2R0PA

K252c-soaked rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
529
structure length
512
Chain Sequence
MNAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords RebC
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule tags Oxidoreductase
total genus 161
structure length 512
sequence length 529
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0pA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0pA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0pA01
4X9NA 4YT0A 4IA5A 4GCMA 1H84A 4JDRA 5BUKA 1TYPA 2GR2A 3AYIA 1PHHA 4U8IA 1E6EA 3SFEA 3VRDB 4U8OA 1XHCA 1GTEA 1ZX9A 2VVLG 2BK4A 3B6DA 1NEKA 2WU5A 2WP5A 2E5VA 2YM1A 4K8DA 1PDHA 2C73A 1YKJA 3EF6A 5HY5A 1REOA 4RG3A 1N4VA 2AR8A 2WESA 2RGHA 1D4DA 2VVMA 4TM3A 2QAEA 3AYJA 4TM0A 3QSSA 4Z24A 2BK5A 1IUSA 4UP3A 3CPIG 3NNEA 1ZMDA 1E1KA 1GT8A 1W4XA 3EAOA 4A5LA 2XLRA 3BNUA 2XCGA 4XWRA 2QA1A 3DJJA 4CCRA 1NDAA 1GXFA 2JKCA 2BACA 2WOVA 2C70A 4AOXA 5J60A 4U2LA 4YKFA 1NG4A 1TRBA 4K22A 2GF3A 2WPCA 3R9UA 3GWFA 3GYIA 3CTYA 2R4EA 2HQMA 3EPTA 2Q0LA 5EB4A 3VR8A 4H7UA 3M12A 2VZ2A 1TDOA 2YM2A 1LQUA 2X8CA 3NKSA 3ICRA 4CNJA 5J7XA 3F8DA 2JK6A 4U8MA 1H7WA 2C3CA 2QA2A 5FS7A 5JCIA 4DGKA 1P2HA 1E39A 2Y6RA 2X3NA 3FG2P 2BXRA 3GMCA 4Z25A 4AOSA 4YKGA 4HA6A 2C3DA 1D4EA 1Y56A 2R4JA 2VVLA 4IV9A 4H50A 2ZZCA 1NHRA 1S3EA 4B1BA 4D03A 3UTHA 1SEZA 4EIPA 2R0PA 2WBAA 3V76A 1OJAA 1AOGA 4RG4A 2YLSA 3PS9A 4U8KA 3L8KA 3C4NA 4EMJA 2TPRA 4BK1A 1GETA 4YTMA 1EBDA 1GEUA 4FK1C 4JNAA 4WX1A 2R9ZA 1GESA 4YTPA 2XLUA 3GD4A 3VRBA 5KVHA 1QJDA 1CL0A 2FJEA 1ZMCA 4H2RA 2B9YA 3BI4A 4KPRA 4YSHA 1S3BA 2WETA 2XFPA 5U25A 4JY2A 1D4CA 1JRYA 4LA1A 3SM8A 4A99A 2WHDA 1DJNA 2WOIA 4H2QA 5TR3A 1XDIA 4OPGA 3CPHG 4NTEA 1GTHA 4NTCA 5BRTA 1BF3A 3NK1X 1PJ7A 2YLTA 2H89A 2JAEA 1OJ9A 2VRMA 4OPTA 2XFNA 3IC9A 1FEAA 1X31B 1BWCA 3P4SA 3DMEA 1DXLA 4NEWA 3UTGA 3GDNA 5C2TA 1PXAA 1F3PA 2C72A 1Z6LA 4H4ZA 3ISHA 