2UYFA

Single mutant f111l dntr from burkholderia sp. strain dnt in complex with thiocyanate
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
SFDPFASTRTFNLAMTDIGEMYLMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPNAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEAHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title In Vivo and in Vitro Investigation of Transcriptional Regulation by Dntr.
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia cepacia
molecule tags Transcription
molecule keywords REGULATORY PROTEIN
total genus 67
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uyfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uyfA02
2O7IA 1US5A 4KHZE 3CR9A 3IOUA 3K00A 3OENA 2D5WA 4UACA 3TTKA 3O9PA 5CMBA 1VSOA 3UA8A 4FEDA 3SEVA 2ZMBA 3B7DA 1IQ7A 2YJPA 2BJJX 2DVCA 1NL5A 4KI0E 4MLVA 4F3PA 3N6TA 3SETA 2UYFA 1B7ZA 1FQDA 4I62A 1FQCA 1NNFA 1HSJA 4C0RA 1R1NA 2PT2A 2XX7A 1QUIA 3LSFB 4OVJA 2PT1A 4FEBA 2NVUB 2F7CA 1P99A 3DELB 1XVYA 4ELOA 5FTHA 3IJXB 2DXYA 4YMAA 4DE8A 3A09A 4OXVA 5ICQA 4TLLB 4KD5A 3FVOA 3RT8A 1LSTA 2HZKA 1B3HA 4OEVA 5AA2A 1TXFA 2F78A 1US4A 4KPTA 4RJZA 1BLFA 3IORA 4KCCA 3RT6B 4Z7EA 1TFDA 5KCJB 4OENA 3FASA 3T9HB 4U2RA 1QVSA 4OHNA 4FAJA 1ZMGA 3K1PA 4OFJA 1SW2A 3BFTA 3W9VA 1LBBA 4X9TA 4YB5A 4G68C 3MPLA 1F9BA 4MBPA 5A5XA 3V83A 4ESWA 3FJGA 2AYSA 4ELRA 1PBQA 3UGWA 4E0WA 1Y1MA 4BDOA 4DIGA 4F18A 5CBRA 4C1UA 1XC1A 1Y4TA 4KYDA 3ZSFA 1VFEA 1FTLA 5F1QA 4ZECA 1EZ9A 4GL0A 3U92A 1MDP1 5KDTB 4ELPA 3CRBA 4LZ7A 2Q8JA 5LOMA 3VDFA 2ZYNA 3LSWA 5HPQA 1A7LA 3ECRA 4JWYA 1MQGA 1S9TA 1B32A 2Z8DA 4R73A 4H67A 3TELA 1Y3PA 4F19A 1QKAA 3UIFA 1OQHA 2AL4A 2A5TB 1JW4A 4Q30B 2ZNSA 2HXWA 5JTYB 1DPPA 3N5LA 5I2NA 4F22A 5JTYA 1QJMA 1EZOA 3I6VA 2P1SA 3MVWA 5TU0A 4NF4A 3S4UA 4F3GA 3S9MC 3M3KA 3QK6A 3VXCA 5ISUA 1UTBB 2DSFA 3ILTB 2QMWA 1EZPA 3H6TA 4POWA 1FQBA 2I3VA 1B3GA 1UTBA 4G4PA 1M5FA 3Q28A 3RY3A 1ZTYA 3T9UA 4GF8A 1UIVA 2UVGA 2QS4A 2I6EA 3DM0A 3OO6A 4ISUA 4KYEA 4P11A 1AMFA 3H7MA 