The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
44
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sequence length |
142
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structure length |
142
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Chain Sequence |
LTAEEKAAVTGFWGKVKVDEVGAEALGRLLVVYPWTQRFFEHFGDLSSADAVMNNAKVKAHGKKVLDSFSNGMKHLDDLKGTFAQLSELHCDKLHVDPENFKLLGNVLVVVLARHHGSEFTPLLQAEFQKVVAGVANALAHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage, oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha-1/2
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| publication title |
Crystal Structure determination of Goat Methemoglobin at 2.7 Angstrom
rcsb |
| total genus |
44
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| structure length |
142
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| sequence length |
142
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| chains with identical sequence |
D, J, L
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-10-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3QM6 A; 4UZV A; 2HZ2 A; 5JDO D; 4AVE A; 1VXA A; 5E29 B; 2DN3 A; 1XZ2 A; 1XZV B; 1NGK A; 1A3N A; 2NRL A; 3SDN A; 3D4X B; 1KD2 B; 4MQK A; 3R5I B; 1ABY B; 1GBU A; 2D60 A; 3RJN B; 3WCW A; 2HBE A; 3ZJQ A; 1AJ9 A; 2FAM A; 1YEQ B; 4FH7 A; 1DTM A; 1YE2 A; 4NXC A; 4IT8 A; 4QAU A; 5SW7 B; 3V2V A; 3WHM B; 3UHB A; 4MQH B; 2IG3 A; 2OH9 A; 4NK2 A; 4WCH D; 1QSI A; 1HBH B; 2C0K A; 2XKI A; 1JF3 A; 5EUI A; 2HHB B; 4TWV A; 1MBO A; 1QPW B; 1JF4 A; 1Y4R B; 3P5Q A; 2MGL A; 2VLX A; 3A59 B; 3UHV A; 3A5B A; 1VXF A; 3A0G B; 3ZJN A; 5AZR A; 1YVQ B; 4N7N A; 1FLP A; 2DN2 B; 3UHG A; 1BVC A; 2V1I A; 3E5O A; 3W4U A; 1SPG A; 2B7H B; 3S1J A; 1MOA A; 3ARK A; 2W72 B; 1PBX B; 5CN9 A; 3ZJP A; 1Y4F B; 4NS2 A; 2PEG B; 1FN3 B; 1NXF A; 1F5O A; 1VRE A; 4BJA A; 5E83 A; 1YDZ A; 2JHO A; 3ARL A; 3LQD A; 5MBA A; 1O1P A; 3PT8 A; 3K8B B; 1K1K A; 5CNF A; 4JYQ A; 5AZQ A; 3WFW A; 3GK9 A; 4WJG 1; 5KER A; 1XZ4 A; 3KUO A; 3AT5 A; 1UC3 A; 1HBA A; 4N7P B; 1Y4V A; 1YMB A; 3A9M A; 3HXN B; 5CNC A; 1J7W A; 1YHU B; 3WCV A; 3MVC A; 3QJB A; 3HEO A; 4OF9 A; 1C7C A; 1V4U B; 1V07 A; 2GKN A; 3WTG B; 1Y7G B; 3D1A A; 3ONZ A; 3MKB B; 4GZG A; 5EET A; 4MQG A; 1GBV B; 3GLN A; 3MJU A; 5CN8 A; 2V1J A; 3GDJ A; 3MYM A; 1CG5 A; 1DKE B; 5ILP A; 1NZ2 A; 3QJE B; 1Y5K B; 1HAC A; 2G0X A; 1XYE B; 5AB8 A; 2OHB A; 5IKS A; 3WCU B; 1JY7 A; 1YMC A; 2G0S A; 3CIU B; 3IC0 A; 5JGG B; 1OJ6 A; 1LH1 A; 2MHB A; 1A01 A; 2RAO A; 1BZZ A; 1Y8K A; 2HCO A; 1MYZ A; 2FRJ X; 1CG8 B; 4SDH A; 3EOK B; 1LH5 A; 1THB B; 111M A; 3S48 C; 1CO9 A; 2O5M X; 3CY5 A; 4N8T A; 4AVD A; 1C7B A; 1MZ0 A; 1LH7 A; 1LFL B; 3QQR A; 1U7R A; 2HHD B; 1NZ3 A; 1A9W A; 1G08 B; 1Y7D A; 1QSH B; 3IC2 B; 2KSC A; 1MLL A; 5ILM A; 1UX9 A; 1WLA A; 3UHN A; 1JL6 A; 3S1I A; 3PI9 A; 3ZJL A; 3PT7 B; 1S61 A; 5C6E A; 1MLO A; 5HLU A; 4ESA B; 1X3K A; 1CBM A; 5ILR A; 3MJP B; 1BIJ B; 3KMF C; 1MWD A; 1M6M A; 3S65 B; 1YHR A; 4HSW A; 1ABW A; 2HBG A; 1HGC A; 1SI4 A; 1S56 A; 1FAW B; 3BCQ A; 4FWX A; 3ASE A; 1DXU A; 3SZK A; 1RQ4 B; 1B0B A; 1J7S A; 1O1N A; 1O1L B; 1G9V A; 1HBS B; 2MGK A; 2W6V B; 4FC3 A; 2GTL C; 3R0G A; 1SDL B; 4FH6 A; 103M A; 3QM8 A; 3DUT B; 1S69 A; 5CHR A; 1Y85 A; 1BAB A; 1CO8 A; 1NS9 B; 3HYU A; 1KFR A; 1O1J A; 3G4W A; 2AA1 B; 1CH9 A; 1DWS A; 1Y4B A; 3TM9 A; 3AT6 A; 1RVW B; 1CLS A; 3M3B A; 5ILE A; 1MOC A; 1YHU D; 1RQA B; 3QM7 A; 2ZSP A; 1BBB B; 2ZLX B; 3NFE B; 3HRW A; 1YOG A; 4HRT A; 1GZX B; 2DN1 B; 1LH6 A; 3B75 A; 1GLI A; 2LH1 A; 4NI0 A; 4MAX A; 4G51 A; 1VWT B; 2H8F A; 4O4Z A; 4F6D A; 2ZSX A; 3PI2 A; 1WVP A; 1DM1 A; 1MTK A; 3HC9 A; 4FWY A; 1G09 B; 1A4F A; 1I3D A; 1YG5 B; 1CMY B; 1V4W B; 4MBN A; 3WCU D; 1MLR A; 2Z85 A; 1Y83 A; 3RGK A; 1DXT B; 1N9I A; 1HJT A; 1MNI A; 1CH7 A; 5E29 A; 1MBC A; 3BJ3 A; 3D4X A; 1KD2 A; 1A3O B; 1SWM A; 1V75 B; 1IT2 A; 1MTI A; 3R5I A; 1ABY A; 2R4W A; 3G4R A; 1MLN A; 2G12 A; 1H1X A; 3PI3 A; 1XCH A; 1ECO A; 1N9H A; 4FWZ A; 2HBF B; 1F65 A; 1YEQ A; 3MBA A; 3OZW A; 3PI8 B; 5SW7 A; 3WHM A; 1MBA A; 2OLP A; 4MQH A; 2MGH A; 1V4X B; 1HBH A; 1SHR B; 3UH7 A; 2HHB A; 1NS6 B; 1ASH A; 1YCA A; 1QPW A; 1IBE B; 1Y4R A; 1FSX A; 3A59 A; 1G0B B; 1Y0W B; 2IN4 A; 4L7Y B; 3BOM B; 3A0G A; 1YVQ A; 2O5Q X; 2DN2 A; 1HGB B; 3ZJI A; 5HU6 B; 4C0N A; 3WCT C; 3DHR B; 2V1K A; 3HEP A; 4G1B A; 2B7H A; 4PQ6 A; 2Z6N B; 2AUO A; 2W72 A; 2M6Z B; 1PBX A; 3M39 A; 2PGH B; 5HBI A; 2D5X B; 2MB5 A; 1BZR A; 3G4Y A; 2G0V A; 1VXB A; 1CQX A; 1YOI A; 2EVK A; 2EKU A; 1MCY A; 2DHB B; 1K0Y A; 3ZH0 A; 1LA6 A; 3K8B A; 4X0L B; 2ZSO A; 2D2M B; 1J41 A; 3OO5 B; 2MGI A; 1J40 B; 5E6E B; 1AJG A; 2VYY A; 2MGD A; 1ITH A; 1O1K B; 3UHY A; 3WCT B; 1XZ5 B; 2ZS0 B; 4N7P A; 4F6I A; 1Y0C B; 2HHE B; 3WR1 A; 1BZ6 A; 