2V3UA

Structure of the ligand-binding core of the ionotropic glutamate receptor-like glurdelta2 in complex with d-serine
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
261
structure length
253
Chain Sequence
b'GGVVLRVVTVLEEPFVMVSENVLGKPKKYQGFSIDVLDALSNYLGFNYEIYVAPDHKYGSPQEDGTWNGLVGELVFKRADIGISALTITPDRENVVDFTTRYMDYSVGVLLRRGTSIQSLQDLSKQTDIPYGTVLDSAVYQHVRMKGLNPFERDSMYSQMWRMINRNNVLESQAGIQKVKYGNYAFVWDAAVLEYVAINDPDCSFYTVGADRGYGIALQHGSPYRDVFSQRILELQQSGDMDILKHKWWPKNG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR DELTA-2 SUBUNIT
publication title Ionotropic Glutamate-Like Receptor {Delta}2 Binds D-Serine and Glycine.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Receptor
total genus 81
structure length 253
sequence length 261
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3uA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3uA02
4DXUA 1WVJA 1DOTA 3M3FA 4U21A 2HZKA 3VE1B 4PP0A 3KN3A 4RJZA 3VFJA 5I58A 1A40A 2RC9A 5DTBA 3RY3A 5ITPA 2ZYKA 1PC3A 2QS2A 4OFLA 3QUJA 4QRZA 1ZIUA 4NEDA 3VLUA 4QFPA 5H8HB 4FJPA 4F2OA 5CM6A 1I6BA 3FVOA 3MZ1A 4IO7A 5A5XA 4DXCA 5AA4A 3SEWA 3OSRA 4O3AA 1JVXA 5FTIA 4NMYA 1MXVA 2D5WA 4R9GA 1D3KA 4KYEA 1FQEA 1A7LA 3PD9A 2I49A 3FXQA 4YKIA 3PUXE 4JWOA 2UVIA 2ZYOA 3K1PA 1IUDA 1NNFA 2DE3A 3TUSA 3S4UA 3H4ZA 3T96B 4KCCA 1B51A 3N6UA 3PUWE 4YICA 1LBCA 3OMBA 3H06B 1II5A 1R1NA 2VOZA 3UK4A 2ONRA 1MM7A 1JW4A 1NNPA 4UA8A 3BFUA 1XT8A 4QSEA 1IXIA 4QFNA 3PPPA 2WKYA 3LBSA 3KFMA 4IY5A 5CMMA 3TKDA 3JYRA 1H45A 3GLBA 2IEEA 5BUUA 3W9VA 1N76A 3K2DA 1H3DA 2IA4A 4PQJA 4LZ8A 1HSEA 4KPTA 5ICQA 5I2KA 3H7MA 4IB2A 4LZ5A 3HV1A 4Q5TA 4NWDA 3F11A 3OO9A 3R7XA 2DE2A 4F39A 2UYEA 1M5FA 2PBWA 3UIFA 1NNKA 3UA8A 1OMPA 4F22A 4BDQA 1IXHA 3OO6A 3MVXA 3MZBA 3OO8A 4ELQA 4ELRA 3MPKA 2H25A 1B7ZA 4R9FA 2XXHA 3ILTB 