2V3QA

Serendipitous discovery and x-ray structure of a human phosphate binding apolipoprotein
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
376
structure length
376
Chain Sequence
DINGGGATLPQKLYLTPDVLTAGFAPYIGVGSGKGKIAFLENKYNQFGTDTTKNVHWAGSDSKLTATELATYAADKEPGWGKLIQVPSVATSVAIPFRKAGANAVDLSVKELCGVFSGRIADWSGITGAGRSGPIQVVYRAESSGTTELFTRFLNAKCTTEPGTFAVTTTFANSYSLGLTPLAGAVAATGSDGVMAALNDTTVAEGRITYISPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKGVVNGVAVEGKSPAAANVSAAISVVPLPAAADRGNPDVWVPVFGATTGGGVVAYPDSGYPILGFTNLIFSQCYANATQTGQVRDFFTKHYGTSANNDAAIEANAFVPLPSNWKAAVRASFLTASNALSIGNTNVCNGKGRPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords HUMAN PHOSPHATE BINDING PROTEIN
publication title Tandem Use of X-Ray Crystallography and Mass Spectrometry to Obtain Ab Initio the Complete and Exact Amino Acids Sequence of Hpbp, a Human 38kDa Apolipoprotein
pubmed doi rcsb
total genus 116
structure length 376
sequence length 376
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12849 PBP_like_2 PBP superfamily domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3qA02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 2v3qA01
3MZBA 1OLAA 4N6PA 3RGYA 3TODA 2RC7A 4IO4A 2PX1A 2QSXA 1UTHB 3JZJA 3UGWA 1JVXA 3E3KA 4OVJA 1B3LA 2DYXA 4OEUA 1YCJA 1B3HA 1I69A 2ONKE 3PUWE 2GHAA 3PMVA 2V3UA 4MLVA 4NE4A 2ZMBA 3T9HB 3MPLA 4MLQA 1OMPA 3CG1A 2DWIA 2F6PA 4NEDA 1H3DA 3FUZA 1XHYA 1LSTA 3SEXA 2R9JA 2V84A 5H8NB 4PQJA 3H6VA 1JEVA 4LP2B 5ICQA 1NNTA 3I5OA 2NXOA 4KYSA 3CRBA 5KCJA 4ZZAA 4GXAA 3U92A 1YPNA 3TTMA 3Q28A 3EF7A 1SW2A 5DTBA 5TP9B 3TTKA 2W7YA 2O1LA 4BDOA 3L6HA 1LFHA 3THIA 4JWOA 1B9JA 1LBCA 3DLNA 1A8EA 3KGCA 3PPNA 5JEIA 4BDQA 2F34A 2H9BA 2I4BA 3VLWA 4YKPA 3ZKLA 2H98A 5BUUA 4PFYA 4NWCA 2O84X 1ZBMA 2M8CA 3C4MA 4WEPA 2NOOA 3KOSA 1IIWA 4G8HA 1B51A 4QFPA 3TDJA 2X7QA 5AA2B 3BBRA 1OIBA 1MM7A 4Q0CA 1IITA 3T96B 1URSA 5H8SA 4HS7A 3PUVE 5FTHA 3LSLA 1KWHA 4ND9A 4YZZA 3O9PA 4KYDA 3O66A 1S7YA 1LBBA 3QK6A 4TLLB 5JTYA 4LQ2A 1B5HA 5FHOA 1AIVA 1MQIA 3H06B 1SYIA 3MVWA 1IEJA 3RN8A 4G68B 1D4NA 1N7WA 