2NPXA 1IUTA 4CY6A 5FS9A 2B9WA 2VRLA 2BCGG 5KOWA 4JNQA 1QO8A 3LB8A 1JEHA 4DNAA 3NG7X 4H4TA 3V3NA 4EMIA 4H4RA 1NG3A 1JOAA 3SQPA 3DH9A 1UKVG 4DSHA 3G5QA 2XDOA 3UOYA 4GUVA 4BJYA 3P9UA 1IUXA 1TYTA 2BS2A 1EL9A 3UOXA 3FBSA 4AT0A 4AP1A 2C67A 1B4VA 3CN8A 5FMHA 3QFBA 2ACZA 5CQFA 4H4QA 2DKHA 3AE4A 3CGDA 3UTEA 3T37A 4EQWA 3ADAB 3NLCA 1VG9A 1Q1RA 1YY5A 4EQXA 1ZKQA 3BHFA 2XVFA 3K7MX 4BURA 2EQ6A 5EBKA 4U8PA 3AYLA 4J36A 1PXBA 3LADA 4OPLA 1N4WA 3NYCA 2V3BA 2XFUA 4K5SA 1LV0A 3B3RA 3CPJG 3LZXA 3QFAA 4RSLA 3UKFA 3AEBA 3D8XA 1RYIA 2V61A 4H4YA 3NRNA 4J56A 3IWAA 2GEWA 1VG0A 2GH5A 1RSGA 1HYUA 2BS3A 2XLTA 4GR1A 2OAMA 3Q6JA 2YR5A 1DJQA 1F8RA 1GERA 1O94A 2C75A 2WEUA 3NK2X 3SGLA 1M64A 3FMWA 1PXCA 3K7TA 1L9CA 2WDVA 4UDPA 3DJGX 3CNDA 2GMHA 1K0JA 2JBVA 3AE1A 3ICSA 2YG4A 1E1LA 1GRAA 3UTFA 4ZCCA 2Z5XA 3BHKA 3P4PA 3IHMA 4XXGA 1EL8A 4YSZA 2ZZ0A 4FDCB 1ZY8A 1KSUA 3KVEA 4ICYA 2GR0A 2GQWA 3DGHA 3RHAA 3QVPA 4TLZA 3V3OA 1XPQA 3GMBA 4IA6A 3O0HA 1IJHA 2BC1A 4O5UA 3NH3X 2GQFA 3BI5A 4Z43A 3AEEA 3NT6A 1Q1WA 3AE9A 2YLRA 1ONFA 3URHA 4A6NB 3AE7A 2YLWA 5HXIA 1E7PA 1N1PA 1LJ1A 2XVJA 4O5QA 3Q9TA 2C76A 2YVFA 2Q6UA 1GPEA 4YTNA 3II4A 3VR9A 1OJCA 3AECA 3ATRA 3CIRA 5EOWA 4EM3A 2BXSA 3ABVA 2WP6A 3DK9A 1F6MA 2BCPA 2GRTA 2WU2A 4NEVA 4BK3A 1IUWA 5IQ1A 3NIXA 5JCNA 2DKIA 2E1MA 4ZN0A 2WPEA 3ZDNA 3AB1A 1CJ3A 5KXJA 1ZOVA 1DNCA 3QSEA 4U2TA 2FJAA 1CHUA 4Z2TA 3H8IA 1E1MA 1BGNA 4BK2A 5DBJA 3UKPA 3NTAA 2Z5YA 1B5QA 3KLJA 4J34A 1KFYA 4J31A 2XLPA 5GSNA 3PVCA 3ALJA 2GMJA 5CKUA 1N4UA 3D1CA 2FBWA 2V60A 4YSYA 3UKAA 3ALLA 4K2XA 2OLOA 2JB1A 3COXA 3ZYXA 3AE6A 1CJCA 2A89A 1L0VA 4B69A 2RGOA 4ADWA 2R46A 1V59A 4A7AA 1FECA 2UZZA 2AQJA 1L9DA 1PBDA 3AE5A 4U8JA 4A79A 4X9MA 4C5OA 1JRXA 1JRZA 4XWZA 1CC6A 1COYA 2YG6A 2VQBA 2BK3A 1F8WA 1FCDA 4YWOA 4CNKA 2IVDA 3C4AA 3FIMB 2YVJA 2W0HA 2XLSA 1PBBA 2BYBA 4H4UA 4H2NA 3NGCX 1NPXA 2PYXA 1QLBA 2WP9A 3CGCA 3DK4A 4CBQA 3OC4A 1H7XA 4HB9A 