The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
DPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPCKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Heat shock cognate 71 kDa protein
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| publication title |
Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Bos taurus
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| molecule tags |
Chaperone
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| total genus |
29
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| structure length |
92
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| sequence length |
92
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| ec nomenclature |
ec
3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase. |
| pdb deposition date | 2007-08-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3UO3 A; 1BQ0 A; 3APO A; 2DMX A; 2OCH A; 2EJ7 A; 2M6Y A; 2CTQ A; 3AG7 A; 1GH6 A; 2QWO B; 2GUZ A; 2L6L A; 2QSA A; 2Y4U A; 2QWP B; 2QWQ B; 2CTW A; 2CTP A; 2QWR B; 3APQ A; 2N04 A; 2N05 A; 1WJZ A; 4IT5 A; 2PF4 E; 4J80 A; 3UCS C; 1BQZ A; 1NZ6 A; 2KQX A; 4RWU A; 2YUA A; 1XBL A; 2QWN B; 3BVO A; 3UO2 A; 2CTR A; 2CUG A; 2Y4T A; 1HDJ A; 4J7Z A; 2YS8 A; 2DN9 A; 1IUR A; 2LGW A; 1FAF A; 1FPO A; 2GUZ B; 1N4C A; 2LO1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5IWA O; 1XRE A; 3SPJ A; 3I55 V; 1QHT A; 1D5A A; 5CA1 A; 5JJJ B; 4QE9 A; 4DV3 O; 3LDD A; 5KHG A; 2DW4 A; 1MOF A; 3N2K B; 1TAE A; 3K5L A; 1NT2 B; 2JS5 A; 4YHH O; 3SYA A; 4ABM A; 3H1K H; 4FIP C; 2Y0I A; 5CB4 A; 2ZD9 A; 1FXV A; 2LQT A; 3ZHU A; 1Q90 D; 3SPG A; 4FLU A; 2M6Y A; 2UXB O; 2YIC A; 3SYQ A; 1RM1 B; 3D36 A; 1T5E A; 4UUJ C; 1AI4 A; 2DWD C; 3G67 A; 5B1B C; 1OCO C; 1BCC H; 3L75 H; 4CH5 A; 2QKS A; 2P06 A; 4O2A B; 1S5H C; 4YJ2 A; 1YTF D; 3B4S A; 1TGO A; 3QTC A; 3AG4 B; 3MHH C; 4I0X A; 5H6R A; 3RYI B; 4DV2 B; 1SS3 A; 1JFF B; 2WLI B; 1W0K G; 1FD9 A; 2QWO B; 5EIB C; 5FPR A; 3OMI B; 2GBO A; 4JI3 B; 4PJ0 Z; 2LJ2 A; 4UB6 Z; 4JI6 B; 2EBO A; 5EYP A; 3C3S A; 