2R37A

Crystal structure of human glutathione peroxidase 3 (selenocysteine to glycine mutant)
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
191
structure length
191
Chain Sequence
GTIYEYGALTIDGEEYIPFKQYAGKYVLFVNVASYGGLTGQYIELNALQEELAPFGLVILGFPCNQFGKQEPGENSEILPTLKYVRPGGGFVPNFQLFEKGDVNGEKEQKFYTFLKNSCPPTSELLGTSDRLFWEPMKVHDIRWNFEKFLVGPDGIPIMRWHHRTTVSNVKMDILSYMRRQAALGVAENLY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Glutathione peroxidase 3
publication title Crystal structure of human glutathione peroxidase 3 (selenocysteine to glycine mutant).
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 63
structure length 191
sequence length 191
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.9: Glutathione peroxidase.
pdb deposition date 2007-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00255 GSHPx Glutathione peroxidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r37A00
1TU7A 1I9DA 4NPBA 3UOMA 4PNGA 5F0GA 1GUHA 4WBJA 4AF2A 5D93A 3A5WA 2H01A 5KEJA 1ZCPA 1DUGA 4KDYA 1FB6A 2AHEA 2YP6A 2ZNMA 5F07A 3ZZXA 1MD4A 4V1Ag 2EIOA 4MLYA 3C73A 1XWBA 1SKWB 4KUNA 3ZIJA 1VF1A 4FYUA 3IBHA 3ZITA 1VF2A 2H74A 2EIRA 4RI7A 1A8LA 1O8XA 3FZAA 3ZTLA 2H1BA 2P5RA 1FVJA 2C80A 2LTKA 2H6YA 2K8SA 3VI7A 2TIRA 3D4MA 3O6TA 1PQNA 3LEFA 2C3NA 3IK7A 1WP0A 4XS4A 2J23A 2O85A 4Q5NA 1HNCA 2FWFA 1TDIA 3Q74A 1YKAA 3G7YA 1GSSA 4GQFA 1IYIA 2PMTA 4WBRD 1UVZA 4L5OA 4MF5A 2V32A 4CDOA 4F82A 5ID2B 1YEPA 3WYWA 1XWGA 3F3QA 3CYNA 1M2AA 3A2VA 2O89A 4IP1A 3FR9A 2RLIA 4KA0A 2XBIA 1SKRB 4EF0A 2WULA 3R2QA 3LWAA 3M1GA 1XW9A 3OR5A 1K3LA 2CT6A 4EUYA 1GUMA 5C00A 4JEDA 4YAVA 2B6MA 2MMNA 4XRDA 4POLA 3UIWA 4PGTA 5F05A 1JZWA 2KP1A 1V40A 3MSZA 4YQUA 2YPMA 4NV2A 2BMXA 1ZZYA 