2Q36A

Actin dimer cross-linked between residues 191 and 374 and complexed with kabiramide c
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
369
structure length
360
Chain Sequence
b'ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Multiple crystal structures of actin dimers and their implications for interactions in the actin filament.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 126
structure length 360
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q36A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q36A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q36A03
1QQNA 4FOEA 5AQXA 3WUHA 2ASPA 5KPTA 3AAQA 1NGJA 1NMDA 3H6EA 5AQUA 2FXUA 2FLOA 2NRHA 4H0XB 1QQOA 1YVNA 4PKHA 5E84A 2P9UB 1KAZA 1K8KB 1HX1A 3ENHA 3FZLA 5AQMA 4A2AA 3LDPA 1E4GT 4FOIA 1S22A 1C0GA 2P9IA 2A3ZA 1TYQB 1GLBG 4QS7A 5FPNA 4BRMA 4EIAA 1RGIA 1BWFO 3FE1A 1GLDG 4CZGA 4HTLA 5KPZA 2A5XA 4CZIA 2QWRA 3O80A 4RWTA 4B1UB 4IJAA 2A40A 2F9WA 3TPQA 3WXLA 1X3NA 1K8KA 1SAZA 5AQTA 3D2EA 4BRIA 3WT0A 3BP8A 5FPMA 2IVNA 3L4IA 4BR5A 4EHUA 5AQOA 1TYQA 2Q31A 2ASOA 5AQFA 3A5NC 1OKJA 4I6MB 4M7XA 3VEOA 2Q97A 4BG9A 2P9LB 5BRFA 1NGGA 5BREA 1KAYA 3ATUA 4PL7A 4BG8A 3BF1A 3SLCA 4GNIA 4H5RA 4JNEA 5ADXA 2P9KB 3JXUA 1LCUA 4BRAA 2CGLA 3R6MA 3H45C 3QBWA 5AQWA 4DB3A 3H1VX 2YHXA 2E2QA 4I6MA 3CIPA 2P9LA 3A5MC 5LY3A 3VF4A 5AZJB 1X9JA 2V51B 3FZKA 1WOQA 4JHDA 1S3XA 4XH1A 2YJEA 3FLCO 2W40A 4WQ4A 1YXQA 2P9PB 4BRGA 5AQYA 3ZX3A 2P9KA 3HZ6A 3G25A 1ZBSA 2P9NB 5BPNA 1R59O 5KPRA 5LJWA 3KHYA 4H0OA 4C23A 3CQYA 3VPZA 4BRKA 3FZHA 2E8AA 1JCEA 3VEYA 3TU5A 1GLFO 4BQLA 3IFRA 1QZ6A 5ELZA 5AZJA 2YI1A 4BR9A 4BRDA 2GWJA 4JAXA 4K42A 3UKRA 4DCHA 3I8BA 3RSEA 1MWMA 4CD3A 3SMPA 3QFPA 2P9NA 4EHTA 2IVOA 3EZWA 4LC9B 4H0VB 1YAGA 4IO8A 4J8FA 3EKSA 1JCGA 1C0FA 3A0IX 3EN9A 3R9PA 4BREA 4CI6A 1XC3A 1XQSC 1KAXA 3WXIA 5F1XA 1U2VA 4ISEA 5AQNA 3JS6A 3LDQA 3A5OC 3DJCA 2IIRA 4MLEA 3M1FA 4MO4A 5ADXH 2VYPA 1NGFA 5F2RA 3FR0A 1KXPA 2GEMA 3QB0A 3ZETB 2FSKA 2PBDA 5KQDA 3J8AA 3HTVA 3HBTA 3H46O 3M3ZA 3WXJA 5AFUH 1Z6RA 