2R0C | Genus

Total Genus 161

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	161
sequence length	528
structure length	509
Chain Sequence	b'NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDASKSTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEERELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA'

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC pubmed doi rcsb
molecule keywords	RebC
source organism	Lechevalieria aerocolonigenes
molecule tags	Oxidoreductase
total genus	161
structure length	509
sequence length	528
ec nomenclature
pdb deposition date	2007-08-18

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.9.50	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	2r0cA02
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	2r0cA03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	2r0cA01

1E1MA 4AP3A 4H7UA 1Q9IA 1D5TA 4Z2UA 2BCPA 4A65A 2E5VA 4WCTA 3ALJA 3L8KA 2YG4A 2YM2A 4E0VA 1CJ3A 1ZP0A 3SGLA 3IC9A 1PJ7A 1COYA 2AAQA 1KF6A 2V5ZA 2X8GA 4JNQA 1CC2A 4GDEA 3ADAB 4USQA 4IA5A 1JRYA 1QJDA 4EQWA 2VZ2A 1PBDA 4EMIA 1CL0A 2JB3A 3P1WA 1YKJA 2YLSA 4IA6A 3VR8A 2X50A 2A87A 3AE2A 4BURA 1TYTA 2Y6QA 1KDGA 2ZBWA 1IUSA 2C3CA 4PAAA 2R0CA 3ALLA 1FCDA 2C72A 4K22A 5J7XA 4OPGA 4B65A 4Z44A 2AR8A 2APGA 3CGBA 3DA1A 2BABA 3DH9A 3AECA 1O95A 4H4XA 3DJJA 3SQPA 1M64A 4U8JA 4GR1A 1Y0PA 1LV0A 2PYXA 1ZKQA 1IUXA 1LTXR 1Q1WA 2GMHA 3O0HA 3QFBA 3CPHG 3AXBA 4I59A 4YKFA 5M0ZA 2WOIA 3UKFA 1JU2A 4Y4MA 1DNCA 1F6MA 1B4VA 1K0LA 3I3LA 3UOXA 3UTGA 4ECHA 2OAMA 5JCLA 2FBWA 4FK1C 4K5RA 1D7LA 1P2HA 4NEWA 1IUUA 4J2WA 3GRSA 3V76A 5KWFA 2H89A 4DSGA 4CY8A 4EQXA 3P9UA 4Z25A 3GMBA 1D7YA 3NIXA 3UP5A 5DBJA 3CNJA 4CY6A 1LJ1A 4IV9A 5FS8A 1DOEA 1H7XA 3CNDA 2B76A 2C7GA 1GRFA 1GEUA 5BUKA 3M13A 4J56A 1F8WA 3VRBA 3QSEA 4YSHA 1EBDA 