2UYEA

Double mutant y110s,f111v dntr from burkholderia sp. strain dnt in complex with thiocyanate
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
DSFDPFASTRTFNLAMTDIGEMSVMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPNAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEAH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords REGULATORY PROTEIN
publication title In Vivo and in Vitro Investigation of Transcriptional Regulation by Dntr.
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia cepacia
molecule tags Transcription
total genus 62
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uyeA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uyeA02
3MVXA 4AB5A 3SERA 1MY4A 3KSJA 2QS3A 2DQVA 1MXXA 1POTA 1D9YA 3ODBA 3S2VA 3CRBA 1LSTA 4YMAA 2H5YA 4U2RA 5HM4B 3T93B 1USYH 1Y3QA 5CMCA 3W9WA 1MXYA 1MXVA 1MY1A 4GD5A 1NFTA 5AE4A 3U94A 3FZVA 2V3UA 3PUXE 1ANFA 1XVYA 4BDRA 3H6TA 3IOVA 2ONKE 4HS7A 4K3FA 3PPPA 4NF5A 3HCQA 3HN0A 4IO7A 5JTYA 1ELJA 1ZKBA 2FNCA 1NNPA 2E1SA 2UVHA 2Z8FA 5I57B 4XTCQ 1GVCA 3U8QA 3PMVA 4H8JA 4U1OA 4ELRA 3FVOA 2I0BA 2ZXTA 4ONYA 4C1TA 3MUQA 3OO6A 3O6IA 5EHSA 3MVYA 3FATA 3FVNA 3M3KA 1Z7ME 1S50A 3PU5A 2XXWA 4HW8A 4U4XA 1IITA 4RXLA 5IAIA 4DE8A 5JTYB 2F35A 2G29A 3MJNA 3H06B 2V25A 1H45A 4ZE9A 2UYEA 2PT2A 1P1NA 4IO6A 1OLAA 3RN8A 1MDP1 3KN8A 1B51A 3HO7A 1B3EA 2XXHA 1EZPA 1MY3A 3V5AA 1DTGA 3OENA 1PB8A 1B6HA 4GL0A 5K2XA 3MPKA 1MQIA 4YAHX 3G3JA 4JSOA 3ILTB 3O29A 4IO2A 1B1XA 1EZ9A 3OMBA 3UIFA 4QRZA 4XIGQ 2HAUA 5HPQA 5F1QA 2LAOA 1L5TA 3IOWA 4U4SA 3BBRA 3VVDA 3TTRA 3RPWA 2W7YA 1MQHA 4TQUQ 5BUUA 4OFLA 4WEDA 2OK2A 3Q25A 1ZLQA 4F3PA 3KSXA 4QFNA 4ESWA 3C32A 1SVXB 2ABHA 4OXVA 4R74A 3IO4A 3N6TA 1B52A 4N07A 1JETA 5JEIA 4JXIA 4AB6A 2HQ0A 4LZ5A 1RYOA 4LZ8A 