2V3UA

Structure of the ligand-binding core of the ionotropic glutamate receptor-like glurdelta2 in complex with d-serine
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
261
structure length
253
Chain Sequence
GGVVLRVVTVLEEPFVMVSENVLGKPKKYQGFSIDVLDALSNYLGFNYEIYVAPDHKYGSPQEDGTWNGLVGELVFKRADIGISALTITPDRENVVDFTTRYMDYSVGVLLRRGTSIQSLQDLSKQTDIPYGTVLDSAVYQHVRMKGLNPFERDSMYSQMWRMINRNNVLESQAGIQKVKYGNYAFVWDAAVLEYVAINDPDCSFYTVGADRGYGIALQHGSPYRDVFSQRILELQQSGDMDILKHKWWPKNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR DELTA-2 SUBUNIT
publication title Ionotropic Glutamate-Like Receptor {Delta}2 Binds D-Serine and Glycine.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Receptor
total genus 81
structure length 253
sequence length 261
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3uA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3uA02
1TFAA 2O69A 5H8HA 3ILUB 1MY4A 3MP6A 3N26A 1B9JA 5CMKA 1FQDA 3IOUA 4DLDA 3B6WA 2YPNA 3MZ9A 2DSFA 3C4MA 4G2ZA 3R7XA 3PGFA 1XC1A 1SBPA 2P1SA 3QIMA 3HO7A 3FJGA 4F1UA 2Q9TA 3ILTB 4GL8A 4DE8A 3B7DA 5ISUA 1GTKA 1OVBA 2ONSA 5JTYB 5I58A 1JW5A 1UQWA 4EDPA 5DEXA 1LAHE 4YU0A 4FEDA 1OMPA 2RINA 4RPOA 3T22A 1B51A 2I48A 3PUYE 1S50A 4DXBA 1FCKA 1SW2A 5I57B 1Z7ME 3C35A 2XXWA 3UGWA 2HQ0A 3LSXA 3U94A 1KWHA 1SQYA 1PEBA 4LUBA 1N76A 2O1LA 4DCYA 1FQAA 3OO8A 4ELPA 4RY1A 3TTLA 3T9HB 3QUFA 3G3GA 3H6WA 4G8HA 2XX9A 3SEVA 1R1NA 2PX1A 3Q25A 4PETA 4YKIA 3P7IA 5KDTB 2AL4A 2UYEA 3QK6A 3MAMA 3PUWE 1OQGA 1M5BA 2O68A 4OYVA 4U4SA 2BJJX 1MXYA 1VR5A 1DPPA 2YJPA 4KYEA 5JK4A 2H4IA 4H6DA 4QRZA 4G68A 4OZ9A 4OEVA 3O6IA 4O3BA 3JYRA 1CB6A 2WKYA 4RA1A 1PBPA 2KLFA 1MY1A 5JEIA 2GFEA 4MLVA 1QJMA 1XS5A 1JW1A 4ECFA 3LSLA 5TP9A 4LZ5A 4DXCA 2YLNA 1Y3NA 1Z7NE 3UORA 3UA8A 1N84A 4R73A 4X1DA 4E0WA 5I59A 1D9VA 1NNKA 