2QWP | Genus

Total Genus 123

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	123
sequence length	386
structure length	386
Chain Sequence	GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQ

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70. pubmed doi rcsb
molecule tags	Chaperone
source organism	Bos taurus
molecule keywords	Heat shock cognate 71 kDa protein
total genus	123
structure length	386
sequence length	386
ec nomenclature
pdb deposition date	2007-08-10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	2qwpA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	2qwpA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	2qwpA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	2qwpA04

5AQOA 2I7PA 3LM2A 5FPMA 3VERA 2P9IA 3OHRA 4PL7A 2IIRA 5BPLA 2V52B 2IVNA 1QZ6A 4EIAA 3HI0A 2ZGZA 3CHWA 4BRAA 2W41A 4BR4A 4BREA 2D4WA 2NRHA 3EKSA 3R8EA 3FZLA 1DGKN 2CH5A 1D4XA 4BR2A 3QBWA 2P9SB 4YDUA 5JLFA 3EKUA 4IWVA 1QQOA 2P9SA 2QWMA 3JXUA 2QM1A 3CIPA 2QWLA 2VWBA 4K43A 5AQFA 2QXLA 3KHYA 3DWLA 4QS9A 5AQKA 1KAZA 3JS6A 3TU5A 3HBTA 1TUUA 4M63C 4H0YB 4HWIA 1RFQA 2GUPA 3VENA 5KPRA 4XH1A 5AR0A 3O5BA 2EWSA 4BR7A 4JHDB 1G99A 1X9JA 1NBWA 3L4IA 4JHDA 3DXKA 3H45C 1C0FA 3VEYA 3WUHA 3VESA 1LCUA 2BUPA 3VEWA 3FZMA 4JD2B 1DKGD 3DJCA 4BGAA 1GLEG 1HKCA 1S22A 3IFRA 3CETA 2H3GX 4FSVA 2W40A 4JD2A 4BR5A 3GDQA 4WQ5C 4FWOA 5AQMA 3HSCA 4M7YA 3MN9A 4XH4A 3A5OC 3BP8A 5ADXA 3KVGA 1SAZA 2ASOA 3ZX2A 3A5MC 1HKGA 5BR9A 1E4FT 4FOIA 4ISGA 2QW9A 2F9WA 3R6MA 4A62A 4AM7A 1RGIA 4QS8A 4EAHD 3MN6A 3LL3A 3QBXA 5E84A 1TUYA 3D2EB 1XC3A 1IG8A 5AQWA 1MWMA 2A40A 4DHYA 1RDWX 2P9KB 3WXKA 4H5NA 3D2EA 4O8KA 2A6AA 4BRNA 1C0GA 4BRKA 5TKYA 2P9KA 4B1UB 3LM9A 3BEXA 4CZIA 4A2BA 3QDKA 1BDGA 4MO4A 5AQTA 2E1YA 1U6ZA 5AQQA 1BOTO 4PKIA 4K41A 4BG9A 3BUZB 4HTLA 4BRIA 2P9NB 3MCPA 5AQZA 4WYBA 1Q18A 4BRGA 3UB5A 3ENHA 2FLOA 1BU6O 2P9NA 1CZAN 