2V32A

Crystal structure of the c45s mutant of the peroxiredoxin 6 of arenicola marina. monoclinic form 2
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
220
structure length
220
Chain Sequence
b'GITLGEVFPNFEADSTIGKLKFHDWLGNSWGVLFSHPRDFTPVSTTELGRVIQLEGDFKKRGVKLIALSCDNVADHKEWSEDVKCLSGVKGDMPYPIIADETRELAVKLGMVDPDERTSTGMPLTCRAVFIIGPDKKLKLSILYPATTGRNFSEILRVIDSLQLTAQKKVATPADWQPGDRCMVVPGVSAEEAKTLFPNMEVKAVPSGKGYLRYTPQPKS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Crystal Structure of the C45S Mutant of Annelid Arenicola Marina Peroxiredoxin 6 Supports its Assignment to the Mechanistically Typical 2-Cys Subfamily without Any Formation of Toroid-Shaped Decamers.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PEROXIREDOXIN 6
source organism Arenicola marina
molecule tags Oxidoreductase
total genus 71
structure length 220
sequence length 220
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2007-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain2 2v32A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2v32A01
4N30A 4FO5A 2QSIA 2F8AA 2VM1A 1A0RP 1YKCA 2RUFA 3CTGA 1S3AA 3KGKA 3APSA 1JZOA 5J9BA 5E59A 4K1FA 3APQA 1DBYA 4ULXA 3ZMKA 1SYXA 1T8EB 1SJZA 3QDNA 4G10A 6GSWA 2I81A 1A2JA 2GQKA 2R4VA 2LV3A 1J9BA 2NTOA 13GSA 4LLRA 3ZL5A 4MPFA 5F05A 5J41A 3W6GA 1DE2A 5LD0A 3QCPA 3TKRA 3QPMA 3WT1A 2P0GA 3O6TA 5HFGA 2FWGA 4KW6A 4GQFA 2PU9C 5JCGA 3GNJA 1LBKA 2GTUA 3ZFBA 2PMTA 2RUEA 5L71A 3KEBA 4J57E 3UAPA 1OKTA 3ZMLA 3US3A 1AXDA 2ES7A 4EKZA 3QMXA 1OC8A 2YN1A 3ZYWA 2FA8A 2WRTA 3ZFLA 3KXOA 1F6MC 3D4MA 4PNGA 3P7XA 1PKWA 2HYXA 5G1KA 5IMVA 2VL2A 1Y6EA 1GTIA 1THOA 2GGTA 1JZWA 5HR1A 3TRPA 1F9MA 3GH9A 2C4JA 1LU4A 5ECLB 5FT3A 4F0BA 2BMXA 3TJFA 4PX1A 3FHKA 