1MOKA 3GYIA 2YAUA 3KPFA 4Y4NA 2XVHA 4Z2TA 1PBFA 4Z2RA 3UTHA 4USRA 1CJ2A 3BHFA 2NVKX 1ZDLA 1JNRA 1JEHA 3R9UA 3AB1A 2RGJA 2W0HA 1E39A 1NAAA 2YLXA 3V3OA 2VOUA 4A99A 2C75A 3LZXA 1PHHA 2XLPA 4H2NA 3PVCA 3VR9A 4O5QA 2JB1A 4YSZA 2BS2A 3RP8A 1YY5A 3D1CA 2DKHA 1NDAA 3NYFA 1FECA 3AEFA 5C2TA 3CN8A 4OPLA 2JKCA 1CC4A 4K5SA 4B66A 1F3PA 3NTAA 3VRAA 5J60A 3K30A 3UTFA 3K7MX 1PJ5A 3AEAA 4AT2A 4ZN0A 2JK6A 5U1OA 4H50A 3ALMA 1XANA 1EL9A 1EL7A 3FMWA 4Z43A 2V60A 5IPYA 2F5ZA 4PABA 3FPZA 5KVHA 5U25A 2R0GA 3CTYA 4NZHA 2RGHA 4XXGA 2WDQA 4U8LA 1PS9A 2XFPA 2ZZBA 3NN0X 1GRHA 1REOA 5HYMA 1TDEA 4LU6A 3ZDNA 3EPTA 3KA7A 3QFAA 3CGEA 4CCRA 2I0ZA 1BF3A 4I58A 5FS9A 3QJ4A 4JDRA 3FBSA 4DNAA 4HA6A 3BNUA 3QSMA 4U2TA 4ZCCA 2YLZA 2WU2A 4A7AA 1XDIA 2C67A 2Q6UA 2XLSA 3LADA 2GQFA 5JCNA 2EQ6A 2V6OA 3C4AA 3KD9A 1GTHA 3OC4A 1TDOA 2WOVA 4B1BA 1Y56A 2HQMA 3CPJG 1ZMCA 1NEKA 1GPEA 1D4CA 1KNRA 4AT0A 2B9WA 1FL2A 4A6NB 1XHCA 2YVGA 1S2QA 3NHOX 2BK3A 2WP5A 1FOHA 4H4SA 3EAOA 1GT8A 2EQ8A 1B37A 2YLRA 4TM3A 2GR1A 3BHKA 3AD9B 2ZZ0A 3PO7A 4JN9A 5KOXA 1OJ9A 1BZLA 1JRZA 1NHQA 2FJBA 2GF3A 4K2XA 2GR0A 2PHHA 4IVOB 4A5LA 2C73A 1YQ4A 4U8KA 1ZOYA 2WQYA 4H4TA 4FDCB 2OA1A 3G5RA 2YG5A 3P4RA 1GERA 2TMDA 3HZLA 1DOBA 3ICTA 3JSKA 2QAEA 3AD8B 3LB8A 2TPRA 3UKPA 1K4QA 4YSYA 1L9CA 4UP3A 4YT0A 2GVCA 3CNPA 2YVJA 1VDCA 1XPQA 2GMJA 2BC0A 2BACA 5BVAA 2GH5A 2WEUA 1E1NA 1NHPA 2Z5YA 3CIRA 3GRTA 1PXAA 4YTPA 4U8PA 1S3BA 4GF7A 3UKHA 5HXIA 3AEBA 3C4NA 2Q0KA 4C3YA 5L46A 1GESA 1OJCA 3GDPA 1IJHA 3D8XA 3NK2X 1Q1RA 5JCIA 3VQRA 1TYPA 5KOWA 2BC1A 1VQWA 2B7RA 4UDPA 3UTEA 1N4UA 1NPXA 2YG3A 2WPCA 3P4SA 1NHRA 4J36A 1FEAA 3GWFA 3ICSA 1YQ3A 3DGZA 3EANA 3Q9TA 1BGJA 1YQZA 2YLTA 3ATRA 5FS6A 4H2PA 1TDKA 2XFQA 3AE4A 1TRBA 4N9XA 3LZWA 4JQ9A 4K7ZA 2BK4A 3SFEA 5ER0A 1MXTA 2JBVA 3GDNA 3DK4A 1L0VA 3AD7B 1KFYA 2ZZCA 4X9NA 2XLTA 