2QM1A

Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
SNAMDKKIIGIDLGGTTIKFAILTTDGVVQQKWSIETNILEDGKHIVPSIIESIRHRIDLYNMKKEDFVGIGMGTPGSVDIEKGTVVGAYNLNWTTVQPVKEQIESALGIPFALDNDANVAALGERWKGAGENNPDVIFITLGTGVGGGIVAAGKLLHGVAGCAGEVGHVTVDPNGFDCTCGKRGCLETVSSATGVVRVARHLSEEFAGDSELKQAIDDGQDVSSKDVFEFAEKGDHFALMVVDRVCFYLGLATGNLGNTLNPDSVVIGGGVSAAGEFLRSRVEKYFQEFTFPQVRNSTKIKLAELGNEAGVIGAASLALQFSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Enterococcus faecalis
publication title Crystal Structure of Glucokinase from Enterococcus faecalis.
rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 104
structure length 324
sequence length 324
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qm1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qm1A02
3A0IX 1YUWA 3VEXA 2ITMA 4CD3A 3BUZB 1C0GA 1NGCA 4CZHA 1NLVA 2NLXA 3EN9A 4NB4A 1KAZA 1SZ2A 4MO5A 4C23A 4O8KA 1DGKN 4H0YB 1NGEA 5B8HA 3A5OC 1GLCG 1KAXA 3UKUA 3O8MA 4AM7A 4RTFD 5F2RA 4FL9A 1E4GT 2P9LB 3FLCO 3IUCA 5AQOA 5EY4A 1GLAG 3VF6A 1Z6RA 2PBDA 4NO7A 4A61A 5AQZA 3CJ9A 5E26A 3ZX2A 3QBXA 5BPLA 2P9LA 2P9KB 2Q0RA 4BC5A 2CH5A 3TU5A 3UB5A 1X3MA 2EWSA 4KBOA 4DQ8A 2P9KA 2A40A 3HM8A 2P9SB 3AAPA 4WQ5C 2UYTA 3ZX0A 3ENHA 3SK3A 4FWMA 4BRNA 2P9SA 3CJCA 4MLEA 5AZJA 4H0PA 5BN9A 2ZF5O 1HJOA 3SMSA 1J6ZA 4FWOA 5ADXH 1MWKA 4O5FA 4PKHA 2YJFA 4BRDA 4H0VB 1NGIA 2P9UB 1YAGA 2ZGYA 3VEYA 3CHWA 3LL3A 3U4LA 3IDHA 2P9UA 1HKBA 4BR7A 5BRHA 4ISGA 3H1QA 3D2FA 4BQZA 5JMVA 2F9WA 1IG8A 4QS7A 3U9ZA 3VF4A 4HTLA 1BU6O 3LM2A 3WXKA 4ISEA 1HUXA 3JXUA 3C7NB 5F1XA 3ULEB 1SAZA 5E84A 1HPMA 1QHAA 2Q36A 1HKGA 1RFQA 3QMLA 5AQWA 2V52B 3KVGA 2QWPA 3AAQA 3C7NA 1MDUB 3ULEA 1ZBSA 3EKSA 5FPEA 5FPNA 1T6DA 4Y0WA 1GLFO 1IJJA 2Q97A 4MO4A 3OHRA 3VEVA 2ZGZA 4BC4A 1NGJA 4FOEA 3TPQA 3SLCA 3VEZA 3LDNA 2HOEA 2E2OA 2ASPA 3HI0A 2ASOA 3KZBA 2YHYA 4IJNA 1BG3A 3GG4A 1TUYA 4BQLA 5TKYA 2D4WA 3VGLA 1LOTB 1GLLO 2GWKA 4FWRA 4IXCA 3BEXA 3VGMA 3R9PA 4PL7A 5AQTA 2P9PB 4M7YA 1NGDA 4BRKA 2KHOA 4BGAA 1Y64A 5AQIA 4EAHD 3JS6A 3AARA 2ASMA 5AQPA 3GL1A 2FLOA 4YDUC 5AQHA 4BR5A 4M63C 2D0PA 2P9PA 3WXIA 4BC3A 