2QGVA

Crystal structure of hydrogenase-1 operon protein hyae from shigella flexneri. northeast structural genomics consortium target sfr170
Total Genus 23
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
23
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
TPFDALWQRMLARGWTPVSESRLDDWLTQAPDGVVLLSSDPKRTPEVSDNPVMIGELLHEFPDYTWQVAIADLEQSEAIGDRFGAFRFPATLVFTGGNYRGVLNGIHPWAELINLMRGLVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of hydrogenase-1 operon protein hyaE from Shigella flexneri.
rcsb
molecule keywords Hydrogenase-1 operon protein hyaE
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Shigella flexneri 2a
total genus 23
structure length 121
sequence length 121
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2qgvA00
3TRQA 1ZCPA 5FHIA 2BMXA 2E0QA 4G10A 4KDXA 5DALB 1TOFA 1QGVA 5HR0A 1QMVA 5L71A 2QGVA 5AN1A 4MJEA 4MF5A 1MD4A 2VCWA 1DE1A 5CP1A 1OE7A 3A3TA 1AAZA 1SJIA 3HD5A 2FWHA 2JZTA 5CRGA 2X8GA 2L6DA 1PKZA 2K8VA 2AUVA 1GWCA 4K2DA 3LSZA 2PVOC 2R3XA 5F05A 2PGTA 2K18A 2DC5A 2RM5A 3DYRA 1YQ1A 3EU3A 3FK8A 3MAKA 4MDCA 1OKTA 2HI7A 3F4SA 1M0UA 1GNWA 1XVWA 2VOCA 3ZMKA 2EC4A 1BYEA 2PMTA 4F82A 3KMOA 3M8NA 2KLXA 4K1FA 1T00A 1UA5A 1TTZA 1ZL9A 2IMKA 2KHPA 1VF2A 3FW2A 3PGTA 3JCML 3A2VA 5JWOB 4ECBA 2HRFA 3FHKA 1F9MA 4JR4A 2HT9A 3M0FA 3VFIA 1J08A 1PX7A 3KJYA 1I5GA 2VCXA 2VLVA 3RDWA 2GSTA 4EO3A 1M2BA 2DSAA 3SBCA 3QD9A 4AJ8A 2C4JA 4ZXGA 4ZL8A 4CDOA 1HNAA 4IELA 1TRWA 3QOUA 3A2WA 5ECIB 1ZYEA 2C1YA 2H71A 2LV3A 4FYCA 1KBNA 2OE1A 16GSA 4HQZA 3FY7A 4K9ZA 1NM3A 1FB0A 3AY8A 3C73A 1NW2A 2F51A 2PUKC 4DSQA 1A8YA 5D8IA 3MSZA 2IFQA 2RM6A 4JRRA 2X99A 4Z7XA 3VLNA 3IV4A 3WGXA 3QFBC 2IJYA 3KCMA 4MABA 4TVEA 3ZVJA 3IC4A 4J57E 3APOA 2YV7A 3F3RA 5ENUA 1DE2A 2H75A 3UBLA 1PX6A 3LORA 1AQWA 4I6XA 1Z7PA 1HYUA 2H70A 1TW9A 2GZZA 2DIYA 2PPTA 1OC9B 4ZIJA 4KSOA 1O7UA 4LLRA 3EU4A 5AIVA 3IA1A 5ELGA 2GQKA 3H79A 2RUEA 4MK3A 1X9MB 2V1MA 3IBHA 2H74A 2VIMA 3FRCA 4WF5A 5GZZB 1AXDA 1FVKA 4K7IA 2BTOT 2WGRA 3PR8A 4NMUA 1CQHA 3F63A 3TKSE 2H0HA 2R5GA 2VM2A 3TJBA 1NSWA 