2Q36A

Actin dimer cross-linked between residues 191 and 374 and complexed with kabiramide c
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
369
structure length
360
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Multiple crystal structures of actin dimers and their implications for interactions in the actin filament.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 126
structure length 360
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q36A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q36A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q36A03
1MA9B 4HTLA 1GLEG 3R6MA 4ISFA 1NMDA 4MO4A 4BQLA 5AQHA 4FSVA 3JS6A 3CQYA 1YVNA 4WQ4C 4CBUA 1QHAA 4O5FA 1KXPA 4BRQA 3WEEA 2QWRA 4IO8A 5ADXH 4BR7A 4IZ9A 4IWVA 1Y64A 5TKYA 3SK3A 3ZX2A 3M3ZA 2ZGYA 5B8HA 2E1ZA 4HWIA 4BGAA 1SZ2A 3LDPA 4BG8A 3WXLA 2F9WA 4J8FA 2J4RA 4BREA 1QZ6A 2ASPA 2NRHA 4BR2A 3HM8A 3WUHA 3H46O 3DJCA 4B1WB 1U2VA 3AAQA 2IVOA 1NGFA 2CH6A 5FPNA 3ZETB 3VEXA 4M63C 3LL3A 4BC5A 3A8YA 4JHDB 2ZF5O 5JLHA 2P9SB 1NGDA 5KPZA 1TYQB 3FZMA 4IXCA 4RCHA 3O80A 3QDKA 4FOEA 3VESA 3I8BA 1U6ZA 3WQUA 2FXUA 3UKRB 2I7NA 1HKCA 3QMLA 2QWOA 3IFRA 1HPMA 2P9PA 3EO3A 4EHUA 3CJ1A 3EKSA 4H5VA 1TUYA 1XQSC 3CQXA 2V7ZA 3ZEUA 4BRIA 3O08A 1BA1A 5F1XA 4BC2A 3GDQA 4JD2B 1BDGA 4FWKA 4C23A 4CBXA 1KAXA 2NZTA 4MO5A 4Y0WA 2A3ZA 3ATUA 1NGEA 3O5BA 2W41A 2DPNA 2D1KA 3GE1A 3H3OB 5JICA 1NGHA 3SJHA 4K42A 4M7XA 3DXKA 4JN4A 2FLOA 4FWSA 1IG8A 4WQ4A 3P4IA 2P9IA 4FWLA 3TPQA 3A0IX 3U9ZA 5BN9A 1BA0A 4BR4A 5EX5A 1ZC6A 1NWKA 3WXJA 3SMPA 3ATVA 1HUXA 4CZKA 4JAXA 2VYPA 4PL7A 3GOIA 2Q1NA 3SLCA 2YHYA 2P9SA 2W40A 3G25A 5E84A 2FF6A 3D2EA 1XUPO 4FWPA 4EAHD 5EVZA 4BRFA 1CZAN 4CD1A 2ZWHA 3FZLA 4FL9A 4K25A 4CBWA 2Q36A 2FF3B 3AARA 3UE5A 4H03B 3MK6A 4BR5A 3HBTA 4BC4A 4E1JA 5AFUA 3L0QA 5FPEA 3ULEB 4BRHA 3BF1A 3IDHA 1QQOA 3MDQA 4PL8A 1V4TA 4A62A 4GY2B 2GTDA 1BG3A 1HJOA 5AQFA 3CERA 5ADXA 3FE1A 3DAWA 4B1ZA 4CZEA 3VGKA 2I7PA 2WUSA 4XH4A 4KBOA 2P9NB 5AQSA 3DWLA 2P9LA 4RTFD 5AZJB 4F9OA 1TUUA 3U4LA 4CD3A 3LDLA 3KHYA 