4THIA 3C9HA 3TQLA 5H8FA 1DOTA 3KFMA 3QUFA 4OFLA 2Q2AA 4QFOA 3RPWA 3MAMA 3SEXA 4R2BA 1P1OA 5L8DA 5JEIA 1NMUA 3PUZE 4IO5A 4QHQA 4Q0CA 3USDA 1UTHB 3OO9A 4IO4A 4JWXA 1TFAA 2DE2A 1R9QA 1BTJA 1MY1A 3FVGA 3IAZA 3OXNA 4PE5B 4BDNA 3N26A 3E4RA 1B46A 2XXTA 5M2VA 1QW0A 1B51A 1OLAA 1S7YA 1Y9UA 3E3KA 4IY5A 3D4CA 3SDFA 5JK4A 1MY2A 5H8NB 5TPAA 2O7UA 3SEWA 1B3LA 4H5GA 2RINA 2OLBA 3TDJA 5DEXB 4NE4A 1URDA 2XXVA 2D3IA 1Z7NE 2AL5A 5DEXA 3KN7A 3Q25A 2Y7KA 4GLIA 4NWDA 4U4XA 5IKBA 2QL3A 4ND9A 4GVOA 3SEUA 1M5BA 4GWOA 1PB9A 2RC8A 2X26A 4C1TA 5AA3A 1NKXA 2H98A 5I84A 4ZE9A 2RCBA 3KGCA 4LP2B 2F6PA 3VV5A 5A5XB 1UIUA 3FVNA 1TWYA 3PV0E 5BUUA 2F36A 1AOVA 1FCKA 2AIXA 1JETA 4NF4B 4EUOA 1B3FA 3FJMA 3OO7A 4F3SA 3FATA 2V25A 4LA9A 2HAUA 4OMBA 1GVCA 3TMGA 3U1OA 3V8XB 5H8QA 1NNTA 1O7TA 2XXYA 4XXUA 5EHSA 3H3GA 4H8JA 4ZDMA 4QFLA 3SERA 3WAEA 1URGA 1ZLQA 1I69A 4FE8A 5AA4A 1NNKA 3VLUA 2F97A 3A3UA 1SQYA 1UQWA 4KYSA 2WKYA 2OZZA 3O29A 1WDNA 2XXQA 3KJ7A 2PYYA 1EH3A 3Q26A 3F11A 4G8NA 4I8CA 2I58A 4IO3A 4BDLA 4N07A 1RYOA 4IGRA 3O97A 4YKPA 2QS2A 4NF8A 1SW1A 1OQGA 3FGSA 3G3IA 4QRZA 4ZEFA 2GH9A 1JW5A 2ALUA 2CMOA 3EF7A 4WXJA 1SVXB 3FJ7A 3OEMA 1ATGA 1MQDA 3VXBA 5I2NB 1D9YA 4YB6A 4ZEDA 4M1VA 3PMVA 2DWJA 4TOZA 3KSJA 4PFUA 4ZEKA 4ZEBA 2ONRA 2THIA 2OBGA 3K6UA 3PUYE 4X1BA 5TPAB 4RYAA 4GIZA 4MLQA 4XIGQ 2DQVA 2R9JA 1FTKA 4ZS9A 3TTRA 2QRYA 3KSXA 1O64A 4JB7A 4DDDA 4QF9A 3KEIA 1B58A 4BDMA 3DP6A 4F1UA 1GGGA 2FNCA 2XXUA 3DLNA 1B7UA 2W7YA 4G68A 3UORA 2CZLA 1I6QA 3UN6A 1I6BA 4AQ4A 3OMBA 4JXIA 5KCJA 1JQFA 2DVZA 3HO7A 1IXCA 2F7AA 1PB8A 3LSXA 3JZJA 4U23A 4DZ1A 1LAFE 2Z8EA 1N7WA 4L17A 3T66A 2DE4A 3O28A 1A8EA 4H6DA 2I48A 2R6GE 2XX8A 3UP9A 2XXRA 3TTLA 1XS5A 3BFUA 5CMMA 5AA2D 1Y4CA 3VE1B 5CMCA 1MG1A 1MY4A 1IEJA 3VVDA 4DXUA 3PUWE 1QUJA 4FECA 3FXUA 5BWJA 3LC8A 3A3CA 1LBCA 2IA4A 3HCQA 3K6XA 1BIYA 3JYRA 3GBAA 3MVXA 1PBPA 1VR5A 3T22A 3CSGA 5F7VA 3MJNA 1R9LA 4EXLA 1YAEA 4NF8B 3IO6A 4I1DA 5HM4B 5EYFA 1KWHA 2G29A 3K1MA 5DTBA 2E1SA 3GBBA 2XXXA 3FXRA 2QJEA 5FHNA 1A99A 1UTHA 