2Q36A

Actin dimer cross-linked between residues 191 and 374 and complexed with kabiramide c
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
369
structure length
360
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Multiple crystal structures of actin dimers and their implications for interactions in the actin filament.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
total genus 126
structure length 360
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q36A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q36A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q36A03
2QXLA 2ZWHA 1NLVA 1QQMA 2NZTA 5ADXH 1BWFO 4A2AA 4BRDA 1XQSC 1QQNA 5BPMA 1T6CA 2Q1NA 3ATUA 5JLHA 3EL2A 3LDOA 4QS7A 4A2BA 2P9NA 2IIRA 3HBTA 3GL1A 4AM6A 2YHWA 3AARA 4WYBA 4DB3A 4RWTA 5AQIA 4PKGA 2ASMA 5AQPA 3O1WA 4L3QA 4DCHA 3OHRA 1X9JA 4BR0A 3GE1A 4BRMA 2E2QA 1XC3A 4H0VB 4BRAA 1GLJO 3VEVA 5AQJA 2FXUA 5AQOA 2P9NB 4FWQA 4BR7A 3GDQA 3FZLA 3W0LA 3KZBA 4XH1A 1BOTO 2YHYA 2A42A 1MA9B 5AQRA 1NGJA 5BR9A 2GTDA 1V4SA 3DWLA 1IG8A 2PAVA 2VCPA 3A5OC 2E2OA 2YI1A 3CERA 5KPRA 3D7EO 5KPZA 4O8KA 2QWNA 4CZLA 5JICA 3F9MA 3IDHA 1HUXA 5AQMA 1Z05A 4H03B 2GELA 3D2EA 3IUCA 1ZC6A 3UKRB 4C23A 2V7YA 3MMVA 2V52B 3HSCA 3HM8A 4FO0A 4H0YB 4K41A 3ZEUA 2F9TA 1Q18A 5FPNA 1T6DA 5AQVA 2QWQA 4A61A 3D2EB 3WXIA 4BVOA 2CH6A 3CI5A 1ESVA 3JS6A 5EY4A 2I7PA 3MN7A 3GG4A 1DKGD 3ZEUB 2IVPA 4FOEA 4FWPA 3CJAA 3VGLA 4BRQA 1JCFA 1C0GA 5KQDA 2FSJA 3LDLA 4FWKA 5F0XA 2W41A 4CBXA 5FPEA 1DGKN 1NGCA 5AZJA 4BR4A 1RDWX 2GUPA 4B9QA 3BF3A 3H6EA 4BR5A 1SQKA 3CJBA 5EX5A 1GLBG 4JNEA 4ISGA 2WUSA 4CZMA 4BG9A 1NGHA 4YDUA 4CZJA 3O5BA 5AZJB 4FL9A 3O80A 3VESA 5AQZA 3VF4A 2P9LA 4BVPA 2A40A 3A5MC 4RTFD 5BRHA 5CE3A 4PKHA 3VEOA 3QFPA 3I33A 5AZIB 3M1FA 1D4XA 3O4WA 4BREA 4FPBA 2HF4A 4H5TA 5E84A 2E1ZA 3FR0A 5AQUA 3WUHA 1WOQA 2V7ZA 4IJNA 