The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
27
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
DPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPCKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Chaperone
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| source organism |
Bos taurus
|
| molecule keywords |
Heat shock cognate 71 kDa protein
|
| total genus |
27
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| structure length |
92
|
| sequence length |
92
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| ec nomenclature |
ec
3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase. |
| pdb deposition date | 2007-08-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HDJ A; 2PF4 E; 2CTR A; 1FAF A; 2DMX A; 3UO2 A; 3APO A; 2KQX A; 2CTP A; 2EJ7 A; 2GUZ B; 2QWO B; 3UCS C; 2CTW A; 2QSA A; 3AG7 A; 1NZ6 A; 2LGW A; 4IT5 A; 3UO3 A; 1BQZ A; 2CUG A; 2N05 A; 4J80 A; 2M6Y A; 1N4C A; 2N04 A; 2DN9 A; 2GUZ A; 3BVO A; 1WJZ A; 1BQ0 A; 3APQ A; 1XBL A; 1GH6 A; 2QWR B; 2Y4T A; 2OCH A; 1FPO A; 4J7Z A; 2QWP B; 2Y4U A; 2QWQ B; 2L6L A; 2QWN B; 2YUA A; 2LO1 A; 2YS8 A; 4RWU A; 1IUR A; 2CTQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4GCZ A; 3ZX6 A; 1UJW B; 1HNX O; 4DXW A; 4B08 A; 1UPG A; 1IBM O; 4ABM A; 2JIZ G; 2ZE5 A; 2OIG A; 4MVZ A; 1O9H A; 4CS3 A; 1TVK A; 3H1J H; 3ZN0 A; 3JSN A; 2EZP A; 1KMI Z; 1N0N A; 3N2K B; 1NVP D; 2P06 A; 1OHH G; 3RBZ A; 1IBL B; 2QWP B; 1F4N A; 2ZKO A; 2BTQ B; 3STZ C; 1F23 A; 5JJN B; 3C3T A; 1PNK A; 1ZUQ A; 4Z1M G; 5KAI Z; 1VQL V; 5LYJ B; 3CMA V; 4B3T B; 4LF5 B; 1HWY A; 2VQE B; 4IIJ A; 3QTC A; 1BQ0 A; 4K3A A; 1WP8 A; 4OXS A; 4I55 A; 3OMA B; 4DRX A; 5IYD O; 2QKA A; 5KMG B; 1FXV A; 1M90 W; 3E2E A; 4FM2 A; 3E35 A; 2ITC C; 4FLW A; 1HNZ B; 2XOK G; 3ZRW A; 1GN6 A; 3S3W A; 2GBO A; 1GO3 F; 5HFL A; 1HNX B; 3CCU V; 3CWB H; 1XL6 A; 4EB6 B; 4F6E A; 3RFR A; 1NH2 D; 1JMK C; 3IC7 A; 1IBM B; 1YSC A; 3A8T A; 4UFZ A; 4P2Z A; 3RYF A; 1ZL8 A; 2OWO A; 5CN0 A; 1Y67 A; 1BMF G; 3CEI A; 4MTG A; 