The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
27
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sequence length |
120
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structure length |
120
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Chain Sequence |
PPEDLMQYEAMAQDALRGVVKAALKKAAAPGGLPEPHHLYITFKTKAAGVSGPQDLLSKYPDEMTIVLQHQYWDLAPGETFFSVTLKFGGQPKRLSVPYAALTRFYDPSVQFALQFSAPE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase activator
|
| source organism |
Caulobacter vibrioides
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| publication title |
Crystal structure of Caulobacter crescentus SspB ortholog
rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical protein
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| total genus |
27
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| structure length |
120
|
| sequence length |
120
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SspB-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1OX9 A; 1OU9 A; 1OUL A; 1ZSZ A; 2NYS A; 1OX8 A; 1TWB A; 1ZSZ B; 2QAS A; 1OU8 A; 1YFN A; 2QAZ A; 1ZSZ C; #chains in the Genus database with same CATH topology 1NEG A; 4LD9 K; 3CME T; 2MPX C; 4JUV A; 4RUG A; 2YUP A; 4PJN A; 4QQG A; 2FPF A; 2EJG A; 1QP3 A; 3VS0 A; 1YIJ A; 4IIO A; 1B34 B; 4J9G A; 5I11 A; 1U8R A; 1KD1 R; 4OMF B; 1M1G A; 3EFO B; 2QDL A; 1AT1 B; 4DBF A; 2DL8 A; 4KGX B; 4E7L A; 1YBY A; 3OB9 A; 1WXB A; 3FEO A; 1WHM A; 5GAO l; 1I8F A; 2IVW A; 5KYU A; 1H8K A; 4C8Q E; 2ED0 A; 2P0P A; 5FU6 C; 1VQK A; 3EGD A; 2K3Y A; 3SFM A; 4BDZ A; 4L59 A; 2ROT A; 3JCM c; 2DXB A; 2CH4 A; 1UHC A; 3EGX A; 3QZ5 B; 5J39 A; 4F04 B; 2M51 A; 5FLX E; 4QKU A; 3MO8 A; 3CCQ A; 3CCV A; 3JCM f; 2PVG B; 3QWY A; 1KHI A; 1PKS A; 3UPU A; 5GAM j; 1M9S A; 2B8A A; 4E7K A; 2X4J A; 5KYX A; 1JO8 A; 1UGS B; 1WNL A; 4RTW A; 4EIK A; 2CT3 A; 1WPY A; 5IXB A; 5CAI A; 5FU6 B; 2ZPI B; 4ATO A; 4XQ3 A; 1DJ7 B; 3SD4 A; 4CC7 A; 4FSS A; 2EKO A; 2H3E B; 2COW A; 2X4W A; 2XDB A; 4M78 A; 3PVL A; 2DFU A; 1GBR A; 4FT4 A; 4JLI A; 4M75 F; 4M7D E; 4XTW