2QS3A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer in complex with ubp316 at 1.76 angstroms resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title ACET is a highly potent and specific kainate receptor antagonist: characterisation and effects on hippocampal mossy fibre function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 80
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs3A02
1B58A 2OZZA 5ICQA 4N13A 3LSXA 1URSA 2CMOA 4QFLA 2XX9A 5HM4B 2HQ0A 1A8FA 1FQBA 3OO7A 1H45A 3ILTB 3IL1B 2V84A 3RPWA 4KYEA 2F6GA 3HSTA 2XXHA 3T96B 1LCFA 1GVCA 3LBSA 1DMBA 1SW5A 1JQFA 5H8FA 2DWIA 4NMYA 5AA1A 5FHOA 1P1QA 4L17A 1ZJLA 3FD3A 1B3EA 3QYTA 3E13X 3N6UA 4HCWA 1MXXA 3SEXA 5LOMA 3U1OA 3H4ZA 1IXHA 4O3CA 1LCTA 5KDTA 3D4CA 4RYAA 1EZPA 4M1VA 4EXKA 3TQWA 1B46A 1R9LA 1A8EA 1QUKA 5DTBA 2VOZA 3DELB 4GL0A 4F2QA 2Q9TA 2O6AA 2IEEA 3CG3A 4XXUA 3U72A 3RUMA 2I3WA 4BDRA 3BFUA 4Q5TA 2F8DA 3OO9A 3QSLA 4F1YA 3KJ7A 3IOUA 2FNCA 3UGWA 4R2BA 3CSBA 3ZS6A 2ZMBA 4YKJA 3OEMA 1B1XA 5I56B 3G3GA 1BTJA 2XD2A 4ONYA 3MZ1A 3MBPA 4H6DA 1RYXA 2XXPA 4ZS9A 3HO7A 4POWA 1D4NA 3O29A 1OMPA 2VD2A 1FQAA 4RY1A 4GF8A 1D3KA 3G7WA 2QJEA 4U1OA 2R71A 4NF4A 2ALUA 4FECA 3TUSA 5HBCA 3OOAA 4ZZAA 2CZLA 4MLQA 2UVIA 1LLSA 2REJA 4DIGA 1NKXA 4PETA 3WAEA 1B3LA 2OWTA 5CMCA 4P11A 5I56A 1LFHA 1SQYA 4HW8A 3KSJA 5AE4A 2QRYA 1GV8A 4GRKA 1IEJA 1UIVA 1JW4A 4ND9A 3CVGA 3SEVA 1IIWA 3FVKA 2P2AA 1GTKA 3GZGA 2XX8A 3KN7A 5H8HB 1TWYA 3SEUA 2O1LA 1FTOA 2DYXA 1P1OA 3I3VA 4HTGA 4MH5A 1QKBA 1B6HA 1II5A 1XC1A 4F1VA 1B2HA 1L5TA 2I6EA 2F6PA 1B5JA 1R6ZA 2HXWA 3ONMA 4X1BA 3K01A 3C34A 3K2DA 3Q29A 5EHMA 4H5GA 4IGTA 4LA9A 1SI0A 1Q1KA 3FATA 2BJJX 3EHTA 3VXBA 2Q89A 2GHBA 3MP6A 2RC8A 4R6KA 1NL5A 