2Q1ZB

Crystal structure of rhodobacter sphaeroides sige in complex with the anti-sigma chrr
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
193
structure length
185
Chain Sequence
TIRHHVSDALLTAYAAGTLSEAFSLVVATHLSLCDECRARAGALDAVGGSLMEETAPVALSEGSLASVMAQLDRQIADPRAPAPLADYVGRRLEDVRWRTLGGGVRQAILPTGGEAIARLLWIPGGQAVPDHGHRGLELTLVLQGAFRDETDRFGAGDIEIADQELEHTPVAERGLDCICLAATD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A conserved structural module regulates transcriptional responses to diverse stress signals in bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RpoE, ECF SigE
molecule tags Transcription
source organism Rhodobacter sphaeroides
total genus 36
structure length 185
sequence length 193
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF12973 Cupin_7 ChrR Cupin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1320 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 2q1zB01
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2q1zB02
1V70A 2XLAA 1WGPA 3I59B 2IC1A 5FPZA 2VECA 2H6CA 1CAWB 2HJIA 4ONUA 1LR5A 4IEWA 4UXAA 4XF4A 4O9EA 3U10A 4HSJA 2PYTA 2GZWA 1Q5OA 3DN7A 3SXWA 4LTAA 2UY9A 1J59A 2IXCA 4HBNA 3BPZA 3SCFA 4Q0UA 2PAMA 4XF0A 3MZHA 1X82A 5J3UA 2O8QA 3OD0A 4XFBA 4ORFA 2Z2SB 4HVOA 4FAHA 2BEOA 3PNAA 1CAVA 3TNPB 4UBGA 4Z82A 4QM8A 4XFFA 2GC2A 1O3SA 1IPJA 4AQ2A 4Q0QA 1LB2A 2MHFA 4FAGA 1FXZA 3N4MA 2OA2A 3CL1A 1IPKA 4XFIA 5JCTA 5I93A 2H6BA 2PTMA 5BV6A 5AVPA 4H7LA 3KMHA 4KU7A 2Y0OA 4KL1A 5K8SA 1DGWA 1ZREA 4IEZA 3RZZA 1WLTA 4IERA 3SMHA 4FT8A 5JSOA 1Y9QA 4HVQA 4QX5A 2O1QA 4ZU4A 1RGSA 2OZ6A 1YUDA 3LOIA 2VPVA 1U12A 3E6BA 3O14A 4N9IA 2KXLA 3IWZA 5I8YA 4KWLA 4EV0A 3FJSA 1NXMA 3PLQA 5E16A 2HKXA 2PA7A 5EFUA 1ZZ9A 3BALA 1ZZCA 2Q1ZB 5C8WA 2IXLA 3DL3A 4MX3A 2H0VA 1EY2A 3IBMA 5FQ0B 1YWKA 1ZRRA 2QCSB 2QDRA 2FMYA 5CADA 2QVSB 4IEPA 4B29A 3U0ZA 5FPXA 1SEFA 2OYZA 4I09A 2BNOA 4I0BA 1YHFA 1J58A 4I2OA 3S7EA 3ST7A 3BU7A 4IEQA 1QXJA 3KCCA 3G7DA 4K8FA 3M70A 3B02A 3EO6A 2WC2A 3ACLA 1XE7A 5KHHA 4Q29A 5JSRA 5BUVA 4QGNA 