2R0PA

K252c-soaked rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
529
structure length
512
Chain Sequence
MNAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords RebC
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 161
structure length 512
sequence length 529
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0pA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0pA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0pA01
2YG6A 1JRYA 5TR3A 2EQ7A 3CPJG 3M0OA 3AE6A 1PN0A 4Y4LA 1IUWA 1ONFA 3DJGX 3DK9A 2WETA 3QFBA 2XLPA 3GMCA 2C65A 2OA1A 4XWRA 1S2QA 3UTEA 1PBEA 4BV6A 4Z25A 1YQZA 3LZXA 4TM3A 3ATQA 3GRTA 4TLXA 4UP3A 3V76A 1JOAA 1E39A 3D1CA 3K30A 4C3YA 2C73A 4HB9A 4B1BA 3AE2A 1BWCA 1PHHA 3NGCX 4GR1A 4H4VA 4U8KA 5IQ4A 1PJ5A 3IF9A 1S3EA 1UKVG 2GR2A 2WPEA 3IHMA 4FK1C 4TLZA 3REDA 1B4VA 4I58A 3D8XA 1GRGA 1Y56A 3NG7X 3B3RA 3FIMB 3S5WA 3L1RA 4FK1A 3PO7A 4MJWA 4CCRA 2OLNA 3V3OA 1FEAA 3AEDA 1E1NA 4D04A 1KDGA 2BABA 2WU5A 2ZZ0A 1VQWA 4U8MA 3O0HA 1CC2A 5KOXA 5EB4A 4IA6A 4BJYA 2Y6QA 4U8JA 4J33A 1DOBA 1GRAA 4YSXA 3FBSA 4CCQA 3ABVA 1EL9A 5LV9A 3II4A 2YG3A 4CY8A 1S3BA 3GD4A 3I3LA 3RHAA 4Z44A 3VR9A 4B66A 1XDIA 3CNTA 3AD9B 1OJCA 1KFYA 3KA7A 4UDPA 1GXFA 3UOXA 3H8IA 4JNAA 3JSKA 2IVDA 1P2HA 1PBFA 2YQUA 3PVCA 4X9MA 3FPZA 4JQ9A 2FJBA 1DOEA 1NHPA 4EMIA 5C3JA 3CNSA 1F3PA 3CIRA 1KSSA 1F8SA 1COYA 4EM3A 2BCPA 3AE3A 2B7SA 2WOWA 2GQFA 2V5ZA 4H4QA 2WU2A 1D5TA 3NH3X 1H83A 1OJAA 3BI5A 2QCUA 2XLTA 1ZMCA 4U8OA 4B67A 4AOSA 3EPTA 4YKFA 4H4YA 2E1MA 4B65A 1NENA 2E5VA 2V61A 2WBAA 5C2TA 3QFAA 4IV9A 4GCMA 3S61A 4CBQA 2Y6RA 2BS3A 3CTYA 2OLOA 2XVIA 5M10A 2EQ9A 4BJZA 2UZZA 3GDNA 3ADAB 2V3AA 3SGLA 1GNDA 2WDQA 3UOZA 4CNJA 2VRMA 3CNDA 4U8NA 3GDPA 2X8CA 3AWIA 4I59A 3DGZA 4B68A 4LIIA 2FBWA 1M64A 2GAGB 3KU9A 4YKGA 3PS9A 4K7ZA 1PDHA 3FG2P 2YWLA 1VDCA 3OC4A 3QSSA 2JB2A 1QO8A 3ALMA 3C4NA 3AXBA 5HHFA 3UKFA 4REKA 2HQMA 1DNCA 3CGCA 2GRTA 2QAEA 3SQPA 1ZP0A 3DJJA 