2QWOA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the adp*pi form #1
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
387
structure length
387
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
total genus 120
structure length 387
sequence length 387
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwoA04
3DAWA 2DPNA 3TU5A 4PKGA 2W41A 4H0TB 4H0VB 4XH1A 2NRHA 2Q1NA 3GG4A 2P9IB 4BRFA 1NGIA 3JXUA 1ZC6A 3ID8A 2P9UB 3JS6A 4JD2B 4Z94A 2YI1A 4FOEA 3O1WA 3CJCA 5I9EB 1K8KB 4JNEA 1HJOA 3MN7A 2IVOA 4BRDA 2CGJA 2Q31A 3O1BA 4A2BA 4CZFA 4WQ5A 5JLFA 1GLBG 4BRMA 3VGKA 3FZKA 4MO5A 2PBDA 3VEXA 3WXIA 3A5MC 4M7YA 3VEWA 1GLLO 1T6CA 3HSCA 4B1ZA 5AZIB 1BA1A 1LOTB 1NM1A 5AQJA 1XQSC 2QWQA 2QWOA 1YAGA 1SQKA 1LCUA 5EOYA 5TKYA 2YHXA 2VCPA 3ZEUA 2ASPA 1JCEA 1WOQA 4XH4A 1U6ZA 3VESA 3BUZB 2I7NA 1NGJA 2V7YA 4PL7A 3VF4A 1Z6RA 1P8ZA 4FWSA 3C7NB 4ISEA 4BR2A 3RSEA 3U8XA 3QFUA 1S22A 1NMDA 4BR9A 4CZHA 1NGHA 4FWLA 3GBTA 3D2EA 4FPBA 4CZGA 1GLDG 5BN9A 4HTLA 4A2AA 4BR5A 2A3ZA 4BGAA 3FZLA 4BR0A 4RCHA 4DB3A 3UKRA 4FWMA 4Y0WA 2QWMA 4O8KA 4JAXA 2QWNA 1DGKN 2Q0UA 3SK3A 2NZTA 3D7EO 2E8AA 2GWJA 2I7PA 1SAZA 1U2VA 5AQXA 2Q2RA 2ASOA 2UYTA 3C0BA 1NLVA 4I6MB 2W40A 1K8KA 4I6MA 4JN4A 3MDQA 4BRNA 3LL3A 4JD2A 3EL2A 4IXCA 3ATVA 1J6ZA 1HPMA 2P9PA 3H1QA 1XUPO 3WEEA 2P9PB 5F1XA 4WQ5C 3U9DA 4FWRA 2QWLA 2FSJA 3D2FB 4AM6A 1YXQA 4YDUC 4FWNA 2BTFA 5FPMA 3KZBA 4CZMA 2HF3A 5AQIA 3DXMA 2D1KA 5BPNA 4KBOA 3O4WA 2FSKA 4CZJA 3I33A 3IDHA 4WYBA 3L0QA 4FSVA 5LY3A 3I8BA 4BRIA 4BVPA 4H5TA 1WUAA 3AAQA 3IUCA 4EAHD 3DXKA 4BC3A 4B1VA 5AZJB 3U4LA 2V51B 2E1ZA 1KAZA 4H0YB 3CHWA 1T6DA 1RDWX 2QW9A 2KHOA 3A5OC 2A6AA 4XH5A 1E4GT 2P9IA 3LDPA 3MK6A 5CE3A 4GNIA 4IZ9A 3EO3A 3UKUB 3J8AA 4FWPA 3OHRA 4BG8A 3UKRB 4E1JA 2E20A 5EX5A 1MWMA 5F2RA 1QHAA 3ULEA 3ZEUB 