2UYFA

Single mutant f111l dntr from burkholderia sp. strain dnt in complex with thiocyanate
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
b'SFDPFASTRTFNLAMTDIGEMYLMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPNAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEAHH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title In Vivo and in Vitro Investigation of Transcriptional Regulation by Dntr.
pubmed doi rcsb
molecule keywords REGULATORY PROTEIN
source organism Burkholderia cepacia
molecule tags Transcription
total genus 67
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uyfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uyfA02
4IO5A 3LSFB 4ZZEA 1IIWA 1DOTA 3CFZA 1LB8A 4U4SA 3QXMA 1FQDA 2XXTA 3PUYE 5I58A 2VD3A 3T93B 1NNFA 3OO7A 3QYTA 3H6VA 4RY1A 5EHSA 3TYHA 2HXWA 4DZ1A 1NNKA 2PBWA 2GFEA 5M2VA 1DPPA 4HTGA 1POY1 1ANFA 2XD3A 4OFLA 3O6HA 3FASA 3LR1A 2OWSA 1N0TA 4MH5A 4TOZA 1A55A 3OMBA 3OO6A 4OENA 1CE2A 1NMUA 1R1NA 3Q28A 1I6QA 1PB8A 1NNPA 1M5CA 1AH5A 1EH3A 1PBQA 3IORA 2LAOA 3CSGA 3R7XA 1POTA 3TTNA 1OQHA 4NF5A 5F1QA 4NWDA 4M1VA 1EZOA 1SW2A 3TCHA 3MP1A 4ELRA 1B9JA 2F35A 4MF3A 4KCDA 1SD3A 3QAXA 1XHYA 4LZ7A 3N26A 3CG1A 3MWBA 2RCAA 4NWCA 4E0XA 1S9TA 3LBSA 3RQTA 2P2AA 1MXYA 4GF8A 2Z8EA 1DSNA 3KJTA 4R2FA 1QUJA 4NTLA 4ZEDA 5DT6A 3K00A 4GRKA 4I9DA 4I8CA 5JK4A 4F1VA 4G68B 5H8NB 4XKRA 3VVDA 3UK4A 1LB9A 2OBGA 1RKMA 4U1ZA 1FTJA 3SEVA 1OLCA 3RT6B 1B32A 4YU0A 3G3GA 3IR1A 3MBPA 3VVFA 1YPNA 1B1HA 2XXQA 3H3GA 2IA4A 1XS5A 2DE2A 3EHSA 2O6AA 3ZKLA 4H5FA 2H98A 4GVOA 1ATGA 2DWHA 3B6TA 1UTHB 2XX7A 1JW5A 1PB7A 3T9UA 1MH4A 1H45A 5I59B 1O63A 4IGTA 3IB0A 1IUDA 2V3UA 3HN0A 4OEUA 4NF8B 5JTYB 3L6GA 1QW0A 5FHNA 3TQLA 1ZMGA 2ZYMA 2F7AA 1VSOA 3T66A 4POXA 1Y9UA 2PVUA 2Z23A 