1MY2A 1JW4A 3TTNA 5DEXA 4BLAA 3B6WA 2P0SA 4R75A 2HXWA 4JWXA 4LQ2A 4U22A 3ECRA 1UQWA 4H6DA 2ZYOA 1YCJA 4F22A 3MZ9A 1CE2A 1LCTA 2DWIA 3TFLA 2XX8A 1IEJA 4G8MA 4GF8A 4IY5A 4KYSA 3LSFB 5DTBA 4X1DA 1XOCA 2F7CA 3GZGA 3FXUA 3BFTA 1B3LA 2ZMBA 3HHGA 5ITOA 3VDFA 3MZ1A 1WVJA 4LUBA 3IORA 4G8NA 5DEXB 2F36A 3I3VA 1QULA 3H4ZA 4GL8A 1SQYA 4QFOA 3PPOA 4ZZAA 1B0LA 1A8FA 1M5EA 1B5HA 4GRKA 1DPPA 3MAMA 2XXPA 4EQBA 2QPQA 2AIXA 4G4PA 4PFWA 4F19A 1URGA 1M5FA 3DM0A 4I8CA 4H65A 3FJGA 4H0WA 1QUIA 1O63A 4UA8A 4DCYA 1NNKA 4C0RA 1A54A 2UVGA 2XX7A 4IO4A 4DLDA 3EHUA 1ZMGA 3E9XA 3MC2A 4IO5A 2VOZA 4QFLA 1QJMA 2VD2A 1FCKA 2H99A 4RK2A 4JSDA 2ANJA 4GFRA 3SEVA 1N76A 3KOTA 1FQCA 1PBQA 1I6AA 5ISUA 2I4BA 5ICTA 2OJTA 2FYIA 2Y7RA 1DOTA 3LSXA 1ATGA 1LFIA 2XXVA 2O7UA 3TODA 4KI0E 2O1LA 4R72A 2E0SA 3K1NA 2ZNUA 5CBRA 4OZ9A 3MW0A 4RPOA 4U1ZA 4F1YA 2QL3A 2Z8EA 3MVWA 5I2NB 1N04A 3SEUA 4MFIA 3SEYA 5B7DA 2O68A 1I6QA 4L17A 1SW2A 3FGSA 3I6VA 3U92A 5CC2A 3O9PA 3TELA 3T9XB 4IY6A 4EUOA 3PGFA 3TCHA 1LCFA 1B0HA 1MG1A 1ZBMA 3JYRA 3K6VA 1R6ZA 4FEBA 3KN3A 1SW1A 1B7UA 2P2AA 2QMWA 1FTJA 2OCUA 1N7WA 2XXIA 1VR5A 4IB2A 4EF2A 3IJOB 3LC8A 1B1HA 2HEUA 3R26A 5DVIA 3GBBA 2DSFA 4MLQA 1R1NA 2PT1A 3T96B 3PUVE 1URDA 2I4CA 1MXZA 3UN6A 1OMPA 4GIZA 4YKJA 3N6UA 2ZYNA 2P1SA 3A3UA 3CIJA 4OETA 3QYTA 5HBCA 5FHOA 4AQ4A 1I6BA 5EYFA 4QFPA 4U21A 3TCGA 5CI5A 4EXLA 4Z0IA 4KHZE 2YPNA 4JWYA 4OEVA 2X7QA 3IL1B 5A5XA 3WAEA 4NE4A 2QRYA 4RPNA 4NF6B 1B3HA 1PBPA 3C31A 2VGQA 5I2KA 3USDA 4NF4A 3FASA 4PP0A 4F39A 4GLIA 2GRVA 3OO9A 4KYDA 5KZTA 3UORA 3QUJA 1MM6A 3CFXA 3S4UA 2ZNSA 1N84A 1MQJA 2Q2AA 4RYAA 5L9SA 3KZGA 3O66A 3Q26A 4BDQA 4ZEFA 1P1WA 3C33A 2Y7IA 5A5XB 3FXQA 1NH8A 2DVCA 4FE8A 1LAGE 1JVXA 1QUJA 3FIRA 3H3GA 4OEUA 1MXUA 4RK9A 3ILUB 2WKYA 3IOTA 3W15C 3MVZA 4NMYA 