2Q89A

Crystal structure of ehub in complex with hydroxyectoine
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
RDENKLEELKEQGFARIAIANEPPFTAVGADGKVSGAAPDVAREIFKRLGVADVVASISEYGAMIPGLQAGRHDAITAGLFMKPERCAAVAYSQPILCDAEAFALKKGNPLGLKSYKDIADNPDAKIGAPGGGTEEKLALEAGVPRDRVIVVPDGQSGLKMLQDGRIDVYSLPVLSINDLVSKANDPNVEVLAPVEGAPVYCDGAAFRKGDEALRDAFDVELAKLKESGEFAKIIEPYGFSAKAAMSTTREKLCAAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of the ligand-binding protein EhuB from Sinorhizobium meliloti reveals substrate recognition of the compatible solutes ectoine and hydroxyectoine.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative ABC transporter amino acid-binding protein
molecule tags Transport protein
source organism Sinorhizobium meliloti
total genus 80
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2q89A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2q89A02
1SQYA 4X1DA 3PUYE 1MXXA 1WVJA 4FJPA 3C35A 1B5IA 2FNCA 3O9PA 3VXCA 1EU8A 1A54A 4IO5A 2ZMBA 4JWYA 4KI0E 3MZBA 2FYIA 2HQ0A 5ITPA 4C1TA 3H7MA 3VLVA 1US4A 3FVOA 1ZIUA 4PFYA 1PEBA 4BDQA 2Z8EA 4XTCQ 4JB7A 1O7TA 5FHNA 3I3VA 5DYHA 1SI0A 1SVXB 4NE4A 1BIYA 3S9LC 5CBSA 4DCYA 5I2KA 4G77A 3MP8A 3PV0E 2VHAA 1LFHA 2NVUB 5DVJA 1UTHB 4QSDA 3VE1B 4F39A 2O1LA 1TFAA 2ALUA 2A5TA 1I6BA 2GFEA 4YU0A 5ICQA 5AA2A 2OK2A 4PETA 1LAXA 3RT8A 3PPQA 1P1WA 4R2FA 4AQ4A 1QKBA 3QYTA 1FTJA 1MXUA 3SERA 1EZOA 1DMBA 3CFZA 1B6HA 1LGBC 2DWHA 1H43A 5TU0A 3OXNA 4XKRA 5DEXB 3KOSA 2HZLA 3QAXA 1Y20A 3MVXA 4QFPA 3SESA 3HSTA 4IY5A 4EF1A 2DSFA 4G2ZA 3VV5A 3U93A 3ONMA 3TAJA 1EH3A 2XXTA 4KCCA 2REJA 1XVYA 4WKMA 4F1YA 3FUZA 3FZVA 4PP0A 4EDPA 3M8UA 3B6TA 1H76A 2O51A 3VVDA 1IXHA 1Z7ME 3GXAA 1SW5A 5M2VA 2CZLA 1N76A 3D4GA 3RGYA 3IK6B 3T9HB 1WDNA 4LATA 1QUIA 3CSGA 4RK2A 2XXYA 2DVCA 4F18A 4OETA 2O7IA 2UXAA 