The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
27
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
b'DPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPCKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQ'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Heat shock cognate 71 kDa protein
|
| source organism |
Bos taurus
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| molecule tags |
Chaperone
|
| total genus |
27
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| structure length |
92
|
| sequence length |
92
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| ec nomenclature |
ec
3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase. |
| pdb deposition date | 2007-08-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1GH6 A; 1NZ6 A; 2CTQ A; 2OCH A; 1N4C A; 2N04 A; 2L6L A; 3AG7 A; 3UO2 A; 2Y4U A; 2CTR A; 2DMX A; 2YS8 A; 3UCS C; 2N05 A; 1IUR A; 1HDJ A; 4IT5 A; 2CUG A; 3APQ A; 2LGW A; 3UO3 A; 2Y4T A; 2QWN B; 2EJ7 A; 2QWQ B; 2QWO B; 3BVO A; 4J80 A; 2KQX A; 2QWR B; 2GUZ B; 3APO A; 1FAF A; 4RWU A; 2CTW A; 2YUA A; 2GUZ A; 2LO1 A; 1FPO A; 1XBL A; 2DN9 A; 2M6Y A; 4J7Z A; 2QWP B; 1BQZ A; 2CTP A; 1BQ0 A; 1WJZ A; 2QSA A; 2PF4 E; #chains in the Genus database with same CATH topology 4X65 B; 1V55 C; 3STL C; 3GB7 C; 5GON A; 4K0K B; 1DGS A; 4JI5 B; 1KBH A; 1XRE A; 3CHX A; 4JAV A; 4JZG A; 3OD4 A; 2QWN B; 3JD4 A; 1NJI W; 2QM4 A; 5EYP B; 2ARH A; 1YIJ V; 1V54 B; 4JI6 B; 1IXM A; 1VAR A; 3CRA A; 5CA0 A; 2ZDI C; 5LP6 B; 4ZBM A; 1Q8I A; 4H0L B; 1N0J A; 2AHY A; 4JV5 B; 4JYA O; 4W4L A; 4X65 O; 2BE3 A; 4DR1 B; 4U3F H; 4K0K O; 4JI5 O; 3CXC U; 1JOY A; 3AG2 C; 3VOU A; 1OCZ B; 2XHB A; 4DV1 B; 4JI6 O; 3FAV B; 5E1A C; 2DJV A; 2JS3 A; 3UM7 A; 4IYI A; 3CS5 A; 3CCM V; 1GAX A; 2IBZ H; 4LF9 B; 1QLE C; 4JV5 O; 3DC5 A; 4H33 A; 3ZMZ A; 5B3S C; 3RYH B; 2DMX A; 4X88 A; 4DR1 O; 1FYJ A; 4J7J A; 1MAB G; 2CUG A; 3K3W A; 2EIL C; 3E83 A; 4LH6 A; 2EJ7 A; 4YY3 B; 1KEC A; 2P5O A; 3ZIA G; 2QWR B; 1FAF A; 2KSD A; 5IYC O; 4LF8 B; 5IYD O; 