3TKSA 19GSA 1G7OA 4X43A 20GSA 1ZMAA 2H8LA 4YH2A 2YOIA 6GSXA 3GX0A 1X5EA 3D0ZA 4GQFA 2GSQA 4IP1A 3VWXA 4QQ7A 2HSHA 2KUCA 1PL1A 1SL2B 5IOWA 4XS1A 4PUFC 4KA0A 4ILFA 3LXZA 2B7KA 5DJLA 1TU8A 2LJAA 2DJ2A 1XOBA 5G2ZA 5DBQA 1ZGNA 5ECHB 5ECLB 2OACA 2OBIA 4PNFA 2GTUA 2VD0A 1UN2A 3MDKA 2H30A 5CAXA 3P8WA 4GWRA 4PQ1A 1PGTA 2HFDA 5KN3A 1UVZA 5D96A 2L6CA 2M46A 3H93A 5ELAA 2FA8A 1T8EB 1PA3A 2KP1A 1QFNA 2YWOA 4PQIA 3L9SA 3D5JA 4RUVA 5JWRB 1Z7RA 3VI7A 3TKRA 4FYBA 2TIRA 3GKNA 2GQMA 2R2JA 1K0OA 1V2AA 2JSZA 1HNCA 2FNOA 1Y25A 5G5FA 3I9V2 1PKWA 2DJ0A 2YZHA 3O3TA 2N5FA 2RLIA 1YEPA 3IDVA 3QAGA 4ECIA 3SWLA 1K0DA 3QMXA 1AIUA 2JADA 4OMVA 4POBA 4HU7A 3FR9A 2LNTA 1GUKA 1KNGA 3VPQA 3WGDA 1X9SB 4GTUA 3E0UA 3DVWA 1MDIA 4L0WA 1ILOA 4KDYA 5J4UA 5ID2B 3EC3A 4IHUA 4V2NA 2HNLA 12GSA 2YCDA 9GSSA 4OO4A 1PL2A 2XHFA 1AQXA 3I6AA 3KD0A 3ZMLA 1XWBA 1SKRB 1SD9A 4RQXA 2CAQA 3UOMA 2V6KA 2EIQA 1TK8B 4IW9A 1YF1A 3LGCA 3HXSA 1WP0A 2GVPA 3BOAA 5KEJA 4NAXA 3ZL5A 4PURA 4ZBBA 5H5RA 4JR6A 2VUPA 3WGEA 1DBYA 3NIVA 4EKZA 1TI1A 3ZLPA 5ECPB 3WT2A 4HU9A 1F3AA 1F6MC 1GSUA 2L5OA 5FWGA 1GSQA 1JZWA 2YNXA 1PMTA 4MMMA 1Z6MA 4L8EA 4NHWA 1T1VA 2GSRA 2H72A 3F6FA 3IRAA 2C3NA 3EMPA 3KGKA 3ZRDA 2RIIA 3KTLA 1W4VA 1A0RP 2LJRA 5ABRA 2VD1A 4KE3A 2P0GA 5J5NA 3CSIA 5D9VA 1FVJA 2WDUA 1FG4A 5A4UA 4PXOA 2YJ7A 1JLVA 3NOFA 1XFLA 1ON4A 2YJHA 4F0CA 1AW9A 3FR6A 1TRUA 1U6TA 3GNJA 3GSSA 4KSMA 1SK1A 1GH2A 4K8MA 2VCTA 3UEMA 3U6VA 4KDUA 1LBKA 2GQLA 4HZ2A 5J9CA 1EZKA 2V6OA 4X1UA 3Q18A 3F0IA 1GULA 2FY6A 1IYHA 5G30A 4G9HA 2HXKA 4HQSA 1ERTA 1M2AA 1XW5A 2JL4A 3TCOA 2OADA 1GRXA 4I8BA 5CRWA 5B8AA 2WULA 1XW9A 2VLTA 2X64A 2WCIA 5INYA 4POLA 3GL5A 1WJKA 1QK8A 3APQA 5CRHA 2M72A 1K0MA 3GX8A 5DJMA 3VWVA 4YQMA 3VPTA 3O76A 13GSA 2WZ9A 5AISA 5J41A 4HOJA 4IN0A 1ST9A 2LSTA 4RI7A 3H8QA 4BA7A 1BX9A 5E59A 4FO5A 4WF4A 2VL9A 5B6MA 2P31A 2BJXA 1S3DA 4IQ1A 2HYXA 1FW1A 1W89A 2CVKA 5F8BA 6GSVA 4YAVA 4X0XA 2HRNA 2MMZA 3DVXA 4N0ZA 2H0GA 4PGTA 5KN1A 3DWVA 2YWNA 4JEDA 5A5KA 1EOGA 1NHOA 4O5RA 4EVMA 3M9KA 5IM9A 4ZL7A 5ID2A 1GNEA 1YY7A 5IIZA 2JZRA 4ML1A 1AUCA 