The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
54
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLSSEEKSAVTALWGKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSSANAVMNNPKVKAHGKKVLAAFSEGLSHLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLSHHFGKEFTPQVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
X-ray crystal structure determination of hemoglobin from rabbit at 2.0 angstrom resloution
rcsb |
| molecule tags |
Oxygen binding
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha-1/2
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| total genus |
54
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-09-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1GCW B; 3PI8 A; 2QSS A; 1R1X A; 3UHK A; 1DO4 A; 3LHB A; 4FWY A; 2V1F A; 2D5Z A; 4UUR A; 1SDK B; 3CIU B; 1O16 A; 1N9X A; 2NX0 A; 5KER B; 5HU6 A; 1X9F B; 3UHU A; 4YU4 B; 1S6A A; 2BMM A; 3WCW A; 3QJB B; 1BZ1 B; 1NZ2 A; 1DUO A; 1Y7Z A; 1BAB B; 1O1P B; 2GKM A; 3LR7 A; 2D2M B; 1WVP A; 3UHT A; 1GBV B; 1K0Y B; 1Y2Z A; 4XS0 A; 3VRF A; 1BBB A; 1R1Y B; 1A01 A; 4ZVB A; 1RTX A; 2R4X A; 4U8U C; 2D2N C; 1QI8 A; 5M3S A; 111M A; 1YVQ B; 2O5S X; 3G4V A; 3QZX A; 3NML A; 1Y5F A; 1Y0D A; 1CMY B; 1OUU A; 1YGF A; 3GKT A; 2CMM A; 1LH1 A; 2R50 A; 1NWN A; 112M A; 2VEE A; 1F5P A; 3UHH A; 1Q1F A; 2ZFO C; 3TM3 A; 1CQX A; 3D17 A; 4WCH D; 4MPM A; 4F4O B; 3G46 A; 3G4W A; 1QSH A; 4HRT A; 2GLN A; 3ARJ A; 2FRI X; 1GDL A; 1A3N B; 1JDO A; 3P5Q B; 3HEO A; 3BCQ B; 1LFT A; 1CP0 A; 3RJ6 A; 2G0Z A; 2BKM A; 1MLS A; 2W72 B; 2QMB B; 2ZS0 A; 1RQ4 B; 1Y8W B; 2FRF A; 3PIA A; 1NS6 A; 3SDH A; 1MNO A; 3AQ9 A; 3ZJH A; 1V75 B; 1TES A; 1DLW A; 1XZ2 A; 1Y46 A; 2ZLV A; 1MBA A; 1S5X A; 1Y0A A; 1Y83 B; 3VAU A; 4MXL A; 1A0Z A; 4MQC A; 3QJD B; 2G0X A; 1Z8U B; 3ECX A; 3MJU B; 1CH4 A; 2HBG A; 3S1I A; 3U3E A; 1W92 A; 2GNV A; 2GDM A; 1LJW A; 3UHC A; 5CNB A; 1V4U A; 2ZFB A; 1VWT A; 2SPL A; 1DLY A; 2FRK X; 5F2A A; 3QM7 A; 4NI0 B; 4O2G A; 3ZJN A; 1SPG B; 1UX9 A; 3PT7 A; 2Z85 A; 1MBN