2QWOA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the adp*pi form #1
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
387
structure length
387
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule tags Chaperone
source organism Bos taurus
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
total genus 120
structure length 387
sequence length 387
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwoA04
3ZEUB 1XUPO 3A5NC 2A41A 1C0GA 3H46O 4ISEA 2IVNA 3WQUA 1NGBA 3MN6A 5E84A 1KAYA 4CZGA 4XH5A 4H0XB 1RFQA 4B1XB 4IJNA 1Y64A 3M6GA 2FXUA 3VEYA 2HF4A 1MWMA 4IXCA 1HLUA 1RDWX 2E2NA 5KQ8A 1BG3A 4BC5A 1NGAA 4K41A 2YJEA 5BRDA 4MO5A 4BVOA 3GBTA 2ZWHA 2E1ZA 3H1QA 2GUPA 3VESA 4CZHA 1GLEG 2W40A 2GTDA 4B9QA 1JCEA 2P9SB 3O1WA 3WXJA 2D0PA 1QQOA 4JD2A 1HKCA 3KZBA 1P8ZA 3DXKA 3EL2A 3MCPA 3HSCA 3HTVA 4YDUC 4EAHD 4H0YB 1U6ZA 5AZJA 4JHDA 3P4IA 3CIPA 2VWBA 3S41A 4BRAA 4BRMA 1NM1A 3AAPA 1XC3A 3ZEUA 3O6WA 1GLLO 2EWSA 3H6EA 3R8EA 4BR7A 4BQLA 4K43A 5KPTA 4O5FA 2QWLA 2CH5A 5EVZA 1LCUA 4AM7A 5KPRA 4BRIA 3F9MA 3C7NB 3H3OB 4H5WA 1YVNA 3TPQA 1DKGD 3U9ZA 3QDKA 4FWQA 4DCHA 5LJVA 3B8AX 1KAXA 4PKIA 3FR0A 3VOVA 2ASPA 4ISGA 2IVOA 3C0BA 5BPLA 4M7XA 2GWKA 2ASMA 3FZLA 2YI1A 3FZHA 3GL1A 1T6DA 3UB5A 3CERA 5BRFA 1GLJO 2WUSA 1WOQA 1IJJA 2P9SA 1NGDA 2A6AA 4H5TA 2YJFA 3CJAA 3H1VX 2YHWA 3W3DA 4CZFA 2I7PA 2A5XA 2ITMA 3BP8A 1C0FA 1DEJA 4DQ8A 4K42A 1GLBG 4I6MB 1NGGA 2A3ZA 5AFUH 1NGHA 4B1YB 4BG8A 4FL9A 3I8BA 4M63C 4CZEA 1NGCA 3ENHA 2YHYA 4KBOA 3H3NO 3M1FA 3WXIA 3QBXA 3U8XA 2IIRA 1GLCG 3HBTA 4FWLA 3C7NA 3QFUA 1SZ2A 4BQZA 3SK3A 3EKSA 4BC2A 4NB4A 1BA1A 5EOYA 1E4GT 1HKGA 5AQTA 2FF6A 4BREA 1SAZA 5AQVA 5AQRA 2E8AA 2FLOA 3KVGA 3CJBA 3A5LC 5AQOA 5AQFA 5F1XA 3SMSA 2F9TA 4QS9A 2BTFA 1S3XA 2A42A 4M7YA 1MA9B 3FGUA 1TUYA 5F2RA 5AQXA 3MN9A 4BGAA 3RSEB 