2UVIA

Structure of a periplasmic oligogalacturonide binding protein from yersinia enterocolitica in complex with 4,5-unsaturated digalacturonic acid
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
404
structure length
404
Chain Sequence
b'EVNLRMSWWGGNGRHQVTLKALEEFHKQHPNINVKAEYTGWDGHLSRLTTQIAGGTEPDVMQTNWNWLPIFSKDGTGFYNLFSVKEQLDLAQFDPKELQQTTVNGKLNGIPISVTARIFYFNDATWAKAGLEYPKTWDELLAAGKVFKEKLGDQYYPVVLEHQDTLALIRSYMTQKYNIPTIDEANKKFAYSPEQWVEFFTMYKTMVDNHVMPSTKYYASFGKSNMYEMKPWINGEWAGTYMWNSTITKYSDNLTKPAKLVLGPYPMLPGAKDAGLFFKPAQMLSIGKSTKHPQESAMLINFLLNSKEGVEALGLERGVPLSATAVTQLRASGVIKDEDPSVAGLNMALELPHKMTTSPYFDDPQIVSLFGDAIQYIDYGQKTVQETAEYFNKQGDRILKRAMR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords ABC TYPE PERIPLASMIC SUGAR-BINDING PROTEIN
publication title Specific Recognition of Saturated and 4,5-Unsaturated Hexuronate Sugars by a Periplasmic Binding Protein Involved in Pectin Catabolism.
pubmed doi rcsb
source organism Yersinia enterocolitica
molecule tags Sugar binding protein
total genus 137
structure length 404
sequence length 404
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uviA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uviA02
1M5CA 1QW0A 3TYHA 3W9WA 1OQGA 2P1SA 5AA4B 4F22A 4NF8A 1D9YA 5ELVA 5H8HA 4BDNA 1S7YA 3BFUA 4R6YA 3QSLA 4FJPA 1AL3A 4FAJA 2O51A 3VLWA 3D4CA 4FE8A 4L17A 2XX9A 2Q2AA 3KOTA 5TPAB 3OEMA 1SW1A 4OXVA 2Z22A 4XKPA 3KN7A 5CMCA 1XVXA 1D4NA 4LA9A 4H5FA 1US4A 3SETA 1SW5A 2HZKA 1OQHA 4H0WA 3JV9A 4LATA 5I59A 1ZTYA 3VXBA 3RT8A 4NF5B 2PVUA 3K02A 3IO6A 4GVOA 1SQYA 4H8JA 1QULA 4QFLA 3OO8A 1A8EA 1MQHA 3IB1A 4U4SA 1O64A 3TTRA 4F29A 1BLFA 4G77A 2P2AA 4IY5A 3K4UA 3OOAA 4JWOA 3LUYA 4ESXA 3H6WA 1FQCA 3FGSA 1MXWA 1AOVA 