3BKIB 1B6HA 3TQWA 3Q25A 3PUZE 4DCXA 5IKBA 1II5A 2X26A 2UYFA 1UQWA 3IL1B 1DTGA 3OO7A 4R73A 1URDA 2Q2AA 1MPBA 1Y9UA 5A5XA 4ELOA 3CSBA 1SW5A 2HZKA 2H25A 4RK2A 2Y84A 4FORA 3OELA 2O69A 3UN6A 4DLDA 1XS5A 4JBZA 1A7LA 1QVSA 4N13A 5AA2D 1Y3QA 2HXWA 4MBPA 2R6GE 4OENA 4YB5A 4G8MA 3K1NA 4P0GA 3ZSFA 4AB6A 1IXIA 5L8DA 2XXRA 3GLBA 2B3FA 1MQDA 2DXYA 3T9VA 2V3QA 3KZGA 3RNNA 1S9TA 1LAGE 2RINA 3C33A 3QUFA 4EDPA 1NNFA 2AYSA 4GD5A 3ILTB 1LCTA 3K6UA 5AA4A 1LFGA 2P0SA 2YPNA 4ZEKA 1DSNA 3KJTA 3VDFA 1EU8A 1N0TA 3MQ9A 4YMAA 4HTGA 2HFBA 3SEUA 3Q26A 4FECA 1QJMA 3I3VA 4G4PA 4POXA 4Z7EA 3E4RA 4L17A 1B3FA 5ELVA 4R75A 4XKPA 1US4A 2O6AA 1IXCA 3VLUA 3A3UA 2QS1A 3A09A 4F31B 3W9VA 5AA1A 4NF6A 4BDMA 4OYVA 1FTOA 1A8FA 3IB1A 2DE4A 1FQEA 3OD7A 4GFRA 4GWOA 3S9EA 4DZ1A 3B7DA 4EUOA 2XX8A 3LUYA 5DT6A 5CMMA 1IQ7A 4OWDA 3KOTA 5HBCA 3N6UA 1MDQA 4G68C 3RT8A 4WXJA 4U23A 4C1TA 1P1OA 2I3VA 3FVNA 1SQYA 3GBAA 3K2DA 3ECRA 3HPIA 1T0KA 3U72A 3G3GA 3RTWB 4KFQA 4FEDA 1SW1A 5I58A 5B70A 2Z22A 4MFIA 1POTA 3CR9A 3K6WA 4ESWA 3LSWA 4GQOA 2I58A 5TPAB 4OFLA 2RCAA 3PD8A 4M1VA 4E0WA 1B58A 3L6GA 3VFJA 5AA3A 2DWHA 1P99A 5CMKA 4GOTA 5I56A 1MQGA 2XXXA 2GFEA 5JTYB 3K6XA 1BTJA 1WVJA 3FV1A 1TXFA 4KR5A 3LC8A 3VVEA 4RXLA 3S9LC 4KYEA 1LB9A 4PFUA 1HSJA 4QFOA 3CIJA 4RK9A 3T9UA 2RF1A 1NFTA 1ANFA 3C36A 5KDTA 1BKAA 1LB8A 2Y7RA 1Z7ME 4I8CA 4Q8RA 2DQVA 2I49A 5I2NA 4OERA 1MXUA 1MXWA 2DXRA 3SKPA 1DPEA 4Q5TA 2RKMA 2PVUA 1QUJA 1R9QA 3HHGA 1QUKA 5A5XB 4ZDMA 2DE2A 4R6YA 4H0WA 2PT1A 4AB5A 4G2ZA 2OJTA 4KI0E 3HCQA 5K2YA 3UIFA 4R9GA 2FA7A 2ZYNA 5L9SA 3GXAA 4C0RA 4F3GA 3KSXA 1N84A 4BDRA 2DSFA 1J1NA 4LZ7A 1D9VA 1IUDA 3P7IA 1PB7A 4BDNA 1HSLA 1JW1A 3V5AA 1ZU0A 1LCFA 3OSQA 4LVQA 3WAFA 5B7DA 3DELB 3CFZA 4ELRA 1Q35A 4ZEDA 5AA4B 4G77A 1JETA 1MDP1 3MAMA 5DEXA 2CMOA 4XIGQ 2UYEA 4ZEBA 5I2KA 1B52A 3ONMA 1MS7A 5ICTA 4JDFA 3TTNA 3OO9A 3HHFA 1O64A 3H3GA 4QSDA 3RTFB 3CFXA 5H8FA 3HSTA 1ZLQA 3KFMA 3G7WA 3JV9A 5L9OA 4ELPA 5DVJA 1NL5A 1SW4A 4GIZA 3JYRA 2O51A 2F7AA 1N76A 3U93A 3MZ1A 3O29A 4NF6B 4QRZA 4OZ9A 2Y7KA 4R2FA 4DE8A 3FD3A 1UTBA 2AL5A 2ANJA 1IZ1A 1I6QA 1A40A 5H8HA 2Z23A 