2QGVA

Crystal structure of hydrogenase-1 operon protein hyae from shigella flexneri. northeast structural genomics consortium target sfr170
Total Genus 23
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
23
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
TPFDALWQRMLARGWTPVSESRLDDWLTQAPDGVVLLSSDPKRTPEVSDNPVMIGELLHEFPDYTWQVAIADLEQSEAIGDRFGAFRFPATLVFTGGNYRGVLNGIHPWAELINLMRGLVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of hydrogenase-1 operon protein hyaE from Shigella flexneri.
rcsb
molecule keywords Hydrogenase-1 operon protein hyaE
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Shigella flexneri 2a
total genus 23
structure length 121
sequence length 121
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2qgvA00
2RUFA 1C72A 1PA3A 3CSJA 2LNSA 1UN2A 4ZILA 2L59A 2WDUA 1RW1A 2GS3A 3ZZXA 2OE3A 4E8HA 1BAYA 10GSA 4TVEA 1TRUA 5KN0A 1WMJA 3QAVA 2VCTA 1A2MA 1ML6A 1SKRB 4POBA 3WD6A 4EKZA 4K7NA 2YWMA 3I43A 2HRNA 5E4WA 5JCGA 3QR6A 5ECHB 6GSVA 3NOFA 2EIQA 2GQMA 4N11A 2GGTA 3IR4A 1VF4A 3ZL5A 4EDYA 1OE7A 4N0ZA 3LFLA 6GSWA 1VF3A 4ILFA 2FUG2 1QMVA 8GSSA 1A2LA 2H1GA 2PPTA 3V1WA 5IM9A 2WFCA 5HR1A 3ZVJA 1K3LA 2DLXA 4TN8A 4WKWA 2H75A 5ID2A 1K0DA 1NHOA 2XC2A 4MA9A 4KNDA 2LRNA 1FVJA 4L5OA 4IW9A 5G5FA 4POLA 1UVZA 2C4JA 1FG4A 1RQMA 3QMXA 2R6KA 1HNCA 1EV9A 4QL9A 2BJXA 3CYNA 5G30A 1ACVA 1BX9A 2GQKA 4HZ4A 3GUSA 5G2ZA 1TU7A 4HQSA 4LA1A 4JZQA 1FHEA 1B9YC 3LORA 1XVQA 2GZYA 1TK5B 4GSTA 4GCIA 1GSDA 1U3AA 2FA4A 1SKSB 13GSA 3GHAA 3J7Yb 4ZBAA 3US3A 1DE2A 3ZMKA 4H86A 3Q18A 5KEJA 3KZQA 1FW1A 5D9WA 3FZAA 4ZL9A 3C1RA 3GTUB 5ECKB 2OADA 3KTLA 4OMVA 4EE0A 2C0EA 2J23A 3HJOA 1XW9A 4BL7A 5IIZA 4NV2A 3K8NA 1UA5A 3F4TA 1A0RP 4O32A 3A3TA 2VIMA 3GSSA 1M0UA 4POKA 2C3NA 2HT9A 4J57E 2C3QA 2EIRA 1T1VA 1XOAA 1G6WA 5CYYA 3F8UA 4I6XA 1PX6A 3CBUA 4XHMA 1G6YA 2V6KA 3HVSA 4K0GA 1JZRA 4FO5A 1K0MA 1MD3A 2VL2A 5GSTA 1PKWA 3RPNA 2HI7A 3C73A 1T4YA 2ZNMA 2FGXA 2C80A 2VCVA 2H66A 2DIYA 3FY7A 4FYCA 5INYA 5LNKe 1QQ2A 5D9TA 4MK3A 4J56E 1XWKA 2WCIA 3F3QA 2CAIA 5DAKB 1V40A 