2F78A 1VE4A 3RTWB 1SYHA 1IITA 2HXWA 3ZS6A 3QXMA 3PU5A 4N6PA 3LSLA 3MP8A 1B3HA 3VDFA 5H8HA 2OZZA 1GR2A 3DP8A 1SI1A 4ZEDA 4ISUA 5AA2B 4P0IA 1QULA 3FXUA 4ZEKA 3OSQA 1ZKBA 5AE4A 3C35A 2F6GA 4HCYA 4GVOA 4R74A 4JWYA 1ELJA 2F6PA 3QSLA 1XS5A 1MY1A 1JEVA 3FASA 3A09A 2RINA 3PPNA 2DWAA 3B7DA 3K01A 1IIWA 2QMWA 3RPWA 4KI0E 3K6XA 3CRBA 4R72A 1B5HA 1JW5A 3H6WA 3MAMA 2Z8FA 4E0XA 1SQYA 2ONKE 1D9VA 2CZLA 4F1YA 2O7UA 2RC7A 3TAJA 1HSJA 1B40A 4YKJA 1PBPA 3KBRA 3K1NA 4RY1A 4YKPA 2ONSA 3Q26A 3IO4A 2Z23A 1UIUA 4H5FA 4R2FA 3ECRA 4ESWA 2V3UA 4U23A 3RLFE 1XC1A 1LFGA 1N0TA 1B2HA 2KLFA 3JZJA 1R9LA 3CFXA 2DXYA 1Q35A 4M1VA 3A3UA 3LR1A 2A5SA 4G4PA 5KDTB 2I48A 2ZNSA 4BDMA 2VD2A 4U2RA 4OESA 4ZZAA 4IY6A 4RA1A 3S9LC 2XHDA 3N26A 3S9NC 3C32A 3FZVA 1WDNA 2XXIA 1FQDA 2RC8A 2Y7IA 2B65A 3RNNA 3ODBA 4RK9A 1BP5A 3T93B 3K6VA 4F3PA 2DS9A 1MXZA 2A5TA 4MF3A 4FEBA 3KEIA 4ZEIA 2V3TA 3UORA 3MBPA 3FV1A 5M2VA 1FCKA 5AA2A 2UYFA 3MUQA 4BDNA 4WEPA 5TPAB 4ESXA 3SETA 2OWTA 3E13X 3K0VA 2FNCA 2LAOA 1YTVA 1MXUA 3MW0A 3ZSFA 3IB1A 1B32A 1JVYA 1NL5A 1S7YA 5I59B 1MPBA 1LGBC 4TLMB 2ZYMA 4KFQA 3P7IA 3CR9A 3M3LA 4BDOA 4EQBA 4OZ9A 3R26A 3USDA 4PFTA 5JK4A 5CBSA 3IK6B 3UN6A 4ZEBA 1VSOA 5HPQA 4E0WA 5KCJB 2O1MA 1LSTA 2PYYA 2HQ0A 1UIVA 1OLCA 5H8FB 3G3JA 3TTNA 3GBAA 4JXIA 4THIA 3SESA 4RNSA 2H5YA 1TFDA 3C9HA 4LVQA 1BKAA 3O97A 2HCAA 3U8QA 2QSXA 5DT6A 2NWJA 4RK2A 1B1HA 5H8NB 3E4RA 3O9PA 4G68B 4G8MA 1B4ZA 1USYE 1EZ9A 2Q2AA 3SKPA 1LAGE 3DELB 3TPAA 1AMFA 4KCDA 5I84A 3UP9A 3N5LA 4KYSA 3VVEA 4C1UA 2XXWA 4RPOA 1I6QA 1NNTA 1VFDA 3PMXA 4I8CA 4GLIA 3KOSA 2Z22A 5TP9B 4POWA 4HW8A 3A3CA 3TQWA 4U22A 1QW0A 3EN3A 1TT1A 3EHSA 3G3FA 2R9JA 3SERA 1RYOA 4FE8A 5BWJA 1P1NA 3TMGA 1B46A 1FQAA 3FUZA 3CVGA 1B6HA 4G68C 4DXBA 2XXRA 1OQGA 1PBQA 3V5AA 3CSBA 3MVZA 2ABHA 1UQWA 1M5EA 4IO2A 4XKPA 3IAZA 4ZEFA 