2QM1A

Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
SNAMDKKIIGIDLGGTTIKFAILTTDGVVQQKWSIETNILEDGKHIVPSIIESIRHRIDLYNMKKEDFVGIGMGTPGSVDIEKGTVVGAYNLNWTTVQPVKEQIESALGIPFALDNDANVAALGERWKGAGENNPDVIFITLGTGVGGGIVAAGKLLHGVAGCAGEVGHVTVDPNGFDCTCGKRGCLETVSSATGVVRVARHLSEEFAGDSELKQAIDDGQDVSSKDVFEFAEKGDHFALMVVDRVCFYLGLATGNLGNTLNPDSVVIGGGVSAAGEFLRSRVEKYFQEFTFPQVRNSTKIKLAELGNEAGVIGAASLALQFSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase
publication title Crystal Structure of Glucokinase from Enterococcus faecalis.
rcsb
source organism Enterococcus faecalis
molecule tags Transferase
total genus 104
structure length 324
sequence length 324
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qm1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qm1A02
1H1VA 1HUXA 4JD2B 3CI5A 4JN4A 4BROA 5BR9A 1KAYA 1IG8A 1QQOA 3O80A 2FLOA 4KBOA 1XUPO 2QWMA 3GL1A 3DXMA 5AQHA 3UKRA 2QW9A 3CJ1A 3QICA 4B1YB 1R59O 2FSJA 4BRHA 4H5NA 2A42A 2P9KA 5I9EB 4QS7A 4A2AA 3MMVA 5FPEA 1ATSA 1OKJA 5FPNA 3W0LA 4CBWA 1QQMA 2ZWHA 4PL7A 1QHAA 3KVGA 4IO8A 3MN6A 5ELZA 2FSNA 1X3MA 3ZEUA 1MWMA 5B8HA 3CQYA 2P9UB 2ASMA 1TYQB 2A40A 4H0PA 3JXUA 4BGAA 1J6ZA 2IVPA 4O8KA 3RSEB 2Q0RA 1ATNA 4B1ZA 1NGGA 2P9NA 1LCUA 2ZF5O 4FOIA 5BN8A 4BQZA 3P4IA 5AQWA 1BG3A 3ZX2A 1XQSC 3VENA 1S22A 4JD2A 1G99A 1JCFA 2Q0UA 2UYTA 4HWIA 5FPMA 4I6MA 4QS9A 5AQPA 5EXWA 1QZ6A 3VGKA 1NM1A 3LDLA 3WQUA 3H1QA 3LL3A 2P9LB 3A5OC 2CGJA 1Z6RA 3U9ZA 5AQUA 4A62A 3CJBA 3O8MA 5BRDA 1HPMA 4ISGA 4CZLA 2FF3B 3SMPA 1NGCA 2VCPA 4M7XA 3QDKA 4CI6A 2D4WA 2E1YA 1GLCG 4FWNA 3CHWA 1XC3A 1E4GT 5BREA 3A5MC 5AFUH 1NGDA 3DAWA 4EHUA 2P9UA 3LDQA 4BRKA 2HOEA 1TUYA 2F9TA 4BGBA 1TYQA 3QB0A 3FFKB 2Q1NA 2QM1A 5AQTA 4YDUC 4BRLA 3RSEA 3H1VX 4BC5A 3ZX3A 1JCGA 4FPBA 3A5NC 1BDGA 2BUPA 3QFUA 3VEOA 4BQLA 3EKSA 3H3NO 1NGEA 5AZIB 3SJHA 3VEVA 2IIRA 3FE1A 4PL8A 4DQ8A 1U2VB 2P9IB 1RGIA 3M6GA 3TU5A 3ATUA 3VGMA 2GEMA 1BU6O 3LDNA 2I7NA 3EN9A 3VEZA 3HTVA 3C7NB 3TPQA 3WXIA 2P9LA 1HX1A 1HJOA 3VEWA 1SZ2A 5JLFA 4H0TB 2YI1A 3WT0A 3ULEA 3VF2A 3GE1A 2A6AA 2EWSA 4FWQA 1GLDG 2FXUA 4FPAA 3UB5A 3FZHA 