1S2YA 3ICRA 1MOKA 3NLCA 4J36A 3CNPA 2YLWA 1CJ4A 2BK4A 4JN9A 5FS7A 4U2LA 3VRBA 3ATRA 3CPIG 3GSIA 3KVEA 3Q9TA 4IVOB 4E0VA 4YXDA 2J3NA 3RP6A 2QA2A 3NRNA 1D7LA 1EL5A 1TRBA 2B76A 1OJDA 2JK6A 3T37A 2DKHA 2BACA 2BS2A 3AE9A 4H4ZA 4USQA 4GRTA 1V59A 3DH9A 4OPCA 4NZHA 3NIXA 2AR8A 3NYEA 2R4EA 2YLRA 3AE5A 2C70A 4TM1A 4JY3A 3AE7A 2X3NA 4DSHA 1N1PA 2C72A 2CDUA 3AYIA 3ZYXA 5JCIA 4K5SA 2GMHA 5EB5A 2C76A 3F8RA 4FX9A 2A8XA 4H4WA 1ZY8A 2VVLG 1TDKA 4LA1A 2CFYA 2R9ZA 2XDOA 3B6DA 3AEEA 2YAUA 1HYUA 2YLTA 3GMBA 3DJEA 3ALLA 3NT6A 3AEFA 2YVGA 5U25A 1DOCA 3LB8A 1TDFA 2CVJA 5FMHA 1N4VA 4H4RA 1OJTA 4RSLA 4RG4A 2WEUA 4H2PA 3RNMA 1X31B 2FJDA 3CN8A 2B9YA 3FMWA 2XLRA 4BK3A 4H2RA 1ZX9A 3NK0X 2XLSA 2WP6A 1L9CA 3AEGA 4U8IA 3UKAA 3EF6A 2W0HA 4A5LA 2GR0A 3P1WA 4H4UA 4XWZA 3AE1A 2VRLA 5DBJA 4APNA 2JKCA 4UDQA 1BKWA 1REOA 1Z6LA 4C5OA 1LPFA 4Z24A 5BULA 2GF3A 4USRA 1H82A 3CGEA 2Z5YA 2OAMA 1PXBA 2XVEA 1P2EA 4K8DA 2IVEA 4CY6A 2R0CA 3K7TA 4WCTA 1GRHA 3LJPA 4DGKA 3QSMA 5JCNA 3AE8A 2F5ZA 2XCGA 3H4KA 1BGNA 3UKLA 1TYPA 4O5QA 3UKHA 1GERA 2XVJA 1IUXA 1E1KA 1LQTA 2BYBA 3F8PA 4X9NA 4H2QA 3UTGA 1GOSA 1LV0A 1QLBA 4YTNA 3DK4A 3AE4A 5FS6A 2WDRA 1MXTA 3AD7B 1L9EA 4EIQA 2QA1A 2XFPA 1IJHA 3HZLA 4EQWA 1E7PA 1PBCA 3QSEA 4U8PA 1TDNA 2TMDA 4TM4A 5CKUA 1K4QA 2RGOA 3UKQA 4YTMA 3I6DA 2C3CA 4A99A 1Y56B 1RP0A 1E1MA 2V6OA 2XFUA 3UTHA 3LADA 1EBDA 5BVAA 4LU6A 1GV4A 1B5QA 3G5QA 2GR3A 1D7YA 2YM1A 4J2WA 1SEZA 3AD8B 1JNZA 2BC1A 2I0ZA 1K0LA 4ZCDA 4C74A 4NEVA 2BXRA 2GMJA 4GF7A 3CGDA 4H7UA 5JCKA 4U2TA 3M12A 1IUSA 4AOXA 1E1LA 4M52A 1CF3A 2WQYA 2C3DA 2C7GA 1IUVA 3UP4A 2B7RA 2WESA 3UTFA 4B64A 2VQ7A 2C67A 1ZOVA 1DJQA 2XFNA 2X8GA 3SFEA 2H89A 1PJ7A 2YVJA 4GDEA 4A6NA 3COXA 2YM2A 1O94A 2JAEA 2X8HA 3BHFA 3ISHA 1XHCA 4KPRA 3Q6JA 4H4SA 3AYJA 2PHHA 1JU2A 3G5SA 4BURA 3VRAA 4H4XA 2VZ2A 3IHGA 1IUUA 2VVLA 3NK2X 3QJ4A 4AP1A 4YSYA 4H2NA 2GVCA 5KXJA 4X4JA 4P9SA 2WPFA 5FS8A 4EMWA 4Z2TA 4YSZA 5HYMA 2YG5A 4OPGA 1B8SA 3C4AA 3NHOX 