4QFLA 5TPAA 1EZPA 4QSCA 1N3WA 1M5DA 3FJMA 1MS7A 2I6EA 1URGA 1ZTYA 3IOUA 4KR5A 4IO5A 2XXQA 3TTRA 1B7UA 4DIGA 5I59A 1MH4A 3OENA 5AA2D 4F1VA 3KJTA 4XKQA 4XIGQ 1P1QA 3WAFA 1SVXB 4AQ4A 4HCWA 4JDFA 5KCJA 3MZ9A 3SDFA 3FATA 2I3WA 2VD3A 3FXRA 4QSDA 3V8XB 2V84A 2W7YA 2QS1A 1URDA 5H8FA 2R71A 3DLNA 3MC2A 4YB6A 1QVSA 4XXUA 3CIJA 4OYVA 2PVUA 3RTFB 4NF8B 1FTLA 2PX1A 4HS7A 3V83A 2F7CA 4F31B 4DE8A 2ZYNA 2XXXA 1B1XA 4I62A 1BTJA 3TYHA 2D21A 2NVUB 4EF2A 1XOCA 2YLNA 4X1BA 4H5GA 3G3KA 3O29A 3R6UA 1AOVA 5JEIA 3OO7A 3FVNA 5DVIA 2UXAA 1TWYA 3BBRA 5CRYA 5EYFA 3MVYA 1FQFA 3QK6A 1H43A 2QMXA 5TP9A 5AA3A 4G8NA 2I0CA 5ITOA 3G3IA 1EU8A 1XHYA 1T0KA 2I4BA 5CC2A 1B3GA 1VFEA 4X9TA 5DYHA 3HHFA 3IO6A 3GXAA 3H6TA 4OFOA 3T66A 3M3KA 1DPPA 1B4HA 3IR1A 1ZMGA 4WKMA 1MXWA 2Q89A 4U1OA 2B3BA 1TXFA 2X26A 5CMCA 2E0SA 5H8QB 3CI8A 3KSXA 4ZECA 1MRPA 3W9WA 2QJEA 3T9VA 3FJGA 1N84A 5FHOA 3VXCA 3CG1A 3TZAA 3G3HA 3TDJA 1NFTA 4O3BA 3MQ9A 3E9XA 1JETA 4YAHX 1Y4TA 2Z8EA 4LZ7A 4GL0A 2VHAA 4BDLA 5JTYB 4EUOA 5I2NB 4ECFA 2REGA 2VGQA 4H0WA 1Q1KA 2XXTA 1QJMA 1DPEA 1ZLQA 1B3LA 1JEUA 4QF9A 1MY0A 2UVJA 1Y3NA 3PMVA 3VVFA 4PFWA 2V93A 2Q88A 4H8IA 5ELVA 4GFRA 4NF8A 4QFOA 5B70A 2P1SA 3V89B 2XXUA 1NH7A 3O6HA 3U93A 1ZU0A 2AYSA 1B9JA 4FIMA 4C0RA 4U1ZA 1H44A 3SEUA 3HN0A 4OQOA 1S50A 1JW1A 3UGWA 1FTOA 4GWOA 1RYXA 3IOWA 1US4A 2HZLA 4XTCQ 1IXCA 1Y4CA 1FTJA 3T9XB 3RUMA 2F34A 2HFBA 2THIA 4YB5A 4LQ2A 4MH5A 4LA9A 4GF8A 4BLAA 3N6TA 3EQ1A 3TTLA 1LAXA 3KOTA 2ESNA 1MQHA 1N7XA 1SDXA 3VXBA 3VVDA 3B6TA 1MPCA 1B3EA 3QAXA 1SD3A 2Y7KA 4H67A 3B6QA 3CFLA 4JSDA 4DZ1A 1LBBA 5CI5A 1Z7NE 1QUKA 2XX8A 1B0LA 1RKMA 4EF1A 3HHGA 1LFHA 1LAHE 1IQ7A 2HAVA 1URSA 3FD3A 1DTGA 3Q25A 5DEXB 3G3GA 1KWHA 2O6AA 4U4SA 3FV2A 4GIZA 5IKBA 2XD3A 4OVJA 4MFIA 1USYH 3O6GA 3OELA 1R9QA 3RGYA 5JTYA 4X48A 4PFYA 1PEBA 4ELPA 3Q28A 2H9BA 