4K0GA 4LMWA 3N9JA 4HQZA 3GX0A 1NW2A 2HYXA 4EL1A 2F9SA 4K7OA 3VWXA 3AY8A 2IMEA 5GAND 2FUG2 1Z7PA 3TUEA 1CQGA 4FH8A 3US3A 3VFIA 2CA8A 2PERA 2R5GA 3U6VA 2HFDA 3IV4A 1FB0A 1PKZA 4F0CA 1ERTA 3HY2A 5G1KA 4JZQA 2FGXA 4IELA 1Q98A 3IHQA 5DCHA 3F6FA 5KN0A 3EC3A 2IN3A 2X8CA 2IMDA 1EV9A 3D4TA 2M46A 4V2NA 3H8QA 3GHAA 4O32A 4GLTA 3C1RA 2JADA 3LQ7A 1B8XA 3TOTA 4WXTA 4ID0A 2ES7A 3CTGA 3L9VA 1TTZA 3O3TA 3QD9A 4TR4A 4ULXA 1GSFA 3RDWA 3GMFA 5ELGA 2JL4A 1XWAA 3RBTA 4Z7XA 4CHSA 4PQ1A 1THXA 3GH6A 4MZCA 1GSEA 1FHEA 2GTUA 5AIVA 4OD7A 4IJIA 1FG4A 2VL2A 2DMMA 4NAXA 3MWHA 1FW1A 1URMA 2MYGA 1B9XC 2HSHA 4EDYA 2H0HA 4KE3A 3VWWA 1K0DA 4TOPA 4LLRA 3ZIVA 3FZ4A 1O85A 1DSBA 4RUVA 1K0AA 4ECBA 4QL9A 1EZKA 2VM2A 2K6VA 1ST9A 1M2BA 4I2TA 1F3AA 1JZDA 4G10A 4J56E 5EVOA 2VLVA 5HQPA 3D21A 1A0FA 4HU7A 4MCUA 4E8EA 1OC8A 4MK3A 5ECOB 4BA7A 2VCVA 2XHFA 5JCUA 3V1WA 1BEDA 1SK2A 1XWCA 4KDXA 2KHPA 2F8FA 1XWKA 6GSSA 5E4WA 1R5AA 3HXSA 3BCKA 3QR6A 5ENUA 2L6CA 4GTUA 3WT1A 3VWVA 1N8JA 5ECQB 2CVBA 2HRFA 3FZ9A 3KIJA 5LCZA 1FAAA 3DKSA 1EOHA 3GV1A 1S3AA 4AJ6A 2P31A 1OC9A 4KCEA 1USBA 1H4OA 1DBYA 4KCAA 3C7MA 1TJDA 2TRCP 2LKUA 4G9HA 3TJKA 1F6MC 1NSWA 4K8MA 4ILFA 3HJOA 2C1YA 3UMAA 2DJ0A 4MH2A 4O5RA 1GSDA 2H70A 1MTCA 2B5EA 2H73A 5HR1A 2GZZA 1W4VA 2C3QA 5KN2A 3FW2A 4MPGA 3EMXA 1WJKA 2H1DA 2KP2A 3J7Yb 4RQXA 4IQ1A 3RHBA 3KMNA 2LNTA 4ZBBA 3HDCA 3TOUA 3MNGA 2L57A 2IMKA 4POBA 3GKMA 4MDCA 4GSNA 3APSA 3C8EA 2HLSA 4TR3A 3EVIA 5CRDA 3KP8A 3GIXA 1UC7A 4IQAA 4HJ2A 4ISDA 2J9HA 2DC5A 4V2LA 1XPVA 2LV3A 2F51A 5IPGA 3DEXA 1Z7RA 4OFTA 3TGZA 3VI5A 4GWRA 12GSA 5ECIB 2LEGA 1F3BA 5ECHB 3P90A 2V6OA 3RHCA 2O8VB 1PRXA 4KDUA 1JLWA 1AAZA 3VPTA 4LL4B 2B3SA 2ZUPA 4HU9A 4OWYA 4OO5A 1K0NA 2LRCA 1AQVA 3TKSE 1ILOA 3EYTA 2B1LA 4WR4A 2PPTA 