2QGVA

Crystal structure of hydrogenase-1 operon protein hyae from shigella flexneri. northeast structural genomics consortium target sfr170
Total Genus 23
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
23
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
TPFDALWQRMLARGWTPVSESRLDDWLTQAPDGVVLLSSDPKRTPEVSDNPVMIGELLHEFPDYTWQVAIADLEQSEAIGDRFGAFRFPATLVFTGGNYRGVLNGIHPWAELINLMRGLVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of hydrogenase-1 operon protein hyaE from Shigella flexneri.
rcsb
molecule keywords Hydrogenase-1 operon protein hyaE
source organism Shigella flexneri 2a
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 23
structure length 121
sequence length 121
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2qgvA00
4LL1B 3IK9A 3VK9A 5DDLA 2YZHA 4KNDA 2F51A 1FVKA 2VIMA 4K8MA 5IQYA 1K3LA 3WYWA 1SYXA 2VCXA 3HZ4A 1ERVA 1TTZA 2JZTA 2YOIA 1M9BA 3KP9A 3J7Yk 3A5WA 3FW2A 4J57E 1DE2A 4JR4A 2O85A 2WULA 4ZBBA 6GSWA 1SD9A 4XIHA 3GSTA 2JU5A 2X99A 4ILFA 3GX8A 2H70A 1PSQA 2YANA 3CTGA 1KBNA 4HQSA 5HFKA 2DLXA 1EP8A 3M3MA 5HR0A 2RLIA 2C3TA 2DJ1A 1PRXA 4TR1A 1RK4A 2H1DA 2YNXA 4MDCA 4YQVA 1EZKA 1KNGA 2FY6A 16GSA 2R6KA 4MLYA 5G30A 3TJJA 3ZIVA 3IAM2 3UMAA 4AJ7A 3KM6A 3GYKA 2GS3A 1AIUA 2RIIA 1DUGA 2O89A 1GULA 2I81A 3LFLA 4ECJA 3H93A 3GSSA 4G19A 2NVLA 3CRTA 4F9ZA 2PN8A 3MSZA 5ECMB 1TK8B 3RPPA 1V2AA 3S9FA 4RI7A 1K0OA 1QK8A 1T4YA 2G0FA 4EF0A 1SL1B 3DYRA 2AUVA 5ECQB 3EU4A 4CDOA 1GSFA 22GSA 2QKEA 2YWNA 2VM1A 1GUKA 4BA7A 1GTIA 1TI1A 5LNKe 3E0UA 1T8EB 3A2VA 1ZYEA 1OKDA 2M80A 1PX7A 3MWHA 3IPZA 3QDNA 3PH9A 1M0UA 3ME7A 3G7JA 3DWVA 6GSSA 1NSWA 1UC7A 4TVEA 3ZYWA 2HRFA 3ZREA 2GQKA 3C1RA 4ECIA 4ECCA 2R5GA 4KB3A 1JHBA 1HQOA 5D73A 1YKCA 4L5LA 5JWOB 1XW5A 2L5LA 5ELAA 2LJKA 5IIZA 5ABRA 1A23A 4EO3A 2LKUA 1ZL9A 4QL9A 2IMKA 3KH9A 1Z9HA 2YPMA 3VWWA 2YV9A 4POMA 3DGQA 5HFGA 2QSIA 3DRNA 2OACA 5IO0A 3APQA 1ERWA 1X9WB 4OCEA 3LWAA 3IK7A 1VF4A 2DBCA 3TUEA 1TK5B 3FZ4A 5ECLB 2RUFA 1Z6MA 3EMXA 3LSZA 2L59A 4WEYA 3NOFA 4ML1A 1X5DA 4KDYA 3E9JB 1XOBA 1X9SB 4ZXGA 