2R0CA

Structure of the substrate-free form of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
528
structure length
509
Chain Sequence
NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDASKSTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEERELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
molecule keywords RebC
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 161
structure length 509
sequence length 528
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0cA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0cA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0cA01
1JU2A 4OCGA 4U2LA 1GV4A 1ZMCA 3DH9A 3GSIA 3BHFA 1D4CA 2WOVA 4Z2TA 3I6DA 3VRAA 1RYIA 3KVEA 4DGKA 1ELIA 3AD8B 3EPTA 3AD9B 3L1RA 4U2TA 5HXIA 2XLRA 4BK2A 3NGCX 2C76A 4Z24A 1KSSA 3ICRA 4UP3A 3G5RA 3UKKA 4TM3A 3S61A 1LVLA 5HHFA 4NZHA 3GRSA 4YKFA 4RSLA 5TR3A 4U8KA 1H7XA 3P4SA 1REOA 1D4EA 2WDVA 2YWLA 4Z25A 3SM8A 1CJ4A 2F5ZA 3ALMA 4JNAA 2R0GA 2Y6QA 1VDCA 3RHAA 1DODA 2OLNA 1GSNA 4O5UA 3AEFA 1KNPA 2BK4A 4K5RA 5IQ1A 3SFDA 4JQ9A 4DSGA 2C7GA 2J3NA 3SGLA 2GEWA 5JCKA 1LJ1A 3UOZA 5EB5A 3I3LA 4H4WA 1S3EA 1F8WA 4EIQA 4GF7A 2WP5A 4Y4NA 1K4QA 1DXLA 4H2NA 2JBVA 2WP9A 3CIRA 3E1TA 3UTHA 2R45A 1GRTA 1BZLA 4E0VA 4IVOB 2YG4A 3EAOA 2X8CA 3II4A 4P9SA 2AAQA 1OJCA 2C65A 1O5WA 1FEAA 4Y4MA 1IUXA 2V6OA 1PBDA 3LB8A 4A5LA 3H8LA 4J57A 4XXGA 1PN0A 2BS3A 2W0HA 3NTDA 3SFEA 4A7AA 1P2HA 4B67A 2GAGB 4J31A 2WU5A 3CPIG 1JNZA 2GMHA 3DGHA 1KDGA 2XVEA 1QO8A 1E1KA 3VRDB 2UZZA 2YAUA 3AD7B 1CJ2A 3P4RA 1OJTA 1RP0A 2YVJA 4KX6A 1EL7A 4NTDA 1OJAA 2TPRA 3V3OA 2AR8A 1JEHA 1E39A 4YWOA 1CJCA 4BJYA 4A6NA 4C3YA 2BS2A 1IJHA 5HYMA 2Q0KA 1ZY8A 1LQTA 1ZOYA 2R0CA 2GR1A 3FMWA 2B7SA 2IVDA 2EQ6A 3Q9TA 1O95A 3GRTA 1GPEA 1TDNA 1COYA 2GR3A 4LA1A 3P9UA 1CC2A 3ATRA 3DK4A 3IHGA 4CNJA 1TYPA 1Y56B 2R46A 3P4QA 2B7RA 1ONFA 4CCQA 1S3BA 2GB0A 5GSNA 4ICYA 3QSMA 5FS7A 3NRNA 4NTCA 3UKHA 4K22A 2ZZBA 1QJDA 3CNTA 4GDEA 1E1NA 4Z2RA 2A8XA 3CN8A 3VR8A 