1VRSD 4NV5A 4I97A 4F9ZA 1SK1A 2H6XA 3GTUA 1G6WA 3NZNA 2K9FA 3HA9A 1TI1A 3CRUA 4RQRA 2AB6A 3HJPA 3N5OA 4ZB9A 5DQYA 5A4WA 5HFIA 1XOBA 1G6YA 3I43A 1OE7A 1M2DA 1A2JA 2EIQA 1BG5A 4I6XA 4EXJA 4IW9A 4N30A 3LG6A 2WRTA 3EURA 3HVVA 1Z9HA 2G0FA 1V57A 1SD9A 1GSYA 3KM6A 1KTEA 1O6JA 4Q5QA 4MJEA 2FY6A 1PKWA 3LXZA 5D9WA 1HYUA 3L4NA 3E0UA 1K3YA 2O87A 2GSSA 1EEMA 1SU9A 2EC4A 2H72A 3ZYWA 3KH7A 1JFUA 4IBPA 2L4CA 4IJ3A 3F8UA 3DGQA 5IMFA 3GH9A 2ON5A 1XXUA 1ZOFA 4PQHA 5AISA 3KMOA 4ZL9A 3TJGA 3W6GA 2RM6A 3FR3A 3GKKA 3QCPA 3TKPA 2IWTA 3H93A 4IKHA 3ZRDA 5J41A 3BBYA 4BWQA 1SYXA 3CSIA 2Z9SA 2FWGA 3F3RA 2JZSA 1T7PB 1GL8A 3HJMA 4PNFA 1ON4A 4ZBAA 1PMTA 1ZYQB 2QC7A 1BYEA 1B4PA 2H8LA 2VCWA 3KGKA 3EMPA 4MA9A 3SWLA 5G5EA 2X8GA 4K1FA 2YNXA 1M7TA 1FO5A 2L59A 3GRXA 4GF0A 4IHUA 3DYRA 2H71A 1LU4A 5G30A 2NPBA 2FWEA 2REMA 1HD2A 3DIEA 4KB3A 4N0ZA 3SBCA 5GAPD 4EDZA 5IMDA 2OE0A 1SYRA 3EWLA 2YZUA 1M0UA 2MMZA 1V9WA 1OC9B 14GSA 3K8NA 5B7CA 3UEMA 5GZZB 5COHA 3KH9A 1YY7A 1QXHA 1ERUA 4IN0A 3UJ1A 1X5CA 1AC1A 4POMA 2M72A 1V2AA 2DBCA 2R2JA 3ED3A 1EGOA 2VAFA 1SJ6A 1OKTA 5AGYA 4IP6A 3D5JA 2CVDA 1U6TA 3L9SA 2K8VA 3QFBC 2WJUA 4JE1A 6GSTA 2AJQB 2OE1A 3KCMA 5ECNB 2B1KA 2DIZA 2RM5A 2HZEA 1FOVA 1GSUA 1T4ZA 1TRVA 1QGVA 3ZMLA 18GSA 1V98A 2HXKA 3MDKA 2DJ3A 2B5XA 2IMIA 10GSA 2X8HA 5IO0A 6GSYA 2HI7A 2GS3A 1SJZA 2K18A 2OADA 3BOAA 2C4JA 1A2MA 3QAWA 1K3OA 1GTBA 3L0HA 1XCCA 5DALB 2VL9A 4N0VA 2ALBA 3IA1A 3C71A 5J4UA 4MP4A 2JZRA 3G7JA 4OCEA 1OE8A 3IDVA 3HKRA 4DVCA 2F8AA 2VL2C 5B6NA 4LMVA 1MDKA 3I6AA 3EINA 4KH7A 4HEA2 1T4YA 1GNWA 3GSTA 4HZ2A 3PR8A 4MF6A 4BVYA 4D73A 3KXOA 2PVOC 3FZ5A 1ACVA 3QDNA 1PN9A 1QQ2A 3Q6OA 4L0UA 3GTUB 2CAIA 2GZPA 2A2RA 1G7OA 1GULA 1EV4A 5HR3A 3KEBA 1RK4A 2I4AA 1GNEA 4I5QA 1SD8A 5JWOB 