The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
27
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sequence length |
120
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structure length |
120
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Chain Sequence |
b'PPEDLMQYEAMAQDALRGVVKAALKKAAAPGGLPEPHHLYITFKTKAAGVSGPQDLLSKYPDEMTIVLQHQYWDLAPGETFFSVTLKFGGQPKRLSVPYAALTRFYDPSVQFALQFSAPE'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Hypothetical protein
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| molecule tags |
Hydrolase activator
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| source organism |
Caulobacter vibrioides
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| publication title |
Crystal structure of Caulobacter crescentus SspB ortholog
rcsb |
| total genus |
27
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| structure length |
120
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| sequence length |
120
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SspB-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1OX8 A; 1TWB A; 2QAZ A; 1ZSZ C; 1ZSZ B; 1OU8 A; 1OUL A; 2NYS A; 1YFN A; 1OU9 A; 1OX9 A; 2QAS A; 1ZSZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2EJ9 A; 2RJF A; 3OW2 A; 3CCL Q; 1X43 A; 2CP0 A; 4N4G A; 3TSZ A; 2AKK A; 3JCM c; 2OTL A; 1KJW A; 4M77 D; 2LQW A; 1X6B A; 3EGX B; 2RQV A; 1AEY A; 2XID A; 3LWI A; 3DLL A; 2EGA A; 1PC0 A; 2DA9 A; 3OYE A; 2DE0 X; 3VUB A; 1MMD A; 4CI0 C; 3OYF A; 3QWY A; 5L23 A; 4J9H A; 1PSE A; 2GCX A; 4XU1 A; 1FXX A; 1M1G A; 1YIT T; 4J9B A; 4OVA A; 3X24 B; 3WXM B; 3TCJ A; 3EG2 A; 3VRZ A; 1HD3 A; 3MP1 A; 3J7A F; 1QVP A; 1FMW A; 1IRE B; 3EAE A; 3I55 Q; 2R5M A; 2K5I A; 3MCA B; 2KDS A; 3WVE B; 4A4E A; 2DER A; 3M4G A; 2VAS A; 1WXB A; 2ZPH B; 5GAN g; 3KBG A; 4FW1 A; 3HFN A; 2O88 A; 1YN8 A; 3BW1 A; 2SEM A; 3OYG A; 4BDY A; 3TSW A; 3X26 B; 5FRO A; 4A4G A; 2LZ6 B; 2QQB A; 3JCM W; 2M0O A; 1O75 A; 3CBP A; 5CR2 A; 3QG1 A; 1AZG B; 3VU3 C; 4DOV A; 1QW1 A; 2RMO A; 2J7I A; 3HPW A; 1NG2 A; 4N4H A; 2QAS A; 3CPW P; 