4CZLA 3FFKB 1JCFA 2QWMA 2FSJA 2YJFA 4GY2B 4K41A 5AR0A 5EXWA 1X3MA 1T6DA 1EQYA 4BRNA 4YDUC 5AQRA 1BA1A 2QWPA 3FZFA 3O4WA 3WQTA 5KQ8A 3ZETA 3GE1A 4PL8A 5AQQA 4BRHA 5AQKA 1MWKA 2QM1A 4CZHA 5AQVA 2P9UA 2NZTA 4H0YB 4H5TA 1BOTO 3GOIA 3LL3A 1HUXA 1DKGD 1V4TA 3H3OB 3B8AX 4NB4A 4BR0A 4BVPA 3CJCA 3MMVA 4BGAA 3VESA 4FWOA 4MLHA 1QQMA 2ASMA 2ZWHA 5AZIB 4B1WB 3A5LC 3IUCA 4FWQA 2CH6A 2YCHA 2E2PA 3DXKB 4H0TB 4BVOA 2E1ZA 2QWNA 2V7YA 3CJAA 4ISGA 4H03B 5AQSA 3O8MA 3GDQA 3IDHA 5AQGA 2V52B 2HF3A 2E2NA 2W41A 1CZAN 3DXMB 4MO5A 3QDKA 2QWQA 5AQPA 4BC3A 5EX5A 2CH5A 2E1YA 4XH4A 1HKGA 5AZIA 3VEZA 4BC5A 1BUPA 2J4RA 5BPMA 4F9OA 2EWSA 4WQ5C 5FPDA 2VWBA 3DXKA 2E2OA 2UYTA 4BR4A 3ID8A 4CZEA 2GELA 3VGKA 4BROA 1Y64A 4BRQA 5TKYA 4A61A 1T6CA 1T44A 3DXMA 3VGLA 4DHYA 1U6ZA 3VETA 5B8HA 3MN5A 4RTFD 1QZ5A 4JD2B 3U4LA 2ITMA 3VEVA 3R8EA 2QXLA 4NO7A 1SQKA 1YUWA 3CJ1A 3CJ7A 2QWLA 5JLHA 1IJJA 4H5WA 2P9SB 3C7NB 3DAWA 3O08A 3C0BA 4H0PA 2FF6A 4IJNA 2P9PA 4IWVA 1NLVA 5AQZA 3SMSA 1J6ZA 4EAHD 3LDOA 3DWLA 4AM6A 1NGBA 3BEXA 4B1XB 1E4FT 3AARA 3LDNA 2D4WA 3HI0A 5F0XA 3CERA 2Q1NA 3AY9A 3L6QA 3ZX0A 1RDWX 2P9SA 3C7NA 3VOVA 3SK3A 3D2FB 3LM9A 3HM8A 1NGAA 3U9ZA 4BC4A 1XUPO 3SJHA 3ULEB 2KHOA 1ESVA 2Q36A 5BN8A 3F9MA 5JLFA 4FWPA 1H1VA 1NGHA 3D7EO 4WYBA 3UKUB 4CJ7A 3OHRA 3H1QA 1GLCG 5AQLA 4FPAA 3ZEUB 1BDGA 1NGEA 4E1JA 3MN9A 2I7NA 4O8KA 4BGBA 3WQUA 1HKCA 4YDUA 3D2FA 4BRFA 2IVPA 4BQZA 3CHWA 2P9IB 1HPMA 3CI5A 1BO5O 1GLLO 3FGUA 4K25A 4EFHA 4BR7A 1G99A 4CZJA 4FWRA 4PKGA 3UKUA 5CE3A 2NLXA 1BG3A 4CZFA 4Y0WA 2QW9A 5EVZA 3W3DA 2A6AA 5EOYA 3ZEUA 4CD1A 1BA0A 2ZGZA 1V4SA 2YHYA 3D2EB 2H3GX 2GTDA 1TUYA 3CJBA 3QMLA 4BRPA 4Z94A 2AP1A 3M6GA 1BU6O 2A42A 2QWOA 3FZMA 2Q0UA 3LDLA 2ZF5O 3LM2A 3HSCA 3ZX2A 4HWIA 3U9DA 2E20A 2F9TA 1ATSA 4L3QA 4B9QA 1MDUB 1NGDA 1ZC6A 3MK6A 3CJ9A 3UB5A 3AAPA 5FPEA 4CBXA 2PAVA 3A8YA 4FL9A 4WQ5A 4A2BA 5E26A 4BR2A 3KVGA 3W0LA 2BTFA 3P4IA 3ENOA 3O5BA 3WXKA 1QHAA 4CBWA 1WUAA 2FSNA 1SZ2A 1RFQA 3VEXA 3VF2A 2WUSA 4QS9A 5AQHA 2HF4A 3CETA 5EY4A 4FSVA 2ZGYA 3EO3A 4ISFA 3MN6A 4JHDB 4M63C 1ATRA 