3LDPA 5AQIA 1BA0A 5AQNA 3GBTA 3IFRA 5FPDA 4FWOA 3WQTA 1NGAA 4BRCA 3GOIA 5AQFA 2NRHA 4Z94A 2CGLA 2V7YA 4B1VA 5LJVA 1RDWX 4H5WA 2H3GX 1BWFO 4BR0A 1MDUB 2AA4A 3DJCA 4FWLA 3UE5A 3CETA 2GELA 3ATVA 3J8AA 2HF3A 2V51B 3O6WA 3A0IX 5AZIA 4ISEA 1U6ZA 3W3DA 2V7ZA 1DGKN 1BOTO 3O08A 4PKHA 4YDUA 2V52B 2P9IA 3KHYA 3EZWA 5EVZA 3UKUB 1NGBA 2FSKA 1YUWA 3OHRA 3QBXA 2I7PA 3FGUA 2AP1A 4XEIA 3R8EA 4B9QA 2YHWA 4CZJA 2PAVA 3C7NA 4C23A 2QWLA 4H0XB 4BR7A 1V4SA 5KQDA 3GG4A 5AQRA 3VEXA 4H0OA 4CZHA 3FZMA 4CZMA 3ZETB 4J8FA 5JLHA 1NGFA 4H0YB 4IWVA 3HZ6A 1HKCA 5EOYA 4BRDA 5F2RA 1T44A 4FWSA 5ADXH 3FLCO 2E8AA 1NBWA 2OANA 2D1KA 1E4FT 1HLUA 1V4TA 3L6QA 4WQ5C 4M63C 5LJWA 3QBWA 4K42A 3FR0A 1ZXOA 3L0QA 1P8ZA 3AY9A 3VESA 3CERA 4JAXA 1NMDA 4BRAA 5AQOA 1SAZA 2E1ZA 3MDQA 4MO4A 2ASOA 4B1WB 2YJEA 4K41A 1GLJO 2D0PA 2GTDA 3BUZB 3BF3A 3WXKA 1SQKA 3D2EB 3VGLA 4LC9B 1HKBA 4BG9A 3UKUA 2A3ZA 2HMPA 3BF1A 4F9OA 3DXKB 3AAQA 5AQZA 2ITMA 4IJAA 5ADXA 2IVOA 5AZJB 5AQSA 3SMSA 4FWPA 5AQYA 5BN9A 4B1UB 3LDOA 3EKUA 3JS6A 3VETA 4BRIA 4BRPA 5JMVA 5KPTA 3G25A 1QZ5A 4XH4A 3ZETA 4IXCA 2QXLA 3D7EO 4BC2A 5CE3A 1NGIA 5KPZA 2NZTA 1WUAA 4WQ4C 4CZIA 5BRHA 3DWLA 2W40A 3KZBA 2E2QA 3CJ9A 2GWJA 4MLEA 3ENHA 1GLBG 2QWRA 3WUHA 4CBXA 1Q18A 2IVNA 4NB4A 4EHTA 3BEXA 2P9PB 2E88A 4IJNA 4CJ7A 1BO5O 5AQMA 4PKIA 2YHYA 2YCHA 4H5VA 4FWKA 5AQJA 1X9JA 4K43A 5KPRA 3D2FB 3D2EA 1S3XA 3C0BA 4MLHA 1YVNA 4FOEA 3DXKA 1GLFO 2Q97A 3MK6A 3WXLA 4BRQA 4CZGA 3LM9A 4Y0WA 3ID8A 2CH6A 3VF6A 5AZJA 3ZEUB 3SK3A 2D0OA 5JICA 4O5FA 4BR9A 4BRFA 3CJ7A 3O5BA 3VOVA 2GWKA 1JCEA 5AQLA 5BPLA 2E2OA 3H3OB 4BVPA 2VWBA 4A61A 3R6MA 2QWNA 1TUUA 2DPNA 2YJFA 1Y64A 2ASPA 2E20A 5TKYA 2E2PA 2VYPA 4IZ9A 5BRFA 5KQ8A 1D4XA 1K8KB 1U2VA 3I33A 3MN5A 3ZX0A 5AQXA 4CD3A 4XH5A 1ZBSA 4I6MB 3A8YA 2P9PA 4E1JA 4PKGA 4WQ4A 4BVOA 4JHDB 2E2NA 3HSCA 3VEYA 4CD1A 4FO0A 4EFHA 3M3ZA 1C0FA 2QWQA 2KHOA 5BPNA 3IUCA 2Q31A 1KAZA 3D2FA 2P9SB 3GDQA 3CIPA 1MWKA 4RCHA 5EY4A 3MCPA 3R9PA 1C0GA 4M7YA 1WOQA 3AARA 1DKGD 1NGHA 3ENOA 4EAHD 4BRMA 5BPMA 3U4LA 1YAGA 4H03B 3U8XA 3EL2A 2A41A 2QWPA 1GLAG 4NO7A 5AQVA 3O1BA 1ATRA 1RFQA 3CJCA 