2RC7A

Crystal structure of the nr3a ligand binding core complex with glycine at 1.58 angstrom resolution
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
284
structure length
284
Chain Sequence
KLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAGQLCLDPMTNDSSMLDRLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEQLAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLSGTANMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRGTELSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVQYLKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTSNISELISQYKSHGFMDVLHDKWY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular mechanism of ligand recognition by NR3 subtype glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit 3A
total genus 99
structure length 284
sequence length 284
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10613 Lig_chan-Glu_bd Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rc7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rc7A02
3K1NA 3FJ7A 3RGYA 4NEDA 2XX8A 2Z22A 4H65A 3M8UA 1HSJA 4TLMB 3FXQA 4FJPA 2ALUA 1GGGA 1MQHA 5F1QA 2Y7PA 3E9XA 1XHYA 3LSLA 3KN8A 1MPBA 3O66A 2ZMBA 4U2RA 3TDJA 4RPOA 2XD3A 2DWHA 3TCGA 2Q9TA 4GVOA 4DXBA 3GXAA 2V3QA 1US5A 4OENA 3O6HA 4EXLA 1VFDA 5FHMA 5I2NB 1TWYA 3FXRA 4NF5A 2XXVA 3JZJA 5DYHA 1TXFA 3TZAA 1IEJA 3MVYA 4I1DA 3MWBA 5KDTA 4M1VA 4ISUA 3H03A 5EHMA 1NH7A 4EF1A 2A5SA 4H8JA 1SW1A 4NE4A 4U1OA 2Z8DA 2VD3A 4JSDA 2XX7A 1EZ9A 4Q30B 4PP0A 4JXIA 2I4CA 2XXRA 4RJZA 1O64A 1Y1ZA 3IL1B 1SYHA 2QS4A 4GL0A 4P0IA 4F2QA 1XS5A 3PU5A 1BLFA 2ZYMA 3M3KA 2AIXA 4BDMA 1QJMA 4KQPA 3SEVA 4YU0A 5DTBA 1Y3NA 1LFHA 4GF8A 3UK4A 1PEBA 4HCWA 3V83A 4IO7A 4GL8A 4G8MA 5H8FA 3C36A 3SEWA 3WAEA 3G3GA 4G68C 1CB6A 2YPNA 5L8DA 3K6VA 3O6GA 3FXUA 1VE4A 1MXUA 4ESXA 3H6WA 2DOJA 3FATA 1QKBA 3Q29A 