2Q31A

Actin dimer cross-linked between residues 41 and 374 and proteolytically cleaved by subtilisin between residues 47 and 48.
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
362
structure length
335
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Multiple crystal structures of actin dimers and their implications for interactions in the actin filament.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 106
structure length 335
sequence length 362
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q31A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q31A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q31A03
3VETA 4H0OA 2J4RA 3SLCA 4PKHA 3IDHA 3UE5A 4C23A 1ATNA 3CI5A 3JS6A 2A40A 2QWQA 2AP1A 5B8HA 2P9UA 3SMPA 4WYBA 1EQYA 2GEMA 2QWNA 3BUZB 1QZ6A 4CZMA 4FOIA 3FFKB 3CJ7A 5LY3A 3H1QA 1U2VA 4K41A 1YXQA 4PKGA 3FGUA 5EY4A 1QQNA 2EWSA 4YDUC 4CD1A 5KQDA 3VEVA 3LDOA 5BPNA 1TUUA 2GTDA 3LM9A 3HI0A 3W3DA 4FWPA 4JHDA 3QBWA 3AAPA 5AR0A 4CBWA 1RFQA 3O1WA 4L3QA 3WXKA 4BGAA 1KAXA 3MDQA 1BUPA 3H3OB 3FE1A 3H45C 5EXWA 4BC3A 4E1JA 4GNIA 3C0BA 4FL9A 1NGEA 2P9SB 3A0IX 5TKYA 1HKBA 1QZ5A 2W41A 3M3ZA 4EAHD 2GUPA 2ZF5O 2I7NA 4KBOA 4BRHA 3A5NC 4WQ5A 2A41A 5FPEA 2KHOA 2A3ZA 1S22A 4F9OA 5AQMA 2P9LA 3ZETA 4JD2A 3BP8A 1HKGA 4IO8A 3ZX3A 4EHUA 3CETA 4JNEA 3EL2A 2P9UB 4BR5A 3LM2A 3VF4A 3DXMA 1C0FA 1NGFA 1U2VB 4CBXA 2FSKA 3VGKA 1GLLO 3O80A 1NGJA 3D7EO 4FWLA 5BRFA 1BU6O 3EKUA 5AQVA 4B1ZA 1MWMA 1XQSC 1XC3A 4FWQA 4PL8A 4JHDB 5AQTA 2HMPA 2ASMA 5ADXA 1GLBG 4IJNA 3FZMA 1V4TA 4H03B 2AA4A 4M63C 1DEJA 2D0OA 3DWLA 3VF6A 3HM8A 2Q0UA 4BRPA 3H1VX 5AQXA 3C7NA 3J8AA 2CH5A 3QBXA 1YUWA 1SZ2A 2ASOA 4BVPA 4Z94A 2IVOA 2E20A 5AQUA 3VGLA 5FPDA 2F9WA 4O5FA 2P9IA 2P9SA 4WQ4A 4IWVA 5BPLA 3CHWA 2UYTA 5FPMA 4DCHA 3VGMA 3ZX0A 4M7XA 1S3XA 3G25A 1GLJO 2Q2RA 2P9LB 4PKIA 3ZETB 4JD2B 4BRKA 3DXKA 1JCEA 1BOTO 2NLXA 1E4GT 4ISFA 4MO4A 3IMXA 3WXLA 1ZBSA 3FR0A 2QWMA 5AQIA 3DXMB 4BRNA 5AZIB 1NM1A 2QWLA 5KPRA 4LC9B 5BPMA 1ZXOA 3JXUA 5F1XA 4CZLA 4B1VA 4CZFA 2ZGYA 3LDQA 3MN9A 1NGIA 3EZWA 