2QS3A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer in complex with ubp316 at 1.76 angstroms resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title ACET is a highly potent and specific kainate receptor antagonist: characterisation and effects on hippocampal mossy fibre function.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
total genus 80
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs3A02
3BFUA 3O6HA 5H8NB 5KCJB 3K6XA 3MVZA 4Z0IA 5FTIA 4BDOA 4LP2B 2OWTA 3N26A 3ONMA 3VXBA 4XTCQ 4QFPA 2PYYA 4KPTA 4UA8A 4GFRA 4XKQA 3SKPA 5A5XB 1SYHA 5KDTB 1USYE 1P1UA 3FJGA 3KEIA 3OEMA 1B6HA 2Y7WA 2F97A 4I8CA 4JSDA 1DTZA 1XVXA 2RINA 4NWDA 2Y7IA 1GVCA 2Z8EA 2F6GA 4R73A 3IOWA 4UACA 1Y4TA 3MZ9A 4BDNA 1Y3PA 1A99A 3TTNA 1QW0A 4RNSA 5I56A 3G3HA 4XIGQ 3Q27A 1XOCA 2R71A 2V93A 2O6AA 3M8UA 3JYRA 4EQBA 3H6VA 5I2KA 1WODA 4F2OA 4XKNA 4LZ8A 1MXUA 4E0WA 5AA2D 3BKIB 3KZGA 4M1VA 2DQVA 1P1OA 4M4GA 4R9GA 3OO6A 5M2VA 1N0TA 1AH5A 1R1NA 4U22A 3W9WA 3FXQA 4JWXA 3OELA 2HAVA 4RA1A 3U94A 1BLFA 2D3IA 4HTGA 5H8FB 2GFEA 4YU0A 1NFTA 4N13A 4YKIA 1LB9A 4EDPA 3RUMA 3RQTA 3PPQA 3Q26A 4WEPA 1N76A 2HQ0A 3PMWA 4QFLA 5CI5A 5DT6A 4ELRA 3S9EA 5EHSA 4NF6B 5CC2A 4RPOA 1B0HA 1NNKA 3SEWA 3MPKA 1XT8A 2RC7A 3I6VA 3IO4A 4IB2A 4OXVA 1JW5A 1MQGA 3H6TA 3IORA 5DEXA 4IO3A 1NKXA 4PE5B 3B6TA 2QMWA 3V89B 4DCYA 4F19A 3PD8A 1QVSA 1ZU0A 4NMYA 4XKRA 4YKJA 1B51A 2OZZA 2ZYNA 4U23A 4C1UA 5I59B 3O6IA 1QUIA 1MG1A 1S50A 2B3FA 2IA4A 2XXQA 4JDFA 4H65A 3TFLA 2O1MA 4XKPA 2QSXA 2REGA 3QIMA 2YLNA 1GV8A 3MZ1A 1MH3A 1QJMA 4NTLA 5TP9B 2O68A 3B6QA 3ODBA 4ZEIA 4F29A 5I58A 2CMOA 4EUOA 1O64A 3KN8A 3O9PA 2B65A 1RYOA 5AE4A 4GLIA 2A5TA 4PQJA 3LSFB 1B1XA 4H6DA 1NNPA 2DP8A 2DXRA 3FXRA 4F1VA 4ZEBA 1TFAA 2YJPA 4WEDA 4YAHX 1XVYA 4MLVA 3GZGA 3KSJA 4THIA 3SERA 4AB5A 3MZBA 2NOOA 2Z8FA 3FATA 1BTJA 3U92A 3IR1A 1SW5A 1B4HA 2G29A 2QMXA 4YB6A 3SDFA 5A5XA 3LC8A 1DOTA 4OESA 3OENA 1OIBA 1VFDA 3THIA 3U1OA 