2C0FA 1A0FA 1TKDB 1BAYA 1JFUA 4I6XA 2VCWA 5IMFA 5DBQA 2OE1A 4OFTA 3ISOA 2O89A 1XWCA 1URMA 1XXUA 2VL9A 2K18A 3CTFA 3UJ1A 3VURA 3DD3A 1A8YA 2AV4A 4O5RA 4GCIA 4E8HA 4WEYA 2OACA 5CRGA 3DMLA 4F03A 1ERUA 4N10A 4QL9A 5G5FA 4NHWA 3G7JA 1BJXA 4HQSA 4MF6A 2FWEA 3ERWA 4XIHA 1T3BA 1QK8A 4TXOA 1TRVA 4RI6A 2IFQA 3LGCA 2GZPA 1NW2A 2XPDA 3KD0A 2GZYA 5IMZA 4GQCA 3VWXA 3G9BA 3IXRA 3UVTA 4ML1A 4MZWA 4FYBA 2VUPA 1MTCA 2IJYA 2FNOA 1FB6A 4PQ1A 3D5JA 1TRUA 3SWLA 1M2DA 2HFDA 3S9FA 3TDGA 4ACSA 5ECIB 3ED3A 1SENA 5ABRA 2CVKA 5ENUA 2VCVA 2V2GA 3LORA 4IHUA 2H6ZA 3TOUA 3CYNA 4GRFA 5H5QA 2WCIA 5KN0A 2JZSA 3PR8A 2LNTA 3U6VA 4HOJA 1GTUA 3KH7A 4N0ZA 1OE7A 5HR2A 1QGVA 2KHPA 2NBSA 3U5RE 2LUSA 3E3EA 2HZFA 2VCZA 2JZRA 4ZB9A 4ZIJA 2FGXA 2A2SA 3TKSA 3DEXA 1PGTA 2GSRA 3DKSA 1V9WA 5FHIA 2L5OA 3D22A 5GZZB 3I43A 4L8EA 1O8WA 3HD5A 5FWGA 1R7HA 3EMXA 3GMFA 1ERTA 4PUAA 1G7OA 4MABA 4KCEA 4RQXA 3MWHA 4ECBA 3PH9A 1VF3A 2DC5A 2B5EA 3TRQA 1HYUA 1XWAA 3HY2A 3UMAA 2MMOA 3FY7A 3N9JA 2VD1A 3EURA 2YANA 5AISA 2VL2C 4P3YB 2XBQA 4MPGA 2H73A 4OCFA 4K0GA 3KM6A 1USBA 4K8MA 5G5EA 1WOUA 2H75A 1X9SB 2J9HA 4DSSB 5ECMB 3VI5A 2X64A 4MZCA 1A8LA 4KAEA 3HVVA 5ECOB 1JZRA 2WGRA 1TI1A 2AUVA 3UARA 3IAS2 1PRXA 1O8XA 4AJ8A 4IJ3A 3CSIA 2P5QA 2O8VB 3F8UA 4K0NA 3O3TA 5DAKA 3LXZA 3KCMA 5IO2A 3LEFA 4GTUA 2LRTA 5DJMA 2OA7A 3F6FA 5GAND 2ON5A 2BTOT 4Q5NA 4K7OA 4NPBA 3C7MA 1PA3A 1XFLA 1ZMAA 3GH6A 2PVOC 5D9TA 2WULA 4I5QA 1CQHA 4K7IA 5EVOA 4MF5A 2R6KA 3ERGA 4MA9A 2BJXA 4Q5QA 2X8HA 3TGZA 2FD3A 1A24A 5AIXA 3FRCA 2DIYA 4MCUA 2VOCA 4NAXA 1ZGNA 2L6DA 2LRCA 1BYEA 5DDLA 1O6JA 2I4AA 1VF4A 4CW9A 3HHVA 3QD9A 1KEBA 2FHEA 2P5RA 3HKRA 1NM3A 1H4OA 4ZL7A 5E4WA 1OVNA 1TRWA 3EE2A 4ZL9A 2H01A 3HZ8A 1Z5YE 5EPFA 4WBJA 4X1UA 1YQ1A 5B8AA 1EP7A 4POMA 1G6WA 3ZITA 