4G68A 1XVXA 2Y7PA 3FVGA 1MH4A 2Q2CA 3IOUA 3VLUA 4FJPA 3RUMA 3R7XA 5IKBA 2UVJA 2XHDA 5AA2D 4GOTA 4YU0A 1XS5A 3TUSA 3W9VA 1D3KA 3KN7A 5TP9A 4POXA 2DE2A 2XD3A 4YMBA 1P1QA 2HAVA 4M1VA 5H8HA 2Y7WA 2QMXA 3D4GA 4ZZEA 4G68B 4TLMB 3FUZA 4I9DA 2X7PA 3DP6A 4OMBA 2OBGA 1HSLA 4BDMA 1N3XA 2NXOA 2DOJA 1Y3PA 4OVJA 2GHBA 3WAFA 3PUYE 1B4HA 4F29A 1OQGA 3DLNA 5LOMA 3PD9A 4P11A 3U1OA 5TP9B 1EU8A 4LVQA 1Q35A 4NF5B 3KEIA 1PB9A 2I58A 3A09A 4PQJA 1H43A 2B3FA 2B3BA 2O84X 1AH5A 4XKPA 5H8HB 2UVIA 2Q89A 4EQ9A 2DWHA 5EHMA 5ELVA 5H8QA 3K6WA 4P0IA 5AA4A 5FTHA 4E0XA 4H5FA 2OLBA 4P0GA 2D21A 4R9GA 1R9LA 3FJ7A 1NNFA 1PEBA 3BFUA 2V3TA 4THIA 5I84A 4JBZA 4PE5B 1M5CA 3EN3A 2GHAA 1MPDA 2XD2A 2I48A 4H1XA 3K0VA 3JV9A 3KOSA 5I56A 1A7LA 1EH3A 3T9HB 3RT8A 1MS7A 3KBRA 1MRPA 3KGCA 1UIVA 4ZS9A 1B46A 1H3DA 3IB2A 3TTLA 2O1MA 2ESNA 2F34A 5AA4B 2QJEA 2DP8A 2YJPA 2UXAA 1LGBC 4HTGA 3T9VA 3KJTA 4ELOA 2ZYKA 2R71A 3V8XB 3V83A 1B4ZA 3QUFA 3PD8A 2GH9A 3QXMA 2F8DA 3TAJA 2UYFA 3MQ9A 4Z7EA 4Q0CA 1VE4A 5M2VA 4BDLA 4EDPA 4GXAA 3L6HA 4X48A 4R6KA 3RGYA 1GV8A 1GGGA 4ZEKA 1JW5A 1B7HA 4OWDA 4NTLA 4NEDA 1A55A 4JDFA 3VE1B 2V93A 4MBPA 4H67A 4JWOA 2Z22A 4I62A 1B32A 2RC9A 3H6VA 1AIVA 4YKPA 4FECA 3K2DA 1PC3A 3MP6A 3VV5A 1XHYA 1Y9UA 3OSQA 3Q29A 3S9MC 1FQAA 3QIMA 1N0TA 4YZZA 4OFJA 2ONSA 2O6AA 1N7XA 1S7YA 2QS2A 3OO7A 4LA9A 5L8DA 2NUVA 3ZKLA 4ZE8A 3KJ7A 4PFTA 2H25A 3K01A 4EF1A 2H98A 1QW0A 1AMFA 3LR1A 2YLNA 3N94A 2Z23A 3KG2A 3GLBA 3OXNA 1D9VA 5L9MA 1SBPA 1QKBA 3VXCA 1QUKA 2Q8JA 3KFMA 3CG1A 4E0WA 1QKAA 2VD3A 3UGWA 1P1OA 1IXGA 4O3CA 4ELPA 1T0KA 2F97A 4BDNA 4F18A 1US4A 4LATA 4G77A 1MPBA 3GXAA 1ZTYA 2OWSA 1SYHA 4KYEA 1FTLA 3H6WA 3FJMA 1SI1A 4JB7A 3E3KA 3C9HA 2O51A 1SI0A 1UTBA 1M5BA 3G3IA 4H5GA 2XXTA 3UA8A 4HCYA 4QSDA 1JEVA 2HFBA 3TEPA 2HZLA 1WODA 1B3GA 