2QL3A

Crystal structure of the c-terminal domain of a probable lysr family transcriptional regulator from rhodococcus sp. rha1
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
205
structure length
205
Chain Sequence
VAGPIAVGCYPALGPTILPSMLYAFTAEYPRASVEFREDTQNRLRTQLEGGELDVAIVYDLDLSPEWQTVPLMTREPMVVLGAEHPLAGVDGPVRLADLAEHPMVLLDAPPSTNHAMDVCREAGFAPRVAYRTANFETARAFVGRGLGWTLLLQRPRVDVTYEGLPVVVKPIAEPKPASVAVVVAWHQEATLSRVARAFIRFVTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The crystal structure of the C-terminal domain of a probable LysR family transcriptional regulator from Rhodococcus sp. RHA1.
rcsb
molecule tags Transcription
source organism Rhodococcus sp.
molecule keywords Probable transcriptional regulator, LysR family protein
total genus 47
structure length 205
sequence length 205
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ql3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ql3A01
4G68C 1POY1 1YAEA 3KOTA 4EQ7A 5EYFA 3JZJA 4IO4A 2AL4A 3PPQA 3R6UA 3CIJA 4RNSA 4RY1A 1Y4TA 5FTIA 3G3IA 4OFLA 5H8HB 4IO5A 4FEBA 5JTYB 4F3SA 2O1LA 4PETA 5AA2B 1MPCA 4L17A 4PFUA 4POXA 2XX8A 3TELA 5I2KB 4OERA 1IXIA 4LQ5A 1O64A 3VVEA 3MZ9A 3KZGA 4BLAA 2V84A 4YKIA 3VV5A 2VGQA 1F9BA 5I59A 4ISUA 5KZTA 1JQFA 4IO2A 1LBCA 4KI0E 3OEMA 5HPQA 4QFPA 2XXRA 3DP8A 1IUDA 5AA4B 1J1NA 4ECFA 5JTYA 1SQYA 4FAJA 3T93B 2QMWA 5AA2A 1B2HA 2O1MA 1M5BA 4DCYA 4XKNA 4OFJA 2I0BA 4U1ZA 1SBPA 5CI5A 2CZLA 3JV9A 3RY3A 1LLSA 1EZ9A 1FTKA 4BDRA 1LAHE 3DELB 3UIFA 4HS7A 2I0CA 1FQDA 4KYEA 2HXWA 1Y3NA 3V5AA 4DIGA 1DPEA 2F34A 1FQBA 4FJPA 5I57B 1MY4A 1B7HA 3BBRA 1B3EA 1VFEA 5ITPA 1SW2A 1VE4A 1MY0A 1H76A 1I69A 3KOSA 3U94A 5KDTB 1MXVA 4DDDA 5DTBA 4F39A 4F1VA 2UXAA 4PFWA 2VD2A 3FJ7A 3S9NC 1URDA 3ONMA 1EH3A 2Z22A 3BKIB 3DP4A 3M3KA 1NNFA 5ELVA 3JYRA 3E3KA 5I56B 2QMXA 