1TW9A 5J9CA 1ON4A 1K0DA 1XWKA 2H1GA 2AYTA 1M7TA 1XW5A 4NMUA 3TKSC 4KX4A 2X8GA 1GTAA 3Q18A 4YQVA 1EEMA 3IPZA 3SBCA 2GSSA 2LTKA 4XS4B 4GLTA 3NIVA 2HXKA 2YWOA 5IPGA 1W4VA 2YZHA 3HDCA 5ID2A 3KMNA 1N8JA 3HJPA 4IP6A 5DCHA 1R5AA 3KZQA 1U6TA 2FWFA 1GSEA 6GSXA 2CAQA 2GDRA 1SL2B 5ID2B 2E2GA 5G2ZA 4KB3A 1K3LA 1XBSA 1T1VA 3GKXA 1PX7A 3GTUA 4L5OA 5F8BA 2GLRA 4TW5A 4I97A 3C8EA 4YAVA 1GUMA 2YWNA 4OFMA 4EL1A 3D21A 1EWXA 3IK9A 2WFCA 6GSYA 1XCCA 2YZUA 5A4UA 4IN0A 2C3TA 2AJQB 4QQ7A 2F9SA 4TRXA 2DJ3A 4OO5A 4GSTA 2FWHA 2H1DA 4AJ6A 3GX8A 5ECKB 5ELAA 2ZNMA 1V57A 2DIZA 2M80A 1Z9HA 2K8VA 2VCXA 3LQ7A 4XS1A 4HS1A 2TRCP 1JZDA 2PPTA 4JBBA 3CSJA 3Q74A 4D73B 1B8XA 5F07A 3DXBA 2KLXA 17GSA 2JU5A 4O7HA 4WKWA 3ZIJA 1PL2A 3EMPA 3DIEA 3WD6A 3L0HA 16GSA 4PNFA 2PERA 5JWRB 5ECQB 4BPYA 5DJLA 3HA9A 4K7NA 4NV5A 2HI7A 4HJ2A 1GUHA 4XRAA 5J3RA 3CSHA 2G0FA 2JSYA 5B8BA 3GKNA 1XWBA 1Q98A 4ZBAA 4NHZA 2LKUA 2XHFA 2VL3A 4J56E 4XCSA 5JWOB 3G7YA 5DCGA 2P31A 1JLWA 4IBPA 2HZEA 2LJRA 3TKPA 3IV4A 1V2AA 2R5GA 3N5OA 3WGDA 1E6BA 3F3QA 1NHYA 3EU4A 1O7UA 1TDIA 3GKMA 4ID0A 1EGRA 8GSSA 20GSA 1Z6MA 3GA4A 2DLXA 1T00A 3BJ5A 1G0TA 5A4VA 4Q5RA 2A4VA 3H8QA 1TK8B 1EOGA 2WS2A 1Y25A 2B5XA 4IVFA 4ZL8A 3J7Yk 2B1KA 4KDXA 4JZQA 1WP0A 3JCML 5GSTA 11GSA 1KNGA 3L4NA 1EZKA 1SKRB 2IN3A 2V6OA 1U87A 1W89A 2DJKA 4EO3A 2GS3A 4FYCA 1R4WA 3IAM2 2KP1A 3P8WA 4HI7A 1GSYA 1SL1B 3HVSA 2YJ7A 1K0NA 2QKEA 4X0XA 1ZL9A 1OC9A 4I8BA 5AIVA 3RPPA 2B3SA 3ZTLA 4F0CA 4PGTA 4BVXA 3D4TA 3HJMA 4GWRA 1QQ2A 2X99A 3ME8A 1OC9B 1C72A 2Z9SA 5IMCA 3FZAA 2R37A 1B4QA 4V1Ap 1TOFA 1QMVA 3EU3A 3PGTA 4LA1A 4MJBA 1RW1A 1DE1A 3GKKA 1HNCA 4TXVA 1AW9A 3VWUA 4K9ZA 4HQZA 1GSQA 3FR3A 1PL1A 1SJIA 1E2YA 1TI3A 2HT9A 1T4ZA 2R2JA 3QR6A 14GSA 3FZ5A 1K0BA 4TOPA 2DMMA 4MZBA 5CYYA 