1FL2A 4JN9A 1CBOA 4M52A 1Y56B 1VRQB 5KOXA 2GR3A 2B76A 3E1TA 4I59A 4PAAA 1PBCA 3GRSA 1LQTA 5EB5A 1LVLA 1K4QA 1LTXR 4P9SA 1ELIA 4CRTA 1MOKA 4OPUA 4B68A 1F8SA 2QCUA 3DGZA 4MJWA 3UOVA 3NHOX 1K0IA 3UKLA 1KF6A 3H8LA 4NTDA 1IUVA 3DJDA 2BABA 2YVGA 3RNMA 4N9XA 4TM1A 3P1WA 1KNRA 4YXDA 1K0LA 2R0GA 5C3JA 3LOVA 2YLXA 3LXDA 3NYFA 4Z2RA 2TMDA 4APNA 4H4XA 2YG7A 1O95A 3UKKA 3ICTA 1D5TA 1L9EA 1NHQA 2I0ZA 1TDEA 2ARDA 2XYOA 3AE8A 1DOEA 1GALA 2X8HA 3CGBA 5JCLA 3FPZA 1B8SA 4B67A 1ZK7A 3CGEA 3KA7A 2Q7VA 2APGA 2GAHB 3AD9B 2CFYA 2YG5A 3ITJA 3EANA 4Z2UA 3HZLA 3CNJA 3H4KA 2XVHA 4CCQA 2PHHA 3S5WA 1XANA 1KSSA 1GSNA 3AEFA 2GB0A 3RP6A 2OA1A 2CDUA 2B7RA 3VQRA 1JNZA 4PABA 4BV6A 3AEDA 3I3LA 5HHFA 1TDFA 2XFQA 3KPFA 2BA9A 1P2EA 2WPFA 2ZBWA 3KU9A 3P4QA 4B65A 2ZZBA 2AAQA 4U8NA 3UKHA 4EIQA 1OJTA 4OPIA 1JU2A 1MXTA 1PS9A 4EQSA 4GDEA 4GDPA 4AP3A 3G5RA 4WCTA 4Y4NA 1GRGA 4JQ9A 4X4JA 4USRA 4USQA 1NENA 2XVIA 2X99A 4K5RA 1KDGA 2X8GA 2CVJA 2EQ9A 3UOZA 2GR1A 3F8RA 2B7SA 1D7LA 2C64A 2GV8A 1BZLA 1S2YA 2BS4A 4AT2A 2Q0KA 2E4GA 5U1OA 4EQRA 1CF3A 1CC2A 1OJDA 3RP7A 1DOCA 2IVEA 1GNDA 1GREA 2X50A 5LV9A 1ZOYA 1BGJA 4C3XA 2NVKX 5KWFA 1E1NA 2WS3A 5GRTA 3K30A 3M0OA 1NHSA 1M6IA 2WDRA 3S61A 4DSGA 2V6OA 4GF7A 4IVMB 1GOSA 1NAAA 3UKQA 3LJPA 3I6DA 1CJ2A 3CNTA 4OVIA 5M0ZA 3AEGA 1GV4A 1O5WA 2EQ7A 1FEBA 2FJBA 2H88A 3GDPA 2YG3A 4U2SA 3AD8B 1DOBA 1GRHA 3GSIA 3IF9A 1TDKA 4K7ZA 1GRBA 2JB3A 1DODA 3AD7B 3C96A 5L46A 5FS8A 1Y0PA 4YSXA 4D04A 4J2WA 4U8LA 2YAUA 1Q9IA 3NTDA 4CY8A 1VQWA 3PO7A 4IVOB 4B63A 1PBEA 3BNMA 4ZCDA 5IPYA 5M10A 2A87A 3AE3A 3GYJA 2WDQA 5HYMA 2R45A 2R0CA 3F8PA 4UDQA 1JNRA 1YQZA 3NK0X 3QJ4A 1PBFA 3P4RA 2OALA 2RABA 2XVEA 3KKJA 3QSMA 2IIDA 1H81A 4B66A 1H82A 2C66A 4A9WA 4EMWA 3GWDA 4Z44A 1PJ6A 3NN0X 4NZHA 1FOHA 1H86A 4TLXA 1EL7A 3ALMA 2EQ8A 4E0VA 5JCMA 3NN6X 4Y4MA 2YQUA 1MO9A 4OCGA 4B64A 2YR4A 3CNPA 3SFDA 1EL5A 3GRTA 3M13A 3GD3A 4J33A 2Y6QA 1D7YA 4TM4A 