2UYFA

Single mutant f111l dntr from burkholderia sp. strain dnt in complex with thiocyanate
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
SFDPFASTRTFNLAMTDIGEMYLMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPNAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEAHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title In Vivo and in Vitro Investigation of Transcriptional Regulation by Dntr.
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia cepacia
molecule tags Transcription
molecule keywords REGULATORY PROTEIN
total genus 67
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uyfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uyfA02
2B65A 2Q2AA 5J1DA 2DYXA 1OVTA 1POTA 2F6GA 4R73A 3IOVA 1FTJA 4NMYA 1PB8A 3M3LA 1Y1ZA 3UORA 1B5HA 2PBWA 2RC9A 3TQLA 2NVUB 2Z8DA 1Y3NA 1B51A 5I58A 3T9XB 4IO5A 2DE4A 1ZJLA 4QSCA 3C31A 3O66A 4OENA 2B3BA 2LAOA 1IXCA 2ONKE 3FVGA 3HCQA 4XKRA 1MXZA 2Q88A 3S4UA 2HAVA 3UA8A 1QW0A 4Q30B 3ZSFA 4QSDA 2GH9A 3T93B 1FTKA 4H5GA 3D4GA 4YZZA 4DXBA 5CBRA 2DWJA 2O69A 4X1BA 4G8HA 1B3EA 1FQDA 1MH4A 1PC3A 1URDA 1XC1A 3HSTA 2F5XA 2OWTA 3UIFA 2PT2A 3IX1A 1NNKA 3OXNA 1FQFA 2NOOA 2ZMBA 4PP0A 1MY3A 1B32A 1LAFE 1O64A 2I4CA 4IO4A 1B1HA 4THIA 1JW4A 5AA3A 2ZYKA 3CFLA 4KYDA 3ZKLA 4MBPA 4F3PA 1VR5A 1FCKA 2V3TA 2ZYMA 3MVXA 4YMBA 1HSEA 1SQYA 2A5SA 4Q0CA 1B9JA 3TFLA 5I57A 1YAEA 1B0LA 4OERA 3TPAA 4IO3A 2D5WA 4BDOA 2ZYOA 2E0SA 3Q26A 1FQEA 4EDPA 2QMXA 1NH7A 3MP6A 4ELRA 1MQIA 1WDNA 1PB9A 2GRVA 1RYOA 3E3KA 2ZNTA 1GVCA 2QS2A 1PDAA 3S9MC 1LAHE 1LBBA 1B6HA 3OO8A 4M1VA 4HCYA 4ISUA 4AB6A 5CBSA 3C32A 2FA7A 3C4MA 5IKBA 2G29A 3UGWA 2PX1A 3P7IA 2D3IA 4WEDA 4PFUA 3VVFA 4DXCA 3V83A 1AMFA 1JW5A 2VGQA 3THIA 3TTMA 4ESXA 2Q2CA 4G68A 1QUIA 1YCJA 4R6KA 4MFIA 4EQBA 