2QWQA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the amppnp hydrolyzed form
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
source organism Bos taurus
molecule tags Chaperone
total genus 115
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwqA04
3FZKA 4NB4A 3O1BA 3R6MA 4FWLA 3VPZA 1T44A 2CGLA 3VETA 2YJEA 3AY9A 3FGUA 1HPMA 4J8FA 3A8YA 3HI0A 4CZIA 1KAZA 4BRAA 3WQTA 1ATRA 5AQJA 1NGFA 2YHWA 4CBWA 4A62A 3IUCA 1RFQA 4CD3A 3QBXA 3GBTA 3CJ7A 5BN9A 4FPBA 3CJAA 1T6CA 4PL8A 3CJ9A 4B1WB 3VEVA 2QWQA 3SK3A 1ZXOA 4RWTA 1BDGA 5BRFA 4CZMA 4BR5A 1TUYA 1NWKA 3O6WA 4ISGA 2ASMA 1BA0A 4H5VA 3ZX0A 1NGBA 3ULEB 1SAZA 5F0XA 4FWQA 3FZMA 2PAVA 3LDNA 1NBWA 3L6QA 1DGKN 2Q1NA 2GTDA 1KAYA 4MLEA 4LC9B 3BEXA 5TKYA 5KQ8A 5AQHA 4JHDA 4XH1A 3A5OC 1NGEA 2CH5A 2Q2RA 2YCHA 4PKIA 1ZC6A 1HX1A 3GDQA 2NLXA 2A42A 4H0OA 3VEYA 4IJAA 3HM8A 3FZHA 3FZFA 3VOVA 1BOTO 5AQIA 4CZKA 5EX5A 3VERA 2E88A 3R9PA 4BR7A 3U9DA 3JXUA 5AQOA 4XH5A 3H3OB 5AR0A 1TYQB 3ULEA 5AQNA 4H5WA 3QB0A 4B1VA 5AQKA 1LOTB 5BPLA 3A5NC 4BVOA 3HTVA 5AQYA 4A2BA 3EL2A 4JD2B 3KVGA 2FXUA 5FPDA 3GE1A 4Z94A 3WQUA 2J4RA 3KHYA 2A6AA 5AQWA 1TUUA 4BQLA 4WYBA 3VEZA 2NZTA 3ENHA 2E8AA 3MCPA 4BRPA 3ZEUB 1HLUA 3EZWA 5B8HA 1K8KB 1NGDA 1SQKA 4BRLA 4JNEA 3FZLA 2VCPA 5KPTA 1X9JA 2E2QA 2IVPA 4FL9A 4DHYA 4CZLA 4PL7A 5ELZA 1YUWA 1U6ZA 4FWSA 2QWLA 3DWLA 3VF6A 4I6MB 1DKGD 2V51B 1X3MA 2QXLA 2W40A 4BRMA 4BRGA 1MWKA 5AZIB 2EWSA 4EIAA 2CH6A 3U4LA 4HTLA 3CETA 4GNIA 2PBDA 4C23A 1BUPA 5AQGA 4FWNA 1J6ZA 2OANA 4A61A 3ZEUA 2V52B 1DEJA 3DXKA 3LM2A 4MO4A 4K42A 4AM7A 5AQLA 4CBUA 1V4TA 5CE3A 4CZGA 2I7PA 4EHUA 5F2RA 3WT0A 3TU5A 1RDWX 4I6MA 4DQ8A 5ADXA 5LJWA 3LDLA 2D0PA 3VESA 2FF3B 4Y0WA 2IIRA 3ZETB 3MN6A 3QBWA 2P9KB 3L4IA 2UYTA 3ID8A 5AZIA 2VWBA 5F1XA 3SJHA 3CJBA 1GLEG 5JICA 