The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
30
|
sequence length |
93
|
structure length |
93
|
Chain Sequence |
SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLSPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILKQRDLEAEAAAAEAAAKA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
E80-TELSAM domain
|
| molecule tags |
Hydrolase regulator
|
| source organism |
Escherichia coli
|
| total genus |
30
|
| structure length |
93
|
| sequence length |
93
|
| chains with identical sequence |
E
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3BS5 A; 5KNI A; 3IDW A; 2JV3 A; 2B6G A; 2E8O A; 2QKQ A; 2D8C A; 2K4P A; 3SEN A; 5JU5 A; 2FE9 A; 4PZO A; 2Y9U A; 2E8M A; 3BS7 A; 2GLE A; 2F3N A; 2KMD A; 2KIV A; 3TAC B; 5J8Y C; 2E8N A; 1OXJ A; 1JI7 A; 2F44 A; 1LKY B; 2QAR B; 3KKA C; 1SXE A; 1B4F A; 2KSO B; 2EAM A; 1Z1V A; 1LKY A; 2DL0 A; 1X9X A; 4IS7 A; 3K1R B; 2QAR A; 4NL9 A; 1SV0 C; 1SXD A; 2YTU A; 2DKZ A; 2L5Y A; 4NJ8 A; 1PK1 B; 2DKX A; 5JTI A; 1UCV A; 1B0X A; 2K60 A; 1PK3 A; 5JRT A; 3H8M A; 3TAD A; 3SEI A; 2EAO A; 4RQN A; 4RQM A; 3BS5 B; 1PK1 A; 3BQ7 A; 2D3D A; 1KW4 A; 3KKA A; 1COK A; 2ES6 A; 2E8P A; 1SGG A; 2QB0 B; 4NL9 C; 2ESE A; 1UQV A; 1V38 A; 3HIL A; 2QB1 A; 2KSO A; 1WWV A; 5L1M A; 2KE7 A; 1F0M A; 1SV0 A; 2QB0 A; 2KG5 A; 2EAP A; 1X40 A; 1RG6 A; 2LMR A; 2EAN A; 3TAD C; 5J8Y A; 2F8K A; 4MHV A; 5F3X B; 2LPE A; 1DXS A; 1V85 A; 1WWU A; 1SV4 A; 1X66 A; 2Y9T A; 1OW5 A; 4PZN A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3IDW A; 8ICF A; 2W8K A; 4M47 A; 4KLS A; 2IHN A; 5HHH A; 2VIX A; 1NI3 A; 3RJK A; 4PGY A; 1S10 A; 4B9V A; 3PMN A; 4I2C A; 2JRZ A; 3PW4 A; 1AQ6 A; 4TUP A; 2ATL A; 5AM5 A; 1KN5 A; 8ICI A; 1X9S A; 3ONN A; 3PST A; 4F5N A; 1ZQK A; 2YY6 A; 1TAU A; 3UQ0 A; 1ZQV A; 3PML A; 4O9M A; 2UVW A; 4ECX A; 4KN4 A; 3JPT A; 4RNO A; 2W54 A; 2VAN A; 3KFU F; 3Q8K A; 1WG8 A; 4Z6C A; 3V7K A; 4P4P A; 7ICE A; 9ICB A; 5KT4 A; 3PNC A; 1O03 A; 4EBE A; 2KTQ A; 5FP0 A; 3B9J A; 3PX4 A; 4DOB A; 