The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
27
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sequence length |
120
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structure length |
120
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Chain Sequence |
PPEDLMQYEAMAQDALRGVVKAALKKAAAPGGLPEPHHLYITFKTKAAGVSGPQDLLSKYPDEMTIVLQHQYWDLAPGETFFSVTLKFGGQPKRLSVPYAALTRFYDPSVQFALQFSAPE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Hypothetical protein
|
| publication title |
Crystal structure of Caulobacter crescentus SspB ortholog
rcsb |
| source organism |
Caulobacter vibrioides
|
| molecule tags |
Hydrolase activator
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| total genus |
27
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| structure length |
120
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| sequence length |
120
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SspB-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YFN A; 1ZSZ C; 1OU9 A; 2QAS A; 1OUL A; 1OU8 A; 1OX8 A; 1ZSZ A; 1OX9 A; 1ZSZ B; 2NYS A; 2QAZ A; 1TWB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2Z0W A; 4F7U F; 2VXF A; 4OMF B; 1WXB A; 5I22 A; 3URG A; 1S72 Q; 3SB2 A; 1JRI A; 2JS0 A; 4MZT A; 4YTL A; 3G6E A; 2LCL A; 5ECA A; 4M78 F; 3OW2 P; 4C5G A; 1HJD A; 2A7Y A; 2F2W A; 2KBT A; 1W2B P; 4M7A F; 1AWO A; 1YNZ A; 3JCM e; 3CCU A; 4JS4 A; 1FXX A; 1M3A A; 3TSZ A; 4A54 A; 2VAS A; 4HVV A; 1YIT Q; 1K1Z A; 2ZCF B; 2ZGW A; 4J6W A; 4CRI A; 3RER A; 1U8R A; 1RLP C; 2DTO A; 1UGV A; 2EQJ A; 1HYO A; 1OZ3 A; 3CMA A; 3P8H A; 2EFI A; 2E3I A; 2OTJ Q; 2QAZ A; 1SHG A; 4J9F A; 3CC7 A; 2OI3 A; 2B86 A; 2QQA A; 1NLP C; 2BZY A; 1UGQ B; 2C0I A; 3I56 A; 4XTV A; 4JJB A; 1I07 A; 1Y71 A; 1K73 R; 3SWN A; 4XTW A; 4BDZ A; 3I35 A; 1UHC A; 3TEE A; 3OB9 A; 4BE1 A; 2HQE A; 4HT9 A; 1SRL A; 1Q95 G; 2YDL A; 1WGS A; 1IHW A; 2LQK A; 2ZAE A; 2KYB A; 3CQT A; 5KE3 A; 2QAS A; 4RG2 A; 4PJO E; 3CBP A; 1E7O A; 2L0A A; 1SPK A; 2E41 A; 2CP6 A; 3CCV T; 3JCM P; 2X4J A; 4TVR A; 3E9F A; 4XU0 A; 2CYZ B; 3OSS