2RLIA 4DVCA 1GLPA 3GTUA 4K1FA 1MDJA 1RK4A 2VCXA 1B4QA 5HR2A 2V2GA 1EGRA 2HE3A 4LLRA 4YQMA 2IFQA 4ID0A 4FIWA 2GDRA 3FZ4A 1URMA 1Z9HA 3F4SA 5A4WA 1VF2A 2LJAA 2N5AA 3TCOA 1AIUA 2IWTA 5ELGA 2H70A 3F63A 2BMXA 3Q74A 1GSEA 3C8EA 1QXHA 3CSIA 5HQPA 4L0WA 1EP8A 1S3AA 3LXTA 1AW9A 1Z3EA 3ERWA 1Z6NA 3ZIVA 4YAVA 1GTIA 4V1Ap 4ML1A 4GSNA 5F8BA 1BEDA 1EZKA 4NHZA 3CTGA 3MNGA 1K0OA 3TKSA 5ECOB 4ECJA 2PVOC 3ZFBA 3IAS2 6GSTA 2OJLA 4BVYA 3HYPA 4HEA2 20GSA 3QAGA 1J08A 3ZMLA 1XIYA 2I3YA 4MZCA 4K2DA 4POMA 4I5QA 1HQOA 1XZOA 4K8MA 2PWJA 3FRCA 1V58A 4PQIA 2XBQA 4J2FA 4KCAA 4IELA 1K3YA 1YZXA 3CSHA 2XPDA 4GQFA 3E3EA 1XVWA 1Z7RA 2IMFA 5GSSA 5L71A 4Z7XA 3QDNA 4JEDA 2WS2A 2DIZA 2MMAA 3O6TA 5A4VA 1XWAA 2YWNA 1AUCA 5ECSA 2ON5A 4GQCA 4PUAA 5CP1A 5D9XA 2ZCTA 2H30A 2IMKA 3TRQA 2VM2A 1K0AA 3MAKA 1WRYA 5G5EA 3W8JA 1SL1B 1OYJA 1DSBA 2MMZA 2DJ3A 4ECBA 3GSTA 3VWUA 3VK9A 4IJ3A 3SBCA 2GTUA 3EMXA 4BA7A 1ZMAA 4RQXA 3EINA 3ME7A 4MJCA 5CRDA 3CXGA 3A2XA 4QQ7A 3VLNA 5ABRA 4OFNA 4EO3A 4K7IA 3UBKA 1YEXA 1Q98A 4K6XA 4WR5A 1WP0A 3WT2A 3UL3A 1G7OA 17GSA 2GSQA 1SENA 2WB9A 2LQQA 5J41A 1H4OA 4XRAA 3TGZA 1F2EA 1T8EB 2H72A 3GV1A 1WOUA 4KB3A 2FWHA 2HSHA 2H6XA 4KUNA 4ZBBA 2E7PA 4MLYA 5ECIB 1OC9B 2RM5A 3MSZA 5JWQB 2WZ9A 2PN8A 1A8YA 5CREA 2F8FA 4OD7A 2ALBA 5DQYA 1XXUA 5CRWA 4OO4A 2CZ3A 4WETA 2IL3A 2I1UA 4EVMA 1PMTA 1A8LA 3DRNA 1TKDB 3C71A 3HDCA 4I2TA 5DALB 3KJYA 1PGTA 2JZRA 2X8GA 1PKZA 3UVHA 3GH9A 1GSUA 3VURA 5EVOA 3WGDA 3HJPA 1ZGNA 3ME8A 4IN0A 2VD1A 3VWWA 1O7UA 1XPVA 4JU5A 2H19A 3VPTA 4JRRA 2RIIA 3GH6A 2HZFA 1SK2A 2KOKA 1K0CA 1WWJA 3ZVJD 3TKSE 2AJQB 4FYUA 1U6TA 1BQ7A 3C7MA 2QSIA 2B5XA 4XS1A 4YQUA 5JCUA 3U5RE 4PNGA 3TJBA 4AJ7A 3NIVA 2GSRA 4KX4A 4MDCA 4PXOA 5GZZB 4TR0A 3NZNA 5D73A 5DCGA 3WGEA 4I8BA 4MZWA 1AQXA 1A2JA 1ST9A 4HU7A 1SYXA 4JR6A 5DALA 4IQ1A 4OCEA 2HLSA 4BWSA 2DJJA 1OAZA 3I9V2 3P8WA 1M9BA 3ZYWA 3DWVA 4TR4A 4L8EA 1T00A 3EURA 3KP9A 1GULA 5AISA 2VLUA 7GSSA 4OFMA 4P3YB 5F07A 2CX3A 1WIKA 5ECLB 5EY6A 2FWEA 1F37A 3IV4A 2JADA 4RQRA 3UAPA 1T3BA 2F9SA 2LS5A 3GKXA 3GIXA 2LQOA 2LV3A 1TK0B 3KP8A 2ES7A 