2RC7A

Crystal structure of the nr3a ligand binding core complex with glycine at 1.58 angstrom resolution
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
284
structure length
284
Chain Sequence
b'KLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAGQLCLDPMTNDSSMLDRLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEQLAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLSGTANMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRGTELSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVQYLKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTSNISELISQYKSHGFMDVLHDKWY'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular mechanism of ligand recognition by NR3 subtype glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit 3A
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 99
structure length 284
sequence length 284
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10613 Lig_chan-Glu_bd Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rc7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rc7A02
3KSXA 2Z8FA 2YPNA 4R72A 1VE4A 4IO6A 3OENA 5HM4B 2GHBA 5BUUA 2XD3A 1MQJA 2XXTA 2G29A 1TXFA 3H6VA 1M5CA 1AH5A 2CZLA 4ELPA 4LZ5A 1MM6A 1LFGA 3M8UA 5FHMA 2DWAA 5LOMA 5L8DA 1MRPA 3EHSA 2HZKA 2R9JA 1B3HA 2QRYA 1XS5A 3DP4A 1PEBA 4H5FA 3OO8A 3OD7A 3T9XB 3C35A 5AA2B 2QMWA 3OEKA 2Z8DA 4PETA 4AB5A 3OO7A 4Z7EA 1LB9A 3O29A 1JETA 3HN0A 3OSRA 4BDQA 1B46A 1WDNA 2DYXA 2O7UA 4OXVA 4U4XA 2AYSA 2DSFA 3V5AA 4YMBA 2VHAA 3RTFB 1D4NA 1GVCA 1B58A 4KCDA 2P1SA 3PUZE 4C0RA 1PB8A 3U94A 3KN8A 3CR9A 4QFNA 4OTEA 3R6UA 1SI0A 3MPKA 2E0SA 3G3HA 1N3XA 4YMAA 4NWCA 2DXYA 3DM0A 3IOVA 4WEDA 5TP9B 2QS2A 1FQFA 4IGTA 1IIWA 3I3VA 3S9EA 2FNCA 4EXKA 2AIXA 2RC9A 4GD5A 4YAHX 5FTHA 1XVXA 2LAOA 1MXUA 2H99A 5CBSA 3FZVA 4GWOA 1QKBA 4GIZA 1B7HA 3Q26A 1TT1A 3S9MC 3DELB 