2QS3A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer in complex with ubp316 at 1.76 angstroms resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
publication title ACET is a highly potent and specific kainate receptor antagonist: characterisation and effects on hippocampal mossy fibre function.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs3A02
1JQFA 3RNNA 3DELB 1RYOA 2NUVA 3OD7A 1A8FA 3SEUA 3GBBA 2XD3A 3MZ9A 1LBBA 1MM7A 2V3TA 1H3DA 4U4XA 1FTJA 1MY0A 4KR5A 4RXLA 4R6YA 3FVKA 3A3UA 3IL1B 4C1UA 3SKPA 2F34A 2DWIA 4FEBA 2O1LA 4FATA 4DIGA 4NF8B 3N6UA 4ELRA 1QUJA 3G7WA 4P11A 1A99A 2X7PA 1QJMA 3TQWA 3CRBA 3KSJA 1H44A 4H67A 1MH3A 4DCYA 4FECA 5DEXB 1J1NA 1US4A 2R6GE 3QYTA 3VXBA 1LAGE 1JETA 1POTA 4F3PA 2PT2A 4IO3A 5A5XA 2I4BA 3V5AA 1Y3PA 4IO7A 2Q88A 1SBPA 4I1DA 3PPOA 4K3FA 3E4RA 2F8DA 1OVTA 1NH7A 3K2DA 2P0SA 2E1SA 4XKPA 3H03A 2ZYNA 3PUXE 4PFWA 4N6PA 5CMMA 3H6UA 1ZIUA 1TXFA 3UGWA 1MY4A 2H5YA 5AE4A 3VLVA 2F35A 1XS5A 2O1MA 3MP1A 3PUYE 3QUFA 4WKMA 3MJNA 2QRYA 4GRKA 4LQ2A 2R71A 2Z8EA 3T66A 3ONMA 3K02A 1D9YA 4IB2A 1I69A 1GTKA 4JWOA 3MVZA 4YKKA 4HCWA 4I8CA 2Y7RA 2DWJA 1N3XA 3C36A 4GIZA 2Y7PA 3GLBA 5ICQA 3U93A 1MS7A 5M2VA 1LGBC 3PD8A 5L9OA 2ZNSA 3N26A 5BWJA 3RY3A 1Y20A 4F19A 1N0TA 3TTKA 3DLNA 1SI0A 1PB7A 3N5LA 2VD2A 2Y7IA 3PUVE 2O69A 2AL4A 3MWBA 1XHYA 3MBPA 3E9XA 4N13A 2IA4A 5ITOA 4EXLA 4EF1A 1NNTA 2WKYA 4ND9A 1B5IA 3TODA 3TTLA 2QMWA 2AL5A 1B3GA 4G68A 4Q8RA 1GV8A 2RCAA 2I48A 4TLMB 1T0KA 1B4ZA 1JW4A 3DP6A 1NMUA 4OTEA 1JW1A 4Z7EA 3FV2A 3D4GA 3K6VA 4XIGQ 1MXXA 3WAFA 1M5EA 3O28A 3SEYA 1OMPA 2GHBA 3Q29A 1B0LA 3IB1A 4Q5TA 2DWAA 2DS9A 1JEVA 3PMXA 2D5WA 4YMAA 2XXPA 2ZNUA 4TLLB 3FASA 3CFLA 4OQOA 2PVUA 1ZJLA 5FTHA 