4LF7 B; 3ZRW A; 1SC5 B; 1Y67 A; 1I5X A; 2LW1 A; 1V9P A; 4DV1 O; 4PDV A; 3AG1 B; 4GT1 A; 1NH2 B; 3RBZ A; 3BA8 A; 3C90 A; 1G4Y B; 1VP7 A; 2QJ1 A; 1HNW B; 5IYZ A; 4LF9 O; 2EIM C; 2Q9L A; 3DTU B; 3CJH A; 5C93 A; 1CEZ A; 4UV9 A; 4H37 A; 4RAI A; 4YY3 O; 3ZMU A; 1I7F A; 4LF8 O; 3PJS K; 4LF7 O; 1H2N A; 3QO7 A; 1H2M A; 3THO A; 3JAM N; 4WBN B; 1SZT A; 3N2G B; 2WLK A; 3W7X A; 1NS1 A; 5LHH A; 3E22 B; 3CYO A; 2QR4 A; 1HNW O; 3ASN B; 2UUA B; 4TV8 A; 2UXD B; 5EIB D; 1HDJ A; 2X6B A; 3APQ A; 3ZX6 A; 4FM1 A; 2JDI G; 4DR7 O; 2OTL V; 1N33 B; 2F43 G; 1IXB A; 2JIZ G; 4J41 A; 1HWY A; 1M56 C; 3FYE B; 1XOU A; 2HKO A; 1Q81 W; 4I9Q A; 3K5N A; 1W2B U; 1YSC A; 1FJG B; 1YTF D; 3C3T A; 1NI8 A; 1MNG A; 2NLJ C; 2UUA O; 2UXD O; 2BSK A; 4IT5 A; 2OT5 A; 4DK1 A; 2HVJ C; 1N33 O; 1PKX A; 2EUL A; 3HKC B; 1F23 A; 1LUV A; 4JYC A; 1WJZ A; 3EVK A; 1N8R W; 1DTO A; 4MVZ A; 3JAS B; 2P4V A; 2Y0P A; 3JAL B; 1VQ4 V; 1NU1 H; 4UCU A; 3P30 A; 4OPA A; 3CCL V; 1BZK A; 3A0H Z; 1FXK B; 4GUN A; 4PHZ A; 1QNM A; 4MTX A; 5IY5 B; 4MS2 A; 1UFI A; 3ZRS A; 3LSU A; 4HZ3 A; 3CPW U; 1GM8 A; 3JSN A; 2X7R B; 4CS2 A; 1GN3 A; 2QKC A; 1TUE B; 3SJA C; 3RT3 C; 4QJF B; 1FXH A; 2X6C A; 5CMU A; 1VQO V; 1OCC B; 1KYO F; 3BCC H; 4H44 B; 5KHH A; 2P4K A; 1QVF U; 2A0L A; 3VQX A; 2WA4 A; 4NXM B; 4Z2W A; 3RW0 A; 4YXW G; 3TK1 A; 2GUZ A; 1AR1 B; 2DN9 A; 3IAY A; 4AIL C; 3L71 H; 4AI8 A; 3JAW B; 3H9V A; 2P90 A; 4X1K A; 1ZL8 A; 3P32 A; 5D5Q A; 5LMU B; 2A79 B; 2LFS A; 3JD3 A; 2YI8 A; 3B8N A; 3KCX A; 1DF5 A; 1KC8 W; 1BMF G; 4LF5 B; 3O65 A; 4R8C A; 1JR9 A; 2AW9 A; 1XNQ B; 4IYH A; 1R3J C; 4NXM O; 1MSD A; 4DO2 A; 2Q68 A; 2IM9 A; 4RQE A; 1BQZ A; 2EIK C; 4LFB B; 2GTA A; 5KAI Z; 2ZR3 A; 1P7B A; 1M4U A; 3VQY A; 1WN7 A; 2XOK G; 2CDY A; 1IUR A; 1W0K G; 1NKD A; 3JYC A; 3K9S A; 4WFA V; 5JVD B; 1K8A W; 3JAR B; 4LF5 O; 4GX2 A; 3E89 A; 1XNQ O; 5FLX N; 4O4L A; 2IH1 C; 1OCO C; 3CXH F; 1KKC A; 1RSO B; 4N21 A; 1SKV A; 1B06 A; 3WFV A; 4O2A B; 4JGS A; 1Y4M A; 1QR9 A; 2BTQ A; 5LOV B; 4K3A A; 3LUT B; 2QGN A; 4B3R B; 3B40 A; 2Q69 A; 1K5Q A; 1SA0 B; 