2QWQA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the amppnp hydrolyzed form
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
molecule tags Chaperone
source organism Bos taurus
total genus 115
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwqA04
5LJWA 2BUPA 2QWLA 4PKIA 4CZMA 3DXKB 1NGEA 1YUWA 2P9IA 1HPMA 3ENHA 3FZHA 4BRDA 4BR9A 2A5XA 4H0YB 1V4TA 2WUSA 2CGKA 5JLFA 1C0GA 3M1FA 3VEWA 3WXKA 1ZC6A 4JHDB 4B1XB 4NB4A 3IDHA 1TUYA 3M6GA 3ZEUB 4B9QA 1K8KB 5BRFA 1JCGA 1QZ6A 3F9MA 1HKGA 4E1JA 2P9KB 3AY9A 1SQKA 2AP1A 3EL2A 3MN9A 1GLCG 3ZX3A 5EOYA 2V51B 5JMVA 1NGAA 3CJ9A 3UB5A 3CETA 3W3DA 2QWOA 4HTLA 4AM6A 2GELA 2QWNA 5BPMA 3SJHA 3HM8A 1BDGA 1GLAG 3BF3A 5AQYA 2NLXA 4BREA 2D0PA 3EZWA 5AQQA 2YHXA 5CE3A 5AQUA 1BO5O 1TYQA 3A5MC 4XH1A 5BRDA 1GLEG 4FWOA 1ATNA 3CI5A 5AZIA 4H0OA 5AQOA 2OANA 3VF6A 3JXUA 5BREA 2QWQA 3DWLA 3FZFA 3IMXA 4CBUA 1T44A 1OKJA 3O1BA 4AM7A 2E8AA 1S3XA 3VGMA 2Q0RA 3QB0A 3I33A 4BG8A 4BGBA 2BTFA 4EHUA 4H0XB 4BC5A 4KBOA 5ELZA 4DB3A 4BRGA 5AQJA 4CZJA 1E4FT 4XH5A 3U9ZA 4H5TA 2FSKA 1NBWA 3LM2A 3UKRB 1E4GT 2A42A 2YHWA 3HTVA 4QS7A 3LDOA 4FL9A 3JS6A 3ZETB 2GWJA 1KAZA 4ISGA 1NGFA 1TYQB 3BEXA 1T6DA 3O4WA 3TPQA 4CZEA 2ASMA 4K43A 4CJ7A 5AQZA 1IJJA 4B1WB 5LY3A 3D2EA 1CZAN 4FPAA 3BUZB 4BGAA 4F9OA 1S22A 5ADXH 5AQNA 2ASPA 5EXWA 3WXLA 4CZLA 3QBWA 4QS8A 3VEVA 4EAHD 2YHYA 3MMVA 4RCHA 3QBXA 5KQDA 1R59O 3KZBA 3C0BA 2P9SA 1Q18A 4CBXA 2P9NA 5F1XA 3ULEA 3SK3A 3UKUA 4JD2B 1RFQA 3ZX0A 5AQHA 5F2RA 2E2QA 3MK6A 4J8FA 5AQPA 1QZ5A 1X9JA 1DEJA 2HF4A 4H5WA 2Q1NA 1MWKA 1SAZA 4MO4A 4FOEA 4DHYA 5JLHA 2E2OA 4RWTA 3A0IX 3WQTA 5BPLA 3FZKA 4I6MB 2UYTA 3I8BA 5BN8A 1TUUA 1YXQA 3VPZA 3HBTA 3S41A 2E20A 2QW9A 4O5FA 4DQ8A 3D2EB 5TKYA 3VERA 5KPTA 2W40A 3A5NC 4PKHA 3ATVA 3C7NA 3IUCA 1YAGA 2AA4A 4BRMA 5BR9A 3R9PA 