The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
DPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPCKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone
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| source organism |
Bos taurus
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| publication title |
Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Heat shock cognate 71 kDa protein
|
| total genus |
29
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| structure length |
92
|
| sequence length |
92
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| ec nomenclature |
ec
3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase. |
| pdb deposition date | 2007-08-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4J7Z A; 1N4C A; 2DMX A; 1IUR A; 3APQ A; 2CTP A; 1HDJ A; 2N04 A; 2CTW A; 2GUZ B; 1BQ0 A; 3BVO A; 3UO2 A; 2OCH A; 2QWR B; 1WJZ A; 2LGW A; 2YS8 A; 4J80 A; 4IT5 A; 1FAF A; 1FPO A; 1GH6 A; 2KQX A; 2M6Y A; 2QWN B; 2QSA A; 2QWO B; 2Y4T A; 2YUA A; 4RWU A; 2L6L A; 2EJ7 A; 2DN9 A; 2LO1 A; 2Y4U A; 2CTR A; 3AG7 A; 2QWQ B; 1BQZ A; 2QWP B; 2CUG A; 3UCS C; 1XBL A; 3UO3 A; 2N05 A; 3APO A; 2GUZ A; 2CTQ A; 1NZ6 A; 2PF4 E; #chains in the Genus database with same CATH topology 4CH5 A; 2ADQ B; 3WU2 Z; 4ZI7 A; 4LF6 O; 4JI2 O; 4O4J A; 1MA1 A; 3LDC A; 3O9O A; 3BVO A; 2QEX V; 1XHX A; 2YEV B; 2P5O A; 3KG2 A; 2PYJ A; 3E22 B; 3BRC A; 2RJZ A; 4BR6 A; 1LUV A; 4X62 O; 3OUS A; 5KAF Z; 4O4L A; 4BIO A; 2HJF C; 2ZM6 B; 2UUB O; 3K03 A; 4KHP B; 1WA8 B; 1SQV H; 4YIO A; 5L3B A; 1YJ9 V; 1SS3 A; 4DV0 B; 4DV6 O; 3LSS A; 2B1I A; 2BSK B; 1NQT A; 2RDC A; 1HNZ B; 2E3C A; 1M4U A; 1E1R G; 1DLB A; 3HKC A; 3CCS V; 4NXN O; 3D3I A; 3K57 A; 3FAV A; 3ZRS A; 4YJ3 A; 1VQK V; 1MSW D; 4PDM A; 1IBM O; 2VS0 A; 1EZJ A; 1SQX H; 3QTC A; 2DYR C; 2XND G; 1SA0 B; 1DF5 A; 2HR3 A; 2EZP A; 1NTZ H; 3JAS A; 1P7B A; 2IBZ H; 3HKD A; 1F7Y A; 2ZR2 A; 1AR5 A; 4DV7 B; 5KHJ A; 4GX0 A; 1R3K C; 5CBH A; 4X20 A; 5H9C A; 3B09 A; 5CA0 B; 3K5L A; 1FKA O; 4A5U B; 3I5D