2QC7A

Crystal structure of the protein-disulfide isomerase related chaperone erp29
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
224
structure length
224
Chain Sequence
VHTKGALPLDTVTFYKVIPKSKFVLVKFDTQYPYGEKQDEFKRLAENSASSDDLLVAEVGISDYGDKLNMELSEKYKLDKESYPVFYLFRDGDFENPVPYTGAVKVGAIQRWLKGQGVYLGMPGCLPVYDALAGEFIRASGVEARQALLKQGQDNLSSVKETQKKWAEQYLKIMGKILDQGEDFPASEMTRIARLIEKNKMSDGKKEELQKSLNILTAFQKKGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure and functional analysis of the protein disulfide isomerase-related protein ERp29.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endoplasmic reticulum protein ERp29
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 58
structure length 224
sequence length 224
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07749 ERp29 Endoplasmic reticulum protein ERp29, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1150.12 Mainly Alpha Up-down Bundle Endoplasmic reticulum protein erp29 Endoplasmic reticulum resident protein 29, C-terminal domain 2qc7A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2qc7A01
2OADA 5ECPB 1SK1A 4ZXGA 3F63A 4O92A 5AIVA 1V9WA 2JSYA 1GWCA 1GTIA 1BJXA 1GTUA 1AIUA 3U6VA 5A4VA 2C3NA 3ZFBA 1CQGA 2REMA 4PX1A 3KZQA 1HNAA 3PINA 5DJMA 3VWUA 1ST9A 2RM5A 13GSA 5HQPA 3HVXA 2L6DA 2FUG2 4NAXA 2WRTA 3IA1A 2H1AA 14GSA 3FK8A 2LRCA 1PL1A 1MDIA 3U5RE 2X99A 2GSTA 3KH7A 1FVKA 4FH8A 3DGQA 4O32A 4HU7A 1MD4A 1VF4A 1B4PA 2J9HA 2G0FA 4MMMA 1QMVA 4WBJA 3C71A 4K0GA 3ED3A 3LSZA 4IQAA 4ML1A 1ZYQB 2V32A 2R2JA 1YJ6A 1BQ7A 1K3YA 2EIRA 2C3TA 4MJBA 2GDRA 4L8EA 1DE1A 1NM3A 1YKCA 2AB6A 3R2QA 3HVVA 4N0ZA 4JU5A 5IQYA 5KN3A 3ISOA 2F9SA 3DXBA 1XWCA 1M2DA 5CRGA 3KMOA 1B9XC 2J23A 3APSA 3GIXA 2MYGA 2H70A 4IBPA 4I97A 2E0QA 