2Q2AA

Crystal structures of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein artj from the thermophilic bacterium geobacillus stearothermophilus
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
b'SSGGDGGATKKKVVVGTDAAFAPFEYMQKGKIVGFDVDLLDAVMKAAGLDYELKNIGWDPLFASLQSKEVDMGISGITITDERKQSYDFSDPYFEATQVILVKQGSPVKNALDLKGKTIGVQNATTGQEAAEKLFGKGPHIKKFETTVVAIMELLNGGVDAVITDNAVANEYVKNNPNKKLQVIEDPKNFASEYYGMIFPKNSELKAKVDEALKNVINSGKYTEIYKKWFGKEPKLDRLKQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures and mutational analysis of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein ArtJ from Geobacillus stearothermophilus. Implications for interactions of ArtJ with its cognate ATP-binding cassette transporter, Art(MP)2
pubmed doi rcsb
molecule keywords ArtJ
source organism Geobacillus stearothermophilus
molecule tags Transport protein
total genus 80
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2q2aA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2q2aA02
1AH5A 4PFUA 4DE8A 1UIVA 1ZLQA 2A5SA 4R72A 2A5TB 1QUJA 3MUQA 1H44A 3PMWA 4KPTA 2QSXA 2OLBA 3T9VA 3OO6A 4F3GA 4YKIA 3AXFA 2OZZA 1N3XA 3S9LC 1PEBA 5ITOA 5ISUA 2KLFA 5TU0A 3ODBA 4TQUQ 3CFLA 3A09A 1RYOA 3KJTA 2XXHA 1B5IA 2V93A 2QL3A 1MXVA 4OHNA 3TELA 5ELVA 4LUBA 2ZYMA 3K6WA 1PB8A 5LOMA 3FVKA 3LSLA 5AA2D 1LB9A 1R9QA 1PBPA 5CI5A 5I58A 4XKPA 1B0HA 4JBZA 2XXUA 4H5FA 2UVGA 3U93A 1VR5A 1FTKA 1POTA 2DOJA 4NEDA 1B3HA 4QFOA 4DXCA 4RJZA 4OEVA 3DP6A 2NWJA 1RYXA 1B6HA 4X9TA 3MP8A 4DXUA 2F6GA 5DVJA 1URSA 5AA4A 4OESA 2RINA 3VDFA 4ZEFA 5CC2A 3MW0A 3KFMA 2I58A 4TOZA 3VLVA 4DXBA 3FUZA 3K6VA 2F78A 1DOTA 1SYHA 5FTHA 1DPEA 4U4SA 3FV2A 2I3WA 2OJTA 3HHGA 3A3UA 1QULA 3R26A 5JTYB 4F22A 4IO6A 5I57A 3H03A 1B58A 1B7ZA 2Z8EA 5JEIA 2FYIA 1R1NA 1XOCA 4N6PA 3EN3A 2QS2A 3OO8A 4EF2A 1JVYA 4NF5B 3PUYE 