJHA 3EC3A 2HYXA 2WS2A 1UN2A 5E59A 5A5KA 1T3BA 1EOGA 4TR1A 2LEGA 3F8UA 1ZZYA 4LL1B 3M8NA 1YEXA 2XPDA 1V58A 5GZZB 3D6IA 1DUGA 1R5PA 1M0UA 4MZCA 3MNGA 3F6FA 4HU9A 3QPMA 1T00A 5DQYA 4V1Ag 3O3TA 5AIVA 4YQUA 4PQIA 1TK0B 2A4VA 1GSDA 1K3OA 3HZ4A 3WT2A 1VF3A 4V2LA 1TOFA 1V40A 4V1Ap 3TJFA 5DALB 5D96A 3HY2A 2WDUA 4GTUA 14GSA 2MMAA 5A4UA 3BCKA 3US3A 4KDXA 3GKMA 2HNLA 1UC7A 5KN1A 1FB6A 2HT9A 2YANA 3TOUA 3VWUA 3HJMA 4O7HA 3WT1A 4KDYA 1WWJA 1LU4A 1RQMA 2WCIA 4EXJA 4HJ2A 6GSXA 4TKYA 4ISDA 2LTKA 1JZDA 1A24A 6GSVA 4MPGA 3LORA 3FR6A 2VCQA 1OC3A 2ON5A 1O85A 3I43A 1DSBA 3TCOA 2PERA 5ECHB 5IMCA 3KMOA 4O5RA 5IPGA 2WFCA 3TDGA 4LMWA 5KN3A 2MMOA 5INYA 4MJAA 1JHBA 3IRAA 4OD7A 2B1LA 1SENA 1R26A 3DVXA 4I2TA 2JSZA 2WJUA 4HJMA 5AN1A 2C1YA 1BYEA 4POBA 2C80A 4OFNA 1U3AA 3DRNA 4ULXA 1GUKA 3LEFA 4L5LA 3NIVA 1PGTA 2H19A 1M9BA 4OFMA 4JU5A 4NV5A 2VCXA 3VWWA 1MDJA 4IP1A 2A2SA 3FRCA 3GMFA 1SYXA 2KLXA 1WP0A 4IN0A 2O8VB 1U87A 3GKXA 3UVHA 3UIWA 3OR5A 1GH2A 4Q5QA 2X8HA 2GZPA 2H30A 2O89A 3CSIA 2Z9SA 1PSQA 2B5EA 3ZVJA 2C0EA 4DSSB 1M2AA 3UBKA 1HD2A 2L5OA 3F63A 4I2UA 2LNSA 2VL3A 4PXOA 1K0CA 1TK5B 3ZMLA 2PVOC 1BAYA 3IC4A 2V6KA 4BWSA 4DSQA 3D4TA 5DQSA 2OA7A 4HZ2A 3HVVA 2FLSA 2IJYA 2CT6A 2RM5A 4KGIA 4WEYA 3LXZA 3HA9A 3F3QA 1ERVA 2YCDA 5AISA 2LKUA 4WR5A 3QR6A 1GULA 5DVBA 1A0FA 4I8BA 1R5AA 3F4SA 3EU3A 1SL1B 4WR4A 5IOWA 3VPTA 1OC9A 5HQPA 2H6XA 1WMJA 1EEMA 2YWNA 1M99A 1YZXA 1X9WB 4V2MA 4KCEA 3U6VA 3M0FA 1HNCA 3FK8A 1AAZA 4BWQA 3GHAA 2AUVA 2GQMA 3H1NA 3KZQA 5CNWA 3LYKA 1IYHA 5C04A 2B6MA 3G7IA 3HZ8A 5ECQB 4AF2A 1ABAA 2PVQA 3CSJA 1V2AA 4L8EA 3QCPA 5G5FA 1SYRA 2GZZA 2HSHA 2LS5A 3CBUA 1SL2B 3HJPA 3LQ7A 3CRTA 3TKSC 2R2JA 5H5QA 3V1WA 4I6XA 5LNKe 1GSYA 18GSA 1XWKA 2WZ9A 4NV2A 4AJ7A 4ML6A 2E7PA 1K0DA 1I9DA 2FUG2 2L57A 1X9SB 4WETA 2QGVA 2GTUA 1M2BA 4Z7XA 2LV3A 2NVLA 1PX6A 2K6VA 1QGVA 1ST9A 5L71A 2R5GA 2PWJA 2DJ1A 