The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
64
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystallographic and Spectroscopic Studies of Peroxide-Derived Myoglobin Compound II and Occurrence of Protonated Fe(Iv)-O
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen transport
|
| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| total genus |
64
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-05-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1BZP A; 1YE0 A; 2GKM A; 1CBM A; 1SDK A; 3PI1 A; 1S69 A; 2G0R A; 4NI0 B; 1RSE A; 2GNV A; 3GDJ B; 3WCW B; 1NS6 B; 5EYS A; 5CND A; 1CQX A; 4M4A B; 4U8U A; 4NK2 A; 5F2A A; 3G53 A; 1GCW B; 1HLB A; 2VEB A; 1UX8 A; 1GLI B; 2RAO A; 2LH3 A; 2B7H B; 3VRE B; 2W6Y A; 1VRE A; 4MXL A; 2MGA A; 3A59 A; 1S0H B; 1F65 A; 1IRD B; 1YE2 A; 3ZJM A; 3QJE B; 1YIH B; 3G4W A; 3PT8 B; 5EE4 C; 1YOI A; 2MGF A; 4HSW A; 4MQJ A; 1JL6 A; 3K3U A; 1VXF A; 1V75 B; 1A0U A; 2PEG A; 3UGY A; 1K1K A; 1HJT A; 2O5M X; 4F68 A; 5E29 A; 2W31 A; 3AQ9 A; 1IT3 A; 5CHQ A; 1Y45 A; 3PIA A; 1BZ1 B; 1ABS A; 3IC2 A; 1LH7 A; 1MYJ A; 4KMW A; 4OOD A; 4MQI A; 1SPE A; 3KMF A; 1JEB B; 1CP0 A; 5HLU A; 1YGD A; 2ZS0 B; 2C0K A; 2QSP A; 3W4U B; 2ZS1 B; 4DWU A; 3NMM B; 3M38 A; 1MLU A; 3UHT A; 2ZFB B; 2BLH A; 4HHB A; 3AQ8 A; 3FH9 A; 1HAB B; 3VRF A; 1JW8 A; 2D60 A; 1YG5 A; 1HGC A; 2VLX A; 3D4X A; 3DHR A; 2NX0 A; 1HBA A; 1Y0C B; 1COH A; 1FN3 A; 1DUO A; 3BOM B; 3EOK A; 3PI8 B; 4FH7 A; 2XKI A; 1MOB A; 2VRY A; 1YEO A; 2W72 C; 2H8F A; 5JDO E; 1Y2Z B; 4HRT A; 3RGK A; 2BLI A; 3G4Y A; 3QZX A; 2DHB B; 1MLG A; 1VXG A; 2E2Y A; 5CNG A; 1DWR A; 2GKN A; 3OZU A; 1DXT A; 1S6A A; 3UHS A; 101M A; 4G51 B; 3RJ6 A; 4F6I A; 1QXE A; 2HBS B; 1XYE B; 2MGG A; 1N9I A; 3GLN A; 3ECX A; 1V4W A; 3A0G A; 2HCO B; 1GVH A; 1DXU B; 2MYE A; 1QI8 B; 1XZ4 B; 4LPI A; 5M3S A; 1NIH A; 1Y01 B; 3PI4 A; 4ROM B; 1YEV B; 3U3E A; 1DO3 A; 1MOA A; 1C40 B; 3AG0 A; 1Y7Z B; 3EU1 A; 3UHB A; 1Y83 B; 1MCY A; 3GQR B; 1S5Y B; 3D1K B; 3HYU B; 3QMA A; 1NPG A; 1OUT B; 4MQK A; 1CG8 A; 2R80 A; 3LB3 A; 1HV4 A; 2HHE B; 3S1I A; 1VXH A; 1SPG B; 3GK9 A; 1O1I A; 3BCQ A; 1YHU B; 2VEE A; 1HBB B; 1LA6 A; 3KMF C; 1YVT A; 2ZWJ A; 1HBH B; 1MLR A; 3PI9 B; 2V1F A; 