A; 5KE3 A; 2XHC A; 4C5I A; 1VQP Q; 1Q7Y C; 5CK9 A; 4BI8 B; 2RJC A; 3M0Q A; 4FL6 A; 1NBE B; 1MGQ A; 2ECZ A; 3X28 B; 2BUD A; 4BDY A; 2I2L A; 4AFZ C; 2BKD N; 4M77 G; 2M0O A; 4J6X A; 1M1K U; 4JS4 A; 1H3H A; 2GQV A; 1TXQ A; 3CBP A; 2HZY A; 1UB4 A; 4A63 B; 2E1H A; 2OTJ A; 1HYO A; 4LDW A; 1R0B G; 2EGE A; 3I56 T; 2E4H A; 2CP0 A; 2LQK A; 4AFS C; 1N8R R; 3UT1 A; 3FJ5 A; 2CUB A; 2DLP A; 3X25 B; 2JN0 A; 2RA2 A; 2Y4X A; 3OS1 A; 1ZSZ A; 1YJW Q; 2D8J A; 1SRM A; 1YIJ Q; 3A8L B; 2PZ1 A; 1FXX A; 3DKM A; 3C0C A; 1C1A A; 4CI0 C; 4MDW A; 2H8H A; 3HP9 A; 4M75 C; 3MEW A; 2KVQ G; 1MND A; 1U5S A; 2EQM A; 3JCM W; 2A36 A; 3J81 E; 2NUT A; 3OYJ A; 2FB7 A; 4M7D D; 4XTX A; 2DTI A; 4QQ6 A; 1JJ2 P; 2X35 A; 3LLR A; 2QEX A; 2RHU A; 2DJQ A; 1Y71 A; 2NYS A; 2F5T X; 3X26 B; 3EG1 A; 2R5A A; 1X2Q A; 3G4S Q; 3PT9 A; 4M77 E; 3OYE A; 1RAF B; 2RJF A; 1VQP T; 1K0X A; 4M75 B; 3FDR A; 4IUV A; 4KRT A; 5GAN d; 1YJ9 A; 3VS7 A; 4M7A E; 3CCQ Q; 3CCV Q; 2HQX A; 1UJY A; 5GAO p; 2EJ9 A; 3LWI A; 3LYI A; 2ZPG B; 4PJO G; 1VQ4 A; 4L6V 5; 3VKI A; 1G3Y A; 2V1Q A; 3KXT A; 3M5A A; 1TH7 A; 4M78 F; 2DRK A; 4RTZ A; 1PRL C; 1D09 B; 3CC7 A; 2J6K A; 1OUL A; 5A2Q E; 3REB B; 4QT7 A; 3I5R A; 2YLC A; 3OA6 A; 5GAN 3; 2MI6 A; 4JJC A; 1UJ0 A; 4QQD A; 1C0M A; 2YRV A; 3RER A; 2RNA A; 3QZ9 B; 1YJW T; 4BD3 A; 3MJX A; 4XAX B; 1YIJ T; 4PNO A; 1BBZ A; 2JZ2 A; 3CPW S; 2L3P A; 4O5V A; 1VYV A; 1M1K C; 2MF2 A; 1CKA A; 3C94 A; 4KBM B; 2VV5 A; 1YFN A; 4PJJ A; 4IIM A; 5GJW B; 2MMP A; 1NE8 A; 5KCH A; 5LJ5 h; 2ED1 A; 3M53 A; 4PJM A; 4HA8 A; 5LJ3 h; 1SPK A; 4HCK A; 5KYU B; 2AT1 B; 4M7A D; 2QK0 A; 4LDY A; 3CMA A; 4JLG A; 3PFS A; 2L3R A; 1G83 A; 1WDX A; 3J80 E; 3EGD B; 3G4S T; 1RAG B; 1WI7 A; 3EGX B; 4M78 C; 3HRS A; 2QI2 A; 2X51 A; 3EG9 A; 3CPW A; 3NPF A; 4PJO E; 2SEM A; 4KGZ B; 5GAM g; 2CS7 A; 3CCQ T; 3CCV T; 1QVG A; 3X20 B; 1NLP C; 2LQ8 A; 1X6O A; 2L3S A; 2X9H A; 5FRM A; 3EG2 A; 1Y0M A; 5GAN j; 2DIL A; 5KYX B; 4JJD A; 3BY7 A; 2DET A; 3ER0 A; 3H9N A; 1OI1 A; 2C0I A; 1SHF A; 4J9I A; 4FM4 B; 2LT1 A; 2XDD A; 3NTI A; 2PVO B; 1QW1 A; 1PKT A; 1TSF A; 1CKB A; 1M3B A; 4M78 B; 