2V3QA

Serendipitous discovery and x-ray structure of a human phosphate binding apolipoprotein
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
376
structure length
376
Chain Sequence
DINGGGATLPQKLYLTPDVLTAGFAPYIGVGSGKGKIAFLENKYNQFGTDTTKNVHWAGSDSKLTATELATYAADKEPGWGKLIQVPSVATSVAIPFRKAGANAVDLSVKELCGVFSGRIADWSGITGAGRSGPIQVVYRAESSGTTELFTRFLNAKCTTEPGTFAVTTTFANSYSLGLTPLAGAVAATGSDGVMAALNDTTVAEGRITYISPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKGVVNGVAVEGKSPAAANVSAAISVVPLPAAADRGNPDVWVPVFGATTGGGVVAYPDSGYPILGFTNLIFSQCYANATQTGQVRDFFTKHYGTSANNDAAIEANAFVPLPSNWKAAVRASFLTASNALSIGNTNVCNGKGRPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Tandem Use of X-Ray Crystallography and Mass Spectrometry to Obtain Ab Initio the Complete and Exact Amino Acids Sequence of Hpbp, a Human 38kDa Apolipoprotein
pubmed doi rcsb
molecule keywords HUMAN PHOSPHATE BINDING PROTEIN
molecule tags Transport protein
total genus 116
structure length 376
sequence length 376
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12849 PBP_like_2 PBP superfamily domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3qA02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 2v3qA01
3FXUA 4ELRA 3I6VA 4GXAA 4NF8B 1A7LA 3PD8A 1ZKBA 1EH3A 2O1MA 4G8HA 1JVXA 1SW4A 1PB7A 1PDAA 5A5XA 3H7MA 2QS2A 4H5GA 4R6KA 1N04A 4OHNA 2GH9A 4NWDA 3TTRA 2RINA 4YB5A 4F3GA 4U2RA 2QS4A 3TCGA 3OO7A 4RK2A 4OQOA 1SW2A 1VE4A 4U1ZA 4GL0A 2GRVA 3FV1A 3D4CA 1FTKA 2DOJA 2ZNSA 3K2DA 2R9JA 1NNFA 3E13X 3K6VA 1IIWA 4GLIA 4LONB 2ONKE 1MY4A 1SYIA 2XX8A 4R72A 1FTLA 1ELJA 3PPNA 3PUWE 3OEKA 2VD3A 2OK2A 3TDJA 4DDDA 1IITA 1BIYA 3L6GA 2V84A 2O69A 1XVYA 2PX1A 1JW5A 4R2BA 1GGGA 1DMBA 2IEEA 3H6TA 2I4BA 5I56A 4YKIA 3O66A 4DCXA 4LATA 2P2AA 2ZNTA 5KDTB 4KQPA 1MXUA 1US4A 4P11A 1B58A 2FYIA 4R6YA 1Y3PA 2Z8FA 3R26A 3CI8A 3CR9A 4IO2A 4OVJA 3G7WA 