3E9JB 1ZOFA 1WIKA 3TKSE 2R3XA 2LSTA 4WBRD 1EEJA 1QFNA 3GRXA 4TXOB 1A23A 1FVJA 2CT6A 3EC3A 2IFQB 2WJUA 4IQ1A 3TJBA 4AJ7A 2CVDA 1SK2A 5ECNB 3GN3A 2AB6A 3OR5A 2GZZA 2AAWA 3CXGA 1GRXA 5AGYA 1TTZA 1FG4A 3APOA 3A2WA 1OYJA 3MNGA 4MH2A 4MMMA 4XS6A 1K0CA 3I9V2 1KTEA 2L59A 1UC7A 2H76A 2ON7A 5D8IA 1GULA 2LRNA 3QFAC 3UBLA 1T7PB 4EDYA 4Z7XA 3FR6A 2NVLA 2FLSA 2IWTA 4TR1A 2HSYA 5J5NA 2TIRA 5C00A 2CV4A 2N5FA 3F9UA 2DSAA 2H72A 2HE3A 3HJOA 1YY7A 4TR1B 1VGLA 4WF4A 1M9AA 4H86A 1MEKA 1SU9A 2PWJA 1XZOA 3C1SA 3D0ZA 4KSMA 5HFKA 5CP1A 2NDOA 2V1MA 4FH8A 5CAXA 1PKZA 1K3YA 5ECSA 2C8UA 2O7KA 2L5LA 1ERWA 1NSWA 3L9VA 4IJIA 1OE8A 4JU5A 2H71A 12GSA 4HDEA 3IDVA 3PINA 3WT2A 2EC4A 1X9MB 1X5DA 1AIUA 2JZTA 4EC0A 5LNKe 2AHEA 2FA4A 2RLIA 1FB0A 3C73A 3LYPA 3M9JA 1AC1A 5ECHB 3FZ4A 4XRDA 2C0EA 4F82A 2VAFA 2HRNA 3A5WA 1BQ7A 5F0GA 2L57A 5F06A 5DALA 5GAPD 4XHMA 5DAKB 2CZ3A 5CRDA 1FOVA 2N5AA 3C71A 3GUSA 4K2DA 1YF1A 4HUAA 2EIOA 4IS0A 18GSA 2OE3A 2I3YA 1KBNA 1K0AA 5EL8A 3AY8A 2RIIA 4WF5A 1B9YC 5IIZA 4ZBDA 1V40A 4HZ2A 2DMLA 2H8LA 2B5YA 4JEDA 2OADA 3GX0A 1XOBA 5ECRB 6GSSA 3EWLA 2I9HA 1R5PA 3IE3A 2RM6A 2C0GA 5IMDA 4LL4B 1O81A 4HZ4A 4ECIA 2JL4A 4POKA 7GSSA 2L6CA 1V58A 4KE3A 2K9FA 3FW2A 3QAVA 4IKHA 3VLNA 3TRXA 3Q6OA 4TN8A 4OWYA 1LJRA 3HZ4A 1SK0A 1DUGA 2IMIA 3KP8A 3MAKA 5JCWA 1ZYQB 5GSSA 6GSVA 1MDIA 3IK7A 1SYRA 1X0RA 1FAAA 2H1AA 3IR4A 2VLUA 3IA1A 2DJ0A 1CQGA 1MDKA 3IC4A 1FHEA 1FVKA 3UIWA 4ZILA 5D96A 3L78A 5IO0A 2YJHA 1WWJA 3FK8A 4K6XA 1F37A 2VIMA 5IOXA 5A5KA 3CRUA 4AGSA 3GTUB 1JLVA 4POLA 4MP4A 2PGTA 3VI7A 3LG6A 1IYHA 4PXOA 3LFLA 1SKWB 1JHBA 3RHBA 1NHOA 4HEA2 3CBUA 1GLQA 3VWVA 2B6MA 2MMAA 2FY6A 1EGOA 3IOSA 2H0GA 1Z7RA 2H74A 4ZB8A 4V2NA 4G19A 2QC7A 5IOWA 3NZNA 2CVBA 5JWQB 4EF0A 3VWWA 5H5SA 1UN2A 2NPBA 3DWVA 