1LSTA 5BUUA 2XXVA 3ZKLA 3KN8A 4IO6A 4H0WA 1ATGA 1A99A 1JVXA 1ZMGA 3OO6A 3OSQA 3K6UA 5I57B 1B40A 5L9SA 2RC7A 3VLUA 1NMUA 1QUIA 3CRBA 4O3BA 2THIA 3T93B 3ILUB 5IKBA 3ZSFA 4G77A 1B7HA 3BKIB 3PMXA 2F7BA 2D5WA 4MFIA 1MY3A 3MVXA 1CE2A 4OERA 3MVZA 3FXRA 4X9TA 4IGRA 3O6HA 4ZZEA 4WEDA 2HEUA 2Y7KA 2Z22A 3LC8A 2QL3A 2Q2AA 3K1NA 3IB0A 3MPLA 3VFJA 2PYYA 4JBZA 3PPNA 2Q2CA 1A54A 5I59B 4R6HA 3CIJA 1B5IA 1ELJA 3SERA 5I57A 1IXGA 1IXCA 2UVHA 2Y7PA 1A40A 3KOSA 2F7AA 1SW1A 3A3CA 3S2VA 5ICTA 4IY5A 4OFJA 1NH7A 3TELA 3OEKA 3TEPA 3CFXA 4G8HA 4PQJA 3QK6A 1DTGA 3IK6B 1H3DA 5TPAB 2HAVA 3SDFA 1VE4A 4GWOA 4JXIA 4OTEA 1S7YA 1EH3A 1N0TA 4XKNA 3KEIA 1TXFA 5FHNA 3EPEA 3FVGA 4AB5A 4LQ5A 3VVDA 3OSRA 1TT1A 1SYHA 3B7DA 1A55A 4RXLA 3K02A 4YB5A 5DVFA 4BDMA 4EQBA 2B3BA 3O6GA 4I62A 1BIYA 2I4BA 4ELQA 2V3TA 4R6YA 4ZE8A 4ZE9A 3AXFA 3TDJA 3CFZA 2F36A 3RTFB 4XKPA 4KPTA 3W15C 3OXNA 5B70A 2GFEA 1PB7A 4F1UA 4YKIA 3E9XA 1CB6A 2PT2A 3FV2A 3IB1A 5TPAA 3TTNA 1LFGA 4THIA 1Y3QA 3S9NC 1ZLQA 2QS1A 4JSOA 4IO3A 4K3FA 3C4MA 1QW0A 3THIA 1SD3A 5KCJB 2NWJA 3VVEA 3LSLA 1N84A 1WODA 4QSCA 1B9JA 4Z0IA 3PPOA 3IB2A 1B3GA 5IAIA 3HPIA 3VVFA 1XHYA 1B0HA 3KSXA 3W9WA 3KBRA 4ESWA 2DE3A 3OENA 3H6VA 1DPPA 3T66A 4QFPA 3IOWA 4G68C 3PMWA 2R9JA 1HSEA 3VXCA 2O68A 5HPQA 3G3JA 2AIXA 3TTLA 4KCDA 2RC9A 4GD5A 1MS7A 3MAMA 4QF9A 5L9MA 5CI5A 2DS9A 3H7MA 1H44A 4QSEA 4DDDA 2QSXA 3TCGA 4ELPA 3K6WA 3TPAA 5F1QA 2X7QA 4I9DA 5H8FB 2A5TB 2VD3A 3HCQA 3HV1A 4OMBA 4ZEBA 4KYDA 5CBRA 3EHSA 3VDFA 3R6UA 4IY6A 1SBPA 3PUVE 4G4PA 3U93A 3VE1B 2XXTA 3IJXB 4EQ9A 3H3GA 4C1TA 1R9QA 1T0KA 4EXLA 5KDTB 1FQEA 4JWXA 2UYEA 3SETA 2H4IA 1P1UA 3FJGA 1LAXA 3T9UA 1JEVA 3I5OA 1PB8A 2A5TA 1MM6A 2V25A 4PFWA 3U92A 2F97A 2Y7RA 1N7WA 2H5YA 2ZNUA 