2R0PA

K252c-soaked rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
529
structure length
512
Chain Sequence
MNAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
molecule keywords RebC
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 161
structure length 512
sequence length 529
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0pA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0pA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0pA01
3AE5A 1XPQA 3QFBA 1D4DA 3NN6X 3OC4A 2BC1A 2R46A 2R9ZA 4CNKA 2FJDA 4O5QA 2VQ7A 1N4VA 2YG3A 1E1MA 2YM1A 4LA1A 4N9XA 2OLNA 1LTXR 2R0GA 3P9UA 1PDHA 4Y4MA 1QLBA 1GRBA 1PBFA 2GRTA 2DKHA 1EL7A 2JK6A 2BXSA 2PYXA 1FEBA 1K0IA 4Z25A 1KDGA 4P9SA 2C67A 2WOVA 4OPLA 2W0HA 2FJAA 2R45A 1PBCA 2GH5A 3AEFA 3GYJA 1LQTA 2JAEA 3VR9A 1VG0A 1DJNA 3QFAA 2DKIA 2WP5A 2XLTA 1GOSA 1IUTA 1GV4A 1UKVG 4Z24A 3ALMA 2QAEA 4A5LA 2C3CA 2OALA 1Z6LA 3NT6A 3I6DA 2BS4A 4NTDA 5C2TA 1B8SA 1GESA 1PJ5A 3BNMA 4NEWA 4NTEA 1S2QA 2RGOA 4YKFA 4H50A 3B3RA 4FX9A 4A6NA 2B9YA 4IA6A 3SM8A 1XHCA 1L9EA 4U8OA 1P2EA 2R4JA 3NHOX 3NN0X 4J34A 1BF3A 1REOA 2F5ZA 3II4A 4H4XA 1TDEA 5U25A 4Z43A 2TPRA 1IUXA 1ZMDA 1YY5A 3NH3X 4B68A 3QVPA 3FBSA 4GUVA 4JY2A 5U63A 3GD4A 1YKJA 3UP4A 1PN0A 2ACZA 2WP9A 3G5SA 4GRTA 4ICYA 3V3NA 4GR1A 3GMCA 3KLJA 2FJBA 1NHRA 2YWLA 1IUUA 1VDCA 2BK5A 1GTEA 3CNDA 4H4WA 5BULA 1JOAA 2XVIA 5KRQA 2C76A 4Z44A 5J7XA 3ABVA 4X9MA 2GR2A 1F8SA 1OJAA 5U1OA 2YLZA 3CIRA 2B9XA 3DK8A 2C73A 3GMBA 2A89A 4C5OA 2WPEA 4B67A 4O5UA 1BZLA 1H7WA 1JNZA 4JY3A 2RGHA 2VVLA 3PVCA 2WDQA 3AEGA 4LU6A 4CY8A 1GREA 4CBQA 2XLRA 1NHPA 4H4QA 1BKWA 3CPHG 3SFDA 1PHHA 2E5VA 2GAGB 3IC9A 1XANA 2CULA 3GYIA 3IHMA 4GDEA 5TR3A 4UDPA 4EIQA 5JCLA 1ZMCA 3AYLA 1H82A 4UDRA 1B5QA 2EQ7A 3ICRA 3T37A 1DXLA 2BK3A 3AD7B 3UKHA 3QSEA 1NHQA 3C4NA 1QO8A 1DNCA 2V3AA 2A8XA 1CC6A 2JB3A 1ZP0A 2YLXA 4JDRA 5EB4A 3VR8A 4FK1C 3AE4A 3NYEA 2GMHA 2XFNA 4JNQA 4WCTA 4RG3A 1D7YA 2C65A 3FIMB 2YLTA 2Q7VA 3HZLA 1TYPA 4IV9A 4U8IA 4AP1A 3VRAA 2OA1A 2Z5XA 1IUVA 5LV9A 2AR8A 2FJEA 4U2TA 2YQUA 3VQRA 3NRNA 3ICTA 2OAMA 1D4CA 2YVFA 1XDIA 2ARDA 3DJEA 2WP6A 1B4VA 1YQ3A 4UP3A 3NG7X 1GSNA 3BHFA 1OJCA 3UKAA 