2V0ZC

Crystal structure of renin with inhibitor 10 (aliskiren)
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
340
structure length
338
Chain Sequence
LTLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords RENIN
publication title Structure-Based Drug Design: The Discovery of Novel Nonpeptide Orally Active Inhibitors of Human Renin
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 338
sequence length 340
chains with identical sequence O
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2007-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2v0zC02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2v0zC01
1YTJA 5P17A 2XYEA 2AZ8A 4OD9B 2IQGA 5P15A 2XFJA 1FG6C 1W5XA 1DW6C 1DIFA 5P1BA 4BEKA 5DR8A 3VYDA 2FMBA 1OHRA 5P6NA 1YX9A 3PJ6A 1DMPA 1AXAA 5E5JA 4Z50A 3R4BA 1T7IA 4HE9A 2BPXA 2FDDA 5P69A 2P3DA 3UTLA 5P8MA 1PSAA 5P7BA 5P3XA 3UDJA 4ZEAA 5P4SA 3LIQA 4L1AA 3NR6A 5P6ZA 4R95A 1D4KA 2BBBA 5P81A 4PEPA 1LF3A 1CMSA 4TVHA 4I0IA 5P3GA 4M8XA 3INEA 4ACXA 2BPVA 3FV3A 2RMPA 5P8QA 3RSXA 2R3TA 1HVRA 4J55A 3C9XA 3D1YA 5P2NA 5P7DA 5P4WA 4CP7A 5P0VA 1SIPA 1Z1RA 5P78A 1LF2A 3EKPA 4TRZA 4EP3A 2I4QA 3URJA 4GJCA 4OBZB 3KT2A 4Q1NA 5HDVA 3PCWA 5OYQA 2QMGA 2P3BB 3ZPSA 3VSXA 2R8NA 4EYRA 3UCBA 1HXWA 5P2RA 4Y3LA 3BUHA 3ZMGA 5P6JA 1FEJC 3BHEA 8HVPA 4DJUA 4AUCA 1K1UA 3QPJA 3OXWA 3GGAA 5HE5A 1TSQA 2F8GA 4BFDA 1BILA 4LXAA 3DM6A 4FIVA 4FRIA 3T7QA 2AVMA 1GNOA 3ZLQA 1ER8E 5P5QA 2G26A 2IENA 4Y3DA 4GJ9A 3SA5A 3F9QA 2ZDZA 1OEXA 4DJXA 4I0ZA 5EZZA 2WHHA 9HVPA 3QBHA 3EL0A 3ZOVA 2QZLA 4RCFA 2BPZA 1HPXA 5P7NA 5P3PA 5ENMA 3INDA 2JYSA 3T7PA 4WY1A 5OZVA 5P3DA 3O9FA 3PEPA 1FGCC 1Z1HA 1LZQA 3IXKA 5P8VA 5P5LA 2PYNA 5P1VA 3UDMA 4XXSA 2G27A 5P5DA 2WEDA 4EQJA 3RVIA 3OADA 5OZ6A 5P5WA 2FIVA 1ZSFA 7HVPA 2P3BA 2ZHVA 2OHSA 4Y41A 5OZ2A 5OZ9A 4DI2A 1DPJA 1FMBA 