1BU6O 5LJVA 1QQMA 5KPZA 4BR7A 3OHRA 4GY2B 4K41A 1NWKA 3FZMA 1WUAA 2GWKA 2FF3B 2P9SB 3CQYA 2P9NB 1BG3A 2YJEA 5AQRA 5BRHA 3CJAA 3QFUA 1P8ZA 3WT0A 1RDWX 3J8AA 4IJNA 5BN9A 4BVOA 5AZJB 3M3ZA 4CD3A 4CD1A 1MDUB 1SZ2A 3A5OC 3RSEA 2I7NA 4CZHA 3O5BA 4A2BA 1Z05A 1C0FA 5AQGA 5AQFA 4JAXA 4PL7A 2FLOA 2FXUA 2CGLA 4GNIA 3MDQA 1J6ZA 4BR5A 2I7PA 1KAYA 3LL3A 1U2VA 2NRHA 4WQ4A 3O1WA 4QS9A 5AQMA 1ATRA 2ZF5O 5JICA 2IVNA 3O8MA 3VEZA 2P9IB 5AFUH 1HLUA 3MN6A 3C7NB 2E88A 4WYBA 1NGCA 4FWPA 5AQTA 3U4LA 3H45C 1NGJA 4BR2A 5F0XA 2HMPA 3DXMA 3CHWA 4BRQA 4H0TB 1HKBA 4M7XA 3EKSA 3H6EA 1KXPA 2EWSA 1D4XA 4FWQA 1NLVA 1GLDG 2P9UA 4K25A 3VF4A 4WQ5A 5I9EB 2FF6A 4B1ZA 1NGHA 1BWFO 2A41A 2F9WA 1HX1A 2F9TA 3BF1A 4CZIA 1LOTB 5FPNA 1BOTO 3BP8A 3ENOA 1NGDA 3VGKA 3RSEB 4FWNA 3P4IA 3EKUA 4BRCA 4H5RA 2YJFA 2VCPA 2YCHA 3EN9A 5BPNA 5E26A 4DCHA 2H3GX 1U2VB 3VEOA 1HJOA 1MWMA 4YDUA 1DGKN 2D0OA 4IJAA 1QQNA 4WQ4C 4A61A 4BVPA 4CZKA 5AZIB 1GLFO 1RGIA 4C23A 3FZLA 4FSVA 2V7ZA 4CBWA 1Z6RA 2P9LA 2Q0UA 2Q97A 4BRHA 4ISEA 1XQSC 5EX5A 3SMPA 4EHTA 1GLBG 5AQLA 1JCEA 1ESVA 3AAPA 5AQVA 5B8HA 4H03B 3D2FA 4WQ5C 2E2NA 3AAQA 4IXCA 4BRIA 3WXIA 4BRAA 1GLJO 2A6AA 2QXLA 2VWBA 3FE1A 3DXKA 3AARA 5KQ8A 4XH4A 2D1KA 2QWPA 4FWRA 3R8EA 4H5NA 1NMDA 1MA9B 2ASOA 2PBDA 3KVGA 1U6ZA 1V4SA 1T6CA 1WOQA 3B8AX 4BQZA 1G99A 1BA1A 4IZ9A 1DKGD 5KPRA 2CGJA 3LDNA 1H1VA 3EO3A 3LDLA 1HKCA 1LCUA 5AQXA 3FFKB 3H3OB 4YDUC 4BG9A 4BR0A 3A8YA 4FO0A 5AR0A 4FWLA 3H46O 4HWIA 3LM9A 3CQXA 4BRPA 4BC2A 3HZ6A 4O8KA 4BQLA 2ZGZA 3ULEB 2V52B 3UKUB 4BRKA 1NGGA 1QHAA 2CH5A 2NZTA 2ZWHA 3VENA 3CJ7A 3LDPA 3HI0A 4FOIA 4M7YA 1EQYA 3H3NO 4PKGA 3WEEA 2QM1A 3H1QA 3L0QA 2YI1A 3SMSA 2FSJA 1BA0A 3ID8A 5AQSA 4EIAA 4M63C 3D7EO 4JNEA 4NO7A 3ZX2A 1GLLO 3GDQA 3KHYA 1KAXA 1X3NA 3SLCA 5FPEA 4BROA 2A40A 2W41A 2FSNA 3L6QA 2A3ZA 2ITMA 5AQWA 4RTFD 3IFRA 3MCPA 3VESA 4MO5A 5E84A 4FWSA 3HSCA 4MLHA 4B1YB 3UKRA 2D4WA 2Q2RA 5FPMA 3ZETA 3WQUA 3H1VX 1Y64A 3FGUA 4PL8A 2HF3A 3WEEB 1ATSA 4BRLA 3VETA 3VF2A 1ZBSA 3VEYA 3QMLA 2KHOA 3DJCA 4FPBA 1BUPA 4JN4A 4BC4A 5AQIA 5AFUA 3R6MA 2DPNA 2IIRA 5AQKA 2P9PA 2J4RA 3CJCA 2IVPA 5EVZA 3GOIA 3WXJA 4JD2A 4CZFA 3U9DA 4FWKA 2V7YA 2PAVA 2E2PA 3W0LA 2Q31A 3QFPA 3O6WA 3WUHA 1NGBA 2ZGYA 3CJBA 3ATUA 4CI6A 4H0PA 3DXMB 3G25A 4BRNA 2VYPA 2IVOA 4H0VB 3LDQA 4K42A 3CERA 3VEXA 3CIPA 4I6MA 4MLEA 4Z94A 1QQOA 2P9UB 3A5LC 3DAWA 4L3QA 4EFHA 2HOEA 4CZGA 1X3MA 3MN5A 2Q36A 3QICA 3CJ1A 4BRFA 3GE1A 2QWMA 1NM1A 3MN7A 2GTDA 2E1ZA 5EY4A 4XEIA 1YVNA 2P9PB 5ADXA 4JHDA 3ZEUA 4B1UB 2QWRA 1K8KA 4B1VA 4ISFA 4A62A 4H5VA 2P9KA 3QDKA 1XUPO 4IWVA 1HUXA 4LC9B 4BC3A 3GBTA 3L4IA 3VGLA 1IG8A 2GUPA 3TU5A 5AZJA 2P9LB 3FR0A 3GG4A 3GL1A 4BR4A 3O80A 2GEMA 3UE5A 4IO8A 1NGIA 3VOVA 4A2AA 5FPDA 4FWMA 3FLCO 1XC3A 2CH6A 4Y0WA 3O08A 1ZXOA 3U8XA 2E1YA 3D2FB 1JCFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TK0A 2QWLA 1C1AA 1DT9A 4DV5K 2DFEA 3CFPA 1CHZA 3FZHA 5FROA 1JLQA 4BR9A 2CGKA 1VQ8N 3M1FA 3VEWA 4HTUA 2X74A 4CJEA 1ICAA 4BDZA 4F3TA 3DOLA 4JRPA 3HRGA 4CGHA 4JHDB 4B1XB 3HXMA 4DWIA 1I2VA 1K8KB 1JCGA 1QZ6A 1HJRA 4E1JA 1Q9XA 3ZLJA 3EL2A 1OZZA 1GLCG 3ZX3A 2HNDA 2V51B 3CETA 4W5QA 4AM6A 2GELA 2KBHA 4DF8A 4CEZA 4DUZK 1VQ4N 5FRNA 3CXCM 1VSKA 1RBSA 3BF3A 3ZYYX 3HVRA 4QOZB 1HRHA 1SUQA 1G15A 4FJXA 4CGGA 4O4GA 2D0PA 2HBLA 3OYBA 1BO5O 4CEQA 4M3TA 1F21A 2KZZA 1EWRA 1OH6A 3CI5A 4IOCL 4I2PA 3I56N 2OANA 2UU9K 4MQ3A 3TR8A 3KWGA 4O44A 4CBUA 5HRSA 4RW6A 1JLEA 1S1WA 1T44A 3R2VA 1RDUA 2E8AA 1IV0A 2Q0RA 4BG8A 2BTFA 3SAGA 4H0XB 1KFSA 2QKBA 4KBOA 3RWUA 3SUNA 4BRGA 4DR1K 4KYPA 1ZFUA 4NLCA 2FSKA 1NBWA 3UKRB 1E4GT 3EZ5A 3HTVA 4Z4GA 1UOCA 2OPSA 