The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
DPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPCKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Bos taurus
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| molecule tags |
Chaperone
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| molecule keywords |
Heat shock cognate 71 kDa protein
|
| total genus |
29
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| structure length |
92
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| sequence length |
92
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| ec nomenclature |
ec
3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase. |
| pdb deposition date | 2007-08-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DN9 A; 2GUZ B; 2OCH A; 2QWR B; 2QSA A; 2QWO B; 1BQ0 A; 3UO2 A; 3AG7 A; 3UO3 A; 2KQX A; 1WJZ A; 2GUZ A; 1XBL A; 1BQZ A; 2EJ7 A; 2N04 A; 1NZ6 A; 2LO1 A; 1GH6 A; 1HDJ A; 2QWN B; 2Y4T A; 2QWQ B; 2DMX A; 4J80 A; 1IUR A; 4RWU A; 1FPO A; 2CTR A; 3BVO A; 1N4C A; 2N05 A; 2YS8 A; 2L6L A; 2QWP B; 2CTQ A; 3UCS C; 2CTP A; 2M6Y A; 2PF4 E; 4J7Z A; 2YUA A; 2LGW A; 3APO A; 4IT5 A; 1FAF A; 2Y4U A; 3APQ A; 2CUG A; 2CTW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1RP3 B; 2QSA A; 2QWO B; 4PA4 A; 2GDS A; 4LNU A; 4I55 B; 3JAR B; 3BCC H; 1SQG A; 1P7B A; 3HB3 B; 3ETQ A; 5FNV B; 2WWW A; 2RDC A; 5LA6 B; 3H1I H; 3H01 A; 3L73 H; 1FXH A; 2Q7H A; 3OUF A; 2WLL B; 5IE9 A; 3RWR D; 1QHT A; 3ZED A; 2UXD O; 5GON B; 1XMO B; 1VQM V; 4JI1 O; 4JZG A; 3RT3 C; 3TGU H; 4DUY B; 1HDJ A; 4QPK A; 2A7W A; 5GTH Z; 2Y69 B; 2X6A A; 1URF A; 3F5W C; 4BW9 A; 4K8Z A; 3SYO A; 4QE9 A; 1KC8 W; 2HFE C; 1YSC A; 1N32 B; 1Q6U A; 1JCH A; 1E79 G; 5KUM A; 5A2Q N; 2Q67 A; 3JCZ A; 3OW2 U; 4DV3 O; 4FLW A; 2OCH A; 1XIL A; 3D3I A; 1NTM H; 4O4J B; 1I5X A; 2DWD C; 2LJ2 A; 1S72 V; 1PP9 H; 4P9P A; 2Y4T A; 4EFB A; 1CP9 A; 2RJZ A; 4IIJ A; 3ZHU A; 2Q69 A; 3W7X A; 4HBN A; 2JEX A; 3RYH B; 4G28 B; 2LFS A; 3CB2 A; 3OEH G; 1HW7 A; 2UUB B; 4LF6 O; 3FB5 