1GETA 2B9WA 3GWDA 5IQ1A 4IA5A 3GYIA 1XANA 1DJNA 1EL7A 1KSUA 2XFQA 1H86A 4UDRA 3URHA 5KOWA 1CHUA 2EQ6A 2GAHB 1VG9A 5ER0A 1LQUA 1PJ6A 2YR5A 2WS3A 3DGHA 4GDPA 4K5RA 2EQ8A 2WOIA 5U1OA 3NNEA 1GESA 2XLUA 4Z2RA 4B69A 3K7MX 3H8LA 4ECHA 2APGA 1DXLA 3DMEA 3UOYA 1CJCA 3BNUA 1ZOYA 5HY5A 1JNRA 5BRTA 4JY2A 5L46A 1GPEA 2XFOA 1NEKA 2YG7A 3VQRA 3UP5A 4A79A 1FL2A 2XVHA 1FEBA 1K0IA 2GQWA 1TDEA 4OCGA 5JCLA 4BK1A 1Q1WA 2RGJA 2C66A 1PXCA 3UKPA 3VR8A 4B63A 4ADWA 2BXSA 1LTXR 2YR6A 3NYFA 2R45A 1KNRA 4D03A 2YG4A 2WPCA 3DA1A 4YWOA 4C77A 3KD9A 1JEHA 1JRXA 4NTDA 1CL0A 2Q7VA 2YLXA 4ZCCA 2X50A 4U8LA 4EQRA 3DJDA 1FECA 2VVMA 3NN6X 3KKJA 4H50A 2FJEA 1QJDA 1Q1RA 4O5UA 3GYJA 1NG4A 1NPXA 1OJ9A 3SM8A 5IPYA 2YLZA 2O9ZA 3P4RA 4IVMB 2RABA 3L8KA 1KNPA 3NK1X 2V3BA 1H81A 1ZDLA 3UKKA 5EOWA 1DODA 2AQJA 3M13A 3E1TA 4EM4A 1BGJA 3GRSA 3GWFA 3LOVA 5GRTA 4H4PA 4H4TA 1GSNA 2ZZCA 1W4XA 1NHQA 4CNKA 3P4PA 1PBBA 4NEWA 3R9UA 3C96A 1ELIA 4TM0A 3BHKA 5KVIA 2ACZA 2R4JA 4JDRA 1F6MA 2VOUA 2X99A 3IWAA 3UCLA 2OALA 2YR4A 1FCDA 4ICYA 4J31A 4CRTA 2H88A 3CNJA 3RP8A 4J57A 1N4WA 4ZN0A 4WX1A 5KVHA 1MO9A 3F8DA 1GRBA 2FJAA 2Z5XA 1Q9IA 2WHDA 3AEBA 4K22A 2R0GA 1F8WA 1JRZA 1CJ3A 1K0JA 3AEAA 1BF3A 1H6VA 5GSNA 5EBKA 1GRTA 4A65A 1E6EA 4AT0A 1FOHA 2BA9A 2IIDA 3K7QX 4AP3A 1VRQB 3P4QA 4PABA 4Y4MA 1NAAA 3NTDA 2Q6UA 2JB3A 2GEWA 2YVFA 1RYIA 3AECA 4JNQA 5KRQA 1H84A 1ZKQA 3UOVA 4DNAA 3KPFA 4RG3A 4J34A 5HXIA 4OVIA 3ALJA 1KF6A 3G5RA 2XYOA 1NG3A 3ICSA 5U63A 4EIPA 3SFDA 1BZLA 2A89A 4OPIA 1GTHA 3RP7A 1O5WA 2A87A 1GTEA 2GB0A 1YQ4A 4U2SA 4HA6A 1AOGA 1IUTA 3DK8A 2BCGG 3AB1A 1GT8A 4KX6A 4YT0A 2BK5A 2ZBWA 4GUVA 4DSGA 3P9UA 1GREA 1TDOA 1N4UA 4Z26A 1LVLA 1ZMDA 2GR1A 2WP9A 2TPRA 2XVFA 4AT2A 2WOVA 3BI2A 2Q0KA 4OPTA 5J60A 1GALA 3NTAA 3OZ2A 2NVKX 2YLSA 1YKJA 1CC4A 4YSHA 1CC6A 3EAOA 1M6IA 3BI4A 1D4DA 3NKSA 4OPUA 2ARDA 5FS9A 1LJ1A 2BK3A 1PS9A 1CBOA 4FDCB 1L9DA 3P4SA 4J56A 4C3XA 1B37A 1NHSA 2BS4A 2GH5A 3BNMA 4N9XA 1XPQA 1NHRA 4EQXA 