3UN6A 3U72A 3WAEA 3MVZA 5EHSA 4BDMA 5DVFA 4OEUA 1B05A 1A8EA 4MH5A 4ELOA 2IEEA 2WKYA 5I57A 3A09A 5IAIA 2OLBA 3RT6B 4JWXA 3TCGA 2DWJA 4JBZA 1BLFA 1Y3QA 4NF4B 3EPEA 4JWOA 1BKAA 1ZTYA 3CFZA 3FVOA 3R26A 2XXTA 5CRYA 1MDQA 3LSXA 4THIA 2GHBA 3TUSA 4IO6A 4P11A 4M4GA 1Q35A 5DT6A 3GLBA 1Q1KA 2XXWA 4IY6A 5I56A 1D9YA 5KCJA 3H3GA 4RXLA 1B4ZA 2P2AA 4YZZA 2HZKA 1B4HA 4KYDA 2DE2A 1B51A 1OVBA 3W9WA 1MM6A 4O3AA 3TDJA 1B32A 4GL0A 3GBBA 1B3LA 3LR1A 1A99A 1XHYA 3FXUA 3C31A 1VR5A 1M5DA 4JXIA 1B6HA 4MLQA 2P0SA 1UTHB 3C4MA 3O28A 1AIVA 2YJPA 2W7YA 1A40A 1IEJA 3VFJA 3M3FA 2HEUA 4OWDA 4POWA 1SW4A 3OO7A 3PD8A 4EQ9A 1MG1A 3TEPA 1I6AA 3VVFA 3C9HA 1YCJA 2H98A 3BFUA 2M8CA 3EQ1A 1PC3A 3M3LA 4Q5TA 1MQDA 3T9VA 1VSOA 2OJTA 4QFNA 5CC2A 4EF1A 1FTMA 3N6UA 2RC9A 4YMAA 3FV2A 1MY1A 3D4GA 3OSRA 1NMUA 3Q27A 2I48A 3DM0A 3TCFA 1R1NA 2F8DA 4BDLA 2I58A 5L9MA 1PBPA 2XXQA 5I58B 5H8NB 3MVXA 1N7WA 3EHSA 2ONKE 1M5EA 4K3FA 3H6WA 3CSGA 3HHGA 4QSEA 4LZ5A 4NF5A 3C35A 1R9QA 2DYXA 4QFOA 4R6YA 4DE8A 4GF8A 3C33A 1SI0A 2DVCA 4YAHX 4OZ9A 3U93A 4ZE9A 4RJZA 1II5A 3E13X 4BDOA 1P1UA 4F3GA 2Q2AA 3MAMA 1OMPA 5L9OA 1B40A 5H8FB 4OETA 3THIA 3FXRA 2ZXTA 2VP1A 3PMWA 3CSBA 4WXJA 1RYOA 1MM7A 2DSFA 3OXNA 2AL5A 3IB0A 3RUMA 3RLFE 1VFDA 1JW1A 3G3JA 2VOZA 3OMBA 5I58A 5ICQA 1ATGA 4QSDA 1BP5A 4RK2A 5H8NA 3PUVE 2V3UA 3G7WA 1AOVA 3O97A 2PX1A 4H5GA 3U92A 4C1UA 3I5OA 4YKPA 4N6PA 1B7ZA 2DWIA 1IITA 1MXZA 3P7IA 2F6GA 3B6WA 1B3GA 1SDXA 3FASA 3PUYE 3OOAA 3O6GA 2I3WA 1H45A 4Q0CA 1PB7A 2B3BA 3QUJA 1NNPA 2UYEA 3UK4A 2GH9A 4ONYA 1B1HA 2RINA 4F18A 4ZEDA 4EXLA 3ECRA 3KEIA 3L6HA 4OHNA 1AL3A 2DE4A 4H8JA 1A7LA 3AXFA 1B3HA 1OIBA 1ZLQA 2H9BA 1MQJA 3UP9A 1FQFA 1QKBA 4R2BA 1FQEA 1Z7NE 2XX9A 2DE3A 4IO3A 4N07A 4PFYA 3K2DA 2IA4A 1A8FA 3GBAA 3K1PA 4TQUQ 2H4IA 4Z0IA 4EQBA 4H6DA 1S9TA 3DLNA 3Q28A 2Q89A 3PPOA 4GOTA 5I59B 