1U6ZA 2P9KB 2E2OA 4BR2A 3LDPA 1X3NA 3WEEB 3FZFA 4EFHA 4CZIA 1DGKN 4B1WB 5KPZA 2BTFA 4MO5A 1ESVA 3CJ1A 4JN4A 4BR9A 1XUPO 2QWRA 3BEXA 1HPMA 4GY2B 1BO5O 2ZWHA 3MN6A 3VENA 2FSJA 3BF1A 3AY9A 4B1XB 4B1UB 3SMSA 3VERA 4H5RA 3C7NB 4QS9A 1NWKA 2IVNA 5AQZA 1YVNA 4JAXA 2VCPA 4PL7A 5CE3A 4M7YA 2P9IB 2FXUA 4BC5A 2PAVA 3O6WA 3HZ6A 2P9PA 1IG8A 4BRCA 3ZX2A 3LL3A 3QMLA 2E2PA 2YHWA 4EIAA 3F9MA 5AQSA 3UB5A 5BN9A 4CD3A 1H1VA 5AQPA 4H5NA 1MA9B 5LJWA 2VWBA 4XH1A 3L4IA 3TU5A 3DXKB 4BQLA 5JLFA 1HX1A 3D2FA 3HSCA 4BR7A 3EKSA 3MCPA 4QS8A 2GELA 1NGGA 1MWKA 4WQ5C 2DPNA 2V7YA 1JCGA 4A62A 3HTVA 2A5XA 5BRDA 4XEIA 1ATSA 1X3MA 1SQKA 1ZC6A 5EX5A 2CH6A 1GLDG 3CQYA 1NGCA 3ID8A 5AZIA 1NGBA 2PBDA 2D1KA 5AQGA 5AQYA 5JICA 4H0YB 4RTFD 3CQXA 4XH4A 4DB3A 5BN8A 4K43A 4K42A 1NLVA 2CGKA 2YJFA 1ATRA 4I6MA 5FPNA 3O08A 2P9KA 3TPQA 3U4LA 2FF3B 2ASPA 3WEEA 4BG8A 2CGLA 3EN9A 1G99A 3DJCA 3ZEUA 1DKGD 4H5WA 5KPTA 1BG3A 3UKUA 4Y0WA 3HBTA 4XH5A 3LDLA 4AM6A 4BQZA 5F2RA 4BR0A 4FWMA 4MLEA 3GBTA 2YHYA 1NGDA 3U9DA 2QXLA 2E2QA 2FSNA 2P9PB 3W0LA 4O8KA 2HOEA 3VEOA 1OKJA 4FOEA 4BRDA 1KXPA 2OANA 3GL1A 4FWKA 3I33A 3OHRA 4WQ4C 3M6GA 3D2FB 3FZKA 2GWKA 3VESA 4A61A 4A2AA 3CJ9A 2ITMA 1NGAA 3IUCA 1QQOA 3QFUA 2Q97A 3QB0A 4FPAA 4BVOA 3QICA 5KQ8A 1T6CA 2YJEA 3GDQA 4H0PA 4H5VA 4CZJA 4CZEA 5E84A 3UKRB 5I9EB 4IZ9A 4FWOA 3VEYA 3DAWA 4BC2A 4I6MB 1BWFO 1NGHA 3LDNA 3CJCA 5AQHA 1BA1A 1R59O 4HTLA 3U8XA 1LOTB 3KZBA 1P8ZA 2H3GX 2YI1A 3ZEUB 4NO7A 1Y64A 3UKUB 4ISEA 5AQJA 1SAZA 3H3NO 4BG9A 3BF3A 2ZGZA 1BA0A 1TYQB 1GLFO 5E26A 3KVGA 4RCHA 2Q0RA 3O8MA 4HWIA 4FO0A 3R9PA 4CZGA 2CGJA 3M1FA 3VPZA 4BGBA 4BRMA 4FSVA 1HJOA 5EVZA 3R6MA 2W40A 4YDUA 2A42A 3A5LC 3CIPA 4FWSA 3EO3A 4CBUA 4FWRA 4BRLA 3ULEA 3MN5A 3H6EA 4K25A 1Z05A 4RWTA 3MMVA 1J6ZA 3VEWA 2V52B 1V4SA 1WUAA 4NB4A 4BRIA 4BRGA 1KAZA 5F0XA 3GOIA 2E1YA 5AQLA 5AQRA 3CJBA 2E88A 3QFPA 3L0QA 4IJAA 4DQ8A 1MDUB 2E2NA 3R8EA 3I8BA 3QDKA 3D2EA 4FWNA 4FPBA 2NZTA 2E8AA 1YAGA 3VEZA 2QWOA 1LCUA 2QWPA 1X9JA 4BRQA 1HKCA 3A5MC 5AZJA 4BRAA 4BROA 3UKRA 5AQKA 1K8KA 5JLHA 2V7ZA 3MK6A 3RSEA 3S41A 2HF4A 