2QNEA

Crystal structure of putative methyltransferase (zp_00558420.1) from desulfitobacterium hafniense y51 at 2.30 a resolution
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
476
structure length
476
Chain Sequence
GLLPKYNILTEDQVQKIHENTMKILEEIGIEFEYEPALEVFRREGQKVEGKRVYLTREFVESKLKSAPAEFTLHARNPENNVVIGGDNIVFMPGYGAPFIYELDGSRRKTTLQDYENFAKLAGASKNMHLSGGTMAEPQDIPDGVRHLQMLYSSIKNSDKCFMGSAEGKERAEDSVEIAAILFGGKDVIKEKPVLVSLINSLTPLKYDERMLGALMAYAEAGQAVIIASLVMAGSTGPASLAGTLSLQNAEVLAGISLAQSINPGTPVIYGSTSALSDMRSGSLSIGSPECALFISASAQLARFYGVPSRSGGGLNDSKTVDAQAGYESMMTLMAANLTGVNFVLHTAGILQYFMAMSYEKFIMDDEIAGMLLHYMKGYTFDEDGMAFDVIEKVGPGGHFLTQKHTRKNHKREFYTPTLSDRSAYDTWAKEKLETKQRAHARWQQILANYVPPALDPEIDAKLQAFIAQRGKEVGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Desulfitobacterium hafniense
publication title Crystal structure of putative methyltransferase (ZP_00558420.1) from Desulfitobacterium hafniense Y51 at 2.30 A resolution
rcsb
molecule keywords Putative methyltransferase
total genus 167
structure length 476
sequence length 476
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.480 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel TIM Barrel 2qneA01
2QNEA 4YYCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RE4A 4KRZA 4ACYA 3IJ6A 3S6TA 1WUFA 2OKTA 1E55A 4IH3A 2AAMA 1S1PA 3CT2A 5EPDA 1H7NA 1GVIA 5A2AA 3OBAA 3NCOA 1R3QA 1I75A 4JIRA 1NDZA 1KTNA 1OK4A 1MFUA 1VRXA 1HL2A 3WQOA 3CIXA 1TCDA 4DZIA 1RCQA 3A47A 5EL1A 2EG8A 3VI2A 3PULA 3DEQA 2FYMA 1BG9A 1HJVA 1CIUA 2B7PA 1H61A 2CC0A 1AK5A 3WF2A 6TIMA 3GC2A 4C6DA 3IVSA 3FGCA 4H7VA 1RZMA 4I9AA 2NX9A 5HJLA 3LX9A 3HPFA 1TJ0A 3NQ8A 4ZGYA 2PGWA 1W5NA 1LT7A 2FMNA 3VE9A 3A22A 1OX6A 4HMCA 1TCMA 3QQWA 4Y7EA 3FXYA 1IGWA 2VCCA 4S3JA 2QKFA 4MNLA 1QI4A 3BWWA 4XTDA 3UVIA 2NQHA 3C86A 3CO8A 2CLPA 5I3GA 3FEMA 1ICQA 3NR0A 4NF7A 3WQVA 2QDEA 4DWSB 1TTIA 5F2LA 4M51A 4C6FA 1P6CA 3GYEA 3UT0A 3GR4A 1XSKA 5I6SA 1C7TA 4KEUA 4DJDD 2PS2A 2WPBA 2XVKA 5G4HC 4H9UA 1PX3A 3ZQ9A 4TV6A 1Z6KA 4DM2A 4GGBA 3TN4A 1CB2A 2X09A 3KRBA 4LX4A 1VIZA 4FSAA 4CD4A 1W1B1 4A22A 4AIEA 3LRLA 1X6NA 2FDMA 5JIPA 1BVNP 4KETA 4UOQA 2WBKA 4LVDA 1Z44A 