1MXVA 3PUWE 4BDQA 4IO4A 1MQIA 2Z8DA 2NVUB 3BFTA 4JBZA 4G68B 4R72A 4YAHX 4EXKA 2ZYMA 2HCAA 1UTHB 1DPPA 1JETA 3IX1A 3B6QA 4JXIA 4IY6A 4ZEIA 3G3HA 1IEJA 2X26A 4GIZA 3H7MA 4OTEA 4WEDA 3M3KA 1Y1ZA 3V83A 4AB6A 4R6HA 4N6PA 3I6VA 1ELJA 4IO2A 3I3VA 1YAEA 3U1OA 4BLAA 1IZ1A 5ITOA 1JVXA 5FTHA 4UACA 1ZU0A 3HSTA 3FVOA 2REJA 4LZ7A 4QFOA 5A5XA 5I57B 1H45A 1JEVA 2ZYNA 3VVFA 1MQGA 3PUXE 3OD7A 1UIUA 4JDFA 3FV2A 2B3FA 2XXQA 4I1DA 2H99A 1JVYA 4ECFA 3VFJA 5I56B 2B3BA 2XXVA 1YTVA 1ZBMA 5FTIA 2XXTA 2ANJA 4ESWA 4N13A 4OHNA 2Z8EA 1PEBA 5CMBA 3KJTA 3UIFA 3KSXA 2YLNA 3KGCA 1N7XA 5TP9B 1UIVA 1OVTA 3IOVA 4FEBA 3K1MA 4PETA 5BUUA 3SEWA 2OJTA 2FYIA 1SDXA 1MH3A 3M3FA 3ZKKA 5DVJA 3KN3A 1P1OA 1A40A 3EPEA 4BDRA 5AA2B 4IO6A 1EZPA 1MPBA 4WXJA 3EF7A 1HSLA 2O6AA 4HCWA 3RN8A 3MVXA 4G4PA 3RNNA 2CMOA 3TELA 2DWIA 3M8UA 1RYOA 5M2VA 4Q5TA 5L8DA 4RXLA 1R9LA 1ANFA 3E4RA 4RY1A 1MXXA 3O6HA 4AQ4A 4KD5A 4RPOA 4XKRA 4JWYA 1S9TA 4F3BA 4DDDA 3T9HB 1B3FA 2A5TA 4F1VA 1VE4A 1IIWA 5AA3A 4R9GA 1MM6A 1FTMA 4N07A 4I9DA 4EQ7A 3G3GA 4H6DA 4IB2A 3H6UA 1LGBC 2ZNTA 3A3CA 3MW0A 1Z7NE 3H3GA 5AA4A 1Y4CA 1OMPA 1LCFA 2PYYA 3F11A 5CBRA 4FIMA 2I0BA 3IR1A 4TQUQ 2REGA 3V89B 2F97A 3ZSFA 5TPAA 4XXUA 1FTLA 5CBSA 4PFTA 3H03A 4NWCA 4DE8A 1CE2A 1Y20A 1MQJA 3EQ1A 3N6TA 2RKMA 2RCBA 1B5HA 4GF8A 2FNCA 3G7WA 3VLUA 4NF5A 5HM4B 2DWHA 3OO7A 1LFGA 4KI0E 4LZ8A 4C0RA 3ECRA 3ODBA 5I2NB 3Q25A 3MBPA 1N7WA 1Y1MA 2F8DA 4Z7EA 4ELPA 2D21A 2UVJA 3C35A 4YKPA 1NNTA 1FQAA 5JEIA 4RYAA 1N3XA 1OLAA 3UK4A 1B9JA 4G8NA 3JYRA 3O28A 2RC9A 5DVFA 2AYSA 4GL8A 4RA1A 2Q9TA 1FQEA 1B5IA 2GH9A 4R74A 2X7QA 4F1YA 3N5LA 3TZAA 1II5A 1QKBA 3VDFA 1PBPA 4EQBA 1A55A 3FD3A 4GXSB 4G68A 4POWA 2I4BA 1R1NA 4F39A 1UTHA 2DVCA 5H8FB 2F78A 4OZ9A 3ONMA 4DXBA 1POTA 4FORA 1MY3A 