3TCOA 4MJCA 2LQOA 2MBSA 1ST9A 5HR3A 3FR9A 4ECCA 4F9ZA 5J4UA 6GSUA 2KP2A 5HR0A 2YWIA 4KDUA 5IPHA 4YQMA 22GSA 3FKFA 3K8NA 2RM5A 3J7Yb 3FZ9A 2YV7A 4TVEA 1FW1A 4OCEA 4LMVA 3HXSA 2PVQA 2V41A 5COHA 2JADA 3ME7A 4AF2A 3GL3A 5CRHA 4J2FA 4JR6A 3L9SA 3F3RA 1RQMA 2YCDA 2LJAA 3ZVJD 4V2MA 2I1UA 1B9XC 1VRSD 5DQSA 5C04A 3UOMA 2KUCA 2VM2A 3BOAA 1XVWA 5D9XA 2DBCA 5ELGA 4KSOA 1X9WB 1DSBA 2CX4A 2HZEB 4FYUA 3QAWA 4OFNA 1GNEA 3QOUA 1FO5A 2CZ2A 3EYTA 1M9BA 2FCHA 2X8CA 2G2QA 3GYKA 1WE0A 2YOIA 5JCUA 3M9KA 1YF0A 3UBKA 1SL0B 1GSFA 1ZCPA 4IQAA 2F3MA 1MD4A 1YKAA 2OBKA 1TU7A 1YZXA 1BX9A 1TXXA 2IMFA 2XC2A 5IM9A 1SK1A 2PBJA 4GSSA 5KN2A 3VK9A 3VPQA 3IHQA 1VF2A 2PN8A 4JE1A 4OO4A 4MDCA 1GSSA 5G1LA 2H19A 4RQRA 1XW9A 2IMEA 1TJDA 1BG5A 5IMAA 4IGJA 4L5LA 3RAZA 4WR5A 4BVYA 2C3QA 1G6YA 3ZIVA 1YEPA 1GL8A 2K6VA 4FIWA 4BL7A 4MH3A 1B48A 3V1WA 3DVWA 4LMWA 1N2AA 4OMVA 1QXHA 1RK4A 5G31A 2REMA 4CHSA 3RPNA 2JSZA 2YP6A 1YEXA 3ZLPA 3L9UA 4X43A 2FUG2 3H1NA 1HNAA 3I6AA 4HU7A 1HNBA 1MD3A 1ERVA 1YDKA 2LQQA 4KGIA 1I5GA 3M0FA 2GT6A 4MK3A 3A2VA 4DVCA 1X5EA 3F0IA 3ERFA 2MYGA 2MMZA 1MDJA 2OJLA 4MJEA 2ALBA 5D9VA 5CNWA 1XOAA 3GFKA 5KEJA 2PUKC 3TJGA 2QGVA 3F6DA 1GLPA 2B1LA 2GQMA 2HLSA 4NWYA 2CA8A 2DJJA 3M3MA 3WGXA 2CX3A 2C3NA 3LWAA 2CAIA 4WR4A 1AAZA 3DRNA 1S3CA 3EVIA 2LJKA 5HFIA 4MJAA 1K0MA 2ZCTA 3UL3A 4BA7A 3KJYA 3M8NA 4DEJA 2M46A 1GUKA 4V2LA 3TJJA 2V32A 3W8JA 3A3TA 4YQUA 1Z7PA 1THXA 3IBHA 2C80A 1S3DA 3LXTA 2DJ2A 2C1YA 2H70A 4RUVA 1TRSA 3BCKA 4O32A 1XWGA 2IL3A 2J23A 4EVMA 4IW9A 2GT5A 1Q4JA 1GWCA 4JRRA 4NXIA 2L4QA 1M0UA 2WZ9A 4TR0A 1WRYA 3KH9A 3BBYA 3TB2A 3EINA 4HJMA 2ZUPA 4BWSA 1IYIA 5AN1A 3WYWA 3M1GA 2VCTA 2N5BA 1GP1A 1SD9A 3KMOA 4GF0A 4QL7A 5EY6A 3IRAA 2VO4A 2E2MA 4POBA 3DYRA 4TKYA 2OKAA 3QFBC 1BEDA 2H6XA 