2R0CA

Structure of the substrate-free form of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
528
structure length
509
Chain Sequence
NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDASKSTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEERELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords RebC
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule tags Oxidoreductase
total genus 161
structure length 509
sequence length 528
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0cA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0cA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0cA01
2VVLA 3VRDB 1H81A 5EOWA 4EMWA 2XFOA 1VRQB 1XANA 3ABVA 4X4JA 1RYIA 1W4XA 4YSZA 2OLOA 1LV0A 4Z25A 1D4CA 5U25A 4U8JA 2GV8A 4CCRA 1DNCA 2C7GA 5IQ1A 2BS4A 1H6VA 3UTEA 4RSLA 2RABA 3NN0X 2OAMA 1FECA 1JOAA 1GNDA 1TDOA 1N4WA 2YG5A 4U2LA 1GRAA 3RNMA 5BULA 3DK8A 2BS3A 4LU6A 1DODA 2VQBA 2XVJA 3AE8A 1PBDA 2CVJA 2A89A 4H2QA 3FMWA 2VVLG 4J34A 1PJ6A 3L1RA 2NVKX 1GRFA 3I3LA 4U8PA 4B68A 2YG4A 3UKLA 2R0GA 1PN0A 3P4SA 2YM2A 4Z2UA 4U2TA 1BF3A 3JSKA 2XFQA 3NT6A 4CBQA 1PDHA 1YQ4A 3AE4A 2C70A 4UDQA 3CNSA 4YTMA 1CJ3A 3KA7A 4XWRA 2YAUA 3GWFA 1ZP0A 3FIMB 1PJ5A 1TDEA 5FMHA 1GRHA 4IVMB 3HZLA 3AECA 3II4A 3NKSA 4J2WA 2Q7VA 2BCGG 1O94A 3ATRA 1S2QA 2I0ZA 2YG3A 2WBAA 3EF6A 1VG0A 2WEUA 1FOHA 1REOA 4C3YA 4HA6A 3CPIG 3BHKA 3B3RA 4H4UA 3ALMA 2R46A 4BK2A 4C74A 2GH5A 2YR5A 4RG3A 3KKJA 4EIPA 1QO8A 1NHQA 2EQ6A 5KRQA 2YG7A 2Q0KA 1PXCA 4H4VA 3K30A 1DJQA 1GEUA 3AD9B 3LADA 1NPXA 2OA1A 2XFNA 2YVGA 1BGJA 1L9EA 4OPTA 4B66A 1PXAA 1ZOVA 2BK4A 3DK4A 1FL2A 2XLUA 4KPRA 1GT8A 2GB0A 4A79A 4REKA 4H2RA 1E1LA 3V3NA 1ELIA 3V76A 2FJAA 3NK0X 1F8SA 1GALA 5HXIA 4OPDA 4BURA 1XDIA 2A87A 3SM8A 4A65A 3T37A 