2QS3A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer in complex with ubp316 at 1.76 angstroms resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title ACET is a highly potent and specific kainate receptor antagonist: characterisation and effects on hippocampal mossy fibre function.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
total genus 80
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs3A02
5I2KB 5TP9B 3RQTA 4JB7A 4LQ2A 2OWSA 1FQFA 3VLUA 3DLNA 2F6GA 2H99A 1SBPA 1USYH 3UORA 2DOJA 1LB9A 3JYRA 2PBWA 3W9VA 2Q88A 4DCXA 3U72A 2B65A 4OZ9A 4OVJA 4R2BA 4P0GA 3JZJA 1B5JA 3B6TA 1LFIA 1QULA 1ZIUA 1EZPA 4NTLA 3HN0A 3FXQA 1FW0A 3FVGA 1MXYA 2XXIA 2NVUB 1PBQA 2DVCA 3OO6A 1LGBC 1GV8A 4I62A 1ZTYA 4ELQA 1MQDA 4O3AA 4EUOA 1US4A 4KI0E 3TEPA 3MC2A 3ONMA 2PMSA 2R6GE 3CG3A 3H03A 1M5DA 1GTKA 3B6WA 1R1NA 1WODA 2D5WA 4QF9A 2O6AA 1B3LA 4LZ5A 1PDAA 2AIXA 1P99A 1Z7ME 4IY6A 4H1XA 3MP6A 2ZNUA 5ICTA 1JNFA 2ALUA 3IK6B 3TQLA 3VXBA 3ILTB 4YB7A 5CBSA 4ZZAA 2ZYOA 5ICQA 4IO5A 5FHNA 3U92A 2W7YA 1MQJA 2XX8A 1O64A 3K00A 2QS4A 3RT6B 2OZZA 4O3CA 3IOVA 1LAXA 3PU5A 2Y7IA 4H67A 3C4MA 1SW4A 2RINA 3EN3A 4KD5A 5J1DA 4C1TA 2V3UA 3PUVE 3A3CA 1H3DA 4P11A 1A7LA 2RCAA 3EF7A 5I2KA 3OSRA 4F18A 5TP9A 3O66A 4RK2A 3H06B 1TT1A 4F2OA 1N3WA 1A8EA 1AH5A 4U4SA 4F29A 1B40A 1B58A 3GLBA 1A54A 5DT6A 1SDXA 3TDJA 2DXRA 4PFYA 1B7UA 4OFOA 5JK4A 2ANJA 4NF5B 4OERA 5AA4B 3QUFA 3THIA 4TOZA 2F36A 3KN8A 2I3VA 4K3FA 2O51A 1ELJA 4F2QA 2HXWA 3MP8A 1JW4A 2PYYA 1NKXA 1VE4A 1MPCA 1LB8A 3G3FA 4U21A 4GF8A 1OMPA 2GRVA 3H6VA 3Q28A 2VHAA 1ATGA 5F1QA 3UP9A 2IA4A 4BDQA 1I6QA 3CSBA 1NNKA 3PUYE 1UIUA 4QFNA 1H45A 4OWDA 4R2FA 2GFEA 1BTJA 1XS5A 2XXVA 3DP6A 1JVYA 4H65A 1P1NA 4F3BA 