2UYFA

Single mutant f111l dntr from burkholderia sp. strain dnt in complex with thiocyanate
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
SFDPFASTRTFNLAMTDIGEMYLMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPNAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEAHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title In Vivo and in Vitro Investigation of Transcriptional Regulation by Dntr.
pubmed doi rcsb
molecule keywords REGULATORY PROTEIN
molecule tags Transcription
source organism Burkholderia cepacia
total genus 67
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uyfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uyfA02
3A3UA 3PPPA 3JYRA 4IGTA 2IA4A 1Y4CA 4R9GA 4YB6A 1B0HA 3IOTA 1GTKA 3FVNA 1B0LA 3CVGA 1MQIA 2XXHA 2QMWA 3T9XB 5H8NA 2Q2AA 1UTBB 3OEMA 2RKMA 3U93A 4X1BA 1MDP1 3RGYA 1P99A 2Y84A 1MPBA 3SETA 4KD5A 1FTMA 4NF4B 2F6GA 4ELOA 3E4RA 4OFLA 2DVCA 3K1PA 4R72A 3TEPA 3CFXA 1IXGA 1SI1A 4O3CA 2O1MA 4LZ5A 4YKKA 3IO4A 5DEXA 1MH4A 2G93A 1LBBA 1IXCA 2PMSA 1AOVA 4TLMB 3VLVA 2H9BA 1BLFA 3PUVE 3Q27A 1LBCA 3PPOA 4M4GA 4R6KA 4HS7A 4NF6B 3C4MA 2GHAA 3MBPA 1XT8A 2D3IA 3G3FA 3TCHA 1PB9A 1Q35A 1Y4TA 3LSWA 1H45A 2H25A 1Y9UA 1MPDA 3MP1A 5JTYA 1B05A 4BDQA 3U94A 1L5TA 3O6GA 4YMAA 1GV8A 4AB6A 5B7DA 2W7YA 3JV9A 4IGRA 2ZNUA 4OEUA 2VD2A 1T0KA 3I6VA 3T93B 1N84A 4GWOA 4NE4A 2O7IA 4FECA 2UYFA 4KFQA 1UQWA 2F35A 3TTKA 3N6UA 3MPKA 4IY5A 2D5WA 1URGA 1NH7A 4LP2B 4ESWA 1VE4A 2F8DA 4NMYA 3DELB 2RC7A 4FEDA 3VVEA 3VVFA 2HXWA 4F39A 4F18A 3KOTA 3IK6B 4TOZA 4U21A 2OJTA 1B7HA 1SW2A 2Y7WA 5AA4B 4G8NA 2DQVA 2PBWA 5FTHA 5DVFA 3MC2A 1JEUA 3DP4A 3QUJA 2HZLA 4MLQA 4MLVA 4R73A 5AA3A 4H8IA 2XXUA 4OFOA 5ITPA 4BDLA 1KWHA 1OIBA 4ZEIA 4GVOA 4OVJA 1CB6A 4DXCA 4RK2A 1MS7A 2Y7RA 