1D4NA 4ESWA 3OSQA 3LSLA 3C32A 3H03A 2HFBA 1SW1A 3RT8A 2YPNA 2G93A 1IEJA 3MAMA 1T0KA 1M5CA 1ZBMA 2PMSA 5EYFA 1KWHA 1GGGA 1B3HA 2XXYA 2O51A 2VOZA 3G3JA 1JQFA 4GVOA 4ECFA 5L9OA 4POWA 5J1DA 1PB7A 5DVFA 1IXCA 5JK4A 4QHQA 1ZLQA 4YB5A 3FV1A 1A8FA 3EHSA 3KN3A 3FZVA 4OEUA 4ZEDA 1CE2A 1OQHA 3CVGA 3OXNA 2HEUA 3FV2A 1Y4CA 4R74A 3RTWB 1FTKA 2XXTA 4QSDA 3SEVA 4ZE8A 3WAFA 4I62A 4LVQA 4NF5A 4RK9A 4OENA 1OQGA 2GRVA 1B3GA 3O29A 1PB8A 3PGFA 3QXMA 5TU0A 5B70A 3FVOA 4N07A 2I0BA 3PUVE 3VLWA 3VXCA 2P2AA 3UGWA 3CR9A 3EQ1A 5H8NA 1AL3A 1LSTA 4G68C 1II5A 2DWAA 2F34A 3HN0A 1B05A 4RYAA 4X9TA 3ILTB 5BUUA 1Y3NA 4YICA 3K00A 5AA1A 3O97A 5FHNA 4MBPA 1B5IA 4TOZA 4NEDA 3RT6B 1BP5A 2R6GE 3IL1B 1S7YA 3A3UA 3TYHA 1GTKA 3R26A 1ZKBA 3DP4A 1J1NA 3PUYE 2RCBA 4H1XA 4E0XA 5B7DA 3UA8A 4X1BA 2VGQA 3KN7A 3OMBA 4YZZA 5TP9A 2RKMA 3WAEA 3LUYA 4H5GA 1B32A 3FVGA 4QF9A 2ZYKA 3TCGA 2Z8DA 1EU8A 1MRPA 2Z23A 3ZKLA 5I2KB 4F3BA 1TWYA 4EXKA 5ITPA 3OEKA 2NUVA 1Y1MA 2RCAA 3MUQA 5F7VA 4ZDMA 3MVYA 1TFDA 1AMFA 2PT2A 3O6GA 3OO9A 4ELPA 1DPEA 3CG3A 2DSFA 2OWSA 4KR5A 2Q8JA 2KLFA 1US5A 3TPAA 3HCQA 2RC8A 4YKKA 2AYSA 1H44A 1EZPA 1H3DA 4FATA 4RJZA 4Z7EA 1IXIA 3D4GA 3O66A 4NF8B 3G3FA 3MP1A 2LAOA 2Y84A 3FIRA 3CFXA 1FTJA 2VP1A 4MFIA 5DEXB 2XHDA 3TKDA 1RKMA 1B7ZA 1LLSA 3H4ZA 3Q28A 4WXJA 1QKAA 1LBCA 5I59A 1H76A 2Q88A 1EZ9A 4L17A 2XX8A 4OERA 1PB9A 3FXUA 3FUZA 4DDDA 4BDMA 1M5BA 1Y3QA 2I58A 2I6EA 3DP8A 3K2DA 4OVJA 1LAXA 3MQ9A 3T9XB 3SEUA 4ELQA 4BDQA 2ZXTA 3F11A 3U8QA 2F5XA 4R6KA 2H5YA 2O84X 2A5TB 3E9XA 1FCKA 3UK4A 4DXCA 1B58A 1A8EA 5H8HA 4DZ1A 4JWOA 5CMMA 3CG1A 3HO7A 2I3WA 4NE4A 5I57B 1P1NA 1MQIA 3KOTA 3Q25A 1OLAA 2ONKE 4HS7A 4PP0A 3S4UA 4R9FA 4DXUA 2B3BA 1AIVA 3EF7A 1Z7ME 2AIXA 5F1QA 2THIA 4RXLA 3DLNA 2VD2A 1URDA 4K3FA 1LFGA 4OFLA 1LAFE 2P1SA 3KOSA 1IQ7A 1YCJA 4FJPA 3PUWE 2BJJX 3V5AA 2QS4A 1A40A 3ZSFA 1R9LA 1WVJA 1EH3A 1PBPA 2XD2A 4KHZE 4R75A 3TMGA 1B5JA 1A7LA 2FA7A 4YKPA 3PPNA 3RPWA 2GHAA 2PT1A 3B6WA 