1B1XA 2REJA 4KI0E 4DIGA 3T22A 3PPOA 1DOTA 1FTLA 4YKPA 4BDLA 5FTIA 1F9BA 4U21A 2UXAA 3RT6B 2I48A 2P2AA 3BFUA 3FIRA 3O97A 3EPEA 3SDFA 1US4A 3IOUA 1LBCA 1Y20A 4MLQA 4P0GA 1B5IA 3CFXA 4YB5A 1B0HA 1Y3PA 4F3GA 2QS1A 3TTKA 1R6ZA 2O1LA 4E0WA 4NWDA 3O6HA 3IR1A 2Q9TA 2REGA 3LSWA 4ZEKA 1LAGE 3SESA 3OELA 4EQ9A 2PMSA 3N6TA 3CG3A 4ZE8A 1FTOA 4JSDA 4OYVA 1ELJA 3MQ9A 1IEJA 2I6EA 3M3KA 4P11A 2Q8JA 3HV1A 1M5FA 2Y7WA 5DT6A 2Y7RA 2D21A 4MLVA 1OIBA 5H8SA 2XX8A 5I57B 3G3IA 3PUZE 3CFZA 3PGFA 3ECRA 4GWOA 1N04A 4GQOA 3TTRA 5F1QA 2ONRA 3M8UA 1Q35A 4O3CA 1B3LA 1IIWA 4TOZA 3PU5A 4K3FA 1S50A 3HO7A 5CMCA 1AOVA 2XXXA 3QUFA 3K00A 4F29A 4GOTA 4KFQA 3IORA 3MPKA 4U22A 1RKMA 3OD7A 3VFJA 3MVZA 4RK2A 3TCFA 2CMOA 3VXBA 2H25A 2O68A 1XT8A 1UQWA 3OENA 4WEPA 1ANFA 2KLFA 3VVDA 1GGGA 2XX9A 3RUMA 4G68B 2ESNA 2DWIA 4JWOA 3VE1B 3IB2A 3KBRA 2E1SA 2ANJA 1Y4TA 5AE4A 4DE8A 4H6DA 2H9BA 1EH3A 3SEXA 4R9GA 2I4BA 2XXPA 4JBZA 3N6UA 4QFOA 1TFAA 3PD8A 4G77A 3RTWB 1VSOA 3PUWE 4XKQA 3DP8A 1URGA 4H1XA 4FORA 3LUYA 5L9SA 1GTKA 3A3CA 3F11A 4OHNA 5HBCA 3TQWA 3S9LC 2VD3A 2XXQA 4RPOA 4JXIA 2ZYNA 4LP2B 4F2QA 4PQJA 4KCDA 1MPDA 1AL3A 3TZAA 1SYIA 3M3FA 1NL5A 3MVWA 1LAXA 5H8NA 3PUYE 5H8NB 1WODA 4HW8A 4QFKA 2CZLA 3G3GA 3MZBA 3VLVA 1LLSA 1NH8A 3KSXA 3ONMA 2DSFA 3OSRA 2YJPA 1JNFA 4C0RA 2H99A 2Y84A 1OQHA 4G68C 3V8XB 3TTLA 1LFHA 4RJZA 4BDMA 3MZ9A 4WKMA 3CIJA 3T9VA 2VP1A 1FTMA 4PFYA 3LBSA 1QVSA 1JEUA 1NKXA 3EF7A 5EYFA 1MY0A 2O51A 1MXXA 1D4NA 1MY1A 2P1SA 2R6GE 3K4UA 4WXJA 1MM6A 2AYSA 3FJMA 4R9FA 4DCXA 1B4ZA 5KCJA 2Y7KA 3RT8A 5I59B 5AA2D 3PMXA 2OZZA 2XXTA 1XOCA 3O6IA 2HZLA 5AA4A 3B7DA 1B05A 4OTEA 2I49A 4JWXA 1USYE 1DPEA 3ZKKA 1JEVA 2HAUA 4EXKA 1ZU0A 4YB7A 1CB6A 2OWSA 1UIVA 1ZMGA 3PD9A 1B7ZA 3U72A 2UVIA 4KCCA 5H8HB 5DVJA 5JEIA 2GHAA 4H8IA 1UTBB 