4DXUA 1SW5A 3S2VA 3IR1A 2HZLA 3K6UA 3RTWB 4ZEKA 1B1XA 4WEDA 3K6XA 2B3FA 3RQTA 4ELRA 4QF9A 3OEKA 2HCAA 4YICA 1T0KA 1ZKBA 4LVQA 1Y1ZA 2XXVA 4H65A 3W15C 2XXXA 3HCQA 4MBPA 3KGCA 4GL8A 4QFKA 2PT2A 3VXBA 1JVYA 3QAXA 3I3VA 4ZE8A 3D4CA 2DP8A 1LB8A 4OVJA 3N6TA 1B9JA 4DZ1A 1NFTA 1M5CA 3KN3A 4I1DA 3C36A 3SEYA 2X7PA 3VLUA 1DSNA 3RPWA 1D3KA 4JB7A 4MLVA 4NWDA 2ONSA 1QKAA 2XXHA 3QSLA 4IGRA 2D5WA 3O66A 1WDNA 3HPIA 4YMBA 5L9SA 4GXSB 3IOUA 4AB6A 1N7XA 3RGYA 2DXRA 3TFLA 3PGFA 3F11A 1ZMGA 3K0VA 4PP0A 3EF7A 3RNNA 1N3WA 3L6GA 2OWTA 3H6UA 3MJNA 1NH7A 2Y7PA 2H25A 2OBGA 3G3KA 4OXVA 2PMSA 4G8HA 5B7DA 4IB2A 1USYH 3S9EA 5AA3A 4WKMA 2YPNA 1OLAA 4FORA 4U22A 3TTRA 4ZZEA 3PV0E 3UORA 2PT1A 4EF2A 1N76A 2I4BA 5IKBA 5DYHA 4XXUA 3V8XB 2OK2A 2ZNSA 1S50A 2H99A 4ELPA 1Y4CA 3FJGA 3H06B 4IO7A 3OSQA 2AIXA 3G3HA 1D4NA 1MXXA 5TPAB 3O6IA 4BDNA 5BWJA 5F1QA 4U1OA 5AA1A 2Q2CA 4IGTA 1LFGA 3HO7A 3A3UA 2XXIA 3PPPA 2HFBA 4R72A 4KHZE 4DLDA 4EUOA 1NNTA 4GVOA 3IB2A 4DCXA 4TOZA 5KCJB 1B5HA 2O51A 2O69A 2GRVA 4R75A 4BDQA 3O29A 2Y84A 1GR2A 4JWYA 5M2VA 3QK6A 3TMGA 5ITOA 1LB9A 1P1NA 4F1UA 1Y20A 2QPQA 2OZZA 5TPAA 1N3XA 1QUKA 2Z8DA 2CMOA 1AMFA 1MPBA 3MPKA 3K1MA 4ZEFA 4R73A 1XC1A 1PEBA 1FTLA 3ZKKA 2H5YA 3CG3A 2AYSA 1IZ1A 2Y7KA 3PPRA 4OMBA 4Z7EA 2UVHA 4ELQA 3EHUA 1PB8A 3W9VA 3IOTA 3FVGA 5DVIA 5LOMA 4PQJA 3O6HA 4R9GA 3TTNA 2HAUA 3VLVA 2RCBA 2G93A 1JEVA 3PU5A 2O7IA 2QS4A 3KFMA 1XVXA 1CE2A 1Z7ME 2ZNTA 1SVXB 5EHMA 3KN8A 2ESNA 4NTLA 5F7VA 2Q8JA 1GTKA 4DXBA 4I62A 2Y7RA 3OO6A 1B0LA 3KBRA 4LP2B 3RN8A 4C0RA 3MVYA 4U4XA 3C32A 1Y1MA 2Q88A 2PVUA 1B0HA 4YKKA 3IOVA 1O63A 3N26A 1H43A 1B3FA 3H7MA 3ILUB 2UVGA 5K2YA 4NWCA 3FGSA 3MZ1A 1NNKA 3USDA 4KD5A 5ISUA 3OO8A 4OEVA 2V93A 2QL3A 4KYSA 4NF5B 3TQWA 3HSTA 2THIA 1SI1A 2E1SA 1I6BA 2ZYOA 3K02A 4M1VA 3TODA 1LFIA 4HCWA 1YTVA 3K1NA 5B70A 4YKJA 3FXQA 4G8MA 