2UYEA

Double mutant y110s,f111v dntr from burkholderia sp. strain dnt in complex with thiocyanate
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
DSFDPFASTRTFNLAMTDIGEMSVMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPNAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEAH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords REGULATORY PROTEIN
publication title In Vivo and in Vitro Investigation of Transcriptional Regulation by Dntr.
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia cepacia
molecule tags Transcription
total genus 62
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uyeA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uyeA02
1B5JA 1GVCA 5H8NB 2Z23A 4F18A 2F5XA 3G3IA 3VFJA 1FTLA 2PT2A 4YKIA 5ELVA 1Y1MA 3G3JA 2Q2AA 5M2VA 4YICA 5K2YA 4F2QA 2RF1A 1OQHA 4QRZA 3M8UA 3PD9A 1B3HA 2ZYOA 4OVJA 5KCJA 1B7UA 4TOZA 3PMWA 4I62A 1FTKA 1FQEA 3K6WA 1QKBA 2I4CA 5JK4A 1B40A 3TYHA 3KSXA 3KBRA 3I5OA 2PVUA 4PFTA 2DP8A 1IXHA 4ELRA 1P1WA 4BDLA 3O2AA 1JW4A 3PU5A 5AA4A 1SVXB 3TPAA 4GFRA 2YJPA 2ZXTA 4NF4B 1GV8A 2VP1A 3ILUB 5I56B 3KOSA 5IAIA 3O66A 4G68C 3L6HA 1A99A 5L9SA 5I2KB 2XX9A 1MQJA 4QSDA 2Q8JA 2F7CA 4P0IA 3TTMA 1IEJA 3H6UA 3RY3A 1FQAA 4U4XA 1JNFA 4X1BA 3CRBA 3JZJA 3KOTA 4N13A 3K6VA 1Q35A 1VR5A 3T96B 3K2DA 2QS3A 1XHYA 5H8HA 3H6WA 3G3KA 1QUJA 1NKXA 1YAEA 3RGYA 2OJTA 3UN6A 1B5IA 3PPQA 1RKMA 4ZE8A 2QMXA 3VXCA 1JVYA 3SEXA 3MVWA 2DVCA 5I59A 1B3FA 1FTMA 4FE8A 2ESNA 3FATA 1MQHA 3CI8A 4IY6A 3MQ9A 5H8NA 5AA3A 1TFDA 2YLNA 4NWCA 4OEVA 3HN0A 3MVZA 3IJOB 2AIXA 3GBBA 1P99A 2I3WA 1LAHE 3KFMA 1J1NA 4JWXA 3FV2A 4BDQA 3U93A 2G29A 3MW0A 4N07A 3U92A 1N3WA 2HXWA 1EZOA 4RXLA 2V25A 1LSTA 1B46A 2OWTA 4LVQA 4GL0A 3EPEA 4NTLA 4YB6A 4BDNA 1O7TA 2UYFA 4M4GA 4LQ5A 3Q25A 