2R0CA

Structure of the substrate-free form of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
528
structure length
509
Chain Sequence
b'NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDASKSTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEERELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords RebC
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule tags Oxidoreductase
total genus 161
structure length 509
sequence length 528
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0cA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0cA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0cA01
4C3YA 3DK9A 3ALLA 2BYBA 5M10A 3PS9A 1OJ9A 3AECA 1PDHA 4B66A 4K7ZA 1N1PA 2BABA 2ZZ0A 3B6DA 3LZWA 2GMHA 2HQMA 3LXDA 2GEWA 4EMIA 2RGJA 4YKFA 3AE3A 3NNEA 3AE5A 4OPLA 1LQTA 1D4EA 3SQPA 2JB2A 1K0IA 2WS3A 2YR6A 3KLJA 3NK1X 2GV8A 4TM1A 3NH3X 2ZZBA 4Y4MA 3RHAA 1FECA 1JU2A 1ZK7A 3ABVA 1OJTA 3VR9A 4C77A 3SFEA 4OCGA 4H4WA 3UKAA 1RYIA 2BS4A 2GR2A 2Z5YA 4KPRA 1E6EA 3OC4A 3DH9A 1KDGA 1W4XA 3AD8B 3CN8A 1CC2A 3GRTA 3KVEA 4BURA 3IF9A 4TLZA 2BK5A 1KSSA 2JB3A 1VQWA 3I3LA 1JRYA 1L9EA 3NT6A 3P9UA 2EQ7A 4H4XA 4APNA 2C73A 1GXFA 5M0ZA 3AEEA 4REKA 4FDCB 3UTHA 3AE7A 3UTEA 3K7QX 3GRSA 4J57A 2YM2A 3GMCA 3DJGX 4A65A 4JNQA 1TYPA 3URHA 1FL2A 1GALA 1LQUA 2YQUA 4OPUA 2XVEA 4U8LA 5J7XA 4IVMB 1GRHA 2GVCA 2W0HA 3C96A 4GR1A 3ICRA 3NYEA 2YLXA 5CKUA 4H4UA 2WP9A 2YLSA 2C3DA 1ZOVA 2XLPA 4USQA 3VQRA 2E1MA 3AD7B 1PBFA 3V3OA 1D4DA 1V59A 5KWFA 3ALJA 2C65A 4H7UA 1YQZA 4TM0A 4B65A 1JNRA 3UKLA 4BK1A 4D04A 3NK0X 1KNPA 1H81A 4OVIA 3QVRA 1NHPA 3H4KA 4P9SA 3AYJA 1JRXA 3GSIA 1YY5A 1IUVA 2VVMA 3UTFA 1Y56B 1LVLA 1BGNA 2WP5A 1DJNA 3AE6A 5U63A 1Y56A 2VVLG 4RSLA 2B9XA 2YR4A 4Y4LA 4YSHA 4C74A 2XVFA 