3NVCA 4AVCA 2GC3A 4LEJA 1OFNA 3OF1A 1J1LA 4PIZA 5BY5A 2QNKA 1YLLA 2GC0A 4XFHA 2CAVA 1UPIA 2OPKA 4P9GA 3EHKA 2MNGA 4E2SA 3E5QA 1LRHA 3CEWA 2N7GA 3HQXA 2PHDA 4Q0SA 4HN1A 5F1RA 1YFXA 3LWCA 4JTOA 3S7IA 1X8EA 1EPZA 3LZZA 4L11A 2I45A 3I54A 4OFGA 1PMIA 2GU9A 4I3PA 3RYRA 1YFWA 4XETA 2EAAA 4NQWB 5D1IA 1UW8A 3NL1A 2IXIA 2WFPA 3CJXA 3H7JA 1QWRA 4QM9A 3UKNA 1RUNA 2CV6A 5BPXA 1LKNA 3FFQA 3RYKA 2Z69A 1YFUA 2EVXA 1UIKA 2D5HA 4E2QA 3UKVA 3MYXA 3EQEA 1O4TA 3MDPA 5JAXA 1Q43A 4Q0PA 2QJVA 4HN0A 1O5UA 2XKPA 4DINB 4J1WA 4R52A 4WZCA 4D7TA 1J3RA 2ATFA 2IXJA 1CAXB 2UYAA 2XHKA 2ZKLA 3M3IA 4CYDA 3DV8A 4MUVA 3IDCB 1DGRA 4I01A 4PIYA 4LUMA 3DKWA 1NE4A 1NYWA 4EROA 2Q30A 1YFYA 3WW1A 4FBFA 3SHRA 4X6QB 3GYDA 3E5UA 4NVPA 1ZX5A 4XFAA 2BYVE 4LLOA 1WA4A 1VP6A 2B8MA 1UD1A 3QOPA 2CGPA 2VQAA 3LA7A 1TQ5A 3E6DA 2BNNA 4YYOA 4YSFA 4RD7A 1CAUA 3PVBB 4XFCA 1J3PA 4IEOA 2ET7A 4XEZA 4I02A 4QGMA 2K9ZA 3SCHA 2PAKA 5T3NA 3ES4A 1ZRCA 1O5LA 5J48A 3I7DA 1CGPA 3HIFA 4HZFA 1ZZ7A 5KHGA 5I0SA 1CAVB 1RTVA 3H3ZA 2IXHA 2Q4SA 3SCGA 1X8MA 3ZDSA 5HI0A 3I59A 5I91A 1QXRA 4JTNA 2ET1A 5I0UA 3MPBA 1CAWA 4IEUA 2GAUA 1X7NA 3EJKA 3KGLA 2B5HA 5KBFA 3FHIB 1Q3EA 1O7FA 1FI2A 5KHKA 2OZJA 3GBFA 1GQHA 2D93A 4AVBA 2ZCWA 3L2HA 4YARA 1PM7A 1EP0A 2MPFA 4X6RB 4EWAA 2P17A 4L2NA 3KSCA 4WBBA 1NE6A 2DCTA 3NSTA 3BB6A 2EA7A 1RUOA 4IEVA 3HT2A 3LAGA 3H1MA 3HT1A 1ZRDA 1FT9A 2D40A 4D7SA 4Q0VA 4YRDA 5JR7B 5I8TA 4I0AA 4LA3A 1H1MA 2XKOA 4BHPA 4GULA 2PQQA 4F7ZA 2UYBA 4IESA 4QMAA 3UKTA 1SQ4A 3USSA 3D0JA 4ZU7A 3OCPA 4YNIA 1O3RA 1OD5A 2CAUA 4LA2A 4MH0E 4XF3A 4XFGA 4Z07A 4OLLA 5EZWA 3H7YA 1DZRA 3R6SA 3ETQA 4MV2A 4R8HA 4MGYE 3H9AA 3QACA 4EWDA 3S0MA 3NJZA 2IXKA 3LA2A 4IETA 5LEJA 4TLFA 4QGLA 1HW5A 5I0TA 1UCXA 5E1RA 3NKTA 1OI6A 4LUKA 4AQ6A 4AXOA 3WW3A 5LEKA 3HUGB 1ZZ6A 4HSLA 2E9QA 3FZ3A 1ZNPA 1CX4A 1VR3A 5FQ0A 5FLIA 4PIXA 3FX3A 3FWEA 1XE8A 2PAEA 2Q0AA 4XF1A 2GC1A 5I0RA 4QXKA 1I5ZA 1QY4A 4KWJA 4MGZE 4J1XA 1RC6A 3OGJA 4N9HA 5LRRA 3WW4A 5I8SA 1O3TA 1DZTA 5KHIA 3RYPA 2K0GA 4BYYA 3D0SA 2D5FA 3BCWA 2BGCA 3E97A 3U11A 3E5XA 