The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
GMERGIVQYDFMAESQDELTIKSGDKVYILDDKKSKDWWMCQLVDSGKSGLVPAQFIEPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| publication title |
Structural Genomics of Yeast SH3 Domains
rcsb |
| molecule keywords |
CYTOSKELETON ASSEMBLY CONTROL PROTEIN SLA1
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| total genus |
12
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| structure length |
60
|
| sequence length |
60
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-05-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LCS A; 2ROT A; 3C0C A; 1W1F A; 3EG1 A; 4CC4 B; 1Y0M A; 1ZLM A; 2DMO A; 2CSQ A; 1T3L A; 4A63 B; 2SRC A; 1SHG A; 2HDA A; 2J05 A; 1QWE A; 2HBW A; 1J3T A; 2RF0 A; 2FPE A; 1X6G A; 1GRI A; 2O2O A; 2DYB A; 2FRW A; 1I07 A; 4ZNX A; 4RTV A; 4D8K A; 1WDX A; 4HVW A; 1ABO A; 1WI7 A; 2ENM A; 2M0Y A; 3RBB B; 2DL8 A; 3M0P A; 2VVK A; 1HD3 A; 4CC2 A; 2GQI A; 4X1V A; 4DEX A; 2J7I A; 2CT3 A; 1NEG A; 2BZY A; 3H0F A; 2VKN A; 1NG2 A; 1QLY A; 1ZX6 A; 3TSW A; 4OML A; 1I1J A; 3H0I A; 2C0I A; 1JU5 C; 2EYX A; 1YWO A; 1MV3 A; 2RQV A; 3UA7 A; 5IHI A; 1UFF A; 2EW3 A; 2CH4 A; 1AWO A; 1GCQ A; 1MV0 B; 1S1N A; 3VRZ A; 1XOV A; 3M0T A; 3VS1 A; 4JJC A; 3THK A; 3UAT A; 1UTI A; 2O9V A; 1PNJ A; 2EPD A; 1UG1 A; 1K0X A; 1JO8 A; 4GBQ A; 1OPL A; 1U5S A; 1U06 A; 1OPK A; 1UDL A; 1E6H A; 4E6R A; 1YP5 A; 1YN8 A; 3EG3 A; 1WYX A; 3KFV A; 1I0C A; 1TG0 A; 2CUD A; 3UA6 A; 4Z89 A; 4KRT A; 4GLM A; 2YDL A; 2CDT A; 1KFZ A; 2VWF A; 2KYM A; 2B86 A; 2RNA A; 2JM8 A; 5FW9 A; 2ABL A; 1AWJ A; 2KEA A; 1WFW A; 5IXF A; 1AD5 A; 4OMQ A; 2JXB A; 3PE0 A; 2YUQ A; 5GJV B; 1H92 A; 2LQN A; 1VA7 A; 2KBT A; 1WLP B; 1T0H A; 2BZX A; 4AG2 C; 5IXB A; 1KIK A; 1UGV A; 2W10 A; 2L3Q A; 1X2K A; 2DE0 X; 4JZ3 A; 2D1X A; 1VYU A; 2JS2 A; 2C0O A; 