3AE2A 1CC4A 4OPDA 1PJ5A 4BJZA 3WE0A 4Y4LA 3IHGA 2V3AA 5FS6A 2RGJA 3BI2A 2J3NA 1S2QA 3LZWA 2GVCA 1ZP0A 2YLZA 2CULA 2XFOA 3KD9A 1YQ4A 2VQ7A 4H4SA 4I58A 4Z26A 5JCKA 4C77A 4EM4A 3CNSA 3QVRA 5ER0A 4C74A 2GAGB 3ATQA 4OPCA 4H4VA 4FK1A 3RP8A 2JB2A 4H2PA 2WOWA 3AWIA 3NYEA 3VRAA 4REKA 2B9XA 4KX6A 4UDRA 3DA1A 2F5ZA 2YWLA 1GRFA 4J57A 4GRTA 1ZDLA 5U63A 4JY3A 4A65A 4LU6A 5IQ4A 1CJ4A 3UP4A 1B37A 2O9ZA 4ECHA 3AEAA 5BVAA 1LPFA 4FX9A 3REDA 3UCLA 1H83A 1H6VA 2VOUA 3JSKA 4H4WA 3DJEA 4LIIA 1TDNA 5KVIA 3DK8A 1VDCA 1BKWA 1IUUA 1KNPA 3UP5A 2C65A 5KRQA 3K7QX 2C7GA 2OLNA 2BC0A 3AXBA 3OZ2A 2A8XA 1YQ3A 3G5SA 3L1RA 1GRTA 1RP0A 4A6NA 4H4PA 4C3YA 1NHPA 1PN0A 2WQYA 2YR6A 5BULA 2FJDA 2V5ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EL8A 3CRTA 1S3CA 1XWBA 2DJ1A 2P31A 3FK8A 1XWGA 5HFIA 2ES7A 2B5XA 5DALB 1TYPA 2G0FA 3DEXA 1XHCA 1ZX9A 3RBTA 2RM6A 3B6DA 3IHQA 5GSSA 1M0UA 4HJMA 1YKJA 1G6YA 1N4VA 2AR8A 3KPKA 1NSWA 3VI7A 3TKRA 1D4DA 1NW2A 4HI7A 2L59A 2V41A 4Z24A 4RUVA 1IUSA 2CVDA 2HRAA 1G7EA 3EC3A 5B6NA 2XLRA 1MDJA 2A4VA 4LLRA 4XWRA 4NWZA 3FKFA 4CCRA 3EINA 1NDAA 2JKCA 2WOVA 4WF5A 4F2IA 4U2LA 5CNWA 1XIYA 4N0ZA 1NG4A 1YKAA 4K22A 3LJRA 3R9UA 1N8JA 2VL2A 3GYIA 4J56E 3CTYA 2MBSA 2Q0LA 2OACA 4MH2A 4H7UA 4LMVA 4OD7A 1MD3A 2YV9A 3ICRA 1FHEA 2CVKA 4CDOA 5J7XA 3F8DA 4U8MA 1IYHA 2C3CA 3M0FA 3KM6A 1P2HA 2Y6RA 2X3NA 4TW5A 2CAIA 3FYGA 2REMA 2I3YA 2ZZCA 1S3EA 3VURA 2HE3A 1TXXA 1HQOA 3CTFA 2WBAA 5DQYA 2G2QA 1ON4A 3PPUA 1OJAA 4RG4A 3PS9A 1O6JA 2C0EA 3L8KA 2YPMA 1ERWA 5LNKe 3DIEA 1SKWB 3EYTA 2J9HA 4HDEA 4TKYA 1SU9A 1GWCA 4JR6A 1TTZA 4GQCA 4YTPA 1K0CA 1GESA 2XLUA 2IFQB 1EP8A 5KVHA 2FJEA 3OR5A 4NMUA 4YSHA 1U88A 1O8XA 1UC7A 4KPRA 4ECJA 3IOSA 2XBIA 1JRYA 4A99A 2XBQA 3ERGA 3ZTLA 4F0BA 4H2QA 3C1SA 1XDIA 1VF2A 5B8AA 2HSMA 5BRTA 3NK1X 3W6GA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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