2V25A 3HV1A 3C34A 3U92A 3E13X 5TP9B 3S9EA 1IXCA 3N5LA 5ITOA 2F7BA 4EQ7A 4ELQA 1B0LA 2ONRA 2YJPA 3UN6A 1HSLA 1LFGA 1L5TA 2CZLA 4N07A 1B2HA 5FHMA 1MXUA 4FEDA 4YKKA 1XVYA 3PPPA 5DVJA 1LBBA 3FZVA 2UXAA 1AL3A 1URGA 1QKAA 3C35A 4OETA 4OFOA 5ELVA 4Q5TA 2OWTA 3TFLA 5AA3A 2I49A 2UYFA 4NMYA 3JZJA 3KN7A 5CC2A 3ONMA 3RY3A 2HZLA 3LSXA 1NH8A 1IXGA 4Q8RA 1D9VA 3TEPA 4PQJA 4L17A 3VE1B 2UVHA 1JVYA 3B6QA 3MZ9A 3RTFB 3MC2A 1PEBA 1RYOA 1B7UA 3KBRA 2DXRA 3I6VA 3MPLA 4H6DA 2O51A 1ELJA 3KOTA 3Q29A 1TFAA 4H8IA 4RYAA 3IJOB 3DP8A 1LAXA 1LAFE 2F6GA 3FUZA 1MG1A 4F29A 2ZXTA 5AE4A 2Z22A 3U72A 3K0VA 5I56B 4NF6A 5H8FA 1VFEA 3K02A 4KYSA 4LATA 1IXIA 1JEVA 1ZTYA 4HW8A 1PBPA 1LGBC 4EF2A 1T0KA 3OEMA 4IO6A 2OZZA 1MQJA 1MY4A 1FQEA 3V89B 1B4ZA 5KCJB 2H25A 3DELB 3PPNA 3O9PA 3M8UA 4R6YA 3MVZA 2RKMA 4Z0IA 3R26A 3E3KA 4F31B 1Y3PA 3H6UA 4QFOA 4U22A 3FXUA 2QS2A 3QSLA 3IO6A 4MLVA 1ZBMA 4NF4B 1LCTA 3FXRA 4LQ2A 1SI0A 2D21A 2G93A 3C32A 3CRBA 3UIFA 3CI8A 4EQ9A 1USYE 1LLSA 2XX8A 2KLFA 4JWXA 2Q88A 3UA8A 3BFTA 4R74A 3ZS6A 3EHTA 3FD3A 3S2VA 1Y4CA 4BDRA 4ONYA 3KJ7A 3U1OA 2I3WA 3ODBA 2FNCA 5DEXA 5ICTA 3I5OA 5CMMA 2QS4A 3THIA 1P1WA 4H67A 3GLBA 2UVIA 4F1UA 1OVBA 1IEJA 1MPBA 3PMVA 2VGQA 2R71A 1B4HA 1B1XA 1FTLA 4YKPA 4F3GA 3WAEA 2ANJA 4HCYA 4KFQA 5AA2B 3PGFA 2QMWA 3FXQA 4QRZA 1IXHA 1SQYA 1J1NA 2I48A 2I0BA 3O6IA 2ZYNA 1MS7A 4NF6B 3V5AA 4H1XA 1MDP1 4LVQA 1SDXA 1OVTA 4P0IA 1FQBA 4O3BA 1Z7ME 1D4NA 2M8CA 2A5TB 4ZE8A 1QUIA 4KYDA 1N3XA 3VLWA 4U1OA 1F9BA 3GXAA 2H99A 4F1YA 2ZNSA 3UORA 3G3JA 4KR5A 3SESA 3FIRA 4LP2B 2XD2A 3T9HB 4G8HA 1B3FA 3VFJA 1MXWA 1B52A 4QF9A 4ELOA 3MZ1A 3BKIB 4QFLA 3T9VA 4QFKA 3QUJA 1B58A 3A3UA 2I0CA 5F7VA 4PFTA 4DDDA 1B3HA 1YTVA 3HHGA 5ITPA 2A5SA 4Q0CA 1O7TA 4KCCA 4IO7A 1M5EA 4F18A 3KN8A 5B7DA 1IZ1A 2DSFA 3T96B 