2YJEA 2VWBA 5AQNA 1TUUA 5FPDA 2IVNA 4BRIA 4XH4A 4K25A 4FWPA 2P9NB 3CJAA 2YCHA 1OKJA 4XH1A 3UKUB 4XH5A 3DJCA 4CI6A 4JHDA 2E8AA 4PKIA 2FXUA 1LCUA 2P9NA 1WUAA 2IIRA 1DKGD 2W41A 3FR0A 2E2PA 1NMDA 4FPBA 4A62A 2BTFA 3GDQA 1DEJA 3MMVA 3EZWA 4BRLA 5KPRA 1JCGA 3CQXA 1BA0A 3DXMA 3QDKA 1ATSA 3ENOA 1HLUA 4CZKA 3WT0A 1E4FT 2F9TA 5EOYA 5LJWA 5BPNA 3IMXA 3WXJA 4GY2B 2GWJA 4H0TB 4CD1A 4H5VA 1ZXOA 3SMPA 1P8ZA 3CQYA 1V4TA 2QXLA 4BR0A 3H3OB 2A6AA 1Q18A 5AZJB 1KXPA 2NZTA 3FZLA 2H3GX 5AQMA 3WEEA 4PL8A 4BRGA 3P4IA 2I7NA 2CGLA 5CE3A 1S22A 3BF3A 3VETA 3A5NC 3WQTA 1BOTO 2QWNA 4FPAA 2Q1NA 4A2BA 1ZC6A 1G99A 1WOQA 2J4RA 2E2NA 4FWSA 4FWKA 2DPNA 1K8KA 4BG9A 4DHYA 4CZFA 4BVPA 3D2FB 3MN7A 1X9JA 3SJHA 4B9QA 4B1YB 4I6MB 4FWLA 3LDOA 4HWIA 4A2AA 2A42A 4CZJA 5EX5A 4BRMA 4RCHA 3QFPA 3L6QA 4WQ4A 4BRQA 4I6MA 3QICA 5EXWA 1X3NA 3O1BA 4WQ4C 4QS8A 3VERA 4CBWA 3H3NO 3AY9A 4E1JA 5AQFA 1V4SA 2E1ZA 3EO3A 3M1FA 1H1VA 3HBTA 3MCPA 3G25A 1C0FA 4LC9B 3QB0A 1QQOA 4BGBA 2QW9A 2V51B 3A5MC 1GLJO 3VPZA 1MA9B 3MK6A 4H5WA 3ZX3A 1QQNA 3HTVA 1YXQA 2FF6A 2QWQA 3H6EA 5EVZA 5JLHA 2BUPA 1ATRA 1R59O 1YVNA 1KAYA 4CZEA 3W3DA 3QBWA 3VEWA 2FF3B 3I8BA 3M6GA 4CZIA 2A41A 5JICA 3A8YA 2FSNA 3O5BA 5BRDA 3GBTA 4JNEA 3L4IA 3IFRA 1S3XA 4BRHA 2E20A 3MN5A 2OANA 3WQUA 3UE5A 2E1YA 1JCEA 3O6WA 4J8FA 3FE1A 4EHTA 1NGBA 2E2QA 4H5NA 4JHDB 4EHUA 3O1WA 1U6ZA 3H1VX 3WUHA 4FWQA 1TYQB 1JCFA 1XC3A 1BDGA 2QWLA 1RGIA 2V7ZA 4BRPA 3D2EB 2YHWA 1BA1A 4GNIA 3DXMB 2V7YA 5ADXA 1TYQA 5KQDA 3ATVA 3QFUA 1BO5O 1EQYA 2D0OA 2HF4A 4BVOA 3VENA 3D2EA 5JLFA 4MLHA 4B1UB 5KPZA 3FZMA 3GE1A 4BRFA 3DXKB 3O4WA 2FSKA 3CJBA 5AQLA 4RWTA 2E88A 4L3QA 4M7XA 5AZIA 3DXKA 2YHXA 4CZGA 2CGKA 3CJ7A 4FSVA 5LY3A 1GLDG 2D1KA 1HX1A 3UKRB 5BRFA 2W40A 3WEEB 4H5RA 2YI1A 1XQSC 4FO0A 4JAXA 2GEMA 2A3ZA 2PAVA 4IWVA 3UKRA 4B1XB 3CIPA 1D4XA 3U8XA 5AR0A 1T44A 3VESA 3DAWA 3LDPA 4JD2B 4BREA 4H03B 2QM1A 2WUSA 3L0QA 4WYBA 3VF2A 2ZWHA 1K8KB 4AM6A 4JD2A 4WQ5A 3FFKB 3RSEB 1ATNA 1QZ5A 1NGGA 5I9EB 3HZ6A 4CBXA 2Q31A 3LM9A 3ZEUB 3LDQA 2AP1A 3D7EO 3R6MA 4BR2A 4K41A 5LJVA 3RSEA 4IZ9A 4BROA 5AQRA 1T6CA 4IO8A 3VEOA 