4R0K A; 1YIT A; 2RO0 A; 3MKD A; 1K8A U; 2HZY A; 1ZUK A; 3QWX X; 4ORZ A; 5GAN 5; 1D0X A; 2RQR A; 1TUG B; 1X6G A; 3C12 A; 2RI2 A; 4M75 C; 4BI3 A; 4DA4 A; 2DZC A; 3VS1 A; 3S3O A; 1BYM A; 3JB9 G; 2HEQ A; 3N5B B; 1I81 A; 1JO8 A; 1NPR A; 3QPH A; 4XTU A; 3GNG A; 1QKW A; 5GAM e; 3ZL7 C; 1VQM T; 3REA B; 2GGR A; 1VYV A; 1VIF A; 3PNW C; 2QYZ A; 4J9I A; 4DOW A; 4XU0 A; 1AWW A; 5DLO A; 4FM4 B; 1MUZ A; 1SSF A; 1OYX A; 1TUC A; 1AWO A; 2KNB B; 4F7U F; 4XTV A; 3M57 A; 4B9X A; 1EFN A; 3HRS A; 2LQN A; 1ZSG A; 2EIF A; 3G7Z A; 5GAM j; 5IT9 E; 2DVJ A; 2EAY A; 4J6W A; 2ABL A; 1OOT A; 2IG0 A; 4FYY B; 3QUI A; 2QGG A; 5LJ3 j; 3JCM Q; 3JB9 F; 2QA4 A; 2L3Q A; 1RI0 A; 2CZ6 B; 2KRS A; 3SB2 A; 1N8R R; 1S72 Q; 3OS0 A; 1VQM A; 2C06 A; 3CC4 T; 1NE8 A; 4LDU A; 5FLX E; 1H92 A; 2RH2 A; 2KEA A; 3HSB A; 5M9O A; 1M90 R; 3C4S A; 2DL4 A; 1Y57 A; 1U06 A; 3EGX A; 1MND A; 3UA7 A; 2M1H A; 5LJ5 d; 1M2V B; 1Y07 A; 4LNP A; 2BE7 D; 4KH0 B; 3E9G A; 3CCQ T; 2EKH A; 1JJ2 A; 4MZM A; 2X4Y A; 3H41 A; 1GXI E; 1K9M C; 2IIM A; 2NWM A; 1WXU A; 3MHX A; 2DRM A; 3FLG A; 3GNF B; 4D6W A; 1MGQ A; 2CP3 A; 4C5E A; 1VQ7 T; 1SEM A; 4LDW A; 2JTE A; 2LX7 A; 5I22 A; 2XDB A; 4XU2 A; 2COY A; 1GFC A; 2DYI A; 2XI9 A; 4M77 A; 3PE0 A; 2WSC E; 4M75 G; 2QA4 T; 2E1H A; 4C8Q D; 3L2U A; 5KYW B; 2MOX A; 3EH1 A; 3GOX A; 2AZS A; 3MEW A; 4GLM A; 1HXD A; 2KY9 A; 2LRQ A; 4NL2 A; 5KCH A; 3U23 A; 1ABQ A; 4JJD A; 1YWP A; 3CCQ Q; 4HCB A; 3OA6 A; 4AT1 B; 1YFN A; 3LGL A; 3HRU A; 3A8O B; 2D8J A; 4HA8 A; 2E3H A; 1I07 A; 5GJV B; 3EHQ A; 1WNL A; 3CCQ A; 5A0D A; 4M75 D; 3JSC A; 1K9A A; 1SRL A; 4M7A B; 2KSS A; 2JUF A; 3JCM f; 2HSP A; 1BU1 A; 5IAY A; 4LD9 K; 1FYN A; 3RES A; 1M27 C; 1VQ7 A; 4ELZ C; 3L42 A; 3WVD B; 1U1T A; 2OI3 A; 2E6N A; 3O5Z A; 2V26 A; 4ZGD B; 2DL5 A; 2V8I A; 2LT1 A; 2R5A A; 3OYL A; 2P0K A; 1M90 C; 3OYY A; 4JRQ A; 3LLR A; 4M78 A; 2BTT A; 1WHM A; 2YXY A; 2P84 A; 2DJZ A; 3OYJ A; 3LW5 E; 1WZO A; 2E41 A; 1AOJ A; 3L2Q A; 1OPK A; 5FWB A; 3CC2 A; 2RK2 A; 4MZP A; 1IHW A; 2HDA A; 4C92 F; 3L2V A; 3M58 A; 1K4U S; 1E6G A; 1M1K C; 1UEB A; 3PVL A; 5FU6 C; 2LNH B; 3VS3 A; 4JZ4 A; 1JQQ A; 4FCY