C; 4BB7 A; 3UA6 A; 2DX1 A; 3VKI A; 8AT1 B; 1UGS B; 2CP7 A; 2RPN A; 5IN1 A; 1R0C B; 3HFO A; 1KJW A; 4FYV B; 5KYW B; 1UFF A; 1QVF A; 5FU6 C; 2EIF A; 2K3B A; 2L2P A; 3EG1 A; 5IH2 A; 4LDU A; 3CCM Q; 3CD6 Q; 4KGZ B; 1GL5 A; 2QDL A; 4KUD K; 4JDS A; 2CS7 A; 3VUZ A; 4MMK A; 2DEU A; 3HTR A; 1XJW B; 5LJ5 d; 1VQ8 Q; 1FMW A; 2XK0 A; 3G6E T; 1I81 A; 2Y4X A; 4M75 G; 2GQI A; 2RB6 A; 4XTZ A; 4FL6 A; 5CO7 A; 2GBQ A; 3JCM h; 3JRZ A; 3CCU T; 1VQK Q; 4RTW A; 3PVL A; 5GMK i; 4UC4 A; 4A4E A; 3F70 A; 2LT4 A; 5GMK m; 2D8J A; 2PNI A; 4N0A C; 2NYS A; 4BDY A; 2F5K A; 2VYT A; 1OEB A; 2KGT A; 2E4H A; 1GXI E; 4F7U G; 2KQW A; 2KT1 A; 2DXB A; 3PMT A; 3CC7 T; 4PJJ A; 4PLI A; 3SD4 A; 4EPC A; 2DBM A; 3HSB A; 3M5A A; 2QYZ A; 1VQP A; 3RDV A; 4C5H A; 3OS0 A; 1T3L A; 2YRC A; 4C0F A; 4MDX A; 4M77 C; 3CCR A; 2VGM A; 4M7A G; 3BDU A; 1VQ5 Q; 1RAD B; 1RAC B; 3VUB A; 3IQL A; 4OMQ A; 1WXT A; 2EJG A; 1VA7 A; 4II1 A; 3OYK A; 4CC3 A; 4DBR A; 1X69 A; 5CCA A; 2HKQ B; 3CC2 Q; 3G1J A; 1SSH A; 2RHI A; 1TUC A; 5KYU B; 1KFZ A; 3LW5 E; 3CC4 Q; 4X34 A; 5A0D A; 1KQ2 A; 2COY A; 2R5M A; 5HCK A; 1M30 A; 2PVD B; 1JB0 E; 2P4T A; 1M90 C; 3WVD B; 3WVE B; 2V8I A; 4RTT A; 2NUP B; 3VRY A; 4C92 C; 1RLQ C; 3PIO A; 1SHF A; 1UEC A; 2NUT B; 1GBQ A; 4HCC A; 4C92 D; 3H8Z A; 2XHC A; 3QO3 A; 2KDS A; 3A8H B; 4DOV A; 2ZPB B; 3JCM g; 3TRE A; 1C1A A; 3HHT B; 2K5I A; 2NUZ A; 1EIF A; 1GBR A; 1ZBJ A; 4C8Q E; 2LQN A; 2RHX A; 4XU1 A; 4B9X A; 1ACM B; 5KE2 A; 4PL6 A; 1YJW A; 3CCS Q; 5DLO A; 4HXJ A; 1WHJ A; 4QQG A; 1M2V A; 4M7D F; 4R0K A; 2VUB A; 1Y96 A; 2MMP A; 1JXM A; 1QWE A; 2RNA A; 4N4G A; 3V8L A; 4LE9 A; 1MND A; 2R57 A; 4FT4 A; 2LCC A; 2DIG A; 3M0R A; 4C5I A; 3P8D A; 2X9H A; 3M0U A; 2KRM A; 1X01 A; 5CQX A; 4IUU A; 2CH4 W; 1VQP T; 2J6F A; 2M02 A; 1PM3 A; 3UAT A; 3VS1 A; 5D7U A; 3I55 A; 1IGQ A; 2YT6 A; 2GF7 A; 5LJ3 d; 3D7S B; 3DB4 A; 2JM8 A; 3CCR T; 1H3H A; 1Q82 C; 4M75 B; 2X35 A; 4JJN K; 3CCE T; 3V7C A; 3BE3 A; 1ZUY A; 2XD0 A; 1VYT A; 3LGF A; 1K0S A; 1WHL A; 3PNW C; 2A28 A; 1KD1 U; 1ZSZ A; 3OYN A; 3M9Q A; 2QGG A; 4LDV A; 2DXC A; 4N0A A; 1PSF A; 3LGL A; 3G7Z