1BKWA 1B37A 3S61A 2R45A 4GCMA 1BZLA 3NK2X 2BK3A 2WS3A 2APGA 1KNRA 2GR1A 4KX6A 2C64A 4EM3A 1FEBA 3LXDA 2PHHA 3M12A 4JQ9A 4B69A 4JY2A 3VR8A 2UZZA 1DOCA 2BC1A 1SEZA 3PS9A 5FS8A 2R9ZA 2YLXA 4PAAA 4ZN0A 3AXBA 2ZZ0A 4D03A 1DOBA 1YQ3A 3UKPA 4EMIA 2J3NA 3IHMA 1LPFA 4EMJA 2IIDA 1ONFA 3DGZA 1S3EA 1GRGA 1OJTA 2YM1A 5KVIA 2IVDA 2JB2A 3LZXA 1KFYA 2E1MA 2XYOA 4H7UA 2A8XA 2X99A 4H4QA 2DKIA 3UTGA 3NYEA 5TR3A 1H82A 3F8RA 1CJ2A 3OC4A 2R4EA 4BJYA 3H4KA 3UKQA 3UP4A 3AE7A 3CN8A 3SFDA 5BVAA 1JEHA 4FX9A 3DJDA 3CGCA 4DGKA 3P4RA 2VQ7A 4A6NB 3DJJA 3FBSA 3PO7A 4NTCA 5IQ4A 1ZDLA 1GSNA 1TRBA 3D8XA 3NTAA 3R9UA 1QLBA 2Q0LA 2YLRA 3AYJA 3NNEA 4B65A 1BWCA 3V3OA 4YSXA 3GWDA 4J36A 5ER0A 2BACA 1OJ9A 4BK3A 4B64A 4BK1A 2WETA 4OPUA 2QCUA 1B5QA 3NTDA 1Q1WA 2BS2A 2WPFA 2C73A 4U8KA 2CFYA 1NAAA 3G5RA 3NK1X 3UTFA 4H4WA 2XFUA 2YLTA 3GRSA 1F8RA 4CCQA 2FJDA 2GF3A 2R0CA 1UKVG 5EBKA 3DA1A 4YSHA 3ADAB 1L0VA 4U8MA 1H84A 1IUWA 3CNJA 4YWOA 1F8WA 1PS9A 2PYXA 2V3AA 4J57A 4EQRA 4EQWA 3G5SA 1TDNA 5C3JA 4K8DA 4H4YA 4OVIA 4C77A 3M13A 4TLZA 3UOVA 4E0VA 4ICYA 1JNZA 4YKFA 4D04A 4Y4NA 1EL8A 1NEKA 1S2YA 2WOIA 4K2XA 4FK1A 4EM4A 1D5TA 4Y4MA 2XLTA 4U8IA 4Y4LA 3ALJA 1PBFA 5KXJA 3QFAA 2Y6QA 3KVEA 1NDAA 2H89A 1NHSA 1O95A 1ZX9A 3UKKA 5FS9A 2R0PA 1CF3A 1DOEA 1LTXR 1OJAA 1OJCA 4EIQA 2WP5A 2XVIA 3ICTA 1K0IA 3ITJA 4I58A 4C3XA 1GERA 1EL9A 2ZZBA 3AEEA 3AE5A 4J33A 4GF7A 1H86A 1K0JA 4TM4A 4EQXA 4U8OA 2JB1A 2V3BA 4XWZA 2XVHA 5BUKA 2QA1A 3P9UA 3CNDA 2GVCA 2HQMA 3E1TA 3RP7A 4A7AA 2C65A 2XCGA 2X8CA 4TM1A 4BJZA 3GYJA 3LJPA 4DNAA 4Z26A 3C4NA 4H50A 3UKAA 3QSSA 1GPEA 1TDKA 2JBVA 2JAEA 4MJWA 4A6NA 3CPHG 5M0ZA 3BNUA 1VDCA 3CIRA 3UKFA 4AT2A 4B1BA 2YQUA 4Z43A 2V60A 3I6DA 4NEVA 4TM3A 4EQSA 4Z2TA 2C76A 2FJBA 2V61A 3NYCA 3OZ2A 4CY6A 1PBEA 2AQJA 