2QM1A

Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
SNAMDKKIIGIDLGGTTIKFAILTTDGVVQQKWSIETNILEDGKHIVPSIIESIRHRIDLYNMKKEDFVGIGMGTPGSVDIEKGTVVGAYNLNWTTVQPVKEQIESALGIPFALDNDANVAALGERWKGAGENNPDVIFITLGTGVGGGIVAAGKLLHGVAGCAGEVGHVTVDPNGFDCTCGKRGCLETVSSATGVVRVARHLSEEFAGDSELKQAIDDGQDVSSKDVFEFAEKGDHFALMVVDRVCFYLGLATGNLGNTLNPDSVVIGGGVSAAGEFLRSRVEKYFQEFTFPQVRNSTKIKLAELGNEAGVIGAASLALQFSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Glucokinase from Enterococcus faecalis.
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Enterococcus faecalis
molecule keywords Glucokinase
total genus 104
structure length 324
sequence length 324
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qm1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qm1A02
5E84A 5F2RA 3EKSA 3MN6A 1X3MA 4H5WA 4JHDB 1NGGA 5AQVA 2P9KB 3U8XA 4BC2A 3DAWA 2D0PA 3ENHA 1JCGA 1R59O 3VGMA 2CGJA 2GWKA 2QWQA 3QFUA 5EOYA 3A5LC 3DWLA 4JNEA 3A0IX 4BRIA 4FOIA 2CH6A 3FGUA 3R6MA 4A62A 1GLFO 3M1FA 1BOTO 1RDWX 5CE3A 2ZF5O 1QHAA 2E2QA 4GY2B 3JXUA 3DXKA 1GLAG 1NGHA 4BVOA 4CJ7A 5EY4A 3O08A 4L3QA 2A40A 1GLLO 2CGKA 3QMLA 5AZIB 5BPMA 4M7XA 5JLFA 3UKRB 4BRGA 1ZC6A 3I8BA 3CHWA 2P9UB 2DPNA 3SMPA 4FO0A 1EQYA 3VEXA 3WT0A 4B1YB 4BRPA 4CI6A 5AQHA 1NLVA 1C0FA 1QQOA 1E4GT 4BRDA 3VEYA 3AARA 1NGFA 2P9IA 3BEXA 3ENOA 1K8KB 2KHOA 1WUAA 1MWMA 4DCHA 4H0OA 4CZGA 3ZETA 3EKUA 4E1JA 3IUCA 1QZ6A 3CQYA 4MLEA 2YHXA 3FFKB 2F9WA 3VEOA 5LY3A 3QFPA 2FLOA 4FWRA 3CERA 4RTFD 1OKJA 4EHTA 1HUXA 4CZLA 2D1KA 4WQ5A 4B1ZA 4IXCA 1U2VB 3OHRA 4H0VB 2HMPA 3MN7A 4ISFA 3A5MC 1Y64A 3FZHA 1NMDA 4FWNA 5BPNA 1X9JA 4H5NA 2ASOA 2YJEA 4BR4A 2YHYA 4BRMA 3MMVA 5FPDA 2CGLA 2QWLA 4CZEA 4BGBA 4BR2A 3MDQA 4CD1A 2W41A 3VENA 2E2PA 4FWLA 4FSVA 1BO5O 4AM6A 3EL2A 5AQOA 3ZX0A 2I7PA 4QS9A 4PL7A 2D0OA 4GNIA 3D2EA 5AQWA 4PKGA 3FR0A 2HOEA 3JS6A 1NGJA 4BRCA 2QXLA 3BUZB 3AY9A 3R9PA 3ZEUB 5FPMA 3FE1A 2ZGZA 3WUHA 1QZ5A 3GDQA 3O4WA 3H3OB 3CJAA 3QICA 4BRFA 2P9KA 3ZX3A 2BUPA 5AQZA 2VWBA 4K25A 3UKUB 4WQ5C 4EFHA 3C0BA 4NB4A 4A61A 5AQXA 2IVNA 1XUPO 3FZMA 2QWRA 2Q97A 2NRHA 3VESA 3VERA 5AQTA 