1S3XA 5AQRA 3WXLA 1NWKA 2VYPA 5AQNA 4JHDB 4EHTA 2P9NB 1NBWA 1CZAN 3HM8A 2AP1A 4FL9A 3LM9A 5AQGA 2D0OA 4LC9B 3U9ZA 3HZ6A 3G25A 1QQOA 3UKUA 3VEOA 3QBWA 1KAXA 2HMPA 4FWQA 4WQ4C 4BRCA 3FFKB 5KQ8A 1NGEA 5AQHA 4CZLA 3H45C 4BG9A 1ESVA 1GLJO 2P9SB 4GY2B 2A40A 3O8MA 2IVNA 3L4IA 2EWSA 3KHYA 1HKGA 3VGMA 1BA0A 3FGUA 3MN5A 1V4SA 4H0PA 4NB4A 2VWBA 3P4IA 4B1WB 5E84A 2PAVA 1YUWA 3BF1A 3H3NO 5KPZA 3D2FA 3CERA 4DCHA 4K25A 3GL1A 3QMLA 2ZGYA 3ZX2A 4C23A 3F9MA 4MLHA 4J8FA 1GLFO 3M1FA 4A62A 2F9TA 4BROA 3R6MA 4BRPA 3VERA 3O6WA 1BUPA 3SMSA 1E4FT 1TYQA 4M7XA 3CQXA 4QS9A 2GWKA 2GEMA 3CJ9A 5AQFA 3FR0A 4MLEA 4CZIA 2YHYA 1HLUA 2FSNA 4FWKA 1U2VB 3W0LA 5BRDA 5AQLA 1HX1A 4H0XB 1X3NA 4ISFA 4EIAA 4MO4A 2IIRA 1NGDA 1BOTO 1ATRA 5EXWA 2D4WA 2E1YA 5FPEA 5AQYA 4BC2A 2E2QA 3MCPA 3M6GA 3SJHA 3UE5A 3VETA 4IJNA 3CJ7A 2ZWHA 5KQDA 5JLHA 1V4TA 1BG3A 3VENA 5AQWA 2ASMA 3QDKA 3AARA 3DJCA 1BO5O 2ITMA 4IJAA 3VF2A 3W3DA 4BRGA 4CBUA 3DWLA 5AQSA 3HBTA 3MMVA 2QM1A 1BDGA 4FO0A 3L6QA 2BUPA 1TUYA 2P9LA 3M3ZA 3HTVA 1EQYA 3ZX0A 5EVZA 1T44A 4QS7A 4IWVA 3A5NC 3ZX3A 4BGBA 3DXKB 1X3MA 5FPDA 3GOIA 3VOVA 1BU6O 2QXLA 1D4XA 5BREA 3ENHA 3FZMA 3WQUA 3VEVA 4BC5A 4BR4A 4A61A 4PKIA 3EZWA 3H46O 4B1YB 5ELZA 4JHDA 3A0IX 4K41A 2FF3B 4CZEA 1TYQB 3EKSA 2ZGZA 5E26A 2Q97A 4CBXA 3A8YA 4YDUA 2E2OA 3HI0A 2Q0RA 1ATSA 4CD3A 5BPMA 3FLCO 1QZ5A 2FF6A 3FZHA 3CI5A 3VGLA 4BRKA 5AQTA 5FPNA 1Q18A 2YHWA 3SLCA 5BR9A 3ENOA 1GLEG 3H1VX 1MDUB 3GDQA 3O80A 3R9PA 4EFHA 3LDNA 5JMVA 1XC3A 4BRHA 1QQMA 3LDLA 2OANA 5AQMA 2YJEA 4FWOA 2FXUA 3EKUA 2GELA 3QB0A 1C0FA 3WXKA 2P9KA 3KVGA 4BREA 1GLAG 5KPRA 4QS8A 4BRQA 4B1XB 1BWFO 1ZBSA 2A42A 3VEZA 3S41A 2NLXA 3CJAA 4H0OA 3IMXA 3ZETB 2A41A 2IVPA 1JCFA 5LJVA 4K42A 3CQYA 3R8EA 2CH5A 4H5VA 1TUUA 2E2PA 4BRAA 1GLCG 3TPQA 4AM7A 4B9QA 4F9OA 3QICA 3BP8A 