2UVIA

Structure of a periplasmic oligogalacturonide binding protein from yersinia enterocolitica in complex with 4,5-unsaturated digalacturonic acid
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
404
structure length
404
Chain Sequence
EVNLRMSWWGGNGRHQVTLKALEEFHKQHPNINVKAEYTGWDGHLSRLTTQIAGGTEPDVMQTNWNWLPIFSKDGTGFYNLFSVKEQLDLAQFDPKELQQTTVNGKLNGIPISVTARIFYFNDATWAKAGLEYPKTWDELLAAGKVFKEKLGDQYYPVVLEHQDTLALIRSYMTQKYNIPTIDEANKKFAYSPEQWVEFFTMYKTMVDNHVMPSTKYYASFGKSNMYEMKPWINGEWAGTYMWNSTITKYSDNLTKPAKLVLGPYPMLPGAKDAGLFFKPAQMLSIGKSTKHPQESAMLINFLLNSKEGVEALGLERGVPLSATAVTQLRASGVIKDEDPSVAGLNMALELPHKMTTSPYFDDPQIVSLFGDAIQYIDYGQKTVQETAEYFNKQGDRILKRAMR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia enterocolitica
publication title Specific Recognition of Saturated and 4,5-Unsaturated Hexuronate Sugars by a Periplasmic Binding Protein Involved in Pectin Catabolism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ABC TYPE PERIPLASMIC SUGAR-BINDING PROTEIN
total genus 137
structure length 404
sequence length 404
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uviA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uviA02
1NFTA 3SEUA 3OO7A 4DLDA 1MQHA 1B3GA 1SVXB 3Q26A 3OOAA 3OEKA 2OJTA 3HPIA 3MUQA 5M2VA 4TOZA 1MPCA 5CC2A 4C0RA 4U2RA 1GVCA 1OLAA 3VLUA 4TLLB 2I3VA 4DXUA 1M5EA 2H4IA 1H44A 2ZNUA 3SEYA 1FQBA 2BJJX 2Z8FA 4IGRA 1B5IA 4F1UA 2FNCA 4MH5A 3IB0A 5I2NA 3K4UA 3W15C 5H8NA 3MC2A 4L17A 1RYOA 1MXUA 1UIVA 2HEUA 1RYXA 1TFAA 4OTEA 5KCJB 1FQEA 4PFUA 4RPNA 2W7YA 4F2QA 3AXFA 1LFHA 2XXTA 3RTWB 5FHOA 2PYYA 4IB2A 2DS9A 3C34A 1IXGA 1A7LA 3RLFE 3KJ7A 2QS3A 4KCDA 2R71A 1IUDA 2IEEA 1VR5A 5H8SA 4NF4A 3FJ7A 2I4CA 1MM6A 3GBBA 4IO2A 5TPAB 3M3KA 3EHSA 3JYRA 2GHAA 4GD5A 4OQOA 4P11A 1MXVA 3Q29A 3IR1A 3IOTA 3FXUA 4NTLA 1OMPA 1D4NA 4F3GA 3CFXA 4GOTA 5HM4B 5A5XB 1DTZA 3TKDA 1N7WA 5I56B 4QFPA 1LFIA 4WEDA 1XS5A 1UTBA 4KPTA 3IAZA 1TFDA 4N07A 4ZECA 4G8HA 4R9GA 3RT8A 1US5A 2OCUA 3M8UA 2QS1A 4PE5B 1N7XA 1P1WA 2VOZA 4HCWA 3A3UA 3OO9A 1D3KA 2QSXA 4RK9A 1AL3A 5I2KB 1Y1ZA 5CMCA 3B6TA 3KBRA 4E0XA 