1YXQA 4BR2A 3HBTA 4BC4A 2J4RA 2CH5A 3F9MA 4K25A 1GLLO 3I8BA 4FL9A 4CZFA 2FF6A 4CBUA 3B8AX 3L4IA 3MN7A 1K8KA 3CQXA 5AQGA 5E26A 3IMXA 4HTLA 1EQYA 3WXJA 4A2BA 4L3QA 3M1FA 5LY3A 4BC3A 4JHDA 2Q36A 3WEEB 3O4WA 4DB3A 1Z05A 1X3NA 3ULEB 3EO3A 2BTFA 2P9SA 4GNIA 4XH1A 1ZC6A 5AQKA 3FZKA 4ISFA 3QMLA 4AM7A 4BG8A 1HKGA 1T6CA 5EX5A 5F0XA 4RWTA 1IJJA 4MO5A 4CZKA 3MN9A 3VERA 3VPZA 2HF4A 1NLVA 4CZEA 3IDHA 2CGKA 5AQQA 2NLXA 2QWOA 4RTFD 1LOTB 3AAPA 2Q2RA 2YHXA 3DXMB 3HM8A 2GUPA 3LM2A 3UKRB 1ESVA 2ZGYA 3FZLA 5AR0A 4DHYA 1BUPA 1DEJA 3H46O 4FWMA 4BR5A 5E84A 2WUSA 1KXPA 4WQ5A 3U9DA 2PBDA 4FSVA 3O1WA 4JNEA 4AM6A 1GLEG 2P9KB 1CZAN 4B1XB 3A5LC 1NWKA 4QS8A 2ZGZA 4BRNA 2W41A 3H6EA 4GY2B 1KAXA 1MA9B 4BR4A 3CJAA 3HI0A 4FWRA 4H5TA 3S41A 3H45C 4H5RA 2F9WA 1BA1A 4H0VB 4BREA 3QFPA 3WEEA 5AFUA 4BRGA 1T6DA 2A5XA 3FZFA 1QQNA 3VF4A 3SLCA 2P9NB 4DCHA 1NGJA 5F1XA 3BP8A 4WYBA 4EIAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4M3WA 4FW1A 2G8IA 4BROA 4CGFA 1QQOA 5KI6A 2FLOA 1XUPO 4BE1A 3IAYA 3HL8A 5AQHA 3C6TA 4JS5A 3F2KA 3QICA 4JV5K 1WNSA 3BZCA 3CM5A 3MCAB 2KZZA 1IKYA 3MMVA 1ATSA 4YHHK 2HHXA 1A5VA 1YITN 4XIUA 3CPWM 2ZWHA 3V9UA 4PL7A 1QHAA 3KVGA 3AVJA 4G9ZA 1LAWA 3OYAA 3HOSA 1UAXA 2P9UB 4JKEA 1TYQB 2A40A 3T1AA 3KK3A 3CCVN 2UUBK 2P1JA 3NMUA 1ZYQA 1VQPN 3P4IA 5AQWA 1VQLN 1LV5A 1S22A 4FK4A 4JKHA 1VSFA 1VQMN 2UYTA 2Z1IA 4DV7K 2IC3A 3F5TA 5J2NA 2G8UA 3ZT3A 1QZ6A 3THXB 1YJWN 3LDLA 3WQUA 3H1QA 2O4IA 3TAFA 4M42A 5AQUA 4JKBA 5GAGP 3CJBA 3O8MA 3CCSN 5BRDA 3PSIA 1HPMA 4KTZA 4M45A 2FF3B 3U3GA 2VG7A 2VCPA 1VQON 3NH0A 1L5UA 1GLCG 4CJRA 4FWNA 5J1EA 1E4GT 1OVYA 4FW2A 2W42A 2HOEA 3NF6A 3RMDA 1TUYA 2F9TA 4NXNK 4CF1A 2Q1NA 4B9LA 5IWAK 1ZBIA 2JLEA 3S3NA 3H1VX 1S5JA 3CCQN 5C42A 4BC5A 2HHQA 1CLQA 1Q7YO 3A5NC 3P39A 5CYMA 3DLRA 3QFUA 4CJFA 3CFOA 3SJHA 4JKGA 3OTOK 4I2QA 1VAZA 1HR0K 2PYLA 4AHUA 2QXFA 3M6GA 3K5OA 3LDNA 4C1NK 2ZJQL 1Q86O 3EN9A 2X74A 3WXIA 1N8RO 4LY7A 1HX1A 4H0TB 1BI4B 4DTNA 4AHCA 2A6AA 4O0JA 1GLDG 2VWKA 4IKFA 2X6NA 2D0AA 5AQNA 2Y1JA 4FWOA 5AQFA 2NRHA 3V9XA 1BCMA 1J53A 2BE2A 4CGHA 3C95A 4Z4HA 1IO2A 4LFCK 4CIGA 