2H8H A; 2L3S A; 2W0Z A; 3GBQ A; 2F2W A; 4RTW A; 4LE9 A; 2J6F A; 5IHK A; 2GBQ A; 2FEI A; 2O9S A; 1H3H A; 2FG0 A; 3VS6 A; 4HCK A; 2A36 A; 1ARK A; 4J9B A; 2DA9 A; 2K79 A; 1H8K A; 2EGA A; 1BBZ A; 1N5Z A; 3I5R A; 1PWT A; 2FPF A; 1WXT A; 1PRL C; 3EHR A; 2LJ1 A; 1CKA A; 1AWX A; 1OOT A; 1BU1 A; 4JJD A; 1PRM C; 2M51 A; 4AFU C; 1SSH A; 3FJ5 A; 2NUZ A; 2JMA A; 4WCI A; 2PNI A; 2DL3 A; 1M3C A; 1RI9 A; 2JW4 A; 2DL5 A; 2OAW A; 1AZG B; 3M0Q A; 4DEY A; 4F17 A; 3VS4 A; 1ZUK A; 4LN2 A; 3REB B; 1OEB A; 4IIO A; 2YUN A; 2EGE A; 1K4U S; 1JQQ A; 1TUD A; 4OMM A; 1K1Z A; 1E7O A; 4CC3 A; 2DRM A; 2F2X A; 3CQT A; 3O5Z A; 4AFZ C; 2K6D A; 3M0S A; 4LUD A; 2IIM A; 2KXC A; 2KXD A; 4K11 A; 2RMO A; 1W70 A; 2EQI A; 2KRM A; 3PVQ A; 1ZUY A; 1K0S A; 4OMO A; 2JM9 A; 2CSI A; 1RUW A; 2DX1 A; 4J9C A; 3EG2 A; 2C0T A; 2DF6 A; 1UE9 A; 2FPD A; 1U3O A; 2P4R A; 1WIE A; 4RTZ A; 2KE9 A; 2JT4 A; 1HSQ A; 3NMZ C; 1GFC A; 4EIK A; 2F2V A; 4F16 A; 3IQL A; 4HXJ A; 1E6G A; 3NGP A; 1YCS B; 1X27 A; 2ED0 A; 2KRO A; 3SHW A; 3VS0 A; 1W6X A; 1ABQ A; 4OMN A; 2NWM A; 3ULR B; 3NPF A; 4J9D A; 2KNB B; 2JTE A; 3I35 A; 3I5S A; 1NLP C; 2JMC A; 1SHF A; 1GBQ A; 4RTY A; 2D8H A; 2I0N A; 1NM7 A; 3VS5 A; 4J9I A; 1Z9Q A; 4RUG A; 1UHF A; 1M3B A; 5I11 A; 1ZSG A; 2KR3 A; 3NHN A; 4LNP A; 1YNZ A; 2EKH A; 2HCK A; 5L23 A; 1FYN A; 2BTT A; 2DNU A; 2PTK A; 1EFN A; 1K9A A; 2EYZ A; 1LCK A; 3R6N A; 4JPB W; 1TUC A; 1SRM A; 2HSP A; 1GBR A; 2EYW A; 2L2P A; 1BB9 A; 1QKW A; 2AKL A; 1T3S A; 1WX6 A; 1JEG A; 1T0J A; 1QWF A; 2MCN A; 1K76 A; 4ORZ A; 1GFD A; 1KSW A; 2DL7 A; 2YT6 A; 1NEB A; 2LJ0 A; 1HJD A; 2DIL A; 1WXB A; 2LJ3 A; 1Y57 A; 2CH4 W; 1OV3 A; 2A37 A; 2PZ1 A; 5FWB A; 1CSK A; 3QWY A; 1AEY A; 2AZV A; 2V1R A; 4AG1 C; 1G2B A; 2KT8 A; 4FSS A; 2X3X D; 1BK2 A; 1YWP A; 3EG0 A; 4Z8A A; 1Z9Z A; 2DRK A; 1AVZ C; 2AK5 A; 1GL5 A; 1M30 A; 1M3A