1FQCA 3EN3A 3FZVA 1RKMA 2XX9A 3FVOA 3G3FA 1VE4A 4MF3A 5TU0A 3O97A 1TT1A 4NWDA 4O3BA 1BIYA 3R26A 3HV1A 3MWBA 3C32A 1LAHE 2UVIA 3OEKA 5H8QA 1I6BA 1R6ZA 3FIRA 4F3BA 1AMFA 3K00A 2FYIA 1ZTYA 3W15C 3D4GA 3IR1A 2HZLA 5FHNA 1LFIA 3SDFA 5I58B 5EHSA 2D3IA 1MXYA 4YB6A 3DP8A 2ONSA 4U2RA 4ISUA 1OVTA 3DP6A 3SETA 3E9XA 4IGTA 1VFDA 3M3KA 3KBRA 1H76A 1MY0A 4QFKA 4ZEIA 1GV8A 4OQOA 2DOJA 3T66A 1MH3A 2D21A 2ZYMA 3VXCA 4IY6A 1GR2A 1B7HA 2F8DA 4HCYA 4R2BA 2LAOA 3R7XA 3I6VA 4KPTA 2VD3A 4HCWA 4P11A 1B0LA 2DS9A 2V3TA 1JW5A 2ZNTA 4ZS9A 4MH5A 3H4ZA 1B0HA 1JVYA 2Z8DA 2I3WA 2B65A 3K6VA 5KDTB 1B5JA 3B6TA 3IO4A 4DCYA 3PGFA 4ECFA 5I2NB 1MY2A 4O3AA 4QF9A 5ITOA 4DIGA 5K2XA 3H03A 2R71A 3QYTA 1PBQA 1WODA 4I9DA 4KCDA 3RUMA 1DPPA 4OEVA 3U94A 1M5CA 4IY5A 3RY3A 3EHTA 1FQAA 3GBBA 3TTRA 2PBWA 4OMBA 3VE1B 2O7UA 1B40A 2NUVA 4JB7A 2I4CA 5CBSA 3V8XB 1B7ZA 3O28A 2REGA 1QKBA 2ZXTA 1SD3A 1MPDA 4TLMB 2F36A 3AXFA 2I6EA 2RCBA 3T93B 4GRKA 1UTHA 5JK4A 2VGQA 2H5YA 3K0VA 4GLIA 4NF5A 1BLFA 4I1DA 2KLFA 5I84A 3D4CA 1TFAA 3K1MA 3TEPA 5DEXB 5CM6A 3TZAA 2QPQA 4NF8A 5I2KB 3EHUA 2GRVA 1MPCA 2F5XA 2PMSA 3TELA 4JSDA 3OXNA 1VR5A 2G29A 5H8FB 3LBSA 1D9YA 1USYE 4RPNA 4JWYA 1FCKA 3RLFE 4OHNA 4X9TA 3IOTA 3MVXA 4EXKA 5KCJB 4PFWA 2Q88A 2BJJX 4YAHX 3FVKA 3O6HA 5KZTA 1XVYA 4LZ5A 2RC8A 3KG2A 1FTLA 3ILUB 3S9MC 3FXRA 3MJNA 4TQUQ 3H7MA 4FIMA 5CBRA 1NMUA 2QS3A 5EYFA 3F11A 2D5WA 3H6WA 1UTBB 4H8JA 2OLBA 3RPWA 3U8QA 4YMBA 3ODBA 4ZECA 1N04A 1AOVA 4POWA 3QXMA 4YICA 3TKDA 1ATGA 1B4HA 4OFOA 4X1BA 1MQJA 4NF4A 3C35A 4QFLA 1N3WA 3EQ1A 4F39A 5DYHA 1ZKBA 3MPKA 5H8QB 3LR1A 3PPOA 5LOMA 1QKAA 4PFTA 1LGBC 3K4UA 4LZ8A 1F9BA 2O68A 3UORA 3T9XB 1FTMA 1FW0A 1MQHA 3S9NC 1ZIUA 4YKJA 1MY3A 2A5TA 5FTIA 2X7PA 1OVBA 3QUJA 4ELQA 2QRYA 1Y4CA 1BP5A 5ITPA 4GXSB 2QJEA 4AQ4A 1B1XA 1JNFA 1H43A 3SESA 4G8NA 3MC2A 2F35A 4DXBA 4R6KA 1P1WA 2OWTA 3SEVA 3O6GA 1MM6A 4I62A 4F3SA 1MXVA 4IO6A 1H44A 2VD2A 1PEBA 2ALUA 4XTCQ 4RJZA 4ZZEA 1FTJA 1DTZA 2HEUA 3Q27A 2AIXA 1JQFA 2DE3A 3FGSA 3SEYA 4DXCA 4YU0A 4KCCA 1MRPA 3B6QA 4GVOA 1QULA 1B3EA 4R9FA 3OEMA 4YB7A 4E0XA 2E1SA 2UXAA 1QW0A 4X1DA 2F6GA 