2Q31A

Actin dimer cross-linked between residues 41 and 374 and proteolytically cleaved by subtilisin between residues 47 and 48.
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
362
structure length
335
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Multiple crystal structures of actin dimers and their implications for interactions in the actin filament.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 106
structure length 335
sequence length 362
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q31A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q31A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q31A03
5FPMA 2YCHA 3QBWA 5FPDA 3L4IA 1T6DA 2Q0RA 3ENHA 4BGAA 3FZKA 2FSJA 4IXCA 1T6CA 1QQNA 3UKRA 4CBXA 2V7ZA 4BQZA 3BF3A 3ID8A 1GLFO 4H5TA 4PL8A 3MN7A 4QS9A 4CZIA 5B8HA 3UB5A 2F9TA 3FFKB 3CIPA 3O1BA 4EHTA 4BRMA 2HMPA 4FL9A 4IZ9A 3GBTA 1BA0A 1GLLO 1HKGA 3DAWA 3LDOA 4MLHA 3WEEB 2Q1NA 5AQWA 4PL7A 4BRCA 4EHUA 1TYQB 3FZLA 1ATNA 2QM1A 2BUPA 3CJAA 1LCUA 5BN9A 5ELZA 4BC4A 4EAHD 3A0IX 5F2RA 2OANA 1BWFO 4H03B 3R9PA 2YJEA 3B8AX 4YDUA 2E1YA 3BF1A 2Q0UA 4XH5A 1Z05A 1NMDA 3HSCA 3W3DA 1NM1A 4FWNA 3ZEUB 2P9NB 5ADXH 3MN5A 1NGFA 5AQQA 1RDWX 4NB4A 3VEXA 4CZHA 5AQJA 2NRHA 5AZJB 4C23A 3FLCO 4CBWA 5AQTA 3L6QA 1NGIA 4BR2A 2CGKA 3RSEB 3HBTA 4BRIA 3KHYA 2W40A 5BPLA 3DXKB 2VWBA 2GEMA 2P9UA 3UKUA 1JCEA 3U8XA 3AARA 5JICA 3HTVA 3CERA 3MN6A 4WQ5C 4CZGA 5CE3A 2BTFA 2P9KA 3FGUA 3C7NA 3QMLA 3ULEA 3VETA 1QQMA 2QWPA 2UYTA 3CJCA 1KAZA 4CD1A 2E2QA 4HTLA 3D2FA 3LM9A 2A42A 1BO5O 2P9IA 3OHRA 4B1UB 5AQGA 1LOTB 4WQ4C 5AQUA 4B1VA 2V51B 1OKJA 4M7YA 1MWMA 1XC3A 4O5FA 3O1WA 5E26A 2P9SB 4JAXA 4FWOA 2Q36A 1C0GA 4CZFA 1TUUA 2ZGZA 5AZIA 4ISGA 1NGCA 3VEWA 5BRFA 4BRPA 2WUSA 2FF3B 1IJJA 3UKRB 3VESA 1HPMA 4BRNA 5BREA 4FWRA 3LDPA 4NO7A 3L0QA 1V4SA 5F0XA 1HKBA 1Q18A 1BG3A 3O6WA 5F1XA 