1DGKN 3H3NO 4I6MB 4A2BA 5BRHA 3VPZA 3MN9A 5AZIA 3IDHA 1RGIA 3WXIA 1Q18A 1QQMA 4EIAA 4MLHA 3GG4A 2P9LA 3BF1A 3CJ7A 3UKRA 4BRKA 4BR0A 3VGKA 1V4TA 2P9UA 4BC5A 4B1VA 4BVPA 1BG3A 5JICA 5AZJB 1HJOA 3MN5A 5F0XA 3AAPA 2QWNA 2A5XA 2GEMA 2FF3B 3WEEB 3A5OC 1ZBSA 3EN9A 4B1UB 2VCPA 3ULEB 1K8KA 3MCPA 1LOTB 2W40A 5AQRA 5EXWA 3QDKA 1BU6O 4O8KA 4XEIA 2ZWHA 3WXJA 4ISGA 3F9MA 2AA4A 2QWOA 4B9QA 3CJCA 4BG9A 3H45C 4IO8A 4BQZA 4K41A 1XQSC 4K42A 3FZLA 3EO3A 3H1QA 2J4RA 5JMVA 3P4IA 1V4SA 1U2VA 4FWSA 4H5VA 2CH5A 1P8ZA 4BGAA 4LC9B 3VOVA 4M7YA 1GLEG 4JAXA 5AQIA 3VF6A 4FWOA 4RWTA 3O80A 1S3XA 5BRFA 3WQUA 3CJ1A 5I9EB 2Q0RA 3H1VX 1BA1A 4FOEA 1NGCA 3FLCO 2A42A 1HPMA 1BDGA 2FSNA 1ATRA 1JCEA 2FF6A 3LDNA 4QS8A 2NLXA 5BR9A 4CZFA 4J8FA 1U6ZA 4BRHA 1NBWA 2ZGYA 4XH4A 3AAQA 3A8YA 4BRLA 4O5FA 1IG8A 1MA9B 3ZEUA 5KQDA 5EX5A 3CI5A 3EZWA 2YCHA 3LDLA 1ATSA 3DXMA 2QM1A 5TKYA 2F9TA 3VF2A 1YXQA 3L4IA 3RSEB 1HKBA 4CBUA 3LL3A 4PKIA 1TYQB 3IFRA 4BG8A 2ASMA 4JD2B 4IZ9A 2HF3A 3CQXA 1ZXOA 2E8AA 4MO5A 5F1XA 4DB3A 1Z6RA 4I6MA 1HLUA 2P9PB 4FWMA 5AFUA 3HSCA 1CZAN 1GLCG 3KHYA 3IMXA 4EAHD 3LM2A 1QQNA 3DJCA 2BTFA 5BREA 3L0QA 2E88A 3HM8A 4JHDA 4MO4A 4CZJA 5AQQA 1Z05A 4Y0WA 5AZJA 2PBDA 3I33A 1D4XA 2GELA 3KZBA 4PKHA 5ADXH 4BR9A 1YUWA 2YJFA 2GUPA 3WEEA 4XH5A 4CD3A 2QWMA 4A2AA 3D2FB 3ATUA 4WQ4A 3ULEA 4FWQA 1IJJA 2OANA 2GTDA 3TPQA 5KPZA 1JCFA 3O6WA 1RFQA 2YHWA 3H46O 3FZFA 2Q0UA 4YDUA 3VEVA 2ASPA 3ID8A 5AQYA 4BREA 4HTLA 1BA0A 2WUSA 3A5NC 3HI0A 5AR0A 2IVOA 3ATVA 2V52B 4CZIA 5FPEA 2V7ZA 3CJ9A 4DHYA 1HX1A 2UYTA 1E4FT 1DKGD 1XC3A 3HTVA 3GBTA 3W0LA 2P9NB 5KPTA 3C7NB 2A6AA 3U4LA 3R8EA 4BRNA 5KPRA 2P9SB 3L6QA 4RCHA 3S41A 1YVNA 4H0XB 3M6GA 4BRAA 1NM1A 5AQGA 3LDOA 1H1VA 2Q2RA 3VGLA 1NGEA 2NZTA 1GLBG 4FL9A 3WQTA 2D4WA 2AP1A 4DQ8A 4B1XB 1SQKA 3SMSA 2Q36A 2IVPA 4PL8A 3MK6A 3U9DA 3QB0A 2QW9A 5AFUH 2EWSA 4WQ4C 4WYBA 2E1YA 1NGBA 3M3ZA 1KAYA 3SJHA 2V51B 3G25A 4YDUC 3VEWA 3BF3A 2P9LB 3H6EA 5KQ8A 1GLDG 5AQPA 3RSEA 4XH1A 1KAXA 5E26A 4Z94A 3J8AA 2H3GX 1TYQA 3CJBA 4JD2A 3B8AX 1C0GA 5BN9A 5AQJA 3GE1A 1X3NA 3QBWA 4FWPA 5ELZA 2HF4A 3UB5A 3VF4A 5BRDA 