1O1K B; 2DC3 A; 5MBA A; 5ILE A; 1X46 A; 2GL3 A; 3VRG A; 1G9V A; 1X9F B; 1Y09 B; 1KFR A; 3ODQ A; 1Y4P A; 2DN3 B; 2GTL D; 4U8U B; 5CNE A; 2GLN A; 2RAO B; 1Y4R A; 3D1A A; 1CO8 A; 1MBC A; 1BZ0 B; 3UHN A; 1A9W E; 1FHJ A; 2QMB B; 1MNI A; 4C44 A; 4MQC B; 4UZV A; 4NXC A; 1YE2 B; 3ARL A; 3IC0 A; 2VYW A; 3EDA A; 3M39 A; 4WCH D; 3MKB A; 2EKU A; 1XXT A; 4MQJ B; 2QFN A; 1YHR A; 4B4Y A; 1O1N B; 1BUW A; 1YFF A; 2PEG B; 2GNW A; 3GKV B; 1Y4B B; 2MBW A; 107M A; 1HBS B; 2G0X A; 1LFV B; 1Y31 A; 1XZU A; 2AA1 A; 1WLA A; 2H35 A; 2HBC A; 1BJE A; 3OZV A; 1Y5J A; 1Y8W B; 1GBV B; 3RJN B; 1G0B B; 3ARK A; 4L7Y A; 2D5X B; 1DXV A; 1U7R A; 1KD2 A; 1AJ9 B; 3G4V A; 4QAU A; 1MYM A; 1ABY A; 3UHI A; 2DN1 A; 3ZJR A; 5ILP A; 3IA3 B; 1YGD B; 3WCT C; 3ZJQ A; 2QSP B; 1JZM A; 4X0L B; 5D5R A; 1YEU A; 1YHE A; 1Y4F B; 1EBT A; 5EE4 D; 3WCW A; 1NS6 A; 1TES A; 4M4A A; 1B86 A; 3NML A; 3WFU A; 1GCW A; 112M A; 3PT7 B; 1C7C A; 1GLI A; 2ZT0 A; 3D4X B; 3DHR B; 2B7H A; 3VRE A; 1HBA B; 1CMY B; 4H07 A; 3QM9 A; 3EOK B; 4N7P B; 1S0H A; 1UC3 A; 1IRD A; 1YEO B; 1SDL B; 3D17 A; 2GRF A; 1MYZ A; 3QJE A; 3PT8 A; 2MGH A; 4HRT B; 3UHD A; 1NAZ A; 1GDI A; 1G09 A; 1NPF A; 2XKH A; 2Z8A A; 2LH7 A; 1EW6 A; 1QSH B; 1MLS A; 1V75 A; 1A0Z B; 1JPB A; 2D6C A; 1DXT B; 1Y0T A; 2O5B X; 1QXE B; 109M A; 1MWC A; 3G4R A; 1BIJ B; 1HDB B; 3DR9 A; 3UBV A; 3ECL A; 5HLX A; 1NZ4 A; 1Y7C B; 5IKS A; 3LHB A; 1YDZ A; 1MLN A; 3ZJP A; 1MTI A; 3BJ3 A; 1GBU A; 1HV4 B; 3GYS A; 1Y35 A; 2ZS0 A; 3W4U A; 3MVC A; 1H1X A; 3NMM A; 2YRS B; 1J7W B; 5CNF A; 2VHB A; 2ZFB A; 1IOP A; 1CIO A; 3A2G A; 1LA6 B; 1CQ2 A; 4UUR A; 3TM3 A; 1YVT B; 4M4B B; 3ZJS A; 1HAB A; 1LH2 A; 1GCV B; 2BW9 M; 3S1J A; 1M9P B; 5F0B A; 3HC9 A; 1Y0W A; 2D2N C; 2OLP A; 3V2V A; 3UGZ A; 2ZT4 A; 5EU2 A; 4NI1 B; 3BOM A; 3PI8 A; 1BZ6 A; 1RTE A; 1NQP A; 1V9Q A; 4TYX A; 3WCV C; 1RQA B; 3DUT B; 2FRF A; 3M3A A; 4KJT A; 1FSX B; 2D2M C; 1FDH G; 3E55 A; 3HRW A; 2W6V A; 1R1Y B; 3UH7 A; 1XQ5 B; 3NFE A; 3WCU C; 1DTI A; 2MGK A; 3ED9 A; 1FHJ B; 1RTX A; 3WFX A; 2HBD A; 3S66 B; 1JF4 A; 1CH4 A; 4ESA B; 2LH6 A; 3IC0 B; 3UBC A; 1Y0D B; 1CH2 A; 1QI8 A; 1YHR B; 3ORD A; 3B75 A; 2R4Z A; 4ROM A; 1BUW B; 1C40 A; 1Y7Z A; 1Y83 A; 3AT5 A; 5JDO F; 1S5Y A; 3D1K A; 3HYU