3NYCA 1OJTA 2C70A 4MJWA 2EQ7A 4J31A 2C3DA 2WOWA 3UOYA 3AE3A 2XFNA 4NTCA 1GNDA 5HY5A 3KLJA 3FG2P 2V3BA 1GTEA 1H83A 1N1PA 3KKJA 4U2LA 1DXLA 4GUVA 2EQ9A 4D04A 4OPUA 2QA1A 4EMWA 5C3JA 2XFUA 2XYOA 3E1TA 5CKUA 4A6NA 1BKWA 3I6DA 3UCLA 3GYJA 2WHDA 1S3EA 5LV9A 1N4VA 4P9SA 2R46A 3UP4A 2XVJA 1OJAA 2V61A 2FJEA 1B8SA 3NH3X 1PXCA 2IVDA 1DODA 4CRTA 5TR3A 2A89A 5U63A 2DKIA 3DGHA 3GMCA 2B9XA 1HYUA 1P2EA 2R4EA 1M6IA 2Y6RA 3CGDA 3ISHA 3G5QA 1H82A 5EB4A 3OZ2A 1GSNA 2J3NA 2GV8A 2Q7VA 2WS3A 3CPIG 2VVLA 3UOVA 2WP9A 4CNJA 3T37A 4FX9A 4X9MA 4GRTA 3ZYXA 2WESA 1DOCA 1O94A 1NHSA 3NN6X 3F8RA 2X8HA 3IHGA 4A79A 1V59A 1DJQA 4EQSA 1EL8A 2CDUA 3G5SA 4H4PA 1PBCA 2WDRA 4C5OA 3AE1A 3L1RA 2E1MA 4BV6A 2V3AA 4GDPA 1GETA 3NT6A 4AP1A 2IVEA 2BS4A 4XWRA 2X99A 1AOGA 4OPIA 4ICYA 4OVIA 1F8RA 1VRQB 4RSLA 4H4RA 4H4WA 4EQRA 2FJAA 5KXJA 1LVLA 3P4PA 2YG7A 3KVEA 2C64A 1EL5A 2BA9A 5BULA 2BXRA 1RYIA 1KSUA 1NG3A 4YKGA 1CJ4A 1MO9A 4OPCA 1N4WA 3FIMB 4H2RA 4B64A 3NKSA 5JCKA 4TLXA 1VG9A 4A9WA 2OALA 3AE7A 2C65A 3BI4A 1CJCA 2GEWA 1TDNA 2BYBA 2OLNA 2X8CA 2YR6A 3H8IA 1LQTA 2H88A 1DJNA 3DJGX 3LXDA 1PDHA 3LOVA 1H84A 1UKVG 4B69A 4Z26A 3B3RA 2ACZA 1BGNA 2R9ZA 3H4KA 3RHAA 2E4GA 4NTDA 5KRQA 1RP0A 3S61A 3NK1X 4YWOA 2BXSA 3BI2A 3BNMA 3AEGA 3F8DA 4OPDA 5EOWA 4XWZA 3F8PA 3M12A 4D03A 4J33A 3UOZA 4BK1A 2GQWA 2XVIA 4OPTA 4H4UA 4CCQA 2R45A 4TLZA 3ICRA 2XLUA 1GRTA 2GAHB 3SFDA 1VG0A 4BJYA 2R0PA 4C77A 3ITJA 1PN0A 4RG3A 2BK5A 5IQ1A 1ZY8A 3NG7X 3NRNA 3QVPA 2YM1A 2CFYA 4BK2A 1IUWA 3AE5A 4C3XA 4WX1A 4EM4A 1D4EA 1PJ6A 3GD4A 4K8DA 4EM3A 4U2SA 2C76A 3IHMA 1GALA 2RGOA 1ZMDA 1PXBA 3NYEA 4JY3A 3PS9A 4H4VA 4J34A 3AYLA 1CBOA 1GRGA 1X31B 2VRLA 3NTDA 4U8IA 3URHA 1GRBA 3RP6A 1GXFA 3UKAA 1H86A 1LPFA 2QA2A 1TDFA 1E6EA 2CVJA 2GR3A 2VQ7A 2WPFA 4O5UA 5FS7A 4AOSA 1GRAA 2YQUA 1QLBA 4EIQA 2GR2A 3SM8A 3AWIA 