5AA2B 1QKBA 4LZ8A 2Z8FA 3IX1A 2HZKA 5FTIA 3PPRA 3QIMA 4FJPA 3SEVA 1ANFA 3H6VA 1FQFA 3TCGA 4KD5A 4AB6A 4QSEA 1MXYA 1MY2A 2O84X 4F3SA 1VFEA 1DPEA 1Y4TA 5L8DA 1PBPA 4KCDA 3K00A 4FIMA 3MP6A 1N04A 4UACA 4F31B 2DXYA 2RINA 4AQ4A 3UN6A 1B2HA 1KWHA 2VHAA 4OMBA 4O3AA 1MY3A 4PETA 1Z7NE 5TPAB 1EH3A 1DPPA 1YTVA 3I5OA 3RLFE 1B7HA 4AB5A 2GFEA 4X1DA 2OWTA 1Q35A 5JK4A 3T93B 1PC3A 5ITPA 1SW1A 3C33A 3LC8A 1DTGA 2Y7WA 3QUJA 2DWHA 5JTYB 5KZTA 1BP5A 1A54A 3H06B 4R74A 5H8FB 1PEBA 2O7UA 5DVIA 2H98A 4GWOA 4F1VA 1ZLQA 2GRVA 5DVFA 2OLBA 4H1XA 3Q25A 3UP9A 1LAXA 4OEUA 3TQLA 1MH4A 1ATGA 4KFQA 2P2AA 1FTLA 3U94A 1B32A 2ONSA 3OEMA 4NF4A 4ZZEA 3O66A 3KGCA 4BDLA 3MZ1A 3H7MA 5ELVA 4HTGA 4RPNA 4U4SA 5ICTA 1N76A 2D21A 3TYHA 4DXUA 2F6PA 1B4HA 2VOZA 3EPEA 2XD2A 4GFRA 3P7IA 3EF7A 3FJMA 1TFDA 5L9SA 4NF6A 4ESWA 4GL8A 4M4GA 1LBCA 4NF5A 2XXIA 1QKAA 1VR5A 3OSQA 3TFLA 3Q26A 3I6VA 4R73A 3O6IA 1MQGA 2IEEA 1VE4A 2O68A 5IAIA 2H99A 1DOTA 4Q30B 3UORA 4I62A 1B9JA 4H65A 1UQWA 3MVXA 5JEIA 4BDQA 1UTHB 2M8CA 2F7AA 3ODBA 3OO9A 3T9HB 1EZOA 2I0BA 1IXIA 1B0HA 2HAVA 2H25A 4ELQA 4R9GA 3RN8A 4MF3A 4X9TA 3KSXA 5I57A 3CSGA 2B65A 3RUMA 1PB8A 2AYSA 1B58A 4OFLA 2GHAA 4MFIA 3N6TA 3IO4A 1DSNA 4QFNA 3FV1A 4EQ9A 3SESA 5CBRA 3O6HA 1Y1ZA 1NL5A 4U21A 1ZTYA 1ZBMA 1I6AA 3D4CA 4ZE9A 3FVGA 3TMGA 3TCHA 3T22A 2HCAA 4YB6A 1SW2A 2DE3A 4F3BA 3FXQA 5DYHA 4DXBA 4OENA 4YKJA 4BDRA 4R9FA 2XXRA 3KZGA 5H8QB 3TAJA 3SEWA 1XOCA 2UXAA 3KN8A 3K01A 1B3EA 2UVGA 1PBQA 4YZZA 1GVCA 4GXSB 5FHMA 1MPCA 5L9MA 5A5XB 3U1OA 5HBCA 1UIUA 4F39A 3RPWA 1YCJA 3N94A 4RK2A 4YKPA 3AXFA 4X48A 3IO6A 3FJ7A 1BTJA 3T9XB 1CB6A 1D4NA 3JZJA 4QFPA 4MH5A 1SDXA 3OOAA 4TQUQ 3EHUA 2YJPA 1P1QA 4YMBA 4BDMA 2O51A 3TELA 2DOJA 1OQGA 4QRZA 