3LDOA 4FL9A 4A59A 1KAZA 1NGFA 1TYQB 1YJ9N 3O4WA 3NBPA 5AQZA 2KKZA 5C24A 1LAVA 4CJTA 1NOYA 2O8CA 4KPYA 2D0CA 5ADXH 2Q3SA 3L2QA 4CF1A 3VEVA 2QTDA 3G6EN 1VAZA 1NKBA 2A7TA 4B9LA 3MWPA 3EYZA 4LFCK 2YNGA 3AO1A 2O4GA 2NRWA 5F1XA 3KHWA 2P5GA 3SK3A 3KOYA 3Q7BA 4YOUA 1FKOA 1ZVGA 3L2WA 5AQPA 1QZ5A 3BGRA 1X9JA 5K14A 1DEJA 4UAEF 1JLFA 3BY5A 2KPYA 4JI6K 2G8WA 5C0YA 3ZCMA 4ID1A 3KK7A 3FZKA 3IRXA 5CZ1A 1S5JA 1T7AA 2QW9A 4O5FA 4DR3K 4JKGA 4PQUA 4OPAA 4CJPA 1RBVA 2W40A 5KPTA 3T3FA 4IKFA 4KHPK 2AA4A 4YOTA 4BRMA 5JS1A 1J53A 1BU6O 3R9PA 1QQMA 5LJVA 4C8KA 2NUBA 4DF4A 3SQ1A 1NWKA 4AEIA 1Z25A 3EY1A 4X65K 1T3VA 3VQDA 2P9SB 2FF3B 2UUBK 2F8TA 4CIGA 2P9NB 4CEOA 4HUEA 3T1HK 3V81A 2RF2A 5J2QA 3QFUA 1P8ZA 3WT0A 3M8RA 3GKUA 1NK5A 3HJFA 4UJ0A 3V1RA 5BN9A 4E1MA 1TL1A 4C8OA 3SAHA 3LWMA 4CF9A 2EX3A 3CM6A 4CZHA 1QHTA 4A2BA 3C94A 5CR4A 3K5NA 4PL7A 3E7UX 2FXUA 2CGLA 1UGLA 5KGXA 1J6ZA 4IG3A 2NRRA 3LL3A 1U2VA 4F2RA 3ENBA 2NRHA 1KVAA 5AQMA 2ASCA 2HHHK 3VEZA 1LQQA 1BRZA 3P38A 1HLUA 2E88A 2N2QA 3U4LA 1L3TA 2MZ0A 3DRRA 1IKWA 3DXMA 4BRQA 1BIZA 1YVUA 3K9KA 4H0TB 1WAJA 3EKSA 1RT7A 1D4XA 5FLXO 1GLDG 3NH0A 1AHOA 3VF4A 4WQ5A 4B1ZA 1BWFO 4I9LA 3L3VA 3VQ6A 4CEEA 3QEPA 1LOTB 1D8YA 5GADP 4FWNA 3P4IA 1N33K 1NU0A 1KV0A 1T7PA 4PWDA 3DLGA 2DY4A 2YIOA 1WWNA 2Y1IA 3TWHA 3MCAB 4EZ6A 3SI6A 2YCHA 5LL6Z 3JSMA 2ZJQL 3VEOA 4OKEA 4YDUA 4IJAA 4O55A 4CW7B 4CZKA 4OX9K 1K9MO 3CCEN 1CLQA 1C1BA 1LWEA 4ID5A 4XJXA 2P9LA 4DV7K 2Q0UA 1GLBG 4DTUA 1ESVA 3AAPA 3QEIA 4M3ZA 1VQON 5B8HA 3L3UA 5C25A 4H03B 4FJ5A 4G1QA 3WXIA 4BRAA 4FXDA 2NRXA 2VWBA 3K2PA 3PUFA 4FWRA 4CHYA 4FM0A 4CF2A 3MEEA 1OH7A 1RDCA 1PX9A 1U49A 3B8AX 3QNOA 1UWBA 1DKGD 2D5RA 4DV2K 4BDPA 2O8CB 1SNBA 1O13A 4RW9A 1I2UA 4GW6A 2OZSA 4B3SK 4AF1A 4W5OA 2WC9A 4FWLA 2M8BB 1I3AA 1Q86O 2NRTA 3A2FA 1VSIA 4F4KA 