1DPEA 3MZ9A 5KDTA 1R9LA 1SDXA 2RCAA 3KSJA 2IA4A 4ESXA 1H3DA 2BJJX 3MJNA 4ISUA 3T22A 3MWBA 4ELRA 5EHSA 2QS3A 4O3CA 1AL3A 2F6PA 2V84A 5AE4A 3F11A 4O3BA 3IB0A 3RQTA 4EQ9A 2B3BA 3IL1B 2NOOA 2THIA 5I59A 3QXMA 1PDAA 3H6TA 3LSWA 2DWJA 2GFEA 1XVYA 1SW4A 2Z22A 3DP6A 1MH3A 2F97A 1SW2A 2VD3A 2ZYNA 1USYH 2I0CA 1P1UA 3IJXB 4TQUQ 3EQ1A 1FW0A 3VV5A 2H4IA 4NF4A 3GXAA 4QHQA 2ZNUA 1Q1KA 2PBWA 3RY3A 1TWYA 1HSLA 4C1UA 5B7DA 1IUDA 3TFLA 1ZTYA 2VD2A 4NF6B 5H8QA 3V83A 5DTBA 3FD3A 4LONB 3HCQA 1MM7A 1QUKA 2RF1A 4GF8A 1NMUA 1OQHA 4G2ZA 4EQ7A 2ABHA 2ONRA 4GXAA 4JDFA 3AXFA 3IOWA 1ZLQA 4EDPA 3TCGA 3FXQA 4MH5A 4NE4A 4JXIA 4KQPA 1JNFA 1F9BA 2I49A 4ESWA 2QSXA 1URSA 3EN3A 3KJ7A 2GHAA 4LZ8A 3B6WA 4QRZA 5CBRA 1DPPA 3USDA 1M5FA 1OVTA 4GLIA 2REJA 1IZ1A 1B3GA 4FATA 3BFUA 4NF5B 4PQJA 3G3KA 5L9OA 4QFKA 2R71A 3C31A 3G3GA 2VOZA 1MXWA 1B7ZA 4U22A 3RT6B 3IO4A 2O1LA 4X1DA 3SEXA 4ZEIA 5I2NA 4I62A 3HO7A 3TCHA 1MXYA 5ITPA 4YKJA 1POY1 4X48A 4E0WA 3O9PA 3JV9A 3VXBA 4BDOA 2XXHA 3M3LA 4NEDA 3W9VA 5H8SA 1A8FA 1D9VA 2OBGA 2E1SA 4F18A 1AMFA 4ND9A 1GV8A 2WKYA 2H25A 3MVYA 5CMMA 5K2XA 3SETA 2Y7WA 1PC3A 4KFQA 3MUQA 3T9HB 1H76A 4TLMB 4E0XA 4POXA 1FTJA 4UACA 4QSDA 1Y3PA 4YZZA 2Q89A 3OO9A 1LAXA 3CSGA 2P0SA 2XX8A 5DT6A 3ZKKA 1RKMA 3KOSA 3ONMA 3D4GA 5J1DA 3IOUA 3N6TA 4OESA 3V8XB 4KPTA 3R7XA 3VVDA 2D21A 1GR2A 4M1VA 1Y20A 2XD2A 1WODA 4AB6A 4F1YA 1UQWA 1H44A 1HSJA 4XKPA 2Y7KA 4XKNA 4EF1A 3LBSA 1B51A 5I2KA 3VLWA 3EF7A 2Q2AA 4G68B 1QW0A 1SW5A 3H7MA 5A5XB 1FQAA 3H4ZA 3TTKA 3K6UA 4PE5B 1VFEA 5DEXA 3RNNA 3HHFA 3T96B 4LQ2A 2DE2A 2XXQA 4RK2A 1URGA 5IAIA 4LVQA 4HCYA 1NNFA 2IEEA 1QVSA 5H8HB 3OMBA 1B7UA 3FV2A 4F1UA 4KYEA 1IXHA 3ODBA 5L9MA 3ECRA 3M3FA 2RC7A 2V3TA 4IO3A 4OENA 3N5LA 4BDMA 2ZYMA 4H8IA 2G93A 3CI8A 1SYHA 2ZNSA 3TAJA 4ZZAA 3R26A 1B52A 1A54A 4IB2A 1B2HA 4OQOA 4FEDA 4BDNA 4LZ7A 4EUOA 5DVIA 2O51A 3JYRA 