1DEJA 5AFUH 1HKBA 1JCGA 1YVNA 1ZXOA 2QWPA 2YCHA 5BN8A 2P9SA 5AZIA 3WT0A 5B8HA 3VPZA 2F9WA 2D0PA 1NGCA 2V52B 1HUXA 2CH6A 4BRLA 4DQ8A 4CZKA 4B1UB 4WQ4A 3H3OB 5AQKA 2GUPA 5BRHA 5BRFA 1MWKA 2CGLA 3CETA 4HWIA 1G99A 4BQZA 3MN6A 1NGFA 1R59O 2A5XA 3LM2A 2FLOA 3BF3A 3WQTA 1OKJA 4IO8A 4H03B 5JICA 2QWRA 5AQPA 5ADXA 1SZ2A 4RTFD 5EY4A 3FE1A 5LJWA 3QBXA 3LDOA 1H1VA 3H6EA 4FPAA 3AY9A 4CBWA 4L3QA 4PKHA 4O5FA 2GTDA 1KXPA 1DKGD 5AQOA 3ATUA 1MA9B 3UB5A 2J4RA 4PL8A 3FZFA 1Z05A 2AA4A 2YJFA 3VF6A 3CJBA 3MN9A 5AZJA 3ULEB 5AR0A 2P9LB 2V7ZA 1X9JA 4CI6A 3RSEB 3CIPA 1HKCA 1QZ6A 4CD1A 3C7NA 5ADXH 2E88A 4BQLA 1IJJA 4NO7A 5AQVA 2H3GX 2HF4A 1NGBA 5AQQA 4BR7A 2Q36A 3WEEB 4BC4A 3AAPA 1NGGA 5F0XA 3LDQA 4K43A 4RWTA 4H5NA 3SMPA 2WUSA 3QFPA 3CJ1A 3DXMB 1C0GA 2HOEA 2ZF5O 3A5LC 2P9UA 1KAYA 2P9KB 3BEXA 1IG8A 4FOIA 2E2NA 3GE1A 4H5WA 5BPLA 4XEIA 1NGAA 4H5RA 5AQZA 3EN9A 2CGKA 4M63C 2P9NA 3ZETA 5AFUA 3O5BA 4BVOA 1QQNA 3D2EB 4DHYA 5KPTA 3WXJA 1ATNA 3O08A 4ISGA 3B8AX 4EHUA 1RGIA 1RFQA 3VEYA 4CJ7A 3IFRA 5AQUA 1Y64A 3WUHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DAWA 4PKGA 4UAFE 1HQEA 4JS5A 1XHZA 2P9IB 3SQ4A 2O8FB 1HR0K 3K9KA 4CHNA 4KB0A 2G8VA 3CCMN 4EP5A 2LI7A 5I9EB 4IFYA 1K8KB 3WNHA 4DV4K 1XC9A 3V9XA 3AA3A 4CZFA 4BRMA 3FZKA 4CQKA 2G8WA 4DU3A 1PTXA 2PBDA 3AO5A 4B9UA 3VEXA 4IFVA 4KHWA 1GLLO 1RT5A 3U3GA 3MXIA 3CC2N 3OYFA 3D6RA 2KBKA 4CEAA 2ZJPL 1BA1A 1LOTB 1XHXA 4KH4A 5AQJA 1XQSC 2G8IA 2E5LK 3MXMA 1LCUA 2Y1JA 2YHXA 3SJJA 4FLXA 4DR6K 1U6ZA 1OH8A 4CJLA 1BCOA 3BUZB 3NF8A 4OO1J 4PL7A 4JI2K 4CF0A 3RSEA 4BR9A 3AGKA 4CZHA 1RILA 4FWLA 4FPBA 4JV5K 4CHQA 5BN9A 3OYDA 5CHIA 1FXXA 3ENBA 4BGAA 4DB3A 3FZLA 3LP3A 4C8KA 3UKRA 2YX6A 3C6TA 5HRNA 1DLOA 4KREA 3AVAA 1NNEA 3D7EO 2E8AA 2GWJA 1NKBA 4CHPA 3NGIA 3R3LA 3AVHA 4BRNA 4M3RA 4JD2A 3ATVA 