C; 2EUL A; 4JI5 B; 1AR1 B; 2B1G A; 2ODM A; 2IJK A; 2DMX A; 2C2A A; 3CS5 A; 1X59 A; 5L3F A; 4L87 A; 4X20 A; 4QIW F; 1MMM A; 3Q4H B; 2BOC C; 5KAI Z; 3T1Y O; 1LNQ A; 1QLE B; 4CH4 A; 3BA8 A; 3CPW U; 1DF4 A; 5KA5 A; 5B66 Z; 1OCR C; 3AG1 B; 3H1K H; 3E22 A; 5DEC A; 3T1C A; 1W0K G; 4FM2 A; 1KQS U; 4KHP O; 3L9D A; 3SR2 C; 2M6Y A; 1YXB A; 3OD4 A; 4LC1 A; 4X66 O; 5LP6 B; 1NVP D; 1M90 W; 4K8X A; 1UJW B; 3SYQ A; 3X2Q B; 4OX9 B; 3AG3 B; 4TV9 A; 2LFR A; 1RM1 C; 3FFQ A; 4JYA B; 1BL8 A; 4W4K A; 3JD3 A; 4TWK A; 4ZOL A; 1S5H C; 2XAH A; 2EBO A; 5E1A C; 1JJ2 U; 3JAW A; 1VQ4 V; 3RYI B; 1RPR A; 4J10 A; 1Z5V A; 1E1Q G; 2F1M A; 1G1X B; 3ZHV A; 3BEH A; 2UXD B; 5B1A C; 1K97 A; 2P22 C; 2ATK C; 4X65 B; 3IC9 A; 3PJS K; 4IIJ B; 2B1I A; 4FMT A; 1XQ8 A; 4NVP A; 1OCO C; 2ZE5 A; 4N23 A; 5JVD B; 1O9H A; 4UB6 Z; 1H8H G; 4IYH A; 4PJ0 Z; 5KA6 A; 1I0H A; 5C8Y A; 2X7R B; 3AG7 A; 5JCO A; 1NH2 D; 3FYI B; 1YTF B; 4LF7 O; 4QJF B; 3ZHR A; 1WA8 B; 2ILM A; 3CSX A; 3SDL A; 5KLV H; 4BW5 A; 4F6R B; 4LF6 B; 3OUS A; 4PDL A; 3IJ4 A; 2XAS A; 4TUY A; 2FML A; 4AIL C; 1XMQ O; 3CE2 A; 3J81 N; 3BY6 A; 3H1L H; 4BR6 A; 4O2A A; 2ZDI A; 3RVZ A; 2XT9 A; 1ARO P; 1H2L A; 3JD2 A; 1ZWI C; 2RNB A; 4ZIB A; 1Y76 B; 4FLY A; 4LNU B; 3E89 A; 1I94 B; 4D7T A; 2EIJ B; 1PL4 A; 3CMA V; 4MW3 A; 5F2V O; 2YC0 A; 2DE0 X; 1W59 A; 4MTG A; 1N32 O; 3K57 A; 1UPG A; 2XND G; 2JS5 A; 5KMG B; 3OT7 A; 2DWE C; 4YJ2 B; 3SGI A; 4AI8 A; 1HP8 A; 5GON A; 4ABM A; 1V9P A; 4FLV A; 4JZ2 A; 3BVO A; 2V1D A; 2QJ1 A; 2NN4 A; 2DOS A; 4G2K A; 2PI4 A; 3N2G B; 3A0H Z; 3AK1 A; 4EEQ A; 3OTO B; 4MVQ A; 2XAQ A; 2CAZ C; 1I7F A; 3SJA C; 1YIJ V; 2KQX A; 4Z1V A; 1FJG B; 2N74 A; 3CCS V; 3LUT B; 2VQE O; 2WAM A; 3ZX6 A; 1SER A; 2CTR A; 4WFA V; 4BIU A; 1Q82 W; 1I5Y A; 3H9V A; 5HFM A; 2K1E A; 5EIB C; 1AI4 A; 1YJ9 V; 4X65 O; 1EM1 A; 1Q7Y W; 3VQW A; 2L35 A; 2Q8V A; 2QTS A; 2P5O A; 3GWO A; 1THZ A; 3P30 A; 2AHZ A; 5JJE B; 2P7T C; 2QWQ B; 2ZNJ A; 3CC7 V; 4X1Y B; 3L75 H; 1DGS A; 1OCC B; 3L70 H; 4O4L A; 3IAY A; 4U3F H; 1Z2G A; 1JFF B; 4LFC O; 1TUE B; 3CX5 F; 