2Q31A

Actin dimer cross-linked between residues 41 and 374 and proteolytically cleaved by subtilisin between residues 47 and 48.
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
362
structure length
335
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Multiple crystal structures of actin dimers and their implications for interactions in the actin filament.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
total genus 106
structure length 335
sequence length 362
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q31A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q31A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q31A03
4BQLA 3WEEB 3ENHA 3U8XA 3CJ1A 3SLCA 3GL1A 5EY4A 2CH6A 3H6EA 2IIRA 3DXKB 1NGHA 3EKUA 4K42A 3FLCO 5EXWA 4BREA 2IVPA 3UB5A 2F9TA 2UYTA 3D2EA 1T44A 3CJCA 5BRFA 1Y64A 3VEWA 4CZFA 4K41A 4CZKA 4BG9A 4KBOA 5F2RA 3D2FB 1ATRA 4BRLA 5E84A 2Q1NA 3HI0A 5I9EB 4BR7A 3ULEB 3MDQA 2AP1A 1NGCA 2P9PA 1E4GT 3JS6A 4B1XB 3QBXA 2Q2RA 2E2QA 3VEZA 2FF3B 3VF2A 2D1KA 2GWKA 4GY2B 4CZHA 1TUUA 2QWOA 3GDQA 3U9DA 1DEJA 3IFRA 1BG3A 1V4SA 4HTLA 4H0PA 3WEEA 1WOQA 3J8AA 5BPMA 2HF3A 4BG8A 4H5TA 3L0QA 3L6QA 4F9OA 4JD2A 2V7YA 4HWIA 4RWTA 4PKGA 4WYBA 2GUPA 5AQYA 3D2FA 5AZJB 5AQIA 3A5OC 4CZIA 4CZEA 1DKGD 5AQPA 3SK3A 3FE1A 2H3GX 5AQGA 3VGKA 4CJ7A 4A62A 1S22A 3ZX2A 2CGJA 5F1XA 2YHYA 4FWOA 1RDWX 2HMPA 2A41A 3FZHA 3LDQA 3DXMB 1LCUA 4H5NA 1BUPA 2QM1A 1KAYA 2A40A 2IVNA 1NGBA 2BTFA 4FWSA 4L3QA 2FSKA 3KZBA 1ZBSA 5LY3A 3MN6A 5FPMA 3LM2A 2Q31A 3CJAA 4JHDB 2QW9A 3A0IX 3M3ZA 4QS8A 2Q97A 3LDNA 5AQRA 4H03B 4BRGA 4QS9A 3O8MA 4NB4A 2QWRA 3MN5A 2PBDA 1H1VA 5KQ8A 5JICA 5AQSA 4H0TB 3RSEB 5KPRA 3ID8A 2KHOA 4EIAA 2NLXA 2ZGZA 3I8BA 1ATNA 4I6MB 2ZGYA 3OHRA 3QB0A 4BRQA 3ATVA 3VEXA 3VETA 1Q18A 3M6GA 4A2AA 2VWBA 4MO4A 1G99A 2I7PA 4EFHA 1BDGA 1T6DA 3LM9A 4H0OA 1V4TA 4K25A 3BF1A 1RFQA 4B1UB 4MO5A 4BC4A 2YI1A 3WXKA 3ENOA 4PL7A 1TYQA 3O1BA 4IZ9A 2P9KB 4B1YB 4H5RA 3DJCA 5BR9A 3BEXA 3IMXA 5BN9A 5AQZA 2VYPA 4EHTA 3EN9A 5FPDA 4JHDA 1LOTB 4CD3A 5AR0A 1C0FA 3VEVA 3H1QA 4FWQA 