The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
DPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPCKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Heat shock cognate 71 kDa protein
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| publication title |
Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Bos taurus
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| molecule tags |
Chaperone
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| total genus |
29
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| structure length |
92
|
| sequence length |
92
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| ec nomenclature |
ec
3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase. |
| pdb deposition date | 2007-08-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LO1 A; 2QWQ B; 1BQZ A; 2CTQ A; 1IUR A; 3UCS C; 1FAF A; 2DMX A; 3BVO A; 4RWU A; 2CTP A; 3AG7 A; 1N4C A; 1WJZ A; 4J80 A; 2PF4 E; 2N04 A; 2YS8 A; 2L6L A; 3APQ A; 2QSA A; 2LGW A; 2CUG A; 1HDJ A; 4IT5 A; 2QWN B; 2GUZ B; 1FPO A; 2OCH A; 2Y4U A; 3UO3 A; 1GH6 A; 1NZ6 A; 2QWP B; 2YUA A; 2EJ7 A; 2GUZ A; 1XBL A; 4J7Z A; 1BQ0 A; 2Y4T A; 2CTW A; 2N05 A; 2QWR B; 2KQX A; 3APO A; 3UO2 A; 2M6Y A; 2CTR A; 2DN9 A; 2QWO B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4K8Z A; 2ADQ B; 2EIJ C; 3JAL A; 2HFE C; 3CE2 A; 3RN4 A; 2LGW A; 3CEI A; 3ETQ A; 1Z5W A; 4Q20 A; 5CN0 A; 1RM1 B; 2JGD B; 4JTA B; 5KHG A; 5B66 Z; 1JFF B; 4J10 A; 3K9A A; 4DW1 A; 5CB4 B; 3SYO A; 3OR7 C; 3ZMT A; 2B1I A; 2E3C A; 2A3Q A; 4PI2 A; 5LP6 B; 5J9P C; 2CTP A; 2GHY A; 3AG3 B; 4IT5 A; 5F2V O; 1WA8 B; 2HJF C; 2RCV A; 3JAT B; 4QGP A; 4NKG B; 5DEC A; 4HYO A; 3J7A U; 3CCR V; 2V1D A; 3APO A; 4AHC A; 4K0K O; 3E22 B; 4JPR A; 4JTC B; 1MOF A; 5KHJ A; 3D3I A; 4RUE A; 3H1H H; 4NYK A; 1BQZ A; 2XHB A; 4LP8 A; 2CK3 G; 2P4K A; 4I50 B; 4FLY A; 2NN4 A; 1L0L H; 1TA8 A; 4J11 A; 5H5N A; 3SPC A; 1KP3 A; 1US6 A; 4CH6 A; 5CBH A; 2ZR3 A; 4DRX A; 4FLT A; 5JH7 A; 2YC0 A; 3E89 A; 4LFB O; 2QM8 A; 2ZIM A; 4X20 A; 