2QWPA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the adp*pi form #2
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
386
structure length
386
Chain Sequence
b'GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
source organism Bos taurus
molecule tags Chaperone
total genus 123
structure length 386
sequence length 386
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwpA04
4B1UB 4JAXA 5AQKA 4CZKA 3SMSA 2FSJA 2YHYA 5LY3A 4BROA 4BRDA 1X3NA 1HLUA 3FGUA 5F1XA 3CETA 4K42A 1U2VB 2OANA 3GE1A 4BR4A 3UE5A 2FXUA 1NM1A 3R6MA 4E1JA 1MA9B 4H5WA 3VF6A 5ADXA 1NBWA 4H5VA 1QHAA 4CBWA 1HX1A 1SQKA 3WXJA 5BR9A 3F9MA 4BRMA 1NGAA 1GLBG 2CGLA 5AQTA 4WYBA 4XH1A 3O6WA 1T44A 1XQSC 2YHWA 2ZF5O 1U2VA 4FWOA 4K41A 1NGBA 3GL1A 4CZFA 3EKSA 5LJVA 3HI0A 3GBTA 1QQNA 2QWMA 4A61A 2A41A 1RDWX 2P9UA 4FWNA 2I7PA 2NZTA 4WQ4C 3TPQA 2ZGYA 2P9KB 3GOIA 5JMVA 4CZMA 1WUAA 1ZC6A 4DCHA 1V4SA 5AQOA 1BA0A 1C0GA 2E2PA 3ENOA 1NGGA 4M7YA 1X3MA 5I9EB 4BREA 2Q97A 3R9PA 2GELA 4XH5A 1ATRA 4IJNA 1GLFO 3S41A 3O1WA 1Y64A 2E2QA 2A5XA 3EL2A 3IMXA 4A2AA 2UYTA 5JLFA 3H1VX 4H03B 2P9KA 5AQPA 1Z05A 4BR0A 4FWLA 1BA1A 5B8HA 1GLDG 3JS6A 3ZETB 4BRKA 1ESVA 2VCPA 2YI1A 3I8BA 3IFRA 5FPMA 5BREA 3VPZA 3ULEB 2ASPA 2Q31A 3MMVA 4BC3A 1BOTO 3U4LA 2V7YA 3QB0A 5EOYA 1HUXA 5AQHA 4DHYA 5KPRA 3ZX3A 3LM2A 3EO3A 4PKIA 3SMPA 1GLAG 1NGCA 1TUUA 1BUPA 4BR7A 5ELZA 3LDQA 4B1ZA 3CJCA 4A62A 4CZGA 2IVNA 4KBOA 1R59O 4IZ9A 4CBXA 3VGMA 2ASOA 3ZETA 3HM8A 3ID8A 5AR0A 3L4IA 2YHXA 3WQUA 4EIAA 4FWSA 3M6GA 3VF2A 3ULEA 5BN8A 4BG8A 2Q1NA 3LDNA 2QWRA 3ZX0A 2KHOA 2VWBA 4EFHA 5KPTA 4EHUA 5AQUA 4IWVA 4FWQA 1G99A 3CQXA 2QWPA 3WXIA 3WXKA 4BQLA 2E2OA 3CERA 5JLHA 3L0QA 3SLCA 3MCPA 5AQRA 3AY9A 1BDGA 3UKUA 4C23A 4BRFA 1MWKA 4QS9A 1T6DA 1BG3A 3FZLA 3ATUA 4WQ5A 4PL7A 2D1KA 4DB3A 1HKCA 1BO5O 2FLOA 5AFUH 