1RYOA 4WKMA 3DM0A 2XXPA 2THIA 3G3IA 3PU5A 2IA4A 2XXTA 3TQLA 2QMXA 2HQ0A 5CRYA 1POY1 4QFNA 4O3CA 3TAJA 1A99A 3S2VA 1WDNA 4H5GA 1PB9A 3V89B 3B6WA 1CE2A 4U21A 5F1QA 2B3BA 3WAEA 1B32A 3CFLA 5I57A 2O1MA 4HW8A 3U1OA 1L5TA 2XXHA 2QMWA 5EHMA 2HAUA 4DDDA 3M3LA 3PPQA 1O63A 1UIVA 5HM4B 3TUSA 3BFUA 5I59A 4GL0A 3OSRA 1XC1A 2P2AA 3FATA 2OBGA 4JSOA 1MG1A 3HN0A 1SDXA 2DWAA 3PV0E 3FXQA 3LSXA 3PPRA 3C9HA 4NF5B 1Y1ZA 1EH3A 4IO7A 3IB2A 3IAZA 1TWYA 4U1OA 1GTKA 2I48A 1R9LA 4NF8B 4THIA 1PC3A 1ZMGA 4H8IA 3MBPA 4LUBA 2AL4A 2UVJA 1DOTA 2Y7PA 2ESNA 2E0SA 4PE5B 4ZE9A 4ONYA 3PMXA 2XHDA 1B1HA 3TYHA 3VLVA 4NTLA 1EZOA 1RYXA 1A55A 2ZNUA 3TMGA 5BWJA 2OZZA 3H6TA 4OFJA 2XXQA 5J1DA 2V25A 1OLCA 3MVZA 2IEEA 4QHQA 4PP0A 3V83A 1O7TA 4TOZA 4Q30B 1JW4A 2Z8EA 2ZYOA 3IO6A 4EQBA 3K01A 1M5BA 3UA8A 3S4UA 1SI1A 4XXUA 1US5A 3K1PA 4BLAA 4F1YA 2WKYA 1EZPA 3ZKKA 3TCGA 2DVZA 2VHAA 4NF4B 4N07A 4U22A 3IJXB 3O6IA 4WEDA 3IB0A 5AE4A 2ZNSA 3KN8A 2Y7IA 3QIMA 4R74A 2H99A 2GH9A 2P1SA 4H5FA 4OESA 3IOVA 4F1UA 2XX7A 3TTLA 2ONRA 1M5DA 4LATA 2F97A 3FVGA 2XXVA 4ESXA 3RQTA 2A5TB 4FATA 1FQFA 1M5EA 2G93A 4F18A 3MP8A 1NH8A 3FXUA 1IXGA 3W9WA 5I56B 5TPAA 2UVHA 2ZYKA 2VP1A 4GF8A 5DVIA 1MXZA 3M8UA 1MY4A 4NMYA 2V93A 2OCUA 4GL8A 4PETA 5DVFA 3KN3A 1NNKA 4LA9A 2NWJA 4LONB 3PUXE 4RY1A 4XKQA 3OO8A 4RA1A 5L9MA 2GHBA 1VSOA 1MH4A 3FV2A 2I0BA 2XD3A 4FJPA 1NKXA 4QSEA 4RNSA 4YKKA 4FE8A 5CMBA 2XD2A 3CI8A 3FJMA 3KJ7A 1Z7NE 3T22A 1IXHA 4C1UA 2DWJA 2RC9A 2XXYA 3IK6B 3N94A 3G3KA 3TCFA 4KHZE 2HCAA 4F22A 4IGRA 3PMWA 4OTEA 4IO2A 3IOUA 3VV5A 3QSLA 4JWXA 3PD9A 1OQHA 5I57B 3QAXA 1UIUA 1HSEA 3KN7A 4OXVA 4H6DA 2XXIA 4QSCA 2DVCA 4DXUA 4RYAA 3IJOB 3G3HA 1B46A 2F7BA 4K3FA 3R6UA 1SI0A 2Q9TA 5I59B 3VXBA 4EQ7A 1MY1A 1P1QA 4KD5A 2XXUA 2FNCA 3CSGA 1Q1KA 3FJ7A 3KEIA 3N6TA 3VVDA 4H65A 3CVGA 4Z0IA 2H4IA 3MP6A 4R6HA 4ZEFA 2HAVA 1Y1MA 4UA8A 2QL3A 4H1XA 2QS4A 3MVYA 3VVFA 2QS2A 3IX1A 5ISUA 3UP9A 4F19A 3CG3A 4FEBA 5H8NA 3FJGA 1LAXA 2UVGA 4EXLA 1B7UA 1PDAA 4M4GA 4F3PA 3SEWA 1URGA 1XT8A 3HO7A 1CB6A 3DP4A 5TP9A 1NH7A 2ABHA 5H8HB 4BDLA 2PYYA 1B4ZA 5IAIA 1LAFE 2Z8FA 3E13X 3M3FA 2Y7WA 