4LC9B 4JD2B 4BRAA 2W40A 4E1JA 2ZWHA 2E1YA 2E2NA 4ISGA 3C7NA 3RSEA 4CBUA 3O1WA 3R8EA 1NGFA 1QQNA 1J6ZA 1MA9B 4BRCA 1QZ6A 2F9WA 1TUYA 3HTVA 4DQ8A 5AQFA 3DAWA 4I6MA 2P9SB 3HM8A 1XUPO 4IWVA 1GLBG 5AQLA 3GOIA 1IG8A 2QWLA 1BA0A 3O6WA 2P9IB 3AY9A 4FWMA 3S41A 4AM7A 4BRPA 2NZTA 3CQYA 4JN4A 1T6CA 2A3ZA 1KXPA 4FL9A 2P9NA 4CBWA 5AQJA 1JCGA 5KPZA 4XH4A 1HKGA 3TPQA 3WXJA 2P9KA 3I33A 2YJFA 4H0XB 4NO7A 4ISFA 1GLDG 1NGEA 4XH5A 1HKCA 4Y0WA 5EX5A 5AFUH 2CH5A 1BWFO 2FXUA 1ESVA 2ZF5O 3JXUA 3CIPA 1QZ5A 4BQZA 4C23A 1E4FT 4BRNA 5BPLA 3SMPA 3IDHA 2EWSA 4PKIA 4XH1A 3O5BA 4FOEA 4BGAA 4QS7A 1NMDA 3H1VX 2VCPA 1HUXA 4Z94A 3IUCA 3WT0A 2P9SA 2QWNA 3BP8A 3CERA 4GNIA 4CZLA 3LL3A 2QWPA 4FO0A 2Q0UA 4DCHA 4EAHD 5JMVA 2PAVA 2P9IA 1KAZA 1HKBA 3DWLA 2CGLA 5BREA 2A6AA 2FF6A 3R9PA 3EZWA 2YJEA 4CZJA 4H5WA 4FPAA 4CI6A 2P9LB 4BC3A 5ADXA 1TYQB 5BPNA 3WQTA 3CHWA 1NWKA 5AZIA 3O08A 2OANA 2E2PA 4JAXA 1XC3A 3P4IA 3W3DA 4H5VA 1GLFO 2HF4A 4BRFA 2FSJA 2GTDA 5AQUA 3FZMA 5AQQA 3R6MA 5F0XA 1QHAA 4IXCA 3WXIA 3B8AX 1NBWA 3C7NB 3VGLA 1SAZA 4WQ5C 4CBXA 2GEMA 5ADXH 4O8KA 3A8YA 4FWLA 3VEYA 1GLJO 4PL8A 1HPMA 2YCHA 4BRDA 2D0PA 5KQDA 4IJAA 4BVPA 3FFKB 4CD1A 1KAXA 1NGDA 4CZGA 1GLAG 2V7ZA 1HLUA 3AAPA 4RTFD 3VOVA 4FWKA 3VESA 4B1ZA 5JLHA 2YHWA 3ZEUB 3MN7A 3ZX3A 4WQ5A 2ASMA 3ZX0A 2ASOA 1NGIA 5AQNA 4BR9A 4A61A 3UE5A 2P9NB 2AA4A 2V52B 5JLFA 1ZXOA 1WUAA 1XQSC 2P9LA 3QFUA 3A5LC 3CI5A 2V51B 1RGIA 3F9MA 5BRHA 2E20A 3ZETB 2FLOA 3EL2A 3L4IA 4M7XA 3LDPA 2E2OA 3O4WA 1BU6O 2D4WA 1DGKN 4CZMA 4FOIA 3H46O 3QFPA 2A42A 4WQ4C 3EO3A 3MCPA 1YUWA 3GG4A 3FZKA 3CQXA 1NGGA 3VERA 4BR0A 2Q36A 4JNEA 4B1VA 3LDLA 1NGJA 2DPNA 1BOTO 4YDUC 4IO8A 3EKSA 3UKUB 3FR0A 3ZEUA 5AFUA 2NRHA 4WQ4A 1MWKA 4MLHA 1U6ZA 4BC2A 5AQWA 3G25A 5AQVA 1P8ZA 4A2BA 1U2VB 2QXLA 4MLEA 1HJOA 1MDUB 2W41A 4YDUA 4FWRA 3WUHA 5AZIB 3SJHA 1OKJA 5AQTA 3QMLA 2WUSA 3M1FA 3UKRB 4BRKA 2D0OA 3TU5A 4BVOA 3ZETA 3CJ9A 3QICA 1MWMA 4FSVA 1BA1A 1QQOA 1YAGA 3HSCA 4BC5A 4EHUA 3FZLA 1ATSA 1X3NA 3W0LA 3H3NO 5BN8A 3U4LA 2FSNA 1HX1A 4ISEA 5EVZA 4BRHA 1JCFA 3ATUA 3SMSA 1K8KB 1R59O 1S3XA 