2RUFA

Solution structure of the a' domain of thermophilic fungal protein disulfide (reduced form, 303k)
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
GPLGSEGPVTVVVAKNYNEIVLDDTKDVLIEFYAPWCGHCKALAPKYEELGALYAKSEFKDRVVIAKVDATANDVPDEIQGFPTIKLYPAGAKGQPVTYSGSRTVEDLIKFIAENGKYKAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Redox-coupled structural changes of the catalytic a' domain of protein disulfide isomerase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Humicola insolens
total genus 22
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2014-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2rufA00
2O85A 1GNWA 4POMA 4XRDA 5IQYA 2XBQA 3GH6A 1A23A 3BOAA 4P3YB 4AJ8A 2DMLA 5D73A 5CRDA 1T00A 1A0RP 1XOAA 3QMXA 4TOPA 1OE7A 1A2JA 1HNBA 2HFDA 4IJ3A 3QCPA 2AAWA 4GRFA 5G5EA 3EU3A 1KEBA 1A8YA 3DEXA 4X1UA 4KH7A 1TK8B 3EMPA 1X9WB 1AW9A 2FNOA 2FWEA 1MTCA 1VF3A 4I2UA 2MZCA 5ELGA 4JZQA 5G5FA 3PH9A 1OC9B 3VI7A 4GSNA 1AIUA 3GTUB 3FR3A 2B7JA 1M2AA 1WOUA 1XPVA 2PVQA 2VOCA 1SJ6A 2FA4A 3NZNA 2HZEB 1B8XA 4H86A 4MJEA 2HZFA 3HVXA 1GRXA 3TOTA 2ZNMA 4JRRA 3F3RA 4ID0A 1KTEA 1JLVA 5J41A 3I43A 1YDKA 2HXKA 4IVFA 4PNFA 2PWJA 4O32A 3VPQA 1PKZA 5DDLA 1VF1A 2M80A 2C0DA 1R7HA 3KCMA 5JCWA 2YWNA 1XZOA 3EVIA 2H1BA 4OO4A 5JWQB 2H01A 4LA1A 4IKHA 3H4KA 2H1DA 3MAKA 1AUCA 2A2RA 2HRNA 3GIXA 1OC9A 3HJPA 3HCZA 4F2IA 1F9MA 3GTUA 3HY2A 1MEKA 4KSOA 1XCCA 4MDCA 4LLRA 4MF5A 2F3MA 1EOGA 1A2LA 5J3RA 1PX6A 3ME8A 2GQMA 2LKUA 3KH9A 2ON7A 1GTIA 1PGTA 1J9BA 3HVSA 3K8NA 4EXJA 10GSA 4L5OA 2DBCA 1FOVA 3KZQA 2CAIA 3GX8A 2JZTA 3RHBA 2ON5A 2J9HA 2Z9SA 1ACVA 1AQXA 2HLSA 2XPDA 3UBKA 2OE0A 1SJZA 4KSMA 2O87A 2N5FA 3DMLA 1U3IA 3ZZXA 4GQFA 2GVPA 2YCDA 3ZL5A 1V98A 1XWBA 3GRXA 4G2EA 1G6YA 3A3TA 1TK5B 1OVNA 4TR1A 2CVDA 3L9UA 4POBA 2B3SA 5CP1A 4EVMA 3DYRA 4AJ6A 2X8GA 4MZCA 2KUCA 5AN1A 2E2GA 3EE2A 4N30A 2B5XA 3TKSC 3D0ZA 3CTFA 2GT5A 1SK1A 1TU7A 3IHQA 1OKDA 3VWXA 4ECCA 5CO3A 3TGZA 4EUYA 2VCZA 4PUFC 1EEJA 4YQVA 6GSWA 4PUAA 2TRXA 2IL3A 2IMEA 2NTOA 2ALBA 5IO0A 3UVTA 