2R0PA

K252c-soaked rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
529
structure length
512
Chain Sequence
MNAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords RebC
total genus 161
structure length 512
sequence length 529
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0pA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0pA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0pA01
1KSUA 2CFYA 1E7PA 3CNSA 3EPTA 1Y0PA 2XLTA 2X3NA 1S3BA 3AEAA 3NTAA 3UKFA 3LJPA 2BK5A 3AWIA 1D4DA 1MOKA 3R9UA 3AB1A 1PBDA 1EL7A 1N4VA 4Z43A 1VG9A 4USRA 4C74A 3NKSA 1VDCA 2WS3A 1GNDA 3NT6A 2Z5XA 3URHA 3AEDA 1N4WA 3AD9B 4BK1A 1JRYA 2WU5A 4YTMA 2VZ2A 3QJ4A 1LQUA 1F6MA 4AP3A 2FJDA 1D7YA 2GQFA 2H89A 2JB3A 4YWOA 4H2RA 2PYXA 4H4UA 4YTPA 2XFQA 1BZLA 2GH5A 2TMDA 3JSKA 2X99A 2YG5A 2V60A 4FX9A 3PVCA 1LV0A 1LJ1A 2EQ7A 2YG4A 4OPUA 3AE9A 1BGNA 1SEZA 4OPDA 3L1RA 4AOXA 2BK3A 1FCDA 2YR6A 1KNRA 2CVJA 2Q7VA 3NG7X 1DOEA 5GSNA 3KKJA 1BWCA 1GALA 4O5UA 3H4KA 3AD8B 4AT0A 2XVEA 3UTGA 4BK2A 3FBSA 4OCGA 1TDNA 2BK4A 3DA1A 2CDUA 5GRTA 3UKAA 4EQSA 3AYIA 4U8OA 1NENA 3KVEA 2EQ6A 1S2QA 1D4CA 1TDKA 2XLRA 1NG4A 4GCMA 3KLJA 5C3JA 1PN0A 1PXAA 2AR8A 3AYJA 3CNJA 5L46A 4H2PA 3ALJA 1GETA 4RG4A 4WCTA 4H7UA 4X9MA 5HY5A 5IPYA 1S2YA 3FIMB 3UKHA 5TR3A 2C73A 4A5LA 4CNJA 4ZCCA 2BYBA 4YT0A 1CJ3A 1F3PA 4U8KA 4U2SA 2VQ7A 1TYPA 2Y6RA 3VRDB 2FJEA 1PS9A 5U25A 4KX6A 4A6NB 4A9WA 4B67A 4Z2UA 1KDGA 1O95A 2AAQA 3G5RA 1ZDLA 3IWAA 3P4RA 4U8NA 4YSHA 4E0VA 2V61A 4NTCA 4CNKA 3BHFA 3F8RA 3T37A 5JCIA 3DK8A 1GTHA 1MO9A 2BS2A 1XANA 2YG6A 2YLZA 3GRTA 3UTFA 1P2HA 3NYFA 1YY5A 2YQUA 1M6IA 4TM4A 2RGJA 4K8DA 5C2TA 2V3BA 4JY3A 3GDPA 1E1NA 2APGA 1OJ9A 1D5TA 5FS9A 4A79A 2B9XA 3ICTA 3LZXA 5M10A 1XDIA 2VVLG 1PXBA 1VG0A 5J60A 1RYIA 5EOWA 2GAHB 2XFNA 3H8LA 4J36A 2QA2A 1PBEA 2R46A 1H84A 1CJ2A 1NG3A 2R0PA 3ISHA 4CY8A 4D03A 2E4GA 5KVIA 1E6EA 2R0GA 2GR0A 