A; 5KYX A; 4FW2 A; 1Y7X A; 2DPP B; 4XTU A; 1QMC A; 1M1K U; 1K9A A; 3ER0 A; 3M54 A; 2H8H A; 2AKL A; 2DVJ A; 5FWB A; 4E7J A; 1WNL A; 3GIB A; 2QEX Q; 3EGD B; 3REB B; 1VQ4 T; 1N8R U; 4PJO C; 2DIL A; 3JAM E; 4JRP A; 2EKH A; 4XQ3 A; 4CC2 A; 2JW4 A; 4ELY C; 2DIQ A; 4OB1 B; 2DKG A; 4PFO A; 1G3T A; 4PJO D; 2EQM A; 1TXQ A; 2DMO A; 2DXU A; 2KEA A; 4E7I A; 1RUW A; 1GFC A; 2FEI A; 3LH0 A; 4E7H A; 2EWN A; 2RK1 A; 3CCL Q; 1G3W A; 2VB6 A; 1B7T A; 2EGE A; 1RL2 A; 3EHR A; 1W4S A; 3JV3 A; 1PCX A; 3L2Z A; 1AZE A; 1YJW T; 3VS7 A; 1K76 A; 1G8X A; 2EPD A; 2FHD A; 4MZP A; 1VQN A; 4C92 A; 2VXE A; 4BAC A; 4QQD A; 2D9T A; 3R6N A; 1AEY A; 3I5S A; 2K5F A; 4NOY A; 1Q86 C; 2KVQ G; 3REA B; 1U5S A; 2QG9 B; 3KBG A; 1KK7 A; 1KQS S; 1T0J A; 1I5L A; 2OTL A; 2E64 A; 1B34 B; 4JRK A; 2BIV A; 2LDM A; 3I55 T; 4XTX A; 2XMF A; 4OMN A; 5J39 A; 1QKX A; 5CKB A; 5GAO l; 1VQ6 Q; 1AZG B; 2DF6 A; 3HRS A; 4M7D G; 1QKW A; 2JOY A; 4EMK B; 3ZL7 C; 5CAI A; 4BE0 A; 2RN8 A; 4MML A; 1W1F A; 1OU8 A; 1UG1 A; 1YWO A; 2QDY B; 3M4G A; 2LQ8 A; 5FU7 B; 4ATO A; 1M9S A; 2RK2 A; 3JCM X; 3H9N A; 2XU8 A; 2QXF A; 4PLL A; 4M77 F; 1YIJ A; 3LWH A; 4BY6 C; 3G4S A; 4OB0 B; 1N27 A; 2K5L A; 2HQH A; 2PTK A; 2EJ9 A; 4BI8 B; 2P0P A; 4IUQ A; 1OV3 A; 5A2Q E; 3JSC A; 2JVV A; 1YWP A; 2FPD A; 3A98 A; 2CP5 A; 3X25 B; 4ZNX A; 2LX7 A; 2DTI A; 1K73 C; 4FYX B; 2E5K A; 2DL4 A; 3QG1 A; 2E1H A; 2K3X A; 1ZHI A; 3JCM f; 4LXC A; 4HCB A; 3SWN B; 3MP8 A; 1QCN A; 2YRD A; 1Q86 U; 2DE0 X; 3KUF A; 2AZV A; 2JM9 A; 3FC3 A; 2CUD A; 2H3J A; 1UGP B; 1NYF A; 3U23 A; 3CCQ A; 2K6D A; 2K3Y A; 2PVG B; 3GPL A; 5GAN 4; 2M1H A; 1NZ9 A; 4PJN A; 4D8D A; 5GAN 3; 2ZPH B; 4PJO A; 1W6X A; 3OW2 A; 1JJ2 S; 1QVG S; 1QVP A; 2JJ9 A; 2LZ6 B; 5L23 A; 2AHJ B; 3RIR A; 2CUB A; 1ZSG A; 1BIA A; 1K8A U; 2MWP A; 1UEB A; 4C8Q C; 4QKU A; 1UB4 A; 1TU0 B; 5EG2 A; 2OTL T; 4FCY A; 1F1B B; 1VQL Q; 4C8Q D; 1VQ9 A; 4JUV A; 2LP5 A; 4HKE A; 5AYF A; 3QDR B; 1M1F A; 2X3W D; 3UF4 A; 1C6V X; 1WQ7 A; 3ZFJ A; 1KHC A; 2KMT A; 1E6H A; 2L8D A; 5KYN A; 5CKF A; 2A37 A; 4D6W A; 2M51 A; 1ZLM A; 1AWX A; 3CCV Q; 1K73 U; 2KYM A; 5A0L