2QL3A

Crystal structure of the c-terminal domain of a probable lysr family transcriptional regulator from rhodococcus sp. rha1
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
205
structure length
205
Chain Sequence
VAGPIAVGCYPALGPTILPSMLYAFTAEYPRASVEFREDTQNRLRTQLEGGELDVAIVYDLDLSPEWQTVPLMTREPMVVLGAEHPLAGVDGPVRLADLAEHPMVLLDAPPSTNHAMDVCREAGFAPRVAYRTANFETARAFVGRGLGWTLLLQRPRVDVTYEGLPVVVKPIAEPKPASVAVVVAWHQEATLSRVARAFIRFVTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The crystal structure of the C-terminal domain of a probable LysR family transcriptional regulator from Rhodococcus sp. RHA1.
rcsb
molecule keywords Probable transcriptional regulator, LysR family protein
molecule tags Transcription
source organism Rhodococcus sp.
total genus 47
structure length 205
sequence length 205
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ql3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ql3A01
1M5BA 4UA8A 1KWHA 3GXAA 4O3BA 3U92A 1PBQA 1LAXA 4NF5A 3G3GA 1POTA 2XXXA 3FVGA 1FW0A 4HCWA 3TCHA 3OMBA 3EHTA 5AA2D 3U93A 1I6BA 1NFTA 4U4XA 5H8NB 2F5XA 1B1HA 2O84X 3VDFA 3F11A 1MXUA 3RT8A 4JWOA 4XIGQ 4LVQA 4WXJA 5IAIA 3CIJA 2IA4A 5CMCA 3VV5A 3SESA 3QUFA 3TDJA 5KDTB 4U23A 1R9QA 1NNPA 3K00A 4FIMA 3TYHA 4I9DA 2B3FA 1MPCA 4LP2B 4H5GA 3O9PA 4G77A 5EHSA 2QL3A 4R9GA 3QYTA 4FATA 1AOVA 1AL3A 3IO6A 3C33A 3OSQA 1MRPA 3PGFA 1LAFE 3C4MA 3KJTA 1H43A 3I6VA 3KN8A 3H6UA 1JW1A 1YTVA 4YB7A 2RINA 5EYFA 4U4SA 4BDNA 3M3KA 2DSFA 4KD5A 1M5DA 4NF8B 4FEBA 4G8MA 1NL5A 3VLUA 1WVJA 1EZPA 3KFMA 3HHFA 3H7MA 3MP1A 3S9LC 3PV0E 4IB2A 3M8UA 3FATA 3ZKKA 3MVWA 1NNKA 3FV2A 5I2NB 4EQ7A 4GRKA 3IB1A 1OQGA 3E3KA 3IOUA 4F2OA 1P1OA 2Y7WA 1URGA 1LGBC 3EF7A 4MH5A 3QIMA 4I1DA 5DEXB 4OESA 2XD2A 3K6XA 5J1DA 5I57A 4GWOA 1VFEA 3K02A 2CMOA 1SYHA 3TKDA 2AL4A 2FA7A 4R73A 