5F7VA 2OCUA 1OVBA 5KDTB 1P1NA 3S4UA 1B2HA 3PGFA 4EDPA 3VE1B 4NF4A 2FYIA 4IGRA 2F8DA 3FXQA 1XVXA 4QFOA 3OD7A 5I56A 2DWJA 3THIA 1GR2A 4TLMB 2ZNSA 2X7PA 2RINA 5I2KA 5EHMA 3PMXA 2O51A 3VLVA 2DOJA 3PUWE 4YZZA 1MY3A 3B6TA 1B4HA 4H6DA 3PUZE 3HHGA 3CG1A 3RTFB 1B1HA 1MS7A 1XOCA 2DQVA 5AA2B 3IB2A 3LSWA 1ZLQA 4JWYA 2PMSA 3HPIA 3B6QA 2XD2A 1DTGA 2F7AA 3DLNA 4RJZA 3V89B 3VLWA 1VE4A 1TT1A 2DWHA 4ELOA 1M5BA 2O1MA 3KZGA 2O7IA 4JXIA 4NF5B 3CR9A 3PV0E 3USDA 1TXFA 1I6BA 4K3FA 2PT1A 1P1OA 3WAFA 3SEUA 2ZYKA 4G77A 5DT6A 1FQDA 1MPCA 1MH4A 1B58A 2Y7IA 3TUSA 4Q0CA 4G8NA 4FATA 4HW8A 2H98A 1H76A 1LGBC 2RC9A 5BWJA 4ISUA 4LA9A 3EHTA 3TMGA 3V8XB 4KYDA 3N6UA 4LZ7A 5I84A 2DXYA 5I58B 3UK4A 2X7QA 4ZS9A 4E0XA 5ITPA 4U4SA 4C0RA 1LCFA 2P2AA 1MG1A 4IO4A 4U21A 1MM7A 2H9BA 4OESA 2DXRA 4JSDA 3MVYA 1O63A 1RYXA 1XT8A 4OFJA 5KDTA 3T9UA 4YKPA 3JV9A 1NFTA 3IL1B 4PE5B 3N6TA 4YAHX 1QUKA 3K4UA 3FJMA 3TFLA 1B7ZA 1JQFA 4DLDA 4KYEA 5A5XB 5J1DA 1JW5A 4QFPA 3H7MA 2XHDA 4ZZAA 4KPTA 3FJGA 2NOOA 3T22A 5AA2A 1PBPA 1PB9A 3T9HB 1ZTYA 4JBZA 1USYH 1B5HA 4OXVA 3S9EA 1N0TA 3K6XA 3Q28A 5ISUA 1BIYA 3GBAA 2OWSA 1MDP1 2V3QA 3K0VA 4NF5A 1WODA 1A8FA 4I9DA 1PB7A 4ESWA 4KHZE 2IA4A 3O28A 2WKYA 3N5LA 4F19A 2XXVA 3UGWA 4ONYA 3W15C 3CVGA 2ALUA 5AE4A 3OOAA 2AL4A 2VHAA 2Q9TA 1A54A 2IEEA 3OXNA 3T93B 3VV5A 3CG3A 3HSTA 5IKBA 2YPNA 1KWHA 3G3HA 4UACA 1Q1KA 5KZTA 1MQGA 4GWOA 4POWA 1R9LA 5I58A 1US5A 1IXCA 3LSXA 3W9VA 4ND9A 2VD3A 2I49A 4F22A 4PFUA 3FD3A 1A40A 2XX7A 4ZECA 4U1OA 3EQ1A 1SDXA 3MZ9A 1MDQA 3JYRA 2R71A 3KN3A 4WXJA 3LUYA 3N94A 3O9PA 4GIZA 4KD5A 3U1OA 1LAGE 3R26A 1DPPA 5L9OA 3OO9A 4EXLA 3UP9A 2ZYNA 3GXAA 1WDNA 4X9TA 3ECRA 1N7XA 2HEUA 5A5XA 1SW2A 3PUXE 3S9MC 5FTHA 2H5YA 4EF1A 4QHQA 3TELA 2XX8A 4YKKA 3PPOA 5CC2A 3O6IA 4KCCA 5CMKA 4F3GA 2O84X 