2FGXA 2PMTA 4XS1A 1E2YA 4HEA2 1GTBA 1ZCPA 2JSZA 4HOJA 1QK8A 2CT6A 3UJ1A 2EIOA 4RI7A 3WD6A 2TRCP 4I8BA 3TCOA 2K18A 4Q5RA 1TK8B 5ELAA 2A2RA 2DIYA 3E9JB 5COHA 4TVEA 2OKAA 4FO5A 3PR8A 1BAYA 4O7HA 2GSQA 2C0DA 1KTEA 2HNLA 1SYXA 4MF7A 2GTUA 1B4QA 3IAS2 5CO3A 3GFKA 2N5BA 3F3RA 3BJ5A 1AXDA 2MZCA 2DLXA 4IP6A 4HI7A 2YOIA 2VCZA 3TJJA 2IFQB 3UVHA 3M0FA 3L9UA 4Q5FA 3CMIA 3W8SA 3N5OA 2MBTA 1J08A 1TRVA 3LYKA 1O7UA 1GULA 2HYXA 2HSHA 3IR4A 2YCDA 3DMLA 2IMDA 17GSA 5B8AA 3GHAA 2VCTA 4IHUA 5G30A 4DEJA 1FB0A 4K1FA 3FZ5A 1T4YA 1HD2A 5D9TA 1LBKA 3IBHA 5F05A 1TDIA 3GUSA 2DBCA 2VCQA 3RAZA 3GRXA 5JCUA 2P0GA 1YY7A 3TKSC 3TJBA 1NHYA 4PQ1A 4TW5A 1KNGA 5HR1A 3A3TA 2GT5A 4K0NA 2WULA 3DYRA 4JR6A 1NSWA 3HZ4A 3ERGA 2M72A 2HZEB 3KTBA 2GZYA 1UVZA 2H75A 2R6KA 2HE3A 4TR4A 2YV7A 1S3CA 2VL9A 4GCIA 1XW6A 4N11A 1PL2A 3F6DA 4KGIA 3WYWA 1N8JA 1Z6NA 4V1Ap 3CRUA 1XWBA 3RDWA 3UMAA 4V2NA 3NZNA 2ZUPA 3I69A 2B3SA 1K0CA 3EE2A 2LS5A 2QSIA 4E8EA 4NPBA 2OACA 7GSSA 3KM6A 5IMCA 3D21A 2KP1A 2E2MA 5E4WA 1W89A 1ZZYA 2RUFA 1XIYA 4HJ2A 1WJKA 4KSOA 2C1YA 2AHEA 5FWGA 3H79A 3TKQA 1SD8A 4K6XA 1WWJA 1OC3A 2K8VA 3BD2A 1ON4A 1Q98A 4MJCA 1NHOA 6GSTA 4GSNA 3KP8A 4MPGA 4YQVA 3DVXA 5EL8A 3EMXA 4KE3A 1VF1A 1YQ1A 4NHZA 5DAKA 3EVIA 4XRAA 1I5GA 3Q18A 4PURA 2I1UA 2LQQA 1XBSA 5F0GA 1G6YA 2HRFA 1F3BA 3GL5A 5L71A 4IGJA 4HJMA 5IPHA 3VPQA 2ON7A 2CVBA 3KCMA 3W8JA 1HQOA 5IMZA 4ILFA 1V2AA 4IN0A 1HNBA 4KCEA 4QQ7A 4EUYA 2X8GA 4ZBDA 3HJMA 3UBLA 1T7PB 1X9MB 3GNJA 5DVBA 5KEJA 1Q4JA 1PMTA 3VI5A 1WRYA 2F51A 3HZ8A 1K0DA 5B6NA 4MLYA 2XPEA 3PH9A 2B5YA 5DALB 5G1KA 4TOPA 2AUVA 2CQ9A 4KDYA 1H75A 3FRCA 3HVSA 5IPGA 4DSRA 2B1LA 4K2DA 3C7MA 3TDGA 3FZ4A 4NV5A 4ECBA 4GQFA 1Z9HA 5DQSA 4IW9A 1RQMA 5HFKA 3CSJA 5JWOB 2NDOA 1XWKA 2YZHA 2HZFA 5CRDA 4K8MA 2GZZA 1WP0A 4KB3A 