3UA8A 1DTZA 4MF3A 1ZKBA 1YAEA 3C36A 4NTLA 1EU8A 2XXRA 1BTJA 2CMOA 3USDA 1GR2A 3CSGA 1Y1MA 3BFUA 5K2YA 1QW0A 2CZLA 3MZ1A 1ZMGA 4YICA 1VFDA 3LBSA 3PUYE 3U8QA 5AE4A 5DVJA 1XS5A 1MXYA 3FVOA 5DEXB 3RPWA 4EQBA 2X7PA 4EF2A 2I3WA 1B4ZA 3B7DA 3H7MA 1B1HA 1O64A 3ZKKA 2Y7KA 1MQDA 3H6WA 3V83A 3QUFA 3W9VA 3RT8A 3MP8A 1LB8A 2ZXTA 1MM7A 3O6IA 1UIUA 2REJA 3Q29A 4I8CA 2NUVA 1SYHA 3C35A 3IL1B 4JDFA 2I4BA 1D3KA 2DWJA 4DDDA 1WDNA 3RNNA 4KYEA 3AXFA 2AYSA 2D21A 5AA2A 4P0GA 3KGCA 3K2DA 5CBSA 2AIXA 4ZZEA 4BDRA 5H8QB 3TQWA 2OWSA 3TCGA 1FQCA 2UYEA 1EH3A 3UN6A 4DXBA 2UVHA 4JWYA 1XHYA 3R6UA 3K01A 4MH5A 3LR1A 1MXZA 4OFJA 1N04A 3LSLA 2F6PA 1IITA 1ZIUA 1NH8A 3JZJA 3PMWA 5H8HA 3OMBA 3S4UA 3HN0A 4OETA 1M5BA 2ZYNA 1TT1A 3WAEA 4C0RA 2DS9A 3G3HA 4H1XA 1MXXA 2ESNA 1D9YA 2QS1A 3OSQA 5I58A 3ZKLA 1IXIA 4FIMA 4OZ9A 1P1UA 3O2AA 2PVUA 3TPAA 2ZYMA 1YTVA 1B1XA 1Y20A 2I6EA 3FXQA 1US5A 3S9LC 3SEUA 1S9TA 1LAFE 3O9PA 4KYDA 5ITOA 3C32A 5FTIA 1FW0A 1JW1A 3W9WA 2G29A 4KQPA 2NWJA 3H6VA 1UTHA 2H5YA 4PFUA 3PUWE 2R71A 2ZYOA 3MP6A 3GBBA 4Z7EA 4G68B 4PE5B 4PFWA 2I58A 2RCBA 3MJNA 1N76A 2DWIA 4F1YA 3QIMA 3SESA 1IQ7A 4XKNA 5AA1A 2O68A 3PUZE 1NKXA 3SDFA 1DSNA 4U4SA 3K4UA 4GIZA 2O1LA 1MY4A 3VLWA 3KN7A 1FQEA 2RF1A 1YCJA 1SI0A 1P1QA 3FUZA 3RLFE 5BWJA 4N13A 2V25A 3TQLA 1MPCA 3SERA 3OOAA 2F7AA 2Z8DA 4FJPA 4DCYA 4LONB 3HO7A 2XX8A 4WKMA 4OENA 3SEVA 3PV0E 2Z23A 5ICQA 1PBQA 1D4NA 2GRVA 2V93A 4R2FA 1MDQA 4R2BA 3OSRA 5AA2B 3HV1A 3C33A 2ZMBA 4YB7A 2QS3A 1AMFA 2OBGA 2B65A 3RTFB 1B5JA 1Y1ZA 1UIVA 5EHMA 4ZEKA 1MQHA 1B9JA 2I4CA 4YKJA 1QUKA 2XXTA 4ZDMA 4UACA 4JSDA 3HHGA 4H8JA 4JSOA 2RINA 3PGFA 1LAGE 3QK6A 4KCDA 1R1NA 4I9DA 2B3FA 2XXIA 4K3FA 3D4GA 5DYHA 4HW8A 1F9BA 5H8HB 4OEVA 1H76A 4GLIA 4OWDA 2V3TA 3TMGA 3CFLA 3RT6B 3ODBA 3S9MC 1DMBA 3FD3A 