5ITZ B; 1F7Y A; 1KP3 A; 1BGY H; 4JF3 A; 4UCU A; 2QSA A; 4G2K A; 4MVR A; 4KHP O; 4WFF A; 3FAV A; 2DJV A; 3HPL C; 1QLE C; 4MTG A; 1ZUQ A; 1AJQ A; 3ZED A; 5KHJ A; 4E4E A; 2JJ1 G; 3HKE A; 1MZF A; 1Q82 W; 4LF4 B; 1L0N H; 5GTH Z; 5HFL A; 4GKJ O; 2CGN A; 3RWR D; 5CBH A; 5JVD B; 3FB7 C; 1FXK C; 1WAZ A; 2VRZ A; 3CJH A; 2CH7 A; 4JI4 B; 1BL8 A; 1OCZ C; 1VQO V; 1AR5 A; 2B5U A; 2XAF A; 2JGU A; 4NTY A; 4O4I A; 5EC2 C; 2XAG A; 3CME V; 4UXN A; 2LO1 A; 3K79 A; 2ARH A; 3ZHT A; 3N2G A; 1WB7 A; 3KG2 A; 2XOK G; 1KMI Z; 5L3E A; 1GN2 A; 2CAZ C; 1ZAU A; 1NH2 B; 4Z1V A; 3K0D A; 3CCL V; 4FM0 A; 3RFR A; 3CRR A; 1S76 D; 1UJW B; 5IJ0 B; 1FAF A; 4O4L B; 1SA0 A; 4DR2 B; 5EBL C; 1FJG B; 4DRX B; 4PEL A; 1RSO A; 2IU3 A; 1HNX O; 4FK5 C; 1GM8 A; 1G1X B; 1H2M A; 3E8B A; 4IYH A; 1EZJ A; 1RM1 C; 1XNQ B; 2YI9 A; 5GON A; 1NR1 A; 2N74 A; 2CTR A; 2IJJ A; 4PA9 A; 1X59 A; 5J9P C; 3C3T A; 4PA3 A; 5B66 Z; 3ZN0 A; 2DMX A; 3AG4 C; 4LWS B; 3LSS A; 3T1H O; 5D5P A; 4RUE A; 3OAA G; 4L8J A; 1XHX A; 2KG7 B; 3BPZ A; 4DR1 O; 1A32 A; 3D3Q A; 4YY3 O; 2D2C B; 4GUN A; 1VQL V; 2WLM A; 2LFS A; 1Y6X A; 2YIB A; 4LC1 A; 1SKV A; 2P5O A; 3G71 V; 4FLV A; 1YIT V; 5IDJ A; 1YF2 A; 4BW9 A; 3G6E V; 5B5E Z; 3H1I H; 2PI4 A; 3EFF K; 1XQ8 A; 3E22 B; 4IGG A; 2JRI A; 3EHB B; 2ZE8 A; 3K04 A; 3ABT A; 4TV9 B; 4O2B A; 4PD4 F; 3SJA C; 3JAL B; 2CDY A; 5LHH A; 5IYZ A; 3QO7 A; 2Q9L A; 1WP7 A; 2JVD A; 2YXL A; 2ZIO A; 2JDI G; 3DTU B; 4NXN B; 5EK0 A; 4MTO A; 5KAF Z; 3TJT A; 3CB2 A; 5BMV A; 1P4R A; 5LXT B; 1VQ8 V; 4K3A A; 4X1I A; 1KP2 A; 1SER A; 5CBG A; 3T1Y B; 3K57 A; 5KLV H; 2GV9 A; 1H2L A; 4J11 A; 5L3G A; 1ZTE A; 1OCR B; 3F7Y C; 5EC1 C; 4CH6 A; 2ZXW B; 4MS2 A; 4MW8 A; 1R6T A; 1F4N A; 2QA4 V; 2FML A; 4GLX A; 2UXC B; 3CP1 A; 4HNA A; 3K06 A; 3ZHR A; 1YVW A; 1XI1 A; 4DUZ O; 4LFA O; 4H33 A; 5LOV B; 4GCZ A; 4DV4 O; 1PM9 A; 3SYC A; 5DEC A; 3OMA B; 4WF9 V; 2Y0P A; 3JAR B; 1S5J A; 5CMU A; 2X6C A; 1KUQ A; 3JAK A; 1K3E A; 1W0J G; 5CA0 B; 2OCC B; 1P7G A; 3ABU A; 3WB0 A; 1JR9 A; 1TVK A; 3FYE B; 1EZV H; 3N27 A; 4OPA A; 1EN5 A; 3FD9 A; 4J80 A; 3WB2 A; 