4NXN B; 3HKC B; 4DV7 B; 4Z2W A; 3H1J H; 2ZNJ A; 2PF4 E; 2YIA A; 3LUT B; 1IX9 A; 4RO2 A; 5AG2 A; 4ZHQ B; 2Q5Z A; 3EVK A; 2Q8V A; 3QO8 A; 2HVJ C; 2QJ1 A; 3FB8 C; 2DWE C; 2EIL C; 2WLL B; 3EHB B; 1OCZ C; 5EK0 A; 1K92 A; 4OX9 B; 3KKY A; 1SZT A; 2BTQ B; 4FJC C; 1V54 C; 4NXN O; 4TUY B; 1S0V A; 1NBM G; 1L1F A; 4DV2 B; 4LR3 A; 4KXR A; 2EUL A; 1GTO A; 3CRA A; 4CH3 A; 4PV1 B; 4JI2 B; 4DV6 B; 2XTA A; 5IJ9 B; 2WA3 A; 4NXM B; 4XDJ A; 1XMQ B; 1ZWI C; 5LHI A; 3RYH A; 4ZKI A; 4B08 A; 2JVD A; 4NVP A; 3CJH B; 4EB6 A; 4B3S B; 4IYH A; 1AJP A; 1XI1 A; 4FFB B; 1ZUQ A; 2ZE7 A; 1CXZ B; 1NI8 A; 5B1O A; 1AP6 A; 3LDD A; 3BCC H; 1M56 B; 3RYC B; 1UPG A; 4KUM A; 5JQG B; 5EYP B; 4RWU A; 1X4T A; 4PDR A; 2UUA B; 3ASO B; 4BIO A; 4D7S A; 2CUG A; 1RPO A; 4U7N A; 1D2D A; 1B3Q A; 1XQ8 A; 1PL4 A; 1WP7 A; 4LFA O; 4H33 A; 3OEH G; 3W7U A; 1V9P A; 4PA7 A; 3JD2 A; 1I5Y A; 3SYA A; 3VQW A; 1EN4 A; 2XAH A; 1TUE B; 1P4R A; 5IY5 B; 3ML0 A; 4UCS A; 4O2B A; 1AI5 A; 3CC7 V; 4GT1 A; 1COW G; 4DR1 B; 3ABK C; 4DW0 A; 1M57 C; 3OUS A; 1BE3 H; 3M99 B; 3CRM A; 5K1P A; 4DR7 B; 4PA4 A; 5IYZ B; 1NVP D; 3JAR B; 2YUA A; 1SQF A; 4O4L A; 3GVM A; 4TOI A; 4KFM A; 5BXZ A; 4X65 B; 1K33 A; 4H37 A; 4IGG A; 2OWO A; 2DMX A; 3ZN0 A; 4B3R O; 4MTG A; 1DF5 A; 1R6K A; 3ABM B; 1TGO A; 1QNM A; 2H94 A; 2JJ1 G; 3I55 V; 3CME V; 3AK2 A; 3L72 H; 1XEQ A; 3RFR A; 1NT2 B; 2JGU A; 4JI0 O; 2EBO A; 4P30 A; 5KX5 B; 5H6Q A; 3SPH A; 4GX0 A; 4RUF A; 3D36 A; 1H8E G; 1KKC A; 3LNM B; 1NTZ H; 2X7R B; 3L71 H; 1GRJ A; 5B1B C; 4LF6 O; 4QE9 A; 3DC5 A; 4PDL A; 5EZY B; 2W6J G; 5KHH A; 1Q86 W; 1NU1 H; 3CWB H; 2XT9 A; 1K7D A; 3UT5 B; 2YIB A; 1PNL A; 4JYA B; 4FZ1 A; 1EZJ A; 3AG1 C; 2F93 B; 1AJN A; 1SRY A; 2R9I A; 2QWR B; 4X9Q A; 4I0X A; 2EIN C; 1VAR A; 1GO3 F; 1FXV A; 4ZOL A; 4L87 A; 5GON B; 2BOC C; 3CRR A; 1I08 A; 1ZX3 A; 1M5I A; 3P3N A; 1FAF A; 1GM7 A; 3HR0 A; 4BIU A; 2JJ2 G; 1FXK B; 4TT3 G; 4TV8 A; 3SGI A; 1HP8 A; 1SET A; 5TIS Z; 5KMG B; 3CC2 V; 3HKE B; 2DOS A; 3ZED A; 3CCV V; 2ZT9 B; 3UKM A; 1JX9 A; 4FM1 A; 3JD3 A; 4D7T A; 3K08 A; 3CD6 V; 1Y76 B; 