2AA4A 3O6WA 3UE5A 3S41A 5BRDA 1NGIA 4B1VA 2Q0RA 3ATVA 1GLJO 1NWKA 4BRCA 1Q18A 3H3NO 3L0QA 1DEJA 3WEEB 1IG8A 4XH5A 1NM1A 4BRLA 1NBWA 3EL2A 1NGCA 4FWSA 5BR9A 1ZXOA 5JICA 4FWLA 2DPNA 5JMVA 1D4XA 5LJVA 5AFUA 4FWKA 1DGKN 3IMXA 5AQJA 3EKUA 4CBUA 3UKRB 3O1WA 2E88A 2V7ZA 2FF3B 1LOTB 3RSEB 5AQIA 3VF6A 1MA9B 3BF3A 4FO0A 1TUUA 4PKIA 3QBXA 4B1ZA 3WEEA 4FWMA 4H5NA 4A62A 3KZBA 4CZKA 4O5FA 4JD2A 5BPLA 2GWKA 4WQ4C 2VCPA 2HOEA 4CZMA 2HMPA 1U2VB 3CQXA 2A41A 1ATNA 3VERA 3VGMA 2GUPA 3GBTA 2Q2RA 3QICA 4B1YB 5I9EB 4M7YA 4FPBA 3GL1A 1GLAG 2D1KA 2D0OA 3U8XA 3VEWA 3MCPA 3QFUA 4H5VA 3MN7A 1Z05A 4IXCA 1HKBA 1GLEG 3MDQA 4DQ8A 2OANA 1HJOA 5BRHA 1HLUA 3BUZB 4XEIA 3VENA 1P8ZA 4BC2A 2I7PA 3GG4A 4FWNA 2D0PA 3I33A 2BUPA 2CGJA 2YHWA 4IZ9A 2CGKA 4QS8A 4KBOA 4K43A 5BN9A 3ULEA 4AM7A 4JN4A 3O1BA 4RCHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FZXC 3LP0A 2ASPA 3THWB 2ITGA 4JI1K 1NGJA 5AQUA 2FLOA 2NRHA 4H0XB 1QQOA 3I56N 4EZ9A 4PKHA 5FROA 2P9UB 1KAZA 4OLAA 1K8KB 5KRTA 3U6FA 1HYZA 1QSLA 3SYZA 2A3ZA 1TYQB 4IBNA 3OS2A 3RR7A 4F2RA 3ISNC 4OKEA 4FJ9A 4CZIA 3AVIA 3TI0A 4CE9A 5C2DA 4RWTA 3LZJA 4B1UB 4AHUA 4W5RA 1T8EA 4IJAA 2A40A 3IG1A 2F9WA 3IRXA 3VN5A 3WXLA 1SAZA 1SL0A 5AQTA 3P39A 3L4IA 3KK2A 5M1QA 1UA1A 4J2EA 2W6LA 3NH0A 1U45A 4ZHRA 1OKJA 2Q97A 3MWTA 4CJ4A 3WNGA 1VSDA 2QTDA 3R3LA 2RHKA 4PL7A 3VA3A 1KTQA 3AVNA 4QAGA 5ADXA 4FJNA 4JKCA 4FW1A 4BRAA 2CGLA 2AJQA 3R6MA 3WNFA 3EEQA 4I7FA 4DV6K 4B9TA 4UY8O 5JVHL 4DTSA 2DFFA 5LY3A 5HL7L 4HTUA 4GKJK 1QHTA 1X9JA 4YY3K 1WNSA 3FLCO 3KKRA 1VHXA 4WQ4A 4FK2A 4BRGA 3PO4A 3DRSA 3LAMA 4DF8A 5BPNA 1R59O 3RVCA 5KPRA 4PWDA 4DQQA 3LPTA 3HL8A 1QZ6A 5ELZA 5AZJA 2YI1A 4BR9A 4BRDA 3AV9A 4JAXA 4K42A 3T7ZA 4DCHA 4B08A 4B3RK 4F3TA 4RW9A 3AVHA 4NLBA 1TK5A 3QFPA 4JK7A 1JJ2M 2B6AA 2P9NA 3G0ZA 4EHTA 2IVOA 4LC9B 3NDKA 4H0VB 4OPHA 3MX2A 1N36K 1XMQK 3EKSA 2WONA 3BZKA 3EN9A 1T3VA 1D5AA 3R9PA 1LW2A 1WSFA 1DTTA 1T03A 1UA0A 3NGIA 5F1XA 1U2VA 3CCQN 4DFPA 1FJGK 1TV6A 2ZJPL 4BDPA 3A5OC 1T7PA 1HYSA 1N5YA 1VSMA 3CPWM 1JLAA 3M1FA 2O8CA 2BH1A 1RBUA 3SUNA 3FR0A 