4ELPA 4EDPA 4R75A 1SVXB 5ICQA 1URDA 1MY0A 4MFIA 4F3BA 4LA9A 2FYIA 3HO7A 4PETA 3BBRA 3TKDA 3D4CA 3DLNA 3DM0A 4ISUA 2R9JA 2Z8FA 4M4GA 4ZDMA 1N7WA 4OWDA 2HQ0A 2AYSA 2V84A 3OO9A 4XIGQ 1UTBA 3VV5A 3MP6A 2DYXA 3W15C 3M3KA 1GV8A 1UIUA 2REGA 1WODA 4HS7A 1IITA 2GHAA 3KSJA 4OVJA 4KPTA 2VOZA 4BDLA 3TTRA 3TZAA 1MQGA 1LFHA 3LUYA 5H8QA 4EXKA 3UGWA 2OCUA 4LUBA 2PX1A 1TXFA 4THIA 4U2RA 3FVOA 1PDAA 5DTBA 4KD5A 4C1UA 2O7UA 4YKIA 3DP4A 3JYRA 5CBSA 4JSDA 4RXLA 4R72A 4RK2A 4QSDA 1MXZA 2QS1A 2AL4A 2O7IA 1GR2A 3OSRA 2E0SA 4IB2A 1B5IA 5BUUA 5I58B 5AA1A 5HBCA 1S7YA 2PT1A 5KDTA 1ZLQA 4ND9A 1LAHE 1B46A 4LZ8A 3L6HA 4IO2A 4KHZE 4XKQA 2VHAA 3RUMA 4TLMB 4BDMA 1GVCA 1EU8A 5A5XA 4FEBA 4F2OA 4OQOA 3WAFA 1MH3A 2F5XA 3T22A 2Y7KA 2Q9TA 1P1NA 2ONSA 4P11A 3IB1A 2OK2A 2DE3A 3S9NC 2O68A 3VXCA 1VR5A 4KYEA 4Z7EA 2DQVA 3HCQA 2VP1A 3Q25A 2V93A 1UTBB 4ZZAA 4RPNA 1N3WA 1KWHA 5TPAA 3K6WA 1A40A 3VLVA 4QSCA 1P1OA 4DLDA 4FECA 1DPEA 4OEVA 4ESWA 3GBAA 1Y3QA 4GLIA 3D4GA 4NF5B 4RA1A 2O1MA 5JEIA 3EHUA 3TELA 2G29A 5ISUA 3U94A 3O97A 3KN3A 4EXLA 1EZ9A 3F11A 3IL1B 3N94A 4JWYA 4OZ9A 2RC9A 3OOAA 1B7ZA 1B3LA 4IO4A 1QKBA 3IAZA 1Q1KA 1SYHA 1P1QA 3K6UA 3CG3A 1M5FA 5I2NA 2ALUA 3K6XA 5CI5A 1OIBA 4YZZA 3EF7A 4GL0A 2CMOA 2DVZA 4TQUQ 2NOOA 4OMBA 2NWJA 4GWOA 1M5BA 4YMBA 1FW0A 2DOJA 1R6ZA 3K4UA 2F6PA 5IAIA 3TTMA 3C31A 1UIVA 4PFYA 2UVJA 1DTGA 4JSOA 4XXUA 4QFPA 2NVUB 2OLBA 2PYYA 1SI1A 2HAVA 3RLFE 2YLNA 4C1TA 4DXBA 5DYHA 5HM4B 3W9WA 4F39A 1H3DA 3HHFA 3AXFA 3RPWA 2XXXA 3N6TA 1O64A 1PC3A 3R6UA 4RNSA 4MBPA 3KSXA 4P0GA 3KEIA 3RNNA 3CFLA 3G3FA 3KFMA 5CMCA 4I1DA 4OESA 1AIVA 4XKPA 1Z7NE 1FTOA 1B0HA 3VDFA 5J1DA 1TT1A 1P99A 2X7PA 4C0RA 3MP8A 1DMBA 2QRYA 3O28A 5DVFA 3MPKA 2VD2A 4WKMA 2HZKA 3O6GA 4DE8A 2E1SA 4QHQA 3FV1A 5I2KA 4GQOA 5DVIA 2ZYKA 1LFIA 