1ZOL A; 1Z1B A; 7ICF A; 2ISP A; 1L7P A; 4KLI A; 4RQ2 A; 2ZJ5 A; 1H38 A; 4Y2T A; 2BCQ A; 2ASL A; 1YZ6 A; 4CF4 A; 4ECW A; 2HOQ A; 5AIA A; 4CDG A; 3UXO A; 4C8L A; 4DF8 A; 5AKY A; 2MAX A; 2F1J A; 5BPC A; 1X6I A; 3S6J A; 7ICL A; 2NO5 A; 3ISB A; 4J9R A; 2W7O A; 5BOL A; 4EX7 A; 4Y2P A; 4C0Z A; 3EWA A; 4J9M A; 1Z3E B; 2E5S A; 8ICE A; 4A8E A; 3LWM A; 1ZQX A; 4IL6 U; 2C2R A; 4O5C A; 2FPM A; 1TK0 A; 4DF4 A; 4UB4 A; 3H7I A; 2E3T A; 3RFA A; 5KL1 B; 3BS7 A; 1ARO P; 4J03 A; 5KG1 A; 2KD1 A; 3A0B U; 1A76 A; 4RQ0 A; 1CRX A; 3RRG A; 5ALR A; 3A0H U; 4QWB A; 2Y0S F; 4MFF A; 4GXI A; 2J6U A; 1X6J A; 4YD2 A; 4K4I A; 3C28 A; 5AHX A; 4FBT A; 2ZIW B; 4DO9 A; 3OHA A; 1S0V A; 4R8U B; 2QAR A; 5KFM A; 1L7O A; 3PX6 A; 3EZ5 A; 2EDU A; 4QNL A; 2CRX A; 1HIW A; 3WKD A; 1RYR A; 4BGD A; 1COO A; 3UPQ A; 4PJ0 U; 4M0A A; 2RP5 A; 4YVZ A; 3PV8 A; 4I28 A; 3UQ2 A; 2GWS A; 8ICS A; 4KLM A; 5ALL A; 2PFQ A; 2G07 A; 1T4G A; 1SWV A; 2FMS A; 4EBC A; 3LYS A; 3MR3 A; 4Y2U A; 3BQ7 A; 3Q8Q B; 2YB4 A; 1T94 A; 2ES6 A; 3RRH A; 5DG7 A; 1ZQG A; 4RPX A; 1NJY A; 1UA1 A; 1PVP A; 4DSK A; 1JXE A; 5GTI U; 2R8H A; 4RNM A; 1N5W A; 3KZX A; 2QLT A; 4OJ6 A; 1SV0 A; 2JMG A; 2JGA A; 2EAP A; 1RG6 A; 5EE9 A; 4R63 A; 4M6W B; 2W43 A; 3E2E A; 4RQ1 A; 8ICK A; 4QZA A; 2G06 A; 1RQN A; 5J2I A; 3OGU A; 4RUA A; 5ALH A; 2F2A B; 2Y9T A; 1OW5 A; 1OUQ A; 5AM2 A; 4GXK A; 2H3Z A; 4IC9 A; 1RYU A; 4BXO B; 3LDA A; 1QQ7 A; 2E8O A; 3QUB A; 1ZQR A; 1K5O A; 2VA3 A; 8ICM A; 5D49 A; 8ICO A; 1DGJ A; 2XY7 A; 4FBU A; 4MF2 A; 2AU0 A; 4NLK A; 4LVS A; 4Y2R A; 3NTU A; 2KMD A; 3T3F A; 5DBC A; 2KIV A; 3RJE A; 8ICU A; 2C2D A; 3TFR A; 3GV8 B; 3ICX A; 9ICQ A; 1BVS A; 4ELU A; 3ZD9 A; 2I6X A; 2AJQ A; 1JX4 A; 3WKE A; 5ALW A; 4B9U A; 3SAG A; 4EEL A; 4C8O A; 3C2L A; 9ICL A; 8ICN A; 1FFV A; 1M6Y A; 4OJL A; 2BCR A; 2IOF K; 5AKH A; 2GO7 A; 5IIN A; 2A1J A; 2OXO A; 2B21 A; 3RR8 A; 3B0Y A; 7ICV A; 3WKB A; 5AKJ A; 4RQM A; 3AEV A; 2E1E A; 2PMZ F; 4P0P A; 4EYH B; 4UB3 A; 4UB6 U; 4RUC A; 4ECS A; 4Z6F A; 4YMM A; 1J2N