3USDA 1XVYA 3LR1A 4GXAA 2FNCA 4FATA 1FTKA 3DP8A 4YKJA 3FVOA 2G93A 1SBPA 4NMYA 3G3IA 2V3UA 1JW1A 2QMXA 4AQ4A 4LA9A 1USYE 1JNFA 2YLNA 4U23A 2HCAA 3LSWA 1URSA 5I57B 1P99A 3GBBA 1N04A 3PV0E 4YAHX 3TFLA 4F1YA 5CRYA 2ZNUA 1R1NA 3WAFA 1EU8A 2DE4A 1B7UA 1OMPA 3U93A 3U92A 2I4BA 4GD5A 3MJNA 4LZ8A 3LC8A 3D4GA 4Q5TA 4DXUA 3U94A 3K6WA 2F8DA 2H4IA 3TAJA 3HPIA 3TTMA 1LCFA 3VLWA 1ZTYA 4ZS9A 5I58B 1B3HA 1P1WA 1WODA 4IY6A 2NWJA 2RC8A 3ZSFA 2R6GE 3C33A 3OELA 2A5TB 3R7XA 4GFRA 4PFYA 4WEDA 1F9BA 4THIA 1B46A 2AYSA 4F3GA 2DWIA 1MH4A 3FV1A 4YZZA 4OFJA 1UTHB 3UORA 3FGSA 4G68B 3Q27A 3H6TA 2NOOA 1D3KA 1Q35A 4NWCA 4YICA 1WDNA 3Q28A 4LVQA 4F1UA 4OFLA 1MDP1 5KCJA 5I2KB 4H67A 2Q8JA 1Y4TA 3B6WA 4NF6A 3H3GA 1Z7NE 4FAJA 2DE2A 4M4GA 2BJJX 5TPAB 4U4SA 3G3FA 5IAIA 1P1OA 3RNNA 2AL5A 1ATGA 1LAXA 1H43A 3KSXA 1A8FA 2I3VA 4GWOA 5AA4A 3RQTA 3MUQA 1IITA 2OBGA 1JEUA 5F7VA 2XXWA 3T22A 1YAEA 4ECFA 4JWOA 2Q2AA 3H4ZA 2ZNTA 1CE2A 4LP2B 3TTRA 5I56A 2F36A 2THIA 2F6GA 1HSLA 3PGFA 3IB2A 1NL5A 5BUUA 3RUMA 4QFLA 4LZ5A 1FQBA 3IR1A 4RK2A 1B3EA 4RXLA 1QUIA 5DVFA 2OCUA 3PD9A 1USYH 4EF2A 5I56B 1BP5A 1B0LA 4GLIA 2PT2A 3SEUA 3GBAA 4NF4B 5ITPA 3CI8A 3IB1A 3BKIB 1MY1A 1MXXA 1SW5A 1FTLA 5H8HA 3FV2A 3N94A 1MG1A 2V93A 4BDLA 3E3KA 1LSTA 5AA2A 5AA2D 2RCAA 2O6AA 4KYEA 2H5YA 4R6YA 3RN8A 2DXYA 4DXCA 3VE1B 2YJPA 3MP1A 3SDFA 3BFTA 4BDNA 4QSCA 3CSGA 2QL3A 3H6UA 1XC1A 2O69A 2V25A 2PT1A 4PFTA 3C32A 1UTBB 1XT8A 1LAHE 3MP8A 4ZEFA 1B32A 4DLDA 3KFMA 1LGBC 5IKBA 2X7QA 1N0TA 5H8QB 2I49A 3HHGA 2KLFA 3ILUB 3IO4A 4FORA 3N5LA 4XKNA 1H3DA 2D21A 4OXVA 3QAXA 3OO8A 3MZBA 1J1NA 3CG1A 3HSTA 1FW0A 4H6DA 1JW4A 1O63A 4IY5A 3L6HA 3P7IA 3TELA 1JVXA 4OESA 2VD2A 1KWHA 1LAFE 1IXCA 3TYHA 4QFOA 3EN3A 3FJGA 3I3VA 3SERA 4R9GA 1LCTA 4NF8A 1YTVA 4F3PA 4KHZE 1B9JA 2HQ0A 4L17A 2V3TA 3HCQA 2XD2A 1SDXA 1SI1A 1PB9A 4E0XA 3G7WA 3PPPA 2ZYOA 2G29A 1MM6A 3PUZE 4H0WA 1MXVA 2ANJA 4QSDA 3S9EA 5EHSA 4OETA 3ZS6A 4F2OA 5I59B 2Y7RA 4E0WA 2DE3A 4XIGQ 2DWAA 1B4HA 1MQDA 4WKMA 3W9VA 4TOZA 2OLBA 1MS7A 4WEPA 1NKXA 3I6VA 3IOWA 4H8IA 3TKDA 3LSFB 2UVGA 4F3BA 1B3FA 4F31B 2ABHA 3HHFA 5CM6A 4XTCQ 2XXTA 1RYOA 3PUXE 2Z8EA 4F39A 3T9HB 5DVJA 3FASA 4IGRA 2QJEA 3B6QA 5DEXA 3O97A 3SESA 1URDA 4QFPA 2DVZA 3OSQA 5ITOA 3B7DA 1B2HA 4MF3A 3ILTB 3JYRA 3IOTA 1A54A 4ELPA 4NF5B 1AOVA 3N6UA 5KZTA 2RKMA 1PC3A 3CVGA 2DYXA 5KDTB 1LLSA 1B7ZA 3A3CA 3DP4A 1OIBA 1M5DA 5FTHA 4TQUQ 2F5XA 2IEEA 2B65A 3U8QA 2O7IA 3HV1A 4BDRA 4IB2A 2OZZA 3KZGA 3H7MA 1NNKA 4IO3A 3TQWA 4DZ1A 3K0VA 4K3FA 4OMBA 1Y3PA 1BTJA 1B40A 2RCBA 3EHSA 3JV9A 1N3XA 2O1MA 2QRYA 4OEUA 2Z23A 3O6IA 2HEUA 2Q88A 3OO9A 3VXCA 5H8NA 1AL3A 3B6TA 3TUSA 2RC7A 4XXUA 3SEYA 4WXJA 3M3LA 4JBZA 2Q2CA 1N3WA 1QUKA 4YMBA 4YB7A 4Z0IA 3IJXB 5H8FB 1O7TA 4GRKA 5H8NB 4MFIA 4OQOA 1XVXA 3K1PA 3MVZA 4I8CA 2ZNSA 4ESWA 1ZU0A 5ICQA 3AXFA 1FCKA 3OEMA 2Y7IA 3SEXA 4DE8A 2DS9A 1UIVA 1OLCA 2O84X 1LB9A 2GRVA 2LAOA 5ELVA 2PVUA 2D5WA 2GH9A 3QYTA 4U22A 3EHTA 4DDDA 3S9LC 3IJOB 1JW5A 2I48A 2I6EA 1P1NA 1L5TA 5CC2A 4IO2A 2F35A 3KJTA 1QULA 3C34A 1WVJA 4G4PA 1DSNA 1B52A 2F34A 4R2FA 2XXYA 3VDFA 3ZKLA 1IXIA 2FYIA 1US4A 1YPNA 3TTKA 4ELQA 4XKPA 3GZGA 3ODBA 1S50A 3RPWA 1DPEA 4OVJA 3PUYE 3EPEA 2DSFA 2O1LA 1B1XA 4EQ9A 1I6AA 4Q0CA 1OVBA 1PB7A 1MXZA 5A5XA 3K1MA 2H9BA 4OYVA 1H76A 1OLAA 3U1OA 1IIWA 4OZ9A 3PMXA 3OENA 4GIZA 3PUWE 5K2YA 3E4RA 3M3FA 3K4UA 1AMFA 5FHOA 1FQEA 3THIA 3T66A 1ZMGA 2D3IA 4TLLB 3ECRA 3IOVA 2NUVA 3CIJA 2PMSA 4OTEA 5JEIA 4EDPA 4IO4A 4F18A 4RPNA 2P0SA 2F78A 2FA7A 3KN7A 1ZBMA 3MP6A 1SD3A 2P1SA 1IQ7A 2XXQA 5KCJB 1DPPA 1QVSA 4N07A 4U21A 4NF6B 4JDFA 2ONSA 4R74A 1M5BA 3PD8A 3D4CA 3S2VA 4AB5A 1SQYA 2VHAA 4F19A 4Q8RA 1IUDA 3IO6A 3GLBA 2XXPA 2RC9A 3T93B 1A40A 4LUBA 1TT1A 4JSOA 4NTLA 5AA4B 1ZJLA 