3B8AX 3VEZA 2PAVA 4NO7A 3M3ZA 3O1BA 4IXCA 3BP8A 1LOTB 3FZKA 2E1ZA 1NWKA 4HTLA 3L6QA 3W3DA 3EN9A 1ZXOA 2NLXA 1JCGA 2P9UB 3EKUA 3EZWA 5AQYA 3QICA 1KAXA 2A40A 3DAWA 5AQZA 3H3NO 1YXQA 3CQYA 4ISGA 2E1YA 3FLCO 5AZIB 5AQVA 5FPDA 3WXLA 3VESA 4FWKA 1NGDA 3SJHA 2QWNA 2W41A 3R8EA 1JCFA 5EVZA 3AAPA 2HF3A 1QQMA 2D4WA 2AA4A 3CHWA 1JCEA 5ADXH 1ATNA 2FF6A 2QWQA 2CGKA 3WQTA 4BC2A 2QWOA 1IG8A 1V4TA 3DWLA 3VETA 4I6MA 4RWTA 5AZJB 2PBDA 3O08A 3FZHA 2ZGZA 4M7XA 1QZ5A 3D2FA 4K43A 2D0PA 4CZEA 2WUSA 4JD2A 5AZIA 1S22A 2F9WA 1NGFA 1Z6RA 4FL9A 1K8KB 1XC3A 1GLEG 4BVOA 2V51B 3CJ9A 3W0LA 3HZ6A 3IUCA 3RSEB 5E84A 4FOIA 4O8KA 4A2BA 4MLHA 4MO5A 3VEWA 5AZJA 5F0XA 5AQFA 4NB4A 2IVPA 3CJ1A 4BR2A 5EY4A 2ASMA 2NRHA 5AQIA 4GY2B 3I33A 4IO8A 1K8KA 3A0IX 3AAQA 4BGBA 4H0XB 2HOEA 4BG9A 2P9PB 4LC9B 4BRPA 1YUWA 1T6CA 3ZX2A 3RSEA 3VGLA 3DXMB 3KZBA 3O80A 2GEMA 4FPBA 3DXKA 3LM9A 4PKHA 4RCHA 5AQWA 2H3GX 1OKJA 3G25A 5BRDA 4FSVA 1BU6O 1XUPO 4CI6A 4YDUC 1NMDA 3UKUB 1J6ZA 4MLEA 3VOVA 2HMPA 3WT0A 3MN7A 4H0YB 4BC5A 3FZMA 3O5BA 2CH6A 1CZAN 2GTDA 4CJ7A 2AP1A 4CZLA 3D2EA 1DEJA 1NGIA 1DGKN 4BRCA 2Q2RA 4FPAA 5FPEA 3A5MC 3FZFA 4PL8A 2P9PA 4BRQA 2W40A 3DXMA 4JNEA 2E2NA 3WUHA 1SZ2A 3VERA 3SK3A 1RGIA 1C0FA 2P9LB 3HTVA 3OHRA 2GUPA 2BTFA 5BN9A 1GLJO 3M1FA 2EWSA 1E4GT 3BUZB 3BF3A 2V52B 3WEEA 2ZWHA 1D4XA 2ITMA 1RFQA 4K25A 4FWPA 5KQDA 4ISFA 2QW9A 1QQOA 4CZHA 3AARA 2Q0UA 4H0VB 5CE3A 5AQJA 2CGJA 5AQQA 1P8ZA 4RTFD 4XH4A 4BRIA 4I6MB 5BPMA 2P9LA 4QS8A 5BRFA 4XEIA 3H6EA 4B1WB 3ENHA 1DKGD 4BR9A 1HJOA 3D2FB 4HWIA 4BQZA 1QZ6A 3QFUA 1BWFO 4JD2B 4JHDB 3VEYA 4BGAA 4F9OA 3LDLA 1U6ZA 1ZBSA 3U9DA 3VEVA 2A6AA 1TYQB 2QWLA 3MN6A 4QS7A 5LJWA 1S3XA 3CJAA 3QBWA 3BF1A 5AQNA 2E88A 3CJBA 4CZJA 5BRHA 1NGHA 4GNIA 2IIRA 3QMLA 1IJJA 2FF3B 3UKRA 5TKYA 4H5RA 3GDQA 4ISEA 4CD1A 2HF4A 4H5NA 5AQSA 2IVOA 3H1QA 1KXPA 