1HSEA 2HZKA 4R74A 3PPNA 2ESNA 2PT1A 2DS9A 2CZLA 3C32A 3G7WA 1Y3PA 4Z7EA 3KZGA 4MH5A 1B3EA 1IXGA 5DYHA 3MZ1A 5DTBA 4NEDA 1D3KA 1POY1 3OOAA 5ELVA 3MP8A 1Y3QA 3K1PA 1B1XA 3TEPA 3IX1A 1J1NA 1UTBA 3RT8A 1MM6A 3OO7A 3MUQA 1EZOA 1H76A 4EUOA 3VXCA 2ZNUA 2AIXA 3I6VA 2X7QA 2O84X 2QS3A 4PP0A 2DE2A 1PB8A 4JXIA 3QUJA 3LR1A 4RPNA 1MY2A 1P1NA 3VLVA 3K1NA 4KYDA 2QSXA 2RC9A 1MXVA 1N7WA 3H6VA 5KCJB 2XXUA 1NH7A 5AA2A 3K1MA 1PB9A 1QKBA 3FATA 3KJ7A 1FTKA 3T9XB 1XVYA 4N07A 3O9PA 1MXWA 2HAUA 4UACA 4M4GA 4K3FA 3S9LC 4N6PA 1USYE 4RXLA 4KYSA 3LBSA 3W9WA 3ZSFA 4P11A 2E1SA 3BKIB 1JNFA 5I56B 1TWYA 4ZEIA 4ND9A 4H8JA 4YB5A 5H8FB 5I2KB 3MWBA 3PUZE 2X7PA 4YZZA 4IB2A 4LP2B 4QFPA 3THIA 1VFDA 4TOZA 3U72A 5AA4B 4L17A 4ZS9A 5CRYA 1MRPA 1FTMA 4POXA 1TT1A 1PBQA 3TELA 3BFUA 3PPQA 1SW1A 3TTNA 3RPWA 1EZ9A 4BDLA 1LCFA 1P1QA 3ZKKA 4WEDA 2QMXA 2XXYA 3UN6A 3TTMA 1B7ZA 4IO6A 4MF3A 3U1OA 2ZYOA 2ZMBA 2I0CA 2I3VA 2DXYA 1ZIUA 2UVIA 3IOTA 1MH4A 1QKAA 2F7AA 3T9UA 4UA8A 1BIYA 3E13X 2XHDA 1RKMA 1SDXA 3PU5A 5CBRA 1CE2A 5TPAB 3SESA 2PMSA 3K6UA 3LC8A 4NF6A 5FTIA 1ZTYA 5EYFA 1Q35A 4HCWA 3IR1A 3RNNA 2Q2CA 1US4A 3UP9A 4QFKA 3CSGA 3WAFA 3CVGA 4JSOA 5A5XB 1MY3A 4ZZEA 2V93A 1LLSA 1S7YA 3EHUA 1NNTA 3EHTA 3T93B 5HPQA 2F6GA 4G77A 4OETA 4LQ2A 3RTWB 2FA7A 3TFLA 5F1QA 1L5TA 2D21A 3ZKLA 1UTHA 2XX8A 2RKMA 3FUZA 3S9NC 3TTRA 1Y4CA 3VVEA 1N3XA 4GWOA 1M5FA 3FVNA 2FYIA 3CIJA 2ONRA 4OFLA 2ZYMA 1M5DA 3H4ZA 1B4HA 4YKPA 4XTCQ 2Q88A 2W7YA 4JWOA 4F3GA 4DDDA 2I4CA 1OVTA 3QSLA 1B2HA 4RK2A 1MPDA 1AH5A 3DP8A 2A5TA 1PC3A 2ZNTA 1QUIA 3Q26A 4OHNA 2RCAA 3B6QA 4U22A 4ZEFA 3TQWA 2F5XA 3G3KA 3C34A 4RYAA 4LATA 3FD3A 1SYIA 2ZYKA 3KEIA 2GH9A 3L6HA 3V8XB 4NF5B 4F29A 5LOMA 3KBRA 1OLAA 5H8QA 4R2BA 1N0TA 4R2FA 4AB5A 3S9MC 2PVUA 3QYTA 4IGTA 3IO4A 1EH3A 2ZNSA 5BUUA 3VDFA 2UVJA 2AL5A 1B3FA 3FZVA 1HSJA 3HHGA 