1QCN A; 3VV0 A; 1BI3 A; 4D8D A; 1FYN A; 1IGQ A; 2D0Q B; 2DAQ A; 3A8H B; 2LMJ A; 1G2B A; 3V7R A; 1KC8 C; 2KT8 A; 2LX7 A; 3UA7 A; 3HFO A; 1KD1 U; 3CPF A; 2DL4 A; 1ZSZ C; 4E7Z A; 2DO3 A; 1M27 C; 4FW1 A; 2HCK A; 1WXT A; 4VUB A; 4V2S A; 1ZSG A; 3OBY A; 4N4H A; 2JTM A; 1VQ4 Q; 3A98 A; 2YUO A; 5GMK i; 1KIK A; 3SWN B; 4KUL A; 1ZBX A; 4J9B A; 1WJQ A; 3V8L A; 4KUD K; 2KRN A; 3S3M A; 2QTX A; 4RTT A; 1MHN A; 1NG2 A; 2HL5 C; 2GTO A; 2GNC A; 3X24 B; 1ZSZ B; 2FZK B; 1BCM A; 2C0T A; 4PL6 A; 3LWH A; 5GMK j; 4R55 A; 2L8D A; 3OY9 A; 3L2R A; 1V76 A; 2RK1 A; 3O5Z A; 1YCY A; 2RB6 A; 2PUO B; 2XMF A; 2W10 A; 2BZ8 A; 4CRI A; 2DIG A; 1VA7 A; 4ORZ A; 3PMT A; 1FMK A; 1JRI A; 2K6D A; 3S3O A; 2NUT B; 2KDS A; 1M1K R; 4BUG A; 5FRN A; 3JCM J; 2D9T A; 2E64 A; 1NLO C; 3CMA Q; 4DBR A; 3VYG A; 2J06 A; 2DL5 A; 2EQJ A; 2ZAE A; 3QG1 A; 2F2W A; 3GBQ A; 1VQ5 A; 2D0N A; 4LXC A; 4PKC C; 5DLQ E; 1M8V A; 1YJ9 T; 1PWT A; 2A37 A; 3URG A; 1PHT A; 4J83 A; 4KT0 E; 3OYI A; 2DKG A; 3JV3 A; 3QYH B; 3VS2 A; 1TU0 B; 4D6W A; 2XKO C; 2LCS A; 2KT1 A; 3L2V A; 2HBW A; 1VQ4 T; 3JCM Q; 1UHF A; 2V8K A; 5CQY A; 1WX6 A; 1WHJ A; 2EAY A; 5J26 A; 1M2V A; 2L5Q A; 4F17 A; 3AT1 B; 4FCY A; 4PJL A; 3OYF A; 3CCR A; 2JXB A; 5CKB A; 2RH2 A; 3JB9 J; 1YIT A; 1XQH A; 2DMO A; 4EPC A; 3L2Z A; 2OX7 A; 4B9X A; 3SB2 A; 3QO3 A; 3ZEH A; 4N0A A; 1WLP B; 1R77 A; 3CD6 A; 1G3T A; 2Z0W A; 5HCK A; 1X01 A; 3QKJ A; 3RDV A; 4C0F A; 1VQO Q; 3VS6 A; 3M54 A; 1JU5 C; 2E10 A; 4A4G A; 1KC8 R; 4B6M A; 3JB9 F; 2DPP B; 4J9H A; 2MK5 A; 1LCK A; 5GAN 4; 3BE3 A; 1LPL A; 3CMA T; 3CCJ Q; 3LX7 A; 4BE1 A; 3CME Q; 3FC3 A; 5GAM f; 2YUQ A; 3VS3 A; 3RUX A; 1U3O A; 3EG9 B; 4E47 A; 4RKU E; 2RQU A; 1QKX A; 5GAN g; 4PK4 A; 2JTE A; 1X2K A; 2YT6 A; 2EW3 A; 2WSF E; 1SKU B; 1ARK A; 2EWN A; 2K3X A; 2LC4 A; 3CBM A; 2CP2 A; 4PLI A; 1O9S A; 2HL3 A; 4ZGE B; 3CCS A; 1N9S A; 4FYY B; 4LDX A; 4KGV B; 1W2B P; 1TWB A; 1GFD A; 4BI4 A; 4X9D A; 1PNJ A; 1ZA1 B; 5GJV B; 3A5Z B; 2KNB B; 3DB3 A; 5CCA A; 5LL6 S; 4C92 D; 3FJP A; 2DBK A; 2JOY A; 3HHT B; 1VQ5 Q; 2G6F X; 2CZ6 B; 3BDL A; 3L2W A; 3LGF A; 2XID A; 2MOX A; 4OB2 