3HHFA 2HXWA 3DP4A 3MC2A 3C34A 1OLCA 5H8NB 1JW5A 3IJXB 3ZS6A 1LCFA 2OJTA 4NEDA 4DXCA 1MQJA 5I2NA 4KYSA 3CIJA 3FGSA 4KQPA 3CSBA 3R6UA 3IB0A 3E13X 1ZU0A 5EHMA 2FNCA 1R1NA 4KCCA 4OEVA 4WXJA 4ZZAA 1I6QA 4NF8A 4PFYA 3CVGA 2B3FA 1A55A 4I9DA 5AA4A 2RF1A 3PV0E 2ABHA 1UIVA 2A5TB 3WAEA 3EQ1A 3HV1A 3ZKLA 1A8EA 5I56A 4F18A 4QSCA 1URDA 5KDTB 4BDNA 1OVBA 1TWYA 1S50A 1SVXB 2O7IA 4DDDA 4YKIA 4G68B 3QXMA 2HEUA 1B6HA 5I2KB 2I4CA 1QUKA 4JDFA 1IZ1A 3IJOB 1H43A 4RPOA 4R2BA 1AOVA 1P99A 3A3CA 1O7TA 2ZYMA 1N7WA 2ALUA 1B3LA 3T9UA 3G3HA 3OO8A 2XX9A 1LB9A 3MP8A 1CE2A 2F5XA 4QHQA 1XT8A 4IY5A 1Y3NA 5EYFA 3L6HA 2XXUA 4LVQA 4DCXA 5FHNA 3HN0A 2NXOA 4WEPA 2Y7KA 4C0RA 3M3LA 5K2XA 4LONB 1MQDA 1B7ZA 3M3KA 2OBGA 5HM4B 1IXGA 3W9VA 5CI5A 4E0XA 4OESA 2I3VA 2X26A 1SW5A 2V93A 3CFZA 3DP8A 4HS7A 2RKMA 3C35A 1M5BA 3R26A 1ZMGA 3JYRA 4BLAA 3C32A 2DSFA 3LSFB 1RKMA 1SW4A 1EZPA 1M5DA 1EU8A 1AL3A 4ZECA 2XXHA 4O3CA 2ESNA 1N3WA 2F78A 2AIXA 3BFTA 3O6GA 2DP8A 1R6ZA 4LQ5A 1MXUA 3VDFA 3RT6B 3V89B 1FQBA 2Z23A 2Z22A 4LP2B 3SEXA 5H8SA 2NOOA 4F22A 3VE1B 1JNFA 3FZVA 2QS4A 4R2FA 2XXTA 2BJJX 3LR1A 4U1ZA 2F97A 4Q0CA 5AA3A 3O29A 1NNPA 3PUZE 1SQYA 1P1OA 4M1VA 4G8NA 1MY1A 4THIA 3KBRA 2UYFA 1Z7ME 1B51A 3Q28A 2I6EA 3CR9A 4U23A 1NNFA 1FQDA 3KN7A 3OO7A 4FORA 5I84A 5H8HB 2UVIA 5TU0A 2I3WA 3FXRA 1B3HA 4ELOA 1MQHA 3S9MC 2QL3A 3L6GA 1RYXA 2D3IA 4XXUA 1URGA 4IO5A 4H8JA 1US5A 2B3BA 3OO6A 1A40A 2RC9A 5CM6A 1B7UA 1TT1A 4QFLA 1JVYA 2OK2A 1HSJA 2DQVA 3TCFA 3KEIA 4GL0A 3OXNA 3MPKA 3PPQA 2PX1A 4NF6B 5HPQA 3K6XA 4R72A 5B70A 1IEJA 4KYDA 4NF5B 5CBSA 1LAFE 4DLDA 3OENA 1MXWA 1NNKA 4XKQA 3CFXA 2DYXA 2Q9TA 4PP0A 2XHDA 3IOVA 1DMBA 2QMXA 1YAEA 3TZAA 4FE8A 4ECFA 4RA1A 4L17A 5KCJB 2Q2CA 4R6KA 4F2QA 