2QM1A

Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
SNAMDKKIIGIDLGGTTIKFAILTTDGVVQQKWSIETNILEDGKHIVPSIIESIRHRIDLYNMKKEDFVGIGMGTPGSVDIEKGTVVGAYNLNWTTVQPVKEQIESALGIPFALDNDANVAALGERWKGAGENNPDVIFITLGTGVGGGIVAAGKLLHGVAGCAGEVGHVTVDPNGFDCTCGKRGCLETVSSATGVVRVARHLSEEFAGDSELKQAIDDGQDVSSKDVFEFAEKGDHFALMVVDRVCFYLGLATGNLGNTLNPDSVVIGGGVSAAGEFLRSRVEKYFQEFTFPQVRNSTKIKLAELGNEAGVIGAASLALQFSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Glucokinase from Enterococcus faecalis.
rcsb
molecule keywords Glucokinase
source organism Enterococcus faecalis
molecule tags Transferase
total genus 104
structure length 324
sequence length 324
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qm1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qm1A02
5JICA 5KQDA 4F9OA 3U4LA 2OANA 1BUPA 1YXQA 4MLHA 4BR5A 1NMDA 2YJEA 5BN8A 3MK6A 3I8BA 3VGLA 3W0LA 1NBWA 3D2EA 5AQQA 2FLOA 3AARA 1QQMA 3DJCA 1NM1A 4FWLA 5JMVA 1JCGA 3A5LC 3IDHA 4CZGA 2FSKA 4RTFD 2BTFA 3CJ1A 3SJHA 5EX5A 4QS7A 1XC3A 1NGAA 4K42A 3SMPA 1Z05A 3VEVA 2Q0UA 3C0BA 3ULEB 1GLBG 3SLCA 2AA4A 1U2VB 2IVNA 4BRCA 3CJ7A 2CGLA 4CJ7A 4A62A 4EHTA 5AZIB 2P9KA 4B1UB 3GOIA 2A40A 4EHUA 3D2FB 2FF6A 5AQOA 4BR9A 2PBDA 1GLCG 2IIRA 4BR0A 3DXKA 1Z6RA 4BRLA 3ZX2A 2QWQA 1NGCA 4FWSA 2HF4A 4O8KA 4CZJA 3H6EA 3WEEA 5FPNA 4M63C 4BC4A 2Q31A 4CD1A 2HOEA 3WXIA 4BG9A 2NZTA 3QICA 4BVPA 1NGIA 2AP1A 4JN4A 1NGBA 3VF4A 2CH5A 3MCPA 3H46O 2P9IA 4H0VB 4BRPA 1YUWA 2W40A 4WQ5C 2VYPA 4IZ9A 1MA9B 3VOVA 4B1YB 4MO5A 5AQMA 2E2NA 5B8HA 4H0YB 4XH4A 5AQJA 2DPNA 4FPBA 2P9KB 1ATSA 1R59O 3HM8A 3EZWA 2UYTA 2P9UB 3MN9A 4CZHA 1KAXA 5FPDA 1XQSC 3O8MA 4PKGA 4C23A 3QFUA 3JXUA 3H1VX 3SK3A 5F1XA 4XEIA 3DAWA 4JNEA 1U6ZA 2ZGYA 1HLUA 1V4SA 3VERA 3WXJA 3EL2A 5KQ8A 2D4WA 1SZ2A 3DWLA 4LC9B 3VENA 5AQLA 4FSVA 3MDQA 4BRKA 2A5XA 1S22A 1TUUA 3H3OB 1IG8A 5AQRA 3D7EO 3ENHA 1WOQA 2F9WA 2VCPA 5BRDA 2E88A 3UKUA 3AAQA 5ADXA 3CJAA 5BR9A 1DGKN 4BRGA 1GLLO 2QWNA 4H0XB 4HWIA 3ZETA 3ZEUA 1ZBSA 2GELA 2Q36A 2QW9A 2NRHA 4YDUA 5F2RA 2A6AA 4BRFA 1K8KA 4BQLA 2QWLA 4CZFA 3CQYA 3CHWA 3FFKB 4FWOA 4GNIA 3VESA 4E1JA 