B; 1N9R A; 5GMK e; 3S3N A; 1Z9Q A; 3LGL A; 5LJ5 d; 1OX9 A; 2ZPE B; 3M58 A; 2GFU A; 2FG0 A; 3EFR A; 4C5H A; 3I55 A; 4IUP A; 1WFW A; 2VGM A; 1GCP A; 4RTY A; 1MMN A; 4J7F A; 1JEG A; 2EQI A; 2XU8 A; 2QQA A; 1VQ9 A; 2LRQ A; 4XTU A; 1YIT Q; 4C5E A; 4QVC A; 1X75 C; 1D1A A; 4J9F A; 3CEY A; 5CKE A; 3CCJ T; 2ROL A; 3LH0 A; 3CC2 A; 4ESR A; 3OYN A; 2CKK A; 1VOM A; 2R58 A; 4RG8 A; 4AG2 C; 1S1N A; 4E2F B; 4Z89 A; 4FIB A; 2CRE A; 5IHK A; 3M0U A; 2V8I A; 1VQM Q; 2OAU A; 5CR2 A; 1CSK A; 4Q5W A; 4DBQ A; 3H41 A; 3RMQ A; 1AHJ B; 1E6G A; 1SRL A; 3PE0 A; 3TVT A; 2GFA A; 5AT1 B; 3V7C A; 1Y57 A; 4C92 A; 1QVF A; 2LNV A; 2O88 A; 2RHI A; 2DXT A; 2P84 A; 3ZBD A; 2CP3 A; 2IIM A; 3I56 Q; 4OMM A; 1BI1 A; 1V29 B; 4HVV A; 3ULR B; 3Q1J A; 3CXC S; 1MNE A; 4ZTJ A; 2XDP A; 4BE0 A; 3CBO A; 2RI2 A; 1NJI C; 1VQ5 T; 1D1C A; 4GLK A; 3CCU A; 3ASK A; 3CC4 A; 4ME7 A; 2QTV A; 2BZX A; 3OSS C; 4X1V A; 2JW4 A; 4N0A C; 2HQE A; 1H64 1; 1UTI A; 4GLM A; 2FZG B; 2P0Q A; 2BE9 B; 4JS5 A; 4JJN K; 5EC7 A; 3M0R A; 5LJ5 j; 2KXD A; 4C5G A; 3CCR T; 4OML A; 5LJ3 j; 2L0A A; 2JTF A; 1G5V A; 1YIT T; 2VWF A; 2EYQ A; 4OB0 B; 3V8K A; 1T3S A; 4ELZ C; 2LT4 A; 2YUN A; 3CXC A; 2FZC B; 3GNG A; 1MMA A; 3L2Q A; 2MYS A; 4FYV B; 1ZBJ A; 3UDC A; 2DL7 A; 4WCI A; 1KK7 A; 3FIF A; 1X6G A; 4F7U G; 5AYF A; 3G6E A; 4XTY A; 1YJN A; 3BFM A; 2MAM A; 4IUT A; 1VQ7 Q; 1BIB A; 2AK5 A; 3GIB A; 1T0H A; 2QXF A; 5GAN 6; 1GFC A; 1VQM T; 2GTJ A; 3RMS A; 4EMH A; 3BW1 A; 4E7S A; 2RHZ A; 4C8Q D; 5HK0 A; 1VQN A; 4Y28 E; 4CC2 A; 2LVM A; 3U23 A; 4KH0 B; 4LD6 A; 4IUU A; 5I22 A; 2EGA A; 1UGP B; 1BU1 A; 2D8H A; 2DJZ A; 2EKH A; 3TCJ A; 1NM7 A; 1BI0 A; 5I21 A; 2EYY A; 1IB8 A; 3QDF A; 3THK A; 5GAN f; 1K9A A; 5FW9 A; 4HCC A; 2C0O A; 5D6X A; 2GCX A; 2HDA A; 3QUI A; 3HFN A; 1QQJ A; 1M30 A; 2VGN A; 1MMG A; 2YDL A; 1KSW A; 3JCM b; 1D0Y A; 4DOW A; 2F1L A; 3H0F A; 2LJ0 A; 1RAI B; 3SHW A; 2ZPH B; 4F16 A; 1PCX A; 4C92 F; 2QQR A; 1V1C A; 3OYY A; 2V8J A; 4HT8 A; 2JM9 A; 2HEQ A; 2M1H A; 1PRM C; 2DTO A; 1YWO A; 1VQ8 A; 2EQU A; 4F7U E; 1VQK Q; 1RI9 A; 4NL3 A; 3V7S A; 4GBQ A; 3CCU Q; 2L3Q A; 5EG2 A; 