3FAV A; 4FLU A; 3SDL A; 5LGT A; 2HJD A; 2A3Q A; 1S5H C; 4PHZ A; 3L71 H; 3RGB A; 4A5U B; 1YF2 A; 3ZN1 A; 1GTO A; 2OTJ V; 3OAA G; 4O4J A; 1V54 B; 3AK3 A; 5JVD B; 2DYR B; 2LQT A; 2DYS C; 5KX5 B; 3CC2 V; 1M56 B; 2HHH O; 1DGS A; 2CAZ C; 1KBH A; 3AG4 C; 3M99 B; 3W7T A; 3ABL C; 4DUY O; 5EC2 C; 4WFH A; 4KFM A; 4RQF A; 4I9W A; 1BQZ A; 3JSL A; 1K9M W; 1N36 B; 2P4K A; 5JCO C; 4FFB A; 5KUM A; 4X66 O; 3T1H O; 4KUM A; 1IZ3 A; 4FK5 C; 2A0L A; 1TUB A; 1H2N A; 2ZIM A; 5B5E Z; 1T5E A; 2YI9 A; 1OCO B; 2EIM B; 4IHJ B; 2PZS A; 2XAQ A; 3SYP A; 4CC6 A; 4FPP A; 4B3R O; 1WPB A; 2IH1 C; 2WPD G; 1Q7Y W; 4KHP O; 4UVB A; 2KG7 A; 3K9S A; 1PKX A; 3TXQ A; 4FZ0 A; 4PJ0 Z; 1XHZ A; 5CA0 A; 4FLY A; 2X6C A; 2KSD A; 4P9O A; 2EIL C; 3K08 A; 2OCC B; 5EIB D; 1HNW B; 4BAY A; 2PY5 A; 3SPH A; 4LF9 O; 5BMV A; 1GAX A; 2IJK A; 4LC1 A; 2HR3 A; 4KL1 A; 2CH7 A; 2ZDI C; 2HHH B; 1VQN V; 3LNM B; 1Q3E A; 2DN9 A; 1KD1 W; 1K4C C; 4J7Z A; 3CCQ V; 3OEE G; 4KXR A; 4DUY B; 4Z2W A; 4OPA A; 5D5P A; 2FL4 A; 3VQV A; 4HNA A; 4DUZ O; 3ETD A; 2W6I G; 4GYC B; 4X66 B; 2CUG A; 4R8C A; 2LW7 A; 4L8J A; 1SRY A; 3QG5 A; 1I08 A; 4CH5 A; 3DC5 A; 1YIJ V; 4B3R B; 1O9G A; 4NYK A; 2QKC A; 4KHP B; 3IC9 A; 1N0J A; 3G80 A; 1KUQ A; 3ZHU A; 2Q6A A; 4P30 A; 1W2B U; 3ZHS A; 4DV2 B; 1FJG O; 4LWS A; 3LSS A; 2LP7 A; 1H2K A; 2ZE8 A; 1RM1 B; 1Y76 A; 5EZY B; 2QTO A; 2VQF O; 4BW5 A; 3F7V C; 2WAM A; 4UCO A; 2NLJ C; 1V55 C; 4LF9 B; 4UUJ C; 5EYP A; 5CA1 A; 5JJJ B; 1OCC B; 3PJS K; 3M8A A; 4CZZ A; 4I50 A; 4JI7 O; 5GW7 A; 1CPY A; 2ZM6 O; 3WU2 Z; 2RNB A; 4DV0 O; 4E2L A; 3UT5 A; 4O4L A; 1K33 A; 1FXK A; 2P22 C; 5LHH A; 3TET A; 2Z0A A; 2EBO A; 4MVS A; 3RT3 C; 1ZX3 A; 4X8A A; 3RYC B; 2E3C A; 2A7W A; 3JCU Z; 2WLH A; 3UO3 A; 3O9O A; 4TV8 A; 3MDS A; 1U97 A; 1XQ8 A; 4NTW A; 4MTX A; 2YEV A; 3T4Z A; 1KP3 A; 1JX9 A; 3B77 A; 2WLI A; 3W7U A; 4DV4 O; 1Z5W A; 2YIB D; 3DXR A; 1KC8 W; 1JOY A; 3ABM B; 1P7B A; 4IGG A; 1G6U A; 2Q8V A; 3ABK B; 2EZO A; 3JAT A; 4HYO A; 3ETE A; 1FJG B; 1D2D A; 4PDR A; 2ZCE A; 1B06 A; 2EIN B; 3FB5 C; 1AI6 A; 1JR9 