4R75A 3KJ7A 2ZXTA 3DP6A 1DMBA 3OEKA 3VXBA 2Y7KA 3CSBA 4HTGA 3TPAA 3C35A 3V89B 4R73A 1UIUA 5B7DA 3KOTA 3FUZA 5L9SA 2VP1A 1NMUA 4ZEBA 3QXMA 4GOTA 5K2XA 1R9LA 2RINA 1FQFA 3FVKA 1MY3A 5AA1A 4POWA 4N6PA 1A99A 3UA8A 3PPRA 4F29A 4NWDA 1PDAA 4RY1A 1ELJA 2GFEA 1D4NA 2UYEA 1B4ZA 1GTKA 5ISUA 1JETA 4FIMA 4MH5A 4LZ7A 1JQFA 4RK9A 4HW8A 5TP9A 3PPQA 3A09A 3OO7A 5FTIA 3MVXA 1FQAA 1LAGE 4ZECA 2XXXA 1GV8A 3SETA 2DP8A 5H8HB 1OQGA 3KG2A 3DM0A 2M8CA 3K6UA 2F7BA 1SI0A 1ZKBA 5AA2B 1A8EA 4H5FA 2CZLA 2QS3A 5H8SA 5L9OA 3IOUA 4KYSA 1B05A 1ZIUA 3KN3A 1B7HA 2UVIA 5TP9B 4XKQA 3VFJA 4LATA 2F7CA 3CFZA 2NXOA 3MVWA 4DCXA 4ZEIA 3K2DA 5AA3A 1QUJA 4ZZEA 3KEIA 2PX1A 1B1HA 3QIMA 2QPQA 3N26A 1H45A 4BDQA 3MC2A 3T9XB 2O7UA 2OWSA 3MZ1A 1P1UA 1QKAA 4G2ZA 1B51A 5L9MA 3I5OA 1XOCA 4OERA 1UQWA 3MZ9A 5CMCA 3BFUA 1DOTA 2OWTA 3OD7A 2PYYA 1N7XA 4YB6A 3O9PA 3S4UA 1MPDA 2ONRA 1IXGA 4EUOA 3H06B 1OVTA 3C31A 2WKYA 1S7YA 4ELOA 4NF8B 2UXAA 2Z8FA 3CRBA 2X7PA 3H6VA 4QFKA 1II5A 5FHNA 1RYXA 3K02A 4R9FA 4JWYA 5I2NA 4LQ5A 3KBRA 4YB5A 3TMGA 4AB6A 2P2AA 2H25A 5CMKA 1P1QA 4FEDA 5B70A 3EHUA 1QW0A 3O29A 2ZYKA 4YKIA 2ESNA 4C0RA 1D9VA 4MLVA 2Q89A 1EZPA 2R9JA 3BBRA 1MM7A 2GHBA 3R6UA 1AIVA 2V84A 4PE5B 4IO5A 3CG3A 3OO6A 3EF7A 1M5CA 2HXWA 2DQVA 5LOMA 3VLVA 1LBBA 5DEXB 1EZOA 1I69A 1GVCA 3VVFA 3FVGA 3U72A 2I0BA 4JB7A 2XXIA 3ONMA 5TU0A 4QRZA 3Q25A 3FIRA 1MQIA 3FVNA 4P0GA 4KYDA 2CMOA 1Y1MA 2IA4A 3VV5A 4KR5A 1NH8A 3C4MA 3QK6A 1MXYA 1NNPA 3PMWA 4U4XA 5CI5A 1B6HA 1N7WA 4OFOA 4ZDMA 5CBSA 4G8HA 2Y84A 1DTZA 2DWJA 2OK2A 3C9HA 4KI0E 1IXHA 1MH3A 4X1DA 5I84A 3TCFA 2QMWA 3TTNA 2X26A 1R9QA 4H5GA 2UVHA 3PUVE 1POTA 2ONKE 4KFQA 4EQ7A 1B58A 1ZLQA 1LFGA 1MXWA 3DLNA 4ZEKA 2REGA 4LONB 3FZVA 4FEBA 1MY2A 4RNSA 2RF1A 3KGCA 1PBPA 1Y9UA 1Q1KA 3MW0A 4DIGA 3TCHA 5I57A 3OSRA 4OWDA 3CFXA 2UVJA 4R6KA 3UGWA 1SW2A 2HZKA 4R2BA 3CFLA 4UACA 