3CMIA 1X5EA 2YP6A 4KDUA 3VFIA 4MF7A 2O89A 2LRCA 4WF5A 1KBNA 3I69A 4IP1A 4ECCA 4KDXA 3APSA 4ACSA 4TOPA 2MMNA 3HZ8A 1NM3A 1TOFA 4MH3A 4GF0A 3FK8A 4Q5RA 2K18A 6GSYA 1EEJA 1BYEA 1TK8B 3QCPA 3M3MA 3PR8A 1ZYQB 5CAXA 2IPAA 19GSA 1SD8A 3LGCA 4TRXA 4ISDA 2VUPA 5IOXA 3D0ZA 1Y25A 3HA9A 2GT6A 3IRAA 5D9VA 2H0HA 2C0DA 4RUVA 2Z9SA 3FR3A 16GSA 2YANA 2GQLA 2NPBA 2E2MA 2J9HA 2NBSA 2A4VA 1YDKA 3M1GA 1PL2A 4ZIJA 3EE2A 4LMWA 1I9DA 1SK0A 2KUCA 2OE1A 5B8AA 4GLTA 2DMLA 2FHEA 2F3MA 5CO3A 1X9SB 1YY7A 2OACA 4O7HA 2VAFA 3W8SA 1V2AA 4IBPA 1GTBA 1QFNA 2VCWA 1JZOA 4WR4A 4F0CA 5DCHA 2L6DA 3GX8A 4PNFA 1FO5A 2IMIA 5D8IA 2CAQA 4PURA 4LL1B 1PN9A 1VF1A 1AC1A 4IP6A 5AN1A 4ULXA 5KN2A 2IFQB 3KMOA 2VL2C 4KAEA 3O3TA 3LXZA 2X8CA 3AY8A 1Z6MA 3TOUA 4G9HA 4MJAA 2YZHA 4ZB6A 3LYKA 1XFLA 3F6DA 3ZITA 1GH2A 1A23A 3TRPA 4MABA 3A2VA 3DVWA 1A0FA 4XCSA 1GUKA 3D22A 1HYUA 1TRVA 3D6IA 3U6VA 2C1YA 2PUKC 1THXA 4OO5A 5F0GA 2LJRA 2JZSA 3GA4A 4ZL8A 4K0NA 4K7OA 4DSSA 3QD9A 3C1SA 5AGYA 4JE1A 4EL1A 3IAM2 2JSYA 3FR9A 4XIHA 1Y6EA 4CDOA 3DKSA 4F9ZA 1YF0A 2VD0A 3PINA 2OKAA 2R2JA 2CT6A 2QGVA 1M2BA 4EXJA 2FA8A 3IK9A 2C0GA 2O87A 2HNLA 4IJIA 2LTKA 1SU9A 4Q5NA 4JR4A 1GLQA 2B5YA 2A2SA 4MZBA 2V32A 2YZUA 3M9JA 3TKSC 2AAWA 2JZTA 1B48A 12GSA 1R5PA 5IO2A 6GSXA 4KCEA 3P90A 5D96A 5KN3A 2MBSA 3R2QA 2KLXA 1U87A 1T7PB 4V1Ag 1O8XA 1AXDA 3D21A 1GUHA 5G31A 3UVTA 4NPBA 1X5CA 2F51A 5HFKA 2PERA 2L6CA 1H75A 3TUEA 4WBRD 1AQWA 2V41A 3P7XA 3VPQA 1BJXA 1XBSA 2B1KA 3IE3A 4NMUA 2GVPA 2JACA 4HS1A 2PVQA 2H74A 1SJZA 2IJYA 1YJ6A 4EDZA 4HJMA 1X0RA 2PGTA 2YV7A 4TR3A 1M2AA 2HZEB 1JHBA 3DGQA 3EVIA 4XRDA 4BPYA 2OE0A 1TTZA 2WRTA 1XOBA 5B6NA 2VL3A 1GL8A 1GTAA 2WULA 3VI7A 3S9FA 1R7HA 3CRUA 3IC4A 3ZREA 1ERWA 3FZ9A 2X64A 3QOUA 2XPEA 1AQVA 3O76A 1YQ1A 1K0BA 1N2AA 2AHEA 1M2DA 2M80A 2MYGA 3L4NA 4PQHA 1Z7PA 2AUVA 5FHIA 3WT1A 3N5OA 1XCCA 3WYWA 3WGXA 3RHBA 1QK8A 1F9MA 9GSSA 2H73A 5C04A 2YWOA 3J7Yk 3MWHA 4Q5QA 1PD21 3FEUA 2E0QA 2HSYA 2B3SA 1X5DA 3KMNA 3RDWA 2HZEA 3JCML 1TU8A 2WJUA 5EL8A 4L0UA 1N8JA 3PGTA 2P0GA 2PBJA 2I81A 3HCZA 4ZB8A 2QKEA 2CA8A 