1GLBG 4BR0A 3U9ZA 2VYPA 3SMSA 3QB0A 5BPMA 3CJ9A 3O6WA 2D0OA 5EOYA 1HLUA 4FPBA 3J8AA 4PL8A 3ZX0A 3VEOA 3VGKA 4BRDA 4MO5A 3EZWA 2AP1A 1EQYA 3ID8A 3VF2A 3A5NC 5ELZA 1NGFA 3R9PA 1GLCG 3UE5A 5AQSA 3M1FA 5JICA 3O8MA 2GWKA 2YJEA 3AARA 3EN9A 2PBDA 1YUWA 2ZWHA 3GG4A 1ZBSA 3WT0A 1ATRA 4CD1A 2P9LB 5JMVA 2V7ZA 4FWQA 5BN8A 4J8FA 4E1JA 3QMLA 2P9LA 1IJJA 2E20A 4CZMA 3FE1A 5AQUA 5E26A 3FFKB 5AQHA 4BRHA 5KQDA 4BRMA 5AQJA 1T44A 1ZC6A 2YI1A 4H0XB 3IUCA 3HZ6A 1BWFO 5BN9A 2YHYA 4RWTA 1YAGA 3G25A 3WEEB 1HKBA 1HPMA 3FZHA 4B1XB 5AQRA 3RSEB 4XEIA 1ESVA 3L6QA 2FSKA 1WOQA 1MWKA 3DXMB 3RSEA 4H0OA 1GLLO 5FPEA 1NGIA 5F2RA 2Q0UA 1X3MA 3SJHA 3DXMA 3SK3A 4H0TB 4IXCA 3AY9A 4EHUA 2QWPA 1QZ5A 3LDNA 1BG3A 1HUXA 3HM8A 4K25A 4H5TA 2D0PA 4CBXA 1JCFA 3CJCA 3P4IA 3IDHA 3MMVA 1BUPA 5AZIB 5KQ8A 3O1WA 3EO3A 5ADXH 4BR9A 3ATVA 5AZIA 3GBTA 3MDQA 2V7YA 1JCEA 2E1ZA 4MLEA 1LOTB 2ZGYA 3H46O 4AM6A 2QWNA 1OKJA 4H5RA 4BQZA 1E4GT 3UKUB 5F0XA 4NO7A 5LJWA 1ATSA 4FWNA 5F1XA 3VGLA 1QHAA 5BREA 2E88A 3UKUA 1BA0A 2V51B 3WXJA 5AQPA 3BF1A 3GE1A 4BRQA 1SQKA 3CERA 4FWMA 3SLCA 3CJAA 2FXUA 5EY4A 1NGGA 3LDPA 3VOVA 3CJ1A 4FWPA 4CZJA 1NGJA 2AA4A 3LDQA 3B8AX 5AFUA 2Q31A 2HOEA 4BGBA 2ASMA 4H0PA 2CH6A 5AZJB 4BRPA 4JNEA 1GLFO 2P9PB 5AQGA 5AQLA 4NB4A 3W0LA 1V4SA 3FLCO 4B1ZA 2UYTA 4GY2B 5AZJA 4CBWA 1V4TA 2P9PA 4CI6A 4H5WA 1NGBA 3VF6A 1XUPO 3O4WA 4DB3A 1K8KB 4FWLA 3U9DA 2D1KA 4FOEA 4KBOA 1YXQA 1K8KA 3H6EA 4DCHA 2GELA 1BA1A 5BPNA 4ISEA 1NGCA 3DAWA 3VEXA 1P8ZA 4Z94A 4FWKA 4BROA 3FR0A 2KHOA 3U8XA 5AQYA 4LC9B 4CZLA 1HX1A 4RCHA 2GTDA 4B1VA 1QQNA 5EXWA 4M7XA 4PKGA 4QS7A 2OANA 2A41A 4PKHA 5B8HA 3WXLA 4RTFD 4WQ4A 1Z05A 3L0QA 2P9IB 1DEJA 1T6CA 2IVPA 3VGMA 1J6ZA 3F9MA 4BG8A 5BRDA 2GEMA 3LDLA 1T6DA 3AAQA 3WQUA 1KAYA 3CQXA 4B1WB 1HJOA 5LJVA 1NWKA 2A42A 2E8AA 4BC3A 4IJAA 2FSNA 3D2FB 1ATNA 4BQLA 2E2OA 3CJBA 3AAPA 2FSJA 5AQXA 3D2FA 4GNIA 1BO5O 4BRFA 3QFUA 2E2NA 4BVPA 1NGAA 3WEEA 