3O8MA 4H0YB 3M6GA 1GLDG 2ASOA 3DXMA 1QZ6A 2ZWHA 2D1KA 2FSKA 3DWLA 4M7XA 5KPTA 1DGKN 5AQXA 5EX5A 5FPNA 3U9ZA 2P9LA 3FZHA 4IJAA 4FWLA 3ZETA 2IVPA 3DJCA 4MO4A 3JS6A 3ZX3A 1GLEG 3ZX0A 3BEXA 1SQKA 3H1VX 3SMPA 5JLHA 1KXPA 5KQDA 2HOEA 2PBDA 1NGHA 5TKYA 4BRLA 3VPZA 2Q97A 4PKIA 1X9JA 2ZF5O 4CZJA 4A2BA 2E2NA 4DQ8A 2AP1A 4FSVA 5AFUA 1CZAN 1YAGA 2P9PA 3I8BA 5AQNA 3TU5A 4B1WB 3LL3A 1NBWA 4BREA 3VF6A 3VGLA 3VEVA 1EQYA 1BUPA 3D2EA 5EVZA 2ASMA 1XQSC 1HJOA 2FXUA 3LM2A 5AQLA 2P9UB 3UKUB 3AAQA 2A6AA 2E20A 2E8AA 3D7EO 1MWKA 1RGIA 2HF3A 2D0PA 1MDUB 3AAPA 5AQPA 3AY9A 1ATRA 5AQFA 4BGBA 1SAZA 4H0XB 3CQXA 2P9KB 3C7NB 4H0VB 3LDLA 3R6MA 4XH4A 3ULEB 5FPEA 3U4LA 2V52B 2FLOA 3EZWA 4BVPA 4CZEA 2NZTA 2CH5A 2FSNA 3ZX2A 3D2FB 4LC9B 2P9IB 4GY2B 4J8FA 4EFHA 4K42A 5LJVA 1GLAG 4BRGA 3G25A 3CJ7A 2ZGYA 3QDKA 1X3MA 4I6MA 3QFUA 1S22A 4XH1A 4DB3A 2FF6A 4Y0WA 5AQKA 4F9OA 1SZ2A 3CJBA 4RCHA 3QFPA 1WOQA 4H0OA 5AZIB 4L3QA 4BQLA 2QWQA 3ATVA 3CI5A 1U6ZA 3GE1A 3LDQA 3WQTA 1GLBG 2W41A 1QHAA 2YI1A 3O4WA 4JNEA 5AQYA 4RWTA 5AR0A 1J6ZA 1GLCG 1ZBSA 4A61A 4WYBA 1V4TA 1D4XA 1HLUA 2D0OA 4BRHA 2QWMA 2CH6A 5AQHA 4BC2A 1T44A 2KHOA 3QBXA 3A5OC 4FWKA 3C0BA 1QZ5A 2DPNA 3DXMB 2YHWA 3A5MC 4H5VA 1NGJA 3J8AA 3WXIA 4IJNA 3FE1A 3EL2A 4FWMA 1Y64A 4B9QA 5AQMA 3U9DA 2QXLA 5BN8A 3FZFA 1R59O 5BPMA 2P9LB 1JCFA 4JHDA 3I33A 1HX1A 3F9MA 3H3NO 3ZETB 2V7YA 4B1YB 4BRAA 2AA4A 4Z94A 5JMVA 2A41A 2GTDA 3S41A 3WXKA 4JD2A 3O08A 1P8ZA 4BVOA 1QQOA 5E84A 3EKUA 3EO3A 4YDUC 4BRDA 1C0FA 2QWLA 1E4GT 4B1XB 3QB0A 1YVNA 4M63C 1ESVA 4FPAA 2HF4A 3H3OB 5KPZA 4FOEA 1NGDA 1NGAA 4O8KA 2E2PA 2P9PB 3SMSA 4K41A 3LDNA 2CGLA 3IDHA 3D2EB 3CJ1A 4HWIA 1NWKA 1H1VA 3O80A 2GELA 2VYPA 2YHYA 4BC3A 2Q31A 3UE5A 2A3ZA 3MDQA 5EOYA 5AQSA 1JCGA 3CJ9A 3EN9A 4CZMA 5ADXA 5AQVA 2A5XA 4H0TB 2YJFA 1BU6O 2IVNA 4BR9A 1U2VA 4KBOA 4FPBA 1KAXA 4H5WA 2VCPA 4WQ5A 2QWOA 3MN9A 3GG4A 