2B1KA 1EP7A 1O81A 2H0IA 2ALBA 3F9UA 4F0BA 2X8CA 2H66A 5F06A 5IOXA 2YZUA 2G0FA 1Y6EA 3DEXA 3HVVA 2H19A 4TKYA 1XPVA 3QCPA 10GSA 1RQMA 2N5BA 1MD3A 2PWJA 3QAWA 1ERVA 1JZRA 1SYXA 4D73B 2AB6A 2H1GA 1SD8A 3GH6A 5HFIA 2FHEA 3GURA 4IP6A 4GCIA 4POKA 3PINA 3CXGA 4MP4A 5CNWA 5ECNB 2LEGA 5JCUA 4JE1A 2TRXA 2IL3A 3HCZA 3GKMA 3ZTLA 2IMIA 3RPPA 5DAKB 4PUAA 2D2ZA 3F4TA 1A8LA 3IXRA 1T4YA 1H75A 4OFMA 4LMVA 4YQUA 3TJFA 1BQ7A 3LWAA 3G9BA 5KN2A 1XWAA 1GSDA 3ISOA 3GTUA 1YDKA 3HY2A 4IBPA 1U3AA 2XBIA 4V1Ag 4MLYA 1HNBA 3K8NA 4EE0A 1G0TA 4XS4A 5IMZA 3CSHA 5ECOB 3RAZA 1TP9A 4GSNA 5CRDA 11GSA 17GSA 2DJ3A 3IE3A 3KEBA 2IWTA 2C3TA 4FIWA 2CX4A 1TK5B 2CT6A 2AYTA 4WXTA 2TRCP 1GTUA 3QDNA 3KH9A 3W6GA 22GSA 2PN8A 2CVBA 1THOA 2HZEB 1F2EA 5ECMB 2ON5A 3IAS2 2AAWA 2GT5A 2VM1A 2EIRA 4MPFA 3QAVA 1MTCA 4PQHA 1YZXA 1BEDA 4F9ZA 2FLSA 2B3SA 3L0HA 1WPIA 3ZYWA 2VLUA 2Z9SA 1FOVA 3E3EA 1A23A 4E8HA 5B7CA 4ISDA 4ZL9A 5J3RA 4HI7A 4LMWA 4MZCA 5JCGA 1O6JA 2YWIA 4FH8A 1SENA 5B6NA 6GSSA 3QFAC 4BVXA 4MH2A 3C8EA 4NV5A 1XW6A 4HJ2A 2QSIA 1TRSA 5EY6A 2DIZA 2AHEA 4PNGA 2DMLA 4XRAA 2NDOA 5DQYA 3H4KA 3A5WA 2R6KA 4YQVA 1K0CA 3ZITA 3GUSA 3OR5A 1SL1B 3UAPA 3ZIVA 3IR4A 4K7NA 4IS0A 2GSSA 4Q5QA 3GHAA 2O85A 2C0GA 4RI6A 3TJJA 4IGJA 1T7PB 1ML6A 2VL2A 3TOTA 4KAEA 4EF0A 4NWYA 2JU5A 2NTOA 3IK9A 4EDYA 4KGIA 2O8VB 2VO4A 5AIXA 2V32A 1EGOA 3M3MA 3J7Yb 1Z6NA 4D73A 3VWUA 4O7HA 3TKSC 1TU7A 1KEBA 1WIKA 5HFKA 2WJUA 3GMFA 1K3YA 1VGLA 1GP1A 1N2AA 4GSTA 2CZ2A 2LRNA 1ZZYA 4AJ6A 1Z3EA 4DVCA 5DAKA 1XCCA 4EL1A 3F6DA 1K3OA 3UVHA 4EXJA 1OKDA 1T3BA 2L59A 4KH7A 1GSFA 2YP6A 5IQYA 4MF7A 2FD3A 4J2FA 4MJCA 1GLQA 4OCFA 5CO3A 1JFUA 4LL1B 3LXTA 2NPBA 3GN3A 3CTFA 1ERUA 4K6XA 2XPEA 1XIYA 4IJ3A 2B1LA 3NZNA 1A2JA 2LRCA 4ZB6A 1TI3A 1V40A 1TK0B 2LJKA 1F37A 5IO0A 3TJGA 1WOUA 3F4RA 1H4OA 2HLSA 1VF4A 1GLPA 2XBQA 4MJAA 2IMEA 3KMNA 1R4WA 2L57A 2HZFA 2OA7A 2VCZA 4OCEA 3ERWA 3D6IA 2HZEA 1SK0A 3ZIJA 3GKXA 3HZ8A 2YPMA 2M80A 5CREA 3M9JA 2ZNMA 2C8UA 2K8SA 2E2GA 2JACA 2O89A 2YWMA 3PH9A 5D73A 1WE0A 4IQAA 2KOKA 3GFKA 3L9UA 4MZWA 2B7JA 2WRTA 3FYGA 1R7HA 