4TLLB 4WEPA 1BKAA 2DWIA 1MY3A 3PGFA 5F7VA 1FTMA 1FTJA 2HEUA 1LB9A 1MXVA 1H76A 1B2HA 3N26A 3K00A 2DXRA 2D5WA 3RTFB 3TCFA 4JSOA 3LBSA 4QFLA 1II5A 4ZZAA 3KZGA 4IO3A 3H6WA 4OTEA 4X9TA 4R6HA 4WKMA 3OELA 3OSRA 2RCAA 1A8FA 3D4GA 3KN3A 3IOTA 1Y4CA 4AB5A 3S9NC 5KCJB 3ILUB 4R74A 1SI1A 3A09A 1XOCA 2NWJA 2X26A 1FQFA 1D9YA 5FTHA 5ELVA 4EXLA 3KSJA 3MP6A 4YAHX 2I4CA 2HAVA 1HSEA 2E1SA 4E0XA 2I0CA 2B65A 4BLAA 1P1QA 3MW0A 4H5FA 5TPAB 1SI0A 5ISUA 4IO5A 3K6XA 3GXAA 3UGWA 4YMBA 3IX1A 3BBRA 3SEWA 2ONRA 1MQJA 3IK6B 2AYSA 5CMCA 4FECA 4O3CA 4EF1A 2O6AA 3H6VA 3SEXA 3TZAA 2UVGA 1UIVA 5I58B 1N76A 5HM4B 1SW5A 2UVHA 4OFLA 1Y9UA 3WAEA 3LC8A 2O84X 4C0RA 4O3BA 4U4SA 3QSLA 3E9XA 3OOAA 4YU0A 2R71A 1O63A 2XXHA 4H67A 4OETA 4GXSB 4LUBA 4KCCA 4GRKA 1LAGE 2XX7A 5I84A 3BFUA 3HN0A 1JW4A 1FQBA 4IY6A 2ONSA 4NMYA 1WVJA 3CG3A 4G68A 4DCYA 3G3KA 4DXUA 5I2NA 3O6GA 1NH8A 3U8QA 1IEJA 5FTIA 2NXOA 3SDFA 3TKDA 1B4ZA 2M8CA 4ISUA 2H99A 2IA4A 3T96B 4HCYA 4AB6A 1ZLQA 4GQOA 1LLSA 4F1VA 3PV0E 1MY1A 3LUYA 2DE4A 1I69A 4OFOA 3V8XB 3OMBA 4IGTA 2HZKA 4XKPA 4KCDA 2I48A 5JK4A 2Z8DA 4OESA 2KLFA 1B05A 3QAXA 4E0WA 2QPQA 3CSBA 3G3HA 3IR1A 3LSWA 1NKXA 4ZEFA 3TELA 2VD2A 5AA2B 3PMXA 1A8EA 2OLBA 4GVOA 3ZS6A 1GTKA 5H8HB 5FHOA 1IUDA 4KPTA 1OQGA 4MF3A 1P1WA 3TUSA 4F2QA 3OXNA 5CC2A 3PU5A 2Z23A 4EDPA 2A5TB 2F7BA 1UTHA 3B6QA 3C4MA 3S2VA 1AH5A 1XC1A 4QSCA 4P0GA 3WAFA 4POXA 2QSXA 2Q89A 1NMUA 3I3VA 4I1DA 2G93A 1H43A 1MXZA 4GIZA 3VDFA 1KWHA 1MQDA 3HCQA 1HSJA 3UA8A 2THIA 3K01A 4GFRA 4JB7A 2NVUB 1MDP1 2XHDA 1IXHA 5L9MA 4H8JA 3PUXE 4TQUQ 4WXJA 4F18A 1WODA 2H4IA 4QHQA 1B32A 5CRYA 2OCUA 4JDFA 2REGA 3CFLA 1I6QA 4XIGQ 3T9HB 3RLFE 3FXRA 3K1PA 3KN7A 1WDNA 2D3IA 4KHZE 1ZMGA 3RT6B 5I2KA 1MQHA 4DIGA 1HSLA 1OVBA 1A55A 3VVEA 2UVJA 1MDQA 4PFTA 1SYHA 3MVXA 4ZEIA 3U94A 1R9QA 3MP8A 2HCAA 2GFEA 2Y84A 3G3GA 4KYDA 4Z0IA 2UYFA 3RTWB 4LA9A 2ZYKA 3OENA 2D21A 4F3SA 4FJPA 