3MN7A 3VOVA 3WXJA 1JCFA 4H0TB 2D4WA 1T44A 4H5TA 5AFUH 1TUYA 3VF2A 4DHYA 3B8AX 3WUHA 1D4XA 5BRHA 3SK3A 2F9TA 3P4IA 2IVPA 1HLUA 2P9NA 4H0XB 4BRFA 3ATVA 1C0GA 2IIRA 2QM1A 4ISGA 2HF3A 3KHYA 4BREA 5ADXH 1Q18A 1TYQA 2E1ZA 2FF6A 3CJAA 3AARA 1HUXA 5AFUA 2WUSA 1RDWX 5AQQA 1GLEG 2Q31A 4CJ7A 3WT0A 3SJHA 1NMDA 3CERA 3ULEB 2QW9A 3WXIA 4B1YB 2I7PA 3FLCO 4QS7A 4EHTA 5JMVA 1WOQA 1GLCG 3H46O 3O4WA 5AQFA 5AQNA 3WQTA 2Q1NA 5EOYA 4IXCA 3A5OC 3WQUA 3L6QA 3AAQA 3FZHA 5BREA 2D0PA 2NRHA 5LJVA 2FLOA 3ENOA 5ELZA 3GE1A 4J8FA 3D2EB 1QHAA 2A6AA 1NBWA 4BC4A 5BR9A 1RGIA 4CZHA 4CZKA 3GG4A 2YCHA 1E4FT 2GWJA 1BDGA 4H0VB 1KAYA 2VYPA 3IFRA 5AQOA 2BUPA 5AZJB 3A8YA 1T6DA 4MLHA 5AQWA 2YHXA 1K8KB 3RSEB 3ENHA 3VEXA 1IJJA 3ATUA 3O5BA 1Z6RA 4B9QA 4CI6A 3O1BA 1GLAG 4BR4A 2V51B 4A2BA 2Q36A 3FZLA 3U9ZA 1CZAN 4AM7A 2P9NB 1QQMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QTDA 3VETA 3QETA 4H0OA 5E41A 2X6NA 3SLCA 4BDYA 3LP3A 2YKMA 2A40A 3L4QA 5B8HA 2P9UA 3SMPA 1EQYA 4ID5A 3HOSA 2RKIA 3ZLJA 3ZSVA 4AHVA 5LY3A 1U2VA 4RW9A 1K9MO 3RRHA 3FGUA 2EWSA 4YDUC 5GADP 3LDOA 3HSTB 4YY3K 1OVQA 4FWPA 4JHDA 3U3GA 1RTHA 3OYFA 4L3QA 4I9QA 1BI4A 2OTJN 3PUFA 1P90A 4DWIA 2E6MA 1BUPA 2ATQA 4F8RA 2VQEK 1J5OA 1JJ2M 2G8IA 3MX2A 4CHNA 1BCMA 3FE1A 1KC8O 3C0BA 4WFAL 4MDBA 1EP4A 4E7IA 2Z1JA 3SQ2A 3PY8A 4F4KA 4J2BA 4E7KA 4I2PA 3THWA 4DR1K 1WN7A 4IEEA 4BRHA 3LWMA 4WQ5A 5LL6Z 1YVUA 3EE8A 1I39A 3I8DA 3SUNA 4JD2A 3AVHA 3BP8A 4YOUA 2HHTA 2YNHA 4N41A 2HHHK 4CJEA 1ZBFA 4IOAL 3MEEA 1C0FA 2RF2A 4LH4A 1RDUA 3MAQA 1L3VA 1NGJA 4JKBA 3VQQA 1BU6O 4NYFA 2XY8A 4Z4EA 1TKZA 1BQMA 5LMNK 5AQTA 4RG8A 2D0AA 3VQ7A 3FZMA 4F2RA 3K5LA 2VG5A 4KH4A 3NF9A 3DLGA 1QTMA 4JYAK 2AJQA 4QCLA 1BIZA 2D0OA 1JLQA 3E9PA 5MLCQ 4F3OA 1L3TA 4NCBA 3D6RA 3QEWA 4BRPA 3QBXA 2DFHA 1YUWA 3RMDA 1SZ2A 2IVOA 2E20A 3OYDA 4LF7K 3VGLA 4O5FA 3PV8A 3CQ8A 1NJXA 2O8DA 3WNHA 4CJ4A 2UYTA 2KW4A 3N4QA 5FPMA 3VGMA 4LSLA 4DCHA 1UAXA 5FROA 3OJUA 4M7XA 4DV4K 3TAFA 3ZETB 4AF1A 1BOTO 1E4GT 1W97L 3DMJA 4ISFA 4FLWA 5CZ1A 3QO9A 4CHZA 2QWMA 5AQIA 4I2QA 4FXDA 4JS5A 4LC9B 5BPMA 