1BJXA 5HR2A 4GQCA 1I9DA 1FO5A 2B7KA 4HJ2A 1RQMA 4G10A 1FB0A 1KNGA 5IOXA 3P7XA 3DVXA 2VAFA 3HD5A 5DCHA 5KN0A 2DMMA 2R37A 1SYXA 3ZIJA 1PA3A 4K7IA 3UJ1A 2H73A 3P8WA 3L9VA 2PU9C 1E2YA 3LG6A 1Z9HA 4ZXGA 4ZL7A 3UARA 1DSBA 5B6MA 5J4UA 3L78A 1TI3A 3H8QA 1QMVA 2K8SA 1WPIA 1GSDA 5INYA 3TRQA 2YV9A 2VM2A 4Q5RA 1S3DA 4MPFA 3GN3A 5HFGA 3ZITA 2AJQB 1Y25A 3FZAA 1F6MC 4OCEA 2OJLA 3O6TA 3QR6A 5JWOB 4RI7A 4NPBA 1XVQA 2F8FA 4HZ4A 5JCUA 2LNSA 2WCIA 1G6WA 1PKWA 3D4MA 2KLXA 4ZBAA 3VURA 2VL9A 4F0CA 5HR3A 3RPPA 1MDJA 3APQA 2EIRA 4MA9A 2IMDA 1RK4A 1A0FA 1FG4A 4KNDA 1O73A 2H72A 2O7KA 1TRUA 4HDEA 2IJYA 4FIWA 1PRXA 1HD2A 4IJIA 4Q5NA 3CTGA 4BWSA 3F6FA 3US3A 4JBBA 2IN3A 4XHMA 1NSWA 3HZ4A 4TW5A 1DE1A 1S3CA 2B5EA 4IQ1A 1JZRA 1YQ1A 1UVZA 1ZYQB 1JHBA 3UEMA 4TVEA 4V2NA 5J5NA 2X8HA 1DE2A 3CSHA 4WBRD 3F8UA 3ZMKA 2DLXA 3FW2A 4E8HA 1GSYA 2BMXA 2NVLA 4ULXA 2IMKA 5D9XA 9GSSA 4KUNA 3ZMLA 5IMDA 4QL7A 1K0OA 2FA8A 4XS4B 1M2DA 4GSTA 2I1UA 4K8MA 2MMZA 2LQOA 2JL4A 3GYKA 4IGJA 1ZCPA 3LYPA 4MF6A 1S3AA 4DSRA 1SL2B 4JR4A 6GSUA 2GLRA 4MZWA 4FYUA 1ZZYA 1RW1A 4YAVA 1QFNA 4WKWA 4X43A 1O85A 1PX7A 5HFKA 2IPAA 1GLPA 2H0IA 1XFLA 1PL2A 1FHEA 5DBQA 2VCXA 1K0BA 1Z5YE 2YWIA 2RIIA 4ZB9A 2FWFA 4RUVA 2DSAA 4ECBA 3GURA 1MD4A 3KJYA 4KW6A 1F3BA 1AAZA 2P0GA 4GCIA 1GNEA 2YZUA 2LQQA 5ECIB 4BPYA 4F9ZA 2GTUA 1U88A 3CSIA 4WF4A 3LGCA 2E0QA 4XS4A 4YH2A 3FR9A 3HKRA 14GSA 2C3NA 3H93A 4PURA 3Q19A 3QDNA 1XW5A 5DAKB 2CT6A 4BWQA 5D9VA 4ACSA 4ZILA 3EWLA 1ABAA 3FK8A 4DSQA 2H1AA 2H74A 4AJ7A 2PUKC 3TKSA 2GDRA 3IC4A 1QGVA 1GL8A 1TRSA 5CRHA 4EL1A 4FYCA 4ZIJA 1Z6NA 3D6IA 1EZKA 1K3LA 5B7CA 4K0GA 2PERA 4XIHA 3IAS2 5ECQB 5CRWA 1B4QA 11GSA 2OBIA 3E0UA 3IE3A 1XBSA 2VCVA 2C0EA 4L8EA 2WGRA 3O3TA 2RUFA 3GA4A 1TOFA 3TRXA 5CREA 3ME7A 4GLTA 4KCEA 2YJ7A 1R5PA 1EGOA 3CMIA 4XS1A 3U5RE 1W89A 2HI7A 2LJRA 4HEA2 5ECLB 5DAKA 4PXOA 3PINA 3GKKA 1XW9A 4TR4A 4V2LA 3CSJA 4PX1A 1ERVA 3CXGA 4QQ7A 5IM9A 3KTBA 4KGIA 4KA0A 1CQGA 1U3AA 1W4VA 4N10A 3WGDA 1X5CA 3AY8A 4OCFA 3HXSA 1CQHA 1EEMA 5CRGA 2AV4A 1X9MB 3EYTA 3ZFBA 1LJRA 