1D7LA 3VR9A 4U8JA 2OALA 2Q6UA 1Y0PA 2C67A 1YQ4A 3V76A 3DK9A 3NYCA 4H2QA 1GEUA 4JNQA 3GMBA 2PYXA 3NH3X 3GWDA 3LZXA 3B3RA 3FBSA 4J34A 3AB1A 3AE5A 4OPCA 4BK3A 2AQJA 1CJ3A 2FJBA 2IVEA 4B66A 3QSSA 3C4AA 1E1MA 4HB9A 4B63A 5U63A 1PBEA 3KLJA 4K7ZA 1ZDLA 1DJQA 1ZX9A 2ZZ0A 1D5TA 2A87A 2R0PA 2GR0A 1TDFA 2QA1A 1FECA 3PVCA 1JRZA 2YLTA 3AE3A 2A89A 4DSHA 4ADWA 2YG7A 2V5ZA 2X3NA 2H88A 3IHMA 4A99A 1GRBA 4C74A 4X4JA 2APGA 2Y6RA 2BK3A 5IPYA 1TYTA 2FJEA 3AWIA 3NN6X 1LPFA 1OJDA 5BRTA 2JK6A 4H2RA 2RGOA 2YM1A 3LZWA 4I58A 5EBKA 3ZYXA 1F6MA 3NNEA 4A6NB 3M12A 1PJ7A 3KKJA 1NHRA 2B76A 2V61A 4Z44A 4EMWA 4EM4A 1N4WA 1CBOA 3DJGX 3PO7A 3F8DA 3RP8A 2WOWA 1BF3A 2VRMA 2Q7VA 4U8PA 4CY8A 4J56A 3AYIA 2WDRA 3KD9A 2XFPA 1Q1RA 2CDUA 4YT0A 1B8SA 3CNDA 2C75A 4XWZA 3QFBA 3C4NA 5U1OA 5GRTA 1GESA 2RGHA 4H4PA 3ABVA 5EB4A 4A65A 5CQFA 2WDQA 3AEAA 4B64A 1H86A 3K7QX 1XHCA 3AE7A 1F8SA 1MO9A 3L8KA 4GRTA 1AOGA 3IC9A 1GXFA 1E6EA 2CVJA 1PHHA 1GETA 3KA7A 1TDEA 4TM1A 4ZN0A 4A79A 1CHUA 4FX9A 4EMJA 1LV0A 2XFOA 1GT8A 4USQA 2XVIA 1H81A 1NG4A 4IVMB 4FK1C 4YSYA 5FS6A 1PXAA 3VRBA 4D03A 3OZ2A 4A9WA 2H89A 2XCGA 2XLTA 4H4SA 2BXRA 1Q1WA 4H4RA 4J33A 3JSKA 4YSZA 4USRA 4EM3A 4AT2A 2XFUA 3B6DA 4OPUA 5KXJA 4OPTA 1GRFA 3QSEA 2XVJA 3ATQA 4LU6A 1MXTA 2VVLA 4EQXA 1EL8A 4CY6A 2ZBWA 4ECHA 5KVIA 2QA2A 2V3AA 3UKPA 4EQWA 2X99A 1JNRA 2OLOA 3DA1A 1NAAA 1BWCA 1CC4A 2EQ7A 3F8RA 5BVAA 1PDHA 1NHPA 1VG9A 5CKUA 5EOWA 4BJZA 2XLUA 3NK0X 3GD3A 1ZOVA 1ZP0A 4HA6A 5L46A 1V59A 3C96A 3CGCA 3NG7X 4ZCDA 1EBDA 2GQFA 2O9ZA 3NK1X 2BC1A 1X31B 2Z5YA 5KWFA 4Z2UA 3HZLA 4JY3A 3AE1A 4H50A 2BC0A 4XWRA 2C70A 2WETA 4J2WA 3ITJA 3NKSA 4X9MA 5M0ZA 3UOYA 2Z5XA 5C2TA 2YLZA 3LXDA 4YXDA 1PXCA 2YR5A 1S2YA 3NTAA 5ER0A 2B9WA 1VQWA 1ZKQA 2X8HA 2YLXA 3IF9A 2V60A 5J60A 2WPFA 3P1WA 4Y4LA 4YSHA 2BCPA 2GF3A 3DGZA 4JDRA 3UTFA 1F8RA 2V3BA 3AYJA 4APNA 4KPRA 4N9XA 3DK8A 4EIPA 3K7MX 1PS9A 4H2PA 1N4UA 2XLPA 3RP6A 1FCDA 5JCLA 4TM0A 2NVKX 2OAMA 3PS9A 2VQ7A 4GUVA 1XPQA 4CNKA 2QAEA 1BKWA 2XYOA 