4KCAA 2MMOA 3BOAA 5F06A 1G7OA 1Z7RA 4YAPA 1GSDA 2H71A 4OWYA 2X64A 1C72A 5LD0A 2N5FA 3Q6OA 4TR0A 3QR6A 2C8UA 3E0UA 2JZSA 2B5XA 1HYUA 4GRFA 3KD0A 4ID0A 4D73B 5G31A 2H6ZA 1X5DA 2M80A 3OR5A 5GZZB 4BVXA 2CA8A 1SL0B 3HJPA 1OC9A 1PKZA 3FHKA 3PGTA 4PUAA 3O6TA 1TOFA 3H8QA 3CTFA 2YP6A 4F0BA 2KP2A 1GRXA 4EC0A 4K7IA 1A2LA 3GTUB 3CRTA 4WR4A 3JCML 4OMVA 2HI7A 2OBIA 1B9YC 4GSSA 3KGKA 2K6VA 4MH2A 4OCEA 5D96A 1MDJA 2AJQB 4OFNA 1A8LA 1ACVA 5HR2A 3ME7A 4ZILA 4I5QA 1TU7A 2H73A 5IMDA 2PN8A 2WDUA 3M9KA 2OBKA 1OE7A 1EV4A 4JRRA 4PGTA 2VCWA 2B7KA 3L78A 1YZXA 2O89A 5JCGA 3VK9A 3GSTA 2OJLA 2WZ9A 3C1SA 3QOUA 4KNDA 1G7DA 3G7YA 2LEGA 3RHBA 5KN2A 1AQXA 3ZRDA 3LORA 3IK9A 6GSVA 1ERUA 3WT2A 3L9SA 3F4TA 2FD3A 2O85A 2P5RA 3H93A 3GKXA 4MJEA 1EP7A 1TU8A 1XCCA 4F0CA 2H72A 2QC7A 2PWJA 1TRSA 3TUEA 1XZOA 5LCZA 1H4OA 4EL1A 1XOBA 3E3EA 2NVLA 3BBYA 1USBA 1X0RA 4GSTA 1K3LA 6GSYA 4OO5A 4V1Ag 1A2MA 2MMZA 1SL2B 4ECIA 4XTSA 1ERTA 2H6YA 1YF0A 2L4QA 5ID2A 1E6BA 3C8EA 3GL3A 4YAVA 4F2IA 1BG5A 5IIZA 1DSBA 5ELGA 4P3YB 5CREA 1XOAA 2V41A 4JBBA 1A2JA 1J9BA 1A24A 1TJDA 1SU9A 1TK0B 2H01A 4G19A 3KJYA 1YKAA 3CSIA 1WPIA 3F4RA 2VO4A 2XPDA 3TOUA 2CX3A 4F82A 3QAGA 3VWWA 1QXHA 1XVWA 1T3BA 2PERA 2VL2A 2R5GA 2V1MA 2E2GA 2FWFA 1BYEA 4K7NA 3LJRA 6GSXA 1T8EB 1Z6MA 3IV4A 4OD7A 1U87A 2XBIA 1VF2A 2C4JA 1PSQA 3VFIA 3LXTA 1UA5A 2K9FA 4RUVA 20GSA 2LJAA 3DKSA 2L57A 4L5LA 3A5WA 2H1DA 1BEDA 4X1UA 2FHEA 3GH6A 2H74A 2R3XA 1FB6A 5ABRA 1V57A 2WCIA 4DSSA 5JWQB 5JWRB 1JZRA 3HA9A 2IWTA 2MMAA 3ZVJA 4WEYA 2BJXA 2VL3A 18GSA 4PNFA 3QD9A 4I2TA 2CVDA 1PRXA 4LMWA 2YWIA 3ZYWA 1S3DA 1SL1B 3VWXA 2WS2A 1GSQA 1GLPA 2FCHA 1DBYA 4LMVA 3NIVA 2JADA 3UEMA 2VUPA 2I4AA 1AQVA 3BCIA 4J57E 4GQCA 3M3MA 1TKDB 5INYA 4POKA 5HFGA 2IPAA 4LL1B 2C3QA 1THXA 3V1WA 4EDYA 1PD21 5IO0A 