2QWOA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the adp*pi form #1
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
387
structure length
387
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
source organism Bos taurus
molecule tags Chaperone
total genus 120
structure length 387
sequence length 387
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwoA04
3IMXA 3MN6A 2Q0RA 3H45C 3U9DA 3EKSA 2CGKA 1NGCA 3U4LA 1X3NA 3AARA 5AZIB 1HKCA 4ISFA 4IZ9A 3FZHA 4CZFA 1NWKA 4BRAA 5BN8A 1QZ6A 4LC9B 4CZHA 4I6MB 5JLFA 4FWMA 1LCUA 2E1ZA 3EL2A 3HM8A 4BC5A 1GLBG 1SAZA 4M7XA 1BG3A 5KPZA 2DPNA 4CBUA 4IJAA 4KBOA 2D0PA 1S3XA 3QICA 1JCEA 4H0PA 1YXQA 3AY9A 1QZ5A 4ISEA 3FGUA 2A3ZA 4JHDA 2IVPA 2P9LA 5BPNA 3CI5A 5LJWA 3FZMA 3VENA 3QBXA 4MLHA 3A5LC 1NGJA 3BP8A 3VF6A 2PAVA 3IFRA 5EOYA 1E4FT 2IVOA 5AQJA 4FOIA 3VEYA 4CZMA 2D1KA 3FLCO 3R9PA 1RGIA 1Y64A 4FO0A 5JICA 2FSJA 3SLCA 2YJFA 4PKGA 2NLXA 4NO7A 4CI6A 2A6AA 2P9KA 2QWOA 3M1FA 5AQUA 2F9WA 4H5VA 5AFUA 4BRHA 5JLHA 4PKIA 3WT0A 2QW9A 4Z94A 2WUSA 5BPMA 5FPNA 4FWSA 4MO4A 3VOVA 1TYQA 1HPMA 1SZ2A 5E84A 2E2OA 4FL9A 4B1VA 4BGAA 2I7PA 3MCPA 4FWKA 5AQNA 3MN5A 4BRPA 3L6QA 3RSEB 3ULEB 4BVPA 1KXPA 1JCGA 1JCFA 3FZFA 1NLVA 4CZGA 1NGDA 4CZEA 3S41A 4XH1A 1T44A 3EN9A 3BF3A 2V7ZA 1NMDA 3SK3A 5E26A 5I9EB 2E88A 2GTDA 3C7NA 2QM1A 3QDKA 1XC3A 4EHUA 5ADXA 1MDUB 5AQRA 3D7EO 3GOIA 1ZXOA 3GDQA 1D4XA 2D4WA 4BC4A 4CJ7A 2FF3B 5B8HA 5KQDA 5EXWA 1QHAA 4BR4A 3KHYA 2W41A 1YAGA 3ZEUA 2P9UB 5FPDA 2A41A 3VEZA 2V7YA 1NM1A 3ZX0A 1P8ZA 3D2FA 4QS7A 2HF3A 4BG8A 3VEOA 3H1VX 5AQGA 4O8KA 4FWPA 2BTFA 4HTLA 2BUPA 1HUXA 3DXMB 3BF1A 3CETA 3P4IA 2KHOA 1NGAA 1LOTB 5AQPA 1BWFO 5EY4A 1HKBA 3A0IX 3O08A 4XH4A 1DEJA 4QS8A 4GNIA 4B1UB 1NGIA 1BUPA 2Q2RA 5KQ8A 2Q1NA 4WQ5C 3H46O 3JXUA 3O1WA 5F0XA 4M63C 2ASMA 1X3MA 2P9PA 2EWSA 