3MC2A 5F1QA 4O3CA 3QIMA 2XD3A 3I3VA 5H8FB 3U8QA 4ELQA 1BTJA 2Z8FA 4MLQA 3C34A 3H03A 1DSNA 1NMUA 2XXQA 2FA7A 2I58A 1Y1ZA 3A3CA 2ONKE 2A5TB 4OERA 1MRPA 4H65A 4IO2A 2RC7A 1HSJA 1SYHA 2QS1A 3BBRA 4RPNA 2O69A 4HS7A 3OSQA 2XXIA 4GD5A 2VGQA 3W9WA 5L9MA 4H0WA 4LP2B 3Q27A 2UVIA 2DWAA 2Q2CA 1WVJA 1MQIA 4F1YA 4NE4A 5DEXB 2OLBA 3G3GA 3RTWB 4R73A 3TEPA 3K02A 1N84A 4FORA 4ZEBA 3KN8A 2F35A 2RCAA 1N04A 2QPQA 3SERA 2QMWA 3KGCA 1PDAA 2HQ0A 2DYXA 4BDMA 1IXIA 1ANFA 3C4MA 2AL5A 3D4CA 4RK2A 3TCFA 3SETA 2B65A 3HV1A 1JEUA 1I69A 4KR5A 5TP9B 1SQYA 4IO3A 4OZ9A 4O3BA 3SESA 1URDA 3L6GA 2GH9A 4QFKA 4GXSB 3QXMA 1MPDA 3IORA 4PP0A 4NWDA 4MLVA 1LFIA 1M5EA 4KFQA 4EQ7A 3U72A 3KJ7A 4XIGQ 3K1PA 3SKPA 3IJXB 3B7DA 2I0CA 3CFXA 1PEBA 3QUJA 1S9TA 4OYVA 1CB6A 3GLBA 3VDFA 5H8FA 1UIVA 1FQFA 1L5TA 1EU8A 4EXKA 2CZLA 3FJ7A 1AIVA 4H5FA 4OEUA 2PX1A 5CM6A 5EHSA 4N6PA 3MPLA 2F6GA 3G7WA 4RA1A 1A55A 2H4IA 1FTOA 2A5TA 1AOVA 3TQLA 3V5AA 1B0HA 1AH5A 1SI1A 3PUVE 3H3GA 1B52A 1JW1A 2DWIA 4YB7A 3I6VA 3VVFA 2P0SA 3IOWA 2DVZA 3DP4A 2OK2A 1IQ7A 5FHNA 1HSLA 1GGGA 4WEDA 1XVYA 1MPBA 2XXHA 3H06B 5FTIA 3EHUA 2R9JA 1EH3A 4LZ8A 5DVIA 1URGA 4G2ZA 5DEXA 4BLAA 2XXRA 1NNPA 3T9VA 3D4GA 3BFTA 5HBCA 2PYYA 1B1XA 1Y3QA 3O97A 3IR1A 5CRYA 4F3BA 4ZEDA 1JETA 3EF7A 1YCJA 2ONSA 3IB1A 3PPPA 4POXA 3MPKA 1Z7ME 2DE4A 1FCKA 2V93A 5CMCA 1B3EA 5TP9A 2UVHA 1B4ZA 5DVFA 1FQBA 1LBCA 3TTKA 4FEBA 1II5A 1Y3NA 3C35A 4Z0IA 2ONRA 1EZ9A 4IO7A 4R6HA 4LQ2A 1LFHA 2Y84A 4ELPA 3IAZA 2QJEA 4P0GA 4DXUA 4G68B 3TZAA 2O6AA 4R9GA 3QSLA 1QUIA 3VVDA 4ZEIA 3OSRA 1VFEA 1H43A 4XKNA 1HSEA 5HPQA 3VLUA 3RQTA 4DIGA 3IOUA 1D9VA 5EYFA 5CI5A 1PC3A 2V3TA 2Y7RA 2Z8DA 3QK6A 1IIWA 2XXUA 4H5GA 3T9XB 3TKDA 2D21A 2RC8A 1SW5A 3E4RA 3C31A 1FW0A 2DS9A 2ANJA 2O1LA 3UORA 5TPAB 4Q8RA 3UIFA 3MP1A 3KEIA 2NUVA 