1YHE B; 2NRM A; 2R80 B; 1YHU A; 1HBR B; 2RI4 A; 2D6C A; 1VXG A; 3WTG A; 1Y7G A; 3MKB A; 1HAB B; 1NIH B; 1XXT B; 4KMV A; 1IOP A; 1GBV A; 3UHE A; 1Y7Z B; 3BA2 A; 3UHZ A; 1DKE A; 3VRE B; 3QJE A; 2FRI X; 3UGY A; 1TES A; 2AV0 A; 1Y5K A; 5JDO E; 1Y8I A; 2GLN A; 3AQ7 A; 1XYE A; 3OZV A; 2AUP A; 3WCU A; 3V2Z A; 2QU0 B; 1N9F A; 4HSX A; 3NMM A; 1MNO A; 3CIU A; 3ODQ B; 3UHD A; 1DO4 A; 3S66 A; 5MBN A; 1JEB B; 3EDA A; 5JGG A; 1DWR A; 2NX0 A; 1NPF A; 3G4Q A; 3GQP B; 2ZLT B; 1Y0T B; 1YGF B; 1FCS A; 1V5H A; 1CG8 A; 1M9P A; 1HBG A; 3WCP B; 2H8D B; 2ZS1 C; 3EOK A; 2D5Z B; 1Y0A B; 1THB A; 1GCV B; 3ZJJ A; 1IDR A; 4H2L B; 1Y4Q B; 1DLW A; 3AQ8 A; 1LFL A; 1HHO B; 1IRC A; 1LFY B; 3WFX A; 2HHD A; 1G08 A; 112M A; 2MBW A; 3A5G A; 1DTI A; 1QSH A; 3IC2 A; 2WTH A; 3ZJO A; 1LTW A; 1Q1F A; 1C40 B; 1BJE A; 1CPW A; 2ZS1 B; 1R1X B; 4M4B A; 1Y35 B; 1BIJ A; 2XYK A; 3S65 A; 5EYS A; 2R50 A; 4ROM B; 3HHB B; 1KR7 A; 1A6K A; 3VRG B; 6HBW B; 1FAW A; 1X9F C; 5CN7 A; 1COH B; 1URV A; 1XQ5 B; 1JZK A; 1LUE A; 1UIW B; 1O1L A; 2ZSN A; 1HBS A; 5JDO F; 1SDL A; 2BLI A; 4PQB A; 1J7Y A; 1YOH A; 3DUT A; 1YVT B; 4F69 A; 4HRR B; 1A0Z A; 3QJD B; 1CP5 A; 2D2M D; 4YU3 B; 1DUK A; 5F0B A; 4ILZ A; 1Y45 B; 1IRD A; 1NS9 A; 2MYB A; 110M A; 1Y09 B; 2LHB A; 3WCT D; 5CN4 A; 1EBC A; 2ZS0 D; 2AA1 A; 3UHH A; 1DXD A; 1RVW A; 5EV5 A; 1RQA A; 1S0H B; 2G0Z A; 1BBB A; 2O5B X; 1HGA B; 1HV4 B; 3HF4 B; 1MYJ A; 1GZX A; 2QFN A; 1HLB A; 2NSR A; 1AJH A; 2SPL A; 1DWT A; 1LJW B; 2NSS A; 1YIE B; 4H0B A; 1QXE B; 1QI8 A; 3UBC A; 1VWT A; 5CHQ A; 1G0A B; 1BZ1 B; 1LFZ A; 1O1M B; 2HBC B; 1CH1 A; 4MQJ A; 1YG5 A; 1YEN B; 1CMY A; 1V4W A; 3K3U A; 2HZ1 A; 1CIO A; 2VYW A; 2AUR A; 1Y8H A; 1DXT A; 4U8U C; 1XY0 B; 3LB4 A; 4JAC A; 1JZM A; 1MBS A; 2R4Z A; 1MOH A; 1A3O A; 1V75 A; 1MKO B; 1MWC A; 4DWU A; 4ROL B; 3ZJR A; 1VXE A; 3LB1 A; 1JWN A; 2ZT2 A; 1HSY A; 2MYA A; 5EE4 C; 1OUU B; 1TU9 A; 5KKK A; 1DUO A; 4F6B A; 3PI8 A; 2BMM A; 1Y4P B; 2MYE A; 2LH6 A; 1V4X A; 1FHJ B; 3EDB A; 1SHR A; 2ZS1 D; 4MXK A; 107M A; 1EWA A; 1NS6 A; 2OH8 A; 1XZU B; 1IBE A; 1G0B A; 3RJ6 A; 5HLX A; 1Y0W A; 2V1E A; 4L7Y A; 3BOM A; 3FS4 B; 3PIA A; 5HU6 A; 4TYX A; 3DHR A; 1HDA B; 3LR9 A; 2Z6N A; 1OUT B; 3G46 A; 1DO1 A; 2W6W A; 1CH5 A; 3LB2 A; 1FDH G; 5D5R A; 2PGH A; 5B84 A; 2D5X A; 1IWH B; 1OBM A; 2ZSQ A; 1BUW B; 5EU2 A; 1XZ2 B; 4X0L A; 2D2M A; 4F4O B; 3GKV B; 1UX8 A; 4NI1 B; 