2VOUA 2YVJA 3L8KA 3NRNA 1FEAA 3F8DA 1IUXA 2B7SA 1GXFA 1BGNA 4GUVA 1LQTA 2DKHA 4LIIA 3ICSA 5HHFA 1TDFA 3CPJG 1CC4A 3UKHA 3NHOX 4AOXA 2BYBA 4USRA 2X8GA 3CTYA 5CQFA 4IV9A 4AT0A 4XXGA 4ADWA 3S5WA 3UP5A 1KF6A 1GV4A 1HYUA 2B76A 1CJ4A 2C75A 2WOWA 4BV6A 4OPLA 4YXDA 2BC0A 2WP9A 1EL5A 3AB1A 1IUTA 3GDPA 1PJ7A 2WPCA 1CL0A 2JKCA 4IA5A 5JCNA 1Q9IA 1O5WA 2GMJA 3NLCA 2C3DA 1VG9A 3AEFA 2E4GA 2BABA 2Z5XA 3KD9A 4I59A 4CNJA 2BA9A 2JB3A 4PABA 1EBDA 2F5ZA 4FK1C 4RG4A 2W0HA 3QVRA 2FBWA 4U2SA 5FS6A 2X8HA 3AD8B 3DJGX 4H4RA 2BK5A 3QVPA 1E1MA 1RP0A 2GQWA 4NTDA 2Q6UA 4TLXA 5EB4A 3O0HA 1VQWA 3ZDNA 1E1NA 2WOVA 4JY3A 4U8LA 4CRTA 2CULA 1PBBA 4GDPA 1P2EA 2GAHB 3AE6A 3SFEA 1YQZA 2B9YA 1E7PA 2WHDA 3UOZA 5GRTA 2V6OA 2H88A 5FS7A 3CGBA 1TYPA 3IF9A 3UCLA 3KPFA 3ICRA 1CC2A 4NZHA 2R4JA 1L9DA 2YR4A 2BXRA 2YLSA 3KU9A 1DJNA 1P2HA 3K7MX 5CKUA 4X9MA 1PHHA 1M6IA 3DK9A 1IUSA 3K7QX 1KSSA 4J31A 3CNTA 3AEBA 5IPYA 3CGEA 2BXSA 2TPRA 1E39A 1GRTA 4HB9A 3AYLA 3G5QA 1S3BA 4CNKA 2ARDA 3AE3A 2WU5A 4TM0A 1Y56B 2QA2A 1AOGA 3BI4A 1N1PA 3AE2A 3AYIA 2QAEA 4AP1A 4OPCA 3EAOA 3URHA 2X50A 3AEGA 4A99A 1D7YA 5LV9A 3UTHA 1GRBA 1NG3A 2GAGB 2GMHA 3GD4A 3WE0A 3B6DA 1IJHA 3VR9A 2OLNA 1B4VA 2WESA 1RSGA 2X3NA 4Z2RA 4B63A 2EQ7A 2AR8A 2RGOA 4AP3A 2WDQA 1L9CA 2VRMA 2XLPA 4UDRA 3C4AA 3GMCA 1MXTA 1KDGA 1COYA 4K5SA 2WPEA 4O5UA 4P9SA 5EB5A 4A5LA 4JDRA 4UDPA 3NN6X 1M64A 3ZYXA 3ATQA 1GOSA 2CDUA 1ZKQA 5JCIA 2NPXA 2OALA 4OCGA 4USQA 1ZK7A 4H2PA 3NG7X 5GSNA 2C66A 2E5VA 5JCMA 5KOXA 3UOXA 3FG2P 1LQUA 2YR6A 1JU2A 3VRAA 4OPGA 4H4PA 5M10A 1V59A 4Z44A 3AEDA 3GYIA 4A9WA 4NTEA 2VZ2A 2GR2A 2IVEA 3AWIA 3D1CA 3IC9A 2XLRA 5U1OA 2C67A 2XVEA 2XFPA 1XPQA 2VVMA 2WP6A 5DBJA 4UP3A 1JRZA 3H8IA 5KVHA 1N4UA 2B7RA 3AE9A 4IA6A 1TYTA 2EQ9A 1CBOA 4YTPA 2YWLA 3QJ4A 