5D93A 3TKPA 4MF5A 5G1LA 4K9ZA 4X43A 1R4WA 1OKDA 4BVXA 3ZLPA 5IPGA 5LCZA 1EGOA 3GKNA 2G0FA 2EC4A 2LJKA 5IMFA 4ZXGA 3RPPA 3DVXA 1WE0A 4WF4A 3GL3A 5COHA 4LMVA 2MBTA 2C0FA 3ED3A 1E2YA 3EC3A 2JSZA 4XS6A 2TRCP 3W6GA 3F6FA 5ENUA 3QFAC 2LUSA 1O81A 1V98A 4O5RA 1SJIA 3ERFA 3KGKA 4GRFA 3F9UA 1GUMA 3EYTA 1TP9A 1B4PA 2C3TA 1T4ZA 4GTUA 4YAPA 4EF0A 2YJ7A 2XBIA 1ZCPA 1KNGA 5GAND 2LSTA 3M8NA 2GSTA 5ECRB 4ZB9A 3H8QA 6GSUA 5HFGA 3FZ5A 2DBCA 2H71A 3HHVA 2JU5A 1ERTA 3UJ1A 4D73B 5HR3A 3F0IA 4DSQA 5IQYA 1OC8A 3TOTA 4XS4A 2RM6A 4DEJA 3IK7A 2FWGA 1O8WA 2AV4A 4EC0A 1YKAA 4ZBDA 5A4UA 1X9MB 3LJRA 1TDIA 4LL4B 5IMAA 2FD3A 2HRFA 2YJHA 3UEMA 2V1MA 1MD4A 2GLRA 1FVKA 1ZYEA 4HI7A 2L5OA 4N0VA 1SD9A 1SJ6A 4L5LA 2VOCA 1F3BA 5DVBA 4O92A 1B8XA 4I2UA 3ZRDA 2B6MA 2GZPA 1TRWA 3VWXA 3EWLA 3KTBA 5ECNB 1GSQA 1GSSA 3L78A 18GSA 1QGVA 3IBHA 2K9FA 4TXOB 2B1LA 3FKFA 5DQSA 1GRXA 4D73A 2L57A 1BG5A 5CRHA 1SL0B 2H1DA 4DSRA 4F0BA 3H1NA 4G10A 3IPZA 4G19A 2I9HA 3LSZA 4NWYA 2DSAA 1U88A 4ECIA 1NSWA 5B6MA 1EOGA 1YKCA 4RI7A 2B7JA 3A5WA 1ILOA 5ECQB 5J4UA 2GSSA 2N5FA 1NW2A 4OCFA 3GURA 3GMFA 1HNBA 4HOJA 4MF6A 4F03A 2B5EA 2F8AA 4FYBA 1GNWA 4MCUA 1ZZYA 3TJKA 3HXSA 4G2EA 1ZOFA 1UC7A 5F05A 2PU9C 1O73A 2VLVA 4KSMA 4TW5A 5F06A 3SWLA 3ISOA 5ELAA 5FWGA 3KCMA 4AJ6A 1PL1A 3UIWA 3GN3A 3GKMA 3KD0A 3KEBA 1XWCA 2DJ2A 5LD0A 2K8VA 3L0HA 4TXOA 5JWOB 3APOA 1JLWA 3IXRA 4N10A 2MZCA 2H01A 3HVXA 3G7JA 3M0FA 3TJFA 5E59A 1FB0A 5HR0A 2H6ZA 3H4KA 1EOHA 1S3CA 3TJGA 2YOIA 4HZ2A 4AGSA 4MMMA 2RUEA 2YN1A 3HZ4A 2O7KA 2DJKA 4DSSB 3BOAA 5IMDA 2M72A 1V9WA 4RI6A 3E9JB 2X8HA 5IMCA 2DJ1A 1U3IA 3G9BA 4KGIA 1TJDA 1EEMA 3I6AA 1LJRA 1PSQA 3MDKA 1Q4JA 4Q5FA 2KP2A 4KH7A 2K8SA 5C00A 1ZL9A 2H0GA 4TR1B 3CRTA 3Q19A 4MH2A 3VI5A 3ZFLA 1KEBA 4IVFA 2EIOA 2CZ2A 1EV4A 3BD2A 3Q6OA 4IHUA 2FWFA 2JL4A 4ML6A 1M7TA 1GP1A 2CQ9A 3KIJA 4HDEA 4MP4A 4TKYA 2HXKA 2OBKA 4CHSA 2FLSA 3KH7A 1M99A 2DJ0A 3FYGA 4HJ2A 2O85A 2H8LA 2CVDA 4WEYA 1F6MC 5CNWA 2AB6A 1SK1A 3TKRA 3F4RA 14GSA 3D5JA 4V2NA 2NDOA 1JLVA 4PGTA 2KHPA 2X99A 2VO4A 4HUAA 2YPMA 3RBTA 4JBBA 4HQZA 1PRXA 