A; 2X6A A; 3EXA A; 2CDY A; 1HNW O; 1HW7 A; 3CCE V; 5LGN A; 2ODM A; 3FB6 C; 4O4I B; 5J2U B; 1K5Q A; 4DV5 O; 4GKK O; 4WBN A; 2BTQ A; 3OAA G; 4QE7 A; 5BR8 O; 4LP8 A; 4JZG A; 5TIS Z; 2WLJ A; 5IJ0 A; 1AJN A; 3OTO B; 3W7X A; 4R50 A; 3ABL C; 3AK2 A; 2QM8 A; 3P30 A; 3ZN0 A; 4UV8 A; 3HKB B; 3J7A U; 3FB7 C; 4DYL A; 1N36 O; 4X64 O; 4LWS B; 5KUK A; 4MW3 A; 4FIP C; 3CXH F; 5BY1 A; 2YIB D; 5LA6 B; 5IY5 B; 4LF8 O; 1OHH G; 1TAE A; 5H6R A; 1Q81 W; 5H5N A; 3QF7 A; 4D7T A; 5K1P A; 1NI8 A; 2EIM B; 4PA4 A; 4CS2 A; 1Z5V A; 4HNA B; 1GRJ A; 4UXN A; 1AR4 A; 3ZBH A; 3FYE B; 5JCO C; 1FFT B; 3BA8 A; 1YJW V; 1J5E O; 3SPG A; 1K33 A; 3THO A; 1NBM G; 2Q73 A; 2AZ0 A; 2CGO A; 4NXM B; 1AIL A; 1OV9 A; 2H94 A; 5LXT B; 1V55 C; 3K58 A; 3DGE A; 2ZM6 O; 1S5H C; 2WLI B; 2EIJ C; 4ASU G; 1NR1 A; 5B1O A; 4KHP O; 1TA8 A; 2YC0 A; 3BEH A; 3JAT A; 1K9M W; 2Q4P A; 3B4S A; 3E22 A; 1N33 B; 1VQN V; 5IYZ B; 4DV0 O; 3AG2 C; 3HPL C; 2F4V O; 4LCU C; 4FLX A; 1JOY A; 4L8J A; 3BAB A; 2R9A A; 4UB6 Z; 4FK5 C; 5KHI A; 1IXM A; 2QWP B; 2XAJ A; 4K0K B; 5KA5 A; 1NKD A; 4YJ2 B; 3JD1 A; 1NVP D; 1AI7 A; 5FNV B; 2Q7H A; 3OD4 A; 4CS3 A; 1V54 B; 2JS5 A; 4MTF A; 2Q5Z A; 2XT9 A; 2WWW A; 5CB4 B; 4IL6 Z; 1L1F A; 1GH6 A; 4EEQ A; 3WB1 A; 1KUQ A; 4DV2 B; 1ZLZ A; 2ZR3 A; 2JJ2 G; 3AG4 C; 4DV7 O; 1H2G A; 2DN9 A; 4OGQ B; 2LW7 A; 5IJ9 A; 3D8C A; 1YDX A; 4JI3 B; 4LF4 B; 1E79 G; 1MNG A; 1Y6X A; 2OIG A; 1W0J G; 5LBQ A; 4UVC A; 2DQ0 A; 3CYO A; 1TVK A; 2EIK B; 1SF9 A; 4PHZ A; 2Z5U A; 2YXL A; 2F95 B; 1I7F A; 1M9N A; 3FYI B; 2Z0A A; 3K5M A; 2L6L A; 2AGA A; 5CA0 A; 3ZHS A; 1PP9 H; 2ZE8 A; 4RQF A; 3OTO O; 4BW9 A; 1YEW A; 4Z1M G; 5J2U A; 1Y74 B; 2HVK C; 1GM8 A; 3B40 A; 1HDJ A; 3WFV A; 4X1Y B; 5JJN B; 2VQE B; 3M99 B; 3G71 V; 4JI7 B; 1SET A; 3EHB B; 2Q69 A; 1JVM A; 1KEC A; 2HJD A; 1K92 A; 3HKB A; 2OYQ A; 5KX5 A; 2OTJ V; 2D3O W; 4FLZ A; 5B1A C; 3L74 H; 4GZR B; 4LWS A; 2IJI A; 2QDO A; 2WPD G; 2UUC B; 5L3G A; 4LF7 B; 1GO3 F; 2LGW A; 5DED A; 1GK9 A; 1Q8I A; 2Y4T A; 1BCC H; 3ABT A; 1ZUQ A; 3CRM A; 3D3Q A; 1G4Y B; 2F43 G; 1URF A; 