4XHMA 3KGKA 3CMIA 1EWXA 2WB9A 2J9HA 1X0RA 4Q5QA 5GAND 1GSUA 4XS6A 3RHCA 2PUKC 5DAKA 4IBPA 3KJYA 4YQMA 4MJCA 4IS0A 2H74A 1EEMA 1GSEA 3HXSA 2LJRA 1SKSB 1JLWA 4IVFA 3CBUA 1ABAA 2GSRA 2G2QA 4PGTA 1M9AA 3F8UA 4ML6A 3QCPA 4KCEA 2FWEA 4KW6A 3TRXA 4PUFC 1Z5YE 4E8EA 3TKPA 2RM5A 2LS5A 3KTBA 4HEA2 5G1LA 1BEDA 3N5OA 1TOFA 4XS4B 3KEBA 11GSA 2H01A 4KUNA 3SWLA 2F9SA 2VCWA 5IMDA 5D93A 2H76A 1TRSA 3L9UA 1OC8A 2LQOA 3GL3A 2CVKA 2DJ2A 5KN1A 1XXUA 1XWBA 1O73A 3D0ZA 2CQ9A 4QQ7A 6GSYA 1PKWA 1LBKA 1I5GA 4KSMA 3L78A 1UVZA 3LQ7A 2OADA 1OYJA 3CSJA 9GSSA 1IYHA 4D73A 5GSSA 3F4RA 2YCDA 2O87A 2VM2A 2LEGA 3LXTA 3GFKA 1PD21 5ENUA 3RAZA 1WE0A 3GKKA 3IOSA 2HNLA 2HT9A 3W8JA 2GSQA 2VD1A 1BJXA 4I6XA 3FZ9A 2VLTA 2IL3A 2B5EA 3Q74A 4PUAA 3L9VA 3UARA 3IHQA 3C73A 4MF7A 3IE3A 4LLRA 2PMTA 5GSTA 3KXOA 2EIQA 4ZILA 4KDXA 1GL8A 2JZRA 1Z3EA 2WS2A 3G9BA 1Q4JA 1OC3A 1UA5A 5CRHA 2C8UA 3DMLA 3FR6A 1K0BA 3HYPA 2H71A 2H19A 1Z7PA 2M46A 3GV1A 4H86A 1RQMA 2GQMA 2CA8A 4FH8A 4HU7A 2H0IA 2FUG2 5IPGA 2E0QA 2P0GA 5CNWA 2CV4A 4OFTA 1K3YA 1K0NA 1EP7A 1WOUA 3ZVJD 1ON4A 4O5RA 4L5OA 5CRDA 5COHA 3Q18A 1QGVA 4BL7A 1NHYA 3KH7A 1A8YA 3VI7A 2TRXA 2VUPA 1ERUA 5A5KA 3TOTA 2HLSA 2OKAA 3LYKA 3APSA 4KA0A 3GL5A 4KDUA 1O8XA 3CRUA 2LV3A 1T4ZA 3LYPA 4MPGA 1XWGA 2AHEA 4BWSA 3ZL5A 1C72A 1FB0A 3O6TA 5CO3A 5C04A 4K1FA 3NIVA 1MD3A 4XRDA 2GDRA 5D9XA 1URMA 2AJQB 14GSA 5D9WA 4KSOA 2EC4A 4FYUA 4YAVA 4KAEA 2CZ2A 4BWQA 5IOXA 3KCMA 1X5CA 1TRWA 3IAS2 5DALB 2K18A 2TRCP 2CT6A 2VCVA 5EPFA 1F3BA 1AW9A 2LUSA 3SBCA 1DBYA 4HU9A 1M99A 1UN2A 2C0EA 1GSQA 3HJPA 4D73B 2HI7A 2HSHA 3TKSA 5ECIB 5AIVA 4MP4A 4GTUA 1HYUA 2H1AA 3UEMA 2F8FA 5G5EA 3P8WA 3M9JA 5HQPA 1TJDA 1JZDA 2WFCA 2L5OA 2H0GA 2K6VA 4JRRA 2P5RA 3HZ8A 2DMMA 4XS1A 1ZYQB 4MPFA 3HD5A 5IMZA 3HCZA 3RDWA 1WPIA 2YN1A 3US3A 3I9V2 1K0CA 1PKZA 4F82A 1XOAA 4POKA 4X1UA 2B1KA 3GMFA 3VPQA 2YV7A 4IKHA 4RI6A 4DSSB 1QXHA 2VOCA 5JCUA 1QMVA 4JBBA 5IMCA 1SYRA 2XPEA 4IELA 5A4UA 1ZCPA 1GH2A 3ZVJA 3GH9A 2CAIA 2F3MA 2NBSA 1NHOA 2DJ0A 4TKYA 3IV4A 3DD3A 3ZIJA 1F37A 2AYTA 5HR2A 2A2RA 3GTUA 4KCAA 3TB2A 