A; 4R0K A; 2A28 A; 1MUZ A; 2JS0 A; 2QDL A; 3EGU A; 1SEM A; 2DVJ A; 3VS7 A; 2K7A A; 2GTO A; 4J9E A; 5ECA A; 1QKX A; 3TSZ A; 2D8J A; 5IHN A; 4M4Z A; 2RQU A; 2D0N A; 2EVR A; 2DBM A; 5IH2 A; 1JXO A; 2KT1 A; 1AWW A; 2LMJ A; 1JXM A; 1IO6 A; 5EC7 A; 3VS3 A; 4JJB A; 3VS2 A; 3REA B; 1G83 A; 1X6B A; 2XMF A; 4LUE A; 2DLP A; 1PHT A; 2KRS A; 2ESW A; 1RLQ C; 2LX7 A; 5HCK A; 4J9F A; 2HEQ A; 4CC7 A; 3M0U A; 2MIO A; 2L0A A; 4RTX A; 4JZ4 A; 3H41 A; 2E5K A; 3ZL7 C; 4F14 A; 1A0N B; 1ZUU A; 1X43 A; 2SEM A; 1NYF A; 2CUB A; 2DBK A; 2V1Q A; 1PKT A; 4QT7 A; 2LQW A; 4OMP A; 2GGR A; 4IIM A; 2O31 A; 2YUP A; 2LP5 A; 2X3W D; 1RLP C; 2GNC A; 2ROL A; 2FRY A; 2EBP A; 2RQT A; 2L3P A; 1UJ0 A; 1UUE A; 4HVU A; 3I9Q A; 1X2Q A; 1QCF A; 4J9H A; 4J9G A; 2YSQ A; 1M27 C; 1B07 A; 4Y92 A; 1KJW A; 2ECZ A; 2YUO A; 4Z88 A; 1X69 A; 2G6F X; 4AFS C; 3H0H A; 3U23 A; 2AKK A; 2J6K A; 2DL4 A; 1SRL A; 1AOJ A; 1UEC A; 2OJ2 A; 4AFQ C; 1FMK A; 2K2M A; 3RNJ A; 2RN8 A; 2BZ8 A; 2K3B A; 4ESR A; 1B3Q A; 3EHQ A; 3M0R A; 1V1C A; 1WA7 A; 2OI3 A; 4HVV A; 1GCQ C; 2FO0 A; 4D8D A; 1M8M A; 1ZBJ A; 2RQW A; 2ED1 A; 2GTJ A; 3SEM A; 2KGT A; 2CRE A; 2A08 A; 1GCP A; 3A98 A; 2K9G A; 5GJW B; 2J06 A; 3UF4 A; 1CKB A; 1NLO C; 5FWC A; 2EYY A; 1VYV A; 4RTT A; 1UJY A; 1SPK A; 1PKS A; 3PVL A; 2AZS A; 2DJQ A; 2CT4 A; 3JV3 A; 2EGC A; 5I22 A; 2MOX A; 2LNH B; 3QWX X; 3VRY A; 2DM1 A; 2J6O A; 2LZ6 B; 1UHC A; 2KRN A; 2O88 A; 1AZE A; 2RPN A; 3TVT A; 4RTU A; 1WXU A; 1NYG A; 2RQR A; 2KYB A; 1VYT A; 3LH5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2ROT A; 2X51 A; 1W1F A; 1MGQ A; 1ZLM A; 4EMK B; 2DMO A; 4A63 B; 3CCL Q; 4M77 D; 3M57 A; 1XJW B; 1TTH B; 2HDA A; 2R58 A; 4XU3 A; 2DYB A; 2DKG A; 1KD1 U; 4RTV A; 4KH0 B; 4JRP A; 3X28 B; 2VUB A; 3FC3 A; 4HVW A; 2MK5 A; 1WI7 A; 2E3H A; 3PFS A; 2QA4 T; 4BY6 B; 4CC2 A; 1K8A C; 1VQ4 A; 