A; 2AV3 A; 3G4U A; 1DLY A; 1Y31 B; 2AV0 A; 2ZSZ A; 2AA1 B; 1V4U A; 1IRC A; 2R4X A; 4AVE A; 1SPG A; 2QU0 B; 2G0S A; 4MAX A; 1F5P A; 1DXV B; 4O1T A; 1HBB A; 1KD2 B; 1LFZ B; 3UH5 A; 2CMM A; 1HBH A; 3PI9 A; 3G4Q A; 1O1K A; 2ZS1 C; 2MB5 A; 1Y4V B; 4O4Z A; 1YEU B; 2WTH A; 1X9F A; 1YHE B; 1Y09 A; 4MBN A; 1MYF A; 3GQP A; 2DN3 A; 1B86 B; 1BIN A; 1MOD A; 2G10 A; 3HXN A; 3TM9 A; 1GZX B; 1QPW B; 3M3B A; 5EQM A; 1C7C B; 102M A; 1PBX A; 1BZ0 A; 1O1P A; 2QMB A; 4MQC A; 1JF3 A; 3D17 B; 2BK9 A; 1G09 B; 1THB A; 4N8T B; 2R50 A; 2G11 A; 3GOU B; 2ZT3 A; 2AUR A; 1O1N A; 2BLJ M; 4IRO A; 3MJP A; 3GKV A; 1Y4B A; 1Y0T B; 2HBG A; 1HBS A; 1LFV A; 4MU5 A; 1XZ2 A; 3R0G A; 5CN4 A; 1CLS B; 1DO4 A; 1MLJ A; 3WCT D; 2MYD A; 1Y8W A; 4MPM A; 3CY5 B; 1GBV A; 3QJB B; 1G0B A; 4F6D A; 1YCB A; 2D5X A; 1OR4 A; 1YDZ B; 1AJ9 A; 2Z6S A; 1NZ5 A; 1Y8K A; 3BJ3 B; 1C7B B; 1GBU B; 1LFT B; 4L2M A; 1YHU C; 1R1X A; 2QLS B; 4VHB A; 1BBB B; 3GYS B; 1S56 A; 1Y35 B; 3EDB A; 1CH3 A; 2ZFO C; 4X0L A; 1XZ5 B; 4MQG B; 2BWH A; 1Y4F A; 1LUE A; 1A9W A; 3IXF A; 1BZZ B; 3WI8 A; 1XZV A; 2O5O X; 1VXE A; 1RVW B; 4F6G A; 3PT7 A; 3AQ6 A; 3AQ7 A; 1Y0W B; 3OJ1 A; 1Y85 A; 1CMY A; 3QZZ A; 4TWU A; 2D5Z B; 2R4W A; 1EBC A; 1WMU B; 4N7P A; 4U8U C; 1NQP B; 1SDL A; 1O1M A; 3HEO A; 2FAL A; 5C6E A; 1UX9 A; 2FAM A; 5EET A; 3HRW B; 2W6V B; 1YMC A; 1QSH A; 104M A; 3NFE B; 1A0Z A; 3NL7 A; 1OFK A; 2VYZ A; 2HBD B; 2OHB A; 3ZOM A; 1BIJ A; 1HDB A; 5CN9 A; 5CMV A; 1Y7C A; 1LH5 A; 1V5H A; 3B75 B; 1UVY A; 3FS4 B; 3OZW A; 1MYT A; 2EKT A; 2ZSR A; 3AT5 B; 1HRM A; 2HHB A; 4KN3 A; 1J40 B; 1VXD A; 1V4U B; 1DKE B; 1MLL A; 2D2N D; 3OO4 A; 1HBG A; 2V1K A; 2Z6N A; 1A6G A; 5KKK A; 1NZ2 A; 2YRS A; 1J7W A; 1MOC A; 2SPO A; 3WCV D; 1XCH A; 3H58 A; 1C7D B; 1OJ6 A; 1Y4Q B; 1Y5K A; 1Y8I A; 2D2M D; 1G08 B; 1MNJ A; 4C0N A; 2Z85 A; 4M4B A; 1M6C A; 3QM8 A; 1GCV A; 3NG6 B; 2MYA A; 3UHX A; 1JZK A; 3WCU D; 3OK5 A; 1M9P A; 2MGB A; 1XZ7 A; 2SPM A; 1UMO A; 5CN6 A; 4NI1 A; 3UHZ A; 2G0V A; 3QM5 A; 1Y4G B; 3UHU A; 5EUI B; 1RQA A; 3DUT A; 2G12 A; 1JL7 A; 2ZSS A; 1UVX A; 2NRL A; 3GQP B; 3ARJ A; 3SDH A; 1FSX A; 1YH9 B; 1BAB B; 4FH6 A; 3HXN B; 1O1O B; 1R1Y A; 1IDR A; 2ZSQ A; 3HHB A; 1XQ5 A; 1PBX B; 1O1P B; 3GQG B; 1MLK A; 5JGG