2BA9A 3AE6A 1F3PA 4U8LA 3FIMB 4U2SA 4NTEA 4IV9A 1GTEA 4OPGA 1UKVG 1ZK7A 4YKGA 3F8PA 3EANA 4RG3A 2BABA 1NHQA 2YG6A 4TLZA 4K2XA 3H4KA 4NEVA 3K30A 3QVRA 1TDKA 1GNDA 1VRQB 2QCUA 3QFAA 5FMHA 2BACA 5U25A 3T37A 1FL2A 2WQYA 3ALJA 1GRHA 1NHSA 3AE4A 5HY5A 2YVGA 3IWAA 3EF6A 2YG3A 2DKHA 3P4PA 4PAAA 1HYUA 2BXSA 2BCGG 3G5SA 3GD4A 4H4QA 4IA6A 4DNAA 2TMDA 3DJJA 3SQPA 3AEDA 3AEGA 3BI2A 2WESA 2EQ8A 1JRYA 2XFNA 1D4DA 1YY5A 2R9ZA 3GYIA 3ADAB 4M52A 4D04A 1Y56A 4H7UA 2E5VA 4ZCCA 2YLSA 5KOXA 1D7YA 1TRBA 2WHDA 3BI4A 4YTNA 3G5QA 2JB1A 2CFYA 2X8GA 1CL0A 1GTHA 2IIDA 4B1BA 1O94A 5BULA 4CBQA 3AEEA 3NK2X 3REDA 2R4JA 3NN0X 3O0HA 4B68A 2Q0LA 2VOUA 3GDPA 4EQSA 1CF3A 2B9XA 3URHA 1K0LA 1FOHA 1GOSA 1BGNA 2YG5A 5DBJA 5JCMA 3QVPA 5KVHA 3GDNA 2C3CA 2C73A 2YR4A 3AE9A 1DOBA 3BNMA 4K8DA 3NT6A 2YQUA 4U8OA 2HQMA 1KNRA 3GWFA 1IUTA 4TLXA 5KOWA 1LQUA 3KPFA 4H4UA 1DJNA 1L9EA 1P2EA 1FEBA 2RABA 4TM4A 2GQWA 2YLRA 3CTYA 2VVLG 4U8MA 4AOSA 1KFYA 3CNPA 4OPDA 3BHKA 2ACZA 1ZMDA 2XVFA 1SEZA 2GH5A 2C66A 3WE0A 5C3JA 3QJ4A 1IUSA 1GRAA 1QLBA 1EL9A 4B65A 2B9YA 4BV6A 3DMEA 1M6IA 1YQZA 2DKIA 3UKQA 3ZDNA 2E4GA 1VG0A 2XFQA 3R9UA 2WP6A 2YM2A 1OJ9A 1MOKA 3ICSA 5J7XA 3ISHA 4JN9A 2NPXA 4YSXA 2OA1A 1DOEA 1E7PA 1LTXR 2WPCA 3VQRA 3CPJG 4CRTA 4EMIA 2XDOA 4OVIA 3UKFA 1CC6A 4AP1A 2VRLA 1YQ3A 3NIXA 1GRGA 1IUUA 1GALA 1PBCA 3COXA 3UTEA 4GDPA 3UP4A 1N4VA 5JCIA 2WU2A 4CCRA 1H6VA 3AEBA 4WX1A 1L9CA 3NHOX 2XVHA 3UCLA 2XLSA 1E1LA 2BYBA 1NDAA 3KU9A 1KF6A 1NPXA 2GMJA 1RSGA 3LADA 1H83A 2EQ9A 3AECA 3ALLA 2C72A 4RG4A 3NLCA 4OPLA 2WS3A 3UP5A 3LJPA 2JB2A 1H7WA 1IUWA 2GR2A 2GAHB 4WCTA 2R4EA 2FBWA 2WPEA 3DJDA 3H8IA 4H4TA 4PABA 5FS9A 4Z43A 3UTGA 5JCNA 3NYFA 5BUKA 1PJ5A 1JRXA 1YKJA 2FJAA 3FPZA 1Z6LA 4FK1A 1NENA 4I59A 3UKLA 1L0VA 1K0JA 4AP3A 1DNCA 2PHHA 2WBAA 2VVMA 1K0IA 3CGEA 3UOXA 4X9NA 4H4XA 1GERA 1NG3A 3UKAA 3GYJA 1EL5A 2JAEA 1PBFA 1DOCA 4BK1A 1B5QA 1TDOA 2BS4A 2E1MA 3BI5A 3GMCA 4MJWA 4UDPA 3RP7A 5M10A 1XDIA 1W4XA 4AT0A 3AXBA 1H82A 2FJDA 4FDCB 