The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
GMERGIVQYDFMAESQDELTIKSGDKVYILDDKKSKDWWMCQLVDSGKSGLVPAQFIEPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural Genomics of Yeast SH3 Domains
rcsb |
| molecule tags |
Structural protein
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| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| molecule keywords |
CYTOSKELETON ASSEMBLY CONTROL PROTEIN SLA1
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| total genus |
12
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| structure length |
60
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| sequence length |
60
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-05-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ZBJ A; 2KXC A; 4HVW A; 3REB B; 1SPK A; 2M0Y A; 4IIO A; 1E6G A; 2F2W A; 2RF0 A; 2YSQ A; 1AOJ A; 1JO8 A; 2A28 A; 2DM1 A; 4F17 A; 1V1C A; 2JMA A; 3O5Z A; 2K9G A; 1WYX A; 2GTO A; 5IHK A; 1PKS A; 1JU5 C; 1NYF A; 1M3B A; 2C0T A; 1RUW A; 2LJ0 A; 4LE9 A; 2LZ6 B; 1AWO A; 1U06 A; 1NEG A; 1B3Q A; 2A36 A; 2AKL A; 2CH4 A; 1G2B A; 1Y0M A; 2C0I A; 2D8J A; 2O31 A; 4JPB W; 5HCK A; 3SEM A; 1PHT A; 2KT8 A; 5I11 A; 1S1N A; 3PE0 A; 2EW3 A; 2O9V A; 2GBQ A; 4ESR A; 1AZG B; 3EHQ A; 4CC4 B; 4OML A; 2EBP A; 2YT6 A; 4Z89 A; 2CH4 W; 4CC2 A; 4F16 A; 1HD3 A; 2OAW A; 1NEB A; 2PZ1 A; 4LUE A; 1PKT A; 2K79 A; 2L2P A; 4GBQ A; 1KIK A; 3UAT A; 3VRY A; 4AFZ C; 1TUC A; 1UEC A; 2LMJ A; 3VS1 A; 4RUG A; 1K0X A; 4A63 B; 1X69 A; 1OPL A; 4J9D A; 2W0Z A; 2EYW A; 1UGV A; 1UJ0 A; 5I22 A; 1YWO A; 2KXD A; 2RN8 A; 1B07 A; 4RTX A; 2J6F A; 2K3B A; 2FRW A; 1PRL C; 1T3L A; 1AD5 A; 3EG3 A; 4HVV A; 1ZSG A; 4RTU A; 3M0R A; 1H3H A; 5IHN A; 1N5Z A; 1AEY A; 1UE9 A; 1X2K A; 2LCS A; 2L3S A; 4AFS C; 2YDL A; 4OMQ A; 2HCK A; 1X6B A; 4RTZ A; 3I9Q A; 2IIM A; 5EC7 A; 2H8H A; 1MV3 A; 2DNU A; 2EYY A; 5IXF A; 1GCQ A; 2LQW A; 1Y57 A; 3REA B; 2MOX A; 2HBW A; 4RTY A; 1PNJ A; 3SHW A; 2ECZ A; 1AWJ A; 2RQU A; 2ESW A; 3UF4 A; 1RLP C; 1TUD A; 3RBB B; 1LCK