3CJ7A 4BC2A 5AQNA 4XH5A 4IO8A 4CJ7A 3VETA 3FGUA 5LY3A 3BF3A 3UKRB 4O5FA 3M3ZA 3ZETB 3WXIA 4FL9A 3UKRA 5BRHA 3ZETA 4I6MB 4K42A 2ASPA 1NGEA 2Q1NA 1NM1A 1U2VB 2J4RA 2HMPA 2VCPA 4I6MA 3VPZA 4CZHA 4A2AA 3VF4A 2GWJA 3W3DA 1GLDG 1U2VA 4B9QA 1WUAA 2QWQA 1R59O 4BC4A 3FZFA 3QFPA 1MA9B 2Q97A 2QWOA 3DXKB 2NZTA 2ITMA 4H0VB 4DQ8A 4CZFA 5FPDA 2CGLA 3ZX3A 1QQMA 3QICA 1Y64A 4H03B 2Q2RA 4IZ9A 2ZF5O 4EHTA 1NMDA 1NGDA 1YVNA 3HTVA 3KZBA 2BTFA 1Z6RA 3MN7A 1S3XA 1X3NA 4Y0WA 2I7NA 2CGJA 1KXPA 5KPZA 1MDUB 2YCHA 2YJFA 3IMXA 4FPAA 3SMPA 5AFUH 2E2QA 4C23A 4L3QA 4CZKA 3VEZA 4EFHA 5EVZA 3H1VX 5BRFA 3A0IX 2DPNA 5FPNA 2PAVA 4FWSA 2F9TA 4JN4A 3C7NB 2YHWA 3MK6A 2HF4A 3S41A 5EX5A 2NLXA 5CE3A 3ATUA 3C7NA 2Q0RA 1KAXA 1XQSC 4WQ4C 3M6GA 2CGKA 4B1YB 2HF3A 4H5VA 1H1VA 1ZXOA 2A3ZA 4FO0A 4F9OA 1JCGA 4CD3A 3A5LC 3D7EO 3FZKA 4CZGA 3WQTA 3U4LA 2FF6A 5KPTA 4BRCA 2QWRA 2FF3B 3ENOA 3ZEUB 3A8YA 4BRLA 3C0BA 4IJNA 3TPQA 4WQ5A 3ZEUA 3H1QA 2P9UB 2A5XA 1NGHA 3LDOA 1TYQB 4BVOA 3H3NO 5AQIA 3ULEB 2YHXA 4YDUC 3VEVA 3H3OB 2P9UA 3GOIA 4FWRA 4ISFA 4MLHA 3I33A 4JAXA 1TYQA 4BC5A 3CQYA 4CZEA 5JLHA 3O1BA 1NLVA 3ULEA 1GLJO 1SZ2A 4A61A 3EL2A 4CBUA 1GLAG 3O80A 5I9EB 3MN5A 2WUSA 3O08A 2Q36A 3CI5A 3GL1A 2IVOA 5AQVA 3I8BA 2E2PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

2OPPA 1WNSA 4CF2A 3SQ2A 1KC8O 4PL7A 4B9MA 2GBZA 2O8DA 4CGFA 2IIRA 1VSFA 3THXA 2FBYA 2IVNA 4EIAA 2ZGZA 3CHWA 4BDZA 3BZCA 1LV5A 1KRPA 1CXUA 2NRHA 3WXMB 1ITGA 2O8FB 1W9HA 1IKXA 4Y1DA 3R8EA 2QK9A 3FZLA 4PQUA 2IGIA 1VQMN 2CH5A 4FJ8A 3K5NA 4IOCL 4CHYA 3OYMA 4CGHA 5LMNK 3SCXA 4RW9A 1JXEA 5GAEP 3O3HA 3OYLA 4WE1A 3JXUA 2JDQD 2QWLA 2VWBA 4K43A 1NH5A 4BE1A 4PY5A 4PA1A 3NF8A 2QXLA 2JWLA 4FJ7A 1SUQA 4QS9A 5MLCQ 3TTCA 3C6TA 4KHWA 1RFQA 4UADE 4JKBA 5AR0A 2KFZA 1JKZA 1JJ2M 3NGZA 1G99A 3OS0A 3THWA 1YIJN 1XHZA 3T7ZA 3MX5A 3H45C 4AHCA 3LPTA 4CEDA 2VWKA 2KPYA 4AH9A 2X78A 3T1HK 3LZJA 1HR0K 3FZMA 