2HOEA 1RDWX 1V4SA 3EKUA 2A42A 3A5NC 5BREA 3ID8A 3B8AX 3ZX2A 5AQHA 4WQ4A 3L0QA 5AZIA 3VEWA 3GL1A 3HZ6A 4DCHA 1BO5O 3O6WA 4I6MA 3FZLA 2FXUA 4YDUC 3CQXA 3WXIA 4PL8A 4H5TA 1GLAG 3CJ9A 2PBDA 5CE3A 1GLCG 3LL3A 3GE1A 3O8MA 1GLEG 3W3DA 5AQMA 1S22A 3GG4A 3M6GA 5TKYA 3VF4A 3KVGA 2ASOA 3QBWA 1V4TA 4H5RA 2QWNA 4BRDA 2ASPA 2CH6A 1IJJA 1XUPO 3ENHA 5EVZA 3WQTA 3J8AA 2D0OA 3D2EB 3LM9A 3WEEB 3HBTA 1K8KB 1NBWA 1X9JA 2IIRA 3VF2A 4BR7A 3JS6A 2F9TA 1G99A 4RCHA 4JHDB 3UKUB 3VETA 4CD1A 2ZGZA 4BR5A 1Z05A 3WXJA 3HSCA 4K25A 3LDPA 5AQZA 3FFKB 4JAXA 3TU5A 4BRLA 3QB0A 5KPRA 2HMPA 3BUZB 2FF6A 2P9SB 3UB5A 3WQUA 3O4WA 4B1XB 1DGKN 3VGKA 3A5OC 4BVOA 3O80A 4IO8A 1TUUA 1BA0A 2FSNA 5AFUH 4BR9A 3ATVA 3DXKB 1RFQA 2Q0UA 2YI1A 1QQNA 2QWRA 3MDQA 4K41A 4O5FA 3UKRB 4PKHA 3WUHA 3RSEA 3CJ7A 2A40A 3U8XA 4CZLA 5AQSA 4BRFA 3R6MA 1HJOA 1BDGA 3CJAA 4QS9A 1EQYA 2E2QA 4IWVA 1HKGA 3MMVA 2GUPA 2Q97A 4JD2B 3ENOA 2ITMA 1IG8A 3VERA 4FWLA 3W0LA 5ELZA 2QWPA 4H03B 2P9IB 1Q18A 4CZJA 3GBTA 5AQLA 2E1YA 1HX1A 2YHYA 4NB4A 4IXCA 4BC2A 1ATSA 1BA1A 2Q31A 5ADXH 1MWMA 3CQYA 2ZF5O 4Y0WA 3C7NB 5AQFA 4B1ZA 4BRMA 3HI0A 3LDLA 2OANA 4K43A 4A61A 3ZETB 4FPAA 2FSKA 3VGMA 2E8AA 5BRDA 3DXMA 2P9NB 1MA9B 1C0GA 3QFPA 4IJNA 1Z6RA 4M7YA 1OKJA 4B1YB 2UYTA 1U2VB 3CJ1A 3CHWA 4MLEA 4BG9A 2CGJA 4H0OA 4XEIA 4YDUA 4JNEA 2E2NA 1KAYA 1ESVA 2V52B 4FWQA 2W40A 3I33A 5JMVA 5AZJB 3CJCA 2ZWHA 2NRHA 4E1JA 4FWNA 3LDQA 2AP1A 2NZTA 4BRGA 4H0XB 2FLOA 3WXKA 4H0VB 3UE5A 2HF4A 4A62A 4H0TB 4BR0A 2P9PB 3IDHA 4EHTA 4BREA 3VEXA 2CH5A 1NGBA 5AQIA 3VGLA 1GLDG 3H3OB 4A2AA 4C23A 1GLJO 5F2RA 3MN9A 4B1WB 4FPBA 5LJVA 3LM2A 2J4RA 4DB3A 1GLLO 4HWIA 1YVNA 4BR2A 4RTFD 3CERA 4H5WA 3H3NO 2ZGYA 3R8EA 4BGBA 1GLFO 4J8FA 1T6DA 4BRKA 1SQKA 3AAPA 1C0FA 3A5MC 2Q36A 4CBXA 1NGFA 3D2EA 5FPMA 3WEEA 4PL7A 3SMPA 2GEMA 1K8KA 4BQZA 3MN7A 