1A8EA 4OERA 2AYSA 3PPQA 3Q27A 4O3BA 2Z8DA 4F1UA 1FW0A 1TFAA 4U23A 4R2BA 3RY3A 2XXUA 4KCCA 4BDOA 3LUYA 3IX1A 4FORA 4PFUA 2BJJX 3CFLA 5FHMA 2DVZA 5AA1A 3N26A 3MP8A 1GTKA 4IGTA 4WKMA 1B9JA 4N13A 2NWJA 3EHTA 4XXUA 1JQFA 3TYHA 3ZS6A 2RINA 3B6QA 3L6GA 3SKPA 1NKXA 4H8IA 3AXFA 1B40A 5AA2A 1XC1A 2FA7A 3K1MA 5FHNA 3IR1A 3K1PA 1MY0A 4NF8A 3MZBA 2H9BA 1AL3A 1LBCA 1NMUA 1IXIA 2O69A 2Q9TA 3C35A 4HCWA 1IIWA 2CZLA 4PETA 3EHSA 3OELA 4Q5TA 3E13X 3TCFA 1RKMA 5AA2B 2V84A 5FTIA 1F9BA 3T22A 2THIA 4NF8B 4NWCA 1J1NA 3RNNA 3IB1A 1JW1A 1Y4CA 1IQ7A 5F7VA 1IXHA 3ZKKA 5H8SA 1BP5A 4N6PA 3B7DA 5KDTA 4R2FA 3RTWB 3SETA 4F3BA 3M8UA 3TMGA 1LAXA 1SD3A 2DXYA 4YICA 4F3SA 2R6GE 2XXQA 1D4NA 4ZECA 4EXKA 4DCXA 2I3VA 5I2KB 5DYHA 4RJZA 2XXYA 4NF4B 3FV2A 1OQHA 4G8HA 3PMXA 4R9FA 3EF7A 1OLCA 5I57A 2ZNTA 3V89B 3S9NC 3F11A 1ZU0A 1B05A 3RTFB 3HV1A 4DIGA 1MH3A 3D4CA 4I1DA 3IAZA 4ISUA 5KDTB 2NOOA 1IXCA 1UIUA 1LB9A 1H76A 3TZAA 4R6HA 1QVSA 1OVTA 4OESA 4WEPA 1FQBA 1MQGA 3OO8A 5DVJA 2H4IA 3T66A 1Y20A 5H8NA 3RQTA 4KFQA 4Q30B 4QF9A 1LB8A 4Q8RA 3OOAA 3M3FA 4G2ZA 2RC7A 1CB6A 1MDQA 2V3QA 4DDDA 3HSTA 1Z7NE 5AA3A 1LFHA 4MF3A 3TQWA 4OFOA 1NL5A 2Y7KA 2Y84A 1II5A 1LAHE 1S9TA 3HPIA 3DP8A 3GBAA 1B58A 3R6UA 3OSRA 1SDXA 3BKIB 3S9EA 3SESA 4DXCA 4KD5A 3TTMA 4PFYA 3DELB 1FTMA 3CG3A 1IUDA 1US5A 3TKDA 3PPNA 3MBPA 5H8NB 1FTOA 2A5SA 3MPLA 2IEEA 3LBSA 4LP2B 3CFZA 1PB7A 1TWYA 3U72A 2PX1A 4X1BA 3H7MA 2F7AA 2XXRA 1B2HA 3VVEA 2I49A 3UP9A 2PBWA 4WXJA 3HHFA 4G68C 3FVKA 1R9QA 1LBBA 5CMBA 3O6HA 2F6PA 3DP4A 4XKNA 2ZYMA 4XKQA 2PMSA 1FTKA 1YAEA 2OZZA 2VP1A 2F6GA 3TDJA 3C34A 3MWBA 2AL4A 5H8QB 1JNFA 4YKKA 2PVUA 1RYXA 4QFKA 2I0CA 3A3CA 3PUZE 2HZKA 3CVGA 3VVFA 1AOVA 4ZDMA 3UK4A 1O64A 3O28A 4QSCA 4R6YA 2D5WA 3K02A 2Q88A 5CBSA 3SEXA 2M8CA 4TOZA 4EQ7A 1B5JA 2O7IA 