The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
30
|
sequence length |
93
|
structure length |
93
|
Chain Sequence |
b'SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLSPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDVLYELLQHILKQRDLEAEAAAAEAAAKA'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
E80-TELSAM domain
|
| source organism |
Escherichia coli
|
| molecule tags |
Hydrolase regulator
|
| total genus |
30
|
| structure length |
93
|
| sequence length |
93
|
| chains with identical sequence |
E
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4NJ8 A; 1X66 A; 3BQ7 A; 2L5Y A; 1X40 A; 1V85 A; 4NL9 A; 3BS5 A; 3BS5 B; 4PZN A; 2QAR A; 3BS7 A; 1JI7 A; 1V38 A; 2B6G A; 2F3N A; 2KG5 A; 2ESE A; 3KKA C; 1SV4 A; 3TAC B; 2D8C A; 2ES6 A; 2FE9 A; 1UCV A; 2EAM A; 1SGG A; 2QB0 B; 2QB1 A; 4IS7 A; 1COK A; 5J8Y C; 5L1M A; 3KKA A; 1LKY B; 2YTU A; 2D3D A; 2K60 A; 1PK1 B; 2KSO B; 1DXS A; 2DL0 A; 2LMR A; 1UQV A; 2EAP A; 2E8P A; 2QB0 A; 3SEN A; 5J8Y A; 3IDW A; 1WWU A; 2F44 A; 1Z1V A; 3HIL A; 5JTI A; 1SV0 C; 1RG6 A; 4PZO A; 4RQN A; 2GLE A; 1LKY A; 5JRT A; 2Y9U A; 1SXE A; 2KE7 A; 5F3X B; 2K4P A; 2DKX A; 2DKZ A; 2E8O A; 2KIV A; 2E8N A; 1PK1 A; 2KSO A; 1B0X A; 2EAO A; 1SXD A; 3H8M A; 5JU5 A; 1KW4 A; 2KMD A; 3TAD C; 1OW5 A; 1SV0 A; 2F8K A; 3K1R B; 3SEI A; 1WWV A; 2E8M A; 4RQM A; 1X9X A; 1B4F A; 2JV3 A; 2QAR B; 4MHV A; 4NL9 C; 5KNI A; 1PK3 A; 2EAN A; 2LPE A; 3TAD A; 1F0M A; 1OXJ A; 2QKQ A; 2Y9T A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1U47 A; 4C0Z A; 4KN7 A; 2EZX A; 2W9M A; 1K1S A; 4RQ4 A; 4ECQ A; 2L5Y A; 1QSL A; 5EWE A; 4MFC A; 3IG5 A; 4P4M A; 3BS5 B; 4CGZ A; 5KFP A; 1T4G A; 1S0M A; 1TK5 A; 3PST A; 2J6S A; 2BQ3 A; 3ZD8 A; 1N63 A; 1QTM A; 3B9J A; 5IIK A; 4XUS A; 5KFG A; 4ED7 A; 3NTU A; 4QZD A; 7ICU A; 2NRX A; 1X9W A; 4FBT A; 5G5G A; 2YQE A; 2LBO A; 3QEA Z; 3WK5 A; 2K60 A; 4QWA A; 4M9G A; 2NO5 A; 1UQV A; 5J2H A; 3WK9 A; 4Y2U A; 9ICX A; 2C2R A; 2KK0 A; 2ZUC A; 1MN8 A; 3QX7 A; 3JPQ A; 3RB4 A; 3QZ7 A; 2CPR A; 2JEI A; 5DB7 A; 3T5L A; 4ED0 A; 4I2H A; 1FFV A; 4KLH A; 4F4Y A; 2K8A A; 1DGJ A; 4UB3 A; 3HWT A; 9ICQ A; 8ICE A; 1WUD A; 4NV0 A; 3MGH A; 1Q3V A; 1NK0 A; 5KT2 A; 2R18 A; 4UAW A; 1PK1 A; 2KSO A; 3OHA A; 3QUB A; 2HDO A; 4C4R A; 3O0F A; 1ZXI A; 3TFS A; 3L4P A; 1GO3 F; 1J2M A; 1L7M A; 4R63 A; 2B0C A; 2KFZ A; 2HBK A; 4J9Q A; 4ECS A; 1ZQX A; 5KFY A; 5EOZ A; 2HHQ A; 2GWS A; 3KD3 A; 4X5V A; 4I2B A; 4QZG A; 7ICT A; 3AN1 A; 1UT8 A; 4OJL A; 3BQ7 A; 3NRZ A; 1V85 A; 4Y2Q A; 2KKP A; 2BCQ A; 3T5J A; 4QWB A; 5HMM A; 1S8O A; 3BQT A; 3PR5 B; 5B5E U; 3MAB A; 4DL6 A; 2HHW A; 2NRZ A; 4F5R A; 3RRH A; 3Q8R B; 4U7C A; 1N5W A; 2F1J A; 4M6W B; 2FI1 A; 3RJH A; 2HCF A; 4KLQ A; 3BQ0 A; 2B21 A; 1ZQK A; 8ICO A; 4DL2 A; 5L1M A; 9ICA A; 1NJX A; 4F50 A; 8ICW A; 3PW5 A; 1Z00 B; 5AKL A; 4Y2J A; 4IL6 U; 2PI4 A; 4KLJ A; 3OJU A; 1J97 A; 4RPX A; 1NJW A; 5ALT A; 2ZJA A; 7ICP A; 2HHV A; 4YD1 A; 3PSI A; 5F9N A; 2J6U A; 5AKJ A; 4I2C A; 5ALN A; 4P0Q A; 4B9L A; 3M6Z A; 4RQ3 A; 3PW2 A; 3MGI A; 1N56 A; 8ICA A; 2KE7 A; 3QU9 A; 5J2B A; 3M8S A; 3M9O B; 2HI0 A; 1SXD A; 3H0L B; 2KP7 A; 5FP0 A; 1SKS A; 3TAD C; 1SV0 A; 3AM9 A; 1M6Y A; 4RNN A; 2D6F C; 1ZQQ A; 4TQR A; 3AU6 A; 1LV5 A; 3F2C A; 1ZD2 P; 2W8L A; 4M04 A; 4USA A; 4IQV A; 2LI6 A; 1VDV A; 1KEJ A; 2DBY A; 4RQ5 A; 1QQ6 A; 4F72 A; 1WCN A; 3ALR A; 1JXE A; 2KD1 A; 1X9M A; 4KIT B; 5KG3 A; 5J2J A; 4O5E A; 1DOQ A; 1FEZ A; 2AHO B; 4UAV A; 5ALS A; 8ICC A; 5BOL A; 2DF4 B; 4K4G A; 2H3F A; 3JPO A; 2F3N A; 4O3N A; 2VKQ A; 5ALE A; 2AGQ A; 2UVV A; 4K4I A; 2ATL A; 4F91 B; 1KFS A; 5AM0 A; 2EAM A; 1SGG A; 3PX0 A; 3MFH A; 4PHD A; 2Y0S C; 2F77 X; 3HX0 A; 4JWM A; 1WCL A; 5AK4 A; 2EZZ A; 1TK0 A; 4ED3 A; 4QZF A; 3GII A; 3C1Z A; 4UQG A; 3H4D A; 1ZQY A; 5DKW A; 5ALF A; 4R8U B; 2I5H A; 4DFK A; 5KT3 A; 4JWN A; 2NV3 A; 1HEK A; 1UA0 A; 4YR0 A; 3SZ2 A; 3EPG A; 3GFK B; 1YZ6 A; 5TIS U; 5KFX A; 3SAG A; 5DB9 A; 4DL7 A; 2CXY A; 2NYV A; 4IRK A; 3I28 A; 2ZIV B; 3BQ1 A; 3SMV A; 2VAN A; 4F4Z A; 2W8K A; 2OEH