2OAMA 3AEFA 3ICSA 3NK0X 3KPFA 5BRTA 1F8WA 2YLTA 2XLUA 5M0ZA 1N4UA 2RGOA 1JNRA 4YKGA 1NAAA 3GMBA 3NNEA 2FJBA 2V3AA 2WPEA 3NRNA 3O0HA 1CC4A 1CJCA 2OLOA 1XHCA 2B7RA 4YSZA 2Q0LA 1PXCA 4GR1A 1FL2A 2F5ZA 1GOSA 1JNZA 1H7WA 1ZY8A 1HYUA 4U8LA 2XFOA 3M12A 4X9NA 4B69A 4C5OA 1H83A 1JRZA 1CJ4A 2YVFA 1N1PA 5KOXA 1ZMDA 3VQRA 2R4JA 5BUKA 2WOWA 1K0IA 3AD7B 2W0HA 4IVMB 4J56A 4EQRA 1E1MA 3F8PA 4IA5A 1TDEA 1ZP0A 4EIPA 3Q6JA 3B6DA 4U8IA 1Y56A 2XLSA 3AE4A 3ITJA 3ZDNA 4DSGA 3VRAA 1VRQB 1B8SA 2YLRA 3BI5A 3H8IA 3GMCA 1REOA 2VOUA 3C4AA 4J57A 2YLSA 2YVGA 2TPRA 2WESA 3RP8A 1FEBA 2JB2A 1UKVG 1E1LA 4U8PA 5KXJA 3AEBA 3NH3X 5U1OA 2BXSA 3CGCA 4OPIA 3IC9A 4EIQA 2GB0A 3Q9TA 4EQWA 3IHMA 5FS6A 4ICYA 3BNUA 3ATRA 2R4EA 3GDNA 4EMIA 2CULA 2FJAA 3NYCA 1H81A 3UKLA 2JBVA 1D4EA 2DKHA 2BXRA 4U8MA 3SFDA 3RP6A 1JEHA 1RP0A 1ZX9A 4H4PA 4TM0A 4TLZA 2YAUA 3AEEA 4UP3A 1B37A 2C66A 1LPFA 1JU2A 2GMJA 3DGZA 2A87A 1LVLA 2JAEA 1GREA 4APNA 3AE6A 4NZHA 4OPLA 2WP6A 5CKUA 3QSSA 5U63A 1NHRA 4XWZA 2YWLA 1L9DA 3UOXA 1P2EA 4Y4LA 2BS4A 1K0LA 1TDOA 3IHGA 1ZMCA 2IVEA 3LOVA 5KWFA 2BA9A 3RHAA 3NK1X 4GRTA 3REDA 3VR9A 2NPXA 2FBWA 3GSIA 3V3OA 1OJDA 1PJ6A 3CGDA 3CN8A 1DJQA 2C72A 1COYA 3FPZA 1KF6A 3DJJA 3QFBA 1YQ4A 4H2QA 1E1KA 1KNPA 4NEVA 4K5RA 2OALA 4IA6A 4ECHA 3KD9A 3UKKA 3ALLA 2I0ZA 1TDFA 2JKCA 2ARDA 3C96A 4I59A 4J2WA 1B5QA 2J3NA 4NEWA 4GDEA 2GQWA 3LZWA 4OPGA 1E39A 2XVJA 4FK1C 4C3YA 2C7GA 4YKFA 3QSMA 1IUVA 1CL0A 3IF9A 3P4PA 4GUVA 3DK9A 1Q1RA 4H4RA 2YG3A 1AOGA 3P1WA 2UZZA 1L9CA 2B9YA 1XPQA 2QCUA 3CTYA 4X4JA 4OVIA 4LIIA 3EF6A 2QAEA 4LU6A 1VQWA 4BJYA 1QJDA 2WQYA 4I58A 5KVHA 1YQ3A 4J31A 4WX1A 2YM1A 4NTEA 3AECA 1BF3A 2YLWA 4CY6A 2X8HA 2XCGA 3UP4A 3VRBA 2GEWA 3NHOX 4J33A 3QVPA 3NGCX 2IVDA 2V5ZA 2Z5YA 4NTDA 3S61A 3GYJA 4DSHA 3K7MX 3SM8A 3NN0X 4CRTA 2RGHA 3GD4A 2YR4A 3P4SA 5EBKA 3AXBA 2WDQA 3BI2A 4H50A 2Y6QA 1IUWA 4LA1A 4GDPA 4OPCA 2WOIA 1GRHA 