4ZBDA 1YKAA 2OBKA 2JZRA 3KTBA 5IQYA 2FWHA 2P0GA 1T4YA 3C1RA 2FWFA 4N0ZA 2GGTA 3CYNA 1BJXA 2IMDA 2CV4A 2MBTA 1YJ6A 6GSSA 2HRFA 1WPIA 1PD21 3GX8A 1EGOA 1XW6A 3A3TA 3E3EA 3KD0A 3A2WA 1THXA 1TK8B 5IMAA 5JWQB 3ZL5A 3NOFA 4JZQA 2GLRA 3TKPA 1C72A 3IPZA 2JZSA 2V1MA 1ERTA 1TU8A 4PQHA 2I81A 3SWLA 3FR9A 3TJKA 3HCZA 5GAPD 4PNFA 5COHA 3A5WA 1CQGA 5G2ZA 3ZVJD 2X8GA 4ID0A 2M80A 1GSQA 3CSHA 2PBJA 4HI7A 3ERFA 1YEPA 2PU9C 4PNGA 2OE1A 2PPTA 4K7IA 1ERUA 1XWCA 3D5JA 2K8VA 3FW2A 4NXIA 2YJ7A 4NAXA 2JACA 3E0UA 2FY6A 2K9FA 3UEMA 3IV4A 3GIXA 3M9JA 1OVNA 2B7JA 2B1KA 2C8UA 1B4PA 1S3DA 4RUVA 5AIXA 4YQMA 1GLPA 3VPQA 2I9HA 2DBCA 4TR3A 2LJKA 3EURA 3BJ5A 2VAFA 4TOPA 2FA8A 2BTOT 2G2QA 1SJIA 2NTOA 2LRNA 2EIQA 1TU7A 2IIYA 3UOMA 1GWCA 2IWTA 3L78A 4K7OA 5DALA 5ID2A 4ML1A 5ECPB 2DLXA 2GSSA 1XZOA 3KP9A 4MZWA 1N8JA 3D22A 3QDNA 2RM6A 2YZUA 5CRGA 2AYTA 2XBIA 1E2YA 3Q6OA 4EVMA 5CYYA 1G6WA 1Z5YE 2HE3A 4MA9A 1PQNA 2JADA 2GS3A 4ZBBA 1THOA 1PL1A 4ZB8A 3IA1A 2OE0A 3EWLA 3HXSA 1SKRB 3QAWA 2L5LA 1ML6A 1W89A 1PN9A 1YDKA 4ZB6A 1YF1A 3GURA 3KIJA 3RPPA 5DJMA 1OKTA 4GWRA 1N2AA 3DXBA 5ELGA 4ZBAA 1M9AA 2DJ2A 1G6YA 3QAVA 2LRCA 2F3MA 2AB6A 4BVXA 1ZMAA 4POKA 4KW6A 3ZLPA 3L9SA 1F2EA 3GNJA 3UMAA 1I5GA 4NMUA 5ECRB 3K8NA 4EDYA 2AAWA 3ZIVA 2AJQB 3MDKA 3HJOA 1TRWA 5ECKB 3U5RE 3Q74A 4Q5RA 2GQKA 4YAPA 5D9VA 4MH3A 1K0MA 5J9BA 2LRTA 5GSSA 2HI7A 1A0RP 1HYUA 1YQ1A 4DSSA 2LQQA 1FVJA 4KDUA 9GSSA 4MF6A 5E4WA 5ECOB 4G10A 4L5OA 1GTAA 2QSIA 4HUAA 1XVWA 3HVXA 1F3BA 2VL2A 1K0AA 3C8EA 3EYTA 2VM2A 1BQ7A 5CAXA 5ID2B 1DBYA 3NZNA 2DIYA 2X64A 5EPFA 3UARA 2PN8A 4TVEA 2LUSA 1Q4JA 2WRTA 4ZIJA 1SL0B 2LJAA 1R4WA 4BA7A 7GSSA 4CW9A 4K2DA 1XBSA 2BJXA 1O8WA 2RUEA 4F9ZA 2KHPA 16GSA 4XRDA 2VUPA 2P5QA 3FZ9A 2F51A 2GDRA 2DMMA 3EE2A 2B5YA 1TTZA 4OWYA 4FYUA 3GH6A 3KCMA 1K0NA 5F8BA 1EP8A 3F9UA 3TOTA 2LNTA 3MAKA 2L4CA 5LD0A 1SD8A 6GSTA 4WXTA 3LXTA 2VLTA 