4JV5 O; 3K5M A; 2F4V O; 4YIO A; 4JI5 O; 3N2G A; 4CH4 A; 4X1I B; 2KKW A; 1MMM A; 4O4I A; 3QNE A; 3UM7 A; 5IWA B; 1Y6X A; 4TV9 A; 1IXM A; 1L8D A; 4AIL C; 1KUQ A; 1AB3 A; 1NKD A; 4PA9 A; 3Q4H A; 3ZRW A; 1WPB A; 3RYF B; 2P4V A; 2Q4P A; 1E79 G; 4QE7 A; 5LOV B; 4IYI A; 1UJW B; 3T1H B; 5IWA O; 4CS3 A; 1MSD A; 1F4M A; 1AVM A; 4HNA A; 1PP9 H; 4AQY B; 1NR1 A; 1N36 O; 2QDO A; 1J5E O; 2JRI A; 3CCQ V; 2XAJ A; 1B06 A; 2QR4 A; 3W7X A; 4IHJ B; 3B2E E; 4JAA A; 2UUB B; 2QWQ B; 4OPA A; 3TK1 A; 2Q6A A; 3UCS C; 1AR1 B; 4JTD B; 1KBH A; 3JYC A; 5LGT A; 2QEX V; 3J81 N; 2ADP A; 3SPG A; 2UXX A; 3G71 V; 2YDE A; 1FFT B; 2ZXW C; 1FXH A; 2LGQ A; 2D2C B; 3ZCC A; 5LXT A; 2N05 A; 2ZM6 O; 3ETG A; 4F6R B; 1VF5 B; 3HPL C; 2UUB O; 2AXT Z; 3RYI B; 4FMT A; 4G2K A; 1MZF A; 1ZAU A; 5LA6 B; 2R70 A; 2MK3 A; 4GKJ O; 2JDI G; 1PV0 A; 1HR0 O; 3VQY A; 3P32 A; 1AR4 A; 1FYJ A; 4HBN A; 1YTF B; 1HNW B; 2FYU H; 3NXS A; 5LYJ A; 4ZBM A; 3QO5 A; 2ZCE A; 2DYS B; 4PHZ A; 4JI4 B; 5KAI Z; 5L3D A; 4X1Y B; 2QWP B; 2BSK B; 3A8T A; 1GN2 A; 5DED A; 5J2U A; 3BEH A; 1ZL8 A; 1UFI A; 3I56 V; 3X2Q C; 2E5L B; 2Q0O C; 4DV4 B; 4DK1 A; 1WJZ A; 3RGB A; 5LMU B; 1YJW V; 4LF9 B; 1H38 A; 3M7M X; 1GN4 A; 4GX5 A; 3ZHU A; 2RN9 A; 4B7K A; 2Q7H A; 3E86 A; 5GW7 A; 4MW3 A; 1AI6 A; 4MTO A; 4B3T B; 4B3M B; 2BCC H; 3SDL A; 2QKC A; 2R72 A; 3WG7 B; 1K34 A; 4X62 B; 4WBN A; 3ABT A; 1U96 A; 2L35 A; 3MDS A; 5IE9 A; 5ITZ A; 1IBM O; 1Q6U A; 3OMA B; 3JAS A; 3OTO B; 2VWJ A; 5LMU O; 4I4T B; 4YJ2 A; 3GB7 C; 3OM3 B; 5JVD A; 4QNH B; 4DR4 B; 2HP8 A; 1YCI A; 3T4Z A; 1ORQ C; 1JJ2 U; 1QLE C; 4B3T O; 3CS5 A; 1XOU A; 2EIK C; 1K4C C; 1HW7 A; 2LP7 A; 4LNU A; 4B3M O; 2Y69 B; 5B1A B; 4CS4 A; 4DR2 O; 4X1K A; 2ETN A; 2HVK C; 1YJN V; 4L8J A; 1SQV H; 4X62 O; 3RWR D; 4GX2 A; 4DV0 O; 4JI7 B; 2P7T C; 3B8M A; 1SER A; 1IXB A; 4LF7 B; 1GMG A; 4KHP B; 4XDK A; 3SYQ A; 3BAA A; 4BW9 A; 3STL C; 1H2L A; 1MSW D; 2W0F C; 1NQT A; 4CZZ A; 2BE3 A; 1Q90 D; 2IU0 A; 3OD4 A; 3CSX A; 1VQ6 V; 4JI7 O; 1XNQ O; 4DRX B; 1I94 B; 4N23 A; 2OCH A; 4GZR B; 3ASN C; 1VQ9 V; 1ENV A; 4AI8 