B; 4F4O A; 1PMB A; 3S66 A; 4ESA A; 1BVD A; 2H8D B; 1Y0D A; 2W72 B; 4KMV A; 1THB B; 1ASH A; 3UHQ A; 4IRO B; 3MJP B; 2HHD A; 3A9M A; 2VM0 A; 1XZ2 B; 2ZSX A; 1FSL A; 2ZS1 D; 1FDH A; 1LTW A; 3HEP A; 4XS0 B; 3PI3 A; 3O89 A; 1YEN B; 2QU0 A; 4F6F A; 1LHS A; 3LR9 A; 4B3W A; 1LH1 A; 4HRR B; 4N7O B; 5E6E A; 1LFZ A; 1Y8K B; 3MYM A; 2EB9 A; 1LH6 A; 1DO7 A; 1R1X B; 1Y4V A; 2DN2 A; 3UHV A; 1MBD A; 1ITH A; 2FRJ X; 1MZ0 A; 3UHG A; 1Y7G B; 1XZV B; 4FWZ A; 5AZR A; 4GZG A; 2W6W A; 1DXC A; 1GZX A; 1IBE A; 3LQD B; 1QPW A; 1HLM A; 1L2K A; 2ZSY A; 2V1I A; 4NZI A; 5EV5 A; 1Y85 B; 3HF4 B; 2AUQ A; 1MLO A; 1VXB A; 4YU3 B; 1XY0 B; 1O1M B; 5C6E B; 1CO9 A; 5ILM A; 4N8T A; 1S61 A; 3WHM A; 3GOU A; 2EB8 A; 2ZLW B; 4ODC B; 1SI4 B; 3NL7 B; 3E4N A; 4ROL B; 2ZLU A; 2ZT1 A; 1T1N B; 1CLS A; 1YHU D; 1MNK A; 5ILR A; 2OH9 A; 106M A; 2ZFO D; 4ILZ A; 3UH6 A; 2GTL A; 1NEJ B; 1A6M A; 3CY5 A; 3QJB A; 1CH7 A; 2GDM A; 1ECA A; 1AZI A; 1MTK A; 3VHB A; 1M6M A; 2LH5 A; 1HDS B; 3D7O B; 1B0B A; 2HHB B; 3BA2 A; 1LJW B; 4H2L B; 2V1H A; 3LB2 A; 1MNH A; 1C7B A; 1OBM A; 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1YOG A; 1J3Z A; 2MGC A; 1O1O A; 1MWB A; 1IBE B; 1J7S B; 4NXA A; 2MGM A; 1QXD A; 3GQG A; 5JGG A; 2D2N B; 1VWT B; 1BVC A; 1MLQ A; 5HU6 A; 1Z8U B; 3O7N A; 3BJ1 B; 2M6Z A; 2H8D A; 2W72 A; 3WCV B; 2G14 A; 1LFY B; 3WHM B; 2D2M B; 3WFW A; 2WTG A; 5CN5 A; 1WVP A; 1NXF A; 4O35 A; 3WCU B; 1FAW A; 2MGL A; 2V1E A; 3WFT A; 4MBA A; 7HBI A; 2EVP A; 4PQB A; 2ZLU B; 2ZSP A; 5CN8 A; 3OVU C; 5CN7 A; 2BNL A; 1MLM A; 1MYI A; 108M A; 4XS0 A; 2GTL B; 1YEN A; 2Z6T A; 2HBE B; 1UT0 A; 1O1L B; 4HRR A; 1HAC B; 2MGE A; 5KDQ A; 4N7O A; 2EF2 A; 3WR1 A; 1MBA A; 1HCO B; 2XKG A; 6HBW B; 1J3Y B; 1J7Y B; 6HBI A; 2RI4 B; 1AJG A; 1Y22 B; 2NSR A; 4DC7 A; 2OH8 A; 4MQH B; 1LH3 A; 1LFQ B; 5JDO C; 1Y7G A; 1I3D A; 1Y8H B; 1GDJ A; 3UHC A; 5EOH A; 3P5Q B; 3LQD A; 1X9F C; 1HGA B; 3PEL B; 1S5X B; 2WY4 A; 1U7S A; 3DHT B; 3HF4 A; 4YU3 A; 4BJA A; 1XY0 A; 3K8B B; 1MBI A; 2LH1 A; 2V1G A; 1NS9 B; 1YMA A; 2ZLW A; 4ODC A; 1SI4 A; 1CH9 A; 3LR7 A; 2FRI X; 4ROL A; 1A3N A; 1AJH A; 2ZST A; 3QQQ A; 1T1N A; 2OHA A; 5SW7 B; 2O5S X; 5AB8 A; 3UH3 A; 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