1A55A 3S2VA 2REJA 3VLWA 2RCBA 1AMFA 4HW8A 3FVKA 3AXFA 4F18A 4NF4B 4R9FA 4ESXA 4IO5A 3ECRA 1IITA 3R6UA 5CMCA 1MS7A 4R9GA 4PQJA 5FTHA 5B7DA 4EQBA 2IEEA 2UXAA 1SW4A 4H67A 4F3BA 3GXAA 3F11A 3U8QA 3PD9A 3PPOA 3CSBA 5I2NB 3QAXA 5K2YA 4YICA 3TQLA 1FTOA 4LONB 4ZE8A 3D4GA 3OMBA 5L9OA 4IGRA 3O97A 4NWCA 2R6GE 2RC7A 4NMYA 3TCFA 1MPCA 4GD5A 5H8HB 1N04A 5DVJA 4NWDA 4LQ5A 1B1HA 2ALUA 1H3DA 2B3FA 1XVXA 1RYXA 1ZU0A 5CI5A 1ELJA 1F9BA 3W9VA 4WEPA 5B70A 4QSDA 1M5CA 3H3GA 4U21A 5M2VA 2Y7WA 3H6UA 2F34A 3OD7A 2HZLA 3O2AA 3CG1A 5H8NA 3MC2A 1GR2A 4GXAA 5F7VA 3U92A 3PD8A 2I58A 1QUKA 3O66A 1ATGA 3EQ1A 4F2OA 1YTVA 4C1TA 5H8SA 4QF9A 2XXXA 3K6WA 4KI0E 4H5FA 4JWXA 4EQ9A 3SEYA 1Y1ZA 1B6HA 1N7XA 1B3HA 3A09A 2DP8A 1ZBMA 3OO9A 4F3SA 4G8MA 3E3KA 1LGBC 4ISUA 5FHMA 5AA2D 2HAVA 1ZMGA 4WXJA 4IY5A 3K6XA 4LVQA 1EZPA 1MDP1 4KCDA 1A7LA 1B32A 1P99A 2XXHA 3H03A 1IQ7A 4EXKA 5L9MA 2V3UA 2NUVA 1MM7A 4KHZE 1USYH 2G29A 3KOSA 3HV1A 4GVOA 1BTJA 3VVDA 3RN8A 1MXZA 2DWHA 3PUXE 3MPKA 3C31A 5KCJA 3VV5A 3SEXA 4QSCA 3KFMA 1ZKBA 1QW0A 3USDA 1LSTA 1IXCA 3RTFB 3VXBA 3ONMA 1A40A 4OMBA 2H9BA 3S4UA 3IJOB 5I56A 2CMOA 1PB7A 3C36A 3GZGA 2Q8JA 1LFIA 3VLUA 5H8FA 1RYOA 5I2KA 2ANJA 2G93A 4BDNA 4Q8RA 2XXPA 3MVYA 5L8DA 4H5GA 1O64A 4R72A 3RGYA 1LB9A 3U93A 1LFHA 2PBWA 5AA4A 1YPNA 2OCUA 3E4RA 5K2XA 2HEUA 1O7TA 5KZTA 5CMMA 3TCHA 4P0IA 5IKBA 4TQUQ 1B5HA 4Z0IA 4XIGQ 4EXLA 4ZEDA 3QXMA 1AOVA 4NE4A 1JETA 1T0KA 1O63A 3SETA 3BBRA 4U1OA 1MQDA 3SKPA 1TXFA 2P2AA 5CMBA 2Y7RA 2Z22A 3K01A 5IAIA 3K0VA 3TPAA 3IORA 2HFBA 4TLMB 1QUJA 2HCAA 2XD2A 2DWIA 4KR5A 2B65A 4ZE9A 3K2DA 3CRBA 4I62A 1MDQA 2PT2A 1FQBA 4LZ8A 1OQHA 3TUSA 4ZEKA 1ANFA 3DP4A 4QFNA 5CM6A 5TPAA 3TYHA 2XXTA 4QFOA 4ESWA 1MQJA 2DXRA 3KGCA 4F2QA 1IUDA 4Q0CA 2DOJA 4PE5B 4YB6A 3IB2A 3FV2A 4KPTA 1GV8A 5A5XA 3TMGA 2FNCA 4THIA 2I4BA 5ITOA 