A; 2P90 A; 4MSW C; 3AG3 C; 2BOC C; 3JAR B; 4JI8 O; 5L3G A; 1D5N A; 3K58 A; 1QLE C; 3K79 A; 4IYH A; 2ZXW B; 4DW0 A; 1I0H A; 3CCM V; 4J42 A; 1BS3 A; 1KB9 F; 3D8C A; 4D6T H; 1H2M A; 2WSS G; 1SQF A; 4JI7 B; 1M57 C; 1U96 A; 1BE3 H; 1GN4 A; 2ZM6 B; 4DV0 B; 1KKD A; 5LP6 B; 5GON A; 2ADQ B; 5IYZ A; 2PTM A; 1MSW D; 2CK3 G; 3JD2 A; 4R50 A; 1Q43 A; 4H0L B; 1WAZ A; 5E79 Z; 4WFF A; 1VF5 B; 2N74 A; 4JI5 O; 1TUE B; 5FPO A; 2JJ2 G; 2QGN A; 3MHH C; 2LW1 A; 2OT5 A; 2A06 H; 3OD4 A; 1GM7 A; 3T2M A; 4OGQ B; 4PA7 A; 1XRE A; 4JI1 O; 4JI6 O; 1WJZ A; 2KKW A; 3CS5 A; 1Q6I A; 4DV4 B; 3HKE A; 4DR1 O; 1ORQ C; 3QO5 A; 1Y4M A; 5L3F A; 3F5T A; 4NR1 A; 1MA1 A; 5FLX N; 1XDC A; 5JQG B; 4I0X A; 2DQ0 A; 4FM1 A; 1QHT A; 3WG7 C; 2CTW A; 2QSA A; 1NTM H; 4AQY O; 4FLV A; 3ICX A; 1A32 A; 5DEC A; 4ZI7 B; 1YEW A; 5IJ0 A; 5L3E A; 4JI8 B; 1SQQ H; 1BHB A; 2GV9 A; 3QO8 A; 1M93 A; 3WB2 A; 1R6T A; 3HKC B; 1NVP B; 2Q68 A; 4DK1 A; 4O2A B; 2CTQ A; 1VIB A; 1E79 G; 3OW2 U; 4JYA B; 1SA0 B; 3CXC U; 5EBL C; 5IJ9 B; 3ZHQ A; 3QNE A; 3ZHR A; 3H1H H; 1WLE A; 1R6K A; 5L3B A; 5CA3 A; 3APQ A; 1F51 A; 3RYH A; 5ITZ A; 3EXA A; 2QWQ B; 3Q4H A; 3SJB C; 4ICG A; 4JI5 B; 3HR0 A; 2WLM A; 2XAH A; 4B3S O; 4NKG B; 1YCI A; 3ML0 A; 3CRM A; 2JGD A; 4YHH O; 2QA4 V; 5EBW C; 4JI1 B; 4JI6 B; 5LXT B; 1YJ9 V; 2P4V A; 4JTD B; 4DR1 B; 5EC1 C; 5TIS Z; 5KUK A; 4JYC A; 1GH6 A; 2ETN A; 1XMO O; 4X88 A; 3WB1 A; 3IAY A; 4RQE A; 3U10 A; 4NXM O; 2ITD C; 1XHX A; 2DW4 A; 3U0Z A; 5KHH A; 2ZIN A; 4AQY B; 4ZOL A; 2K1E A; 2BTQ A; 1NH2 B; 3OT7 A; 4WCE V; 1K3E A; 1R3I C; 4E4E A; 1Q81 W; 1FKA O; 2E74 B; 4JI2 B; 2EIJ B; 2Q0O C; 3GVM A; 2Q67 A; 1ZWI C; 1H2S B; 4X1Y B; 2ZDI A; 3KZI Z; 4QGP A; 1JFF B; 5KMG A; 4J9Z B; 2M6Y A; 1J95 A; 1WPX A; 2XAF A; 1M5I A; 3SGI A; 3TK1 A; 2IM9 A; 4LF5 O; 1R3K C; 3AG2 C; 1NJI W; 4LF4 B; 4B3S B; 2YC0 A; 2D3O W; 2Q0A A; 2GTS A; 1JCH A; 3VQX A; 2CE4 A; 4K8X A; 4YHH B; 2EJ7 A; 2DOS A; 5KAF Z; 3CRA A; 3JCZ A; 4PI2 A; 4GLX A; 4JI4 O; 2X6B A; 3CD6 V; 1KYO F; 1XMO B; 3K3W A; 3ETQ A; 1MZF A; 1KU9 A; 4I4T