3O28A 2B3FA 3MPKA 3VVDA 2I58A 2QS2A 4X9TA 3OXNA 4YKPA 4KCDA 1T0KA 1A55A 4I9DA 4KPTA 3EQ1A 1LB8A 5I58A 3PPNA 3TEPA 1BKAA 1N84A 4OHNA 3O2AA 4ZE9A 3PPOA 2A5TA 3DELB 2VGQA 1POY1 3OOAA 4LQ2A 4PFUA 5DVIA 2E0SA 4PETA 2UYFA 1FQCA 3K00A 1UTHA 4Z7EA 2E1SA 2XHDA 4G68A 1TFAA 1HSEA 4X48A 2W7YA 4YMAA 3F11A 4F1VA 2QS1A 1Y20A 3A3UA 3HO7A 1IZ1A 3E13X 5I2KA 4ND9A 4EXKA 4GXSB 3MAMA 3W9WA 4G8NA 3IK6B 3Q26A 4IGTA 3G3JA 3LBSA 3V5AA 2H99A 1OQHA 5CBRA 5A5XB 4FE8A 3T9VA 3VLUA 1N76A 5CMMA 4HCYA 3KSJA 2AL4A 1JVYA 5TPAA 3RY3A 1Z7ME 2HAVA 3RLFE 1MQJA 1DTGA 1PB8A 1URGA 4QF9A 3FD3A 3SKPA 1M5EA 4R72A 1SYIA 1NNTA 1R6ZA 2OJTA 1Y3QA 4H1XA 4POXA 3W15C 1MQGA 1I6QA 4QHQA 3IB0A 3V8XB 1I6BA 3IORA 3MPLA 3S9NC 4KD5A 5HBCA 2VOZA 1VSOA 1AH5A 3TODA 1MPCA 1S9TA 3N6TA 2PBWA 3VVEA 1VFEA 1MDQA 1NFTA 1NNFA 4RYAA 5HPQA 1MRPA 3LSXA 2B3BA 1EH3A 5HM4B 3IX1A 4C1UA 4EQBA 3HN0A 1FTMA 2Y7WA 1LBCA 1VR5A 4O3AA 3RTFB 4NF4A 3LUYA 4C1TA 2ZYNA 3G3KA 1FQDA 2DVCA 3UIFA 3UN6A 4X1BA 3QUFA 4BLAA 4U1ZA 5AE4A 2XXUA 4ONYA 4BDOA 4MBPA 2HAUA 2XX9A 3K6XA 1M5FA 1FTJA 2HZLA 2F97A 3L6GA 4YKKA 1TFDA 1UTBA 4JWXA 1RKMA 1D9YA 4PQJA 4PFWA 4ZEDA 5DT6A 1BIYA 3KOSA 2F6PA 2REJA 1JEVA 1PBQA 4F22A 5EYFA 5H8QA 2O68A 2H98A 1ANFA 4UA8A 1Y4CA 2R71A 1B0HA 3T96B 3UP9A 5ICTA 3G3HA 1B3LA 1MY4A 1B5HA 4HS7A 3PMVA 2GHAA 2DXRA 1B5IA 4O3CA 5M2VA 5JTYA 4O3BA 2I3WA 3RT6B 5JK4A 2QSXA 1B3GA 1SVXB 4XKRA 1A7LA 4R6HA 3ZKKA 4ZE8A 3OMBA 3QUJA 4IO6A 2F7AA 3QSLA 4GQOA 3S9MC 3R26A 1B5JA 4OEVA 5JTYB 5BWJA 3CR9A 4DCYA 4MLQA 2NVUB 1LFIA 4N13A 5CMBA 3IAZA 3RT8A 4RA1A 4ZZAA 4G77A 4KCCA 3FJMA 2HFBA 1FTOA 1H44A 4P11A 1YCJA 4F3SA 3RTWB 1GR2A 3T9UA 4QFNA 5I59A 4FECA 4I62A 3K01A 1SW4A 2XXHA 4ELRA 1MY0A 2O51A 5J1DA 3TQLA 3MBPA 3TTLA 2I0CA 3MQ9A 4QSEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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