4DCYA 2DSFA 3KZGA 1P1WA 4OETA 2V25A 2OJTA 2OWSA 5I58B 2I3VA 4IO3A 5H8SA 2XX9A 4BDRA 3H03A 4YB7A 1IZ1A 1YPNA 3OXNA 3ZKKA 4X1DA 3LSWA 1MXYA 4NF6B 2O84X 5AA1A 4F3SA 4R6HA 4YMBA 5B7DA 2F7BA 1M5CA 2PT2A 3I6VA 3IOTA 3RN8A 2Q8JA 1UTBB 1CE2A 3O28A 3RT6B 3IORA 4LONB 4ZE8A 4I1DA 3M8UA 5TU0A 2I4CA 3H6UA 3Q29A 4EXLA 4Z7EA 4EQ7A 3TTMA 2XX7A 2RCBA 4IGTA 3C33A 2OCUA 4R6YA 1A8FA 1CB6A 3PMWA 3FVKA 2F35A 2HAUA 4ELOA 2DQVA 1SW4A 1O64A 1Y20A 4YZZA 1AH5A 1MQGA 5KDTA 1PB9A 3RT8A 2CMOA 4FAJA 4G2ZA 4R73A 1N7WA 5CMKA 3ILUB 2BJJX 1DSNA 3KJ7A 2F97A 2DE4A 3FJ7A 5L8DA 4MLQA 4XKNA 2P2AA 5L9OA 1GVCA 3TCFA 3OOAA 1MH3A 4IO6A 3TTKA 4Z0IA 2GH9A 1O63A 1MPDA 2XXVA 1QKAA 1Y3PA 4GXSB 2QS4A 2O69A 5DEXA 2DWIA 1MM6A 4UACA 3RQTA 4LP2B 4H65A 3OEKA 1D9YA 3E3KA 1ZBMA 4IO4A 3H6VA 1B7HA 4AB6A 3S9MC 4I9DA 4GQOA 5DVJA 1LB8A 1SI0A 3G7WA 3S9EA 5F1QA 1EZOA 2DYXA 1B3FA 4ZE9A 3O6IA 2O68A 3AXFA 3TQLA 3QUFA 1YAEA 5FTHA 2Y84A 2ALUA 4WEDA 2XD2A 5ICTA 1Y1MA 4NF6A 1LLSA 3LC8A 2QL3A 2YPNA 3O66A 3I3VA 4F3BA 4OWDA 4JB7A 3OEMA 3CFZA 4YU0A 1MG1A 4R6KA 4ND9A 1FTKA 3HO7A 5KZTA 2GFEA 1F9BA 1P1OA 5ISUA 4KD5A 4RPNA 1UTBA 3EHUA 3QIMA 5FHNA 3L6GA 4H8JA 1PDAA 4GRKA 3FIRA 5J1DA 2X7QA 4RXLA 3KN7A 2VP1A 4TLLB 2F8DA 3JV9A 3IX1A 3KGCA 3KG2A 3K6UA 1MY4A 4JWXA 3PD8A 5H8NA 4R75A 2AL5A 4OEVA 1GTKA 1SW5A 3B6WA 4G68A 1S9TA 3TODA 1OVBA 1A8EA 1NH8A 4Q0CA 4GOTA 3FGSA 2UVHA 2ZXTA 1A99A 4O3CA 2O1LA 1AIVA 1FTMA 3U72A 2I58A 2QRYA 4KQPA 3TELA 5K2XA 4G8HA 3IJOB 1P99A 4U4XA 3VLWA 4YMAA 4NF5B 1YCJA 1BIYA 1US5A 2DWJA 1I6AA 4GL8A 4FATA 4L17A 2GRVA 1P1UA 4GD5A 5L9SA 1FQCA 5EHMA 3LUYA 4TQUQ 2OLBA 3IOVA 3IB0A 1TFAA 3K1MA 2Q9TA 1JQFA 1J1NA 2DVCA 4ZDMA 1MDP1 2REJA 1VR5A 4F18A 4FECA 2FYIA 2DOJA 4Q30B 3PPRA 3K02A 1D4NA 1LB9A 1SW1A 4WXJA 3HPIA 3U1OA 3GZGA 2A5TB 1H76A 1LCFA 2O7IA 2B3FA 4H1XA 2DVZA 2P0SA 2OK2A 