2R0PA

K252c-soaked rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
529
structure length
512
Chain Sequence
MNAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords RebC
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule tags Oxidoreductase
total genus 161
structure length 512
sequence length 529
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0pA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0pA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0pA01
3GDPA 1YQ3A 2YAUA 5EOWA 1IUVA 1B4VA 2R4JA 4CCQA 2C72A 2YVJA 1TDEA 1F8RA 3IC9A 1KDGA 1BF3A 1H84A 4CCRA 1RP0A 4H7UA 3NTDA 1OJ9A 1ZP0A 3C4AA 1GXFA 2ARDA 3IHGA 4PABA 3UKPA 4YTPA 3AEBA 4ZN0A 4H4UA 1S3BA 5FMHA 3K7TA 5CKUA 4AOSA 2JBVA 1GEUA 4JDRA 3V3NA 1B5QA 3CTYA 2GF3A 3DH9A 4H2NA 1NHQA 1ZOYA 3NKSA 3AEAA 1XANA 2VQBA 3RHAA 3V3OA 4C5OA 2C76A 4BV6A 4Y4LA 5GSNA 4TM0A 1EL8A 3P4QA 1NAAA 5TR3A 1RYIA 3F8DA 4U8MA 4H2PA 4X9NA 4A6NB 2TMDA 1GV4A 2ZZBA 2VZ2A 2WU5A 1PDHA 1CJ3A 1KNRA 3UKQA 2BK3A 1QO8A 3B3RA 1JRYA 3K7MX 4Z25A 2XFOA 3D1CA 5FS6A 3URHA 5IPYA 2Q0KA 4ECHA 1F3PA 3ATQA 1D4CA 2DKHA 4Z2TA 2EQ9A 4LIIA 4C77A 4IA5A 2GQWA 1W4XA 1GTHA 1LV0A 2ACZA 2YVFA 1IUUA 4U8PA 2GB0A 2R0PA 4O5QA 1EBDA 1MO9A 2GVCA 5KVIA 4J56A 3ICSA 4CRTA 4YSHA 1N4WA 2RGOA 2VVLG 2C3DA 3GRTA 3FPZA 4J33A 2WEUA 3NK2X 1LPFA 3LB8A 3DK4A 4I58A 1DOEA 4RSLA 3KLJA 2E4GA 4YWOA 3SM8A 1Q9IA 4B69A 5KWFA 2ZZCA 3AE1A 4GCMA 3UKHA 4NTCA 3LXDA 5IQ4A 2C66A 3DJJA 3DMEA 2V3AA 3BHFA 3NYCA 2JB1A 4FK1A 2DKIA 4GDEA 1GRTA 5JCIA 3ICTA 2BA9A 3UKLA 2AAQA 2FJAA 3FBSA 1FEBA 1LQUA 4B68A 5HXIA 1TRBA 1O5WA 4YSZA 3BHKA 4JY3A 1O94A 2C70A 1PXAA 2C7GA 4OPGA 3OC4A 2Q7VA 1SEZA 3AE7A 1NG3A 3ABVA 4FX9A 4H4XA 4BJZA 1AOGA 2XLUA 3H8IA 1JU2A 5J7XA 4A79A 4EMIA 5EB4A 2Y6QA 2YM1A 4H2RA 2ZZ0A 3DJEA 2I0ZA 1GREA 1PBEA 1OJCA 1F8SA 1L9CA 3AE6A 2E5VA 2BK5A 1KSSA 2YG6A 4U2TA 1H86A 3O0HA 1KFYA 4A5LA 1FOHA 1L9EA 2CDUA 