2RAYX

Beta-chlorophenetole in complex with t4 lysozyme l99a
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Rescoring docking hit lists for model cavity sites: predictions and experimental testing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2rayX00
200LA 191LA 1C6JA 1LYIA 1LYJA 137LA 2LC9A 1L79A 201LA 1C6HA 1L46A 1L02A 2LZMA 2RAZX 1P64A 1LGWA 3FI5A 1L05A 1LYGA 169LA 157LA 1LI2A 1D3FA 4EKRA 3HUKA 1OWZA 1QS9A 4S0WA 236LA 4I7QA 3C8QA 4GBRB 217LA 1PQJA 3DN4A 1C6BA 158LA 3HTFA 1L03A 112LA 1G06A 1G0PA 3HT9A 4I7TA 1JTNA 1L49A 1CTWA 1QS5A 2B6ZA 1C62A 1L30A 2F47A 1L89A 1EPYA 166LA 3SN6R 2RB2X 231LA 1L72A 4ARQB 251LA 3SB7A 1QT8A 1L25A 1OV5A 244LA 5LZMA 1XJUA 3QAKA 245LA 252LA 1L58A 1L39A 225LA 3RZEA 1DYEA 1QTVA 1C6IA 226LA 1D3NA 1L56A 1C63A 1CVKA 1L83A 3HTDA 171LA 2RB0X 1QUGA 119LA 1C64A 1L0JA 1KW7A 155LA 1LLHA 1L22A 4E97A 1C6MA 3DN6A 1DYCA 1QUOA 2O4WA 3OE0A 199LA 1C6NA 109LA 144LA 1C65A 2OEAX 1CV3A 238LA 1L66A 3SBBC 3JR6A 1L29A 1L28A 3CDVA 1L63A 1G0MA 4I7OA 1QSBA 2B72A 1G0KA 150LA 1ZWNA 3SB5A 1C66A 1L45A 1G1WA 3GUIA 1L21A 115LA 4ZPUA 1C6CA 258LA 3HTGA 3HT7A 1L23A 1C61A 242LA 1L40A 253LA 3DN0A 120LA 1L86A 2RB1X 104LA 3HH3A 4W59A 212LA 1P56A 3DN8A 1G0LA 167LA 1CX6A 1K28A 4DKLA 3L2XA 1CU0A 1L06A 1QTDA 1WTHA 4W58A 3PBLA 3DKEX 1LW9A 4ARQA 4W54A 1PQDA 3DMXA 2OTZX 3F9LA 1L70A 111LA 1LYEA 4K5YA 4I7NA 4I7PA 1KW5A 1C6LA 2HUMA 1L68A 108LA 1OVHA 1XJTA 3D4SA 118LA 3DN1A 3C81A 4YXCA 2B6WA 1P46A 1DYGA 1T8AA 4DJHA 1L07A 1C6TA 1CU6A 1P2LA 3EMLA 114LA 1L97A 196LA 143LA 1G0QA 4I7SA 1OV7A 1DYDA 1PQIA 3HU9A 175LA 1C60A 1L74A 1SX7A 259LA 165LA 1L94A 3CDRA 1LI3A 1L81A 3FADA 2OTYX 246LA 1L38A 1L31A 1L57A 1L96A 4ARLA 1KNIA 1L32A 3C82A 227LA 232LA 3HT8A 4EPFA 2B6XA 1C6DA 1L10A 4I7MA 3CDOA 2B75A 1L13A 1L47A 152LA 162LA 1L52A 262LA 4LDEA 3GUPA 4PK0A 1QTHA 2RBQA 1PQMA 1L54A 2RBNA 3SB8A 229LA 1L55A 2B6TA 1PQKA 130LA 183LA 260LA 174LA 3HU8A 1L18A 188LA 2QARC 1L20A 1SWYA 1JTMA 107LA 1L27A 2RAYX 4IAPA 7LZMA 3C8SA 3HDEA 1L80A 3RUNA 4ARJA 1SWZA 4EPIA 1QTZA 122LA 1CU2A 1NHBA 243LA 3C8RA 1QUDA 1G0GA 1D3MA 1B6IA 1L73A 1L00A 