2Q31A

Actin dimer cross-linked between residues 41 and 374 and proteolytically cleaved by subtilisin between residues 47 and 48.
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
362
structure length
335
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Multiple crystal structures of actin dimers and their implications for interactions in the actin filament.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 106
structure length 335
sequence length 362
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q31A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q31A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q31A03
2Q0RA 4WQ4C 3FZKA 4JD2B 2WUSA 1DGKN 2FF3B 4A2AA 3B8AX 3H45C 3VETA 3W3DA 3HM8A 3WEEA 1NGHA 2E1YA 3LM2A 3VGLA 5AQZA 4CZEA 2A41A 4ISGA 5EX5A 4IJNA 4JAXA 3WEEB 4C23A 2E2NA 5JMVA 1ZXOA 1H1VA 4EAHD 1BO5O 1KAXA 2ASMA 4MLHA 3FZLA 3RSEB 3P4IA 5AR0A 1P8ZA 4FWOA 4JHDB 5F0XA 4H0OA 3FGUA 2V51B 3D2EA 2E88A 2FSKA 5B8HA 2ITMA 4BRQA 1TYQB 1XC3A 4BRMA 3CQXA 3UKRA 3RSEA 3J8AA 3ENHA 5FPMA 2P9NA 3IMXA 3M6GA 3H6EA 1BA1A 1GLDG 4FPBA 5AQXA 1QQOA 1HLUA 5BRHA 2QWLA 3MN6A 1NBWA 3JS6A 5EOYA 3U9ZA 4BRHA 3EKUA 2P9PB 3VEZA 5EY4A 2D1KA 2FSNA 4BRFA 3FZMA 2HOEA 3VF6A 1D4XA 3L6QA 4FWNA 3QICA 2YJFA 1YAGA 3CJCA 4WYBA 1LCUA 4A62A 4PL7A 3U4LA 2PAVA 4FWPA 4IWVA 2CH5A 4E1JA 1V4SA 5JLFA 1DEJA 2E2QA 4FWRA 2YCHA 1QZ6A 2BUPA 2P9UB 2P9KB 3WXJA 4O5FA 3DWLA 2E2OA 2AP1A 1X3MA 2P9PA 2P9SA 2YHYA 3MMVA 5JICA 4BRAA 4H03B 1S22A 1BU6O 4BR0A 4CZKA 4H0YB 3JXUA 4JD2A 4M7YA 4H5TA 3WUHA 5ADXH 5BRFA 4B1ZA 5AZIB 4BQZA 4PL8A 1NGEA 3BUZB 2CGKA 2HMPA 1ZBSA 3SJHA 4DHYA 3O6WA 1TYQA 3F9MA 3MK6A 3ATUA 2HF3A 1JCGA 3ZX0A 1YVNA 3L0QA 4ISFA 4PKIA 2ZGYA 3S41A 3VOVA 1NGAA 3VEXA 4FWKA 3M3ZA 4MO5A 4B1UB 5EVZA 2I7PA 3CETA 4IJAA 3W0LA 5BPNA 2UYTA 1NGFA 3FZHA 4FL9A 5LJVA 3O1BA 4F9OA 1NMDA 2Q2RA 3H1QA 4K43A 3SLCA 3VENA 4BC3A 4EHTA 5LJWA 3GL1A 3MN5A 4BR7A 1C0FA 1U2VA 1YUWA 1OKJA 3CHWA 3VEOA 1GLJO 4JNEA 3UKRB 2EWSA 3KVGA 3D7EO 1QQNA 1GLAG 1JCFA 4K42A 4BRPA 4FPAA 4MO4A 2GWKA 1GLLO 2NLXA 