5I57B 4OHNA 1GV8A 3TCHA 2F7AA 1SYIA 5HM4B 1OIBA 3WAEA 1PB7A 3EF7A 3U92A 3K6WA 3PGFA 1BLFA 1ATGA 1XVYA 3BFTA 5LOMA 3IL1B 4NE4A 1OVTA 2DXRA 2X7PA 2FA7A 2ZNUA 3EHTA 1AL3A 5FHMA 3TCGA 2AIXA 3LSXA 4OTEA 1LFIA 4PE5B 3FVGA 2H98A 1EH3A 3N94A 1L5TA 3K4UA 3D4CA 2HEUA 1QUIA 2XXYA 2XXPA 3PUVE 3PUZE 3HSTA 3PV0E 4XKRA 4R2BA 1R6ZA 3DP6A 5DVFA 3SEXA 4MBPA 3BKIB 2Y7WA 4N07A 4LUBA 4NF4B 1DTZA 4PETA 4NTLA 4NF5A 1Y9UA 3MP6A 4IGRA 4P0GA 1Z7ME 4K3FA 4EDPA 1ZJLA 4F2QA 2Y7RA 1MQDA 5HBCA 4DLDA 2NOOA 3C4MA 4KYDA 1QUJA 1UTHB 4ONYA 2NUVA 1DMBA 2G29A 3MP1A 1MY3A 4PFUA 3PPOA 2AL4A 3KSJA 4OFJA 2RKMA 2ANJA 2F36A 2Q2CA 4F29A 5H8QA 2I0BA 1Y1ZA 3MVWA 4GXAA 5I56B 4OMBA 1MDQA 4MLVA 4F19A 4AB5A 4OERA 3W15C 3TEPA 4JSOA 3CG3A 3H3GA 2RF1A 4M4GA 2GHBA 2Y7PA 1B5IA 4Q8RA 2R6GE 4OXVA 2PMSA 1HSLA 4HTGA 3C36A 5I57A 5I2NA 2G93A 1NMUA 4LQ5A 5F7VA 4FORA 4FEDA 3OD7A 1MXXA 5CMBA 3SEVA 1ANFA 1SBPA 1GGGA 2DWHA 4G77A 5A5XB 5AA4B 1Y3QA 2H99A 3S2VA 2M8CA 4NWCA 1A54A 4ZS9A 5IAIA 1SW2A 2Z8DA 4KHZE 1B58A 3ONMA 2YJPA 4TOZA 2UVGA 1MQIA 1POY1 4OEUA 3DP4A 1OLAA 3VLVA 1B0HA 3LSFB 2GHAA 2OBGA 1I69A 1WODA 3IB2A 2V3QA 3KN8A 4YKKA 5L9MA 4F1UA 1FW0A 1O7TA 1POTA 1MY2A 1B05A 4EQ9A 4JBZA 3MPLA 3PUYE 4NF4A 4ZZEA 4H6DA 1OQHA 2O51A 3D4GA 2QPQA 3T22A 1PB8A 2NXOA 4LATA 3O2AA 1JNFA 3EPEA 1LAFE 3U94A 1B5JA 3SEYA 4QHQA 3TFLA 3DM0A 3QYTA 1NKXA 2D3IA 3I5OA 2E1SA 5CBRA 2F5XA 4EXKA 3ZKLA 1LCTA 1UTHA 4N13A 1FQBA 5I2KB 3K00A 2RCAA 2ZMBA 3C34A 1MQJA 2ZNTA 4RYAA 3PPQA 3VV5A 3THIA 2PT1A 5K2YA 3HCQA 3IJXB 4P11A 4POXA 4F3GA 5I56A 3T9UA 4DDDA 5EHSA 4OENA 2QS3A 4QFKA 1N04A 1XVXA 2H4IA 3GBBA 1IEJA 3MJNA 4DCXA 1QKBA 3MWBA 1IXGA 1N3XA 2DP8A 3C31A 1A55A 3L6HA 3T9HB 4C1TA 1B52A 3Q27A 1M5BA 3CSGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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