A; 2D60 B; 2AUP A; 3WCP B; 1HGA A; 3UGY A; 1UFJ A; 1FN3 A; 1NS9 A; 3LQD A; 5MBN A; 1MBS A; 1HBH A; 1O1K A; 1NXF A; 1YCB A; 3EOK A; 4MQI B; 2EF2 A; 1MKO A; 5HY8 A; 1A9W E; 2MBW A; 2C0K A; 3PT8 A; 1T1N B; 3EU1 B; 1FSX B; 110M A; 1AJG A; 4U8U D; 2D2N D; 3HF4 A; 2Z6S A; 3S66 A; 2QFK A; 1Y8K B; 1Y7D B; 2EVP A; 4F6G A; 1CBL A; 4ODC A; 4AVE A; 3ZJL A; 2EB9 A; 3UBC A; 3AG0 A; 1C7D A; 1CQ2 A; 1YEV A; 1J3F A; 3ZJJ A; 2YRS B; 2NRL A; 1DO1 A; 1UT0 A; 2GTL C; 2MYA A; 1B86 B; 2ZFO D; 1C40 A; 5E29 B; 2GRH A; 1LH3 A; 1SI4 A; 1A6N A; 4UZV A; 1YE2 B; 3IC2 B; 3ZJM A; 5EUI B; 4IRO A; 2EVK A; 3WCT C; 1YOI A; 4O35 A; 1J41 B; 3ZH0 A; 1YHU B; 1C7C B; 1M9P A; 2XYK A; 1JEB B; 1Y0T A; 1CH1 A; 2R80 B; 1JZM A; 1MLN A; 3PI8 B; 3MJP A; 1S5Y A; 2QSS B; 1R1X B; 3WCU A; 1QXD B; 108M A; 105M A; 4O4T A; 1RSE A; 4F68 A; 2O5T X; 1Y4Q A; 3MN0 A; 1FDH G; 2HBD A; 1HBA B; 2D5Z B; 1NAZ A; 3E5I A; 1YEU A; 2G11 A; 5EYJ A; 1V4X A; 3WCW B; 1DXV A; 1Y7Z B; 3TLD A; 1DTM A; 1HV4 A; 2H8F B; 1JY7 B; 1Y4B A; 1FHJ A; 3UHW A; 1XY0 A; 109M A; 3VRF B; 1UIW B; 1O1I B; 1A01 B; 1MLF A; 3ARL A; 4PQ6 A; 3IA3 B; 1C7B A; 2MB5 A; 1VXC A; 3D1K A; 1SHR A; 1Y01 B; 1PBX A; 1DO3 A; 1J7Y A; 5EE4 C; 1Y5F B; 2LH2 A; 1Y0D B; 2ZS1 A; 1IRD A; 2LH7 A; 1CH5 A; 3WTG A; 1COH A; 3A0G A; 3UH6 A; 3QJE B; 2SPO A; 3UHG A; 3R0G A; 1Y7G B; 2HHE A; 2G10 A; 5JDO E; 3A5A A; 1QSH B; 3D1A A; 4HRT B; 2RAO A; 5CN8 A; 2ZSS A; 1GLI A; 1DO7 A; 1XZ4 B; 2GTL D; 3OK5 A; 1LFT B; 1JPB A; 1BUW A; 2H35 A; 1GDI A; 1XZV A; 2ZS0 B; 1FLP A; 5D5R A; 1NS6 B; 3G52 A; 1A6K A; 2FRJ X; 3WCT D; 1XZ2 B; 2MGC A; 4ESA A; 3G4Y A; 1Y46 B; 4N7P B; 2ZLV B; 1HLM A; 1S5X B; 3KUO A; 3FS4 A; 1QPW B; 2QU0 B; 3VRE A; 1A0Z B; 1WMU A; 3QM8 A; 4XDI A; 1RQ3 B; 1YH9 A; 1AJ9 A; 1VXF A; 1LJW B; 2ZSQ A; 1V4U B; 1A4F A; 1VWT B; 1YE0 A; 3WI8 A; 2ZSY A; 2R4Z A; 1YEO A; 1MNH A; 4O1T A; 4MQH A; 3K8B B; 5HBI A; 5CNG A; 1I3E A; 1LA6 B; 2BNL A; 1LHT A; 1HGA B; 3LQD B; 1NS9 B; 2ZT3 A; 2G12 A; 2OHB A; 4HSX A; 3EOK B; 2O58 X; 5HY8 B; 1MKO B; 1Y35 B; 