5G31A 3C71A 4YAPA 2H66A 4N11A 1OC3A 5AGYA 2HE3A 5CAXA 2XC2A 4CW9A 1GULA 1EOHA 1XWCA 3LORA 1XVWA 3JCML 1XIYA 5G2ZA 1K0NA 2RM5A 2CAQA 3C8EA 3RBTA 2CZ3A 4WETA 3MNGA 4OFMA 4HJMA 2MMAA 2MMOA 4BL7A 1GUMA 1GLQA 2A4VA 3GL3A 3SWLA 4CDOA 3LEFA 3ZFLA 3WT1A 3DXBA 5GSTA 2LEGA 2AB6A 2H70A 4XS6A 4EF0A 2NDOA 2HZEA 3DIEA 4I2TA 1G7EA 3LFLA 2LRCA 4TRXA 3FRCA 1BG5A 5DALB 4WBJA 1K0DA 2HSYA 12GSA 3I6AA 1T1VA 2YPMA 4KE3A 1SENA 5D93A 1A2MA 2JZSA 2QSIA 4EE0A 2C80A 3M0FA 1F3AA 3ED3A 3NIVA 3TRPA 2CA8A 4MPGA 1SJIA 1SKWB 3G7IA 2AUVA 3C7MA 4RQRA 3VI5A 4MH3A 5IMAA 1ERWA 2MMNA 2PPTA 5G1LA 4POKA 3ZTLA 1TTZA 1ON4A 4KDUA 1FVKA 3ZVJA 1PMTA 1ZMAA 2FLSA 2VLUA 3TB2A 5KN3A 5E59A 2F9SA 2R6KA 2CV4A 3F3QA 2J23A 1EP8A 4HQZA 1NW2A 5KEJA 5IMVA 5DALA 2B1KA 2L4QA 4D73B 3A2XA 3LXTA 3BCIA 1H4OA 2GSQA 1SU9A 3VPTA 2VUPA 1OAZA 3HA9A 1DBYA 2YP6A 1ZOFA 4EDZA 2GZPA 2VD0A 3FHKA 2L57A 2F8AA 2JZRA 4HU7A 5B8AA 3IDVA 3ZREA 3ISOA 3NOFA 2P5RA 2E2MA 4KCAA 3VFIA 3IOSA 3RPNA 1MDIA 4I8BA 4IP1A 4Z7XA 4HI7A 5HQPA 4NXIA 5A4UA 3BBYA 3LXZA 2YV7A 1M0UA 2PVOC 2LSTA 2K9FA 1N2AA 2C0FA 3VK9A 3IPZA 1MDKA 1OYJA 1YF0A 1PL1A 1BX9A 4I6XA 2V6KA 3F6DA 1YEXA 5IO2A 3KH7A 3DGQA 2PBJA 1A8LA 3QFBC 4NV2A 2X64A 3KMNA 2H76A 3LQ7A 1V58A 5ECOB 4D73A 4KDYA 2JADA 1A24A 1FB6A 1ZYEA 2FWHA 2FCHA 1M9AA 3OR5A 3CRTA 3CBUA 5HFIA 1GSFA 2WRTA 1BEDA 4LMWA 3Q6OA 2CX4A 1X5DA 4MJAA 4YQUA 2G0FA 2WDUA 5IOWA 1G7OA 5B8BA 1TRVA 4OD7A 3FZ4A 3UAPA 2V32A 1K0CA 5LNKe 2GS3A 2VCQA 1FAAA 5ECHB 4HS1A 3UL3A 3TOUA 2O89A 5LD0A 5HR1A 4MLYA 3CYNA 4IW9A 4PGTA 2V1MA 1YJ6A 3GSSA 2GGTA 2OA7A 1M2BA 2XHFA 1Z7RA 4NHWA 1XOBA 6GSSA 2B6MA 5D9WA 2OACA 22GSA 5KN2A 2AYTA 2MYGA 5F8BA 3IXRA 3EINA 4G19A 1G0TA 4WR5A 4MMMA 5IMCA 2YOIA 4HZ2A 4J57E 3EMXA 4NHZA 4TKYA 3V1WA 6GSVA 1K3OA 1AXDA 1OKTA 3HYPA 3UMAA 1QQ2A 2O8VB 5ECMB 2B1LA 3M1GA 2N5AA 3TKPA 2LNTA 3A5WA 2P31A 3O76A 3FZ5A 1KBNA 2VD1A 3UOMA 3WGXA 5ID2B 1HNCA 1ILOA 1SYRA 4ISDA 2I81A 2RM6A 2DJJA 3ERGA 4OFTA 5G30A 1U6TA 5AIVA 4AF2A 2MBSA 2KP2A 3Q74A 2VLVA 2A2SA 3IR4A 2H30A 2FY6A 1GTUA 2H0GA 1AQVA 