The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
77
|
structure length |
77
|
Chain Sequence |
b'SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDELYELLQHILKQ'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
E80-TELSAM domain
|
| source organism |
Escherichia coli
|
| molecule tags |
Hydrolase regulator
|
| total genus |
19
|
| structure length |
77
|
| sequence length |
77
|
| chains with identical sequence |
C
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2FE9 A; 2E8M A; 5L1M A; 1PK1 A; 1SV0 C; 2D8C A; 2QB0 B; 3BQ7 A; 5J8Y C; 2KSO A; 2JV3 A; 1WWU A; 5JU5 A; 1B0X A; 3KKA A; 3IDW A; 5F3X B; 2GLE A; 1WWV A; 2F8K A; 1RG6 A; 2Y9T A; 2L5Y A; 1Z1V A; 4IS7 A; 4RQM A; 2B6G A; 4NL9 A; 3TAD A; 2EAO A; 1SXE A; 2QAR A; 2K60 A; 2QKQ A; 2YTU A; 1PK1 B; 2KSO B; 4PZO A; 1LKY A; 2E8P A; 2KMD A; 2D3D A; 3SEI A; 2ES6 A; 1SV0 A; 5J8Y A; 2ESE A; 2F44 A; 2EAM A; 3SEN A; 1DXS A; 1F0M A; 1JI7 A; 2F3N A; 2DKZ A; 3BS5 A; 2LMR A; 2QAR B; 1B4F A; 2DL0 A; 1V38 A; 1SGG A; 1OW5 A; 2KG5 A; 3BS7 A; 1LKY B; 2QB0 A; 4NJ8 A; 1COK A; 4RQN A; 1UQV A; 5KNI A; 2E8O A; 2EAP A; 2DKX A; 2QB1 A; 3BS5 B; 5JRT A; 3K1R B; 3KKA C; 2E8N A; 1UCV A; 5JTI A; 2LPE A; 4MHV A; 2Y9U A; 2EAN A; 2KIV A; 1PK3 A; 1SXD A; 4NL9 C; 4PZN A; 1X66 A; 3TAD C; 1V85 A; 1SV4 A; 3H8M A; 2KE7 A; 1X9X A; 1X40 A; 3TAC B; 2K4P A; 1KW4 A; 3HIL A; 1OXJ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2XCP A; 2BDP A; 1TAQ A; 4YN4 A; 2Y1I A; 2OYY A; 2ZIW B; 2CN1 A; 8ICK A; 1L7M A; 5JU5 A; 1U48 A; 3FYH A; 2OEH A; 5AI8 A; 2W8L A; 8ICJ A; 2Y9T A; 3AQF A; 2JXJ A; 1IV8 A; 5CEH A; 5IIO A; 1S0O A; 4NY8 A; 4QZ9 A; 4DL5 A; 3MFH A; 1ZD4 A; 4R66 A; 2FMQ A; 5J0R A; 4PGY A; 4C8O A; 2KSO B; 1LKY A; 3ZDA A; 3C5F A; 4UB2 A; 5ALP A; 2ESE A; 5AIC A; 1F0M A; 9ICE A; 5IIL A; 2H3Q A; 2B21 A; 3RJJ A; 2VA8 A; 3SAG A; 5K4L A; 4R65 A; 1XNS A; 4KMU A; 2ALZ A; 5G5H A; 2ASJ A; 1TKD A; 5EWG A; 1JN3 A; 1ZQD A; 3GII A; 3AM9 A; 4JUZ A; 2WF9 A; 9ICF A; 2DKX