2O9ZA 1PBEA 2X50A 1NG4A 2AR8A 2B9YA 1B37A 3AEAA 4UDPA 2CULA 3IHGA 3VRDB 4H2PA 4YT0A 2BXSA 5KRQA 3UCLA 4H4VA 3GD3A 4I58A 3BI5A 1GV4A 5KVIA 1F3PA 3BI2A 1KFYA 3OZ2A 3DJJA 3NN0X 2WQYA 3AXBA 3UKPA 4XXGA 4EM3A 1GETA 4H4SA 4TM4A 4USRA 4K2XA 4J34A 1PXAA 2CVJA 3NLCA 4ICYA 1KF6A 1EL8A 1DODA 2C64A 2B7RA 2EQ6A 4RG4A 1COYA 3UOXA 4A9WA 3UKKA 1TDFA 2QCUA 2YG7A 2XVJA 3BNUA 4Z2RA 2ARDA 1S2QA 3FBSA 1GSNA 1H7XA 2V6OA 3DJDA 3QVPA 4J2WA 2EQ9A 2GRTA 3LJPA 2PHHA 4RG3A 4B64A 3UP5A 2BXRA 2R0CA 1F6MA 1GRGA 2RABA 4U8MA 4Z43A 1ZDLA 4YTMA 2NPXA 2FJBA 2V3AA 1O5WA 2C70A 3NIXA 1GERA 2GR1A 3CGDA 2GF3A 3M13A 3SM8A 2DKHA 4EQSA 3UKFA 2XCGA 3CIRA 4OPGA 2FJAA 4Z26A 4H4QA 1EL5A 3NHOX 1IUTA 3G5SA 2GMJA 2H89A 2E5VA 2X3NA 4AP1A 2R0PA 3EPTA 1SEZA 4Z24A 3L8KA 1JEHA 1DNCA 1BF3A 5L46A 3BHKA 1PS9A 1TDOA 3L1RA 5IQ1A 4AT2A 1GRBA 1CBOA 1E1MA 1GT8A 2C66A 3D1CA 3DJEA 3CGEA 4UP3A 3RP7A 1EBDA 2XFNA 3GYJA 5HHFA 1LJ1A 2R9ZA 3AYIA 4GRTA 2Q0KA 1X31B 4YWOA 5FS8A 1E39A 3R9UA 1YKJA 3V3NA 3NYFA 3Q9TA 3QFAA 4U8OA 4X9NA 1LPFA 1PJ6A 3DA1A 3CPHG 1JRZA 2QA1A 4U8KA 2VRMA 2OAMA 5FS9A 2OALA 2YLTA 3LOVA 1QJDA 3CNTA 1ZMDA 3S61A 1K4QA 3DK4A 3O0HA 2YVGA 4N9XA 5JCMA 4YSYA 2WHDA 1PJ5A 4DGKA 2WDRA 1LV0A 1PXCA 2XFOA 4FK1A 2GR0A 3ZYXA 1PJ7A 1FOHA 2WU2A 3GD4A 1N4VA 3LB8A 4PABA 3Q6JA 2Q0LA 3EANA 5C3JA 3ITJA 5EBKA 3CNJA 1MOKA 4GCMA 1TDNA 3EAOA 1DOBA 4FK1C 3BHFA 2R45A 4EQXA 2X8CA 2WDQA 2YG6A 4BV6A 1ZOYA 3P4PA 4JDRA 2XFUA 4JQ9A 1NEKA 1H86A 1PBDA 2WPFA 1NENA 1H84A 1L0VA 2QA2A 2X99A 4TM3A 2BC0A 5KVHA 4YXDA 4X4JA 2C75A 4OPCA 1D7YA 1S2YA 4H2QA 5BULA 3F8RA 4PAAA 1ELIA 2Y6QA 1MXTA 3BI4A 1D7LA 3G5QA 1FEAA 4E0VA 3NKSA 2JK6A 3PVCA 3WE0A 2XVIA 2YG4A 1M6IA 1Q1RA 4CRTA 4J56A 1L9CA 1NPXA 4CNKA 4YKGA 4X9MA 1MO9A 1O95A 1XPQA 5U1OA 1EL7A 5BRTA 3NN6X 