1HNAA 3LSZA 3APQA 3EMXA 2HSYA 2J23A 4F2IA 2VCWA 1ZOFA 3Q18A 1V98A 1TDIA 4WF4A 1SK2A 2L59A 4GXZA 4ECJA 1W4VA 1XVQA 4QQ7A 3APOA 1SU9A 3GSTA 1G7EA 3IBHA 3ME8A 2H76A 1SJ6A 3WGDA 4TRXA 2C3TA 3PR8A 4POLA 4BL7A 3GV1A 3GH9A 2PGTA 4DSRA 1OKDA 3ERWA 4AJ8A 4F0BA 1A2LA 2YV9A 4OCEA 3M1GA 4JR4A 2DJKA 11GSA 4FYBA 3G9BA 2L6CA 2TIRA 4XIHA 2MBSA 2D2ZA 3FHKA 1RW1A 4KCAA 1AXDA 2FD3A 1UA5A 3PH9A 4TR0A 4EE0A 5IPHA 5ENUA 2R3XA 1TRVA 1CQHA 1SD9A 2H73A 2WB9A 2OBIA 1DE1A 1KEBA 4ZB9A 2E0QA 1XPVA 5JWOB 1A8YA 1QK8A 5DDLA 4XCSA 3ME7A 1EZKA 3UJ1A 4HEA2 3WYWA 3KP8A 4KE3A 4PGTA 4KX4A 5A4WA 1T1VA 3GL3A 1A8LA 2KP1A 5JWRB 2H1GA 1NHOA 4MJEA 1GRXA 2CQ9A 1G0TA 3QD9A 5D93A 2YWIA 1KNGA 1TW9A 2R6KA 2B5XA 4YAVA 4ZL7A 3KH9A 4IVFA 2V2GA 1Z7PA 2YP6A 4XS6A 4KAEA 3SBCA 1X9MB 1GTIA 5ELAA 3M3MA 3IAM2 5IMVA 5JCGA 3ED3A 1QUWA 3QAGA 4MABA 3CMIA 2RUFA 2F8AA 3HKRA 2IN3A 1PKZA 1T8EB 1QMVA 3TB2A 2I3YA 3IE3A 5DBQA 1XOAA 3UAPA 4EO3A 2VOCA 4KA0A 5LCZA 4G2EA 4GSSA 3F4RA 3ZZXA 2E2GA 3VLNA 2KOKA 3D0ZA 4WKWA 1V9WA 3J7Yk 2GZYA 4FO5A 3FY7A 4K0NA 4GSNA 3KXOA 2HRNA 2FGXA 3HHVA 4E8HA 3WD6A 2GSRA 5IMFA 1FOVA 3G7YA 1XOBA 2TRCP 3O76A 2H0HA 4IQ1A 3CTGA 3I6AA 1ILOA 3QFBC 3BD2A 5J41A 1TKDB 3HYPA 5D73A 5B6MA 4IKHA 4XHMA 3TKRA 1JLVA 1K0OA 2CX4A 2QC7A 4KSOA 3ZRDA 3IHQA 2ALBA 4CHSA 3QMXA 5HR3A 1AUCA 3PGTA 4K6XA 4P3YB 2DIZA 8GSSA 3O6TA 1BX9A 2CVDA 4MLYA 3P7XA 1H4OA 4Q5NA 4OFTA 4L0WA 1GTUA 5B8BA 1O6JA 1FG4A 1XCCA 1XXUA 4MPFA 3HD5A 2VD1A 4N10A 4IJIA 1S3AA 4HS1A 1KBNA 4I97A 4X0XA 1Q98A 4MCUA 4MJCA 1PA3A 1B9YC 1USBA 1F6MC 5F0GA 2VD0A 3TJJA 4IELA 5IOXA 4IHUA 1AQVA 1X5CA 4JR6A 1K0BA 5ECLB 5KN0A 2VO4A 1QXHA 4RI6A 1GUMA 2FWEA 2NDOA 3H93A 1NM3A 3Q19A 5HFKA 3GTUB 1J08A 1EOHA 3LWAA 4WBRD 3W6GA 1ERWA 1WE0A 1JZRA 1E6BA 4WF5A 2F9SA 3TKSA 4O92A 3BOAA 2P31A 1A2JA 3APSA 5EY6A 1PRXA 4GQCA 1SKWB 3ZITA 5JCWA 1UVZA 4MF5A 20GSA 1X0RA 1FVKA 1PX7A 1PL2A 