5DMRA 1NKBA 3ZT0A 2M8BB 1DKGD 3DJCA 4YOVA 1GLEG 1HKCA 4FVUA 3CETA 4FSVA 2W40A 4JD2A 4BR5A 1X9SA 1VSEA 4WQ5C 4TSXA 1JLBA 5AQMA 2KZZA 4M7YA 1XWLA 4HCCA 2NNWA 1EP4A 3FFIA 1YTUA 1I6GA 3A5MC 5C2FA 2G8WA 5BR9A 4ISGA 2F9WA 2LN8A 3SZ2A 1SKRA 4IFEA 1IH7A 3T19A 5JVGL 1TI5A 3QBXA 2YBRC 2D5RA 1IG8A 1X9MA 5AQWA 2DY4A 4O8KA 3KOYA 1T03A 1ILYA 2KBJA 1C0GA 5CYQA 2P9KA 4B1UB 2NY9X 4CJTA 5IT9O 4CZIA 4DR6K 4DFPA 4X66K 4PKIA 1Q18A 1WWNA 3EE9A 4BRGA 3ENHA 2OA8A 1BU6O 3KC6A 2OZMA 1CZAN 3U9ZA 1IBMK 5BPMA 3KOWA 3PSIA 5LL6Z 3J8AA 1C6VA 3AO2A 4KHNA 4JKGA 3VA3A 4J2DA 4MO5A 3NF7A 4Y1CA 1EQYA 3QEPA 1S6QA 1GLCG 3UE5A 3KLGA 4FLTA 1MYNA 1QE1A 5AQSA 1SKSA 2PBDA 3MEDA 1YUWA 4DTJA 1ATRA 1C0MA 1LWFA 2P9LB 3TSPA 5C12A 3RVCA 1L5UA 3A2FA 2OCEA 4KHUA 2LSNA 3J7YP 4L8RB 1WSGA 4KKOA 4QCLA 4BWMA 4IG3A 3PIPL 4AILC 4LFCK 5JS1A 1Z26A 2NRWA 1I2UA 3VQPA 5KQDA 3OTOK 3TAQA 4G1QA 2VG5A 5BN9A 1XNQK 2YHYA 4RWTA 3AO5A 1HKBA 3MAQA 4GKKK 5AQRA 4E72A 4CJUA 2E5LK 4JK7A 1XRSB 1WOQA 1WSEA 3DXMB 3RSEA 1VK0A 5GADP 1S1UA 1X3MA 1RCHA 4FJKA 3J80O 1RBSA 4C8LA 4H0TB 4IXCA 1NK0A 1BG3A 3HPGA 1HUXA 3SUQA 4H5TA 4CBXA 4DV7K 1JL1A 1K73O 5SZTA 1U48A 3IAYA 2O8EA 5AZIB 5KQ8A 2NRZA 1IO2A 4BR9A 2V7YA 1LOTB 1OVQA 3KLIA 4AQYK 4NXMK 3AO3A 3DRSA 2E88A 1L3VA 4FWMA 1NGGA 1BHLA 4F2RA 1KLNA 4CJRA 3AGRA 1NGJA 1KFSA 1AHOA 2PZSA 3LDSA 4DTMA 2HOEA 2ASMA 3DOLA 1WAFA 2UU9K 4I2QA 5AZJB 4W5QA 3QESA 5AQGA 3TSUA 4GY2B 4FW2A 4FZYA 3HPOA 3DRRA 5C25A 2OZSA 2HNDA 4O4GA 1SL1A 3VF6A 1XUPO 3O4WA 4AF1A 4DSKA 3CCJN 4E7HA 1C1CA 4IEIA 3H6EA 3KWIA 1NGCA 1OH7A 3KLHA 3FR0A 3ASMA 1POIA 2YNFA 4B1VA 4CF1A 4JI5K 5EXWA 3OYFA 3BZKA 4PKGA 4CFDA 4M42A 4QS7A 4CERA 3CPWM 2A41A 4EP4A 4DSEA 4I7FA 3R2VA 3WXLA 2NRRA 4OPKA 4WQ4A 1BQNA 3K9JA 1HQEA 1T6CA 2IVPA 1EO1A 1J6ZA 3F9MA 4O0JA 3AVJA 3LDLA 4CHOA 4B1WB 1HJOA 4DLGA 3NF9A 2HHIA 4IJAA 4DFKA 1EETA 3NGIA 1NK9A 3WNFA 3ULDA 1NJWA 2VGNA 1NJYA 4BE2A 2QKKA 5LMUK 4BQLA 