A; 3QYP A; 3SD7 A; 4ECV A; 1HUO A; 5EE0 A; 2F1H A; 4R66 A; 4B9S A; 1D8Y A; 9ICJ A; 4JK1 A; 4ICA A; 4B9T A; 3OPX A; 3B0X A; 5F9L A; 1C7Y A; 7ICE A; 1XO0 A; 2Y9T A; 5KFO A; 4NJ8 A; 1SL0 A; 2WF5 A; 4DFJ A; 2I1Q A; 1MSW D; 2OCE A; 1CI4 A; 2BHN A; 1BGX T; 4MF2 A; 2MUT B; 5CJ7 A; 3KBB A; 1ZQ1 C; 2YN4 A; 3BS5 A; 1KLN A; 5HML A; 1UHU A; 5KG0 A; 3EWA A; 3KHH A; 2WF9 A; 1Z19 A; 3NVW A; 2F1I A; 4F5P A; 8ICI A; 3BZC A; 5J0P A; 4LVS A; 4RUC A; 4I2I A; 2Q4T A; 1TAQ A; 5AK5 A; 3NVV A; 4AYB C; 1BNP A; 3F5E A; 4J9N A; 3OSP A; 4O3O A; 2CN1 A; 3H0R B; 4ELU A; 5CRX A; 1ZQI A; 2KNJ A; 2RQ5 A; 1N62 A; 2J6T A; 4BJQ A; 2HSZ A; 3RJF A; 2F44 A; 5BPC A; 5L1J A; 5DBA A; 1MQ3 A; 3LYS A; 3ZD9 A; 4PH5 A; 4Q43 A; 2DKX A; 2JH7 A; 3K1Z A; 5DG8 A; 1QH9 A; 2E8O A; 2PMZ F; 3HT3 A; 4QWE A; 3V7K A; 1L3V A; 2BCV A; 2ZIX A; 3FDS A; 4QZH A; 3WK6 A; 3OJS A; 1VJ5 A; 4ELV A; 2I6X A; 1DGS A; 4GFJ A; 1OUQ A; 4YR3 A; 1T3N A; 4QZI A; 3BQ2 A; 3T5K A; 3N4M B; 4YN4 A; 1OXJ A; 3KFU F; 3WU2 U; 2R8I A; 3H40 A; 1ECW A; 1KTQ A; 3QUT A; 2LM4 A; 2UVW A; 2JZB B; 1SKW A; 4RPZ A; 1L6N A; 8ICB A; 8ICL A; 3PO4 A; 4UAR A; 4PZN A; 4PHP A; 4UAY A; 2AGO A; 3BS7 A; 3Q8M A; 1JI7 A; 3RJI A; 4GXI A; 8ICT A; 2ZIW B; 2RLT A; 2W7P A; 3MC1 A; 2XCP A; 4DSI A; 2ZIU B; 2KZZ A; 3Q8S B; 2QB1 A; 2VA2 A; 4O3P A; 5KFK A; 1AQ6 A; 2ZTE A; 2QLT A; 5HP4 A; 2AXT U; 3GZF A; 3RTV A; 7ICL A; 2R8K A; 4F2S A; 2HW3 A; 2VA3 A; 2D3D A; 4QIW F; 1Z00 A; 2Y1J A; 1S0V A; 3H0M B; 3RAX A; 2EAP A; 2GH1 A; 3IHQ B; 2E8P A; 1VLB A; 2A1J A; 3OSN A; 4FZN A; 2N1R A; 4YMN A; 1MQ2 A; 4P0P B; 1ZQZ A; 4DL5 A; 5DLG A; 4O3R A; 5JRT A; 1SXE A; 2FPM A; 2DKZ A; 7ICF A; 2VA8 A; 4EBE A; 3SV3 A; 3NVZ A; 2BQR A; 3HRD D; 5L1K A; 2ASL A; 2JEJ A; 3I76 A; 4MFA A; 2W11 A; 4EBC A; 4Z6E A; 4CE6 A; 1X9X A; 4J03 A; 3F2B A; 2C22 A; 4WJ3 B; 1XU4 A; 1NK7 A; 4FE3 A; 4I2D A; 4NL9 C; 2YB1 A; 1SL1 A; 2ODG A; 3IP4 B; 4PGQ A; 3MR3 A; 2DUY A; 1F0M A; 5J2F A; 5AKY A; 5KG1 A; 3SAF A; 4KLM A; 5KFA A; 3GV7 B; 3UQ0 A; 4F4W A; 4DSF A; 4OJO