2GQI A; 3PNW C; 4LDY A; 1WJQ A; 5FU7 C; 3MKD A; 5GAN e; 1KQ2 A; 3JB9 J; 1DJ7 B; 3HP9 A; 2QEX T; 3MP1 A; 4LD9 K; 1ZBX A; 4OML A; 5IAY A; 1JU5 C; 1MV3 A; 4PJN A; 5KYX A; 2CH4 A; 1W2B S; 3OYF A; 1GCQ A; 1MV0 B; 4CRI A; 1VQK Q; 3VRZ A; 1QVF P; 3C12 A; 3VS1 A; 4JJC A; 3LW5 E; 3R6O A; 3CPW P; 1UTI A; 3CCU T; 1UG1 A; 1JO8 A; 2DK3 A; 5A2Q E; 3E9G A; 1YHQ T; 3C4S A; 2LT4 A; 5D6W A; 1WQW A; 1OPL A; 1U5S A; 3PTA A; 4C8Q A; 5FRN A; 1YP5 A; 2HNI A; 3EG3 A; 1WYX A; 5GAM f; 4OP0 A; 4JS4 A; 2CUD A; 5KE2 A; 3UA6 A; 3TCJ A; 3JCM c; 3RER A; 2V26 A; 1QVF A; 4M75 E; 3OA6 A; 2R5M A; 2L8D A; 3CC2 A; 4BE1 A; 2CDT A; 1X75 C; 1IHW A; 2HKQ B; 5D6Y A; 5IXF A; 3BE3 A; 3MP8 A; 2NUT A; 4DOW A; 3FB9 A; 4UC4 A; 1VQM T; 3C95 A; 2LQN A; 2WSF E; 1C0M A; 1WLP B; 1T0H A; 1M5Q 1; 3VV0 A; 2KSS A; 1KIK A; 2W10 A; 5A0G A; 5CR2 A; 1VQ7 T; 1ZA2 B; 5KYX B; 2IPO B; 4X9D A; 2F5K A; 4EMG A; 1EX4 A; 4D6W A; 4WTO B; 2L3S A; 4C92 F; 2YWW A; 4LE9 A; 4C8Q G; 1I8F A; 2CZ7 B; 3CPF A; 5LJ5 f; 4M7D A; 1HYO A; 1X01 A; 4M7A D; 1ARK A; 4NS5 A; 1VQ5 A; 4J9B A; 2ZPH B; 1KD1 R; 3X26 B; 3MEA A; 2EGA A; 1WXT A; 7AT1 B; 3CC4 T; 3OYY A; 3CCV A; 1CKA A; 1OOT A; 2VC8 A; 1VQL T; 4F04 B; 1VQP Q; 1PC0 A; 3X25 B; 4ELY C; 3DB4 A; 4WCI A; 1M9S A; 4F7U A; 3I55 A; 2DTO A; 4PJO F; 2RM4 A; 1N27 A; 1QQJ A; 2DL3 A; 1RI9 A; 1AZG B; 3M0Q A; 1ZUK A; 3UPU A; 3CCL T; 1RI0 A; 2JTF A; 1TWB A; 2EGE A; 4C5G A; 4V2S A; 1K4U S; 1TUD A; 3C94 A; 1K1Z A; 1E7O A; 2RHX A; 1TUG B; 1ZSZ C; 4AFZ C; 1QVF S; 2K6D A; 2OTL Q; 1BI1 A; 3BDU A; 1D1A A; 3CPW S; 1W70 A; 2RK2 A; 5GAM g; 3OYN A; 1ZUY A; 2GCX A; 2COZ A; 4M7D G; 2JM9 A; 4LDU A; 1JRI A; 2DX1 A; 5GAO q; 1KQ1 A; 3QYH B; 3CME T; 2DF6 A; 4RKU E; 2DIQ A; 2FPD A; 2HZY A; 3P8D A; 3T9N A; 3QDR B; 1WIE A; 4M77 E; 1TH7 A; 4RTZ A; 1BCO A; 4E2F B; 3OYC A; 1E6G A; 3CXC A; 3NGP A; 1Y71 A; 3FEO