1EOHA 19GSA 5B6NA 1K0OA 1HQOA 3HVXA 1PSQA 3ZREA 1O73A 2VCQA 3P2AA 5D9WA 4ISDA 4DSSA 3F4TA 1V98A 2CQ9A 1AQVA 2WDUA 1WJKA 1GH2A 5IQYA 2MMNA 1M2AA 3GHAA 4GXZA 4F2IA 3G7IA 4MF7A 3E0UA 2GQLA 2V6KA 4TR3A 5CRWA 4EE0A 2GSTA 4DSQA 3LYKA 2H6YA 4PUFC 1J08A 1HD2A 2K8SA 5A4WA 1PD21 2LNSA 2GVPA 1SKSB 4ECJA 1Z3EA 3DVXA 3WGEA 4DSRA 5HQPA 5CO3A 3H4KA 3ZVJA 3MSZA 2O87A 3I69A 1AQWA 2IPAA 1OAZA 3GV1A 2HNLA 4OD7A 4WETA 2XPEA 3MDKA 5H5RA 1WMJA 5DALB 3TJKA 2H0HA 1K3OA 1PN9A 4L0UA 5D93A 5B6MA 5DQYA 1M99A 2EIQA 4Q5FA 1O85A 10GSA 1PMTA 5LCZA 2YPMA 3QAGA 3C1RA 5G30A 4ILFA 1GSUA 3FEUA 1Z6NA 4V1Ag 1YJ6A 2H0IA 2H1BA 1ILOA 3VFIA 3BD2A 3GL5A 3O76A 1J0FA 3GSTA 1M2BA 1GSDA 4EDZA 9GSSA 1R26A 3P90A 4JR4A 3D6IA 3H93A 2KOKA 2YNXA 4YH2A 2VLTA 4G9HA 3W8SA 4O92A 4RI7A 3F4SA 2C0DA 3H79A 5ECPB 4ML6A 1ZYEA 5CREA 2LS5A 6GSTA 1TK0B 4XS4A 2HRFA 2MBTA 3ZZXA 1XW6A 2JACA 4TR4A 3TUEA 1AUCA 2L4CA 2YWMA 1OC3A 1GTBA 1AQXA 2DJ1A 4HU9A 3GSSA 3ZRDA 4I2UA 1SD8A 1XVQA 2O85A 2MZCA 3RHCA 4PQHA 3HYPA 4KDYA 4KUNA 5DVBA 4N0VA 3Q19A 1F3BA 1G7EA 1ABAA 4WXTA 4BWQA 2M72A 1SJ6A 2IIYA 4G2EA 1F3AA 4LL1B 2VD0A 1GNWA 2YV9A 3NOFA 1ACVA 4CDOA 4L0WA 3UVHA 3LJRA 4IELA 1A2LA 2HSHA 4PQIA 1I9DA 4XTSA 1UVZA 5KN3A 4N11A 3HCZA 1H75A 2E7PA 4YAPA 1EV9A 1X5CA 4IP1A 1PX6A 4PURA 4EUYA 2OBIA 3VPTA 2E0QA 1EV4A 1TP9A 1ZZYA 4KH7A 3KP9A 1XPVA 3A2XA 4GSNA 5INYA 5B7CA 1TU8A 1U88A 3RBTA 4D73A 1EP8A 3GIXA 2IMKA 2H66A 3GURA 1U3IA 1PQNA 2D2ZA 1ML6A 1WPIA 3FYGA 2XBIA 1XIYA 2EIRA 1U3AA 3KTBA 2LEGA 2WB9A 4MLYA 3UEMA 2VLVA 1T4YA 4KCAA 3LSZA 3R2QA 3BCIA 1UA5A 4ZBBA 2A2RA 2F8FA 3DGQA 3CRTA 5D73A 2B7JA 2OE0A 5KN1A 4ZB6A 1OKDA 3F4RA 1VF1A 2GSQA 3F63A 2H30A 2IMDA 3TOTA 4EXJA 4I2TA 3KTLA 1B4PA 1F2EA 2TRXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite