2QCFA

Crystal structure of the orotidine-5'-monophosphate decarboxylase domain (asp312asn mutant) of human ump synthase bound to 5-fluoro-ump
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
257
structure length
256
Chain Sequence
MELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKHEFLIFENRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase (UMP synthase)
publication title Structures of the human orotidine-5'-monophosphate decarboxylase support a covalent mechanism and provide a framework for drug design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 101
structure length 256
sequence length 257
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2007-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2qcfA00
1W1ZA 2I1OA 2EAWA 1A53A 4UIOA 3UWVA 5FF3A 1EP1A 4RK8A 2ZZ3A 3VE9A 2ATSA 4XBKA 2YW4A 5D2TA 4OHQA 3E9AA 3G8EA 1TPWA 3NZ1A 4IGHA 4I9AA 1WV2A 3NQ2A 3C4UA 3N2MA 4ZQNA 1W8SA 1I45A 3C2OA 2ZA3A 4O54A 3AJXA 2G5WA 4R34A 4R53A 4JTKA 3NPUA 4YMZA 4UTWA 3VE7A 5HUPA 4P61A 1EEPA 1OF8A 3F03K 4Z0SA 1H62A 3JR2A 4HT3A 1BWLA 3W07A 1VHCA 5KZMA 2DZVA 1F7BA 2VXNA 2WJZA 1R30A 2FJKA 1H50A 3LCXA 2DZSA 4TX9A 5CPNA 3CEUA 3UWUA 1YADA 4QM1A 3MMTA 2YYUA 4DBDA 5HWNA 2NUWA 3PC0A 4K37A 2YFOA 3PS7A 3NL2A 1IXOA 4NQ1A 5DBUA 4LC6A 4W9TA 4A3UA 1KFEA 2CU0A 4BI6A 4O57A 4IMCA 3GR8A 5CSRA 5A8GA 3LCFA 4FF7A 3NG3A 2FFCA 3FKKA 3KHJA 4JTLA 1YTDA 2E5CA 3P67A 1S5VA 1ZAJA 3MBDA 3GR7A 1QMLA 1H7RA 4R7JA 4ALDA 1TYGA 3PVFA 5F2LA 1THFD 4PTNA 3PG9A 2RH9A 2A4AA 1OFDA 3FA5A 3GXTA 2C1HA 1XCFA 3C2RA 3B06A 4DQWA 5D02A 2Z6IA 1IGSA 3W7LA 1YTKA 1TTPA 1X6UA 1W5OA 3C2VA 2O7QA 1PIIA 2PURA 5K4ZA 4FXSA 3N14A 3CU2A 5K9XA 1SZFA 2G96A 4MIMA 2W79A 1L6YA 1AMKA 2G97A 3PF3A 4AHOA 2QEZA 3LXAA 3N9SA 2NXIA 2GPTA 2ZQ0A 5I3GA 1VR6A 3INPA 3RU6A 1WX0A 3NQMA 1H5YA 2GVGA 3H53A 1W5PA 3BARA 2CZEA 4GUFA 4MFDA 3RLVA 4WUIA 4Y96A 3KVLA 4E0CA 2NV1A 3PG8A 2A7NA 4JTHA 3D0CA 3UWZA 3R89A 3B0UX 1LYXA 1E51A 5SWUA 3LI0A 1SQ7A 3OEXA 4JXCA 2X2GA 1K02A 2QF7A 4OQVA 2PCQA 4A29A 4NJIA 6TIMA 3W1RA 1M7PA 1G67A 2JKEA 1WBJA 4UTWC 3PBVA 3STGA 2NUXA 3KRSA 1YPFA 2ZZ7A 4YCPA 3W76A 5EBUA 1NF0A 1EP3A 4PA8A 4U4MA 3S5ZA 3VNDA 3NZRA 1WOBA 4DBEA 3JRKA 3W85A 3PUDA 1S3HA 3QMRA 2DORA 4XKYA 4NXSA 3F4WA 3EXSA 3NXFA 2VEKA 4NX0A 1TB3A 1W3IA 1LBFA 1GWJA 4GE8A 1JULA 1OFOA 5IBXA 3WK3A 5D03A 2Y88A 4BWLC 1F6KA 2VFIA 1UUOA 4PL2A 1H7NA 2WSQA 3M16A 1WAUA 1M5WA 4O19A 4O11A 5C5YA 1RQHA 4RXGA 4GNJA 4RZ4A 2OJPA 1TPUA 2EF9A 3U6WA 2V2HA 2R8WA 2JGQA 1ZALA 1R47A 3NL5A 5CG7A 3DHFA 1Q6OA 3FJLA 1ONRA 3DFNA 4ML9A 4EOUA 3W84A 1K8YA 1PCWA 2X1UA 3MJYA 3TSBA 4EF9A 3ZWSA 4JTGA 2QCNA 2A85A 3HG4A 5DCDA 1FWRA 1GT8A 4X9SA 3W3OA 1RPXA 2E5BA 2V30A 3TKFA 3MP5A 4ZQMA 1SFLA 3PBYA 2WOQA 1NF7A 5HUOA 2VFGA 1T8XA 1TPC1 3LCLA 4PCFA 2Z1BA 4Z08A 3MI2A 3LHYA 1N8FA 4LOCA 1LBMA 5D2WA 1UB3A 2QAPA 4LS1A 4MJZA 3P60A 2J9YA 4UUIA 2GVLA 1B57A 1SSDA 1JR1A 2JBMA 3GDLA 2ZRZA 1I8JA 3FEMA 1AG1O 4JS3A 2NUYA 1DORA 4AHQA 3HG3A 4DF2A 1GEQA 3UYCA 3M43A 2WV8A 3IEBA 1HTIA 4M7SA 2WKJA 4Z1DA 4DPQA 1LTDA 3G1XA 1H7WA 3LERA 4M5PA 1TIMA 3LBMA 3LCIA 4GXMA 1ZFJA 2ZFAA 4M6PA 1PE1A 2CZ5A 3GDMA 4UTJA 4XQ6A 2CLLA 4O0ZA 1W3TA 3KVKA 1PV8A 4JN6A 3KOFA 1RQBA 3DAQA 5D2VA 3R5EA 4CQ8A 5AYZA 5HQEA 1Q6LA 3LCGA 3UZ5A 5DXXA 3M47A 4X3ZA 2RKXA 2KZHA 1SZNA 3CEPA 5I3HA 4HKPA 1JCYA 4TMCA 1DVJA 5LSMA 4EWND 3DXIA 1F73A 4N02A 5IBXC 2QJHA 5LNVA 4H4IA 1KA9F 3UNDA 2QCLA 3S1WA 1LP6A 1TJRA 3N3MA 1ZCOA 4LWWA 2ZRXA 4CCEA 5AYXA 2HTMA 3MUXA 2V5BA 1VGAA 3WK0A 4PC8A 3C8FA 1DQXA 5L6UA 1H1YA 3CM4A 1FUYA 4S2CA 5AHLA 4GUJA 2DJXA 2V2CA 3IIZA 3W2KA 4DO5A 1TMHA 4O12A 3JS3A 4GWEA 1T99A 2TSYA 3NQVA 1O5XA 3M0ZA 3T55A 5G2IA 1QCWA 3F4NA 1OK6A 3EEGA 5E1QA 1TRDA 3QW3A 4E2DA 3I6RA 3HPZA 2ZRVA 2VENA 3L66A 2YGYA 3DFQA 1SW0A 4POCA 3TSDA 1J5TA 1VLIA 1XBXA 1XDLA 2VC6A 4YWIA 3TC6A 1HO1A 3EX6A 4QIUA 1TTIA 1IF2A 3C6CA 3T4CA 3IGSA 2X1SA 1VJIA 2Z2UA 2B7QA 2QCCA 4JTEA 3RNDA 3NVTA 3HGOA 3G3DA 3SGUA 2ZA1A 1JRBA 4JEQA 2CLEA 1OFQA 3M5VA 2A6LA 3L9CA 1FXQA 4NNBA 2QCHA 4UMCA 3WJZA 3C2FA 3T78A 4UNLA 4BK9A 1GTHA 4MY9A 1W5MA 3S1XA 2GQAA 4O0KA 4RLIA 2A2IA 4LVAA 1ML1A 3ATYA 