3H3OB 4IJNA 4J8FA 3UKUA 3HBTA 3D7EO 3DXKA 2P9UB 2GWJA 5LJWA 3MN9A 2E8AA 2Q0RA 4M7YA 1U2VA 5AQXA 4BRMA 5LJVA 4PKHA 1EQYA 1NM1A 3LDOA 1GLLO 5FPEA 1YXQA 4FWPA 1NLVA 3MK6A 4M63C 3GBTA 3A5MC 3UKRA 3ULEA 1X9JA 4FPBA 3BUZB 5E26A 4BROA 4FWNA 3AAQA 2I7NA 1IJJA 1SQKA 5AQOA 5EOYA 4B9QA 3H45C 3CJBA 2IVOA 3GE1A 5TKYA 4BR5A 3A5NC 3VENA 3C0BA 3O80A 2GELA 3U9ZA 4H0YB 2BUPA 2CGKA 3MMVA 5AQMA 5ELZA 2E1ZA 1QQMA 4BGBA 3QBWA 1JCEA 4BR2A 5B8HA 4BRIA 3FZFA 1X3MA 2J4RA 1K8KA 4AM6A 3VF4A 3VF6A 1GLCG 1D4XA 2P9UA 3VPZA 4BR4A 3D2EB 1BO5O 4B1WB 4K43A 3BF3A 3VEOA 4DHYA 3WXLA 1ZC6A 2QWMA 1YVNA 5AZJA 1Z6RA 2ASPA 3WQUA 1NGAA 1SZ2A 1CZAN 1C0GA 2P9PB 2QWQA 3FGUA 3HZ6A 5BRDA 2E88A 3CJ7A 2HOEA 3DXMA 4O5FA 1Z05A 1GLEG 4H0VB 2A5XA 3KHYA 4RCHA 3KVGA 5CE3A 3AARA 3QDKA 4DB3A 5KPTA 3VGMA 5FPNA 4XEIA 5AQHA 3CETA 2ITMA 2YHXA 5AQKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1N5YA 4B3SK 1RTDA 2A1SA 3CJ1A 5M1KA 2CH6A 3SCXA 2HBLA 2IIRA 4JI2K 5C15A 1NGHA 3OYJA 4BREA 3FLCO 4FK0A 3NH0A 3UB5A 3F73A 3D2EA 1U4BA 1YHQN 3CJCA 4CHQA 1R0AA 5BRFA 1Y64A 5IWAK 4JLHA 4K41A 5KGWA 5KTQA 2X78A 3OYEA 1LW0A 2HB5A 3D2FB 4B3RK 3M8RA 4B3OA 4LSNA 4DQRA 3ULEB 1VRTA 4QOZB 4PUOA 1DT9A 2AP1A 4YOYA 2C1IA 4B1XB 2ATQA 3QBXA 2Q2RA 2E2QA 1VSMA 2FF3B 3HOTA 2D1KA 3KWIA 3P83D 4B3MK 1TUUA 3GDQA 3SV3A 4W5NA 4HTLA 1NKCA 4H0PA 3ZT1A 3AVIA 1EKEA 2FBVA 4JI3K 1TKZA 2Z1GA 2HF3A 3I56N 4J2BA 2O8BB 4HWIA 3M8SA 2O8EB 4WE1A 4M3WA 1Z25A 2RPIA 4BDZA 5AQYA 2ZQBA 1DKGD 3DLKA 4WF9L 3LDSA 1S22A 1VQKN 4CESA 4CJ3A 2HMPA 3DXMB 5AJ3K 4H5NA 1BUPA 1WSJA 1ASWA 2A40A 4FWSA 1NGBA 3VQ9A 4GV3A 4L3QA 4NCGA 3HYFA 4O8UA 1Q86O 3V9SA 3BDPA 4DV0K 4PWDA 4ILJA 3LM2A 2Q31A 1W97L 3CM5A 3A0IX 1N36K 2Q97A 1QSLA 4U7BA 1KTQA 3QETA 4JKCA 4JV5K 3L3UA 5AQSA 4H0TB 4OGEA 5KPRA 2F8SA 1T7PA 3E9PA 2IAJA 2ZGYA 4FM1A 3ZT3A 4BRQA 5CZ2A 3BGRA 1Q18A 3M6GA 1KLMA 2VWBA 3G6EN 1NJZA 2HSTA 5CYMA 4EFHA 5J2QA 5IT9O 1V4TA 3BF1A 4M3TA 4B1UB 3BZKA 3HP6A 5LMNK 1RBSA 1QE1A 2YI1A 1HQEA 3K57A 2RF2A 3Q7CA 4IZ9A 3DJCA 3BEXA 1I3AA 5C25A 4EHTA 4JHDA 1C0FA 2OZMA 4DWIA 5JENA 3PLAA 4O0IA 