3VERA 3CETA 2QWRA 2D1KA 3DXMA 4JNEA 5LY3A 3VEZA 3QMLA 1SQKA 3LDPA 5AQJA 4I6MA 3WXLA 3D2EA 2V52B 3DWLA 2Q2RA 4CZKA 2V7ZA 5AQWA 4PKGA 3O5BA 3CQYA 4CD3A 2FSKA 1BU6O 5AQYA 3VF4A 3IUCA 5AQSA 4BRCA 4B1ZA 2P9KB 2HOEA 3MN5A 4FWSA 2HMPA 3J8AA 4WQ5C 4BRDA 3ATVA 4FPAA 3LDOA 3MDQA 2FSNA 3VGKA 1X3MA 1TUUA 3O8MA 5JICA 4CZMA 4BRKA 2CGLA 4B1VA 3EO3A 4FWKA 5JLHA 2UYTA 2V7YA 2AP1A 3IMXA 4B1WB 3BF1A 3RSEA 4FWNA 4J8FA 1YAGA 2VYPA 1TYQA 1CZAN 4RCHA 1HKBA 1JCGA 3MMVA 2QWPA 4B1UB 4BRFA 3CI5A 5AR0A 1H1VA 5FPEA 2P9NB 4BRNA 1XQSC 3H45C 2NLXA 3LM9A 4XH1A 1YXQA 4BG9A 3VENA 4L3QA 1X3NA 2BUPA 2D4WA 3FZMA 4BRGA 4IO8A 3MN7A 1GLFO 2P9KA 4CBXA 2QWQA 1T44A 3VEXA 1QZ5A 2QW9A 3L6QA 2D0OA 5KQDA 3MK6A 4IZ9A 1NBWA 3JXUA 4BC3A 3W0LA 1HJOA 2PBDA 2VCPA 2FSJA 3CQXA 3DAWA 1BDGA 3VF2A 3ENOA 1QHAA 3AARA 3L4IA 3ZX0A 1OKJA 3DXMB 3LDQA 3BEXA 4MO4A 4FWMA 3IDHA 3D2EB 4A2BA 5BREA 3FFKB 4BGBA 2GWJA 3IFRA 3BUZB 1MWKA 2A40A 2Q31A 3A5MC 1QQMA 3CHWA 4A61A 3FZFA 4XH4A 1KXPA 1WUAA 4DB3A 2W41A 5AQLA 4CZIA 5ADXH 1R59O 2P9NA 2CGKA 4MLHA 4E1JA 4H03B 2F9WA 5AFUA 1MDUB 2QXLA 2CGJA 1Z6RA 2YHXA 4EHUA 1ATSA 1NMDA 4FPBA 1D4XA 4WQ4C 3WQTA 2QM1A 4YDUA 4DHYA 2Q97A 3A5OC 4CZLA 5AZIB 1LOTB 4EFHA 3ZETB 4H0OA 1NGFA 4QS8A 4A62A 4C23A 1TYQB 3SMPA 2P9IA 1BA0A 3I33A 1NGIA 2QWMA 4PL8A 3CJ1A 3O08A 2NRHA 3VGLA 1BOTO 4H0VB 2ASOA 3UE5A 1T6CA 3LDNA 3FLCO 5AQUA 1S22A 3CJ7A 3FZKA 3VF6A 2Q36A 4BR0A 2DPNA 3BF3A 3AAQA 5JMVA 5KPZA 3SLCA 3LM2A 4FWOA 5AQQA 3ZX3A 3LDLA 5E26A 5JLFA 3D2FB 3FE1A 4JN4A 2J4RA 2IVPA 4FSVA 3A0IX 2E20A 5BR9A 1NGEA 1HX1A 4ISFA 5AQPA 5B8HA 2P9UB 3WXKA 1GLAG 2P9PA 1G99A 4CBUA 4CJ7A 2PAVA 5ELZA 2H3GX 1V4TA 5AQMA 3U4LA 3DJCA 4O8KA 3CJCA 3U9DA 4BRHA 1Q18A 4NO7A 3UKRB 5I9EB 5EY4A 2E88A 2FF3B 1RGIA 5AZIA 3UKUB 4BR5A 4WYBA 5AQZA 3GG4A 3JS6A 1HUXA 2YCHA 3ZETA 1HPMA 3R6MA 4HTLA 