5LJVA 4H0YB 5LJWA 2A3ZA 3BP8A 2P9PA 3DXKB 3O1WA 3VEZA 4JN4A 3SLCA 4BRQA 2FSJA 4EHUA 4H0PA 4HWIA 3VETA 4BC3A 5JLHA 3CETA 1KXPA 2A41A 3WXLA 2Q31A 3QBXA 1G99A 3CIPA 4K43A 2PAVA 4IJAA 3UKUA 3KVGA 4IJNA 4CZMA 1NWKA 3LDQA 4B1WB 2YI1A 5AQSA 4BROA 1J6ZA 3D2FA 3U9ZA 1T44A 2P9IB 4CZKA 3HZ6A 4BC4A 4FPAA 5ADXA 1TUUA 2QWPA 2Q1NA 3GOIA 1ATNA 2GWJA 4H5TA 1YAGA 1MDUB 3ZETB 1SZ2A 1DEJA 4KBOA 1NGAA 2ITMA 3W3DA 3D7EO 4F9OA 1HKGA 1S22A 1LCUA 4CBWA 4NO7A 1ESVA 4BR7A 4FPBA 1KAZA 1TUYA 1GLJO 5AQLA 1MWKA 1SAZA 2E2NA 2E20A 4AM7A 4H03B 2IIRA 4QS7A 3O8MA 4CZHA 2P9NA 3C7NA 2E2OA 1NGDA 5EVZA 1BUPA 2P9SA 3LDPA 2E1ZA 1T6DA 4FWKA 3DXMB 5BN8A 5AQUA 5AQFA 1WOQA 2I7NA 1HKCA 4H0TB 3O1BA 4BQLA 1NGIA 3TU5A 3HBTA 4CBXA 5FPNA 4H5RA 4IWVA 5AQNA 3O5BA 3ZX2A 4M63C 2VYPA 4BR5A 2FXUA 5AQKA 1T6CA 3GL1A 3LM9A 3SK3A 3WXKA 5B8HA 3UE5A 5AQMA 5BPLA 3D2EB 4C23A 4ISEA 2V7YA 3FZKA 2FSKA 1BWFO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TAPA 1DLOA 3EY1A 5DK5A 1NGGA 2P9KB 4FLWA 2D0PA 2X78A 2ETJA 2OPSA 5SWMA 2QWQA 5IT9O 3SQ0A 4FJKA 3A5LC 3DWLA 4JNEA 3A0IX 4WFAL 4Y1CA 4OPAA 3OYFA 4W5RA 4E7HA 1C1AA 2ZF5O 3ENBA 1VQNN 3JXUA 4BVOA 4DUZK 1Q9XA 3QNNA 2B5JA 1KCFA 4JI2K 2A40A 4C8OA 5JS2A 4DV4K 1XC9A 3DOLA 4AHCA 4CFDA 4HCCA 3I8BA 4IG3A 3F5TA 3TTDA 3QNOA 5C12A 5T7BA 4DTNA 5J2PA 2HNDA 2IOCA 2P1JA 2O8DB 4FO0A 1HNVA 4LD0A 4BRPA 1E4GT 4BRDA 3VEYA 3AARA 1S1UA 1TKXA 4DSLA 3HO1A 4O4GA 3TTCA 2RF2A 1MWMA 1FXXA 4DCHA 4H0OA 1F21A 4CZGA 4E1JA 1FW6A 1A5WA 3NH1A 3IUCA 1QZ6A 4N47A 1WN7A 2O4IA 2BANA 3FFKB 2F9WA 4CGHA 4OKKA 3OA9A 4RTFD 1E3MA 3K5MA 3NH2A 1RDCA 4IXCA 1S72N 1D5AA 2O8EA 1U2VB 3OHRA 2HMPA 1Y64A 3DYAA 3O9QA 1NMDA 4Z4HA 3SV4A 2G8KA 4G1QA 3HRGA 5BPNA 4FZZA 1X9JA 2B6AA 4H5NA 4B9VA 4KAZA 4JS4A 4B9MA 4BRMA 2AJQA 4JKHA 3DLBA 4NXNK 3MMVA 4BGBA 2ZJRL 1Q82O 4FJ8A 1RBVA 4KH4A 3AA3A 4FSVA 3LAMA 1BO5O 4AM6A 4CECA 1KC8O 3EL2A 5AQOA 3AA5X 4PL7A 2D0OA 5FROA 2PZSA 2KZMA 4BRCA 1I39A 1NGJA 4JLHA 1KTQA 2G8UA 1RT5A 4AHUA 4F8RA 2R7YA 3FE1A 2ZGZA 3O4WA 3SZ2A 3SUQA 1HYZA 4CJTA 4DTXA 2XRIA 3CFRA 1NG9A 1BIZA 1N32K 4DSEA 4OPHA 3CG7A 4A61A 1VQ7N 2NRHA 4ID5A 