2MK3 A; 4DV5 O; 4MVS A; 4NXM B; 2JGD B; 3L74 H; 2Q67 A; 2L35 A; 4HAM A; 2OIE A; 4H0L B; 2RJZ A; 5B3S B; 1R6K A; 4GYC B; 5BY1 A; 4R50 A; 2F4V B; 3RVY A; 1G4Y B; 5JCO C; 1R3L C; 2JJ2 G; 4B3R O; 3OGI B; 1JX9 A; 1XNR B; 2Z3Y A; 4X65 O; 1SQQ H; 4DR4 O; 4MW3 A; 1THZ A; 1HNZ O; 5LA6 B; 1Y76 B; 3WU2 Z; 3ZBH A; 4JYB A; 3VQX A; 1FPO A; 3TXS A; 4DR3 B; 3HKB A; 4IHJ A; 4BR6 A; 4CH4 A; 1L1F A; 3QO5 A; 2L6L A; 2VQF B; 3AG1 B; 3OGC C; 3JD1 A; 2P22 C; 1SQB H; 2UUC O; 3H01 A; 3CWB H; 4X9Q A; 2ETN A; 4QIW F; 5LMN O; 1M93 A; 4K0K B; 3FX7 A; 1RPR A; 1VQ4 V; 2KB1 A; 4JI2 B; 1GH6 A; 1GMG A; 2BE3 A; 3A0B Z; 2B1I A; 3OR6 C; 1OCR C; 3RYC A; 3J7A U; 3STZ C; 1K4D C; 5JQG A; 4MVQ A; 2ZXW C; 3AK1 A; 1OJH A; 4LF8 O; 5H6Q A; 3AEI A; 3BVO A; 4OX9 B; 1PD3 A; 3AG3 B; 3IFX A; 4JAA A; 5HFM A; 4Q6G A; 4X1Y A; 2V4D A; 4FLY A; 3DXR B; 1BHB A; 2CTQ A; 5JH7 A; 4FM2 A; 1F23 A; 2QR4 A; 1WA8 B; 3E83 A; 3HB3 B; 3I56 V; 4B7E A; 3K5M A; 3ZS8 C; 1DK1 A; 3BA8 A; 2WLK A; 1YCI A; 4ZI7 A; 3T1C A; 4TUY A; 3ZRW B; 4F6R B; 2EIN B; 4ZHQ B; 1QU7 A; 4YJ3 A; 2G38 A; 3L70 H; 1M4U A; 4LP8 A; 3E86 A; 1XMO B; 4WBN A; 2OCC C; 2PTM A; 2DQ0 A; 2LW1 A; 4IIJ B; 2QWR B; 2Y48 A; 2HJD A; 5IE9 A; 4CZZ A; 1WNS A; 4B3T B; 1N32 O; 4FJC C; 2HJF C; 2E5L O; 1LUV A; 3O65 A; 3ETE A; 4LFB O; 3ZCC A; 5B3S C; 1WP8 A; 3QVN A; 4I55 A; 5F2V O; 3E2E A; 1HNW B; 4UVC A; 1XMQ O; 2ZE6 A; 4FLZ A; 2PYL A; 1JOY A; 4WCE V; 2ATK C; 5CA3 A; 2F66 C; 1JJ2 U; 2ZNI A; 4N23 A; 1EN6 A; 1BSM A; 1MMM A; 1SZX A; 2VWK A; 2PY5 A; 4XDK A; 3B40 A; 1BHA A; 1KEC A; 4ZKI A; 2ZIM A; 2QJ1 A; 5H2F Z; 1SQX H; 1K34 A; 3L72 H; 4UCT A; 2NN4 A; 3CRQ A; 1VQ9 V; 3TXQ A; 1J5E O; 1XUQ A; 2QKA A; 3K9A A; 1VQ7 V; 1WN7 A; 3ETG A; 3AG1 C; 4MVO A; 2HHH B; 5B1A B; 1B04 A; 3OR7 C; 3LUT B; 5FNV A; 4RQF A; 4R7C A; 3RYF B; 2MW2 B; 5BR8 B; 5KUM A; 3HKD B; 2H94 A; 1SQV H; 1K4C C; 2YIB D; 3CS5 A; 2UUA B; 3HR0 A; 3W7X A; 3W7W A; 5KA6 A; 2X0L A; 4JI8 B; 4FZ1 A; 3K5N A; 2ZM6 O; 3ZX6 A; 2HG5 C; 2H3O A; 3SPC A; 2P90 A; 3ZJZ A; 4MVZ A; 1O9H A; 3OD4 A; 1HNX B; 3JAS A; 5GTI Z; 3AG3 C; 4JI0 B; 