5HBCA 3MVWA 3L6GA 1MXXA 2THIA 1JQFA 2F7BA 3IK6B 3IL1B 4P0GA 4X9TA 1DPEA 3SEWA 3CR9A 4BDQA 3TAJA 1Y20A 4XXUA 2NXOA 2XXRA 2H25A 2F36A 3SERA 3M3KA 4KD5A 5TU0A 5ITPA 1FQEA 4F3PA 4GXSB 4OQOA 2ZXTA 4OVJA 4XKNA 3CFZA 4C0RA 3FVOA 4ZEBA 2V3QA 2DQVA 4IO4A 1I69A 1XHYA 5DVFA 1OIBA 1US5A 1SI1A 2LAOA 3VVFA 3HPIA 3T9VA 4QFLA 4PFTA 4NF5A 3V89B 1NNFA 2Y7KA 3N94A 3RUMA 3KG2A 4XKQA 1ZJLA 2H98A 3TZAA 1NFTA 3O29A 4YMBA 1VFEA 3LUYA 3EHSA 1HSLA 1S9TA 3PMXA 3HHFA 1MH3A 1MG1A 4YKJA 1QVSA 3UK4A 1Y4TA 1B40A 1H43A 1FTLA 3C9HA 3HSTA 2DVCA 3EF7A 1BLFA 4FIMA 4NF4A 3FGSA 4I9DA 2XD3A 4HCYA 5JTYA 3CG3A 2ABHA 3A3UA 3SEUA 3H6TA 4NF6B 3TTKA 2F6PA 2A5SA 4GL0A 4EF2A 3GLBA 3O28A 3IJXB 1LAGE 4R6HA 5I57A 3HN0A 2QS2A 4HS7A 1Y1MA 2REGA 4FEBA 1D4NA 1A8FA 1YCJA 5I2NA 4LA9A 3O6GA 1WVJA 4PFUA 1FQFA 3PPRA 2R71A 2QS1A 4OFOA 1UTHB 3R26A 1NKXA 4F1YA 3OSRA 1A8EA 2E0SA 1VSOA 4G8NA 5FHOA 5CBSA 1H44A 4IY6A 2O7IA 5I84A 4POWA 5KDTA 2Q2AA 1P1OA 2IA4A 4KCCA 1ZLQA 1IEJA 3PMWA 2A5TB 4DCXA 1JVXA 2XXIA 4NF8B 4PFWA 3TODA 3GBBA 5AE4A 3OELA 3FIRA 3H06B 2NVUB 4H8IA 5J1DA 1DTGA 3MBPA 4OEUA 4YB7A 2O1MA 3RY3A 4EQ7A 4GLIA 1R6ZA 2QMWA 4ELQA 3DELB 2DE4A 3I3VA 5H8QB 4BDRA 2AYSA 3KOTA 2F8DA 2VHAA 4JBZA 1B0LA 1URDA 3B6TA 3RQTA 2XX7A 4KQPA 1WODA 4MBPA 4JWYA 4KFQA 5AA3A 3OXNA 2F97A 1B7HA 3SDFA 4FE8A 3FXQA 3KSXA 4OXVA 3RT6B 3T66A 4YMAA 1AIVA 3MPLA 3UIFA 4LZ7A 2XXQA 5I58B 4H0WA 3CFLA 3ZS6A 5DEXB 1M5EA 4ZECA 1DMBA 3IB1A 2Y84A 3PMVA 3Q27A 3S9EA 1MQGA 3DP6A 2UVHA 3MQ9A 4Q5TA 4WKMA 3HCQA 5EHSA 5BWJA 3G3HA 3TKDA 3FJ7A 1B7UA 3IOVA 3FASA 1B5IA 1YAEA 3K00A 1NH8A 3WAEA 3V5AA 4BLAA 1SYHA 2OBGA 3JZJA 1JEUA 1URGA 1R9LA 4R6KA 4O3AA 1AL3A 4JSDA 1OLCA 4DIGA 3V83A 1URSA 1LCTA 1Q1KA 1TFDA 4M1VA 3T96B 1BKAA 1B58A 5H8NB 3FVGA 4FORA 3RLFE 4R75A 1IXIA 4MLQA 1NMUA 3JV9A 5ICTA 4G68B 1B3GA 1LBCA 4IO7A 4G4PA 