4JWOA 3KOTA 2O68A 4IO3A 3IORA 4ESXA 1GV8A 4OFOA 4DDDA 3C9HA 3W15C 4QSCA 4OMBA 5AA4B 3OSRA 3DP4A 4R9GA 1B32A 2QRYA 3ZS6A 4QFKA 3D4CA 3TFLA 1N3XA 5KDTB 2B3BA 4ZDMA 1D3KA 4HW8A 2R71A 2LAOA 1OVTA 1S50A 2DE4A 3USDA 3N6UA 3CR9A 5CMBA 3QUFA 1MG1A 1B40A 4DLDA 3PMVA 1B4HA 3KN3A 4KR5A 1MQDA 1PBPA 3KJTA 4YAHX 2Q8JA 3O66A 1MPBA 5FTHA 3EF7A 4ZEDA 3MVZA 3O6IA 3RLFE 1TT1A 1SYIA 3C33A 4NF8B 1EZ9A 3V89B 5EHMA 1MXZA 2OBGA 1FQFA 2GHBA 2KLFA 3E4RA 4OHNA 1B2HA 1J1NA 3VLUA 2P2AA 5H8FA 1H44A 4HS7A 3PMWA 3SKPA 1OLAA 3S4UA 4H0WA 3Q25A 1QUJA 5H8HA 4IY6A 4ZE9A 1P99A 4RJZA 3LSWA 2Y7RA 3TQWA 3E13X 3KN7A 1JEVA 2AL5A 4MBPA 3MP1A 4XXUA 3K1NA 3TMGA 3FIRA 1IQ7A 1USYH 4GFRA 3PPPA 2GH9A 3SEVA 2XXRA 2H25A 3MZ1A 4H5GA 1S9TA 2O7UA 4DXUA 2B65A 2Y7WA 3ILUB 3RTWB 4QFLA 4EUOA 2F6PA 2DE3A 3PUXE 5CRYA 4G68A 4R72A 4ZZEA 3PPOA 2I3VA 5FHMA 4YB7A 4JBZA 2Z8FA 4C1UA 3OSQA 3A3CA 1PB8A 4R6KA 4F22A 1ZLQA 1OLCA 1URGA 1B1XA 3ILTB 5KCJA 1TXFA 1B7UA 1JW4A 4P0IA 4FATA 3TELA 1Y4CA 4NWDA 2W7YA 4BDRA 3CFLA 3FV1A 4JWXA 4H67A 3OOAA 3GLBA 5K2YA 2XXPA 4XKQA 4GQOA 1FTMA 2QS2A 1MXVA 4BDMA 4XKPA 3VDFA 4ECFA 4OFJA 3TCGA 4IO2A 3C4MA 5H8NA 4ELOA 4EXLA 4FAJA 5JTYA 5I58A 3FATA 1R1NA 4YB6A 4ZECA 3MPLA 4UACA 2E0SA 1LAFE 3JV9A 4TLMB 3MWBA 1B9JA 1UTBB 3MPKA 1MDP1 3MC2A 3H4ZA 3EPEA 1A7LA 3B6WA 1LSTA 1AMFA 1P1OA 1VR5A 3F11A 1FQEA 2O69A 4LP2B 1NH7A 4Q30B 3I6VA 4OERA 5I2KB 1NNTA 1JEUA 3TTLA 4Z0IA 4F3GA 1NL5A 3SETA 2F6GA 2RC7A 1QVSA 3PMXA 1R9LA 1R6ZA 4JDFA 2ABHA 3O6GA 1MY0A 3TTKA 4KCDA 1B58A 4BLAA 2VD3A 3HO7A 4QHQA 5AA2B 1B3EA 1A40A 1ANFA 1YTVA 1SW4A 4I8CA 2PT1A 2X7PA 2D5WA 4OFLA 2RINA 5H8QA 1ZU0A 1FTOA 3ECRA 3FVKA 3P7IA 3UK4A 4I9DA 1I6QA 2DXRA 5CMMA 2F7CA 2H99A 2ONRA 1NNPA 5I56B 3TTRA 2F78A 4YKKA 4R2BA 4DXBA 2PMSA 4ELRA 2QPQA 5B7DA 1IXIA 2DXYA 4WEPA 1LFGA 3CFXA 1VE4A 3G3FA 1JVYA 1N84A 