3LSWA 4Q5TA 3SEYA 4EF2A 5CBRA 3C36A 4LONB 3R6UA 5I2NA 3GBBA 3MP6A 1DSNA 4LQ2A 3MC2A 1IUDA 2I48A 4IGTA 2H9BA 3C9HA 1ZIUA 3A3CA 4XXUA 5DTBA 2ALUA 2HZKA 4KD5A 3TDJA 1Y20A 5AA3A 3KGCA 1JEUA 3K6WA 1JVXA 2NVUB 3H6WA 4FEBA 2QJEA 3SEXA 1UIVA 3EPEA 1R6ZA 1SBPA 1URSA 5ELVA 4I9DA 4P0GA 5DYHA 2I49A 2XXVA 4FORA 2O1LA 1FQAA 1FQEA 2X7PA 3FD3A 3OOAA 3PV0E 4NF8A 4OFJA 1B3EA 3G7WA 3TTRA 2PX1A 5ISUA 3TQLA 2F6PA 2UXAA 3E3KA 4ND9A 1LCFA 4OYVA 4BDLA 3IB0A 4POXA 1M5DA 2DS9A 3QYTA 4F3SA 2D5WA 2F8DA 4RY1A 4EF1A 1NH8A 4U1OA 1B52A 1SD3A 1LGBC 3CFLA 3PUZE 4G8HA 2Q89A 3N6TA 2PVUA 3IOUA 3SETA 1UTBA 2I3VA 2E0SA 4H5FA 4G8MA 1MM6A 4LUBA 4EQ7A 3KJTA 1FQBA 3T9UA 4FECA 1B2HA 1A55A 4MLQA 3T9VA 2H98A 4OETA 3TZAA 3C34A 2RF1A 4OHNA 2XX7A 5H8SA 1JVYA 5AA2A 1DMBA 2ONRA 3T96B 2IEEA 5H8HB 1MXWA 3K1MA 3JZJA 5TPAA 3VFJA 4AB6A 5IAIA 4P0IA 4RPNA 4KCDA 3CI8A 5JTYB 1LB8A 4ZEKA 1OVTA 4GQOA 3G3GA 4WKMA 3V83A 1B1HA 5HBCA 1MXYA 4H8JA 3HPIA 4OWDA 1M5EA 2H4IA 2ZYMA 2XXPA 3IO6A 3CRBA 3K02A 2Q2CA 4R2FA 2NXOA 4DIGA 3UORA 1I69A 5I56B 1VSOA 3LSXA 2REJA 1DPPA 1RYXA 1B7UA 4OZ9A 2Z22A 1D9VA 1SI1A 3PUXE 5ITOA 3K4UA 2Y7KA 5I2NB 3FASA 1TXFA 2Q2AA 4F18A 1SQYA 3E4RA 3IX1A 3VLUA 3VVEA 2UVJA 4F1UA 3OD7A 1LBBA 4FAJA 4KYSA 2I4BA 4IO7A 2F36A 1ANFA 1N04A 1B46A 3L6GA 2DWIA 5DVIA 1POY1 2Y7PA 5FTHA 3MVXA 3OSRA 1D3KA 1MXXA 3ILUB 3JV9A 3MBPA 1VR5A 1XHYA 4GRKA 2R9JA 4BLAA 3T66A 4F3PA 1MDQA 1MY2A 2F7CA 4F2QA 4GIZA 2DWHA 2OJTA 3LBSA 2UYFA 4H0WA 1URGA 5I57A 2GHBA 1DTGA 1VFEA 3L6HA 1M5FA 4EXLA 1A54A 4GL8A 2X26A 1B4ZA 2GH9A 2DVZA 4G2ZA 2ONSA 2ZNUA 3FJ7A 4MH5A 4QSEA 1NL5A 1POTA 3IAZA 4GD5A 4R2BA 2ZYOA 4IY6A 4U4XA 4AQ4A 2CZLA 1JETA 1AOVA 1QUKA 4PFYA 5I84A 4H67A 1MPDA 1ZTYA 2HCAA 3ECRA 3U93A 1UTBB 2D21A 3P7IA 2HAUA 2O7IA 3PU5A 5AA4B 5HM4B 2Q9TA 3KG2A 3QK6A 3K6UA 2DE4A 4KQPA 4DE8A 1OVBA 2Y7RA 3IOVA 4QFNA 4OMBA 1UTHB 4FEDA 1NNFA 1UIUA 5H8QB 4ZZAA 5JEIA 1B40A 1XS5A 4U4SA 4KFQA 2QS1A 4F31B 5JTYA 1B0LA 4G68A 1MM7A 