4B68A 1BKWA 1XANA 1NDAA 4XWRA 5JCIA 3P4SA 3CGBA 1TDEA 1E1NA 1LTXR 2WOWA 3AEDA 1CJ4A 4UDRA 4EQRA 2B9WA 1NHSA 2ACZA 1S3EA 1B4VA 2TPRA 4K8DA 4OPDA 2Q6UA 2JB1A 3IWAA 3I6DA 3AE4A 1L9DA 3DGHA 4H4ZA 5KOXA 1Z6LA 3GMBA 4LU6A 1NG3A 2J3NA 1GRAA 1JNZA 2WESA 3P4QA 3UOZA 1IJHA 2V61A 5FMHA 3DMEA 3F8PA 5C2TA 1CJCA 1N4UA 3NK2X 4EIPA 2YM1A 3V76A 3CNPA 2VVLA 4K5RA 4OPTA 5ER0A 2BCPA 1BWCA 1DOEA 3ICTA 4OPIA 3SGLA 1K0JA 4Z2UA 3ISHA 5HXIA 4NZHA 4EIQA 2XYOA 4TLXA 3QSSA 4H4RA 4B69A 2GR3A 2RGHA 1GTHA 2XLUA 3GDNA 3UP4A 1XDIA 3UKHA 4AP3A 3ATRA 1M64A 2CFYA 4JY2A 3UOYA 1E7PA 4JNAA 5FS6A 1GRTA 1DJQA 4JY3A 1BGJA 2EQ8A 1VG9A 4C5OA 2V5ZA 4BK2A 4D03A 4J33A 4EMJA 4GF7A 2C7GA 1CC6A 1GNDA 2BC1A 2APGA 5U25A 4YTPA 5HYMA 1EL9A 3CPJG 2WOVA 4A7AA 3M12A 1E1LA 1CL0A 5LV9A 1PBBA 2QAEA 1CJ3A 3JSKA 1F8WA 2F5ZA 4DNAA 2WPEA 2BACA 2A89A 3F8DA 1AOGA 1BZLA 5KXJA 3FPZA 3P1WA 1CJ2A 4Y4NA 2GAGB 3KPFA 2YLZA 3T37A 2WPCA 2WDVA 3E1TA 1RP0A 1YQ4A 2FJDA 4EM4A 3GYIA 1P2HA 3AEFA 1ZKQA 2GQFA 1H6VA 1NAAA 2R46A 4EQWA 3LZXA 4YSZA 2CDUA 3NTAA 4WCTA 3EF6A 2DKIA 4HB9A 1PHHA 4LIIA 3ZDNA 5JCNA 2IVDA 4A5LA 4U8NA 4U8IA 4NTCA 4MJWA 4XWZA 4Z25A 4DSGA 4K22A 1GOSA 3H8LA 3IHMA 4UDQA 3AE1A 1KNRA 2GB0A 3COXA 4U8JA 1IUWA 2XVHA 1QLBA 3G5RA 3QSMA 3QFBA 3B3RA 2Q7VA 3CTYA 3KU9A 1DOCA 4IV9A 1OJDA 4J31A 2BCGG 2Y6RA 2IIDA 1ZMCA 1K0LA 3CNDA 2X8HA 2BS3A 2FJEA 4O5UA 3RP8A 1H82A 3GWDA 4BJYA 1GRFA 2WEUA 2XLTA 1FCDA 1Q1WA 4J36A 1GEUA 3AB1A 1F8RA 3P4RA 5GRTA 4A79A 4CBQA 5IQ4A 5DBJA 4K5SA 4B67A 1TYTA 1O94A 2GAHB 2AAQA 4FX9A 3AEGA 3K30A 4H4YA 2C76A 3FG2P 4IA6A 3C4AA 2BK3A 2VRLA 4H50A 4H2RA 1CC4A 4ZN0A 5BVAA 5CQFA 1CHUA 1REOA 1NHRA 4HA6A 3VR8A 2YVFA 4U8PA 3VRBA 5JCKA 3NGCX 3UOVA 3CGCA 3NG7X 3ADAB 3DGZA 3REDA 1B8SA 2AQJA 2YAUA 3D8XA 3II4A 4U2TA 1YQ3A 