4RJZA 3K6UA 3TQWA 3RPWA 2DE4A 2Q88A 3M3LA 3QK6A 4F3GA 3DM0A 3T9UA 3UGWA 1B5JA 2F35A 2F6PA 1B32A 3VE1B 1POY1 3FZVA 5CC2A 3K0VA 3R6UA 5I57A 4QFKA 4MLQA 2QMWA 5I58B 2DSFA 1LLSA 2R6GE 2GRVA 3FXUA 3GBBA 3ZS6A 4U21A 4X9TA 1LAGE 5CMKA 5KDTB 3TTMA 5EHSA 2A5SA 4ONYA 3Q27A 5I56A 4EQ9A 3IB0A 3CVGA 4E0XA 3CG3A 4QFNA 1SVXB 3RQTA 4LQ2A 2VHAA 3MJNA 1EU8A 1URGA 1FTKA 4RK2A 2V3UA 3PPOA 1B46A 2XXXA 3CRBA 1L5TA 4R75A 4OFLA 1URSA 2NWJA 3FVNA 4TLMB 1B0LA 1EZOA 2HFBA 1LBCA 5AA2A 3QXMA 2I0CA 1MY2A 4ELQA 4JB7A 1QVSA 3SEVA 3OSRA 4LQ5A 4NMYA 3K01A 3GXAA 1LAFE 4XKNA 5L9OA 1B40A 5IKBA 4ZE9A 5BWJA 1M5EA 1US5A 1A99A 4KHZE 1IUDA 2F7BA 2GFEA 3OMBA 4IO3A 1IXCA 4MBPA 1ZKBA 1NFTA 3CFLA 2O69A 1FTOA 3U93A 5J1DA 1MXUA 2KLFA 1M5DA 4YB7A 3O6GA 5H8QB 2GHBA 3BKIB 2DVZA 5B7DA 1MY4A 4OMBA 5ISUA 4EDPA 3EHUA 4YZZA 1TXFA 4ZZEA 4LVQA 2RC7A 4NEDA 3RTFB 2XXIA 3OSQA 3U92A 1PC3A 4P0IA 4KPTA 1F9BA 4M1VA 4FEDA 2Y7PA 3A09A 3MQ9A 1XT8A 2DWAA 4KCCA 4ELOA 2XXUA 3Q26A 2DE3A 3MWBA 1PB9A 1Y3QA 2M8CA 2XHDA 3LBSA 3CFXA 4ND9A 1NNFA 3TCHA 4QSDA 3QUFA 2ESNA 2PBWA 3WAEA 2OWSA 1AMFA 3O97A 2V3TA 2PT2A 3GLBA 3MP1A 5IAIA 3S4UA 3TKDA 2RF1A 1PBQA 4WKMA 4EF2A 1XOCA 3R7XA 1HSEA 1MXYA 4G8MA 3RUMA 2V93A 3FIRA 3KBRA 2OBGA 3RLFE 5I2NA 1P1NA 4KYEA 4U2RA 2THIA 3TDJA 5I2KB 3IK6B 2E0SA 1N76A 2YPNA 3MAMA 1DOTA 1T0KA 1EH3A 4NF4B 3EHSA 1LAXA 1TT1A 4ZEBA 1XC1A 3DELB 1MDQA 1H3DA 3U8QA 1O63A 1JEUA 4LZ5A 3MZ9A 3QUJA 5ICQA 1N3WA 4YU0A 5H8HB 3IL1B 3IOUA 2AL4A 2AIXA 2BJJX 4F2QA 4IO7A 4Q30B 2CZLA 1UQWA 1CB6A 2XXWA 3MUQA 2O1LA 1B52A 3SEXA 4POXA 4OWDA 5H8FA 1J1NA 4BDOA 2GHAA 3B6TA 3T22A 4YB6A 5JTYB 3SEYA 2B65A 4GD5A 4KR5A 1LB8A 3OENA 4EUOA 2QS1A 2R9JA 4R9FA 1LFHA 3S9LC 1B58A 2DS9A 3CI8A 4JWXA 3P7IA 5CRYA 2O7UA 1OVBA 3KG2A 2QRYA 4PFYA 