2XXXA 3CI8A 4JBZA 4RJZA 4IGTA 3TEPA 4ZEDA 4HW8A 4GXAA 1NH8A 2RC8A 3VVFA 1LSTA 3U92A 1B1XA 3FVNA 4F29A 1LLSA 4NWCA 3OMBA 4OHNA 3VVEA 1L5TA 2NWJA 5BUUA 2W7YA 4X1BA 3QSLA 1USYE 4U1OA 3O2AA 2PT1A 1WVJA 1O64A 4DE8A 5TP9A 3LSXA 3FD3A 4ISUA 3VVDA 4OXVA 4IGRA 1GR2A 1MXVA 4NTLA 1N7XA 2CMOA 3PUWE 3LUYA 2DVCA 4H5GA 2XXYA 3MVYA 2XX7A 2HFBA 3K4UA 2XX8A 5CC2A 3RT8A 1TFAA 1M5CA 2GH9A 4XKRA 4OERA 3B6WA 1QW0A 2UVJA 3CG1A 3QAXA 4PQJA 4RY1A 3O9PA 1F9BA 4ZEKA 4QSDA 1UTBA 1B46A 5I58A 4F3GA 3V8XB 1H76A 1LFIA 4IO2A 4OETA 3UK4A 1UTHA 4GQOA 5F7VA 5K2YA 3CG3A 4ZS9A 4U22A 4EUOA 4R6HA 2G93A 4NWDA 1MPDA 5CMCA 4QF9A 3MPLA 4EDPA 3FUZA 3ILTB 5ISUA 2FA7A 3G3GA 3UA8A 4GOTA 5DTBA 4BDOA 2F7BA 4PFTA 5CMBA 2ONRA 1B3FA 2H9BA 5I2NB 3KFMA 1PDAA 4OVJA 2XXQA 1MRPA 1S9TA 3K6WA 5I59A 3MAMA 2KLFA 4GD5A 3KN3A 3EHSA 1D9VA 1OQHA 1USYH 1IUDA 1VFDA 2CZLA 4PFUA 5CRYA 4DZ1A 1MDP1 5FHOA 2QPQA 3MUQA 3K0VA 3S9LC 1IXHA 5AA4B 2HZLA 3BFUA 1M5FA 3VLWA 4UA8A 1FTOA 3HPIA 2QSXA 4LATA 5H8QA 1II5A 3VXCA 4R75A 4JSOA 3FIRA 1A7LA 5I56B 1YPNA 3PD9A 1IQ7A 3LSLA 3ECRA 2HQ0A 4ZEIA 3M3FA 4ESXA 2QS3A 3TKDA 1SD3A 2V3QA 1FTMA 4EF2A 3VV5A 2PBWA 2PMSA 2DVZA 4LZ7A 4GVOA 3K1PA 2ZMBA 4JWXA 4ZDMA 2REGA 4QFKA 4KHZE 4OWDA 1LFHA 1Y9UA 4IO6A 3RTWB 4F1UA 4KYEA 3HHGA 5DVJA 4QFOA 1ELJA 4H8IA 1LAHE 5DEXA 2R9JA 1WDNA 3V83A 2X7QA 4C1TA 2I49A 2XXWA 4G4PA 4LZ5A 5H8NA 1LB8A 1NKXA 1Y3QA 3OELA 2DE4A 1B05A 2Q2AA 4XKNA 5J1DA 4H5FA 4POXA 3TDJA 4RYAA 2ANJA 2Y84A 3DM0A 2ZNTA 3E3KA 4YICA 1FCKA 3GBAA 5AA1A 3JV9A 3IR1A 2OCUA 1URSA 2YPNA 3S9EA 1B1HA 4Z0IA 1HSLA 4YB7A 4G68C 4OZ9A 1DTZA 2A5TA 5LOMA 3U72A 5EHSA 4O3BA 3IB2A 2O6AA 1OIBA 3W9WA 4OYVA 3FVOA 4G8HA 5KDTA 1B52A 4YU0A 1IXCA 3UIFA 3TTMA 4EQ7A 4G2ZA 2F6GA 