2RFSA

X-ray structure of su11274 bound to c-met
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
280
structure length
264
Chain Sequence
QHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLKIHCAVKSLNIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVHTGAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title c-Met inhibitors with novel binding mode show activity against several hereditary papillary renal cell carcinoma-related mutations.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hepatocyte growth factor receptor
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 264
sequence length 280
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2007-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2rfsA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2rfsA01
3PJ8A 3SG9A 2V7OA 4BI1A 3JY0A 3L8XA 3W2SA 4QP2A 5AIRA 5BVKA 2XNGA 4ANOA 4DEIA 4XG2A 2W4JA 5FDPA 1OL2A 4IWPA 1DS5A 3DS6A 3RVGA 4TYHB 4YU2A 3WF8A 3DFCB 3TZMA 3DJ5A 4DT9A 5JT2A 3AD5A 4FIEA 3HLLA 3FKLA 3ODYX 4AT3A 4ZLYA 5H3QA 2QURA 1RQQA 4BZDA 3N4VA 3BHTA 2OG8A 4FTKA 5IQGA 4FC0A 4BCGA 4KIKB 4QMZA 2ONLA 3V3VA 3QHRA 4NSTA 3AC3A 1JQHA 4QMOA 5D1JA 3CS9A 1YI4A 2PL0A 3G33A 1JNKA 1Q24A 1E9HA 2VX0A 4I20A 2QC6A 4YZMA 5A4QA 4DFUA 2OZAA 2QNJA 4AW0A 3UQFA 4WIHA 5EFQA 4JG8A 3MH2A 4UY9A 5AP0A 5HI2A 4DGGA 4KBCA 2BDFA 2XP2A 3IGGA 3P79A 3EFLA 2R4BA 3IECA 3Q53A 2R7IA 4CFNA 5JGDA 4DFBA 2WMVA 2Z8CA 4KBAA 5DH3A 2CN5A 5HICA 5C4LA 4QTCA 2F9GA 3Q9WA 4WA9A 4UMRA 2E9UA 5EQYA 3CY3A 4BDFA 3DU8A 4EHVA 1FPUA 2IZSA 5AUWA 3PSBA 4I5CA 4O0YA 4EWHA 3V8SA 4PMSA 1H26A 1PHKA 4BGQA 3UJGA 4AN2A 1OIQA 1U59A 4MD8E 3AOXA 4BCQA 1JSVA 3KRJA 4R7BA 3P9JA 1GAGA 4WD5A 4ZSLA 1O6YA 2XMYA 1SVGA 4F6SA 1YDTE 4I5MA 2VTPA 2WXVA 2BZJA 2WQOA 3FPQA 2PVFA 4FZDB 4HGLA 2W1ZA 2XRUA 2HY81 2VTAA 5AP7A 4DTKA 2BTSA 3ZZEA 4BZOA 2WO6A 3EFWA 4CT1A 3DXNA 3RK5A 2IW6A 3AMBA 2QU5A 2WMUA 5FTQA 4O22A 4ASXA 4G5JA 2PE0A 3A4OX 4L01A 4X2GA 4C7TA 4LGDA 4YR8A 3B2TA 3FMEA 4QYEA 3D14A 3ORTA 5M55A 1XBBA 4XV3A 4DLJA 5EOBA 3BLRA 2C6IA 2FB8A 