2R46A 2E4GA 2DKIA 4A6NB 4BK2A 3EANA 2Q0LA 3NN0X 1F8RA 4A7AA 3LZWA 3IC9A 1D4EA 2R0PA 1YY5A 1NDAA 2CULA 2WDVA 2JBVA 4OPLA 3VRDB 5J7XA 1GRFA 4NTEA 4NTCA 1EL8A 1ZK7A 2V60A 4XXGA 4YTPA 3ZDNA 5KWFA 2BC0A 3CGBA 3QVPA 3GD3A 5BUKA 3ITJA 2VQBA 4EMJA 1CJ2A 1D4CA 3QVRA 2AAQA 1H7XA 4A9WA 4OPDA 2B9XA 1PBDA 1Y0PA 1YQ3A 4Z43A 4PAAA 2C64A 1PXAA 1L0VA 1TYTA 5JCMA 1O95A 3NYCA 2GV8A 3LXDA 4Z2UA 3WE0A 3ICTA 1RSGA 2NPXA 2RGHA 2ZZBA 4K2XA 1H7WA 2JB1A 1GEUA 2PYXA 3KLJA 3CPHG 5CQFA 1VG0A 4EQSA 3AYLA 3V3NA 2WP5A 4Y4NA 5M0ZA 2C75A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YH2A 5TR3A 4HU7A 3M0OA 4ILFA 1PN0A 4I2TA 3TKQA 1ONFA 3DJGX 4EF0A 5ECKB 1ERWA 2HYXA 2C65A 3IR4A 3ZNOA 3G7JA 4BV6A 2HZFA 5EY6A 5GZZB 2LJRA 4TLXA 1WMJA 4C3YA 4B1BA 1C0PA 2DJ1A 1PHHA 1BWCA 3NGCX 3UIWA 4GR1A 1O85A 4U8KA 3TRXA 5JWQB 1A23A 4KH7A 1K0BA 3IHMA 4TKYA 3TJGA 3WGDA 2GR2A 2WPEA 5J9BA 1VE9A 3B3RA 3FIMB 4FK1A 2NVLA 2C8UA 5KN1A 4MJWA 5IMVA 4CCRA 1YEPA 3H8QA 1TXXA 2BABA 2WU5A 4LMVA 1CC2A 5JCGA 4EL1A 4BJYA 5EB4A 2WZ9A 2EC4A 4USSA 1RQMA 1GRAA 2RLIA 3HVNA 3RPPA 3CTGA 3ZVJD 5G5FA 3II4A 1HNAA 1PKZA 4CY8A 3GD4A 3RHAA 3VR9A 4B66A 3F4TA 3AD9B 2LRTA 2HSYA 4RI7A 1X9SB 2VIMA 4TR0A 3ZZXA 3HA9A 3FPZA 2FJBA 2YV9A 1NHPA 3GKNA 1USBA 4EMIA 5C3JA 1T1VA 1PX7A 3UBKA 3GA4A 4G74A 1U3IA 3GX8A 3KGKA 1COYA 3HYPA 2B7SA 6GSSA 4H4QA 1D5TA 4A5PA 1OJAA 2QCUA 2GGTA 3E0UA 4B67A 4AOSA 1XOAA 3EPTA 4YKFA 2GSQA 2E1MA 4MABA 1NENA 2E5VA 2V61A 4KF9A 5C2TA 4ACSA 3S61A 5ECHB 1EVIA 3SYIA 2N5BA 2VL2A 2V3AA 4POBA 2WDQA 5KN3A 3UOZA 3KIJA 2VRMA 3CNDA 2L6CA 4HJMA 3PH9A 2N5FA 2FD3A 4TOPA 3ZIJA 3M9KA 3KU9A 2ON5A 1QGVA 1Q98A 4K7ZA 3SY4A 2YWLA 3HHVA 4NMUA 3QSSA 5DCHA 2WFCA 3C4NA 5HHFA 4REKA 2GZZA 4CDOA 2BTOT 1G6YA 14GSA 3DJJA 2VM1A 3NLCA 4J36A 3CNPA 2YLWA 2BK4A 4JN9A 2AB6A 1XPVA 4YXDA 2IFQA 3FW2A 2QA2A 3W8JA 1GLPA 2JK6A 3T37A 2DKHA 2BACA 3IRAA 4H4ZA 2AUVA 2V41A 1V59A 4OPCA 1SK2A 1YEXA 2YLRA 3TKPA 3C8EA 4TM1A 3ED3A 2VOCA 1X0RA 