A; 3H6Z A; 4F7U G; 4PFZ A; 4QVD A; 4AT1 B; 3HRT A; 4BDY A; 1VQ7 A; 4E7J A; 3TQ7 P; 2NWM A; 4JUV A; 3ULR B; 3A8L B; 3NPF A; 4J9D A; 2DER A; 2JTE A; 1RAI B; 4PJL A; 1GBQ A; 1SKU B; 4RTY A; 2D8H A; 2FZG B; 5LJ5 g; 1K9M R; 1UB4 A; 4MZM A; 1O75 A; 1I4K 1; 2QDY B; 3OYA A; 4LDV A; 4QQG A; 2EKH A; 3G1J A; 1QP2 A; 2KK4 A; 5GAN 2; 2PTK A; 1VQO T; 1K9A A; 2QI2 A; 3OYM A; 1W4S A; 1SRM A; 1YBY A; 1TSF A; 2L2P A; 1BB9 A; 2DZ9 A; 5LJ3 j; 2WAC A; 3CCL A; 4ORZ A; 1B34 B; 2DL7 A; 1NEB A; 3CD6 T; 3JCM f; 2X35 A; 3KBG A; 1WXB A; 3FRN A; 2LJ3 A; 2K5F A; 1C6V X; 2CH4 W; 2PZ1 A; 2MWP A; 4N0A C; 1M4Z A; 2KT8 A; 2E4H A; 2X3X D; 2VV5 A; 2DTI A; 1Z9Z A; 1AVZ C; 1GL5 A; 4BY6 C; 5KCH A; 2JS0 A; 2LTO A; 1IHV A; 1RAD B; 3DLM A; 4QVC A; 4XU2 A; 1QKX A; 4A4H A; 1RAC B; 5GAN 4; 4HKE A; 1S72 Q; 3EFO B; 2RI3 A; 3RMS A; 2LQK A; 4MMK A; 3QBY A; 4M75 G; 3CCR Q; 5IH2 A; 2XID A; 2KT1 A; 3OYB A; 1FX7 A; 4BDZ A; 1VQK A; 2ZPI B; 1BI3 A; 1SG5 A; 4XTY A; 3QPH A; 3HPW A; 2MI6 A; 1G83 A; 2E64 A; 1FMV A; 2KRS A; 3URG A; 4JLG A; 2QGF B; 4J9F A; 2HEQ A; 2BIV A; 3M0U A; 2L0A A; 3L2W A; 5GAN 8; 2CP2 A; 4F14 A; 5FU7 B; 1D1B A; 1M90 C; 1YIJ T; 3OSS C; 3PMI A; 1VQ8 T; 1WQ7 A; 2V1Q A; 1PKT A; 2AHJ B; 1PD1 A; 2RHY A; 2GGR A; 3TEE A; 2LP5 A; 4C0Z A; 2GNC A; 4FW2 A; 4ELZ C; 1Q7Y U; 2G3R A; 2JJ9 A; 2RI5 A; 2X4J A; 1UUE A; 4HVU A; 1RAF B; 3QSU A; 1QCF A; 2V8K A; 4KT0 E; 2VXF A; 1KJW A; 4YTL A; 3V8J A; 4TVR A; 2RJD A; 2DL4 A; 3JRZ A; 1SRL A; 4OB3 B; 5HY6 A; 2OJ2 A; 4M77 A; 4AMC A; 4C5E A; 2RN8 A; 3HFN A; 2LQ8 A; 5HK0 A; 3M53 A; 3S3M A; 2K3B A; 2DIG A; 2JVV A; 3AHU A; 4EDU A; 3JB9 F; 4L5G A; 4ANJ A; 3M0R A; 1KHI A; 1RAA B; 2EIF A; 3EG9 A; 3D7S B; 2DXT A; 3OS5 A; 1Q81 R; 2CZ6 B; 1GCQ C; 2DYI A; 2QQB A; 3MHX A; 5KYW A; 2ED1 A; 4N4H A; 2KGT A; 2ZPG B; 2A08 A; 2E5Q A; 1WJR A; 2YLB A; 1U8R A; 2M02 A; 