2QWQA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the amppnp hydrolyzed form
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
total genus 115
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwqA04
4FPBA 1BU6O 3H1QA 3SLCA 3M3ZA 4MO5A 3WXIA 3WEEB 3AY9A 3WXLA 3HM8A 5AQMA 1H1VA 1ZBSA 3MN7A 2Q1NA 4WQ4A 4K25A 4BRDA 1S3XA 3VPZA 2IIRA 4IJAA 1P8ZA 3CJAA 1ESVA 3J8AA 5KPTA 4H5RA 3FE1A 1KXPA 4BRHA 4QS9A 4BG9A 4BQZA 2QWRA 4FOIA 4IWVA 3B8AX 1JCFA 1GLJO 5JMVA 4A2BA 4BRPA 5ADXA 4A62A 2P9UA 1Z6RA 2HF3A 4B1XB 4WQ5A 3A0IX 3QFUA 3C0BA 4CZEA 2Q2RA 3H46O 1IJJA 1X3MA 3P4IA 3WQUA 4A61A 3MDQA 3FZMA 4CD3A 1R59O 4EHUA 5BRDA 1NGIA 2IVOA 3BEXA 1XC3A 4B9QA 3EL2A 1NBWA 2E2PA 3GOIA 4HTLA 4YDUA 2UYTA 3CI5A 3GBTA 3VF4A 4FSVA 1GLAG 3VGMA 1DKGD 3ENHA 3OHRA 2V7YA 4IO8A 3WT0A 5F2RA 3WUHA 2GWKA 1JCGA 4CBUA 1Y64A 4EHTA 5AQFA 4KBOA 3FZLA 4BRAA 5AQGA 4BR4A 5BPMA 4H5VA 4CZHA 2E2QA 5AQPA 2AP1A 4FWSA 4I6MA 3ULEA 4CZMA 4CZFA 3VEZA 4MLHA 3CJ1A 5LJVA 2QWLA 3ATUA 3ZEUB 2ASPA 1LOTB 1DGKN 2GEMA 4IJNA 3DJCA 4GY2B 1ATRA 3BUZB 5KPRA 3CETA 3QBXA 3VEXA 3QDKA 3A5MC 5CE3A 2I7PA 1GLCG 3ZEUA 4XEIA 5AQKA 2OANA 4ISFA 1NM1A 3L4IA 2VYPA 4BRGA 3VEVA 3GE1A 1KAXA 2W40A 4DB3A 5EY4A 2CGKA 5ADXH 3CIPA 5B8HA 4HWIA 3D2EB 1TYQA 4BQLA 5AQWA 1NGEA 2ASOA 3RSEB 4K43A 3CJ9A 3QMLA 4BGBA 4CJ7A 1V4TA 5F1XA 4RCHA 1GLFO 3UKRB 4PKGA 4PL7A 5FPEA 4E1JA 3U9DA 3KHYA 2ZGZA 2A40A 1QZ5A 1KAYA 2A42A 3DXKB 4JHDA 3LM9A 4F9OA 2GELA 1NMDA 5EXWA 5TKYA 2P9LA 4BG8A 3GDQA 2E8AA 1U2VA 2IVPA 3IDHA 4FWOA 1SAZA 2W41A 3D2EA 1TYQB 3ENOA 4BRFA 1ATNA 1GLEG 2P9PB 4O5FA 4ISEA 1MDUB 1U2VB 3LM2A 3CHWA 4FWMA 4CZGA 4DHYA 3ZX0A 5AQTA 3FFKB 2P9NA 3VOVA 3VF6A 4EAHD 3EKUA 4IXCA 1X3NA 3VEYA 3D2FA 3ATVA 1XUPO 2QXLA 2Q0RA 3WXKA 1QZ6A 1KAZA 2QWNA 4FWLA 3DXKA 2CH5A 