2VCTA 2WCIA 4WF5A 3D6IA 2H1BA 1O85A 5CP1A 1OC9A 1A2MA 1XW9A 5F0GA 1LJRA 3ERWA 1A24A 1J9BA 17GSA 1KEBA 2CX3A 2PPTA 2HSYA 1K0AA 2IFQB 3O76A 2KUCA 3GNJA 6GSVA 3IR4A 4DVCA 3UIWA 1PGTA 3GKXA 1YZXA 2IMIA 3LJRA 4IW9A 4K7IA 3GRXA 1GSDA 2K9FA 3FK8A 5A4VA 2V6KA 2HXKA 2H66A 4EUYA 2C0FA 4ACSA 4GSNA 1PX6A 1S3AA 3APOA 1AAZA 4LL4B 4HI7A 3F6FA 1O81A 1B4PA 5DCGA 4QL7A 2REMA 5DCHA 2FWFA 1HD2A 4HZ2A 3MNGA 4NHZA 3I43A 1WIKA 4K7NA 2IMEA 1F9MA 4L8EA 2N5AA 5FWGA 1M2BA 1YEPA 3FR3A 3ZMLA 2NPBA 3LGCA 4AF2A 5D9VA 5B6NA 3I6AA 1WP0A 2GT6A 1YY7A 4ZBAA 5IO2A 2X8GA 3QAGA 4X43A 1HNCA 1SJZA 2ALBA 3EURA 4ZB6A 2C4JA 4NMUA 2AAWA 2V6OA 4IJIA 1TDIA 1BQ7A 3C1SA 1SK2A 2NDOA 1T00A 1AUCA 2N5BA 3EE2A 1ZMAA 2CX4A 3UJ1A 5IOWA 1EEJA 4MZCA 4V1Ap 2LQQA 3VPTA 2C80A 5CYYA 5ECHB 5JCGA 2LRCA 3PR8A 2JSYA 1FOVA 5IPHA 4MA9A 2R3XA 4LA1A 4WBRD 1GLPA 5ID2A 1K0DA 2FGXA 2XBIA 1ML6A 4FO5A 5JWRB 3IC4A 5DVBA 3P2AA 2BTOT 2FD3A 1O7UA 2KHPA 1PN9A 1R4WA 3HJMA 3UOMA 4BPYA 3TKSC 4GQCA 1SL2B 4GXZA 1BG5A 1WRYA 5G31A 5AISA 1OAZA 3DXBA 2LRNA 3ME8A 3IA1A 3L4NA 1U3AA 5L71A 2GQLA 1G7OA 4TR1B 2E2MA 1XW6A 4K9ZA 2VL2A 3ZFBA 2H6XA 1FHEA 2LSTA 1YF1A 5ELGA 18GSA 2MMAA 2L4QA 1TW9A 3F3QA 2LRTA 1CQHA 4MCUA 3KP8A 1M2DA 1SU9A 2IPAA 4POBA 13GSA 1HNBA 3FHKA 3TJFA 2B7KA 2H8LA 2JL4A 2MMZA 2GZYA 1N8JA 3ZLPA 1JZOA 2PWJA 2X64A 4IJ3A 3QAVA 1G7EA 3LXZA 6GSXA 2C0GA 1WWJA 2GGTA 2R2JA 3A2XA 4Z7XA 4I8BA 4OO4A 4EXJA 1N2AA 2VL9A 3TRQA 4OD7A 1YEXA 1QUWA 1H4OA 3UL3A 1FVJA 3UBLA 3ED3A 2GSTA 5ECRB 2VD0A 3HHVA 1XVWA 5CREA 1A0FA 1XWKA 3VWXA 4V1Ag 4LMWA 4N0VA 1MD4A 5LCZA 1XCCA 4TR4A 1SJIA 2B1LA 3GN3A 4F2IA 4WKWA 5B8BA 4MMMA 3ERFA 4ISDA 4LMVA 3FKFA 4FIWA 1EV4A 4ULXA 2R4VA 2H75A 1U3IA 3W6GA 3BD2A 1R5PA 4TOPA 4KX4A 2ZCTA 4GSTA 2MMNA 6GSUA 3QAWA 3IXRA 3EVIA 1OKTA 2F8AA 2CZ3A 1USBA 2YWOA 4EE0A 4K2DA 1V58A 1PL2A 3GIXA 1EOGA 2DIZA 2RM6A 3L0HA 2HZEA 4NXIA 4J2FA 3WT2A 10GSA 5HFIA 4EKZA 3M1GA 3DIEA 2B3SA 3W8SA 1R5AA 4V2LA 5J3RA 3HVSA 2L6CA 1GRXA 4P3YB 2OE3A 1RW1A 5EL8A 4MF6A 3GKMA 1W4VA 2V1MA 3F9UA 3GH6A 4ID0A 4O7HA 3TGZA 2PVQA 3ERGA 1THOA 2H72A 1VF1A 