1Q6I A; 1Z2G A; 1O9G A; 3K08 A; 2EIK B; 4OXS A; 2QGN A; 1PP9 H; 2F1M A; 4FZ0 A; 4ICG A; 3EXA A; 5IJ9 B; 2ADQ B; 3MDS A; 5KA5 A; 1ARO P; 5AG2 A; 1Q7Y W; 4DV1 O; 2Y4T A; 4PV1 B; 1GK9 A; 1S0V A; 2EIN C; 2UU9 B; 1PV0 A; 2BTQ A; 1WPX A; 2AZ0 A; 2IJH A; 4BIO A; 1NS1 A; 1BQ0 A; 4AQY B; 1VQ5 V; 4FFB A; 3EVK A; 4YY3 B; 5H5N A; 1V54 C; 1RP3 B; 3SJQ C; 1VF6 C; 4TOI A; 4I50 B; 3R66 A; 5FPO A; 4HBN A; 5KX5 A; 2Q73 A; 1N36 O; 5IY5 B; 2XT9 A; 1NVP B; 2AZ2 A; 2OTL V; 3GB7 C; 4P9O A; 4OGQ B; 4TQD A; 4DR6 B; 2YEV B; 2UUB B; 4UCV A; 1YEW A; 2BSK B; 3W7T A; 2LGQ A; 1YTF B; 2FYU H; 1NKD A; 3TK1 A; 2V1D A; 5J2T B; 3JAW B; 1VP7 A; 5LHI A; 3STL C; 3QNE A; 3ETD A; 1IBK B; 3ABK C; 2F95 B; 3SYO A; 3FKS G; 3VQW A; 3CC4 V; 4GX0 A; 2Q0O C; 1ROP A; 1FFT B; 3SPH A; 1TUB B; 3ZHQ A; 3E8H A; 3RYH B; 4NVP A; 2XUM A; 4LF6 B; 4U7O A; 1LR1 A; 1SET A; 1GTO A; 4X1K B; 3ZMU A; 1KU9 A; 4B3S B; 1R3K C; 4LNU B; 3GWO A; 4LF7 B; 2JK5 C; 5B1A C; 4PDL A; 1JJO A; 5LGT A; 3UM7 A; 1FS0 G; 2ZT9 B; 1Q81 W; 2EIJ B; 4U3J B; 3ASN B; 4J42 A; 1N0N A; 1ZL8 A; 3NXS A; 1COW G; 4GKK B; 2N05 A; 2VQE O; 3OTO B; 3AG2 B; 4J7J A; 1YIJ V; 2Q69 A; 2GSM B; 2HVJ C; 4KL1 A; 4DV4 B; 3FYI B; 2XHB A; 1IZ3 A; 3L71 H; 4GX1 A; 4CBC A; 3NR7 A; 5KMG A; 4DUY O; 1Q6U A; 2EUL A; 2Y69 B; 1EBO A; 1G8M A; 4IYI A; 3T4Z A; 1GN3 A; 2EIK C; 4W4K A; 4UV9 A; 1NTK H; 3UO2 A; 1H38 A; 3JCZ A; 1HR0 O; 1YSC A; 4X64 B; 1V9P A; 3AK2 A; 3HKC A; 2OIG A; 4J9Z B; 2XAH A; 1NH2 D; 3J81 N; 2YIA A; 3F5T A; 4DV5 B; 1R6N A; 2EIM B; 2WA4 A; 4QJF B; 3APQ A; 2FKX A; 4DV6 O; 2X7R B; 1G6U A; 1FFX B; 3WB1 A; 4LF5 B; 3IGA C; 3C90 A; 3RW0 A; 4G27 B; 4DV0 B; 1MSW D; 2XAQ A; 3ZMT A; 5K1X A; 5LMU B; 2CUG A; 1QVG U; 2JEU A; 4I4T B; 5IY5 C; 1I94 O; 4JI7 O; 1P7B A; 2UXD O; 3APO A; 2HR3 A; 4JYA B; 3AG7 A; 3U0Z A; 1XOU A; 4R8C A; 2EZP A; 5LP6 B; 5C93 A; 1MZE A; 4IT5 A; 1HNZ B; 3CPW U; 2OTJ V; 4EB6 B; 1IBL B; 5LYJ A; 5JJN B; 1BZK A; 3DC5 A; 4LH7 A; 4TWK A; 1QBZ A; 3KZI Z; 4O4J B; 4PI0 A; 1FXK A; 1GM7 A; 5EBM C; 4OPH A; 4JV5 B; 1PPJ H; 3S3W A; 4LFC B; 3ZMV A; 4I5S A; 1IDS A; 