2C72A 3F8PA 5L46A 1MO9A 3AE1A 4JNQA 2RGJA 3NH3X 4YT0A 1YKJA 5U63A 3LOVA 1X31B 1H83A 2GEWA 4U8NA 3IWAA 3QSMA 3K7TA 3QFBA 4ECHA 4OPIA 2JK6A 5KOWA 4CY8A 1NG4A 2FJEA 1IUVA 4AOSA 2ZZCA 2O9ZA 1GESA 1E6EA 1JNRA 2VRLA 3PVCA 3FPZA 1OJDA 4Z24A 3VQRA 1ZMCA 2B9WA 4FDCB 4JN9A 1NHRA 2XLSA 2YG6A 3VRBA 3GMBA 3ISHA 3GDNA 4DSHA 1N4VA 2V5ZA 2TMDA 3DH9A 1Z6LA 3CGDA 4YTNA 1Y56A 4YSYA 1ZOYA 4NEWA 1QJDA 4GDEA 2WQYA 4APNA 3ALLA 2C3CA 1GTEA 1EL7A 1ZY8A 5HY5A 2ZBWA 3BI5A 3DJEA 1K4QA 3EANA 3NIXA 2XVFA 3SGLA 5J60A 1E1KA 4H4ZA 1NHPA 2EQ8A 3LZWA 3GSIA 4K7ZA 4LA1A 3RHAA 3P4PA 5JCLA 3Q6JA 2Y6RA 2ACZA 1PBCA 3REDA 3IHGA 1K0LA 4X9NA 3Q9TA 2RGHA 1GTHA 4WX1A 1GREA 3AEAA 3QSEA 4JNAA 3KLJA 2GQFA 4K5RA 4DSGA 1H7XA 1CHUA 2YVFA 4M52A 3GD3A 1H7WA 3BNMA 4GRTA 4H4XA 4H4TA 4YKGA 5C2TA 4O5QA 3DGHA 1KNPA 5BRTA 2Z5YA 3NYFA 3GRTA 3P1WA 1ZMDA 1D7LA 5JCKA 2GR3A 4B67A 4H2NA 3C96A 1XHCA 3NGCX 3P4QA 1CJCA 1JRXA 4K22A 1LVLA 2GR0A 2WU2A 5J7XA 4C5OA 5KWFA 4J56A 3AD7B 3M0OA 3COXA 2GRTA 4ZCDA 3RP8A 2WDVA 3DMEA 1D4EA 2WDRA 2YLZA 1JRYA 3SQPA 1B8SA 1FCDA 3BHFA 1IUUA 2B9XA 1KSUA 3CNPA 1D4DA 4WCTA 4ZCCA 3EPTA 1YY5A 4GR1A 1F6MA 4IVOB 1NENA 2YLWA 1Y0PA 3BI2A 4N9XA 3UOYA 2AAQA 1F3PA 1CC6A 3RP6A 4H4SA 3H8LA 3LB8A 2BCPA 1LJ1A 1DXLA 1Q1RA 2XDOA 1GETA 5HYMA 1MOKA 1PXBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3F3QA 1VRQB 1XANA 3DXBA 4X4JA 4HUAA 1W4XA 2VAFA 4Z25A 2OLOA 2JSZA 4AJ6A 1D4CA 4Q5FA 5U25A 5DAKB 2C0FA 2C7GA 3DVWA 4RSLA 3NN0X 2H70A 1JOAA 1GNDA 2H6YA 1N4WA 2YG5A 3RNMA 1B9XC 4TXOA 3F4TA 2N5FA 3ZYWA 2VQBA 3VWWA 2AB6A 1ON4A 4KE3A 3FMWA 1PJ6A 4DVCA 1GSSA 4B68A 2YG4A 22GSA 3GX0A 2A4VA 4U2TA 3O3TA 4Z2UA 2PVOC 3JSKA 1EV4A 1GSYA 1PD21 3W4IA 2RM6A 2XFQA 1PDHA 1YQ4A 3AE4A 5ELGA 3LWAA 2VO4A 4DSSB 1CJ3A 3ZZXA 3EMXA 2R3XA 