3H6UA 4F39A 3LSWA 4H5FA 3SEYA 1FW0A 1J1NA 4XIGQ 4EQ7A 4G8MA 5CM6A 2OBGA 3BBRA 5FHMA 4R2FA 3UORA 4BLAA 3RQTA 1Y1MA 3QUFA 1TFDA 4JDFA 2I0CA 2DP8A 4WKMA 5ELVA 4ELRA 3TTRA 2OWSA 4OHNA 4OFLA 1HSLA 3QUJA 2I49A 1UTBB 4NF4B 3H06B 1YCJA 3GBBA 2ZXTA 3SESA 1I6BA 4BDNA 5H8QA 5ISUA 4UA8A 4LVQA 4FE8A 1GGGA 1Y4TA 2B3FA 3HHFA 1Y4CA 2GH9A 5M2VA 4ESXA 3MWBA 4C1UA 5F7VA 2IA4A 1NNFA 2ZYOA 3TODA 2V3QA 3HN0A 2UXAA 3C31A 1FCKA 1M5EA 1VSOA 4YMAA 2ZNTA 4I1DA 1UTBA 4F3BA 4LZ7A 3Q26A 3U8QA 2ESNA 4GXSB 3C36A 3UA8A 3PUWE 1POY1 4G8NA 5DT6A 1B3FA 5I2KB 3K0VA 2QPQA 4DXBA 4NF5A 4RPOA 2PVUA 3VLWA 2DQVA 4LP2B 3PUYE 5ITPA 3MUQA 5CMKA 3PD8A 3Q25A 1NFTA 1URGA 4PFUA 1FQCA 2E1SA 3UIFA 1ANFA 4OFOA 2O1MA 4KD5A 3UP9A 4EUOA 1XVXA 3G3FA 3MJNA 3TYHA 2QS4A 4P0GA 3FJMA 4G2ZA 1BKAA 4QFOA 2DXRA 4KI0E 3EHUA 1FTLA 5I2KA 1GR2A 3K1MA 3FJ7A 1FTKA 1EZOA 3MP8A 5I2NA 2QS3A 4Q8RA 1B7UA 2AYSA 3RTWB 2DSFA 1ZU0A 3C9HA 5H8SA 1I6AA 5I84A 2HFBA 1VFEA 3PPQA 4EF1A 3S9EA 4H65A 3TAJA 3RN8A 4Q0CA 2I48A 1LAFE 3GLBA 3N6TA 4KR5A 3O2AA 1OQGA 2YPNA 3CG1A 5B7DA 3V5AA 3B6TA 3FVNA 2OJTA 4WXJA 2Y7WA 1M5FA 1US4A 3C32A 3V8XB 2XHDA 3VLVA 4Z7EA 1MXUA 1AMFA 3SEWA 4TQUQ 2PT1A 1JW1A 1P99A 2UVJA 4G68A 4BDQA 4PE5B 3DP6A 1HSJA 3UK4A 4NF6A 3CSGA 4GFRA 4YMBA 4KQPA 2V3UA 3IORA 1S50A 1QJMA 1MPBA 4F18A 2YJPA 3MC2A 5L8DA 4JWYA 1MY0A 3TTKA 1N76A 2DOJA 3CI8A 2Z8EA 3D4GA 1UTHA 2VP1A 1IUDA 1O7TA 4E0WA 2ONSA 3CFLA 4ZEKA 3RY3A 4OZ9A 1ZKBA 4MBPA 5JEIA 2REGA 4IO7A 3DP4A 3GXAA 3R26A 3T9XB 4KCCA 3KFMA 1MQIA 4DE8A 2Y84A 3M3FA 1M5BA 2XXWA 2H98A 4F29A 2OCUA 4Q30B 2F5XA 2M8CA 2RCAA 5AA4B 1MY4A 1OIBA 3W9VA 1D9VA 4LQ2A 4YB7A 2UVGA 2ZYNA 1B32A 4IO5A 3IR1A 4FIMA 3H03A 1I69A 4H67A 4DLDA 2I0BA 3F11A 4X1DA 4UACA 1ZTYA 5FTIA 