2Q36A

Actin dimer cross-linked between residues 191 and 374 and complexed with kabiramide c
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
369
structure length
360
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Multiple crystal structures of actin dimers and their implications for interactions in the actin filament.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
total genus 126
structure length 360
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q36A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q36A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q36A03
4BG9A 3KHYA 1D4XA 1GLFO 4ISFA 5KPRA 3RSEB 5F2RA 2EWSA 1E4FT 3M6GA 4BR2A 3VGKA 4L3QA 1DKGD 4XEIA 2P9NB 1GLJO 5EOYA 5KPTA 5LJVA 1YXQA 2W41A 2QWMA 1KAZA 2ITMA 2YJFA 2IVNA 3H3OB 3I8BA 3A8YA 4BC2A 4H5WA 3UKUB 4BROA 2P9SB 4K25A 3ENOA 2VWBA 4FSVA 3CIPA 1NGAA 5EX5A 2YHWA 4BQZA 4BRQA 3A0IX 4BR5A 3CJBA 4CZJA 3WEEB 4FWLA 4FWNA 4BRAA 2UYTA 4DB3A 3U9ZA 4B1YB 4BGAA 1NGHA 3CJ7A 3ZETA 2CH5A 4XH5A 3VEWA 4H0PA 4B1UB 1MWMA 2ASPA 2IVOA 3ZX3A 2ZF5O 3WXJA 5AQUA 1NGJA 1TUUA 3O80A 4JHDA 3O1BA 4BVOA 3O4WA 1RFQA 1KXPA 2I7PA 5AQTA 5FPDA 2GELA 3ZX2A 2A3ZA 3H6EA 3FR0A 4WQ5C 5BPLA 2H3GX 5AR0A 3HZ6A 3VEZA 4EFHA 3HBTA 1S22A 2F9TA 3O5BA 3DXMA 3FZMA 2V52B 1NGBA 1QZ5A 3JXUA 1HKBA 3D2FB 3QB0A 1QHAA 3MDQA 2A40A 4FWOA 3FZFA 4BRGA 2VCPA 5AQKA 5AQFA 4Z94A 1BDGA 5FPNA 5ADXA 2CGKA 4A61A 5KPZA 4PL8A 2Q2RA 3L6QA 1C0FA 4F9OA 1S3XA 1NM1A 2A6AA 2E2NA 3GE1A 4K43A 2J4RA 4FL9A 2YJEA 4MLHA 1BA0A 1JCEA 2IVPA 1LCUA 5AQLA 5ADXH 5AZJB 3UKRB 2GTDA 4B1VA 3OHRA 3G25A 3GDQA 4B1WB 2WUSA 3H1VX 1HKGA 3HM8A 1NWKA 4XH4A 4MLEA 5AQJA 4RCHA 3GG4A 5E26A 3LDQA 3MN5A 4FWSA 4FWMA 1U2VA 2YI1A 3ULEA 2QWQA 4H5TA 1TYQB 3IDHA 1ESVA 3D2EB 2GWKA 4C23A 3FE1A 3IMXA 4QS9A 4QS7A 5BRHA 3WXIA 2QM1A 5TKYA 2E1YA 4WYBA 4JN4A 1YUWA 4B9QA 3O08A 4BRKA 5AQXA 3FZHA 1KAYA 2FF3B 3ATVA 4CZEA 5AZIB 5BPNA 2BUPA 4A2BA 3O8MA 2FSJA 2P9UA 3GOIA 1QZ6A 1Z6RA 2PAVA 5AQHA 1NGFA 4BG8A 3CHWA 5JLFA 2P9KA 1GLDG 1K8KA 4CJ7A 2HOEA 2E1ZA 1BG3A 3R6MA 