5DVIA 3BKIB 1A8EA 2ZNSA 5DVFA 1UTHB 1GR2A 3TAJA 2V3QA 2NXOA 4F22A 3FUZA 4F3SA 5DEXA 5I2KB 5DEXB 5ELVA 3DP6A 2O6AA 3GZGA 5CRYA 5FTHA 4R6YA 3FASA 2XXRA 3A3UA 3MP1A 5TU0A 3KEIA 3T9HB 3V5AA 5CI5A 4BDQA 2ABHA 1EZ9A 2O7IA 3O29A 3SEVA 1LFIA 4F3BA 4N13A 5H8FB 3U8QA 2XXVA 3D4CA 4R72A 3K1PA 5ITOA 2R71A 4GRKA 4YU0A 5H8FA 2UYEA 4GLIA 5ISUA 5B7DA 1MG1A 3HPIA 4NWCA 2DS9A 3FVKA 3E4RA 1LSTA 2RCAA 1M5CA 2DWHA 4NEDA 3C35A 5I56B 3W15C 4DZ1A 1MY2A 3PMWA 4FIMA 4FJPA 4GVOA 1ZKBA 4FECA 5FHMA 1MRPA 2H5YA 3H6VA 3KZGA 1Y4CA 3PV0E 4KR5A 4NF5B 3SEYA 1PBQA 1OLAA 2DE2A 1DPPA 3FD3A 3HHFA 4EF1A 2DP8A 3V89B 1XVXA 4LZ8A 3MW0A 1LB8A 2ALUA 2YLNA 5AA4B 4OZ9A 3EHUA 3IK6B 5HPQA 4U23A 1MQJA 3IO4A 4LQ5A 4IY6A 1H44A 1M5EA 4R2FA 4I9DA 4Q8RA 1JVXA 2O1MA 3DP4A 3S9EA 1JETA 2X7PA 3KG2A 4F31B 5A5XA 4NF8B 1QULA 3PUVE 1A7LA 3C9HA 3H06B 4N07A 3IL1B 4OXVA 1UIUA 2I0BA 4F19A 3WAEA 4F1UA 5JK4A 3G3KA 1TFDA 1MQHA 1USYH 3U92A 4XKNA 3KGCA 4U1OA 1B7HA 3VVEA 3JV9A 1SYHA 4OFJA 1P99A 4R6HA 4KQPA 2XXWA 1JVYA 3L6GA 3MJNA 3QUJA 4GFRA 4OFOA 4TLMB 3FXRA 2NWJA 2V25A 5I59A 5KDTA 5ICTA 5ITPA 2HXWA 5CMMA 1D3KA 3LSXA 1YPNA 3B6QA 1FW0A 3K01A 2G93A 2F35A 4M4GA 3USDA 3K02A 1A55A 1A54A 1MDP1 2RC7A 4NF4B 5DTBA 5KDTB 4F2OA 2AIXA 3RNNA 1P1OA 3CSBA 3FJ7A 4U4SA 4X1DA 2BJJX 5H8HA 3FV1A 3VDFA 4H8JA 2VD2A 1OMPA 1MS7A 3PUXE 4NF5A 1T0KA 1EZOA 4C1UA 2QS4A 4OVJA 4QRZA 5I2KA 3RN8A 2DVCA 1TXFA 3Q29A 3IOTA 4ZS9A 4H67A 1MQGA 4QHQA 1MPCA 3RY3A 1I69A 3C36A 3H6WA 3QIMA 1XHYA 4ZDMA 2O7UA 2UYFA 3BFTA 3EHTA 1TWYA 3IJXB 5CM6A 5B70A 1P1UA 4HS7A 1FQBA 1QKAA 2IA4A 3KN8A 3OEKA 1SW5A 2Y7IA 4ELOA 4PFWA 4DLDA 3TCHA 4GL8A 5H8QB 4L17A 4RA1A 5H8QA 3H6TA 5I56A 3E13X 3GBAA 1BP5A 1TT1A 4QFPA 4YMAA 4H5FA 3QK6A 3UP9A 3CVGA 4NF4A 4RY1A 2XHDA 2XXYA 1LCFA 3RGYA 1AIVA 1D9VA 1N76A 5TP9A 