2GFEA 3FVKA 1LCTA 3E9XA 1A8EA 1TWYA 4R6YA 2F6PA 4HCYA 3MZBA 4UA8A 3TQWA 4FJPA 5ICTA 1F9BA 2ZNTA 4QFNA 4DXCA 2ZYMA 3IK6B 3FVGA 2REGA 2HZKA 3ZS6A 4U2RA 1VSOA 4U1ZA 4R6KA 4C1UA 4LONB 3QYTA 1P1QA 2O7UA 3OO6A 1D9YA 1NNTA 2XXXA 4MF3A 2F34A 3B6WA 2PBWA 4WEPA 2UXAA 5B70A 1OLCA 1QW0A 1MXUA 4AB5A 1LAXA 2G93A 1OMPA 4JDFA 2V84A 1ZMGA 3FASA 4NMYA 4G68A 3FUZA 5L8DA 2R6GE 4M1VA 3LC8A 3KJTA 1B32A 4ZZEA 2F78A 3K6UA 2OZZA 2A5SA 3M3FA 3RT6B 2XXTA 4OWDA 1Y4CA 1M5CA 5BUUA 2Q89A 3SDFA 3ZKLA 2UVGA 5TU0A 1MXZA 1T0KA 4YB5A 4P11A 3F11A 4DZ1A 1ZKBA 2XXPA 3LSFB 1IITA 4FECA 1DTZA 4G8MA 4OQOA 1YTVA 4ZDMA 1Y3PA 4ESXA 4H1XA 1JVXA 3A3UA 5H8QB 3PMVA 4OETA 4MBPA 4X1DA 2HZLA 1SBPA 5ITOA 1UQWA 5TPAA 1MY2A 1LFGA 3FV1A 2I48A 2I6EA 3HO7A 1AL3A 4FAJA 3CSBA 4RY1A 3G3FA 1M5FA 2GRVA 3HCQA 1Z7NE 3T66A 2VOZA 4GOTA 3A09A 1GTKA 3CFZA 3C36A 3FVOA 2QL3A 2Y7WA 3TDJA 3KN7A 3RT8A 1QVSA 1ZU0A 2CMOA 3CSGA 2M8CA 3EHSA 4DCYA 4HTGA 4MH5A 1BLFA 3FGSA 2ZMBA 3TAJA 4EUOA 4PFWA 3U94A 2ZNUA 4F3PA 2XXWA 4XXUA 1Y9UA 1N76A 2F36A 4NF8B 1IUDA 4U23A 2W7YA 5CBRA 3LSLA 2ABHA 4OFOA 1PBQA 4F31B 3TODA 3E3KA 3HHFA 4ECFA 3AXFA 4LATA 2P1SA 4KQPA 1LLSA 3PPRA 5ICQA 4NF6B 3FVNA 5JTYB 3OEMA 1XC1A 4KYSA 1US4A 2V3UA 3K1MA 1N3XA 1RYOA 4X48A 1TFAA 4QF9A 4IGTA 4TLLB 5I57B 4E0WA 3MP8A 1SD3A 2I4BA 1D3KA 4XKPA 3ILTB 1B7HA 3IX1A 4KI0E 4GQOA 1B51A 2Q88A 5LOMA 3FZVA 3H4ZA 1MXWA 2HFBA 3PD8A 1B05A 1LB8A 4FEDA 3K1NA 4BDRA 2Y7PA 4I1DA 2NXOA 3P7IA 5H8QA 4TQUQ 4DCXA 4KCDA 3O6HA 4I8CA 2Y7KA 4G8HA 3N26A 3TCHA 2X26A 1R6ZA 3TTLA 3TCGA 4GL8A 2I0BA 3S9NC 2KLFA 5H8SA 1QJMA 4IO5A 3MBPA 1QKAA 4DDDA 1JEVA 1A7LA 4DXBA 2GHAA 3TTNA 1FQCA 4FIMA 1P1UA 2QRYA 1EZPA 4YU0A 4LZ5A 3IOVA 2F7BA 4DE8A 3OO7A 1NNFA 3V83A 1QULA 3IO6A 4NF8A 3R7XA 4F1VA 3DP6A 1LBBA 2FNCA 3RUMA 1MY4A 1XS5A 4Q5TA 