3H3GA 4G4PA 1MXVA 1PEBA 3I3VA 3C33A 2F78A 3E13X 1FQFA 4ELOA 1I6BA 2XX9A 2QL3A 3KBRA 1BKAA 2OCUA 3QUFA 5EHMA 4EQ9A 1Q35A 2QS2A 3TAJA 4ZEFA 4DXBA 4Q30B 1O63A 4PETA 1O7TA 1HSEA 2OK2A 2XXWA 1SW2A 3M3FA 2XXHA 1ATGA 1MQHA 4IO4A 3H6UA 4LZ5A 4P11A 2VD3A 2QRYA 5L8DA 3G3KA 3RNNA 3VVFA 5IKBA 1LFHA 2UVHA 1LAHE 3USDA 3S9MC 2DE2A 4KYDA 3UIFA 1Y9UA 4GOTA 3TEPA 2PBWA 3GBAA 1FQDA 2XXIA 3FJMA 2OBGA 4TQUQ 3RTFB 1USYH 3MWBA 4X1DA 1N3XA 4IY5A 4QRZA 2ZNSA 2QPQA 1SI0A 4IO6A 1MY4A 3IOTA 1CB6A 2ANJA 3BFTA 1NH7A 2ABHA 3PMVA 4QFKA 4GF8A 1JW4A 4ONYA 3RN8A 5KZTA 4ISUA 4JBZA 4LZ7A 4JWYA 4R6YA 4GWOA 3U72A 4F22A 5ICTA 1TT1A 3BBRA 1MY3A 4PFTA 3O28A 2H99A 2UVIA 3IB1A 5FHMA 2X7QA 4OTEA 5AA2B 3K01A 4YB7A 5TPAB 3A09A 1I6AA 1HSLA 2P0SA 3TELA 1ZMGA 1HSJA 4NF4A 1P1WA 3IK6B 1FQCA 1US4A 1N3WA 3FVKA 5KCJA 4FIMA 3CIJA 1MPCA 1BIYA 4MF3A 3S9NC 1N7WA 4LATA 3K6VA 4LQ5A 4PFWA 3SESA 2OLBA 3RGYA 4ZS9A 3GLBA 1PC3A 3K1PA 1IXGA 4O3AA 4KI0E 1MY1A 4KYEA 2A5SA 2HZLA 5AA4A 5LOMA 3IB2A 5CMCA 5K2XA 3TUSA 2M8CA 3UN6A 1B3LA 1MXZA 2I4CA 2ESNA 3AXFA 3EN3A 3C31A 3I5OA 5L9SA 2F7BA 2V25A 3S2VA 1MH4A 1UTHA 3B7DA 1IITA 1LFIA 2UVGA 2V3TA 1IIWA 1F9BA 2V3QA 2QS3A 4JB7A 3TCHA 4HCWA 3PMXA 4Q0CA 4F1YA 1SW4A 1ELJA 4G68B 2DYXA 2XD3A 3IJXB 3W15C 5CM6A 5HPQA 5DVJA 1UQWA 3OO7A 1QKBA 1MY0A 3VE1B 3IJOB 4LA9A 1VE4A 3PD9A 1MQDA 3TODA 1H43A 1H45A 1N7XA 1S9TA 4O3BA 3MP8A 1QUJA 4OEVA 3TTLA 4YMAA 2XXUA 2I0CA 1N84A 1YAEA 3CSBA 4GXAA 1MQJA 3TTMA 3ZS6A 4C1TA 3RY3A 2W7YA 4O3CA 3H06B 2ZNTA 3D4CA 1PBQA 4YMBA 3MVWA 1IZ1A 1D9YA 3HSTA 3V8XB 4DLDA 5L9MA 2RC9A 3HV1A 5CMKA 1I6QA 1SVXB 1OLCA 2O7UA 1R9QA 4PFUA 4NF6A 4QFOA 4OFOA 5ICQA 1QULA 2V3UA 3FVNA 2VHAA 3KJ7A 3M3KA 4F39A 3QAXA 4IO5A 4GL0A 1NMUA 1L5TA 3C4MA 4FE8A 3HHFA 3G3IA 5KDTA 3LR1A 1FTMA 4IGRA 1YTVA 1NNTA 3CSGA 3N5LA 3MW0A 3N6UA 2AL4A 1P1QA 3RLFE 3UP9A 3VDFA 4ZE9A 4NWCA 3KFMA 2DVCA 3O2AA 1MS7A 3VVDA 1FW0A 2E1SA 2AL5A 3PPPA 5H8QA 1Z7NE 2DXYA 1P99A 1Q1KA 3QSLA 4H8IA 