4O8KA 4BR4A 4CZFA 4CZJA 1IG8A 4M7XA 1C0GA 4BRGA 5AQVA 1CZAN 5AQUA 3KZBA 4ISEA 5BPMA 2IVNA 3CJ7A 3QBXA 3ULEA 3LL3A 1WUAA 4MLEA 3EL2A 3BEXA 1ZC6A 1HKCA 3EZWA 1ATRA 3IUCA 3KHYA 4B1WB 3BP8A 4FWQA 3TPQA 5F1XA 1KAYA 4H0TB 2OANA 1GLCG 2P9IA 3ATVA 3ULEB 5AQPA 3EKSA 3IFRA 3MCPA 1Z6RA 1GLEG 2P9LA 5JLHA 5I9EB 5AQWA 3UKUA 3CQYA 4H5RA 4NO7A 5AQNA 2V52B 4FOEA 3A5LC 1BA0A 4WQ5A 4BQLA 3A5OC 4JHDA 4BGAA 4B9QA 1RGIA 2Q36A 1MWMA 3TU5A 3C0BA 3WXKA 4DB3A 4I6MA 1NLVA 4FO0A 2QWNA 3H3OB 3U8XA 4BR5A 5LY3A 3VEWA 2F9WA 4CZHA 1NM1A 1R59O 3ID8A 3A0IX 3CJ1A 2QWOA 3AAQA 3SMSA 5KPZA 5AQLA 4EFHA 1E4FT 3AARA 1ATNA 3VEYA 1KAZA 2P9IB 2IIRA 2A42A 2E1ZA 4CJ7A 2QW9A 3I8BA 3A8YA 2ZWHA 3DXKB 4CBXA 2QXLA 3CIPA 1NGBA 5KPRA 4BC4A 4DQ8A 4B1YB 3VPZA 3HSCA 3WXIA 4H0PA 1BDGA 5ELZA 1NGGA 4A61A 2CH6A 3LDQA 1G99A 1BUPA 2AA4A 2P9UA 3R6MA 1TUYA 1DKGD 2DPNA 5BREA 2PBDA 4JN4A 2ASPA 2FXUA 5AQOA 4IZ9A 2QWMA 4BRIA 3SMPA 4IO8A 2IVPA 2FLOA 2J4RA 4HTLA 2F9TA 4HWIA 2P9NB 3O08A 1EQYA 3QDKA 3A5MC 1XQSC 3GG4A 2D0OA 2FSJA 3DXMB 1QQMA 3LDNA 4CZMA 3BF3A 5EXWA 3ZX2A 4BC5A 4J8FA 4H0VB 2CGJA 3GDQA 2FF6A 5F2RA 2A5XA 2Q31A 2KHOA 1NGCA 3FLCO 1NWKA 3H46O 1BG3A 4AM6A 5AQYA 4AM7A 1GLBG 1JCEA 5FPDA 4XEIA 3QBWA 1BWFO 4H5NA 5ADXA 3ZEUB 4FSVA 3WXLA 1QZ5A 2IVOA 4A2BA 5CE3A 3DXMA 4K41A 2A40A 2V7YA 4BR9A 4DCHA 3M1FA 2YI1A 2NZTA 3D2FB 3DXKA 4RCHA 4XH1A 5TKYA 1J6ZA 3LDPA 1HPMA 4BVPA 4KBOA 1X3NA 3LDOA 3VF2A 4EHUA 5AZJB 3CERA 4CZLA 1Q18A 4BRCA 2E2PA 1SAZA 3QB0A 3ZETB 3C7NB 4B1VA 1HKBA 3CI5A 4K25A 4FWLA 3VGMA 3O80A 1NGIA 2ZGZA 1T44A 3HBTA 3GOIA 5AFUA 4CD3A 1HUXA 3L4IA 5BPLA 3AAPA 5AZIA 4I6MB 1MA9B 2YHXA 3OHRA 5E84A 3UE5A 5AQHA 3WQUA 4QS8A 3ZX3A 3O8MA 2Q97A 1KXPA 5KQ8A 3BF1A 3EN9A 2P9LB 5E26A 1X9JA 3I33A 1T6DA 5AQRA 3MN7A 3O5BA 4CZGA 4L3QA 3R9PA 2D0PA 3VERA 3HI0A 5AQTA 3VF4A 1SZ2A 3DJCA 1HX1A 3C7NA 1LOTB 1Z05A 4FWSA 3UKUB 1S3XA 2QWQA 2GEMA 4EIAA 1NGDA 5AQGA 4PKGA 3O1WA 4BG9A 1Y64A 2P9SB 1GLFO 3QFUA 2HF4A 1U6ZA 3FR0A 5AQQA 3LM9A 1NGJA 4PKHA 4Y0WA 4H0XB 3D2EB 1TUUA 3WT0A 2YJEA 1BOTO 1WOQA 3H3NO 4CBWA 4CBUA 4BG8A 4FWMA 5AZJA 