A; 4CI0 C; 5GAM d; 4C92 E; 1M1G A; 1YIJ T; 3G4S T; 3ME9 A; 4LUE A; 4QVZ A; 1XQH A; 2DTH A; 2O4X A; 2PU9 B; 2VKN A; 3OYB A; 2COZ A; 4DQ2 A; 1TWB A; 2YUP A; 2HQX A; 1PD1 A; 4M75 F; 2PUK B; 2EYX A; 3FEO A; 1OUL A; 4FYY B; 2DNU A; 2YXY A; 1LVK A; 3VU3 C; 5I21 A; 2QI2 A; 4B6M A; 5DM7 R; 5D6Y A; 2M0O A; 2DEQ A; 1ZUK A; 1IZ6 A; 3X28 B; 3CME Q; 1VQO A; 1OX8 A; 1RAH B; 2HKN A; 3NTI A; 2O2O A; 5GAM e; 1M3C A; 3QJY A; 1PKS A; 2MCN A; 4Y28 E; 1V29 B; 2W0Z A; 1IO6 A; 3M53 A; 2EYW A; 3H6Z A; 2V8J A; 4M77 G; 3G6E Q; 3O5Z A; 2YUQ A; 5C6S A; 2FZG B; 3NMZ C; 1Y0M A; 4RMO A; 1KQS P; 5GAN j; 4KUL A; 2HD0 A; 2RMO A; 5GAO n; 3CCU Q; 3BY7 A; 1K8A R; 3X24 B; 3L2R A; 1FMK A; 4KH1 B; 3MEU A; 3C12 A; 2X3X D; 2P84 A; 1PD0 A; 2DL8 A; 4OP0 A; 1WHG A; 2KXC A; 4J83 A; 3CC7 Q; 2ZPG B; 1YJ9 Q; 3SEM A; 3NFC A; 1S72 A; 3A5Z B; 2MOX A; 2QTV A; 3M58 A; 4F04 B; 2QA4 A; 3QYG B; 1OX9 A; 5GAN h; 1D3B A; 3CPW S; 3S6W A; 5IAY A; 5GMK e; 3C95 A; 1BI3 A; 2FZC B; 1YIT A; 1NYG A; 3J7A F; 2RD1 A; 3E1S A; 1O75 A; 2LJ0 A; 4CC7 A; 1X2K A; 2WAC A; 1AT1 B; 3V8K A; 3OMG A; 4R55 A; 5FRM A; 4C8Q A; 2YUO A; 4HVU A; 2QQS A; 1Y96 B; 2J06 A; 2EGC A; 1R77 A; 2D1X A; 5FU6 B; 5HKC A; 2KNB B; 3BFM A; 4O5V A; 4DBH A; 2KRN A; 2XDD A; 1AD5 A; 5AT1 B; 3A1P A; 4XK8 E; 5GJW B; 1ZA2 B; 4M78 E; 2CP3 A; 3L2Q A; 3EFR A; 4OMP A; 5IHI A; 1JJ2 P; 4M7A E; 3DLM A; 4NL3 A; 4PKC C; 1QVG P; 1YI2 A; 2XIC A; 5J26 A; 3JB9 F; 3WXM B; 2RM4 A; 5FW9 A; 3V8J A; 3G71 A; 4RCB A; 3H0F A; 1I1J A; 2ABL A; 1ZBX A; 3THK A; 1MHN A; 3I5R A; 1WHH A; 4HA8 A; 2JTE A; 5KYX B; 3CCM A; 3CD6 A; 4N4I A; 4HCK A; 5C0M A; 2RJD A; 2LT1 A; 1ZSZ C; 5GAN g; 4IUP A; 3CMA T; 2RA2 A; 2XDB A; 5LJ5 e; 4FYW B; 2RQR A; 1S72 T; 4AG1 C; 1VQ8 A; 1OQK A; 2M16 A; 4Z02 A; 1Q7Y R; 2QA4 T; 2HSE B; 2LX9 A; 4M77 B; 3I56 T; 3CCR Q; 3PTA A; 4RTU A; 3CCE Q; 3A8M B; 3EFO B; 4IUR A; 4HT8 A; 1VQK A; 3MPU B; 3Q1J A; 3OYH A; 4DA4 A; 1YIT T; 2DRK A; 1BB9 A; 2L89 A; 2JT4 A; 2BTT A; 4FSX A; 2J6O A; 2ZPE B; 4C0D C; 1OPK A; 3OYD A; 3LWI A; 3L1A A; 4OGE A; 2KR3 A; 4FM4 B; 1K9M R; 2XG8 D; 4ANJ A; 2QQ9 A; 1MNE A; 1VQ4 