1B6HA 1R9QA 4HCYA 1FCKA 4LZ7A 4KR5A 1WVJA 3SEXA 4IO2A 1XVYA 1SBPA 1FQAA 2HCAA 4DLDA 4C1TA 3C31A 4G8HA 1Q1KA 4ND9A 5I58B 1XVXA 4PETA 1JVYA 4NF8A 1FTOA 3ILUB 4OHNA 3V8XB 4LUBA 4H5FA 4THIA 4RJZA 1QKBA 5CMMA 3P7IA 2Q8JA 5I57A 2XXXA 1B5HA 2V84A 4QSCA 4PQJA 2V3UA 3CRBA 1ZLQA 2LAOA 5I59A 1OLCA 3CG3A 5H8FB 3TZAA 1I69A 1JW4A 3T9HB 4Q5TA 4F31B 1Z7NE 2ONSA 4YU0A 1I6QA 2HZKA 1LFGA 4EF1A 1OVBA 1M5EA 4F3PA 1B3HA 1BIYA 4AB5A 3KJTA 2V3QA 4U4XA 4IO4A 2DXYA 1MY0A 4P11A 4YB5A 2Z22A 3KSJA 3TTLA 3VXBA 1URDA 4RA1A 2XD2A 4KYSA 3G3KA 3OENA 4BDMA 4N07A 4JBZA 3OO6A 4G77A 4DIGA 1SW1A 2XD3A 4QSDA 4KI0E 4YMBA 1B4HA 3QSLA 1H44A 5BUUA 2I49A 4NF5A 4F3BA 3GXAA 3PPQA 1VFEA 4IO6A 2F36A 3I3VA 1DTGA 4H67A 5KDTA 4OQOA 1MY3A 3MZ9A 3PMVA 4XKPA 4NWCA 2BJJX 1AL3A 5CI5A 1FTKA 1IZ1A 4ZECA 1SW4A 2O84X 5HBCA 1FQFA 3Q25A 1NL5A 3MVWA 2OWTA 1OVTA 1ZTYA 2HQ0A 4F19A 3MUQA 1RYOA 4PP0A 4EXLA 2UVJA 3TTMA 3C9HA 5H8NB 4R9FA 2M8CA 1FTLA 2KLFA 1LFHA 4ZZAA 1I6BA 4H0WA 3IX1A 5I2KA 3D4CA 3QAXA 5HM4B 1BKAA 2QMXA 3TDJA 3B6WA 1P1NA 4GQOA 2OCUA 1WODA 5F7VA 1DPEA 3W15C 4QRZA 3OO7A 4XIGQ 3TUSA 3FASA 4EQ7A 1LCTA 3O28A 3V5AA 5L9OA 3EPEA 4EDPA 4X1DA 1MQGA 2IEEA 3CG1A 4NF8B 1EZOA 3G7WA 4Z0IA 1JEVA 1A54A 4NEDA 3VLUA 3PPRA 3KN3A 5DT6A 2ZNSA 4H6DA 2ONRA 4ELPA 5ISUA 3OD7A 4O3AA 1A8FA 3FIRA 1US4A 2AL5A 3L6HA 4FAJA 2VOZA 3T9VA 3MVZA 3GBAA 1N7WA 3EHTA 5CRYA 3KG2A 1B52A 3TELA 1RKMA 4IO7A 5JTYB 3TAJA 1B3FA 3MWBA 4RYAA 4IO5A 4QFOA 4EXKA 4X9TA 3CIJA 4RPNA 1NNTA 2O7UA 1MXWA 5I84A 5FHMA 2B3BA 3LUYA 4R75A 2A5TA 2DP8A 3VVDA 5TPAA 4TLLB 3FV2A 1PB7A 4QF9A 2VP1A 1EZ9A 3KEIA 5L8DA 4POWA 1IUDA 2P1SA 4ZS9A 3M3KA 3ILTB 4JXIA 1ZJLA 3U92A 2XXQA 3PD8A 4XKQA 3TTNA 3EHSA 4ZEDA 4DCXA 1CE2A 3EHUA 4RPOA 2Q88A 1RYXA 2NXOA 3E3KA 3WAFA 1LSTA 4NF5B 5DVIA 3M3LA 1UTBA 