A; 2ED1 A; 3QWY A; 2J7I A; 1GL5 A; 2RQW A; 1VYT A; 4J9I A; 2D1X A; 1QKW A; 1ZX6 A; 1E7O A; 2X3X D; 2CSI A; 2HDA A; 2YUQ A; 2FG0 A; 2JW4 A; 1OOT A; 2K6D A; 2ABL A; 2AK5 A; 1W1F A; 3VS6 A; 2KYB A; 3H0F A; 3I5R A; 1RI9 A; 1CKA A; 1HSQ A; 2DJQ A; 1UFF A; 2LJ3 A; 2KGT A; 1K4U S; 1VA7 A; 4LNP A; 2DX1 A; 2ROT A; 1GRI A; 3VS3 A; 2J6O A; 3NPF A; 1ABQ A; 2F2V A; 3M0S A; 2CUB A; 2JS0 A; 1TG0 A; 1I07 A; 2CDT A; 2EPD A; 2M51 A; 1QWE A; 2KYM A; 1GBQ A; 2B86 A; 3QWX X; 1WIE A; 2FO0 A; 4KRT A; 1SHF A; 5FWB A; 1VYU A; 1UHC A; 2KNB B; 4J9C A; 2KE9 A; 1IO6 A; 4OMO A; 1WXB A; 4J9G A; 1GFC A; 3EGU A; 3NHN A; 2EQI A; 2EKH A; 4HCK A; 1VYV A; 2CT3 A; 2GQI A; 4JJC A; 2YUO A; 2CSQ A; 2KR3 A; 1T0J A; 2RQR A; 2DBK A; 1I0C A; 2KBT A; 2DLP A; 2AZV A; 2RMO A; 2DRM A; 1E6H A; 4J9B A; 4Y92 A; 2OI3 A; 2K7A A; 3A98 A; 3H0H A; 2LNH B; 1SRL A; 2L3Q A; 2RPN A; 1NLP C; 2EGA A; 3RNJ A; 1X27 A; 2VWF A; 1OPK A; 1MV0 B; 2DBM A; 1SRM A; 4ZNX A; 5FW9 A; 1WI7 A; 3EG2 A; 1M27 C; 4AG2 C; 2RNA A; 1A0N B; 1AWW A; 2EYZ A; 3I35 A; 1HJD A; 2P4R A; 2DF6 A; 3M0T A; 1G83 A; 1NG2 A; 2ROL A; 2L0A A; 4D8D A; 2JS2 A; 2DVJ A; 1PRM C; 4OMP A; 1U5S A; 3C0C A; 3PVL A; 4E6R A; 1AZE A; 4JZ4 A; 1U3O A; 2A08 A; 1H92 A; 3EG0 A; 2E5K A; 1NYG A; 1UTI A; 4DEX A; 1YNZ A; 1Z9Z A; 2JMC A; 2JM8 A; 4OMM A; 3NMZ C; 2KRN A; 2D0N A; 1AWX A; 1WLP B; 1H8K A; 1KSW A; 1W6X A; 2O9S A; 2O88 A; 4R0K A; 1BBZ A; 3IQL A; 1GCQ C; 1I1J A; 1JXO A; 2DRK A; 2X3W D; 3VS4 A; 4RTW A; 2BZX A; 2J06 A; 2V1R A; 3GBQ A; 2MCN A; 4GLM A; 1T0H A; 2PTK A; 1X43 A; 1ABO A; 1OEB A; 2C0O A; 1JQQ A; 3JV3 A; 1ARK A; 2CT4 A; 1ZUU A; 2KRM A; 2FPF A; 2LX7 A; 1M3A A; 2G6F X; 4ORZ A; 1JEG A; 3EG1 A; 2DIL A; 4EIK A; 1CSK A; 3THK A; 1KFZ A; 1UJY A; 5ECA A; 3H0I A; 1X2Q A; 2FRY A; 2LP5 A; 1Z9Q A; 4OMN A; 3R6N A; 2LQN A; 2VKN A; 4D8K A; 1K1Z A; 2BTT A; 2GTJ A; 3VS7 A; 2CRE A; 5GJV B; 3TVT A; 3VRZ A; 4IIM A; 2EGC A; 3EHR A; 4DEY A; 1GBR A; 1EFN A; 1WX6 A; 1RLQ C; 1QWF A; 2RQT A; 1UG1 A; 1YWP A; 2BZ8 A; 2BZY A; 3M0P A; 5IHI A; 2CUD A; 3VS2 