3ZEUA 3MN9A 4ISFA 1GLBG 3I33A 2VCPA 5KQ8A 3WXLA 3H45C 2GUPA 3CERA 1NGFA 5AQXA 3BP8A 4DCHA 5AFUA 3DWLA 5AQGA 4BR9A 3J8AA 4H0XB 5AQKA 4BR4A 5ELZA 3HSCA 4EFHA 4EIAA 1BUPA 2IVPA 3ID8A 1U2VB 1QQMA 3CETA 4CZLA 5AQJA 4CZMA 4H5TA 2CGJA 1U2VA 3O80A 4K43A 4XEIA 1NGHA 5BR9A 5BN8A 3KHYA 1XUPO 3EL2A 2QWOA 3B8AX 3MN6A 3O08A 4PKGA 4F9OA 4QS9A 5AQYA 4IJAA 5AQSA 3R8EA 3FZFA 3ZETB 3GOIA 5BREA 3VGKA 3ZETA 3M3ZA 2GELA 1NWKA 2QWRA 5FPMA 1BWFO 1NBWA 4FWNA 4K42A 4BRCA 4CBUA 4DB3A 1NGAA 4JN4A 3C0BA 2AA4A 2IVOA 5AQVA 2Q0UA 4B1VA 3F9MA 3FZKA 3U9DA 2QWMA 2I7PA 3BF1A 4H0OA 5BPMA 3FZHA 1MWMA 2Q2RA 4FOIA 4BRAA 5AQUA 5AQQA 5AFUH 1ESVA 2HF3A 2GTDA 4Z94A 4B1WB 1QZ6A 4YDUA 1NM1A 3CJ1A 1RDWX 2NRHA 4B1ZA 2P9IB 3LDLA 4BG8A 3A5LC 3EKUA 3MDQA 3S41A 3H46O 3VOVA 5F0XA 1HKCA 1GLEG 1SQKA 2FSJA 5AZIB 2A5XA 2P9IA 3W0LA 4BC2A 3CI5A 4CJ7A 1CZAN 3FGUA 5KPTA 1Z05A 3ATUA 2HMPA 2VYPA 2CH6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DTUA 5H1SQ 3TSPA 2GBZA 2IGIA 3EN9A 4CZHA 2XY6A 1KAZA 1SZ2A 2ZM6K 3P38A 3PO5A 1IBKK 5DK5A 1EP4A 1JLEA 4O8KA 3SI6A 4OLBA 5IT9O 4DSKA 5B8HA 3O9QA 2O4IA 1L3UA 4OGEA 5F2RA 3D6RA 4IFYA 3FLCO 5EY4A 2YKNA 5E26A 3T69A 3QBXA 4CESA 4YNQA 4F3TA 1Q86O 2CH5A 3CQ8A 3TU5A 1X3MA 4B8CA 1A5WA 3AVGA 2O8BA 5I3UA 4DR6K 4KFBA 2DY4A 3G0ZA 2P9KA 2P9SB 1QVFM 2JGUA 3O3HA 4RW8A 2ZD1A 1S1UA 1GOBA 4BRNA 2G8KA 3CJCA 4DUZK 4DR5K 1QS4A 5BN9A 3U3YA 1J6ZA 4FWOA 3OYFA 1VQNN 4O5FA 4PKHA 3TAMA 2YJFA 3OYKA 4BDZA 1NGIA 4B3SK 2P9UB 3I0RA 1YAGA 1U4BA 3CF5L 3P83D 1VSDA 2P5GA 5GIOA 4WFAL 3LL3A 3IDHA 3KD5E 1HKBA 3THXA 1WAFA 3THYA 4KRFA 4OGCA 4JRPA 4IDKA 1JL2A 4OJRA 3SJJA 1WSJA 1NK8A 1S9GA 3L3VA 3MCAB 3VF4A 4CJPA 1IV0A 3WNFA 1C6VA 4BE1A 1BU6O 3WXKA 2BH1A 3IRXA 3JXUA 5FROA 5F1XA 3QESA 5E84A 1ITGA 3QMLA 1IBMK 2Z1IA 4LFAK 2QWPA 3I8DA 4CFDA 4J2DA 5FPEA 4CERA 5LL6Z 4MO4A 3OHRA 4KV8A 1VSIA 3VEVA 3G71N 3LDNA 1YTUA 2E2OA 2ASOA 3THWA 4FLYA 3O9RA 1QSSA 5FRNA 2XHBA 2ZE2A 4BQLA 3ZYYX 2O8DA 1XWLA 2D4WA 1RILA 3DOLA 3KD1E 4FM1A 3PY8A 4FWRA 1C1BA 1NGDA 5C10A 1Y64A 4FM0A 3Q7CA 1XMQK 3OS2A 2D0PA 1O1WA 2I5JA 3HJFA 2YJEA 2QKKA 5FPDA 2OPQA 4CJQA 