5C6Y A; 3S1J A; 3DHR A; 3ZJR A; 1QSI A; 1CPW A; 1MYJ A; 1Y4P A; 1MYH A; 3DUT A; 1UVX A; 3NG6 B; 3S66 B; 2HHD A; 1HDA A; 2GRZ A; 2W6V A; 3WCV A; 1YCA A; 1Y45 A; 4ODC B; 5EE4 D; 1Y4G A; 5CHR A; 4ILZ A; 3OZW A; 3AT6 A; 1NZ3 A; 2LH1 A; 1L2K A; 3G53 A; 3W4U A; 1LFV A; 1V5H A; 3V2Z A; 1XXT B; 1S69 A; 1IDR A; 1XQ5 A; 1SI4 B; 4G1V A; 4NS2 A; 1DKE A; 1S56 A; 1MYM A; 2HZ1 A; 1J7S A; 3GDJ A; 1MWD A; 2ZSX A; 1DXU A; 1M9P B; 4AVD A; 2XKH A; 1Y0T B; 4FH7 A; 2Z6N B; 2LH3 A; 1IWH A; 1MLJ A; 1YMC A; 1S5Y B; 3WCU B; 4HSW A; 1Y22 A; 1O1O A; 1HJT A; 1THB A; 1Y4Q B; 2FAL A; 2HBD B; 2W6W A; 4NK2 A; 1CO8 A; 2DN1 A; 1YEU B; 1LFQ A; 1MLU A; 4TWV A; 3E4N A; 3QMA A; 3ZOM A; 4KJT A; 1MNK A; 1V4X B; 4MU5 A; 1DXV B; 1EW6 A; 1Y5K B; 1HBG A; 1G0B B; 1CG5 A; 3UHD A; 1HV4 B; 5CNF A; 3GQP A; 3WFW A; 1Y4B B; 1FHJ B; 1XY0 B; 4F6I A; 4O4Z A; 3ZJI A; 2HBS A; 1MLQ A; 4GZG A; 1CH7 A; 1RQA B; 3D1K B; 3IXF A; 1SHR B; 1MYG A; 106M A; 1PBX B; 3A5G A; 1J7Y B; 1CG8 A; 3LB1 A; 3ZOL A; 2DN2 A; 2ZS1 B; 1IRD B; 3VRG B; 1MDN A; 1Y8I A; 1Y85 B; 3PI9 B; 1JP8 A; 3M3A A; 1MBI A; 3GOU A; 2HHE B; 3WHM A; 1HHO B; 3D1A B; 3S65 A; 2RAO B; 4B4Y A; 4HHB A; 1NWI A; 2XKG A; 1Y0W A; 1GLI B; 2LH6 A; 1NZ4 A; 1HCO B; 3HC9 A; 1MGN A; 1BUW B; 1V07 A; 2H35 B; 1XZV B; 2HBE B; 1HBR A; 1HSY A; 3QQQ A; 3UHX A; 3MKB A; 1DXT A; 3UHS A; 3NMM A; 4H2L B; 1NQP A; 1S61 A; 4N7N A; 107M A; 4ESA B; 2VEB A; 1NEJ A; 3BJ2 A; 2BWH A; 3VRE B; 3G4U A; 1JZK A; 5AB8 A; 1BZZ B; 1YH9 B; 3MYN A; 1AJ9 B; 3AQ5 A; 1X46 A; 2HHB B; 2MGF A; 1A4F B; 1XZU A; 1RPS A; 1SDL A; 1NIH A; 3LB3 A; 5ILP A; 1O1J A; 5B85 A; 1YEO B; 1YVT B; 2ZS0 C; 1NGK A; 4FC3 B; 4MQH B; 5CN6 A; 2HCO B; 1QXE A; 4U8U A; 2D2N A; 1A00 A; 2R1H A; 2GRF A; 1RVW B; 1O1L A; 4X0L B; 2V1K A; 1O1N A; 3AT5 A; 5CNC A; 2GKN A; 5CN5 A; 2AA1 A; 3BOM A; 1VXB A; 1A3O A; 1G0A A; 4MQK A; 3QJC A; 2MGM A; 3ASE A; 2NSS A; 1A6G A; 1CH3 A; 1MTI A; 2ZFO A; 1Y4P B; 1H97 A; 3DUT B; 1FAW A; 4WJG 1; 2HHD B; 1J3Y A; 2W6V B; 2WTH A; 3WCV B; 1YGD A; 2R4Y A; 1Y45 B; 2ZLW