2GHAA 4U21A 1HSEA 2O69A 2ONKE 4DXUA 4RPNA 2Z8FA 4E0WA 1B40A 2Q88A 5TPAB 4NF6B 3LUYA 1JNFA 1MPDA 3O29A 1MQIA 4PP0A 4QFPA 2HZKA 5I59A 3H6VA 1N3WA 1ELJA 3DELB 1SQYA 4IY5A 3IJXB 1USYE 3RGYA 2Z22A 3TPAA 3HHGA 1UIUA 4UACA 1NNTA 1RYXA 2I3WA 2HEUA 1ZJLA 1FQCA 4IO7A 5TU0A 3KG2A 4ZZAA 3S4UA 1N76A 2D3IA 1Q35A 1GVCA 1AH5A 2XXUA 4ZEKA 5AA4B 3EN3A 2DXYA 1DSNA 2QS4A 2DYXA 2X7PA 1N7XA 1UTHA 4KYEA 1FQDA 4AB6A 3IR1A 3OSRA 5IKBA 3LR1A 3Q27A 5EHMA 5L9OA 3H03A 2QJEA 2WKYA 4F1UA 4WEPA 2UVIA 4NMYA 4I62A 1QUJA 3D4GA 5JK4A 1LAHE 1CB6A 3O6IA 3TTKA 3IOVA 3OXNA 2VP1A 4DXBA 1IXGA 2H25A 3WAEA 4OTEA 1B9JA 2UVGA 5AA2B 4QSCA 1YAEA 1FQEA 2DE4A 2XXYA 5I56A 3CRBA 2QS2A 4X9TA 3TAJA 2ZYMA 1DTZA 3CSBA 3PD9A 2A5TA 2UVJA 4OFOA 3T96B 3MJNA 1NH7A 4PQJA 1L5TA 3OO9A 4XKQA 1A55A 1JQFA 5DVFA 1N04A 1AMFA 4OYVA 1OLCA 3IB0A 4BLAA 1IEJA 2LAOA 5L8DA 1TXFA 3IOWA 4GL0A 5FTIA 5BUUA 1WDNA 3R6UA 3K0VA 3FVNA 3EPEA 3N94A 4OQOA 5A5XB 3IJOB 1EU8A 4NE4A 5JTYA 4X48A 1GV8A 1RKMA 3V83A 3I5OA 3RT6B 4ZDMA 5FHNA 2XX7A 3MPLA 3QSLA 3VVFA 1LFGA 1CE2A 5HBCA 4YKIA 4IO2A 2QMXA 1Y3PA 4F39A 1H44A 2I6EA 2OK2A 1A54A 2Q2CA 1EH3A 4EF1A 1M5CA 4TOZA 5CBRA 1B5HA 2HFBA 3MAMA 4OEUA 3TFLA 1B32A 3MZ9A 3IAZA 4E0XA 3U94A 2AL5A 1VFDA 3PMWA 4EQBA 3TUSA 4H67A 1B0HA 3KOSA 2NVUB 1JVYA 4QFLA 4GXAA 2I58A 3SEVA 4OENA 1MM6A 3K6WA 1JVXA 2Z23A 3PPQA 1QULA 2XX9A 3KEIA 4Q8RA 1URSA 4H5FA 1B2HA 1EZ9A 4DDDA 4FJPA 3CG1A 2ANJA 2XXQA 5CM6A 1OVBA 3H06B 3KJ7A 1B3LA 2V25A 3PUVE 3T66A 2V3QA 1PB8A 3GBBA 5I57B 1A40A 1SW2A 2O7IA 1M5FA 1Y9UA 4KPTA 4DLDA 1H3DA 3TCGA 1LBCA 2I48A 1MDQA 3LSWA 3SKPA 3OENA 3TMGA 1GR2A 1S7YA 3G3JA 1B51A 5TP9A 4IO3A 1TFDA 1PDAA 4G68A 3SDFA 1OVTA 1QVSA 4ONYA 5CMBA 4F29A 4ZECA 1MS7A 1B3FA 1ZLQA 2QMWA 3PU5A 4RK2A 3PPOA 1P1QA 3QXMA 4GXSB 4YMAA 3SEXA 3C34A 4F31B 3TTMA 2PYYA 2R71A 3A09A 4GIZA 4RNSA 3MP6A 