4K43A 3WXKA 2A41A 5TKYA 4EAHD 2CGKA 3LDNA 2P9LA 1NLVA 2VWBA 2ASOA 4IJNA 4CZEA 1YAGA 4K25A 3LDPA 3AY9A 3VEZA 3O6WA 1G99A 1BDGA 2HMPA 3JS6A 1HPMA 5AQSA 5AQGA 1BA1A 2H3GX 4CZIA 2D0PA 5FPEA 1KXPA 2P9PA 3L0QA 5CE3A 2E1ZA 2QWRA 2YCHA 1JCFA 3QB0A 4A2AA 2F9TA 3FZMA 3O1WA 3C7NA 3EO3A 2GTDA 3H45C 1C0FA 1GLJO 2BUPA 3HBTA 4I6MA 3UKUB 5FPMA 4CZMA 1WUAA 3BEXA 3M1FA 3AAPA 4CZKA 4CD3A 4PKIA 3VF6A 1Y64A 4IJAA 3ZETB 3BUZB 4ISFA 4IXCA 1QQNA 4WQ4A 3UKRB 4PL8A 4BGBA 5LJVA 3GL1A 4BREA 1MWKA 4BR7A 4RWTA 4EIAA 4AM7A 2E2OA 3HZ6A 3CJCA 2IVOA 3QBWA 4JD2A 4BC3A 1DKGD 5BRHA 1GLFO 1GLDG 5BPNA 2I7PA 1QHAA 4BVOA 2Q0RA 3VEWA 1SAZA 2Q97A 5AQIA 3D2EB 4BR4A 1HKCA 1T6CA 3IFRA 3FR0A 1NGGA 3G25A 3OHRA 4IWVA 4H0OA 4HTLA 4PKHA 1SQKA 4H0PA 3LM9A 2YHWA 3EKUA 3O5BA 3QFPA 4CZLA 3QMLA 3CIPA 3W3DA 4ISGA 4K41A 1QQOA 5AQXA 4FL9A 4BRHA 4CBXA 2V52B 1P8ZA 2GWJA 4L3QA 3A5NC 4QS8A 5E84A 5AFUA 2YJFA 3RSEA 1HUXA 5AQFA 5AZJA 1QZ5A 1CZAN 1ATRA 2CGJA 3TU5A 3WT0A 4FWQA 4BC2A 2E2QA 1NWKA 3A0IX 5JLHA 5E26A 4MO4A 5AQUA 1ZXOA 5AQTA 1LCUA 4YDUC 4DB3A 3ENOA 4BR2A 3DXKB 4J8FA 5EY4A 3FLCO 3A5OC 3VEYA 4KBOA 2Q2RA 1NGJA 2A42A 5KPRA 4MLEA 4BRDA 2YHXA 4JAXA 3WEEB 3BP8A 4BRMA 5BPLA 1EQYA 3HSCA 1YVNA 2I7NA 3B8AX 1BG3A 3L6QA 3CETA 1KAZA 3I33A 4H0TB 1DEJA 4M7XA 3M6GA 4XH5A 1RDWX 4FWMA 4ISEA 3KHYA 3WQTA 3H1QA 3LL3A 1D4XA 2E8AA 3ZX0A 4XH1A 3VEXA 5ELZA 4B1VA 5AFUH 2P9IB 1NGFA 2NLXA 5BN9A 5KPTA 2QXLA 1ZC6A 3R9PA 2E20A 2PAVA 3VGKA 4Z94A 3LDQA 2P9SA 4FPAA 4B1WB 3IUCA 3HTVA 1X3NA 3GDQA 1OKJA 1E4GT 1T44A 4JHDA 3U9DA 2FF3B 4WQ5A 4B1ZA 5AR0A 4EFHA 5LY3A 1V4TA 3ULEA 3VETA 3BF3A 5I9EB 1HKBA 1NGHA 3MN6A 3FE1A 3VGMA 3VEOA 4NO7A 3ATVA 2ASPA 1U2VA 4CI6A 3R8EA 3R6MA 3S41A 1HKGA 2FXUA 5AZIA 1TYQA 3CERA 3O80A 3A8YA 4H03B 2CH6A 4M7YA 3CI5A 3LM2A 4B1XB 3ATUA 4H5TA 4DCHA 2GEMA 1GLEG 3WUHA 4BRIA 2QWPA 4H5RA 5AQZA 4WYBA 2P9NA 3BF1A 5ADXH 1RGIA 2FSJA 3VPZA 4GY2B 4AM6A 3EKSA 2ZGZA 2IVPA 2ITMA 4FWKA 3KZBA 3O08A 4H5NA 5LJWA 2A3ZA 4FOIA 5EXWA 3SMSA 4BRNA 1BU6O 1HX1A 3QBXA 2HF3A 3MMVA 3ZEUB 1LOTB 3IMXA 2P9SB 1H1VA 4H5WA 4JHDB 1K8KB 3O1BA 1Q18A 3FGUA 5AQWA 3ZX3A 