2QS2A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer in complex with ubp318 at 1.80 angstroms resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Binding site and ligand flexibility revealed by high resolution crystal structures of GluK1 competitive antagonists.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
total genus 79
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs2A02
2ZXTA 4R72A 2O1MA 4IO5A 3O2AA 4MLQA 4ZECA 2FYIA 2O51A 1GTKA 2HQ0A 2R71A 3ILTB 2RCAA 2E0SA 1FTLA 4OHNA 2Q2AA 4TOZA 4ZZEA 4WXJA 4R2BA 1MQDA 4KCDA 5DTBA 3Q27A 4OEVA 3IORA 3VXBA 4MBPA 2RINA 3RUMA 3PD9A 3PPOA 2ZYMA 1MDP1 5BUUA 4GLIA 1ZKBA 2DS9A 4FECA 4OYVA 5H8FB 2PVUA 3Q28A 3MWBA 1LFGA 4ESWA 4OESA 4F3SA 3KEIA 3H6VA 4FAJA 4GXSB 2REGA 1HSEA 5BWJA 5KDTA 4OWDA 3UGWA 3OO9A 1R9LA 3B6TA 1OLAA 1SYIA 3USDA 4ECFA 4GL0A 4LQ2A 5TPAA 4DIGA 3EHTA 3IOVA 1AL3A 3MQ9A 3MVZA 4C1TA 2DXYA 1QJMA 2H25A 3W9WA 2HZKA 2XXWA 4F3BA 2H5YA 1UIVA 1B05A 2XXHA 4YB7A 3TDJA 2V93A 3FD3A 4F29A 1N3XA 3U93A 5A5XB 2NOOA 3RN8A 3EPEA 3FUZA 1JW5A 4LZ8A 2QPQA 4LUBA 1FQFA 2QS3A 4F1UA 5DT6A 4PFYA 3TPAA 4R6YA 2X7QA 3D4GA 1CB6A 4FORA 1FTKA 4TLLB 3SESA 4GL8A 3IL1B 1SVXB 3OO8A 2AL4A 2GFEA 1LLSA 2AYSA 4X48A 3OENA 3CFZA 1USYH 3SEWA 5H8QA 3UORA 2H98A 1MM7A 3KN3A 1D9VA 3FXUA 1OVTA 1WVJA 4H8IA 1HSLA 5AA2D 5CI5A 2RKMA 4NWDA 3VE1B 3H4ZA 4OFOA 1IUDA 3FXQA 3G7WA 4DCYA 1QULA 3VV5A 2PYYA 4DE8A 1M5BA 4QFOA 4Q5TA 3ZS6A 1MQGA 3PMVA 4C1UA 4N6PA 3O6GA 1O64A 1I6QA 2D5WA 3C31A 3DP4A 2HAUA 4QSDA 4RPNA 4EQ9A 5KZTA 3PPRA 3M8UA 3N94A 4HCYA 4YICA 4UACA 4BDMA 4ZEDA 1NFTA 3M3FA 3D4CA 4NWCA 3EHUA 4LONB 4OQOA 1BIYA 3DP8A 2F35A 1I6AA 2Z23A 3Q29A 3E13X 1D3KA 5L8DA 2Y7IA 5I59B 3MPKA 1I69A 3ODBA 3HPIA 