2PBWA 1TXFA 2Q9TA 4R74A 1BTJA 4Q30B 5FHMA 4MFIA 3PD9A 3A3CA 4G2ZA 3LUYA 3S9MC 1POTA 4YU0A 2F36A 2QS2A 4YB7A 3FIRA 1MQGA 1USYE 2DOJA 3UGWA 2DWAA 4U21A 1DOTA 4HTGA 2F97A 3SERA 4AB5A 1S7YA 2V25A 2I49A 5CMMA 3FD3A 4JSOA 2PYYA 3IK6B 2DXYA 3KSXA 4LZ8A 3IORA 1QJMA 1GV8A 1OVTA 1B52A 3S4UA 4OENA 5K2XA 3TTKA 3V89B 1P1WA 2XXPA 3MP6A 3MBPA 4E0WA 1L5TA 3K6VA 1LBBA 3FUZA 4H1XA 1Y9UA 3T66A 3VE1B 3K6WA 3OD7A 4Q8RA 4F31B 2OWSA 4F19A 1ZU0A 4C1TA 4RK9A 4WEPA 3TCHA 1TWYA 1LFHA 4OTEA 1URSA 4GLIA 5L8DA 3R7XA 2I4CA 1QW0A 3T9UA 3TKDA 2NWJA 2NXOA 4TLLB 1MRPA 3QUFA 1PBQA 4FE8A 4FEDA 2Z8EA 4R6HA 4GWOA 5JEIA 4YB6A 3QXMA 4TLMB 4ZEIA 3T9HB 2F7CA 2DS9A 4U4SA 4ESXA 3HN0A 3B6QA 2XX7A 3FVKA 3HHFA 4F2OA 2Y7IA 3DP6A 1SYIA 2YLNA 4NF6A 4XTCQ 1JW4A 2UVJA 3I6VA 3EN3A 3FATA 3MUQA 3SEVA 3FV1A 2RKMA 1FW0A 4HW8A 3MZBA 2F78A 3K01A 3PUWE 1ZBMA 1FCKA 5H8QB 4ESWA 2A5SA 5I2NB 3MVWA 5A5XB 3LBSA 4LONB 1UTBA 2RC8A 4NF8A 5DEXA 3BFTA 2F7AA 1IIWA 4OYVA 3GXAA 1B5IA 1DMBA 1EZOA 4I9DA 2ONRA 1R9LA 1MS7A 4H5FA 4ND9A 3ZSFA 2NVUB 1FTJA 1ANFA 1NKXA 3TPAA 2FYIA 1GGGA 4RPNA 2GFEA 2QSXA 3TTMA 4KPTA 4XKQA 1B58A 1A55A 3SEXA 2O84X 2GHAA 2FNCA 2R9JA 4X1DA 3IJXB 4G4PA 1SD3A 3B6TA 3K4UA 4XKPA 2REGA 2VD3A 4UACA 4KCDA 5H8QA 5HBCA 1TFAA 5I2NA 2XXYA 1AH5A 4H8IA 5A5XA 2XXUA 2RC7A 3IB1A 1IXCA 2R71A 2O6AA 3MC2A 2HAVA 1IQ7A 4G77A 4ZS9A 5DVJA 3H6TA 1QUIA 3MPLA 1Y3PA 4O3BA 3TZAA 4FATA 1M5FA 2XHDA 3ZS6A 3Q26A 3SEUA 4U23A 1FQAA 2BJJX 5H8HA 4F1YA 5TP9B 4NMYA 1B5JA 4QRZA 3TAJA 1B7UA 3IAZA 4N13A 1H3DA 3V83A 5I2KA 4NEDA 1MXYA 3LC8A 2ZYMA 3VLWA 2ANJA 1FQCA 2VHAA 1I6QA 4ZZAA 3FVNA 2QS3A 2LAOA 4GXAA 3IX1A 3SETA 3QYTA 1NL5A 2X26A 1RKMA 1ELJA 3VVDA 1O7TA 1MY2A 2QRYA 3PMXA 3CR9A 5AA4A 4KCCA 3IO4A 5TP9A 1LAGE 3O2AA 3MQ9A 5H8SA 5CMCA 1LGBC 4KR5A 2G29A 2F5XA 1N0TA 5HM4B 1TT1A 3Q29A 2XD2A 1MXUA 1JW5A 3G3FA 