3KEIA 2ALUA 1FQCA 1GGGA 4F2QA 3FJ7A 2CMOA 1Y4CA 2RINA 3MW0A 1Y3NA 1JW4A 5I58A 4FORA 2PMSA 5AA4A 1I6AA 3K4UA 2V3UA 2UVHA 3OO6A 1OLAA 1OVBA 3B6QA 3H6WA 3IK6B 4HS7A 1BKAA 3BFTA 3CRBA 4RYAA 4PP0A 4F31B 4YB7A 1D3KA 4XIGQ 5CMBA 5KCJB 5F7VA 4FJPA 2Y84A 3TTRA 3FGSA 4ELOA 3LSFB 2F7BA 2O7IA 3P7IA 2I48A 4AQ4A 2DP8A 4U2RA 2ONKE 3TZAA 5AA2D 3N94A 3K6XA 4G68C 1NNPA 3VVFA 3MP1A 1O7TA 1MY0A 4YICA 5CM6A 3DLNA 1URDA 4DXUA 3O2AA 2GRVA 4JSDA 2FA7A 1JEUA 3CFZA 3IB2A 1AIVA 2DWIA 3SEUA 4THIA 1IXGA 5TU0A 1JW5A 2XXYA 4L17A 3LSXA 3QSLA 3FJMA 4QFLA 1MPDA 1YTVA 4EXLA 1T0KA 1I69A 4F22A 4OERA 3CSBA 1XHYA 1BP5A 1SW1A 1POTA 4IO4A 1IQ7A 3U1OA 3G3IA 1IXCA 5H8FB 3TKDA 1EU8A 2UYEA 3RGYA 2Y7IA 4Q8RA 3EHTA 3GBBA 3PGFA 3H06B 1H45A 1N7WA 5AA3A 3SDFA 1MQHA 1MDP1 3WAEA 2OCUA 4KI0E 5JEIA 3RTWB 5AA2A 1A7LA 3ZKLA 2Q8JA 4G8HA 2I4BA 2W7YA 4RPOA 1B4HA 2XXVA 1LCFA 3IORA 3HSTA 5H8NB 3G3FA 1MXZA 2XX7A 3QK6A 4ONYA 3U8QA 1UTBB 3UORA 3BBRA 3KZGA 1NNKA 4R6HA 3VXCA 2PYYA 1DMBA 4UA8A 4NTLA 4OFJA 1MPCA 2O84X 4BDLA 2QMXA 2HQ0A 1CB6A 3OSQA 3W15C 4R9GA 3T9UA 1P1OA 2O69A 4F3GA 2B3FA 1S7YA 3TTLA 3T66A 1SQYA 5TP9A 4DLDA 1LBCA 1EH3A 4NF8B 4JB7A 3H03A 5EHMA 1B0LA 3DP8A 1EZOA 3CIJA 1H43A 3U93A 5HPQA 4OYVA 4U1OA 3TTNA 2D3IA 3MVZA 5FTIA 1P1NA 4YU0A 1BTJA 1PBPA 3UIFA 1P1QA 4GQOA 4OHNA 2YJPA 3T9VA 2QPQA 4OFLA 2O68A 4YKKA 2UVGA 1N0TA 2Z23A 4KYSA 4FEBA 1JVXA 2DOJA 1A99A 1NH8A 2PT1A 3GZGA 4R6YA 3Q28A 1LB8A 4PFYA 2I0BA 2Q2CA 4OFOA 3PMVA 1XC1A 3C34A 2F6GA 2HXWA 4LATA 1MG1A 5CI5A 1XOCA 4ZZEA 3K1PA 4NF6A 4OZ9A 2ZYOA 1FTKA 4OETA 4DIGA 2Z8EA 4ZECA 1JEVA 1LFHA 4TLLB 4H6DA 4MBPA 3SEVA 4OWDA 3MQ9A 5K2YA 5I57B 2I6EA 2H5YA 4NMYA 1WVJA 3PUWE 1TFAA 3MVXA 1B6HA 3IJOB 1ZMGA 4ZE9A 2NUVA 1MQGA 4I8CA 4XXUA 3GLBA 3MZ1A 4U21A 2V25A 4IGRA 3C9HA 2O6AA 2R6GE 4EF2A 2OZZA 3FATA 4C1TA 2UVIA 4NF5A 1UIUA 1I6BA 1DSNA 1A40A 4R2BA 4F2OA 3K0VA 