5P6HA 1MPPA 5P6CA 3SA9A 4Y9WA 2B7ZA 5P07A 4FRJA 2I4WA 4LAPA 3SA4A 1K2CA 2ZHUA 5P3WA 2I1AA 1LYBB 1HVHA 2B8LA 3CKTA 4GIDA 3EL4A 5P23A 1UH7A 3O9LA 1BDQA 4TRYA 3SA6A 4RZ1A 1TQFA 4JPCA 2QZKA 2WEZA 3PSUA 1KJ4A 4Q1XA 5DR3A 3EMYA 3EM3A 3L5BA 3GGUA 2IRZA 4OBJA 2R9BA 3WB4A 4DJWA 3LIVA 3UDQA 5P31A 5P4MA 3EKWA 1FQXA 1MEUA 3K4VA 4J1HA 5P6QA 1EEDP 2BPYA 4ZSMA 1EC2A 2I4VA 1EBKC 4GZFA 3S43B 3FNUA 1LEEA 3PCZA 4ZLSA 4DJVA 1SH9A 3K4VC 3NDUA 4NJVA 2B8VA 1K6VA 2AOFA 4LP9A 5FIVA 1Q9PA 3UFLA 3OWNA 2NXMA 1PSOE 1TCXA 1HIHA 5P55A 3UDNA 1LYWB 4MC1A 2Z54A 4FM6A 5HE7A 3S54A 2APRA 5P00A 4RCEA 2BKSA 2FNTA 5P74A 2I4XA 5P5FA 2OHMA 5P1DA 2WF3A 4K4PA 1BXOA 1LYBA 3EKYA 4DQEA 2F80A 5P3IA 4Z2ZA 5P48A 4DQGA 2OHPA 1MRWA 4K4QA 1VIKA 5P39A 5OZ5A 1YTIA 1D4SA 3D91A 3EM4A 2OAHA 5P89A 2VNMA 4YA8A 1XDHA 5UPJA 3SO9A 1ZSRA 4AMTA 5OZWA 3KA2A 1HVIA 3OQDA 6UPJA 5OYTA 1FLHA 3PWMA 3PB5A 5DR0A 3Q4BA 3MXEA 5HCOA 1BDRA 2UXZA 1KJFA 2QU2A 2FNSA 3CYXA 3LIZA 2QI5A 3PSGA 3IN3A 1GKTA 4ER2E 5P61A 4B1EA 3S2OA 1EAGA 2O4NA 4FAFA 5P6RA 3VSWA 5P79A 1QBTA 3NDTA 4R8YA 3UDPA 4Y4GA 5HU1A 1BV7A 2WF1A 5DQCA 3L58A 3HDKA 1K1TA 5P5XA 4PHVA 1A94A 1BWBA 1ODWA 4OBDA 4AZYA 5P5GA 1MTRA 4Y36A 1HSIA 3GI5A 5P1QA 2G22A 3G6ZA 1HTGA 3TNEA 5P8LA 3VG1A 5P7QA 4YD3A 4EJKA 5P7RA 4FRSA 5P3OA 5P88A 1FKNA 5P3VA 3LPKA 1HWRA 1BV9A 2HB4A 3LPJA 2BJUA 1G0VA 2G94A 3JVYA 4Y4EA 1FIVA 5P6LA 1HXBA 1KJGA 2RSPA 5I3VA 5JFPA 2QI3A 4GJ6A 4RRSA 5OYRA 5P2LA 4PZXA 4QGIA 5P38A 2AVOA 5P72A 2NNKA 3HAWA 3SFCA 1OD1A 3UDHA 1YT9A 3TL9A 3SPKA 3HW1A 2QZWA 3ST5A 3DK1A 5F01A 5P8RA 4HEGA 5P2KA 1HPSA 5SXNA 2SAMA 1HVCA 4UPJA 3DJKA 1YTGA 4Y3XA 3CIBA 5IE1A 5P1FA 1A9MA 1B6MA 2H6SA 3R1GB 1E80E 3OXCA 3OUCA 5P6SA 3OY4A 1PPKE 5P85A 5P6GA 1AM5A 4U7QA 4EXGA 3UQPA 2J9JA 1W6IA 3T7XA 3N3IA 4EJLA 4K4RA 1TSUA 5P7CA 3U6AA 4LBTA 2PSVA 4PZWA 1LF4A 2OHNA 5P6UA 1BVEA 5BRYA 5P2XA 3PSYA 3CIDA 1MRXA 4YD7A 2P83A 1EC0A 5OZ4A 5P8KA 3UDKA 3ECGA 4Q1YA 1XE5A 5P3SA 4RGHA 2R38A 4HDFA 5P4UA 4DQFA 5P02A 4NJTA 4APEA 3UDYA 3VEUA 5P2GA 3L5FA 5P7IA 4Y4ZA 4I11A 4LXKA 3D20A 4Y3EA 4I0FA 5P84A 4I0JA 5ISJA 5P0HA 1HIVA 3BGBA 5P8PA 4DH6A 5P2SA 1W51A 2ZJKA 4DV9A 4CPUA 4OBGA 4OBKA 1EPOE 5P1JA 5DR1A 4GJBA 1SDUA 5P01A 2JJJA 3OAGB 5P7KA 5P71A 4TRWA 5P5EA 3SKFA 4RVJA 5OZQA 4EXHA 5DQ4A 5P6FA 3OU1B 5P4YA 4KB9A 5DR4A 5P27A 5P1GA 3S85A 1K6TA 5OZKA 3R2FA 3S7LA 5P45A 3TH9A 4J0TA 3TLHA 4HZTA 3DOXA 3EL5A 5P3TA 4BELA 2F3EA 5P2CA 3DV5A 5P16A 3O9GA 3SKGA 1QBRA 5P5YA 5SY3A 5KOQA 1BWAA 5P56A 4ZPGA 2Z4OA 4B1CA 1FMXA 3D1XA 4L7GA 3VV6A 2PSUA 3D3TA 2AOEA 2QZXA 5P1KA 3PGIA 5P22A 3TPRA 2HS1A 4RRNA 5P6YA 2MIPA 1G2KA 2ZHRA 4Y5NA 5P2MA 5HDXA 3NWXA 2HAHA 2PMAA 4FAEA 4J1CA 3I2LA 2QK5A 3QP0A 5P18A 2RKGA 3RTNA 5SY2A 1D4LA 4M8YA 4YD6A 5C9DA 5P3BA 4EWOA 5P4JA 4GB2A 3BUGA 5P6TA 2QI7A 2ZE1A 4FM8A 4D83A 3Q6YA 2VA7A 4Y57A 2VIJA 5AH8A 1CZIE 5P34A 4Y56A 4L7HA 2G1SA 3L5CA 4Q1WA 1M4HA 4DJYA 5JG1A 3KFNA 4I0EA 1HVJA 1MT9A 1SDVA 3N4LA 3ZKGA 5P8GA 3O9HA 4EP2A 5P7VA 3KYRA 5P76A 5P83A 2HB3A 4NPTA 4NPUA 2AOGA 5P54A 3QS1A 5P0PA 1NPVA 2I0AA 2FLEA 1BIMA 5P65A 2VJ9A 2AVQA 4CPTA 3IXJA 5P0KA 2V00A 5P3LA 3FSMA 4CPSA 3BGCA 2AOJA 5P3AA 5OZYA 4GJ5A 5P62A 1APTE 3BRAA 4YDGA 3NYGA 4I12A 5P6KA 2H6TA 4CPQA 2AOHA 3TOGA 4DJOA 4DVFA 2WJOA 3SA7A 4J54A 3TPPA 4ZSRA 5P4ZA 3IXOA 1EPLE 4KUPA 3TOFA 2HS2A 2NXDA 3OUDA 1APWE 4ACUA 3KDDA 5P20A 4OD9A 5AH9A 3R0WA 5P5VA 2VIEA 4Y5AA 3BC4A 2PWRA 3GGVA 5ER2E 5P3QA 2I0DA 1EPNE 4Y5KA 2P4JA 5P0TA 3O9DA 3DCKA 2IL2A 1RNEA 3LIYA 5HDUA 4H1EA 2P8HA 2VJ6A 4DJRA 3HD8A 3O9AA 5P2FA 3K5FA 5P4VA 5P7EA 3NUOA 3RTHA 1XL5A 4Y5CA 6FIVA 4NJSA 2NNPA 1XN2A 4D88A 5P8FA 2VKMA 2Q64A 3Q70A 5JODA 1G6LA 5KQXA 3SABA 3KDBA 3BVAA 4RYCA 3OK9A 3EBZA 3LIXA 5P64A 4LC7A 4QJ8A 1SGUA 5P33A 1EPPE 1PPLE 3APPA 3URIA 5DQ5A 5P5KA 2XFIA 4F75A 5COOA 1GVWA 5OZ0A 2V11C 4OBZA 5P0RA 1B6PA 3U71A 1HRNA 2Q3KA 4RLDA 5IVRA 4YOBA 4Q5MA 4R92A 1W5VA 1MVPA 5P7ZA 1HEFE 3RTMA 4FCOA 4Y4BA 2ZYEA 1B6KA 2VNNA 5P0GA 3VCMA 1GVTA 1B5FB 1K6PA 1HTRB 3B80A 2O40A 1ZP8A 2ZHTA 1LS5A 5P47A 1FF0C 2NXLA 1FQ6A 5P4FA 3OOZA 5P6DA 2R5QA 3VYFA 2F3FA 5P2UA 5P0YA 3HVGA 4YCKA 1MSNA 5P2QA 4Y3YA 3OGPA 4Y5PA 2WEAA 2BPWA 4KE0A 4GJ8A 1IZDA 4YDFA 5APRE 5P8AA 4AA9A 5P4QA 1OEWA 5P5HA 4QJ7A 2ZHSA 4JOOA 5P2VA 4NJUA 2BB9A 5P3CA 5EZXA 1AZ5A 4CKUA 5P8NA 1PPME 1YTHA 4CPRA 4GJ7A 3DUYA 5P3HA 5P4TA 5OZ3A 4R91A 2ZGAA 1T6GA 3KF0A 5P14A 5P6WA 3CKRA 5P2ZA 1MT8A 2RKFA 5P0IA 5E5KA 4RCDA 2AVSA 1T7KA 2NTRA 5KR0A 4Y3NA 2AZCA 1FQ8A 3IGBA 5P1CA 4FS4A 2NMYA 2B60A 2A4FA 5P6MA 3OU4B 1ZPAA 2ZJNA 5OZMA 5BS4A 2WEBA 5P3UA 3OUAA 2I4UA 5OZUA 5P1LA 2AODA 1GNNA 1SDTA 4A4QA 4A6BA 5P0WA 1BBSA 1SGZA 4I0GA 5IS4A 1B6JA 5P1XA 2QD8A 5P12A 1FFIC 2OHLA 5PEPA 1IZEA 2OHRA 5P3KA 4Y5GA 1FQ4A 5ER1E 4Y3AA 2AVVA 4PPHA 3BXRA 5P4GA 2G1NA 5OZEA 1RPIA 1MUIA 1IVPA 2V16C 4NKKA 3FNSA 4HA5A 5P03A 1HTFA 3PMYA 1EPRE 2FGUA 2O4PA 5P1MA 4Y3JA 4OBFA 5P1OA 1M0BA 2V0ZC 3CICA 5DGUA 3ZKMA 1WBKA 1EBWA 3ZKNA 1G35A 5P0NA 3WZ8A 3UDRA 3HAUA 5OZOA 2VA6A 2HPFA 2WF0A 3OQFA 2XYFA 3S43A 5P7MA 3SA8A 3NU4A 4DJPA 5P8BA 5P1TA 3TKGA 5OZTA 1XL2A 2QMDA 5TOLA 3QVCA 5OZJA 5P2HA 1MTBA 5P4NA 4E43A 1U8GA 4X2LA 1F34A 1LYWA 4DPIA 5P4LA 5KOSA 5P8TA 3H5BA 5P6EA 5T4SA 3OU4A 1APUE 4S1GA 4OC6B 3PWRA 3LNKA 2HM1A 3I8WA 5P05A 4Y3TA 2IGYA 3OQAA 4OBHA 5P51A 3OXXA 3EM6A 1IZHA 4Y50A 3GGXA 2QI6A 5P3EA 2CEJA 3O99A 4IVTA 1NPAA 1TCWA 1HVSA 1HPOA 1BXQA 1N49A 3K1WA 3TPLA 1K2BA 5P4XA 2BKTA 5P3RA 5SZ9A 2QMPA 1TZSA 5P6OA 2QU3A 1YM4A 5P4DA 5P6PA 5OZGA 2QCIA 5P0MA 3UHLA 3SACA 4FE6A 3ZPTA 2BQVA 4N00A 3QIHA 5CONA 1Z8CA 2ER6E 5P46A 4ZPEA 3VLBA 2PH8A 5P4CA 2FXEA 4Y6MA 