3H1QA 2YHWA 4WQ4C 3VESA 3SMSA 4BRIA 3UKUA 5AQTA 4FSVA 1TUYA 2P9LB 1ZC6A 4GY2B 1MWKA 3BEXA 3CIPA 4BC3A 5AQVA 1NGEA 1BOTO 2YJEA 5AQXA 5BN9A 5AQOA 2GWJA 4EFHA 2E2PA 3O5BA 4JN4A 2P9SA 1YUWA 5BPLA 4CZKA 1J6ZA 2QWQA 3VPZA 1WOQA 3DXKA 2YCHA 1ZBSA 2P9KB 3UKRA 4FWOA 3ULEA 4RWTA 4A2BA 4K42A 3F9MA 2YHXA 1XQSC 5FPEA 3M3ZA 1DKGD 4ISGA 4CBWA 1NGHA 1QQOA 4CZIA 2VCPA 5BRFA 1ATRA 5F1XA 4B9QA 1ATNA 2QXLA 1TYQB 5LY3A 3LDOA 2I7NA 4JD2A 4DQ8A 3L4IA 3FZKA 2AA4A 2VWBA 3EO3A 1H1VA 4BQLA 4EIAA 4FWRA 4EAHD 1QQMA 2CGLA 5AR0A 4F9OA 3C0BA 2P9IA 3HTVA 1BU6O 3ZX3A 3EZWA 3CJBA 3DWLA 3O1BA 4MO5A 5KPTA 3IUCA 4XH5A 5BRHA 4AM6A 1E4GT 2GWKA 5AQKA 1KAZA 2E20A 2H3GX 2P9UA 4WQ5A 1R59O 4CD3A 3TPQA 4BROA 2GELA 4H0YB 5BR9A 1HLUA 3A8YA 4WYBA 1U6ZA 3WXLA 3ZETA 2QWLA 4H5NA 2P9NA 3ATUA 3QMLA 2A5XA 1NGGA 3ZEUB 1U2VA 2QWMA 1CZAN 3OHRA 3DAWA 3D2FB 2VYPA 3G25A 3H6EA 5AQQA 4AM7A 3FR0A 4BRQA 5EX5A 4BRCA 5AZJA 3AAQA 5AQYA 4L3QA 3VEVA 4BRNA 3LDNA 4FOEA 1WUAA 3DJCA 1KAXA 3FE1A 1T6CA 3SJHA 3U9ZA 3KZBA 3MK6A 5AQWA 2IVNA 3I8BA 4DHYA 2V51B 3QFUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HOTA 3TWHA 3H45C 3EKSA 2CGKA 1U4BA 2XY7A 3FZHA 1YI2N 1GPTA 1NWKA 3LALA 4BRAA 4CZHA 3V9XA 2E1ZA 3TAFA 3AA5X 4PQUA 4M7XA 4KBOA 4O0JA 2D0PA 3K58A 4H0PA 4AHUA 1XHZA 1QZ5A 5DMRA 2RPIA 3C6TA 2A3ZA 4JHDA 1RDDA 2B5JA 2IVPA 1XMOK 2P9LA 3CI5A 5LJWA 4KI4A 4FLZA 1WN7A 4WFAL 2HMIA 1NG9A 1BISA 3A5LC 2PAVA 5EOYA 2E2FA 2LSNA 2D5RA 4FOIA 2X78A 3VEYA 4CZMA 2KSKA 3FLCO 4UADE 1VQPN 4H8KA 4CFDA 2FSJA 2YJFA 1TK8A 2NLXA 3OJSA 3P5JA 3IRXA 2QWOA 4EZ9A 2D0CA 4B3SK 1DTTA 3AVJA 5JLHA 2OZSA 2QW9A 4FWSA 3SAGA 3VOVA 1TL3A 4FLUA 4F8RA 1KTQA 5HRNA 5DM7L 2DY4A 2E2OA 4B1VA 2UXCK 4CFAA 2X6NA 5AQNA 3L6QA 2HBKA 3ZT0A 1CXUA 3AVBA 2JLEA 3ULEB 4BVPA 4E7HA 1KXPA 3RMCA 1OH7A 4I2QA 1TKZA 4OLBA 2ZE2A 1OH6A 3K5OA 1T44A 