5KVIA 4AT0A 4B69A 5IPYA 3AE2A 3P1WA 1D4EA 3FG2P 3AE6A 4GDPA 1FOHA 2C66A 4Y4NA 3FPZA 1E1LA 3CPJG 1Y56B 1DOCA 1K0JA 2C64A 3B6DA 3GWDA 3M12A 3PS9A 2IVDA 4ZCCA 3BI2A 4J33A 1IUWA 1RP0A 2JBVA 2YR4A 4NEVA 5FS8A 1H81A 1PJ6A 5M0ZA 3GRSA 1PBBA 1LVLA 2B9WA 4BJYA 4J2WA 3CGEA 1NAAA 4H4ZA 4KX6A 4YXDA 5JCKA 2V61A 4JQ9A 2C7GA 4B64A 3K30A 3UKPA 2X50A 5KVHA 2WOIA 4H2NA 2C75A 4OPUA 3Q9TA 5IQ4A 3LOVA 2Y6RA 2XCGA 1W4XA 1Q9IA 3L1RA 3UOYA 4DGKA 3IHGA 3AYIA 4OPCA 4C74A 1H7XA 2V6OA 1D5TA 2C72A 1GRFA 1GT8A 3K7MX 2XDOA 3KPFA 3NYFA 1EBDA 4U2SA 2GMJA 3M0OA 2WS3A 3F8PA 3RP8A 1PS9A 2BK4A 4U8KA 1CC2A 4B65A 2WQYA 4U8MA 3E1TA 1GRTA 5CKUA 4J31A 3UKLA 1GTHA 3NNEA 3DA1A 4CCQA 3REDA 4H4PA 4K8DA 1S2YA 1S3BA 1N4WA 1ONFA 3AE1A 3AE9A 3O0HA 4BK1A 1VRQB 1GRHA 2X99A 4K5RA 3QSMA 2V3BA 4CY6A 1E39A 3CTYA 2EQ9A 5CQFA 3UOXA 1Q1WA 3AD9B 2XYOA 1GXFA 1PXCA 4K7ZA 4JN9A 1GERA 4H2RA 3ATRA 1GETA 4H4TA 4TM0A 4TM4A 4XXGA 2H89A 4A99A 4DSGA 4YSZA 1CC4A 3AEDA 2WDRA 3CPIG 2WOWA 4U2LA 1F6MA 1QJDA 3EAOA 4TM1A 4H2PA 1TDFA 2WESA 4H4SA 5IQ1A 3ALJA 3UOVA 2V5ZA 3LADA 2GQWA 1H84A 3NKSA 4PABA 2VVMA 2V60A 2YVGA 1L0VA 1RSGA 2JKCA 5EBKA 2WPFA 1JRZA 1B37A 4RG4A 1NG4A 3QJ4A 5JCMA 1E6EA 2A87A 2GAHB 1CJ4A 3KU9A 1GNDA 5BRTA 4D03A 2B7RA 2R0PA 2WEUA 1BGNA 3H8IA 3UKFA 4YT0A 5FS6A 3AE3A 4A7AA 4AOSA 1EL9A 2I0ZA 2J3NA 1OJDA 3I3LA 4JNAA 3QSSA 4EMIA 4H4VA 2YM2A 4H4YA 3BHKA 3SFEA 1TRBA 1LV0A 1ZK7A 3RNMA 4YSXA 1KNPA 2X8HA 4C3YA 3VRDB 5J60A 1ZKQA 2H88A 3R9UA 4CRTA 1FL2A 2ZBWA 3GRTA 3BI5A 4H4RA 3D1CA 2HQMA 3KD9A 1COYA 5EB5A 1H83A 1ZOVA 4HB9A 4OPTA 2YR6A 3EANA 4J57A 4YTPA 5DBJA 2B76A 2WU2A 4I58A 1E7PA 3AWIA 1ELIA 1PJ7A 1KFYA 1NDAA 3RHAA 2VRLA 4ZN0A 2NPXA 2WDVA 1JRXA 4USQA 3AEBA 2E4GA 2WU5A 4AP3A 2Z5YA 5FS7A 4EQRA 4TLXA 4U8NA 2C70A 2ZZ0A 1DODA 2XFPA 3DJDA 3CN8A 3G5RA 3ICSA 3S61A 4B63A 2BABA 3GWFA 4YSHA 3CNPA 3DJGX 3ADAB 3UTGA 3NGCX 1F8WA 2Y6QA 3NTDA 1D7LA 3BI4A 3QVRA 5ER0A 4IVMB 4OPDA 4LIIA 1VQWA 5GRTA 3LJPA 2E1MA 3AYJA 2GR3A 1DJQA 4NTCA 4KPRA 3DMEA 3VRBA 4BK2A 1TDOA 4EM4A 4A9WA 4Z2TA 3CGDA 2CDUA 3IWAA 3UTHA 3DJJA 2JB2A 3FMWA 2XLSA 5HHFA 4BK3A 3SQPA 1DOBA 4ADWA 4ZCDA 2GB0A 4K5SA 1NHSA 4E0VA 3H8LA 3KA7A 4FDCB 4USRA 3KVEA 