1ZTYA 3BFTA 5JTYA 1R6ZA 5F1QA 1AL3A 5H8QB 3TTKA 1LAXA 2DXYA 1JNFA 1MRPA 3HSTA 1JQFA 5H8FA 3Q28A 1MXYA 1IXCA 2OWSA 3TFLA 1CE2A 5JEIA 3UN6A 4YKJA 3K6WA 4F1YA 1QVSA 4ZS9A 3KJTA 5I57B 3W9WA 2F6PA 5DT6A 3I5OA 1DPPA 4QFKA 3RT8A 2Q88A 3RGYA 1N7WA 3THIA 4DLDA 4G4PA 4IO6A 2I3WA 3RY3A 2RC7A 3PD9A 3T22A 2V25A 5AA2D 2X7PA 1XS5A 1YCJA 1NNPA 5K2XA 2H5YA 4Q8RA 4RY1A 4ELOA 2HXWA 3B7DA 2OZZA 1LBCA 2HQ0A 2UXAA 3S9LC 5CMBA 3JV9A 1VR5A 2PBWA 4NF4B 1Y3NA 4RNSA 4NE4A 2HAUA 3FZVA 4ZECA 3VLWA 3VVFA 4QFOA 1IXIA 2NOOA 3QIMA 1UQWA 4KI0E 4EUOA 5DYHA 2Y7IA 4LZ7A 3ILTB 1B3EA 4Q0CA 5I59B 3VLVA 4ZE9A 3KOSA 4XXUA 3E4RA 3O6HA 4ELPA 1B1XA 5TP9A 3EF7A 2PT2A 2OBGA 4PQJA 1M5DA 3FATA 1Q35A 4YICA 5HBCA 1QUJA 4THIA 4PETA 5L9OA 3IB0A 1USYE 5HPQA 4X1BA 5BWJA 2H9BA 2Y7WA 3M3LA 1M5BA 1SVXB 1QKBA 3LSLA 3V83A 3MZ1A 4IO7A 1RKMA 3AXFA 2VOZA 2F36A 4MBPA 3U93A 2XXQA 3O28A 5DEXB 2Q9TA 3GBAA 4KFQA 1A54A 2RC8A 3VLUA 4Q30B 3TTLA 2NUVA 5AA4B 2UYEA 4H6DA 4OYVA 1FQEA 4H65A 3ONMA 3TTNA 2F7AA 1J1NA 4L17A 3PPQA 2B3BA 4MFIA 1US5A 4EF2A 4R73A 1UTBB 3FVNA 2RCBA 1D4NA 1FCKA 1LFHA 1MPDA 1QULA 4JBZA 4YB7A 4OWDA 3U92A 1RYOA 3EHSA 1A40A 2REJA 4X48A 4WEDA 1MM6A 2OWTA 3R6UA 4P0IA 1ANFA 1DTZA 4IGRA 4GOTA 5AA3A 5AE4A 3V5AA 1LCFA 3KOTA 1F9BA 1N7XA 2DS9A 1S7YA 3KBRA 5AA1A 1AIVA 5LOMA 4NF8A 2V3TA 4F39A 4DXBA 4NF6B 3B6WA 1B0HA 2VGQA 1B3HA 1D9VA 1JW1A 3T9XB 1PBPA 4IO4A 3CIJA 2YJPA 2DWHA 4IB2A 2A5SA 2YPNA 2O51A 3VXBA 5H8SA 4OEVA 1B4HA 4C1TA 1M5EA 1LCTA 1FQCA 1LSTA 1IZ1A 2I6EA 1ATGA 1DTGA 1N84A 2DWAA 4N07A 4MLQA 2XD3A 3UIFA 3KG2A 3JYRA 2ZYMA 1URGA 3LSXA 4DXCA 1B9JA 5M2VA 4M4GA 1PEBA 2ZXTA 5A5XB 2DSFA 2UVIA 4K3FA 2P1SA 1MH3A 3TQWA 1MY0A 2QL3A 4ZDMA 4KYSA 1B5HA 3QYTA 3Q26A 3H4ZA 4NF4A 4R9GA 3OO8A 4LQ5A 5KDTA 2CMOA 3MBPA 4U1OA 4HCWA 3CFXA 3EHUA 3DM0A 2I58A 3H03A 3OEMA 5J1DA 1B1HA 1B6HA 3EQ1A 3OD7A 4FORA 3MP1A 1MH4A 4FIMA 1ZIUA 3UORA 4N6PA 1R1NA 