3CJCA 4CD3A 2P9IB 3H45C 2KHOA 4BC5A 1HKGA 3RSEA 5BREA 3AAPA 4CJ7A 1H1VA 3DXKB 4LC9B 1LCUA 2CH5A 5AQHA 4CZFA 1TUUA 3EKUA 5AQWA 2E8AA 3H3OB 4MLEA 4BG8A 3QBXA 5JLFA 5LJWA 1NGGA 4GY2B 4ISFA 4IWVA 3VEXA 1ZBSA 4FWRA 1YXQA 2BTFA 2AA4A 3RSEB 3H1QA 2GWJA 1S22A 3LDQA 4FOIA 1SAZA 1GLDG 4JAXA 3FZMA 1KAZA 4M7YA 3CHWA 4HWIA 4FWLA 1HX1A 4BGBA 3TPQA 4H5RA 1ATSA 5BRDA 4MO5A 3WQUA 2E2NA 2YHXA 3VF2A 3WXKA 4BRKA 1Y64A 5AQXA 4H5VA 3UKRA 4Z94A 3S41A 1NGDA 5TKYA 3VERA 4BRFA 4CZGA 3JXUA 3EN9A 4B1WB 2ASPA 5F2RA 4XH5A 4CZIA 4CZEA 2BUPA 3SMPA 4M63C 4H5NA 4BRIA 1ZXOA 3A8YA 4B1ZA 5JMVA 4CZKA 2QWOA 1OKJA 3BEXA 1NMDA 1BG3A 4H0PA 4BQLA 4QS9A 2NLXA 3QFUA 1R59O 5LJVA 1GLEG 4Y0WA 4PL7A 1KAXA 3CQYA 3WT0A 4CI6A 1HPMA 1HLUA 2VYPA 1NGEA 3FLCO 1YVNA 3ZX0A 3QDKA 1NGFA 4B1YB 3C0BA 2A5XA 4BR9A 3A0IX 4WQ5A 1KXPA 1HKCA 4EAHD 3DAWA 1BDGA 3P4IA 2YJEA 1BO5O 5AQLA 2CGJA 3A5LC 2J4RA 4FWOA 3BUZB 2A41A 2FSNA 3BF1A 2Q2RA 1C0FA 3D2FB 3SK3A 4F9OA 1S3XA 2GEMA 3CJ7A 1BA0A 2D4WA 2D0PA 2PBDA 3ATVA 5BN8A 3MN5A 5AQKA 3VOVA 3UB5A 2QM1A 1NGBA 3CJ9A 3W3DA 4CBWA 1GLFO 1U2VA 5BN9A 1X3NA 2E20A 3CIPA 2ASOA 5AZIA 1K8KB 3ENHA 3MN9A 4PL8A 1RFQA 4BRHA 1MWMA 2HOEA 4GNIA 3HI0A 4IXCA 1X3MA 5KQ8A 1YUWA 2NRHA 4CZHA 4DHYA 1BA1A 3HZ6A 2QWRA 3FGUA 3H46O 4JD2A 3L6QA 1U2VB 2OANA 2Q97A 3J8AA 2P9IA 2HMPA 3DXMB 3LDNA 3ULEA 2Q0UA 2W40A 3DXKA 3UE5A 4BC3A 4IJAA 3U4LA 1GLCG 3QMLA 1QQOA 2E1YA 2V51B 3VEWA 5BPLA 4JD2B 3GOIA 1JCEA 5AQTA 1G99A 1GLLO 3EO3A 4RCHA 3LM2A 3U8XA 3ULEB 1BUPA 2P9PA 3WQTA 4H0XB 4EHTA 4FWSA 1ATRA 2Q36A 2AP1A 3MCPA 2EWSA 4BROA 4HTLA 3VEYA 4ISEA 3C7NA 1J6ZA 3VGMA 4YDUC 4E1JA 1WUAA 3VPZA 3U9DA 3SMSA 1NWKA 3LL3A 2IVOA 2DPNA 5F1XA 2UYTA 2E2PA 2P9PB 4BC2A 1P8ZA 1QZ6A 5ELZA 3KVGA 4I6MA 1E4GT 3M6GA 3C7NB 3ZX2A 1NGIA 2H3GX 2P9SA 1XUPO 5AR0A 3VETA 2FLOA 3FFKB 4EIAA 5AQQA 4BRGA 1V4TA 4XH4A 5BPNA 2ZGYA 1U6ZA 5KPTA 