3LBSA 1B46A 3TTKA 2LAOA 5DVJA 4H5FA 4ND9A 1TFDA 2O68A 5I2NB 4ZDMA 2HFBA 1IEJA 4OQOA 4BDLA 3CFXA 3Q26A 2NXOA 2I3WA 3FVKA 1MDP1 3OSQA 3CRBA 4ECFA 4ZE9A 2QMXA 1SVXB 1M5CA 2DSFA 1B3FA 4PETA 1Y4TA 2Q8JA 1LAHE 3K2DA 4KHZE 5AE4A 2XX7A 1BKAA 3KGCA 3W15C 5K2XA 3FASA 4OYVA 3KN3A 3QXMA 2H9BA 3DELB 3U94A 4JWOA 3HO7A 3HPIA 3FVNA 1BLFA 5CRYA 4JSOA 4GL8A 3K6VA 3T9XB 3AXFA 3V5AA 4AB5A 2QSXA 4KCDA 1FTMA 1US5A 4JBZA 2F7CA 2X7QA 2B3BA 2F35A 3VV5A 4NF5A 3T9VA 1IXCA 5AA4A 4Q5TA 1N04A 4R6HA 1S7YA 5I58B 1SD3A 3IO4A 4BLAA 4IO6A 5F7VA 1LBCA 4PP0A 4EQBA 1B7ZA 1NH8A 5H8SA 3USDA 2CZLA 1B3EA 2NWJA 1XT8A 4NF8B 3M3FA 1YTVA 2VD3A 3S2VA 4U1OA 4OFLA 4GL0A 1QKAA 4ELOA 4POWA 2XXXA 3TTMA 1FQAA 5L9MA 1RKMA 3MW0A 3R26A 2ZNTA 4IO4A 3HCQA 4U4XA 3LSFB 3R7XA 3G3KA 1B51A 3FATA 3B7DA 3OXNA 4GOTA 2I49A 1P1WA 5I57B 1GR2A 3TCFA 5I2NA 2THIA 4IO2A 2ONSA 3ODBA 4Q0CA 4QFPA 2XXRA 2DS9A 3G3GA 4QFLA 1WDNA 2Q2AA 2OCUA 3W9WA 2AYSA 1ANFA 4YB6A 1PC3A 2DQVA 1H76A 3K6UA 1M5EA 1DPPA 4FEDA 3QAXA 2DE3A 1Y9UA 4FJPA 3RY3A 1SI1A 3GBAA 4F19A 2XXHA 1QJMA 3TUSA 1QVSA 2XXYA 3FJMA 2ZYMA 3VLWA 4FORA 1MM6A 4WEDA 1A8FA 3HHGA 5KCJB 5AA3A 3C33A 3O6GA 3PUZE 3OEKA 4YICA 3FXRA 5CM6A 4L17A 2OBGA 4G68C 2VOZA 3D4CA 1B2HA 3TELA 4C0RA 4X1BA 5KDTA 5I58A 3PPPA 1B0HA 1P1OA 5FTHA 4TLMB 1OVTA 3IB2A 1FQEA 1RYOA 2FA7A 3SESA 4JDFA 3WAFA 3VVFA 1NL5A 4LQ5A 3DP8A 4GVOA 4DXUA 1LLSA 3PD8A 1PBPA 4NEDA 1IQ7A 3A09A 4NF8A 4JSDA 1MH3A 3K1PA 4XXUA 4GWOA 4R73A 2ZXTA 1MY4A 1OLCA 1B32A 4OENA 1MDQA 1B3HA 3G3HA 2V84A 3QIMA 1EU8A 3EQ1A 2VD2A 3ILUB 4RA1A 4ZEBA 5H8HB 4AB6A 5ELVA 2Y7WA 1NMUA 4LATA 3QK6A 3BFTA 3OMBA 2QS1A 2I0CA 3TMGA 2Q2CA 1MXVA 4GFRA 1O7TA 3IJXB 4GRKA 4DXCA 1Q35A 1OLAA 1N76A 4ZEDA 2O1LA 2X7PA 5I57A 4QRZA 4KYDA 