1ERWA 2E0QA 1Z6NA 5LNKe 4KSMA 5ECMB 3ZREA 1E6BA 2DSAA 4K6XA 4XHMA 3GA4A 5CP1A 4HZ4A 3M3MA 5JCGA 5D9VA 5ECSA 2GSRA 2OBKA 1N2AA 3I9V2 16GSA 4ZL7A 3HYPA 2H30A 3WGEA 4TR1B 1MD3A 2CZ2A 1K0OA 3NOFA 4MZWA 1A8YA 3KP9A 3P2AA 2AYTA 3F6DA 5F8BA 4LA1A 2H75A 5B8BA 5DAKA 4NHZA 1XW6A 2OE3A 3UVTA 4FO5A 1B48A 2WGRA 2E2GA 3C1SA 1YF1A 3KTLA 3HCZA 2V6KA 5HR2A 2PWJA 3ERWA 4IS0A 6GSXA 4EC0A 3GSSA 19GSA 2GQKA 2PUKC 4ACSA 3QFAC 1B4QA 4XCSA 1AIUA 1NHOA 3BJ5A 3VPQA 1PX6A 1GSQA 4XS1A 5B8AA 1MDJA 5FWGA 2X64A 1TKDB 1WIKA 3CSHA 2E7PA 1JZRA 1GTAA 2QKEA 2GQMA 1JLVA 1O8WA 4O7HA 3CBUA 1JHBA 3L78A 3J7Yk 2IIYA 3CTFA 3E9JB 2AV4A 4AJ7A 4ML1A 2DLXA 1PX7A 3GKNA 2IFQA 1QUWA 5G31A 1OVNA 4DSSA 2FNOA 2YJHA 4MMMA 2WCIA 3CSJA 3TJJA 2H6ZA 2PU9C 2YCDA 2HNLA 3D0ZA 1XOAA 4N10A 3TKSA 1O81A 4QQ7A 4ZIJA 3M0FA 2LS5A 1MDIA 3D6IA 8GSSA 1S3DA 2I3YA 2KUCA 1DE2A 2YWMA 1K0CA 1M9AA 3GN3A 4Q5FA 5D73A 3FK8A 1WE0A 4OO4A 5CRGA 4XS4B 5DVBA 1XZOA 4GSTA 1YDKA 2MMOA 2HZEB 2PN8A 1T1VA 1SK0A 1TK8B 2YZHA 4Q5RA 4RI6A 4PUFC 2GSQA 5IIZA 3ME7A 4TXVA 2VIMA 1TK0B 3M9KA 1Z3EA 1SL0B 11GSA 4H86A 6GSUA 6GSVA 1GUKA 3HZ8A 1XBSA 5CRHA 3A2WA 2HT9A 2O7KA 5IMZA 5ID2A 2YJ7A 2E2MA 5ECKB 1J9BA 4ZBDA 1V58A 3GKXA 1XW5A 4K0NA 1K0BA 3IE3A 5DJLA 2H0GA 1LJRA 2FHEA 5A4UA 5JWRB 3UAPA 1TW9A 3ME8A 5ECPB 1O7UA 2C0FA 3DXBA 2CAQA 1ZL9A 3RPPA 2OBIA 4IGJA 4JU5A 4ZB6A 4BWSA 5A5KA 3P8WA 3WGXA 3IOSA 3QAGA 3TKRA 4J2FA 1BX9A 4D73B 4ECIA 4TVEA 5ABRA 1TP9A 3F63A 5IMCA 3Q18A 4QL7A 2VLUA 1SL2B 4L5LA 2YWOA 1THOA 1HNAA 2CX3A 3ZMKA 2XBQA 1NM3A 3PH9A 1F2EA 2FA4A 1OKDA 2JACA 1GRXA 5DBQA 4PQIA 4FYBA 1YZXA 2R4VA 2F3MA 1TK5B 2LQOA 1X9MB 4GSSA 4MPFA 3IR4A 4HUAA 1YKCA 3ERGA 5AIXA 2AAWA 3ZL5A 1ERVA 3FYGA 1A2LA 2YV7A 5IQYA 3VWUA 1SENA 1YF0A 2HZFA 4WF4A 1EP8A 