2I4AA 2GLRA 2AV4A 3P2AA 2LQQA 1DSBA 3IOSA 2CQ9A 1E2YA 1FB6A 1WWJA 2RUFA 5GAPD 3ZVJD 3G7YA 3VK9A 1U87A 1JLWA 4WR5A 3GA4A 5DCGA 1B9YC 1XOAA 4CHSA 4G19A 1OC8A 3H1NA 4KB3A 4IKHA 4MH3A 2MMAA 1VRSD 5ECRB 3EMXA 3HHVA 2CAIA 4PX1A 1BAYA 3ERFA 4I5QA 2DBCA 3C71A 5KN0A 5D93A 5F07A 2F3MA 2I81A 2WB9A 1B8XA 3VURA 1FHEA 4O92A 3GIXA 3BD2A 3KTBA 3GTUB 4G2EA 1GSSA 3I69A 4TR1B 3HJMA 3UMAA 4ECJA 5HQPA 1GUHA 2FUG2 1K0BA 3KP9A 4XS4B 1WRYA 1O85A 3GRXA 1F3BA 4BVYA 1OE8A 2VL3A 2AJQB 1PD21 2IMDA 3UARA 4XS6A 3C1RA 4FYUA 2IPAA 1WMJA 2R37A 2JZSA 4GSSA 4OWYA 1I9DA 1DUGA 3CBUA 4JBBA 3UIWA 4TR0A 1BG5A 2LS5A 1SU9A 3P90A 5IMFA 4EDZA 2DJJA 1ERWA 3IHQA 3D4TA 1SKSB 1PN9A 5CYYA 2C0FA 1GL8A 1A2MA 1K0AA 3KXOA 3D4MA 5DDLA 2H6YA 2O7KA 4KX4A 2B5YA 1MDKA 6GSYA 1XWKA 3ED3A 4NV2A 5IMCA 4OFNA 4GQCA 1THXA 2LQOA 4KCEA 3ZFLA 2H1DA 5D9TA 2ON7A 5HR2A 1K0NA 2C0EA 1A2LA 1YKAA 3DXBA 2GZYA 3GKKA 2FA4A 1XZOA 2K6VA 1GTBA 4N30A 3UBKA 3HKRA 1XXUA 1QUWA 3BCIA 1O73A 1HD2A 4ACSA 3LYPA 3I43A 3LEFA 4JU5A 4J56E 2EIOA 3G7JA 4NPBA 5G31A 2ZCTA 4OD7A 4I97A 2GGTA 4P3YB 2DJKA 1V9WA 2MMOA 3IK7A 4WBRD 1EWXA 2JSYA 2N5AA 3WYWA 3UL3A 1X5CA 3RBTA 1QQ2A 2CVDA 1J9BA 3U5RE 3LFLA 2H6XA 4WR4A 2CX3A 1S3AA 1K3LA 1KTEA 4MZBA 2A2SA 3Q6OA 5IMAA 4OFTA 5DQSA 4Q5FA 6GSWA 2DLXA 3KIJA 4N11A 2IIYA 1EGRA 4GLTA 2QC7A 1GTIA 3D22A 18GSA 5G5EA 2MBTA 4LA1A 4ZB9A 3ME7A 3EE2A 5IMVA 2C3QA 3HYPA 4MJBA 2P5RA 2FGXA 1SJ6A 2IMFA 1O8XA 5HR1A 4CW9A 1YJ6A 4OO5A 4ZBAA 4TXOA 4HZ4A 1USBA 1PSQA 2LRTA 3IAM2 3KP8A 4IVFA 2F8FA 1LU4A 4QL7A 5G1KA 5D9XA 4K0GA 1TXXA 1JZDA 2IN3A 3KZQA 3L78A 5H5SA 4TR1A 2H73A 2V41A 2J9HA 3S9FA 1EEJA 3HDCA 4DEJA 2WS2A 3KM6A 1OVNA 3HVXA 3N5OA 4AF2A 4XTSA 2OJLA 3TJKA 2J23A 1ACVA 1S3CA 4ECCA 4TOPA 3US3A 5HR3A 3G7IA 1U3IA 3P7XA 4ULXA 2ES7A 3FKFA 3HZ4A 5LD0A 3D21A 2A2RA 3MWHA 3EINA 1ZYQB 1TDIA 3UJ1A 1SKWB 3F3QA 1OC3A 1TJDA 1X5DA 2QKEA 3CTGA 2DMMA 3L9VA 3HA9A 2L4QA 2LUSA 2OE0A 2PVQA 4JZQA 4I2TA 4TXVA 2FWEA 1R26A 1Z9HA 4BWSA 1MEKA 2V2GA 4Q5NA 2CV4A 5H5QA 5IPHA 2H6ZA 1PQNA 3FEUA 2LKUA 2DJ1A 2XC2A 1VF1A 1LJRA 6GSUA 3DD3A 3V1WA 