1DHKA 1DJHA 2OSYA 3UJ2A 3GDLA 1TIMA 4PCTA 3T6CA 3ABSA 3BLLA 3LENA 4XAYA 1DWHM 3KVLA 2ZA3A 3RPMA 1OVDA 4PR4A 4AEEA 1F2JA 2CLKA 3FYPA 1U33A 5I2UA 1MRQA 4KCUA 1JCTA 3AMDA 4HOWA 7ODCA 4C6KA 1R9XA 3FCPA 2FH6A 2YDAA 3TP4A 4CNNA 1EHAA 4UFJA 4H2HA 2EO7A 3WQ6A 5LYRA 4FNRA 4PYSA 3OLDA 1WDPA 1EJTC 4I7WA 1LBLA 1MFVA 4H04A 2QJHA 3MP4A 3MUIA 2RAGA 3JZEA 3H2EA 5ABFA 3NSXA 4KEZA 4LUTB 2AAAA 1LQAA 2ISSA 3CL8A 2Z1WA 1GOKA 3IIPA 4WSHA 5TQLA 3PBYA 3UWQA 5C7VA 1F8MA 7TIMA 5M3WA 1F74A 3R1ZA 3TN5A 3M4HA 5F1VA 3CMGA 4NZ4A 2WANA 4HSNA 4CQCA 4BFAA 1ESWA 2A3BA 4NYUA 3DECA 2BVYA 1UKOA 1ONWA 5F4XA 3OIHA 3NDYA 1G01A 2FVKA 3QR1A 5CSUA 2BOFX 3IUHA 2HRWA 1UHVA 3GTXA 3KBVA 1W3IA 2XFYA 2ZADA 3HQNA 3AIRA 4YS1A 1EXPA 3GKAA 2XJ7A 2H8XA 3CXOA 3SFKA 2A3LA 1MQQA 4IP5A 1FHDA 3INPA 1R3YA 4IIFA 2A6NA 3TYCA 3S46A 3WJYA 3THAA 2PGRA 4EWJA 2HQAA 2E6DA 3EWZA 4G7EB 1LQ2A 3B8DA 1JZ2A 3B97A 2FHCA 5IOBA 4ZB2A 2BG5A 4MJMA 2O4QA 5A6BA 4AZCA 1DXEA 2DUZA 5L6UA 2WJZA 2C1HA 3S1VA 5BU6A 4B5XA 2ANUA 1JUBA 4AZBA 1JIBA 4Z0SA 4KGLA 5EMKA 4C6CA 3FK4A 1QU4A 2PC4A 4DF1A 1TR1A 1D3GA 1NU5A 5DXYA 4Y8FA 1V51A 4C7GA 4NILA 2PC8A 2HXUA 3RX2A 1PKLA 1ICSA 4PUDA 2P8CA 2Q01A 1HW6A 1W5MA 1GVYA 3KLLA 1ADOA 5I0DA 3T42A 1K6AA 4MZ8A 2YDRA 2DW6A 2WHLA 4TOQA 4XZIA 4B5SA 1XICA 4NUWA 4JTGA 4GZ7A 1NOWA 2QW5A 1A3XA 2OVLA 1EC9A 3CEPA 4YCOA 2I9UA 2OLSA 3SW6A 2DT1A 2F7FA 2D2GA 3OP2A 2GJXA 5GJPA 2QDGA 3AU2A 3LD5A 2PTWA 1JCNA 1S2VA 2Z6IA 1EIXA 3H70A 2XPKA 2YJQA 3U48A 4GHRA 5CZJA 2X16A 2ADAA 1REQA 1VEOA 3FJ4A 1EUNA 2R8WA 3R79A 3KBSA 3GTHA 4AC7C 4DAFA 1AL8A 5A6JA 5LA0A 2CLIA 2OZ0A 3WLNA 4ATDA 4FK9A 2BASA 5FEZA 3AOFA 3ZSTA 3HO8A 5CJ5A 2PDGA 5AHFA 5G1YA 5FF0A 1KFCA 3VIKA 3ORWA 3UR8A 2R94A 3AWNA 1QAPA 4LC6A 4BHYA 4KW2A 1YXCA 1J12A 1FDJA 3CZJA 1AUSL 4GZIA 3T0DA 1DJYA 3R5EA 4A2RA 1XLJA 1FXPA 1DORA 4JY8A 1AFSA 1R7AA 3NJ3A 2Q3RA 4WD0A 3SCUA 3QC3A 4D9PA 1MZHA 1QWKA 2C15A 3CIWA 4CLMA 3SGGA 2OXNA 4GUJA 3BGJA 4C1NA 3G8RA 1M03A 1FWSA 3NIYA 2NLYA 1KLYA 3TOYA 5A8OA 3DC0A 1KRBC 3CUFA 3GW3A 5D2XA 3B8VA 4PH6A 4AYSA 1XYFA 4C6PA 3MYOA 4DJDC 3W2KA 3VZZA 4JQ4A 1P0EA 4K39A 1JR1A 2VC9A 3C2FA 7PTDA 1EGMA 3WD4A 3W85A 2QCDA 3FJLA 2VT0A 2W92A 