4KHSA 5AJ3K 1WSIA 4CGHA 1XUPO 3P83D 1NRAA 3WEEA 2N66A 5F1XA 2QWLA 2FSJA 3NH0A 2QXFA 2BTFA 4JI4K 2HF3A 4CZMA 3UIQA 3M8QA 4CJTA 5BPNA 1A5XA 1TKZA 3O4WA 3PX4A 1W2BM 4M3UA 4B9VA 4FJLA 1DT9A 1HNWK 2ASCA 3L0QA 4FSVA 4U7BA 4E7JA 1NKEA 1M90O 4BRIA 2YNGA 1WNSA 5SWMA 1YITN 3AAQA 2O8CB 4EAHD 3HOSA 2ATBA 1RT2A 2JGUA 3NH2A 3AO4A 3QEPA 2E1ZA 1KAZA 3QEWA 2YKNA 5C25A 5C15A 2YBRC 1T6DA 2KQ2A 3TR8A 1RDWX 1S1XA 2HHUA 2KHOA 5M1PA 4K8ZA 1E4GT 1VQLN 3TWHA 1F21A 4GNIA 1BCGA 3P39A 5T7BA 4KTWA 3QNOA 4RW4A 1OZZA 2DFHA 2OYQA 3OHRA 3OVNA 3UKRB 1MWMA 3SBGA 2O8BA 4F3TA 3G6EN 4DTJA 1BK8A 3ZEUB 1IG9A 3WXLA 1RBSA 5AQNA 4EHTA 4NYNA 2KYQA 1YJWN 2AP1A 3LM9A 3U9ZA 3SPYA 4PWDA 3VEOA 3QBWA 1L3VA 4WQ4C 4BRCA 1QQCA 3DM2A 1NGEA 4DTSA 3SQ2A 2VG6A 5AQHA 3SUNA 4LSNA 4CESA 1GLJO 3G4SN 4GY2B 4FW1A 3O8MA 3OS2A 4KPYA 2P51A 1NJXA 2YIPA 3G0ZA 4E89A 4OPAA 3I0SA 3N4QA 4KI4A 1RBTA 3EYZA 3L3UA 3ZT4A 4CJ5A 3H3NO 5HP1A 3TSPA 3HP6A 3D2FA 4K25A 3QMLA 4DFMA 4DQQA 2BDPA 4GMJB 1NK6A 4R79A 3R6MA 5SZTA 1BUPA 4DR4K 2WBNA 4CEBA 4W5QA 1J5EK 3HPGA 4E19A 3CJ9A 3OTOK 2KBHA 2YHYA 1HLUA 1U2VB 3OJSA 5DK5A 5IWAK 1HX1A 2X6SA 1Q9YA 2IIRA 1C0MA 1BOTO 4IFEA 1KFDA 3QEVA 2OTJN 1SV5A 3MCPA 3M6GA 3SJHA 3LDSA 1NK7A 4KYPA 4YOVA 3E7RL 4BDZA 4FJIA 2ZWHA 4EZ6A 1QS4A 5JLHA 4BE1A 3VENA 5MLCQ 2ASMA 2F96A 3AVBA 3ITHA 4Q0BA 3DJCA 1SL1A 4IJAA 1VSJA 3PO4A 4CBUA 2MZ0A 1BIZA 4AF1A 3DWLA 2EHGA 1S6PA 4AHSA 5HOOA 1SS6A 3IRXA 3CPEA 3T1AA 3KK2A 1JLAA 3QETA 1HMVA 2UUBK 2ZM6K 3CF5L 4BECA 4CEDA 3S3OA 3PY8A 5C12A 3L2VA 1BU6O 1ZU3A 3TAQA 3VEVA 4BC5A 3BZCA 3LPUA 3VQ9A 4DTXA 4B1YB 2E3GA 3SNNA 4JHDA 1RTJA 1PE4A 3KKRA 4K41A 2FF3B 5C2FA 2KW4A 4FLUA 4ZHRA 1RDUA 4DUYK 3HL8A 4YDUA 2E2OA 3DYAA 4ID1A 4OLBA 2Q0RA 3U3YA 2HBJA 1OVQA 4DG1A 5I3UA 4CHYA 5JVHL 1J5OA 1GLEG 3NVMA 1MDUB 1RCHA 1NK9A 1N8RO 2A1SA 