4QSDA 1N0TA 4PE5B 1B3GA 3IB2A 1FTKA 5HPQA 4YAHX 3HO7A 1QUIA 3JYRA 4BDMA 2O68A 1LFHA 3L6HA 2XX8A 4IGRA 4LA9A 1QUKA 1A7LA 4R2FA 2RCBA 2DP8A 4RPOA 4QRZA 3E13X 1OLAA 3USDA 5DYHA 1DPPA 3S9MC 4FAJA 2R9JA 5HM4B 3FVKA 2OLBA 4F1VA 4YMBA 4QFKA 5I58A 3E9XA 3KN7A 4AQ4A 4ELPA 3IK6B 4QHQA 1IXHA 4NEDA 3IL1B 5ITPA 1LB8A 3AXFA 3K6UA 2RC7A 4EXKA 4F18A 1PB9A 5DT6A 3CVGA 1MY1A 3EHUA 3OO6A 1Z7ME 3B6WA 4YKPA 3QUJA 5AE4A 3ONMA 3FXRA 3PUZE 1OQHA 1MDP1 1UTBA 4GF8A 2A5TB 3S9EA 3DP6A 3PUYE 1P1NA 2OWTA 1J1NA 5K2YA 1FQFA 3OD7A 1VE4A 4LQ5A 4OEVA 1MH4A 4O3AA 2F97A 2R6GE 3MZ1A 2DVZA 1NMUA 3QAXA 4Q5TA 5I2KB 1XVXA 5F7VA 1II5A 3B7DA 3V5AA 4R75A 3CFLA 2XD3A 4BDLA 5ICQA 4F1YA 1TT1A 3TCFA 1FQAA 1D9YA 2REGA 1TWYA 5H8HB 4KFQA 2ZNSA 4FE8A 5FTHA 5JTYB 3SEWA 1A8FA 4FEDA 5KCJA 3WAFA 3P7IA 3V89B 2XXVA 2I3VA 3CFZA 3H6WA 3M3FA 2H99A 2ONRA 3A3CA 2GH9A 2FYIA 1US5A 4XTCQ 3OO8A 3UK4A 2P2AA 3FV1A 4FECA 1WODA 3PPNA 3UORA 1VSOA 1DMBA 3VLWA 2XXIA 4THIA 1B0LA 1N7WA 3TQWA 3C35A 4ZEBA 1Y1MA 2M8CA 3G3HA 1NH8A 3O28A 1MH3A 2HXWA 4R6HA 4P11A 4R6YA 1IQ7A 1OMPA 1Y20A 4OETA 4F2QA 1PB7A 1FQBA 3PPPA 4EDPA 4ELOA 3C9HA 1I6QA 2Q8JA 3MPKA 3K01A 3PMXA 4R2BA 1TFAA 2F6PA 2ZYOA 4H65A 3UP9A 4LUBA 1PBPA 4O3CA 1ZBMA 2ZYNA 3MW0A 3K1MA 4MF3A 4BDQA 5H8FA 3MUQA 1D9VA 3DM0A 2HAVA 2XXTA 1B6HA 4ZE8A 4AB5A 1FTJA 5L9SA 3HN0A 4OERA 3TEPA 2GHBA 1BP5A 4G68B 1B5IA 3FASA 2GRVA 4N6PA 3EQ1A 5H8NA 3MP8A 3UIFA 4OHNA 1MG1A 3A3UA 2Q2AA 4LZ8A 2XHDA 3S2VA 2GFEA 3BFTA 5KDTA 4YB5A 2F6GA 4F3SA 3ECRA 5FHOA 3W9VA 4GL8A 4BDRA 1FCKA 1NNFA 1B7HA 1QJMA 5JEIA 3N6UA 4H1XA 4YKKA 3TTRA 2ZNUA 2X26A 1SD3A 2V3UA 3W15C 4Z0IA 4NF5B 4FORA 1PEBA 1SYIA 2YJPA 1A99A 4NF8A 4TLLB 1LCTA 2Y7PA 4P0IA 1SVXB 2YPNA 4WKMA 4JDFA 3C32A 5KZTA 5H8SA 5K2XA 4H8IA 4KYDA 1MQJA 3OOAA 4H6DA 5B7DA 1BTJA 3V8XB 3FXUA 1PC3A 5I2NA 4JXIA 4GQOA 4OWDA 3CI8A 1IIWA 