3VESA 1L3UA 4I6MB 4DF4A 3AA4A 5TKWA 4OO1J 1NMNA 3VPZA 4JKDA 2G8WA 3CCVN 1RGIA 1VSFA 2P9LA 4CGGA 4NCGA 2P9UA 4BVPA 1BG3A 1WSIA 1U45A 5F0XA 2D0BA 2O8CB 3C65A 3V9WA 2GEMA 5M1QA 3P1GA 5C42A 1ZBSA 1LOTB 4NYFA 3P38A 4XEIA 3NVKA 2ZWHA 4ISGA 4CJUA 2F7TA 3AO3A 1ZBLA 2QWOA 4B9QA 3H45C 4KREA 4DQPA 3CD6N 3MXMA 1XQSC 1WSEA 4K42A 4YOXA 2WFBA 2J4RA 4QAGA 4EP4A 4CHNA 3P4IA 1V4SA 1YTAA 5CYMA 4RW4A 2O4GA 4H5VA 3T1AA 3MEGA 1EWRA 3WNGA 4BGAA 3NMUA 4BWJA 3MX5A 3VOVA 4M7YA 1GLEG 4JAXA 4UQGA 5DM6L 3VF6A 4RWTA 4YOYA 2YHAA 5BRFA 3WQUA 3CJ1A 5M1KA 2JWLA 2A42A 1JCEA 2G8HA 2HBMA 3LDNA 2NLXA 1HNZK 4J8FA 5HRNA 4F2RA 4JI8K 1YJWN 4BRHA 2JWKA 4XH4A 3A8YA 4BRLA 3JAMO 1IG8A 4YOUA 1MA9B 3ZEUA 5KQDA 1X9WA 1I94K 4RW6A 4Q0BA 1NKEA 4CEZA 2D0AA 3L4IA 4CF2A 4ZTFA 3ZSQA 4B9LA 3TABA 4CF8A 3IFRA 4CJ5A 2ASMA 5M1FA 2HHUA 2X6SA 2KW4A 5F1XA 4IO9L 3THYB 4Z0UA 2A1RA 4C8KA 1M90O 4LFAK 1IKVA 3PSFA 4CJQA 2ZJPL 2WTUA 3HSCA 1GLCG 2QI2A 4EAHD 4OKEA 2BTFA 3L0QA 4MDBA 5BREA 4MO4A 2XY6A 5AQQA 2HBJA 1Z05A 4IFYA 4HCBA 3QIPA 3I33A 1D4XA 1NK9A 3KZBA 5ADXH 4DR5K 3VQEA 3TSPA 2GUPA 3HPOA 2Y1IA 2DTUA 4A2AA 2UUCK 3D2FB 3MCAB 3CM6A 5KPZA 3O6WA 2KLAA 3J81O 3O3FA 3V9UA 5J2NA 4U67L 1U4BA 3ID8A 5AQYA 3S9HA 3A5NC 4FZXC 2V52B 3KWIA 2V7ZA 3TWHA 4B8AB 3TAEA 5D3GA 4JK8A 3PV8A 1VAZA 3W0LA 1VSMA 3HPHA 1JLCA 3U4LA 2P9SB 3L6QA 3S41A 3O3HA 2WONA 3M6GA 4CHYA 5SZTA 4LFBK 5JVGL 4B3SK 2ZQBA 3LDOA 5KGXA 1GLBG 1U48A 2Y1JA 3WQTA 3I55N 4YOTA 1RTDA 4DQ8A 5FRNA 5C25A 2OPPA 3AGKA 3SMSA 3DI6A 4IOCL 3MK6A 4AHTA 3T1YK 2PY5A 2QW9A 4CHPA 1UA1A 4WYBA 4C1NI 3SQ1A 4O5BA 2E1YA 5HBMA 4DR3K 3KLIA 1YJ9N 1WLJA 5DMRA 5HRSA 3SJHA 4DFPA 4C8MA 1VRTA 3BF3A 4KB1A 1BCOA 1QE1A 1ILYA 4FLTA 3L3VA 4Z94A 5E26A 3F9KA 1VQ4N 3B8AX 1C0GA 5AQJA 1X3NA 3CC2N 2I5JA 3VQ8A 4DV3K 5LJWA 4K0KK 2P9PA 4DQSA 3I0RA 3O1WA 1DT9A 4MQ3A 1KSPA 4GKJK 1ASWA 1RTHA 5DM7L 4JV5K 1TKDA 3OYBA 1WAFA 2HB5A 3CC7N 3ZCMA 4HWIA 5JLHA 3ASMA 2NNWA 2IDOA 4HVJA 4K43A 5I42A 2PAVA 1IH7A 1ZBIA 4IJNA 4E7IA 1DTTA 2HHWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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