2REMA

Crystal structure of oxidoreductase dsba from xylella fastidiosa
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
190
structure length
190
Chain Sequence
b'HLPVVGEDYVEIPDGRPFAPLAGKIEVVEIFGYTCPHCAHFDSKLQAWGARQAKDVRFTLVPAVFGGVWDPFARAYLAADVLGVAKRSHTAMFEAIHEKGSVPIQNVGPDELAVFYAGYGVQPDRFVATFNGPEVEKRFQAARAYALKVRPVGTPTIVVNGRYMVTGHDFEDTLRITDYLVSRERAASHG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Residues substitution in the active site of DSBA may compensate for the lack of the canonical motif CPHC
rcsb
molecule keywords Disulfide oxidoreductase
source organism Xylella fastidiosa
molecule tags Oxidoreductase
total genus 60
structure length 190
sequence length 190
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.8.4.2: Protein-disulfide reductase (glutathione).
pdb deposition date 2007-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2remA00
2L57A 5IIZA 4HOJA 3ED3A 1PA3A 3TCOA 1WOUA 2FGXA 4MPFA 1SK2A 5GSTA 2HRFA 3CTGA 3QAGA 3N9JA 3WGEA 4AF2A 4O5RA 19GSA 4WF4A 4PX1A 2AAWA 4IJIA 3U6VA 5C04A 1EP7A 3UVHA 1SU9A 2V1MA 5J4UA 1AQVA 2TRXA 4NAXA 1TJDA 2OBIA 1T3BA 2DJJA 3GSSA 1NHOA 4MK3A 3D0ZA 3DWVA 1Z6MA 2LS5A 3BCKA 4X0XA 1X5EA 1M99A 2HI7A 1ZYEA 1AQXA 3G7JA 5IMZA 4OD7A 1K3YA 4MZWA 2GLRA 3VWWA 5EY6A 1AC1A 3FYGA 2YV7A 2JSZA 1KTEA 2H19A 5B8AA 3GH6A 3TJGA 2C8UA 2LQOA 3MDKA 2I4AA 3I69A 3U5RE 4KX4A 2AUVA 4KSOA 5JCGA 4D73A 2C3QA 3TKRA 2BJXA 1XWKA 1KEBA 1RQMA 2FWGA 5IMFA 5D8IA 2V41A 1XFLA 4X43A 3RHBA 2FA4A 3C7MA 5HFKA 2P5RA 1KNGA 1EEMA 1LBKA 1EZKA 1A24A 4WBJA 3EMPA 1TRVA 1Z7PA 3H8QA 2JACA 2YWNA 3IOSA 4OO5A 2RUEA 2CZ2A 2YZHA 4N10A 2WS2A 2KLXA 4MF7A 2XPEA 4MLYA 2IL3A 3H79A 2VD0A 2HZEB 1ERVA 3UL3A 3IE3A 3KTBA 1TK8B 5IMAA 2H6YA 2IMDA 