3QAXA 2HZLA 3MVWA 4R2FA 1OQHA 4YICA 2B3FA 3G3JA 4RA1A 3O6HA 2IA4A 3VVEA 3MC2A 3U92A 2QPQA 4THIA 4TLMB 4IB2A 1H43A 2F36A 1CE2A 3QIMA 3PD9A 5TPAA 1WVJA 5AA3A 1B3EA 2DXYA 4YKKA 1SI0A 3QYTA 4EF1A 2QMWA 1MQDA 4R6KA 2DXRA 4OERA 5BUUA 2FA7A 1MY0A 1Y20A 4XKNA 3KZGA 3VLUA 1XT8A 5EHMA 2DWAA 4HCYA 5I2KB 1LFGA 3THIA 3H3GA 5KDTA 1SW1A 3K00A 2P1SA 4H0WA 3UN6A 1SVXB 5CMMA 4RNSA 1FQCA 1IITA 4YKPA 4OZ9A 3PU5A 3V89B 1O64A 4KYDA 4YKJA 2XX9A 1PDAA 4ELRA 2Y7WA 1MQIA 1D9VA 1EZOA 2I4CA 1UTHB 4OFLA 2O1MA 4NF4A 1ZKBA 3GLBA 1M5FA 1XS5A 3BBRA 2OWTA 1N7WA 4WKMA 5CBSA 2H25A 2UVIA 1P1OA 1I6BA 1BKAA 2LAOA 4G68B 2VD3A 4LZ8A 3FASA 4O3AA 4JWXA 1MXYA 3FD3A 1JQFA 3K1NA 4GRKA 3S2VA 4HTGA 3I5OA 3KSJA 3BFTA 1Q1KA 1GTKA 4MLQA 4EDPA 1NNTA 2P0SA 1FQEA 1NNKA 1QW0A 5DEXB 1Y3NA 1B51A 1N76A 3ZKLA 2XXTA 2GFEA 3FVNA 1M5CA 1P1UA 2DVCA 3LUYA 1LAHE 3LSXA 1B3LA 1ATGA 3TCFA 2F7AA 3UORA 4HS7A 3S9NC 3CR9A 3IO6A 4KFQA 4O3BA 4ZZEA 3B6WA 3TCGA 1SBPA 4Q5TA 1B4HA 1A40A 4FJPA 3MAMA 1A55A 5K2XA 3V5AA 1SQYA 3QXMA 1A54A 4LONB 1MDQA 4P0IA 1XC1A 2PT1A 2YLNA 4NWCA 4R6HA 4U22A 1PB9A 4H65A 3TTKA 2D21A 2D5WA 1QUKA 1US4A 3WAFA 2OCUA 4O3CA 3LR1A 2F35A 4WXJA 3CG3A 3OXNA 4MFIA 3MJNA 1D3KA 2DP8A 1US5A 4JDFA 1GGGA 2RC8A 5L9OA 3IK6B 1YAEA 2DWIA 2ZYNA 1B3GA 2PVUA 2ANJA 4FEDA 3QSLA 3IB1A 4R74A 3L6HA 5ICTA 4H67A 2CZLA 1R6ZA 3EPEA 2I6EA 1LGBC 2I4BA 1AOVA 3ZS6A 3G7WA 5KZTA 1FQAA 3IJXB 3OOAA 2W7YA 5JK4A 2ZNSA 5H8FB 4NWDA 1IEJA 1VFDA 3C35A 4OFJA 3ZSFA 1MXZA 4KYSA 4TLLB 4POWA 1N04A 4BDNA 3BFUA 2XXXA 1MG1A 2CMOA 5I56A 5DTBA 5B7DA 4YMBA 3CIJA 3QK6A 5ITPA 1MQJA 3MP6A 1LSTA 4LZ7A 1TWYA 2QS1A 3CRBA 5I58B 2V3QA 4YB6A 1HSLA 3E13X 1DSNA 3GZGA 4U2RA 1TFDA 3PV0E 2Q89A 4AB6A 5B70A 3TODA 1BLFA 5L8DA 3T9XB 1MY3A 3O6GA 1UTBA 4I9DA 2GH9A 4Z0IA 3W9WA 4NF8A 1HSJA 1NMUA 1VSOA 3HPIA 4Q8RA 2F6PA 1LAFE 1A8EA 3T9UA 2H98A 4R73A 