A; 4KHP O; 5FLX N; 5CA0 A; 1KEC A; 1M93 A; 3HKD A; 4X20 B; 1FFX A; 1SS3 A; 2RQ6 A; 4K35 A; 4ZI7 A; 4BIZ A; 5FPO A; 2A7W A; 3FKS G; 3FX7 A; 4DR6 B; 1S72 V; 1TVK B; 1VQ8 V; 1EZV H; 3STZ C; 2OT5 A; 1SQP H; 2GTA A; 1GH6 A; 2AHY A; 3JAK A; 3EXA A; 4DO2 A; 3DXR A; 4U3F H; 3KCY A; 3JAM N; 5CBF A; 3K3W A; 3R66 A; 3FAV A; 1YJ9 V; 4WFG A; 4LFC O; 1OCO B; 1OHH G; 4X8A A; 4BAY A; 4UCU A; 2PY5 A; 3JAW A; 4N21 A; 4O2A A; 1R1B A; 4J7Z A; 3C90 A; 4F6E A; 3K58 A; 3VOU A; 5IT9 N; 5CMU A; 1VQL V; 3ZMV A; 2V7Q G; 4I7Z B; 3RYH B; 4K3A A; 3W7S A; 3E8H A; 1BZK A; 1DLB A; 2HG5 C; 4UVB A; 4JI8 B; 4O4J A; 3W7W A; 4GX1 A; 5L3C A; 5LMN B; 5LGU A; 1XDC A; 4EB6 B; 3TET A; 5L3G A; 1RSO A; 1NS1 A; 3SR2 C; 3H1K H; 2IW5 A; 1I5X A; 4JAU A; 3ZHS A; 2EZO A; 3AEI A; 4JZG A; 2JS5 A; 3K06 A; 1OCC B; 5CA1 A; 2ATK C; 4MW8 A; 1SQG A; 4FPP A; 1BL8 A; 1Y74 A; 1Q82 W; 3QG5 A; 3M8A A; 4I9Q A; 1EM1 A; 3BHP A; 3FYE B; 2UXB B; 1BHB A; 1Q6H A; 3EFF K; 5LMN O; 2CH7 B; 1IZ3 A; 3MHH C; 4EFB A; 3JCZ A; 3BPZ A; 2ZKO A; 2KG7 B; 2OTL V; 3ZHR A; 1AI4 A; 4I9W A; 2CTW A; 2HHH B; 1N0N A; 4X88 A; 2AZ0 A; 2FML A; 4UCO A; 3LSU A; 3FB5 C; 5JJJ B; 1Q43 A; 4UB8 Z; 2F1M A; 1RM1 C; 2PTM A; 2KSD A; 1XIL A; 4DV7 O; 4WFF A; 1K73 W; 4JI3 B; 2UXB O; 4MVQ A; 4P2Z A; 3TGU H; 1Q81 W; 3QO7 A; 1VQ7 V; 1PL0 A; 2X0L A; 2JGD A; 2GUZ A; 4O2B B; 2DQ3 A; 1HNZ B; 4FIP C; 1WB8 A; 4DUZ B; 2HHH O; 5LP6 C; 1NR7 A; 3ZHT A; 2YIC A; 4OX9 O; 1VIB A; 3KZI Z; 3AG3 C; 5LHG A; 5CB4 A; 1J95 A; 1OCR B; 2EJR A; 1KD1 W; 2WLH A; 4JI3 O; 3CXC U; 4DV2 O; 2OIE A; 3CB2 A; 2GTS A; 2ZE8 A; 1PPJ H; 4O4L B; 4DV5 B; 1JVM A; 3DSQ A; 3JAT A; 4FLW A; 4JAS A; 4JI2 O; 2XAQ A; 4DV6 O; 3CCJ V; 3T1Y B; 4TQD A; 2Y0I A; 2IJK A; 4OGQ B; 1QHT A; 4NXM O; 1NVP B; 2QKS A; 1LR1 A; 1XMQ O; 4BWA A; 4TQF A; 1LUW A; 4FFK A; 4I50 A; 4UV8 A; 5EC2 C; 5D5Q A; 4B3S O; 2HR3 A; 4YJ3 B; 1RPR A; 4QPK A; 4DV5 O; 1EN5 A; 1V55 B; 4DV1 B; 3H9V A; 1S77 D; 4A5U B; 3T1Y O; 5DN6 G; 4IIJ A; 2F95 B; 4WCE V; 4GKK B; 2Q73 A; 3HKC A; 2YEV B; 2K9P A; 2M7W A; 2N04 A; 2IJI A; 2N74 A; 2UUA O; 4NTW