1UH9A 1WBMA 4H3FA 4R93A 5P41A 1MSMA 3BXSA 1D4HA 4Y47A 5P5SA 3UQWA 1QS8A 2OHKA 5P4IA 4ZSQA 4Y35A 3ZKIA 3NU3A 5OZCA 1ENTE 5P13A 2G20A 5OZHA 4Y3SA 4DQBA 1ZAPA 5P5CA 2QNQA 3AIDA 1AIDA 3PRSA 3EL1A 5P7HA 4DUSA 3EKQA 4J1KA 3VF5A 3PLLA 4YBIA 3OTYA 5P19A 4RVIA 3QROA 2G1RA 2O4KA 2R5PA 5P35A 3LPIA 5P5OA 5P58A 2WF4A 5P80A 3G70A 2QAKA 4J1IA 1QBSA 3U7SA 3ZKQA 1W50A 1LYAB 5P0JA 2PSGA 3FNTA 4MC9A 5COKA 1PSNA 5P0QA 3Q5HA 5P2AA 3VLAA 4FSLA 1QBUA 4F74A 5P8EA 1EBZA 2OHUA 5P5UA 1D4JA 3NUJA 2FDPA 1META 5P4HA 4L7JA 1HOSA 3IAWA 4YHQA 4EJDA 3S53A 1SP5A 3IVHA 5P3ZA 2Q11A 1C6ZA 5P7XA 4I1CA 1MESA 2JXRA 3B7VA 5P28A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1YTJ A;  5P17 A;  2XYE A;  2AZ8 A;  4OD9 B;  2IQG A;  5P15 A;  2XFJ A;  1FG6 C;  1W5X A;  1DW6 C;  1DIF A;  5P1B A;  4BEK A;  5DR8 A;  3VYD A;  2FMB A;  1OHR A;  5P6N A;  1YX9 A;  3PJ6 A;  1DMP A;  1AXA A;  5E5J A;  4Z50 A;  3R4B A;  1T7I A;  4HE9 A;  2BPX A;  2FDD A;  5P69 A;  2P3D A;  3UTL A;  5P8M A;  1PSA A;  5P7B A;  5P3X A;  3UDJ A;  4ZEA A;  5P4S A;  3LIQ A;  4L1A A;  3NR6 A;  5P6Z A;  4R95 A;  1D4K A;  2BBB A;  5P81 A;  4PEP A;  1LF3 A;  1CMS A;  4TVH A;  4I0I A;  5P3G A;  4M8X A;  3INE A;  4ACX A;  2BPV A;  3FV3 A;  2RMP A;  5P8Q A;  3RSX A;  2R3T A;  1HVR A;  4J55 A;  3C9X A;  3D1Y A;  5P2N A;  5P7D A;  5P4W A;  4CP7 A;  5P0V A;  1SIP A;  1Z1R A;  5P78 A;  1LF2 A;  3EKP A;  4TRZ A;  4EP3 A;  2I4Q A;  3URJ A;  4GJC A;  4OBZ B;  3KT2 A;  4Q1N A;  5HDV A;  3PCW A;  5OYQ A;  2QMG A;  2P3B B;  3ZPS A;  3VSX A;  2R8N A;  4EYR A;  3UCB A;  1HXW A;  5P2R A;  4Y3L A;  3BUH A;  3ZMG A;  5P6J A;  1FEJ C;  3BHE A;  8HVP A;  4DJU A;  4AUC A;  1K1U A;  3QPJ A;  3OXW A;  3GGA A;  5HE5 A;  1TSQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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