2D2ZA 1LJRA 1GLQA 5KN0A 3DEXA 4JE1A 4TR1A 1KBNA 4WXTA 1ZGNA 4BPYA 4K9ZA 1THOA 3UOMA 1M0UA 2VLUA 3TKSA 2DJ2A 5ECLB 1F9MA 4ZIJA 1ZYEA 4MH3A 2MBSA 4MF5A 3F9UA 2IL3A 5IM9A 4ISDA 1DE2A 2RLIA 6GSSA 1MD3A 4OFMA 4QL7A 2LRTA 4ZL7A 3TRPA 1AAZA 1JZOA 1M9AA 1WIKA 1OKDA 1GTAA 2GS3A 4CW9A 9GSSA 4GXZA 1KEBA 1SJZA 4MK3A 1GNEA 4KAEA 4AF2A 3FY7A 2C0FA 4KDUA 1SK0A 6GSUA 1TTZA 3P2AA 3GMFA 4DSQA 5A5KA 1EOHA 3QAVA 4F03A 5HR3A 3TJFA 3ZFLA 3UL3A 4F9ZA 1QUWA 3ZTLA 1TRUA 3LYPA 2JU5A 1R26A 1AC1A 2B1KA 1X9SB 5CNWA 5G5FA 5EVOA 4PXOA 4X43A 1O85A 3KEBA 4OCFA 2OE1A 1FHEA 5J5NA 2LNTA 1G6WA 4KX4A 2LTKA 5B6MA 3QMXA 4IKHA 3CXGA 4G2EA 4V2LA 1EWXA 3M1GA 2DIZA 4FYBA 5AIXA 2RUEA 1XVQA 2XC2A 2JZTA 2YWMA 4JZQA 2EC4A 2HT9A 1OYJA 1M2AA 3ZIJA 3QDNA 4MZBA 5DAKB 4TXOA 5A4UA 3D6IA 3K8NA 5E59A 5ECMB 3ZMLA 3VI7A 1YEPA 3MNGA 4KA0A 3APQA 3HY2A 1O81A 2RIIA 1S3AA 2OA7A 1FOVA 3ZVJD 1YF1A 2BMXA 2CZ3A 2IIYA 1R4WA 2GQLA 4AGSA 3TKSE 1UN2A 2VOCA 2PUKC 4CHSA 3P8WA 1O6JA 1QFNA 2IMFA 4G10A 1IYHA 1XW9A 12GSA 3KMNA 3M9JA 4JEDA 2JL4A 2A4VA 3HHVA 1XWGA 2CZ2A 3HCZA 2AV4A 1O8WA 4MJAA 3TGZA 3L0HA 2EIQA 4JR4A 1FVJA 4KDXA 1Y6EA 3AY8A 1AQWA 3DRNA 5ECHB 5ECIB 3Q19A 2FLSA 4IVFA 1O8XA 1TXXA 2GT6A 4EE0A 3ZZXA 4WETA 2VM2A 5DBQA 3TRQA 1VGLA 1T4ZA 1M7TA 1K0OA 3HKRA 2VM1A 1GUMA 5DCGA 4ECCA 2B5EA 1Y25A 3KTLA 3O3TA 3GYKA 5EY6A 2MMNA 4QL9A 4IJ3A 1WE0A 3IC4A 2VD0A 3D4MA 2L59A 2YJHA 2ES7A 3DIEA 2R37A 3QAWA 1R5PA 2FY6A 3D5JA 3UAPA 3GX0A 4HQSA 3IE3A 3M8NA 4HDEA 1PN9A 2DJ0A 3SBCA 4XIHA 1K0BA 1M9BA 5ECQB 4GF0A 2XHFA 5IOWA 3KIJA 5ECRB 2DC5A 4I6XA 1M99A 3CSHA 4XS6A 1FW1A 6GSWA 3RBTA 19GSA 2VLTA 1OC9B 3LQ7A 3C73A 5H5RA 4BWSA 3TKRA 1EV9A 3HDCA 5ECNB 4AJ6A 2VLVA 4ZBAA 5IO2A 5D93A 2PVQA 4EDZA 2H1GA 5J9CA 2YV9A 3LWAA 4HU9A 3L9VA 2LQOA 3ERFA 3CTGA 2YN1A 4MABA 