1D5N A; 2JEU A; 1N33 O; 1MOF A; 4H13 B; 1RM1 B; 1R1B A; 2NNU A; 1YF2 A; 2XAG A; 5LXT A; 3RVZ A; 2P4K A; 2A3Q A; 3OR6 C; 1FXH A; 4JI0 B; 2YDE A; 3W7S A; 1R3L C; 4KFM A; 4K0K O; 4FFB B; 1R6K A; 3F7V C; 3ASO B; 3ETE A; 1MAB G; 4JI6 B; 1I94 O; 2FB5 A; 4N21 A; 2XOK G; 4JI5 B; 4YIP A; 5C8Y A; 2DE0 X; 1KB9 F; 1AP5 A; 1NR7 A; 4DV3 B; 2ZT9 B; 4FZ0 A; 4X1K B; 3E8H A; 4DV2 O; 1XNQ B; 1VIB A; 3CC7 V; 4JAV A; 3H01 A; 4XDJ A; 4ZKI A; 4LF4 O; 5LP6 A; 3BCC H; 3JD4 A; 3ZIA G; 5DEC A; 3LNN A; 1K5S A; 1US6 A; 3K0D A; 3K0G A; 1COW G; 1OCC B; 3JSL A; 2C2A A; 5K1X A; 3H1K H; 4I4T A; 2EBO A; 1SQB H; 1F4M A; 1B04 A; 1OCZ C; 4XBF A; 2Z3Y A; 4DR2 B; 1NJI W; 3GVM A; 1K34 A; 2JDI G; 3TET A; 1FJG B; 5B5E Z; 2Y69 C; 4H33 A; 4RUE A; 2VQE O; 3SR2 C; 4JI7 O; 3ZS8 C; 1KP3 A; 5L3C A; 2K1E A; 3UO2 A; 4FMT A; 3A8T A; 1RFY A; 3RGB A; 3E2E A; 5JVD B; 5AG2 A; 4I55 B; 1IZ3 A; 4OPH A; 1MSD A; 1Y74 A; 1ZAU A; 1RPO A; 2CTR A; 4TSF G; 3K59 A; 3G6E V; 3JAK A; 2QE7 G; 5B1N A; 4F6E A; 4LH7 A; 2OIE A; 2P7T C; 4RQE A; 4CBC A; 2QTS A; 4HZ3 A; 2GUZ B; 3LSQ A; 2WLH A; 3JAW B; 4WFB V; 1X4T A; 1F4N A; 1S76 D; 3ZHQ A; 4O2B B; 2FYU H; 1FFX A; 1PNL A; 2DJV A; 1X59 A; 2OT5 A; 5CBG A; 2Y0I A; 2CAZ C; 1NS1 A; 5HFM A; 3K5O A; 3ZRX A; 1O9H A; 3G80 A; 1VEW A; 2LQT A; 3KCX A; 2JK5 C; 4JI0 O; 1SQP H; 4CH4 A; 5D5Q A; 2H3O A; 2YID A; 2R9I A; 3K04 A; 2NLJ C; 1YTF D; 4JI6 O; 2P67 A; 2ZE7 A; 3SDL A; 4JI5 O; 3K08 A; 1ZL8 B; 3AK3 A; 4UVB A; 4I9W A; 2O57 A; 3RYF B; 5EBW C; 1KBH A; 4DV3 O; 1XNQ O; 4U3J B; 2CTP A; 1EN5 A; 2N74 A; 3G67 A; 1GN4 A; 4JI8 B; 1EZV H; 3RYI B; 1FXK B; 2LGQ A; 4DV1 B; 4B08 A; 3DXR A; 4U3F H; 4RO2 A; 4RUF A; 3JAL A; 3UKM A; 2WA3 A; 3CCR V; 1SRY A; 4GKJ B; 3QO7 A; 5KA6 A; 1QBZ A; 3FKS G; 3RYC A; 1U96 A; 5GON A; 5E1A C; 3L71 H; 1Q6H A; 3FD9 A; 3JD2 A; 3STL C; 4MVO A; 1FYJ A; 1Q6U A; 5J2T B; 4DR2 O; 4NR1 A; 1JQ0 A; 1G8M A; 1FJG O; 1B6Q A; 4NTX A; 2LP7 A; 1QLE C; 1MZE A; 1IBL O; 3QO5 A; 1M90 W; 2ZIM A; 3CMA V; 1OCO C; 2QA4 V; 3ASN B; 1XMO B; 3ZMS A; 2EIL C; 4PDR A; 3CX5 F; 3UT5 B; 