1VRSD 4K5SA 4OO5A 2RUEA 4FX9A 4ECJA 2VVLG 2GSTA 4HS1A 3QFBC 4K7NA 1HYUA 2DJJA 2YLTA 4AF2A 3ALLA 5JCUA 1FVKA 2LSTA 4TR3A 1OJTA 2VCWA 1A0FA 4H2PA 5ECOB 4KW6A 1R5AA 5LD0A 4KNDA 1ZYQB 5AN1A 4EDYA 1O81A 3GURA 4H2RA 3LORA 4ML6A 4RQXA 2W0HA 1X9WB 3P1WA 4H4UA 4XWZA 3EYTA 2VRLA 2YWOA 2NBSA 1XWGA 2YJHA 1EGOA 1Z6LA 4IP6A 1LPFA 3GN3A 4AJ8A 2GQMA 5BULA 2GF3A 4BVXB 1H82A 1HQOA 2X49A 2P0GA 1GRHA 4DGKA 4ZL7A 4KA0A 3WGXA 2LV3A 2GLRA 3A5WA 1IUXA 5B8BA 2IPAA 3AE4A 5GAND 3SWLA 1C0KA 1GTIA 4YAPA 4EQWA 1F3AA 4U8PA 2H1BA 1K4QA 19GSA 1Y56B 1F9MA 1RP0A 1EWXA 4OWYA 2V6OA 1TU8A 5EL8A 4RQRA 3Q18A 1XWCA 2RM6A 1XWBA 1B5QA 2YM1A 2PWJA 3GL3A 3QCPA 4HI7A 2BC1A 2G2QA 3SX6A 2PVOC 2PGTA 1SENA 4CW9A 1S3CA 3J7Yb 3HKRA 4GF7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4YH2 A;  5TR3 A;  4HU7 A;  3M0O A;  4ILF A;  1PN0 A;  4I2T A;  3TKQ A;  1ONF A;  3DJG X;  4EF0 A;  5ECK B;  1ERW A;  2HYX A;  2C65 A;  3IR4 A;  3ZNO A;  3G7J A;  4BV6 A;  2HZF A;  5EY6 A;  5GZZ B;  2LJR A;  4TLX A;  1WMJ A;  4C3Y A;  4B1B A;  1C0P A;  2DJ1 A;  1PHH A;  1BWC A;  3NGC X;  3UIW A;  4GR1 A;  1O85 A;  4U8K A;  3TRX A;  5JWQ B;  1A23 A;  4KH7 A;  1K0B A;  3IHM A;  4TKY A;  3TJG A;  3WGD A;  2GR2 A;  2WPE A;  5J9B A;  1VE9 A;  3B3R A;  3FIM B;  4FK1 A;  2NVL A;  2C8U A;  5KN1 A;  4MJW A;  5IMV A;  4CCR A;  1YEP A;  3H8Q A;  1TXX A;  2BAB A;  2WU5 A;  4LMV A;  1CC2 A;  5JCG A;  4EL1 A;  4BJY A;  5EB4 A;  2WZ9 A;  2EC4 A;  4USS A;  1RQM A;  1GRA A;  2RLI A;  3HVN A;  3RPP A;  3CTG A;  3ZVJ D;  5G5F A;  3II4 A;  1HNA A;  1PKZ A;  4CY8 A;  3GD4 A;  3RHA A;  3VR9 A;  4B66 A;  3F4T A;  3AD9 B;  2LRT A;  2HSY A;  4RI7 A;  1X9S B;  2VIM A;  4TR0 A;  3ZZX A;  3HA9 A;  3FPZ A;  2FJB A;  2YV9 A;  1NHP A;  3GKN A;  1USB A;  4EMI A;  5C3J A;  1T1V A;  1PX7 A;  3UBK A;  3GA4 A;  4G74 A;  1U3I A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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