4FECA 2V3TA 3G3GA 1DTZA 4JDFA 2Y7WA 3N5LA 3KJ7A 4RYAA 3SEWA 2DQVA 2A5TB 5I84A 1UIUA 2HQ0A 1CB6A 3PUXE 2RCAA 3MWBA 1D9VA 2XD3A 3KJTA 2F35A 4QFLA 2X7QA 3MP1A 3IJOB 4U2RA 1P99A 5FHOA 1MXWA 2DWHA 3CI8A 1NH8A 2ZYNA 5KDTA 4P0GA 2RF1A 1SW1A 3IOWA 1N84A 4OFOA 4F22A 3S9LC 4X9TA 5ICTA 3U1OA 1WODA 1IXGA 1R6ZA 4H67A 4G68B 3QIMA 3ILTB 3CFXA 2A5TA 1IXHA 1GVCA 4GQOA 2NUVA 3KN7A 1MH4A 1H44A 5CBRA 1LAFE 4E0XA 3CRBA 1JEUA 4F3PA 3E9XA 1MQIA 3K00A 4LA9A 3PPNA 1OQGA 4RA1A 1MPDA 3SDFA 4GIZA 5AE4A 3Q25A 4NF4A 3UA8A 1OLCA 1HSEA 4MF3A 1KWHA 3PMVA 1A54A 1LSTA 2NOOA 2V3QA 3M8UA 2ZNUA 2ALUA 5FTHA 4XIGQ 3KSJA 2P1SA 3TYHA 3VDFA 1QVSA 4DXCA 1PDAA 1LCFA 4OQOA 1OQHA 1XOCA 2ABHA 3HV1A 2Z8FA 4G68A 3H6VA 3LSLA 3IL1B 1WVJA 3H4ZA 3SKPA 2QJEA 3TQLA 3IO6A 5CM6A 3KG2A 4AQ4A 1XVYA 4IY5A 4R6KA 5BUUA 4JSDA 1MY3A 4OESA 4F3BA 1URGA 2I6EA 4GD5A 4X1BA 4GFRA 4R2FA 1DPPA 1UTHA 4PE5B 4P0IA 3H03A 2FA7A 5CMBA 1ZJLA 2UYFA 2QS1A 5FHNA 3T96B 1P1QA 2Z23A 1MQHA 5AA2D 1ZIUA 4UA8A 5JK4A 4EXKA 3ODBA 1HSJA 4QHQA 3SESA 1US4A 3TTLA 2ZMBA 3O9PA 2D21A 1UQWA 3PUZE 3LSWA 4NE4A 1N04A 3OELA 1B46A 3LSFB 1SYHA 2OCUA 3C34A 4F29A 3FJMA 1JVXA 4O3CA 4NF6B 3T9XB 4LUBA 5J1DA 3CVGA 3MP8A 3ZKLA 4YB5A 1FTOA 1EU8A 3RTFB 4ZECA 2UVIA 1HSLA 4HCYA 1MH3A 2O68A 3B7DA 3T22A 2B65A 4H0WA 4PFTA 1P1OA 3E4RA 1MDP1 1JNFA 1YPNA 4RPOA 1UTBB 4XKRA 4ZEBA 1DTGA 4KQPA 4X48A 1BIYA 3N94A 2F6PA 2REJA 4NF8B 2ZYKA 5DEXB 4KFQA 1LAXA 3GZGA 4LZ7A 4FIMA 4LATA 3RT8A 2E0SA 5H8FA 2I3VA 1LCTA 2O7UA 4F2QA 3CG1A 1PB9A 2R6GE 1XS5A 4LQ2A 1QULA 5TU0A 4ZDMA 3MW0A 1UIVA 4EDPA 4I8CA 1US5A 3OO9A 2F7BA 1RYXA 1QUJA 3OENA 3VXCA 3CFLA 4QSCA 3EHTA 1JETA 1TFDA 1XT8A 2D3IA 4GRKA 1EZPA 4G8NA 3FZVA 3U8QA 3WAFA 2KLFA 5CMKA 2DVZA 4R9FA 5CBSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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