2NUVA 5DEXB 4TLLB 3H7MA 3RPWA 4Z0IA 3PGFA 1PB7A 4FE8A 3OENA 5ITPA 3TQWA 3S9LC 3VFJA 3N6UA 1MQGA 3K1NA 3O6IA 1AIVA 2IEEA 1MXZA 3U1OA 4DLDA 1ZJLA 3EPEA 3VLVA 2XXTA 3HV1A 1LFGA 1MY2A 1MXWA 3LR1A 1N7XA 3IAZA 4E0XA 1URGA 4NWCA 4GXSB 4GXAA 4LP2B 3PD9A 3V8XB 2E1SA 1N7WA 3LC8A 3VE1B 3KOTA 4FEBA 4I8CA 2ONKE 1JETA 2P0SA 5KCJA 3E4RA 3H6TA 3SERA 3QUJA 4ELPA 4G68B 4U1ZA 1HSLA 2OLBA 4MLVA 3C34A 4WKMA 2F8DA 1IIWA 5FTIA 4JWXA 3MAMA 2F5XA 2UYFA 1EZ9A 1B5IA 3LSLA 3ZKKA 3N26A 1XC1A 4YKIA 3KFMA 3ZKLA 1N3XA 2CMOA 2XXQA 2H98A 3A3UA 4IGRA 4KFQA 1NNTA 1IXHA 3IO6A 3T96B 3CR9A 4DE8A 1BP5A 1M5FA 1B0LA 5IAIA 1QW0A 1YAEA 3IOWA 3OEMA 2Y84A 2XX9A 3FJGA 1JEVA 4ZE8A 4YAHX 4X1DA 2UVGA 1MS7A 5H8HA 2YJPA 5A5XB 4ZEIA 3I5OA 4DDDA 1TXFA 4QFOA 3LUYA 1IXIA 2ZYNA 5L9OA 4G8MA 2Z22A 4EF2A 4KYSA 1LBBA 4F31B 4RNSA 1S50A 2H4IA 1L5TA 3PUWE 4HCWA 3PV0E 2F7AA 5DEXA 1I6AA 1P1QA 4LVQA 4F1YA 3Q27A 2RC8A 2V3QA 4C1UA 4RPNA 3TODA 3H3GA 2PT1A 5I84A 3O97A 1B4ZA 3RTWB 4XKQA 2ABHA 1MY0A 3IB0A 4QHQA 4DIGA 4OTEA 3F11A 5JEIA 3KEIA 2QPQA 3K6XA 2DVZA 3CFLA 4G8HA 2V93A 4X9TA 5CMBA 1N0TA 4QSDA 4XIGQ 4JWYA 3RN8A 2XD2A 2D21A 3N6TA 3RUMA 3K6WA 1Y3PA 3OO8A 4OHNA 3DP4A 3GZGA 1ZMGA 4G68A 1JQFA 1XVXA 1IXGA 5TPAB 1PEBA 1MG1A 3CIJA 3MBPA 4BDNA 4MBPA 3CVGA 1JEUA 2ESNA 2XHDA 4EDPA 4F3GA 1SQYA 4YB5A 4R9GA 2O7IA 3OD7A 1ZU0A 4PE5B 1FCKA 4KR5A 4NMYA 1JVXA 1POTA 1AMFA 3TFLA 5I59B 2DE4A 1MXXA 4IGTA 1MQIA 5KDTB 1MQHA 4OEVA 2OK2A 4U23A 5A5XA 5CMCA 5HBCA 3BFUA 5K2YA 1OQHA 5ITOA 4NE4A 3TCGA 3C9HA 5CMKA 3UN6A 2HAUA 2FNCA 2A5SA 2REGA 3Q25A 3SEYA 3FXUA 1ZBMA 3SEXA 2HEUA 3TCHA 1R6ZA 3MVWA 4H0WA 5BUUA 4NF4B 1LAFE 3O29A 2R9JA 2ZYKA 3MVXA 5H8QB 1LCTA 4OEUA 3T9HB 4PFWA 2V3TA 5IKBA 5AA1A 2FYIA 5I56B 4HW8A 3E3KA 