3FUZA 2O69A 1B1HA 1MDP1 4OEUA 1NNPA 5KZTA 3OD7A 1QKAA 5AA4A 2NOOA 3KG2A 4YKPA 1USYH 1LBCA 4TLMB 3A09A 4F31B 3P7IA 5I58A 4U4XA 4TOZA 1DTZA 5CRYA 3L6GA 2Y7IA 3KZGA 4FEBA 4OYVA 3WAFA 4POXA 2RCBA 4KHZE 5CC2A 1WDNA 2I3VA 4U2RA 5TP9A 1NH8A 4ZEFA 3K6VA 4P0IA 4OEVA 3Q27A 4YAHX 4ZEDA 4R9FA 1US5A 2Q8JA 5K2YA 2DE2A 1WVJA 1B52A 2DXYA 4GOTA 4EF2A 2HCAA 3PV0E 3N94A 1QUJA 3M3KA 3S9LC 4OENA 4IO4A 1BLFA 4YICA 3PGFA 1JNFA 1QVSA 2KLFA 1MY2A 1ZIUA 3M3LA 1VR5A 2XXQA 1MPCA 3IOVA 1VFDA 1LBBA 4H1XA 1MM7A 2XXXA 1POTA 5DVJA 2RINA 3RNNA 2V93A 4XTCQ 4R9GA 2FYIA 1UIUA 1Z7ME 1MRPA 1Q35A 2ONKE 4FATA 1SYIA 3EN3A 1XT8A 4MF3A 3IX1A 3I6VA 4LZ5A 3O97A 2ZYMA 3TTMA 5AA3A 2NVUB 2Q88A 2A5SA 5DEXA 3DM0A 4F2OA 4U21A 5A5XA 4EDPA 4F3GA 2DWJA 2NXOA 3RGYA 3TCHA 5EYFA 1H76A 5H8QB 4GVOA 4FORA 4MLVA 4YB6A 1MXWA 1YTVA 3CR9A 1JW5A 3LR1A 1ZBMA 1EU8A 1O64A 2X7PA 1MG1A 4ECFA 1M5CA 1USYE 2WKYA 4GLIA 2DWHA 4OWDA 4NTLA 4AQ4A 2F7CA 3A3UA 4QFKA 1IITA 2RKMA 2B65A 3PU5A 2VGQA 5EHSA 3MVWA 3QAXA 4ZEIA 3B6WA 4NF5B 4FEDA 3IOTA 3EQ1A 1OLCA 4PFYA 2RF1A 2HZKA 4N6PA 3N5LA 3JZJA 3FXUA 2LAOA 3HHGA 3OELA 2O51A 3K00A 1B5HA 3KOTA 5BWJA 3SKPA 1Y3NA 1LB8A 3FZVA 2OK2A 1MXZA 4NEDA 4R75A 1LGBC 2NUVA 4NWDA 1DOTA 2PBWA 1XS5A 1Y1ZA 5AA2B 1Y9UA 4NF8B 4ELOA 2HZLA 5I2NB 4WEPA 3PUXE 3C33A 4ZDMA 4F3SA 4ZECA 2I4CA 4LATA 2H25A 1LB9A 3TCFA 3S9MC 4OXVA 3H6TA 3GBAA 4XKRA 1MQJA 4N07A 3E3KA 2R6GE 3Q28A 1AOVA 1URDA 4YU0A 1MH4A 1F9BA 3IJOB 1B05A 4QRZA 4GQOA 3O9PA 4KYSA 2AL5A 5K2XA 2GHAA 2OLBA 1FTMA 1MQGA 3L6HA 4NWCA 4YKKA 5AA2A 1A7LA 1UQWA 4NF8A 5FTHA 3IO6A 2F78A 4OVJA 3K4UA 4DXCA 3FV1A 1PC3A 2I58A 4QHQA 4BDOA 3RT6B 2G93A 4RJZA 1S9TA 4F3PA 1AH5A 2FA7A 3G3KA 1XVYA 4DXUA 1SW4A 3QIMA 4G68B 4C0RA 4TLLB 4IB2A 2D21A 