2B9YA 1E7PA 3DGHA 3UOVA 3GMCA 3EAOA 1K0LA 3F8PA 2B9WA 1BKWA 2OA1A 3RP6A 2JK6A 4NTEA 2CULA 4A65A 4BJYA 4A7AA 4UDRA 3NIXA 3AYJA 4NEWA 1NENA 2YG5A 1PS9A 2X8GA 4USQA 1ELIA 1GRGA 1E39A 4D04A 3DK9A 3P4RA 4HB9A 2VRLA 3EANA 1TDNA 2WPEA 3BI2A 4PAAA 1XDIA 2A87A 2GAHB 3II4A 1PXBA 2VVMA 2JKCA 3BNUA 1TYTA 1TDKA 2XFUA 2WQYA 2EQ8A 3C96A 3CNTA 3REDA 4B67A 4C74A 2YVGA 3SQPA 1CC4A 2YG3A 3AE3A 2BXRA 1XHCA 3AD9B 4H4ZA 4HA6A 1UKVG 4CNKA 2HQMA 5C3JA 1JNRA 1IUTA 2FJDA 3UKAA 2C65A 1GETA 3F8RA 2OAMA 4DSHA 1Y56A 2RABA 4EMWA 3VR9A 2OLOA 4E0VA 2GR2A 4LU6A 1S3EA 4IVOB 4H4YA 3G5QA 1L9DA 4XXGA 5BULA 3AE8A 4EQSA 2R0CA 5U1OA 5DBJA 4U8OA 2APGA 2OALA 3FIMB 3ICRA 4Z24A 2XVJA 4EQXA 3DJGX 2J3NA 1BZLA 2Z5YA 3NTAA 1VDCA 1S2YA 3LZXA 3ALLA 1NEKA 3PS9A 2H89A 4JN9A 4BK2A 5JCKA 2O9ZA 2WHDA 3LADA 4OCGA 4WX1A 5ER0A 1S2QA 4FDCB 2BC1A 3EPTA 1PJ6A 3NK1X 4APNA 1LVLA 4OPUA 3GWFA 3CPHG 2RGJA 1DOBA 1O95A 1FECA 1YQZA 4AOXA 4GRTA 2EQ7A 3GYIA 4BK1A 3NLCA 1QJDA 1Z6LA 2X50A 2WP6A 4K2XA 5HYMA 3BI4A 3UP4A 4J31A 2Y6RA 1HYUA 4OPCA 4XWRA 2RGHA 5C2TA 3GRSA 3ISHA 1H7XA 3V76A 1IUXA 1PBCA 2Q6UA 2XVEA 1E1NA 3CNPA 4H4SA 3H8LA 4I59A 3UTGA 2V60A 3CN8A 3VQRA 4EM3A 2AR8A 1Y56B 2E1MA 2BACA 1BGNA 3AEEA 3SFEA 4GUVA 1Q1RA 2C75A 2BCGG 1Y0PA 4U8IA 2GR1A 3K7QX 3KPFA 4H4RA 1E1MA 2XLSA 4K22A 3QFBA 2CFYA 4U2LA 1IUSA 3JSKA 5EBKA 2BS2A 1H6VA 2C3CA 3ZDNA 3H4KA 3IWAA 3BI5A 2WPFA 3CNSA 1ZMDA 4OPTA 2FBWA 4H4VA 1GERA 4B65A 3UOYA 5J60A 2XYOA 3KKJA 3LOVA 4EIQA 2YM2A 1B37A 4B66A 1DXLA 1QLBA 4XWZA 4DGKA 3P4SA 4H4WA 1V59A 1X31B 2WS3A 1ZY8A 2OLNA 1NDAA 4MJWA 1GRHA 1GRFA 1TDFA 2YR5A 2JB3A 2YG4A 4M52A 4Z26A 4B1BA 2QA2A 1DODA 4Z44A 4TLXA 1COYA 3CGDA 2NPXA 3AYLA 4U8JA 2GR3A 3SGLA 1ZMCA 3DJDA 2CVJA 3GDNA 2VRMA 4GDPA 4RG3A 1CBOA 4X4JA 2BC0A 1DJNA 2YLWA 4NEVA 2F5ZA 4YXDA 3NN6X 4TM4A 2QAEA 1OJAA 2IIDA 3AD8B 1E1LA 1GALA 2WOWA 3AD7B 1H83A 2B7SA 3I6DA 4UP3A 3UP5A 1JRXA 4J36A 4YT0A 3NHOX 1EL7A 