4H6DA 3W9VA 3T96B 4LZ7A 3FD3A 2I48A 4F2QA 3LSFB 4C0RA 3QUJA 3ZKKA 1L5TA 2ZNTA 2I4BA 3U92A 1B5JA 4NF5A 2PYYA 2NWJA 3U1OA 1Z7NE 4LONB 2V93A 2Q2AA 4TQUQ 3Q29A 3G3KA 2I0BA 4WEDA 1B4ZA 3PUZE 4LQ5A 2ESNA 2HCAA 4L17A 4Q8RA 1FCKA 2V84A 3FJGA 1BTJA 1NH8A 1A8EA 1Y3NA 3EHSA 2XHDA 2DS9A 4LZ8A 3OELA 3AXFA 3S9MC 1N04A 3OEKA 1FQCA 2I0CA 1B05A 4UA8A 1ZMGA 1MQJA 3C34A 3LUYA 1MM6A 3MP6A 3A3UA 4JXIA 2PVUA 3PGFA 4GOTA 1BP5A 2H98A 3RT6B 1N3WA 3EQ1A 3G3GA 3MW0A 1IZ1A 5A5XA 2BJJX 3QSLA 1D4NA 5H8FB 1NMUA 4LQ2A 1LFIA 3GBAA 5H8HB 5I84A 3IB1A 1DPPA 3UIFA 4U1OA 1ZBMA 5FHOA 4F29A 1XOCA 3FXQA 2UVIA 1H3DA 1JVXA 1SD3A 2ZXTA 2ZYKA 4GWOA 2UVJA 3KFMA 5I59A 2E1SA 1TFDA 4G8MA 4IGTA 1SBPA 4EF2A 1O63A 4TOZA 2ZYNA 4RY1A 5ICTA 1MY3A 1QJMA 4FE8A 4RPNA 1B52A 3PD8A 3RY3A 4GL0A 1VFEA 3S9EA 3DELB 2HAVA 3TQLA 1QUKA 5DVIA 1RKMA 2XX7A 4E0WA 4G68B 5FTIA 3MZ9A 4ZEBA 3HN0A 1OIBA 4QFOA 3V83A 3M3KA 4KQPA 3UP9A 3K01A 5DTBA 4LZ5A 5TPAA 4X9TA 2ZNUA 1LAHE 3LBSA 2Q2CA 5J1DA 3FXRA 3PU5A 3H6UA 2QS1A 3K02A 5KCJB 2I3WA 2F35A 4H8JA 5TP9A 4POWA 3FV2A 1MPCA 1NFTA 1M5CA 3TDJA 1LB9A 1CE2A 1Y1ZA 4YKPA 4NMYA 1B3FA 5HM4B 3MQ9A 4R9FA 3N94A 3VLWA 3Q26A 3KGCA 4POXA 2UYEA 3C31A 5BUUA 4ESWA 2QL3A 4H5FA 4R6HA 2OCUA 4G8HA 1CB6A 4NTLA 4GRKA 3RTFB 2R9JA 1ZJLA 5B70A 1N7WA 2YLNA 4N13A 3H03A 4HCWA 2V3QA 4YB5A 2B3FA 5BWJA 3WAFA 4F19A 3I5OA 4WXJA 1ZKBA 5CC2A 3OMBA 1PC3A 4ZEIA 3OD7A 4JSOA 4KHZE 2CMOA 1RYOA 4EXKA 4H65A 4NF4B 5F1QA 2OWSA 3HCQA 4BDOA 1AOVA 4F1VA 3LSXA 2XD3A 3O28A 3BBRA 4ONYA 2Q88A 1PDAA 1JETA 3PUWE 1P1UA 5HBCA 3SEUA 5ISUA 4U4XA 2QS4A 4IB2A 3QIMA 2XX8A 3OO9A 2M8CA 2QS3A 1B0HA 3IO6A 1ATGA 3L6HA 3S9NC 2RCBA 1DTZA 1Y3QA 2UYFA 3IJXB 3HHGA 4FEDA 4U1ZA 4GD5A 4K3FA 5CI5A 2D3IA 1XHYA 1YAEA 1ELJA 3H6TA 2Z22A 2XXIA 3K6WA 2DYXA 3JZJA 2P1SA 2DWIA 3PD9A 2IEEA 5KZTA 4ZE8A 3KBRA 1URDA 1NNKA 