3F11A 2ZMBA 2RKMA 4ZEIA 1MQJA 5K2XA 3K1MA 1M5DA 3PPOA 1B6HA 2REJA 1P1OA 3IJXB 2RCBA 4ESWA 3EPEA 3FATA 2HXWA 4EUOA 3O6IA 1SQYA 2H99A 4RNSA 3O28A 3DP8A 1WVJA 1DTGA 2I58A 2O84X 4OFOA 1MDQA 4F1YA 4UA8A 4QFOA 2O51A 4JWXA 3FVGA 1BP5A 3LR1A 3T93B 1IEJA 3KN3A 4DCYA 4ELOA 4RY1A 4H8JA 1I69A 4U21A 4F18A 1ANFA 2YPNA 2B65A 3RY3A 1ZMGA 4H67A 4FEBA 4ONYA 4QHQA 2QRYA 5KCJA 3K00A 1MQDA 2UVJA 4DXCA 1MY2A 4OZ9A 4ZEDA 3OELA 3T66A 2Z8EA 4HS7A 4I1DA 2QS4A 2B3FA 3VDFA 5H8QB 2XXRA 2NVUB 4OESA 5FTHA 3SETA 5TPAA 2XXVA 3TUSA 4R74A 1T0KA 3TODA 1I6AA 4IO3A 4H65A 1NNPA 3VVFA 5A5XA 3OO8A 1PEBA 3ILUB 1A8EA 1JW4A 5I56A 2YJPA 3MP1A 1P1NA 2AYSA 3IB1A 3K6WA 1MY3A 2H98A 3VFJA 4QF9A 1ZLQA 1Y9UA 1IIWA 1EZPA 1B58A 3CSBA 1R1NA 2D21A 2HZKA 4O3BA 5I2KA 1OIBA 1PBPA 5AA1A 2I0BA 1PB8A 1NMUA 1SYIA 2OWTA 3CVGA 3O6HA 4ZE8A 3UN6A 5IAIA 2G93A 3IO6A 5J1DA 4EF2A 2V84A 4NEDA 1USYH 3WAFA 4GQOA 1M5FA 1I6BA 2Q2AA 2O7UA 3SEWA 3U93A 3G3HA 3KOSA 1IXHA 5CMBA 2XXUA 3TTNA 1MG1A 4POXA 1R9LA 5DTBA 4U22A 2OWSA 3TZAA 4ECFA 3RUMA 1URSA 5ITOA 1FQFA 5CI5A 2DE4A 1YCJA 5L8DA 2QS2A 4GXAA 1S9TA 4XKRA 2DP8A 3TTMA 3H6VA 5ELVA 2XXPA 3EHUA 5H8QA 4BDOA 4OYVA 3BFTA 3IJOB 1B5HA 1NL5A 3OXNA 1UQWA 1M5BA 5L9SA 2V3UA 3Q27A 4RJZA 1PC3A 1GR2A 1MH3A 1MQIA 2H9BA 5DT6A 2UVGA 2FA7A 3GLBA 1OQHA 2PVUA 4LATA 4BDNA 4GXSB 4F3PA 4R6YA 1A55A 5JK4A 1IXIA 3K0VA 1II5A 1B3EA 5I59B 4GLIA 4H1XA 3C36A 1QJMA 2UYEA 1ZIUA 1NH7A 4OEUA 1B46A 4O3CA 4JSDA 1B51A 2UVHA 4M1VA 1URDA 5H8HB 1MM7A 3LUYA 1FTJA 3FJMA 1AOVA 1N84A 2QMWA 2VD3A 3MBPA 5ISUA 3O9PA 3Q28A 3PMXA 4U23A 4BDLA 5FTIA 2DOJA 3PV0E 4OHNA 4BDQA 3B6QA 3PGFA 1USYE 4OVJA 3E13X 3QXMA 1ZKBA 3RT6B 2AIXA 1DSNA 3KEIA 3G7WA 3ONMA 3L6HA 2RC8A 3JV9A 4GF8A 2V3TA 4G68B 1QUKA 2I4BA 4OETA 4I62A 3LSFB 2DE2A 4IO4A 1ZU0A 1VFEA 3ZKKA 3TQWA 1XT8A 1MY4A 4F31B 4PQJA 2I48A 1OLCA 3SEVA 4ELPA 1N3XA 4WKMA 1F9BA 2Y7RA 1AMFA 4X1DA 3QUJA 5LOMA 5KDTB 5BUUA 3PPPA 2O1MA 1YPNA 1SD3A 4OERA 1LAXA 2ZXTA 1B1XA 1LLSA 1P1QA 3G3KA 4LVQA 1MXWA 4U4XA 5DEXB 2ALUA 3OMBA 3T96B 2QMXA 3TCHA 1JW5A 1ELJA 1SI0A 1EH3A 1FQCA 2V3QA 2HAVA 3MPKA 5AA2B 3T9UA 2NOOA 