B; 3SR2 C; 2P5O A; 5J2U A; 2CGN A; 2A79 B; 2KQX A; 1N33 O; 1EBO A; 3T1C A; 3OTF A; 4MVU A; 1M9N A; 1XL4 A; 2GTA A; 4JAU A; 2XUM A; 2YXL A; 2ODM A; 1M1K W; 5L3C A; 1P7G A; 5LHI A; 2QM4 A; 4WBN B; 2Q7E A; 4O2B A; 5KX5 A; 4EFB A; 3H1K H; 3X2Q C; 3I56 V; 1WA8 B; 4JPR A; 4LNU A; 1US6 A; 3CHX A; 1GRJ A; 5KHG A; 1P4R A; 4PDL A; 4EFE A; 3DC6 A; 1URF A; 3FB8 C; 1OZ0 A; 5EK0 A; 1K5Q A; 5CMU A; 1VQO V; 4PDV A; 1KKC A; 3EFF K; 5GTH Z; 1BCC H; 4F6R A; 3T4D A; 4DV5 O; 5B1A B; 2VS0 A; 3K0G A; 3OUS A; 1H2G A; 4X64 O; 4JI4 B; 1IVS A; 4R7C A; 3R65 A; 5LMU O; 3RN4 A; 1QLN A; 1VQP V; 5CBG A; 3H01 A; 3E83 A; 3CC7 V; 1N36 O; 1VQK V; 3LSU A; 2ATK C; 5B1B C; 2NNU A; 4JGS A; 2QKS A; 5B3S C; 2HVJ C; 1DK1 A; 1N33 B; 5LGU A; 3B40 A; 3AK2 A; 1GMG A; 2YSU B; 4O4I B; 1CP9 A; 2ARH A; 2YIA A; 1N32 O; 4YJ2 B; 1VQ7 V; 2Z3Y A; 2WLL B; 4LFB O; 3D36 A; 3RYI B; 5IYB O; 1Q86 W; 4PEL A; 1YJN V; 3CP1 A; 1YJW V; 1SZT A; 2PYL A; 4L87 A; 1D5A A; 1I7F A; 3BAA A; 3AK1 A; 4CH4 A; 1FD9 A; 1AJQ A; 2QR4 A; 1HNW O; 3HKD B; 1W0J G; 4U3F H; 3FX7 A; 3KCX A; 2VWJ A; 2HKO A; 3VQY A; 1N34 B; 4FLZ A; 4OPH A; 4WFG A; 2B5U A; 4WFE A; 4DR2 O; 2MW2 B; 4PA6 A; 4X65 B; 4DV5 B; 3EHB B; 4JI3 O; 2K9P A; 4GX1 A; 1TVK B; 2HG5 C; 1NQT A; 4X64 B; 4ZHQ B; 1CEZ A; 3TJT A; 5H6R A; 1EN4 A; 1SC5 B; 4DW1 A; 2QTS A; 5LMU B; 1VQ8 V; 5DED A; 2JEU A; 2EIK C; 4TSF G; 1NKD A; 3VBB A; 2ADP A; 4J7K A; 4TV9 B; 1ROP A; 5FPR A; 1P84 F; 1EM1 A; 4JAS A; 4MT8 A; 4BR6 A; 1N32 B; 3BPZ A; 2F1M A; 3E22 A; 5EZY A; 3STL C; 4I55 B; 5J2T A; 3H9V A; 4LF7 O; 4LFB B; 2UXN A; 1RSO A; 2Y69 B; 5BY1 A; 1NTZ H; 2W0F C; 4DV2 O; 2AZ0 A; 1XNR O; 1MAB G; 1W59 A; 2ZR3 A; 4N23 A; 3JAL A; 1ZLZ A; 1V9P A; 3ZRW B; 3ZMZ A; 5KLV H; 2IU3 A; 1AR4 A; 2HVK C; 5BZB A; 1BT8 A; 1Q5O A; 4JTA B; 4MTO A; 3K57 A; 4IT5 A; 2YXY A; 2IBZ H; 3RYC A; 5F2V O; 4JYB A; 4DR2 B; 2E5L O; 1FS0 G; 4JI3 B; 3B8N A; 1AI7 A; 3LUT B; 2JVD A; 1WB8 A; 4LF8 B; 3LDC A; 5IWA O; 1JA8 A; 1QBZ A; 1GKF A; 4FFK A; 3RYF B; 3JAK A; 1VQ6 V; 5HFM A; 1SQB H; 4NTY A; 4NVP A; 3FAV B; 