2WOVA 1NHPA 4IV9A 3ZYXA 3LXDA 4MJWA 2C3DA 1H7XA 2NVKX 3NTDA 3UKQA 1K4QA 3UOYA 1PJ5A 3V3NA 4B1BA 4H4XA 1JOAA 4H2NA 1GRTA 4TM1A 2H88A 2VVLA 1M64A 2BABA 2IIDA 1NHQA 3CGEA 1GEUA 5HHFA 3D8XA 4RSLA 1PDHA 1S3EA 2WP5A 4Z2TA 2ZZ0A 5IQ1A 3B3RA 4XXGA 4CCRA 4BJZA 3WE0A 1DNCA 3ADAB 4ZN0A 2WPFA 2B76A 2GV8A 1GXFA 4AP1A 3S5WA 1TYTA 5DBJA 2B7SA 2WEUA 1W4XA 3KU9A 3FG2P 1ONFA 2ACZA 2BCPA 3P4QA 3QFAA 1FOHA 4U8JA 3SGLA 1DXLA 3EANA 1IJHA 4PABA 2C76A 3AE2A 5CQFA 5KRQA 1GRGA 3SQPA 1PBFA 3NLCA 4C3XA 2YM2A 3CNDA 2YVJA 4PAAA 4DGKA 1GRBA 3CNTA 4Z2RA 2R45A 2AQJA 1GPEA 3AEGA 3GYIA 2XYOA 4TM3A 3VR8A 1EL5A 1OJTA 4C77A 4UDPA 2C70A 3NIXA 4M52A 1L0VA 2A8XA 2B9WA 3C4NA 4EQXA 1ZOYA 2WDVA 3L8KA 1KFYA 3DGHA 1NPXA 3ABVA 4K2XA 4YSXA 4H4ZA 2BC0A 3CIRA 3K7QX 2GF3A 5JCKA 2C3CA 1ZK7A 3SFEA 4HA6A 2GR1A 2JB1A 3NYEA 3LADA 4Y4NA 1GSNA 2ZZCA 3LB8A 4BK3A 3PS9A 2V6OA 1GV4A 2VVMA 3FMWA 1OJCA 2C67A 1ELIA 3CPIG 4P9SA 3UCLA 4H4QA 4AT2A 5KOWA 3P9UA 4IVOB 2YG7A 2WETA 1IUSA 4JN9A 2C65A 4B65A 2VRMA 4DNAA 2BS3A 3BI4A 4JDRA 3DJEA 1EL9A 2YR5A 4Z24A 2XVIA 3RP7A 4BV6A 2X8GA 1NHSA 2WDRA 4JNQA 2EQ8A 2GR2A 4K5SA 3GWFA 2E5VA 1B4VA 4OPTA 3CNPA 4J34A 5JCMA 3QSEA 4N9XA 1YQZA 2Q6UA 2O9ZA 4YXDA 4A6NA 2WHDA 2RABA 3RNMA 4B64A 4B68A 1KSSA 5FS7A 4BURA 2BCGG 2BACA 4REKA 4Z26A 1L9EA 2C75A 1ZKQA 5J7XA 3DJDA 3HZLA 2EQ9A 3ALMA 5BULA 2XDOA 4B63A 4Z25A 5HXIA 1CC6A 1Q1WA 4Z44A 1QO8A 3DMEA 3GD3A 4A7AA 2ZBWA 2VRLA 1PJ7A 1NEKA 3EAOA 5FMHA 2GVCA 4EM3A 1PBBA 5EB5A 1LTXR 1Z6LA 3UOVA 1MXTA 3AE5A 4O5QA 3D1CA 4B66A 4EMWA 3UOZA 2BC1A 2YLXA 5ER0A 2WP9A 1D7LA 4ZCDA 1K0JA 3GWDA 1Q9IA 5BVAA 1DOBA 2Q0KA 1PBCA 1GT8A 3BNMA 4HB9A 3G5SA 3ICRA 1GRFA 4JNAA 1X31B 1F8RA 4K7ZA 3AE7A 1FECA 5JCLA 4U2TA 2WPCA 3NN6X 1Y56B 2PHHA 3AE8A 3UTEA 3F8DA 1V59A 3KA7A 4FK1A 3DK4A 1YKJA 3M0OA 1H86A 2XFPA 3NK2X 3V76A 3AYLA 4UDQA 3QVRA 2XVFA 4RG3A 3CPHG 4H4TA 4YSYA 1CC2A 3PO7A 3UKPA 4A99A 4XWRA 