4DXUA 2H4IA 2YJPA 3RTWB 2DWHA 1N3XA 3THIA 3LC8A 1N0TA 3A09A 2PX1A 4R6HA 4NF4A 2YLNA 2FYIA 5EYFA 3FXRA 2DE4A 4YAHX 4KPTA 3FJGA 2OZZA 2RC8A 3FVGA 3RUMA 4KHZE 4ONYA 3IOWA 4OERA 4LATA 5DTBA 2REGA 2XHDA 3GLBA 4JB7A 3QXMA 3OXNA 4AQ4A 3S9NC 4QFPA 4FORA 3UIFA 4ECFA 1IEJA 2VD3A 3FZVA 3SKPA 1USYE 4ISUA 1DPPA 1M5DA 3CFZA 2Y7PA 3IOUA 1TFAA 4IB2A 4LZ8A 4ZEBA 3H06B 4RK9A 4F2OA 3KSXA 4X48A 3E9XA 3IO6A 2ZYKA 1QUJA 3TCFA 5CM6A 4ESXA 3UORA 4F3GA 4GXSB 1EZPA 2RC9A 4FE8A 3TTRA 5I56A 4Q0CA 4H65A 3B6QA 4U1ZA 3EN3A 1QUIA 3K6XA 2H98A 1LGBC 1IXHA 1JETA 2DOJA 3HSTA 1NNKA 1TWYA 5H8SA 1A7LA 3TYHA 2OLBA 4IY6A 4ZE8A 3RQTA 1B58A 4OYVA 2A5SA 3H6TA 2F7CA 2HEUA 3A3CA 2UXAA 5IAIA 2F78A 3H03A 3MPLA 4PFYA 3IR1A 1QULA 1PDAA 4YKIA 3FATA 3RN8A 5AA4A 3U72A 1TXFA 3B6TA 3S9EA 4BLAA 1B7ZA 2QJEA 5TPAB 1SD3A 3M3FA 5FHNA 3QYTA 1MM6A 1R6ZA 3TKDA 2UVGA 3PMXA 5K2XA 1MQJA 3PPNA 1OQGA 3DM0A 1SQYA 1MXVA 4LA9A 3N6TA 5B70A 2XXVA 3ZS6A 2QS4A 4LQ5A 4HTGA 4UA8A 4QFNA 3VDFA 1M5FA 5KZTA 1USYH 2ALUA 3VFJA 4GOTA 1A8EA 2P0SA 4QHQA 4ELRA 4ELQA 3IB0A 1S7YA 1A55A 2I48A 3R7XA 4OMBA 3MZBA 4C1UA 1N3WA 1H43A 4KCCA 3LSXA 3H4ZA 4EQ9A 1QVSA 3K6VA 3O66A 3K1NA 1POY1 4G8MA 3H6UA 2AL4A 4R6YA 5ELVA 2O6AA 3IAZA 1B5IA 1FTJA 3HHFA 3UP9A 3FJ7A 4HCWA 1AIVA 4RY1A 3KFMA 3IB1A 1I6AA 3OO9A 1O63A 1UTHB 1PC3A 1JQFA 1BP5A 1II5A 3EF7A 4I1DA 3T9UA 2QSXA 3IOVA 1B3GA 4U2RA 3UGWA 2QL3A 1B32A 4XXUA 2RCAA 3M8UA 1JNFA 5L9SA 1ELJA 3F11A 2R9JA 2XX7A 3H3GA 2DYXA 2Z8EA 1NNFA 4Q30B 2QS2A 1LAHE 2GH9A 3FJMA 4G4PA 5CC2A 2ANJA 3LSFB 5I56B 4R74A 5H8QA 4F22A 2VGQA 1QKAA 4XKRA 1R9LA 3V89B 1XOCA 2DE3A 1S50A 5TP9A 2R6GE 4GRKA 4U1OA 4GD5A 1MY1A 1B7UA 3HPIA 4E0XA 2I0CA 4JWXA 1P1OA 5TU0A 1Y3PA 3MW0A 1D9VA 2H99A 3G3IA 3N94A 3CI8A 2PT2A 4FATA 1MRPA 1B46A 1OQHA 4QFKA 2YPNA 4OXVA 