4IY5A 2V3QA 5AA4A 1SBPA 3H4ZA 5L8DA 4IO3A 3A09A 3PU5A 4DXCA 1HSEA 3IOWA 4ZECA 2BJJX 4R6HA 1JW4A 1H44A 4DCYA 2HFBA 2NXOA 3SEXA 3K01A 4JBZA 4KI0E 5K2YA 3FATA 1A8FA 4H8JA 2XXPA 3G3KA 1MRPA 1CB6A 1P1UA 1FTKA 2AIXA 2GRVA 1YCJA 3VVEA 2P1SA 3C33A 3FVGA 3SEYA 2DP8A 3U93A 3RT8A 3B7DA 3USDA 2UVGA 1FTMA 1B3EA 1LAGE 4H65A 3C9HA 2Y7RA 3MZBA 3M3LA 3K1PA 2ZNTA 4ZEFA 1QVSA 5H8FB 1QULA 2Q2CA 3V83A 5LOMA 2Y7PA 2XXHA 2I4BA 3RTWB 2GH9A 3IOTA 4HCWA 5TU0A 4Q30B 1PB9A 2XXVA 3O66A 4R2BA 5CBRA 4PE5B 4U21A 3UP9A 4G4PA 5CM6A 2Y7IA 2GHBA 1TFDA 3PPRA 4OYVA 1FQFA 2RF1A 4GXAA 3PMXA 3N6UA 3MQ9A 2R6GE 3MVYA 4FJPA 1MY1A 1B05A 1MPCA 2B3FA 4AB5A 3IJXB 2QL3A 3ILTB 1ZU0A 4ZE9A 5AA4B 1B5HA 1BKAA 3IOUA 4BDNA 3GBBA 3T9XB 3ECRA 4UA8A 3S9LC 1JQFA 4X48A 1OLAA 3IB2A 2QJEA 1LCFA 4MLQA 3H6TA 2NUVA 5EHMA 4G68A 4JWOA 5DEXB 5H8NA 4R9GA 2HAUA 2B3BA 2D5WA 4F3SA 2I4CA 2I6EA 4ZS9A 1SW5A 1ZKBA 5I84A 3SDFA 2F34A 2AL5A 2O84X 1MQIA 1UTHA 5K2XA 1MXXA 3MAMA 3S9MC 1QJMA 3PMWA 5I59A 2FA7A 1I6AA 5BWJA 5H8HA 4WEPA 3ZSFA 1Y4TA 4ZEBA 2WKYA 4NF8A 3VLUA 3KOSA 4RJZA 5JTYA 3TCGA 3SEUA 4LQ5A 1USYH 1A54A 2DWAA 4DIGA 3C36A 2HEUA 5B70A 4KQPA 3TUSA 3LSWA 2RINA 5H8SA 1MQHA 3E9XA 1JETA 5TP9A 2Q2AA 1XT8A 4YICA 3Q26A 4POWA 1GGGA 4O3AA 1IQ7A 1H43A 3KGCA 1MM6A 1WVJA 1Y3NA 2ZYOA 3PD8A 2XXUA 2I3VA 3HSTA 4G77A 1GTKA 3TAJA 4FE8A 3B6WA 1Y20A 2I58A 3MJNA 4F22A 4LZ5A 2F97A 3CFXA 2PT2A 4BLAA 3O2AA 1A8EA 3OELA 3IK6B 1A7LA 3K1MA 4ECFA 1Y1ZA 3SEWA 1EZPA 3OENA 3SKPA 1B3GA 5CMBA 1M5DA 2PMSA 4E0WA 2RCBA 4DXUA 4EUOA 3VXBA 2F78A 1NFTA 1MPDA 4PFUA 2ONKE 1MM7A 3I3VA 1UQWA 2QMXA 2H4IA 4FATA 1R9LA 5CRYA 2Z8DA 1N7XA 3MUQA 1AOVA 4RPOA 3ZKKA 4U4XA 2X7QA 1WDNA 3PV0E 4AQ4A 1B6HA 1MXVA 4JDFA 4G8NA 4YAHX 4R9FA 5H8HB 1MDQA 1ZJLA 2QSXA 1MQDA 2D3IA 3E4RA 5H8QB 5EYFA 2V3TA 