A; 2FPE A; 1KJW A; 2A37 A; 3M0Q A; 2RQV A; 1GFD A; 4K11 A; 2AZS A; 1ZLM A; 4Z88 A; 2KT1 A; 1X6G A; 1YCS B; 1SSH A; 1BK2 A; 2YUP A; 5IH2 A; 5GJW B; 1K76 A; 2HSP A; 5FWC A; 2KRS A; 1W70 A; 1UUE A; 1YP5 A; 2NUZ A; 3ULR B; 2V1Q A; 1ZUY A; 4JZ3 A; 2YUN A; 3ZL7 C; 1NM7 A; 4J9F A; 1WA7 A; 1BB9 A; 2K2M A; 4QT7 A; 4X1V A; 4WCI A; 4AFQ C; 2KRO A; 2J6K A; 2D8H A; 4F14 A; 4RTT A; 1J3T A; 2FPD A; 2F2X A; 3LH5 A; 3PVQ A; 2JXB A; 2DA9 A; 1XOV A; 3NGP A; 1SHG A; 1YN8 A; 1MUZ A; 1WXU A; 4HXJ A; 4J9H A; 3KFV A; 2JT4 A; 2L3P A; 1K0S A; 1WXT A; 2O2O A; 2EGE A; 4AG1 C; 3TSW A; 4JJB A; 1QCF A; 2GGR A; 2DYB A; 1OV3 A; 1K9A A; 3U23 A; 4LN2 A; 1UHF A; 3VS0 A; 2AKK A; 1WFW A; 4AFU C; 1NLO C; 3FJ5 A; 2DL7 A; 1ZUK A; 1UDL A; 2J05 A; 1CKB A; 1PWT A; 2W10 A; 1QLY A; 2NWM A; 2LJ1 A; 4CC3 A; 2SEM A; 2EVR A; 1BU1 A; 4HVU A; 2DE0 X; 4FSS A; 1M8M A; 2KEA A; 2QDL A; 4J9E A; 1AVZ C; 1FYN A; 2DL5 A; 1WDX A; 1M3C A; 2MIO A; 2VVK A; 2JM9 A; 1JXM A; 3UA7 A; 3I5S A; 1QKX A; 3TSZ A; 2GNC A; 2JTE A; 3CQT A; 4JJD A; 1M30 A; 4M4Z A; 2EYX A; 2DMO A; 1GCP A; 2ED0 A; 3H41 A; 1T3S A; 4LUD A; 2OJ2 A; 5L23 A; 2DL8 A; 2I0N A; 2HEQ A; 3M0U A; 4Z8A A; 1FMK A; 2PNI A; 5IXB A; 2SRC A; 3UA6 A; 2DL4 A; 4RTV A; 2XMF A; 2FEI A; 2DL3 A; 3VS5 A; 2ENM A; 4CC7 A; 1SEM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2HKQ B; 2QEX Q; 1PD1 A; 4RMO A; 3OYA A; 5GAM e; 4F7U G; 1VQ7 Q; 4OB3 B; 3CC4 T; 2L8D A; 2I2L A; 1KG1 A; 1E6G A; 2ZPG B; 5LJ5 f; 3PT9 A; 4A4F A; 2PVG B; 1OU8 A; 1BI2 A; 2KQW A; 3HFO A; 3JSC A; 1PKS A; 3A8O B; 4KGX B; 2GFA A; 2KI7 A; 1VQP Q; 3CCU A; 4XU0 A; 5HK0 A; 2LZ6 B; 1AWO A; 1ZBX A; 1JJ2 A; 2A36 A; 3X26 B; 1Y0M A; 2D8J A; 4JPB W; 2DIQ A; 1PHT A; 1O75 A; 4A4H A; 4QKU A; 5GAN f; 1S1N A; 2CP5 A; 1EZZ B; 2DIG A; 2O9V A; 2GBQ A; 4ESR A; 7AT1 B; 4CC4 B; 3MET A; 4Z89 A; 3Q1J A; 4F16 A; 1HD3 A; 3FRN A; 2K79 A; 3M55 A; 2FZG B; 3VRY A; 2MWP A; 2HQX A; 1KQS S; 5LL6 S; 2JJ9 A; 5A0G A; 1UJ0 A; 2RN8 A; 1B07 A; 2JTM A; 3S6W A; 2K3B A; 1YIJ T; 4HVV A; 3EGD A; 5J39 A; 4ZTF A; 