3EN9A 5I9EB 1ASUA 3C7NA 1JLEA 3CCJN 1LAVA 3OW2M 3SCXA 1VSMA 5HRRA 1XC3A 1SL1A 2NRZA 4EHUA 2LR3A 3LZIA 1NRAA 5AQRA 1Q8IA 2F96A 1X9WA 4DTMA 2O8CB 2GX9A 3OYHA 2A1SA 3GDQA 1HMVA 4CJ7A 1JLCA 5B8HA 5KQDA 4RW6A 1YTAA 2I61A 3CXCM 1X9MA 1EWRA 5KK4A 5FPDA 1L4VA 4JK7A 2KLAA 3VEZA 1NM1A 4DR4K 5K14A 3D2FA 4QS7A 1RNHA 2HHXA 5AQGA 3WNEA 3C6AA 3ZCMA 1W2BM 1TK5A 2BUPA 1HYZA 2VG5A 2WC9A 3BK3C 4BECA 3PSMA 1BWFO 1HKBA 4XH4A 4DQPA 3O9QA 5KQ8A 2E3FA 2Q2RA 5I3UA 2ZM6K 2XY5A 3ZLJA 1X3MA 2P9PA 1P00A 4DS4A 1NPIA 2HOEA 4DFKA 1JLQA 1RDWX 1RTDA 4CGIA 3LDSA 4LSLA 4JYAK 1VSEA 3ID8A 5LMNK 3V9ZA 2HHSA 1TKDA 3KLGA 3GL1A 3VQPA 1VAZA 4HUFA 4H5TA 4E19A 3AVAA 1JLBA 1RBRA 1Q9XA 4DQRA 1PTXA 3E7RL 5TKYA 2QK9A 1QSLA 4A5BA 3C95A 1T7PA 1LWEA 2O8EB 3CCQN 4JI2K 3VF4A 3J7AP 5T7BA 3HYFA 3T1AA 3QBWA 2QWNA 2ASPA 1FKPA 3ZSXA 1IJJA 3NGIA 4Y1DA 5EVZA 4CJ5A 2HHWA 3MXJA 1K8KB 4FW1A 1NBWA 4CF1A 1POIA 4B08A 4BR7A 2IDOA 3JS6A 2E5LK 1Y97A 4RCHA 4JHDB 1NKBA 4CF9A 4QAGA 1KSPA 4LF6K 3IG1A 1WSHA 3L2RA 3KLEA 2XO7A 3T3FA 3OYJA 3MXIA 3AA4A 1KRPA 1RDBA 1TUUA 2FSNA 4UY8O 3PSIA 4BR9A 1RT1A 2NRVA 3VN5A 4JKDA 3O4QA 1VQ8N 1RFQA 3MDQA 4K41A 1QQNA 2P5GA 3WUHA 3U8XA 4CZLA 5HRSA 3R6MA 1HJOA 1BDGA 2O8FB 1EQYA 3CMAN 1KLMA 1Z26A 2GUPA 3IKMA 4FJ8A 4CEQA 3ALYA 3VERA 4FWLA 4K8XA 5ELZA 3QIOA 2P9IB 4GW6A 4DSIA 2UU9K 2PYLA 3VA0A 2G8IA 3AVNA 1HX1A 2YHYA 3AVMA 3DOKA 4NB4A 4CGDA 1ATSA 2LY5A 5CYQA 1MWMA 1KVAA 1KC8O 1JL1A 3C7NB 4G9ZA 1HPZA 1Q82O 4IOXA 2HBMA 3TI0A 4FPAA 2E8AA 2WFBA 3CCEN 4KTZA 2N69A 1MA9B 4DKWA 4M7YA 1WSEA 1OKJA 4M3UA 4LFBK 2YILA 4DFPA 3TSUA 3THYB 3CJ1A 4MLEA 3C6UA 4BG9A 2A1RA 3HP9A 4K8ZA 2UUCK 3PIPL 3E66A 2E2NA 1KAYA 1OH8A 3I33A 3MWTA 4HE7A 5AZJB 3P39A 2ZWHA 1HNVA 3HSTB 3SPZA 1YJNN 3OS1A 3KK7A 2HHQA 2KBJA 3SBTA 4LF4K 4KH6A 1RT3A 3OYBA 3LDQA 1FW6A 1BMRA 3TAMA 2Y1IA 1HYVA 4OLAA 2MN5A 1ILYA 3RR8A 4H0VB 3KOYA 1S6QA 5J2NA 3KOZA 4AILC 1TAQA 2P9PB 3WNFA 2JGUA 3VEXA 4CF0A 2BE2A 2E6MA 2KW4A 4A2AA 3IS9A 4V1DC 3PUFA 4B1WB 4FPBA 4ILGB 5LJVA 1GLLO 4OKJA 3ZYYX 1YVNA 4BR2A 5FROA 4H5WA 4IOCL 3TAQA 3SUOA 4DR6K 1IBMK 1B9DA 4J8FA 1VSHA 1SV5A 3THVA 2LI7A 4BACA 4RW7A 5FPMA 3WEEA 4PL7A 4M3WA 2GEMA 2HNDA 3DYAA 2WTUA 4FLYA 3TAPA 2OYQA 2YHWA 3SMSA 4C8LA 3C65A 1C6VA 1XNRK 3TSQA 1RT6A 1NGEA 1RT4A 1VRTA 3QEIA 5HL7L 4RW8A 4EFHA 2E2PA 3O5BA 1OVYA 2FBTA 2P9SA 5GAEP 3GKUA 4Z4CA 2QWQA 1BCGA 4AB0A 3DM2A 3DXKA 1S1WA 4OVLA 1UAXA 4FK2A 2PFUA 3DLKA 1J5OA 4HUGA 4JRQA 3THWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HOT A;  3TWH A;  3H45 C;  3EKS A;  2CGK A;  1U4B A;  2XY7 A;  3FZH A;  1YI2 N;  1GPT A;  1NWK A;  3LAL A;  4BRA A;  4CZH A;  3V9X A;  2E1Z A;  3TAF A;  3AA5 X;  4PQU A;  4M7X A;  4KBO A;  4O0J A;  2D0P A;  3K58 A;  4H0P A;  4AHU A;  1XHZ A;  1QZ5 A;  5DMR A;  2RPI A;  3C6T A;  2A3Z A;  4JHD A;  1RDD A;  2B5J A;  2IVP A;  1XMO K;  2P9L A;  3CI5 A;  5LJW A;  4KI4 A;  4FLZ A;  1WN7 A;  4WFA L;  2HMI A;  1NG9 A;  1BIS A;  3A5L C;  2PAV A;  5EOY A;  2E2F A;  2LSN A;  2D5R A;  4FOI A;  2X78 A;  3VEY A;  4CZM A;  2KSK A;  3FLC O;  4UAD E;  1VQP N;  4H8K A;  4CFD A;  2FSJ A;  2YJF A;  1TK8 A;  2NLX A;  3OJS A;  3P5J A;  3IRX A;  2QWO A;  4EZ9 A;  2D0C A;  4B3S K;  1DTT A;  3AVJ A;  5JLH A;  2OZS A;  2QW9 A;  4FWS A;  3SAG A;  3VOV A;  1TL3 A;  4FLU A;  4F8R A;  1KTQ A;  5HRN A;  5DM7 L;  2DY4 A;  2E2O A;  4B1V A;  2UXC K;  4CFA A;  2X6N A;  5AQN A;  3L6Q A;  2HBK A;  3ZT0 A;  1CXU A;  3AVB A;  2JLE A;  3ULE B;  4BVP A;  4E7H A;  1KXP A;  3RMC A;  1OH7 A;  4I2Q A;  1TKZ A;  4OLB A;  2ZE2 A;  1OH6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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