4BC2A 3NMUA 4W5NA 4BQLA 1D5AA 4CF8A 4BRKA 5EU7A 1HYZA 5GIPA 4DR5K 2ZWHA 4M3RA 3IAYA 3LDPA 1T1TA 3AVLA 2PFUA 1P00A 4M7YA 3SV4A 3L0QA 1SS6A 1C56A 3ID8A 1MR4A 5AQSA 3AGKA 4KHQA 3OS0A 4EIAA 4M63C 4B3MK 3GDQA 4AHRA 5KTQA 2OPRA 3ZSOA 2PY5A 5FPEA 3KP0A 4BEBA 3TAEA 4M3WA 1Q9YA 3KLHA 4MDBA 4O0IA 1FH3A 2ITMA 4RTFD 1I6FA 3MCPA 3PIPL 4MLHA 2XY5A 2Z1GA 2OZMA 4B1YB 4FK2A 4KV8A 2LR3A 1S6QA 5GINA 4DR4K 2DFFA 2E5LK 3VQ7A 3WQUA 3VQPA 4PL8A 1ATSA 2O8DA 4H4MA 1ZBSA 4FJ8A 4LF8K 5KGWA 1N5YA 3O3GA 5I3UA 2KHOA 4FPBA 4DQQA 1KLNA 4WF9L 1U48A 1CXUA 3K9JA 5AFUA 1WSFA 4JEPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1TK0 A;  2QWL A;  1C1A A;  1DT9 A;  4DV5 K;  2DFE A;  3CFP A;  1CHZ A;  3FZH A;  5FRO A;  1JLQ A;  4BR9 A;  2CGK A;  1VQ8 N;  3M1F A;  3VEW A;  4HTU A;  2X74 A;  4CJE A;  1ICA A;  4BDZ A;  4F3T A;  3DOL A;  4JRP A;  3HRG A;  4CGH A;  4JHD B;  4B1X B;  3HXM A;  4DWI A;  1I2V A;  1K8K B;  1JCG A;  1QZ6 A;  1HJR A;  4E1J A;  1Q9X A;  3ZLJ A;  3EL2 A;  1OZZ A;  1GLC G;  3ZX3 A;  2HND A;  2V51 B;  3CET A;  4W5Q A;  4AM6 A;  2GEL A;  2KBH A;  4DF8 A;  4CEZ A;  4DUZ K;  1VQ4 N;  5FRN A;  3CXC M;  1VSK A;  1RBS A;  3BF3 A;  3ZYY X;  3HVR A;  4QOZ B;  1HRH A;  1SUQ A;  1G15 A;  4FJX A;  4CGG A;  4O4G A;  2D0P A;  2HBL A;  3OYB A;  1BO5 O;  4CEQ A;  4M3T A;  1F21 A;  2KZZ A;  1EWR A;  1OH6 A;  3CI5 A;  4IOC L;  4I2P A;  3I56 N;  2OAN A;  2UU9 K;  4MQ3 A;  3TR8 A;  3KWG A;  4O44 A;  4CBU A;  5HRS A;  4RW6 A;  1JLE A;  1S1W A;  1T44 A;  3R2V A;  1RDU A;  2E8A A;  1IV0 A;  2Q0R A;  4BG8 A;  2BTF A;  3SAG A;  4H0X B;  1KFS A;  2QKB A;  4KBO A;  3RWU A;  3SUN A;  4BRG A;  4DR1 K;  4KYP A;  1ZFU A;  4NLC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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