2FVU A; 4RTU A; 1N8R C; 2LT4 A; 2EJ9 A; 1YFN A; 3CCU Q; 3VUB A; 1UE9 A; 1Q86 C; 4JRI A; 3GPL A; 2L3S A; 5KH6 A; 1G3T A; 4DBF A; 2VC8 A; 4C0Z A; 3I9Q A; 2C06 A; 4M7A G; 5EC7 A; 1MV3 A; 1UEB A; 5IXF A; 3REA B; 5KE2 A; 2O4X A; 3VU3 C; 1N8R R; 2E64 A; 3SDZ A; 1PNJ A; 3V7C A; 2VUB A; 2ESW A; 1PSE A; 4J5Y A; 2FL7 A; 5CKB A; 1Q86 R; 2QG9 B; 5A2Q E; 3C4S A; 2K3Y A; 2KAF A; 2ED1 A; 2J7I A; 2X51 A; 2DXB A; 2GFU A; 3PGG A; 2MK5 A; 1E7O A; 3EGX B; 1WQ7 A; 4V2S A; 1KQS A; 2JW4 A; 2EQU A; 3CPW P; 2QA4 A; 4MZT A; 2K6D A; 1WJS A; 4JRQ A; 5GMK e; 2HNI A; 4OVA A; 3UPU A; 1Q82 C; 2KYB A; 3H0F A; 3JCM c; 4M7D G; 4QW2 A; 3DLL A; 5FU6 B; 2MAM A; 1GRI A; 1BCO A; 3FB9 A; 1R0B G; 3CCL T; 4Z02 A; 4R55 A; 4QVC A; 3P8B B; 1TWB A; 1D1B A; 3CBO A; 4C8Q E; 3OYG A; 2M51 A; 2ZPF B; 3JCM P; 3N5B B; 1V76 A; 1Q7Y C; 3G6E Q; 2FO0 A; 1Q82 R; 4KRT A; 2RI3 A; 4IUQ A; 1QVG P; 2KE9 A; 1VQ5 T; 2P0Q A; 3D7S B; 1WXB A; 3PMI A; 3E19 A; 3L2R A; 4C0D C; 4J9G A; 1GFC A; 3EGU A; 3CCM A; 1VQO T; 2EKH A; 3KUF A; 2NUP B; 2JVV A; 4HCK A; 1LNX A; 4JJC A; 3SFM A; 3VYH B; 2RQR A; 2DEQ A; 2X9H A; 3V8L A; 2R5M A; 2ZZD A; 3CC2 A; 1E6H A; 5DLQ E; 2QA4 Q; 4B9W A; 4KUD K; 4PJO G; 2ZPH B; 3RNJ A; 2YHT A; 1O9S A; 3LX7 A; 1SRM A; 4ZNX A; 4F7U E; 2CS7 A; 3QZ9 B; 3C12 A; 3RUX A; 3CCM T; 1NPR A; 4N4I A; 1HJD A; 1Q81 C; 1G83 A; 2QAZ A; 1RAA B; 4DQ2 A; 1M2O A; 4D8D A; 1MHN A; 1U5S A; 2QGF B; 2COZ A; 4PJM A; 3C0C A; 4BB7 A; 3JB9 F; 4LDV A; 4M78 A; 1RAH B; 2LNV A; 4M77 F; 1NYG A; 1Z9Z A; 2JMC A; 3G7Z A; 4M77 B; 2XG8 D; 4IUR A; 1W6X A; 2O9S A; 1YBY A; 2QQS A; 1BBZ A; 1H3Z A; 4JRP A; 3IQL A; 2M1H A; 3GLX A; 1JXO A; 2DRK A; 4TVR A; 3VS4 A; 4GY5 A; 4C5G A; 4RTW A; 3CC2 Q; 2J06 A; 1PM3 A; 3GBQ A; 2MCN A; 3OYH A; 1M9S A; 2E70 A; 2Y4Y A; 3CMA Q; 2FZK B; 3MPU B; 1ZUU A; 2KRM A; 2VV5 A; 2LX7 A; 5D7U A; 3INZ A; 3QPH A; 3L42 A; 4JJN K; 1NPP A; 4OB0 B; 1Z9Q A; 3FEO A; 4OMN A; 2OX7 A; 1KD1 C; 2NLU A; 4C92 A; 4D8K A; 1K1Z A; 5LJ5 e; 2CRE A; 1X01 A; 2DD5 A; 3EH2 A; 3G71 A; 1RAG B; 5EG2 A; 1RLQ C; 5KYU A; 