A; 1KKX A; 5KFG A; 3BS5 B; 4PHE A; 2DWQ A; 4UBC A; 4HYK A; 2KJ9 A; 2JEG A; 7ICM A; 7ICO A; 1TK0 A; 2ZIX B; 1DK2 A; 3KZI U; 5ALF A; 3PML A; 5ALO A; 2HHS A; 4GC6 A; 1QQ7 A; 2OH2 A; 3TAD C; 3LVW A; 5D46 A; 4ED1 A; 1N62 A; 2IOF A; 2W55 A; 1X40 A; 3DDH A; 3KHL A; 3DEE A; 3N97 B; 4P0Q B; 2A1A A; 2JEI A; 1EXN A; 2MU2 A; 1T3N A; 3ZD9 A; 2W9B A; 3V6K A; 2HBJ A; 1SV0 C; 1ZRN A; 1JXE A; 2BR0 A; 4OJP A; 1B0X A; 4RU9 A; 3BQT A; 4PL2 A; 4QZG A; 1LVH A; 1ZQP A; 3BZK A; 3E58 A; 4NL9 A; 1QLN A; 3K1Z A; 1BPZ A; 2IHN A; 5KFW A; 4BX9 C; 2ZIU A; 2UVR A; 9ICW A; 4O3Q A; 5CJ7 A; 1DK3 A; 3TQ1 A; 2ZIV B; 4LZG A; 2CRX A; 8ICP A; 1NZB A; 5ALR A; 4Y2U A; 3PR5 B; 1NNL A; 4DSF A; 2LM4 A; 1DXS A; 4Y2T A; 5H2F U; 3WK4 A; 4RNM A; 2F3N A; 2FMS A; 3NAS A; 4Y2R A; 5J0X A; 1ZQA A; 2JEJ A; 3BDP A; 4KLS A; 1NI3 A; 8ICT A; 4XUS A; 2H3F A; 4GIB A; 3JPQ A; 3GV8 B; 2F77 X; 2QLT A; 5ALH A; 1ED1 A; 5AI6 A; 5AKI A; 1PVP A; 5AK5 A; 3NRZ A; 3KHG A; 1ZQT A; 2W11 A; 1Z3E B; 3KBB A; 5DQH A; 4ECY A; 2F2A B; 5EE3 A; 2ZXH A; 4YR0 A; 8ICI A; 1RQN A; 2F1I A; 3AEV A; 2XGQ A; 4FE3 A; 2ZUC A; 3SAF A; 2LYH A; 3BJY A; 9ICU A; 3ICX A; 3MR3 A; 2Y9U A; 4F2R A; 2M0N A; 3PVX A; 4MFA A; 2G06 A; 2XVT A; 4M6W B; 4DSE A; 1A0P A; 3OJU A; 2C2R A; 3PZP A; 4J9O A; 5J2B A; 4ECV A; 5KT5 A; 4M0A A; 4KX5 A; 1ZQH A; 1SWV A; 5KG6 A; 4C7Z A; 3F53 A; 1O03 A; 2NRV A; 4TUQ A; 8ICL A; 1Z1V A; 1XS9 D; 9ICT A; 4XA5 A; 5DG8 A; 4DOA A; 4BJQ A; 3I1Y A; 1SXE A; 3E0F A; 4F91 B; 1JX4 A; 2VIX A; 1TVA A; 2HMX A; 4ED7 A; 2DUY A; 3MFI A; 2PMZ C; 4ECR A; 1JI7 A; 1VLB A; 4RQ0 A; 4I2F A; 5KFZ A; 4F2S A; 1NK5 A; 2M9N A; 3H0L B; 1D8L A; 3V6H A; 1O08 A; 1ZQY A; 1Z19 A; 3HRD D; 4YQW A; 2F76 X; 2HHX A; 3TFS A; 2V4Q A; 4YR2 A; 3MAB A; 4DL2 A; 5ALL A; 2BCS A; 4NLB A; 2P6U A; 5KG2 A; 4DFP A; 3NVZ A; 2VA2 A; 1KQQ A; 4KLJ A; 3C2K A; 2K8C B; 3T79 A; 2PFN A; 4KLT A; 2BQ3 A; 3QYP A; 1XO1 A; 3PST A; 4EX6 A; 3IG8 A; 7ICH A; 4FS2 A; 3M9M B; 4C0Z A; 4UB3 A; 2HBK A; 4I2E A; 2O6K A; 3I76 A; 