4ESXA 1UIUA 4EXKA 3O2AA 4HS7A 3CVGA 2ABHA 4Q5TA 3FVOA 2ZMBA 3H3GA 1OMPA 3RNNA 4QRZA 5I56B 3MZ9A 3QUJA 2ANJA 3T9VA 3FJMA 1EZOA 1LGBC 1BP5A 1BTJA 3CFZA 2XX9A 3P7IA 1USYH 2O68A 3TODA 5KCJA 1RYXA 4FAJA 2OJTA 2F35A 3MPKA 3CRBA 1LFIA 3A3UA 1B5JA 3Q25A 1H45A 3KEIA 4OERA 2XD2A 3GLBA 2W7YA 1O64A 1N3WA 2LAOA 4UACA 3O9PA 2HFBA 3IAZA 4YKPA 3TAJA 2Y7RA 3SEUA 1B0LA 3G3FA 4RYAA 1MPCA 1B46A 4EQBA 5TPAA 3IL1B 1I6AA 1ZJLA 4I8CA 3M3FA 1MM7A 2Z8EA 5KZTA 2Y7PA 2O1LA 1MY2A 3HHFA 3T93B 4N13A 2PT1A 4QFPA 4GF8A 1Y1MA 1I6BA 3PUYE 2GHBA 4G2ZA 2DP8A 3IJOB 1QUIA 5EHMA 1AOVA 3MUQA 4OZ9A 1JVYA 2Q2AA 4JWOA 1TXFA 4BDRA 4Z7EA 3KSXA 2WKYA 4EQ9A 5CMMA 5I58A 3LR1A 2F5XA 2F8DA 4LQ2A 2QS1A 3PPOA 3KGCA 4ELQA 1B3GA 3QUFA 5TU0A 2O7IA 4RA1A 3O6IA 4NF5B 3VE1B 4ESWA 3FV2A 1H3DA 4JWXA 2PYYA 1SQYA 1EU8A 1URSA 2DVZA 3GZGA 4ZEDA 3BKIB 3Q27A 4HTGA 5IKBA 2ESNA 3S9EA 4H8IA 4G77A 5IAIA 4RXLA 3USDA 2XXUA 3DLNA 3JZJA 1JEUA 3HPIA 1ZU0A 2X7QA 4ZEKA 4EQ7A 3VV5A 4F22A 3W15C 3K02A 1POY1 1PB8A 5ITOA 1MS7A 3EHTA 1NFTA 3L6HA 4LZ8A 3C34A 2ZYNA 3SERA 5L9SA 3N6TA 3UK4A 3MVZA 3IOVA 2QS3A 4U23A 3FASA 4I62A 1OQHA 1FQAA 3CG1A 4QFNA 3QK6A 5DTBA 5EHSA 4G68B 3PUZE 2BJJX 3K4UA 3A3CA 1MG1A 2AIXA 2F78A 1PC3A 3FUZA 1DSNA 3OSQA 4TLMB 1B5IA 1B51A 3RUMA 4FE8A 5I2NB 1P99A 1T0KA 3HO7A 3F11A 5AA2A 1O7TA 3O97A 1SBPA 5B70A 1DOTA 5H8HA 1IXGA 3DP4A 4OMBA 3VXCA 3CSGA 3FVGA 3G3IA 1YAEA 2ALUA 2AL4A 5B7DA 5CM6A 1VFDA 2RKMA 5DVJA 3EPEA 1MXXA 5FHNA 3IO6A 4XTCQ 1A99A 3N6UA 4OENA 1XHYA 4AQ4A 2XXRA 4MLVA 2A5TA 2I3VA 2F97A 1QUKA 1SDXA 4R75A 3S9MC 4U4XA 5FHMA 4ND9A 2DVCA 1BLFA 1QW0A 4G68C 1B3FA 4QF9A 2QMXA 4R9FA 1QJMA 2B3FA 4KYEA 5K2YA 2V3UA 2O7UA 4RK9A 3T66A 3EN3A 2I0BA 3QXMA 4C1UA 2QJEA 1VFEA 4DE8A 4F29A 1P1NA 3C32A 4FATA 3T9UA 1TWYA 3MJNA 4ZE8A 4U22A 3C31A 2Z22A 1GR2A 1TFAA 1N0TA 2DQVA 3HV1A 1UTHB 3SETA 1JETA 4NTLA 3MPLA 5CBSA 1TT1A 4ONYA 5ICQA 4HW8A 4ZEBA 