A; 3A59 B; 4DWU A; 1Y4F A; 2OHA A; 3AT6 B; 1YEN A; 1XZ7 A; 2ZLT A; 1LFL A; 1HBI A; 1A6M A; 3A9M A; 3WCW D; 3W4U B; 3R5I A; 1JP9 A; 1YDZ A; 3UHZ A; 2V1I A; 4G51 A; 1LFV B; 4MQG A; 2QRW A; 1XQ5 B; 4H07 A; 1HAB B; 2RI4 A; 2ZT2 A; 1DKE B; 1D8U A; 2W31 A; 1UVY A; 2NRM A; 3GDJ B; 2IG3 A; 3M38 A; 1BIN A; 1DXU B; 1YMB A; 1LTW A; 1YEQ A; 2O5B X; 102M A; 1JZL A; 3PI2 A; 1IWH B; 4KN3 A; 1URY A; 1O1O B; 2ZLU A; 1THB B; 4N8T B; 3PEL A; 2DN1 B; 1LFQ B; 5F0B A; 104M A; 1Y8H A; 3RJN B; 3HRW A; 4DC8 A; 4F6B A; 2ZS0 D; 1HBS A; 2OH9 A; 1CG5 B; 3GQP B; 3GQR A; 1OUT B; 3UHV A; 2HBC A; 1KR7 A; 2EKT A; 2AUO A; 1G9V B; 2DN2 B; 3GQG A; 3UHE A; 2HBF A; 2GTL A; 3O89 A; 3QM9 A; 3SDN A; 1LH6 A; 103M A; 1XZ5 A; 3KMF C; 3HXN A; 1IRC A; 1IT2 A; 2AUR A; 3GOU B; 1DTI A; 3CY5 A; 3WHM B; 5SW7 A; 1J40 A; 2ZT4 A; 3WCT A; 6HBI A; 5CND A; 5HU6 B; 4C0N A; 4HHB B; 1B0B A; 2PEG A; 5D1V A; 1BIJ A; 4L7Y A; 2O5M X; 1GBU A; 3LR9 A; 1MBC A; 1F65 A; 4N7O A; 1J3Z A; 1Y2Z B; 4XS0 B; 3GYS A; 1HBR B; 1I3D A; 3GK9 A; 1BBB B; 1CLS A; 3MKB B; 1YHR A; 3NMM B; 1Y0C A; 2BLH A; 1NQP B; 1QI8 B; 3E55 A; 1J7W A; 4N7N B; 1NEJ B; 1BZ0 A; 1ABW A; 5B84 A; 1DUK A; 3BJ2 B; 1OUU B; 1YGF B; 1X9F C; 1AJH A; 1ECN A; 4ROM A; 2G0R A; 4M4A A; 4FWX A; 1G09 A; 3O7N A; 1MZ0 A; 3LB4 A; 4LPI A; 3D17 B; 3WR1 A; 3OJ1 A; 1XZU B; 2D2M C; 2DHB A; 1SDL B; 2XKI A; 4NZI A; 1NIH B; 4MQJ A; 1O1J B; 2R4W A; 1DWR A; 1MYF A; 2M6Z A; 2G0V A; 2VLZ A; 3PI3 A; 1A00 B; 1XCH A; 5ILE A; 2R1H B; 1OFJ A; 3UGZ A; 4BJA A; 1O1N B; 3AT5 B; 1MLG A; 3DHT A; 3PIA B; 1YIE A; 2AA1 B; 1G0A B; 2V1H A; 1JF4 A; 2ZFO B; 5JDO F; 1O1P A; 1Y0A B; 1K0Y A; 4MQC B; 1FAW B; 1YOH A; 4PQB A; 1YGD B; 5EV5 A; 4NK1 A; 1Y4F B; 3EDA A; 1YVQ A; 2D6C A; 2ZFB B; 1YEN B; 1XZ7 B; 2W72 C; 2ZLT B; 1LFL B; 1LH7 A; 3R5I B; 3AQ7 A; 1YDZ B; 1MLK A; 3PT7 B; 4G51 B; 4MQG B; 1CP5 A; 2SPN A; 1FN3 B; 4SDH A; 1HBH B; 1ASH A; 1V4W A; 1O1K B; 2RI4 B; 2WTG A; 1MNI A; 3OO4 A; 3OZU A; 1JL6 A; 3PT8 B; 2NSR A; 2ZS1 D; 2V1J A; 3B75 A; 1YEQ B; 3BCQ A; 1Y4R A; 