3PPQA 3OXNA 1FCKA 5I56A 3OO8A 2DE4A 3G3IA 1ZIUA 4FIMA 5CMKA 4U23A 3ILUB 1JNFA 3CR9A 3PUWE 1B40A 4RK9A 2B65A 1TWYA 5KCJA 2ZNUA 5L9MA 4UACA 2XX9A 3K1NA 1N76A 4YB7A 2QPQA 4BDQA 1BP5A 3G3HA 4H5GA 2W7YA 4YB5A 5KDTB 3H03A 3TQWA 4PP0A 4F3PA 2O1LA 3C4MA 4YKJA 3JV9A 3H7MA 1N84A 4NF4A 2F8DA 4GIZA 3K2DA 1LBCA 3W9VA 5A5XB 3U8QA 1OQGA 3TMGA 1NKXA 4DCXA 4IY6A 2XXRA 1NL5A 4WXJA 3MW0A 2ABHA 4OFJA 3PUXE 3TTKA 1LSTA 4PFWA 3A3CA 4I62A 2RC8A 2ZMBA 2RC7A 4F2QA 2IEEA 3V8XB 2H5YA 1I69A 3MVWA 4G68C 1FQCA 1H76A 3H6WA 4H0WA 4ZEIA 4F19A 3PUZE 4XKNA 1SW4A 3FJMA 4NE4A 5TPAB 4N6PA 1VE4A 2F36A 2YPNA 2H9BA 1R9QA 4GXSB 2P0SA 3M3FA 1XC1A 3IO4A 3O29A 3P7IA 5AA2A 3TTLA 1XOCA 2DWJA 4G2ZA 4BDOA 1NH7A 4GL8A 2Q8JA 1DTZA 4GOTA 3LC8A 4EQBA 2X26A 4FAJA 1URSA 2A5TA 1US5A 3OSQA 1B51A 5L9OA 3RN8A 1BLFA 1JEUA 5I57A 3CVGA 4X1DA 3IOVA 4R6KA 1B7HA 3HPIA 3FV2A 5HPQA 3TDJA 4G8MA 3Q27A 5I2NB 4X9TA 1D3KA 3FGSA 1AMFA 1BIYA 4OXVA 3FVNA 3EPEA 2Y84A 3OD7A 3EQ1A 5AA2D 3CSBA 1US4A 3TPAA 2F7CA 3K6VA 1YAEA 2HCAA 3FJGA 4JB7A 4YMAA 4ZEKA 2XXIA 2O69A 4X1BA 3TODA 1N04A 3BFUA 2XXWA 4JXIA 1RYXA 4OHNA 1JVXA 1SW1A 5IKBA 1I6BA 2OJTA 4XTCQ 2DXYA 4EF1A 2XXYA 3IX1A 4WEDA 3H06B 1VFDA 3G7WA 1B5JA 4GD5A 2QS3A 4OERA 3CIJA 3S4UA 4LONB 4OTEA 2DVCA 3GZGA 4IGRA 4QFNA 1A99A 1II5A 3SETA 3QUFA 1SYIA 3QIMA 1MY2A 4FORA 4AB6A 4R73A 4ESXA 5KZTA 4N13A 4GFRA 3OEKA 2ESNA 1S50A 3FVKA 1HSJA 4TLLB 1XVXA 1NNTA 2THIA 3TCFA 3MVXA 1Q35A 1QUKA 1BTJA 2UYEA 1D9YA 3EN3A 3SERA 5I2KB 5FTIA 5FHOA 5I57B 3KZGA 4YB6A 1JW1A 2REJA 3DP6A 3QK6A 2DS9A 5FTHA 1Y1MA 3FJ7A 1FQAA 3PUVE 3KG2A 2Y7WA 1OMPA 3PD9A 2Q89A 2XHDA 3PPOA 4QSEA 5L9SA 2DWIA 4O3CA 3RGYA 4K3FA 1MY3A 3LSLA 4NEDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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