1SKRA 4B9TA 1QQMA 3LDLA 4JEPA 2YJEA 2HHQA 3K5OA 1C0FA 2KLAA 4OLAA 1WBBA 2G8KA 3THVA 1IKXA 1GLAG 4DWIA 3T69A 2WOMA 1JLCA 1BWFO 1RT1A 1HNIA 1NJYA 1S1TA 2F7TA 1VQKN 4HUFA 1YI2N 2LY6A 2A41A 2IVPA 4FZYA 4DSIA 2VGMA 2UUCK 5K14A 3R8EA 3MECA 3J80O 1REVA 4MDBA 1AYJA 2A1RA 3LP0A 1RDDA 5J2PA 1ZXOA 2QWPA 2W00A 1Q8IA 4JKAA 1NMNA 1S1UA 3KWGA 1ZBUA 3MX2A 3F73A 1N32K 4JS4A 3E66A 1VSKA 3QLHA 2F9WA 1VSMA 2X78A 1NGCA 3CCLN 4DQ8A 3Q7BA 4B1UB 4CJ3A 2VQEK 1T1TA 1HYVA 1C0TA 1MWKA 2RHKA 4OGEA 2A5XA 3CM5A 5LL6Z 4H8KA 3LM2A 3BF3A 5GAGP 1S6QA 2QWRA 5AQPA 1HQUA 1SZ2A 4RTFD 1O13A 1BIUA 1RTIA 3FE1A 3CYGA 3QBXA 4CBWA 1VSDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DAW A;  4PKG A;  4UAF E;  1HQE A;  4JS5 A;  1XHZ A;  2P9I B;  3SQ4 A;  2O8F B;  1HR0 K;  3K9K A;  4CHN A;  4KB0 A;  2G8V A;  3CCM N;  4EP5 A;  2LI7 A;  5I9E B;  4IFY A;  1K8K B;  3WNH A;  4DV4 K;  1XC9 A;  3V9X A;  3AA3 A;  4CZF A;  4BRM A;  3FZK A;  4CQK A;  2G8W A;  4DU3 A;  1PTX A;  2PBD A;  3AO5 A;  4B9U A;  3VEX A;  4IFV A;  4KHW A;  1GLL O;  1RT5 A;  3U3G A;  3MXI A;  3CC2 N;  3OYF A;  3D6R A;  2KBK A;  4CEA A;  2ZJP L;  1BA1 A;  1LOT B;  1XHX A;  4KH4 A;  5AQJ A;  1XQS C;  2G8I A;  2E5L K;  3MXM A;  1LCU A;  2Y1J A;  2YHX A;  3SJJ A;  4FLX A;  4DR6 K;  1U6Z A;  1OH8 A;  4CJL A;  1BCO A;  3BUZ B;  3NF8 A;  4OO1 J;  4PL7 A;  4JI2 K;  4CF0 A;  3RSE A;  4BR9 A;  3AGK A;  4CZH A;  1RIL A;  4FWL A;  4FPB A;  4JV5 K;  4CHQ A;  5BN9 A;  3OYD A;  5CHI A;  1FXX A;  3ENB A;  4BGA A;  4DB3 A;  3FZL A;  3LP3 A;  4C8K A;  3UKR A;  2YX6 A;  3C6T A;  5HRN A;  1DLO A;  4KRE A;  3AVA A;  1NNE A;  3D7E O;  2E8A A;  2GWJ A;  1NKB A;  4CHP A;  3NGI A;  3R3L A;  3AVH A;  4BRN A;  4M3R A;  4JD2 A;  3ATV A; 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