3RPNA 2C1YA 2L6CA 1ZGNA 1M9AA 2VLVA 2PWJA 3HZ4A 3MWHA 1GP1A 1JLVA 3L9UA 1BQ7A 1VRSD 5H5SA 3TGZA 2JSYA 4PQ1A 3KJYA 1SK0A 1DBYA 1PMTA 1ZZYA 3LGCA 1U88A 4MJEA 4ML6A 5FWGA 3H93A 2JL4A 4NHZA 1Y25A 4K1FA 2FA8A 4BA7A 3FY7A 2B7KA 5HFGA 4KB3A 4N30A 1X9SB 2I81A 3ZYWA 2WRTA 4YQMA 3VLNA 2C3TA 5GZZB 3QAVA 1XZOA 1PGTA 3TKQA 2M46A 5AN1A 5KN2A 1F3AA 1VF2A 5H5RA 2MBTA 3VPTA 4XS1A 3KP8A 2DJ2A 3F4SA 1BYEA 3KEBA 4FIWA 1O73A 1O8XA 1XW5A 2E2GA 3MNGA 2DJ1A 4POLA 2WDUA 2MMAA 2P31A 2H1GA 2C0DA 4KA0A 2CZ3A 2H8LA 5ABRA 1GTAA 5D9WA 3FHKA 4IS0A 2WJUA 2VUPA 3EMXA 3DD3A 4NV5A 2DBCA 2OE3A 2B5EA 3DRNA 2WFCA 1DE1A 2XHFA 2K6VA 5D9TA 2GT6A 4BVYA 3UBKA 1S3DA 4EDZA 3C1SA 1K0NA 1SL1B 2VL2C 5DJLA 2GZZA 2HSHA 1Q98A 3QMXA 2FCHA 4K0NA 4RUVA 4TVEA 2MZCA 2L4QA 1G7EA 1MDIA 1UN2A 2R3XA 2B3SA 2G0FA 3TUEA 3TKSC 2LKUA 3S9FA 4GXZA 4IVFA 5B8BA 2C80A 4PURA 1USBA 1TOFA 4WR5A 3D6IA 1YQ1A 2GQKA 2R37A 1Z6NA 1HNCA 5DDLA 3GA4A 2VL2A 2L59A 2OACA 2GQLA 1OC9A 3BD2A 1B8XA 1EWXA 2YZUA 5ECKB 1ACVA 2GSRA 3EC3A 3TKSA 3QPMA 5GSSA 5DCGA 1ERWA 4ID0A 2R4VA 2TIRA 3HD5A 1U3AA 3GTUB 3TRXA 1JZDA 1GSEA 3I9V2 4EE0A 2YWMA 4LA1A 1WRYA 3DVXA 1O85A 2MMNA 4Z7XA 3ZL5A 1F6MC 4TN8A 3GH9A 4XS6A 4JR4A 2HSYA 1CQHA 2CA8A 5DVBA 5G5FA 2K9FA 2A2SA 1GTUA 5ELAA 1XXUA 2C0EA 5CO3A 3GMFA 4HS1A 1Z5YE 4HJ2A 2YV9A 2A2RA 2IMKA 1X9MB 4JZQA 5KN0A 1ERTA 3F4TA 3ZFLA 5DAKA 3KH7A 1G6WA 2G2QA 3F6DA 1PX7A 2L6DA 2WCIA 5F07A 3A3TA 1M0UA 2FD3A 1ZOFA 5INYA 1N8JA 5DBQA 1JZWA 3GKMA 2VLTA 1A8LA 4CW9A 3CYNA 4V2NA 3Q6OA 1NW2A 1V40A 4MA9A 1W4VA 1XWAA 5G2ZA 4MJAA 2YCDA 2IPAA 3LORA 1LU4A 1TK5B 3IK7A 2TRCP 4TR3A 4RQRA 2O8VB 2KP1A 4WBRD 1GSQA 3ERWA 2YJHA 1EOGA 2GSTA 5IMDA 3EINA 2DMLA 2YPMA 4ACSA 2VM1A 1EGOA 3GHAA 2OJLA 2LEGA 3O6TA 5D96A 5EVOA 3ZIJA 