3NNXA 4FKQA 4E4NA 4R6VA 2WIHA 3RCDA 5HORA 2XK9A 4JBQA 3RWPA 4FMQA 3LLTA 5E1SA 4F64A 4AACA 3TNHA 1IA9A 1IAJA 4FTIA 4UMQA 5DVRA 3VJNA 5IPJA 3MWUA 2C6MA 3OT3A 2OSCA 3VRYA 4Y73A 2R3RA 3F9NA 2WMSA 3OCTA 1I44A 2E9NA 3D2KA 3EQCA 2Y4IB 2V55A 5EK7A 5CXHA 4OT6A 1YWVA 4FKJA 5J87A 2BKZA 1FVRA 2UW9A 2WEIA 4D9TA 1ZZ2A 2JFLA 1VYWA 3BRBA 5FDXA 4C33A 4EZ7A 3O17A 4FT5A 4Z3VA 5JH6A 1W98A 3BGZA 5AADA 4C4GA 3FQSA 1BX6A 2QQ7A 4J98A 3DK6A 3DBQA 3QAME 5AV3A 3S95A 4MTAA 4QMVA 5CASA 5CEMA 2QKWB 1G3NA 4IHPA 2XNPA 2YM6A 4DFYA 4FV6A 3FE3A 4U45A 4EHGA 4AG8A 5CXZA 1Q8TA 4D28A 3VULA 3EQGA 2ITUA 4A9TA 1REJA 4PRJA 3F3ZA 2R2PA 4FEVA 4B7TA 3DOGA 4J52A 2J5FA 1Q97A 1BMKA 1ZOGA 4W4XA 3RALA 2FSLX 3PY0A 3B8RA 1TQMA 3CKWA 2X4ZA 2C0IA 4FV1A 4DCAA 4DN5A 4O7SA 5DFPA 4H36A 2REIA 1ZZLA 5IH4A 2CJMA 3VN9A 2RFEA 2XNMA 4FA2A 4GJ2A 3JXWA 4CKIA 2CNVA 4PL5A 3M2WA 3H0YA 4FVRA 3ZBFA 3OROA 3ZUTA 4KD1A 4L8MA 3DBCA 4AX8A 5HZNA 4C3PA 3ODZX 1PRYA 2C3JA 4FZ6A 2OF4A 2C30A 4JAIA 4LI5A 4ZTRA 2LAVA 3PA4A 1NVSA 5AP2A 4MAOA 3KXXA 2WU6A 4NKAA 3EFJA 4HCVA 3RCJA 4PX6A 3WYYA 3TIYA 1L8TA 4MEDA 3OCBA 3NW6A 3GOPA 3FYKX 4NJDA 5ETAA 4ANSA 4EI4A 4LL5A 5LVOA 4U6RA 5F1ZA 3ORKA 3LVPA 3QGYA 3DKFA 3OOGA 4FR4A 4MF1A 4PPAA 5C03A 4M84A 4FNXA 4YLJA 3VQUA 4E6AA 5HTBA 5EHYA 3VF8A 4C02A 4C4JA 4GG5A 4QQTA 3F5UA 4IB3A 4IWDA 3FWQA 1HOWA 3DFAA 4MVFA 4Y85A 3WF5A 4QP4A 3UQGA 4I4EA 5CF6A 4C36A 4FG7A 2R9SA 1VEBA 4UYNA 4R78A 4NW5A 3BU5A 4DGLC 3IO7A 3JVSA 3Q2JA 3O0GA 4IWQA 3DB6A 2W1FA 5CY3A 2IVTA 4JL9A 3PXQA 5CU4A 3UIBA 2BCJA 3QQKA 3OY1A 4ZSGA 3VS5A 3UPXA 5HCYA 5GZAA 5C9CA 3VUIA 4U81A 1KUTA 3PIZA 4FTJA 4LMUA 5JQ5A 1G5SA 4EH7A 2NPQA 4TYHA 2WPAA 3EN9A 2JITA 3CCNA 3DGKA 3LFAA 4ACGA 3EQBA 2QO9A 2WFYA 2B9FA 4L42A 4ZLOA 2WNTA 4KRCA 3GP0A 4RFYA 3TIZA 2YABA 2JDOA 3IOKA 2W1DA 4P5ZA 3PLSA 4KIKA 3A62A 3L8VA 4ZMFA 4CLIA 4M0YA 3E92A 3Q6WA 3GU5A 3FLZA 5BYZA 1R3CA 1ZAOA 3IDCA 3PWDA 2NRYA 4HZRA 3K3IA 3VW8A 2QCSA 2P3GX 2PZ5A 4C62A 3IONA 4NTSA 3G9LX 3Q9XA 5FUTA 4EH6A 3HV3A 4I6HA 3JUHA 4FVPA 2P33A 5HU9A 3GC8A 1OIYA 2BPMA 3S0OA 4G3FA 4LRMA 3ZCLA 3I81A 