2RO0 A; 2LDM A; 3A8L B; 5LJ3 h; 4F7U F; 1YWP A; 4M7A E; 1M1K U; 1VQ4 Q; 2CUD A; 4KGZ B; 1WGS A; 5KYX B; 4F7U B; 4JS4 A; 1KD1 R; 5I2M A; 1RAI B; 1GFD A; 2ZPB B; 2KT1 A; 1X6G A; 1YCS B; 1SSH A; 5GAN e; 5IH2 A; 2LTO A; 5FWC A; 1W70 A; 4EDU A; 4UC4 A; 1UUE A; 1M8V A; 1IGQ A; 1NJI U; 3L1A A; 4J8O A; 1YJN A; 1IXD A; 1BB9 A; 3E1S A; 1VQN A; 2D9T A; 4NL3 A; 3E2U A; 2HMA A; 2QK0 A; 4RTT A; 1IZ6 A; 1J3T A; 1MMN A; 2RK1 A; 2NUT B; 2A3L A; 1UGQ B; 4FYX B; 3NGP A; 1SHG A; 2RK2 A; 4M7D C; 3JB9 I; 2BKD N; 4C8Q D; 3MEU A; 2RHY A; 2CYZ B; 2O2O A; 3BFM A; 4HCC A; 2O01 E; 2JOY A; 3EG9 B; 4JJB A; 4C5I A; 4BY6 C; 1VQ6 A; 1K9A A; 2E3I A; 3QO3 A; 4LN2 A; 3G71 Q; 3EFO B; 3E9G A; 2DL7 A; 3AHU A; 2J05 A; 1YJN T; 4ELZ C; 2NWM A; 5FRM A; 3BW1 A; 4CC3 A; 2MI6 A; 2XKO C; 1WHH A; 1G3W A; 4XTW A; 1BI3 A; 4B6M A; 2ZGW A; 1QQJ A; 1M3C A; 2MIO A; 2VVK A; 3M53 A; 4PFZ A; 1VQ6 T; 2HL5 C; 3I5S A; 3TSZ A; 2GNC A; 1R0C B; 2JTE A; 3AT1 B; 3FIF A; 4A4E A; 1UGR B; 5CIU A; 4HT8 A; 1U8R A; 1VQN Q; 2EYX A; 5GAO l; 1GCP A; 4KH1 B; 3I55 A; 1T3S A; 2RJF A; 3CXC S; 4PJO E; 4FW2 A; 4X34 A; 2OJ2 A; 2P84 A; 2I0N A; 2HZY A; 1HK9 A; 5IAY A; 2HEQ A; 2LC4 A; 1YJW A; 2E3H A; 2QQR A; 3S3M A; 3CPF A; 1M2V A; 2F5T X; 2DL4 A; 2YLB A; 4N4H A; 2XMF A; 3H8Z A; 2FEI A; 2DL3 A; 2DFU A; 2FYK A; 1ZBJ A; 2KXC A; 1UGS B; 2LQ8 A; 1YHQ A; 2Y90 A; 3FJP A; 4YTL A; 2RB6 A; 3I55 T; 3SWN C; 3REB B; 2RF0 A; 1AOJ A; 3M56 A; 2A28 A; 2KDS A; 5HK3 A; 1U1T A; 1UGP B; 1M90 U; 2K9G A; 2M0O A; 1WYX A; 2GTO A; 3JCM J; 2LCL A; 1NYF A; 1RI0 A; 1M3B A; 2C0T A; 2M16 A; 3KXT A; 1D1C A; 4LE9 A; 1NJI R; 1BYM A; 4FYW B; 1U06 A; 1U1S A; 4FT2 A; 4WTO B; 2AKL A; 2M02 A; 1ZA2 B; 2C0I A; 3QSU A; 2O31 A; 2AT1 B; 1EX4 A; 5GAM g; 1YJW Q; 2KT8 A; 5I11 A; 1VOM A; 2EW3 A; 2M9U A; 1AZG B; 3RKW A; 3UT1 A; 2PZ1 A; 4LUE A; 3OYY A; 4GBQ A; 3JB9 G; 1WNL A; 4AFZ C; 4M7A D; 1YHQ Q; 4A63 B; 1X69 A; 3CCE T; 3BDU A; 4PJO F; 1M5Q 1; 4M77 G; 2W0Z A; 2EYW A; 1UGV A; 3H6Z A; 2ZPI B; 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