2NVKX 2UZZA 2V60A 1ZY8A 1VRQB 2ZBWA 2BK4A 2C67A 2WP6A 3AE2A 3K7TA 1P2EA 2TMDA 2XDOA 5JCLA 3ATQA 4C3XA 3AE9A 3C4NA 3SFDA 4NEVA 4AOXA 1CF3A 2XLRA 1JOAA 1ZP0A 3UKQA 2XFPA 2VOUA 4CY6A 1GPEA 4ZCDA 4ECHA 1PXBA 4H2NA 2C3CA 1D4CA 4ZCCA 3RNMA 2XLSA 3K7MX 4LA1A 1B5QA 1UKVG 4O5QA 2VZ2A 1VG0A 1PBCA 2BA9A 2VQ7A 4IVOB 2YLRA 4NTEA 2YVJA 3ICSA 2H88A 1KSUA 3AWIA 4DSHA 1IUXA 2OA1A 3IC9A 3NRNA 3VRAA 2OLNA 1IUUA 4CNJA 5HY5A 1VDCA 2B76A 3DK8A 4CCRA 3M0OA 4H4TA 5EOWA 1S3BA 4U2LA 2IVEA 3KKJA 1OJCA 4M52A 2Z5XA 3NYCA 1QO8A 4BK3A 2V3BA 4I59A 4B63A 4CCQA 3QJ4A 2B7SA 5KOWA 3AEBA 1PN0A 1NHQA 5TR3A 4YTNA 3GWFA 4A6NB 1OJAA 1FEBA 1F8SA 1GREA 4A6NA 4AOSA 2YG5A 2YLWA 2R0GA 3ALMA 3QSEA 5J60A 1IUSA 1GESA 3RP6A 1RSGA 3FIMB 3PO7A 3UTGA 1TDKA 2A8XA 4WX1A 4YSXA 1HYUA 1H7WA 2JBVA 3LADA 3NTDA 1E1KA 2C72A 5EB4A 4IA5A 2WOIA 2BS2A 1N4WA 2JKCA 2YWLA 3H8IA 3KA7A 3GDPA 4B1BA 4GDEA 4JN9A 4AT0A 4KX6A 1H83A 3KD9A 2JAEA 3AD9B 2E4GA 3S5WA 2GH5A 2R4JA 2A87A 4ADWA 2GQWA 3AE8A 1GTEA 2ZZCA 3HZLA 4H4PA 3CNSA 2WU5A 3CPIG 2VQBA 4NTDA 2PYXA 2WBAA 4NEWA 3BNMA 1TRBA 1XHCA 5FS7A 1ONFA 4GUVA 1DXLA 5EB5A 2I0ZA 1Q9IA 4GDPA 5IPYA 5BUKA 2RGOA 2OLOA 2XFQA 1ZX9A 4U2SA 4A99A 4Z2TA 3AYLA 4CY8A 1D5TA 3FMWA 2WETA 4Z44A 4BJZA 4EMWA 2R4EA 2YG3A 5GSNA 2X8GA 2YR5A 1Y0PA 2FBWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2MBSA 4C3YA 5M10A 3PS9A 4OFMA 1N1PA 1AC1A 3EU3A 4KA0A 5B8AA 1CQGA 3LXDA 2LRCA 3IK7A 4YKFA 3NNEA 4OPLA 3GIXA 1LQTA 1D4EA 2OE0A 2UZ8A 1K0IA 4TXOB 2WS3A 3NK1X 2GV8A 4TR4A 4LMVA 3SZCA 1FECA 1ZK7A 3RBTA 4LL4B 3DD3A 2ZUPA 1O6JA 2IMDA 2WB9A 2GR2A 3UKAA 2C0FA 3EYTA 4JRRA 3DH9A 1W4XA 3AD8B 3IF9A 2I9HA 2BK5A 1C0LA 3I3LA 3NT6A 2QKEA 3ZMLA 2EQ7A 3UTHA 1OE8A 3CMMA 1DSBA 3TCOA 1MD3A 2YM2A 3DJGX 3M1GA 4U8LA 3C96A 2E0QA 5CKUA 