3N5LA 3K2DA 2GRVA 1FTKA 3K6VA 5ITOA 5IAIA 2RF1A 5AE4A 4HTGA 4R6YA 2XD2A 1GR2A 1HSJA 1AIVA 4GVOA 3OEMA 1A99A 3B7DA 5AA2D 5CMCA 3TZAA 2QJEA 3OO8A 4IGRA 1FQBA 4RA1A 1KWHA 4NF8A 3ZSFA 1BLFA 3VXBA 3UORA 2DP8A 3HV1A 3MVWA 2R6GE 3TKDA 1POY1 1JW5A 2I4CA 3FASA 2XXXA 2G93A 3GBBA 2VD2A 4PQJA 5H8SA 1LAGE 4M4GA 2I49A 4ZZAA 4NF5B 3N26A 4FORA 1MQIA 1N0TA 1TWYA 5I2NA 3BFTA 3C32A 4DZ1A 3O29A 3LC8A 1UQWA 2QMXA 1D9VA 1Y4TA 4N6PA 3V8XB 3R7XA 3CRBA 3MVYA 2Y84A 4MH5A 4P0GA 1YPNA 1B0LA 1F9BA 3QXMA 1B7ZA 4YKIA 2A5TB 3MBPA 3RPWA 4IO6A 3TTMA 3BFUA 3TPAA 3O2AA 4IO7A 2ZYMA 1LB8A 3FJMA 2THIA 1IIWA 1IITA 4ND9A 3TODA 3E3KA 3TEPA 3V5AA 1MQHA 2GHAA 5A5XB 3E9XA 4QRZA 2Q9TA 1MH3A 3K0VA 3LSLA 1PB9A 4I1DA 4ISUA 4ZEKA 4BDNA 2WKYA 5IKBA 5EHSA 3IB0A 3JYRA 2F97A 3L6GA 1IXGA 4OZ9A 3QK6A 2H5YA 4EQ9A 4G8NA 2PT2A 4G4PA 5L9SA 2PX1A 5I59B 3WAEA 3O6HA 3VVEA 1B7HA 3T22A 4U23A 3G3HA 2OWTA 1H45A 2G29A 5K2XA 2RC9A 3CSBA 4RXLA 2P0SA 4EQBA 1JNFA 3KEIA 3RQTA 3DLNA 3SDFA 4OTEA 3IOWA 3TTNA 1GVCA 2VP1A 1SI1A 5CMKA 5HPQA 4Q5TA 2ZYOA 3M3LA 4G68C 2QMWA 3SEXA 4DXCA 4NF6A 1FW0A 4U2RA 1UTBA 1LCFA 2F34A 3O97A 3R26A 2F7BA 5TPAB 1XS5A 2VOZA 2PBWA 3PPNA 5TP9B 1AH5A 1NKXA 4U4SA 2O84X 3Q28A 1ZTYA 1YCJA 3UGWA 2DVZA 2REGA 3IB2A 3IX1A 1A55A 1MDQA 5DT6A 2XXHA 4F31B 1DSNA 2Y7KA 2F36A 2NUVA 2DWJA 2O1MA 2F7AA 2V3TA 1QKAA 3FJ7A 2X7QA 3IOVA 3W9WA 3RN8A 3KSXA 1MPDA 3FXUA 1B1HA 2NOOA 4OWDA 3LR1A 1SDXA 2HZKA 3EN3A 3IO4A 1UIUA 1IEJA 3T66A 1XVXA 3H3GA 2AYSA 3DM0A 5I57A 1OMPA 4AB5A 1P1NA 3OO7A 4OXVA 4YMBA 4KPTA 5I56A 1JW1A 2QSXA 4RYAA 1SW1A 4RK9A 3U8QA 3VFJA 1I6AA 3EHUA 3H6WA 4NEDA 3CIJA 1M5DA 4YKJA 4R73A 1MM7A 3TYHA 1B3LA 1SYHA 5F7VA 1HSEA 3FVNA 4GF8A 2UVGA 5ELVA 4F3PA 1VSOA 3UN6A 4LUBA 3KN8A 3KG2A 4U22A 3M3FA 4H1XA 2Z8DA 1S7YA 3T9XB 4DIGA 4Q0CA 3T9VA 1PBQA 4YZZA 3S2VA 3TCFA 1B5HA 4ZEFA 