2V3UA

Structure of the ligand-binding core of the ionotropic glutamate receptor-like glurdelta2 in complex with d-serine
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
261
structure length
253
Chain Sequence
GGVVLRVVTVLEEPFVMVSENVLGKPKKYQGFSIDVLDALSNYLGFNYEIYVAPDHKYGSPQEDGTWNGLVGELVFKRADIGISALTITPDRENVVDFTTRYMDYSVGVLLRRGTSIQSLQDLSKQTDIPYGTVLDSAVYQHVRMKGLNPFERDSMYSQMWRMINRNNVLESQAGIQKVKYGNYAFVWDAAVLEYVAINDPDCSFYTVGADRGYGIALQHGSPYRDVFSQRILELQQSGDMDILKHKWWPKNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Ionotropic Glutamate-Like Receptor {Delta}2 Binds D-Serine and Glycine.
pubmed doi rcsb
molecule tags Receptor
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR DELTA-2 SUBUNIT
total genus 81
structure length 253
sequence length 261
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3uA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3uA02
4R9FA 3O2AA 4OEUA 5AA4A 4H1XA 1FTLA 2B3FA 4NF6A 2O1LA 3G3HA 4G4PA 1XT8A 4F19A 4ESWA 1CB6A 5H8HB 4QF9A 2XXXA 4EUOA 3LC8A 1JVYA 1TFDA 4XTCQ 3VVFA 3B7DA 2AL5A 3PPQA 4G77A 1N04A 4PETA 1YAEA 5AE4A 5ISUA 3BBRA 4OHNA 1US5A 1JEVA 4QFPA 2H5YA 3O6IA 4YZZA 3FVKA 3HO7A 1B7ZA 2Q2AA 5EHMA 1PEBA 2REGA 3FVOA 3S4UA 1XS5A 2F7CA 4F3GA 4WEPA 3T9XB 2H99A 3U1OA 1ELJA 2REJA 1IIWA 2NUVA 2F6PA 3RQTA 3FVGA 4RPOA 2VGQA 4RA1A 4U2RA 3W9VA 4F22A 1PB8A 3QUFA 3EQ1A 1QUJA 1Q1KA 2OCUA 4YAHX 3K6VA 1IQ7A 3K0VA 3SEXA 4GQOA 2D5WA 4LATA 2HEUA 5I2NB 1OQGA 4G2ZA 1SW4A 3IB1A 4M4GA 1PBPA 3QAXA 4HCYA 2I6EA 1B05A 2O69A 1A8EA 3EN3A 4H8IA 4THIA 1HSEA 4R9GA 5FHMA 4FAJA 3UA8A 3K4UA 4GL0A 3CSBA 4M1VA 4POWA 5I2KB 2V3QA 1USYE 3HPIA 2O7IA 3RT6B 4X9TA 5H8SA 5AA2B 3KN7A 3K00A 4U4SA 3FV1A 3LSWA 1FCKA 2Y7WA 1B46A 3H6UA 3U8QA 4E0XA 5TPAB 2I3WA 4GWOA 4KD5A 1USYH 4I1DA 3MVYA 1B2HA 1MY2A 3OO7A 5AA3A 4RPNA 