2QM1A

Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
SNAMDKKIIGIDLGGTTIKFAILTTDGVVQQKWSIETNILEDGKHIVPSIIESIRHRIDLYNMKKEDFVGIGMGTPGSVDIEKGTVVGAYNLNWTTVQPVKEQIESALGIPFALDNDANVAALGERWKGAGENNPDVIFITLGTGVGGGIVAAGKLLHGVAGCAGEVGHVTVDPNGFDCTCGKRGCLETVSSATGVVRVARHLSEEFAGDSELKQAIDDGQDVSSKDVFEFAEKGDHFALMVVDRVCFYLGLATGNLGNTLNPDSVVIGGGVSAAGEFLRSRVEKYFQEFTFPQVRNSTKIKLAELGNEAGVIGAASLALQFSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Glucokinase from Enterococcus faecalis.
rcsb
source organism Enterococcus faecalis
molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
total genus 104
structure length 324
sequence length 324
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qm1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qm1A02
4RTFD 3LDNA 1GLBG 4BC2A 2A42A 1S22A 4BGAA 4BRAA 3ID8A 5FPEA 1Y64A 1X3NA 4BRIA 3VOVA 4FWNA 1U2VA 1NMDA 3EKSA 1T6CA 3WXKA 2YHWA 2AA4A 5EVZA 5BPNA 4FWSA 3CJAA 4KBOA 5AFUA 2J4RA 1NBWA 3CERA 4H0PA 2OANA 4BQLA 2E88A 3C0BA 4CBUA 1RDWX 4H5WA 4BRHA 3UE5A 2E1YA 4AM6A 4XH4A 1KXPA 3FR0A 3ZETA 4FWMA 3MN7A 2HOEA 5AQUA 1BOTO 4CD1A 3B8AX 2FSJA 4B1WB 1YXQA 3VEXA 5BRFA 2D0PA 3SMPA 2CGLA 4EAHD 3QBWA 4QS9A 5BN8A 3AARA 3GG4A 4CZJA 1BA0A 2QW9A 3JS6A 4JNEA 2P9KA 3VGKA 1BDGA 1Z05A 3D7EO 3LDQA 2FSKA 4C23A 3RSEB 3UKRA 1LCUA 2FLOA 3OHRA 1X3MA 2V52B 4M63C 4B9QA 1V4SA 3CJ9A 2P9SA 3ENHA 1ZC6A 1TUYA 4PKGA 4BGBA 4CZFA 5FPDA 1WUAA 3H1VX 3ZEUA 2A5XA 4H5NA 4PKIA 2IVPA 3WXLA 3MN5A 4MO5A 3SJHA 5JLFA 2P9NB 4B1UB 3MN9A 1K8KB 3CQYA 2NZTA 5AQIA 5F0XA 3M1FA 2YHXA 4JD2B 1J6ZA 2DPNA 5BRDA 4K25A 4FOEA 1E4FT 2W41A 3BUZB 3MDQA 4BROA 3IUCA 2QWOA 4JN4A 1X9JA 4H0XB 1QQMA 2P9KB 2HMPA 5AQKA 2A6AA 5CE3A 2QWLA 4XH5A 4NB4A 3UKRB 2UYTA 4PL7A 1NWKA 2P9LA 3LDOA 4PKHA 1H1VA 3VF4A 3WT0A 3DWLA 3DXMB 3WXIA 1EQYA 1XUPO 4M7XA 5BR9A 3FLCO 2CH5A 3A5NC 1C0GA 3ATUA 4BREA 3VEOA 3R8EA 4CBWA 1T6DA 3R9PA 1S3XA 3QICA 1TUUA 1JCFA 2E20A 5ELZA 3M3ZA 4HWIA 4RWTA 2D0OA 3O1BA 2P9IB 1YAGA 2YI1A 3L0QA 3DJCA 4XH1A 3HM8A 4BG8A 2P9NA 1GLEG 4JHDA 1GLLO 1C0FA 1NGDA 3C7NB 3H45C 1HX1A 1TYQB 3ULEB 1P8ZA 1NGCA 2QWRA 3EN9A 1WOQA 5BRHA 5EXWA 3VENA 4ISEA 1NGBA 4RCHA 3IDHA 5AQXA 4DHYA 5AQGA 3MK6A 4B1YB 4QS7A 4BR7A 1E4GT 3VESA 3AY9A 5FPNA 5F2RA 2GWKA 5BPLA 4GNIA 3CJ7A 2GWJA 4MLEA 5AQNA 3QB0A 4K43A 3FZLA 3BF3A 2A40A 5AQOA 3HBTA 5AQPA 1ATSA 3ZX2A 4IWVA 2F9TA 3CJ1A 3H6EA 3KHYA 1NGFA 1GLCG 4FPAA 4O8KA 3SLCA 2VWBA 5BREA 3MN6A 4A62A 2Q0RA 3GOIA 1BWFO 2HF4A 2P9IA 5AQMA 5AZJB 5AR0A 4BVOA 1BU6O 3J8AA 1SAZA 1ZXOA 2QWMA 4O5FA 3C7NA 1D4XA 1GLJO 4Z94A 4XEIA 1RGIA 4CZGA 3M6GA 2E8AA 3BF1A 4MLHA 4BRDA 1XQSC 5AQZA 5I9EB 1HUXA 5LJWA 2E2QA 1MA9B 1OKJA 3R6MA 4BRMA 1HKBA 3O80A 3EZWA 4BC5A 3VGMA 2V7ZA 4BR5A 4AM7A 2Q31A 2Q1NA 3H46O 3W0LA 3AAQA 4BRPA 3EO3A 2P9SB 2P9PA 2Q2RA 5KQDA 2ZGZA 1K8KA 2I7NA 3DXKA 3TU5A 3ZEUB 5FPMA 4A2AA 1IJJA 2PBDA 3GBTA 3WQUA 1IG8A 4I6MA 4IXCA 4LC9B 4WYBA 5AQSA 4DB3A 4CZKA 3FZHA 1U2VB 5ADXH 4HTLA 4CZHA 1YVNA 1BG3A 4WQ5C 1RFQA 3TPQA 3CETA 4BG9A 2GTDA 5F1XA 3BEXA 3O6WA 3WUHA 4EFHA 4BR9A 3FZFA 4M7YA 3CIPA 1YUWA 2EWSA 3VF2A 3U9ZA 4B1ZA 2D4WA 2NLXA 1KAXA 1R59O 4ISGA 5AZIB 4WQ4A 2VCPA 1MWKA 1ATRA 3FFKB 3D2FA 4H0OA 3O4WA 3KVGA 1ZBSA 2YCHA 4JHDB 3O5BA 5AQWA 3SK3A 4A2BA 4DCHA 5LJVA 2KHOA 3ULEA 5AQFA 2QM1A 4EIAA 2QWNA 3ZX0A 4A61A 5JLHA 4BRGA 4J8FA 5JMVA 1NM1A 2HF3A 5EY4A 3DAWA 4FWQA 1ESVA 2A3ZA 4BR2A 2F9WA 1MWMA 3VETA 2ZWHA 5AQVA 1NGHA 3A0IX 3H1QA 2GEMA 3QFUA 5BN9A 3ZX3A 3ENOA 4WQ4C 4B1VA 4H0YB 4YDUC 4BRLA 2ZF5O 1G99A 2VYPA 5AQLA 2YHYA 1CZAN 1HPMA 4FSVA 5B8HA 3QBXA 4IO8A 4H0VB 3VEVA 4BVPA 3D2EA 3A5OC 3GE1A 3CQXA 1JCGA 4K42A 4CZLA 4JAXA 3D2FB 4DQ8A 4BC4A 1NGGA 3IFRA 3SMSA 2P9UA 4B1XB 3KZBA 2BUPA 4FWRA 2ASOA 4BC3A 2V7YA 1T44A 2QWPA 3S41A 5AQYA 1DEJA 5AQQA 5AZJA 5AQTA 3O08A 1V4TA 5EX5A 4YDUA 2YJFA 4FWOA 1BO5O 4H5VA 3MCPA 3EKUA 3VGLA 4IJNA 3VEWA 4BRQA 3A8YA 3UB5A 3CJCA 1Z6RA 2FXUA 1DKGD 2H3GX 3EL2A 3I8BA 1QQNA 1QQOA 4GY2B 5LY3A 2QWQA 1GLDG 1JCEA 4CZEA 4IJAA 4EHTA 3VEYA 2WUSA 2I7PA 3GL1A 1HJOA 2P9PB 1SQKA 3P4IA 3ATVA 3U9DA 5E84A 1TYQA 3UKUB 4FWPA 5AQHA 4CBXA 3DXKB 5EOYA 2CGKA 2Q0UA 2FF3B 3O8MA 2FSNA 3LDPA 3L6QA 1QZ6A 1XC3A 4I6MB 1QHAA 4FL9A 5BPMA 3O1WA 4BRFA 1NGIA 2CH6A 2D1KA 4H5TA 5TKYA 3LM9A 3HTVA 1KAZA 5AFUH 4CD3A 1HKCA 3FGUA 3FZKA 3VERA 4BQZA 5AZIA 1GLFO 2ASPA 2P9LB 2GUPA 3CI5A 2CGJA 3CHWA 3U8XA 5AQRA 5JICA 3DXMA 4ISFA 4CJ7A 2FF6A 3HI0A 1QZ5A 4BRNA 3A5MC 2Q36A 3BP8A 5E26A 3RSEA 2AP1A 3VPZA 5KPZA 4BR0A 5KPRA 3UKUA 2E1ZA 2IVNA 4CZIA 1BA1A 4H03B 2YJEA 3LM2A 4L3QA 4BRKA 1MDUB 1U6ZA 1NGEA 2BTFA 4BR4A 3WQTA 3L4IA 4E1JA 3WEEA 1BUPA 3VF6A 3VEZA 3H3OB 1NLVA 5AQJA 1NGJA 2NRHA 2E2NA 2E2PA 1DGKN 1HKGA 4F9OA 3H3NO 4EHUA 1LOTB 4QS8A 1GLAG 3FE1A 1Q18A 3W3DA 3A5LC 3IMXA 2V51B 4PL8A 1HLUA 4FPBA 1KAYA 3FZMA 3D2EB 2ITMA 2A41A 3QMLA 4CZMA 5KPTA 2QXLA 5ADXA 4JD2A 4FWKA 4BRCA 2ZGYA 3QDKA 5KQ8A 3AAPA 2Q97A 4FOIA 2ASMA 4FWLA 1SZ2A 3I33A 2P9UB 4Y0WA 4NO7A 4WQ5A 2PAVA 3JXUA 2IVOA 3HZ6A 3GDQA 1NGAA 3LL3A 1ATNA 4H0TB 3WXJA 3HSCA 3LDLA 2E2OA 4CI6A 3G25A 3WEEB 3QFPA 2IIRA 2W40A 3F9MA 3MMVA 4MO4A 3U4LA 3ZETB 4H5RA 4FO0A 2GELA 4IZ9A 3CJBA 4K41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YOTA 1GOBA 4GVEA 2Z1JA 4J2BA 4N5SA 1UA1A 1W9HA 2A42A 1VSMA 1U48A 2D0BA 1TKDA 2IOCA 4LH4A 3S3OA 4BGAA 5FPEA 3EZ5A 4BRIA 1VQKN 4IBNA 1T6CA 3WXKA 4CJKA 1VSJA 2G8IA 3MWTA 4RW6A 4LF4K 1WBDA 1J9AA 1FK9A 1DLOA 4AM6A 2QI2A 3UIQA 4KB1A 4FWMA 4E7KA 3AGKA 3HVTA 4E7IA 4CD1A 4KV8A 1KSPA 5BRFA 4CE9A 4X66K 2CGLA 3ZT2A 1HYVA 3AARA 1QHTA 2QW9A 3OYDA 4JNEA 2P9KA 1S6PA 5KGXA 1Z05A 4Y1DA 3U3GA 3WXMB 4AHVA 4WE1A 4CW7B 5GADP 3J7YP 3V6DA 4M63C 4B9QA 1XC9A 3CJ9A 2HHTA 3ENHA 2ATQA 1TUYA 2G8UA 4DUZK 4BY9C 2HMIA 2OYQA 1RBTA 1RT2A 4H5NA 5BR8K 4PKIA 4RW4A 3KJVA 4FLWA 3MN5A 4I9QA 1QE1A 3WNEA 4DTRA 1JLGA 2P9NB 3HPOA 4OO1J 5AQIA 3AO2A 3M1FA 2YHXA 2YNGA 5BRDA 1HNZK 2G8KA 4J2EA 2YV0X 1E4FT 4M3RA 2BGGA 2QWOA 2G8VA 3EE8A 4DR5K 4M41A 3V1QA 2PYLA 3CCVN 5AQKA 3HOSA 5CE3A 3ZSXA 3UKRB 4PL7A 2UYTA 1ASWA 1YITN 5HLFA 3LDOA 1S6QA 4O0JA 2I5JA 1QVGM 3DWLA 1X9MA 3K5LA 1VQPN 3L8BA 1HQUA 1GOAA 4FLTA 3R9PA 4PY5A 4OKKA 3QICA 2HHXA 4E3SA 5ELZA 4B9VA 4RWTA 4UQGA 2D0OA 2Z1HA 4FJXA 3L2WA 4OGEA 4CJTA 2F4VK 1C0FA 1TYQB 1NK8A 3ULEB 1P8ZA 2Z1IA 4DS4A 5EXWA 4ISEA 1NGBA 4RCHA 4Z0UA 3NF8A 3KLEA 3CCQN 2O8DA 4DHYA 1VSDA 3MK6A 4B1YB 3V9SA 3TTDA 