A; 2HQH A; 3CCE A; 4QVD A; 2NUZ A; 2XMF A; 1H3H A; 1RUW A; 5IH2 A; 4M77 F; 2QQS A; 1EX4 A; 3JCM V; 2YUQ A; 4ZGJ B; 4EMG A; 2LCS A; 1JRI A; 2DEU A; 2ZGW A; 5CQY A; 1QCF A; 2E70 A; 4LE9 A; 3CME Q; 2A08 A; 5FW9 A; 4M77 C; 2F2W A; 1Q82 C; 4YTL A; 2RA2 A; 2L3R A; 1VQ6 A; 3JCM h; 4M7D E; 1ZA2 B; 2QK0 A; 2W10 A; 1K76 A; 3CC2 T; 4E7J A; 1YJN A; 4QW2 A; 2X4J A; 2O9V A; 1NEG A; 2RQU A; 3I9Q A; 3C0C A; 3E2U A; 4LDY A; 4M78 C; 2K7A A; 1RAF B; 5GAN f; 2F1L A; 1M90 U; 4M77 E; 4NOY A; 1FMK A; 3LYI A; 3SWN B; 3EFO B; 1KHI A; 4C0G A; 1NLO C; 2RPN A; 4LDX A; 1UG1 A; 1BIB A; 5DM7 R; 5CK9 A; 1GRI A; 2LC4 A; 5CCA A; 3GIB A; 3OMC A; 2KVQ G; 1FMV A; 3L2W A; 2DIQ A; 1VQ9 A; 3VJP A; 2GTJ A; 2ENM A; 4HKE A; 1MV0 B; 5GAM f; 1Z9Z A; 2KMT A; 1WHJ A; 4DQ2 A; 4M7A C; 3O8V A; 5LJ5 j; 2RM4 A; 1X69 A; 1T0J A; 4AMC A; 1TG0 A; 2RD1 A; 1X27 A; 5GAO l; 1PG5 B; 3FJ5 A; 1X75 C; 4ELY C; 2AK5 A; 3SD4 A; 2Y4Y A; 4V2S A; 1VQ4 T; 1MMG A; 3CCL T; 1W2B A; 2RHZ A; 3OYM A; 3HL8 A; 3CCS Q; 4EMK C; 4L5G A; 1IGU A; 2DK3 A; 2IPO B; 2P0P A; 1SSH A; 1UEC A; 4RTX A; 2DL8 A; 4J7F A; 1C0M A; 3OS2 A; 2H3J A; 2KRM A; 3CQT A; 3VUZ A; 1Y96 A; 2X51 A; 4RCB A; 2D9T A; 1QP2 A; 2COZ A; 3P8D A; 4JS4 A; 4QKU A; 5CAI A; 1YJW Q; 2YSQ A; 5A2Q E; 4HXJ A; 2PVD B; 2B86 A; 4BI8 B; 3OS1 A; 3CC7 Q; 2FRY A; 1G3T A; 3CCU T; 1YJW T; 2NUP A; 3QJY A; 4Y28 E; 2OTL Q; 4XTZ A; 1WPY A; 1N6A A; 1PCX A; 3C95 A; 1JB0 E; 2CH4 W; 5IXF A; 4AG1 C; 5CKH A; 1K8A R; 5HKC A; 1D1A A; 2A28 A; 2DVE A; 1H8K A; 2I2L A; 4J9E A; 1PWT A; 3VRY A; 2K3X A; 2FZK B; 1VIE A; 1UFF A; 2LMJ A; 3BE3 A; 3FEO A; 3MP6 A; 2MK5 A; 3PIO A; 5LJ3 e; 4J6X A; 1JBM A; 1WFW A; 1GCP A; 2ROT A; 2DKG A; 1Q81 C; 2YWW A; 4OML A; 1VQN Q; 1KG1 A; 3EGD A; 2OAU A; 2KQW A; 1RLP C; 3GLX A; 2X35 A; 1B7T A; 4JJC A; 5D6X A; 4PJO C; 1PRM C; 1N8R C; 1R0C B; 1YJW A; 1WYX A; 4BUG A; 1UGP B; 2WAC A; 2EW3 A; 1LOJ A; 4E7H A; 1Y0M A; 3EG1 A; 3G71 Q; 1UGS B; 1WJS A; 1BK2 A; 6AT1 B; 1PKT A; 3KUF A; 3FDR A; 2CZ1 B; 4OB3 B; 3QKJ A; 1JJ2 P; 3SFM A; 2HBP A; 4QQ6 A; 2LQK A; 4LDV A; 4N0A C; 2O31 A; 2RHU A; 4EMH A; 1KD1 R; 2BZ8 A; 4II1 A; 3EHR A; 