4M7XA 4I6MB 1YAGA 5AQGA 2QWPA 3LM9A 2P9SB 1HKBA 2ZF5O 5EOYA 3R9PA 4H0TB 3CJ1A 3ID8A 4IO8A 4BQZA 1EQYA 1HJOA 3IFRA 4H0OA 4K43A 4BGAA 4WQ4A 4FPAA 4QS8A 2QWMA 5AFUA 1NM1A 2YJFA 3ENOA 5E26A 4JN4A 3ZX3A 4CBUA 4B1UB 3U9ZA 3G25A 4J8FA 2A3ZA 4AM7A 5LY3A 3O8MA 1GLAG 4EFHA 4H5WA 5AQNA 2F9WA 4K42A 3VEZA 1KAYA 3UKUA 5BRFA 3D2FA 4MO4A 4BC4A 4KBOA 3H3NO 5I9EB 1QZ5A 5AQFA 4BR2A 3O08A 4BRNA 4A62A 2P9UA 3QB0A 1CZAN 2I7NA 4CD1A 1K8KA 2A6AA 4NB4A 1IJJA 3HTVA 4B1VA 5ADXA 3SJHA 3UKUB 4PKIA 1TYQA 2YCHA 3MN6A 2FF6A 4WQ4C 3O1BA 4JHDA 4FWMA 5EXWA 1Z6RA 1NBWA 2P9UB 3KHYA 4FWNA 4DQ8A 2FSKA 3R6MA 3AAQA 3MK6A 1QHAA 3SLCA 3DXMA 1JCGA 3WEEA 1E4FT 3FE1A 2Q31A 2HF3A 4MLHA 2CGLA 4NO7A 1TYQB 3A5NC 1NGAA 2VWBA 3MDQA 3VENA 1BU6O 5B8HA 3CQXA 3TU5A 3ZETA 4JHDB 1LOTB 4WQ5C 3IMXA 4XEIA 3DJCA 5FPMA 1RGIA 2D0OA 3L4IA 4K25A 2E88A 3VF6A 3WEEB 3FZKA 5AQYA 1TUYA 4BRCA 3EZWA 3FZFA 1MDUB 1T44A 2P9KA 3QBWA 3I8BA 5AQSA 4BRPA 2FF3B 2D1KA 3B8AX 3VGKA 3ZETB 3H1VX 4BRLA 4EHUA 5AFUH 3GBTA 2CGKA 3QICA 1MWKA 2ZGZA 3EKSA 5EVZA 3R8EA 3BP8A 1DEJA 2P9KB 3AY9A 4FSVA 1ATNA 1SZ2A 3CETA 3LDPA 4O5FA 3O6WA 4B1XB 2GWKA 2IVNA 4IZ9A 3WXJA 2Q0RA 2P9LB 5FPDA 2QW9A 3L0QA 3FZHA 3WXLA 3M3ZA 2ITMA 2QWLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QVGM 3LPTA 2DTUA 3K5NA 5BPMA 3K57A 2BE2A 3LDOA 4HUGA 1D9DA 3GL1A 3OYMA 3RMDA 4AM6A 4M42A 5AQIA 1XWLA 4B08A 4BE7B 3ZT1A 1X9JA 4BRMA 4DF4A 1NJWA 3CFOA 4BRAA 1NK6A 1WSFA 5AQJA 4J2EA 2QKKA 2E6LA 2KFNA 4XIUA 1L3TA 3KZBA 4JKHA 1BOTO 3OTOK 4CJRA 1NK4A 3OYBA 4B9SA 5AQRA 4KH6A 3HT3A 1NGJA 4KO0A 5C15A 2YI1A 4L8RB 4DQPA 4CZLA 5JICA 3VQCA 4LFAK 2NRVA 3KK7A 3M8SA 1KVBA 1MU2A 2GELA 2X78A 4IOAL 3UKRB 3QETA 1WBDA 3MMVA 3HSCA 4KH4A 4FO0A 3QESA 3JYTA 1IKWA 3ZEUA 3NVKA 2BANA 5MLCQ 5HRPA 1E3MA 1T6DA 3DLKA 4FLUA 1C0UA 3MEDA 3WXIA 4BVOA 5J1EA 3NDKA 4HUFA 4E7KA 2G8UA 3JS6A 4OPHA 1IBKK 4YOWA 