1IM4 A; 4LVS A; 1S9F A; 1V85 A; 5DBC A; 5L1K A; 3NRW A; 5DG7 A; 2A19 A; 1HUZ A; 1SZH A; 4I2D A; 4C8N A; 5CHG A; 5AK6 A; 3M8R A; 2BKE A; 2D8C A; 3THV A; 5J8Y C; 4O3N A; 3M7D A; 1XO0 A; 3JPP A; 4J9K A; 3KKA A; 1N5W A; 2KVC A; 1ZQS A; 2F8K A; 5C0Y A; 3EW9 A; 3HJE A; 1CRX A; 1V9P A; 3WK5 A; 1NK6 A; 1NK4 A; 4ICA A; 2QAR A; 4DFD A; 2KKV A; 1KRP A; 4WJ3 B; 3RBD A; 1ZD2 P; 1MSW D; 3IG5 A; 1FFV A; 4KLF A; 4G3I A; 1BPY A; 8ICN A; 3TAQ A; 4IL6 U; 1GO3 F; 2KNJ A; 2JGA A; 4UB4 A; 2B0C A; 2ISO A; 2HVI A; 2G07 A; 2AH5 A; 1TAM A; 4C8K A; 4IRK A; 3BQ1 A; 1ZQW A; 3RJE A; 5GTH U; 2ZUB A; 3MR2 A; 2R8K A; 3Q8M A; 1Q3V A; 5DLF A; 3RJK A; 3TAN A; 1LKY B; 2QB0 A; 3RJH A; 1NJZ A; 1N5X A; 4KLL A; 4UAZ A; 5KFI A; 5KFQ A; 4NM2 A; 3NS1 A; 2NRX A; 4QIW C; 5JRT A; 3UQ0 A; 1SB3 C; 5KT3 A; 4YCX A; 9ICX A; 4QZI A; 2NV3 A; 1U49 A; 2AQ4 A; 2JEF A; 4OJ5 A; 4KLE A; 1UT5 A; 3PSP A; 4J9Q A; 5KT2 A; 4NLC A; 4F50 A; 3FAH A; 4RQ4 A; 1MA7 A; 2IHM A; 2ZUD A; 7ICF A; 3SV4 A; 3N7S C; 3CNH A; 5TZV A; 5L9X A; 4M9H A; 3ZDC A; 3NVV A; 2BHN A; 1ZJN A; 2XGP A; 1ZQE A; 2RDJ A; 3Q8L A; 1A6S A; 4I29 A; 1NKB A; 1PK1 A; 3H0R B; 4UAY A; 3E2E A; 4Y2X A; 1NKC A; 3F2C A; 3QE9 Y; 3SYZ A; 1WWV A; 2W9C A; 3DV9 A; 5KFR A; 5DQI A; 4I2J A; 5D4B A; 3GZF A; 2ZTD A; 8ICY A; 2VKQ A; 5KG3 A; 2ZXI A; 2YTU A; 3V7L A; 5HP4 A; 1SL2 A; 3WK8 A; 2XI9 A; 7ICT A; 5J2F A; 5ALE A; 2E8P A; 1NJX A; 1PVQ A; 9ICQ A; 5CB1 A; 3U26 A; 9ICK A; 2EAM A; 4Z6D A; 4C8M A; 3JPT A; 5CA7 A; 2ZIU B; 4PH5 A; 2FLP A; 3T5K A; 3ISD A; 2UVU A; 4Q8E A; 1BVS A; 3T5L A; 1DOQ A; 2BPC A; 1XC9 A; 3V6J A; 4C4T A; 4TQS A; 2FMP A; 4J9S A; 5CRX A; 5J2K A; 3RB3 A; 4NLK A; 2WF7 A; 4IRC A; 1XSN A; 5ALX A; 5KFD A; 5IIM A; 7ICK A; 3QUT A; 4DOB A; 4OO1 J; 2LM1 A; 3KD3 A; 2FDR A; 1F5S A; 3N7P D; 2VJ5 A; 3EZ5 A; 4QWC A; 7ICU A; 3H40 A; 3TAC B; 5HR7 A; 4NXZ A; 7ICV A; 3LDA A; 4Y2Y A; 3SD7 A; 1NK7 A; 1QQ5 A; 4DL4 A; 4CF5 A; 4ED2 A; 3SR6 A; 4CF4 A; 5AIB A; 3RJG A; 5BOL A; 1SKW A; 4BXO A; 1ZQN A; 