3FB7 C; 4J10 A; 3ZRX A; 1GRJ A; 5K1X A; 2Q7H A; 5J2T A; 3BAA A; 3UCS C; 3SYO A; 3CRM A; 4KL1 A; 1Q5O A; 4CH6 A; 5CB4 B; 4X20 A; 3JAT B; 1QQC A; 2AXT Z; 3H01 A; 4U3J A; 3BVO A; 1YDX A; 2ZIO A; 1B04 A; 4I9W A; 2ZCE A; 3OMI B; 5ITZ B; 5LHG A; 3L74 H; 4B3R O; 1JCH A; 3K5L A; 4JAS A; 5CBH A; 2DQ0 A; 5BZB A; 1FS0 G; 1BHA A; 2H94 A; 4TOI A; 1WB8 A; 2BSK B; 4YHH B; 2JGD B; 1Q6I A; 5CA1 A; 3ZMV A; 2NNU A; 4DV6 B; 3A0R A; 1P49 A; 2MK3 A; 1DF4 A; 2JJ2 G; 1K9M W; 1KKD A; 1XDC A; 2OCC C; 2GHY A; 3P3N A; 5JQG A; 2MW2 B; 2W6J G; 2GSM B; 5HFL A; 1VQ8 V; 3R65 A; 4YHH O; 4PI2 A; 1BHB A; 5FL7 G; 1WB7 A; 4XDJ A; 3UQ8 A; 4DV6 O; 2WLI B; 4XDK A; 2X0L A; 2RDC A; 4DRX A; 1GO3 F; 4O4H B; 1HNX B; 1F4M A; 2F66 C; 3N2K B; 5GW7 A; 1HW7 A; 1TVK B; 4TWK A; 2JVD A; 3QO8 A; 4TUY A; 4E2L A; 1S76 D; 4DV5 B; 1RM1 C; 3DXR A; 1L8D A; 4C7U A; 2KQX A; 2XAG A; 1I08 A; 3HR0 A; 3OT7 A; 5L3C A; 3ZMT A; 4X1K B; 1Y74 A; 1JFF A; 1XIL A; 3LSS A; 3E8B A; 1HNX O; 4TT3 G; 3SPI A; 2Y0I A; 3EFF K; 4L8J A; 4NYK A; 2D3O W; 1GH6 A; 2A9H A; 5KUK A; 5LGN A; 2EBO A; 4ZHQ B; 4DV5 O; 3UO3 A; 1BCC H; 4LCU C; 5LGT A; 4MW3 A; 2HVK C; 2DWE C; 3CME V; 3QNE A; 2HJF C; 1VF5 B; 4DV0 B; 4LWS A; 3CRC A; 2RCV A; 4IHJ A; 2X6A A; 3L72 H; 1H2K A; 2DYS B; 1KB9 F; 2DYR C; 3TJT A; 3C3S A; 1NR7 A; 3OW2 U; 1MG1 A; 5LXT A; 1WA8 A; 3KKY A; 4DV0 O; 1QCE A; 1NVP D; 4X1I A; 2F23 A; 5EZY A; 5E79 Z; 1FFX A; 3B4S A; 1K34 A; 5L3G A; 3OM3 B; 2LQT A; 2QTS A; 1TGO A; 3ETE A; 2QWO B; 4OXS A; 1TUB A; 1XMQ B; 1F7Y A; 3LNN A; 1KP3 A; 3OUS A; 1TA8 A; 4FFK A; 1L0L H; 1VQ9 V; 1N36 B; 1KUQ A; 5IJ0 B; 2ZD9 A; 4UB8 Z; 4UVA A; 3ICX A; 5EIB C; 5JH7 A; 5IWA B; 4I0X B; 5DEC A; 1VQ6 V; 1PNK A; 1JMK C; 2WLL B; 1QBZ A; 5LYJ A; 4X89 A; 2Q5Z A; 1I0H A; 1XL6 A; 1XMQ O; 1V55 B; 5CBF A; 5FPO A; 5LA6 B; 4F6R A; 2NN4 A; 1R6K A; 1N34 B; 1T5E A; 1Y6X A; 3RYF B; 4JI8 B; 1N36 O; 4U7O A; 1S77 D; 1FFT B; 4DR5 B; 5IWA O; 3G6B A; 2BTO A; 3KG2 A; 3E8H A; 4GKK B; 5B1N A; 2E5L B; 4IIJ B; 1YEW A; 2CAZ C; 4YJ3 B; 2UXN A; 2W0F C; 1N34 O; 3AG2 B; 2CK3 G; 4JI8 