2P9NB 2GWJA 3EKSA 3ZETB 4M7XA 1HX1A 2KHOA 4B1UB 2YI1A 2ZF5O 3O4WA 4WQ5C 5AZIA 4BR2A 3CJ7A 5AQQA 3AAPA 4CZJA 3CJBA 2D1KA 3D7EO 5FPNA 1HKCA 1LCUA 3LDQA 3DXMB 3ZETA 4BRQA 5EX5A 2DPNA 5KQ8A 2QWQA 3EZWA 3LDPA 3M1FA 4XH4A 2NZTA 1YAGA 1T6DA 2HMPA 3R6MA 3QBWA 4MLEA 2WUSA 4FWKA 4YDUC 1IG8A 3UKUB 3QB0A 4BRNA 4FL9A 2GTDA 5EOYA 1U6ZA 3ZX3A 3VGKA 4H5WA 1HKBA 2CGLA 3H3NO 3BP8A 4JAXA 4LC9B 5BN9A 5AQXA 4CD1A 2I7NA 4AM6A 1BDGA 1XQSC 3GG4A 2BTFA 4XH5A 3DAWA 4B1VA 5BRFA 4O8KA 3C7NA 2F9TA 2Q36A 4BRLA 3AAQA 3FZKA 3UB5A 4BR7A 5JLFA 2VWBA 3SK3A 5AR0A 4BRMA 4BGAA 2F9WA 2QW9A 1GLLO 3U9ZA 3VESA 3MCPA 2V52B 3WXJA 5BRHA 2QM1A 1GLDG 1GLBG 1C0FA 2PAVA 2P9KB 4CBXA 3FLCO 5AQIA 2AA4A 1YUWA 3I33A 2A6AA 4JD2B 4XH1A 4B1ZA 1HPMA 3FR0A 3MN6A 3VEOA 3L6QA 3ID8A 3GL1A 1SZ2A 3MK6A 2D4WA 4AM7A 4BR9A 5F0XA 4BROA 2QWMA 3SMPA 2V7ZA 2QWOA 3A5NC 1J6ZA 3FZFA 2A3ZA 2P9UB 3ZX2A 1TUUA 2FSNA 4CZLA 4BC5A 1OKJA 4FPAA 4Y0WA 2EWSA 2ZWHA 4BRKA 3IFRA 4RWTA 1K8KA 1SQKA 3W0LA 2PBDA 5AQVA 2E1YA 3BF3A 5AQLA 1WOQA 3CQYA 1DEJA 2NRHA 1QQMA 5AQRA 1NGBA 3BF1A 1V4SA 1NLVA 1HUXA 4H0PA 1EQYA 2GUPA 1HKGA 4M7YA 1K8KB 3TU5A 3LDNA 3VGLA 2IVNA 2A5XA 3S41A 1C0GA 1NGJA 3CJCA 3UE5A 3MN5A 1NGAA 1E4GT 4K42A 5E26A 1YXQA 4CZIA 2A41A 3HSCA 2D0OA 5AQOA 3CQXA 4A2AA 4BREA 5KQDA 4WQ4C 3H6EA 3O1BA 4DCHA 4Z94A 2P9IB 3A5LC 3EN9A 4QS8A 3QFPA 1NWKA 2YHXA 5BR9A 2FF6A 4H0TB 3U4LA 5ELZA 3R8EA 3F9MA 1MWMA 1Q18A 3ULEB 2BUPA 1BWFO 5LJWA 5KPZA 3HTVA 1T6CA 3O5BA 1BG3A 4H0OA 1G99A 2CH6A 3WQTA 3H1VX 4BC4A 4RTFD 4CI6A 2HF4A 4PL8A 3KVGA 5JICA 4J8FA 4L3QA 3TPQA 3H45C 2H3GX 4FWNA 4ISGA 2J4RA 4I6MB 4BRCA 2YHYA 4H03B 4GNIA 4JN4A 2P9IA 1BOTO 3JS6A 1NGHA 3AARA 2ASMA 2E88A 1ATSA 5AQNA 4PKIA 4H5NA 5FPDA 1BA1A 2YJEA 1ZXOA 4H5TA 2P9LB 3LDLA 2V51B 1WUAA 5AQUA 3RSEA 1QQOA 4CZKA 