1LB8A 2Q9TA 1D4NA 1AL3A 2ZXTA 4H0WA 1H3DA 3ZKKA 5CM6A 3G3JA 2PVUA 4NF5A 1MXYA 3H6VA 3MBPA 3FIRA 2DXRA 2E0SA 3OD7A 5H8NA 3V89B 1AH5A 2GRVA 5H8FB 3QAXA 1P1WA 4R2FA 3ODBA 5I56B 3RTWB 1JEVA 1ANFA 1B5HA 1LAXA 1N84A 4BDRA 4EF2A 1DMBA 2V3UA 3T96B 2OJTA 1FQFA 2XXPA 2XX9A 3H03A 3OELA 3QYTA 4N13A 3VFJA 1B4ZA 4GD5A 3DP8A 3IK6B 4OZ9A 1P1NA 1H45A 2P2AA 3MQ9A 4R6YA 5K2XA 3EPEA 4X1DA 5DT6A 1FQEA 3S9EA 4DXCA 1CE2A 3VVFA 4H8IA 2Z22A 5FTIA 1MQIA 3FV2A 4ZZAA 3S9LC 2UVHA 5H8QB 4RA1A 4UA8A 4JSOA 4YU0A 5KZTA 1HSEA 1OIBA 2HFBA 2I49A 2YLNA 5CRYA 2UVJA 3M3LA 3LUYA 4H1XA 3EHUA 1B0HA 3KBRA 1SBPA 1SI1A 4OWDA 5AE4A 1ELJA 3K2DA 1AIVA 3VLVA 3MZ1A 1QUKA 3TCGA 4WEDA 4JSDA 2H5YA 2HEUA 3C31A 3E13X 1GV8A 4GOTA 3BBRA 4F2QA 3HHFA 5AA2B 1LFIA 5I57B 1MY0A 1BP5A 1LLSA 3TUSA 3HN0A 3I5OA 1VFDA 3K4UA 5B70A 1D9VA 2VOZA 2IEEA 3FV1A 3KN8A 3DP4A 2UVIA 5IAIA 3CG1A 1IITA 1MH3A 4U1OA 3G3GA 2XHDA 3MWBA 1LGBC 1PEBA 1Y3NA 2B3BA 2LAOA 2NUVA 2V84A 2ZNUA 4GFRA 4XTCQ 3MVYA 5EHMA 3QUJA 5ELVA 5KDTA 1Z7ME 3OOAA 4OFOA 3O6GA 2PBWA 4MFIA 4IO7A 1DPEA 5I59B 1JNFA 2XD2A 4XKPA 2A5SA 4F29A 3OO8A 2O1LA 3N6UA 1FTOA 2F8DA 2DYXA 2OWTA 2ZYOA 3B6QA 3CFLA 3PUXE 4R6KA 1POY1 4GL8A 4TQUQ 1GR2A 1WODA 2VD2A 3K6WA 1MRPA 4IO2A 3C34A 3TODA 4HW8A 4LONB 3MUQA 4QFNA 4ZEIA 3IO4A 3VLWA 1MXWA 4F1YA 4U4SA 1LCFA 2QS3A 3TPAA 2F5XA 3PPNA 3S2VA 5CBSA 3MC2A 3OEKA 3T93B 1B5JA 3ONMA 4DCXA 4EQBA 5L9OA 2PMSA 2I4BA 1BKAA 3C32A 1OVBA 4DXBA 4KR5A 3Q27A 4R72A 3MZBA 3OSQA 1YPNA 4BLAA 3H06B 5I58B 1SYHA 1DTGA 2YPNA 3G7WA 3K1NA 1JW1A 3EHSA 1N3XA 3G3HA 3SKPA 4RK2A 5CMKA 3PPRA 1FTJA 4NMYA 1H44A 3MVZA 2NWJA 4F2OA 1GTKA 3E9XA 4HTGA 3C33A 2O6AA 3SESA 1MQHA 2P0SA 1H76A 3CFZA 3IB1A 3K0VA 2DOJA 4F1VA 4OTEA 4GXSB 1B1HA 4IO6A 1Y20A 4M4GA 3O6IA 1XT8A 3U93A 4OERA 1A54A 1MXUA 3LR1A 3C36A 2X7QA 4Z0IA 3L6HA 4HCWA 4K3FA 3THIA 5K2YA 4DLDA 5ITOA 1JEUA 1LFHA 1I6AA 1RYXA 3B6TA 2XXWA 2Z23A 5DVJA 3U72A 2HCAA 2QPQA 1USYE 5CI5A 4U1ZA 3EQ1A 4ELQA 2VHAA 1URSA 4FIMA 4R9GA 4RK9A 4YICA 3RNNA 1NNPA 3S9NC 1SDXA 4QFKA 