4KFQA 1QW0A 2NUVA 3VLUA 2XXVA 1JVXA 3O9PA 1M5EA 4LQ5A 2PT2A 4EUOA 3PPPA 1MXVA 4OZ9A 3HCQA 3WAEA 3TTRA 2A5TA 3RQTA 3ONMA 3MVXA 4Q30B 3N6UA 2R6GE 1N7XA 4IY6A 1WDNA 4KI0E 4OXVA 5LOMA 4YKIA 3Q26A 3FATA 4IO4A 2VD2A 4I62A 1B0LA 4TQUQ 1Y4CA 1AH5A 5CMKA 1A55A 1MRPA 3SERA 1OQHA 1P1QA 1NMUA 3A3UA 3RNNA 5H8HB 1B6HA 1BTJA 4NEDA 4P0IA 5TP9A 3HV1A 2GHAA 4R2FA 1B0HA 4C0RA 2VD3A 2F7CA 3THIA 1SQYA 3K01A 1ZBMA 5I56B 2LAOA 3TTNA 3L6HA 3H3GA 1US5A 2XX9A 4EDPA 3KGCA 1B1XA 3FGSA 1LB9A 1QUJA 1NNFA 4DXBA 3C32A 5FHOA 3FV2A 2ONKE 4ELRA 2BJJX 1I6BA 4PFWA 4MH5A 5J1DA 3T9HB 1LAXA 1QVSA 3BFUA 4P0GA 3KZGA 4IGTA 4K3FA 1YPNA 3FVGA 3K4UA 4NF8B 4R9FA 3MP6A 1FQBA 2I0BA 3E9XA 5I58B 2B65A 2G29A 3E3KA 3FASA 3KN7A 3OO7A 3O66A 5JTYB 1N3WA 3RY3A 4JB7A 1IIWA 4RNSA 1XHYA 1NH8A 1FTOA 3ZKLA 4R6HA 3PUWE 1URSA 4LZ7A 4F31B 1ZMGA 4XKQA 3PGFA 5AE4A 3PUYE 4G68B 2QS1A 3KBRA 1B2HA 4YMAA 4F39A 4XKRA 3SEXA 3OO6A 4F19A 3U8QA 3K6XA 4MF3A 1QUIA 2GHBA 3LR1A 4X1BA 4RK9A 3H06B 2B3FA 3OSQA 1CE2A 1SI1A 4FE8A 3K6VA 4H6DA 3R7XA 2HCAA 4ZEBA 3CFXA 3TCFA 3EN3A 3U1OA 3OEMA 4H5GA 2XX8A 1D4NA 1VSOA 1N7WA 3GBAA 5H8SA 4XKNA 1H43A 3SEVA 3DP6A 4OERA 3T9UA 5K2XA 2OWTA 5ITPA 1LFIA 4PP0A 3CG3A 2QS4A 3FVNA 1B58A 1MY0A 4F2OA 3TAJA 5I57A 4DLDA 4O3BA 5ISUA 2V3UA 1Y1ZA 4WEDA 3VVEA 2XXQA 3PU5A 2DVZA 1ZLQA 2Z8EA 5I58A 2VOZA 5KDTB 2G93A 4YMBA 2X7PA 1YAEA 1SW4A 3TTLA 1M5DA 4X9TA 1A7LA 1PBPA 1RYXA 1B3FA 1LBCA 2XXTA 2DWHA 2D21A 2HAVA 3RGYA 1SD3A 3H6TA 1VFEA 3IB2A 4OTEA 2XXPA 1P99A 1UTBA 1EH3A 2UVGA 5EHMA 1IZ1A 1B3EA 3MBPA 1ATGA 2D3IA 4NTLA 2NVUB 1N04A 3CI8A 1XOCA 3K02A 3DLNA 4H67A 3PMXA 4F3GA 2FNCA 4U22A 4MLVA 4RYAA 2QMWA 4R9GA 2HXWA 1FTMA 4KCCA 3QUJA 4DZ1A 4XTCQ 3VFJA 2YJPA 3PPNA 4PFUA 2PBWA 1R6ZA 3C9HA 