4NMUA 4X1UA 4F03A 4I2UA 3IC4A 2NTOA 5DAKB 4LL1B 4GRFA 2IPAA 4J57E 2BJXA 1B9YC 2MMAA 2LQQA 1RQMA 4G2EA 2A2SA 4V2MA 4KSOA 4G19A 2CQ9A 3IXRA 1BQ7A 3W8SA 1A23A 4MABA 1JZOA 5CAXA 2YANA 2C8UA 5FT3A 2V2GA 1BJXA 4KAEA 1QMVA 5G5FA 3H4KA 1S3CA 1AUCA 2IL3A 3FHKA 2CZ3A 5C04A 2I9HA 2PBJA 2L5LA 2OACA 3KD0A 2WZ9A 5J9CA 1TI3A 3ERFA 3EU3A 1R5PA 4I8BA 5B6MA 1GWCA 5IO2A 5J3RA 3HZ4A 1O73A 2H1AA 4ECCA 4MZBA 3VK9A 4TKYA 4K9ZA 2N5AA 1A24A 5DQSA 1GLPA 1ZMAA 1UN2A 4PURA 3KTBA 1XIYA 3A3TA 2FD3A 4V1Ap 2XC2A 5E59A 3QOUA 4EVMA 4XRAA 2L5OA 2CVKA 2IFQB 3U5RE 3RPNA 3TJBA 2HE3A 4DSSB 3ISOA 4ZXGA 2VCTA 4GXZA 4MJAA 2VD1A 2XPEA 4K2DA 1M99A 1OYJA 4IVFA 4X0XA 3IK9A 4JBBA 2GSTA 1SJIA 5L71A 4YH2A 3WGDA 1PD21 1QFNA 3LFLA 2B7KA 3F4SA 3TCOA 5CYYA 3IAM2 2WS2A 4ECJA 3GL5A 1TU8A 3DD3A 2FCHA 5GSSA 2P0GA 3F9UA 3UL3A 1E2YA 1YJ6A 4P3YB 1EOGA 1J08A 5IOXA 4GCIA 3Q19A 3GL3A 2YOIA 3LGCA 1WRYA 1WWJA 5G1LA 4GQCA 2ON7A 2H0IA 9GSSA 1RW1A 5JCWA 3BCIA 3LXTA 3UBKA 1ABAA 4HQSA 3A2XA 2CX4A 3TRQA 3ZFBA 4PX1A 5H5QA 3FKFA 4MJBA 7GSSA 1T00A 3APOA 3HD5A 1UA5A 2YV9A 4HOJA 2WFCA 20GSA 2NVLA 2B7JA 2DJ2A 2R6KA 1GLQA 2LNSA 3H1NA 2VO4A 1K0MA 2D2ZA 4MF7A 4X43A 1G7EA 1ML6A 1U88A 2WDUA 1VF3A 4KGIA 2M80A 3M9JA 4JR6A 1HQOA 2LSTA 2GT5A 2YWIA 1PGTA 3TDGA 1F37A 2QSIA 5A4VA 1Y25A 3O76A 5DDLA 5FHIA 4EKZA 2CV4A 1X0RA 3ZVJD 2MZCA 3UBLA 1M9BA 1TOFA 3APQA 1F9MA 4MH3A 3H79A 1AW9A 4HI7A 4JR4A 2GDRA 5AN1A 4F2IA 3TJFA 1I5GA 4KNDA 1WPIA 5CO3A 4CW9A 5F06A 3DMLA 1PL2A 1IYHA 2RUEA 5KN1A 1XFLA 2LRNA 1X9WB 5D9TA 3L9UA 1NHYA 2VLTA 4DEJA 5ELAA 5GSTA 5H5RA 4HDEA 2DIYA 2FA8A 3F4TA 5EPFA 2PGTA 2OJLA 4PUAA 4HS1A 1OC3A 5CNWA 1PA3A 4NXIA 2QGVA 1GTIA 4WETA 5G2ZA 1G0TA 2JSYA 5LD0A 3TKSC 1WOUA 1PSQA 4XIHA 1TRWA 5IPHA 1TXXA 1GP1A 3G9BA 3NIVA 