1VQ9 V; 3BRC A; 1E1Q G; 3NR7 A; 1G8M A; 1UFI A; 1WB7 A; 3PN1 A; 1AI5 A; 3WB0 A; 3SPI A; 3E8G A; 3K06 A; 3JD0 A; 3OMI B; 4DV7 O; 4O4J B; 3GWK C; 2CDY A; 2X7R B; 5IT9 N; 1OV9 A; 2JS3 A; 5IE9 A; 4B7E A; 1S72 V; 2P67 A; 2YIC A; 3L75 H; 3ZRV A; 2WLN A; 3JAR A; 4DV1 O; 4LF7 B; 4MVO A; 4U7O A; 5DM6 V; 3FYI B; 3H1I H; 3FYE B; 1XNR B; 3SPG A; 2H94 A; 3GWO A; 1WNS A; 2HLD G; 4YY3 O; 5BR8 O; 2DQ3 A; 3TCU A; 2RCV A; 3JAS B; 2UUC O; 2OYQ A; 4KP4 A; 3ZRS A; 1J5E O; 5LMN O; 4AHC A; 1R6N A; 3K5O A; 5LP6 A; 1GM9 A; 4LR3 A; 1BZK A; 2DMX A; 4LBE C; 1V54 C; 5CB4 B; 2IJJ A; 1TUB B; 3E8H A; 1VQ4 V; 3KKY A; 3AG7 A; 4BW9 A; 2RDC A; 1PM9 A; 1M56 C; 2E5L B; 4IYI A; 4MVQ A; 3FD9 A; 2RJZ A; 1ARO P; 5IWA B; 1IBK O; 2KG7 B; 3CJH B; 2M7W A; 3IFX A; 1SQG A; 2BCC H; 1JVM A; 1HDJ A; 2PF4 E; 2QDO A; 1IXM A; 5B1N A; 1SQV H; 3THO A; 4FVM A; 1XMQ O; 4WFA V; 3M7M X; 1NTK H; 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1RM1 C; 2W0X A; 2N04 A; 4X1Y A; 1NT2 B; 4I7Z B; 4D7T A; 2Y4T A; 3OTO O; 1JFF A; 3ZMS A; 3P3P A; 1AR1 B; 2UXD O; 3ASO B; 5KA5 A; 2YS8 A; 3CCJ V; 3C90 A; 1QNM A; 4JI2 O; 4XDK A; 4DR4 B; 1H8E G; 2WLI B; 3SJA C; 4JZ2 A; 2QJ1 A; 4O4H B; 2B9Z A; 1R3J C; 1FXH A; 3OGI B; 4UVC A; 5IYC O; 2F4V O; 4GKK B; 4DR3 O; 1NU1 H; 4LF6 B; 2JK5 C; 1QR9 A; 2GHY A; 3JAT B; 4J11 A; 4CS4 A; 1EN6 A; 3QO7 A; 1DF4 A; 3B2E E; 2XHB A; 3I55 V; 4LF4 O; 2XT9 A; 1QCE A; 3ZCC A; 3FKS G; 4DR5 B; 3B4S A; 1B6Q A; 4FLT A; 3LSQ A; 4JI0 O; 1NS1 A; 3X2Q B; 3UKM A; 3SPC A; 4I9Q A; 2F93 B; 5FNV B; 1YZB A; 2QEX V; 2QE7 G; 3BCC H; 1NR7 A; 3ABK C; 4X9Q A; 4W4L A; 1YTF B; 5GON B; 3UO2 A; 5IYZ B; 3N2K A; 3U11 A; 2YID A; 2EIN C; 2HJF C; 2P7T C; 1WN7 A; 1VP7 A; 4PA4 A; 3DGE A; 5E1A C; 3OTO B; 3JAW B; 2UXD B; 2QM8 A; 4J41 A; 2ZXW C; 2F23 A; 1GK9 A; 5LYJ A; 1S5L Z; 3QVN A; 1I5Y A; 5A9G A; 2PYJ A; 3B8M A; 3BAB A; 4RWU A; 3RW0 A; 2BTO A; 5B1B B; 1OJH A; 5H5N A; 5B1O A; 3A0H Z; 5LP6 C; 4K0K O; 3HKE B; 2L35 A; 3OEH G; 1G4Y B; 4GUN A; 2F4V B; 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