3UH5 A; 1AZI A; 3HF4 B; 2GL3 A; 1SPE A; 1RQ4 A; 1WLA A; 2ZLU B; 5HLQ A; 2ZSN A; 1ABS A; 3BA2 A; 1C7D B; 1V75 A; 1YEV B; 1X9F D; 2ZST A; 3PEL B; 1YZI A; 1MNJ A; 1Y83 A; 3IC0 A; 1Y09 A; 3ONZ A; 3QJD A; 4H0B A; 3MJU A; 1C40 B; 2D2M D; 3BJ3 A; 4TYX A; 5E6E A; 1KD2 A; 1CIK A; 2BW9 M; 1HBS B; 4IRO B; 1BVC A; 3GQR B; 1K1K A; 3ZJO A; 2HBC B; 2LH5 A; 1KFR A; 3MJP B; 1MOD A; 2HBF B; 2GTL B; 5CN4 A; 3SZK A; 1Y31 A; 3ZHW A; 1NPG A; 4HBI A; 1XZ5 B; 2ZLX A; 1DWT A; 3GKV A; 3HYU A; 1YG5 A; 4F6D A; 3EU1 A; 5SW7 B; 3ECZ A; 1J40 B; 2VLX A; 2MGL A; 1YHU C; 3WFT A; 2AV0 A; 5ILR A; 2V1G A; 2VYY A; 5ILM A; 2HZ3 A; 2MYE A; 5CN7 A; 3QZZ A; 1BIJ B; 1LFY A; 1GBU B; 1MBD A; 4HRR A; 1MYZ A; 1RTE A; 4F6F A; 2YRS A; 3GYS B; 5JDO D; 1CLS B; 1VXA A; 1HDB A; 2VM0 A; 2MGH A; 1C7B B; 1N9F A; 3S48 C; 1N9I A; 4DC7 A; 1J7W B; 1BZP A; 3UI0 A; 1BZ0 B; 1ABW B; 5CNE A; 1YE2 A; 3IC2 A; 1MWB A; 3K3U A; 4MXK A; 5C6E A; 3WTG B; 1COH B; 5MBA A; 2ZWJ A; 4ROM B; 2VYZ A; 3A0G B; 1C7C A; 1FCS A; 4M4A B; 3G4Q A; 1G09 B; 3WCW C; 5AZR A; 2DXM A; 1N9H A; 3WR1 B; 1UMO A; 2R80 A; 4MQJ B; 3TM9 A; 1QXD A; 1TU9 A; 2GNW A; 2M6Z B; 2QSP A; 1VXE A; 2HZ2 A; 1EWA A; 4YU3 A; 2LHB A; 1HBA A; 4NXA A; 1S0H A; 1UFP A; 7HBI A; 2EKU A; 1IT3 A; 3DHT B; 1VHB A; 1MLL A; 1DXD A; 1YIE B; 3ODQ A; 1LUE A; 3WFU A; 1JP6 A; 2ZSO A; 2H8F A; 3FS4 B; 1HDS A; 1JY7 A; 2PGH A; 1WMU B; 1UIW A; 1MLR A; 1O1I A; 3UH3 A; 1GZX A; 5IKS A; 3NL7 A; 1YE0 B; 2H8D A; 4OF9 A; 2Z8A A; 2QLS A; 3MOU A; 3D7O A; 1VXH A; 3UHI A; 6HBW A; 5E83 A; 2AUQ A; 1HLB A; 3QJE A; 1Y7G A; 1LH2 A; 1YHU D; 1YFF A; 1OJ6 A; 1V4W B; 1V9Q A; 1LFZ A; 3OO4 B; 2G14 A; 3WFX A; 1U7R A; 2MYB A; 1XZ4 A; 5EOH A; 3DHR B; 3B75 B; 1QSI B; 1Y4R B; 1CIO A; 2MGE A; 4ROL A; 5KDQ A; 1HDA B; 3AQ6 A; 2DN3 A; 1JW8 A; 1U7S A; 1Y4G B; 1EBT A; 1HAC A; 1OFK A; 1OBM A; 1YZI B; 4N7P A; 1QPW A; 2QU0 A; 3IC0 B; 1Y09 B; 3ONZ B; 1ECO A; 2B7H A; 4M4B A; 2VRY A; 2QFN A; 1ECA A; 2D5X A; 2E2Y A; 3BJ3 B; 1RQ3 A; 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