1O63A 4KPTA 1B5JA 1XC1A 2THIA 4H0WA 2F6GA 3E4RA 4YMBA 4RJZA 1Y4CA 1IXCA 5M2VA 4IO6A 2IEEA 5AA2D 4N07A 5KZTA 4AQ4A 3MQ9A 2DXRA 3IJXB 3IORA 4YKJA 5A5XA 3LSLA 2QMWA 4FEBA 3UORA 3TEPA 3HCQA 5DTBA 3FXRA 1MQJA 4MFIA 1MPCA 1NH7A 4NF4A 1MQHA 4P0IA 1F9BA 3QYTA 3R7XA 3N26A 2PBWA 1B1HA 3FXQA 4G8HA 3H4ZA 1FTJA 3RTWB 2XXTA 1FTKA 5FHNA 3K1NA 4FEDA 4F2QA 2QS3A 4GOTA 2XX8A 4KCCA 5DVFA 3N94A 3TDJA 2WKYA 3S9MC 4QFLA 4ECFA 4TOZA 3V5AA 3DP8A 1IEJA 2XXIA 5KDTB 5H8QB 3B6WA 4JSOA 3TFLA 2W7YA 3GLBA 3IK6B 4L17A 3ONMA 4OETA 1B4HA 1SI1A 3IB2A 1JW5A 2ONSA 2Q88A 3QIMA 4LZ7A 3MZ9A 5JEIA 1EH3A 4H67A 1M5FA 1N84A 2ZMBA 1LFHA 4G68B 4KYDA 3PPPA 1QJMA 2ZNSA 2DE2A 3TUSA 3CG1A 3EHTA 3V83A 3M8UA 1H44A 1H43A 3N6UA 3KZGA 4P0GA 2H25A 3H6WA 2GH9A 1UIVA 4MF3A 1BIYA 2Y7KA 2HAVA 2Z22A 2XXVA 3B6TA 2UVGA 4ELQA 4LA9A 1SW2A 1R9LA 5DVJA 1YPNA 1NL5A 4JWYA 1SW1A 3OO8A 2YLNA 2NXOA 2D3IA 4QFOA 3OD7A 1IZ1A 1QW0A 4JWXA 2QS2A 1I6AA 4PE5B 2GHAA 4GL8A 3PD9A 1JW1A 3RPWA 1GTKA 3KOSA 4RK2A 4YICA 4ZE9A 4IGTA 4GIZA 1XVXA 1IITA 3SEWA 4F29A 2ABHA 4XXUA 4YB5A 3A09A 2HZLA 1B3HA 2F5XA 2XD3A 1OMPA 1N3WA 3T96B 5ITPA 4Q0CA 3FASA 3THIA 5H8FB 1MH4A 4F2OA 2FYIA 3T9VA 3S9LC 4YB6A 4UA8A 3KEIA 4KI0E 1OLAA 1HSLA 4ZE8A 1IXGA 2QRYA 2V25A 3WAEA 1RYXA 2DE3A 3GBAA 3PPOA 4DCXA 1A8FA 4R2BA 3I3VA 4F1VA 4ZDMA 1IUDA 5L9OA 1A7LA 3E3KA 5CBSA 4QHQA 3BFTA 3F11A 1I69A 1I6BA 1B6HA 1A99A 1ZMGA 1MQIA 1FTMA 3L6GA 1UIUA 2PT1A 5KCJA 4BDLA 3TTMA 1M5EA 2A5TB 1OLCA 2AL4A 3C9HA 2HFBA 1URSA 4PQJA 4EQBA 4QSCA 4JSDA 3MWBA 3IJOB 2ONRA 4NWDA 1JVXA 4Q8RA 5B7DA 3Q29A 3K1MA 4LUBA 3CI8A 2OZZA 2X26A 3MP8A 5DEXA 4H8JA 2G93A 5EYFA 5I56A 2I3VA 2I4BA 4IB2A 2AYSA 2XXYA 1MY0A 3C32A 4POXA 4U1OA 5I59B 1LBCA 4OXVA 1P1NA 3G3FA 1PC3A 2KLFA 2DE4A 3HV1A 4KR5A 4GD5A 4X48A 3CFLA 2E0SA 5CMBA 3BKIB 1OVTA 4LZ5A 2I58A 2QS1A 5CMKA 2I0BA 