5AA4B 1UQWA 1J1NA 3MP1A 4RPNA 1JW5A 5FHOA 3T96B 1JW1A 2Y7PA 1MY4A 2ZYOA 2O6AA 2UXAA 3CG1A 4PE5B 4BDLA 2IEEA 1Z7NE 2XXRA 4JWOA 3PUZE 3SETA 3OO7A 4JSOA 2HXWA 1DTGA 5I57B 3CSBA 4LA9A 4IO5A 3SEVA 2E1SA 3RNNA 3PGFA 1I6QA 2HQ0A 2XXWA 3M3FA 2AL5A 1MM6A 1O63A 3OEMA 1MS7A 2H4IA 1OLAA 3JYRA 4F29A 3I3VA 4QSDA 5KCJA 4XKRA 1ZTYA 5DYHA 1UIUA 5DVIA 4RK2A 2G93A 4H5GA 2XX7A 3RTFB 5AA2A 2B65A 5M2VA 4P0GA 1DPPA 3Q29A 4JWYA 3MVZA 1QKBA 1Y9UA 2H5YA 1IQ7A 1B5HA 3E9XA 3KN7A 4G4PA 2V3UA 5TPAB 1EZPA 4XTCQ 1LAXA 3Q27A 2ALUA 2AYSA 3OMBA 3PUWE 4BDRA 4KCDA 1MH4A 5H8HA 4R2BA 3UA8A 2PMSA 3TQWA 1P1WA 1URGA 5CM6A 1SYIA 3D4GA 4DZ1A 3CFZA 1M5BA 4OWDA 5H8NB 3O6IA 3D4CA 3OSRA 2VGQA 1DTZA 2H9BA 2QS4A 3MPLA 3EHSA 4OXVA 3CVGA 1DMBA 2NXOA 3OSQA 1ZIUA 4GLIA 4NF6A 2ZMBA 4OYVA 3RGYA 4GXAA 4F3SA 4GF8A 5IKBA 4Z7EA 1Q35A 2G29A 5HPQA 4M1VA 4OQOA 1TFAA 3MVYA 4KHZE 2BJJX 4GIZA 2A5TA 1MXUA 4R9FA 1P1NA 2THIA 3EHUA 4DIGA 3TTLA 2Q2CA 3I6VA 1IIWA 1N0TA 3TTRA 4ISUA 1XHYA 4JB7A 3TFLA 4U4XA 4U23A 2F34A 4EUOA 3W9VA 1CB6A 1JEUA 1N84A 3OELA 1Y1ZA 4KYEA 3IJOB 1ZBMA 1I69A 2Z23A 2AL4A 4C1UA 2HZKA 3K1PA 3HSTA 3USDA 4M4GA 5CBRA 4IY6A 3FVGA 3TTMA 3KOSA 2DE3A 1FQFA 4OEUA 4F1VA 1POY1 3Q26A 5I2NA 4ZEIA 4YAHX 3LSFB 3MVXA 1S9TA 1MM7A 2FNCA 3CFXA 2VD2A 4ESXA 4OENA 4ELPA 2Z22A 4R75A 2UVJA 4R6YA 4BDMA 4POXA 4OTEA 4GD5A 1QKAA 1PBQA 3HV1A 2XXIA 3GBAA 3Q28A 3JZJA 3RT6B 3SEUA 3VFJA 3FIRA 3ONMA 2VHAA 4QSCA 3UK4A 2GHAA 4GL0A 1D4NA 1T0KA 1H45A 1FTLA 3Q25A 5HM4B 5ICQA 3UGWA 1JW4A 3IOWA 2XX8A 3IL1B 2PYYA 3C36A 4QFNA 3FVOA 3KJ7A 3KN8A 1MXWA 1L5TA 2AIXA 2O51A 3N94A 4Q30B 1S50A 1R9LA 1H3DA 4G68C 4KI0E 3LSWA 1FTOA 2DWJA 2RC9A 3F11A 3CI8A 4NF5A 4G77A 3K0VA 1FQBA 3TUSA 1MDP1 1IXIA 1OIBA 4IO3A 1OMPA 4F39A 1LAGE 2V3TA 1YTVA 2REGA 3RLFE 3O9PA 2B3BA 1Y4TA 1H76A 2PBWA 3MWBA 3C33A 4ZEDA 1IZ1A 2V25A 4I8CA 3N26A 5I59A 2I3VA 2ZNTA 2HAUA 5I56B 2UVHA 1NNPA 1MPDA 4G8MA 3T22A 3W15C 5H8QA 2ZNUA 3HHFA 1B3FA 3DP4A 2F8DA 2HAVA 5I84A 1WDNA 4BDQA 2DVZA 4G8HA 1SD3A 4ND9A 3C31A 3SEWA 4MBPA 4XKQA 1LBCA 4MH5A 3G3FA 1UTBB 1MQGA 1B40A 4F18A 1SDXA 4GXSB 2HCAA 4LP2B 4F31B 4MLVA 4F2QA 2XXVA 4NF8B 1MRPA 3TTNA 4LQ2A 4EXKA 1A7LA 3TCHA 4UA8A 4JSDA 1I6AA 3T66A 2QS3A 3PPRA 3K2DA 4AB5A 3RUMA 1ANFA 3VXCA 3KOTA 4P11A 5AA1A 1EU8A 4PP0A 3RN8A 3U94A 4ZDMA 3UIFA 5CRYA 2M8CA 4QFLA 3H6TA 1UTHA 3N6UA 5A5XA 4GFRA 2ABHA 1ZMGA 3M3KA 2F7BA 4RK9A 4XIGQ 5DVFA 1B9JA 1A8FA 3PMVA 1M5EA 3TMGA 3MZ9A 3KGCA 2RCAA 4F19A 5KCJB 2UYFA 4PQJA 4IGTA 1VFEA 3KEIA 4FE8A 1YCJA 4C0RA 4FORA 2OBGA 4GQOA 5AA2B 3K02A 5EHSA 3DM0A 3BKIB 1XVXA 1AIVA 2RCBA 2REJA 3G3GA 4K3FA 3H4ZA 5L9MA 4HW8A 3DELB 3KSXA 4ESWA 1SW5A 4EXLA 1BTJA 2Q8JA 3H7MA 1MPBA 3U72A 2F5XA 3DP8A 2RC7A 4YZZA 1SW4A 1AMFA 4ZECA 2RF1A 3ILUB 1IXHA 2XHDA 1F9BA 4OVJA 3V8XB 5CMBA 2DSFA 3T93B 4N13A 2O84X 3VXBA 3TYHA 2I48A 2ZYKA 1ZJLA 3TQLA 4FECA 2YPNA 5TP9A 1QJMA 5J1DA 1OVBA 2Y7RA 2Q9TA 4QFKA 2Y84A 2O7UA 4QRZA 1BP5A 4NF6B 5FTIA 3VV5A 4FEBA 4KD5A 2ESNA 2OWSA 3PPPA 1USYE 1IXCA 4X48A 2ONRA 1B0LA 1AL3A 4EQ7A 3T9HB 4U1OA 3TKDA 4RPOA 4UACA 3O28A 2PT2A 3HCQA 3HN0A 3P7IA 2O1LA 3SESA 1NFTA 4ZE8A 4ZS9A 1B32A 1JVXA 3S4UA 3EHTA 5H8SA 3VLWA 3DLNA 3M8UA 3IORA 3FGSA 3L6GA 5H8FA 4NE4A 1USYH 2DE4A 2QJEA 1II5A 3FZVA 2QMXA 4F1UA 3TAJA 3G3KA 3B7DA 2V84A 2DS9A 4H6DA 4JXIA 3IAZA 3TEPA 3K6XA 1NNFA 2O68A 1LCTA 3SEYA 3OEKA 1B05A 1D9YA 4YMAA 2GHBA 5I2NB 1HSEA 1O7TA 1P1QA 2Z8FA 1EZ9A 1LFIA 4GL8A 2Y7IA 5L9SA 1IXGA 4ZE9A 3PPNA 1EH3A 1JNFA 4NTLA 3RQTA 3C9HA 4ECFA 2GRVA 1MY1A 3S9EA 1B46A 1M5DA 3MZ1A 4DLDA 5KDTB 3MBPA 1FQDA 3SKPA 3N5LA 4IO4A 3IR1A 2HFBA 4XXUA 3QUFA 4ZZAA 2DYXA 1PB7A 1MXXA 2DWHA 3FJMA 4DDDA 1B7UA 3LBSA 2OK2A 1FW0A 4IGRA 5BWJA 4PFYA 4QFPA 2H99A 4Q0CA 3IOUA 2NOOA 3U1OA 3LC8A 3PUXE 4NF4B 4FATA 3GXAA 3G3IA 4KQPA 3V83A 1PC3A 1WODA 2QRYA 1Z7ME 4KR5A 1LCFA 3FV1A 4PFTA 4QSEA 2Q88A 1SW2A 3R6UA 4X1DA 1URDA 4DCXA 4U1ZA 4IO2A 5CMCA 1LBBA 3U8QA 1QUIA 2R9JA 1NH7A 3RY3A 4ELOA 4RY1A 2XD2A 4YU0A 4ZEBA 1QVSA 5I59B 3PD8A 3K01A 2YJPA 3OO9A 1SI1A 4MF3A 1XVYA 5H8QB 3IOTA 3R7XA 1JETA 3RPWA 3FJ7A 3OENA 4BDOA 3A3CA 3SDFA 4LVQA 3N6TA 2XXQA 1Y1MA 5H8NA 4E0XA 3VVDA 2P2AA 2UYEA 4WEDA 4IY5A 3TZAA 2I49A 2ZXTA 1B4ZA 3IOVA 2X7PA 4EQBA 4LZ5A 2X26A 3GBBA 4GVOA 3B6QA 1OVTA 1IUDA 1B5JA 3PPQA 2E0SA 5F1QA 3H6UA 3H6WA 1MH3A 2Y7KA 4FAJA 5JTYA 1Y3PA 1FTJA 1JEVA 1OLCA 4YB7A 3PPOA 2RKMA 3SEXA 4OMBA 3O2AA 5A5XB 3FXRA 3M3LA 4I62A 2WKYA 3RT8A 4KCCA 1LLSA 5IAIA 4F3PA 1Y4CA 4E0WA 1N3WA 3CSGA 3K6UA 4NMYA 3E4RA 3KBRA 4R9GA 3VE1B 3RTWB 1TT1A 4H8JA 2PX1A 4DCYA 3SERA 3FXQA 3K1MA 2XD3A 4LQ5A 1NL5A 5K2YA 2VP1A 1BIYA 4AQ4A 1OQGA 1GVCA 3WAEA 1ELJA 3IO4A 5CMKA 4PFWA 1A99A 3KN3A 5AE4A 3FATA 2I0CA 1YPNA 3IB2A 3OD7A 3MPKA 1B2HA 5I2KA 1N7XA 1LFHA 1FTMA 3JV9A 3ILTB 2Q2AA 3KG2A 5TP9B 1RKMA 3O97A 2DE2A 2XXYA 4ONYA 3ECRA 1ZU0A 3MZBA 1MPCA 2Z8DA 1NKXA 4HCWA 4F3BA 3O66A 2HEUA 4OFOA 4GWOA 3ZKKA 1NH8A 1P99A 3EF7A 1B1HA 1GV8A 3H6VA 4WEPA 3S9MC 3HO7A 3UP9A 3B6TA 4PETA 1S7YA 2DQVA 4ZEKA 5DT6A 3E3KA 2F7CA 4G68A 1MQHA 5EYFA 1LB8A 4RXLA 4H1XA 1B52A 4U21A 4QF9A 4YB5A 1MY2A 2F97A 3TDJA 4N07A 1TXFA 4GOTA 1GR2A 3EQ1A 2I0BA 5DEXA 2NUVA 1VE4A 2ONKE 3K4UA 3C34A 5FHMA 4G2ZA 3G3HA 2NVUB 1B7HA 5HBCA 4F2OA 4C1TA 4F1YA 4G8NA 2O69A 2R71A 3FXUA 3QUJA 3MQ9A 1B1XA 5FHNA 4FIMA 4H8IA 3IX1A 3TPAA 3C4MA 5H8HB 4X1BA 3VVFA 4LATA 4RYAA 3H06B 4QHQA 4ELQA 3IB0A 1KWHA 2X7QA 3PMXA 1Y3QA 3FJGA 3PUVE 3C32A 2XXPA 2O7IA 4I1DA 5F7VA 2ONSA 2VOZA 4L17A 4BLAA 2R6GE 4EQ9A 4IO7A 4OETA 1FCKA 2D3IA 3O29A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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