2DP8A 2O1MA 1B7HA 4FATA 2QSXA 3G3FA 3GLBA 4POXA 4OQOA 3IB2A 2F35A 4R9FA 4PFWA 2V93A 1LFGA 3FVKA 2OCUA 3O2AA 2X7PA 3TQWA 5TP9B 4PFTA 1OVTA 3PUVE 4XKQA 3H4ZA 2V3QA 1LB9A 3OSRA 4OETA 3C4MA 4PQJA 4U21A 2H9BA 4YMBA 3CIJA 3IOVA 1B6HA 4MF3A 1N76A 3PU5A 3T9XB 4ZE8A 4JWOA 3I3VA 4ECFA 2DS9A 2Y7RA 3LSLA 5DVFA 1P1QA 4NF6B 4ZZEA 1MXVA 3T9VA 3W15C 2KLFA 2O51A 5I57A 2V3TA 3IOTA 1B0LA 3HPIA 1S50A 1A40A 2H25A 3B6WA 4FJPA 4U22A 1DSNA 3L6GA 4LATA 3UK4A 3TCFA 4LUBA 2NOOA 2Y7PA 4N6PA 4NWCA 2HZLA 4H65A 4G8MA 4WKMA 3R26A 1OMPA 2HAVA 3KOSA 3MPKA 1D3KA 3K02A 3QIMA 2OWSA 2O68A 1B3EA 2B65A 2Q89A 3O6HA 4YKKA 4E0XA 1NFTA 3PMXA 4O3CA 5I58A 1LCTA 1EU8A 1M5DA 4OESA 2UYEA 1FTMA 2Y7IA 1YCJA 2Y84A 5H8HA 3PD9A 4AB5A 4RXLA 3IX1A 3MP8A 1MPBA 1XOCA 1M5EA 1PDAA 2QS1A 3EHTA 3M3FA 3PPOA 4G2ZA 1L5TA 3CG3A 5FHMA 4PFYA 3TKDA 3MZ9A 4P0GA 3MP1A 4TLMB 1MM7A 1OLCA 4RNSA 2H4IA 4EXKA 2RKMA 2FA7A 2DWHA 3WAFA 1MXZA 2B3FA 1P1UA 1IZ1A 3ZKLA 4LQ2A 3K6VA 4YB7A 1TT1A 2M8CA 2DE3A 2ONSA 3TAJA 4RY1A 1Y3QA 1SYIA 2NXOA 1IXHA 5I2KA 4PETA 1Q35A 1WVJA 1JVYA 3TEPA 5AA4B 3KZGA 1HSLA 2ESNA 3SEYA 3D4GA 4GRKA 2FYIA 3IJOB 3FZVA 1ZU0A 4FORA 2Y7WA 1B9JA 4R74A 5DYHA 3HV1A 4GQOA 5HBCA 4XKRA 3PPPA 4G8HA 4IB2A 4OYVA 4ONYA 3TTMA 3JV9A 4Q5TA 5FHOA 2F7BA 2I0BA 1JVXA 3TTNA 3R7XA 1N0TA 1MM6A 3IL1B 2XXIA 2I3WA 1SW5A 2I0CA 1YTVA 5I59A 4RPNA 1M5CA 3RN8A 1LAHE 3KN3A 5J1DA 3M8UA 1A55A 1N7XA 1NH8A 3H6UA 4P0IA 3U8QA 4ESXA 1MPCA 1NH7A 2GHBA 3PPQA 2DWIA 4NF6A 4X48A 5DVIA 3TFLA 3C35A 3KJTA 4IY6A 4NF5B 2PX1A 4IGTA 1B52A 2QMXA 4PP0A 1ZKBA 2GHAA 2D21A 2R71A 4KCDA 4LVQA 3RTFB 1DTZA 3ZS6A 4F39A 4G68B 4BDQA 3TYHA 4YZZA 5B7DA 1MDQA 3MP6A 1T0KA 1Q1KA 2RC9A 1B4HA 1B5IA 3ILUB 3IOWA 1MH4A 1Y1ZA 4R75A 1VE4A 3MW0A 4LZ8A 2I4CA 1XHYA 4QSEA 3H6WA 1IXIA 1LAGE 2Q88A 1RKMA 2O84X 2ZYMA 4O3AA 1MQJA 4I9DA 2GFEA 4Q8RA 1N04A 5H8HB 5ICTA 1FW0A 1MPDA 3R6UA 3Q29A 1IXGA 4LZ5A 3FXQA 3IR1A 3LBSA 3FUZA 2HQ0A 3PGFA 4HCYA 2H99A 4YKIA 1PB7A 2OK2A 2RF1A 5AA1A 2RC7A 3CVGA 2ABHA 2REJA 4QSCA 3EN3A 2RCAA 1QULA 