5EHMA 2RINA 5K2YA 2I49A 5CM6A 3Q29A 1B3LA 3E9XA 3KOSA 4IO5A 2O84X 4OYVA 5I58A 3TAJA 4Q0CA 2QJEA 4G2ZA 1BKAA 2HAVA 4ZEFA 1MY1A 2UYFA 1LBBA 1DTGA 1SYIA 4U1ZA 3PUVE 4UA8A 5KDTA 2VOZA 3FATA 4H5GA 2QPQA 4YKKA 1JQFA 3C36A 1URDA 1GGGA 4GFRA 5AA1A 3TFLA 2FA7A 2F7AA 1TWYA 4YMBA 2I6EA 2IA4A 4YKJA 3W15C 2H98A 1B7UA 4OENA 4PFUA 3LC8A 3TCFA 4GXAA 4KCDA 2UVHA 3T9XB 4P0GA 4Z0IA 1IXIA 5FHOA 3PD8A 4QFPA 4KYSA 3T93B 4R6KA 2ZNUA 2OWTA 3I5OA 2Q2CA 5KCJB 1IXHA 4O3AA 1Z7ME 4G8HA 3FASA 1FCKA 3CSGA 3K00A 3N26A 3HHFA 3IAZA 2Q89A 5B70A 2HXWA 3IOTA 3R26A 1NKXA 3O6IA 3S9MC 1NMUA 3T96B 4YMAA 2H9BA 1QJMA 5H8QA 3N6UA 3N94A 1B7HA 3L6GA 2OK2A 2Y84A 3IJXB 3RT6B 5H8NB 1ZMGA 1QUIA 3MVZA 5I84A 3MP8A 1JW4A 4THIA 1N84A 1LFIA 3PPRA 2F7CA 1IITA 2D3IA 3UORA 3ILUB 2ZNSA 3RY3A 3O29A 2DXYA 3IB2A 3TTKA 5DT6A 4X48A 3EHTA 4OESA 1B2HA 2ZYOA 5EYFA 2YJPA 3HO7A 2WKYA 4ZE8A 3OO6A 3LSLA 1WODA 4C1TA 1MPCA 1GTKA 3QYTA 2X7PA 4XKQA 2XX8A 2DP8A 1IQ7A 4H8IA 5ITPA 2F5XA 1Y4TA 4DLDA 1MQDA 2QL3A 4DZ1A 1S50A 2HQ0A 1TFAA 5I2KA 4HW8A 1RYXA 2QMXA 2DYXA 5H8SA 1VR5A 1B6HA 1ZJLA 3HHGA 2RC8A 1DMBA 4F19A 2NOOA 3CFZA 5L9MA 1SBPA 4NF4A 2UYEA 2VD3A 4IGTA 1FQDA 1WVJA 3RTWB 4LUBA 2LAOA 5TP9A 3G3IA 2VD2A 2Z23A 1B4HA 1TFDA 4DCYA 2F36A 2XD3A 4U22A 1FW0A 2E1SA 4NWDA 1I69A 1I6BA 4ZZAA 2I4CA 2P0SA 4HTGA 1XS5A 4OERA 3TCGA 1GV8A 1LSTA 3HPIA 1RKMA 3CG1A 4WEPA 4U1OA 5CI5A 5DEXB 3E13X 5F1QA 4DXUA 1R9QA 1B7ZA 5JTYA 2RCAA 4NTLA 1DSNA 1MPDA 1NNPA 4K3FA 5DVIA 1D3KA 1SI0A 4R73A 1PDAA 3RGYA 4OQOA 4Q8RA 3OELA 3U94A 1ATGA 3HCQA 2ONSA 1XVYA 3DP8A 2ONRA 4E0WA 3H06B 4XIGQ 3C32A 4OEVA 3SDFA 3PPQA 3CSBA 1Y9UA 3MVYA 3ILTB 1N04A 3HN0A 1B0HA 3ZKLA 3V5AA 3QIMA 3S9NC 1Q1KA 3FJ7A 1P99A 1MH4A 2XX7A 2ZMBA 2ZXTA 2ABHA 4H65A 1B3EA 2I58A 5FHMA 3KEIA 3KN8A 