4PJYA 3VHRA 2PHLA 4MZUA 4AVAA 2XLGA 5CU1A 3IIAA 5LRSA 3TNQA 5FLHA 1JUHA 4JV4A 4KWKA 1O3QA 3H1YA 3RPQA 5FCCA 1G6NA 4E2GA 1ZVFA 4META 5KHJA 4MGKE 5BXXA 3RDIA 5CVRA 3JZVA 3RNSA 5FDBA 1EYBA 2FQPA 4O9GA 2BNMA 3ES1A 4KU8A 4UBHA 3CF6E 1NZCA 5JSPA 2GH2A 5J7MA 3CLPA 2XGXA 3NW4A 4LULA 1L3JA 4IEXA 1ZZ8A 1UIJA 2V09A 4JVAA 5FLJA 4IEYA 2PFWA 2ETEA 1Y3TA 3OTFA 1J3QA 3E6CC 4XF9A 3ROUA 3IDBB 3H8UA 2B9UA 1ZRFA 3H1WA 3KGZA 4WVZA 3ELNA 2XL9A 4HVRA 4HMZA 5C6CA 4EWEA 1RL3A 3WW2A 3D82A 1OMIA 1ZZBA 1I6XA 3LA3A 4BH9A 4MGIE 1CAUB 3CO2A 1CAXA 3H3UA 2UY8A 1GQGA 4A2UA 1H1IA 2C0ZA 1SFNA 1XRUA 4ZU5A 4BIFA 2XLFA 1VJ2A 4HLTA 3C3VA 2F4PA 2XL7A 3FE5A 4F8AA 3EBRA 3H50A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NRVA 2ELHA 3HBKA 5GAHJ 1ENQA 2BW3B 3CP8A 1WKYA 1KFXL 4HSJA 2VN2A 4FHTA 3BOPA 2FF4A 1SLCA 4M3CA 2PHTA 5EZHA 2VOOA 4WVWA 2DPDA 4W65A 1MBKA 4TXWA 3TGNA 1YO5C 4ORFA 3BTAA 1KU3A 1SBDA 2VOXA 4IL6C 3I56I 4AQ2A 2MH9A 5FLVA 1UMQA 3OYCA 3MLKA 1QJX2 2PTMA 4G9SB 4BHBA 5JVVA 3ZYPA 1RINA 2HVQA 4HDVA 5DUUA 3C2UA 4ENMA 4YPJA 2PMZN 3K4AA 4QDRA 3WDTA 4ABZA 4IHYA 1MD0A 3VBHB 5E3LA 1YUDA 2VPVA 1JUPA 3IWZA 5I8YA 1SAUA 4Q1RA 1SVMA 3HOUJ 1PNFA 3UESA 3A0NA 1Z6TA 3KP4A 2OBPA 3L2RA 4GJYA 2Q8CA 4LLLA 2DF7A 1A5JA 3WD5A 4RA0A 1WZ2A 3OYIA 4H7MA 4E4SA 4R9AA 3ABZA 1W0PA 2VW1A 3S7EA 2F5EA 5BMZA 2EIEA 3IMMA 1TZLA 2DMUA 4H14A 3K2OA 3FHZA 4QPIC 1PGL2 3DKQA 5EZGA 5D8AB 3TN91 1JYTA 3ZXLA 4Z2YA 3ABTA 5L3GA 3LDKA 6PAXA 4HN1A 3NV4A 1ENRA 3JD72 4OMCA 1MNMC 5K0UB 3K51A 5DUWA 1YI7A 2SBAA 4FQZA 3ZDVA 4OFGA 4GD4A 4QPIA 2HEOA 3NJXA 1S72I 1F5FA 1DP3A 3DBLB 4I76A 5JOZA 4I98B 5JIAA 4IQPA 3AL0C 2JIJA 1RXFA 3UKNA 5LW9A 2X9DA 2BOLA 5HLHA 3CMAI 3RYKA 2YY1A 3D1NI 5A3UA 2XRNA 2DUOA 3CMYA 3OEBA 5L9RA 3BOQA 1ETQA 1L7LA 2ZHMA 1W0OA 4HETA 1V6IA 4HN0A 4CPBA 1CJPA 2W87A 1UOGA 4Y1XA 5A7NA 2R1BA 2R7WA 5J8FA 1IW7F 2XHKA 1W2NA 2OD5A 1VQOI 4OUSA 2NS7A 4HNTA 4I01A 2I8DA 4RBOA 5DUVA 2Y9ZA 1UY2A 4AQTA 3FHAA 1ZK8A 3M8JA 4BQNA 1ZX5A 3T8TA 2PN5A 5JI9A 1LFBA 3ALQA 4LLOA 3FLRA 2GA1A 2XJVA 1MIJA 1ZKGA 1SFEA 