3WB2 A; 4L8J A; 4O4H A; 3AG4 C; 4JI0 B; 3BAA A; 1YEW A; 4N21 A; 2VQE B; 1MSW D; 4FFB B; 4B7K A; 2Q0A A; 2GHY A; 4CS4 A; 3CWB H; 5LMU B; 2FTK A; 4X1K B; 3ABM B; 5CMU A; 1XRE A; 2EIN C; 5KX5 A; 1HNZ O; 1VQ7 V; 4JI1 B; 1HWY A; 1US6 A; 4ICG A; 4I7Z B; 4J9Y B; 4I9Q A; 2R9I A; 2JRI A; 4DR6 B; 3R66 A; 4TV9 B; 2EIK C; 1K5Q A; 1QBZ A; 1P84 F; 2X0L A; 2Y48 A; 3ZMU A; 3OR6 C; 3B2E E; 1ZTE A; 2NR5 A; 3QO8 A; 1VQ6 V; 4LF5 B; 2UXB B; 2DYS C; 5DED A; 4JTA B; 4GKK O; 3ZRX A; 2ARH A; 3TCU A; 2CGO A; 1IBL O; 1GRJ A; 1NR1 A; 2EJR A; 3CXC U; 4WBN A; 3ZIA G; 1YCI A; 1WP8 A; 5LOV A; 4IHJ B; 2ETN A; 3ASO B; 2UUA O; 4PD4 F; 4XBF A; 2F4V B; 5BMV B; 2PZS A; 1ZL8 A; 5LHI A; 1GN3 A; 2KG7 B; 4ZHQ B; 4U3J A; 2HHH O; 2QEX V; 1V55 C; 4JYC A; 3APQ A; 4NB5 A; 4PDR A; 2IJI A; 3ABT A; 5KHG A; 3J80 N; 1SQF A; 3JAM N; 4TQD A; 5C8Y B; 1R6T A; 2ZT9 B; 5LYJ A; 1PD3 A; 2OCC C; 2Q4P A; 2WLH A; 4WFF A; 1YVW A; 4O4I B; 1SQX H; 1PV0 A; 3SJC C; 2H8P C; 1EZJ A; 1TGO A; 4TV8 B; 4LF4 B; 2PF4 E; 2G38 A; 4X88 A; 4RUE A; 1P7G A; 1SZX A; 4J7K A; 4RQF A; 3D8C A; 2ITC C; 1B06 A; 4QE7 A; 4DV5 B; 3K5M A; 4LBE C; 1XNQ O; 4J80 A; 2HHH B; 3U10 A; 1MOF A; 4CH3 A; 2K9P A; 1ZX3 A; 1FXK B; 5J2U A; 4JI3 B; 1D5A A; 2QKA A; 4RAI A; 1IX9 A; 5IJ9 A; 2CTP A; 1CPY A; 3H1H H; 2E76 B; 3CCE V; 2P06 A; 1XBL A; 1LUW A; 2YIC A; 1M1K W; 2QDO A; 4UV9 A; 2JGD B; 1N36 B; 1KP3 A; 4XDJ A; 4DO2 A; 1XI1 A; 1SF9 A; 3ZS8 C; 4J7J A; 1L8D A; 1A32 A; 3HR0 A; 1IXM A; 4DV6 B; 4X64 O; 1R3I C; 5EBW C; 1XNR B; 4D6T H; 4DW1 A; 3CCQ V; 3FB7 C; 4GX2 A; 1MZF A; 1K7D A; 2BTO A; 3CYO A; 1W0J G; 3MDS A; 1TUB B; 2RCV A; 1ZL8 B; 4ZHQ A; 4JAA A; 2PY5 A; 3CJH A; 3LDD A; 3RYH A; 2PGG A; 2NLJ C; 1TVK A; 3A0R A; 3E8B A; 1SQV H; 4OPH A; 5CBH A; 3M7M X; 1J95 A; 3W7U A; 5LYJ B; 4UCR A; 1S5J A; 3JYC A; 2N04 A; 2WLJ A; 1KKD A; 3UT5 A; 2VWJ A; 2ZIM A; 2ZIN A; 5TIS Z; 1DLB A; 1N33 B; 4I50 A; 3ZRV A; 4PI0 A; 4GX1 A; 1I08 A; 1R6K A; 2OIG A; 5KHH A; 5K1P A; 2OT5 A; 1VQ5 V; 1ZLZ A; 1IBM B; 1JFF A; 2QM7 A; 2Q68 A; 3T4D A; 4DK1 A; 2XHB A; 5LP6 C; 1JX9 