3CXC A; 4M75 F; 2K3B A; 1Q95 G; 5KYX A; 3CC4 A; 2JM9 A; 4C92 A; 3M53 A; 1X6O A; 1VQL Q; 3M0U A; 3JCM e; 2HKN A; 5CKD A; 1SRM A; 4J9F A; 5LJ5 g; 1BIA A; 1YJ9 A; 2FPE A; 3EGD B; 2J05 A; 2CUD A; 1F1B B; 1M3C A; 3PGG A; 3ZEH A; 1N9R A; 5KYX B; 4HCZ A; 5CKE A; 3CCV A; 1UHF A; 1K1Z A; 4CC3 A; 3JAM E; 1QVG S; 3UDC A; 2VUB A; 3MEV A; 2I0N A; 2F5T X; 2RJC A; 3A98 A; 2EQJ A; 4R55 A; 1UHC A; 3VYG A; 4R56 A; 4M7A G; 3I56 T; 3S6W A; 4M7A E; 1W2B S; 2RHY A; 3MEU A; 4LUD A; 2V8K A; 2CP5 A; 4E6R A; 4C8Q G; 3MJX A; 1I0C A; 2KT8 A; 1LVK A; 1E7O A; 2ATC B; 2E5Q A; 1BKB A; 4KUL A; 1B34 B; 2MMP A; 3NMZ C; 4AFQ C; 2L8D A; 4M77 G; 2X3W D; 2DYB A; 5L8R E; 1C1A A; 1XNI A; 4RTT A; 4MML A; 2WSF E; 3THK A; 4C92 D; 3CXC S; 4KGX B; 3CCV T; 3OBW A; 4D8K A; 1VUB A; 2CP6 A; 4XTY A; 1YIT Q; 4FSS A; 2RQW A; 4A54 A; 2EPD A; 1Q81 U; 3HP9 A; 1D1C A; 1UUE A; 4PJL A; 1YI2 A; 2JNG A; 4NS5 A; 3VS2 A; 3RER A; 4IUT A; 2EQK A; 4Z88 A; 3I56 Q; 4M7D A; 2QQ9 A; 2KGT A; 2MYS A; 3G4S A; 5D6W A; 1R77 A; 2LJ1 A; 3PVQ A; 3SWN C; 4MDW A; 2RNA A; 4OGC A; 2F5K A; 5J3B A; 2YRC A; 2K2M A; 1QWF A; 3EG0 A; 1D0Z A; 2LP5 A; 2LCC A; 2DJQ A; 2Y4X A; 1WA7 A; 5KYY A; 1C6V X; 1KQ2 A; 2RHI A; 1OEB A; 1VQ6 Q; 2ESW A; 4KT0 E; 3QO3 A; 2HNI A; 2DAQ A; 1IHV A; 4NL3 A; 3FIF A; 4ZTF A; 4AFS C; 1NYF A; 3GP8 A; 2DTO A; 2E3I A; 4F04 B; 2EQM A; 5GAN 4; 1ZBX A; 1QCO A; 2HAX A; 1E6H A; 4JPB W; 2ZPI B; 4FU6 A; 5ECA A; 2QEX T; 4OB0 B; 3FRN A; 2RI3 A; 3G4S T; 3HKS A; 1QVF S; 5KH6 A; 3EG9 B; 2EYZ A; 1G3S A; 2D0Q B; 3CME A; 2ZAE A; 4TVR A; 1BI2 A; 1U3O A; 3VS5 A; 1TS9 A; 2J6K A; 1WHL A; 4RCC A; 1KIK A; 1GCQ C; 3OW2 P; 2KYB A; 2GF7 A; 2GQI A; 1VQ6 T; 1SHG A; 2LX9 A; 5A0G A; 4RTY A; 4XQ3 A; 1YJN T; 3CCR T; 2CP2 A; 2DLP A; 2C0O A; 1LJO A; 1AHJ B; 3CXC P; 4M75 B; 4LXC A; 3TVT A; 1KSW A; 1UTI A; 2K9G A; 3AHU A; 2VXE A; 4M7D G; 4AFZ C; 2FG0 A; 1NM7 A; 3JB9 I; 2QDL A; 2RF0 A; 1I5L A; 3HHT B; 1EIF A; 2QEX A; 3QJ6 A; 2HL5 C; 4M78 D; 2ZPF B; 4M4Z A; 5I2S A; 4C5G A; 3FJP A; 3EFR A; 1RAI B; 2E6Z A; 5GAN 7; 1K73 C; 5J39 A; 1NZ9 A; 3CME T; 4FIB A; 1VQ9 T; 2ECZ A; 2L3S A; 2PUK B; 1NJI R; 4OP0 