2H30A 3PGTA 3KIJA 5DAKB 1KTEA 1XVQA 1XPVA 3BJ5A 4TXOA 1Q98A 4OCFA 1U88A 1FW1A 2LJAA 2XPDA 4XTSA 3KD0A 2OJLA 3VLNA 5CRWA 2I9HA 4IP6A 5J41A 2OE1A 3LEFA 1DE1A 5INYA 3TDGA 2R37A 4IN0A 3GKNA 1Y25A 2JZSA 2WDUA 4Q5NA 4XCSA 1TRUA 1J08A 4MH3A 3EMPA 1H75A 2B5XA 2C3NA 2EIOA 2X8HA 4F0BA 3TJBA 3TJGA 3Q6OA 2FLSA 1PQNA 4TXVA 5IMVA 3M9KA 3FZ5A 2CAQA 1SKWB 4KGIA 1GTAA 1FB6A 1SK0A 4RQRA 4JR6A 1T7PB 4PNGA 3ZMKA 2IN3A 5E59A 2H73A 4GLTA 2VL2C 4OFNA 3DVWA 2FA4A 5J4UA 4F03A 2WZ9A 4IGJA 5G5FA 2KOKA 2MMOA 1A2JA 2B5YA 3EWLA 2MBSA 5ECPB 4V2NA 4HS1A 4NV2A 4HJ2A 3TOUA 5A4WA 3ZTLA 1V57A 5DJMA 4NAXA 3WGDA 5B7CA 4JE1A 4MZBA 2FA8A 2PERA 4YQUA 3KZQA 1GLQA 3HVVA 2I1UA 4HZ4A 2VO4A 4BVXA 4YAPA 3H1NA 1EGRA 2VCZA 2IIYA 2L6DA 3TKQA 3L9SA 2ES7A 1ERTA 3VFIA 3WGEA 3VURA 1OE8A 4NV5A 2GLRA 1GUHA 1WJKA 5JCWA 2XC2A 5KEJA 3BCKA 5H5SA 1XWCA 1XBSA 1A0RP 5G1KA 3G7IA 4TR0A 2B6MA 2DSAA 3KMNA 2DMLA 4TRXA 4Q5RA 1TXXA 1MEKA 2FHEA 3D5JA 1MDJA 2WRTA 4OWYA 1YDKA 2ON5A 2M72A 4MK3A 5ECNB 3D4TA 1GNEA 1E2YA 1VF2A 2LTKA 3IRAA 2HYXA 1R26A 4HDEA 5H5RA 4Q5FA 3U6VA 1BAYA 2WJUA 3HVXA 2ZUPA 4MZWA 3EYTA 1AXDA 3FZAA 2DC5A 1X5EA 2KP2A 4L0WA 1F6MC 3MAKA 3NZNA 1Z7RA 5CAXA 8GSSA 2MBTA 2NTOA 2P31A 1NW2A 2IMFA 1OE7A 2X8CA 3TCOA 1SENA 4AJ6A 4O92A 2H6ZA 1XWAA 2YWMA 2J23A 5IMFA 1IYIA 1JFUA 1GTBA 5DJLA 2BJXA 4AGSA 2MYGA 3N9JA 3ZZXA 2YJ7A 5D96A 5AIXA 1QQ2A 3WT1A 2PVOC 1Z6NA 2LNTA 2ON7A 2C1YA 3QPMA 1TI3A 5ECKB 2E7PA 1TP9A 2TIRA 2K8SA 3EU3A 4PXOA 1F2EA 4POLA 4ZBDA 4ZIJA 2HZFA 4E8HA 1MDKA 1FG4A 4WF4A 3J7Yb 19GSA 3M0FA 4GSSA 3UVHA 5AGYA 4HQZA 1JZWA 3GHAA 2PBJA 4FYBA 2KLXA 3GA4A 2XHFA 2GZZA 2AV4A 1ZZYA 4DSQA 3D4MA 2FNOA 3VWUA 3RPNA 2GTUA 4XS4A 2DJKA 3CTFA 5AN1A 4ZB8A 1A2LA 4ECBA 4RUVA 1U87A 3HY2A 4J56E 3HA9A 5CRGA 4F0CA 2H1GA 4MJBA 5F8BA 3FEUA 1BX9A 4GRFA 1FAAA 3C7MA 4V2MA 4I2TA 2E2GA 2L57A 1K0MA 1O8WA 3QMXA 5J5NA 4GF0A 3GTUB 4YH2A 3AY8A 3VWVA 3E3EA 3A3TA 4HJMA 2KP1A 1OC9B 3TKRA 4IHUA 4TN8A 4AJ8A 4CHSA 2MZCA 1YJ6A 3FR9A 3LG6A 3CXGA 5E4WA 1JLVA 3K8NA 1S3DA 1J0FA 3RBTA 5G2ZA 3O3TA 2PU9C 4K7OA 5J9BA 2JSZA 4TW5A 2VL3A 