3IX1A 2H4IA 1RKMA 4WKMA 5KCJA 1M5FA 3V89B 1QUKA 1SBPA 5EYFA 2E1SA 4IB2A 5H8QB 4LP2B 3UN6A 2ZYKA 3C33A 3LC8A 2XD3A 3K6WA 1N76A 1TFAA 1Y3QA 1B7ZA 1PC3A 3QXMA 1JNFA 2O7UA 3MC2A 2RC7A 2M8CA 4ONYA 3F11A 3T9XB 3CG1A 1IEJA 4FEBA 4RA1A 4F1YA 1R1NA 3ZSFA 1A99A 1MY1A 1MY3A 1D9YA 4YZZA 1IXGA 3S9LC 1PEBA 3JV9A 3GBBA 3CSBA 3IOWA 1URDA 4GIZA 2I3WA 4OMBA 3GXAA 4ISUA 3K1MA 2HEUA 4YB6A 3IO4A 2UXAA 4EF2A 3JYRA 1A40A 1JEVA 5IAIA 3CIJA 1B3LA 4DCXA 3S9MC 4U1OA 2O84X 4RXLA 4N07A 3FZVA 4BDQA 3QYTA 1OVBA 3PUXE 2Q89A 4BDOA 2F78A 3IJOB 2UYEA 2A5TB 1SYHA 3ZKKA 1HSJA 3L6GA 3OELA 3SKPA 3DM0A 3S2VA 3T9VA 3IR1A 3KSJA 3HSTA 2I6EA 1T0KA 3MVWA 4Q0CA 4GWOA 4QSEA 4F18A 3FVKA 1B40A 1PBQA 4GF8A 4Q8RA 4PQJA 3TCHA 1MY4A 2DE3A 2H9BA 5TP9B 2DSFA 1ZIUA 1B5IA 3R6UA 1ANFA 1KWHA 3EQ1A 1MH4A 3TTKA 4BDNA 3T22A 2F6PA 4H5FA 3RTWB 3FXRA 1IQ7A 5AA4A 2OCUA 4ZE9A 3TTMA 3QIMA 3LSWA 1MS7A 2XXYA 3KFMA 3IOUA 2V84A 4G8MA 2Z22A 2R9JA 4ND9A 4IO2A 4ZEFA 4QFPA 4I1DA 4UA8A 1EU8A 3N5LA 4LZ5A 4YB5A 5DVIA 3TEPA 1DPEA 5K2YA 1LCTA 4FIMA 2VHAA 5DEXA 3U94A 2KLFA 3PMWA 3K2DA 3MZBA 3CFLA 2DWAA 2AIXA 2Q2CA 5ICTA 3G3KA 2QJEA 2ONRA 2ANJA 1JETA 5ITOA 3W9VA 3ILUB 2AL5A 5FHMA 2I0CA 3MVYA 1POY1 1SI0A 4EXLA 3I6VA 2B3BA 4G2ZA 3MPLA 3M3KA 4G8NA 3RTFB 2F5XA 1JW4A 3TUSA 4X1DA 4R73A 1FQAA 2QMXA 3FIRA 3AXFA 1SW1A 4N13A 1XS5A 1B3GA 1B7UA 1DPPA 3CVGA 1GV8A 2I4BA 2PT1A 1DOTA 1Z7NE 3PD8A 4YKKA 1B4HA 1XVYA 1NNKA 2YLNA 4H65A 1LFHA 2ESNA 3K6UA 3KSXA 1Y3PA 2HFBA 4FJPA 5I57B 2QS2A 5ELVA 2OK2A 1H76A 4NMYA 4KHZE 4KPTA 1MY2A 4U4XA 1FQEA 1MXYA 4YAHX 3IOTA 3QAXA 1NL5A 1MXUA 2Q9TA 2DE2A 1UTHA 4HS7A 2XHDA 4G68C 3A09A 1EZPA 3I3VA 4OFLA 3W15C 2IEEA 4OEUA 4NF5A 2DP8A 2V3QA 3B6WA 5CBRA 1QKAA 4RPOA 1MG1A 5FTHA 4ZDMA 