4MJBA 2H70A 2O87A 3QFBC 1R5PA 4MF6A 4O92A 1AIUA 4HDEA 4K2DA 2I1UA 2R6KA 4O32A 1ERUA 4L0WA 1J0FA 3FR3A 3IK9A 2PUKC 4FYBA 1R26A 3LYKA 2OA7A 1I5GA 1GSYA 4DEJA 2B5XA 2NBSA 2H1AA 4K7IA 4V2MA 3TRPA 2ZUPA 1NHYA 4CHSA 9GSSA 4QL7A 4D73B 1GTBA 1N2AA 3L0HA 1IYIA 4Q5QA 1M2AA 4N11A 1MEKA 2KUCA 4TXOA 1DSBA 1Z9HA 3ZVJD 4IQAA 3M8NA 1THXA 3G7IA 5E4WA 2F8AA 1PL1A 3US3A 3FR9A 1T7PB 4NXIA 3WGXA 3KGKA 3FKFA 2IFQA 1BJXA 1QUWA 3FW2A 5G1KA 3F4RA 1GLQA 4GSNA 4MZCA 4F2IA 3CTFA 1GH2A 1ML6A 2CAQA 4TXVA 5L71A 3HZ8A 3VI7A 5IQYA 3IBHA 1JHBA 5CRHA 3AY8A 3RBTA 5AIVA 5HR0A 10GSA 2PGTA 3F0IA 1HD2A 1PSQA 1FB6A 3GSTA 3HXSA 2LUSA 3GX0A 1S3CA 3KP9A 1TP9A 3GL5A 2OADA 1SK1A 2HE3A 3L9VA 4XHMA 2L5LA 4EDYA 3NZNA 2VD1A 5F8BA 2DMMA 2L4CA 2R2JA 4ULXA 4MH3A 3ZZXA 5ECIB 2ON5A 2VO4A 3VWUA 1A8YA 1YY7A 4NV2A 4YH2A 4EL1A 1W89A 4L5LA 3ZLPA 2DIZA 1DUGA 2LJKA 1VGLA 3Q18A 3Q74A 3MAKA 1NM3A 3KD0A 1T4YA 3IXRA 1OVNA 2B1LA 4IKHA 2RUFA 2HRNA 3VURA 5COHA 2CX4A 3BBYA 5IMCA 3HVSA 3E3EA 3CMIA 2H71A 5ECQB 4JBBA 3IAM2 2WB9A 3UOMA 4RQXA 1BG5A 1X5CA 2CAIA 1AQWA 2MMZA 1GSFA 5J9CA 4OWYA 2FWEA 4ECIA 4ML1A 1YJ6A 4ISDA 2H6XA 5A5KA 4XTSA 2OKAA 3KMNA 2F3MA 1G0TA 5EL8A 6GSXA 4ZB9A 1OYJA 4PNGA 3KMOA 2NPBA 3LQ7A 2AJQB 6GSWA 5ECMB 5A4VA 1UA5A 5HR1A 2JU5A 2P0GA 2B1KA 2QKEA 2KP2A 1K0BA 2CX3A 3C8EA 3WT1A 4V1Ag 1XOBA 4DSQA 1URMA 5ENUA 2M80A 3F6FA 2X8GA 3G7YA 4BPYA 4F0BA 2VL3A 1PN9A 3F63A 2E7PA 3P2AA 3TDGA 1U87A 4POMA 4YQUA 4MF5A 1GSSA 2GS3A 3WYWA 4XRDA 4LLRA 4MH2A 3QOUA 2REMA 2C4JA 1BEDA 1OC9B 3I6AA 2AYTA 2LRTA 3FRCA 5IO0A 5IMVA 2PVOC 3D21A 5E59A 1G7OA 14GSA 4E8EA 4HU9A 5AISA 1QMVA 1PQNA 1XIYA 2IIYA 3UVTA 4V1Ap 3UMAA 5J5NA 1PL2A 1U6TA 2LTKA 5ID2A 2JZTA 1ZMAA 12GSA 1A23A 3A2WA 3VWXA 3QD9A 3BOAA 3KTLA 2IJYA 1PKZA 