4FAJA 4XXUA 1MXZA 4H8IA 2DQVA 2Q2CA 5I59A 5IKBA 4F1VA 1HSEA 3OENA 4X48A 4F22A 1FTLA 1O64A 1B3LA 2I49A 3QIMA 2Y7WA 4GFRA 1AIVA 3TAJA 3MP6A 4FJPA 3S9NC 3C31A 2Z23A 3CFZA 3FUZA 3DP4A 3R26A 1XVXA 1VFDA 3CFLA 4LUBA 4ZEKA 3PU5A 4XKNA 4JXIA 4U1OA 2X26A 3H3GA 3BKIB 4OXVA 4QSEA 1JEUA 1A54A 2NXOA 4GL0A 3C9HA 3FGSA 3THIA 3W9VA 1FTMA 4RXLA 3GBAA 5ICQA 4EDPA 1A8FA 4FATA 3PUVE 3JZJA 5H8FB 4G2ZA 2ONRA 2LAOA 4G68A 2F5XA 1LAGE 1Y1MA 4PETA 1B05A 1TT1A 3KFMA 4KYSA 4GL8A 4KYDA 4QSDA 3H6WA 1SW2A 1A99A 4FECA 3MVXA 1B1HA 1JVYA 3FV1A 4N13A 4YKPA 4AQ4A 2DWAA 1Y3NA 4LA9A 3TMGA 1AH5A 1N04A 5KDTA 3E4RA 2DSFA 1GGGA 3H4ZA 2DE3A 4KQPA 1BTJA 2F35A 4QFNA 3L6GA 2E1SA 4NF5B 3IB2A 1B4ZA 4TQUQ 3P7IA 4U1ZA 1PDAA 2E0SA 1VSOA 1FW0A 4YB7A 4QFLA 2F7CA 5DEXA 1P99A 2XXWA 1PB9A 4F3SA 1MXXA 5EYFA 3ILTB 2R9JA 3BFUA 4LZ7A 4H5GA 1FTOA 5AA2A 3K01A 3G3JA 5L9MA 2UXAA 3M3LA 3MAMA 1UTHB 5AA3A 2RC9A 4KHZE 3N94A 4YKKA 2Q88A 5CM6A 3USDA 3K02A 2PMSA 3FIRA 5B70A 2QPQA 1SI1A 3O6GA 2XD3A 1DPEA 1IZ1A 1ZTYA 1JVXA 5AA4B 3HV1A 3O2AA 1POTA 2Y7PA 3CI8A 3TCGA 4PFWA 4YKJA 4Q30B 4XIGQ 3I3VA 1Y20A 3KN8A 2ZNTA 3S9EA 3O29A 3TPAA 5HPQA 1FQAA 3M3FA 2OBGA 1QULA 3SDFA 3HN0A 5CMMA 4AB6A 4FE8A 3FVKA 4EQBA 5AE4A 4ZEFA 2RC7A 3PPQA 1H45A 2XX9A 2KLFA 3HO7A 4YMBA 2Y7IA 2REGA 4Q0CA 3DP6A 2HZLA 5H8FA 2H25A 1EZ9A 4ND9A 3TEPA 1B5JA 2HAUA 2F97A 1Y4CA 1FCKA 5JTYB 2DVZA 5EHSA 1Z7ME 3OO6A 4DIGA 2WKYA 3KGCA 4POWA 1UIUA 4RK2A 1N3WA 2V93A 4YZZA 2XXHA 4IY6A 2QJEA 4PFYA 1PB7A 3PD8A 2R6GE 1Y3QA 1TWYA 3V5AA 4ZE9A 1POY1 3RPWA 4F39A 1I6QA 3VVDA 2F6GA 3EHTA 3D4GA 3VV5A 3TYHA 3Q25A 3QAXA 1RKMA 4NF5A 1QUIA 3K6XA 4F3BA 3EQ1A 4DXBA 2F7BA 1N0TA 2DWIA 1B2HA 2GRVA 4MLQA 4DZ1A 3K1NA 1JW1A 3OSQA 4NMYA 4LQ2A 4LONB 3GXAA 3O66A 1CE2A 4KFQA 3UK4A 4PP0A 4ZEBA 3K6UA 1JETA 4R9FA 1IQ7A 3E3KA 3TTLA 1B7ZA 2G29A 1UTHA 3QUFA 3R6UA 4YKIA 2HCAA 1JNFA 2ESNA 3KSJA 1Y3PA 1LAHE 1US4A 3E9XA 1GV8A 4OMBA 2UVIA 3C35A 2I3WA 1CB6A 1XHYA 1MS7A 4RA1A 3U8QA 1HSJA 2I6EA 1OQGA 3MVYA 4F29A 3BBRA 5AA4A 4R73A 3EF7A 3KN7A 3MW0A 4BDRA 1LCTA 4AB5A 5CMKA 3IOWA 4RPOA 3IOVA 3PUWE 1SBPA 3W9WA 1FQDA 3MVWA 3MZ9A 