3LSFB 3ZKLA 3FZVA 4GOTA 4KR5A 1B3EA 3LSLA 3H4ZA 3B6QA 3KZGA 1UTBB 4F22A 3FJGA 1MY4A 4M4GA 1LB9A 4EQ9A 1B46A 1FTLA 2XXHA 2Y7KA 3TZAA 4C0RA 4NF6A 5DVJA 3VVDA 4JSDA 5F1QA 3VE1B 4JWYA 1QKAA 2G93A 2ESNA 2F7CA 3W9WA 3FUZA 1MQDA 3Q29A 3HPIA 4H8JA 4ZEFA 4OXVA 3SERA 4DE8A 3RTFB 3U8QA 4GD5A 2DS9A 1XC1A 4Z7EA 4F3PA 3DLNA 2RC8A 2O1MA 5LOMA 2DWIA 4PFWA 4R72A 3D4CA 4BDOA 2F35A 5CBSA 2OWSA 1DTGA 3KSXA 4RK9A 4ZEIA 3T9XB 3TTNA 3L6GA 3H3GA 3FVOA 1YPNA 1Y3NA 1H45A 4G68C 4RXLA 2O7UA 5DTBA 1ANFA 2FNCA 4QF9A 4XKPA 1JW5A 4PETA 5ITOA 2DQVA 2OCUA 1HSJA 1MXZA 2ZXTA 4LQ2A 5CMKA 2PT2A 3E4RA 2ONSA 5I59B 4YICA 4R74A 3ODBA 2Q89A 2D5WA 4XKNA 1HSLA 4IO4A 3KOTA 3M3LA 2UVHA 3KN3A 4HCYA 3O6GA 1URDA 2PT1A 1BIYA 2ZNTA 4LZ7A 4KCCA 3DP4A 3C31A 3CG3A 1IXCA 3HCQA 1B52A 2UYFA 5AA2A 3RQTA 4PFTA 3VXCA 1BKAA 2KLFA 4R6KA 4YKJA 1MY3A 4ELRA 3MVYA 3HSTA 1D3KA 5CRYA 2OJTA 4RY1A 4OMBA 4KYSA 1SI1A 3QK6A 2B3BA 4N13A 4YU0A 2W7YA 3G3IA 2Y7RA 4X1BA 1UTHB 2AIXA 4R9FA 1Y4CA 4LATA 2ZYKA 4F19A 4OFJA 5CMMA 4IY6A 4HS7A 2NWJA 2X7QA 2QRYA 5H8FB 3R26A 1LAGE 4IO5A 2QS1A 2PX1A 3N5LA 2F7BA 2A5SA 4X1DA 2G29A 5DVIA 3FJMA 5I84A 3SEUA 4C1UA 5A5XA 3MC2A 1IZ1A 1XHYA 4MLVA 4RA1A 3PUXE 3UA8A 1ZTYA 1DPEA 1B5JA 3IO4A 4I8CA 5I56B 3O97A 2ALUA 1NKXA 4GVOA 2DOJA 2AYSA 4KHZE 2RKMA 3ZS6A 3K1NA 2PVUA 3EHSA 1UIVA 3T93B 1XOCA 3FD3A 1OIBA 1ZIUA 3VXBA 1O63A 2P0SA 1O64A 2DWAA 5M2VA 4JWXA 3GLBA 2UYEA 2CZLA 4IGTA 3RY3A 4MBPA 3RUMA 4EXLA 4U1OA 3VFJA 4HW8A 1SW1A 1XT8A 3MVXA 4ELQA 3K1PA 1MQGA 1N84A 2BJJX 2HAUA 3BBRA 3JV9A 1JEUA 3ILTB 4XKRA 3O2AA 1S9TA 3I3VA 4NF4A 4JB7A 1QKBA 1QW0A 3G3FA 1Z7NE 1LFIA 3G7WA 2Y84A 2H5YA 5CI5A 4NWDA 4KQPA 4L17A 3KSJA 2VOZA 1N3XA 4PFYA 4DCXA 4GLIA 2O6AA 4YZZA 4WEDA 1MM7A 3PUWE 2H9BA 3LSXA 3VVEA 3N26A 4IO6A 2F78A 3TQLA 1ZMGA 2HZLA 3MQ9A 1MXXA 2Y7IA 1SDXA 3KGCA 5AA3A 3RLFE 4G8NA 