2RC7A

Crystal structure of the nr3a ligand binding core complex with glycine at 1.58 angstrom resolution
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
284
structure length
284
Chain Sequence
KLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAGQLCLDPMTNDSSMLDRLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEQLAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLSGTANMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRGTELSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVQYLKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTSNISELISQYKSHGFMDVLHDKWY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit 3A
publication title Molecular mechanism of ligand recognition by NR3 subtype glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 99
structure length 284
sequence length 284
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10613 Lig_chan-Glu_bd Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rc7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rc7A02
3MZBA 1SW2A 1TWYA 1XC1A 2DP8A 5KCJA 2H25A 3Q28A 3IR1A 5HM4B 1S9TA 1LFHA 2ONSA 1B7ZA 3LSFB 4OQOA 3U72A 1SYIA 4GVOA 3FJ7A 2HFBA 3PUYE 2NVUB 4ZDMA 1Y3PA 1ZJLA 5FTIA 4QFLA 4JSOA 4OHNA 5JK4A 5I56B 1P1QA 2HAUA 2F6GA 4R9FA 3SEXA 3KOTA 4NMYA 1SD3A 3ZKKA 3HHFA 3QXMA 2X7QA 3VLWA 1MY0A 3FV1A 4F1YA 5JTYB 1II5A 4C1UA 1NNFA 2DOJA 4QSEA 1I69A 3TCHA 4R2FA 2H4IA 2I6EA 3OEMA 5CMCA 4O3AA 3C33A 3QSLA 4G77A 4Q30B 3G3GA 5F1QA 2DWJA 1B58A 3HO7A 5TP9A 4KYDA 1JW1A 4ELPA 2CZLA 3OO9A 2V25A 2ZXTA 3MVZA 3BFTA 3TDJA 5ICQA 2E0SA 1QULA 3A09A 1B0HA 4FATA 4F1UA 3W9VA 4ZE8A 5B70A 1S7YA 2O84X 3LBSA 5CI5A 4NF6A 3UORA 3IO6A 4AQ4A 1OIBA 3TEPA 4N13A 5FHNA 1POY1 3MWBA 2Q89A 3H6VA 2ZNUA 4KCDA 5I2KB 2Y7PA 1MY2A 2B65A 4LONB 3G3FA 4WEDA 3O6HA 2XX8A 4OTEA 3KN8A 3N5LA 3PUVE 4THIA 1IITA 