1WHJ A; 4R55 A; 3QO3 A; 3QZ9 B; 1IGQ A; 5GJW B; 2KVQ G; 1UGQ B; 4P5N A; 2EYY A; 4XTV A; 1M2V A; 1VYV A; 4BI3 A; 4C8Q C; 2YLC A; 5A0L A; 3JCM J; 2DJQ A; 1Y96 B; 4KH1 B; 3SWN A; 8AT1 B; 2ZPE B; 1VQP A; 3OBY A; 5I22 A; 2GFA A; 1RAE B; 3M5A A; 3QWX X; 2JOY A; 2LZ6 B; 3RIR A; 3EFR A; 2KRN A; 3A8O B; 2K3X A; 2RPN A; 2JNG A; 4M77 G; 3TVT A; 1LVK A; 1QW1 A; 1F1B B; 2RQR A; 2KYB A; 1OI1 A; 1VYT A; 2LCS A; 3C0C A; 3EG1 A; 3OYJ A; 1Y0M A; 2QA4 Q; 2EQM A; 2CSQ A; 4BAC A; 2SRC A; 1SHG A; 1VIF A; 2FVU A; 4NL3 A; 1J3T A; 3OYK A; 1YIJ A; 2OTL A; 2K5L A; 3AT1 B; 1GRI A; 2O2O A; 2QEX Q; 4N4G A; 1WHM A; 4ZNX A; 3RKX A; 3OY9 A; 3CBM A; 2KAF A; 2QXF A; 4JDS A; 3JCM W; 1ABO A; 5KYY A; 2ENM A; 1O9S A; 2P0K A; 4M78 D; 3RKY A; 5LJ3 d; 4E7S A; 4HA8 A; 4M75 D; 3OSV A; 2I2L A; 4X1V A; 4E47 A; 4M7D C; 3JB9 I; 2XU8 A; 3UT1 A; 2CT3 A; 1NEG A; 5FLX E; 3CCU Q; 2VKN A; 2YRV A; 1YHQ Q; 4FSX A; 1NG2 A; 3TSW A; 1V76 A; 1M2V B; 1PM3 A; 2D0Q B; 3CCR T; 2EYX A; 3ME9 A; 4B9X A; 1FMW A; 1VQ6 T; 4RCB A; 1ZSZ B; 1Q7Y R; 5LJ3 h; 1OX9 A; 4A4G A; 4QKU A; 4DA4 A; 2CP7 A; 5KYU B; 4KUL A; 2MWO A; 2E1H A; 1XOV A; 1WHG A; 1R0C B; 3UAT A; 3VJP A; 5DLO A; 1PNJ A; 3EFS A; 2CGH A; 4M7A A; 4GBQ A; 4XAX B; 4II1 A; 3PIO A; 1N8R U; 1E6H A; 4E6R A; 1VQM Q; 5CKD A; 3MEV A; 3KFV A; 2M1H A; 4XTX A; 2EJG A; 3CCE T; 3GPL A; 2K2V A; 1Y07 A; 3E9F A; 4Z89 A; 2VGM A; 2Y4Y A; 2YDL A; 4J5Y A; 3LGL A; 2KYM A; 2B86 A; 2RNA A; 3OYI A; 1AWJ A; 3RUX A; 4FYV B; 1BCM A; 2JXB A; 4DQ2 A; 2NYS A; 2BZX A; 3VUB A; 3DB3 A; 3MET A; 3OS1 A; 3EGD A; 3CC4 Q; 2DE0 X; 1VYU A; 1VQL Q; 4M7A G; 2AIR B; 2W0Z A; 3E2U A; 1ZHI A; 2J6F A; 1H3H A; 1VQ9 T; 1S72 A; 3CCJ T; 1U1S A; 2R5A A; 2K79 A; 3CCR A; 4IUR A; 3A1P A; 1PCX A; 2DZC A; 3CCM T; 3EHR A; 2YRD A; 4GY5 A; 4JJD A; 5LJ3 e; 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