4YMAA 2H98A 4LQ5A 3O6HA 4LP2B 1Y3PA 3U92A 1MY4A 3O29A 2ZXTA 3TPAA 1B51A 1H76A 2DS9A 3EF7A 4P11A 4EF1A 2P1SA 4Q30B 1NNTA 3R6UA 1XOCA 1GR2A 1L5TA 2OBGA 2I49A 4RYAA 3D4GA 5H8NA 4BDRA 3TTKA 4C1UA 2RCAA 3GBBA 1P99A 5TP9B 2O7UA 1LLSA 4EXLA 1MQDA 3CIJA 3VLWA 2NOOA 2OJTA 3QK6A 2RKMA 3ZKKA 3C35A 3MZBA 1LCTA 4DXBA 4JWOA 3FD3A 4WEDA 3K6XA 4PFWA 3RTFB 5BUUA 3ZS6A 3MPKA 1D9YA 4F39A 1M5BA 3H6TA 2IA4A 3C4MA 4C0RA 2F8DA 4LZ8A 3PUVE 1JNFA 1B3LA 4H6DA 2HAUA 2RINA 1MXXA 2O68A 4JBZA 5L9SA 1GVCA 3TMGA 1XVYA 4O3CA 3VXCA 4QFNA 1FQAA 4DIGA 3G7WA 3IX1A 1TWYA 2ESNA 3V89B 3H7MA 3O97A 3S2VA 1I6QA 1PB9A 1FQFA 4GVOA 4BLAA 4ZEFA 4OFOA 3L6HA 1Y1MA 3LUYA 1AL3A 1SQYA 1B7HA 5JTYA 4FE8A 1UQWA 4NF8B 4XKPA 2OWTA 1VE4A 3V8XB 4R2FA 4TQUQ 3G3IA 4OENA 1AIVA 1P1UA 2YPNA 3OO6A 4R74A 1YTVA 1EZPA 3UK4A 1BTJA 1SD3A 4Q5TA 3OOAA 1TXFA 4IO5A 3RGYA 1Y3QA 3FGSA 1ZTYA 4OEVA 1SDXA 4O3BA 3PPRA 4QSDA 5FHOA 4ZZEA 2ZYMA 1BP5A 1JW4A 1RKMA 1POY1 3K01A 1ZLQA 4NF5B 2QL3A 3HHGA 2XHDA 5HPQA 4DXCA 5LOMA 3TKDA 4FECA 2XXRA 1FQDA 2RF1A 1MXWA 2Y7PA 1OVBA 2OWSA 4OESA 1GV8A 2OK2A 4N13A 4OQOA 3VXBA 1P1QA 2DWIA 4GXAA 2Q9TA 1QKAA 3EPEA 5L8DA 4O3AA 3OELA 2HXWA 3PMWA 4N6PA 4EQ9A 3MVWA 1ATGA 3OSRA 4MBPA 3ILTB 1UTHB 3ODBA 4EDPA 1UTBB 5F1QA 4F3PA 4DCYA 2I0CA 3O9PA 1N76A 4GRKA 3B6QA 5HBCA 5I57A 5I58A 1MDP1 5CRYA 4HS7A 1B3EA 3ZSFA 3FZVA 3VVDA 1B3GA 4MLQA 3KOTA 4NF6B 1CE2A 3IOTA 1JEUA 3W9WA 3A3CA 4NMYA 1LAFE 3H3GA 2DWJA 2RC7A 1N7XA 2ZNTA 4GXSB 4LQ2A 1H45A 4K3FA 3MPLA 3TCFA 4PFTA 1MXYA 3O66A 3RLFE 4PP0A 5ELVA 5H8HA 2A5SA 2YJPA 4ZEDA 3KN3A 3I5OA 1URGA 1H3DA 4I8CA 3VVEA 1B58A 3RNNA 1P1OA 1ZBMA 2V84A 2Z8FA 4F1YA 2ZYNA 4F3BA 4I9DA 4H65A 3OO9A 2H4IA 2X7QA 4U21A 1R1NA 1MM6A 3GXAA 3H6VA 4QFKA 4ELRA 4GFRA 1DSNA 1P1WA 3MBPA 1ZIUA 3VDFA 3D4CA 3TZAA 4AB6A 2HCAA 3SETA 4LONB 4R6YA 3TQLA 4Z7EA 5I2NA 