3RSEB 1QQNA 4K43A 3QFUA 1QZ5A 5I9EB 4FOIA 4BRGA 4WQ5A 4FWNA 3C7NB 3VEZA 3S41A 1NGIA 2NLXA 4H0XB 1IJJA 2OANA 2CGKA 4NB4A 4QS7A 1NBWA 2D0PA 2FSNA 1WUAA 2VCPA 3A5LC 4MLEA 4BRCA 5AQKA 3CHWA 1GLCG 1YUWA 2V51B 3M6GA 1NGGA 1T44A 3ENHA 2FSKA 3D2FA 3VEOA 5E26A 3DXMA 3GL1A 3VENA 3UKUA 3CJ7A 2P9UA 5AQUA 3WT0A 4FPAA 3FGUA 4I6MB 3MMVA 3KZBA 2PBDA 1QQMA 3EN9A 3HI0A 4BVOA 1E4FT 1GLJO 5AQXA 2ASMA 4BRNA 4CZLA 2P9KA 2YJFA 3A5OC 3HTVA 4QS9A 1YAGA 4BG9A 4JNEA 4FWQA 4XH1A 1RDWX 1Q18A 1G99A 1C0GA 3GBTA 1K8KA 3IUCA 3O6WA 1S3XA 2UYTA 4IJNA 2E2OA 5FPMA 5BRFA 2GUPA 3H6EA 4AM6A 1X3MA 4WQ5C 4XH5A 2Q97A 1HX1A 3LDNA 2QWQA 3H3NO 3QICA 3R8EA 3VEVA 4PKHA 3VF2A 2IVPA 1X9JA 3F9MA 1H1VA 1V4SA 4YDUA 2YJEA 2A6AA 1BU6O 1S22A 2GWJA 3O1WA 2Q31A 4ISGA 5AZIB 1LCUA 1NGCA 5KQDA 2FSJA 3FLCO 2QXLA 2A40A 4AM7A 3CETA 4CZFA 5AQGA 3MN9A 3ZETA 2E2QA 3KVGA 4M7YA 4B9QA 4CZJA 3VF6A 4A61A 3ENOA 2E88A 4JHDA 4CJ7A 3D7EO 1NM1A 2GWKA 5LJWA 3WEEB 1P8ZA 1TYQA 5FPDA 4H0OA 2HF4A 4XEIA 2F9TA 4Z94A 3VERA 3J8AA 1NGJA 4BQZA 1XC3A 3UKRA 4PKGA 3VF4A 4DQ8A 4B1XB 3CJAA 1MWMA 5AQOA 4BRMA 5EOYA 3QB0A 4EIAA 5KPTA 3AAPA 1NLVA 5BPLA 5AQLA 2QW9A 1U2VB 3EZWA 1BUPA 4YDUC 5AQPA 1GLBG 4JD2A 4CZIA 1T6CA 4L3QA 2KHOA 4H0YB 4EHTA 5AQNA 1ATNA 4BR0A 4QS8A 1ZBSA 5AQZA 1D4XA 3L6QA 4IJAA 3VEWA 3CI5A 2VWBA 3VPZA 4BC3A 3MN6A 3GG4A 1J6ZA 1SQKA 4H0VB 3R9PA 1DEJA 3EL2A 3B8AX 4BRLA 3MN7A 2P9PB 3VETA 2BTFA 3H1VX 4H0PA 2IIRA 4MLHA 3ZEUB 4GNIA 3AY9A 1JCFA 3HSCA 1NGBA 3O4WA 1MWKA 2BUPA 3IMXA 4H5TA 5AQIA 4DHYA 3C0BA 2A42A 4FWRA 5BRHA 1BO5O 1NGAA 2E20A 5AQMA 2E2NA 3LM9A 2CGJA 2ITMA 4CZGA 2V7YA 3BF3A 2HF3A 2Q2RA 3ULEA 3VOVA 1GLDG 3CJ9A 3DXKB 3VEYA 5BRDA 3ID8A 1RGIA 2V52B 5F0XA 2P9IB 2QWLA 5EXWA 1DKGD 3TU5A 1HKGA 2GELA 3QFPA 2Q0UA 4CI6A 1GLLO 2YCHA 3BUZB 4EFHA 4B1VA 1GLFO 2ASOA 2P9NA 5AZJA 3H1QA 3SMSA 2QWPA 4FO0A 4B1UB 1ATRA 5BR9A 4NO7A 3D2EB 1X3NA 3WQTA 4CZHA 5JMVA 3U9DA 5AQVA 5AQYA 3RSEA 3FZKA 3W0LA 1JCEA 2CGLA 2HMPA 3BP8A 2A41A 5BPNA 4FPBA 4BRPA 2IVNA 3C7NA 2D0OA 4K41A 1OKJA 5EY4A 3CJBA 1EQYA 3HZ6A 3A5NC 3BEXA 2YHXA 1ESVA 