3Q18A 1F3AA 3UARA 4USQA 3VQRA 4ECJA 2XLPA 2OBKA 5G5EA 5ECKB 1PBFA 6GSXA 5J5NA 3HA9A 3ALJA 4JEDA 4ZBDA 2FWFA 3TOUA 3UAPA 1ST9A 3BCIA 2MYGA 2XC2A 3P7XA 3NZNA 3H4KA 1NHPA 2WS2A 4BL7B 2IMFA 2O89A 2H1GA 3CRUA 3CTFA 3TJJA 3WGXA 2BJXA 1GSQA 2OKAA 2ZCTA 2KUCA 3UBLA 1AXDA 4RSLA 3HXSA 4YSHA 4RQXA 1QFNA 4ZB8A 3D22A 1NG4A 2AR8A 3UCLA 3GYKA 3BI5A 5KVIA 2GS3A 4N11A 1F3PA 4MF7A 3BI2A 5CRHA 1Z7PA 3K8NA 3DGQA 4K2XA 4J34A 3QOUA 1PXAA 2H30A 1AQXA 2CT6A 5AIXA 1EL8A 5IIZA 2EIOA 2B7RA 3QAGA 5F0GA 4KF9A 1R7HA 4A9WA 1EZKA 4G10A 2GGTA 1WP0A 2QGVA 2WULA 2ARDA 1GUHA 1ACVA 4LMWA 2GVPA 4ML6A 1Z3EA 2EQ9A 4RG3A 3ZIJA 3FK8A 2BXRA 4CDOA 4X1UA 4U8MA 1ZDLA 2NPXA 2FJBA 2V3AA 3MYDA 2H74A 4WKWA 2L4QA 5GAND 4I6XA 3ZZXA 2DKHA 2LV3A 3HKRA 3LSZA 1ZYPA 2GT5A 10GSA 1AQVA 1F6MC 4Z26A 2IFQB 1IUTA 2GMJA 2X3NA 5J9BA 4ZIJA 3EPTA 2DJ1A 3U6VA 3CSHA 3IC4A 3VI7A 3L8KA 1JZDA 4KX4A 1S3RA 3GSTA 5ECQB 1VGLA 4MCUA 1O73A 5L46A 3BHKA 5IQ1A 2XHFA 1CBOA 1E1MA 2DSAA 1S3CA 2FHEA 1AAZA 5JWRB 2Q0KA 4YWOA 3ZYWA 1E39A 1YKJA 2RUEA 3ZNNA 4I2TA 2VO4A 3DA1A 4HJ2A 2MMAA 2VRMA 2J23A 2OALA 4JE1A 2DBCA 2YLTA 3LOVA 1G7OA 4PTSA 4MMMA 4ZBAA 2C0EA 4ECCA 1G6WA 3KEBA 4YSYA 2HE3A 2WGRA 2WDRA 2LNTA 2IWTA 3IA1A 4MK3A 3GD4A 4PABA 1PA3A 4NWYA 4O92A 1C0IA 2L5LA 4GCMA 3GKKA 4OO5A 1TTZA 2CAIA 5B7CA 5DBQA 4FK1C 5JWOB 1DE2A 1ZOYA 1SU9A 3ZITA 4HSCX 4IP1A 1NEKA 4YJHA 2H73A 3SY4A 2FD3A 2RLIA 5COHA 4YXDA 1WWJA 2EIRA 2RM6A 2H19A 1S2YA 4IQ1A 2KOKA 4YQMA 4NAXA 4PAAA 1YKCA 4E0VA 1YJ6A 2ES7A 3PVCA 2JK6A 4PUFC 2YG4A 14GSA 4G0LA 4J56A 3F6FA 4CNKA 1MEKA 3ZIVA 2YCDA 1SL0B 1T00A 3NN6X 4B68A 2YV9A 4XWRA 3KM6A 4L8EA 1NDAA 4TKYA 1TDEA 1LTXR 2WOWA 3VWVA 3AEDA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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