1JD9A 3EZ4A 4IFKA 2BP1A 3DI0A 3PZUA 4LUJA 1SVDA 3LTYA 1TPUA 4IUGA 4PRWA 4PTWA 4MWAB 2VEMA 2D2JA 3N2OA 3WMSA 3N9KA 3W72A 1UP3A 4R5EA 4IPPA 1RA5A 3TAOA 2J78A 1ENUA 3LV6A 4CNOA 3BSHA 1HJUA 2PTZA 4DX3A 3R8RA 1NOUA 3GKFA 3R58A 2D2OA 4WX2A 4M56A 2C14A 4DBEA 4QAWA 5LNRA 3BG9A 1CDGA 1VHNA 1LROA 3W2NA 3C5QA 3K5XA 5FSDC 1BKHA 2V3EA 2YA1A 3M7WA 1GVRA 5H91A 3SN1A 4NX5A 5CSYA 4HPNA 4OBTA 2PP1A 2FTWA 4RDYA 2GGJA 4JX5A 1YNYA 1TTJA 4BEUA 3ARTA 1UH4A 1ECEA 3NPUA 2QUMA 1J96A 4HIBA 3MKCA 2WHKA 1FFRA 4QCEA 4XZMX 5DF0A 4EF8A 3PN8A 4F48A 1YEYA 1UWAA 4AWSA 4B90A 3SUVA 4MLJA 1XJBA 4KWUA 4JN8A 2DEPA 3F2BA 1OYAA 4PUKA 1A5OC 1X97A 2ZZ1A 4DXVA 2PDQA 4Y9MA 4HZ7A 3G0UA 4DWDA 3GBEA 4BS0A 3GLCA 1CBGA 2DW7A 1RCOB 4OECA 1VENA 3A21A 2POTA 3WDPP 2GJLA 4O14A 2EXOA 3P5YA 1U30A 3WLKX 1X1NA 4A8NA 1NDYA 5HMDA 3WH8A 3R4IA 4Q33A 5A6AA 5CPNA 4QX4A 3V5CA 1Q63A 5J8LA 1LOLA 1QW7A 1UP2A 2G3IA 2HSAA 2BOGX 1TE6A 3LRKA 5CC6A 3WNLA 3SY5A 2F2KA 2ALRA 2GUUA 3VIIA 2YR1A 3QV8A 3PBGA 4C5ZA 2NVDA 2DVXA 1CXKA 3VKDA 3L12A 2B7OA 1EJRC 1PAMA 4E5TA 1SFSA 2J9YA 3KLKA 4ZFCA 2VWTA 4QP0A 1JCYA 2H9AB 3A9IA 3WF1A 3MUY1 4PB3A 3T2OA 4EE9A 1XSJA 2AKZA 3BG3A 1O94A 2HNEA 4TU1A 1VFTA 2P76A 2C7FA 1AJZA 3MZNA 1JRBA 4I7VA 5I06A 3KBMA 4UFLA 1OG0A 2YL9A 4U31A 2D0GA 4NRSA 1H4PA 4YHEA 1A0EA 2D1ZA 1ZQ5A 2V38A 4JIIX 1BFNA 4INFA 3ABRA 4AMCA 2ZBTA 4K8GA 4Z2KA 4FOJA 3VIJA 2QS8A 4XBJA 1QXLA 4XK2A 2GOKA 3IGXA 2FQIA 3LHWA 3NAVA 6REQB 1ONXA 3S83A 4Y9NA 2DZWA 5D05A 3TV8A 2NT1A 5FJUA 2GSEA 3G24A 3O9NA 4ZB0A 2PBGA 4YTRA 3WNPA 3PZNA 4JKKA 3A4XA 5EGRA 4U5KA 5XIMA 2VGIA 3W1NA 1JF5A 1O4UA 1RAKA 2FZBA 1OM0A 4Z2IA 4TX9A 2ZRYA 4F4RA 3GVRA 4YN5A 3HV9A 2YDSA 3UPBA 1M7OA 2I9EA 4MKVA 3TFXA 4D6IA 1GOQA 3PPHA 1HJSA 4M6QA 2J7CA 4WJEA 3OGSA 1HX0A 4W89A 4DRSA 3PS7A 2TSYA 4OOUA 3CLWA 2DT0A 3PZQA 1E0WA 5K2ZA 1YPFA 3S4TA 4IX0A 4TVCA 3QN3A 4CNSA 1Z9AA 3T2PA 1JZ3A 4GYKA 2VFGA 3QSRA 1X6UA 4NNAA 5C55A 2Q8ZA 3VABA 1TWIA 1U2YA 1V6TA 3J7HA 3W7CA 3TONA 1WXJA 3A3WA 2ZUUA 4E3TA 1V08A 4UCFA 4B9ZA 2OX4A 3MT1A 1JPMA 4O57A 3LGGA 1EJWC 1JNEA 5CAKA 1OIMA 1J8VA 3QGVA 3ATZA 2FGBA 3WNMA 1B0IA 2ZX6A 3O63A 3WFAA 4PCSA 1H0IA 5BWFA 3CWHA 5CZKA 2IXUA 4LEFA 3KBJA 