1QMC A; 2L89 A; 3CC4 Q; 1NPP A; 2EGC A; 3UA6 A; 2PVD B; 3QJ6 A; 2D6F A; 2QAS A; 2E5Q A; 1NJI R; 4J6W A; 4C8Q A; 1MUZ A; 1KC8 U; 3J7A F; 2DXC A; 5HY6 A; 1VQ7 T; 4B9W A; 2AKL A; 5C6S A; 1UE9 A; 1K8A R; 2E70 A; 1JB0 E; 2V26 A; 2MCN A; 4CC4 B; 5IHN A; 5KCO A; 5IAY A; 3M59 A; 2X3W D; 4C92 C; 1IHV A; 2EPD A; 4WF2 A; 3CQT A; 1AZE A; 2B86 A; 3M55 A; 4DA4 A; 1AVZ C; 2FYK A; 2FL7 A; 2JNG A; 2X4X A; 3ZL7 C; 3G6E Q; 1YJN Q; 3PVQ A; 2CP6 A; 1D0Z A; 4BY6 C; 4PLL A; 1SF9 A; 4M7D A; 3G71 A; 1BYM A; 2LCL A; 5DLO A; 1VQN Q; 5A0L A; 2BZY A; 5CQX A; 3RKX A; 3TSZ A; 1RI0 A; 4C92 B; 4M77 D; 1UEB A; 4ZN1 A; 2LX9 A; 1RAA B; 5LJ5 e; 2OTJ Q; 1IO6 A; 4JZ4 A; 5LJ3 e; 4FW2 A; 2CUD A; 2ABL A; 1YHQ A; 1I81 A; 3GLX A; 1XOV A; 3M56 A; 1XNI A; 1LJO A; 1VQK T; 2LJ3 A; 1X27 A; 2O2O A; 1QCF A; 2DRM A; 3CCU T; 3CC4 T; 2G3R A; 4JRI A; 1UG1 A; 4BY6 B; 5KYW A; 2KEA A; 2EQK A; 1BB9 A; 3L1A A; 1HD3 A; 2M02 A; 3N5B B; 2HNI A; 2KYB A; 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4Z02 A; 3CCM A; 1VQ8 T; 4PFP A; 2Y4Y A; 3DB4 A; 3RIR A; 3EFO A; 3MPU B; 3VRY A; 1PSE A; 5IH2 A; 1M3C A; 2JMA A; 1W6X A; 3QII A; 1WHG A; 3IQL A; 3O8V A; 4M75 E; 1AD5 A; 1Q86 C; 2A7Y A; 3JCM h; 2LQW A; 4M4Z A; 3A8G B; 3JCM e; 2GGR A; 4YTL A; 4KH1 B; 2CZ1 B; 3GPL A; 3VS5 A; 1FMV A; 1N6A A; 4PJO A; 2YRD A; 4M7D C; 1GL5 A; 4BI3 A; 1WZO A; 1WIE A; 3P8H A; 3CC7 T; 1UGV A; 3UWN A; 4A54 A; 2D1X A; 2DEU A; 2IPO B; 3VRZ A; 1Q82 R; 3MP1 A; 5FU7 C; 3RBB B; 1M90 C; 1RAC B; 4FT2 A; 3PGG A; 2FRW A; 3F70 A; 1U1T A; 4QVD A; 2F2V A; 3DLL A; 2OTL Q; 1PG5 B; 1XTD A; 1YI2 A; 3OYK A; 3S6W A; 2ZPF B; 4E7I A; 2E12 A; 4AFQ C; 1UEC A; 3CCL A; 5C0M A; 4M78 G; 3OYH A; 3MET A; 4RCB A; 1WHK A; 4M7D B; 1Q81 R; 4M7A F; 2GQI A; 1TUD A; 2DYB A; 4XU1 A; 4E6R A; 5M9O A; 2LCC A; 3A8O B; 2RI3 A; 4DOV A; 5FU7 B; 2CZ7 B; 2A08 A; 1K9M C; 1YN8 A; 5CKH A; 5L23 A; 1K0S A; 2H3J A; 1ABQ A; 1YHQ T; 4A4F A; 1GCQ A; 2CT4 A; 2CGH A; 2DZ9 A; 4KUI A; 2CP5 A; 4RMO A; 2FPD A; 2DNU A; 1B07 A; 3OBW A; 1ABO A; 2J7I A; 1Y96 A; 2DE0 X; 1QWE A; 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