1MPBA 3CFZA 4BDOA 1MPDA 3FD3A 1VFEA 3KSJA 4H5GA 1D4NA 1DOTA 3S4UA 2I58A 3FIRA 1KWHA 3V89B 1Y20A 4YMAA 4U22A 5KZTA 4PFTA 2OJTA 5TU0A 1OQGA 1MY3A 3U8QA 5DVFA 3MZ9A 1B6HA 3SETA 3VVEA 4Q30B 1FQBA 1DSNA 2E0SA 2XXWA 3GBBA 3SEVA 3UA8A 1D9YA 3I6VA 1LAGE 3OELA 4PFUA 4GQOA 4HTGA 4TQUQ 3C35A 4WEPA 2Q9TA 2P2AA 4POXA 4IY5A 2M8CA 3FVOA 3KG2A 4QSCA 1YCJA 3S9MC 5HM4B 4GD5A 3S9EA 3TTNA 1NH7A 4FIMA 1MY1A 5TPAA 4HS7A 1J1NA 5B70A 3E13X 3PMWA 4GLIA 3FZVA 3IOUA 3BKIB 1CE2A 3HHFA 1FTLA 1QKBA 3O2AA 3PUXE 4OESA 3D4GA 1JW5A 3EHSA 2I4BA 4YU0A 5AA2D 4FECA 3TPAA 5JTYB 4DCYA 5I59A 4KQPA 2XXPA 1DPEA 1R9QA 3TTRA 3IX1A 3BBRA 3IL1B 1RYXA 1OIBA 4RYAA 3VVDA 5CMMA 3PPOA 2F6PA 3O9PA 4R75A 2AL5A 4MLQA 3N94A 4NF4A 4O3BA 5H8QA 2RC7A 2KLFA 4M1VA 4XKNA 2REJA 3R6UA 3SEUA 2QJEA 3DM0A 4ESWA 4YZZA 4AQ4A 5I56A 3RNNA 3KJTA 4U2RA 3FV2A 3E9XA 3C36A 1URSA 1FTJA 2Z8EA 4RK9A 2Q89A 4RXLA 3OO9A 2OWTA 3PPQA 1UQWA 4LZ7A 2ONRA 4R6KA 4IB2A 3H6UA 3O28A 2WKYA 2A5TB 4NF6B 4MH5A 3CG1A 4X48A 1Y3QA 3UK4A 5DVIA 3JV9A 1LFHA 1B5HA 1QUJA 3QYTA 3K1MA 3MPKA 1PB9A 1CB6A 2AL4A 1MXUA 4RJZA 1O63A 1R9LA 3TZAA 1ZKBA 5M2VA 2NOOA 3ZS6A 1NNFA 1UTBB 1DTZA 2ZNSA 5DTBA 1GVCA 3H4ZA 2F78A 2UVHA 2I0BA 3FUZA 1LSTA 3SKPA 3GXAA 4WXJA 4G77A 1XHYA 3TAJA 2I48A 3T22A 4LONB 1YPNA 1NNPA 3Q29A 1UIVA 3KOSA 5JTYA 3H6WA 4EF1A 3PPNA 5CBRA 1S9TA 4N13A 4OETA 4R6YA 1UTHB 5HPQA 1B7HA 3MZ1A 3MQ9A 4OFJA 3M8UA 1EH3A 1GGGA 1IZ1A 5LOMA 2RCBA 4EQ9A 1BIYA 4I1DA 3IR1A 2RKMA 3SDFA 1OVBA 3EHTA 2UXAA 5L8DA 1WVJA 4PQJA 3B6QA 5FHMA 3KJ7A 4M4GA 1SYIA 5EYFA 1AOVA 2HZLA 4F3SA 4ESXA 1SW1A 2HZKA 3SEWA 4P0IA 3LSXA 4YKJA 4OXVA 4FAJA 3PPRA 3UGWA 1VFDA 2GH9A 1POY1 3KBRA 3RLFE 3IB1A 4OMBA 1HSJA 2Z8DA 1D3KA 3EHUA 2QS3A 1URDA 3CSGA 1N84A 3ZSFA 