1KAZA 3O1BA 5BN8A 2P9LB 3VGMA 3D7EO 1JCFA 3TU5A 4H0PA 3VEOA 5AQNA 1U2VB 2Q0RA 4BRLA 2E2OA 4RWTA 3WEEB 2GELA 3EKUA 3QB0A 5TKYA 2NZTA 3SJHA 2E1YA 1ATRA 1X9JA 3EZWA 3OHRA 3ULEB 3HM8A 4IJAA 1ZXOA 4LC9B 4WQ4A 3VETA 1K8KB 2QWNA 4FOEA 5CE3A 3D2FA 3GDQA 5AQHA 3R9PA 4QS7A 3WT0A 1ATNA 4H5RA 5AQIA 5FPMA 2P9UA 4CI6A 1ESVA 2E2PA 4BR2A 4PL7A 4FWRA 4JAXA 2P9IB 1QQNA 5AQKA 5F0XA 3VEWA 3GOIA 2KHOA 5BN9A 4F9OA 3UKRA 3GE1A 3QBWA 5BRHA 3L0QA 4BRQA 4GNIA 3UKUA 1ZBSA 2V51B 2OANA 4BRPA 4Z94A 5LJWA 3KHYA 4BVPA 3ZX2A 4IWVA 2ZGZA 3HI0A 2P9LA 4CZJA 5AQGA 4Y0WA 2HF3A 1BO5O 3G25A 4BR4A 5BPMA 1IG8A 2ZGYA 1NLVA 4EHTA 1YUWA 1Z05A 4WQ5A 3LL3A 1U2VA 2AA4A 4BR9A 4FOIA 2ZF5O 3WEEA 1EQYA 4XEIA 3M3ZA 5BPNA 2P9PB 2Q1NA 3VPZA 4BC4A 5FPDA 4PKHA 3CJ9A 5EX5A 3ULEA 4BROA 3O80A 2CH6A 3ATUA 1DGKN 2E2QA 4A2AA 4CBWA 1K8KA 2Q0UA 2I7NA 4H0TB 1NWKA 1BUPA 1NGJA 4CD1A 2QWOA 1V4SA 4EIAA 5ADXA 4HWIA 4K25A 1E4FT 3HZ6A 3QFPA 1QZ6A 4H5NA 1BWFO 4RTFD 3WUHA 3AY9A 4H5VA 4FO0A 3VEVA 1GLDG 4JD2B 1ZC6A 3EN9A 3DXKB 4FWPA 3QICA 5AZJB 4JHDB 4AM6A 3O4WA 5FPNA 4MLEA 3A8YA 4GY2B 3ID8A 2GEMA 5EXWA 1J6ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HVHA 3ZEUB 1XUPO 4CJ3A 1C0GA 4IDKA 1IKXA 2LJMA 5E84A 1KAYA 3J7ZO 3THWA 4DR5K 4KB1A 1RFQA 2Y1IA 2P5GA 1J53A 3VEYA 1ZUTA 4OPHA 4IXCA 3T69A 1HLUA 1Q86O 3EE9A 4KHQA 4BC5A 4DV2K 4BACA 4O8UA 4CHOA 4F3TA 3NH1A 1W0HA 4O0IA 4LY7A 4CHPA 4JK9A 3GBTA 1LV5A 3AA3A 4PA1A 3MWTA 2RPIA 4NCAA 1RILA 4LSNA 1VSIA 2FBYA 4X62K 1YI2N 2ATBA 2P9SB 4B9UA 4CJ5A 2KBKA 4DTSA 4IG3A 1P8ZA 3EL2A 4DF8A 4YDUC 1U6ZA 5AZJA 4JHDA 2YKMA 3D0PA 5LMUK 4DU1A 1EP4A 2M8BB 3AVMA 1FXXA 2KLAA 4BQLA 3G6EN 1KCFA 4NXMK 5EVZA 1O13A 1LCUA 1VQ8N 3TANA 2O4IA 4AM7A 3TPQA 1I2UA 2IS3A 1KAXA 3FR0A 3VOVA 1B3CA 1HNVA 3C0BA 5BPLA 3KWIA 2GWKA 3ZSQA 3SAFA 3SI6A 1KRPA 2QXFA 4BWJA 3CMAN 1QSLA 