3FW2A 1VF3A 4KSMA 2YWOA 4YQUA 3DD3A 3TKPA 3WGXA 1T1VA 3L4NA 1U3AA 4LA1A 1XW5A 2LNSA 3ZREA 1UC7A 4Z7XA 5GSSA 5HR0A 2B6MA 4ZL9A 2KHPA 1SD9A 4IS0A 2VAFA 2P31A 2L6CA 5EPFA 3WGEA 5ECOB 2Z9SA 2DJ3A 4EVMA 3D22A 5D9WA 3DVWA 1DUGA 4MP4A 2P5QA 5IMFA 1U3IA 1U6TA 4HZ2A 4IP1A 2YZUA 4KUNA 4ULXA 1B8XA 1ERVA 3Q74A 3ZLPA 2ZNMA 4K7OA 1J0FA 2DSAA 1VRSD 3F3QA 3MDKA 4NHWA 2F8AA 2L4CA 2C80A 3W6GA 2KLXA 1SJ6A 3UARA 4XS4A 3TJGA 1SENA 1Z3EA 1N2AA 1K0MA 4NMUA 1OAZA 4ML6A 1RK4A 1M2BA 2K8SA 2I81A 3F8UA 4ZB9A 2F3MA 1TW9A 4WF5A 5H5SA 3A2XA 1MTCA 4CDOA 1FG4A 2FWGA 5G5EA 2H8LA 3I6AA 4HUAA 3VURA 4V2MA 2C0EA 1K0NA 3S9FA 2V6KA 3LGCA 3VLNA 5ID2B 3H4KA 4RQXA 1EZKA 1A23A 4HS1A 4L0WA 4KH7A 2VCVA 2X8CA 1WMJA 3BCKA 2VCXA 1TRWA 2HLSA 3P90A 4PNGA 3QPMA 1XXUA 4LLRA 1X9WB 2ALBA 1JLWA 5GAPD 3G7IA 4PUFC 3WGDA 2NPBA 1Z5YE 2QGVA 3MAKA 4ZB8A 2XBQA 2IJYA 1XFLA 4I2UA 2VD1A 4IQ1A 2O8VB 3O76A 2O87A 3EURA 4HQZA 5CRWA 2NTOA 2G2QA 2VL2C 5GSTA 4J56E 4NWYA 2CVKA 3ERWA 5FT3A 2LJRA 2FWHA 1GSFA 1EEMA 1NW2A 1LU4A 3IOSA 4NV2A 2H19A 1EP8A 2GLRA 5G1LA 3LG6A 2GVPA 4DSSB 2VIMA 2FA4A 1ILOA 1GL8A 4MPFA 5IMAA 3KXOA 3GV1A 3RHCA 4WR5A 2H0HA 1GP1A 1K3OA 5C04A 3GURA 2OE0A 3ZIVA 2TIRA 4AJ8A 4X0XA 1SYRA 1EEJA 2LRNA 3GN3A 1AW9A 1V58A 1BX9A 1V40A 4TR3A 2JZRA 3EINA 4MZWA 4G9HA 4ZL8A 1TP9A 2R4VA 4FIWA 3DWVA 2FA8A 4YH2A 3CYNA 5B8BA 1PX6A 2RM6A 4LL4B 3IPZA 5CAXA 2LUSA 2DJJA 1SKWB 1PGTA 1ERWA 1F37A 2HFDA 3FKFA 1F2EA 4GTUA 2X8HA 4EKZA 2V6OA 4TR1B 5CRHA 4ECJA 1IYIA 3GKKA 2IFQA 3GH9A 5IOXA 3FR6A 2WJUA 4BL7A 2YNXA 3KH9A 5AGYA 4GLTA 1X5EA 3QFAC 3IRAA 3C1RA 4N10A 3EWLA 1HNCA 3HD5A 1V98A 5HFIA 3P7XA 4FYUA 3A2WA 4OO4A 3LFLA 3HXSA 4Q5NA 2H0GA 2NBSA 4MDCA 4O5RA 3HJOA 4WF4A 4N0VA 4PQHA 3MWHA 3TJKA 2LJKA 2LV3A 5F8BA 2E7PA 4XHMA 4BA7A 3F6FA 1SKRB 5H5QA 