2PYXA 5LV9A 3HZLA 1D5TA 2B76A 3S61A 4IVMB 4YSYA 5M0ZA 3WE0A 2YLTA 1NPXA 2IVEA 2YG7A 1P2HA 3NYFA 2GV8A 2W0HA 4KX6A 3S5WA 2FJBA 3KVEA 3CGEA 1RSGA 2PHHA 5EB5A 3BNMA 3CPIG 4Y4NA 1B8SA 1TDOA 5IQ1A 1ZKQA 4H4TA 2WESA 1YY5A 3P9UA 3IF9A 3QJ4A 2GR0A 4EQWA 3K30A 5JCMA 4B63A 1F6MA 3AE4A 3L8KA 1VQWA 1GRBA 5U25A 3NNEA 5U63A 1DJQA 4J34A 5HHFA 4AP1A 2EQ6A 3OZ2A 2VVLA 2XLRA 4FK1C 1FEAA 2NVKX 4GR1A 4OVIA 5GRTA 1ZK7A 1CL0A 3GD3A 4H4QA 3AE9A 2YLZA 3VRAA 4C3YA 1JNZA 2B9XA 2X8HA 3CPJG 4J57A 3LJPA 3P1WA 4JQ9A 1D4EA 3UKKA 1GT8A 5KXJA 3B6DA 2R9ZA 1VG0A 2V3BA 1D7YA 3NH3X 2GH5A 5JCLA 3C4NA 3VRDB 3AEFA 3I3LA 1ZDLA 4A99A 3KA7A 4K7ZA 1CC6A 2WOVA 3SFDA 5KRQA 3NK0X 4OPDA 2V6OA 4YTMA 5L46A 3NRNA 1OJDA 2GMJA 1N4UA 2B7RA 2XFQA 3M13A 4K5SA 2BXSA 4U2SA 1CHUA 2R4EA 3G5RA 3GD4A 2GEWA 3DA1A 4CY6A 1H7WA 1KSUA 2X99A 2ZBWA 2BYBA 2C64A 3ZYXA 1VRQB 1VG9A 2XVIA 4YKFA 4CY8A 5KOWA 4AT0A 3ALJA 3AEGA 3CGCA 5BRTA 2YLRA 2BS4A 3UTHA 1E6EA 4N9XA 4JNAA 4U8NA 4U8KA 4UDPA 4B64A 2GAGB 1NHRA 1CJ4A 3AE2A 1P2EA 1PN0A 2WU2A 4TM3A 4D03A 1KF6A 2GQFA 1YQ4A 5CQFA 4K5RA 3GWDA 1FCDA 4DNAA 4YTNA 2QA1A 5JCNA 4IV9A 1CF3A 3AECA 2WDRA 1LQTA 1EL5A 2XCGA 4JY2A 3CNJA 1NHSA 4DSGA 2VOUA 3NGCX 1M64A 4K8DA 1PJ5A 4EM4A 1EL9A 2UZZA 2WP5A 3ADAB 3QVPA 1K0IA 3UKFA 1F8WA 3VR8A 1PBDA 1PXCA 1H81A 2WPCA 4UDQA 2XFNA 3G5SA 3QSEA 1CC2A 3GMBA 1REOA 3IHMA 2BK4A 2JB2A 4USRA 4NZHA 4Y4MA 1PHHA 3GYJA 1BGJA 3GSIA 1L0VA 4ZCCA 3RP8A 4ADWA 5M10A 4J2WA 1PJ7A 1YKJA 3ALMA 4OPIA 2X8CA 1OJTA 4EIPA 1CJ2A 3Q6JA 3RP7A 3UOXA 3CIRA 3ITJA 1GESA 2Q0LA 1GSNA 4Z2RA 4TLZA 1CJCA 1D4DA 2C73A 1LTXR 4P9SA 3UCLA 3EF6A 3UTFA 4CNJA 3ATRA 1D7LA 1NG4A 3DGZA 3L1RA 2GRTA 4C3XA 5KOXA 1LJ1A 4Z43A 5HY5A 2XLPA 4TM1A 3R9UA 1Q1WA 4ZCDA 1JRZA 4H4PA 4REKA 3NT6A 3E1TA 1KNPA 1NHPA 2FJEA 2R46A 2X3NA 1N4VA 3KD9A 3NYEA 1GOSA 3P4PA 3FMWA 4LA1A 5FS7A 1MXTA 1MOKA 3NG7X 4BURA 1ZX9A 2YLXA 2TPRA 2YR4A 4H50A 2XVFA 1BWCA 4A9WA 2WBAA 