A; 5DGA A; 4NLB A; 1HUO A; 4JB3 A; 3PW5 A; 1KRP A; 2AQ0 A; 4UAR A; 2KSO A; 4F4Z A; 3WKA A; 5ALM A; 3FAH A; 2HBM A; 4EX6 A; 5AKK A; 2QB0 A; 4F4K A; 5ALD A; 2LMR A; 4FZL A; 4US8 A; 4E0D A; 4KIT B; 4G3I A; 1ZRN A; 3TKA A; 5TZV A; 3SQI A; 2KN7 A; 5DB9 A; 2XY6 A; 3OTQ A; 4GC7 A; 7ICK A; 2R8J A; 2HDO A; 3AMZ A; 5CB1 A; 4P0Q A; 3M9O B; 1RXV A; 1JXL A; 2D6F C; 2RRD A; 3D2S A; 4Q8E A; 4KLH A; 4IQV A; 4CCH A; 4M9H A; 5L1I A; 4ED3 A; 2BGW A; 2ISO A; 2FDR A; 2YB1 A; 3FC4 A; 1KDH A; 3KKA C; 5KFG A; 2YN4 A; 2HVI A; 4DLE A; 3KHR A; 5HP4 A; 3C5F A; 3BQ2 A; 1F5S A; 2WHE A; 4YCX A; 5ALP A; 3WK6 A; 1TK8 A; 7ICN A; 3N4M B; 1FEZ A; 4ICA A; 2KP7 A; 1C7Y A; 4GIB A; 4CF5 A; 3ED5 A; 5J0R A; 1NJX A; 2JHD A; 1TVA A; 3H8M A; 8ICW A; 3D6J A; 4NY8 A; 3M8R A; 8ICZ A; 1V97 A; 4O5K A; 3G6Y A; 2IOH A; 2ZIV B; 3HKZ F; 2LYA A; 4NL9 C; 3RBD A; 5HR6 A; 3WK5 A; 1KFS A; 4QZD A; 3J81 j; 2PFP A; 5KG4 A; 4O3O A; 4C4T A; 3MFH A; 1TE2 A; 5ALN A; 1ZQB A; 2HI0 A; 1QQ6 A; 1WCN A; 4IQU A; 1XSN A; 2K4I A; 1V85 A; 2P6U A; 3MGV A; 2UVR A; 1JAL A; 3FM9 A; 1U4B A; 2DUY A; 3CYM A; 4OJ5 A; 1MSW D; 3LWL A; 2W9M A; 4FZN A; 1L7N A; 1L8O A; 2XIC A; 4ECR A; 3H40 A; 2FLL A; 2ZIX B; 3HP6 A; 4I2D A; 2J6S A; 1NK7 A; 3EYZ A; 2OEH A; 7ICJ A; 2MUT B; 1KL9 A; 5K4L A; 2AGP A; 2F44 A; 5DQI A; 3F2C A; 1D8B A; 2LM1 A; 4FZM A; 3V7J A; 2W04 A; 1NKC A; 5G5G A; 2K4E A; 4XRH A; 3G6V A; 5KFC A; 3AM9 A; 2KHQ A; 2WAQ C; 3R9K A; 1SXD A; 8ICL A; 1UA0 A; 2HHS A; 2F1H A; 2BHN A; 2EQY A; 4JMU A; 5CA7 A; 9ICF A; 3NGD A; 1DK3 A; 4K4H A; 4XUS A; 1B0X A; 4PH5 A; 1MA7 A; 3PZP A; 4DQQ A; 2BQ3 A; 2OCE A; 4Q44 A; 5KT7 A; 2BZF A; 1PK1 A; 4C4R A; 4B9M A; 2LHT A; 3ISC A; 4EZ6 A; 4QWA A; 5DB8 A; 2JZB B; 3NVY A; 5J2H A; 4CGZ A; 2V4R A; 4PL1 A; 3RJI A; 2KZ3 A; 2NRW A; 3ZI4 A; 4RNN A; 1L3T A; 4C7Z A; 2CPR A; 3THV A; 3PY8 A; 4EEY A; 4Q8F A; 4DSJ A; 3MDA A; 3Q8S B; 3H8W A; 5ALV A; 1XNS A; 1J97 A; 5J2C A; 3EPI A; 5J8Y A; 1BGX T; 4IR1 A; 4PHA A; 4LZD A; 3IV6 A; 4F4X A; 5DBA A; 4QZH A; 4DL2 A; 