4MJCA 4TXOA 1Z5YE 3DWVA 2BTOT 3W8JA 4OFNA 1X5DA 2JU5A 3GYKA 1R26A 2GVPA 4L8EA 1R4WA 5KN3A 3IPZA 2IJYA 3LYKA 5IM9A 3UARA 5HFGA 2G2QA 4OFMA 1U3IA 4K7IA 2I1UA 3EE2A 3P7XA 1LBKA 3EU4A 4DSRA 1Q4JA 2VL3A 2GLRA 3LYPA 4N11A 5EL8A 5DJMA 2C0EA 1TRSA 3WD6A 2LRTA 4E8HA 5HFKA 3HVSA 4KW6A 5D9XA 4TR0A 2R37A 3TRPA 1U87A 1QK8A 3QPMA 2PVQA 3I69A 1TRUA 3F0IA 4FYCA 13GSA 3FEUA 2DMLA 2H76A 5IOWA 3DVXA 3HHVA 4XS6A 4XTSA 6GSWA 2JZTA 4WKWA 4AJ8A 2GQLA 2NBSA 1KNGA 2RUFA 5J5NA 2OA7A 3ZVJA 3PGTA 1GTUA 3TKQA 3GNJA 5D8IA 1R7HA 1XVQA 5H5SA 2KLXA 2DJ1A 3LJRA 2XPDA 4OMVA 4YQVA 5IMAA 2MBSA 2HRNA 2OKAA 1X9SB 1U3AA 1XVWA 4FIWA 5HR0A 4K7NA 3S9FA 3JCML 3D22A 3FY7A 1T3BA 4O92A 1H75A 3CRTA 3CXGA 1VF4A 4BVXA 1OAZA 1BAYA 4BL7A 2LJRA 2VOCA 3G7IA 3QMXA 4WR5A 4BPYA 3QAVA 3IAS2 2LJAA 3HVXA 3ZLPA 1EWXA 2ZCTA 1C72A 4TW5A 5JWQB 5DALA 2H66A 1KEBA 4OCFA 1ZGNA 2TRXA 2C0DA 1CQHA 5INYA 2MBTA 2V1MA 2VCQA 3VURA 3PINA 4EO3A 2GZYA 4KX4A 2NDOA 1VGLA 4NHWA 2H19A 2HSYA 2LUSA 3BD2A 1SL1B 2JSZA 2V41A 2L4QA 3KZQA 4WF5A 2X99A 3IRAA 1HNBA 2N5FA 3M8NA 5EY6A 1EEJA 4EE0A 2DJJA 2VM1A 1GH2A 4L0WA 1T8EB 2GT6A 3DVWA 1AQWA 1DE1A 1PL1A 1WMJA 1MEKA 2C3TA 4HJMA 4NWYA 4TN8A 1EP7A 1SKSB 3LORA 2VCXA 5D96A 4TRXA 4ZB8A 2YN1A 5CREA 3UVHA 5IMVA 2RIIA 4POKA 1AQXA 3GX8A 1AXDA 3GFKA 4DSQA 2I81A 3KJYA 3WT2A 3CMIA 4YQMA 4PXOA 3FR6A 2A4VA 4AGSA 22GSA 2YWNA 3RAZA 5CRWA 2N5BA 4ZILA 1J0FA 2GGTA 3VLNA 4TR1A 2VD0A 1W89A 1YEXA 2DJKA 2B5YA 3MAKA 4WEYA 5J9BA 1ZYEA 3DRNA 3LSZA 5ECRB 1Z6MA 1YQ1A 4JRRA 2LJKA 2FLSA 5ECLB 1X5EA 4YAPA 2H1GA 3TB2A 4TXOB 2R3XA 3GUSA 2AUVA 3ZFLA 1KBNA 2C0GA 4ML6A 3F4RA 3FRCA 5DCGA 2IMFA 17GSA 2P5QA 3GURA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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