5M1OA 1F21A 2GEMA 3ZT0A 3ZETB 2FSKA 2IOCA 3CC7N 3QEWA 1U4BA 1J9AA 3J8AA 1KVCA 3HTVA 4DS4A 1VSHA 1G15A 2BE2A 2WOMA 3SBGA 4OGCA 1JCFA 4JI0K 2HHQA 4YORA 5EXWA 5AR0A 1N32K 1T6DA 3H08A 2O4GA 3QNOA 2QWPA 5KQ8A 3O4WA 2YV0X 3V1OA 3IKMA 4JYAK 2NRXA 1Q82O 2NZTA 5J2PA 4H0YB 1HPZA 1RBVA 4H4MA 1EWQA 3B6OA 2VG5A 1S1VA 1SV5A 4CFCA 4DTOA 3PIOL 5AZIB 5HRPA 4B1WB 3A5LC 2Z1GA 4DQSA 1YTUA 3C6TA 4AHCA 4Y1CA 3K2PA 5GAGP 2E1ZA 3R1XA 3DLKA 1JLQA 3CJAA 3KIOA 1EX4A 3O9UA 3AGRA 2XO7A 2HF3A 1BI4A 2E2NA 2Z1JA 4GV3A 1NKBA 1IBKK 3C6UA 1BQMA 4YNQA 3PY8A 4JK9A 3S3OA 5CZ1A 3CCEN 4E7JA 5AQPA 1RT1A 3SAGA 1HKGA 3O9RA 4RW6A 4CHQA 3V9ZA 4ID1A 1WSGA 3O9SA 1UAXA 1IKVA 1YVUA 2E2OA 3OYCA 1J53A 1SKWA 2GELA 3ZSOA 4BROA 4M3ZA 3ITHA 5TKYA 4A61A 4DR7K 4CJVA 4B9MA 3CC2N 2QA4N 1TKXA 4RTFD 4W5NA 3U4LA 2ITMA 4DU4A 3VQBA 5IT9O 4FLUA 3R8EA 1NOYA 3CJ7A 2NUBA 1IJJA 3O08A 3QERA 4Q0BA 3MWPA 3NFAA 3V1QA 3DI6A 4IO9L 1T05A 5C0YA 2P9PA 3KTQA 1NLVA 2VGNA 3VQEA 4JLHA 2HNYA 2D4WA 1SS6A 3CERA 4FZYA 2Q1NA 4JI3K 3ZYYX 1KFSA 3VOVA 3D2FB 3HM8A 3U9ZA 2ZM6K 4DV5K 3ULEB 3P5JA 1ESVA 1NK9A 5BN8A 5GINA 3UIQA 5GAHP 4XIUA 2KW4A 1KFDA 4JKGA 4N5SA 4HCCA 1GOAA 4CFAA 4CJ7A 3OHRA 3ZEUB 1SUQA 4O8KA 4AQYK 1KLNA 1KQSM 2YNIA 3WQUA 3CM5A 2F8SA 4DR6K 3AVJA 3HO1A 4BQZA 3OYKA 3CI5A 1HPMA 1GLLO 3RR8A 3ZSQA 4LY7A 3AA2A 4BR7A 2ZJQL 3O4NA 4FWRA 5CE3A 2W6KA 4Y0WA 2QW9A 3K5LA 1KRPA 5EVZA 3VQQA 2A6AA 5EOYA 2OTLN 4E1MA 1S72N 4FJIA 3CJBA 3QMLA 4CJPA 2ZJRL 2A42A 2O8BB 3HSCA 4CEEA 3DLHA 2HMIA 2E6LA 3CJ9A 3CQ8A 4PA1A 3AVCA 4BWMA 1WN7A 4WQ5A 1NOZA 3HVRA 3OYLA 4J2AA 3O5BA 4IOCL 4Z4CA 2FSNA 2OPRA 4QS9A 5AQHA 4CJLA 3F9KA 4M45A 1TAUA 4CK1A 2UUBK 5D3GA 3UE5A 3TSUA 1NGIA 4MFBA 3AA3A 3OVNA 5FDLA 3SV3A 1NG9A 1WAJA 4E1NA 5K14A 4ZTJA 1IG8A 4XH5A 4C1NI 1S5JA 1QS4A 3CCUN 1VQPN 3K9JA 4BRLA 4HVJA 2XHBA 5BR9A 5JMVA 3AVGA 4DSLA 4K8ZA 4JI4K 4RG8A 3IMXA 5AQJA 3SPYA 3EYZA 5LL6Z 3L2UA 4KI6A 3WEEA 4FWMA 4OGEA 3NBPA 4C8NA 4OO1J 2WC9A 4JKAA 1P90A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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