2YLNA 3MZBA 4I9DA 4GWOA 3PPNA 3PD9A 4YB5A 3KZGA 3N6TA 4ZDMA 4JWOA 4C1UA 1DMBA 3IOUA 1LCFA 4X1BA 3RGYA 3V8XB 4ISUA 4H5FA 4XKQA 1SYHA 1PBQA 2CZLA 3PPRA 4OENA 1YAEA 2X7PA 4R75A 4ELRA 5B7DA 4IO7A 5KZTA 5JTYA 1BLFA 2Z22A 1NNKA 5EHMA 3DM0A 3IORA 2VD2A 3PUYE 1VE4A 3ZKLA 3FJGA 3H7MA 1ATGA 2RINA 5JEIA 1QVSA 3RN8A 4JSOA 4LP2B 4KYEA 1A40A 4YU0A 4JB7A 3VE1B 4OFLA 2A5TB 3PUXE 4U4SA 4IY5A 3K1PA 1B0LA 4H6DA 3D4CA 4BDMA 3LSXA 3N6UA 2Z8DA 1B0HA 1MRPA 3G3GA 1B7HA 3RTFB 2P1SA 2ZYNA 4MBPA 4FIMA 1ZJLA 4OWDA 4F19A 3C4MA 3CG3A 4WEPA 4THIA 2O7IA 2ZYKA 3UP9A 4G8MA 1H3DA 3CIJA 1QKBA 2VHAA 1LBCA 3U94A 2DXRA 2Y7KA 4M4GA 4EQ9A 2QL3A 5CRYA 2ZYMA 2F6PA 2X7QA 2H5YA 4NF6B 4ELQA 4E0WA 3T9VA 4Z7EA 1B52A 4YMAA 2F8DA 3G3FA 1SDXA 5L9OA 2O68A 3N5LA 3OEMA 4MFIA 5H8HA 2PT2A 1NNTA 2CMOA 2P2AA 4LZ5A 4R6KA 3QSLA 4OEVA 4YAHX 3MPLA 4ZZAA 4XTCQ 1O63A 2DWJA 3CSGA 3UORA 1URGA 1QKAA 2ABHA 4QRZA 2M8CA 5TP9B 3FZVA 3FD3A 1BIYA 2XXQA 4DDDA 2OK2A 4MLVA 1MPDA 1LBBA 1NH8A 2ZNSA 4DCXA 3RQTA 4QFKA 1WDNA 1MXYA 3R7XA 4ESXA 4OFJA 4R72A 3EN3A 4JDFA 4O3AA 2ANJA 1QW0A 2PBWA 4R2BA 4BLAA 1H76A 4UACA 2ZYOA 2RCAA 1LB8A 3UA8A 4NWCA 1MPBA 4EF1A 2F7AA 4GVOA 4ZS9A 5TU0A 3T9XB 2A5TA 3PUZE 3TDJA 4YB6A 2DXYA 3FVNA 4WXJA 2O6AA 2O1LA 1SW4A 4TLMB 3QK6A 1OVTA 3ECRA 1H43A 2GFEA 4QSCA 4NF8B 3IO4A 4KCCA 2XXYA 1B4HA 5DVIA 3TTRA 4LQ5A 4KR5A 3PMVA 1BKAA 4EXLA 2XXIA 3FXRA 4EQ7A 1QUJA 3S9MC 1B3FA 1XVYA 3A3CA 1NNFA 3VLWA 1MH4A 3H6UA 5F1QA 1FTKA 2DYXA 2XXXA 3FV2A 3MZ1A 3U72A 3A09A 3I5OA 3K2DA 4NF6A 3O97A 3C33A 1SW5A 4KD5A 1LGBC 2AL5A 4Z0IA 3IL1B 2A5SA 3TTKA 4G8NA 1JEVA 5CBRA 2ONSA 1SW1A 3MVZA 3RNNA 5I58B 1M5CA 1XC1A 3DLNA 4R6HA 5AA2D 3G3IA 4IO6A 5CBSA 2P0SA 1YTVA 3B6WA 4NWDA 5I57B 2VP1A 1IITA 2Q9TA 3DELB 1HSLA 5TP9A 3LC8A 4X9TA 3PMWA 5K2YA 3TQLA 5ICTA 4FORA 4KI0E 3S4UA 4HCYA 3U92A 3LSWA 3QYTA 3SESA 4F2OA 2HQ0A 1B3HA 3VLVA 1EZOA 3OSRA 4MF3A 4K3FA 4H0WA 2ONKE 1LSTA 3LSLA 3S2VA 2OZZA 4GIZA 1D9VA 2D5WA 3MP8A 3H06B 3C32A 2VGQA 2HFBA 3ODBA 3FASA 3VXBA 3MQ9A 1MQGA 3GZGA 4ZZEA 5FHMA 3VVEA 4Q8RA 4HTGA 1XOCA 4Q5TA 2PX1A 2I0CA 1JQFA 2XHDA 1ZBMA 1L5TA 1Y4TA 4NE4A 