3AWIA 2A8XA 2R0GA 5FS9A 1PBFA 5BUKA 3AE5A 1DNCA 3Q9TA 4CBQA 2XVHA 3AYIA 4WCTA 3RNMA 2YQUA 3FG2P 5BVAA 3QSMA 4KPRA 1TYPA 1JOAA 2WDVA 1XPQA 4AP3A 4YKGA 1DOCA 1FL2A 2GMHA 3PVCA 1E1KA 5KVHA 4NTDA 2WOIA 2QCUA 2WP9A 1GPEA 3QFAA 4EMJA 4EQRA 5FS8A 2XFPA 2BS3A 3D8XA 3KU9A 3AEDA 3AB1A 3DK8A 1M6IA 2C67A 4IA6A 4H2QA 2JAEA 1GNDA 3AXBA 3M12A 3VRBA 3CGBA 1N1PA 4AT2A 2WETA 1ZOVA 4OPLA 1GTEA 2R45A 2XDOA 1IJHA 4YSXA 3QVRA 4BK3A 3UTEA 2BCPA 2YR6A 3T37A 1ONFA 2BABA 4X9MA 2VQ7A 4JNQA 2WDQA 2AQJA 4U8LA 2V5ZA 1GRAA 3CNDA 2Z5XA 1H82A 3PO7A 2YLSA 4O5UA 1IUWA 2XLTA 3COXA 3LZWA 1PBBA 3UOZA 2V61A 3M0OA 4ICYA 2YWLA 1JEHA 4GF7A 4Z2UA 2H88A 3QSSA 2A89A 1K4QA 3NN0X 4A6NA 1K0JA 4RG4A 2IVDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EOWA 1YQ3A 2YAUA 1IUVA 1AQVA 4DSSA 2R4JA 1TOFA 1SD8A 4PQIA 4IS0A 2YVJA 1EVIA 1F8RA 1KDGA 4WF4A 4CCRA 4H7UA 4OFMA 1R5PA 3VWUA 1ZP0A 16GSA 3UKPA 4QFCA 1TI1A 1G6YA 1AN9A 4ILFA 4OFTA 3GKNA 3HDCA 13GSA 1K3LA 3GV1A 2P31A 4HU9A 3K7TA 1YF1A 2DBCA 2WZ9A 5CKUA 4YH2A 1ZL9A 4KUNA 2J23A 2HSHA 3DMLA 4PNFA 4ZBBA 3CTYA 4JR6A 2V1MA 5J41A 4C5OA 4GQFA 4BVYA 3VWVA 4F0BA 1ERUA 4OFNA 2R37A 3EU3A 1T4YA 4L0WA 4F82A 2AUVA 2VZ2A 1PDHA 5D9XA 2DJJA 1Z5YE 3UKQA 2E49A 1JRYA 4N11A 5FS6A 4KB3A 2EIOA 2EQ9A 4C77A 4IQ1A 5D8IA 2GQWA 2C0GA 2VD0A 4LMVA 5HR0A 1M2AA 3F6FA 4U8PA 2VL2C 4O5QA 2GVCA 4K0GA 5KVIA 4WBRD 1X5EA 2RGOA 1N4WA 2VVLG 4J33A 3NK2X 1MTCA 1ZMAA 4DVCA 4I58A 1K0OA 3DK4A 1GNEA 4RSLA 4YWOA 2E4GA 1Q9IA 4B69A 1C0IA 4NTCA 3LXDA 1F2EA 2C66A 4OO4A 4PXOA 3DMEA 2LEGA 3BHFA 4GDEA 1FHEA 2BA9A 5EL8A 4G0IA 2AAQA 2M80A 2FJAA 3FBSA 19GSA 2KHPA 1LQUA 1O5WA 2RIIA 1O94A 2C70A 5INYA 4N30A 4FX9A 3ABVA 1VF4A 2VCTA 4I8BA 5ECIB 3WT2A 2XLUA 3DYRA 2QKEA 2B5XA 4GAVA 4A79A 4EMIA 3FR6A 3DJEA 3H93A 4K7IA 1A0FA 2E0QA 2QC7A 4BIKA 2E5VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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