Q; 1X6B A; 4A4F A; 4RTY A; 1VQ5 A; 3UDC A; 2JMA A; 2E3H A; 4C92 B; 2OJ2 A; 2XDP A; 4PFZ A; 1NPR A; 4KGX B; 2FZK B; 2RH2 A; 4GY5 A; 1KD1 C; 5DY9 A; 1RAB B; 1G2B A; 4X1V A; 3BDL A; 4D8K A; 2E12 A; 2JTM A; 2XI9 A; 3INZ A; 1XOV A; 3OYA A; 1M8M A; 1YI2 T; 2IVW A; 4F14 A; 1M1K C; 2DER A; 4WF2 A; 2HL5 C; 2DXT A; 2L3S A; 1NJI R; 1OU9 A; 5LJ5 j; 3L2U A; 1D1B A; 2BKD N; 1RAE B; 1OI1 A; 5GAN 2; 4AFQ C; 2A08 A; 5FWC A; 1YJN Q; 4OF1 A; 1N8R C; 3G71 T; 1G5V A; 1Y57 A; 2DL5 A; 2FRW A; 4XU2 A; 2J6K A; 1YHQ A; 1ARK A; 3CPW P; 3QUI A; 1TUD A; 4E7K A; 3FB9 A; 2XKO C; 3JCM b; 2EQU A; 1XNI A; 4KH0 B; 1BBZ A; 3FLG A; 2P4R A; 2EGA A; 4RTX A; 5GMK l; 5LJ5 h; 5CKH A; 1WHK A; 4J7F A; 1VOM A; 1E6G A; 1NLO C; 3RR6 A; 3I55 Q; 2FO0 A; 5GAN 7; 2LNV A; 4HCZ A; 2O9V A; 2NWM A; 3H0I A; 2DZ9 A; 1M5Q 1; 1WJR A; 2H3E B; 3JB9 G; 2Y90 A; 4JZ3 A; 5L8R E; 1OYX A; 3E19 A; 1PWT A; 2RI2 A; 4E7S A; 2LC4 A; 2BZ8 A; 3EHQ A; 4Z8A A; 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1BK2 A; 4R56 A; 4ESR A; 1J3T A; 5GJV B; 3VS5 A; 4GBQ A; 5KYY B; 3OQ5 A; 5CK9 A; 5GAN 8; 2CP2 A; 1M90 R; 3HPW A; 1VQM T; 4BY6 B; 1K8A C; 3O8V A; 3G4S Q; 3GNG A; 1GCQ A; 4LDX A; 1W2B S; 4QW2 A; 4ME7 A; 1BI2 A; 1O9S A; 1BYM A; 4DOW A; 4RTZ A; 2EJF A; 4J9B A; 2DD5 A; 5LJ3 h; 2KK4 A; 4MZM A; 4Z89 A; 2GFA A; 4JRQ A; 3QYH B; 1VQ6 A; 4NS5 A; 4ZTJ A; 1IXD A; 4X9C A; 4LDY A; 3GBQ A; 5FLX E; 2E70 A; 1NBE B; 2JS2 A; 7AT1 B; 4JLI A; 2Y4Y A; 2LNH B; 3HKS A; 2WSE E; 3E2U A; 1TH7 A; 1MMA A; 3FJ5 A; 2RJC A; 1K0X A; 2F2X A; 4IUT A; 2QEX T; 2HAX A; 1NG2 A; 3T9N A; 1ZA1 B; 2X4W A; 1D0X A; 3ZBD A; 4C92 F; 1WIE A; 4P5N A; 5HY6 A; 4N4H A; 3EG0 A; 1KQS A; 4E7Z A; 4OB2 B; 4WCI A; 3CBM A; 3JB9 H; 1OZ2 A; 3RBB B; 2MYS A; 1VQN T; 2ENM A; 3VYH B; 3L2W A; 1Q82 R; 4MDW A; 4C8Q B; 2HNI A; 4J9C A; 1TOV A; 3A8G B; 3QBY A; 1VIE A; 1ZQ1 A; 2P0Q A; 3CCL T; 2EVR A; 3PT9 A; 4X9D A; 5D6X A; 4F7U A; 2E5Q A; 1KG1 A; 5M9O A; 4JZ4 A; 1KC8 U; 1IGU A; 1AOJ A; 2L3R A; 5HK3 A; 5CIU A; 5FRO A; 4M78 A; 1P92 A; 2RHY A; 2P0K A; 4WTO B; 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