3U8XA 1IJJA 4BROA 1HJOA 2FSNA 2P9LB 3KVGA 5BREA 3CJBA 3L4IA 5AQPA 2GUPA 3TPQA 1TYQB 2GWKA 3UB5A 2P9UA 4QS9A 3UE5A 4O5FA 3U9ZA 1X9JA 3EN9A 2EWSA 2D0OA 2P9NB 2KHOA 4A2BA 4IO8A 1E4FT 2P9PB 4FWPA 4RCHA 3WQUA 3M3ZA 1X3MA 4A61A 3HI0A 1ESVA 3C7NB 1BO5O 4I6MB 4BRAA 2ASMA 1BA0A 4B9QA 3P4IA 3FZHA 3FZFA 2ZF5O 3J8AA 4BGAA 1QZ6A 5BPMA 5AQHA 4BG8A 1J6ZA 4BC5A 2QWOA 3O4WA 4DHYA 1RFQA 3VF2A 2YHYA 2J4RA 2YI1A 3WXLA 4JD2B 5AQYA 1GLAG 3DXMA 5EVZA 5F0XA 3CQXA 3GG4A 5AQNA 5EOYA 1TUYA 2D1KA 4FWRA 4FWNA 1MWMA 3LDLA 3LDOA 1BWFO 2V51B 3FZLA 3CJ9A 3GE1A 1NGDA 4FO0A 5JLFA 4DQ8A 2QM1A 3A5MC 4BRQA 2V7ZA 5KPZA 3F9MA 2W41A 1S3XA 2E1YA 3MN5A 3QDKA 1ATNA 1XUPO 3FZKA 3RSEB 4Y0WA 1MDUB 2Q1NA 2V7YA 5AZJB 4WQ4C 3GBTA 1JCEA 4H5VA 5AQVA 1NGEA 2E2PA 2WUSA 4CBWA 4CBUA 4NB4A 1BOTO 4FOEA 3DXMB 3MN7A 2ZWHA 5BRFA 2QWMA 1KAYA 3D2FA 3H3NO 3ID8A 3UKRA 5AQKA 4BQZA 1C0GA 4PL7A 1T6DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F9OA 3NMUA 5FRMA 3O9QA 3VA3A 3SUOA 4IG0A 2YJEA 3KD5E 5BN8A 3VGLA 5HROA 3D2EA 1B92A 1NJZA 3D45A 5C12A 1JCGA 3IDHA 4RTFD 3DI6A 3CJ1A 3OS2A 1N6QA 4IEEA 5J1EA 2XRIA 1XC3A 1NGAA 1FXXA 1VQ6N 4L8RB 4B9LA 2Q0UA 3C0BA 3K5OA 1SKWA 3IS9A 1VQ9N 1GLBG 4CEQA 4W5TA 4BE1A 3N4PA 4U67L 5C0YA 4GKKK 2CGLA 2OZSA 4G9ZA 1C1BA 3GOIA 4A5AA 2UXDK 5C24A 2XY5A 4M41A 3O4NA 5AQOA 1N5YA 4BR9A 3EEQA 3LPUA 1VQPN 4DQPA 2IIRA 4CJSA 4BR0A 3CD6N 3DXKA 1NGCA 3KWGA 3PO4A 1ITGA 3NH1A 3H6EA 1N8RO 1YJ9N 4CD1A 3WXIA 3MAQA 4BVPA 3QICA 4FJ7A 4DV0K 1NGBA 5IWAK 3VF4A 3MCPA 4OX9K 2P9IA 4H0VB 4BRPA 4FM0A 1GOBA 4WQ5C 1TVRA 3DMJA 4F4KA 2VYPA 2VQEK 4KKOA 5C2FA 4FJKA 5E41A 1GOAA 5B8HA 4GKJK 4DTOA 4FPBA 1RTDA 1ATSA 3HM8A 4DR7K 3TSQA 3SQ1A 1KAXA 1U48A 1A5XA 1WSJA 4GV3A 4FZXC 1HNXK 1RT6A 1LWFA 3DOKA 3SK3A 1TAUA 4XEIA 4ELVA 3C6HA 1RILA 3QINA 3VERA 3WXJA 3M8PA 1M1KO 4B8CA 2HHHK 4IFVA 4FSVA 3AGRA 1EO1A 3HPOA 4BRKA 2E6MA 3MXJA 3QEVA 4PHTX 5HP1A 3D7EO 3MX5A 3QEXA 4CJUA 4HTUA 4B3RK 3UKUA 4ILJA 3OYKA 4DR5K 1S6PA 4IEIA 4CJVA 4LF6K 3OYMA 4DTXA 4HWIA 3ZETA 1ZBSA 4KH5A 4DF4A 4FCYA 4RG8A 2GELA 3S3MA 3T1YK 5JS1A 2Q36A 5F2RA 4I9LA 1HNWK 1K8KA 3SBGA 