1BISA 1N32K 1O13A 3CETA 3L2WA 2YNGA 5AZIA 2V51B 3S9HA 4QCLA 2RF2A 4JI2K 1DGKN 2V52B 3KHYA 3EZWA 4WFBL 3OHRA 1YUWA 4R79A 1HNVA 3PX6A 3N4QA 1KVBA 2AP1A 4EP4A 2YHWA 5GAEP 4H0XB 3G0ZA 1C1CA 2ITGA 4BR7A 3OJSA 4AILC 3VEXA 4H0OA 4E1NA 3VA0A 4F2SA 2RPIA 4DLGA 4CZMA 2ATQA 4IWVA 4Q5VA 3SPYA 4BRDA 3OYFA 1XMOK 3ZSOA 4LFBK 4FWSA 2E8AA 4FM0A 4DR1K 5C0YA 1VQ7N 1V4TA 3L6QA 4IFEA 1R0AA 4DTXA 1CXUA 3FR0A 4IEIA 4JS4A 4JI3K 3OA9A 1P8ZA 1S1TA 1O1WA 1W97L 4JAXA 1X9SA 4BRAA 5AQOA 3HM9A 4MO4A 3NFAA 4AHSA 3TABA 4HUEA 3BY5A 2D0PA 3BUZB 3OBWA 4MDAA 3WXKA 4PQUA 4LC9B 3UKUA 3AVKA 3S3OA 5DM6L 2HMPA 1SV5A 5AQZA 2ITMA 3ASMA 3RR7A 5ADXA 3SMSA 5MLCQ 3TAQA 4DR6K 3LDOA 3T7ZA 3VETA 3LZJA 3KTQA 3VQQA 1L3UA 4FJ9A 3ZETA 4IXCA 1J54A 3S3MA 1OH5A 2YV0X 3HVRA 2IOCA 2QK9A 1NGIA 4OPKA 1NK9A 4B9MA 1RBRA 4CZIA 4O8UA 3OVNA 3NVKA 1WN7A 2E2QA 1VQ8N 1YTUA 4JEPA 3ENHA 1WAFA 2HHUA 1N36K 3WUHA 4M3ZA 1KFDA 4W5QA 1IBLK 2A1RA 4EHTA 1P90A 4ILHA 3K58A 2P9PB 1VSHA 1BO5O 2Q3SA 2KW4A 2WONA 2YCHA 5CY4A 1JLGA 2RN2A 5KPRA 1L3TA 4FYDA 1S1WA 3KLEA 3D2EA 2WOMA 1WSIA 3AVBA 2W6KA 3DXKA 2Q97A 3MK6A 4FOEA 3ZSVA 2E6LA 5TKWA 4C1NI 3VF6A 5AZJA 5GIPA 4DUZK 1TK0A 2D0OA 4OJRA 4KH5A 5JICA 4O5FA 3C6AA 4BRFA 5A2QO 3RRHA 3CJ7A 4YOXA 2HB5A 5BPLA 4EP5A 3H3OB 1CZBA 2VWBA 4CEFA 1KLNA 4A61A 3CG7A 2QWNA 3JSMA 1A5XA 3HP6A 1TUUA 3OJUA 3IS9A 3HPHA 1SKRA 4FJMA 5BRFA 3O3GA 4GVMA 1ASUA 1U2VA 4QOZB 1YT3A 3ZX0A 4DTJA 5AQXA 1XHXA 1X9MA 4I6MB 4CHOA 1SS6A 3C6HA 1SL2A 3E01A 1LWEA 2E2NA 3HSCA 3VEYA 3SI6A 1HNZK 4DSFA 1VQ4N 1NNEA 5IT9O 1W0HA 4PHTX 3RTVA 2PZSA 4W5NA 3SCXA 1IH7A 4CEQA 1KAZA 1B9DA 4DR5K 4CJ3A 1NKEA 4ZTJA 1S1XA 1SKWA 2O8FB 4DUYK 4M7YA 1GOCA 3ENOA 3OYLA 3MXJA 4HTUA 1WB9A 4FK2A 5GIOA 3TR8A 3K5LA 3HBTA 3AVMA 3SNNA 3DLEA 4DV0K 5FLXO 1BQMA 3TSUA 3F9KA 4DSEA 3QEPA 4IOCL 1G15A 1WLJA 4CJVA 3L4IA 1YIJN 2B5JA 3CQXA 4DTUA 3VQ9A 3CCLN 3IMXA 2F4VK 1KTQA 4A2BA 1IBMK 4JHDA 4M3UA 1TGOA 3OS1A 4V19S 3P1GA 3VQPA 3VQ8A 1GOAA 3I0RA 3WEEB 4LFAK 2HBKA 1X3NA 2JWLA 3TTFA 3OS0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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