3Q9OA 2IXSA 1TMF3 1WVRA 1G3SA 3PUHA 1PYVA 4CA0A 1FOXA 1CGPA 3OV8A 5AC93 5BPDA 2E7AA 3ME2A 3WZ1A 3DEUA 3IHUA 4UB6C 5I0UA 2VU9A 1XCBA 3ZN5A 5IT9K 2GAUA 1VBD3 2NM1A 2P6HA 5KBFA 1LOAA 2RV8A 5FJHA 1UMHA 2X09A 5GJ6A 3KT1A 4FSJA 2YFUA 4EWAA 4LO7A 5G05L 4AD9A 4S2GA 3HOXJ 3EXUA 3O2PE 1OJLA 2QQOA 1W8WA 1W9WA 4W8JA 1R5GA 1TWHJ 4B8EA 4FXKB 5A7WA 2P1BA 1W7PD 2DWRA 4GULA 2PQQA 4F7ZA 2Z4FA 4IESA 1ZGJA 3N9MA 4N43C 3I49A 1H1AA 4MTEA 2LH9A 5FKLA 4CDWA 5GM0A 3E1F1 1DZRA 1XC5A 4QPWA 2M45A 4WVVA 1W5TA 1HC8A 4G7OF 3NJZA 1BN5A 1U5IA 2ENRA 4OMYA 3ZFEC 3ABKH 2XVGA 3R4DB 4QXCA 4AXOA 5H20A 4AUXA 4JAAA 4XTPA 1GWMA 4ZYGA 1OLMA 4HSLA 3FZ3A 1RUI1 1ZA4A 5FPLA 2ISYA 5FQ0A 2YU1A 4RS8A 4FTEA 4V1PA 3U1KA 4PLNA 1CR7A 1SD5A 2Y69H 2VULA 1B59A 4XMIA 3A23A 5EF6A 4N7UA 5GZCA 5C7GA 5KWRA 1H2KA 4L0PA 4FCAA 3PNYA 3TB0A 5JI7A 1R1VA 1O57A 1WCMJ 4JQTA 2BTVC 3OYBA 3WX5A 5C71A 2EB7A 4MZUA 1ZG1A 5AC92 4JX5A 2CGOA 2ZGMA 2GOMA 3TNQA 2EK5A 2HYJA 1D3YA 4WVMA 1X58A 3AG2H 4HF0A 2EV6A 4IJAA 1VBD2 3BR1A 2QVOA 4P14A 5FDBA 1XS9A 1XTAA 2O8OA 1BOAA 1Y56A 4XILA 3DTEA 4ZDLA 5GLVA 5C5UA 1YQAA 4JHZA 2XJQA 2CY6A 4XONA 1LHVA 2CQ7A 3FBIB 4LFUA 1GNZA 4ENKA 3OTFA 1EH8A 5FZHA 2DT7B 2R7XA 3ROUA 1W5SA 1LEBA 5FMDA 4QPOA 1VQ5I 4WVZA 3P6BA 2IBDA 4LBQD 4WXCA 1F2NA 1RUC2 4RLQA 4XABA 1SFKA 4K1YA 1JXNA 3KZYA 2D6OX 4H3WA 5B66C 4AI2A 1AZDA 2XRLA 2HDCA 2D6PA 2A6ZA 3I55I 3REOA 2PXJA 3JCIA 4HZFA 4ZY9A 2K7LA 2D1HA 1TWFJ 1UZWA 4E7LA 4UUSB 4P1WA 5EXOA 3CBNA 4O5VA 4BK5A 3I3BA 1JHJA 2CRGA 4OI4A 3WODF 2QDNA 3MO4A 3KP6A 2J1SA 2Y38A 1S7EA 3SH5A 1D1AA 2ZNZA 4XLCA 2IP2A 4BJ6C 1IPKA 3CJIB 4IE4A 1U8RA 4X1EA 1G4DA 2RE9A 1HDPA 1W8UA 1BJZA 4CZCA 3O1PA 4FFGA 4QT6A 3H36A 4FT8A 1EJ9A 3VBRB 1JKPC 3ZFGB 2QQ8A 1LULA 4C91A 4K8RB 4ZU4A 2EALA 1UG0A 3HD8B 1KQ9A 2PHFA 3BR3A 1ITYA 1IRXA 2DXIA 2JA7J 3PIJA 1FJLA 4LHNA 3P1IA 3AMHA 2JDPA 3DWLE 2DAOA 4YW5A 2MD5A 1N75A 2DDUA 2F2EA 5CIRA 4MX3A 1T6SA 2UZKA 1WJEA 5DD4A 4BHCA 1YWKA 2CUFA 3DYMA 1W7PB 4BQWA 5L3CA 3UK9A 1IG3A 1RUD3 1ULCA 4NOTA 1RKTA 2BNOA 4I3GA 1V6NA 3VBSA 5B4NA 4Y5Z0 