1XVQA 1T8EB 4ZXGA 3FZAA 4RI7A 5IOWA 4V2LA 3G9BA 2LJAA 3LJRA 4P3YB 3IHQA 5D73A 2JADA 3APSA 4ZILA 6GSYA 22GSA 3IPZA 5HQPA 2GTUA 2KOKA 2YANA 3P8WA 3CRTA 1XOAA 2HZFA 5DAKB 2OBKA 2VCXA 3IR4A 3ZFBA 1GUMA 3DXBA 4H86A 2H0IA 2M72A 4HJMA 3L9SA 2BTOT 2H0HA 4EXJA 2H1DA 1K0DA 3ZMKA 2XBQA 4KDYA 3LG6A 3A2VA 3APOA 4E8HA 3HJMA 5DJMA 3F8UA 5CNWA 3HVXA 2VAFA 4F9ZA 4PNFA 2K18A 1EV9A 3DEXA 20GSA 3LFLA 2NTOA 1VF4A 3WD6A 1CQGA 4IBPA 3TKPA 3ZVJA 4KDXA 4IP6A 2H73A 1VF1A 1RK4A 4ZBBA 4G19A 1AUCA 1OC3A 7GSSA 1XWGA 2RM6A 3RDWA 2LRCA 4EUYA 2B5YA 2YN1A 1QK8A 2XBIA 4WR4A 3C71A 4POBA 1FB0A 1A0RP 1Q4JA 2HYXA 3BCIA 2OE0A 1SD9A 4NHWA 5J41A 4LMWA 1PKWA 5DALA 2VM2A 2X99A 3E0UA 4WF5A 1M2DA 3ZMLA 3D4TA 3TJKA 1OC8A 3W8JA 2K8SA 2J9HA 2IN3A 1OE8A 1EP8A 1HNBA 2DSAA 3EYTA 4K0GA 3CSJA 3P7XA 2H6ZA 4FYCA 1QFNA 5ECPB 1SYRA 1B4PA 1WMJA 1TRWA 2K8VA 3APQA 1B48A 2RM5A 2I3YA 1A2LA 5HR3A 2P5QA 2Z9SA 3M9JA 5CYYA 4GWRA 1C72A 2VL9A 2XPDA 2C3NA 4TXOB 4TR1A 2ES7A 2YOIA 4I5QA 2YP6A 3WT2A 1F9MA 1FOVA 4K9ZA 2VOCA 2I9HA 1YEPA 4IN0A 13GSA 3EU3A 1F3BA 5FHIA 3A2XA 3GUSA 4BVXA 2IFQB 4EKZA 4TW5A 2N5FA 4ECCA 1K0CA 5B6NA 1HNAA 4MCUA 3F3RA 2YWIA 4NPBA 3ZREA 4F0CA 3PINA 3O3TA 3UARA 4GSSA 4NWYA 1A0FA 3TJJA 1XBSA 4HEA2 2GDRA 4Q5FA 4TR4A 1O6JA 2HLSA 3CXGA 4G2EA 4LL4B 1A2JA 4KH7A 4HU7A 2PMTA 3ZITA 1SKWB 4MP4A 4OFTA 2JZSA 1SL0B 4DSRA 2ZCTA 2VCZA 1SKSB 3K8NA 1SJZA 1XCCA 4KCAA 1WPIA 3HKRA 3KXOA 2VIMA 3DMLA 3QR6A 1ST9A 5F0GA 1TI3A 4FH8A 5EPFA 2LSTA 5A4WA 3KCMA 1B9YC 3CRUA 1K0AA 1TU7A 4OFMA 3GL3A 2AB6A 1A2MA 5LNKe 3F9UA 1V2AA 17GSA 3ZTLA 3ISOA 3GKKA 3FR6A 2HFDA 1O8WA 1GL8A 2IMIA 3GNJA 4N0ZA 4BWQA 4I97A 4DSSA 3MSZA 4I2UA 1ZYQB 3GYKA 3I43A 4K7NA 3R2QA 1E6BA 4WKWA 4EVMA 3TKSE 3H4KA 3FK8A 1M2BA 3LEFA 2FWHA 1PRXA 