3FZHA 5BPNA 5AFUA 3O6WA 4FWPA 5AQHA 4BVPA 2E2OA 5AFUH 1S22A 4JHDB 2P9SB 1NGFA 2CGJA 5BPLA 2QWPA 2FF3B 3HBTA 4PKHA 1QHAA 3U8XA 3VERA 3H3OB 1HLUA 2YJFA 4QS7A 4CBWA 1Z05A 5LY3A 4EIAA 3MN9A 5AZJB 4BVOA 2Q97A 1X9JA 3O08A 2NLXA 1E4FT 4BC3A 1MA9B 3DWLA 3I8BA 1RDWX 4DQ8A 1ZC6A 3O80A 5JLHA 1NGGA 1NGCA 5BN8A 3HI0A 4MO4A 2P9SA 3R9PA 3UKRA 3KZBA 1MWKA 3G25A 2P9PA 3IUCA 3JXUA 5AQSA 4BR0A 5AQJA 1RFQA 4H0XB 1D4XA 3EO3A 4H0YB 1BUPA 4JNEA 4B1YB 3LDOA 2YCHA 3W3DA 1TUYA 5AZJA 5BREA 4K41A 3M6GA 3FGUA 4M63C 2ZGYA 1T44A 5AZIB 3A8YA 5AQYA 4B1WB 3IMXA 1NGDA 4FWQA 3SJHA 4BC2A 1CZAN 3DXMA 4IZ9A 5FPMA 4BRIA 2FLOA 2FSKA 1BO5O 1BA0A 3D2FB 2FSJA 4FOEA 2HOEA 4WYBA 2E1ZA 4NO7A 2FXUA 3VENA 2Q31A 3CERA 3C7NB 2E20A 2E2NA 2P9KA 5E84A 4JD2A 2D0PA 4C23A 1JCEA 4FWRA 3O8MA 2VCPA 1YVNA 3QICA 1QQNA 4NB4A 5EVZA 3VETA 4H0VB 3L0QA 4BR5A 5I9EB 3VF2A 5AQZA 3SMSA 3LL3A 2Q0UA 2ITMA 3MMVA 3HZ6A 3O1WA 4EFHA 1RGIA 3WEEA 2YHWA 3UKUA 4FO0A 1HJOA 3VEWA 3A5OC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E2FA 4CEZA 2IOCA 2O8DA 3RWUA 3M3ZA 3K2PA 4MO5A 3AY9A 3WXLA 3CCEN 3AVHA 2Q1NA 4WQ4A 5KGWA 1S3XA 2IIRA 3ASMA 4IJAA 1ESVA 2VG7A 5KPTA 1I6GA 4E19A 1KXPA 3PX6A 4B9SA 3PO4A 1KTQA 1IV0A 1K9MO 3ZSWA 1GLJO 2Z1HA 2A7TA 5ADXA 4FLXA 2P9UA 2BRZA 1Z6RA 4CFAA 3PUFA 1GOAA 2HBKA 3MECA 4CFDA 1SN1A 3OYHA 3E01A 3HXMA 2O8DB 3D0PA 1XNRK 4DSKA 2UUAK 1QQCA 3C0BA 3ALYA 5GINA 1J54A 1L3SA 4FK0A 1X3MA 4A61A 1KCFA 4GV3A 3FZMA 3CXCM 4CHOA 1R59O 5BRDA 4JK7A 3K5OA 4B9QA 1HNZK 1NH5A 1BI4B 4UY8O 2E2PA 1ZFUA 2UYTA 4E72A 3CI5A 4IFYA 3GBTA 3UIQA 4PY5A 1VQ5N 4NYNA 1DKGD 3ENHA 1VNBA 4FK2A 3ZCMA 4DG1A 2GWKA 4CBUA 4E0DA 4EHTA 3LAKA 2VWJA 4KBOA 4BRAA 2WTUA 1CXUA 4M3XA 5AQGA 3QEXA 2B5JA 1NK6A 3QEIA 3K57A 4I6MA 4A57A 1RBUA 3ISNC 3OJUA 4LH4A 4Y1CA 3S3OA 5DMRA 4B3OA 3CMAN 4MLHA 1ZVEA 2ASPA 1VRTA 3CCVN 3BUZB 4DQRA 1KV0A 1TAUA 3SYZA 5CE3A 4W5TA 2OANA 1VQ8N 3RMAA 1VSHA 3VEVA 1KAXA 1T1TA 4EP5A 5ADXH 3CIPA 3MCAB 1UWBA 1YF5L 1I3AA 2HB5A 1YIJN 1TYQA 5C24A 1WLJA 1KC8O 1NGEA 3VQ6A 1VQKN 2ASOA 3OYFA 5HRPA 2E0HA 4K43A 1WSIA 5C2FA 4N56A 3QMLA 5F1XA 2PYLA 1HYZA 3UKRB 4CEBA 4YY3K 1WT7A 5FPEA 4MFBA 4E1JA 3U9DA 3KHYA 1WWNA 2YV0X 2ZGZA 2WONA 4NCGA 1KAYA 2A42A 3TAGA 2UUCK 1K6YA 1SNBA 5EXWA 1WSHA 4CHPA 3O9RA 1U2VA 3KLGA 4ZTFA 1U49A 3O3HA 3IDHA 4UAFE 2A1RA 1SAZA 1HPZA 2P9PB 4FWMA 4YOXA 3THYA 3NGYA 3FFKB 1TKTA 3EKUA 1CN2A 2NRVA 4OO1J 4FLYA 2OZSA 2HBLA 2LKBA 3SQ1A 2PFUA 3AVJA 4IOCL 3T1YK 3ZETB 4M7XA 2XY8A 4B1UB 4FJ5A 1RT2A 4CJEA 3DM2A 5AZIA 4BR2A 3CJ7A 3J81O 2VGNA 3D7EO 5FPNA 4OPJA 1HKCA 3V81A 4C8KA 4M3ZA 1XI1A 4KKOA 2XHBA 1LW2A 3EZWA 1TK0A 3LDPA 3M1FA 2O4GA 4CIFA 4J2EA 1JKHA 3KJVA 4E7HA 3QBWA 3I55N 2E5LK 1Z25A 4MLEA 4W5RA 1IG8A 3QB0A 1D9DA 4YORA 4FL9A 2GTDA 5EOYA 1W2BM 1U6ZA 3F73A 5KRSA 2RN2A 3TSPA 5I3UA 1YJ9N 1C1BA 3CCSN 1SKSA 4FJ9A 2P1JA 1SKWA 4JAXA 1WSFA 4JI8K 2KFNA 2DFEA 1YT3A 4Z4FA 1BDGA 1XQSC 2BTFA 3DAWA 4B1VA 5BRFA 1CXQA 4JS5A 4HUEA 3ZSOA 2Q36A 4JYAK 2IC3A 4Z4HA 3FZKA 1I2UA 3E9OA 3CQ8A 5JLFA 2VWBA 4BRMA 2GBZA 5GIPA 2QW9A 1GLLO 1VQ4N 4RG8A 4AHRA 1JJ2M 1C0FA 2PAVA 4CBXA 3FLCO 2AA4A 4AB0A 1YUWA 2A6AA 3IS9A 3CC2N 3FR0A 3OYAA 3LZJA 3O4QA 3VEOA 3GL1A 4JLHA 4EP4A 4AM7A 1ZU3A 4BROA 2QWOA 2O8EA 2OYQA 3HPGA 2FSNA 3DLEA 4CIEA 4AAZA 4BC5A 3OW2M 4Y0WA 4FJXA 3MWPA 4B9LA 1VAZA 3IFRA 3TAMA 1X9SA 1K8KA 3NF8A 5EU7A 5AQVA 4OPHA 3CQYA 1FJGK 2NRHA 4DU3A 1JL2A 3M5RA 1V4SA 3PSIA 1HKGA 1NK7A 2YIPA 1U48A 4M7YA 4AHTA 3LDNA 3LP1A 3TSUA 4C8LA 4DQPA 1N36K 1NGAA 1YXQA 4CZIA 3AO2A 3OBWA 2YNHA 3S3MA 4IDKA 4JKBA 4DCHA 3CCUN 4LF6K 4UJ0A 3OTOK 2P9IB 5J2QA 