O; 3LNM B; 3WG7 C; 1XQ8 A; 2FTK A; 4DR5 O; 2GDS A; 1SQF A; 3CRR A; 1SQP H; 5GTI Z; 3TGU H; 4CH3 A; 4GKK O; 2XTA A; 1QLE B; 1M9N A; 1K97 A; 3I5D A; 5B3S B; 3AG4 C; 2E5L O; 5B1A C; 4YIO A; 4DW1 A; 2E3C A; 2OCH A; 1K3E A; 3L75 H; 4JTA B; 2EIL B; 1VQ5 V; 3ZBH A; 1BGY H; 1EZJ A; 4LP8 A; 3HB3 B; 1KU9 A; 1PP9 H; 2ODM A; 3T1H B; 4X9Q A; 4I55 B; 1ZUQ A; 1IVS A; 1VF7 A; 2YEV A; 4FLX A; 5JJJ B; 2EIM B; 2EIJ C; 2QSA A; 2IU3 A; 1MZF A; 1ZWI C; 4W4K A; 4F6E A; 5J9P C; 3SJB C; 1XMO B; 1E1R G; 4HNA B; 2EZO A; 2QKA A; 1OJH A; 2Y4T A; 3W7U A; 2YIA A; 3RVY A; 5B5E Z; 3T1H O; 3ABK C; 3CCV V; 3HKB A; 3CCE V; 2FML A; 3SPJ A; 2Q7E A; 3T4Z A; 1PV0 A; 2ZXW C; 4FVM A; 3OR6 C; 4FLV A; 4DV4 B; 4J42 A; 1YCI A; 2PY5 A; 1XMO O; 3J81 N; 1Q3E A; 1WNS A; 1UJW B; 1M56 B; 1K5S A; 1L1F A; 2YXY A; 4X1I B; 5L3B A; 4OPH A; 1Y66 A; 4QPK A; 3ZMS A; 2NR5 A; 3Q4H B; 4HYO A; 4I50 B; 5C8Y A; 3OTF A; 4ZOL B; 4B3S B; 3ZED A; 4DV4 O; 3AK3 A; 1NR1 A; 2Y69 C; 4R50 A; 4DR7 B; 5EBL C; 1GN6 A; 4MTF A; 4BWA A; 4GX0 A; 3QG5 A; 1XI1 A; 1MA1 A; 1U97 A; 3ABU A; 5IT9 N; 1AI5 A; 4HAM A; 1Q82 W; 1B3Q A; 4B3S O; 1JA8 A; 1BL8 A; 4LBE C; 3JD2 A; 4B08 A; 2P6J A; 1SS3 A; 5LYJ B; 5J2U A; 1PPJ H; 3D36 A; 5B1B C; 2JS5 A; 4F6R B; 2QE7 G; 4TSF G; 2IW5 A; 3E2E A; 1URF A; 1Y76 A; 3S3X A; 2Q7G A; 4LFA B; 2KG7 B; 4I4T B; 2ITC C; 4TQD A; 1SZX A; 2Z0A A; 2E74 B; 3J7A U; 4ZI7 B; 1K4C C; 3JD0 A; 3SPG A; 3TET A; 4LNU B; 3IC7 A; 3CCS V; 3ABM C; 2LFR A; 4NKG B; 2IJH A; 2ZE7 A; 2RQ6 A; 4Q6G A; 3AK1 A; 4JAA A; 5FNV B; 2W0X A; 4RQF A; 2EX3 A; 2B9Z A; 3JAK A; 2FYU H; 1NT2 B; 4LFA O; 4FZ1 A; 2L6L A; 1AB3 A; 3K04 A; 4FIP C; 3KZI Z; 1AR4 A; 3CD6 V; 1M93 A; 3J80 N; 2XAJ A; 2EIK B; 4MT8 A; 2ILM A; 2C2A A; 3W7T A; 4CH4 A; 4J7Z A; 3D3Q A; 5GON B; 1SES A; 3SPC A; 4WFF A; 2H3O A; 2R9I A; 2N05 A; 3ZHT A; 3RGB A; 1QR8 A; 4J7K A; 1OCO B; 4EB6 A; 5CA0 B; 4X1Y A; 3CWB H; 3RYC A; 3RYI A; 1ENV A; 2DQ3 A; 2DOS A; 3OEH G; 4MSW C; 4DV2 B; 3HKD A; 2GTS A; 3OGC C; 1VQN V; 2YI9 A; 4ASU G; 4NVP A; 2QEX V; 2YSU B; 1B6Q A; 2Q0A A; 4DUZ B; 2V7Q