5DYHA 2VGQA 2F6GA 5F7VA 1FQBA 4OFJA 3MZ1A 3TTNA 2QSXA 3WAFA 4OFOA 1PB8A 4R2BA 4QHQA 1ZLQA 2F34A 1P1QA 3K6XA 4NF6B 1FTJA 2HAUA 3SESA 2ZYKA 5KCJA 4I62A 3KJ7A 4U4XA 2PMSA 1USYH 4JSOA 3TUSA 1H44A 1P1UA 4YB5A 1Y3PA 2DQVA 4RPNA 4GL0A 2OLBA 2QS3A 4GLIA 1QKAA 1UTBB 2DE2A 2ONKE 4HCYA 1DTZA 4F3PA 4JSDA 3KSJA 3O9PA 3O66A 2AL5A 3LSFB 4BDMA 3EN3A 4LP2B 2UVGA 2OCUA 4DXCA 3FVGA 3TMGA 1B4ZA 3LR1A 3MVWA 3PPNA 5H8NA 4O3BA 3FXRA 2I3VA 2UXAA 1BTJA 1M5BA 3AXFA 1B1HA 4C1UA 4NF8B 1R6ZA 4XTCQ 3FJMA 2Q8JA 2DWJA 3G3JA 1QUKA 2Y7IA 1IXGA 4PP0A 1YCJA 4F18A 4RNSA 3C33A 1SYHA 3PV0E 3K6WA 3G3KA 3A3UA 3C34A 2O7IA 4NE4A 1QUJA 3OEKA 2XXRA 4F2OA 1SW2A 2I48A 4EXLA 1A8FA 4PFWA 3TEPA 3U72A 1I6AA 1GVCA 3QAXA 1LAHE 4GQOA 4MF3A 1JNFA 5I59B 4F3SA 1B3GA 3TPAA 2G29A 1USYE 4QRZA 4RK9A 1SD3A 4EF1A 1LCTA 5CMMA 3C4MA 3PUYE 4O3CA 1A54A 1P1WA 2NXOA 3MC2A 3PU5A 2HEUA 1EZ9A 1JW1A 3Q28A 4YICA 1B3HA 3L6HA 4G68C 1ZIUA 2ALUA 2Z8FA 1VSOA 3VV5A 1D9VA 3H6TA 3CR9A 1SW4A 3USDA 1DPEA 3FJGA 3C31A 4TLLB 4H1XA 4KFQA 1VFEA 4P11A 2PT1A 3PGFA 3VVDA 4PE5B 3TODA 1NH8A 2QS4A 4TOZA 2HZLA 3DP4A 4KQPA 3K1PA 4BDLA 2O68A 1AIVA 2XXHA 5FHNA 3IO4A 2W7YA 4ZEDA 1LB9A 3SKPA 2IEEA 4HS7A 4ISUA 1NL5A 2OZZA 2Y7WA 1FQFA 2Y7RA 4R2FA 2XD2A 3K6VA 2G93A 4OVJA 3VVEA 3PMXA 4MLVA 4QSCA 5LOMA 4X1BA 1MS7A 1YPNA 1OIBA 3UN6A 1B05A 3BBRA 3KZGA 3H4ZA 5DEXA 1BP5A 3IJOB 3B6WA 4MFIA 4FATA 3MZBA 4F31B 4OETA 4ZS9A 3C9HA 4U23A 4DIGA 3T66A 1NNKA 1XHYA 3HV1A 1M5FA 4QF9A 3THIA 1MXZA 5A5XB 2H4IA 4ZDMA 1JW5A 1B1XA 4DCXA 2NUVA 1A7LA 3W9VA 3LSWA 5JK4A 1SI1A 2XXPA 4OEUA 2V84A 3IOWA 4FECA 4X1DA 2V25A 3FV1A 3UA8A 3K2DA 5TU0A 3MPKA 3KFMA 1NH7A 5KZTA 4LONB 4H67A 4AB5A 3PMVA 1Y3NA 3FVKA 3TQLA 2V3QA 1OLCA 3H6VA 4KYDA 1AH5A 3VXCA 3CIJA 3LSXA 1MDP1 4GOTA 2QS2A 