1Q82O 4B9MA 3VN5A 1NWKA 2P5OA 2YHXA 2O4IA 3CPWM 4JKFA 4JRPA 5ELZA 1VSIA 3ULEB 3F9MA 1RCHA 1NOYA 1UAXA 4CEAA 2LT8A 5KPZA 3OS2A 4KYPA 3U3YA 1J9AA 3VQDA 1EXQA 3CCMN 4FCYA 3H1VX 1PE4A 4BC4A 1WN7A 4PQUA 4L3QA 3TPQA 4CJPA 3CM6A 1GPTA 4N41A 4BRCA 3ENBA 4H03B 1SEGA 4GNIA 4DSFA 2JLEA 5C10A 2ASMA 4H5NA 5FPDA 4F4KA 2N66A 3SPZA 3VQPA 3RSEA 1QQOA 3SQ2A 1TKDA 3JAMO 4DTNA 5SWMA 5H1SQ 2O8CA 1BL3A 5AFUA 3O6WA 3L2VA 2O8BA 4G9ZA 4IKFA 3LWLA 3K9KA 4CJ4A 4JK8A 1U45A 2MN5A 5GAGP 3KLFA 3VQQA 1RTDA 5C25A 2P9SB 3ID6A 4MQ3A 3PSMA 1QHAA 4FJMA 3P38A 3U8XA 3H3OB 1HLUA 1ASUA 1CLQA 1P00A 1POIA 3NF6A 2ZQBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2E2F A;  4CEZ A;  2IOC A;  2O8D A;  3RWU A;  3M3Z A;  3K2P A;  4MO5 A;  3AY9 A;  3WXL A;  3CCE N;  3AVH A;  2Q1N A;  4WQ4 A;  5KGW A;  1S3X A;  2IIR A;  3ASM A;  4IJA A;  1ESV A;  2VG7 A;  5KPT A;  1I6G A;  4E19 A;  1KXP A;  3PX6 A;  4B9S A;  3PO4 A;  1KTQ A;  1IV0 A;  1K9M O;  3ZSW A;  1GLJ O;  2Z1H A;  2A7T A;  5ADX A;  4FLX A;  2P9U A;  2BRZ A;  1Z6R A;  4CFA A;  3PUF A;  1GOA A;  2HBK A;  3MEC A;  4CFD A;  1SN1 A;  3OYH A;  3E01 A;  3HXM A;  2O8D B;  3D0P A;  1XNR K;  4DSK A;  2UUA K;  1QQC A;  3C0B A;  3ALY A;  5GIN A;  1J54 A;  1L3S A;  4FK0 A;  1X3M A;  4A61 A;  1KCF A;  4GV3 A;  3FZM A;  3CXC M;  4CHO A;  1R59 O;  5BRD A;  4JK7 A;  3K5O A;  4B9Q A;  1HNZ K;  1NH5 A;  1BI4 B;  4UY8 O;  2E2P A;  1ZFU A;  2UYT A;  4E72 A;  3CI5 A;  4IFY A;  3GBT A;  3UIQ A;  4PY5 A;  1VQ5 N;  4NYN A;  1DKG D;  3ENH A;  1VNB A;  4FK2 A;  3ZCM A;  4DG1 A;  2GWK A;  4CBU A;  4E0D A;  4EHT A;  3LAK A;  2VWJ A;  4KBO A;  4BRA A;  2WTU A;  1CXU A;  4M3X A;  5AQG A;  3QEX A;  2B5J A;  1NK6 A;  3QEI A;  3K57 A; 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