1YKCA 3EMPA 3MSZA 1IYIA 3L0HA 5FT3A 4EC0A 3A2VA 2JU5A 4N11A 4D73A 3F0IA 3GX0A 3ZIJA 1SK0A 3F3RA 2O87A 1B48A 4ZL9A 4J2FA 2L4QA 1ZGNA 4JRRA 4XRAA 1M2DA 4ACSA 4BPYA 5D9XA 2CVKA 2YPMA 2PUKC 1EGRA 1MDIA 1XW5A 22GSA 5HR1A 4F0CA 3EVIA 4IP6A 4MDCA 2GT6A 4PX1A 3R2QA 4XS4A 4HDEA 4XTSA 5HFIA 1K3YA 2OKAA 4QL7A 3CRUA 1GSUA 3KGKA 2HFDA 4F82A 2YOIA 1TRSA 2FHEA 2IMIA 5FWGA 1O7UA 4EUYA 2EIRA 2MZCA 2RLIA 2DC5A 1V57A 3N9JA 1WOUA 1GNEA 3L9UA 2JL4A 3UL3A 1AQXA 2K18A 3RDWA 3TUEA 3VI7A 1EV9A 2HZEB 3FYGA 3UVTA 2M46A 4EL1A 4HOJA 4GSTA 4QL9A 3TKQA 1EEJA 1WJKA 1O73A 1GNWA 4FIWA 1BG5A 2C3QA 2CZ3A 1YY7A 1PMTA 2L6DA 4GQFA 4KB3A 5CREA 4HU7A 4E8EA 2CA8A 2R37A 1U6TA 2C4JA 4GCIA 3AY8A 1ZYEA 5ECMB 5IMZA 2DMLA 1F9MA 5G30A 2XBQA 3L9VA 1DE2A 3IAS2 2O85A 1X5EA 2ZNMA 2H0IA 5G1LA 1MEKA 3F4TA 4TXVA 2PMTA 1U88A 2AV4A 3TRXA 1T7PB 4F03A 4BVYA 2A2RA 1A23A 2CAIA 4LL4B 2YNXA 5F05A 4OO4A 3IOSA 4XS1A 5F06A 1GSFA 2I4AA 2IMFA 3DKSA 3GKKA 3KMNA 4IBPA 1B4QA 4D73B 1Z9HA 5CO3A 4PUAA 4LMVA 1EV4A 3MWHA 4MH2A 1Z7RA 10GSA 3ZTLA 5IO2A 2X99A 2WULA 1BEDA 4AJ6A 2H1BA 1F3AA 4ECBA 1F37A 4OMVA 4K1FA 1GUHA 4IW9A 4J56E 3RAZA 4XS4B 1B9XC 2YV7A 3GUSA 1K3LA 3DWVA 4I5QA 1J0FA 1NW2A 4JEDA 5F07A 2LJRA 2H1AA 3FEUA 4ECCA 2H71A 4X1UA 2XPEA 4K7NA 1KTEA 5C00A 4YQVA 2ON7A 4L0UA 3VURA 5B8AA 1VF1A 5DCHA 2REMA 5GSTA 2KUCA 1O81A 1TP9A 1R7HA 4JBBA 1EWXA 4MJBA 4ILFA 3VK9A 3GA4A 4HZ4A 2V41A 2AHEA 3PINA 5EL8A 3W8SA 1TXXA 4Q5FA 4TXOA 17GSA 4N0VA 4CDOA 3I9V2 3KM6A 2JSYA 3J7Yb 19GSA 1WRYA 2IFQB 3H79A 4TN8A 2I1UA 2XC2A 1H75A 3VWVA 1J9BA 4K9ZA 1MTCA 5G5EA 5CRHA 3S9FA 3IDVA 2ZUPA 4ECIA 5B7CA 3ZFLA 3RBTA 4DEJA 1SJZA 1G7OA 5ECSA 4TR1B 4HQSA 2IPAA 2IL3A 5D9TA 2YWOA 2GSTA 3P90A 2H72A 5J9CA 3F6DA 2O7KA 3IK7A 2XHFA 3L4NA 3DGQA 5ECNB 1JFUA 3TJBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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