2HP8 A; 1VQ8 V; 2F66 C; 2MK3 A; 3JAR B; 3W7U A; 2Q0O C; 4EKW A; 4GX2 A; 4QE9 A; 5JQG B; 1N34 B; 2ITD C; 4I55 A; 4F6R A; 5LOV B; 2PUS A; 4UV9 A; 2ZDI A; 2N04 A; 1WN7 A; 2YXH A; 3TJT A; 3OM3 B; 3M7M X; 4J9Y B; 4IT5 A; 4ZHQ B; 2GTS A; 1YIJ V; 1NTK H; 3VQX A; 1MMM A; 4JYY A; 4JGS A; 2AHY A; 1NT2 B; 1WPB A; 3AG1 B; 5LMU B; 3BA9 A; 2AXT Z; 3JAW A; 4RAI A; 2HHH B; 1WAZ A; 4O2B A; 2OCC B; 1BMF G; 1AI6 A; 3GWO A; 1G6U A; 2Q67 A; 2HFE C; 1H2S B; 1O9G A; 2DWD C; 1SQQ H; 2IH3 C; 4X65 B; 4DR4 O; 5GW7 A; 1P4R A; 2EIN B; 2F23 A; 1VAR A; 1I08 A; 1XBL A; 1H2K A; 3ZRV A; 2A0L A; 3GB7 C; 1QQC A; 1FXV A; 3ZRW A; 3ZHR A; 4PA9 A; 4DW0 A; 2ADP A; 4JI8 O; 2LW1 A; 1XL4 A; 3J80 N; 4DV1 O; 1HR0 B; 1ZL8 A; 1FPO A; 5B3S C; 1MG1 A; 1QNM A; 3RYF A; 1UFI A; 1LNQ A; 3OEE G; 4KXR A; 5A2Q N; 3CCQ V; 2HEP A; 4U3J A; 1YI2 V; 4GKJ O; 3APO A; 4TOI A; 2JIZ G; 5E79 Z; 3RYI A; 3SJQ C; 1BZK A; 1AI4 A; 1FXK A; 1CPY A; 2P22 C; 1L0L H; 2Q8V A; 1PL0 A; 1V54 C; 2QTO A; 2RCV A; 3F7Y C; 5LP6 C; 4X89 A; 3RWR D; 1OZ0 A; 4UCR A; 3H1I H; 1WNS A; 2CGN A; 3MHH C; 4FFK A; 3CCL V; 3UQ8 A; 3T1Y B; 4JTD B; 1SZT A; 3CME V; 4I50 A; 1XMO O; 3OT7 A; 2DYS B; 4G27 B; 3ZHU A; 5J2T A; 5IYD O; 5KLV H; 4O4H B; 2WSS G; 1AJP A; 1M57 C; 2XUM A; 3HB3 B; 3VQV A; 4OX9 B; 1B3Q A; 1NH2 D; 5FL7 G; 5IWA B; 1XIL A; 2JGU A; 4JV5 B; 1N34 O; 1KP2 A; 3T4D A; 1H2L A; 3SYP A; 2CH7 B; 2OWO A; 3TXS A; 2DQ3 A; 3UT5 A; 4HAM A; 1QR9 A; 2V7Q G; 2WLM A; 4LR3 A; 4LFC B; 1Y76 B; 5JQG A; 5LMU O; 4J11 A; 4CH3 A; 2X6B A; 3I56 V; 2HHH O; 1EN6 A; 5B1B B; 3IJ4 A; 2XTA A; 4TV8 B; 5KAI Z; 4LBE C; 1YXB A; 4ZHQ A; 1D2D A; 1N32 B; 1FD9 A; 3ABK C; 5H2F Z; 4JI4 B; 3CJH B; 2RN9 A; 1LR1 A; 1ROP A; 4PD4 F; 5CA1 B; 4X65 O; 2Q0A A; 3CRR A; 5EYP B; 5DN6 G; 3JCU Z; 5EZY A; 4PA6 A; 1YSC A; 1VF7 A; 4JAA A; 4K3A A; 1MZF A; 3P32 A; 1KMI Z; 4AI8 A; 4LFB B; 4CZZ A; 2YEV A; 4FPP A; 1HR0 O; 3ETG A; 1P49 A; 2YS8 A; 2W0X A; 2YUA A; 5EC1 C; 1NU1 H; 1JJO A; 1HNZ O; 3OGC C; 4UCT A; 3JAM N; 2GSM B; 3CRA A; 4KUM A; 3QNE A; 4Q20 A; 4JAU A; 2W6J G; 3MHS C; 1WA8 