1B05A 2PT2A 1P1UA 4F29A 4ZE8A 3IORA 1GGGA 5HPQA 1YTVA 1R1NA 1JEUA 1H45A 1NNPA 1Y3NA 4YKIA 2XXWA 4R72A 3SERA 3N26A 1DMBA 3C31A 3OO6A 1PBPA 2OK2A 4UACA 5CMCA 5CI5A 5AA2A 4U1ZA 4H67A 3KSJA 1N7XA 3OOAA 4F1VA 4X48A 1Y20A 3Q29A 4KQPA 1EZ9A 5CC2A 2VOZA 4EQ9A 3IOWA 2NVUB 3LSFB 4P0IA 1I6AA 1B2HA 1ELJA 1FQDA 1YAEA 1PB8A 2F7CA 1GVCA 2F78A 3O2AA 1S50A 2A5SA 1N3XA 3GZGA 3C34A 3PPPA 2Q89A 1AL3A 1XOCA 1SYHA 3TCHA 3TFLA 5F7VA 3EPEA 2DP8A 1USYH 3K02A 4LQ5A 1XVXA 1TFDA 1AH5A 4U4XA 1B3GA 2YJPA 3PUYE 1SBPA 4XKNA 2OWSA 4IO5A 3MZ9A 4JXIA 3N5LA 3MUQA 4G68A 2REJA 4OETA 1A54A 5M2VA 4EF2A 1MXXA 3H6UA 3RT6B 2CZLA 2Q8JA 1FQBA 1ZJLA 4F2OA 1FTKA 2O7IA 3BFTA 1VFEA 3OENA 1SVXB 3A3CA 3EHSA 3FASA 2YLNA 1D3KA 1QUIA 4F2QA 4IB2A 3MP1A 4RPOA 1OQGA 2Q2CA 3UK4A 3ZS6A 3TPAA 5FHMA 4FAJA 4XKRA 3MW0A 4IO3A 1Y3PA 4EF1A 3OMBA 2I0CA 1Y4TA 1M5FA 1LLSA 1P1NA 1B5IA 3USDA 3G3JA 4U4SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MZBA 1OLAA 1D9QA 4N6PA 3RGYA 3TODA 3E79A 2RC7A 4IO4A 2PX1A 4GWYA 1FBEA 2QSXA 4OVRA 1UTHB 3U65A 3JZJA 3UGWA 4GWSA 1JVXA 3E3KA 4OVJA 1B3LA 2DYXA 4OEUA 1YCJA 1B3HA 1I69A 2ONKE 3PUWE 1DCUA 2GHAA 3PMVA 2V3UA 4MLVA 4NE4A 2ZMBA 3T9HB 3MPLA 2WEFA 4MLQA 1OMPA 1FPBA 3CG1A 4O7MA 2DWIA 2F6PA 4NEDA 1H3DA 3FUZA 5T3JA 4X8RA 4I3EA 1XHYA 1LSTA 3SEXA 2R9JA 2V84A 5H8NB 4PQJA 3H6VA 1JEVA 4LP2B 5ICQA 1NNTA 4OVPA 4OVQA 3I5OA 2NXOA 4KYSA 3CRBA 5KCJA 4ZZAA 4GXAA 3U92A 1YPNA 3TTMA 3Q28A 4MNIA 3EF7A 1SW2A 5DTBA 2HHMA 1G0HA 2VT5A 1K9YA 5TP9B 3TTKA 2W7YA 2O1LA 4BDOA 3L6HA 1LFHA 5DW8A 5ET8A 4HE2A 4OVTA 3THIA 2XWVA 4JWOA 2FIXA 1B9JA 4NG7A 1LBCA 3DLNA 1IMAA 1A8EA 3KGCA 1NV4A 3PPNA 5JEIA 4BDQA 2F34A 3IFCA 2H9BA 2I4BA 3VLWA 4YKPA 1NUZA 3ZKLA 2H98A 5BUUA 4PFYA 4NWCA 2O84X 1EYIA 1ZBMA 4GX3A 2M8CA 3C4MA 4WEPA 2NOOA 3KOSA 1IIWA 4G8HA 1B51A 4QFPA 3TDJA 2X7QA 5AA2B 3BBRA 1OIBA 3G3JA 1MM7A 4Q0CA 1IITA 3T96B 1URSA 5H8SA 4HS7A 3PUVE 5FTHA 3LSLA 1KWHA 4ND9A 4YZZA 3O9PA 4KYDA 3O66A 1S7YA 1LBBA 3QK6A 2ZZXA 4TLLB 5IZZA 5JTYA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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