3REDA 1NG4A 4U8MA 2Q0LA 2RABA 4B68A 3DJDA 3RNMA 4UDQA 4Z24A 4TM4A 2GRTA 1ONFA 3LJPA 4NEVA 5BRTA 1LQUA 3NK0X 3AE9A 1ZOVA 1NENA 2GAGB 1E1LA 4H4QA 2GB0A 1BWCA 3B6DA 2QCUA 1E1KA 2YWLA 4BJZA 1KSSA 4LA1A 1Y56B 2A8XA 1CC6A 4U8OA 4YXDA 1QO8A 2NPXA 3GD3A 1ELIA 2VVLG 5JCMA 1OJDA 5GSNA 2IIDA 3AEDA 3EF6A 3RP7A 1K0IA 1CHUA 2XDOA 1GV4A 1B5QA 1H7WA 3S5WA 4X4JA 4RG4A 4TM0A 3WE0A 1F8SA 4LIIA 5FMHA 2XLRA 4AOXA 1O5WA 3DK9A 1E7PA 2ARDA 2YR5A 3KU9A 3UKLA 2Z5XA 4YTNA 1KNPA 5CQFA 3AE6A 3Q6JA 4KX6A 2WETA 3AE8A 2CULA 4H4YA 3H8LA 2YVFA 5EB5A 5KVIA 4CBQA 1IUVA 2VVMA 4EMJA 5M10A 2X3NA 1K0JA 2WBAA 3DJEA 5HHFA 4YTMA 3V3NA 2B7SA 3II4A 4TM1A 2OLOA 2WP6A 3UKQA 3VRDB 3CGCA 1ZX9A 2YG6A 1GREA 1SEZA 4DGKA 4JNAA 2B9YA 2WDVA 1L9EA 1RSGA 3COXA 4M52A 1FEBA 1PBEA 4OCGA 2XCGA 2BS3A 2VQBA 4HB9A 4KPRA 4REKA 5GRTA 2JB2A 1Z6LA 3K7QX 2XFOA 4U8NA 3DK8A 4IVMB 4C74A 3DMEA 4ZCDA 3P4QA 4JY2A 3IWAA 3GSIA 4YSXA 4DSHA 3M0OA 3BI5A 2BCGG 1PBBA 1S2YA 3C96A 4APNA 1JOAA 5EBKA 1H81A 2WU5A 2C66A 1D4DA 2FJDA 3QVRA 1W4XA 4Y4LA 4BK3A 2O9ZA 4GCMA 3GWDA 2YR4A 3ABVA 3AEEA 4FK1A 1ZK7A 4ADWA 3CNTA 4B63A 4CNKA 5IQ4A 3ATQA 3QSSA 1JRXA 2AQJA 2R4JA 3AYIA 3NLCA 4UDRA 3NNEA 4EIPA 3UKKA 2XVFA 3CNSA 2WPEA 3K7TA 2JAEA 3AYJA 2YLWA 1GOSA 1IUTA 2VRMA 1CF3A 4B67A 3NGCX 1JNZA 4NTEA 1H6VA 4J57A 4H2QA 3IF9A 2XVEA 2UZZA 4H4ZA 1L9DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1F3BA 4AP3A 2K8SA 5B6NA 5ABRA 2E5VA 4WCTA 2GSQA 1K0CA 4HI7A 3ALJA 3VURA 3PINA 2DJ1A 2YG4A 2YM2A 1XVWA 2ON7A 1PJ7A 2X8GA 4USQA 1KF6A 2V5ZA 1K0MA 3ADAB 3HJPA 4IA5A 4KDUA 2B6MA 4EQWA 4F0CA 4EMIA 5IMCA 3WGDA 3FK8A 2YLSA 3CTGA 3GIXA 4EO3A 1U87A 2XPDA 5H5QA 4XS4B 4BURA 1GSSA 1T4ZA 4L5LA 2ZBWA 2ON5A 2C3CA 5CO3A 4K22A 1X9WB 4Z44A 5DALA 3DA1A 2VLTA 4D73A 3DH9A 1O95A 3SQPA 1M64A 1JZRA 2R4VA 4GCIA 3PPUA 1LV0A 2CZ3A 1IUXA 1K0AA 