2E6MA 4IG3A 3TABA 2DFFA 4ILHA 2E2NA 3C7NA 3O1WA 1UOCA 4FJ5A 1NGFA 2F9WA 3C6UA 5H1SQ 2IOCA 3DAWA 4YNQA 4OVLA 4LFAK 2P9SB 1IKYA 3HM8A 1S6PA 2C1GA 3NFAA 1G15A 3NBPA 3CC7N 3ZSVA 3WXMB 3CFPA 4WFNL 3MEDA 4EZ9A 3AY9A 3K58A 4KTQA 4CJPA 2IC3A 4C1NK 5GINA 3OJSA 3JSMA 4CF9A 3M8QA 4PHTX 2UXCK 2YV0X 4IG0A 4BEBA 1N8RO 2QTDA 4NO7A 4ISFA 1NGEA 1HKCA 2CH5A 2FXUA 4CEEA 3ZT2A 1NK0A 2KQ2A 4M45A 3IDHA 4FM0A 4XH1A 1XI1A 1HNIA 4J2EA 1VSHA 1WSGA 4BGAA 3CCVN 2VCPA 2ZD1A 1HUXA 5M1OA 3OW2M 1X9MA 4Z94A 3IUCA 3VQDA 3WT0A 3BP8A 2P5OA 2RE2A 2Q0UA 1RBTA 2VGMA 1IBMK 5JMVA 2XO7A 3AO1A 5JVGL 3TTCA 1SKWA 3DWLA 1SV5A 3WNEA 4DV2K 1ZYQA 1HNVA 4YY3K 2FBTA 4H5WA 2P9LB 4BC3A 1NWKA 1TL1A 1HQUA 5HRSA 1NG9A 4DSLA 3W3DA 1NNEA 4LD0A 1JLGA 4B9MA 2QXFA 4BRFA 4OO1J 2FSJA 5AQUA 4BE7B 3R6MA 1P90A 1CLQA 1U49A 1NBWA 3C7NB 4KHNA 2NRTA 2Q3SA 4AHCA 5ADXH 1GLJO 3NAEA 3L2RA 1HPMA 4Q5VA 4KH4A 4LFCK 4CHPA 1QTMA 3I8DA 4IJAA 4CZGA 1GLAG 3AAPA 5CY4A 3SQ4A 3VESA 2O8FB 3WNGA 2DFHA 3ZEUB 4WQ5A 3LPTA 4ZTJA 4A61A 1XHXA 2HHUA 3KLEA 2UXBK 4ICLA 3OYCA 3RVCA 3J81O 2WOMA 4FJIA 4OGCA 4JK9A 2VG6A 3ZLJA 1RGIA 4IOCL 4KFBA 2FLOA 1UAXA 3THWA 4KRFA 4IFYA 1ZBUA 3C6AA 2Z1JA 4FOIA 2VWKA 3H46O 4WQ4C 3EO3A 4CERA 2G8UA 3FZKA 4IFEA 4BR0A 3QESA 4B1VA 3AO2A 1HPZA 4HUEA 2LSNA 4IO8A 4Q0BA 3FR0A 5AFUA 4OLAA 2NRHA 4LH4A 1W9HA 3D45A 4BDYA 3G25A 2QXLA 1Q7YO 1C6VA 2ETJA 4YDUA 4FWRA 1VQON 4K8XA 3ZYYX 1OKJA 4E72A 4NYFA 2WUSA 3AA3A 1XHZA 3KK7A 4I2QA 3ZETA 3K5LA 3QICA 1MWMA 3ZT0A 1SKRA 1VQ7N 1QQOA 3HSCA 3NHGA 4BC5A 4OKKA 4LF6K 4DU4A 1HMVA 3FZLA 3U4LA 3SUQA 3QEPA 1RBUA 4WFAL 1KVAA 1KVBA 2HNYA 2YKNA 3QINA 3R3LA 5J1EA 1EX4A 4HTUA 1U2VA 1U47A 4DTSA 4E0DA 4LF9K 4YOXA 4B9VA 3LDOA 3DMJA 1RTHA 1S1XA 2P5GA 3I0RA 1BIUA 3BZCA 3UKRA 2QA4N 3BUZB 4WFBL 4CJUA 1BI4A 3AAQA 2I7NA 1IJJA 5AQOA 1S6QA 3S3NA 2ZJRL 4C8LA 2HBJA 3G4SN 2IVOA 2NNWA 4BR5A 3A5NC 4GKJK 3U9ZA 3S5TA 3E01A 3QERA 4H0YB 1YITN 1TAQA 3MWTA 5ELZA 2E1ZA 1QQMA 1J5EK 1K9MO 5B8HA 1IV0A 1KRPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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