3AY9A 5FPNA 5BPLA 2XY8A 3CJ7A 3U6FA 1U47A 4FK0A 3NMUA 4DMNA 2KFZA 3M8PA 4LSLA 3J81O 4K43A 4J2AA 2HW3A 4DWIA 2A40A 5AQOA 3ZX2A 1D9FA 4E0DA 3C6AA 3CJ1A 4FK2A 4IEEA 3AA4A 4FPAA 3VA3A 4NXNK 4O8KA 3SLCA 3TWHA 3L2VA 3V9UA 2ZJQL 1RBVA 4LY7A 2P9IA 5AQMA 4FLVA 1BU6O 5C12A 3J8AA 1P90A 4IDHA 5J2PA 1VQ6N 2G8WA 5C42A 1GLJO 2O4IA 5DK5A 4Z94A 1RGIA 3MEEA 5AQZA 3VQ8A 5LJWA 2E2QA 4BRMA 3R6MA 3MXMA 1HKBA 3TABA 4BC5A 4NYFA 2Q31A 4Z4IA 3BGRA 3AAQA 4BE1A 1T03A 5C25A 2P9SB 2P9PA 3SPZA 2ZGZA 2JGUA 1IG9A 4B3RK 3WQUA 4DG1A 1IG8A 1J5OA 4C1NK 3CPEA 5AQSA 2P1JA 4ID5A 2DTUA 5ADXH 3NHGA 1OH8A 2X6NA 4CZHA 1BG3A 1U45A 1RFQA 1FKOA 4AHTA 4DQQA 1X1PA 4NXMK 2GTDA 2OZMA 3WUHA 3QIOA 4EFHA 2FBVA 3NBPA 4BR9A 3EE9A 2EWSA 3OYFA 4B1ZA 3O3FA 1W2BM 1KAXA 4BDZA 1RTDA 3L2RA 1ATRA 1KC8O 3M8RA 1KQSM 2D0CA 1A5WA 4H0OA 3RMBA 3KVGA 1YTUA 3O5BA 4DCHA 3I0RA 1VSEA 4DFJA 1LWEA 1XI1A 3ULEA 4CEDA 1NJXA 5AQFA 3CD6N 5JLHA 3F2KA 4BRGA 1LWFA 5JMVA 3CXCM 3T3FA 4FWQA 1T05A 3OYKA 3ZCMA 2F9WA 1MWMA 3IAYA 4DR6K 4CJ5A 3SV3A 4CHZA 1NK4A 4IG0A 3ENOA 2RN2A 4DTJA 4YDUC 4BRLA 2ZF5O 1KLNA 3HL8A 3LP0A 2YHYA 3VMFB 4DTMA 2UUBK 5B8HA 4G9ZA 2NUBA 4B9SA 2HNZA 4HTUA 3TAQA 4DU4A 4E7HA 3D2FB 3MECA 5CR4A 1NGGA 3DLBA 1N6QA 3LAKA 3KZBA 4EZ9A 2BUPA 2EX3A 2ASOA 1TL3A 5LL6Z 5AZJA 2WC9A 5AQTA 1I94K 5EX5A 4NCAA 4YDUA 1DTTA 4H5VA 2PFUA 3MCPA 4KH5A 3J7ZO 3UB5A 3PV8A 1QSLA 3CFRA 2H3GX 3EL2A 1QQNA 3AA3A 4GY2B 1B9DA 2QWQA 4IEIA 4QCLA 3CG7A 4C8OA 1SS6A 3I56N 4IJAA 3SZ2A 3VEYA 2WUSA 2XY5A 1HJOA 3P4IA 3O4NA 3NGZA 3PX4A 5CHIA 1KCFA 4YOXA 4GVMA 2VG6A 2UUAK 1YIJN 4W5RA 4K8XA 4JEPA 4I2QA 5BPMA 3QERA 5HRRA 1NGIA 3QLHA 5TKYA 1NNEA 3LM9A 5AFUH 1YHQN 5M1FA 1IBKK 3CYMA 1GLFO 2ZQBA 5C24A 2QA4N 3QIPA 3PX0A 3CHWA 3N4QA 2RPIA 1KD1O 5JICA 3K5MA 3NF7A 1QZ5A 4BRNA 1NK7A 2BANA 3BP8A 4RW7A 4AHUA 3V1RA 3HPHA 3NH2A 3V4IA 5HRPA 3SUOA 4DSIA 1ASVA 3MX2A 4CHOA 5FRNA 2JWKA 4H03B 3PSIA 2YJEA 1Q7YO 4L3QA 4BRKA 4JYAK 4GKKK 3ISNC 4PA1A 1NGEA 4BR4A 3OJSA 1HNVA 3CM6A 4WCEL 1BUPA 3DRSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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