1X3NA 1K8KA 3O5BA 5BRHA 3W0LA 4CZLA 1XUPO 1E4FT 2NLXA 4I6MB 3R8EA 3WQUA 1KAYA 4EIAA 4H0PA 3VGKA 4CI6A 1ZC6A 3BP8A 4A62A 3BUZB 3MMVA 4WQ4A 2ASPA 3GOIA 2QWRA 4DCHA 2I7NA 3GL1A 2E2OA 5EXWA 3M1FA 4AM6A 4FWPA 2ITMA 3A5LC 2GWKA 3GDQA 4BRKA 4CZKA 1BOTO 3VGMA 5BR9A 1ZXOA 5AQZA 4BRQA 5JLFA 3HM8A 4QS8A 3SK3A 4CJ7A 2CGJA 4FWSA 3H6EA 4BRFA 3IUCA 1G99A 3MK6A 1HUXA 3VOVA 3VENA 5I9EB 4PKHA 3CHWA 3A8YA 4E1JA 3VERA 5LJWA 3CETA 3VEOA 2IIRA 3FZMA 4JHDB 4XEIA 4AM7A 3HZ6A 1YXQA 2E1ZA 1BA1A 4BR4A 4DHYA 3M3ZA 2QW9A 2I7PA 4K43A 4H5RA 3KVGA 4H5NA 3EKSA 1BDGA 4JD2B 4MO5A 3WEEA 2QWNA 4ISFA 5BPNA 1TYQA 1NGGA 4QS7A 5AFUH 4A2AA 4IO8A 3SJHA 2PAVA 3VEYA 4FO0A 3ENOA 2A40A 3WXLA 5LY3A 4CD3A 4B1ZA 4BR0A 1DEJA 5AQRA 2J4RA 3VF2A 3MCPA 4IWVA 3ATUA 2F9WA 5EY4A 1YUWA 3H45C 3QICA 4K25A 1MA9B 4JN4A 4ISEA 5AQOA 3ZEUA 2P9NA 3CQYA 3A5NC 5AZJA 2H3GX 3JXUA 4FWQA 3H46O 1TUYA 4PKGA 3RSEA 3VF4A 1DKGD 2YHXA 3FR0A 3WT0A 4BROA 1S3XA 3IFRA 4CBUA 4BR5A 3DXKA 1ATSA 2Q2RA 1GLJO 2D4WA 4BG9A 4GNIA 3HI0A 1U2VB 1NGBA 4MLEA 2E88A 4RTFD 1RFQA 1K8KB 5KPRA 3VEZA 3H1QA 4BR7A 2GUPA 1HKCA 1WUAA 1NLVA 2EWSA 5AQIA 3WUHA 3P4IA 3TPQA 3SLCA 4BC5A 1Z6RA 1IG8A 2GWJA 5KQ8A 5BRDA 3KZBA 1NGEA 3IMXA 4FOIA 4BG8A 2IVOA 2P9SA 3WXJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KTQA 2YCHA 2UU9K 4M3ZA 3L4IA 3V9WA 4B8AB 4C1NI 5C24A 3O9UA 4IDHA 3UKRA 3DLHA 4BQZA 3ID8A 1GLFO 4PL8A 2UUBK 1RBRA 1HR0K 1NOZA 4GV6A 4EZ6A 1QE1A 3FFKB 3CCVN 1M90O 4BE0A 1B9DA 2YNGA 1U47A 5GINA 1RDAA 3DOKA 3KWGA 4B3RK 2Q1NA 1OVQA 3I8DA 3SQ2A 4EZ9A 4J2EA 3DI6A 1NKBA 4Z4CA 3V9SA 2QM1A 3AVAA 2BUPA 5J2PA 1LCUA 4RW4A 5D3GA 2VG7A 5ELZA 3A0IX 4N56A 3R3LA 3B8AX 4OJRA 2O8FB 4KTZA 1JL1A 1XNQK 3NFAA 3PIOL 1NMDA 1ASVA 4FJ7A 4FWNA 3NGZA 3J7YP 3ZEUB 4YFUA 2P9NB 4FJLA 5ADXH 3MN5A 4IKFA 1RDWX 4NB4A 3OYCA 1TAQA 2XRIA 1S1XA 4W5OA 4CBWA 1VQ4N 3UIQA 3WNGA 3SI6A 3CFRA 3HBTA 