5ECPB 3IAS2 3UIWA 4XWRA 5AIVA 3QAGA 1A24A 2KLXA 1TXXA 1C0LA 1V58A 1IYIA 1O94A 3ATRA 2CAIA 3F63A 4POKA 2WEUA 2ES7A 2L4CA 2RUFA 3ZRDA 4ZBDA 2HLSA 4PUAA 2JL4A 4C74A 5F0GA 1T1VA 4YJDA 5CO3A 2GH5A 2HSYA 5J9BA 4NHZA 4G2EA 1NHQA 4MA9A 2EQ6A 2QGVA 1I5GA 1QK8A 4H4VA 4YQVA 3D4MA 2YVGA 3KXOA 1GNEA 4LLRA 1PXAA 1ZOVA 4XTSA 2BK4A 1AUCA 4KF9A 2VLUA 1GT8A 4H2RA 1XZOA 1E1LA 1ELIA 3DVXA 3V76A 1HNAA 3UVHA 5HXIA 4BURA 4I6XA 3A3TA 2YJ7A 3NK2X 2APGA 4EM3A 1THOA 1BAYA 4JQ9A 5B7CA 1GP1A 5KMPA 2UZZA 3PS9A 4GAPA 5KMQA 2YLXA 2O8VB 4WBJA 1S3RA 2R4VA 2REMA 3CYNA 1NSWA 4D03A 2H72A 1USBA 3IHMA 2J3NA 1LPFA 4L0WA 2IIDA 3TRPA 3HYWA 2IVDA 2JB2A 3J7Yk 3LZXA 2E1MA 2A8XA 3CMIA 2IMDA 1W4VA 1MD3A 1K0AA 3HXSA 3P4RA 2VQ7A 5DALB 2C0EA 3DJJA 3L4NA 3NOFA 3PO7A 5IQ4A 2PU9C 3LFLA 1ZDLA 1GSNA 4B65A 4BJZA 1QLBA 3NNEA 1BWCA 4XS4A 1ML6A 3V3OA 4YSXA 4L5OA 5F05A 4FO5A 4GSNA 4G73A 2MMOA 1N8JA 4GTUA 3I9V2 3FK8A 4BVXA 3TDGA 2N5AA 2BS2A 2WPFA 2XBIA 4ISDA 3TRXA 2ZUPA 4GSSA 3G5RA 3NK1X 2YLTA 4PQ1A 5H5QA 2C80A 3A5IA 1PMTA 5EBKA 3DA1A 4IP1A 2P0GA 3HYPA 3EE2A 3W8SA 4XRAA 2PYXA 2V3AA 4J57A 2LSTA 4K8DA 2DSAA 4E0VA 1NEKA 4FK1A 4EM4A 1XVWA 1VRSD 4Y4LA 4OWYA 2CT6A 2RUEA 1NHSA 3H8QA 1EOGA 1CQGA 3VI5A 1O95A 2R0PA 4II3A 4X43A 2HE3A 1DOEA 1GLQA 1PQNA 2IIYA 3VPQA 3AEEA 4J33A 4GF7A 1H86A 4WF5A 3ZNQA 3KMNA 4EQXA 1SKSB 4XWZA 3A5WA 4OFMA 1X9WB 5KMSA 2XCGA 3CXGA 3LJPA 4DNAA 2DJ0A 1K3LA 1M2DA 4ZIJA 3QSSA 2FHEA 3TCOA 4KCEA 4MJWA 4A6NA 1M99A 3G7YA 4IN0A 3BCIA 2HFDA 2V60A 2E4AA 3IK7A 4TM3A 2VCQA 2V61A 1WIKA 2AQJA 1PX6A 1SL1B 3NRNA 4G0IA 1M9AA 1BGNA 2BRYA 4GUVA 2DKHA 4LIIA 3ICSA 1TDFA 4EVMA 3MSZA 5A5KA 2BYBA 1A0FA 4AT0A 3UP5A 2HZEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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