A; 1V9P A; 3K9A A; 2X7R B; 1KQS U; 4WFG A; 1T5E A; 4QGP A; 4IHJ B; 2BSK A; 2IU0 A; 4FLW A; 2WLL B; 3U0Z A; 1XNR B; 3T1Y O; 1Q6I A; 2XAH A; 3SYA A; 3E89 A; 5KMG B; 1Q7Y W; 4BWA A; 1M1K W; 1SA0 A; 1Z5W A; 4JTA B; 1PL4 A; 2ATK C; 3WB2 A; 3H1L H; 2DYR B; 4ICG A; 2RQ6 A; 4OX9 O; 2GBO A; 3AG3 C; 2WAM A; 5IWA O; 4XDK A; 1EBO A; 2GV9 A; 4I9Q A; 4DR7 B; 2QM7 A; 3I55 V; 4JV5 O; 4W4K A; 3Q4H B; 1P84 F; 1TUB B; 3A0R A; 1JX9 A; 3CCJ V; 4B3M B; 3S3X A; 3SGI A; 2QKS A; 5BMV B; 4AIL C; 1XEQ A; 3OW2 U; 4O4I A; 2E76 B; 2HVJ C; 1ENV A; 4LFC O; 3L9D A; 3TGU H; 2DOS A; 4TV9 B; 1NVP B; 1GAX A; 4C7U A; 1IBK B; 3KZI Z; 5FLX N; 1WPX A; 2CH7 A; 2AW9 A; 2BCC H; 1R6T A; 3LDD A; 3N2K B; 3X2Q C; 5J9P C; 2N05 A; 4P2Z A; 4J7K A; 3ABL B; 2H8P C; 3WG7 C; 3W7W A; 4FVM A; 4JI4 O; 1B06 A; 1BL8 A; 1IDS A; 3A0B Z; 3ZCC A; 3SPC A; 1Y76 A; 2P90 A; 3LUT B; 5LA6 A; 2YSU B; 1GN6 A; 1A32 A; 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1Q82 W; 4RWU A; 5BMV A; 3N2G B; 2JEX A; 3QVN A; 2GHY A; 4MVS A; 4TUY B; 4FM0 A; 4DK1 A; 2UXB B; 3ZHV A; 4TV9 A; 4X1Y A; 2UUC O; 2NN4 A; 5IDJ A; 4LF7 O; 5B66 Z; 1ZX3 A; 1K7D A; 2ZXW C; 2F93 B; 3C90 A; 3ZJZ A; 3DC6 A; 1RP3 B; 2UXX A; 1FAF A; 1YJN V; 4WCE V; 2M6Y A; 5DM6 V; 5L3E A; 2UXC B; 3K5N A; 4H44 B; 3WB0 A; 5EBL C; 5B1A B; 3CXC U; 5KHG A; 4B3T B; 2JS3 A; 3CCV V; 2OCC C; 4MVQ A; 4B3R O; 2Q7G A; 1DGS A; 3U11 A; 3UM7 A; 4O4J B; 1JCH A; 2JGD A; 3PJS K; 5CBF A; 5CN0 A; 4FLU A; 4DR1 B; 3OFN G; 3ML0 A; 4IGG A; 2QM4 A; 3IC9 A; 2UU9 B; 4LF6 B; 4FFB A; 1UPG A; 2VQF O; 1GN3 A; 3SJC C; 1K97 A; 1BHB A; 1K8A W; 3UO3 A; 1D5A A; 4X1K A; 4ZIB A; 5IE9 A; 4IIJ B; 4QIW F; 1ZSP A; 4IYI A; 2IW5 A; 3OGI B; 4YJ3 B; 1HNX O; 4DR5 B; 4LFA O; 1XI1 A; 3RN4 A; 2IJK A; 1PKX A; 2LFR A; 1HP8 A; 4AQY B; 1KC8 W; 3JAS B; 1BT8 A; 3UCS C; 5L3F A; 3ZED A; 5LYJ B; 3CRQ A; 2HG5 C; 3HKD B; 4JTC B; 1I0H A; 4UVA A; 4NXN B; 5D5P A; 1YTF B; 2WLK A; 4XDL A; 4X88 A; 4GLX A; 1F23 A; 4NYK A; 4YHH O; 1IBM B; 4X20 B; 1N0N A; 3SJA C; 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