2JH7 A; 4F91 B; 2P6R A; 4F93 B; 1MQ2 A; 1NK8 A; 2ZG6 A; 4NM1 A; 3H8J A; 3I76 A; 3RAX A; 1ZQ1 C; 4DQR A; 2B6G A; 1ZQO A; 1SL0 A; 4NM2 A; 1Q46 A; 3M6Z A; 7ICR A; 2AXT U; 3TFS A; 1NOM A; 1O08 A; 1DRG A; 2W8L A; 3BJY A; 8ICB A; 4PZO A; 4F71 A; 1BNO A; 4UAV A; 2A19 A; 4UBC A; 5HNK A; 5KT2 A; 3NVW A; 1S76 D; 4PHE A; 4DFJ A; 2BQU A; 1X2I A; 3M8S A; 4ED8 A; 1XSP A; 2G08 A; 5AK4 A; 2FLN A; 5EOZ A; 5D4B A; 1Z4O A; 2WF7 A; 4YR2 A; 1ZQS A; 4KLD A; 2NYV A; 4P2H A; 5AKZ A; 2DKX A; 5TIS U; 1N63 A; 1T8E A; 2FJ6 A; 4YG2 A; 3PSI A; 5T14 A; 3AN1 A; 2F1I A; 5AKI A; 3TAD A; 3RB4 A; 4R66 A; 5J0Q A; 4YP3 A; 3AL0 B; 3PX0 A; 2D3D A; 2JXJ A; 2LI6 A; 1KW4 A; 2ZIU B; 1ZET A; 4QZI A; 4RQ4 A; 1ZD3 A; 3RBE A; 1ECW A; 3U26 A; 1BNP A; 9ICK A; 2FPL A; 3IN5 A; 8ICT A; 5JUM A; 3VC8 A; 5GTH U; 5DQH A; 4LZG A; 9ICO A; 1ZD4 A; 5KFN A; 1IM4 A; 5III A; 4HYK A; 9ICE A; 3B0X A; 3V7L A; 1XU4 A; 1KFT A; 3H8S A; 3RB0 A; 2A1A A; 4U6P A; 4DFD A; 2NRZ A; 1XSL A; 4B9S A; 3JPS A; 3RH5 A; 9ICH A; 4M2Y A; 5KFL A; 5AK5 A; 5J2E A; 3C5G A; 3MFI A; 4JV1 A; 5DB6 A; 1ZQF A; 2Y9U A; 1N5X A; 8ICH A; 9ICM A; 2GLE A; 4Z6D A; 2F3N A; 1QSS A; 3NVV A; 4QZE A; 3QU7 A; 5HR7 A; 3HJE A; 4EEN A; 2E8N A; 2BPF A; 4IQT A; 3NAS A; 4ED7 A; 3HW8 A; 1L7M A; 4UAT A; 1SXE A; 2LYH A; 2LYB A; 2ZJ8 A; 4YR0 A; 1QH9 A; 4QZC A; 2UVV A; 1HJP A; 4ED0 A; 7ICS A; 3CW2 C; 1SL2 A; 3IHQ B; 1Z1V A; 2W55 A; 4AP9 A; 4O3R A; 5KFZ A; 2IA6 A; 2L5Y A; 2JEI A; 2HOI A; 4NJ8 A; 2ZIW A; 2CXY A; 4JWM A; 2PI5 A; 2W9B B; 3NRZ A; 1RXW A; 3KHG A; 3SEI A; 3CNH A; 2Y0S C; 5KFQ A; 3AU2 A; 3QUQ A; 3Q8L A; 1QSL A; 1P7D A; 1XWL A; 2EZY A; 4ECQ A; 4DL3 A; 2V4Q A; 4OD0 A; 4ZH4 A; 2RQ5 A; 2H3F A; 7ICG A; 2DGZ A; 1UQV A; 1V38 A; 2WF5 A; 1U49 A; 2QB1 A; 1S77 D; 3QEB Z; 3PW2 A; 5J2G A; 3F5A A; 2NO4 A; 1TAM A; 3QX7 A; 1X40 A; 2EAN A; 3SZ2 A; 3G6X A; 1VJ5 A; 1A0P A; 5EE1 A; 1BPE A; 2KJ9 A; 5KG6 A; 1L8L A; 5KTQ A; 4NWI A; 4YFK A; 3WU2 U; 5ALG A; 4MFC A; 3F53 A; 5L1L A; 1BPX A; 4ECY A; 4M6W A; 2QKQ A; 3UXP A; 4B9T