1CX9A 2OCZA 2E6AA 4Z1BA 1JJKA 1VCFA 3WJWA 1G7UA 2F84A 4UMBA 5BNKA 3IIOA 4MJMA 3W7KA 3DZ1A 1GVOA 2YYTA 1OHLA 1VH7A 1TPH1 1WYIA 2PC4A 3L5MA 2CWNA 5FF2A 3UY7A 4LS2A 1N7KA 2FIQA 3ANYA 1Q6QA 3NQCA 4EIVA 3W83A 3CQ0A 2A6NA 2VFFA 4Q32A 4FNRA 1ICQA 1P1XA 1K7XA 4WJEA 5BMXA 4QSHA 4TR9A 1HO4A 5AHMA 3OBKA 1PL9A 2V82A 1FCQA 1YDNA 2O7SA 4FNSA 4M6VA 2ZZ4A 5FESA 2QUVA 4JX6A 4L4LA 1WA3A 1RV8A 3B0PA 1GTEA 3LCWA 3L65A 4NT0A 3SR7A 1CW2A 3S1UA 1U83A 1KLYA 4NJJA 5G1TA 1LBLA 1K3UA 3LX9A 3HPSA 4KFPA 2E6DA 4XTIA 5KINA 2ZTJA 3KRZA 1C9DA 4JIQA 4WXZA 2TRSA 2YCEA 4JIPA 3TJXA 1ME7A 1LRTA 1BTMA 2CZFA 2VEMA 3N9RA 5HJLA 4BI5A 4WY0A 1HL2A 2CLIA 4A2RA 1V5XA 1KFKA 1QPNA 3ZFHA 1X1OA 4HIBA 3RLUA 4HNTA 1S5TA 1G4SA 3IVTA 3VCRA 1JUEA 1J4EA 3LTSA 1Z41A 4IMEA 1KTCA 3W86A 1XBZA 6ALDA 1XI3A 4MPQA 3PB0A 2NWRA 3C56A 3PSVA 4IMGA 1N55A 3BG9A 1FDZA 3TXVA 3GIYA 4UFMA 4A21A 3Q58A 1C29A 1NAL1 4MZ8A 2F7FA 3L5LA 1I2PA 5BOOA 3G1HA 2NLIA 4IXHA 1JQXA 3HO8A 2JKAA 4LC8A 1ADOA 1B3OA 3NL6A 1GG0A 3L0GA 1K7EA 5AC7A 2VFHA 5AC6A 1KLZA 4K8HA 1SO3A 4IQLA 1BEUA 4C1KA 4OE7A 1S5WA 2QCEA 2CLMA 2FDSA 3UY8A 2CLKA 4M6QA 4K6AA 2AQWA 2DU2A 1LLWA 5J5RA 4CLMA 3NGJA 3TMQA 3WFAA 1EPXA 1MEWA 3R12A 3L0NA 3G24A 5D05A 3MP4A 1LLZA 4O1AA 4TU1A 3A23A 3TH6A 1FCBA 3AO0A 3W7OA 1ZHAA 1QDSA 3E0IA 3LOTA 3C61A 1QNVA 3NQGA 1JCXA 4TO8A 1X7FA 3LRLA 3IIVA 3W2UA 4MZYA 4O14A 5EKYA 2Y63A 1TJPA 3TCEA 3QW4B 3EXRA 2C0AA 4NZFA 1LCOA 1DL3A 2A5HA 4N9BA 3UPWA 1QR7A 4LVBA 1KM5A 4Q33A 2QCFA 4L4MA 5D2YA 1VC4A 4RZ6A 3E49A 5BRBA 2NV2A 3W88A 4BFAA 3W7GA 5CPOA 3BW2A 3W2MA 3W1QA 3CLMA 4NJHA 1Z44A 2PRMA 5D09A 3L68A 3ABQA 1VYPX 2QUUA 2Z0IA 1G6CA 3LV5A 1YXDA 3IV3A 3ATZA 1K03A 1BWKA 4ZQRA 1KW1A 4JY8A 4ADSA 2AGKA 3V75A 4A2SA 2B0MA 3IGUA 2ZRWA 4JR5A 1EIXA 3O63A 5E93A 1QAPA 1ME8A 5HULA 5D33A 1VS1A 3N19B 1KM0A 1TV7A 2Y7DA 3B04A 5U7SA 3SFKA 3TFXA 4IXXA 5LGZA 1SW7A 3O16A 1GVRA 3W2JA 3GDRA 3LHUA 5MHBA 5F4XA 2FTPA 2NXGA 4HN4A 1KBIA 3OIXA 5CPMA 2H3DA 3GNDA 5K3VA 5HWJA 5FEZA 3SY5A 5C2XA 4MLJA 3EX3A 2YDAA 2Y70A 2ZRUA 1OF6A 3C3NA 4D2JA 3EKZA 3OG3A 