3K1MA 1A8FA 4X48A 2Y7PA 4F1UA 2RCAA 4F2OA 5CBRA 3RNNA 5JK4A 2Q89A 4OQOA 5AA1A 3K6XA 1M5EA 3OO6A 1LBBA 2O6AA 2HEUA 4YICA 3T93B 1URSA 3CI8A 4TLLB 1B3HA 2V3UA 4GLIA 2XXUA 3IAZA 1UTHA 2I58A 2OJTA 3ODBA 4U21A 3IJOB 4BDLA 2YPNA 4LA9A 4O3AA 1EZPA 5CM6A 2ONKE 1JQFA 2OLBA 2ZNSA 3K4UA 1Q35A 3K00A 1O64A 5L9OA 2D21A 1MXYA 3HPIA 4HCYA 2IA4A 4OEUA 1B46A 2DOJA 4OYVA 1US5A 5H8NB 5LOMA 1LLSA 1USYE 2DQVA 4OEVA 5JTYB 5I58B 5DEXA 2X26A 1UIVA 3OENA 2DWAA 4M1VA 3VVFA 1XC1A 3GZGA 3RUMA 2XXQA 1OVBA 1NNFA 1VFDA 4JSDA 4YMAA 2AL4A 5I2NB 1FQAA 3THIA 1PB7A 3N6TA 2I6EA 1MH4A 2YJPA 1MS7A 1MXWA 2OZZA 1MY1A 4MLQA 4ZS9A 1XT8A 1II5A 3T9UA 4MLVA 1T0KA 4THIA 5L9MA 4O3BA 3CVGA 1WODA 2H4IA 4N07A 2AIXA 3KZGA 4GIZA 4QFNA 1OQHA 3ZKLA 5AA3A 4XIGQ 1QULA 2HXWA 1IXCA 3G7WA 4PE5B 3HHFA 4PFTA 2V25A 5JEIA 4R75A 5H8QB 1MY2A 5AA4A 3SEWA 3PPRA 4FECA 5DVFA 1Q1KA 1OQGA 4NWCA 4OESA 4E0XA 1B3GA 2RKMA 1AL3A 4H8IA 1MY4A 1DTGA 4LVQA 1Y1MA 5KDTA 4IO4A 3U72A 1POTA 3G3IA 3DP8A 3DP6A 2H9BA 4KFQA 1GTKA 4R74A 5L8DA 4GXSB 1P1QA 4KYEA 4QF9A 4F3BA 1GGGA 4KYDA 4GXAA 3SEYA 4QSEA 4P11A 4F3SA 4I62A 4DCXA 4FIMA 2XXWA 3H06B 4O3CA 4Z7EA 4GL8A 3KJ7A 3G3JA 1N7XA 4MF3A 4RNSA 3IOTA 4FEBA 3CG1A 4EQ7A 2ONSA 2Z23A 2Y7IA 3A09A 2XXVA 3IL1B 3H6VA 4NF6B 1M5BA 3FVGA 1DPEA 1I69A 1DOTA 3MUQA 3IOUA 2F8DA 1Y3PA 1IUDA 1R9QA 4KYSA 2HFBA 2VGQA 3BKIB 4NF4A 2HAUA 3FGSA 2XX9A 4PFWA 3MAMA 2F5XA 3C36A 3Q27A 2DE2A 3PUVE 2ANJA 4AB6A 1BKAA 3B6QA 3K1PA 1D9YA 4OVJA 3U94A 3TUSA 1B51A 3R6UA 3IR1A 4OENA 1FQDA 3K6UA 4MFIA 3EHTA 4X1BA 1LBCA 2RC8A 1HSLA 1MQGA 4KD5A 2FA7A 2NXOA 1QW0A 2A5SA 4XKNA 2UVHA 4RPOA 4PFUA 3KSJA 5EYFA 1FTLA 3CG3A 1MRPA 5I57B 1RYXA 3MJNA 4ELPA 1LCTA 1Y9UA 1M5FA 4ELQA 4DE8A 1SW2A 3UA8A 3TCHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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