A; 3HX0 A; 3UM9 A; 5IIJ A; 4ZOH C; 1ZQD A; 4FO6 A; 1X9M A; 1NK4 A; 2NV3 A; 2VJ5 A; 4QZG A; 3KBB A; 2H3I A; 5EWG A; 4BXO A; 1V9P A; 4HAI A; 2BKE A; 3AUO A; 4F3O A; 1B22 A; 5ALE A; 4MEY A; 3GIM A; 3ISD A; 1KTQ A; 3SV3 A; 2I9G A; 1SKS A; 3Q8R B; 1C20 A; 1B4F A; 4NXZ A; 4AYB F; 5ALO A; 3N7S C; 3E0F A; 5DDY A; 4I2H A; 3PSP A; 3NRW A; 2DL0 A; 2IHM A; 4C8N A; 3KTQ A; 1BPB A; 2RDJ A; 5L1J A; 1Q8K A; 2OHF A; 3LVV A; 3BDP A; 2P35 A; 3M9N B; 4QWD A; 2KOB A; 1ZJM A; 2KZZ A; 3OPX A; 4JV0 A; 4DQS A; 3QZ8 A; 5H2F U; 3GII A; 3ORY A; 3ZDE A; 1SKR A; 4IRK A; 3KKA A; 4DWI A; 3OHB A; 9ICR A; 1SGG A; 2OYY A; 3RR7 A; 2ESE A; 5AM1 A; 4F92 B; 8ICX A; 3EUB 2; 3L3F X; 1JN3 A; 4KMU A; 5HHI A; 2AQ4 A; 3PO4 A; 5DLF A; 4M04 A; 2ZUD A; 3F2B A; 1YT3 A; 2KG5 A; 1LVH A; 1BPD A; 3RF9 A; 4F2R A; 2KZM A; 4MEX A; 4MHV A; 3V6J A; 2H3Q A; 4M9N A; 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3PVX A; 3BS5 A; 5KNI A; 3K4G A; 4US9 A; 5C0Y A; 3QU4 A; 5ALY A; 4F50 A; 2AGO A; 3PW7 A; 1WUD A; 2D8C A; 2K4H A; 3TAQ A; 1MC8 A; 4C80 A; 4B9L A; 1ZD2 P; 4UB2 A; 5KAI U; 3AU6 A; 3WK7 A; 2HCF A; 1ED1 A; 4O3M A; 2IOF A; 3RTV A; 4KLG A; 2MA1 A; 4GFJ A; 2ZTD A; 2ZIX A; 3SYZ A; 1K1Q A; 5E79 U; 4QZB A; 4UAS A; 2MUT A; 2A3V A; 3KD3 A; 2WF8 A; 4PL2 A; 4F2S A; 7ICO A; 8ICY A; 3GZF A; 5AI8 A; 4UBB A; 3ZDC A; 4I2G A; 3GFK B; 1KLN A; 2I5H A; 5CR0 A; 2C28 A; 5JTI A; 2C2E A; 4RU9 A; 4BWM A; 1T3N A; 1N2X A; 1FIQ A; 4KN7 A; 1YZ7 A; 2E1F A; 2XO7 A; 5DG9 A; 3C1Z A; 5J2K A; 3OSP A; 1NKB A; 2YMP A; 2WTF A; 4DLG A; 2XVT A; 1EXN A; 2DF4 B; 5J2A A; 2I1Q A; 5KG7 A; 2KHV A; 5KFB A; 4FFD A; 4QZ9 A; 4B6J A; 2XCP A; 3NS1 A; 2CN1 A; 3CP8 A; 2JZB A; 3RJJ A; 1NKE A; 4J9S A; 9ICG A; 4QW8 A; 2KKP A; 2M0N A; 4DFK A; 4QIW F; 4DSE A; 5CRX A; 1L6N A; 2AGQ A; 1F44 A; 1U9L A; 5KL8 B; 4F5O A; 3C2M A; 4UAZ A; 2B0C A; 3FDS A; 2R8K A; 4DSL A; 4B9N A; 1UT5 A; 4R65 A; 5J0W A; 5KFI A; 2HBJ A; 3C2K A; 5AIB A; 3E58 A; 2KK0 A; 5KFR A; 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