4EUOA 2OWSA 3IOTA 5A5XA 4I9DA 5B7DA 1USYH 1SBPA 4OXVA 1N76A 4IB2A 4GLIA 3QIMA 1ZBMA 3MBPA 1SI0A 2DVZA 2F7AA 4PFTA 3OXNA 1EZ9A 2Y84A 4EXLA 3K6VA 3MW0A 4GOTA 3GXAA 3KN3A 3TQWA 2XXUA 4IO6A 2FYIA 3T93B 1Y3QA 4DXBA 4F3SA 2OJTA 4YKJA 5H8NB 1BTJA 4TLLB 1PB9A 3FJGA 2WKYA 2QJEA 4U1ZA 2DSFA 4OEVA 4F22A 3FZVA 3T96B 3DELB 1N7WA 4OYVA 3TTRA 3CIJA 4BDQA 4GL0A 4QFOA 1DTGA 1B3GA 4EQ7A 1O64A 1R9LA 1FTLA 5CM6A 4GFRA 4P11A 1B6HA 4OERA 4JSDA 3IOVA 4XXUA 1N84A 4OENA 4X1BA 3MPLA 3Q26A 3L6HA 1VFEA 1OVBA 4OETA 5AE4A 3RUMA 3KJTA 4HS7A 3FUZA 4BDRA 1LAFE 1A54A 3FXRA 4R75A 4LZ8A 3UIFA 1URSA 3TYHA 1QKAA 5CMMA 2F36A 4QRZA 1EU8A 3IOWA 4R6KA 4YKPA 1B2HA 1NKXA 3SKPA 4XKQA 3V5AA 2YPNA 1DMBA 1YCJA 2VGQA 2AYSA 3QUJA 2H9BA 1MXVA 4TLMB 3UGWA 3UP9A 1SVXB 2F7BA 3BFUA 2ANJA 1D4NA 2YJPA 3TTLA 4R9GA 4MF3A 1XHYA 2XHDA 5KDTB 1MH4A 1NNKA 1WVJA 3KG2A 3RTFB 1TXFA 2DS9A 3KFMA 4POWA 1QJMA 3VVEA 1NMUA 2Y7RA 3FJMA 2D5WA 3S9EA 3PMVA 1JVYA 5CBSA 1PBPA 2RC9A 4I8CA 4LP2B 3DM0A 1NFTA 2D3IA 2W7YA 4NEDA 4I62A 4E0XA 1LCTA 2A5TB 1RYXA 1Y4TA 3KJ7A 2ZNSA 3DP8A 5H8FB 4MFIA 1OLCA 4KI0E 1BIYA 1T0KA 1YTVA 1B32A 3OELA 5LOMA 4G8HA 3GBAA 3PV0E 1MPDA 4YICA 2HEUA 2ABHA 5HBCA 3U92A 4KFQA 3D4GA 4QF9A 3MVYA 4ELRA 3QK6A 2HZLA 2OLBA 2XXWA 4Q0CA 2D21A 1US4A 4G68B 4PQJA 1SQYA 4C0RA 2E1SA 3I6VA 1SDXA 3OO8A 4HW8A 1URDA 4HTGA 3IORA 1B05A 1B46A 3FGSA 3E4RA 4IY6A 1D9YA 3PUWE 3RLFE 5BUUA 1PC3A 3TCGA 4RJZA 4R6YA 3UA8A 2PYYA 2DQVA 3V89B 1MH3A 2RCAA 4YB7A 1B40A 3SDFA 3SEUA 2GFEA 5ITPA 1UIVA 3RQTA 3FIRA 3U94A 3IB0A 1AH5A 5L9OA 1LAHE 5I2NB 3S9MC 2I3WA 3EPEA 3PPNA 4PE5B 1IUDA 4BDLA 1VE4A 5DVFA 1NNTA 4PFUA 4LQ2A 3TKDA 2XXIA 2Z8DA 3RTWB 5TPAA 3OO6A 1MDQA 1FQCA 2P1SA 4QSDA 1LFIA 3FV2A 4OFLA 5I59A 3KSJA 1R9QA 2QPQA 1UTBB 3EQ1A 3PGFA 1B3EA 4H5FA 2UXAA 5CMBA 3IX1A 2ALUA 3I5OA 1MM6A 1NH8A 3S9NC 4EQ9A 4JWXA 1FTKA 1AMFA 5F7VA 2XXRA 