3BZKA 4FK4A 3PIPL 4BRIA 2HMIA 3F9KA 3V1QA 2PYJA 1ASWA 4CI6A 4M45A 2Y1IA 1ZYQA 1LWCA 4KI6A 2E2PA 1NMDA 2BTFA 3G6EN 1DEJA 3MMVA 4BACA 2HW3A 3B6OA 4RG8A 4DTPA 3L2VA 4IG3A 2O8BB 3KLEA 4H0TB 3V81A 4E0DA 1UOCA 2WFBA 1ZXOA 4DTRA 4GMJB 3AA5X 3AO3A 3H3OB 1FKOA 4PL8A 3VMFB 3MAQA 3IAYA 3DYAA 5CE3A 3SQ4A 2HNYA 1SS6A 3Q7BA 1ZC6A 4DU1A 1B9FA 4PA1A 2E2NA 4BY9C 5KRSA 3THXB 3NCIA 2DPNA 3AA3A 3MXJA 2B4JA 4BG9A 3SUQA 4H4MA 4BVPA 3M8RA 4DS5A 4B1YB 4I6MB 4CF0A 3LDOA 1HNXK 1RBVA 4CHNA 4RCHA 3QFPA 1P90A 3NH1A 1YHQN 2D0CA 2HVIA 5HP1A 1VQON 2X6NA 4WQ4C 4YOXA 3P1GA 2E1ZA 4IOCL 1JLQA 3MCPA 3CC2N 1OH6A 2IC3A 1C0FA 5SZTA 3SBGA 2V51B 3OTOK 4CEOA 4LSNA 3A5MC 3F5TA 3VQ4A 4A59A 3VPZA 3LP1A 4DV0K 1KVBA 1VSHA 1BQNA 2E6MA 2O8DB 3ZX3A 3BDPA 1BI4A 4F2SA 1YXQA 2QWQA 5JLHA 4DV1K 3V9UA 1C0UA 2R7YA 1IKXA 2X74A 4CGHA 1C0MA 2A41A 3A8YA 2FSNA 3O5BA 3LWMA 3GBTA 4EP5A 4IDHA 5DM6L 3T3FA 3RMAA 4IO9L 1K9MO 2OCEA 1WNSA 3IFRA 4EP4A 3TTFA 4BRHA 2E20A 3L2WA 1YITN 1JCEA 5HROA 1BIZA 4CEAA 3HOTA 4CJTA 4H4OA 1TAUA 4J8FA 4XIUA 1NGBA 4E7JA 4ZTJA 1LV5A 3MXMA 4WE1A 1BGXT 1BQMA 1JCFA 1RGIA 2YHWA 2HHXA 2W6LA 2V7YA 5KQDA 1TK8A 4ELTA 3QFUA 2E6LA 5IWAK 1RDCA 3BGRA 3DXKB 1G15A 3J7AP 4U67L 3HK2A 3EYZA 3RMCA 2E88A 4L3QA 2CGKA 3CJ7A 1SUQA 1EKEA 3DRRA 3ZT0A 3OYHA 4YOTA 1NMNA 2GEMA 4IWVA 3UKRA 4AHVA 4B1XB 3E9LA 4J2BA 3ISNC 1D4XA 3U8XA 3TAGA 3DAWA 3VQ8A 1F21A 4CJ4A 4GV3A 4JD2B 3L0QA 3MX2A 4AM6A 2EHGA 4PQUA 3FFKB 1B9DA 1VSJA 4QOZB 2Q31A 3LM9A 4YOUA 1I94K 4K41A 5LJVA 4GV9A 4BROA 5AQRA 4IO8A 3RWUA 3PLAA 1HNZK 3TR8A 3HPGA 4CJEA 3PIOL 3CERA 4DCHA 3I55N 3BP8A 1RT5A 4BR9A 2A1SA 3J8AA 4H0XB 2VG6A 4EFHA 3KLGA 2OTLN 1QQMA 5J2QA 1M1KO 3QIPA 4MDBA 1VQ4N 3CXCM 4DV4K 2GV9A 2CGJA 5FRMA 4XEIA 4NLCA 4KTWA 3QEIA 1N36K 2XO7A 4ILJA 4DFMA 3OBYA 1NOZA 3MWPA 3MN6A 4F9OA 4IJAA 1C1AA 1NKCA 4HUEA 4KTQA 4YHHK 1LW0A 4U7BA 4CK3A 2PY5A 3V4IA 4R79A 4NXNK 1KVAA 2QWRA 2Z1GA 5FPMA 4CGIA 4C8MA 4CBUA 1KVCA 4DB3A 4OO1J 5AQVA 2O8CB 3F9MA 2QWMA 4OVLA 3BF1A 4KB0A 3QNOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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