4POMA 2I9HA 5GAND 3IXRA 3UBKA 1B48A 1O73A 2B7JA 2WFCA 4PQIA 2GGTA 2HZEA 2H1BA 2IMEA 2HRNA 1R7HA 5A4WA 2ON5A 3TRXA 5G2ZA 2FNOA 4AJ7A 4TRXA 1YDKA 1EOGA 2AYTA 1FAAA 3J7Yk 1JFUA 2F8FA 2A2SA 2PU9C 4TXVA 1XWAA 3US3A 3FZAA 5F07A 3F0IA 1OVNA 3QCPA 3ZL5A 2OE3A 1GUHA 2GQKA 3GA4A 1A8YA 5D9VA 5KN1A 2QKEA 5DCHA 2O7KA 3G9BA 4RI6A 1A0RP 2WGRA 1ML6A 4IJIA 3GSSA 3FR9A 1I9DA 1TK5B 5AISA 4BWQA 2H0IA 1EGRA 4H86A 4IELA 4TXOB 4YQMA 1ABAA 2L5LA 4EXJA 4BVYA 2M46A 3EMPA 1JLVA 1A0FA 5DDLA 2TRXA 5CP1A 1SK2A 4RQRA 3F4SA 1T00A 3MSZA 1OE8A 2AAWA 1GSYA 1PKWA 1MDKA 5JCWA 1ZL9A 4XRDA 3IK7A 3EYTA 2KOKA 3FEUA 3KP9A 3CBUA 16GSA 4ZBBA 4L5OA 2GZPA 3UVTA 3GKNA 1G7EA 3HYPA 4E8HA 2V2GA 3G7JA 1K0AA 3EU4A 3RPNA 3D4TA 3GX8A 4Q5QA 5ECKB 2ZCTA 3QFBC 2LKUA 3EC3A 2M66A 2GQMA 2H30A 3I43A 1W4VA 1OKTA 1ZMAA 2YANA 2GSRA 5J3RA 10GSA 5ENUA 4XCSA 3IHQA 1SJIA 3H1NA 4FYCA 2FWEA 5LNKe 1GSEA 3FYGA 2CX4A 5DJLA 3VPTA 4EF0A 1JZDA 1F6MC 2GSSA 1R5AA 2LSTA 1TI3A 1GSSA 1URMA 2HXKA 2DJ1A 1MEKA 3ZMKA 1JZWA 5DALA 4L0UA 4WBRD 1PA3A 3TOTA 1F3AA 2H66A 2C0GA 5ECSA 2IMIA 3GKMA 2YPMA 4ACSA 3SWLA 2DMMA 3IAM2 22GSA 2WB9A 4MZCA 5J9BA 1XPVA 3UIWA 1CQHA 5CYYA 1QQ2A 1GH2A 3VWVA 1SKSB 4TKYA 3APOA 1ZOFA 2PBJA 5C00A 2L5OA 1QGVA 4MF6A 4POLA 2H6XA 4KW6A 2JACA 5D9XA 4DVCA 2IN3A 5B7CA 3I9V2 4MA9A 1U88A 5D8IA 3NOFA 3ME8A 4OFTA 4D73A 3LXZA 3FZ9A 3TB2A 1AUCA 3WT1A 1WOUA 2IMKA 1TI1A 3FR3A 4ZB6A 2N5AA 1GUKA 2DMLA 1FO5A 4TN8A 4N30A 8GSSA 11GSA 1PX7A 1OC8A 5D73A 4GWRA 3EU3A 4EO3A 5FHIA 2CAIA 2YJ7A 2BTOT 4HZ4A 1RW1A 3D0ZA 3GTUA 2I3YA 1EGOA 2PPTA 1YEXA 1PQNA 5AN1A 5DQYA 3RPPA 5J4UA 2YWNA 1G0TA 4POBA 1GNWA 2H76A 3N9JA 1X5CA 2CAQA 3ZITA 3J7Yb 4WKWA 2PVOC 2DJKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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