3CIJA 1ATGA 4H8IA 3OEKA 2VD2A 3IO4A 4NF6A 3H6TA 5JTYA 4AQ4A 3S9LC 1BP5A 2DE3A 1MM6A 2HAUA 1OLAA 4RYAA 3Q26A 4OHNA 5CBSA 3EN3A 3MUQA 1UTHB 4IY5A 5I57A 3OELA 2QS2A 3QAXA 3C32A 1ZIUA 3RNNA 2DSFA 2I3VA 4ZE9A 3O29A 4ZEFA 3ZSFA 2DE2A 4YMBA 1DMBA 3OO8A 1MQDA 4OMBA 3GZGA 3MAMA 3OENA 3QUFA 3MP6A 4BDOA 3DM0A 4OENA 1MY1A 2LAOA 4XTCQ 2NVUB 3LBSA 5AA2D 4R2BA 2THIA 3OMBA 5I2NB 4QFLA 4NEDA 1R9QA 1FTJA 3KG2A 4U22A 3K00A 5FHOA 2UYEA 4H67A 4EQ9A 1IXGA 1AMFA 2B3FA 1NL5A 3RLFE 2NWJA 2RKMA 3E13X 3FIRA 1USYE 3K01A 1OIBA 1O64A 1S50A 4IO6A 1D4NA 1LB9A 4OFLA 1CE2A 1MH3A 1YPNA 5HM4B 3SEYA 4Q30B 3CFLA 4RNSA 1M5DA 3DP8A 3R6UA 1DOTA 3MJNA 5B7DA 4F3SA 1SYIA 1Y20A 1IZ1A 4G4PA 1NNKA 2E0SA 1UTBB 3LR1A 1I6QA 5JEIA 5DTBA 4AB6A 3H6VA 3RN8A 4GRKA 4ZEKA 4PQJA 4QSCA 1POTA 3S2VA 3PPNA 2E1SA 1B3LA 3DELB 4H8JA 3PUYE 3FXRA 1UTHA 3ONMA 4OTEA 4HCWA 4YKJA 4R2FA 3ODBA 1N7WA 1H3DA 4XKRA 4F2OA 2OBGA 4IB2A 4GF8A 1VFDA 2F97A 3MVXA 2RCBA 2B3BA 2UVJA 4PFYA 2D3IA 4F39A 1SI0A 3RPWA 4MFIA 3SEWA 5CMBA 5I2NA 4JSOA 4WKMA 2QS4A 4JWOA 3C33A 2Z8EA 1B3GA 5DYHA 1SW1A 1MXXA 2AYSA 2XXYA 3Q29A 2O68A 4R74A 1Y4TA 3IB0A 2BJJX 2H25A 5KCJB 5K2XA 2QSXA 3FXUA 2GHBA 1BKAA 3UA8A 1ZJLA 3TTRA 3C9HA 4EQBA 1POY1 2Z22A 4F1UA 3WAEA 4JB7A 4Z7EA 3MWBA 1B0LA 1UTBA 1PB8A 3MZ1A 4YMAA 1S7YA 5AA4B 1LAFE 2HCAA 1SW4A 1NH8A 5AA1A 4QSEA 4GVOA 4R72A 1OQGA 5CMMA 4GLIA 5DVJA 4F29A 2REJA 4PETA 1MXYA 4R75A 3ZKKA 1H44A 1MXVA 3M3KA 4RK9A 1MY0A 1H45A 2HAVA 1URSA 1ELJA 3KSJA 5FHMA 3VXBA 4THIA 1R1NA 3M3LA 5H8HB 1NH7A 4R9FA 4GXAA 4LUBA 3VVEA 3O6GA 1B9JA 4L17A 3BFUA 4O3AA 3IOTA 4XKQA 1I6AA 4C1TA 3BKIB 1DPEA 1ZBMA 3SEVA 4EF2A 2D5WA 2H99A 4RPOA 5I59B 1OVTA 1B6HA 1UIUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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