2HF3A 4WQ4A 3ZEUA 4EAHD 2Q97A 4DHYA 4FO0A 3O1WA 1RDWX 2E8AA 2NLXA 1NGIA 4IJNA 4CD3A 3VF2A 3FGUA 3P4IA 3MN6A 3EL2A 4IO8A 3J8AA 3SJHA 3RSEA 2V7YA 3H45C 1EQYA 2QWLA 3JS6A 4BR7A 1WUAA 5KQ8A 2P9NA 5FPEA 1Z05A 1T6DA 3SLCA 2CGLA 4KBOA 3CJAA 1V4TA 2A42A 4JNEA 5AQIA 4EHUA 3EKUA 4BRPA 2NZTA 1RGIA 3DWLA 1QQNA 2E2QA 4FPBA 3CJ9A 2D4WA 2P9SA 2Q0UA 1HJOA 3MK6A 4CBUA 2NRHA 4PKIA 4CZMA 4BR4A 4H0TB 1HKCA 3VPZA 3WEEA 1H1VA 4K41A 4JD2B 1CZAN 2HMPA 3WT0A 4H0VB 3HSCA 3UB5A 1MDUB 3UE5A 5BPMA 1QQOA 1NBWA 4CBWA 2P9IB 3H3NO 4JAXA 4BRIA 4CZGA 2P9PB 4BQLA 4BREA 1SAZA 1X9JA 1R59O 3VEOA 4BRNA 3U9DA 3VGMA 1NGGA 4H5NA 3LM9A 1NGDA 5I9EB 4FWQA 4LC9B 2P9LB 2V7ZA 3KZBA 4PKGA 1U6ZA 2FXUA 3VEXA 5AQZA 5AQSA 1G99A 3WQUA 2QWPA 3BF3A 4I6MB 4IZ9A 2YHYA 4EIAA 1IJJA 3DXKB 5BN9A 3ZX0A 2FF6A 3C7NB 1DEJA 5BN8A 3D7EO 3EKSA 1BU6O 3LM2A 3QICA 4AM6A 1ZC6A 2D1KA 2Q0RA 3VENA 1BO5O 1GLCG 3W0LA 3CQXA 2GWJA 4DCHA 5AQGA 2VYPA 3D2FA 4BR9A 5B8HA 3TU5A 3GL1A 3EO3A 5LY3A 1J6ZA 1ZBSA 2HF4A 3DAWA 3ENHA 3IUCA 3VF6A 4CD1A 2AP1A 2GUPA 4H5VA 4HTLA 2BTFA 2QXLA 4BRMA 4M7XA 3QFUA 3R9PA 4NO7A 1KAXA 3R8EA 3O6WA 1E4GT 4H0XB 1Q18A 5AFUA 5CE3A 1WOQA 2E2PA 3FLCO 5EXWA 2E20A 1HUXA 5AQQA 5AZJA 3UKRA 3QBXA 2E2OA 3FFKB 4BC5A 1NMDA 4IJAA 1MA9B 4BRDA 3AAPA 4FWKA 3WXLA 4A62A 3BEXA 2ASMA 3M3ZA 4BR0A 3F9MA 1GLEG 3HTVA 4FOIA 3LDLA 2A41A 5AFUH 3A5NC 4CZHA 3MCPA 4WQ5A 1YVNA 3VERA 4YDUA 1P8ZA 1SQKA 3L4IA 1YAGA 4Y0WA 2ASOA 3VGLA 1ZXOA 4M7YA 4XH1A 4DQ8A 2F9WA 1TYQA 1TUYA 3D2EA 4RTFD 3M1FA 1ATRA 3VETA 3U8XA 2A5XA 3L0QA 1ATNA 3SMPA 1IG8A 2QW9A 1GLLO 5AQNA 3LDOA 1BWFO 5AQOA 2CGJA 4NB4A 1LOTB 5F0XA 1HPMA 4H03B 4FPAA 5AZIA 1NGCA 2V51B 3QBWA 3GBTA 3FZKA 4BC3A 1X3MA 3VOVA 5AQYA 4BC4A 4BRLA 1XQSC 4IWVA 3AARA 3ZETB 3AAQA 4IXCA 3CI5A 3SMSA 3CETA 4ISEA 5F1XA 3UKUA 4JHDB 1X3NA 3BUZB 4CI6A 4BRHA 3AY9A 1BA1A 3A5MC 2FSKA 2QWNA 2ZWHA 5BRFA 4K42A 4RWTA 5JICA 3QMLA 5BREA 4CZFA 5EVZA 3DXMB 4AM7A 2ZGYA 1C0GA 3VEVA 3MN7A 5AQMA 1ATSA 4H5RA 5E84A 5LJWA 1T44A 3EN9A 3S41A 4BGBA 1NLVA 3W3DA 4ISGA 4CZKA 4E1JA 3BP8A 4BVPA 4CZIA 5JLHA 2D0OA 