3F8VA 4W52A 209LA 1P3NA 220LA 3NY9A 1L50A 4LDLA 3DNAA 4I7KA 1KY1A 1LYDA 1CU5A 178LA 1QT6A 2OU0X 2HUKA 3GUMA 3PDSA 2QB0B 3C7YA 3C80A 3V2YA 1D2YA 1SSWA 161LA 3HUAA 1G0JA 1L87A 138LA 2Q9EA 4EKPA 1G07A 192LA 1D3JA 3C7WA 1D2WA 1L67A 3FA0A 3SB6A 1QSQA 102LA 1OWYA 1L17A 103LA 184LA 3VW7A 195LA 146LA 1P36A 1QT5A 1P2RA 219LA 206LA 4YX7C 1L36A 1P5CA 1L01A 3C83A 2CUUA 1L42A 1LYFA 233LA 3HH6A 1C6AA 1P37A 1L75A 218LA 2LCBA 1KS3A 1ZYTA 241LA 181LA 1P7SA 1CUPA 1LWKA 211LA 2L78A 113LA 4W57A 1L91A 3HT6A 1L82A 2B73A 1KY0A 4AQNA 1L41A 3HH5A 198LA 3OE9A 1CV0A 261LA 1XEPA 210LA 189LA 1LPYA 1OYUA 139LA 4EXMA 2RH1A 1CV5A 4I7LA 3NY8A 141LA 1L51A 1QUHA 234LA 2F32A 123LA 1L99A 4I7RA 1TLAA 3HTBA 4YXAC 1PQOA 6LZMA 182LA 3OE6A 1DYAA 1L14A 214LA 1L0KA 1LGXA 1L60A 185LA 4DAJA 4EKSA 3HUQA 1SSYA 4W55A 1L11A 2F2QA 1CV1A 145LA 142LA 2ANVA 4ARMB 1L33A 1T97A 3SBAA 3C7ZA 190LA 3HWLA 3SB9A 4OO9A 2OE7X 240LA 3DMZA 3UONA 3V2WA 1LGUA 3DN3A 1L69A 1CU3A 164LA 1L98A 2B7XA 222LA 254LA 1OVJA 125LA 1D9WA 151LA 1P6YA 1L62A 2RBRA 1T8GA 1CX7A 4PJZA 1L71A 1C6FA 2RBPA 3GUOA 1G1VA 1QTCA 1L09A 1DYFA 3K2RA 1C6GA 221LA 4ARPA 1L53A 230LA 1OVKA 129LA 1L44A 3DN2A 215LA 1L15A 4W53A 4W51A 235LA 2O7AA 1QT3A 1L61A 2HULA 3L64A 4GRVA 1L04A 1L85A 2OE4X 1L92A 1L08A 1L19A 216LA 3NYAA 1QT7A 1L16A 168LA 1LYHA 250LA 2OE9X 149LA 1C6QA 1L24A 1L43A 2B74A 2B70A 1L84A 160LA 1L64A 1L48A 2O79A 3LZMA 4W56A 180LA 159LA 248LA 127LA 170LA 2NTHA 247LA 176LA 1DYBA 228LA 3GULA 3ODUA 1C69A 140LA 4LDOA 3OE8A 1QT4A 3GUJA 187LA 1T6HA 1ZURA 3DMVA 205LA 3G3VA 1T8FA 1JQUA 4EJ4A 5I14A 3G3XA 255LA 256LA 223LA 172LA 1C68A 1CV4A 177LA 1L93A 3HDFA 156LA 4ARMA 1L88A 147LA 2NTGA 249LA 148LE 1QTBA 3CDTA 1LI6A 1L77A 239LA 4I7JA 1C6EA 1L35A 2IGCA 237LA 1L26A 1L37A 3GUNA 224LA 257LA 1C6KA 1LWGA 2OU8A 1L95A 1L59A 2RBSA 1L76A 126LA 186LA 3HH4A 4EKQA 3GUKA 110LA 1L34A 2Q9DA 3CDQA 2A4TA 1SX2A 2RBOA 4LZMA 173LA 1L90A 3G3WA 2ANXA 1I6SA 213LA 163LA 2Z6BA 1CUQA 2OU9A 128LA 1C6PA 1L65A 197LA 2B6YA 1L12A 1CV6A 131LA 1C67A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HEMA 1OUEA 1JWRA 2HU3A 4BADA 1OUGA 