2FSJA 3D7EO 2P9NB 4B1UB 3MN9A 4JHDB 3LDPA 5AFUH 4MLHA 1HKBA 3VGLA 5AQRA 1XUPO 4H5NA 4H0YB 5AQTA 4BC5A 3DXMA 3CJCA 4CZFA 4CBXA 2ZWHA 3A5MC 2YHYA 3GOIA 3F9MA 3RSEA 1HJOA 2F9TA 3MN5A 2D1KA 3UE5A 3ZETA 1MDUB 3JS6A 1GLDG 3MMVA 3M1FA 2KHOA 1E4GT 3AAQA 4BR0A 3GL1A 2P9KA 4JAXA 4XEIA 3CQXA 3HSCA 3EO3A 4ISEA 3MDQA 4ISFA 4WQ4A 2P9NA 1NM1A 3UKRA 2P9LA 3AARA 5AQSA 1WOQA 2DPNA 3EKSA 4FWMA 4BC3A 2Q0UA 3C7NA 4GY2B 4BGBA 1P8ZA 5LY3A 1BU6O 3SMPA 4BRCA 1QQNA 2ITMA 4EAHD 4M7YA 4PKGA 2AP1A 4H0VB 2V7YA 2GUPA 3VGMA 4FPAA 1IJJA 3W3DA 5KPRA 1NGIA 3H45C 1ESVA 3UKUA 2E1YA 4BG9A 2P9IB 1NGGA 1IG8A 5EVZA 3QFUA 3VEWA 2D0OA 4BR2A 4WQ4C 2GWKA 1KXPA 5BR9A 3VGKA 1GLBG 2ZGYA 3WXIA 4DB3A 3CI5A 1JCEA 2Q36A 4BRKA 2AA4A 3QDKA 3DXKB 2QWOA 3WEEA 4CI6A 2P9UB 3O4WA 4WQ5A 1WUAA 4AM6A 3OHRA 3ATUA 2P9IA 4M7XA 3SMSA 3UB5A 2IVNA 1YAGA 2GEMA 3FE1A 4JN4A 4BVPA 2QWNA 3R8EA 3L0QA 3WXJA 4H0XB 5BRHA 5JLFA 3I8BA 1QZ6A 4RCHA 4FWOA 2QWMA 1EQYA 3DJCA 2YHXA 4NO7A 1QZ5A 1U2VA 2ZF5O 3IFRA 5FPNA 1GLFO 3H6EA 4L3QA 3DXMB 5AQPA 3CIPA 5AQVA 3AAPA 3VF4A 1RGIA 1NMDA 5FPMA 2FF6A 2P9UA 4BRNA 3TPQA 2FLOA 3RSEB 4XH4A 4BR9A 1BG3A 4H0TB 4B9QA 1LCUA 4BC2A 3LM9A 1OKJA 2P9PA 1NGAA 2P9SB 1Y64A 3DAWA 5I9EB 2CGKA 4BRDA 4IZ9A 5AQFA 1YXQA 2A40A 2VYPA 2YJFA 4QS9A 4BC4A 4IWVA 4QS7A 5EOYA 3UKRB 4EFHA 2HF3A 1ZBSA 2P9LB 3LDQA 1JCFA 1GLAG 1XC3A 2IVOA 1GLLO 3C7NB 5BN8A 1GLJO 1Q18A 4H03B 1MWMA 3QICA 1C0GA 1QQOA 1QHAA 2NRHA 4IXCA 3SLCA 4K43A 3S41A 2Q31A 5AQUA 4FSVA 1CZAN 2QM1A 3UKUB 4CZEA 1JCGA 3VENA 1C0FA 2P9SA 5E26A 3M6GA 3D2EB 1G99A 2QWPA 5KQDA 1ATNA 4F9OA 3FR0A 2E1ZA 3BF3A 4A2AA 4H0PA 3QMLA 2HMPA 2Q97A 3BF1A 2V7ZA 2A5XA 3KZBA 3IMXA 3CJ1A 3U8XA 2E2OA 3O8MA 2A41A 4KBOA 4K25A 4H5TA 5EXWA 3J8AA 4O8KA 2F9WA 3W0LA 3WEEB 5JMVA 4BGAA 3MN7A 3LDOA 4B1ZA 2H3GX 3IDHA 