5JMVA 3A5OC 2D0PA 3VESA 2Q1NA 5BR9A 1BUPA 4FWRA 4JD2A 3MN9A 4PL7A 2CH6A 4H0YB 4YDUC 1HX1A 5AQRA 4FWPA 2P9IA 3BF1A 3HI0A 2P9PA 2Q31A 4H0OA 4EHTA 2I7NA 3B8AX 3U4LA 1GLAG 2YCHA 4MO5A 2P9LA 1NGEA 1JCFA 2FLOA 1XUPO 3H1QA 4GY2B 4QS8A 3SK3A 1OKJA 4WQ4C 3IFRA 3WUHA 2QWOA 4MO4A 3VEYA 3WQTA 4BRFA 1MWKA 5EY4A 1Y64A 4I6MA 5AQVA 1T6CA 4O8KA 4B1XB 3DXKA 3C7NA 4M63C 1BOTO 1U2VB 3C0BA 3ULEB 3ATUA 2FSNA 3QDKA 3TPQA 2OANA 3A5LC 2GEMA 3CJCA 1QQMA 3LDPA 2DPNA 3KVGA 4B1ZA 2QWRA 3EZWA 1GLBG 3ID8A 5KQDA 3I33A 3CQYA 5BRDA 5AQWA 3VF4A 1SZ2A 4HWIA 2IIRA 4CBXA 2YHXA 2P9UB 5AQPA 2PBDA 4FOEA 3FZLA 3CJ1A 4CZLA 2P9KB 5ELZA 5FPMA 1K8KB 3LDNA 3DJCA 4A2AA 1V4SA 3ZEUB 3WXKA 1HLUA 4PKHA 1XC3A 3MMVA 3CERA 4O5FA 2KHOA 1JCGA 2ZGZA 3QFPA 4GNIA 2AA4A 4BRCA 2W40A 3LL3A 2E88A 1DGKN 2Q36A 4J8FA 3H46O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V1RA 1D4XA 4ISFA 3QEVA 3RSEB 3VQBA 3TAEA 4Z0UA 3M6GA 3VGKA 1W9HA 2VG7A 4N47A 3LWLA 3OS2A 5KPTA 1YXQA 5C42A 4DV7K 2IOCA 5M1NA 4Z4CA 3AVLA 2ITMA 4BC2A 3A8YA 3PX0A 4DSIA 2R7YA 4LFBK 1BIUA 4E3SA 5M1FA 4FSVA 5EX5A 4RW8A 4BR5A 3CJBA 4CZJA 4FWLA 4FWNA 4BRAA 2HMIA 2UYTA 5CZ1A 2W00A 1B9FA 3U9ZA 4MFBA 3LPUA 4CGHA 3HXMA 3ZETA 4B9TA 4B1UB 1MWMA 4XIUA 2HHSA 3V6DA 5SWMA 2ASPA 4JYAK 2ZF5O 5AQUA 1OH6A 1NGJA 1TUUA 4I2QA 3O80A 3O1BA 2ZD1A 3O4WA 1RFQA 1KXPA 2I7PA 5FPDA 3NBPA 2A3ZA 4W5RA 2RKIA 4K0KK 3DLGA 2O8BB 2FBTA 3MWTA 2F9TA 3DXMA 2V52B 1NGBA 4CEDA 4FLTA 4ID1A 3T3FA 2QTDA 4QAGA 3K57A 3FZFA 3TAPA 4Z94A 1BDGA 1ILYA 3CMAN 4F2RA 2ETJA 2F96A 3ALYA 4PL8A 3NGIA 1C0FA 3MXJA 4CECA 3IG1A 4DF8A 4K8XA 2E2NA 3MEGA 4ELTA 1U48A 4M3ZA 2VQFK 5AQLA 3DM2A 3K9KA 3UKRB 1HQEA 2GTDA 4B1VA 4CJ3A 1VSMA 3SUNA 1I3AA 1HQUA 4B1WB 2WUSA 2HNZA 1O13A 3AVBA 1C0TA 4IG0A 4XH4A 2XHBA 1C1BA 5AQJA 1VQ4N 1TVRA 3LP3A 3ZSYA 4MDAA 3THXB 2O8CA 3CCQN 5E26A 3MN5A 2B4JA 2P5OA 2QWQA 3E66A 1RTHA 3AVCA 4YHHK 1L5UA 4CGDA 4C23A 1TAQA 4E19A 1EWRA 2E1YA 3HP9A 2HHHK 3LDSA 3C95A 1VQPN 1J54A 1D9DA 3N4PA 1KAYA 4Z4EA 4DV4K 1YHQN 1RT2A 1TKXA 3T1AA 2YNIA 3V81A 3O8MA 2P9UA 2PAVA 5AQHA 3DRPA 