A; 4QWD A; 4KLD A; 1X40 A; 3CRX A; 4QIW C; 5KFC A; 1KFD A; 1KRP A; 4EBD A; 1RPL A; 3ISB A; 2QAR A; 4KLO A; 3ORY A; 3PSP A; 2KG5 A; 3MDA A; 3C29 A; 5J2G A; 3RR7 A; 9ICW A; 1A76 A; 3WK7 A; 1JRP A; 1SB3 C; 7ICJ A; 2LYB A; 3C2L A; 3QUQ A; 1RYS A; 1L7P A; 1ZQN A; 5J2K A; 4PJ0 U; 5KFL A; 2JMG A; 2XID A; 2HVI A; 1N5X A; 1N60 A; 2P35 A; 1HJP A; 1IXR A; 4AP9 A; 4QZ9 A; 9ICH A; 1WG8 A; 4DSJ A; 8ICQ A; 3H7I A; 2FMS A; 4O5K A; 3MGV A; 2F8L A; 3GIJ A; 3QUC A; 1ZQG A; 1A0P A; 1Z1V A; 3HJE A; 4TUQ A; 2KZM A; 5KFI A; 2ISO A; 1FIQ A; 3TAP A; 3LDA A; 4KLF A; 8ICR A; 4RQN A; 4NLK A; 2WB1 C; 3OTQ A; 3IM1 A; 4RQ2 A; 5HR6 A; 4Q45 A; 4YP3 A; 2IOF K; 1XS9 D; 4LJX A; 4F93 B; 2R8J A; 3RJG A; 2HMX A; 1B0X A; 1NK9 A; 1BNO A; 3UQ2 A; 3V6J A; 5EE1 A; 3RJE A; 3QU7 A; 1A6S A; 1QCK A; 1TV9 A; 2G5H B; 3L3F X; 4QZE A; 3UM9 A; 4KLI A; 3DEE A; 2JHD A; 4MHV A; 5KAF U; 2W9B B; 3J81 j; 4A8E A; 2ASD A; 4J9M A; 2BPG A; 5DB6 A; 3TAD A; 3MR2 A; 4KN4 A; 3KOO A; 3K75 D; 7ICI A; 4O0I A; 4XRH A; 1Q46 A; 1ZQT A; 1ZET A; 5ALG A; 4TUS A; 5KL1 B; 1JRO A; 2C28 A; 1ZQF A; 2ISP A; 2NRT A; 4BGD A; 2G5I B; 4C4T A; 4F92 B; 1SV4 A; 5ALV A; 2C2E A; 4B9V A; 2KIW A; 4US8 A; 2QB0 B; 2BQU A; 1L3S A; 5J0R A; 1SWW A; 1O08 A; 4JV0 A; 5ALP A; 5HHH A; 5J8Y C; 5KFU A; 3C5F A; 1LKY B; 1NKE A; 4CRX A; 5DBB A; 4ECY A; 4DFP A; 1X42 A; 2P6R A; 1L8O A; 3WKB A; 1HIW A; 4DQS A; 3M9M B; 4OJP A; 2OHF A; 1NKB A; 4UBB A; 2EDU A; 3LK9 A; 4OO1 J; 5AKI A; 5G5H A; 3H4B A; 4EEN A; 5KT7 A; 5KFE A; 5AKK A; 5IIJ A; 4JB3 A; 1BPB A; 2H3Q A; 4MF8 A; 4FZL A; 2KZ3 A; 2W54 A; 2Q0Z X; 4ECR A; 1S0N A; 4Y2V A; 1TFR A; 4C80 A; 2E5S A; 2IHN A; 2A19 A; 1ZD5 A; 5AKZ A; 5L1L A; 5ALQ A; 5JU5 A; 4OJ5 A; 4BWM A; 1JAL A; 3R9K A; 9ICC A; 1Q8K A; 2W43 A; 5EE3 A; 5AI4 A; 1ZRM A; 2NO4 A; 5KFF A; 2G08 A; 4RQ1 A; 5AKG A; 2JV3 A; 3TQ1 A; 4CF3 A; 2RRD A; 1IV8 A; 1RYR A; 2JGA A; 1PK3 A; 5T14 A; 5ALZ A; 1ZJN A; 3RH4 A; 4Y2P A; 4KLE A; 2K89 A; 3SAH A; 3LVV A; 2JZB A; 2MRL A; 5ALK A; 5KFH A; 1B22 A; 2AGP A; 3M6K