3B6TA 3DP6A 1B3LA 3E9XA 5ISUA 1FQEA 3IOUA 1DPPA 1QUKA 5AA3A 2Y7IA 3FVKA 1H44A 5AA1A 1EH3A 1MY4A 1B51A 1F9BA 3MZ9A 1SW1A 4JWOA 4BDMA 4R2BA 2GH9A 4F18A 4NF8B 3LSXA 4GXSB 4ZZAA 3FD3A 4EXKA 1MY1A 1GGGA 2V93A 1LCFA 4ZZEA 2F97A 4H6DA 1MS7A 1P99A 1FTMA 3OOAA 3TELA 4GF8A 1ZLQA 2G29A 2OCUA 2PMSA 2HXWA 5I84A 3K00A 1DPEA 1A55A 5KZTA 2RC8A 1FTOA 2VD2A 4NWDA 2CMOA 3ZS6A 4U4SA 3E13X 1OQHA 1GTKA 4KYEA 4LA9A 3CSGA 1N7XA 1UTHB 2ZNTA 1N04A 3MP6A 1IXCA 1XS5A 3K01A 2DWHA 4BDOA 4XKNA 4OVJA 4DDDA 1MDP1 1I6QA 2V3TA 5ICTA 4K3FA 2F34A 1IZ1A 1MQGA 1M5EA 2DWAA 3O28A 3MZ1A 3FXUA 3KSXA 3CG1A 2NUVA 5DYHA 3TTMA 3S4UA 1ZKBA 1A40A 3A3UA 1RYOA 3C34A 4NF4A 5H8HA 2Z22A 3PD9A 4UACA 3VVDA 1B1XA 5AA4A 4JXIA 1Y3NA 3TFLA 5I57A 3LSWA 1FQFA 4JDFA 2NOOA 3R6UA 3O29A 4OESA 2NWJA 5KCJB 4F19A 5DVIA 4KYSA 2QRYA 2AIXA 1MXYA 2DE3A 2ZYNA 3O97A 3EHTA 4H67A 2DE4A 2QMXA 4IY5A 3VXBA 1TT1A 1Q35A 3C4MA 3H6UA 2P0SA 4WEPA 4KD5A 3RN8A 4GD5A 4F2QA 5IAIA 3B6WA 1MPBA 1UIUA 4MH5A 4KHZE 3IO4A 1ELJA 4ELQA 3MJNA 4WKMA 4G8MA 2F7CA 2Y7KA 1IXGA 1A8FA 1RKMA 3KZGA 2B3BA 2KLFA 2PVUA 2A5TA 4YZZA 5DEXA 3MAMA 1QUIA 3H03A 5H8FA 2AL5A 2LAOA 3M3KA 3G3IA 4G68C 4QFNA 1IXIA 3THIA 1MQHA 3Q25A 4JB7A 3IL1B 3MPKA 5TP9B 1B5IA 5HPQA 1PBQA 4G2ZA 2BJJX 1JW4A 1MQDA 1NL5A 3OMBA 4U21A 3CRBA 4H8JA 3IB1A 4XKRA 3C35A 4ZEKA 1IQ7A 1GR2A 2I0CA 3ILUB 4AB6A 5EHMA 4NWCA 3MP8A 4KPTA 1A8EA 4LZ7A 3O2AA 4G68A 4P0IA 4NF6B 1FQDA 4RPOA 3EN3A 2ONKE 5AA2A 1LBBA 3UK4A 3W9WA 4L17A 1XOCA 3K6UA 3KOSA 5L9MA 2HZKA 4PETA 2OK2A 2Q88A 3U93A 2XD2A 4RXLA 3Q29A 4YMBA 1JEUA 1R6ZA 2RF1A 4QFPA 2QSXA 4U23A 2IEEA 4ISUA 5CC2A 2Y7WA 4ZEIA 1JW5A 3RT8A 3SERA 1H3DA 4FECA 3BBRA 1JEVA 3H4ZA 2PT1A 1O7TA 3HHGA 4GIZA 3N26A 4R6HA 4OFJA 3TODA 4U2RA 1A99A 3UN6A 1SYHA 4FORA 4U1OA 1MXUA 2OZZA 5H8QA 3G3HA 4EQBA 4DCXA 1WDNA 4QHQA 3JV9A 1H43A 3PPQA 3FATA 1FCKA 2YLNA 1IEJA 