4IGRA 4PQJA 3E3KA 3PPPA 2UVIA 1GR2A 3S2VA 1PB7A 1H76A 5HPQA 3DP6A 5ICTA 2R71A 3TTLA 2D5WA 3MP6A 1MY0A 3K1NA 5K2XA 4GRKA 4QSEA 3DLNA 2H25A 1WDNA 4YKIA 5AE4A 4NF6A 1BIYA 2I3WA 4ZEKA 1H43A 1B51A 3UP9A 3PMWA 3MPLA 1MM7A 3GZGA 5L9SA 2O1MA 2VP1A 3B7DA 2H5YA 3OO9A 1Q35A 1I6QA 2DXRA 1VFDA 1N0TA 3S9EA 2DOJA 2Y7KA 2XXYA 3FXQA 3O2AA 5DTBA 4I8CA 3PUZE 2PX1A 4F1UA 1UTBA 3GBAA 1MG1A 3V8XB 3T9VA 2A5TB 3G3FA 3OXNA 5AA2D 3FUZA 4M4GA 3D4GA 4ELRA 1O7TA 3PD9A 5HBCA 1MRPA 4ZECA 4MH5A 4GWOA 3SERA 1HSJA 3JZJA 1KWHA 3SEUA 3VLVA 3IORA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1M5CA 1QW0A 3TYHA 3W9WA 1OQGA 2P1SA 5AA4B 3U65A 4F22A 4MIJA 1YXIA 4NF8A 1D9YA 5ELVA 5H8HA 4BDNA 1S7YA 3BFUA 2FBPA 4R6YA 3QSLA 4FJPA 1AL3A 4FAJA 2O51A 3VLWA 3D4CA 4FE8A 4L17A 2XX9A 2Q2AA 3KOTA 5TPAB 3OEMA 1SW1A 4OXVA 2Z22A 4XKPA 3KN7A 2XWKA 5CMCA 1XVXA 4AS4A 4N4UA 1D4NA 4LA9A 4H5FA 1US4A 3SETA 1SW5A 2HZKA 1OQHA 4H0WA 3JV9A 4LATA 5EQ7A 5I59A 1ZTYA 3VXBA 3RT8A 4NF5B 2PVUA 3K02A 3IO6A 4GVOA 1SQYA 4GWSA 4H8JA 1QULA 2WBDA 4QFLA 4PF8A 3OO8A 1A8EA 1MQHA 3IB1A 4U4SA 1O64A 3TTRA 4F29A 1BLFA 1Q9DA 4N8GA 4G77A 2P2AA 4IY5A 3K4UA 3OOAA 4JWOA 3LUYA 4ESXA 3H6WA 1FQCA 3FGSA 1MXWA 1FPKA 4P56A 1AOVA 1MXVA 3PUWE 4BDQA 4IO4A 1VDWA 3D1RA 1MQIA 2Z8DA 1NV0A 2NVUB 1DK4A 3BFTA 4DI4B 4JBZA 4G68B 4R72A 4YAHX 4EXKA 2ZYMA 2HCAA 4MAGA 1DPPA 1JETA 1UTHB 3IX1A 5IZZA 4PAKA 3B6QA 4JXIA 4IY6A 4ZEIA 3G3HA 1IEJA 2X26A 4NAPA 4GIZA 3H7MA 5EYHA 4OTEA 1FBCA 3IFAA 4WEDA 3M3KA 1Y1ZA 3V83A 4AB6A 4R6HA 4N6PA 4XEQA 1IMCA 3I6VA 1ELJA 4IO2A 3I3VA 1YAEA 4HE0A 4PC9A 3U1OA 3LUZA 4BLAA 5EQAA 1IZ1A 5ITOA 1JVXA 5FTHA 4UACA 1ZU0A 3HSTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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