1CXUA 4BY9C 3ZEUB 2IVPA 1NJIO 1VQ7N 3CJAA 5EU7A 1JCFA 5KQDA 3LDLA 4CVNE 4FWKA 5F0XA 1J5EK 3PX0A 1DGKN 5AZJA 4KHQA 1RDWX 1KC8O 3BF3A 3H6EA 3C65A 3CJBA 2HHUA 1B9DA 1U49A 4ISGA 3QIPA 4BG9A 4DSFA 3QERA 4BACA 5AZJB 5AQZA 1OVYA 2P9LA 3ZSZA 3CC2N 2HHQA 4RTFD 2FBXA 4PKHA 1RT1A 4F8RA 4FJXA 3VEOA 3QFPA 4CF1A 1K73O 1RT7A 3O4WA 4JKDA 3HYFA 4CFDA 3HSTB 2ITGA 4OKKA 3ZT3A 4KHYA 3FR0A 3NMUA 2X74A 4GKJK 3AO4A 3L4QA 4CD3A 2P9IB 3H45C 3DLEA 4BWMA 4CJQA 4IG0A 2OYQA 3MWTA 4KHSA 4LC9B 2CH5A 3CMAN 1TUUA 3AVFA 3PO4A 3NF8A 3O9QA 4BG8A 5SWMA 5LJWA 2ZJPL 1JLFA 4IWVA 5DM7L 4E72A 3CCSN 5HL7L 5LMNK 2HBJA 2GWJA 1RBRA 3LDQA 2UXCK 1JLGA 4Z4EA 1VHXA 4A5BA 4FK4A 1TK5A 3QO9A 1BIZA 4H5RA 3SV3A 5BRDA 3P5JA 2YHXA 3LAKA 5J2MA 4B9MA 1NK0A 3HP6A 4DS5A 1KQSM 5AQXA 4H5VA 3NBPA 3VERA 3EN9A 4B1WB 2ASPA 5F2RA 3TABA 4I9QA 1UWBA 4CZIA 3SMPA 4H5NA 3ZCMA 4FW1A 5JMVA 4CZKA 5J2QA 1OKJA 1T3VA 2GV9A 4E3SA 1R59O 4G9ZA 4Y0WA 3T1AA 2YNFA 2DFFA 1A5XA 3V6DA 3OW2M 3FLCO 1YVNA 2OCEA 3AVCA 3QDKA 4CJUA 3SJJA 3KLIA 4WQ5A 4CERA 4FZZA 1JL2A 4FLWA 3DAWA 2QEXN 1BDGA 3VTIA 1TKXA 3LANA 3P4IA 4OLAA 3P31A 1BO5O 3VQ5A 4LSLA 1JLQA 3A5LC 2J4RA 1TKZA 3MXMA 3BUZB 2W00A 3B6PA 3D2FB 2B5JA 1S9EA 3G0ZA 2OPRA 4FJGA 2PBDA 3ATVA 3VOVA 3SAGA 4KTZA 5GIPA 3CJ9A 4CBWA 1GLFO 4CBUA 3QNOA 5AZIA 1LW2A 3MN9A 1RFQA 3ITHA 2HHSA 4E1MA 1JJ2M 1WLJA 3J81O 1X3MA 1YUWA 1SKRA 2NRHA 2A1RA 3HZ6A 3DLLL 4JD2A 1Y97A 3BGRA 4DQQA 4LH5A 2HHHK 4CGHA 2HMPA 1VSFA 5FRMA 2P1JA 1GOAA 2QTDA 3DXKA 1BIUA 1Q82O 1GLCG 1X9SA 2VG5A 2E1YA 2V51B 3VEWA 5BPLA 4KTQA 4JD2B 4Z0UA 4CE9A 5AQTA 1G99A 3EO3A 4IEEA 4GV3A 4OX9K 3WQTA 4EHTA 5KRSA 2E5LK 3VEYA 4ISEA 4KHNA 3KLHA 1NKCA 4WFAL 1BHLA 4E1JA 2FBYA 3PIPL 1P90A 3ZSYA 3L2QA 2IVOA 5F1XA 2IAJA 2FBTA 4C1NI 3SQ0A 1QZ6A 3CFPA 2I5JA 3ZSOA 4WF9L 4JS4A 4LF6K 4I6MA 3DRPA 5HBMA 4DSLA 2XY6A 3J7YP 2H3GX 4ILGB 1XUPO 4JK8A 5GAHP 3WNHA 