4U22A 3CFZA 4G8NA 4Z7EA 4F31B 1XT8A 1M5CA 3LUYA 4ZS9A 2DYXA 2I3VA 3R7XA 1Y1ZA 1URGA 1OQGA 4OMBA 4M4GA 1OVTA 3OEKA 3PUZE 3D4CA 2REGA 2UVJA 1FW0A 2FNCA 1B9JA 2UYEA 1BLFA 3FXQA 3C32A 3O66A 4ONYA 3T66A 3G3KA 4HCYA 4I1DA 4DIGA 3N94A 1N3XA 4M1VA 1SW4A 4LVQA 4FAJA 3C36A 1LBCA 2RC7A 3CG3A 1HSJA 3EF7A 3P7IA 2H98A 3T22A 2PT2A 5I56A 2VHAA 4GQOA 1NH7A 3N6UA 4YB5A 2GHBA 4PP0A 4R73A 4ZEFA 3BKIB 2QS2A 5JTYA 4F2OA 5ELVA 2XXQA 4X48A 2Q2CA 3ONMA 1D3KA 2Q9TA 4P0GA 3OD7A 1N0TA 4UA8A 1YAEA 1OLAA 3IB2A 1POTA 1MXZA 2O6AA 1Y4CA 3RT6B 1CB6A 3O9PA 4DXCA 5I58B 3T9VA 1B7HA 2B3FA 3S2VA 2O1LA 2VOZA 4DXUA 3AXFA 2OBGA 2XXVA 1UQWA 4FE8A 2R9JA 1HSLA 3H06B 5CMKA 3USDA 3LC8A 4EDPA 3PMWA 3PPRA 3B7DA 2ZYMA 3LSLA 4DLDA 2I48A 1VFDA 1PEBA 3VE1B 1SW5A 1TFAA 3HV1A 2PBWA 3H3GA 5I2KA 3OENA 2O68A 4H65A 3M3FA 2DVCA 2XXYA 2O7IA 2PX1A 1LSTA 4IO7A 5EHSA 5TU0A 1YPNA 1VR5A 4FEBA 3TQLA 5DVJA 4FIMA 5BWJA 4OZ9A 3V8XB 3RY3A 4IO3A 1B0LA 3VVFA 4RK2A 1PB8A 1Z7NE 1LB8A 1HSEA 2RCBA 5IKBA 2F5XA 1B3FA 2NXOA 1XVXA 4F3GA 3Q27A 4RPNA 3JYRA 2REJA 5AA2D 4X1DA 2VD3A 4YKIA 5H8NA 1USYE 2I4BA 4NE4A 3TUSA 4O3CA 3I3VA 4POXA 2GRVA 4FEDA 3ZSFA 2ZMBA 4MBPA 3DLNA 3U8QA 3VFJA 1US5A 3FVGA 1EZOA 4JWYA 4Q8RA 4F3BA 2M8CA 2R71A 5CRYA 1M5DA 1FQAA 3CSBA 2IA4A 1BP5A 3K6WA 1MG1A 1S50A 3DP4A 4F1VA 3K0VA 4IO5A 4RY1A 4YAHX 3LR1A 5TPAB 3VLUA 4AB5A 1B4ZA 3OO7A 4MLQA 3H7MA 5I59B 4Q5TA 3H6WA 2OWTA 3IJOB 4DCYA 4C1TA 4GRKA 4LUBA 3KGCA 3SEVA 1JQFA 2THIA 3KN7A 3F11A 1QUJA 1Y20A 2QL3A 3C31A 3C9HA 1PB7A 2HQ0A 1LGBC 3HCQA 3K1NA 1WODA 4F39A 4NF5B 3K2DA 3WAFA 4LZ5A 4IGRA 4ESWA 1B7UA 1LB9A 2UYFA 3CR9A 3MP1A 1VSOA 1ATGA 1D9VA 3PU5A 3HPIA 2RINA 2F6PA 3SESA 3V83A 1QKBA 1AOVA 4RYAA 1A7LA 4IGTA 2ZYKA 5M2VA 5ITOA 2O51A 2XX7A 3WAEA 3VDFA 4N07A 4E0WA 3FASA 5KDTA 4QSCA 3FVNA 1GV8A 2O7UA 3S9LC 2V3UA 4YMAA 4ZECA 4KQPA 4LATA 1ANFA 3VLVA 1O63A 4TOZA 