3KLIA 3SBGA 2JGUA 5LL6Z 1K9MO 2HF3A 4CFBA 4R5PA 1FKPA 3VQ9A 4DTNA 4WFAL 3AA4A 1RDWX 1RDDA 2XY5A 4IJNA 4CD3A 4CJ4A 3HOSA 4DS4A 3SJHA 4CHPA 1RTDA 2V7YA 4JKBA 3OVNA 3JS6A 3TANA 1RT5A 3MAQA 4V19S 3SLCA 1S1WA 4JV5K 1QTMA 3CJAA 4JNEA 2UUAK 5AQIA 3TAFA 2XRIA 4BRPA 1IKXA 3L8BA 4F2SA 3DWLA 2E2QA 2WONA 3CJ9A 1HJOA 4CGFA 4DFPA 1L3VA 3BZCA 3AVFA 4KTWA 4PKIA 4DSKA 1HKCA 4JD2B 1CZAN 1NK8A 4ID5A 1MDUB 1NK0A 4JI1K 3I0SA 4FJXA 4O44A 3P83D 2P9IB 2P9PB 3K59A 1SAZA 1X9JA 1HMVA 1RBTA 3LM9A 3DRRA 4OKKA 5C0YA 1QSYA 1M1KO 5I9EB 4DF4A 3AA5X 2FXUA 3VEXA 5AQSA 3K58A 1RDCA 1G99A 4E89A 2GX9A 4DTXA 4I6MB 4KHPK 1Q86O 2YHYA 4DR1K 4JKGA 2VG6A 3D7EO 3SJJA 1NG9A 3EKSA 3DLEA 2D1KA 1WSIA 2O8FA 3KK1A 1NKCA 1BO5O 4GMJB 2QA4N 3W0LA 3CQXA 3HVRA 4BE0A 3MX2A 4BR9A 5B8HA 1OH8A 3V9ZA 2WFBA 2YV0X 3D6RA 3QINA 3VA3A 3ZT3A 2HF4A 1EXQA 3CCRN 4CD1A 3IAYA 4DTMA 4KAZA 3R9PA 4NO7A 3R8EA 3L2RA 5GAHP 2OPRA 1WOQA 1KD1O 1HUXA 3QBXA 3O9TA 1NMDA 4FWKA 1WLJA 4CFAA 3QERA 1NKEA 4BR0A 1GLEG 4E7IA 3ITHA 1UOCA 4FOIA 4JK8A 1RT4A 4X64K 5LMNK 4DTOA 3J7YP 1YVNA 3SNNA 4BECA 1XMOK 4WE1A 1P8ZA 4YDUA 4HTUA 3L4IA 2NRZA 5C15A 1IV0A 1S6QA 4KHSA 3HL8A 1I39A 4A5BA 3L3UA 1TYQA 3ZCMA 1JL2A 3EE8A 3DLLL 3B6OA 1IG8A 4A57A 1BWFO 1XHXA 5AQOA 2CGJA 4LH4A 3CCUN 4DSJA 4FPAA 1QSSA 1VSEA 1NGCA 4CJRA 4ELVA 4DTRA 4CF9A 3KKSA 1SS6A 3MECA 2VWJA 4BC4A 4BRLA 4DKWA 1RCHA 3OYIA 4IWVA 3AARA 3ZETB 4YOXA 4KI4A 1TKZA 4OPHA 3F2KA 3S3MA 3ISNC 3G6EN 1X3NA 1D9FA 1HYVA 4AHVA 4BRHA 1OH5A 3A5MC 4FJGA 4WF9L 3C6UA 3ENBA 4RWTA 3QMLA 3KD1E 1X9WA 4CZFA 3OBYA 1C0MA 3DXMB 4LY7A 4DV0K 4AM7A 3VEVA 2P1JA 5E84A 4H5RA 3OYHA 3AVJA 1NLVA 3R1XA 4CZKA 2D0OA 1WB9A 4AF1A 3SBTA 3SI6A 2D0PA 2FBXA 4H4MA 5BR9A 2BH1A 2CH6A 2C1IA 3ZSRA 3CM5A 1VSJA 2HW3A 5AQRA 4PA1A 4FWPA 2HHUA 4H0OA 2NRXA 1EO1A 1T8EA 3SV4A 4IBNA 2W6KA 1N5YA 1NGEA 2FLOA 4QS8A 3WUHA 1BHLA 4CF2A 2I5JA 4RW6A 3FFIA 4BWMA 2O8CB 1YJ9N 3MXIA 1JXEA 2RHKA 4BDPA 3NF8A 1SL2A 4G9ZA 3CD6N 3ATUA 2WOMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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