1NK5A 4B3MK 2FLOA 1X9WA 1NJYA 3FFKB 4CHNA 2NRZA 5AQQA 4BRGA 3KK1A 1KLMA 1V4TA 5BPNA 3LALA 2DFEA 4CEZA 4X64K 4IOXA 3CM6A 5E41A 4CK1A 3CPWM 3RMBA 5C25A 1C0TA 3C6UA 4I6MB 3ENBA 3V1RA 3DOKA 4GW6A 1OH6A 1RDBA 4CEDA 2QKBA 1QHTA 2RN2A 4BQZA 3IFRA 4K43A 3S9HA 3CCJN 4BGAA 4FJKA 1WBBA 1TK8A 2P5OA 1QQCA 4FCYA 2QWMA 2YJFA 2HW3A 4R5PA 3ZX3A 4ZTFA 1NK7A 3AA3A 1Q86O 1YF5L 3G25A 4J8FA 2VQFK 4EFHA 4JKBA 2OA8A 3CPEA 2F9WA 4GVEA 3VEZA 3AVJA 4YNQA 1KAYA 5FROA 3UKUA 4MO4A 4BC4A 4E7LA 1QZ5A 4DS4A 3VQAA 1F21A 2HHVA 4EZ6A 4A59A 4A62A 5JS1A 4FLXA 3QEIA 2Y1IA 2R7YA 2A6AA 4NB4A 3UKUB 3MN6A 5M1PA 4WQ4C 4JKEA 1ITGA 4JK9A 5EXWA 3TTDA 5GIOA 3MK6A 4CIGA 2KW4A 3DXMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3ZT2 A;  2Y1J A;  1J9A A;  2ZQB A;  1BCO A;  3QB0 A;  1RT3 A;  1WNS A;  2I7N A;  1RTH A;  1K8K A;  3WXM B;  4CD1 A;  3OYA A;  1NK9 A;  3C6T A;  2UUC K;  3HTV A;  5ADX A;  4W5Q A;  1TYQ A;  2JWK A;  5FRN A;  4B9V A;  3O1B A;  1VQL N;  2KTQ A;  4KHP K;  3KHY A;  1NBW A;  4FWN A;  4LF8 K;  3Q7B A;  3QLH A;  3SNN A;  3SLC A;  3IKM A;  1IO2 A;  1JCG A;  1IKX A;  3FE1 A;  2Q31 A;  4NO7 A;  2CGL A;  1TYQ B;  3L2V A;  5JVH L;  1WSI A;  3ZET A;  3OS0 A;  1LOT B;  2G8W A;  4O5B A;  1XHX A;  2EHG A;  2O8E A;  1RGI A;  3VF6 A;  3OYH A;  1Q9Y A;  4YOX A;  3EZW A;  1T44 A;  2P9K A;  1S72 N;  4QOZ B;  3VGK A;  2HBK A;  3B8A X;  3ZET B;  1BGX T;  3H1V X;  4BRL A;  3S3O A;  5AFU H;  4PHT X;  4GVM A;  4DR7 K;  3KD1 E;  1TV6 A;  3HVT A;  1MWK A;  3EKS A;  5EVZ A;  4WCE L;  2O8D A;  3DRS A;  2P9K B;  1G15 A;  4JI8 K;  3VQB A;  3LDP A;  3ZSQ A;  4FJM A;  4FYD A;  4RW8 A;  4N5S A;  4CJ3 A;  3MEE A;  4FW2 A;  5I42 A;  2F96 A;  4JI6 K;  2O8D B;  1YT3 A;  2QWL A;  4LF4 K;  4DR2 K; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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