2DVZA 2UVJA 4IO2A 3W9WA 4ZEDA 1BIYA 4H65A 4ONYA 4ZEFA 2IEEA 4GXSB 4ZZAA 5K2XA 2FYIA 3S2VA 1SI1A 4EQ7A 1QJMA 4MH5A 1L5TA 2QS3A 1N3WA 1M5BA 3K6VA 3IOWA 3IJOB 3JYRA 4XXUA 2NUVA 2DOJA 3MUQA 1UTBA 3TODA 2OLBA 4N6PA 1IQ7A 2Q89A 1XVYA 3ILTB 4OQOA 1JW1A 4EF2A 1VFDA 1UTHA 3PPQA 5A5XB 1EZPA 2A5TA 1URSA 1SW2A 4I1DA 4YAHX 3RPWA 4FATA 3OMBA 1RYXA 2XX7A 2QPQA 3B6TA 3GLBA 4UACA 4OEUA 3SETA 3IAZA 4RK9A 3CR9A 3C33A 4R75A 3KN7A 1NNPA 1DSNA 2QL3A 4POWA 3MAMA 1MXYA 1A40A 2I58A 4BDRA 4EUOA 3TUSA 3IB0A 4JSOA 3PMVA 2QRYA 4POXA 4F1VA 3MZ1A 4KD5A 1MXVA 5CMKA 1H43A 2PYYA 1D9YA 4Q5TA 1SW1A 3FJGA 3I6VA 4X48A 4ZECA 2O84X 2HZKA 3HN0A 3RTFB 1B58A 3I3VA 4IB2A 3CG1A 3TCGA 2RKMA 3FVOA 4ZZEA 1R1NA 4FE8A 4IY5A 2X26A 1B3FA 1B40A 2DQVA 1JQFA 1H76A 1MXWA 2I3WA 2OCUA 3EHSA 3G3FA 1IXGA 3L6HA 3MP8A 4KYEA 4OETA 4I8CA 5AA2A 5ICQA 1Y1MA 2FNCA 3MC2A 2Z23A 3T96B 5LOMA 3QYTA 2I3VA 1KWHA 1M5DA 1QUKA 3TEPA 1IXHA 5TPAB 1QUJA 1Z7NE 1OQGA 3H4ZA 4QF9A 3LC8A 1QKBA 3LR1A 4DCYA 4NF6A 3FZVA 4NF6B 3VLUA 4Z7EA 3ODBA 3AXFA 4R74A 4ELPA 1B3GA 3FXQA 2V93A 3N5LA 3KJ7A 3OO9A 4LZ5A 3OO6A 4ND9A 4NF8A 1ZTYA 2A5TB 2H98A 4G2ZA 4XKPA 5CMBA 3LSLA 3SERA 2Z8EA 5L9MA 3Q27A 3U93A 4BLAA 3Q25A 4TLLB 4ZE9A 2H4IA 3RQTA 1Y9UA 5K2YA 3TTNA 4QSEA 5I84A 1B4HA 2AL5A 3CRBA 3PPNA 2OK2A 2X7QA 1R9LA 3R26A 1MQDA 4JB7A 1O7TA 3PPPA 1SW4A 3QAXA 1S9TA 2F7AA 2PVUA 4KPTA 2OJTA 4GIZA 5TP9B 2DXYA 1P1WA 4O3AA 5FHOA 1N7WA 3MVYA 1O63A 2RCBA 3FV2A 3H3GA 3WAFA 3R6UA 4OFLA 1IUDA 1Q1KA 1MXUA 4IO7A 1SBPA 4YKJA 5CC2A 1HSJA 4PETA 4QFLA 3VLWA 5F7VA 1SI0A 1H3DA 3TKDA 1DMBA 1Z7ME 3PPRA 1US5A 4YB6A 1MY4A 2GHBA 1MDQA 3B6WA 4I62A 1N0TA 3H6UA 3K1MA 4LQ2A 4DXUA 1I6AA 3HHGA 5FHNA 3C34A 4XIGQ 2HEUA 5TPAA 3UK4A 1ZLQA 2XXUA 1J1NA 2F97A 4HCWA 1OLCA 2XD3A 4MF3A 4OWDA 3W9VA 1B46A 2DXRA 