3CIPA 4BROA 3QBWA 4PKIA 4B1YB 2CH5A 5KQ8A 3M1FA 3VGLA 2GEMA 4A2AA 3LDOA 1R59O 2Q0RA 2AA4A 3LDQA 1YXQA 4I6MA 4CZMA 5AQQA 3WXKA 2AP1A 4WYBA 2P9LB 1SAZA 2E1YA 3L4IA 1Z6RA 4H0TB 4ISEA 4LC9B 5AQTA 2ZGZA 4DCHA 1HLUA 5AR0A 1BWFO 5AQJA 3WXIA 4BGBA 1E4GT 2EWSA 3A5MC 3FZFA 3FZHA 4BVPA 5JLFA 3CJCA 5AQWA 3VGMA 5LJVA 1HKBA 1GLAG 4FWMA 3U8XA 4FWOA 2YI1A 3O1BA 4RWTA 2QWMA 5BN8A 5ELZA 2QWNA 3OHRA 5F2RA 1JCGA 4O8KA 3I33A 2PAVA 3ZX3A 3W3DA 1WOQA 3D2FB 5BPMA 3DXMB 3MN5A 1KAZA 2QM1A 3UKUB 2E8AA 2E2PA 3EKUA 2P9UB 4BRDA 3FFKB 1C0FA 1Z05A 4BR9A 4H5RA 1BOTO 3QBXA 2H3GX 3MCPA 1DGKN 3JXUA 2YHWA 3UB5A 3H45C 2HOEA 3ZX0A 2P9KB 5CE3A 3O8MA 4DB3A 4H5NA 1KAYA 5AZIA 4A2BA 1T6DA 5AQRA 4BRKA 3LM2A 5KPRA 4BRAA 1LOTB 2D4WA 5LY3A 1RFQA 1ZXOA 4H5WA 5AFUH 5BREA 1K8KB 1MDUB 2A5XA 1ATSA 3FR0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HTLA 1RT4A 3V9UA 4JYAK 1KC8O 3AA2A 4WQ4C 2HHTA 4AF1A 3AGRA 3CCLN 1Q7YO 4O5FA 2YKMA 2KLAA 2LSNA 3CYMA 4IO8A 4JRQA 4IWVA 3IS9A 1YJWN 4M41A 3M3ZA 3OS1A 3HP6A 3VN5A 4DS4A 4J8FA 1QZ6A 2HHXA 4BR2A 3HM8A 3DYAA 3M8PA 3H46O 2R7YA 4PWDA 1REVA 3L2RA 5FPNA 4Z4IA 3A2FA 2OZMA 1HMVA 1NK0A 1J54A 1X1PA 3A8YA 4JHDB 4FJKA 3CCSN 2P9SB 2D0CA 1NJIO 4CJWA 4H4OA 2P51A 3FZMA 4FCYA 1SUQA 4IXCA 4CEOA 2HBMA 1HNVA 1QVFM 3DLHA 3RR7A 3LPUA 3WQUA 3KK3A 2FXUA 4CF9A 4DF4A 2E4LA 4Z0UA 4HVJA 4H5VA 2NRRA 1XQSC 4FJHA 3KIOA 2V7ZA 3V9ZA 5M1OA 3RMDA 1JLGA 4C8OA 4CHZA 1BDGA 3DRRA 4C23A 4CBXA 3SAGA 4N56A 3O5BA 4EZ6A 2IC3A 2DPNA 2JGUA 2ETJA 4JI3K 1NGHA 2ZD1A 1IBMK 3SJHA 4K42A 5H1SQ 3CC2N 2FLOA 2VG5A 4OJRA 3TTFA 1C6VA 3FFIA 3AVKA 3VTHA 1VRUA 4BR4A 1IV0A 1ZC6A 1ZBFA 4CEBA 2PYLA 3ATVA 3PLAA 4CZKA 3KLGA 3HRGA 3RVCA 2VYPA 3HOTA 3BY5A 2P9SA 3G25A 3SNNA 1N34K 2FF6A 1RT3A 4CW7B 1VQMN 1XUPO 4Z4HA 2Q36A 3UE5A 4H03B 4CCHA 3TWHA 5FPEA 4DFMA 1VSMA 1Q86O 4BRHA 3BF1A 3IDHA 4ILGB 5FRNA 1GOBA 2GTDA 1YJNN 4O5BA 4CESA 1BG3A 3THXB 1HNZK 2JWKA 3S3NA 5CZ1A 1BCMA 4BE7B 3FE1A 3QIOA 3VGKA 3THYA 3NGYA 4RG8A 4LFBK 2P9LA 4KHWA 2HMIA 1N32K 1BHLA 4DSFA 4CD3A 4JS4A 5GAEP 4F4KA 1ZYQA 4U7BA 4DTPA 