A; 2MA1 A; 4ELT A; 1IM4 A; 3GIM A; 4IQW A; 2ZXH A; 2HHU A; 2PFO A; 4UAT A; 3WKC A; 4BWJ A; 4UB4 A; 2W9C A; 3RB3 A; 2ESE A; 3F5A A; 2LHT A; 2CRX A; 1T94 A; 3KKA C; 2I9G A; 4LZG A; 3OHB A; 1TAU A; 2ES6 A; 1X9S A; 3TAQ A; 3E58 A; 4GC6 A; 4TUP A; 5ALI A; 2LYH A; 5ALL A; 4KLU A; 3SI8 A; 4DL4 A; 7ICS A; 1D9D A; 8ICG A; 5KAI U; 3THV A; 2WF7 A; 1RQN A; 3RBD A; 5DLF A; 3KZX A; 7ICM A; 2DWQ A; 3RB6 A; 4O3Q A; 4FFD A; 3L5K A; 8ICM A; 4FZM A; 1MC8 A; 2V9W A; 3IDW A; 3RH5 A; 2AH5 A; 3QU5 A; 2YMM A; 4OD0 A; 4RQ0 A; 4P0P A; 4BXO B; 2XY6 A; 1Y88 A; 5BOM A; 3JPS A; 4DSK A; 2ZXI A; 3CP8 A; 3MR6 A; 1KDH A; 5ALH A; 2UVU A; 4DSL A; 2WFA A; 2XVT A; 9ICU A; 2YMQ A; 5EWG A; 3NAS A; 3JPN A; 2RHF A; 2RDI A; 5D46 A; 2W7O A; 2G06 A; 3VCB A; 2BKE A; 4OCZ A; 5KFM A; 4J9S A; 5DG7 A; 1RM6 C; 1BVS A; 2V4R A; 4DOB A; 1V9P A; 2K4P A; 3PX6 A; 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2RDJ A; 1X66 A; 3WKA A; 2FLL A; 1IIP A; 2IOF A; 1SL2 A; 2XY7 A; 1PVR A; 1S0O A; 4RUA A; 9ICR A; 4NL9 A; 1S5L U; 4FS1 A; 2MU2 A; 2NRW A; 8ICV A; 1Z4O A; 1TAM A; 2H5X A; 5AIA A; 5KFV A; 2IHM A; 4US9 A; 3N7S C; 4YVZ A; 4NXZ A; 3HW8 A; 3KHL A; 1DK2 A; 4DLG A; 3KZI U; 4NLC A; 4DSE A; 5TZV A; 9ICN A; 1D8B A; 3CYM A; 5DBC A; 5J2C A; 2FDR A; 2KFN A; 5AM3 A; 5KFD A; 4P0Q B; 3NRW A; 3C2M A; 4OJ6 A; 2H3Z A; 3ONN A; 4ZOH C; 4QZA A; 3MDC A; 1KKX A; 3NUQ A; 4GC7 A; 3TFR A; 4M6W A; 4QWC A; 4G9B A; 3M8R A; 1U9L A; 2XCA A; 1J2N A; 3V72 A; 1F5S A; 1ZQB A; 2PMZ C; 4Q8E A; 3C21 A; 3NS1 A; 3GV5 B; 3E0F A; 2HHX A; 3TAN A; 3N97 B; 5J2D A; 4R65 A; 3T3F A; 1XWL A; 4ED6 A; 4ED1 A; 5KFZ A; 3LWL A; 4ECZ A; 4ZH4 A; 4GXK A; 3LWM A; 9ICF A; 9ICP A; 2HHT A; 5AIB A; 3UMG A; 5J2I A; 3LVW A; 5AIC A; 2G07 A; 5HNK A; 5C0Y A; 4HAI A; 1RYU A; 1BPY A; 1ZQP A; 3NVY A; 1WWV A; 5KT6 A; 3NGD A; 3PML A; 2AQ4 A; 5J0T A; 3BJY A; 2R8H A; 4O9M A; 2HBM A; 4KLG A; 4RPY A; 5AHX A; 5AK6 A; 4DF8 A; 5ALW A; 2LPE A; 3QXG A; 5DQH A; 1ZRN A; 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