4IO2A 4R6HA 4RK2A 1B9JA 4R72A 3T9HB 3OO8A 5I58B 3T93B 2H25A 3CFZA 5K2YA 2DWJA 1IXHA 3H7MA 3M3LA 4U21A 3DP6A 3R7XA 3N94A 4F3GA 3ZKKA 1MDP1 2V84A 3DM0A 1OMPA 4JSOA 5CMBA 4C0RA 4ZECA 1SYIA 2HXWA 2DE3A 1B7HA 3C35A 4KCCA 4U1ZA 3TTKA 4HCYA 4TLLB 4N6PA 3EHUA 5FHOA 4OQOA 4GXSB 2XXXA 1SDXA 1JW1A 2XXRA 4U2RA 3DELB 4TLMB 4QSCA 3W9VA 5H8FA 3T22A 2FNCA 1FTLA 2O69A 3K0VA 3PPOA 1B5HA 4G77A 2NWJA 3VLVA 4G8NA 2DOJA 3MPLA 5CRYA 2FYIA 4DCXA 3HHGA 1MPBA 1WDNA 3GXAA 3QUJA 4JXIA 1B3FA 3VV5A 1JNFA 2ZMBA 1GR2A 3EHTA 3TQWA 1FTOA 5CBSA 4BDRA 3TCFA 4X48A 1XC1A 1PDAA 3K1NA 3FGSA 1YPNA 4ESXA 4Q8RA 2F7AA 3KSXA 4NF5B 1EZOA 1Y1ZA 1ZJLA 2UYEA 2F35A 5BWJA 3Q29A 1JEVA 4ZZEA 1LCTA 4HW8A 3PPRA 4I1DA 3S9LC 2WKYA 3MJNA 1LAGE 4NF4B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RDZA 3BFUA 5FTIA 3VXBA 4XTCQ 4QFPA 2PYYA 4XFEA 2ZZWA 4KPTA 4GFRA 5KDTB 1B6HA 2Y7WA 4NWDA 2RINA 2Y7IA 3IOWA 1Y4TA 4RNSA 1XOCA 4P3LA 2V93A 3JYRA 3KC0A 2KQZA 1WODA 4F2OA 4LZ8A 4OVQA 3OO6A 3W9WA 2HAVA 3A29A 3EKIA 2GFEA 5A5LA 3Q26A 1N76A 2HQ0A 4QFLA 5DT6A 3S9EA 5EHSA 4NF6B 1B0HA 1NNKA 1FPLA 3I6VA 5DEXA 3IORA 4IO3A 3B6TA 3PD8A 1B51A 2XWIA 2B3FA 2QSXA 2V4CA 2YLNA 4NTLA 5TP9B 3B6QA 3ODBA 4ZEIA 4EUOA 1O64A 4GLIA 2A5TA 5I5PA 1B1XA 1NNPA 2DP8A 3B50A 4OANA 1XVYA 4THIA 4AB5A 4GX6A 1B4HA 2G29A 3E78A 1DOTA 3OENA 3C32A 3H03A 3RT8A 2YPNA 1GGGA 4GVOA 2VOZA 4ECFA 4POWA 1PB7A 3U65A 4QHQA 3FZVA 3RTWB 2HEUA 3SEVA 4NF5A 4OENA 1B3GA 1PB8A 5B70A 1Q9DA 3EQ1A 1LSTA 2DWAA 2F34A 1B05A 4YICA 3K00A 3O97A 2Y5KA 5FHNA 4MBPA 1B5IA 2P3VA 4TOZA 1BP5A 3A3UA 3DP4A 5B7DA 3WAEA 3FVGA 4I3EA 3TCGA 3ZKLA 1LBYA 1TWYA 3OEKA 2RCAA 1AMFA 2PT2A 3O6GA 3OO9A 1DCUA 4KR5A 4NN3A 1NI9A 1YXIA 3D4GA 3O66A 3MP1A 3FIRA 2HPGA 4O7MA 5DEXB 3TKDA 1LLSA 1QKAA 1IMBA 2Q88A 4L17A 1PB9A 1M5BA 2I58A 4P47A 2FHYA 3U8QA 2PFYA 1FPKA 2A5TB 1FCKA 4N8YA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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