1QPQA 1G4PA 2WNZA 2GVJA 1GJPA 4LUIA 1WXJA 1H1ZA 1XL9A 2J6XA 3STEA 1XXXA 5F2IA 4UFIA 1DBTA 3LHVA 3IIPA 2H90A 4NXKA 3T40A 3M5ZA 2E77A 3OA3A 1BKSA 4QISA 3FFSA 3BLFA 3L2IA 7TIMA 3S9YA 3S42A 3ZS4A 2QAFA 5F2GA 1TPFA 3CTLA 3UD6A 1LOLA 3N2XA 4HSOA 3TAOA 3W71A 4N4QA 2EHHA 3IRDA 3DU0A 3PUEA 3GXNA 3BW3A 5DBTA 1VYSX 3M6YA 3W72A 4ORMA 1Z48A 1MO0A 2I14A 2X1RA 3NO5A 2FB2A 3WK2A 1XBVA 2J27A 1MSSA 2IQTA 4RZ5A 2OT1A 4X22A 4UC5A 3G0UA 3NL3A 1DKWA 5F1VA 2ALDA 4LVDA 2OT0A 3CIXA 3Q37A 4XTDA 3W7QA 2GJLA 4PFMA 3W7MA 3LBCA 1VYRA 1A5AA 3TFCA 2FPTA 4B5NA 4LU0A 2VEPA 4N9DA 1KFBA 1SPQA 5HR6A 4LT9A 5EY5A 1GYLA 4JTUA 4QQ3A 1RD5A 2ISWA 4BF9A 4O4VA 3KXQA 3QH2A 5KZEA 3MYOA 2ZCGA 3TC7A 1OX5A 2QCDB 3E12A 3DBPA 4IX2A 3CB8A 1IXNA 3SECA 3I65A 1W3NA 3HGJA 5J5DA 1F05A 5F4SA 3P82A 3QEZA 3MYPA 4LUJA 4NJKA 3ABRA 3NQ6A 5EYWA 3S6DA 3M1ZA 5FEWA 1X8FA 2ZZ2A 3B4UA 2QJIA 4S1FA 1KFLA 2ISSA 4KWWA 4O4WA 5DN1A 2BTMA 4LS0A 3LTYA 3QSTA 3EX4A 2ZZ6A 2AAMA 2X1TA 5AHNA 1OFAA 3QMSA 1P0NA 1HUVA 3NR0A 5HWMA 1HFBA 5C6MA 2BLEA 1KTNA 1GQNA 2V81A 5K4XA 3NA8A 4AWSA 1KV8A 1FCUA 5DCBA 3S5YA 4PL1A 1OYBA 2Y7EA 1YXCA 3FOKA 3MWAA 4O10A 1RQEA 1SZGA 1W0MA 3NQEA 3M5YA 3R13A 1H61A 1O4UA 5KZDA 5AN7A 4O53A 3PUOA 3P62A 3EKLA 1SFJA 4KFOA 4HNUA 4QAIA 1XKYA 5LZLA 3G8RA 1OFRA 2B7NA 3GNNA 3DENA 3P7YA 4AEOA 1SO5A 3SZ8A 3FYOA 2BXVA 5K9DA 5LNUA 2A21A 5CSSA 5CPLA 3KVMA 4H3DA 1XFBA 1YLVA 1H60A 5FI8A 4WOQA 4K36A 1TPB1 1GVQA 4JTJA 1FX6A 3S0CA 3E02A 5EA9A 4JYEA 3WJYA 3QYQA 3IVSA 4FEZA 1TCDA 4MYAA 2QDGA 4UTIA 3STCA 4S2BA 3U2OA 1F6PA 1I2RA 1QOQA 2NX9A 3G1DA 3T7VA 3CPRA 3L21A 4AF0B 3M7WA 3RK8A 4A22A 2DJLA 3P5YA 3O6DA 2J9XA 3ABSA 4MFEA 1B4EA 3GLCA 4C1LA 5BMWA 4BI7A 1NSJA 2BSLA 3FLUA 1JRCA 4EF8A 1VZWA 2XN0A 2C18A 4FHAA 4Y8FA 1TSIA 4Z0JA 1F74A 1EUNA 4UTUA 1KM3A 1FCVA 1LRNA 4BR1A 2H3BA 3M41A 3BGGA 3G22A 3W2LA 3S8HA 3MW7A 1I2NA 4N2YA 1EB3A 4XZ9A 1OFBA 3I68A 3LHTA 3NQDA 1ZENA 4N9EA 4LRTA 2WO5A 2YZRA 2C14A 5D32A 2D73A 1GOXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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