G; 3APO A; 4FFB A; 3R66 A; 3HKE A; 3ASO C; 2VQF B; 1QHT A; 4O4I A; 4QIW F; 5H9C A; 5TIS Z; 3OAA G; 4DV2 O; 2Z3Y A; 3L73 H; 2ZNJ A; 5EK0 A; 1YXB A; 1JX9 A; 4O4J A; 2XAS A; 4PA6 A; 2YIB D; 3ZRW B; 1MMM A; 4FZ0 A; 3OR7 C; 4RWU A; 4D6T H; 4DUZ O; 1GKF A; 4B3M B; 1OCR C; 4LF4 B; 4QE7 A; 2CH7 A; 4XDL A; 2VQF O; 1FKA O; 2FL4 A; 2LO1 A; 4P9O A; 1H2S B; 1E1Q G; 5IYZ B; 5KMG A; 3CC2 V; 3CJH B; 3HPL C; 4ZKI A; 1CXZ B; 4PI0 A; 3CC4 V; 3AK2 A; 1RP3 B; 1YVW A; 2IJI A; 3W7W A; 4JI2 B; 4GKJ B; 2XT9 A; 1DK1 A; 3S3W A; 2IJK A; 3JD1 A; 2EIN C; 4J9Z B; 1SER A; 4JTC B; 1N32 B; 2OCC B; 3F7Y C; 4B3M O; 3X2Q C; 4LF4 O; 3BPZ A; 4PDL A; 3AG3 C; 4EFE A; 1J95 A; 4LC1 A; 2WLJ A; 4MVR A; 2PF4 E; 1BS3 A; 4TV8 B; 1XEQ A; 1IDS A; 5HFM A; 4R6Z A; 2Q6A A; 4R7C A; 5JJE B; 4JI2 O; 4GKJ O; 1D5A A; 3LSQ A; 3B09 A; 4DUY B; 1YIT V; 1M5I A; 3T4D A; 3M99 B; 4DV7 B; 1N32 O; 1X4T A; 2HLD G; 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4B7E A; 3BA9 A; 4DV3 O; 1AR5 A; 2OYQ A; 1AVM A; 1Z2G A; 4J9Y B; 5H5N A; 2ZNI A; 4WF9 V; 1AJQ A; 3WB2 A; 1IBK O; 3M8A A; 5JWP A; 3FAV A; 1YTF B; 4JI0 B; 1KMI Z; 4I7Z B; 4JI7 O; 3FD9 A; 2BTQ B; 4LFC B; 3RYH A; 4GLX A; 4JI1 B; 1XHX A; 1EBO A; 1X59 A; 1S5J A; 1N0N A; 2CGO A; 3B77 A; 2DW4 A; 2PTM A; 4UVB A; 5J2T B; 3LDD A; 2ITD C; 3K79 A; 4JI0 O; 5GTH Z; 5H6Q A; 3WG7 B; 3ZHV A; 3DC6 A; 4X20 B; 5JJN B; 1H38 A; 4U3J B; 1CPY A; 4LFC O; 2LGQ A; 2YDE A; 3MD0 A; 2JGU A; 5F2V O; 2RNB A; 3AG4 B; 4JI1 O; 4WCE V; 5B1A B; 2QKS A; 1P4R A; 3ABT A; 5CA1 B; 1EFR G; 2Y48 A; 4TV9 A; 4WBN A; 1YF2 A; 3F5T A; 1MZE A; 3N2G A; 5B66 Z; 4ICG A; 4QPJ A; 2R9A A; 3MDS A; 4PA4 A; 4E4E A; 3CCQ V; 2BOB C; 2HEP A; 2VS0 A; 3OE7 G; 5LL6 Y; 2EIJ B; 2UUB B; 1VQK V; 4UUJ C; 3T1C A; 1BSM A; 3D8C A; 2BCC H; 5EC1 C; 5JQG B; 3CCR V; 3WB1 A; 4EFB A; 1PD3 A; 3CMA V; 4NXN B; 3K58 A; 3CCU V; 2CTR A; 5IYB O; 2XAQ A; 4O2B A; 1WPX A; 4DXW A; 3B2E E; 5BXZ A; 3ABK B; 1FD9 A; 3MAQ A; 4MVS A; 1H2G A; 2ADP A; 3WB0 A; 4DRX B; 3ABL C; 4CZZ A; 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