A; 3C3T A; 1NZ6 A; 3OW2 U; 3ABU A; 3E8B A; 2DYR B; 3HKB A; 3ZMU A; 1H2M A; 4F4L A; 4TSF G; 4ZOL B; 2WLL A; 3I5D A; 1MA1 A; 4WFE A; 1AP5 A; 4GKK O; 1F51 A; 2P22 C; 1OV9 A; 2PGG A; 1A32 A; 3O65 A; 4PA3 A; 2YSU B; 4IL6 Z; 3ZRV A; 2ZIN A; 4ASU G; 5GTI Z; 2GBO A; 3FYI B; 5BR8 B; 5IJ0 B; 2IJJ A; 2Q69 A; 1EN6 A; 5L3F A; 2WLK A; 5FNV B; 3UO2 A; 1R73 A; 3K03 A; 3N2G B; 5E79 Z; 5C8Y B; 4O4I B; 5H9C A; 5B3S B; 5J2T A; 3FB6 C; 4KP4 A; 2KB1 A; 4Q6G A; 4WFH A; 4DR1 O; 4PA6 A; 3AK1 A; 1K97 A; 1P7B A; 4TV9 B; 1W0K G; 4UCT A; 1I0H A; 2L6L A; 2ZE5 A; 4DR7 O; 3Q4H B; 3ZRW B; 4FM0 A; 4DUY B; 3LSS A; 1M56 C; 5BR8 O; 4G28 B; 2YIB D; 4MTF A; 1N8R W; 3ASO C; 5HFL A; 4J7K A; 4X65 O; 5FL7 G; 3ZHQ A; 2PUS A; 2Q7E A; 3ZMZ A; 3RYC A; 5JQG A; 5EYP A; 4JI1 B; 2LQT A; 1VQK V; 2B9Z A; 2WAM A; 1RFY A; 3ABL B; 2EJ7 A; 5LL6 Y; 2BOB C; 3UQ8 A; 4DUY O; 3E8G A; 4MVS A; 1VEW A; 1TUB B; 1O9H A; 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5JVD B; 4R6Z A; 3HB3 B; 3IC7 A; 3K5L A; 3OGI B; 1R6T A; 4R7C A; 3HKE A; 1Q5O A; 1D5A A; 4Z1M G; 4DR5 B; 4TWK A; 1W59 A; 3J80 N; 4X1K B; 2YXH A; 1Y76 A; 5KA5 A; 2CDY A; 3TXQ A; 1BCC H; 2EIK B; 4R8C A; 4H0L B; 3CRQ A; 4HAM A; 2YI8 A; 3E8F A; 4LF4 B; 3OAA G; 1QBZ A; 3NR7 A; 2IJH A; 5CBG A; 3SYC A; 2IH3 C; 4DYL A; 3LNN A; 2P67 A; 2ILM A; 1KMI Z; 1K9M W; 2MW2 B; 4JYB A; 2EX3 A; 2VS0 A; 5EC1 C; 4D6T H; 1E1Q G; 3ZRS A; 3RYF A; 4EFE A; 3SJA C; 1HNW O; 5LHH A; 5LOV A; 3DGE A; 1FPO A; 4LF4 O; 1CEZ A; 1SZX A; 3DTU B; 4JI4 O; 2P5O A; 3HKD B; 5LBQ A; 2WLI B; 3ASN B; 2AGA A; 2VQF B; 2E76 B; 4PDV A; 4BW5 A; 1VF6 C; 2Q9L A; 1KQS U; 4JI6 B; 1YI2 V; 3BVO A; 3LDC A; 2E5L O; 3MD0 A; 3JAL B; 1VQP V; 4DV4 O; 1WLE A; 4WF9 V; 2ZNI A; 3QTC A; 4UV9 A; 5BZB A; 1VF6 A; 4LF9 O; 2JEX A; 1K3E A; 4JGS A; 2EIJ B; 2WLN A; 3LSQ A; 2XOK G; 4EEQ A; 4JAV A; 2IH1 C; 2WLM A; 4K8X A; 3C3S A; 1R3K C; 2R9R B; 2F43 G; 2M6Y A; 4P9O A; 1H2N A; 1YXB A; 2QTS A; 3BFR A; 1AJQ A; 4I55 A; 2QKA A; 2OCC C; 1VQN V; 4YHH B; 4O2A B; 5LA6 A; 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