3VDFA 1NNTA 4BDLA 5CC2A 5I2NA 4BDRA 1UTBB 5HM4B 3SETA 3UK4A 3RT6B 3MZ9A 4U21A 1AOVA 5L9MA 3T96B 4XXUA 4YU0A 4FEDA 1B32A 1IXHA 1ELJA 4IY5A 2GH9A 5ICQA 1B9JA 2DYXA 3O6HA 3G3FA 4PFTA 3TODA 1US4A 2ALUA 3E4RA 3MJNA 3V83A 1BKAA 3KJ7A 3KN8A 1JW1A 3K0VA 1S50A 3KJTA 4GXAA 1DTZA 3ECRA 1XT8A 5KCJB 3VVFA 1SW2A 4DXUA 4QHQA 1NH7A 3EHSA 1BLFA 2VP1A 2OJTA 1QKBA 1IITA 1SDXA 3C35A 1TT1A 2F7BA 1P1NA 4JSDA 5I2KA 3MAMA 2GRVA 2ZNTA 2PMSA 4POWA 3TQWA 3LBSA 3TMGA 3N26A 2WKYA 2I4CA 2F36A 2O69A 1JQFA 2ZYOA 5B7DA 2QSXA 5AA2A 5CMBA 4EF1A 1WODA 3PUVE 3G3HA 1MDQA 3OEKA 1GVCA 2H99A 3OMBA 1SW5A 2Y7PA 1LBBA 3SEUA 1B1HA 5L9OA 3KOTA 4QF9A 1PB8A 1AMFA 1JVYA 3TZAA 5L9SA 5JEIA 4DXCA 1Q35A 2RC9A 2F97A 2Q8JA 3G3JA 4G8HA 1LGBC 2F34A 4NF4B 4RJZA 3Q25A 3VLVA 4KYEA 5DVFA 3FV1A 4NF6A 4ZEKA 4GOTA 3JZJA 1MPDA 3H7MA 1TFDA 1GGGA 3K1NA 1H45A 2P2AA 2XXUA 3H03A 1ZTYA 1Z7ME 4R6KA 1II5A 3PV0E 4ZE8A 2NXOA 2P0SA 2ZNUA 3IAZA 1POTA 4RK2A 3S4UA 1YTVA 3PUZE 4OVJA 1LAGE 3LUYA 1H44A 2O7IA 4XIGQ 2Y7KA 4ZEIA 2V25A 1P1WA 4GVOA 4G4PA 3IJXB 4ESXA 3P7IA 2ONSA 3UIFA 3BBRA 1Y4TA 1MXXA 5F1QA 1A8FA 1PDAA 3H6WA 5CBSA 5DVJA 2DVCA 2REJA 1EZ9A 2UVHA 1B7HA 4U23A 4PE5B 4HW8A 3IB0A 1JEUA 1OMPA 1B51A 4U2RA 3TYHA 3A3CA 4IO3A 4Z7EA 1B46A 1VFDA 2DE4A 2UYFA 1B5HA 3LSXA 5F7VA 4NF4A 4H8JA 4GD5A 1MQJA 2PX1A 2Y84A 2W7YA 4LA9A 3OXNA 4JDFA 2ABHA 3S9NC 2DWJA 2THIA 3TCGA 5AA4B 1FQCA 4G77A 2IA4A 4POXA 3RPWA 1EZOA 1M5CA 4F1VA 3GLBA 1MPCA 3IK6B 3OOAA 3TKDA 4QFNA 4AB6A 3K00A 4AQ4A 2I49A 3SEYA 2VGQA 5H8FA 1USYE 4F22A 3G3GA 3MUQA 5DEXB 1PB9A 4KQPA 1H3DA 1AIVA 4FATA 1Y9UA 3RLFE 3DELB 1MM6A 2Y7RA 3HHFA 1Q1KA 1FQDA 2O68A 4JXIA 1DMBA 1P1UA 4HTGA 1Y20A 4IGRA 1L5TA 1VR5A 1FTJA 2Z8DA 3SDFA 1P1OA 5CRYA 2ZMBA 1TWYA 