1VSOA 2GHAA 2A5TA 2UVJA 3K4UA 4NF6A 1FQDA 4QSEA 1XVYA 3T9UA 1F9BA 1Z7NE 1IITA 1IUDA 2Y7RA 4F39A 1ZLQA 4I9DA 1SYHA 3IORA 5FHOA 4RY1A 5H8FB 4XKPA 4F3PA 4ONYA 2PT2A 1MRPA 3TKDA 2QMWA 2YLNA 3IJOB 1UTBA 4MFIA 1B05A 2Y7KA 4ISUA 4N07A 2RF1A 3PMVA 4THIA 1FTKA 3M3LA 3OOAA 4LUBA 3L6GA 4LA9A 1Y1ZA 1Y4CA 3K01A 1XOCA 3FJ7A 4G4PA 1Y3NA 1MH4A 5ISUA 5AA2B 3V83A 4H8IA 4ZS9A 4LZ8A 2X26A 2O1MA 4DZ1A 3MVYA 4IO7A 1UTHA 4EXKA 4Z7EA 5CC2A 1A99A 4R9FA 3S9NC 4QFKA 4BDRA 5CI5A 3I3VA 4GIZA 1AL3A 1SW5A 1H43A 2R71A 1H44A 3K0VA 3U93A 4ELRA 2V25A 2UYEA 2YPNA 4YMBA 2QS2A 4MF3A 3RTFB 5H8NB 4G8NA 2DWAA 4RPOA 2G29A 1QUKA 2F34A 1SI0A 3MUQA 3RGYA 2RC9A 2DWJA 1D9VA 2F97A 1T0KA 2PVUA 3T93B 2O69A 3KZGA 1B4HA 4NWDA 4EQ7A 2P1SA 1B1HA 3G3JA 1JW1A 4H8JA 4DXBA 2QL3A 3LSWA 4YKKA 2H25A 3P7IA 2QRYA 2H5YA 2XXUA 3MWBA 3C31A 4N6PA 3G7WA 3CI8A 4ZEKA 2UVIA 3L6HA 1B52A 3MP1A 2PX1A 3HSTA 3UIFA 2DWHA 1SW2A 3VXCA 5L9SA 4KCCA 2DWIA 3MPLA 5EHMA 2I6EA 3KN7A 1QUIA 3T66A 4FATA 3TTLA 2DYXA 4F22A 1B1XA 5H8FA 3FGSA 3O6HA 4F1UA 2DP8A 4JXIA 1Y1MA 4YKPA 1VR5A 1M5BA 1I69A 3M3KA 4R74A 2HQ0A 2F7BA 3OO7A 2HCAA 1TFAA 2Z8FA 5DYHA 1I6BA 3KSXA 1II5A 2DXYA 1PB8A 3C32A 1USYE 2Y7PA 2O7UA 4H6DA 4ZECA 1A40A 2B3FA 3MVZA 3K02A 4XKRA 3WAEA 5AA2A 1EZOA 3RT8A 2BJJX 1B9JA 1DMBA 5B7DA 1NFTA 3N5LA 4KPTA 4IO3A 1HSEA 2XD3A 3MZBA 2D3IA 4HCYA 2VGQA 4BDMA 2VP1A 2I4CA 2O84X 2HAVA 3MJNA 1B3GA 2ZMBA 1LCFA 4E0WA 2GHBA 2Z23A 4UACA 2G93A 4ZEFA 1MM7A 3FV1A 1A55A 3ECRA 1P1UA 3PMXA 3QSLA 1FTOA 4G2ZA 2DE2A 4KYEA 5H8NA 4Q8RA 4XTCQ 4EXLA 1FQCA 5BWJA 4UA8A 4R72A 3G3IA 4ZZEA 3TYHA 3VDFA 5EHSA 3IOTA 1DTGA 4F1VA 1TWYA 1Q1KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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