4OFNA 3O0HA 3QFBA 4I59A 4MPFA 1JFUA 2WOIA 3QOUA 2B3SA 4I97A 4KNDA 2VCXA 1B4VA 1K0LA 3I3LA 3GKXA 2VCQA 2OAMA 1SD8A 1GTIA 4K5RA 4MH3A 3V76A 3QMXA 4DSGA 3GMBA 2H19A 4PXOA 2LJAA 1DOEA 2C7GA 1GRFA 1GEUA 5BUKA 3VRBA 1F8WA 3CUKA 2VIMA 3GYIA 2X4AA 2WULA 2L6CA 4Z2RA 5KN0A 1TU7A 1ZDLA 1JEHA 3R9UA 3AB1A 3NZNA 1E39A 2YLXA 3LEFA 3LZXA 5FT3A 2XLPA 3VR9A 3UL3A 2FWGA 4O5QA 3D22A 4YSZA 3WD6A 2BS2A 1GSEA 3HJMA 2MMZA 2WB9A 1FECA 1QQ2A 4OPLA 1IYHA 3ZZXA 1F3PA 3A2VA 1EV4A 3JCML 4FO5A 3W6GA 3ZNQA 2GZYA 2YOIA 1GNWA 2EC4A 3N9JA 1EL7A 1J9BA 5ECHB 4JZQA 1AW9A 3FPZA 2R0GA 4IBPA 2IN3A 4GF0A 1E6BA 1H75A 2XFPA 3T2KA 1QMVA 1MEKA 3A3TA 2OE1A 5CAXA 1G7OA 2I0ZA 2H30A 5FS9A 3GX0A 2LS5A 3F8UA 1Z6MA 4DNAA 3L9UA 4HA6A 3BNUA 1OKDA 3QSMA 4ZIJA 4ZBAA 4KSOA 4USSA 3ZNPA 22GSA 2PERA 1XDIA 1TK5B 3C4AA 1EZKA 3GYKA 3TJJA 4AT0A 3TRXA 4DVCA 4GRFA 2BK3A 4IKHA 1FOHA 1QGVA 2KUCA 3LYPA 4G0LA 1GT8A 1U3IA 4MK3A 2GF3A 2PHHA 1OJ9A 4IVOB 1U6TA 4K2XA 4A5LA 4E8HA 3DIEA 4U8KA 2ZNMA 3IC8A 20GSA 2TMDA 1GSYA 3JSKA 3TOUA 1WMJA 2TPRA 3QPMA 2OKAA 4ZB6A 4YT0A 4WF4A 1XPQA 4JBBA 5BVAA 2GH5A 5IMDA 4II3A 5JWRB 4U8PA 1JZDA 3UKHA 3BBYA 19GSA 3C4NA 2VL2C 3AEBA 4MMMA 2DIYA 2VCWA 1OJCA 1XW5A 2LKUA 5JCIA 3VQRA 1DDOA 1N4UA 1NPXA 1NHRA 1RW1A 3LXZA 1E2YA 3MNGA 5D93A 1YQ3A 3DGZA 1SL0B 1BGJA 1A2JA 1XXUA 1O85A 3ATRA 3QFAC 1YJ6A 4EDZA 2HI7A 1T00A 4XIHA 1AIUA 1PN9A 3G7IA 2MBSA 4MP4A 3SFEA 1MXTA 3RHCA 2RLIA 3J7Yk 1YF0A 3NIVA 3GFKA 2C70A 4MJWA 1BQ7A 10GSA 5IO0A 4YAVA 4YJHB 2C3DA 2WDUA 2XFNA 2LTKA 1V9WA 4Z7XA 4BVXA 2EIOA 2F9SA 4U2LA 3W8JA 3I6DA 3LORA 3VWXA 3M9KA 4P9SA 2R46A 1N4VA 4II2A 3HCZA 1C0PA 1B8SA 3IAM2 1DODA 4CRTA 5TR3A 2DKIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2R0CA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

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