3D8XA 1PXBA 4J36A 2GVCA 2I0ZA 1B4VA 4H4VA 1NEKA 4Z26A 3AYLA 1H84A 3D1CA 2BK5A 4H4ZA 4EQRA 4JY2A 4H4YA 4UDRA 3RNMA 1L9DA 1XANA 1PBBA 2YVFA 4NEWA 3CGBA 4IA5A 3M0OA 4GR1A 1B37A 1GREA 3AE2A 4U8NA 4C5OA 4K5SA 1JOAA 3CNSA 4AOXA 4YTPA 4OPIA 1N1PA 2GV8A 2YLWA 1M64A 1PJ6A 2VQBA 3BNUA 4YTMA 4BURA 5KRQA 2C3DA 3CGDA 3CNJA 3UOVA 1S2QA 2ARDA 2YR6A 4C3XA 3DJEA 3S5WA 4REKA 3ICTA 2C64A 4C77A 1BGJA 3FG2P 3AE8A 5FS8A 2VZ2A 5LV9A 2RGJA 2CULA 4U8IA 5IQ4A 3V3NA 4LIIA 1KSUA 2JKCA 2WEUA 2ZZCA 3Q6JA 4UDQA 4B69A 3LOVA 3OC4A 2WOIA 1IUVA 2X50A 4O5QA 3K7TA 4GCMA 3CPHG 1Q9IA 3NYEA 3M13A 2GRTA 2JB3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OCGA 4U2LA 1O85A 1D4CA 4Z2TA 3I6DA 4LLRA 2KOKA 3KVEA 3AD9B 5IM9A 3EWLA 2M80A 2XLRA 3CRUA 3ICRA 4UP3A 5C00A 1ABAA 4NZHA 3VI5A 3N5OA 3J7Yk 2EIOA 3CQFA 1REOA 2HRFA 1C0IA 1CJ4A 2F5ZA 4JNAA 4GLTA 1DODA 3RBTA 4O5UA 4Q5RA 3AEFA 3F6FA 2FGXA 3P7XA 2N5BA 5JCKA 2P0GA 3I3LA 1F8WA 4Y4NA 5HR2A 3E1TA 4H2NA 4GSTA 2WP9A 2R45A 4FH8A 1V40A 3HJMA 3EAOA 6GSWA 3II4A 2IPAA 1OJCA 1FEAA 4A5LA 3NTDA 1S3AA 1X9MB 3J7Yb 4A7AA 2VOCA 4J31A 3P90A 1AN9A 5JWOB 3DRNA 2WCIA 3EYTA 1E1KA 3VRDB 1CJ2A 4KCEA 1OJTA 4TKYA 2GVPA 4WETA 2YVJA 2GZPA 4AJ6A 1JZWA 4PQIA 4JR6A 3A5WA 2TPRA 1EEMA 1B48A 3U6VA 1JEHA 1DAOA 4XCSA 1M0UA 4POKA 1QQ2A 3NIVA 2R0CA 1S3RA 1R4WA 2B7SA 2OADA 1WPIA 1R7HA 4LA1A 1TDNA 3EU4A 3MIXA 2GR3A 3P9UA 1CC2A 3DK4A 1PX6A 4AJ8A 3KM6A 1ONFA 4EO3A 2GB0A 5IMFA 3WYWA 3GNJA 1QJDA 3VR8A 2A8XA 2MMNA 4RI7A 3VR9A 4FYBA 4U8JA 2LEGA 1EOHA 4POBA 3QFBC 1YQ4A 2CX3A 2PYXA 2OBIA 2HRAA 3CPHG 1XOAA 2AQJA 3GH6A 4IGJA 2FJBA 2E4AA 2IVEA 4B66A 2C3QA 3ISOA 4O32A 3TKSC 4EL1A 1E1MA 2ZZ0A 1A2MA 1KBNA 2K8SA 1GSFA 1K0OA 3RDWA 2QA1A 4OWYA 3AE3A 2YG7A 1EVIA 2R3XA 2PWJA 3RAZA 2C0GA 1XWAA 2G2QA 2APGA 2BK3A 3EMXA 3AWIA 4HI7A 1OJDA 4I58A 3IDVA 3LZWA 3M12A 1GUKA 3G7JA 2TRCP 3KKJA 4HUAA 1GLQA 1Y6EA 2VAFA 4EM4A 1N4WA 3PO7A 3CXGA 4U8PA 3IOSA 1C72A 4IP6A 4J56A 3AYIA 4OFTA 2WDRA 4YT0A 5HR0A 1Q1RA 2GGTA 2GTUA 4BWSA 