2W40A 1Q8IA 3OBYA 4IFYA 1NK8A 2PYLA 3HVTA 1JCEA 3U8XA 5JICA 3OY9A 1FW6A 4WQ5C 1A5VA 3P31A 3L3VA 3ULEA 4AH9A 2UYTA 2O4GA 3CQ8A 2A42A 3HP6A 4B1UB 4CHOA 4KHNA 3TI0A 4WQ4C 3H08A 5AQUA 5DM6L 1MWMA 4DR7K 4IFEA 3QETA 1C0GA 3QO9A 3ALYA 3SQ0A 2KFZA 1TK8A 4CEFA 2XY5A 3NH2A 1SKWA 4JKHA 4FW2A 4E1NA 1TAUA 1C1AA 3V9ZA 3DOLA 2ZM6K 3L0QA 1Q81O 1Q18A 1RBSA 1RT7A 4KV8A 3M6GA 3HK2A 1GOAA 3D45A 1QZ6A 2BGGA 3DWLA 1SS6A 4M7XA 2ZJQL 5AQXA 4O55A 5EX5A 1NK9A 1RDUA 3BZKA 3DJCA 3O4NA 4MO4A 4W5RA 4NLBA 2E6MA 3MWTA 4W5QA 3SUPA 4HCBA 2G8VA 5KQDA 2QA4N 4GV9A 1NGHA 1XC9A 2ZJPL 2Q97A 1VQ9N 5GADP 3NVKA 1VQLN 3SUNA 1S9GA 4N47A 3E9PA 4LF7K 1RT1A 3ID6A 4DR3K 4FVMA 2AP1A 4FSVA 1YAGA 3ZSQA 2WTUA 1HYVA 1ASUA 4Y1DA 3VF6A 1EQYA 5EVZA 4DSJA 1XQSC 2FXUA 5AQLA 3U3GA 2A6AA 2E20A 3SV4A 1KVBA 2B5JA 1MDUB 5AQFA 4BGBA 4H0XB 4NYFA 2P9KB 4MDAA 3C7NB 5DMRA 2NRTA 2V52B 4BVPA 3AO2A 4JI2K 2RE2A 2FSNA 1TK5A 3D2FB 2D0CA 3B6PA 3VQ7A 4GY2B 4J8FA 4EFHA 5J2NA 1GLAG 4FLYA 3MXMA 4CHPA 1OH7A 4JRPA 1S22A 3TAPA 4DB3A 4F9OA 2QI2A 1SZ2A 3CJBA 4DQQA 4H0OA 5AZIB 4BQLA 4IEIA 2O8EB 4OPHA 3OYMA 4LY7A 1U6ZA 3WQTA 2W41A 3SYZA 5HROA 4DTXA 1QHAA 3O3GA 5I3UA 3QINA 4JNEA 4RWTA 5AR0A 1RBTA 3LANA 4CEDA 4B3TK 3SNNA 3ZLJA 4DQRA 3A2FA 4E3SA 3NCIA 3EY1A 2OTLN 4BDPA 3NGIA 1VSKA 5GAEP 4FVUA 3WXIA 3FE1A 4DR1K 3HRGA 5AQMA 2NNWA 3U9DA 4BE2A 2GBZA 3DRRA 5BN8A 3KKSA 3AVLA 4B9LA 4B1YB 3QESA 2A41A 2W6KA 4LH5A 3WXKA 4OVLA 1DTQA 3O08A 4OO1J 5SZTA 4FM0A 4BVOA 1R0AA 4K0KK 2QWLA 2VWJA 3IKMA 3OYHA 4OLBA 2KFNA 2DFFA 3L2WA 4YY3K 1YVNA 4M63C 1ESVA 4FPAA 1L3VA 4JKDA 2HSTA 4C8NA 4CHZA 3VQ9A 4DV2K 1WSIA 2P9PB 3AVMA 4CERA 4IG0A 2VQFK 1KSPA 1NK7A 3CJ1A 2KKZA 2AJQA 3O80A 4PWDA 2GELA 2VYPA 1C1CA 1E3MA 3PV8A 2Q31A 3UE5A 2X6NA 3K57A 2HNDA 2UXCK 3ZSVA 1IG9A 4CJUA 4DQPA 4CZMA 4UQGA 4H0TB 2YJFA 4U7BA 1SKSA 4G9ZA 1BI4A 4H5WA 4JKEA 3PO5A 1RBUA 3DMJA 2HBKA 2ZD1A 