A; 3CCV V; 4ASU G; 4J42 A; 1LR1 A; 2VQF B; 4B3R B; 2AZ0 A; 5L3E A; 4YY3 O; 1H2N A; 4X1I B; 4WFG A; 2JDI G; 4MVZ A; 1VF6 C; 1OV9 A; 2HVK C; 5CB4 A; 1SES A; 1JVM A; 4LR3 A; 1NJI W; 5BZB A; 3ZN0 A; 4H33 A; 2Q7E A; 3AG2 C; 2R9R B; 2WA3 A; 3ABL B; 1P49 A; 4ZBM A; 2IJH A; 1M57 C; 3TXS A; 1Q81 W; 3JAW B; 3CCU V; 1NTZ H; 1XMO O; 4KFM A; 4F6E A; 2UXC B; 4I9W A; 3OMA B; 4YHH B; 2JGU A; 2IH3 C; 3FD9 A; 1NI8 A; 2EIL B; 2DJV A; 5CN0 A; 3G6E V; 4DW0 A; 2QWN B; 1BS3 A; 4WBN B; 4DR4 O; 4BIO A; 1HNX O; 5BMV A; 3LNM B; 3P3N A; 1OZ0 A; 3O65 A; 4CH5 A; 4U3J B; 4TSF G; 1WA8 A; 1SKV A; 1QQC A; 5LMN O; 2FL4 A; 2Q9L A; 2ZE6 A; 1WP7 A; 4I50 B; 1WAZ A; 2V4D A; 1JPX A; 4DR7 B; 2Y0P A; 4JI4 B; 1AI5 A; 4O4I A; 4B3M O; 1WPB A; 1H2S B; 2CUG A; 2A79 B; 4JI8 O; 4UFZ A; 1BHA A; 4DUZ B; 3K3W A; 3K0G A; 3CP1 A; 4UXN A; 3BA9 A; 3K0D A; 4TQF A; 3JD1 A; 5LGT A; 1F23 A; 4Z1M G; 5LHG A; 1BT8 A; 5ITZ A; 2IM9 A; 5IY5 C; 4DYL A; 2UUC B; 2YI8 A; 1MNG A; 4KL1 A; 3RBZ A; 5J9P C; 4FJC C; 4DV4 B; 3W7S A; 1R73 A; 1K3E A; 4X89 A; 3ETG A; 5CA0 A; 4GX5 A; 2XAJ A; 1K4C C; 4QPJ A; 1K92 A; 1AR4 A; 2Q7G A; 2NNU A; 5K1X A; 1V54 C; 5GW7 A; 3ZMS A; 2AHY A; 2X6C A; 5CA1 A; 3GWK C; 1NKD A; 2HEP A; 1EBO A; 4JAV A; 2HKO A; 5JQG B; 3N27 A; 2AW9 A; 3RW0 A; 4PA9 A; 4GX0 A; 4NXN B; 3CXH F; 2IH1 C; 5L3D A; 1DF5 A; 1E1R G; 3DXR B; 3G4S V; 1Q6I A; 4JYY A; 3FX7 A; 2E74 B; 2CK3 G; 1KYO F; 4B3T O; 4D7S A; 5EYP B; 2XAG A; 4FIP C; 3AG1 C; 2ZXW C; 2XUM A; 4X1Y A; 3CCR V; 1FD9 A; 1VQ9 V; 2E5L B; 4FZ0 A; 1ZSP A; 2EX3 A; 3KZI Z; 4O4L B; 4UCV A; 4BWA A; 3ZJZ A; 3ZBH A; 3ZHQ A; 3D36 A; 3K5O A; 2Q6A A; 2JK5 C; 4GLX A; 1XHZ A; 1MAB G; 1XUQ A; 1VF6 A; 4I55 A; 2QM4 A; 1U96 A; 1KU9 A; 4JV5 O; 3UO2 A; 3K59 A; 3HKC A; 4UVC A; 1YJN V; 2WLN A; 1K5S A; 4FFB A; 4DV7 B; 2YXH A; 2OCC B; 4XDL A; 1W2B U; 2EIM C; 3OGC C; 3VBB A; 2WLL A; 5KX5 B; 5LL6 Y; 2ZM6 B; 1H2G A; 1AB3 A; 4YIP A; 4GCZ A; 3A8T A; 4X1I A; 1FXV A; 2ZR2 A; 4JI0 O; 2BTQ B; 3QG5 A; 3K08 A; 5CB4 B; 1K4D C; 2XOK G; 1H8E G; 1TA8 A; 3QTC A; 1KMI Z; 5CA0 B; 2F4V O; 