5TU0A 4KR5A 4U4SA 4I9DA 3OSRA 4JSOA 3U72A 1OIBA 1RYOA 1Y1MA 1FW0A 5AA3A 1VE4A 3V5AA 5CMMA 1DSNA 4JBZA 4ELQA 3LSLA 3O29A 2YPNA 4RY1A 3MP8A 4ELPA 2XXRA 3FJGA 3KOSA 2X26A 3BFTA 1O7TA 2OZZA 3LSFB 5A5XA 3C36A 2CZLA 3T66A 3B6QA 5CM6A 1F9BA 2O1LA 2ZYNA 5JK4A 1UIUA 2CMOA 2OLBA 3CRBA 4KYDA 1FCKA 4HCWA 1A8EA 4I8CA 1UTHB 3TQLA 5B70A 4U1ZA 3TELA 2Y7WA 5AA1A 3BKIB 2RCBA 4QFKA 5HBCA 5EHSA 4EQ7A 1BP5A 3WAFA 2XD2A 5HPQA 4NF5B 3GZGA 3H6UA 1MPBA 5H8NB 3HO7A 1IXCA 3VVDA 1UQWA 4O3CA 3O97A 2F6GA 4Z0IA 3QSLA 3O6IA 2F7AA 5I2NB 4GRKA 3HHGA 2Q88A 3C4MA 4OENA 1LAFE 2HZLA 3OD7A 3N6TA 1MQHA 5I84A 5DYHA 2XX7A 3TFLA 2Z8FA 1MXZA 4THIA 1MH3A 3CR9A 2ZNSA 3FJMA 4M1VA 5CMCA 1OQGA 4E0XA 1LSTA 4BLAA 4R75A 3IO6A 1S9TA 1ZU0A 4LATA 2P1SA 1LB8A 4JWYA 3G3IA 3S9EA 3VXCA 2F8DA 3EF7A 1XVXA 1R9QA 2DWIA 3KG2A 2I48A 2OBGA 2DXRA 2I3VA 2DQVA 5I2KB 4YKPA 5I59A 4LVQA 4EXKA 3R26A 1N0TA 1N84A 3I5OA 3C34A 3HN0A 3U92A 4F3PA 5AA2B 1LCFA 5H8NA 4PETA 4KD5A 2DOJA 4ZS9A 1LAHE 1B52A 3T93B 2QRYA 4TLMB 4NE4A 2A5SA 1B3HA 3V8XB 2V3TA 2RC8A 3UP9A 4E0WA 2FA7A 4YKJA 1S7YA 1NKXA 5H8HA 4H1XA 4M4GA 2UVIA 4ELOA 4EQBA 5IKBA 4L17A 4NF6B 1YCJA 2XXIA 1B4ZA 3FVOA 4OFJA 4F2QA 4O3AA 4QFLA 4AB5A 4OETA 3UA8A 3IB1A 1NNPA 3K1PA 4JWOA 5I56A 1J1NA 4MFIA 2QL3A 4GFRA 4ZZAA 2XXXA 3O28A 3FJ7A 4IO7A 1ZJLA 4IO6A 1GR2A 4H0WA 1XC1A 1O63A 4P11A 2UVJA 3CSGA 2NWJA 1OLCA 4GQOA 4R74A 3PPQA 4NF8A 1IXIA 1TXFA 4XKPA 3RT8A 1MQIA 3VLWA 3MW0A 1MXWA 3QUFA 2OWSA 4DDDA 2O6AA 4QSCA 4KYSA 5FHNA 4JWXA 4QRZA 1URGA 1A54A 3MZ1A 5JTYA 1Y3NA 2I58A 1DTGA 4WEPA 1B5JA 5TPAB 3QK6A 5M2VA 5FTIA 3B7DA 3M3LA 1PB7A 4G68A 3MP1A 2RF1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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