3VEOA 3WUHA 2ZGZA 1S3XA 3D2EA 2A3ZA 4FWPA 1KAXA 5AFUA 3O80A 3U9ZA 2BUPA 4IO8A 1R59O 3CERA 3O1WA 2GELA 5AQQA 4FOIA 5BREA 5KPZA 1BA1A 2ASOA 3BUZB 4QS8A 2BTFA 3CHWA 4CJ7A 3O08A 4FO0A 1NLVA 1U2VB 5AZJB 3VF2A 1D4XA 3B8AX 3ENOA 4H5RA 3D2FB 3ZX2A 4BROA 3ZX3A 1SZ2A 1YVNA 1S22A 2GWJA 1HKGA 3FLCO 3VEXA 4CZJA 1GLCG 5LJVA 1V4SA 4BREA 2E2PA 5BPNA 3M3ZA 3I33A 5JLHA 3A5LC 1XQSC 2QWRA 1QQMA 4PKHA 5ADXH 5BRDA 4O5FA 4M63C 3H1QA 2YI1A 4FOEA 2QW9A 4FWKA 2E20A 3CQYA 3WXKA 1BO5O 1E4FT 1HKCA 4IJNA 4B1XB 4CD1A 4BRHA 2HF4A 2P9PB 4BR4A 3LL3A 1H1VA 4E1JA 4MO5A 5E84A 3QFPA 2Q0RA 2WUSA 4EHTA 3MK6A 4K41A 3O5BA 3EKUA 1TYQA 5BPMA 2E2NA 4YDUA 4CZHA 5AZJA 1ATSA 2I7NA 3D2FA 1T6DA 3EN9A 4RTFD 3ATVA 2CGJA 1Z05A 3FFKB 1NGCA 1Z6RA 3H3NO 4JD2A 3P4IA 5AQXA 4BRFA 1NGJA 4HWIA 1HUXA 3H1VX 4FWRA 1NGHA 2ASPA 2W41A 3H46O 4WQ5C 2D4WA 2FSKA 4B1YB 3HZ6A 3HBTA 5AQZA 3G25A 2HOEA 4BQZA 4BRIA 1MA9B 3A0IX 1K8KA 3C0BA 5EY4A 4BRQA 3BP8A 4DCHA 1BWFO 5FPEA 3WXLA 3GG4A 5AQMA 4YDUC 2FSNA 1X3NA 4BG8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NB4A 3CF5L 4KTWA 3VPZA 2CGLA 1C6VA 4AEIA 4J8FA 4DV5K 1LAWA 3HI0A 1N6QA 1VNBA 1MU2A 3NFAA 3WQTA 4B08A 2ITGA 3BZKA 3L2VA 1RBVA 4A62A 4CBWA 5M1NA 4Z4FA 3SI6A 4CECA 1WNSA 5BN9A 3CJAA 3OYDA 3V9SA 4B1WB 2UXCK 2QWQA 1BISA 3HT3A 3ISNC 3DM2A 3M5RA 3KLHA 4AHTA 1NWKA 1BIUA 1ILYA 4B9LA 1GOAA 2KSKA 3FZMA 1UA0A 3CXCM 2PAVA 4M3XA 3L3UA 1P0AA 3L6QA 2VGNA 5KRTA 1LWEA 2GTDA 4MLEA 4OVLA 3K5LA 2IOCA 3OYJA 4CHQA 4JHDA 1LWCA 4FJXA 1JLGA 1ZC6A 3LP0A 3GDQA 4LD0A 4C1NK 1L3TA 2NLXA 2A1RA 4JKFA 3FZFA 3VOVA 1BOTO 3M8RA 4CVNE 5AQIA 4N41A 3K2PA 2YNIA 3R9PA 4BR7A 3JXUA 4N47A 3T3FA 1J5OA 3E1YA 3QB0A 1VSEA 2XY5A 3HTVA 3OS1A 5AQYA 4FJNA 3KTQA 4A2BA 4A59A 3A2FA 1C1CA 4E19A 3IAYA 1VSFA 1T03A 4YNQA 3AO1A 5FPDA 3SUNA 3GE1A 