2DE3A 3GBBA 3IORA 2XXTA 1ZBMA 3TTMA 2PVUA 4ECFA 4QSDA 4YMAA 4FEBA 3ODBA 1M5FA 1R9LA 2F7CA 4PFWA 2XXVA 3FVKA 4H1XA 3FD3A 1OVTA 1AMFA 2G29A 1TFDA 3B6TA 1Y1ZA 1YPNA 1NNTA 1Z7NE 1QKAA 1FW0A 3ZKLA 2ZYOA 2HZLA 4NF5A 5DVFA 3IOWA 3MVYA 2Q8JA 3KN8A 3M3KA 1B7ZA 4QSEA 3FJGA 4ZZEA 1Q1KA 2F6GA 5H8QA 1NH7A 3TQLA 4OEUA 4BDNA 4LP2B 5H8NB 2RC9A 3KFMA 3MVWA 5I2KB 2XXIA 4RJZA 4G8NA 1SD3A 3U1OA 2ZNUA 3OO6A 1YTVA 5I57A 2AL5A 4RPOA 1JEVA 2YLNA 1XVXA 4I9DA 2FNCA 3MWBA 2Q2CA 4O3AA 3VVDA 4BDOA 1OLCA 3IO4A 2XXWA 4F2OA 1MPBA 2V3QA 3SKPA 3G3JA 4UA8A 3SEYA 5CMKA 4KD5A 3VFJA 1H44A 4YB6A 5ICTA 5JTYB 1B7UA 4IY5A 1XT8A 1PB9A 4GWOA 2QMWA 3MQ9A 3W9VA 3FIRA 5H8FB 4F3BA 1M5CA 1CB6A 3TCHA 1NL5A 5BUUA 4U21A 2DYXA 3V89B 5CI5A 1B7HA 4H0WA 1S50A 4PFYA 3DP8A 3IJXB 2E0SA 1DPEA 2FA7A 4OFJA 3SEVA 3K1NA 4XKRA 3DP6A 3PPPA 1POTA 4YZZA 3MAMA 3O29A 1L5TA 5I59A 1LBBA 3N5LA 1Y3QA 3FXQA 1MQIA 2I49A 3R7XA 2RF1A 1IQ7A 4JWYA 3S4UA 1NNKA 3IB2A 3PMVA 5DVIA 3TEPA 1Z7ME 3ZSFA 3MZBA 4F1UA 4F19A 3DELB 4DZ1A 3C36A 3TMGA 2DWJA 4NWCA 4FEDA 3U72A 3PUVE 3UP9A 1B3LA 1P1UA 5DEXA 2PMSA 5CBRA 3C33A 3FGSA 4X1DA 2P0SA 1LAHE 1EZ9A 2QRYA 4F31B 4KR5A 1S9TA 4GL8A 4PP0A 3HHGA 4NEDA 3PPRA 4OXVA 5AA4A 3TPAA 1OLAA 2F34A 3N94A 5TP9B 1LB8A 1GV8A 4MH5A 2XXYA 3ECRA 3K1MA 1UTBA 3PMWA 4BDLA 1MXWA 4RPNA 1Y4TA 3C35A 4YKKA 4JSDA 3KJ7A 1LFGA 1EZPA 3M8UA 4TOZA 4XKQA 3K0VA 3RPWA 2DE2A 2R6GE 4LZ5A 4BDMA 1FQDA 1P1OA 3C9HA 4GD5A 1FTOA 3FJ7A 3LSFB 4F3PA 3RN8A 5EYFA 3TYHA 1OIBA 3ZKKA 1LAFE 1Y20A 2CZLA 3H06B 5ITPA 4NF6A 4BDQA 2H25A 2Y7KA 4M1VA 4LVQA 4XKNA 5H8NA 4PE5B 2XXXA 5L8DA 3RQTA 3IOUA 1B52A 1GVCA 2GHAA 4PFUA 3E3KA 1N3XA 1VSOA 2H98A 3K6UA 4G8MA 2VP1A 1URDA 4POWA 3SESA 3MC2A 4JXIA 2XXPA 1B40A 3IB1A 3H6UA 2VHAA 3OO9A 1SW1A 3Q29A 1PBQA 1D3KA 4R2FA 1MQGA 2V93A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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