4LA9A 5KZTA 1PB7A 2YPNA 3TMGA 4Z0IA 4ECFA 4X9TA 3OO7A 1DTGA 4KYSA 1LGBC 2HCAA 1VFEA 3O28A 3I5OA 3FXUA 3U1OA 5DYHA 1POY1 4YKIA 5EHSA 5AA1A 3OEMA 4LZ7A 4NTLA 3U94A 1B5JA 5BWJA 1MH3A 3G3JA 4OEVA 4PFTA 4U4XA 3CI8A 5JTYB 3R7XA 3S9NC 1H45A 3IB1A 4AQ4A 1B7UA 3BBRA 5IAIA 1ZBMA 4QFNA 4AB5A 2QJEA 4E0XA 1NNFA 3N26A 1IXIA 1WVJA 2XD2A 1R9QA 4HTGA 4KHZE 3FVNA 3K2DA 5L8DA 1PEBA 2F36A 3FGSA 3ILUB 1N84A 2F6PA 2GFEA 2F78A 3G7WA 4C1TA 4R2BA 4GF8A 4RNSA 5L9OA 5HM4B 4EXLA 2M8CA 3VV5A 1A8FA 3Q28A 1S7YA 1MPBA 1SDXA 4GL0A 1B52A 2P0SA 2QMWA 4FEBA 5I2NB 1ZIUA 3DELB 2ZXTA 2OBGA 1LCTA 1AH5A 1SD3A 2DE3A 2V3UA 3H03A 4LVQA 4XTCQ 3TDJA 2UVGA 1FQAA 3K6XA 4YKKA 4RXLA 3E9XA 1PBPA 4F39A 2Z8FA 1GV8A 4LONB 3SEWA 3OOAA 3LSFB 2XXHA 1N3XA 3DM0A 1IITA 4P0IA 2Y7PA 2RF1A 4U1ZA 3MBPA 3RLFE 3T66A 3MPLA 3UN6A 3K0VA 4U2RA 3ZS6A 3CSGA 4IGTA 4DDDA 3QXMA 1BLFA 1SVXB 2THIA 4FEDA 2Z22A 4LATA 1II5A 2R9JA 3GXAA 4IGRA 4JDFA 3K6UA 4OESA 1N7XA 2AL4A 3KFMA 4TQUQ 1NFTA 4NE4A 4OMBA 4JWYA 1P1QA 2QSXA 3IO6A 3K6WA 5BUUA 3MWBA 4LUBA 4GXAA 1NMUA 5AA2B 5I58B 1CE2A 1I6QA 2VHAA 3EN3A 3KOSA 1NNTA 1VE4A 2DWAA 1I6BA 3N94A 1DTZA 1Y3QA 3OSQA 4G8NA 4H0WA 1LB9A 4ZEIA 1FQCA 2XXIA 1LFGA 2HQ0A 5M2VA 4YICA 3TYHA 2F7CA 1B2HA 3KN3A 3G3HA 3O6GA 2I0CA 1EU8A 2V84A 4F1YA 3TELA 2B3FA 1A99A 3QSLA 4PE5B 4RPNA 1IZ1A 4IO6A 5I2NA 4O3BA 4RYAA 4UA8A 1B3HA 4ZEBA 1ATGA 4ELQA 1XS5A 3JZJA 3GBBA 2RC8A 3T9UA 3KSJA 2WKYA 3K1NA 4G8MA 2ZNUA 1P1NA 5JTYA 2F7BA 2RINA 1HSLA 1MM7A 3FATA 5EHMA 5KCJB 2F34A 1YTVA 3KOTA 3O2AA 3EQ1A 3DLNA 3SEUA 3VXCA 1OVBA 4FAJA 3H7MA 1BKAA 3O9PA 4GD5A 2PT1A 3SKPA 4F18A 2F8DA 2HFBA 2ONSA 2UVHA 4G4PA 3KJTA 2W7YA 2VOZA 4BDNA 4ESWA 1BTJA 3A09A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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