4KQPA 2G93A 1KWHA 3PUWE 2DWAA 5I56B 3FV1A 4DXBA 5B70A 3FXRA 1TXFA 3IB0A 3C36A 4FEDA 5KCJA 2B65A 1M5DA 4MLVA 5CM6A 4DXUA 3PPRA 3O6GA 5BWJA 1MM7A 1YPNA 1MXWA 3IK6B 3N5LA 1I69A 4LONB 4POWA 3K6UA 4ECFA 5DT6A 2KLFA 5TPAA 3MP1A 2ONRA 3VLWA 2QS1A 4IGRA 1UTHA 1DPEA 1BIYA 1USYE 4ND9A 1Y3NA 3H03A 4F3GA 3EPEA 4FAJA 3CSGA 4LZ7A 1DMBA 5KCJB 4DZ1A 5L9OA 1Y4TA 3TQLA 1O7TA 2REGA 3CR9A 1B7ZA 2RCAA 4ZEBA 1FQFA 3QK6A 3OEKA 5I59A 1BTJA 3VLVA 1HSJA 3ZSFA 2A5TA 3C4MA 3EQ1A 5TPAB 5ITPA 1DSNA 4XKRA 1UTHB 3M3LA 1BLFA 4QSEA 4OYVA 5CRYA 1FQEA 2XXXA 3OD7A 5CMKA 1DTZA 1TT1A 2DE3A 1OIBA 3PV0E 1LAFE 1FQDA 1VFEA 1H44A 4RNSA 1XT8A 2R9JA 3QAXA 4RY1A 1URSA 4FIMA 4YB5A 1B5IA 4ZEIA 2RC8A 4YKIA 2F5XA 1ZIUA 3K4UA 1NNTA 1VSOA 3LSLA 5I2NA 3Q28A 5I59B 4GXSB 5JK4A 3E4RA 3SEWA 1P1UA 2A5TB 2F7BA 4X9TA 3LSWA 1TFDA 3K00A 3K6XA 4F1VA 2D3IA 2VHAA 3G3HA 3G3FA 4KR5A 3IO6A 3I5OA 5J1DA 1MPCA 2AL5A 3O97A 1IZ1A 2RCBA 1YTVA 2QS4A 2RKMA 4GVOA 4UACA 4F2QA 2I3WA 2DS9A 3T9UA 1MQDA 4GWOA 2X26A 5CMMA 4OENA 1Y1ZA 2CMOA 1N3WA 4NWDA 3THIA 3CI8A 4F31B 1UTBB 4OHNA 4RA1A 3G3KA 4YB7A 4ELQA 1P99A 5ICQA 4MH5A 2HCAA 4C1UA 4F2OA 3U93A 3JZJA 3P7IA 4QHQA 2DYXA 4ZEDA 1SW5A 1BKAA 2NVUB 1NH7A 3G7WA 3B6TA 4GQOA 3VXBA 1JEUA 5I58A 4NF6A 2REJA 3RLFE 5H8FA 4TLLB 2XX9A 2OWTA 2F78A 1POY1 3QSLA 4YB6A 4OQOA 1Q1KA 2DE4A 1LFGA 1EZOA 1A99A 5TU0A 3FD3A 2DWJA 3H6UA 2PYYA 3PMWA 4IO3A 3TPAA 3ONMA 1JVYA 5K2YA 3TTKA 1WDNA 2RF1A 3IJXB 1SYIA 1SW4A 3OEMA 4KCDA 5I58B 3O2AA 1B3FA 5H8FB 3CSBA 4FATA 1PDAA 1HSEA 4KPTA 1A40A 1LLSA 4OTEA 1OVBA 3RT6B 2QSXA 3S9LC 1VFDA 2IA4A 4R73A 2ALUA 5DVFA 2I6EA 1GR2A 2DXRA 1Y1MA 4ESXA 2GFEA 3G3GA 4M4GA 4O3AA 3VFJA 4LQ5A 3SDFA 1ZJLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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