4UJ0A 1T7EA 1Q8IA 1T03A 2ZD1A 3TABA 1N33K 3W3DA 3H1VX 1OVYA 4DWIA 2UU9K 1W97L 1TKTA 4JKDA 4G9ZA 3M8PA 4R5PA 4JS4A 4X66K 4O5BA 1JJ2M 3LWLA 4I6MB 3NBPA 4F2RA 1CHZA 5AFUH 3PSIA 3HJFA 3LP1A 3OYIA 3ZT1A 3N4PA 1ZBUA 4KTZA 2Y1JA 3LDSA 4B1YB 4KH6A 4BG8A 4YFUA 4LSLA 4DSFA 3ENHA 2YHYA 2LR3A 3U8XA 2IIRA 3TAEA 5HLFA 3K9KA 1SZ2A 3TAPA 1M90O 3DOLA 3KK3A 3SK3A 4NB4A 1BA1A 1ZBLA 2E6LA 1HKGA 2FF6A 3DRPA 2G8WA 5AQRA 2FLOA 3QINA 3KVGA 3CJBA 4QCLA 3A5LC 5AQOA 2HHVA 4YOUA 5F1XA 4N41A 4QS9A 3HM9A 2BTFA 3WNGA 4M7YA 3K2PA 1MA9B 3FGUA 3SUQA 1IV0A 4BDPA 1VQON 3IG1A 1K9MO 5AQXA 3C6UA 4DFKA 3QERA 1XHXA 2ZJPL 4Z4FA 4B8AB 3JSMA 1L3TA 3DXMA 4DTRA 2O8EA 4AHSA 4BECA 2V52B 3DWLA 3KOZA 4DG1A 2G8HA 4I2PA 2KZMA 4M3YA 1VQMN 2EX3A 3S3NA 2HB5A 2P9KB 2HOEA 4FWSA 3AO2A 3MN5A 2HMPA 4JKFA 1KLNA 3LP0A 1JLFA 3ZT2A 1SN1A 4AHVA 3ATVA 4FPAA 3CQ8A 3LDOA 3V9SA 4KV8A 3MDQA 2G8VA 4KHYA 1EX4A 4C8KA 3VQ5A 3EO3A 3C65A 1C0MA 2AP1A 1C1AA 2OPQA 4B1WB 2YIOA 2D0BA 4CJUA 2F7TA 3AVIA 4CJRA 1SL1A 1JXCA 1EWRA 4KHWA 1VK0A 4J8FA 2VYPA 1TYQA 5IWAK 1W7AA 1GOAA 2VWJA 4IO9L 2HW3A 4LFBK 1HKBA 1JCGA 3MMVA 2QWPA 4GVMA 2NY8X 1S1TA 1XQSC 2NLXA 1YXQA 4OJRA 4BG9A 1X3NA 4ID5A 3FZMA 3K5MA 5BR8K 3J7YP 3OYHA 4CBXA 3VMFB 2OTJN 3VEXA 1QZ5A 3L6QA 3HOTA 4H4MA 1ZYWA 1NBWA 3NH0A 3JXUA 3A2FA 4MDBA 5TKWA 1BDGA 1XNRK 3K58A 3L4IA 3D45A 3DXMB 2O8EB 1VQ9N 3OBWA 2KYQA 4FZYA 3TTCA 3IDHA 3OYKA 1WLJA 1QE1A 1LQIA 1WNSA 3NH2A 4BGBA 1I6GA 2GWJA 3T1AA 3CFRA 3PUFA 5C24A 4DR3K 1VNBA 4A61A 1WSJA 3FZFA 4CEFA 4KFBA 2B4JA 3DLKA 4DV5K 4AB0A 4BE2A 1KXPA 4CEQA 4KO0A 2KKZA 3KOXA 2YV0X 3CCLN 5ADXH 4K0KK 2CGKA 3MXJA 4MLHA 1AHOA 1B9DA 1RDUA 1MDUB 2QXLA 1HQUA 2LN8A 2CGJA 5C0YA 5GIOA 2O8FA 1JLGA 3THXA 3F5TA 3EE8A 4EHUA 4CHNA 4FPBA 3DLLL 2YHAA 3WQTA 3MX5A 4DFMA 3U3YA 2Q97A 3KLHA 3AO1A 4PHTX 3PY8A 4ELUA 4C1NK 4IFYA 4FJ7A 