1C6JA 2YSSC 2YDGA 1OUCA 1RE2A 1L79A 1C6HA 1L46A 5L9JA 1GFTA 1UBZA 157LA 1D3FA 5K7OA 4EKRA 4ZIXA 4DDCA 4S0WA 1DZBX 236LA 5ILCA 2RSCA 3DN4A 158LA 1LMPA 1BWJA 1L49A 1C62A 1L30A 1REXA 4NIJA 1YL1X 2Z2EA 166LA 4ANRA 5FELA 3A95A 1GB6A 1LHHA 2BQEA 1BB4A 3SB7A 1QT8A 1LZAA 1WTNA 1IP6A 5KXOA 1JTPL 3QAKA 4HJVA 252LA 4XENA 1L39A 225LA 1WQNA 1B5VA 2DBTA 1LJ4A 1KXWA 1VDQA 1C63A 3HTDA 5KJ9A 119LA 2Z19A 4XJGA 155LA 4G4BA 3TXEA 1EQEA 1HELA 2YBLA 1BWIA 1WTMA 1IWTA 1OUIA 1UIBA 3DN6A 1QUOA 3OE0A 3W6AA 3TMXA 1IWYA 4X3BA 4BS7A 4TWSA 3D9AC 1PS5A 238LA 5LAFA 2Z12A 4H93A 1VFBC 2DQHY 1ZWNA 1TCYA 3SB5A 3ZEKA 1XGPC 4O34A 2MEFA 4NG8A 115LA 1DPXA 1C6CA 1LPIA 2IHLA 4OWAA 1UUZC 3DN0A 120LA 3W6FA 1JTTL 1E8LA 4GCEA 1IP3A 3DN8A 5EBHA 5I5QA 1B9OA 1HSWA 1L06A 4W58A 4W54A 1PQDA 1YL0X 2OTZX 3F9LA 1AM7A 1OUBA 4K5YA 1LSPA 1C43A 4B4IA 1C6LA 3D4SA 4H9CA 1QTEA 1YANA 3P66A 1NDMC 1GE0A 3TXJA 4CGEA 4WM6A 3B0IA 4YXCA 4H8YA 4CFOA 1L07A 1WQOA 1YAQA 1HF4A 1OV7A 1DYDA 2DKVA 4DD3A 1C60A 4W94A 259LA 3W3EA 1LZCA 3CDRA 1GFEA 3TXHA 1LYOA 3N9AA 1KNIA 3C82A 1G7HC 232LA 1KIRC 1C6DA 4I7MA 3CDOA 1HHLA 262LA 4HV2A 3N9EA 4NGYA 5LVJA 3IWRA 1CJ6A 2HECA 4B4EA 4NSHA 2B6TA 4DC4A 1LZSA 183LA 2AUBA 260LA 4KPMA 5C6JA 1L18A 3HBEX 1JHLA 3P4ZA 1GFGA 4OWEA 1JTMA 2YBMA 7LZMA 1L80A 2BLYA 4ARJA 1JSEA 1F10A 122LA 1CU2A 1QSWA 3C8RA 1JKDA 5T3FA 3MGWA 1N4FA 1L73A 4Z3MA 1LHLA 4W52A 209LA 220LA 1DI5A 3NY9A 4LDLA 3WXUA 5B59A 1XEJA 4B1AA 1QT6A 2HUKA 3PDSA 1GBYA 1ZV5L 4LFXA 2QB0B 4NWEA 2MECA 2D6BA 1SSWA 1LHMA 4NGJA 3GXKA 2Q9EA 1JJ0A 1IC7Y 3SB6A 4OOTA 1OWYA 184LA 1OUFA 1JPOA 1P2RA 4YX7C 3CB7A 1L01A 2CUUA 4J1AA 1L42A 233LA 2F4AA 1LYSA 1GE1A 4YM8A 1GF8A 1HFXA 1LKRA 1JJ3A 3TXGA 5LA8A 1GF3A 1GBWA 4W57A 4LT3A 5C6IA 1GB5A 1L82A 1B7RA 1FLYA 4NGKA 1XEPA 1REMA 189LA 1LJKA 2RH1A 2EIZC 1ZVHL 1QUHA 5FEKA 1L99A 1PQOA 6LZMA 3W6CA 3B72A 182LA 1L14A 1LGXA 4ML7A 4MR1A 2GV0A 3RW8A 5LVIA 185LA 2XJWA 1L11A 1LSFA 2ANVA 3KAMA 142LA 1L33A 4RW1A 3WU9A 3C7ZA 3WPKA 3IJVA 1A2YC 240LA 3UONA 1GBOA 1JITA 4LYTA 2BQLA 1CU3A 1L98A 222LA 125LA 1IWWA 1D9WA 1L62A 5JENB 4OWHA 4GLAA 4LFPA 1NF5A 1LJJA 4DQ7A 3A8ZA 3CT5A 3M3UA 