3CI8A 2DE3A 1B0HA 4RNSA 1UIUA 3PUVE 1PDAA 2XXVA 1GVCA 3MVZA 5DT6A 2OZZA 1MXUA 1R9QA 1LAXA 1D9YA 3FXUA 4BDOA 1XT8A 2I49A 3K4UA 5TP9B 3K02A 2ONKE 4ZZAA 5L9SA 1IXHA 1P1WA 3OENA 4GQOA 4DZ1A 5I59B 3G3JA 3N6TA 1Y9UA 3N5LA 2B3BA 3OEMA 3M3LA 4BDMA 2V3TA 3I5OA 4JDFA 1H45A 1GGGA 4XKPA 4H65A 4FAJA 4U4XA 2OWTA 3EPEA 2Q89A 4N13A 2QL3A 3M3FA 4OFJA 2PYYA 4OTEA 4RJZA 3BFTA 4FATA 1B46A 5FHNA 4YKKA 5DVIA 4I1DA 3W15C 2O7UA 4E0XA 3TDJA 3N6UA 4JB7A 2Y7PA 2DYXA 5HM4B 4R6YA 2VP1A 3OEKA 1VE4A 4AQ4A 1I6QA 4X48A 1UTBB 3KJTA 3GBAA 3Q29A 4TLLB 3LSFB 3VE1B 2Y7IA 2V84A 4OERA 4NTLA 3LSWA 5CC2A 4FECA 2Z23A 3FJMA 4H1XA 2I6EA 4F31B 2QPQA 2I3WA 3H7MA 3MP1A 1JEVA 3IOWA 1MQIA 3FXRA 2UYFA 3IO6A 2OJTA 2QS4A 4F1VA 1B3LA 4G68C 4IO2A 2UVGA 3ODBA 2RC8A 1SI0A 4ZDMA 3EN3A 2VGQA 5AA2B 4PFYA 4MFIA 4OWDA 1FW0A 4YAHX 1P1UA 1B5JA 3FV1A 4RK9A 1MY0A 4GF8A 2V25A 2H99A 2D5WA 2VD2A 3A3CA 4ELOA 1MPBA 1DOTA 1A99A 1SVXB 5EHMA 1LBBA 1B4ZA 3MW0A 4IO3A 4AB6A 3O6HA 1UIVA 1BP5A 4QHQA 1IIWA 1IZ1A 4X1BA 1WDNA 2QRYA 1JVYA 3OO6A 5ICQA 2F7CA 2Z8DA 4C1UA 2O6AA 4Q30B 4QSEA 1JW4A 4FJPA 2D3IA 2VD3A 3KSJA 2OWSA 4HTGA 2F35A 2GHBA 3VFJA 1N3WA 1FTJA 2H5YA 3MJNA 2Z8EA 2DVZA 2NOOA 2VOZA 1QULA 1POTA 1LAFE 4EF1A 1DSNA 1SW5A 1DTZA 2F78A 3IB0A 3E9XA 3MZBA 2M8CA 1A54A 2QJEA 3D4CA 2OLBA 1LFGA 2O51A 1FQCA 2NWJA 1EU8A 2GHAA 3KN8A 4GFRA 3PPPA 3K6VA 3CFXA 4OESA 4U1ZA 1I6BA 4F22A 4XKRA 4F19A 5AA1A 4ELRA 1I6AA 3MVXA 3IAZA 4U2RA 4GRKA 2DWJA 3TCGA 3KN3A 1B05A 1LB8A 2DWAA 4GIZA 4F39A 2X26A 4O3CA 4I8CA 4NF8A 2ZYNA 1II5A 3PV0E 2RF1A 1NL5A 1B52A 3G3FA 3Q28A 3KN7A 4DXUA 1XOCA 4ONYA 3C33A 1SD3A 4GOTA 2R9JA 3OSQA 2GRVA 2Z8FA 4OENA 1NNPA 2HXWA 3DLNA 3DM0A 3G3IA 3M8UA 2I0BA 4U23A 2OK2A 1MQHA 2P0SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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