3MK6A 4BVPA 3CIPA 3HBTA 1YVNA 4BRAA 4AM7A 3ZEUB 5BPLA 4JHDA 3D7EO 1TYQA 3A8YA 3TU5A 2E20A 3CI5A 2Q0RA 2Q36A 4O5FA 4BR5A 1ATSA 3HSCA 3LDPA 4WQ4A 4FWMA 3DXKB 3CJ7A 2BUPA 2YCHA 4M63C 2VYPA 3P4IA 2I7NA 3DJCA 5EX5A 1GLLO 2GWJA 1HPMA 3ZEUA 4EHTA 5BPNA 1EQYA 2A42A 2YJFA 1GLCG 3H45C 4L3QA 3FFKB 3QDKA 3D2EB 1NLVA 1Q18A 2CH5A 1YAGA 3C0BA 4MO4A 2P9IB 3BEXA 3GG4A 4PKGA 3A5OC 4FOEA 4B9QA 1TUYA 2V7ZA 2YJEA 3VEOA 4J8FA 4H0PA 4FWRA 1X9JA 3H3OB 5JICA 4H0OA 4CBUA 2FSKA 4CD3A 5KPZA 4FO0A 4B1XB 3VEXA 5AQXA 3VENA 2DPNA 2J4RA 2D0OA 2P9SB 3O8MA 5AQMA 4JN4A 4BRNA 1MWMA 3C7NB 3WEEB 1HKBA 2F9TA 2GWKA 3A5LC 2P9IA 4Z94A 3MN5A 1NGEA 4EAHD 4IJAA 3QFPA 3ATVA 3O4WA 3KHYA 3QBXA 2P9NB 4YDUA 1LCUA 2QM1A 5AQLA 1KAZA 5FPNA 5AQGA 3FE1A 4B1VA 3FR0A 4BRHA 4H5TA 3VGKA 2QXLA 4Y0WA 1WOQA 3U8XA 3A5NC 2P9SA 3J8AA 4B1YB 3C7NA 5E26A 4WQ5C 4BRLA 1E4FT 1SAZA 4BC4A 3JXUA 3KVGA 3IDHA 5AFUA 3VF4A 3MN9A 4BRGA 3U9ZA 3H46O 3MDQA 4CZIA 4DQ8A 2A3ZA 2FSNA 1KAYA 2P9NA 3UKRB 1NGJA 5KQ8A 1H1VA 3LL3A 5EXWA 1HKGA 4AM6A 3LDOA 2E8AA 5F2RA 3UB5A 4H0TB 1MDUB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KKZA 4JAXA 5SZTA 1NRAA 3NGZA 3T1HK 1QHTA 3VQQA 1HYSA 4W5TA 2RN2A 4H8KA 1JLGA 4IKFA 2YX6A 4DR6K 2OANA 3GE1A 1AHOA 1RT1A 4KB1A 4ILHA 3VF6A 4M3ZA 1O13A 3H08A 1HX1A 1BL3A 1VQLN 2F8TA 3SYZA 3K2PA 4BRMA 2E3FA 1U47A 1B9DA 5MLCQ 3THWB 1VQ7N 2VY6A 4CK2A 3KOWA 4PHTX 4GKKK 2ZF5O 1TKDA 3AVJA 4W5OA 2W6LA 2JLEA 1QQNA 2A41A 5HRSA 2ZGYA 2K35A 1VHXA 1Y97A 4CZMA 1WUAA 1ZC6A 3N4PA 1K73O 1BA0A 4FJKA 1KSPA 2UUCK 5I9EB 4A57A 3HPHA 3L2UA 1IBKK 4IJNA 1X9SA 4KFBA 1Y64A 5FRNA 2A5XA 2UYTA 1M1KO 1S1VA 4JS5A 2XY7A 4CF2A 5FROA 5AQPA 2RPIA 3TWHA 4B9UA 1BA1A 3HM9A 4CIEA 4G1QA 4LD0A 2YNIA 1RDDA 1WSIA 1DTTA 2YI1A 3L2WA 3KOXA 2D0BA 3U3GA 2Q31A 1BOTO 1T8EA 3C95A 3QB0A 5AQHA 4DR4K 3V6DA 1IKWA 1RTDA 2OA8A 