4XDJ A; 4DO2 A; 2A9H A; 2ITD C; 4X20 A; 2F43 G; 3JAT A; 1K92 A; 2QWN B; 2WAM A; 4BAY A; 4PI2 A; 4UCR A; 3KKY A; 3Q4H B; 1H8H G; 2JIZ G; 1SQF A; 4ZOL B; 2ZQM A; 3AK3 A; 4DV2 O; 2P67 A; 5C8Y B; 3K0G A; 4DR5 B; 1PNL A; 2EIJ C; 4H13 B; 3VQV A; 1OZ0 A; 2PF4 E; 2LP7 A; 2WPD G; 3ASN C; 3ZMS A; 1K9M W; 4JI3 O; 3CMA V; 3N2K A; 5B1N A; 2ODM A; 4JI6 O; 1Y74 B; 1BE3 H; 3JCU Z; 3AG2 C; 4D7S A; 1OHH G; 2WLL B; 5A9G A; 3JSL A; 3M99 B; 1Q8I A; 1AJP A; 4MTX A; 3BCC H; 2C2A A; 2PI5 A; 1ZSP A; 1SRY A; 4EKW A; 5KHI A; 3CD6 V; 1Y67 A; 1K97 A; 2WLH A; 4XDL A; 2Y69 C; 2HEP A; 4KXR A; 3U10 A; 4ZIB A; 3BHP A; 4TV8 B; 5L3F A; 4O2A A; 4JI5 B; 1QR8 A; 1FYJ A; 4BW5 A; 5CN0 A; 3RYI A; 3UT5 A; 3JD2 A; 3JD0 A; 1DTO A; 4LF4 O; 1WB8 A; 1JFF A; 1BMF G; 4DW1 A; 1S3J A; 3DSQ A; 4DXW A; 4LCU C; 1N32 B; 3G4S V; 2EIM C; 1VQK V; 4JI4 O; 1IX9 A; 1M56 B; 4R6Z A; 1KB9 F; 1JCH A; 2K9P A; 5ITZ A; 2BOC C; 1N4C A; 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4LWS A; 3ZIA G; 1ZWI C; 2YI8 A; 4WFB V; 2KG7 A; 3HKE B; 1AP5 A; 1SES A; 2HVK C; 1DF4 A; 1IXM A; 5FLX N; 3CXC U; 1H8E G; 2RDC A; 4J41 A; 3T1Y O; 1M56 C; 3FFQ A; 4JYC A; 2GTA A; 3CJH B; 2CH7 B; 5JCO A; 4P9P A; 1TA8 A; 1CEZ A; 4I9Q A; 5L3B A; 3PN1 A; 4F4L A; 4WFH A; 4YIO A; 2XAJ A; 4FLW A; 4JI1 O; 3E22 A; 4D6T H; 4O4I B; 3CCS V; 2O57 A; 1I5Y A; 2Q4P A; 2R9A A; 2UXC O; 1XEQ A; 1RPO A; 4KP4 A; 3CCE V; 3UO3 A; 4TV9 A; 4KHP B; 1NTM H; 3N2G B; 4X66 O; 3JAL A; 1L0L H; 3TCU A; 4QNH B; 3CCV V; 1XL6 A; 3P3P A; 1AI6 A; 3ABM B; 3S3X A; 1NTZ H; 2B1G A; 1DGS A; 5EIB D; 3A0R A; 1NZ6 A; 4DR7 O; 2YUA A; 2KSD A; 1ORQ C; 1U96 A; 2YXH A; 5LXT A; 4GKJ B; 1SA0 B; 1AVM A; 1K5Q A; 4RO2 A; 1HW7 A; 1RSO B; 2B9Z A; 1I0H A; 2P4V A; 3P32 A; 1QNM A; 4U7N A; 3RN4 A; 3M8A A; 3T2M A; 4CC5 A; 3D36 C; 3PJS K; 3TGU H; 4FLX A; 5GON B; 2HKO A; 4PDR A; 2YID A; 4NXM O; 2YXY A; 4WFE A; 4X62 O; 4RAI A; 4EFE A; 1K8A W; 1L8D A; 3VQY A; 3SGI A; 1B3Q A; 1S72 V; 5LOV A; 2WA3 A; 1M5I A; 2F4V O; 5LYJ B; 2HP8 A; 1YJN V; 4XBF A; 2Z5U A; 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