4DEJA 3F63A 1YKAA 4X0XA 4K0GA 3MDKA 1B48A 2WGRA 1B8XA 2IWTA 4K6XA 4OO5A 4BVYA 4CW9A 1GTUA 4PNFA 5DBQA 3TJKA 2L4CA 1PA3A 5ECSA 2HE3A 3ZFLA 3FRCA 2DIYA 1CQGA 1O6JA 1SD8A 2VCQA 1MDIA 2YP6A 2YJHA 5C00A 5FT3A 3ZITA 3C8EA 3RHBA 1BYEA 4PQHA 1WMJA 1ST9A 1V98A 2O7KA 5GAPD 2DJJA 1T3BA 1AC1A 1V40A 3GX0A 4WR4A 1I9DA 2QGVA 1NM3A 3BBYA 3WGXA 1Y6EA 3GURA 4I97A 2V32A 1LU4A 4NHWA 4WXTA 4WR5A 3FY7A 5IMAA 4HUAA 5J9CA 5KN3A 2K8VA 1M2AA 2OBIA 4DSRA 4IQ1A 3ZRDA 3TRPA 1R7HA 1EOHA 2V2GA 4JEDA 2P5QA 4L0UA 3UAPA 2GVPA 5H5QA 2ZNMA 1SK1A 7GSSA 4EVMA 1EGOA 5EY6A 2YWIA 3DEXA 3FYGA 2EIRA 1DSBA 1G0TA 3F4SA 4ZL7A 5F06A 2DJ3A 2I4AA 2FCHA 4I5QA 4EL1A 5ID2B 2VLUA 1ACVA 2H6YA 3LORA 1XZOA 5DALA 3VI5A 3CYNA 3QD9A 1G6WA 1S3CA 4PQ1A 2FWHA 2YZUA 2A4VA 2GZPA 3HKRA 4G2EA 1OVNA 1HNAA 3P90A 3TKSE 1FO5A 4JU5A 2CVBA 1E6BA 3DVXA 3H8QA 3D22A 3DKSA 5KN0A 2B7JA 1GP1A 1TRVA 2I3YA 2OE0A 4ZB9A 1A8LA 1M7TA 1QFNA 4JZQA 1X9MB 2HFDA 4PQIA 4PX1A 5DQSA 6GSTA 3F4TA 4N11A 3QFBC 3PINA 3H79A 4N30A 4WBJA 1AQVA 3QFAC 1ZGNA 4IQAA 2OA7A 1W89A 2C3QA 4GCIA 4WETA 4OMVA 1VRSD 2RUEA 3D21A 1SJ6A 5HR3A 1G6YA 1PMTA 2JADA 3M8NA 1GNWA 4G10A 5B6MA 2HRNA 2V41A 2IJYA 3A2WA 1V9WA 1ILOA 5HR1A 4MH2A 4DSSA 1B4QA 3CSIA 3UVTA 5B8AA 1AQXA 1YQ1A 3QR6A 4KE3A 3U5RE 4GQFA 4EDZA 1VF3A 3KTLA 3OR5A 5JWQB 3BCIA 4K0NA 4NWYA 20GSA 2D2ZA 3IBHA 2LNSA 1U6TA 1TKDB 12GSA 4IP1A 5F05A 2VAFA 5ECOB 1TK0B 4XRAA 5F07A 2GSSA 2VLVA 3V1WA 1PL1A 1GUMA 1THXA 2C0DA 1XFLA 4NPBA 1JZRA 2CVDA 3QOUA 1GSYA 2IFQA 3H4KA 1EV9A 4RQXA 3KMOA 2XBQA 2IMDA 4OFMA 3ISOA 4N0ZA 5DQYA 4MF5A 2JACA 2H0HA 5D9TA 2A2SA 2AB6A 4O32A 1SKRB 3EINA 1AQWA 4G9HA 1TU7A 3UBKA 3EC3A 2BMXA 5FHIA 2N5FA 1B9YC 1F3AA 2FWGA 5KN2A 3BOAA 2HZEB 3WD6A 5EVOA 1VGLA 2Z9SA 1XIYA 1K3OA 2PGTA 3F3RA 5IM9A 3IDVA 3I69A 3P7XA 3Q19A 1GSSA 4MABA 2GT5A 5LD0A 4EC0A 1B9XC 2O8VB 4EDYA 2QC7A 1ZOFA 1MTCA 2OBKA 4MJEA 3JCML 3C71A 3F0IA 1GWCA 1YF0A 4TXOB 4ZL9A 3R2QA 4HOJA 4ZL8A 4GWRA 3GUSA 4TR3A 4KH7A 4FYCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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