2YDKA 4GIHA 4D1XA 3AMAA 3QXPA 2A2AA 3QRUA 4NKSA 3QA0A 4IM2A 3F7WA 3H9RA 4W8DA 3QUPA 4BWXA 1Q3WA 2J9MA 2VWXA 4F7NA 4PNKA 5GIPE 4NUSA 5EKOA 4TYIA 2Z02A 4QMMA 4AZWA 5K3YA 2QG5A 3VUGA 4CEGA 4FKUA 3JR1A 4NW6A 1UVRA 4DLIA 5LCJA 5EQPA 4UV0A 4CQGA 2H8HA 2C0OA 1M52A 2PE2A 2R64A 5DR6A 3RM7A 5E8TA 1FGKA 3QQHA 4RJ3A 4WNOA 3ACKA 1OB3A 3RTPA 4D2WA 2G9XA 5B7VA 1H08A 1H27A 4DYMA 2ZMDA 3LQ5A 4I6QA 3CTJA 4BYIA 5HG8A 4GT3A 3FC2A 3CBLA 4FIIA 5JGAA 4FVQA 3GU6A 1SVEA 4KSQA 3A7FA 3QGWA 1IR3A 4CZYB 2J7TA 3PXYA 2C1AA 1BI8A 4CFUA 2YIQA 1M14A 3AD6A 4NM3A 3OXZA 2XNOA 4GU9A 1MQ4A 4IX3A 1J7UA 3BEAA 2XNBA 4MX9A 5EH0A 4YTIA 1TQIA 2KULA 3DBFA 3GT8A 4GFGA 4HZSA 2IW8A 3TI1A 5M44A 4IAZA 3UOJA 2GS6A 2OI4X 2BZIB 4FK3A 4IAKA 4MH7A 4EK5A 2WB8A 3NUNA 4C0TA 5HX6A 3VUDA 3UOHA 4JDJA 3PY3A 4DHFA 2HW7A 1DAYA 3A61A 3B8QA 1LPUA 1Q62A 3HMIA 4UEUA 4WG3A 3E3BX 4LOPA 4CLJA 5J9LA 4TWPA 3HAVA 2VO7A 2AYPA 3TUDA 5CEKA 4OTQA 1H01A 2XUUA 2C3IB 4G6OA 3W32A 5CANA 4EYJA 2YCFA 3UIMA 4UZDA 3TV6A 3QRJA 4LOQA 2CCHA 2B1PA 2OXDA 5DN3A 3BYOA 3PPZA 4JXFA 2PZYA 4B0GA 2Z2WA 3BELA 5IA2A 3F88A 3JPVA 3KMMA 4IJ9A 2XJ0A 5CENA 4YJRA 5EOLA 4S32A 2O8YA 2RG6A 3TXOA 4BTFA 1GNGA 4WG4A 4BDGA 2PTKA 3HV5A 3D94A 4GG7A 4TPTA 4IBMA 2EB2A 3FZOA 4K6ZA 4NCTA 5AMNA 3NYOA 2R3NA 3TJCA 4EH4A 4F7SA 4AE6A 4FSRA 3F2NA 4USEA 4C4HA 2GQRA 2ZM4A 1E1VA 3ERKA 3VW6A 1Y8GA 4RIXB 5D7VA 5AR4A 4FNYA 3W2QA 3T9IA 3ZXTA 3LFSA 3C5IA 3FEGA 3MB7A 2PVKA 3SDJA 4WBBB 3SC1A 1B39A 4OBOA 2C5VA 4OTGA 1JWHA 4ZTQA 4AF3A 4EJNA 5AUTA 5EYKA 4D5HA 2BIKB 3R63A 4QMTA 4EOMA 3F69A 4C58A 3KREA 5EYMA 2ZV7A 5CEOA 2I0YA 4XBUA 1PXOA 4RJ7A 3W18A 3OWLA 3IKAA 3R71A 4H1MA 3OD6X 3QWJA 5ANDA 5LMAA 4RGJA 1RE8A 3R7EA 1OPKA 4M0ZA 2I0EA 4AW2A 5FTGA 2FO0A 3P4KA 3NAXA 5AX3A 4XEYA 4JR3A 2Y4IC 4F9YA 1A06A 3KXGA 3IW5A 2XCHA 1PXMA 2BIYA 3PVBA 4GUEA 3CPBA 4H3PA 3PDTA 2VTLA 2JKMA 3HMOA 1MRYA 3MA6A 2QKRA 5ANEA 2H34A 4V0GA 1XR1A 3VUKA 2Z7RA 1UNHA 4IAAA 4Q2AA 3OXIA 2OXYA 3TT0A 4EK4A 1URWA 4WSYA 3VUHA 4FEUA 4AA0A 5HQ0A 3OCGA 1NVQA 1OKWA 5AUVA 1IASA 1W84A 1YRPA 5IU2A 1AGWA 2XBAA 1R0EA 3ROCA 