3OO5 A; 1J40 A; 2W31 A; 5E6E A; 2EF2 A; 3GQR B; 2Z6T A; 1O1K A; 2EB9 A; 3WCT A; 1XZ5 A; 2ZS0 A; 1Y0C A; 2HHE A; 5HAV A; 1RTE A; 2VEB A; 1YHE A; 3ZHW A; 1YEO B; 1BZ0 B; 1CIK A; 1CH4 A; 1HBR A; 4UUR A; 2MYC A; 2LH7 A; 3UH6 A; 4MQI B; 1A6N A; 1QXD B; 4O4T A; 4KMW A; 1HAB A; 1NIH A; 2O5L X; 4YU4 B; 1XXT A; 1RSE A; 1MBD A; 2G11 A; 2GKM A; 1O1O A; 2GL3 A; 1C7D B; 5D1V A; 2GTL B; 1NPG A; 2H35 B; 1BZP A; 3VRE A; 1JPB A; 3MOU A; 5B85 A; 1L2K A; 1Y5J B; 1EW6 A; 2QU0 A; 5HY8 A; 4DC7 A; 1JEB A; 1UFJ A; 1YCB A; 3QM9 A; 2LH3 A; 2R1H B; 1YDZ B; 3GQP A; 2ZLT A; 3LQD B; 1Y0T A; 2E2Y A; 2H8D A; 2D5Z A; 1Y0A A; 1YE0 B; 3TM3 A; 1GCV A; 2CMM A; 2OHA A; 4H2L A; 3PI4 A; 1J52 A; 1Y4Q A; 1HHO A; 1OR4 A; 2ZFB A; 1O16 A; 1LFT B; 1LFQ A; 4MPM A; 2HBS B; 3ZJH A; 108M A; 3ARJ A; 4PNJ A; 1XZV A; 3G4U A; 1C40 A; 2YRS B; 4UIQ A; 3D7O B; 3G53 A; 3NML A; 1ECN A; 1YGD B; 2AUQ A; 2MGG A; 1ECD A; 2ZS1 A; 4MQG B; 4ODC B; 1R1X A; 1A6G A; 1S5X B; 5JDO C; 1MLF A; 4ROM A; 2VYZ A; 3HHB A; 1GCW B; 5EE4 D; 3VAU A; 6HBW A; 1Y5F B; 1DO7 A; 1COH A; 1XQ5 A; 4PQC A; 1UIW A; 4HBI A; 2SPO A; 2HZ3 A; 1JP8 A; 3NL7 B; 2BWH A; 4HHB B; 104M A; 2DXM B; 1BZZ B; 2SPM A; 1YVT A; 4HRR A; 1UMO A; 3QJD A; 3ED9 A; 4YU3 A; 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1VHB A; 1YEU B; 3OJ1 A; 2ZSY A; 1IWH A; 3MJP A; 3QJC B; 1PMB A; 1HBI A; 1HDB B; 1BUW A; 3OO4 B; 3BJ3 B; 4NXA A; 4F4O A; 3GKV A; 4NI1 A; 1Y8W B; 3GQR A; 1LH2 A; 3NG6 B; 1RQ4 A; 2ZFO C; 3MN0 A; 3K9Z A; 1J3Z B; 2W6V A; 1CH2 A; 3UH5 A; 1BVD A; 1YEO A; 1BZ0 A; 2LH5 A; 1F5P A; 4F6G A; 5CNE A; 2W72 C; 1AZI A; 3KMF A; 4MQI A; 1QXD A; 1VRF A; 1GDL A; 2MGE A; 1OFK A; 3A2G A; 3DR9 A; 4WJG A; 3GKT A; 1Y7C B; 1FSX B; 1X9F B; 4YU4 A; 5CND A; 3ZJS A; 2G0R A; 4VHB A; 2ZFO B; 2ZT0 A; 5C6Y A; 2W6Y A; 2Z8A A; 1XZ7 B; 2GNW A; 3UI0 A; 1C7D A; 2GTL A; 2H35 A; 2GRH A; 1HCO B; 2ZLX A; 3D17 B; 3NFE A; 1JP9 A; 1RQ3 B; 2DN1 A; 1Y5J A; 1Y2Z B; 5F2A A; 1Y0D B; 2XKH A; 1YHU C; 3D1K B; 3M3A A; 2DC3 A; 3H58 A; 1I3E A; 2R1H A; 2HBD B; 1VXH A; 2R4X A; 1K0Y B; 1MLK A; 2GRF A; 1LA6 B; 2XKG A; 4XDI A; 1MYH A; 1DO3 A; 2D2N D; 1J41 B; 1G09 A; 1Y31 B; 1YE0 A; 1NQP B; 4NZI A; 5EYJ A; 3ORD A; 106M A; 3WFU A; 4LPI A; 3PEL B; 3WR1 B; 1LFT A; 3EU1 B; 2ZST A; 2ZT3 A; 3VRF B; 3SDH A; 2HBS A; 2RI4 B; 3WCU C; 1JZL A; 3UHS A; 1UFP A; 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