1US5A 1UTHB 3C36A 4IO2A 2XXPA 1B3FA 3K2DA 5TPAB 2DWHA 2F7CA 2V93A 1MY1A 3U72A 4RPNA 3IO6A 3FXRA 3TPAA 2DE3A 1OQGA 3TODA 2I58A 5EYFA 5FHNA 3V89B 3PPQA 4KD5A 1LGBC 3EHUA 3CG3A 5I84A 1S9TA 2A5TB 4XKRA 4Z0IA 4FAJA 4LP2B 4U1ZA 4GXSB 3H3GA 1NH7A 3TTMA 5HBCA 4OEUA 2OJTA 3PPOA 1ZIUA 4P0GA 1GTKA 4K3FA 4RK9A 2I3VA 2AL5A 3PUYE 1Y1ZA 4G77A 5M2VA 5JTYB 3A3UA 3UN6A 4N6PA 4I1DA 4H8JA 3L6GA 3Q25A 1LAHE 3OXNA 1SYIA 1MH4A 2VGQA 3FVNA 3K6VA 4G8MA 4F3SA 2F78A 3VE1B 2HFBA 1B9JA 1FCKA 2KLFA 4G68A 3WAFA 4FE8A 5A5XA 4DXBA 1MXVA 3PV0E 3SESA 5ITOA 2YLNA 1RYXA 2PVUA 4R6KA 1FTLA 4DDDA 2HAVA 3KJTA 3GBAA 3MPLA 1IITA 4F3PA 3HV1A 3O6IA 2O1MA 1JQFA 3MZBA 2X7QA 4XKQA 1TFDA 4R2FA 5H8HA 4ZEKA 3MC2A 3UK4A 3E13X 1PB7A 4HCWA 2OWSA 3PUXE 3FXUA 3TYHA 2HAUA 1OIBA 3TQLA 2XX9A 4O3AA 3VLUA 1FTOA 4Q0CA 1CE2A 3TUSA 1NKXA 1O64A 3A3CA 1A55A 1B3EA 4H5GA 1ELJA 4F1VA 1BIYA 3TELA 4IY6A 3U92A 3VLVA 4ELQA 2XXXA 4JWYA 3MP6A 4YKIA 4WKMA 4HTGA 1B1XA 4LA9A 1LFIA 5CC2A 3IX1A 3Q27A 3QUFA 1LSTA 1FQEA 4M4GA 1B05A 2F36A 3VVEA 1MY2A 1I6QA 4U23A 2NXOA 4RA1A 4G4PA 1SD3A 4PFWA 4I9DA 2UXAA 3ZS6A 2F35A 3G7WA 1YAEA 3IOTA 1B5HA 4H0WA 2ZXTA 2NVUB 1IXIA 3TMGA 1US4A 5JK4A 3Q29A 4IO5A 5KCJA 1BLFA 5F1QA 2XXRA 3ILUB 4YKPA 4MFIA 3T93B 5CMCA 3RPWA 3K00A 4P11A 2F8DA 3KOTA 1ZKBA 4ZE8A 2XHDA 5AA1A 4R75A 1B3LA 4OVJA 3MP8A 4LUBA 1R1NA 3RLFE 2UYFA 4IO7A 3MVWA 2HCAA 3LUYA 5ICQA 3E9XA 4RY1A 2FYIA 5KDTB 5KZTA 3SKPA 1IEJA 3MBPA 1YPNA 1DTZA 1MPBA 2DE4A 3TEPA 4GL8A 5L9SA 2REGA 1O63A 2PX1A 4GL0A 3RT8A 1D9YA 5ISUA 1PBQA 1M5EA 1RYOA 4QFOA 2Y7PA 2QS4A 3S2VA 1OMPA 3L6HA 2PT2A 4OMBA 5I59B 1MY3A 1ANFA 2HEUA 3BKIB 1SVXB 2P2AA 3KBRA 2OK2A 1YCJA 3CFLA 2DVZA 1KWHA 2RKMA 5H8FA 4NF4B 1B40A 1N84A 2F5XA 1ZBMA 3QIMA 4Q5TA 4KYDA 4RNSA 3TCFA 4MLQA 4R74A 5H8QB 1N04A 1ATGA 1MY4A 3JZJA 1LLSA 3KFMA 4ZS9A 3K1NA 4QSCA 5H8NA 4PFTA 1DTGA 3IAZA 3N6UA 2X26A 