1TUUA 4FM2A 3UIQA 1VSMA 2LR3A 3OYGA 4DTRA 2E6LA 1ASWA 3AVFA 2YNGA 3NGYA 4CGGA 2NY8X 3HM8A 3ID8A 4LF7K 2HBJA 3WQUA 2D5RA 1Q82O 3QEWA 3VF2A 1TVRA 2QWRA 2RE2A 1XC9A 4JI2K 3SQ2A 3PO4A 3HP9A 4EHUA 5AQUA 5FRMA 1TL1A 4LH4A 3CQXA 4QCLA 3KWGA 3WXKA 4FJ7A 4BQLA 5JLHA 1WBDA 4CEQA 3ASMA 4IOAL 1RBTA 2G8UA 1BDGA 3MEDA 3FZLA 1NK0A 4CF1A 4PL7A 2B68A 1YTUA 4DB3A 1BO5O 1RTIA 4Y1DA 4OX9K 3VEZA 4NO7A 4CIGA 1OH8A 1NWKA 1BHLA 3NMUA 2ATQA 1ZXOA 4AHRA 2IGIA 3ZSOA 4GKJK 1T3VA 1JZAA 5AQYA 3QICA 5FDLA 1KAXA 3RR7A 4KHWA 5M1PA 3WXMB 1I2VA 1ZBIA 3DAWA 5AQZA 1ZBUA 1ITGA 3FLCO 3JYTA 4JKEA 3HYFA 5AZIB 4XIUA 3VESA 4CJVA 2M8BB 1RNHA 5ADXH 4NXMK 4BC2A 3VETA 4RWTA 4CJPA 3MEGA 2O8EA 4ZHRA 1QZ5A 3D2FA 2D0PA 4W5RA 2G8KA 1NGFA 3SQ0A 4X65K 4BVOA 2HHTA 1OH6A 3MAQA 3HZ6A 3VQ6A 4YFUA 1ZBFA 4FK2A 4NLBA 1D5AA 3E9PA 4O8KA 4YOXA 4A2BA 3QESA 2YBRC 3D0PA 1XNQK 1DT9A 1YIJN 4KREA 5F0XA 4NCBA 3VMFB 1S1UA 5EY4A 1YITN 2ASMA 2HHSA 1IO2A 1JLQA 2NRHA 3OYEA 3TAQA 3DOLA 3PX0A 2O8BA 1ASVA 1Q86O 4J2AA 4DTUA 4KPYA 4H0XB 3NF6A 2HOEA 1ASUA 3CMAN 4BG9A 2KGQA 2P9PB 3AA2A 3RSEA 2VG6A 4CESA 3DXMB 3O80A 1Q9YA 2XHBA 4PKHA 2NRWA 3G25A 3AVKA 1KLNA 1XUPO 1CZ9A 4Z4CA 4YDUC 3OYBA 5I42A 1RDCA 1C1BA 3F2KA 4F2RA 3N4QA 3MN7A 1VQKN 3FZMA 2CH6A 4CJ7A 4CZLA 3SAFA 1VQ9N 2HMIA 3ZT0A 4FPAA 4DR1K 3L2RA 2LT8A 2OPRA 3L3VA 3K57A 4V19S 2QKBA 3SPYA 2XY5A 1VNBA 4YY3K 3QEXA 4G9ZA 5M1OA 2DFHA 2IDOA 4DV0K 3OHRA 5JENA 3K5OA 4WE1A 2O8DB 1TAUA 2C1IA 2BTFA 1BCOA 4OKEA 4BDZA 1B92A 3BF3A 3CC7N 3AVGA 4HUFA 4JS4A 3WEEA 4KHPK 4IBNA 4RW9A 5KQDA 3G4SN 2QW9A 4FLXA 3RMBA 3AARA 2Q0UA 3E9LA 5DMRA 3SI6A 5AQJA 3O9RA 1JXEA 5DM6L 4C8LA 1L3TA 3VTIA 2KZZA 2XRIA 5BRFA 2OZSA 3DLBA 2O8EB 1ILYA 3ENHA 4BR9A 3R3LA 4RW8A 3V9SA 3D2FB 4FW2A 4BQZA 1QZ6A 3QFUA 1BWFO 2X6SA 2HW3A 4M3RA 3VEVA 3MN6A 4KO0A 3CQ8A 1W2BM 2E88A 2SN3A 4HHFA 