1SKSB 3F9UA 1WRYA 8GSSA 2V2GA 4XCSA 2HSHA 2FWGA 4K0NA 2IWTA 5GAPD 4JR6A 3MDKA 2NPBA 3GUSA 3GKXA 2X99A 2OBKA 3VLNA 1YY7A 3GFKA 3TKSE 3C1RA 3HZ8A 2VL2C 4TN8A 4IHUA 1EWXA 5GAND 2C4JA 2GSSA 1X0RA 2H6ZA 4TXVA 2GZZA 3IK7A 4DEJA 3WT2A 1H75A 3FKFA 2JSYA 3H79A 2FHEA 3PR8A 1SL1B 2HT9A 5ID2A 3WGEA 2EC4A 1GTAA 1Z3EA 3QAGA 4DSSB 3GH9A 1ST9A 1IYHA 5EVOA 1TU8A 1M99A 4TR3A 3W8JA 1WMJA 1HYUA 2R2JA 4N0VA 1XWKA 1ERTA 4GTUA 4Q5FA 1PD21 1UA5A 2H0HA 5CNWA 3D4TA 16GSA 3F0IA 3HDCA 3IK9A 3M9KA 3SBCA 5FT3A 1T8EB 4ZL8A 1C72A 2LJAA 5J9CA 4HUAA 3ZRDA 1JFUA 3VWUA 1UC7A 2RUEA 4L0WA 3WD6A 4LL4B 4EO3A 1TXXA 2I9HA 5JWRB 2M46A 2LJKA 2HRFA 5F0GA 3GHAA 2DJKA 2YN1A 3LJRA 1T4YA 6GSTA 1Q98A 1Y6EA 3C73A 2LS5A 2C1YA 4L0UA 4ECIA 5GZZB 4K1FA 3D22A 3FEUA 5F07A 3FR6A 2VLTA 1YKCA 1TKDB 3KEBA 1NM3A 1TJDA 3TUEA 4DSSA 3LYKA 2E7PA 1O8XA 2NBSA 2YZHA 1JZDA 1K3YA 3QOUA 5A4VA 1PSQA 4WR4A 3S9FA 3BJ5A 4IELA 5H5SA 2I3YA 3KXOA 2C3TA 2VM1A 4LMVA 5L71A 2L5LA 3ZIVA 5DQSA 5CYYA 5HR0A 3HHVA 1EP7A 4V1Ag 1PQNA 4FO5A 4XTSA 2CX3A 4I5QA 4QL9A 2GQLA 2WB9A 2EIOA 2BJXA 1N8JA 1YF1A 3TJBA 2IMFA 2JACA 3GV1A 3I9V2 4IBPA 2DC5A 4O7HA 2LUSA 3APOA 3EU4A 5IMZA 4WF5A 1V9WA 1F2EA 1VGLA 2JSZA 4K2DA 4O5RA 4L5LA 1R4WA 20GSA 4K6XA 2X8CA 3TJGA 4ML1A 2VO4A 4N0ZA 1U87A 4CHSA 4OWYA 2L4CA 2F51A 2AHEA 4K9ZA 4BVXA 4I97A 4ML6A 1SK0A 3DKSA 4F0BA 2G2QA 3L9SA 2H75A 1HQOA 3IRAA 3D5JA 4NWYA 1R5AA 2VCWA 2HYXA 5D96A 4NAXA 3Q18A 2KP1A 5IIZA 4FH8A 5AIXA 2FGXA 3ZLPA 5IPHA 1GH2A 5A4WA 6GSXA 3KP9A 2GSRA 5F05A 4F03A 1OE8A 1ERUA 2GT6A 3M9JA 2CZ2A 5COHA 2C3QA 4PQIA 1VF2A 1USBA 3P90A 3P2AA 4TR1B 3TDGA 1EGRA 3TJJA 2CVBA 2L6DA 1O8WA 2IMIA 5IPGA 1O7UA 1B48A 4PNGA 4MZBA 1THOA 3RHCA 2L6CA 2H8LA 2YJHA 5C04A 4ZBBA 1GWCA 1WJKA 2RLIA 2LRNA 5G1KA 3J7Yk 2HNLA 3HJMA 1TK0B 1V2AA 3GNJA 2XBIA 3KD0A 4KX4A 2H6YA 1GSSA 4ECJA 2EIQA 2OADA 1THXA 3APSA 2IFQB 4POLA 3DVWA 3R2QA 2DJ3A 3L4NA 2VL2A 4AGSA 3MWHA 2DJ1A 1B4PA 4KDXA 1YZXA 1QK8A 3UIWA 3KGKA 2L59A 4LL1B 3FY7A 2OE3A 5EPFA 4F82A 3CRUA 1WE0A 4OMVA 2PMTA 4J2FA 13GSA 4GSSA 2DIZA 4MCUA 