2GH9A 3WAEA 4RYAA 1Q1KA 1DPPA 3VXCA 3FXQA 4N6PA 3TCFA 4C1TA 3TFLA 1OVBA 2DWHA 2F34A 3HHGA 4JWYA 4I8CA 4NF8A 2UYFA 1B7UA 2V25A 3LBSA 3FVOA 1R6ZA 4JBZA 4EXKA 2PT1A 3KJTA 2GHBA 3I6VA 5DYHA 4HW8A 2FYIA 3SEXA 1S50A 5I84A 5DVJA 5I2NB 4G68C 3IK6B 3V83A 5H8NB 3S9LC 1KWHA 3HHFA 4P0IA 3N26A 1TXFA 1Z7NE 1P1UA 5FHNA 4PFTA 3U1OA 4LZ8A 1B40A 1B9JA 4G77A 5BWJA 3KG2A 4G4PA 1J1NA 2OLBA 2XX7A 4NF4B 4FEDA 1R9QA 2XD2A 3HSTA 2F78A 5I58A 2DVCA 2Q89A 3CRBA 3CR9A 3H6TA 1MY0A 2AL4A 2O69A 3UIFA 3H03A 2RF1A 1D9YA 3UGWA 2Y84A 2NUVA 5I57A 1UTBB 2IA4A 1LAFE 4YICA 5F7VA 3MWBA 1B32A 1O7TA 1GTKA 2D3IA 2F36A 3T22A 1N76A 5DVFA 3ZSFA 3CG1A 1IXCA 1NKXA 3B7DA 1S7YA 3SERA 1LFGA 3MJNA 3ZS6A 3KOTA 3V89B 2B3BA 4XKPA 4GRKA 3HCQA 2XX8A 3KSXA 2THIA 1MDP1 4R2FA 1MY1A 2Q8JA 3OD7A 4DE8A 1EU8A 4IGTA 2NWJA 3IX1A 1Q35A 3SKPA 4IO5A 3T9HB 1WODA 1DOTA 3K6VA 4P0GA 3TELA 5ITPA 1LB9A 5HBCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NFTA 3SEUA 3OO7A 4DLDA 1MQHA 4NHBA 1B3GA 1SVXB 3Q26A 3OOAA 3OEKA 4MCOA 2OJTA 3HPIA 5A5LA 3MUQA 5M2VA 4MJOA 4TOZA 1MPCA 5CC2A 4GWWA 4C0RA 4PE3A 4U2RA 4O7MA 1GVCA 1OLAA 3VLUA 4TLLB 2I3VA 4DXUA 1M5EA 1FPIA 1IMDA 2H4IA 1H44A 2ZNUA 3SEYA 1FQBA 2BJJX 2Z8FA 4IGRA 1B5IA 4F1UA 2FNCA 4GWXA 4GX3A 4MH5A 3IB0A 5I2NA 1LBXA 3K4UA 3W15C 5H8NA 3MC2A 4L17A 1RYOA 1MXUA 1UIVA 2HEUA 1RYXA 1TFAA 4OTEA 5KCJB 1FQEA 4PFUA 4RPNA 2W7YA 4F2QA 3AXFA 1LFHA 1FPEA 2XXTA 1NUYA 3RTWB 5FHOA 2PYYA 4IB2A 2DS9A 1FPGA 3C34A 1IXGA 1A7LA 3RLFE 3KJ7A 2QS3A 4KCDA 2R71A 1IUDA 2IEEA 1VR5A 5H8SA 4NF4A 3FJ7A 2I4CA 1MM6A 3HFUA 3GBBA 4IO2A 5TPAB 3M3KA 3EHSA 3JYRA 2GHAA 4GD5A 4OQOA 4P11A 1MXVA 3Q29A 3IR1A 3IOTA 3FXUA 4NTLA 1OMPA 1D4NA 4F3GA 3CFXA 4GOTA 5HM4B 5A5XB 1DTZA 3TKDA 1D9QA 2FHYA 2VT5A 1N7WA 5I56B 4QFPA 1LFIA 4WEDA 1XS5A 1UTBA 4KPTA 3IAZA 1TFDA 4N07A 4ZECA 4G8HA 4R9GA 4GX6A 3RT8A 1US5A 2OCUA 3M8UA 4OVRA 4NAPA 2QS1A 2OX3A 1DCUA 4PE5B 1N7XA 1P1WA 4NG7A 1NV4A 2VOZA 4HCWA 3A3UA 1VDWA 3OO9A 1D3KA 2QSXA 4RK9A 1AL3A 5I2KB 1Y1ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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