4WEDA 1JVXA 2OZZA 3BBRA 4XTCQ 3K1NA 3THIA 2HAUA 5I2KA 2Q8JA 3C31A 3W15C 3GXAA 4F2OA 4ELPA 4PE5B 3HO7A 4EQBA 4ZE8A 3FXUA 3G3JA 1IIWA 3K6UA 3LBSA 4MLVA 3IORA 3USDA 3B6QA 1MDQA 4MLQA 4HCYA 3MQ9A 4MBPA 3MVWA 4JXIA 3A09A 1FQCA 3MW0A 4RNSA 4GF8A 1MM6A 1P1UA 1SI1A 3HCQA 3GZGA 1FQAA 4YAHX 4KPTA 3I3VA 4IY6A 3IOTA 2ZYOA 2ZYKA 3TUSA 2F36A 3HSTA 2ZXTA 1NFTA 3IK6B 2DXRA 3H3GA 4N07A 1IITA 3R7XA 1SYHA 1B5JA 4JWYA 3QK6A 3SDFA 2PYYA 3PMWA 3C4MA 1JEUA 3G3IA 1R9QA 2QS2A 2I0CA 4LA9A 2G29A 3ZSFA 4OFJA 1S7YA 1LFGA 1N84A 4NF4B 3F11A 4LUBA 3KOTA 5AA2A 1R9LA 3KJ7A 2VP1A 4F1YA 3PMVA 2ONKE 1AIVA 3B7DA 2VGQA 3RTFB 3FJGA 4JSDA 2FYIA 3OSRA 3KOSA 3M8UA 3TTNA 3EN3A 1XVYA 3FATA 4ZEFA 3H4ZA 2YLNA 4TOZA 2RCBA 1ZKBA 1MXZA 5B7DA 1H45A 5IKBA 4OFOA 3VLUA 2V3UA 3MZBA 1LCTA 3ZKKA 4KI0E 4FEDA 5TPAA 5H8HA 1I6BA 1WODA 4EXKA 4NE4A 1EZ9A 3K1MA 3B6TA 1QVSA 4RK9A 1Y1MA 3TTRA 3U8QA 5DT6A 2F7CA 3C9HA 5TP9B 2DE2A 5JTYA 1AH5A 2QJEA 1D3KA 2VD3A 3SERA 5I57B 1XC1A 5H8FA 1Y4CA 3RGYA 5AA2D 2V84A 4H0WA 3IOUA 1B40A 3H6WA 1SYIA 2E0SA 2Z8DA 4P0GA 3G3KA 1O63A 4U2RA 5CMKA 1MG1A 4ONYA 3VFJA 4E0WA 3T9VA 3ILUB 1OLAA 3RQTA 1PB9A 1UTBB 1BLFA 1BIYA 5I58B 3H6TA 3Q27A 2REJA 1FQEA 2UYEA 4G8MA 1XVXA 2V25A 5KCJA 1B5HA 1BKAA 2Q89A 3KJTA 1POY1 3T96B 3IOWA 4ZEBA 2OWSA 2H4IA 2QS1A 3TPAA 1GGGA 4P0IA 4NMYA 3PGFA 1P1WA 5F1QA 3LSWA 4FAJA 1MPBA 3G3FA 2I58A 2RC7A 3PPPA 2UVHA 4IO4A 4G77A 1FW0A 3PPNA 3IAZA 4H6DA 2A5SA 3PU5A 1VSOA 3SETA 3KG2A 4JB7A 1MQIA 5I59B 1AMFA 2NVUB 1FTKA 1QULA 3EHTA 3O97A 2LAOA 4GLIA 1Q1KA 3S2VA 3S9NC 3S4UA 2P1SA 4YB5A 2XXVA 1QUIA 2THIA 4POWA 1P1NA 1HSEA 3OEKA 3BKIB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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