4PY5A 3CFOA 3MN9A 1SKRA 3AO5A 4CEEA 5BRHA 2G8KA 3KLIA 3NF7A 4CI6A 4CHYA 4A62A 3BUZB 3KLFA 3L8BA 1J5EK 5I42A 1S9EA 1X1PA 3BY5A 4DCHA 5CZ1A 4JI5K 1XNRK 3GL1A 1IKWA 1XI1A 5T7BA 4AM6A 3RR8A 4DR2K 1HNXK 2GWKA 5HL7L 4JKAA 1BISA 5KTQA 4BRKA 4IDKA 4CZKA 3CYGA 3AVNA 1EP4A 1VHXA 4CGIA 2QKKA 2PY5A 4KHYA 4FW1A 1T8EA 5JLFA 4ID5A 3SK3A 4E89A 3H6EA 1IBKK 1O1WA 3QLHA 3EE8A 3VERA 2PZSA 4M3TA 3CETA 4DUYK 2IIRA 1JLQA 3TAQA 4B3MK 3T1AA 4WE1A 3PX0A 1YXQA 3P83D 1HYZA 4BR4A 1KC8O 5CYMA 3V1OA 4KTWA 3SAHA 3M8SA 1XMQK 1BDGA 1TV6A 2QWNA 1T03A 1TYQA 2O8BB 3NHGA 4IO8A 3ENOA 3AVJA 4DF4A 3U3YA 4JK9A 1ZBLA 3LALA 3TAGA 3PY8A 2VWKA 4IWVA 4DR4K 4DTUA 1X9WA 4KH6A 3QEVA 3H45C 3TTCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1RCH A;  2QW9 A;  1NK5 A;  1X9S A;  4DSE A;  3WEE A;  4H5N A;  5BPN A;  4ISF A;  5AFU H;  3LP2 A;  3T19 A;  4CD3 A;  2DTU A;  1QSS A;  4BR0 A;  5H1S Q;  3VQ8 A;  1RTJ A;  4NCB A;  3KK1 A;  4JKF A;  1TK0 A;  3CD6 N;  3F9K A;  2J4R A;  3L3U A;  3V1R A;  1OH6 A;  5M1O A;  4BE1 A;  3C95 A;  4B9T A;  1F21 A;  1BGX T;  3QIC A;  1YVU A;  1MA9 B;  4JN4 A;  4ISE A;  4GVE A;  3J80 O;  3OW2 M;  3AV9 A;  4KHS A;  5AZJ A;  4CF8 A;  3JXU A;  5HRR A;  3RSE A;  3VTI A;  4BRO A;  4ELU A;  2FBT A;  3F5T A;  1T3V A;  4JKC A;  4BR5 A;  3MXI A;  3DM2 A;  1ATS A;  4DTO A;  4DR5 K;  4ZTF A;  2Q2R A;  3IG1 A;  1P90 A;  2D4W A;  4GNI A;  3RVC A;  1U2V B;  4CFA A;  1NGB A;  4F3T A;  1TGO A;  4Z4I A;  1L3U A;  3LP1 A;  4M41 A;  4C8O A;  1YHQ N;  4EP4 A;  1K8K B;  3Q7B A;  4E19 A;  3TSP A;  1LWF A;  2O8D B;  3SLC A;  3I0S A;  2G8U A;  2HBJ A;  3HPG A;  4FJG A;  2X78 A;  4FLU A;  1VQ6 N;  1NGE A;  4Z4G A;  4I2Q A;  1HNW K;  2IVO A;  1Z25 A;  2VG5 A;  2P9S A;  3QEX A;  1YIT N;  4FJI A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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