3K1PA 4QRZA 3MZ1A 2GRVA 5K2XA 3UN6A 3CSGA 3PV0E 3DM0A 4ESXA 4KFQA 2Z8DA 3KN8A 3T9UA 3PUZE 3IL1B 1B32A 2F35A 1VR5A 3PUWE 3I6VA 3VLUA 3CFZA 2Z23A 2ZNUA 2UVHA 5I2KA 4U4XA 2DP8A 3PMVA 1ANFA 4ZEIA 4GLIA 1DMBA 2PMSA 1SI0A 1EZ9A 2PT2A 5AA2A 2DOJA 1J1NA 1Y3NA 1S7YA 1LSTA 2LAOA 1Y20A 5TPAA 3FVNA 1DPPA 1QULA 3TCHA 2RC8A 3CFXA 3Q28A 2FA7A 1BLFA 4WXJA 3C36A 3HN0A 5A5XB 2V3UA 4R72A 2DXYA 3M3FA 5ICTA 3BFUA 1YCJA 1URDA 3JYRA 3TTNA 1VFDA 3TTLA 4NF4B 2FNCA 2F7AA 4NEDA 1NMUA 2DVCA 3ZKLA 4H5GA 4ND9A 4NWCA 4QSEA 1MPDA 1MPBA 1WDNA 1II5A 3VLVA 5CM6A 5HM4B 3H03A 2BJJX 2D21A 3PUXE 3Q25A 4WKMA 4XKQA 4XKRA 2R6GE 3EHUA 3MP6A 5L9MA 4F3SA 3KFMA 4DZ1A 4FJPA 5BWJA 1Z7ME 2QS4A 5TU0A 1HSJA 3MVXA 2UXAA 3FIRA 5KDTA 3T22A 2M8CA 2QPQA 4G68C 5H8QA 1Q35A 2UYEA 4IY6A 3K02A 4G8MA 2R71A 3S9EA 1DTZA 3TYHA 4OYVA 4KYEA 3UGWA 1NH8A 4TLMB 5I84A 2UVJA 3N5LA 1RYOA 3CVGA 3PD8A 1XHYA 3G3GA 2XXUA 4ZEBA 3SEYA 4OWDA 5JK4A 4ISUA 3MVZA 3PU5A 4OFLA 1DPEA 4G68A 3W15C 1LAXA 4R6KA 2B65A 1B5HA 1O7TA 3FJGA 3HHFA 1Y4TA 2P2AA 1FQBA 1LGBC 1PBQA 1NNPA 1TFAA 1S9TA 1N3XA 3PGFA 3R26A 4C1TA 3KSXA 2Q89A 5F7VA 1POTA 4ZEKA 4IO3A 2F97A 3VE1B 4IO2A 1B9JA 3FJ7A 4BDMA 1LAHE 4U22A 3ILUB 2Y7IA 2CZLA 2HZKA 1D4NA 3Q26A 3VFJA 4BDNA 3MJNA 2GFEA 1ZU0A 4KQPA 3Q27A 2DWHA 5EHSA 4ZS9A 1QKBA 4F1UA 4X1BA 5CC2A 3MP1A 1EU8A 2ALUA 3DLNA 5CBRA 3T93B 1N0TA 4I62A 5CI5A 1OIBA 1SYHA 2OLBA 3LSXA 2Z8EA 1O64A 2ZYKA 3EHSA 1B40A 1QVSA 2HQ0A 3O28A 3MW0A 4OFJA 1IXHA 4FIMA 2H9BA 1MXUA 1OQHA 1Z7NE 5H8FA 4KYSA 5DYHA 5ICQA 1SVXB 4G8NA 3SDFA 1WVJA 1JQFA 2Y7RA 1NKXA 1TT1A 3JZJA 2VP1A 4KCDA 1LCFA 4FATA 5FTIA 4IO7A 1LB9A 3IO6A 3C33A 1VFEA 1AOVA 3M3KA 3PMXA 4X1DA 4OTEA 3K6UA 1MY1A 4YKKA 5CMCA 5KCJB 3RN8A 2XD2A 1M5DA 2X7PA 1LB8A 4ELPA 4H5FA 2QSXA 1KWHA 2VHAA 3FUZA 3M3LA 1JETA 1B0HA 3LBSA 3DELB 4JDFA 2XXPA 3WAFA 3FXUA 