5ECNB 4GRFA 3UIWA 4ZB8A 4MZBA 1FVJA 4L0UA 6GSVA 3NIVA 3LXZA 2WZ9A 4QQ7A 4TRXA 4KE3A 4ZB6A 5F05A 2LJRA 3LWAA 5IOXA 1YF0A 3D22A 1WIKA 1QXHA 4L8EA 3UBLA 1EEJA 1GULA 2HXKA 2F9SA 3LYPA 4OCFA 3VWVA 2E2MA 4PUAA 5G1LA 4GQCA 2PBJA 3KIJA 1TI1A 2YJ7A 3UAPA 4HZ4A 5JWRB 1XW6A 3GIXA 2LV3A 2H30A 1K3OA 1RW1A 1GUHA 1OE7A 5ECSA 3TJFA 5B7CA 4G9HA 4HQZA 1UC7A 2PVQA 3EWLA 5G31A 5ID2B 1DE2A 4K7OA 4EF0A 2QC7A 1ON4A 2F8FA 1XW9A 3QFAC 2V6OA 1F2EA 3V1WA 4FO5A 3O76A 3QCPA 2YWOA 2QSIA 4JR6A 2MBSA 4O7HA 8GSSA 5CRDA 5JCUA 2JZRA 2WULA 1T00A 4F03A 4XRAA 2DJ3A 3GRXA 3NOFA 2DJKA 1X0RA 2O7KA 1J08A 5CP1A 1GNWA 2H66A 3IA1A 4XCSA 4MMMA 4GF0A 2EC4A 4XS4A 3HYPA 1JZOA 3OR5A 3DKSA 4LL1B 1XWCA 4AJ6A 2R5GA 2KHPA 2LRNA 4G10A 3GN3A 1GNEA 2HNLA 4MABA 2AHEA 3IAS2 4KGIA 5G30A 2PU9C 1B9XC 1I9DA 1HQOA 3IDVA 1PX6A 1OKDA 4K6XA 2NDOA 4IHUA 3EVIA 4ZBAA 4MJCA 2DJ0A 3RAZA 4BL7A 3TOUA 1OAZA 5CRWA 2IMFA 2DIYA 4ZIJA 4PQIA 5JWQB 5C00A 5JCWA 4KCEA 2D2ZA 2PERA 3ERGA 3HY2A 11GSA 5AIXA 4ZL9A 1K0MA 2XC2A 3HDCA 3RHCA 5DALB 3VI5A 3Q19A 1TKDB 1IYHA 1AXDA 2A4VA 2C0FA 3W6GA 3SBCA 1FHEA 4GCIA 4IGJA 2CVKA 1EGRA 3FZ4A 3F3QA 5DQSA 2FWFA 2GT5A 1GWCA 4J56E 1JLWA 1KBNA 2H76A 4ZL8A 5F06A 5B6MA 4I2TA 1V98A 4ECJA 1FW1A 3TOTA 6GSTA 2QGVA 4OO4A 4OFNA 3GURA 3ME7A 1S3AA 3DYRA 3IV4A 5JWOB 4Q5NA 4KDUA 3EE2A 4CDOA 1XVWA 1MD4A 5IO2A 4TR1B 4IW9A 1BAYA 1XPVA 1AW9A 1TDIA 1ILOA 6GSUA 4F82A 5HFIA 5KEJA 1Z7RA 1M7TA 3GV1A 1V58A 2GSQA 4QL9A 3PGTA 1FAAA 2N5BA 1UVZA 3J7Yb 1EOHA 2CV4A 4ILFA 4IJ3A 1O81A 2FLSA 1FO5A 4POKA 3D5JA 4MPGA 4XIHA 3GKNA 3E9JB 1X5DA 1X9WB 3M9KA 2GVPA 4I8BA 3GFKA 2LNTA 1TK0B 1R4WA 1U3IA 4IQ1A 3D4MA 1HYUA 4AGSA 1K0OA 2YNXA 2PPTA 1TRUA 4JEDA 4ZL7A 4IP1A 2GQMA 1SJIA 2WGRA 3QAWA 3FZ9A 4TKYA 1MDKA 3TJBA 2ZNMA 