4WEYA 4N0VA 4KNDA 5GAND 2P5QA 3R2QA 3ZREA 4AJ7A 1HQOA 2H01A 2H1BA 4MA9A 2G2QA 2B5XA 2FWFA 14GSA 1CQGA 1G6WA 5E4WA 2VCVA 4XIHA 1QXHA 3APSA 4DSSA 3CRTA 2HSYA 1GUMA 1EV9A 4BL7A 2HE3A 2PU9C 3VI5A 5D9WA 3TDGA 1XVQA 5DALA 1AQVA 4F03A 2B5EA 3W8SA 3FR3A 3E9JB 4WKWA 4XRDA 4E8EA 3LG6A 4TW5A 3MNGA 3BBYA 5IPGA 1Z5YE 4L5LA 2VL2C 5FT3A 3WD6A 3EURA 4AGSA 3TKPA 3RHBA 5A4WA 1B48A 3ERGA 5LNKe 3CMIA 4ID0A 1A24A 1O8WA 3O6TA 4WBJA 2REMA 1V98A 1GSYA 4MCUA 1ABAA 1GSEA 5DVBA 4POMA 4K7OA 2OBKA 4O32A 1UC7A 4BWQA 1PRXA 1Q4JA 3GL3A 4HEA2 2CZ3A 2GDRA 4Q5RA 1EV4A 1TKDB 1URMA 3CSJA 5EVOA 3C1SA 3DKSA 1N8JA 4K0NA 4H86A 2MMNA 1EEMA 1V57A 1OAZA 5JWQB 4GF0A 4KCAA 1TRVA 2K9FA 3CYNA 5ECKB 4V1Ap 4KW6A 3Q19A 5GSTA 3TB2A 5EL8A 2LTKA 4N10A 1JZOA 2YV9A 3LJRA 1J0FA 3FZ5A 2PBJA 2F9SA 1V58A 2C0DA 3KH7A 2R4VA 1G7EA 4GRFA 1YKCA 2XPDA 5IO2A 3ZFBA 1B4PA 1IYIA 2VAFA 3EYTA 1Q98A 3HJOA 5J9BA 3GSTA 4XCSA 1FO5A 3RPNA 1YEXA 1EP8A 2O87A 3F8UA 2GT6A 1XBSA 3UVTA 7GSSA 1C72A 5LCZA 2X8HA 1M2DA 3LQ7A 3HVSA 3DIEA 2YANA 4MF6A 2MZCA 2I9HA 4EC0A 4XHMA 3HJPA 1SK2A 4HS1A 3DRNA 5IMDA 5GSSA 3VWWA 1SJZA 3GV1A 5JCWA 1U88A 2E2MA 2WFCA 1OC9A 4NXIA 4HDEA 4EUYA 4HJMA 5A4VA 4L5OA 3FZAA 5F0GA 1MDJA 1R5PA 3ME8A 4ML6A 4TXOB 5B8BA 1RK4A 4QL9A 3EVIA 4V2LA 4YAPA 2PERA 1RW1A 3ZZXA 4LL4B 4ZBDA 5G1LA 3EWLA 3A2XA 4DSRA 4HUAA 4TN8A 3W8JA 1A0FA 3QPMA 2VCQA 1XWGA 2YN1A 5AGYA 3C7MA 2GS3A 1E6BA 1ZOFA 3TRPA 2L4CA 1SYRA 2FCHA 2GZPA 1R5AA 2I1UA 1JHBA 4BPYA 1AC1A 2CA8A 3L4NA 3RHCA 3GH9A 4ZILA 4TR4A 3M1GA 3TRXA 3FZ9A 1X0RA 1M99A 2ZUPA 3LYKA 8GSSA 1FAAA 3IPZA 5C04A 1B4QA 2OE3A 4MPGA 1G6YA 2MYGA 4I2UA 3TOUA 4ZB8A 3QR6A 5ECQB 4KUNA 4WETA 2H76A 2NVLA 4TR3A 1VF3A 4RQRA 5HFGA 4TRXA 2A4VA 2IFQB 1B9XC 1NHYA 3DGQA 2LNSA 3TKQA 2NBSA 5C00A 2OKAA 5ECSA 3TUEA 1T4ZA 1EOHA 2I3YA 2L5LA 1XWCA 3Q74A 4GXZA 1M9AA 1YF0A 5EPFA 1M9BA 2E7PA 3BJ5A 3FZ4A 2F8AA 1BJXA 6GSTA 4IJIA 2H1AA 3N9JA 2B6MA 1OYJA 3J7Yk 4L0UA 1M7TA 5DCHA 3WT1A 2KP2A 3GYKA 2FWGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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