4DNAA 4IA5A 1ZY8A 3AEEA 2JB1A 2BACA 3BNUA 4EM3A 5FS9A 3K7TA 1AOGA 2C3DA 5M10A 3AXBA 1MXTA 2X8CA 1L9DA 1H86A 1NENA 4GCMA 4PAAA 1LPFA 4K22A 2GF3A 1VG9A 3ZDNA 4CNJA 3URHA 4CCRA 2IIDA 3AE7A 4REKA 1V59A 3CNTA 1LQUA 3P4SA 4A65A 1EL5A 3COXA 1BWCA 1MO9A 4NZHA 3V3OA 2Q0LA 3ATQA 4I59A 2AAQA 3GSIA 2R0CA 5EOWA 3P4PA 3UTEA 1CJ2A 5FMHA 1MOKA 1KSUA 2GVCA 4XWZA 2VRMA 3ALLA 2UZZA 2BC0A 4APNA 2ZZCA 2Q0KA 2WHDA 2XFUA 2B7SA 1GRGA 1EL8A 2PHHA 3DGZA 2YG4A 1ZDLA 1GALA 1CBOA 1PXBA 3DGHA 4AOXA 1F3PA 3S5WA 1Q1RA 2WBAA 1CF3A 2EQ6A 1M64A 3C4AA 1H6VA 1CJ3A 5KOXA 3CGBA 4YWOA 1ZOYA 1NPXA 3AEAA 3ITJA 2XVFA 4K2XA 3WE0A 4EMJA 3L8KA 3UP5A 2BCGG 4H4UA 2BA9A 4EIPA 3RP6A 3RP7A 2XLUA 1JRYA 4Z2UA 4YTNA 1OJTA 3ISHA 3GD3A 1ZX9A 1PBEA 2YLWA 2YLSA 3KKJA 2X8GA 5KWFA 1E1KA 2CVJA 3DK9A 1KNRA 1YQ4A 1GRAA 3LXDA 1L9CA 4H7UA 5JCNA 4GF7A 1IJHA 3P4RA 4X9NA 1PXAA 2XFQA 2CFYA 1NG3A 3NK0X 4EQXA 1Y0PA 2R4EA 4OPGA 2XVHA 3LB8A 1O5WA 1JNRA 3NLCA 4HA6A 4AT2A 3K7QX 2AQJA 2O9ZA 4OCGA 2OLOA 5HY5A 4B1BA 5GSNA 1DOEA 2YG5A 4YKGA 4ECHA 3AE8A 5KOWA 3D8XA 3NK2X 4OVIA 3P4QA 3UKKA 2XVEA 1O95A 3Q6JA 4TM3A 2VZ2A 2QCUA 4EQSA 2QA2A 4C77A 1RYIA 3EPTA 1OJ9A 4C3XA 3DH9A 2XFOA 4U8PA 1Y56A 5C3JA 3CNSA 1F8RA 4A6NB 2FBWA 4FK1A 4MJWA 1S3EA 5BVAA 4BJZA 2YR5A 1KSSA 3UKQA 3AECA 4XWRA 2VQBA 4U8JA 2VOUA 4DSHA 1N1PA 1YQZA 1P2HA 2QA1A 2IVEA 2RGJA 3PO7A 4IVOB 4A79A 3GDPA 2BCPA 5HXIA 4EMWA 1FEAA 3M13A 3CGCA 3F8RA 2YG7A 4RSLA 1K4QA 3C96A 4U8LA 4Y4LA 3NYCA 3UOZA 4B66A 1JEHA 2BYBA 2XVJA 2BS2A 3V76A 3IF9A 2TMDA 2GR0A 1NEKA 3AB1A 4J56A 4WX1A 1TDKA 4H2QA 1GPEA 1FECA 2NVKX 4M52A 3EF6A 3NIXA 2XLPA 3G5QA 2YG6A 1KF6A 1PBDA 3NK1X 5HYMA 1CHUA 3AD8B 2BXRA 2VVLG 1SEZA 3OZ2A 4EQWA 4OPIA 2ZZBA 3H4KA 1O94A 3F8DA 4BV6A 4Z26A 5JCIA 2GV8A 2YAUA 3DK4A 1FCDA 2Q6UA 3JSKA 5L46A 1BGJA 1GEUA 4YTMA 3UCLA 1IUSA 2WPCA 1JU2A 3NTAA 3SGLA 2GEWA 3CNJA 3GDNA 2EQ8A 2GQFA 4J36A 4Z2RA 2YVJA 4X4JA 5KXJA 4BURA 1N4UA 4UDQA 2YLRA 1K0LA 4YSYA 1CL0A 3UTFA 1LJ1A 1X31B 2GR1A 2BS3A 1HYUA 3LZXA 1CJCA 3ZYXA 1TDNA 2RABA 3LZWA 2APGA 1M6IA 5BUKA 2WETA 4TLZA 2X3NA 4D04A 1TYTA 1E1NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AE5A 4G2EA 4ZL7A 3MAKA 3NN6X 2BC1A 