4FK2A 4Z94A 1S6PA 4BDPA 4Y1DA 4FW2A 3CC4N 1EKEA 3SUOA 1YJNN 4BQLA 1HRHA 1QE1A 3VEZA 3OYCA 1HLUA 1FK9A 3K5NA 5JS1A 2Z1IA 3VA0A 2RF2A 1W97L 2VCPA 5KPTA 1Z25A 4DHYA 4FVMA 1VHXA 5ELZA 1U6ZA 3MAQA 4FWSA 3DWLA 4YOYA 1T7BA 4I6MB 5I42A 1ZUTA 2QA4N 2HHTA 3SNNA 4GNIA 1WLJA 2PBDA 4FWNA 1BGXT 3T1YK 2PZSA 3BDPA 2HHWA 3MEEA 4K8XA 4Z4IA 3PSIA 4PWDA 4DF8A 1VQLN 4Z0UA 3L4QA 4K42A 5AJ3K 3R3LA 3KOWA 1V4TA 5CE3A 4CZGA 5F2RA 4JS5A 4JI3K 1RDWX 4I6MA 4DQ8A 5ADXA 3VESA 1GPTA 4CJPA 3MN6A 4FJMA 1SL0A 3TABA 3L4IA 3O3HA 3BZCA 3SJHA 5KRSA 1TI5A 3QEXA 3VQ5A 1RT1A 2FC0A 4MLHA 4JKEA 4LSLA 3R1XA 2Z1HA 1S1VA 2GMOA 4AAZA 1IV0A 3R2VA 1I2VA 1L4VA 4CZFA 4CBXA 2FBXA 2KYQA 4BE0A 5HBMA 2IC3A 3F5TA 4M41A 3MXJA 5DMRA 3RSEA 2HBJA 1ZU3A 2WFBA 1OVQA 3LP3A 1MDUB 4FLYA 3MMVA 2HHHK 1E4GT 4BR0A 1RTDA 1C1BA 4XEIA 1VQ7N 3Q7CA 4LY7A 4ISEA 3L2WA 4DTUA 1IBMK 4DUYK 5BR8K 4DTXA 3C94A 2P9LA 3AARA 1I6FA 1R0AA 1O13A 2DPNA 2KBKA 5HROA 5J2PA 4BGBA 4CEZA 2BGGA 1VSHA 3ZT0A 4JI5K 1ASUA 3L2RA 4M7YA 1NPIA 2AP1A 3U3GA 2G8HA 4KB1A 1YVUA 3AVBA 1FXXA 4IOCL 4B3RK 4WF9L 1NGGA 2YEOA 1L3SA 5EVZA 4IDKA 5C2DA 3VQBA 2PY5A 4UJ0A 4CGIA 1O1WA 2JDQD 1FKPA 3CYGA 4WQ4C 4LF9K 2O8FA 1C1AA 1EWRA 1GLBG 1QVGM 4K0KK 1VRTA 3CG7A 2QK9A 4BRKA 4JV5K 3QDKA 2E2FA 3DXKB 1RT7A 1UOCA 5GAGP 2P9UB 1HQEA 3O4WA 1WUAA 3EE9A 4HUGA 4DV7K 4JRQA 4WFBL 3OY9A 5GADP 3ZT2A 2UU9K 4K8ZA 5C15A 3WXMB 5BRHA 4FW1A 3OYLA 4RCHA 4DTMA 1YHQN 3DJCA 1L3VA 3HPOA 5KGXA 1KLNA 3NF9A 1U2VA 2ZF5O 3IFRA 3QINA 3TTDA 4I9QA 1HYZA 3H6EA 4KHQA 3DXMB 5AQPA 1B3CA 3AAPA 4JS4A 3VF4A 4E7HA 5HLFA 1RGIA 1NMDA 2P9UA 3HPGA 3RWUA 3P1GA 4DR7K 3KD5E 1L5UA 1S9GA 5DM7L 3OVNA 3LWMA 4YOUA 1LCUA 3LPTA 2YKNA 3Q7BA 4YFUA 1NJXA 2O8DB 1LW0A 3KIOA 1YJWN 4FVUA 4FLTA 1QQCA 4IZ9A 1TK5A 1EETA 4QS7A 4FJGA 4JYAK 4EFHA 2HF3A 1RDUA 3DLRA 