1UTBA 1DOTA 3PMWA 3VDFA 1FTMA 1JW1A 3K1MA 5I56B 1MXXA 1Y3QA 1N76A 1Z7ME 3SEYA 3FVOA 1R9QA 3H6UA 2I4CA 4ZDMA 3TQWA 4ZEFA 3W9WA 2HZLA 4EQBA 1JVYA 3PPRA 3HPIA 2OWTA 5BWJA 4XTCQ 4OEVA 5DYHA 2F34A 3S9LC 1B1HA 4GFRA 2H9BA 3OEMA 1QUIA 4YB5A 2ZYKA 3PD9A 4NF8A 3PUVE 1LBBA 4X1BA 1N3WA 1USYE 1A8EA 4MLVA 4HW8A 2XXIA 2RC8A 3QYTA 5CMKA 3S9NC 3ZSFA 3B7DA 1M5BA 2M8CA 3IB1A 3QAXA 2NWJA 5I2NB 4JSOA 2DXRA 4H67A 5I56A 2UVJA 4KCCA 3K6WA 1MQDA 1Q35A 4R73A 1UIVA 3O6HA 4JBZA 1B32A 2QS1A 3PD8A 4F39A 4F3BA 1NL5A 2XXWA 5ELVA 3OOAA 1LAFE 2ZNTA 3KGCA 5CRYA 3CFXA 5IKBA 2F7AA 1B5JA 5ICTA 4QFPA 4G8NA 1VR5A 3FIRA 3K01A 1MS7A 3SERA 4Q30B 3OELA 5B70A 4N07A 4DE8A 1B5IA 3PPPA 2Y7RA 3HHGA 4RXLA 4JWOA 4BLAA 4DCXA 1S50A 3C32A 3KN3A 1L5TA 4ECFA 2AL4A 3EPEA 4P0IA 2OLBA 4TOZA 5DVJA 5I2KB 3S4UA 4GRKA 1Y9UA 3O6GA 1MQIA 1EZ9A 3RUMA 4F19A 1VFDA 5I57A 3TDJA 3O66A 4WXJA 4NWDA 1QJMA 2XXUA 5DEXB 4KHZE 2VP1A 4N13A 1Z7NE 1LCTA 1NNTA 4ZEDA 3M3KA 2Q9TA 1B4ZA 4U4SA 4WEPA 3CG1A 3PPNA 3KG2A 3K02A 2B65A 1VSOA 1QKAA 1J1NA 3LR1A 3FUZA 4GVOA 4R9FA 4FECA 2ESNA 3G3JA 3PU5A 3E3KA 1UTHA 1PB9A 1P1WA 4YB6A 5TPAA 3PMXA 3CVGA 3FVKA 4DCYA 1Y4TA 1Y1MA 1SBPA 3UP9A 2RCBA 3FV1A 3UGWA 3LC8A 3RN8A 4H1XA 4DXCA 3FASA 2A5TA 1P99A 2A5SA 4BDRA 1AOVA 3A09A 2ZMBA 5I58B 5AA4B 3C4MA 3E4RA 4JWXA 2DQVA 4ZEBA 1XT8A 2D5WA 3SEWA 3C33A 3LSLA 2GH9A 1NFTA 4F29A 5DVFA 3O28A 4IY5A 3D4CA 4H65A 2DS9A 2ONSA 3MAMA 4KR5A 3ILTB 4DZ1A 2H98A 4MF3A 5JTYA 1SI1A 4QSEA 3IR1A 3I5OA 2QL3A 4RJZA 1II5A 2V3QA 1LAGE 1ZU0A 3QUJA 4LQ5A 1QUJA 1MDQA 3FVGA 1OLCA 5FHOA 1N7XA 3THIA 1B0HA 1QULA 1HSEA 1FQBA 2ANJA 4POWA 1R6ZA 1ZJLA 3B6TA 3VFJA 3O97A 4QF9A 2QJEA 4PFUA 1EZPA 4FIMA 4X9TA 1M5DA 3I6VA 3KN7A 2Q88A 1FQDA 3UA8A 2DVCA 3FJGA 2I3WA 2X7PA 4GOTA 3N26A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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