2E2OA 3CJBA 3SF4D 3AAPA 4ZHRA 1N8RO 1NKEA 1BO5O 2E2NA 4BVPA 1NGAA 4IG0A 3O3GA 4XH5A 3HP9A 2N69A 3FGUA 3E9PA 3NBPA 3UKRB 4O5FA 4M3UA 1PTXA 3IKMA 4FL9A 1NK5A 1VSJA 2ASPA 3QETA 3I0RA 2JGUA 3ZSOA 1U2VB 2J4RA 1GOBA 4Z0UA 1OH8A 3V9XA 4B9QA 3MXJA 3AA2A 4CW7B 3FZFA 2Z1JA 2VGMA 4NCGA 4C8KA 1NK6A 3DXKB 2ITMA 3JSMA 4CJPA 3CMEN 1BK8A 4RW7A 5FPDA 3O9QA 1TK0A 1FW6A 3L2RA 1F21A 3QICA 4NXNK 3K5LA 1Y64A 4IZ9A 4JV5K 2X6SA 2ZF5O 3MECA 4KTWA 4H8KA 4CEOA 1U45A 4B9NA 4LFAK 3HTVA 5CHIA 4M3XA 4CGGA 3OVNA 1JLFA 4Y0WA 2CGJA 1MDUB 2YCHA 3THYB 1SV5A 1VQLN 2ATBA 1RBTA 4C23A 4EFHA 5BRFA 5HLFA 5EVZA 3AGKA 3A0IX 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2OPP A;  1WNS A;  4CF2 A;  3SQ2 A;  1KC8 O;  4PL7 A;  4B9M A;  2GBZ A;  2O8D A;  4CGF A;  2IIR A;  1VSF A;  3THX A;  2FBY A;  2IVN A;  4EIA A;  2ZGZ A;  3CHW A;  4BDZ A;  3BZC A;  1LV5 A;  1KRP A;  1CXU A;  2NRH A;  3WXM B;  1ITG A;  2O8F B;  1W9H A;  1IKX A;  4Y1D A;  3R8E A;  2QK9 A;  3FZL A;  4PQU A;  2IGI A;  1VQM N;  2CH5 A;  4FJ8 A;  3K5N A;  4IOC L;  4CHY A;  3OYM A;  4CGH A;  5LMN K;  3SCX A;  4RW9 A;  1JXE A;  5GAE P;  3O3H A;  3OYL A;  4WE1 A;  3JXU A;  2JDQ D;  2QWL A;  2VWB A;  4K43 A;  1NH5 A;  4BE1 A;  4PY5 A;  4PA1 A;  3NF8 A;  2QXL A;  2JWL A;  4FJ7 A;  1SUQ A;  4QS9 A;  5MLC Q;  3TTC A;  3C6T A;  4KHW A;  1RFQ A;  4UAD E;  4JKB A;  5AR0 A;  2KFZ A;  1JKZ A;  1JJ2 M;  3NGZ A;  1G99 A;  3OS0 A;  3THW A;  1YIJ N;  1XHZ A;  3T7Z A;  3MX5 A;  3H45 C;  4AHC A;  3LPT A;  4CED A;  2VWK A;  2KPY A;  4AH9 A;  2X78 A;  3T1H K;  3LZJ A;  1HR0 K;  3FZM A;  5DMR A;  1NKB A;  3ZT0 A;  2M8B B;  1DKG D;  3DJC A;  4YOV A;  1GLE G;  1HKC A;  4FVU A;  3CET A;  4FSV A;  2W40 A;  4JD2 A;  4BR5 A; 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2QWPA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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