1D9F A; 4BUG A; 2LKY A; 4YMO A; 1KFS A; 2B6G A; 4RQ1 A; 1RXW A; 5DG9 A; 2HHU A; 1CUK A; 2Z7J A; 3RB4 A; 2J6U A; 2OWO A; 5ALM A; 3GU3 A; 5J2J A; 4ELU A; 5L1L A; 1T7P A; 2YN4 A; 2NRW A; 2EH9 A; 1J97 A; 4B6J A; 3SEN A; 1KTQ A; 4QZE A; 3M9N B; 4I2H A; 3T3F A; 3V7K A; 3HP6 A; 3RH5 A; 4JWM A; 1B4F A; 2D6F C; 2DL0 A; 3TFR A; 9ICJ A; 2H3V A; 5EOZ A; 2E1F A; 3QEA Z; 2W9A A; 4O3O A; 4Q45 A; 2KG5 A; 1QCK A; 3UXN A; 2I5H A; 2Y0S C; 4YP3 A; 4CE6 A; 4QZF A; 1X2I A; 4YR3 A; 2UVV A; 3BZC A; 3RJF A; 3UM9 A; 5ALQ A; 2FPM A; 5EE0 A; 4DSI A; 1UA1 A; 4ECS A; 2IBK A; 1KBU A; 3RAQ A; 4EBD A; 3H8S A; 3AUO A; 1CEZ A; 3PY8 A; 3ZDB A; 1ZXI A; 5KAI U; 4GXI A; 2XO7 A; 3A0H U; 4K4H A; 3T5H A; 5KFX A; 1XSL A; 2MUT A; 3GFK B; 8ICC A; 2KIW A; 4CGZ A; 2W7P A; 3H8M A; 1JAL A; 3OPX A; 4YFK A; 1RQL A; 3D2S A; 2P6R A; 5ALZ A; 2V4R A; 4FBT A; 2FE9 A; 2E8M A; 4RQ7 A; 2C28 A; 3JPO A; 2JV3 A; 5KTQ A; 1IG6 A; 1X9S A; 4QZD A; 5KAF U; 3H4D A; 4ED8 A; 5AKK A; 2HVH A; 4KLH A; 8ICM A; 1XSP A; 4IS7 A; 1TK8 A; 1L8O A; 7ICI A; 2PKE A; 5AKH A; 5EWF A; 2QKQ A; 3HWT A; 3EYZ A; 4RQ2 A; 2GOL A; 1AQ6 A; 4Z6E A; 4F3O A; 4PZO A; 2ASL A; 5KFJ A; 2F8L A; 4YD2 A; 2D3D A; 3PW2 A; 1HJP A; 1T94 A; 5DGA A; 4B9U A; 4KX3 A; 2LMR A; 4J9P A; 2QAR B; 2EZX A; 3GIL A; 2LYA A; 5F9N A; 1V38 A; 1SGG A; 4YXJ A; 4DS4 A; 2JR5 A; 5AI4 A; 3BS7 A; 4ECZ A; 1ZQL A; 4DLG A; 4UB5 A; 4NWI A; 5J0U A; 2J6T A; 3QUC A; 5KFH A; 3HKZ C; 2Y1J A; 2DFL A; 4MF8 A; 4IQT A; 2XY6 A; 3PSI A; 1X9M A; 3GV7 B; 4UAR A; 2PI4 A; 4BWM A; 3M8S A; 3PW5 A; 1IIP A; 5HHH A; 4QJF B; 3IHQ B; 5J0O A; 4O0I A; 2AGO A; 4KLD A; 3H8J A; 1BPB A; 1SWW A; 8ICW A; 3QXG A; 4QW8 A; 4Z6C A; 4JB3 A; 1PUZ A; 5DBB A; 2MRL A; 2KKP A; 5B66 U; 7ICJ A; 2EQY A; 2HI0 A; 5AM3 A; 1JXL A; 5ALY A; 5ALS A; 2VA3 A; 2JZB A; 4BGD A; 1XU4 A; 1JUD A; 3C1Y A; 3QU4 A; 4YG2 A; 5J2D A; 5KFM A; 3HT3 A; 4F5O A; 4F4Z A; 4EEN A; 4C4R A; 2G08 A; 4I2I A; 2G0A A; 5AKL A; 5EE1 A; 3M6Z A; 1ZET A; 2RDI A; 1ZQC A; 1RDF A; 3A0B U; 3IM1 