4B9UA 1YF5L 4FK2A 4JK8A 2F8TA 4BDYA 3C7NB 1IKWA 4WCEL 1NGIA 4JKGA 4LH5A 1IJJA 2W00A 3U6FA 1VQ4N 1WUAA 2VCPA 4BRCA 4OPHA 5AQKA 4CFDA 3CHWA 1YUWA 4J2AA 3VQEA 4PQUA 2V51B 4OX9K 3M6GA 1NGGA 1J53A 2F4VK 3D2FA 1BCOA 2XY8A 4JI1K 3GL1A 2XY6A 3VQ4A 4GKJK 4E0DA 2D5RA 3MWTA 1NG9A 3KZBA 1WBBA 3QERA 3EN9A 3HI0A 4CK2A 4A5AA 2WOMA 2YJFA 4KTQA 1YAGA 4JNEA 1UWBA 2QKKA 2HHHK 3IUCA 1S3XA 2UYTA 4CJEA 2E2OA 2HSTA 3AVAA 5BRFA 3N4PA 1S6QA 3MEEA 3SYZA 3OBWA 3QICA 3HM9A 4IFEA 4FJIA 3P38A 3F9MA 1QS4A 1DLOA 1V4SA 5SWMA 1BIZA 3J7YP 2O8FB 2A6AA 1S22A 2GWJA 4CEDA 3CM5A 2FSJA 3SQ0A 1KFDA 4A57A 3LP3A 1D5AA 5M1KA 4WF9L 3T3FA 3LZIA 3QNNA 3S9HA 3VF6A 3SPYA 5FROA 2E88A 2VGNA 3C6AA 4O4GA 4CJ7A 2G8VA 3LPTA 3WEEB 5KRTA 2WONA 1SS6A 5FPDA 2KW4A 1TL1A 3I55N 3ID6A 3VERA 1XC3A 4CGHA 1FKOA 4B3SK 3G71N 4FZZA 3CJAA 3F9KA 3KD1E 3O9UA 4BRMA 4DSEA 5EOYA 3QB0A 1RDAA 3I0RA 3NGZA 1VK0A 2HW3A 3AAPA 1NLVA 4B9NA 4DMNA 3ZSXA 4LF7K 4YDUC 1L5UA 3THWB 4DG1A 4OPKA 1NU0A 4DUZK 1NK6A 3M8RA 3OYKA 5M1QA 1SKWA 1Z26A 4IJAA 1N33K 1TGOA 2VWBA 1CXUA 3CQ8A 5J2PA 3MXMA 3E1YA 4KV8A 4GKKK 3OYBA 4BACA 4IFYA 4DQQA 1NNEA 1IBKK 4BRLA 1VSFA 2P9PB 2BDPA 4C8NA 2YNFA 3H1VX 4H0PA 5CYMA 3NAEA 2KKZA 3ZEUB 3AY9A 3UIQA 4OGCA 4B9VA 1KLNA 2O4IA 2VG6A 4CF2A 3HSCA 4JK9A 3D0PA 4H5TA 5AQIA 3QEPA 1HRHA 3M8QA 1Q81O 3IG1A 4JKFA 4RW4A 5BRHA 1NGAA 2CGJA 5MLCQ 3V9WA 4CJPA 2Z1IA 2HF3A 3VOVA 1HNWK 1EXQA 4LF4K 3V1QA 4NYFA 2V52B 2E6MA 1IG9A 2P9IB 2DY4A 1DKGD 3G4SN 1HKGA 4CJLA 1SL2A 2YCHA 4EFHA 4M45A 1U4BA 3ZT4A 3RTVA 2P9NA 2O8DA 4KTWA 2QWPA 4FO0A 3KK7A 5C0YA 3PX6A 4NO7A 3D2EB 4KAZA 5GIOA 3U9DA 1X9SA 1VSJA 3LWLA 2UUBK 4J2DA 1KVAA 3G6EN 4E19A 2IVNA 2UXDK 4LFCK 3HYFA 3LP2A 3J80O 4C8MA 1WAJA 4YOWA 3NFAA 3A5NC 2YHXA 4O44A 1D9FA 3IKMA 3VQ6A 4KREA 3QBWA 4PKIA 4KH4A 5C15A 1D9DA 3NDKA 4CJKA 2GEMA 1KFSA 1YXQA 3KKRA 4IDKA 1XHXA 3SUPA 4JLHA 4B9MA 1XNRK 3L4IA 4HUFA 4ISEA 4E7JA 1HLUA 1BWFO 5AQJA 3ZT3A 3ZSZA 3H08A 4DTJA 4CJRA 4WE1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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