1N32K 1SL2A 5HRRA 4JKGB 3SQ1A 4CZLA 1VQMN 1TVRA 2ZGYA 3LDQA 3MN9A 1L3UA 5C42A 5D3GA 1Q82O 1RDDA 3HRGA 4CESA 2P9KB 3LDPA 1X3NA 5M1PA 1ZYQA 5C0YA 2Y1IA 4PQUA 1XUPO 2QWRA 4AHUA 5J2NA 4FVMA 4PHTX 4NCGA 3ZSWA 1LWCA 4GY2B 3SI6A 2FSJA 1HNXK 5LMUK 4FJKA 4B1UB 2G8KA 1TAQA 2IGIA 5K14A 4EP5A 5CE3A 3AVMA 4K8XA 4M3TA 2P9IB 3VN5A 2PAVA 4BE0A 1O1WA 4BRCA 1NKCA 3QMLA 2E2PA 2YHWA 3F9MA 5GIPA 4C8KA 5BN9A 3TSPA 4FLXA 4LFBK 1H1VA 4H5NA 3JYTA 3ALYA 4FW1A 1J53A 3ID6A 3TU5A 3DXKB 2X74A 3MECA 1NK6A 3HSCA 4FJ9A 4LF5K 4CJUA 3PX0A 4YFUA 1MWKA 5BR8K 1Q7YO 4CEAA 4NYNA 3SNNA 4N76A 1NK8A 3TANA 5JVHL 4JI8K 1NGCA 3C94A 3ID8A 1NGBA 4LF9K 5AQGA 2D5RA 1HYSA 1RBUA 5KRTA 1GOAA 1S6PA 5BN8A 4FJ8A 2KLAA 1ATRA 5FPNA 4JLHA 2ASPA 3KLFA 3EN9A 3AVKA 4KI6A 1DKGD 4I7FA 3MWPA 4H5WA 4C8LA 4EZ6A 3UKUA 1IO2A 4FJNA 4AM6A 4DSLA 1CZ9A 3CM5A 4BDZA 4GVEA 3DOLA 4AHCA 1BHLA 4FK2A 4CCHA 3U9DA 1S1UA 3CM6A 4FJXA 3OYCA 4IFEA 2B5JA 4LFCK 3HPGA 1O13A 3I33A 1NK9A 4WQ4C 3QEVA 3M6GA 3D2FB 1IKXA 2GWKA 3VESA 3OYKA 1Q86O 3L2VA 1K6YA 4JRPA 4A57A 4B8CA 3ZSYA 1BIUA 2QXFA 5KRSA 4X66K 3GDQA 4H0PA 4H5VA 4CZEA 5E84A 3ISNC 3QLHA 4GV3A 3V1RA 1R59O 1I3AA 3AVCA 2UUBK 2YI1A 3PLAA 1U04A 3SZ2A 4N56A 4E72A 2ZGZA 4OPHA 1BA0A 3HJFA 4CJTA 5DK5A 3OYIA 1UA1A 3RTVA 3THYB 3KVGA 3NMUA 2Q0RA 3G6EN 1LWFA 4GMJB 2E5LK 3O3GA 4FO0A 1S1XA 4IDHA 4OKKA 2CGJA 3R9PA 4CZGA 3QEIA 4BGBA 1HJOA 3BY5A 1VK0A 2HBMA 3R6MA 4YDUA 4WFBL 3A5LC 4DV2K 1HRHA 4CBUA 4BRLA 3LALA 1NJIO 3MMVA 4CGFA 3T1YK 1XMQK 2V52B 4B3SK 5AQRA 4E89A 2OPSA 2E88A 1S9GA 3CJBA 3QFPA 3ZCMA 4IJAA 2O8EB 1MDUB 3TR8A 3TSUA 3HP6A 5TKWA 3E66A 3R8EA 3D2EA 4H8KA 3QESA 3VEZA 4JRQA 2O8FA 4CHYA 4CIGA 5C25A 3HVRA 1T3VA 4Y1DA 2WOMA 3EZ5A 5M1KA 2V7ZA 1W7AA 2XHBA 3VOVA 4CJFA 3LDSA 4OGEA 2D4WA 1TK8A 2Z1IA 2FBYA 1W0HA 3SK3A 2Z1GA 2B4JA 4YORA 1HLUA 2P9NA 4B8AB 4OKJA 4FJIA 3SAHA 1VQON 5EU7A 2HW3A 1TYQA 1WSEA 4ELVA 3THXB 5M1QA 2C1GA 4CJ7A 3SJHA 3CERA 4B08A 1WBDA 2FBXA 1LWEA 1KD1O 3FLCO 5JMVA 1WOQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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