2Q2RA

Trypanosoma cruzi glucokinase in complex with beta-d-glucose and adp
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
373
structure length
370
Chain Sequence
APAGSHMNIKELSLHELCEELKTPAWNAPLTFVGDVGGTSARMGFVREGKNDSVHACVTRYSMKRKDITEIIEFFNEIIELMPASVMKRVKAGVINVPGPVTGGAVGGPFNNLKGIARLSDYPKALFPPGHSAILNDLEAGGFGVLAVSDAHVFSEYFGVMWEGTQWRTCEQEPAGSVIGRGRCLVLAPGTGLGSSLIYYNPQHIVVPLELGSQTLPMRKDIDYIQTLHAELKLFPNYENMVSGAGLEFHYRQVVRGSRPPCSAGEIAKLASEGDANACKAMKKYHEYLMRVGSEASMALLPLTIVLVGDNIVNNAFFYRNPQNLKEMHHEALNHEMERFGFQSRVSYLRQKKLLNLNLMGCYRCGLDLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Crystal Structure of Trypanosoma cruzi Glucokinase Reveals Features Determining Oligomerization and Anomer Specificity of Hexose-phosphorylating Enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase 1, putative
molecule tags Transferase
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 124
structure length 370
sequence length 373
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2007-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q2rA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 2q2rA02
3UKRB 4KBOA 4HTLA 1XQSC 3MCPA 3L6QA 4BRFA 3O08A 3EO3A 4O5FA 1T6DA 5TKYA 4BRPA 5JLHA 4A2BA 4IXCA 1MA9B 4H0VB 4BG9A 2GUPA 1HPMA 3C7NB 5F1XA 2CGKA 5CE3A 5FPDA 4MO5A 3SK3A 1TYQA 4AM6A 1NGBA 4H0XB 3D2FB 1MWMA 3HI0A 1SAZA 1ESVA 1S3XA 2GEMA 3FZHA 4K41A 4JD2A 3WXLA 5KPRA 3ZX3A 3LDOA 2YI1A 1HX1A 5JMVA 3UB5A 1NLVA 4CD3A 5ELZA 5F0XA 2P9SA 4B1UB 4BRQA 3UKRA 3I8BA 4BC4A 5AQXA 4LC9B 3ENOA 3H46O 3VESA 1QQOA 2IVOA 2Q0RA 1NGJA 2YCHA 3C7NA 3KVGA 2E88A 3GG4A 3QBXA 2E8AA 4XH5A 3W0LA 3D2FA 1Z6RA 3QFPA 3LDQA 1J6ZA 3QICA 3UE5A 3DJCA 4B1YB 2Q36A 4H5WA 2P9IB 3F9MA 2YJEA 4FWLA 3H1QA 1TUYA 4JHDB 3GE1A 5AQGA 3BEXA 2VWBA 4JNEA 5AQKA 3KZBA 4B1VA 4BR2A 5AQMA 1KAXA 1BO5O 1SQKA 1MDUB 4K42A 3CJ1A 2E20A 1DKGD 4XH4A 3BUZB 4BVPA 3DAWA 3J8AA 1IG8A 1V4SA 5BRFA 1T6CA 2IVPA 5KQ8A 2Q0UA 3O80A 1JCGA 3JS6A 3ZETB 5BR9A 1TUUA 4EHUA 2DPNA 4CZFA 2FLOA 4BR5A 2D0OA 3VF2A 2P9IA 1YXQA 4IWVA 4NO7A 4CBUA 2CGJA 5B8HA 2NLXA 3CJCA 4BRNA 1BG3A 2QM1A 3AARA 3BF1A 3GBTA 1X9JA 4GY2B 4H0YB 4PKGA 3ENHA 1Z05A 3H1VX 3TPQA 3H45C 2IVNA 4FL9A 5BRDA 3WQUA 3U9DA 3MN7A 3CIPA 3CJ7A 4CZIA 5FPEA 4BR9A 3ZETA 2D0PA 1EQYA 4E1JA 4WQ5A 3AAQA 1G99A 1X3MA 3ZEUB 4EIAA 5EVZA 2PBDA 1GLBG 3KHYA 4IO8A 1BDGA 1WUAA 2FSKA 5BPLA 3L4IA 1QZ5A 4FO0A 1GLJO 1KAYA 3VF4A 5KQDA 2Q31A 4H5NA 4FWRA 4MO4A 2FSNA 4H5TA 5AQHA 2VCPA 3EZWA 4BQZA 5AQSA 3IDHA 2HF3A 1BU6O 3HBTA 3WXKA 4A61A 2WUSA 4FWPA 1NGDA 1NGEA 3MMVA 4BC2A 4FWOA 1ATRA 1NMDA 3VPZA 2IIRA 3D2EA 4C23A 5AQYA 1HKBA 5BN9A 3VEZA 4I6MB 3O1BA 5EX5A 4BRHA 1NGGA 5F2RA 5AR0A 4CI6A 3CQXA 1RDWX 4BGAA 2HOEA 4B1XB 2PAVA 2A42A 2H3GX 5BREA 1U6ZA 3CJBA 4CJ7A 3QFUA 1BOTO 5AQNA 4IJNA 1KAZA 2OANA 3VOVA 2W41A 3C0BA 3W3DA 1C0FA 3O4WA 1IJJA 4PL7A 1NM1A 3IMXA 4CZHA 1RGIA 3U8XA 2YHXA 3H6EA 3VGKA 2V7YA 4XH1A 3R9PA 5AQZA 1BWFO 3QMLA 5AQTA 4FOEA 4I6MA 5FPMA 4CBWA 5ADXA 3OHRA 4QS7A 2GELA 3EKUA 4RWTA 4CZLA 1NGFA 5E84A 2KHOA 5AQJA 4CBXA 2P9LB 3G25A 3SJHA 5AQFA 4A62A 3VEXA 2F9TA 4K25A 1P8ZA 2QWNA 5AQPA 1LCUA 4FPBA 3RSEB 3WXIA 2GWKA 2W40A 4B1WB 2NRHA 3EL2A 5EXWA 4JN4A 4WQ5C 3LDPA 3LL3A 4YDUA 5AQUA 1T44A 1DEJA 1NGIA 2BTFA 5BPMA 3FR0A 2A40A 4BQLA 3FZLA 3EKSA 4DQ8A 2ZWHA 3A8YA 3IUCA 4BRLA 3CI5A 5AQVA 4JAXA 2FSJA 4BC3A 2UYTA 2J4RA 3GL1A 3S41A 4WYBA 4XEIA 1R59O 1MWKA 1E4FT 1H1VA 4FWNA 1WOQA 1NGCA 2P9LA 3U4LA 2BUPA 2ZGYA 3FE1A 4JHDA 4CZMA 2EWSA 4RTFD 1Y64A 3HTVA 3UKUB 1V4TA 2Q97A 3ID8A 3BP8A 3M3ZA 3RSEA 3O1WA 2YHYA 1JCFA 4K43A 4CZEA 3LDLA 4NB4A 3FZMA 5BRHA 5BN8A 1XUPO 3AAPA 3FGUA 4BC5A 5AZJB 1NWKA 1ZXOA 4PKHA 4Z94A 3GOIA 2V52B 2HMPA 2QXLA 1S22A 3M6GA 3VERA 5JICA 4Y0WA 4F9OA 5AFUA 1GLEG 3VENA 5KPZA 1NGAA 2ITMA 2Q2RA 1RFQA 2CH5A 2CH6A 3GDQA 1QZ6A 4B1ZA 4ISEA 4FOIA 1X3NA 4IZ9A 3UKUA 3MN5A 2ZF5O 1CZAN 4BROA 3TU5A 4FPAA 2GTDA 2QWRA 2E1ZA 1QHAA 3M1FA 3VEWA 4H0TB 4MLHA 2A3ZA 3CJAA 3HSCA 1Q18A 4EHTA 4MLEA 2VYPA 2A41A 2YJFA 2I7PA 4BR7A 2AP1A 2P9NB 1C0GA 4BRAA 1YAGA 5E26A 3A5LC 2I7NA 2P9SB 2HF4A 3QBWA 2P9UB 3WQTA 3ZEUA 3VF6A 3FFKB 2F9WA 5LJWA 4H5RA 4YDUC 3WT0A 1GLDG 3WUHA 3A5OC 5AQLA 4BR0A 5EOYA 4FWKA 3VETA 2FF6A 3ATVA 3P4IA 2D1KA 4H0PA 1BA1A 4BRMA 4RCHA 2ASOA 3IFRA 1GLFO 3QB0A 5LJVA 3CJ9A 2QW9A 5I9EB 1SZ2A 4CD1A 4H5VA 3U9ZA 2ZGZA 5EY4A 1NBWA 1ZC6A 2V51B 2P9KB 3LM2A 3DXMB 2QWQA 2P9NA 2NZTA 2P9PB 4H0OA 5ADXH 2A6AA 1JCEA 1DGKN 3ATUA 2P9UA 4J8FA 4BVOA 3CERA 3O6WA 3MN9A 3VGLA 4BRDA 2ASMA 2D4WA 4H03B 3SMPA 1HUXA 3B8AX 4M7XA 5AQQA 4ISFA 4HWIA 4BRIA 1D4XA 3SMSA 4M63C 4EFHA 4WQ4A 4CZGA 3QDKA 5AQIA 1BUPA 1QQMA 2E2OA 2V7ZA 3MDQA 3WEEB 3JXUA 3ZX0A 2QWMA 3ULEB 3FZKA 4PKIA 4BREA 4QS9A 4L3QA 2AA4A 1OKJA 2GWJA 4EAHD 3O5BA 1HKGA 1HJOA 2P9KA 3CHWA 1XC3A 3DXMA 3A0IX 1HLUA 2P9PA 4B9QA 1ATSA 2Q1NA 1U2VB 2YHWA 1YVNA 3A5NC 3FZFA 4PL8A 4IJAA 2ASPA 4BGBA 2E2QA 4CZKA 1ZBSA 3DXKB 1QQNA 3SLCA 5LY3A 5AQWA 1HKCA 2QWPA 3WEEA 4BG8A 3H3OB 3EN9A 3ULEA 3BF3A 4CZJA 1GLAG 1GLCG 2A5XA 2CGLA 3I33A 3VEVA 3D7EO 3FLCO 3A5MC 3CQYA 4FWSA 3R6MA 3VGMA 2FXUA 1K8KB 5AZIB 3HZ6A 3R8EA 4DHYA 2FF3B 4M7YA 4ISGA 3MN6A 1U2VA 4QS8A 5AFUH 3L0QA 2E2PA 2E2NA 4BRGA 4DB3A 3O8MA 3AY9A 1GLLO 3DXKA 4FWMA 2QWOA 1LOTB 4BR4A 4DCHA 3LM9A 5AQRA 1BA0A 3DWLA 1KXPA 2QWLA 4AM7A 3WXJA 1E4GT 3ZX2A 2E1YA 4FSVA 4GNIA 5FPNA 5BPNA 1ATNA 4BRCA 3D2EB 1TYQB 3MK6A 5AZJA 3CETA 1YUWA 4A2AA 3H3NO 3HM8A 3LDNA 1NGHA 4JD2B 1K8KA 5JLFA 4FWQA 5AZIA 5AQOA 4O8KA 4WQ4C 5KPTA 3VEOA 3VEYA 4BRKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BDZA 3L2RA 3HPGA 2G8IA 1BQNA 3EO3A 2G8VA 2HBLA 4W5OA 3AVNA 4A2BA 4GV6A 1S1XA 4KHWA 3ALYA 4A5AA 1HPMA 2CGKA 4O0JA 2F8SA 3FFIA 4AM6A 4CEOA 1N33K 4JKEA 2Z1JA 3PO5A 4M3ZA 2BH1A 4K41A 4F3OA 4J2DA 3LDOA 2P9SA 3UKRA 2X6SA 3CCMN 1KFDA 4BE1A 4BC4A 2OA8A 3ZYYX 5J2MA 1GOAA 4IO9L 4B8CA 3AVCA 3H46O 1QQOA 2QXFA 3C7NA 4A59A 3MEDA 1Q86O 4DFJA 3GG4A 4CIGA 1NK7A 3E01A 2HHVA 4C1NI 1S9EA 3D2FA 2BE2A 1VQ9N 3UE5A 3DJCA 2Q36A 4FYDA 4HHTA 4BACA 2YJEA 1WB9A 1S1TA 5IWAK 1J5EK 1XWLA 2DFHA 2VWBA 4MQ3A 5AQKA 3KZBA 1RBUA 4B9NA 4JS5A 2PYLA 4NYFA 4B1VA 4MFBA 1BO5O 4JI6K 4K42A 1KRPA 3CJ1A 1DKGD 3RMAA 3DAWA 1IG8A 4LSNA 1V4SA 1HNWK 5BRFA 1RT3A 1T6CA 3OYGA 2Q0UA 3T7ZA 3TARA 3OYKA 4BE2A 4E0DA 5M1PA 2DPNA 3ZCMA 4DSIA 4JV5K 4YFUA 2FBVA 4FXDA 3VF2A 3QEXA 4NO7A 1M1KO 3CJCA 4DSFA 1NK6A 4DQQA 1VSHA 3K5LA 1EWQA 1X9JA 3RRHA 3ENHA 3KWIA 3WNHA 4R79A 1IKXA 3AGKA 4XIUA 3H45C 2O8BB 3O9RA 3WQUA 3U9DA 3MN7A 3LP0A 2HNYA 4B9MA 1U48A 2KQ2A 4LH5A 2OCEA 3AAQA 3D45A 1JXEA 3ZEUB 5EVZA 3KHYA 1J54A 4IO8A 4C8NA 1BDGA 1WUAA 3RMCA 1WLJA 1LW2A 2Z1IA 4FO0A 1GLJO 4BWMA 3JSMA 2FSNA 4B3SK 3DRSA 2JWKA 4IOCL 4NLCA 3SJJA 1BU6O 3VQAA 1IKWA 4A61A 4FWPA 5J1EA 3VQPA 1NMDA 1JXBA 2WOMA 1S1WA 1HKBA 2LSNA 3O1BA 1NGGA 4CI6A 5AR0A 2E4LA 1IG9A 4B1XB 4AHVA 5BREA 1X1PA 4FK0A 1TK5A 1BOTO 4W5RA 3VOVA 2W41A 3O4WA 4Y1DA 1HNXK 3LANA 4DLEA 3THYA 2PYJA 4PA1A 1ASWA 4BE0A 3LZIA 3MWPA 4CK1A 4DR4K 4ZTFA 4CJFA 3V1RA 2ZJQL 4I6MA 5FPMA 5J2PA 4CGIA 1LW0A 4JI4K 2GELA 1VQON 2JWLA 1QVGM 2YKNA 1NMNA 1VQKN 2KHOA 5AQFA 3KK2A 3VEXA 3SI6A 2VQEK 4DU4A 4N56A 3O4QA 4PWDA 2VG6A 4KHQA 3WXIA 3RMBA 2GWKA 2W40A 3LALA 3TSQA 3KLFA 3EL2A 5EXWA 1WAJA 4JN4A 5AQUA 1T44A 1DEJA 1WNSA 3FR0A 2A40A 3CCSN 5FRNA 3EKSA 4KHUA 3AVJA 4DQRA 1R0AA 4CJRA 1OVYA 2XHBA 3WXMB 3DRPA 3CI5A 3IAYA 3CQ8A 3T1AA 1NOZA 4JAXA 2FSJA 2UYTA 2J4RA 2P5OA 4LFAK 4YOYA 2FBXA 1R59O 3IRXA 1MWKA 3K9JA 4LF5K 4FK2A 4FWNA 1VQ4N 2DY4A 1T7PA 3FE1A 4FM1A 4JHDA 4CZMA 4IG3A 4O4GA 4E89A 2Q97A 4FW1A 3AVIA 3BP8A 4CEZA 3O1WA 5MLCQ 1RT5A 5GIOA 3VTIA 5J2QA 3QEPA 5AZJB 2KTQA 3K9KA 3O3FA 4PKHA 3PUFA 5KRTA 1TL1A 1L5UA 3U3GA 4N47A 3L3UA 1NKBA 4OLBA 3G0ZA 4I7FA 1Q9XA 4IEEA 1LAVA 1TVRA 5JICA 4Y0WA 5AFUA 4IG0A 1GLEG 3VENA 1NGAA 1RFQA 3GDQA 4B1ZA 3K0SA 3B6OA 4ISEA 3UIQA 4IZ9A 1RNHA 3LPUA 3UKUA 3TU5A 2O8EA 4X65K 3AVKA 4JKDA 4H0TB 4KRFA 4DFKA 1NJIO 2QK9A 2O8DB 1RTHA 4B3OA 3HJFA 1NJZA 3IKMA 3A5LC 3I55N 2KFZA 3NF9A 3WQTA 4CK3A 1VQNN 4H5RA 3SQ0A 4YDUC 1GLDG 3OYBA 4FWKA 4H8KA 3V9SA 2DTUA 1WSEA 1U47A 3CM6A 1BA1A 4JKCA 4OGCA 2RE2A 1UA0A 1BI4B 1JL2A 1WAFA 3DYAA 3MECA 5HRPA 3VQ7A 3E1YA 4GV9A 5HOOA 3K5MA 2P9NA 1KLMA 2NZTA 4M45A 1CXUA 5HLFA 3ATUA 2KKZA 3MX2A 1HUXA 1U4BA 4MDAA 2KW4A 4EFHA 4WQ4A 4YORA 2E2OA 2RPIA 3QO9A 3WEEB 3ZT4A 2D0AA 5C10A 4Z4GA 3JAMO 4L3QA 2AA4A 1FKPA 2GWJA 4B9UA 1Q8IA 3O5BA 2P9KA 2HHUA 3NVKA 1HNZK 4KV8A 1HLUA 4Z4HA 2WONA 2ITGA 4B9QA 3CCJN 3O3GA 4NCGA 4BGBA 2HHTA 4A5BA 2RF2A 3MEGA 3V4IA 4CW7B 5D3GA 1TK8A 4R5PA 1B92A 4BG8A 1LWEA 3BF3A 1GLAG 1QVFM 1IBKK 4KTZA 1VQMN 5CYMA 4K8ZA 4BDYA 3AVFA 1JLFA 5AZIB 3HZ6A 4QS8A 5DK5A 5AFUH 1TK0A 2E2NA 4CJEA 3HOTA 4DTOA 1WBBA 3S3OA 3AY9A 3NGIA 5E41A 1YI2N 3C6UA 1M90O 3DWLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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