1ESVA 1RDWX 4BRNA 4FOIA 4LC9B 2H3GX 3ZETA 4GNIA 1T6CA 2GELA 1MDUB 2E8AA 4YDUA 1RFQA 2V7ZA 3U9DA 1QHAA 3EO3A 3G25A 2QM1A 3WQTA 1K8KB 3FZFA 3R8EA 2QWPA 3FFKB 2A3ZA 4BVOA 5BR9A 5AFUH 4YDUC 3CJAA 3CJ9A 3D2FA 1YXQA 3MN9A 4BREA 1MWKA 5AQMA 4CI6A 5BN8A 4BRKA 1HKGA 2NRHA 2I7NA 2GUPA 1V4TA 4QS9A 2D4WA 3AY9A 3IDHA 4XH5A 5FPEA 3LDLA 2Q1NA 3VESA 1HJOA 2GTDA 4WQ5C 4WQ4A 3QFPA 3DAWA 2ZF5O 4CD1A 4GY2B 5BRDA 3A5NC 3HZ6A 5AQFA 3ZEUA 5AQKA 3GE1A 2VCPA 4BC2A 4RWTA 4M63C 2BTFA 3SK3A 3O4WA 4NB4A 2W40A 3ENOA 3UB5A 1ATSA 5AQJA 4IXCA 1U2VB 4BRLA 1XUPO 2GWJA 3VGKA 1SQKA 4BROA 5KQDA 3GBTA 3FE1A 4Z94A 4CZIA 2E20A 5BN9A 3H1VX 4BR2A 3HTVA 3CJBA 3MDQA 2YHWA 4XH4A 4H5VA 3QMLA 2CGLA 4BRDA 2QWRA 2W41A 5AQSA 2A6AA 4H5WA 2P9KA 2VYPA 4BGBA 5KPTA 5FPNA 4QS7A 3VEVA 2ASOA 1E4GT 5AQIA 1K8KA 1IJJA 4RTFD 2Q0UA 4B1XB 2VWBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CCRN 2YHBA 4WQ4C 2A1SA 3ZSRA 2FF3B 3HVTA 3H45C 3PX4A 3W3DA 3DMJA 4KB0A 3VGLA 1X1PA 4CZEA 3VA0A 1Q82O 1ZBLA 1RCHA 3T7ZA 5EX5A 2E2NA 4FJ7A 4MDBA 4EAHD 1KAXA 5JVGL 4JKCA 3FZLA 1J53A 1Y97A 4FWOA 4IFEA 4CERA 4BWJA 1C1AA 1NK0A 1A5XA 3CQXA 4I9LA 3EE9A 4CEZA 3CFRA 1L3SA 1HNXK 4CK1A 4JKBA 3K57A 4CJSA 4RG8A 4CIEA 1QVGM 1GLDG 4FPBA 1RTHA 5M1PA 3NF6A 5BRHA 4FLTA 3LP3A 4YOVA 4BRHA 3BGRA 2KQ2A 5EY4A 5HRRA 4O5BA 3G4SN 2ZJRL 2Q3SA 3ZSWA 2HOEA 4E1MA 5MLCQ 1TKTA 2Z1IA 4DUZK 3C95A 1YTUA 4FM0A 1BGXT 3SPZA 3U4LA 1RDCA 2PAVA 5JLFA 3SQ0A 4FJLA 2YCHA 3ZSZA 3OS2A 4LF8K 2ZJPL 3WXJA 3HPHA 2XY5A 4PUOA 4B9NA 2E2OA 2AP1A 1T7PA 3P31A 5JICA 1VQKN 1VSHA 5KRSA 4JD2A 4M7YA 3J7YP 1JLCA 2OPRA 4EZ9A 3HPOA 4PL8A 4FM2A 4ILJA 3MEEA 4DR6K 3MXIA 4E0DA 3LP0A 1Q9XA 3MK6A 3LAKA 2HF3A 1JCGA 1LAVA 2FBYA 1YVNA 2HHHK 2KTQA 3CCSN 3VOVA 3NF8A 3MXMA 4FWKA 5FRMA 3TAGA 4MO5A 4KHPK 2I7PA 1VQ7N 3W0LA 5BPNA 4FLYA 4FL9A 4AHSA 3VENA 3H1QA 4K43A 4A57A 5LJWA 2BH1A 3MN5A 1C0FA 4WCEL 1KTQA 2XY7A 3ZSQA 2VQEK 1OKJA 4M3XA 3CHWA 3U6FA 1VQNN 4DR2K 3KVGA 3P39A 4DF8A 2NLXA 1NK5A 1VSEA 3F2KA 4I7FA 3VQEA 4RW9A 4KFBA 1A5VA 3KZBA 4ISEA 1WBDA 1L3UA 4GKJK 2OTLN 5BPMA 3TTFA 1YITN 