3EF7A 1Z7NE 4FAJA 4LUBA 2F34A 3N26A 3MQ9A 4NF6B 2ZNSA 3TMGA 1TFAA 1PB9A 5J1DA 4JB7A 1IZ1A 1N04A 3KGCA 5AA2D 4GIZA 3KN3A 3E4RA 4HCYA 1N7XA 2PX1A 1IQ7A 1FQFA 3G3IA 1I6QA 3LUYA 3FXQA 1B7ZA 1AL3A 1Y20A 1JVYA 4AB6A 1DPEA 5H8HA 2O7IA 5H8NB 4XKQA 1UTHB 3QXMA 4JWOA 4RK9A 1H43A 3VV5A 3H6WA 5CMMA 3T22A 1NNKA 2O7UA 3TKDA 4KFQA 3MP1A 1QULA 3JV9A 4RK2A 2QMXA 1O63A 4M4GA 3MZ9A 1RKMA 2XXRA 2F35A 2W7YA 1SDXA 1SI1A 2XX7A 1MQDA 2AL4A 4OQOA 3V89B 4R72A 2XD3A 2Z8DA 3FIRA 1JETA 3DLNA 5H8NA 1SVXB 2H99A 4PP0A 4NE4A 2H9BA 1N3XA 2DE4A 4DZ1A 2ONRA 1D9YA 1B0LA 2DVZA 5DYHA 4ISUA 4X48A 3PPPA 2Z23A 1LAHE 1N3WA 3T9VA 3O6IA 4U4SA 1LFIA 3PMVA 4E0XA 1P1WA 4RNSA 3MVYA 1PDAA 4H8JA 1M5DA 4H8IA 1EZ9A 2X26A 2QS2A 4QSDA 1YAEA 4U1ZA 2HAUA 1IXIA 4OESA 3USDA 2E0SA 3ECRA 3OMBA 1LAGE 3R7XA 3TFLA 4PFTA 3DP8A 2ANJA 1NNTA 4BDLA 1B51A 2XXUA 4HS7A 4I8CA 4F22A 1OQHA 2XXIA 2QMWA 4OETA 5I58B 3B6QA 4U23A 1P1NA 3BFTA 3TQLA 3K1PA 4YZZA 4FJPA 2YLNA 3T9HB 3PUZE 1KWHA 5I59A 1MY1A 4RPNA 1SW2A 1B4ZA 3V83A 2VHAA 1MQHA 3MW0A 5TP9B 3FASA 2ZYKA 3RT8A 1RYOA 3U94A 2D3IA 1OVBA 4IO2A 4DCYA 1OLAA 3MPKA 1B3HA 1XOCA 3KJTA 1AIVA 1DSNA 4R73A 3C35A 5CBSA 2G29A 1Y3PA 2PMSA 3IAZA 3OO8A 2O84X 3UN6A 2UYFA 4JSDA 4LONB 4R74A 5CMBA 5ITOA 3PD9A 5TU0A 1R1NA 2P1SA 4GXAA 4O3AA 5JTYB 1MDQA 2XXYA 5DVIA 2DVCA 1B4HA 3FVOA 3LSFB 4GL8A 3K6XA 3ODBA 4RA1A 1YPNA 1JEUA 1MPDA 2P0SA 3JYRA 1BP5A 1MXYA 3M8UA 1PBPA 4LZ8A 5JK4A 3O66A 3S4UA 3IO4A 5KCJA 1MH3A 3ZKKA 4U22A 5DEXB 1OVTA 2DWAA 3G3HA 2GRVA 2ABHA 5A5XB 3MZBA 1FQDA 3TZAA 3FGSA 5L9OA 5JTYA 2Z8FA 1PEBA 3RLFE 1PBQA 3PPRA 4DCXA 1MXVA 1FTJA 3O28A 4QFNA 4F19A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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