3KJ7A 1MG1A 2V93A 3C34A 3OXNA 2A5TA 4DE8A 3IOUA 4PFYA 5DEXB 3VV5A 3SERA 1MRPA 1B52A 5I56B 2QMXA 3PPNA 1US4A 2DYXA 4TLLB 2Q8JA 3N6TA 3IB0A 3U72A 2O84X 2RCBA 2Y84A 3T66A 4RK9A 1WODA 1MDQA 3OEKA 3OSQA 2PYYA 5FTHA 3RY3A 5AA1A 3SESA 4R6HA 2DQVA 3T9HB 3ECRA 1B3FA 5I59A 1ZJLA 5AA4B 2VD2A 2XXWA 1MQGA 2DWAA 2P0SA 4NE4A 3PUYE 2ZYOA 4OVJA 4KHZE 1NNFA 1VSOA 3P7IA 3TAJA 2R9JA 4DLDA 3KG2A 4ONYA 3H06B 4F31B 1MY3A 2Q2CA 5H8NB 3FJMA 4IGRA 2O1MA 3K6WA 3CR9A 4YB7A 5ITOA 3DP4A 4F18A 2ONKE 3CG3A 1N7WA 2F7BA 1Y1ZA 1S50A 2XXHA 1FQEA 4FORA 1T0KA 3CRBA 3K2DA 1D9VA 3SKPA 1QUIA 3GZGA 1MS7A 4OMBA 5TP9A 2XX7A 2F36A 3U94A 2VD3A 4DXUA 1MH3A 1B7UA 3FATA 4R73A 3O6GA 5DVIA 3DP6A 3SEUA 4YKPA 3TCGA 2V3TA 3QXMA 4U1ZA 4JB7A 4PFUA 1LAGE 1PB7A 3LSFB 1B0LA 4ZECA 4XKNA 4HW8A 4BDQA 5IKBA 4OERA 4MH5A 2PVUA 4MLVA 1MXVA 3LR1A 3QUJA 5IAIA 2RC9A 4YU0A 3A3UA 2UVIA 2NWJA 1DTGA 4YKIA 3UIFA 1QUKA 1FW0A 5JTYB 4AB5A 1A40A 1M5CA 1A55A 3S9NC 3KJTA 4U23A 1Y9UA 3AXFA 1GGGA 1D3KA 2I4CA 3UP9A 3QSLA 4NF8A 1B4ZA 4IO4A 1LBBA 1R6ZA 4EQ7A 3IO4A 2ANJA 3USDA 4JXIA 4BDOA 4DDDA 2PX1A 1LFIA 5B70A 4ELOA 3G3KA 1SYIA 2VOZA 3IR1A 4XIGQ 3MC2A 2UYFA 1SW5A 2B3BA 2CMOA 4RXLA 3E9XA 2DVZA 1BKAA 3TELA 1NNKA 3KSJA 3KBRA 3FV2A 2QJEA 3MUQA 1B5IA 3U93A 1AH5A 2F34A 3KGCA 1B1XA 3IAZA 2I48A 3IOWA 1FQCA 1EZOA 4NF5A 1NFTA 2NVUB 1AMFA 3JV9A 2XX9A 5DT6A 2AIXA 1ZKBA 5K2YA 4RY1A 3RUMA 1SBPA 4RNSA 4HTGA 3OMBA 3TQWA 1MM7A 2F78A 3SEVA 3MAMA 3TTRA 5CMMA 4EF2A 4IY5A 4ZZAA 2G29A 4R75A 1R9QA 5J1DA 2GHBA 3TODA 3OEMA 2DSFA 3IOVA 4Z0IA 1DOTA 2O51A 1PDAA 2O6AA 5I57B 4EXKA 4OZ9A 1MXZA 5I58B 4GF8A 1UTHA 1A54A 1UTBA 4LVQA 3OENA 3HSTA 3RT8A 1LFGA 4NTLA 4E0WA 3E13X 3G3JA 4HCWA 2E1SA 3C31A 1FTOA 4UACA 1IXIA 2XXQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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