2UXAA 4WEPA 4EF1A 1MXXA 4KQPA 4OEUA 3O66A 4KFQA 3FD3A 3GZGA 3VVEA 2VD3A 4R6HA 3PD8A 3TCHA 3K01A 4F3BA 1O63A 4O3BA 1H43A 4G77A 3RQTA 1ZJLA 1B40A 4AB6A 4EQ9A 1R6ZA 4RPOA 3CSBA 5ITPA 3V5AA 4DCYA 3PMWA 4H5FA 3HSTA 1B1XA 4NEDA 3GXAA 1CB6A 3HHGA 3KG2A 1XVXA 5L9MA 1N3WA 1ZBMA 4NTLA 4XKNA 1ZIUA 4QSDA 2VP1A 1MS7A 2VGQA 3AXFA 4EDPA 5I56A 2Z8FA 4YAHX 4LQ5A 1II5A 1QKBA 1MY3A 3CFXA 3QSLA 1SW4A 1USYH 3G3KA 1B2HA 3CI8A 4HS7A 4YKJA 3KOTA 5H8SA 2XD3A 5TP9A 1B05A 5L9SA 2O69A 3TZAA 1PC3A 2A5TA 2ONKE 2F34A 2F6GA 2ZYKA 1J1NA 2Q2CA 3IB0A 4EQ7A 1POTA 3N94A 2REGA 3W9WA 4MH5A 1A8FA 1FQAA 3RGYA 5CC2A 4GXAA 3QXMA 1IUDA 1SI0A 2ZNTA 2ANJA 1IIWA 2XXHA 3BKIB 3RLFE 3P7IA 4JDFA 3RUMA 4F31B 2DWAA 1SD3A 5I2KB 4JBZA 4QFPA 2G93A 3U94A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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5IZZA 1AH5A 1P1WA 4R2FA 1D9QA 1B5HA 1G0HA 1LAXA 1N84A 4MHFA 4EF2A 2XXPA 2XX9A 1B4ZA 4R6YA 4X1DA 4ZZAA 1NV6A 4N6DA 5KZTA 3HFUA 2UVJA 3LUYA 4H1XA 3EHUA 1B0HA 1SBPA 3MZ1A 1GV8A 5AA2B 1BP5A 3KN8A 3DP4A 1IITA 1MH3A 1Y3NA 4DI4B 4N17A 2V84A 5EHMA 3QUJA 1Z7ME 5A5LA 2FIEA 4F29A 3N6UA 2DYXA 3B6QA 4TQUQ 4LONB 2QS3A 3S2VA 3MC2A 1B5JA 4DCXA 5L9OA 2I4BA 4BLAA 1SYHA 2YPNA 3K1NA 1N3XA 3G3HA 3SKPA 2R8TA 4NMYA 3C33A 1MQHA 3CFZA 4GXSB 4IO6A 3U93A 3C36A 2X7QA 4DLDA 1LFHA 1USYE 1NUYA 2GQ1A 4R9GA 1URSA 1DBZA 4NN3A 4QFKA 4FATA 3IB2A 2V93A 2V3QA 1LB9A 4O7IA 3I3VA 2DS9A 4ZZEA 1MXVA 2KLFA 2O51A 3HPIA 5ITPA 1A40A 4GWWA 3UK4A 4LATA 4WKMA 3K02A 3QIMA 2OWSA 2O68A 1B3EA 2Q89A 1NFTA 4NG7A 5EQ8A 1LCTA 2Y7IA 1NV0A 1MPBA 1M5EA 3PPOA 4G2ZA 4PF8A 3MZ9A 3MP1A 4TLMB 2B4LA 2H4IA 2RKMA 1FPLA 2KQZA 4LQ2A 4YB7A 1Y3QA 2NXOA 4MIJA 1JVYA 1IMBA 4GRKA 1B9JA 3HV1A 4XKRA 1FTAA 4PFBA 3TTNA 2XXIA 3U8QA 1NH8A 4P0IA 3TFLA 2DWIA 3KJTA 2R71A 2GHAA 5KCJB 3TYHA 4N91A 1T0KA 3ILUB 3MYUA 3MW0A 1XHYA 3H6WA 1LAGE 2ZYMA 1RKMA 2GFEA 1FW0A 3R6UA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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