3LHJA 1YW2A 1ZOHA 2Q0NA 3HP2A 3FBVA 3QUEA 4RLLA 3O8UA 3BZ3A 4PDSA 4HVDA 2GTNA 5A4TA 4O0RA 5F95A 5FEEA 2E9VA 2G2IA 5HO6A 2ITZA 3VS6A 5KUPA 4HOKA 4S2ZA 3MVJA 4QTEA 3QTUA 3SD0A 5DT3A 5C27A 5J5SA 2X2MA 3Q4ZA 3PIXA 4IMYA 3FKOA 5M56A 1PMUA 2PK9A 3N4UA 2GFSA 4C61A 1WBSA 4APCA 3WZKA 4OGRA 4D9UA 1OL5A 2ETMA 3BIZA 4I22A 3QRIA 5E8YA 3NIEA 5C1QB 4OR5A 3C4CA 2ETRA 4XNEA 5AA9A 1H28A 2B9JA 4IM3A 4O7TA 3ZO3A 3TDWA 4Q9ZA 1JLUE 3HUBA 4GVAA 3HL7A 3ZTXA 3NYXA 4EOQA 1B6CB 4CD0A 5IKWA 4LQMA 5TKDA 3KF4A 3NUXA 4RIWA 4DG0E 3SV0A 5L2SA 2JD5A 4L9IA 1ND4A 3HUCA 4IH8A 2CN8A 4O38A 3V5WA 4W4VA 1H1PA 5CVHA 2VTTA 3COKA 2QR8A 5I9VA 4ITJA 4D4YA 2FSTX 4JBOA 5CF5A 1GIIA 2PY3A 1A48A 3MESA 3MVLA 4YHTA 4BTKA 5K0XA 2J5EA 2J50A 4DBNA 2FA2A 3C4ZA 3ZZWA 3QZIA 2R3OA 5G6VA 3G0EA 4N70A 5L6WL 4ZJIA 3EQHA 3A7GA 4FV9A 4QTBA 4HGSA 1HCLA 2ESMA 2UZNA 4BKYA 4O0VA 5J1WA 2VWVA 3R83A 2JGZA 3G15A 3D9VA 3GB2A 1UWHA 3AD4A 3WZJA 2PUUA 2V7AA 4XOYA 5I9WA 5H2UA 2GS7A 1P4OA 4ZTHA 4BBEA 4D4RA 2J0KA 3R9OA 1V0PA 4K77A 4ZSJA 4AWIA 4ERKA 5HIEA 4FV8A 2Y6MA 4XUFA 4BFMA 3OEZA 4M15A 5HD7A 4HVGA 3UOKA 3VBXA 4IB5A 3ANRA 4V05A 3OUNB 3W10A 5CALA 5GJDA 2QU6A 3FMNA 5L2WA 4PDYA 3MDYA 4K33A 4FUYA 4UBAA 1OI9A 3O51A 2NNWB 3EQDA 3TG1A 4IX6A 2PVHA 3GVUA 3UG2A 1K3AA 3DK7A 4NH1A 2VTNA 4F9BA 2YM7A 1U46A 4MWIA 3CP9A 4I41A 4DFZE 2CGUA 4UMUA 2XCKA 2OIDA 1Q99A 4DITA 2WMBA 2WELA 1UKHA 3BU3A 4IQ6A 4X3FA 3R7IA 5M4FA 3PWYA 3HDNA 4WOVA 3FUPA 5E7RA 3ORMA 1GOLA 4Z16A 4DA5A 4J53A 5BPYA 2XH5A 4TWOA 5AUZA 4KS8A 1PMNA 4KSPA 5CWZA 3RPSA 3U6IA 2IG7A 2Y7JA 3EQFA 1RJBA 4BVUA 4EH2A 2ZB1A 3VS0A 1ZYCA 3FY2A 4CSVA 4RJ8A 3GXLA 2BR1A 2X4FA 3QWKA 3QXOA 4TYEA 3Q3BA 4IB1A 3E62A 4G16A 4JT3A 4LFIA 1H1QA 4BDDA 5CX9A 3N4TA 1S9IA 4X3JA 3R9DA 5IUGA 1TVOA 4YHFA 2DWBA 1EH4A 2WD1A 2AC3A 4KA3A 2IWIA 3BWJA 2OK1A 4R1YA 3HV7A 4EHZA 4RWLA 3E64A 2O63A 5KKRB 5BYLA 3R7UA 3SA0A 5CSVA 4GKIA 4AGWA 2CDZA 4QMWA 3PSDA 5LVMA 4OTFA 5CNOA 1WVXA 3LPBA 3TCPA 2WTJA 4QP8A 4FKOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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