4G8HA 1LLSA 2F34A 2O51A 4ISUA 4F3BA 4DXCA 2ABHA 3CR9A 2NOOA 4KCDA 4YB6A 2E0SA 5H8QA 3FJ7A 1SW5A 2DE3A 3CFXA 3T9UA 4NTLA 3C36A 1IITA 1LBBA 2V3TA 4ZE9A 1MXWA 2DE2A 4DZ1A 2XXWA 2F8DA 4JBZA 2B65A 4Q30B 1SBPA 2I0BA 4ESXA 2V84A 2RCAA 4KI0E 3FIRA 4F3GA 1D4NA 3OEMA 1SI0A 1Y1ZA 2I4BA 2NUVA 1Y4TA 1R1NA 1RYOA 4XXUA 2Z8EA 5CC2A 4G2ZA 4U1ZA 3MBPA 4TLMB 4GFRA 5TP9B 3G3KA 3OO7A 1A8EA 3PMVA 3IX1A 4QFOA 3LBSA 1B3HA 3O6HA 3FXQA 2F36A 4QFNA 1AIVA 3DP8A 2QPQA 1UQWA 1Y3QA 2O1LA 3FGSA 1P1WA 2DVCA 1P1UA 3OELA 1MY2A 3U1OA 3UGWA 5L9MA 3LC8A 3BKIB 2F7AA 4PFUA 3N6TA 2PBWA 2NXOA 2QS3A 3IORA 3RN8A 3U72A 3T22A 1R9LA 2QSXA 4U2RA 3KBRA 3VLVA 1B4ZA 4ECFA 1BLFA 4P0GA 3THIA 3ILUB 4TQUQ 1ZKBA 2Q9TA 4OFLA 5I58B 1SW4A 2ZMBA 1S50A 5I2KA 3GBAA 4H0WA 2XXRA 2V93A 2DWJA 5FHMA 1B7ZA 1B7UA 2VD3A 3H6TA 4DCYA 1MQHA 1I6AA 2UXAA 4EUOA 3Q25A 4NWCA 2VGQA 1H76A 5H8HA 2P1SA 2RC9A 4POWA 3B6TA 1B1XA 1JEVA 2Z8DA 1LCFA 4OVJA 5DEXA 3CSGA 3SETA 1IUDA 1YCJA 4POXA 3RPWA 3TTLA 2E1SA 4MFIA 1B4HA 1EZOA 4EF2A 4G4PA 3K6VA 2OZZA 3JZJA 5TPAA 4OZ9A 4DIGA 1ATGA 1XVYA 4LONB 2XXPA 1POY1 2I49A 4MLQA 1VR5A 2H4IA 1US4A 3T9VA 1JETA 2THIA 2OBGA 3OEKA 4ND9A 2IEEA 4K3FA 1USYH 1GTKA 4N07A 3O66A 3MZBA 2RF1A 3SEYA 3IOTA 5BWJA 2DWHA 4LZ5A 1B05A 3HV1A 4NF4B 4QSEA 5ELVA 1XS5A 5B70A 4ZS9A 1MPBA 3Q28A 1O7TA 4ZEDA 3S9NC 1R6ZA 5KCJB 2REJA 3Q26A 3GZGA 3TELA 1ZU0A 2VHAA 5AA4A 3T9HB 3PPRA 3K4UA 1DOTA 1JW4A 5AA1A 4ESWA 3UN6A 2I0CA 2D21A 4JSOA 2DXRA 2H98A 4HTGA 2YLNA 2I4CA 1T0KA 2HQ0A 1B58A 5ISUA 3RNNA 1MY0A 1MXVA 3K2DA 4U22A 2VD2A 1GGGA 4Q0CA 4C1TA 1IXIA 3TODA 1LSTA 4RJZA 3ZSFA 2PMSA 1FTMA 5H8QB 1I69A 1FTOA 2HCAA 1M5EA 3BFUA 5ICTA 4RYAA 4M1VA 1F9BA 3PD8A 3RTWB 1MXYA 1Q1KA 1P99A 4ZZEA 3MWBA 3R7XA 3MVZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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