1RT7A 1WUAA 3AA4A 4U7BA 2UXDK 4B1WB 3NAEA 3BP8A 4CGJA 3ATVA 3DRPA 3N4QA 2HMIA 1BI4B 1Z6RA 3SBTA 1GLEG 5I9EB 1RT2A 2XRIA 1REVA 4NO7A 4FOEA 1BQMA 3VQ6A 4LSNA 4E7JA 3MXJA 4LFBK 2Q36A 4FLUA 1RBSA 4DB3A 3CYGA 1LWFA 4FO0A 2QWNA 3OBWA 3CMAN 3H3OB 3K9JA 1K6YA 3ASMA 2O4GA 3KKSA 4R5PA 3OJSA 3HSTB 1YVUA 3PV8A 2HHTA 3NVKA 2QTDA 5KTQA 1TK8A 3SUNA 3AAQA 3SMSA 1IBLK 3CCEN 4CJ7A 2HBLA 3I8BA 3A8YA 4CBXA 3NF7A 1T8EA 1QE1A 3L2RA 4JI1K 4IEIA 4FLWA 4B1YB 3ZCMA 4QOZB 3WXIA 4H0PA 1Q7YO 5ELZA 4M3TA 1NGGA 4DTMA 1BUPA 4A59A 3R6MA 1TUYA 1T3VA 2PBDA 3P38A 3NGIA 2NRTA 4BRIA 2BE2A 3TAQA 4LF6K 1SKWA 4CW7B 4FJMA 2UUAK 3O08A 5M1NA 1ASVA 3QDKA 4FW1A 3L3VA 4E7LA 4FJGA 3A5MC 1XQSC 3GG4A 1HNVA 5GAEP 2CGJA 3DLGA 1L5UA 5IWAK 1DTTA 5F2RA 2A5XA 3MAQA 4B9TA 1BG3A 2IOCA 4AM6A 2C1IA 4YNQA 2G8VA 1RDBA 5ADXA 4H5NA 4NYFA 1Q86O 4FSVA 4AHCA 2QA4N 4BE1A 5CE3A 3DXMA 4CJ5A 4A5BA 1D9DA 2A40A 2V7YA 4BR9A 1VSLA 2YI1A 5EU7A 3THYA 3CPEA 1EO1A 1WN7A 3I0SA 4FJNA 1J6ZA 3PY8A 4OO1J 4MFBA 3CQ8A 3LDOA 5AZJB 1VQ4N 4Y1CA 3AA3A 2E2PA 1SAZA 1U49A 3CI5A 3BY5A 3ZT3A 4CJPA 1IH7A 3GOIA 1HNWK 4N5SA 1LWCA 3U3YA 1FW6A 5C2FA 3AAPA 4IBNA 4NLCA 2VWKA 4I6MB 5AQHA 4DMNA 3WQUA 4QS8A 3AVNA 2Q97A 1WSHA 4MDAA 1XC9A 3RTVA 3NH2A 1S1VA 3QNNA 5E26A 5FRNA 3I33A 1C6VA 1T6DA 3AVAA 4CZGA 3T1AA 4FXDA 3HI0A 2NRWA 3RMAA 4DV1K 4DQRA 4IOCL 3ZSYA 3I8DA 1LOTB 4FWSA 1S3XA 4KH5A 3K2PA 4DV2K 3S3MA 4BE7B 3AA5X 1NGDA 5AQGA 3EEQA 2QKKA 3OYBA 4YOUA 3S9HA 4BE2A 4B3MK 2OPSA 3K5OA 3S5TA 4KH6A 3OW2M 3FR0A 2D0BA 3LM9A 4H0XB 1BHLA 3M8RA 1IKVA 1HMVA 5LMUK 1TKZA 1WSJA 5J2NA 3I56N 4UQGA 2H3GX 1RTDA 2O8BA 3L2WA 1NJXA 5D3GA 2GELA 2E8AA 4M3RA 3G0ZA 1QHAA 1GOCA 3G25A 4IG0A 5M1QA 4LF5K 1VQLN 2VGMA 3OYMA 2QWPA 1HQUA 4HUFA 3KK7A 3T1YK 1CLQA 4CEBA 1LW0A 4B3RK 3O9QA 4ZTFA 5KRTA 3CJ9A 3D2FA 5K14A 4FM1A 3O4QA 5AQMA 3V6DA 2IC3A 1KSPA 1HKGA 1NK7A 4DFMA 4DR1K 1N33K 2D4WA 3AY9A 2XO7A 4DV7K 4XH5A 1MU2A 4UY8O 4G1QA 4E89A 4JS4A 4WQ5C 3G6EN 1QSLA 4B3SK 3DAWA 1NK9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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