1SYXA 1Y6EA 4J57E 3ME8A 4PXOA 1ZL9A 1SKRB 1J9BA 5J3RA 1GUKA 4AJ7A 2H0GA 1K3LA 4OCEA 1WJKA 1YEXA 3KH9A 5FT3A 3P90A 3L78A 1GRXA 5GAPD 3ZRDA 3FZ5A 1Z3EA 5D9XA 1TRSA 5IM9A 3TB2A 4GSTA 5CREA 4NMUA 1TXXA 1GTIA 1V9WA 1G6YA 3TRQA 2AV4A 2L5OA 5ECHB 4DSSB 2HZEA 2X8CA 2ALBA 4JRRA 4JE1A 5ECRB 3CSHA 2B6MA 3DGQA 3N5OA 5LCZA 2H74A 2MYGA 2GGTA 18GSA 2J23A 1R7HA 3M1GA 4N0VA 2H72A 3ERFA 1YDKA 1ZCPA 3M3MA 3DIEA 4ZBDA 4HI7A 2HT9A 3IRAA 3VPQA 16GSA 1GSUA 1GSDA 1WE0A 2GSSA 4K8MA 2E0QA 3KM6A 3RPPA 3LXTA 4PUFC 1TTZA 2H75A 3QDNA 3L4NA 1FG4A 1YF1A 2IMEA 5ECOB 4YAVA 1JZRA 5ELGA 1YKCA 2H01A 2CQ9A 1PD21 3C1RA 4IELA 1H4OA 2B7JA 3SWLA 1VF3A 2VCTA 4EC0A 5HR2A 4DVCA 3PR8A 2FNOA 3VFIA 4TOPA 1E2YA 3PH9A 4FYUA 2EIOA 1F37A 4PQHA 3C73A 2VCQA 4YAPA 5KN3A 2PN8A 1YZXA 4X1UA 2RIIA 4AJ8A 5H5QA 1OKTA 2H1BA 5AGYA 4J2FA 3HVVA 2RLIA 2O89A 1BX9A 4GTUA 1THOA 3BJ5A 2FHEA 5G5EA 1SENA 1NSWA 1H75A 3GX8A 3WGDA 5D9VA 3HA9A 3H1NA 4MDCA 1AAZA 1YKAA 1R5AA 3GKXA 1SJ6A 4GQFA 4XS4B 5IPHA 3JCML 3HJOA 1GLPA 4HUAA 1B4QA 3ZIVA 2BMXA 2CT6A 1QGVA 2VCVA 4EO3A 5A4UA 3EU4A 2CVDA 4KAEA 2V2GA 4OMVA 4KNDA 1XWBA 3FEUA 4YQVA 2VCWA 1JFUA 3M0FA 2X8HA 5CAXA 3HCZA 4WEYA 1WP0A 3J7Yk 1EV4A 2LQQA 4GLTA 6GSSA 1MD3A 3UEMA 1TU8A 1TW9A 2FUG2 2LNSA 3GTUA 1LJRA 1SL2B 4KUNA 2GZPA 2CVBA 2X64A 3UJ1A 1QQ2A 3IC4A 3A5WA 2GZYA 4JU5A 5ECLB 1SD8A 5DQYA 5DCHA 1O7UA 2V32A 4PGTA 1ABAA 4RI6A 2V6KA 2O85A 4TR0A 2FY6A 4L5OA 2EIRA 2C0GA 4HQSA 5KN1A 3HJPA 1T1VA 5D93A 2EIQA 4ECBA 3CSIA 2VLUA 2NVLA 4WETA 1MDJA 5IPGA 5CRGA 3EURA 2N5AA 4HZ2A 5LD0A 4WXTA 1FVKA 2ON7A 3VK9A 5GAND 4KSMA 4KW6A 3LSZA 3W8SA 1M9BA 4I6XA 1T4ZA 1V57A 2OE1A 3KZQA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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