A; 1R8O B; 2LQ8 A; 4F17 A; 2YLC A; 4E7K A; 2X4X A; 2EYW A; 2JM8 A; 2DFU A; 1GFD A; 4FYW B; 4RTW A; 3QHS A; 2DL7 A; 2EWN A; 4F14 A; 3JV3 A; 2O4X A; 3ASK A; 4C0D C; 2O9S A; 1VQK Q; 1IB8 A; 1TWB A; 2LCL A; 1Y96 B; 2XIC A; 2L5Q A; 1KQS P; 2DRK A; 1T0H A; 3QZ9 B; 3LH0 A; 4E7L A; 3BFM A; 1Q81 R; 3G6E A; 1VQ4 A; 4WCI A; 3CCL A; 3AT1 B; 1W2B P; 2H3E B; 2AT1 B; 2H8H A; 1VQK A; 4OB1 B; 3CPW A; 1KD1 U; 1YCY A; 1K0S A; 2AKL A; 1TUD A; 3ZFJ A; 1XQH A; 2VVK A; 4X9C A; 4M7D F; 1M1K R; 2QG9 B; 4PJM A; 4QQD A; 1WI7 A; 1KQS A; 4JLI A; 3CBO A; 4LD6 A; 1PD0 A; 1KQS S; 4X34 A; 2MWP A; 4AFU C; 4PFO A; 4BI4 A; 3RDV A; 2NUT B; 2E64 A; 2DO3 A; 2CGH A; 1KC8 U; 1WQW A; 2GQV A; 3OQ5 A; 1YWO A; 3CCU A; 1NJI U; 3UPU A; 1X01 A; 2NUP B; 1IZ6 A; 3G6E T; 5I11 A; 2EQU A; 1UJ0 A; 3A8M B; 5LL6 S; 1VQK T; 2EBP A; 3SHW A; 1SPK A; 5KYN A; 3FC3 A; 2R57 A; 3G6E Q; 1KC8 R; 1PM3 A; 3OSV A; 1QMC A; 4ZN1 A; 1M9S A; 2YRD A; 4ZN3 A; 4KGZ B; 1NPP A; 2KXC A; 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1V29 B; 1ZA1 B; 4PNO A; 2KRO A; 4C92 B; 1VQP T; 3M0Q A; 1VQ8 Q; 4B9W A; 2DEQ A; 1LCK A; 4O6J A; 2KR3 A; 5FWC A; 1VQN T; 1KC8 C; 1TSF A; 3OYI A; 1OUL A; 5LJ3 h; 1PRL C; 2MIO A; 4IUU A; 2QQR A; 2K5L A; 4BE0 A; 4OB2 B; 2MPX C; 5HK0 A; 2CH4 A; 2DZ9 A; 3OSS C; 5I2M A; 2RN8 A; 4J8O A; 2EKO A; 3CCS A; 3A8G B; 5LJ3 f; 1HK9 A; 1YI2 T; 2L0A A; 4F7U E; 1VYU A; 1VQ5 T; 3M56 A; 2FZG B; 4Y91 A; 4Z89 A; 3EFS A; 2O01 E; 1M8V A; 4HCC A; 5AYF A; 3CD6 T; 4M7A F; 2XG8 D; 5GAN h; 5HY6 A; 1D3B B; 1XJW B; 3X28 B; 2DTH A; 1D1B A; 3HRT A; 4HT9 A; 1VQN A; 1YI2 Q; 1BCM A; 1K8A C; 4M75 A; 2EJF A; 4MZT A; 1ZSZ C; 3RNJ A; 2ZPE B; 1FWZ A; 2AHJ B; 4QQG A; 5D7U A; 2V8J A; 2EGC A; 4AG2 C; 3BDU A; 1UDL A; 1U8R A; 2DPP B; 1VQO Q; 3QZ5 B; 4F16 A; 1ARK A; 5IN1 A; 3V7R A; 1RL2 A; 3CCS T; 3CPF A; 3JB9 H; 2M16 A; 1SKU B; 1QQJ A; 2KT1 A; 3M0S A; 4QT7 A; 2ED1 A; 4FYX B; 1FX7 A; 1VQP Q; 2HSE B; 1RAG B; 1PNJ A; 3URG A; 3OYN A; 4Q5W A; 1I8F A; 4PL6 A; 2D8H A; 3CD6 A; 3SDZ A; 1DJ7 B; 4E47 A; 5HCK A; 4RG2 A; 4XU3 A; 2JT4 A; 4BY6 C; 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