3IK6B 2I4CA 1B5JA 2ESNA 4OFOA 1MXXA 2H5YA 1MQIA 2Z23A 3T9XB 4H8IA 1SI1A 1QW0A 3TMGA 2DXRA 2I58A 3B6QA 3GBBA 1B52A 4ND9A 4YKKA 3G7WA 2UVIA 4ECFA 1IIWA 2UVGA 2R6GE 2AL4A 5H8SA 1JNFA 2RKMA 1DSNA 4N6PA 3QAXA 5K2XA 5FTHA 3T9HB 2Z8EA 2A5SA 3SEWA 4F29A 4KCCA 4R72A 1MXWA 1OMPA 1ZTYA 2HCAA 5DTBA 2ZYOA 3CVGA 3VV5A 1NNPA 4X9TA 4NF4B 5H8HB 2DXYA 4Z0IA 4QFKA 4F3PA 2Q2AA 3OSRA 4HCWA 1FTJA 5AA4B 5I57B 3K4UA 4H0WA 3TAJA 1L5TA 3PPPA 1B3HA 3ILTB 2X7PA 1M5BA 2V84A 1ZIUA 4XKPA 2ONRA 4GWOA 5A5XB 2VP1A 4H1XA 5FHMA 4ESXA 1N3WA 1ZMGA 1Y1MA 4DE8A 3MUQA 1MM7A 5I2NA 3RGYA 2QMWA 3HSTA 2I49A 1QVSA 4G4PA 4RK9A 1GVCA 2DE2A 3CFXA 1CE2A 1LAXA 1I6BA 1P1UA 4IO4A 1AIVA 5I58A 4ZE9A 1ZU0A 1UTBA 1B5HA 3H6TA 3KBRA 3GLBA 3VXCA 1P1NA 3MVWA 2XXXA 1P1OA 2QS3A 3ECRA 1PDAA 1DTZA 4BLAA 3K02A 4MLVA 5DEXB 4JBZA 3IAZA 3IJXB 3W15C 1B1HA 3MVXA 1MY3A 3G3JA 3N6TA 2F35A 3E3KA 4TQUQ 3R26A 2XXPA 4ELOA 1TFDA 4FJPA 3RNNA 3TPAA 2GHAA 4GXAA 5EYFA 5DT6A 4R74A 4NTLA 4KR5A 2XXHA 5FHOA 3FVOA 3SETA 3JZJA 1XVYA 4H5GA 2DWIA 1LAGE 2HAVA 3M8UA 1H76A 3HN0A 1H45A 5CBRA 2Q8JA 3RPWA 3PMXA 4EF2A 1EZPA 1MQJA 5AA2B 2H99A 4ZEBA 4NF8A 4U4XA 5JEIA 1J1NA 3TZAA 3PPOA 3TTKA 4LQ5A 1FQBA 4YB6A 1LLSA 1Z7ME 1MPCA 3PD8A 3EHUA 3SEYA 3CI8A 4RNSA 2XXTA 2F78A 3ZKLA 2QS4A 2P2AA 1DOTA 4DZ1A 1JVXA 3L6GA 2X26A 2G93A 1KWHA 3QUFA 5J1DA 3OSQA 4PFYA 4BDNA 3T9UA 2Z8FA 4OEUA 3M3LA 1UTHA 3PUXE 1I6AA 1M5FA 2UVHA 3EHSA 2O1MA 2XX9A 1AL3A 1R1NA 3ODBA 4XTCQ 5K2YA 4WXJA 3CFLA 4ZEDA 1MRPA 4GL8A 1Q1KA 3O6GA 4OWDA 1B4HA 3A3CA 2F8DA 3GZGA 4O3BA 5H8QB 4IO2A 4EF1A 3K6XA 2V3QA 5L8DA 1P1WA 3TCFA 3O6IA 4YU0A 3MQ9A 2I0BA 3K1MA 5L9SA 1JETA 4PFWA 3KEIA 3QYTA 2O69A 2FA7A 1Y9UA 4XIGQ 2QS1A 3MC2A 1IXHA 3U1OA 4RA1A 1BKAA 2XD3A 3K1PA 4NF5A 1LFGA 3TTNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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