4DQJA 4GCBA 4W53A 1QT3A 1D6QA 4GRVA 3AGHA 1LJIA 1L08A 216LA 1XGTC 4YENA 2LZTA 3A67Y 3J6KA 1L84A 2O79A 1G7IC 1GAZA 180LA 4PRQA 176LA 1QT4A 1AKIA 4R6CA 5KXRA 2ZILA 1LJ3A 1P2CC 1ZURA 1T8FA 1LZEA 1LHJA 4XN6A 3EO5A 2D4KA 1I56A 177LA 156LA 1L88A 1MELL 5D5FA 239LA 1C6EA 2IGCA 237LA 2ZIKA 4RLNA 1ALCA 4P2EA 257LA 1GDWA 1LWGA 1L76A 4LT1A 186LA 3HH4A 2HEFA 2G4PA 110LA 2HU1A 5KXKA 3G3WA 3FI7A 4DD0A 5KXYA 1IP2A 5LINA 1CUQA 128LA 1L65A 3A6BY 1NBZC 197LA 3QE8A 200LA 3WUAA 4M4OA 3WPLA 2YBNA 1LYIA 4GLVA 137LA 1GEVA 2Z2FA 1WQRA 5I53A 1NBYC 6LYZA 1LZBA 1GE4A 1LYGA 1AT5A 1BHZA 4ETBA 1FKVA 3HUKA 1OWZA 3C8QA 1XGUC 3TMUA 3AZ7A 1C6BA 112LA 3BKHA 3AW6A 1GD6A 4I7TA 1CTWA 1QS5A 2DQJY 1GF9A 2WARA 2ZYPA 135LA 2Y8PA 1EPYA 1GFAA 5LYZA 3SN6R 3WUMA 4XJBA 1MLCE 1L72A 1GF0A 251LA 1GF6A 1XJUA 2MEEA 3T36A 1VEDA 4NSGA 3RZEA 1IORA 4OW1A 1D3NA 1OUAA 1CVKA 1L83A 3WVYA 3WVXA 171LA 2RB0X 1QUGA 1GF5A 1L22A 1C6MA 4DD1A 1YAMA 4NHPA 1C6NA 2G4QA 1DXJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HEM A;  1OUE A;  1JWR A;  2HU3 A;  4BAD A;  1OUG A;  1C6J A;  2YSS C;  2YDG A;  1OUC A;  1RE2 A;  1L79 A;  1C6H A;  1L46 A;  5L9J A;  1GFT A;  1UBZ A;  157L A;  1D3F A;  5K7O A;  4EKR A;  4ZIX A;  4DDC A;  4S0W A;  1DZB X;  236L A;  5ILC A;  2RSC A;  3DN4 A;  158L A;  1LMP A;  1BWJ A;  1L49 A;  1C62 A;  1L30 A;  1REX A;  4NIJ A;  1YL1 X;  2Z2E A;  166L A;  4ANR A;  5FEL A;  3A95 A;  1GB6 A;  1LHH A;  2BQE A;  1BB4 A;  3SB7 A;  1QT8 A;  1LZA A;  1WTN A;  1IP6 A;  5KXO A;  1JTP L;  3QAK A;  4HJV A;  252L A;  4XEN A;  1L39 A;  225L A;  1WQN A;  1B5V A;  2DBT A;  1LJ4 A;  1KXW A;  1VDQ A;  1C63 A;  3HTD A;  5KJ9 A;  119L A;  2Z19 A;  4XJG A;  155L A;  4G4B A;  3TXE A;  1EQE A;  1HEL A;  2YBL A;  1BWI A;  1WTM A;  1IWT A;  1OUI A;  1UIB A;  3DN6 A;  1QUO A;  3OE0 A;  3W6A A;  3TMX A;  1IWY A;  4X3B A;  4BS7 A;  4TWS A;  3D9A C;  1PS5 A;  238L A;  5LAF A;  2Z12 A;  4H93 A;  1VFB C;  2DQH Y;  1ZWN A;  1TCY A;  3SB5 A;  3ZEK A;  1XGP C;  4O34 A;  2MEF A;  4NG8 A;  115L A;  1DPX A;  1C6C A;  1LPI A; 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