3CQYA 3CHWA 4CVNE 3VESA 2G8IA 3TAQA 1TKZA 5TKYA 4CJ3A 4ZTFA 4A59A 4EAHD 2HNZA 1NLVA 2G8KA 2ASOA 4FYDA 5MLCQ 2RPIA 1Q86O 4JLHA 1BA1A 4G1QA 2OZMA 3JAMO 1YHQN 2IAJA 1KXPA 2HBJA 3TABA 4JS5A 1BGXT 5CE3A 4YOYA 5M1FA 3OYEA 4A2AA 1EX4A 1TK0A 2GTDA 1C0FA 2BUPA 4CZMA 1WUAA 3AAPA 1TKXA 4DV5K 2HHQA 5GINA 3UIQA 5J2NA 1YJNN 3BUZB 4K0KK 4CGJA 3UKRB 1WBDA 4PL8A 5LJVA 3P5JA 3LP0A 3SUPA 4CF1A 3TARA 3HZ6A 2O8BA 3T19A 4CF0A 1IH7A 2ZJRL 4FK2A 1E3MA 1GLDG 5BPNA 4M3RA 3ZT4A 1QHAA 4BVOA 1XI1A 4LFAK 5AQIA 3D2EB 1T6CA 2FBXA 2NRZA 4LF5K 3E9PA 3FR0A 3L2UA 3KTQA 4KHQA 4IKFA 4E19A 4DR1K 4FM1A 1SQKA 4DTMA 1CXUA 2QXFA 2YHWA 2KZMA 4JI5K 3HRGA 4CZLA 5FDLA 4JI6K 1ASWA 3HT3A 3ZSVA 4K41A 3HPHA 5AQXA 1W9HA 5FRNA 1RT2A 3DRSA 3VQQA 5E84A 2NRTA 3RSEA 4PA1A 4DV7K 5AQFA 5AZJA 1QZ5A 3NDKA 4UY8O 1S5JA 1ATRA 3HM9A 2FC0A 3WT0A 3E66A 4Z0UA 4CJEA 4B9VA 4ILGB 3VQ7A 3A0IX 3MWTA 3CCEN 5AQTA 1LCUA 4YDUC 3KK1A 1VQLN 5M1QA 4BR2A 1ZBUA 3DXKB 4J8FA 5HL7L 4PUOA 3VEYA 4KBOA 3PO5A 4MLEA 4JKFA 4JAXA 3BP8A 4BRMA 1YVNA 1S72N 4H0TB 4CF9A 5M1OA 2VGNA 1RDWX 3WQTA 2BDPA 1HNVA 3V1RA 4ZHRA 3O9RA 2P9IB 4CFCA 1RBUA 3I8DA 1YIJN 5KGWA 5DM6L 5BN9A 1ZC6A 4AQYK 2E4LA 2P9SA 2IGIA 4FPAA 4DG1A 4IBNA 3SAFA 4JHDA 4LFBK 4WQ5A 2ZQBA 4AHSA 5AR0A 1NG9A 1V4TA 3ULEA 4B9UA 4LH5A 3VETA 3BF3A 2YX6A 4CHQA 2JLEA 4H4OA 4NO7A 1EKEA 2ASPA 3EYZA 4WF9L 1RBTA 3VQ9A 1HKGA 3OYNA 2FXUA 2QTDA 5AZIA 3CERA 3KJVA 2CH6A 3MX2A 1CXQA 4H5TA 2GEMA 1D8YA 2QWPA 1ZBHA 3HOTA 2R7YA 3M8RA 3AA2A 4NLCA 2IVPA 4JV5K 1CZ9A 3ENBA 4DFKA 1VK0A 4FOIA 4YNQA 4CJPA 4O55A 3CF5L 3LP1A 3OYAA 4CF2A 1HX1A 2A1RA 2P5GA 3O9SA 4U7BA 1IBLK 3IMXA 1TV6A 4H5WA 4DSIA 1KLNA 3B6PA 1K8KB 1VQ4N 4K8ZA 1KTQA 4KB1A 1FKOA 3ZX3A 4LFCK 1HJOA 2FSNA 5FROA 4FLYA 3DLHA 1REVA 3I0SA 1U45A 5HOOA 3HVTA 1XHXA 3VQ5A 4QS9A 3UE5A 3QERA 4O0IA 3LALA 1VSDA 4O5FA 3MWPA 3EN9A 3R3LA 2EWSA 3RRHA 4A2BA 4Z4IA 4IO8A 2HBLA 1Y97A 3LAMA 4OGCA 3AVFA 4O5BA 3NGIA 1BO5O 3OYFA 2ASMA 1Q7YO 4OPKA 4B9QA 4DQSA 3THWA 1HQEA 3J8AA 4BGAA 2YNIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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