A; 4CCH A; 4R64 A; 5KL8 B; 2I9G A; 2V9W A; 2W54 A; 3ORY A; 3GDX A; 3TAR A; 1PK1 B; 3WKE A; 2WF6 A; 3AN1 A; 1M6Y A; 5ALD A; 2PMZ F; 2FLL A; 4CF3 A; 4B9T A; 3KHH A; 2FJ6 A; 1VJ5 A; 5E79 U; 2LBO A; 9ICO A; 5L1J A; 1FEZ A; 5KFE A; 4DCC A; 4EX7 A; 3RTV A; 2ZJ5 A; 4QZ8 A; 3EPG A; 1MQ2 A; 3Q8P B; 4UAW A; 4KN7 A; 2KJ8 A; 3PW4 A; 4RQ5 A; 2FLN A; 3V7J A; 4O9M A; 2XC9 A; 3RB6 A; 1J2N A; 3ZDD A; 3MGH A; 2HHW A; 1B43 A; 5IIN A; 2WAQ C; 9ICS A; 4F93 B; 4P0P A; 3C21 A; 4QWA A; 5ALT A; 7ICE A; 4EYH B; 1T4G A; 2Q0Z X; 1FO4 A; 5A0L A; 1C20 A; 3UMG A; 3RAX A; 5AM2 A; 2R18 A; 2KZ3 A; 2LPE A; 4C8L A; 3QNM A; 5ALI A; 1S76 D; 4AYB C; 5KFL A; 2H3Z A; 4ECT A; 2BPF A; 1NJW A; 3OHA A; 1ECW A; 9ICC A; 1SV4 A; 5DDY A; 1V97 A; 1S0N A; 8ICG A; 3HPO A; 1TE2 A; 1N56 A; 4UB8 U; 3BQ7 A; 1WCL A; 4RNN A; 3QZ8 A; 4TUR A; 3KTQ A; 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4Q43 A; 2YX8 A; 4RNO A; 3MR6 A; 1ZQM A; 3RH6 A; 3EWA A; 3TAD A; 1Q3U A; 3FC4 A; 3PW0 A; 4DO9 A; 4Y2S A; 1DRG A; 1HIW A; 3RFA A; 1BPE A; 3OGU A; 4PHP A; 1L3V A; 1SV0 A; 3B9J A; 4M47 A; 1ZD5 A; 1X42 A; 4C80 A; 4M6W A; 9ICG A; 5J2C A; 1ZQI A; 5DLG A; 1SKS A; 2R8H A; 9ICA A; 3ISB A; 2DPJ A; 4IR9 A; 1TAU A; 4P4M A; 4UAS A; 2W9B B; 1YZ7 A; 4M9L A; 3OSP A; 1S10 A; 1COK A; 5ALJ A; 1TK5 A; 4US8 A; 3FDS A; 4OD0 A; 1RPL A; 4IQV A; 2XCA A; 2HHV A; 2OHF A; 4RQ6 A; 4QWE A; 2ZTC A; 5J29 A; 1LV5 A; 8ICB A; 3MGI A; 2A1J A; 4RPY A; 4E0D A; 2PFO A; 4DQP A; 4F4W A; 3WKB A; 3AU2 A; 3GIJ A; 1DGS A; 2KK0 A; 2IA6 A; 4FZN A; 2VAN A; 5J2H A; 4FS1 A; 9ICV A; 2DGZ A; 2DPI A; 2I6X A; 4US9 A; 2WHE A; 1L7N A; 1PK3 A; 2K4E A; 3F2D A; 3PMN A; 3NVW A; 4Y2P A; 4ELV A; 1NK9 A; 4PJ0 U; 4UAV A; 4B9L A; 1S97 A; 5AM1 A; 4F5P A; 2YMP A; 4IQW A; 4F4X A; 5HNK A; 3T5J A; 3VCB A; 5L1M A; 3RF9 A; 4EEK A; 4RPX A; 1C7Y A; 3QEB Z; 5F3X B; 3J81 j; 3N28 A; 3QUQ A; 4YVZ A; 4QZC A; 1X6I A; 3UMC A; 1L5U A; 5J2I A; 3H8W A; 5J0Q A; 3KHR A; 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