1GHCA 5LGNA 5JOYA 2K3FA 4XXPA 3HUGA 5DV5A 4OYUA 2JG8C 3ONQA 4LEJA 1B9NA 4GMP0 4CDQA 1LOGA 5FP3A 3JTGA 4IRGA 5C9AB 3QCWA 4Q4Y3 1UPIA 3EPZA 2JA2A 2X53S 2DFIA 2JE8A 2JTVA 1XGMA 3OYFA 1QZYA 3W59A 4HPKA 3KB5A 2OT7A 1BQPA 2W1QA 2R30A 5EYYA 2Y0MA 1G9DA 2ZGOA 4P08A 2EFNA 5HLGA 2A6XA 3OB8A 2PMHA 1WW4A 2PX9A 1KQ0A 4Y1UA 5F6FA 4LO5B 4SLIA 4NAMA 5BNNB 3RJPA 1RR8C 3KPHA 2WT0A 3GTQJ 4GMP1 4TWTA 4CDXC 4A0ZA 4D0QA 2H94A 4XJUA 4EN9B 3J7ZI 1E0EA 5FY8A 3KD4A 3CMGA 4Y1VA 3P3NA 1VBC1 1AOYA 4OAYA 4XLEA 1D5VA 3EQEA 1ETKA 1XNDA 3WU0A 2CMPA 2VMEA 4W4ZA 3BY6A 3ZQCA 5K5QA 4YFXF 3EDPA 1IQDC 1AYN1 2VKHA 4DINB 3O1MA 4CGZA 4RAYA 3LPGA 4FPFA 2ZXHA 4CDXA 5EJ1B 5BOXA 1REFA 4QQOA 1ONAA 1NQJA 4BB3A 3T3YA 2NXNB 1EUTA 4NHXA 2X5IC 2TEPA 1VP6A 2B8MA 3J7AY 1HXS1 1U5TA 2V5YA 3S2DJ 1UX7A 1GOGA 1MQTA 1G8WA 2AO9A 2D2WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1V70 A;  2XLA A;  1WGP A;  3I59 B;  2IC1 A;  5FPZ A;  2VEC A;  2H6C A;  1CAW B;  2HJI A;  4ONU A;  1LR5 A;  4IEW A;  4UXA A;  4XF4 A;  4O9E A;  3U10 A;  4HSJ A;  2PYT A;  2GZW A;  1Q5O A;  3DN7 A;  3SXW A;  4LTA A;  2UY9 A;  1J59 A;  2IXC A;  4HBN A;  3BPZ A;  3SCF A;  4Q0U A;  2PAM A;  4XF0 A;  3MZH A;  1X82 A;  5J3U A;  2O8Q A;  3OD0 A;  4XFB A;  4ORF A;  2Z2S B;  4HVO A;  4FAH A;  2BEO A;  3PNA A;  1CAV A;  3TNP B;  4UBG A;  4Z82 A;  4QM8 A;  4XFF A;  2GC2 A;  1O3S A;  1IPJ A;  4AQ2 A;  4Q0Q A;  1LB2 A;  2MHF A;  4FAG A;  1FXZ A;  3N4M A;  2OA2 A;  3CL1 A;  1IPK A;  4XFI A;  5JCT A;  5I93 A;  2H6B A;  2PTM A;  5BV6 A;  5AVP A;  4H7L A;  3KMH A;  4KU7 A;  2Y0O A;  4KL1 A;  5K8S A;  1DGW A;  1ZRE A;  4IEZ A;  3RZZ A;  1WLT A;  4IER A;  3SMH A;  4FT8 A;  5JSO A;  1Y9Q A;  4HVQ A;  4QX5 A;  2O1Q A;  4ZU4 A;  1RGS A;  2OZ6 A;  1YUD A;  3LOI A;  2VPV A;  1U12 A;  3E6B A;  3O14 A;  4N9I A;  2KXL A;  3IWZ A;  5I8Y A;  4KWL A;  4EV0 A;  3FJS A;  1NXM A;  3PLQ A;  5E16 A;  2HKX A;  2PA7 A;  5EFU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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