4KPRA 2X50A 1BKWA 2HQMA 4TLXA 3M13A 1IUTA 1GTEA 4H4WA 3I6DA 3I3LA 1JRXA 5EB4A 4YTNA 2R9ZA 4A65A 4K22A 1IUXA 1EBDA 1RSGA 1CBOA 1GRAA 5IQ4A 3AE3A 2XLPA 2R0CA 2A89A 2GRTA 3BHKA 2DKIA 1QLBA 4FDCB 4JQ9A 4U2LA 4UDRA 4EMJA 2QA1A 4CBQA 3GRSA 2GMHA 2WU2A 2VQBA 3K30A 1H82A 5JCNA 3CGBA 4USQA 3DJGX 3II4A 1FEAA 1DODA 1DJNA 1O94A 4AOSA 2E1MA 4H4SA 1GERA 4GF7A 2GAGB 1GESA 2WBAA 5FS8A 2OLNA 3ATQA 3OZ2A 1F8SA 1IUUA 3CPJG 3COXA 4D04A 3G5QA 4H4YA 3UTHA 1PHHA 5HYMA 1CF3A 1CHUA 3UP5A 3E1TA 4JY2A 3DH9A 1DOCA 2XVHA 2OA1A 1EL8A 1ZOVA 4H4VA 1OJAA 2X8CA 3K7TA 1NDAA 4EM4A 3OC4A 2C64A 1TRBA 1H6VA 2XFUA 2ZZBA 4CCQA 4Y4MA 4ADWA 5LV9A 1LQTA 1BGJA 2JK6A 1O5WA 2GR3A 3AE1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KSUA 2CFYA 3KTBA 2CAIA 4RI7A 1FO5A 5COHA 1PQNA 4DSSB 1QMVA 2PMTA 3EURA 4DSQA 3AWIA 2V1MA 3AB1A 1PBDA 1ZMAA 3UARA 1VG9A 4Z43A 4PQ1A 3TCOA 2E4AA 1M9BA 3NKSA 1VDCA 2K18A 2WS3A 3AEDA 4BK1A 3AD9B 1BJXA 4ZL8A 3HA9A 4F82A 3QJ4A 5IQYA 5B7CA 2VCXA 5HFIA 2LKUA 4MJCA 3WGDA 1D7YA 2FJDA 4G0KA 2H89A 2JB3A 3TRPA 3T14A 1BZLA 3KJYA 2JU5A 5CAXA 4IJIA 2H6XA 3UOMA 1SEZA 3L1RA 4AOXA 1G6WA 3GA4A 5KMRA 5GSNA 2OACA 4O5UA 1Z5YE 3H79A 4YJGA 4OCGA 1TRWA 3ERGA 3AYIA 1AXDA 3DRNA 4EVMA 1TDKA 2A4VA 1FHEA 2P0GA 2GZPA 2PWJA 2DJJA 5IOXA 2J9HA 2H19A 1AQXA 2CX4A 3ALJA 2FWFA 4X9MA 4WCTA 1GETA 3FIMB 2OJLA 1I9DA 2HRKA 4O5RA 4A5LA 4CNJA 4ECBA 4U8KA 2H30A 1R5PA 4OCEA 3ZVJA 2VQ7A 4KCEA 4MPGA 2CX3A 1PS9A 3A2XA 2VL2A 4Z2UA 2AAQA 3GMFA 1QK8A 2D2ZA 3KZQA 4NTCA 5G31A 1OVNA 1E2YA 2GT6A 5J5NA 1GTUA 1GTHA 2BS2A 2B5YA 3GRTA 1X5EA 3NYFA 4TN8A 3DKSA 4ZIJA 2RGJA 5C2TA 4YQMA 2APGA 5G1KA 2B9XA 2JZTA 4GQCA 2GTUA 1VG0A 2C3TA 4WR5A 4FIWA 2DLXA 2IPAA 2QA2A 3PPUA 1WRYA 3RPNA 3SX6A 1NG3A 1TU8A 4JEDA 1H84A 4D03A 5KVIA 1X5DA 1WWJA 2H66A 1K0OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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