1XLLA 3G0SA 2CIPA 3K8KA 3WCZA 5C9RA 1TIWA 3MSYA 3CAWA 3LZ3A 3IVUA 3MQTA 1N82A 1NWSA 3N13A 1EQPA 1UA3A 1XLFA 5DBUA 4F3HA 4Y90A 1YTEA 3SUTA 3ZOAA 4LY4A 3UZZA 2CWNA 5CAHA 3HURA 4ZMGA 1QO2A 4LUTA 4GE8A 1Q3NA 3DDMA 3ITOA 4OOZA 5HXMA 1GONA 4V1YA 1QR7A 5FL1A 1KFEA 3HJZA 2EQDA 5ABEA 1BQGA 4PEKA 1J2BA 5C2CA 2WCGA 4L1WA 3WUFA 1HTIA 3M0XA 2NV1A 1ISZA 4Q3MA 4M29A 4TMCA 2GQ9A 2V9DA 3NPXA 1GOWA 4Q8OA 2IKGA 1XRTA 2XIOA 3BMWA 3LLXA 4ADTA 3WLRA 1PTAA 4G1NA 1YE6A 3G6MA 3RLHA 1TZ9A 3H4XA 3CV6A 3SCNA 1GOXA 1XIFA 4PUMA 3WLIA 3OYXA 1HIZA 4MY8A 3NDOA 4L9XA 1AQ0A 2WOQA 4QE4A 3C6CA 1KCLA 4O12A 4QR6A 3K8MA 1LWHA 3NQBA 4G7EA 5J04A 2OZTA 5E0KA 2XWDA 3QFEA 1IWPA 4EXAA 2PA6A 3PC0A 4GISA 3OZYA 3D3AA 1DKWA 4NSBA 1ZBVA 2F2HA 4MVAA 3HG5A 3WJWA 4J5NA 1WDSA 4FX7A 1R86A 1LBFA 1GZJA 3H23A 1XC6A 4ZOAA 2X0HA 4DLMA 3JW7A 3G6LA 3GNDA 2YBTA 4AD2A 1R7OA 4H83A 1ZP4A 4LVBA 2E6YA 4AWTA 3A64A 3AYRA 3QYQA 3V75A 1WYIA 3O6CA 4HT3A 1J01A 1SJCA 4AG0A 5JQ9A 3OVPA 4X9SA 1SFLA 2WQPA 1XLGA 3B4UA 1B9BA 4RDWA 1PWLA 3PNUA 4O1BA 3T0BA 4HGXA 2POZA 2WC4A 1JQXA 4RX0A 3IJ9A 1XL9A 3E02A 1AL7A 3QGAC 4GABA 3CUXA 4RUBA 1E9ZB 4YTSA 1UWUA 2W4XA 4XUYA 4PRTA 4IGMA 2NVAA 4G6CA 5FIPA 4D6EA 3KS6A 2WMKA 3V16A 3H4GA 2ZUVA 2RKXA 1DQXA 5CPQA 3U2CA 4XAZA 3P67A 3R8GA 5CXPA 4Z2HA 4LVFA 2HJPA 3W02A 2GQ8A 3CB3A 3GAYA 5AHLA 4MB5A 3IGHX 1KGXA 2FMOA 4IMCA 3MB9A 4AXKA 3NZRA 1GJPA 1V3IA 4J3XA 4E4PA 3UJRA 2W79A 1KLZA 4IIBA 2ZVIA 1PHQA 2V68A 3L5LA 4FXJA 2B7QA 4K2SA 3SIZA 3VDAA 3WK2A 4MB4A 3BANA 3D46A 5BROA 4L4OA 1OC6A 2RGMA 3TN6A 3L2LA 1RXOB 1KKOA 1E6QM 2NXHA 4PMYA 3AYVA 4MZYA 3U3HA 4U4MA 4HNNA 1QNVA 3P74A 4HJWA 4S2CA 3WK3A 1K8YA 1PX4A 2J13A 4UC5A 3WF3A 4RZ5A 1GVQA 4L7ZA 4QAIA 5I3FA 1XKYA 3EYPA 1H0GA 2TMDA 4KKXA 2NQLA 2QUNA 4LOCA 1P6BA 4DVOA 1X7IA 4EK7A 1WX0A 3QR0A 3KOXA 3E2VA 3L0GA 1FHLA 1T99A 4BCEA 3SCRA 1FWRA 3BW4A 2QCGA 1R3VA 1I8JA 3AIVA 2QCFA 5GNXA 4R88A 1RP8A 3MUAA 3PZMA 2D3NA 3E2SA 3G1AA 3V0UA 2GVLA 3POHA 3AICA 1VBRA 3UZYA 2TYSA 3MYPA 3E74A 3F2CA 1W1ZA 4ZBCA 1OT1A 5BZAA 2YBUA 3OB8A 4Z2LA 1ISXA 1F61A 3N25A 4A2SA 1PZ3A 2V3FA 5I3JA 4MM1A 4MWAA 2E9BA 2ASHA 5FF2A 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