1MU2A 3UKRA 5TKYA 4M3WA 2C1GA 3SUPA 1JLAA 2VWKA 4ISEA 4CD1A 2DFFA 2A7TA 2HF4A 4F8RA 3ZCMA 5AQSA 2IVOA 3H1QA 3MK6A 3CIPA 4O5BA 1NMNA 1TK8A 1D9FA 2O8BB 3LALA 1IKXA 4DFPA 4NXNK 3A8YA 3TU5A 1NKEA 1TL3A 1NOYA 2LI7A 3CI5A 3BGRA 4LSNA 4ELVA 4BR5A 4DG1A 1ATSA 1BQMA 5JS1A 1VSDA 4NCAA 3LDPA 3ZT4A 4JI4K 3ZT1A 4CJWA 2E5LK 3CJ7A 4M63C 5HROA 2VYPA 4J2DA 4FK4A 1QSYA 4ILJA 4W5NA 4WFAL 4DSFA 3DJCA 2PYJA 2GWJA 4DV1K 3LP1A 3PSFA 2NRXA 1L3VA 1BI4B 1TK5A 4CGDA 1BCGA 2HHUA 4WFBL 3C0BA 3MEEA 3BEXA 4GMJB 2D56A 4OJRA 1J5OA 2A1SA 1K9MO 1W9HA 3LP2A 4EP4A 2V7ZA 3HVRA 4J8FA 2F4VK 4CERA 2KBKA 2FSKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2KKZ A;  4JAX A;  5SZT A;  1NRA A;  3NGZ A;  3T1H K;  1QHT A;  3VQQ A;  1HYS A;  4W5T A;  2RN2 A;  4H8K A;  1JLG A;  4IKF A;  2YX6 A;  4DR6 K;  2OAN A;  3GE1 A;  1AHO A;  1RT1 A;  4KB1 A;  4ILH A;  3VF6 A;  4M3Z A;  1O13 A;  3H08 A;  1HX1 A;  1BL3 A;  1VQL N;  2F8T A;  3SYZ A;  3K2P A;  4BRM A;  2E3F A;  1U47 A;  1B9D A;  5MLC Q;  3THW B;  1VQ7 N;  2VY6 A;  4CK2 A;  3KOW A;  4PHT X;  4GKK K;  2ZF5 O;  1TKD A;  3AVJ A;  4W5O A;  2W6L A;  2JLE A;  1QQN A;  2A41 A;  5HRS A;  2ZGY A;  2K35 A;  1VHX A;  1Y97 A;  4CZM A;  1WUA A;  1ZC6 A;  3N4P A;  1K73 O;  1BA0 A;  4FJK A;  1KSP A;  2UUC K;  5I9E B;  4A57 A;  3HPH A;  3L2U A;  1IBK K;  4IJN A;  1X9S A;  4KFB A;  1Y64 A;  5FRN A;  2A5X A;  2UYT A;  1M1K O;  1S1V A;  4JS5 A;  2XY7 A;  4CF2 A;  5FRO A;  5AQP A;  2RPI A;  3TWH A;  4B9U A;  1BA1 A;  3HM9 A;  4CIE A;  4G1Q A;  4LD0 A;  2YNI A;  1RDD A;  1WSI A;  1DTT A;  2YI1 A;  3L2W A;  3KOX A;  2D0B A;  3U3G A;  2Q31 A;  1BOT O;  1T8E A;  3C95 A;  3QB0 A;  5AQH A;  4DR4 K;  3V6D A;  1IKW A;  1RTD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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