4B3S B; 2JJ2 G; 5EK0 A; 2Q73 A; 4LFC B; 2LGW A; 2GV9 A; 3SYP A; 2VS0 A; 1AJQ A; 1RSO A; 3RVY A; 1ROP A; 5JQG A; 1H38 A; 1BQZ A; 3RYC A; 3HKE A; 3F5T A; 2Z0A A; 2Y69 C; 4DRX B; 2V7Q G; 4KXR A; 3J7A U; 1NU1 H; 3KCX A; 2A0L A; 2GTS A; 3OM3 B; 1R3K C; 3JD0 A; 5EYP A; 1YF2 A; 3N2K A; 4R7C A; 4A5U B; 1N33 O; 1YIT V; 1R1B A; 2F95 B; 2ZDI C; 4NTW A; 1ENV A; 4JI2 O; 3K5L A; 3E8H A; 1WB8 A; 1PPJ H; 3ZMT A; 2F66 C; 4E4E A; 4F4L A; 3ZRW A; 3OEE G; 1Y66 A; 3NR7 A; 4PA6 A; 1J5E O; 2DYR C; 3BAB A; 1D2D A; 3B8N A; 4DV0 B; 3CRM A; 3AK2 A; 2CDY A; 1RFY A; 1S5L Z; 1WJZ A; 4LF9 B; 2ZIO A; 3U11 A; 4DUZ O; 1O9G A; 3MAQ A; 3JAS B; 3VQV A; 5IJ9 B; 2HJF C; 4LH7 A; 3UKM A; 3JAT A; 4BIZ A; 1SRY A; 2WPD G; 1GM8 A; 1Q8I A; 4DR2 B; 4DR5 B; 2BTQ A; 4H44 B; 3MHS C; 1F4N A; 1Q6H A; 2DYS B; 5LGU A; 2EZP A; 1I94 O; 4FZ1 A; 1XNQ B; 5IYD O; 1FJG O; 2P4K A; 2N05 A; 5H5N A; 1MZE A; 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4K3A A; 3JAL A; 3IGA C; 1MG1 A; 2GSM B; 4X66 B; 4GYC B; 2AZ2 A; 3F7V C; 1BE3 H; 1QLN A; 1JOY A; 1R6N A; 1ZUQ A; 3KG2 A; 1K73 W; 4LWS B; 2OTJ V; 4JF3 A; 2YDE A; 1VEW A; 4IGG A; 3S3X A; 4LFA B; 2E75 B; 5D5P A; 2JVD A; 3VOU A; 1G4Y B; 1NT2 B; 1OCR B; 4PV1 B; 5B1N A; 3SPC A; 5CBF A; 4LF8 B; 2ZR3 A; 1FKA O; 5J2T A; 5FPO A; 5DM6 V; 3P32 A; 5IDJ A; 4FM1 A; 2YSU B; 4O4H B; 3F7Y C; 4MVU A; 3OMI B; 2QA4 V; 1BQ0 A; 2CH7 A; 5BY1 A; 2JEU A; 4FK5 C; 1GK9 A; 5B1B C; 3ABU A; 2DQ0 A; 3QO5 A; 4U7N A; 4CC6 A; 5KHI A; 5IYC O; 4U7O A; 2KKW A; 4X1K A; 2MW2 B; 3SJB C; 3E22 B; 5EC1 C; 3RYF B; 1KEC A; 2W0X A; 3E83 A; 4DR6 O; 2VWK A; 5BR8 O; 3JAT B; 1GKF A; 2Y0I A; 2PYJ A; 4DV2 O; 4P30 A; 2BSK B; 1PNL A; 2EZO A; 4WFH A; 1MSD A; 2OIE A; 1GO3 F; 2YIA A; 2LQT A; 4FM0 A; 4MSW C; 4GKK B; 1X4T A; 2E5L O; 1YI2 V; 4B7E A; 4YY3 B; 4PDV A; 1NBM G; 1XEQ A; 4JYB A; 1IBL B; 5JJN B; 3EFF K; 3JAL B; 5LXT A; 1Q90 D; 5IJ0 A; 1XNR O; 2QTO A; 1SQB H; 5LOV B; 2HVJ C; 4IHJ A; 3GVM A; 4KUM A; 2VRZ A; 3CRR A; 1Y6X A; 5BR8 B; 4LWS A; 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