4DQRA 3OJSA 3S3NA 5C2FA 4DR4K 1EO1A 5BN8A 4O8UA 1YTUA 1MWMA 4KI4A 2YHAA 2QXFA 3CMEN 2E0HA 3K9KA 1WSIA 2OPQA 3SLCA 3S41A 1LWFA 1DTQA 5K14A 1C0TA 4CZEA 4DV6K 1YTAA 1C0FA 3M6GA 1W2BM 1CLQA 2UUAK 2E1ZA 4Z4GA 2KKZA 3QMLA 2O8EA 3DLEA 4CEBA 2A5XA 3IMXA 3U8XA 3CW4A 2A41A 2ZJRL 4ILJA 3V81A 4YHHK 1T1TA 2UUBK 3HOTA 3ZSWA 4CF2A 2AJQA 3IRXA 4BGAA 5H1SQ 1WSJA 2QTDA 3DLBA 2ZGZA 2A3ZA 4OGCA 3OYGA 3BGRA 3G4SN 4JI7K 4FJ8A 4DWIA 2BUPA 5BREA 4M3YA 5AQQA 4QS8A 4CJ7A 3M8PA 4AH9A 4KHSA 5AZJB 1OVYA 2KTQA 3B8AX 3ENOA 4QOZB 4OLBA 1BCMA 3ZX2A 4BROA 2KZMA 3ZX3A 3O9TA 2KBHA 1S22A 2GWJA 4OKEA 3HL8A 2E2PA 4CJTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4NB4 A;  3CF5 L;  4KTW A;  3VPZ A;  2CGL A;  1C6V A;  4AEI A;  4J8F A;  4DV5 K;  1LAW A;  3HI0 A;  1N6Q A;  1VNB A;  1MU2 A;  3NFA A;  3WQT A;  4B08 A;  2ITG A;  3BZK A;  3L2V A;  1RBV A;  4A62 A;  4CBW A;  5M1N A;  4Z4F A;  3SI6 A;  4CEC A;  1WNS A;  5BN9 A;  3CJA A;  3OYD A;  3V9S A;  4B1W B;  2UXC K;  2QWQ A;  1BIS A;  3HT3 A;  3ISN C;  3DM2 A;  3M5R A;  3KLH A;  4AHT A;  1NWK A;  1BIU A;  1ILY A;  4B9L A;  1GOA A;  2KSK A;  3FZM A;  1UA0 A;  3CXC M;  2PAV A;  4M3X A;  3L3U A;  1P0A A;  3L6Q A;  2VGN A;  5KRT A;  1LWE A;  2GTD A;  4MLE A;  4OVL A;  3K5L A;  2IOC A;  3OYJ A;  4CHQ A;  4JHD A;  1LWC A;  4FJX A;  1JLG A;  1ZC6 A;  3LP0 A;  3GDQ A;  4LD0 A;  4C1N K;  1L3T A;  2NLX A;  2A1R A;  4JKF A;  3FZF A;  3VOV A;  1BOT O;  3M8R A;  4CVN E;  5AQI A;  4N41 A;  3K2P A;  2YNI A;  3R9P A;  4BR7 A;  3JXU A;  4N47 A;  3T3F A;  1J5O A;  3E1Y A;  3QB0 A;  1VSE A;  2XY5 A;  3HTV A;  3OS1 A;  5AQY A;  4FJN A;  3KTQ A;  4A2B A;  4A59 A;  3A2F A;  1C1C A;  4E19 A;  3IAY A;  1VSF A;  1T03 A;  4YNQ A; 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