2IIYA 2H19A 1XCCA 4MK3A 4BVXB 5EVOA 1GSSA 3GKMA 5E59A 1LTXR 1W89A 1PDHA 1KBNA 1QLBA 10GSA 1PBFA 5ID2B 2FWEA 2DKHA 5AN1A 2BXSA 5F0GA 4O92A 1KDGA 3IRAA 1LJRA 2AHEA 4OPLA 2R3XA 1GSFA 1TJDA 3GYJA 4G6HA 2JAEA 3UBKA 2GGTA 1DJNA 3RDWA 2WP5A 1GUKA 4Z24A 1DSBA 3ALMA 5DVBA 1HQOA 1TRUA 2H73A 1QMVA 2YWMA 3PINA 3LORA 3NT6A 2ZCTA 3VWVA 3BNMA 4NEWA 1JZWA 4MDCA 4IW9A 1S3AA 2IMIA 4U8OA 2R4JA 1P2EA 2CZ3A 1ZCPA 5JCWA 1G6YA 2F5ZA 2F8AA 5U25A 4G19A 1IUXA 3P2AA 4PUAA 1YY5A 2HYXA 1JLWA 3QVPA 4K7OA 4JY2A 5U63A 3S9FA 1BEDA 3UP4A 2ACZA 4K0NA 4GRTA 4GR1A 3GMCA 2R37A 1K0AA 1Z9HA 3HYPA 3FYGA 1YKCA 1UVZA 1A2JA 4P3YB 5G5EA 5BULA 1VDCA 1HD2A 1K0NA 1XWKA 2XVIA 4Z44A 2G0FA 4TRXA 5EL8A 5J7XA 3F4SA 3FR9A 1F8SA 2YLZA 4WEYA 4F2IA 2KUCA 3UOMA 1VF1A 4C5OA 3GX8A 4O5UA 3A3TA 3DWVA 2JSYA 3IOSA 4JY3A 2RGHA 3F3RA 2GQMA 4CBQA 1NHPA 1XW6A 3L4NA 2GAGB 4AF2A 2LQOA 1XANA 4GDEA 3FR6A 2VCWA 4UDPA 4EIQA 1ZMCA 2L4CA 3AYLA 3E0UA 1H82A 3UARA 5IPHA 1O7UA 3T37A 4KCAA 2O7KA 3HVXA 2YZUA 5HR3A 3EMXA 1QO8A 2A8XA 1WPIA 2V41A 3HVNA 5EB4A 3ISOA 4G74A 2GMHA 2XFNA 1PX6A 4RG3A 1YQ1A 1D7YA 4LLRA 2C65A 4PX1A 3HZLA 1M7TA 2AYTA 4IV9A 4AP1A 4AGSA 2OA1A 4F82A 2YJ7A 3T0KA 2FJEA 1BG5A 3VQRA 1B9XC 3NRNA 3ICTA 2CQ9A 3PPUA 3F63A 1GTIA 4XS6A 1RQMA 3BHFA 3UKAA 1QXHA 4L0UA 1D4EA 1AXDA 3AE6A 3LXZA 2OE3A 1E1LA 1Y56B 3B6DA 2CAIA 3GWDA 2RLIA 1SK0A 1THOA 4YJFA 4NEVA 1H81A 1YZXA 4K0GA 4MMMA 4NNJA 3CGEA 4H4ZA 5JCKA 1XPVA 2BRAA 1O85A 2IMDA 2QGVA 6GSSA 1VGLA 5KVHA 3RPPA 2WOIA 2C75A 3KTLA 4OPUA 5IQ4A 2XCGA 3NOFA 4Q5NA 4OPCA 4C74A 1M2DA 1D5TA 3HVVA 3EE2A 12GSA 3KPFA 3NYFA 2K6VA 1EBDA 3N5OA 5DJLA 4PNGA 3QFBC 1FW1A 3E1TA 1GRTA 1EWXA 5CKUA 3ZNOA 3KM6A 3I9V2 1S3BA 3KZQA 5ECLB 1THXA 4ECIA 3SZ0A 4RI6A 4I5QA 2NPBA 2PN8A 1GRHA 4GAVA 3DVWA 1SK2A 1V98A 1OC3A 2EQ9A 3UOXA 4KUNA 3QCPA 2E2GA 1GXFA 1PXCA 1SKRB 4K7ZA 5KMSA 3QFAC 4OMVA 3DD3A 4H4TA 4DSGA 2H89A 3UEMA 1Z7PA 5CYYA 1SKWB 2WDRA 1U3AA 2CX3A 3EC3A 4TM1A 2TIRA 3RPNA 4II3A 1GTAA 3UOVA 2V5ZA 3LADA 4TR1B 2YVGA 2LJRA 5B7CA 1JRZA 3QJ4A 2GAHB 2MBSA 4D03A 4GSNA 2B7RA 2O85A 4WF5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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