2WULA 5FWGA 2C0GA 5KN1A 3TKRA 2PN8A 1E6BA 5DJMA 4NMUA 2H6XA 1XWAA 1X5EA 2XPEA 2KHPA 4BVYA 1R26A 5D8IA 4EC0A 5J9BA 4TR0A 1TRWA 1WP0A 3QPMA 3UBLA 1T4ZA 1QUWA 5FHIA 1GP1A 4JEDA 3KP8A 5ABRA 4HU9A 6GSYA 4ILFA 1EV9A 4IS0A 2IFQA 2WJUA 1GSEA 5JCGA 1V57A 4JE1A 5H5QA 3C1SA 3I69A 4MK3A 1PN9A 3QD9A 3RAZA 4G9HA 1X9SB 4DVCA 1DUGA 5ENUA 3IBHA 2DJ2A 3ERWA 1LBKA 1Z7PA 2FD3A 2R5GA 2V41A 2TRCP 1M9BA 3FZ9A 1GUKA 3IV4A 4ZB8A 3VWVA 17GSA 1JLWA 2ES7A 4E8EA 4IP6A 3F4RA 2N5BA 2YWOA 1FVJA 2KOKA 5A5KA 2H71A 3G9BA 3GMFA 1Z6MA 2MBTA 1WIKA 2WFCA 5ELAA 4RQXA 2YNXA 5E4WA 1SD9A 2QGVA 3GKNA 3LWAA 3KTLA 4RI6A 3DWVA 2H19A 3ZVJD 3GX0A 1GSUA 1SD8A 2VCTA 3D21A 2YWMA 2K18A 3QAVA 1VF4A 1O6JA 5DJLA 3A2VA 4YQMA 2CVKA 4HQSA 3TCOA 4GXZA 5F06A 3F4TA 2I4AA 3H1NA 4WXTA 1I5GA 5DQYA 5C00A 1HNAA 3GKMA 3BCKA 2WZ9A 1AQWA 3ZYWA 3ERFA 3F4SA 3KM6A 5H5RA 1GSQA 1Q4JA 4V1Ap 4MH2A 2LV3A 1UN2A 5ECPB 4MF7A 1SKRB 5EY6A 4K7OA 2OE1A 4PQHA 1NHYA 1B9XC 3M8NA 1F37A 4XRAA 1B9YC 4GWRA 4EKZA 3TJFA 3FYGA 1JZWA 2GSTA 18GSA 4O92A 3J7Yb 1T7PB 3F63A 4MJBA 2WS2A 2H1GA 1VRSD 4MJCA 19GSA 1YKAA 3M3MA 3GL5A 5B6NA 5GSSA 2M72A 7GSSA 2QC7A 2LRTA 1NHOA 2R3XA 5EL8A 1XW6A 3L0HA 2P5QA 4TXOB 4V2MA 2JU5A 4MP4A 1J08A 5IMFA 2CQ9A 4HOJA 2K6VA 1TW9A 2ZCTA 3W8SA 1XXUA 1JZOA 2PGTA 4K7NA 3QFAC 5DVBA 1TI1A 3DRNA 3G7YA 3G7JA 2DIYA 2YANA 4Q5QA 3DD3A 1BAYA 5ECRB 1MD3A 2LTKA 1GUHA 5LCZA 1XWGA 1BQ7A 3GSTA 2K8VA 4X0XA 4ZL9A 4PQ1A 3TKQA 4JU5A 1J0FA 1WWJA 1BYEA 3QAWA 5D9TA 4ZBDA 1K0MA 3KIJA 3UVHA 2L5OA 5ECSA 1EV4A 1M7TA 3KMOA 1AC1A 4J56E 4KAEA 1IYIA 2OKAA 1GTBA 1TDIA 2QKEA 4MABA 4ZB6A 4OFNA 1K0AA 3HJOA 1LU4A 2REMA 3N5OA 5AISA 1V40A 4EDYA 2ZUPA 5ECKB 4TXOA 3IA1A 4WEYA 3BD2A 3MSZA 4IQAA 2GZYA 1O81A 1SL0B 2VIMA 2IIYA 4BA7A 1ZL9A 1FW1A 2BTOT 2D2ZA 3A2WA 3LSZA 1QXHA 1SK2A 2FUG2 4FYBA 4NV5A 5ECNB 2C8UA 4KB3A 3WYWA 2R4VA 1YEPA 3EURA 1OC8A 2GQKA 1ML6A 1T3BA 3N9JA 3E9JB 2DJ0A 2B5YA 3EC3A 2V6OA 4GF0A 1TP9A 1URMA 3VWWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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