4F29A 4G2ZA 2XX9A 1MY2A 3E13X 3IJXB 4P0IA 4WXJA 3PD9A 3KBRA 2DE2A 5CBRA 3K6UA 3ECRA 1B2HA 2X7QA 5I2NA 4BDOA 1NNPA 3BFTA 1LFIA 4XTCQ 3G3GA 1DOTA 3DP8A 1GVCA 1LCFA 2NOOA 3K00A 1PBPA 3PU5A 4F2QA 1SW5A 4IO3A 1HSEA 1JW5A 2P2AA 4YZZA 1MH3A 3IORA 4OESA 2QRYA 1VR5A 2Q2CA 2PT1A 2ABHA 4G68A 4E0WA 3OEKA 3HCQA 3MAMA 5KCJA 1M5CA 3CSBA 1ZBMA 1PB8A 1P1WA 2I3VA 3OO8A 5I57B 1A99A 5M2VA 2F5XA 4MFIA 5EHSA 3K1MA 4G68C 1AH5A 1LAXA 2FNCA 3KZGA 5I59B 4RNSA 3G3JA 5JEIA 3OELA 1H3DA 5CMBA 2HAUA 1MG1A 2Q9TA 4NWDA 1YPNA 3MQ9A 5A5XA 4F3SA 5J1DA 3GZGA 2DXRA 3ZSFA 3CR9A 1A40A 2ONKE 3TODA 4U23A 1B40A 1QJMA 3N5LA 3VXCA 3VE1B 2FA7A 1FQDA 4JWOA 3KOSA 3O6HA 4I62A 4LVQA 2O51A 3FV1A 3R26A 5LOMA 1B51A 1POTA 3DLNA 1LB9A 1VSOA 3IJOB 4L17A 1NFTA 2QPQA 3FXUA 3K0VA 5TP9B 1IIWA 4PFTA 1B3LA 3TFLA 1TFDA 1SYIA 1Y3QA 5CMKA 4OTEA 1JVXA 3KN8A 1Y3NA 3SEWA 2Y7IA 1J1NA 2HFBA 4GL8A 5KDTB 3SEYA 5FHOA 2XXYA 1MXUA 3C34A 1N7XA 4F1UA 4EUOA 1FQBA 1URSA 4M1VA 4GF8A 2THIA 3I5OA 2VHAA 3KJ7A 5I2NB 2DSFA 3IB2A 4QFLA 1HSLA 3K6WA 4U22A 5I2KB 4WEPA 2X26A 3UK4A 5H8FA 2F34A 2I0BA 1O7TA 4DZ1A 4NF6A 1SVXB 1NMUA 1OMPA 1B3EA 1ANFA 5L9MA 2XXPA 4GXAA 2GHBA 1Z7ME 3BKIB 2OK2A 4MBPA 4QSEA 3VV5A 2F7BA 1OLAA 1PEBA 3PUXE 2PYYA 2NVUB 4RXLA 1LLSA 3T22A 3MVYA 4O3BA 3N26A 5KCJB 3RY3A 3DP6A 4BDNA 3L6GA 2GFEA 3Q28A 1XC1A 3FGSA 2Q89A 3T66A 2E1SA 3K02A 4H5GA 1HSJA 3MVXA 4FEBA 4POXA 3EQ1A 3U1OA 4N6PA 4ZEFA 5HPQA 4TQUQ 4F1VA 2DWAA 5CMCA 4DE8A 5IKBA 3FVKA 3ONMA 4ZE9A 2O69A 4WEDA 2ZNTA 1GGGA 5JK4A 2XXWA 3S2VA 2WKYA 4GFRA 3Q26A 2UVIA 3BBRA 2Z8FA 5A5XB 3O97A 2E0SA 1ZU0A 5AA2D 1ATGA 2HAVA 4Q8RA 2DVZA 4LQ2A 4YKPA 5F1QA 3O29A 5ICTA 2F97A 1SDXA 2A5TB 4GL0A 3T96B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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