3ERGA 1OKTA 3GRXA 4IQAA 5ECPB 3EMPA 3OR5A 5AIVA 1IYHA 3HY2A 4KDYA 2D2ZA 4GXZA 3DD3A 3LEFA 4IGJA 2R4VA 2C8UA 1EWXA 4IS0A 2OA7A 1WJKA 3QAWA 2QC7A 3D4MA 4MJEA 5HFIA 1JZDA 2VM1A 2V6OA 1FB6A 5KN1A 4WXTA 3GX0A 1VGLA 2E2GA 4TR1A 3UOMA 1X9WB 2AYTA 2VL9A 1HNAA 2BTOT 5IPHA 2WGRA 3L9VA 4IKHA 1GSYA 2L4QA 2NVLA 3HVVA 3E0UA 4KE3A 4FH8A 5JCWA 1B9XC 2K6VA 5IMZA 1S3DA 2A2RA 2P5QA 4F2IA 1LU4A 3APQA 2HFDA 5J9BA 4GWRA 4MJBA 4OWYA 4V2MA 1LBKA 2OBIA 1NHYA 1GTUA 4WBJA 1GWCA 1IYIA 4MPGA 1DE1A 3RHCA 3IA1A 2I4AA 1MDKA 4PX1A 2H1AA 1ABAA 4KA0A 2DMMA 3N9JA 3A2WA 5DAKA 3KXOA 4F82A 3HKRA 3D4TA 1A24A 5IOWA 3LQ7A 2MMOA 3CTFA 2M46A 3GFKA 3BJ5A 1OC3A 2REMA 3HJMA 4KSOA 2LEGA 3UBLA 3GL5A 6GSSA 2O8VB 4OFTA 3TB2A 3UMAA 1V57A 3RAZA 5GAPD 4XTSA 2VCQA 2KP1A 4NV5A 3UARA 3GNJA 2YCDA 1TI1A 1PX7A 4CW9A 2GT5A 1TXXA 3ZTLA 1DUGA 5EPFA 1OVNA 3FW2A 3P2AA 4X1UA 2P31A 22GSA 2NTOA 2R3XA 1R26A 4N30A 1XWGA 3PH9A 3KM6A 5J9CA 1FAAA 3LG6A 2LNTA 3BBYA 1W89A 1O85A 1TI3A 2CV4A 3G7YA 2VCZA 5G1KA 3DEXA 3L9UA 1G0TA 5DDLA 3GKKA 1G7EA 1Z5YE 4EUYA 5J5NA 1W4VA 5JWRB 3FHKA 2CVBA 2TIRA 4KW6A 4TXVA 2L5LA 2YWIA 5B8BA 1THOA 3KH9A 3ZIJA 5A5KA 1AAZA 4V2LA 1ERVA 1FOVA 4XS4B 1WPIA 2ON7A 1CQHA 1EP7A 4GSSA 3DIEA 2ZUPA 3TKQA 4NXIA 1TRSA 5H5QA 1TW9A 3IOSA 3L9SA 2R5GA 4MPFA 4QL7A 3QPMA 2IMDA 2XHFA 5FT3A 1M9AA 1MTCA 1E6BA 4NAXA 4AF2A 3FR6A 3LYPA 2GZZA 2VLTA 2IMEA 5H5RA 1KTEA 1OE8A 1DBYA 1GSFA 3TDGA 3IDVA 2G2QA 2CVKA 5DBQA 2FY6A 3TJJA 1GNEA 2YNXA 2L4CA 2IN3A 3QFBC 2B7KA 1J9BA 1ON4A 4ZL7A 11GSA 1PQNA 2H1BA 1O6JA 3DXBA 5CRGA 4NHWA 1SYRA 2LRTA 1XW5A 5DJMA 3VWVA 2FCHA 3DYRA 1R5AA 1ERUA 1MDIA 3M9KA 2N5BA 4PUFC 1XWBA 1SL2B 2H6YA 1SKWB 4YQVA 2FNOA 1HD2A 5B7CA 3EU4A 3GYKA 1I5GA 3LWAA 3DMLA 3BCKA 3F3RA 1VRSD 5J3RA 5DJLA 5H5SA 2YV9A 4E8EA 2DC5A 4YH2A 2LKUA 2PMTA 3BCIA 2CX4A 1MEKA 3G7IA 3HD5A 4BWQA 2TRXA 5AIXA 1K0NA 3EU3A 2R37A 1CQGA 1XW6A 1J0FA 4AJ8A 1OC9A 2IIYA 4X0XA 3IHQA 1F3AA 1QUWA 1JZWA 2H0IA 3H93A 4HU9A 4PQ1A 1YF1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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