4PY5A 2DFEA 4FM2A 1NGFA 1ICAA 4A62A 4AILC 1TYQB 1NPIA 2YEOA 3AVKA 2P9IA 4FJXA 3D6RA 2O8CA 1T6CA 3LDNA 5GAGP 3QNNA 1YTUA 3MEDA 3SBTA 1CZBA 3BF3A 3V1OA 4Z4HA 1RBTA 1VRUA 3OYBA 2BE2A 3DLGA 2HNZA 3ZX3A 4M3TA 4CFDA 2WONA 1NGEA 4DUYK 4LF9K 3WXKA 3QLHA 3ZT3A 4A59A 2ATQA 1W2BM 4PUOA 1SEGA 3DLEA 3DJCA 3R1XA 1Q18A 1ZU3A 4JRQA 4NO7A 5FRNA 1D9FA 1OH6A 4BR5A 1RGIA 5AZIA 3I0SA 4FLYA 2N2RA 2HHSA 1HUXA 2YCHA 4DF4A 2PY5A 4DR2K 4UAEF 1HPMA 1VSFA 3NF9A 3R6MA 4HTLA 3J80O 1K8AO 4ILGB 4GV6A 3ALYA 2N2QA 3MWPA 3M8RA 1FH3A 4DQRA 2HHXA 3NDKA 4CEEA 1Q7YO 1YIJN 1TK5A 2LI7A 3ASMA 1VQ4N 1RT2A 4FVUA 3KOWA 2BGGA 3KK2A 3EKUA 1AYJA 2KW4A 2ZQBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2HVH A;  3ZEU B;  1XUP O;  4CJ3 A;  1C0G A;  4IDK A;  1IKX A;  2LJM A;  5E84 A;  1KAY A;  3J7Z O;  3THW A;  4DR5 K;  4KB1 A;  1RFQ A;  2Y1I A;  2P5G A;  1J53 A;  3VEY A;  1ZUT A;  4OPH A;  4IXC A;  3T69 A;  1HLU A;  1Q86 O;  3EE9 A;  4KHQ A;  4BC5 A;  4DV2 K;  4BAC A;  4O8U A;  4CHO A;  4F3T A;  3NH1 A;  1W0H A;  4O0I A;  4LY7 A;  4CHP A;  4JK9 A;  3GBT A;  1LV5 A;  3AA3 A;  4PA1 A;  3MWT A;  2RPI A;  4NCA A;  1RIL A;  4LSN A;  1VSI A;  2FBY A;  4X62 K;  1YI2 N;  2ATB A;  2P9S B;  4B9U A;  4CJ5 A;  2KBK A;  4DTS A;  4IG3 A;  1P8Z A;  3EL2 A;  4DF8 A;  4YDU C;  1U6Z A;  5AZJ A;  4JHD A;  2YKM A;  3D0P A;  5LMU K;  4DU1 A;  1EP4 A;  2M8B B;  3AVM A;  1FXX A;  2KLA A;  4BQL A;  3G6E N;  1KCF A;  4NXM K;  5EVZ A;  1O13 A;  1LCU A;  1VQ8 N;  3TAN A;  2O4I A;  4AM7 A;  3TPQ A;  1I2U A;  2IS3 A;  1KAX A;  3FR0 A;  3VOV A;  1B3C A;  1HNV A;  3C0B A;  5BPL A;  3KWI A;  2GWK A;  3ZSQ A;  3SAF A;  3SI6 A;  1KRP A;  2QXF A;  4BWJ A;  3CMA N;  1QSL A;  4UJ0 A;  1T7E A;  1Q8I A;  1T03 A;  2ZD1 A;  3TAB A; 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