3SZ0A 2E0QA 3QFBA 10GSA 3C4NA 3IAS2 4TN8A 5GRTA 2RM6A 2RGHA 2DJ2A 3ME8A 4MMMA 5EB4A 4XRAA 4B64A 3K7QX 3LWAA 1F8SA 1AOGA 3TKSA 1E6EA 1PHHA 1K0BA 4CW9A 5G1LA 2IMEA 3O3TA 4A79A 5IMZA 4FX9A 2VD0A 3ZNPA 2H76A 2H0HA 4EMJA 4WBRD 2VIMA 1LV0A 2V1MA 4YSYA 1NG4A 2DBCA 4JR4A 4IVMB 1EP7A 5G5FA 3OZ2A 1EV9A 1M3IA 2H89A 4K0GA 2YZUA 2CX4A 4MJAA 3TJJA 2QSIA 3TDGA 2ON7A 4KAEA 3T31A 1Z9HA 1UN2A 1J0FA 2YANA 3ZVJD 2QA2A 5ECHB 1DE2A 2JL4A 4N0ZA 4N30A 1CC4A 2ES7A 1VG9A 3VURA 2XLUA 4TR1B 1PRXA 1ZOVA 4II2A 2VCVA 4IHUA 3C96A 4YJHB 3CGCA 2AB6A 1DDOA 4ML1A 5IQYA 4RQXA 1EBDA 5ECPB 5GSSA 2O9ZA 1W89A 1HNCA 3HZLA 4H50A 5F05A 1SKWB 4MF6A 1GUHA 1ERTA 1TU8A 2FWHA 4YXDA 1YZXA 3Q74A 1YEPA 5D96A 4RI6A 2C3TA 2H70A 3WT1A 3P1WA 4YSHA 2DMLA 2NPBA 3VWVA 3FKFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4OCG A;  4U2L A;  1O85 A;  1D4C A;  4Z2T A;  3I6D A;  4LLR A;  2KOK A;  3KVE A;  3AD9 B;  5IM9 A;  3EWL A;  2M80 A;  2XLR A;  3CRU A;  3ICR A;  4UP3 A;  5C00 A;  1ABA A;  4NZH A;  3VI5 A;  3N5O A;  3J7Y k;  2EIO A;  3CQF A;  1REO A;  2HRF A;  1C0I A;  1CJ4 A;  2F5Z A;  4JNA A;  4GLT A;  1DOD A;  3RBT A;  4O5U A;  4Q5R A;  3AEF A;  3F6F A;  2FGX A;  3P7X A;  2N5B A;  5JCK A;  2P0G A;  3I3L A;  1F8W A;  4Y4N A;  5HR2 A;  3E1T A;  4H2N A;  4GST A;  2WP9 A;  2R45 A;  4FH8 A;  1V40 A;  3HJM A;  3EAO A;  6GSW A;  3II4 A;  2IPA A;  1OJC A;  1FEA A;  4A5L A;  3NTD A;  1S3A A;  1X9M B;  3J7Y b;  4A7A A;  2VOC A;  4J31 A;  3P90 A;  1AN9 A;  5JWO B;  3DRN A;  2WCI A;  3EYT A;  1E1K A;  3VRD B;  1CJ2 A;  4KCE A;  1OJT A;  4TKY A;  2GVP A;  4WET A;  2YVJ A;  2GZP A;  4AJ6 A;  1JZW A;  4PQI A;  4JR6 A;  3A5W A;  2TPR A;  1EEM A;  1B48 A;  3U6V A;  1JEH A;  1DAO A;  4XCS A;  1M0U A;  4POK A;  1QQ2 A;  3NIV A;  2R0C A;  1S3R A;  1R4W A;  2B7S A;  2OAD A;  1WPI A;  1R7H A;  4LA1 A;  1TDN A;  3EU4 A;  3MIX A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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