2V3UA

Structure of the ligand-binding core of the ionotropic glutamate receptor-like glurdelta2 in complex with d-serine
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
261
structure length
253
Chain Sequence
b'GGVVLRVVTVLEEPFVMVSENVLGKPKKYQGFSIDVLDALSNYLGFNYEIYVAPDHKYGSPQEDGTWNGLVGELVFKRADIGISALTITPDRENVVDFTTRYMDYSVGVLLRRGTSIQSLQDLSKQTDIPYGTVLDSAVYQHVRMKGLNPFERDSMYSQMWRMINRNNVLESQAGIQKVKYGNYAFVWDAAVLEYVAINDPDCSFYTVGADRGYGIALQHGSPYRDVFSQRILELQQSGDMDILKHKWWPKNG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Ionotropic Glutamate-Like Receptor {Delta}2 Binds D-Serine and Glycine.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR DELTA-2 SUBUNIT
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Receptor
total genus 81
structure length 253
sequence length 261
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3uA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3uA02
1FQEA 1DPPA 2DSFA 3ECRA 2Y7RA 3N6TA 4NF6B 3I5OA 4LVQA 3MWBA 4PFTA 2DVZA 4NE4A 1BLFA 3TELA 4KI0E 1NH8A 4R73A 3RY3A 1QJMA 1DSNA 1B2HA 2D5WA 4R6YA 5JTYB 3L6HA 4EDPA 3EHTA 5H8QB 1UIVA 1IXGA 1Y3PA 3PD8A 4BLAA 1B1XA 4QFNA 1B6HA 5F7VA 1A7LA 1NH7A 2F34A 4GIZA 3A09A 1PB7A 2I49A 1PEBA 4ECFA 4EQ7A 1B9JA 4EF2A 3B7DA 3GBBA 2Y7KA 4GQOA 1RYXA 1PB9A 3KZGA 3PUZE 1XS5A 5I58B 4LONB 1IXCA 1NFTA 2OWTA 3FIRA 1UIUA 2Q2AA 1B05A 3PU5A 4NF4A 1I6BA 3OO6A 1M5EA 1UTHA 1YAEA 3FVKA 3SEUA 3VE1B 2O84X 3M8UA 1URDA 4TQUQ 1LAXA 1FTOA 1DOTA 1VFDA 4ZZEA 2PMSA 3V8XB 3LC8A 4OFOA 1SD3A 3C31A 4NF6A 4IO6A 3OOAA 1DMBA 1OMPA 1TFDA 4ZS9A 2VHAA 5H8HB 3AXFA 3S4UA 4OETA 4AB6A 1MQDA 1P1QA 5DTBA 5EHSA 2ZMBA 2FA7A 1MH3A 5JTYA 1SW5A 5H8QA 5JK4A 4YU0A 4JBZA 1A40A 4HTGA 2QPQA 4JWOA 3TCFA 3TTMA 4ESWA 1EH3A 4U1OA 1B51A 3ZSFA 2H5YA 5ICTA 3QUFA 4M1VA 5I58A 3MPLA 1EZOA 1MY4A 4L17A 2VGQA 1O63A 3PPQA 1A8FA 3RTWB 3OELA 3VXBA 3FXUA 1BIYA 3E3KA 4PP0A 4R2BA 4YKPA 3E9XA 4N07A 4DLDA 1MXUA 4GXSB 4NEDA 4HW8A 3PMWA 4OYVA 4O3CA 3DP8A 1S9TA 4X1DA 4TOZA 2X26A 5L9MA 1XC1A 1US5A 1Y4TA 4KPTA 4X48A 4E0XA 3W15C 4F2OA 5KCJB 1FQDA 3TUSA 3T22A 4LQ2A 1JNFA 2Z8DA 3TYHA 3KSJA 3MP1A 1OQGA 4OVJA 3JYRA 5I84A 4H8JA 5H8HA 5FHOA 2ZNUA 3B6QA 2H4IA 3B6TA 3TAJA 1EZPA 3VLWA 3IB0A 4C1TA 2ZYNA 5H8NB 1Y3QA 2BJJX 4R75A 4ONYA 4EF1A 2HZLA 2QMXA 2DE2A 4R6HA 1H44A 4OENA 3ILUB 3PUWE 1AL3A 4F1VA 3U93A 4PETA 1I6AA 4E0WA 2ANJA 5KZTA 2QJEA 3G3IA 3M3FA 4H5FA 1OVTA 3IAZA 3IORA 4YB6A 1H43A 1UQWA 2VD3A 3V83A 1IITA 4Z7EA 4ESXA 3RGYA 1FQCA 4ND9A 3CSGA 4JDFA 3RN8A 3KFMA 4U4XA 1XVYA 1BTJA 1MXXA 3FV1A 2NVUB 1Y3NA 2YPNA 3HO7A 4BDMA 2H9BA 3IJXB 3H6WA 3O29A 3MP8A 4XXUA 1FQAA 2DWJA 2V93A 3UORA 5IKBA 4NMYA 2AIXA 2O7IA 1EU8A 2XXPA 3FZVA 3H03A 5KCJA 3G3GA 1PBQA 3KGCA 3WAEA 3TTRA 3KOSA 1H76A 1MQGA 4NF8B 1N76A 1B3FA 3MC2A 1GR2A 1B5HA 3UP9A 5IAIA 1GTKA 3G3FA 2Y7WA 2HEUA 2YJPA 4YKJA 4JWXA 4ZZAA 4KYDA 3UK4A 5H8NA 1B7HA 3OSRA 1AH5A 4WXJA 3T9HB 3VVDA 2DWIA 3LBSA 5FHNA 4ZEDA 5CMCA 2F8DA 4RPNA 1PB8A 5DVJA 1QW0A 5HPQA 1MQHA 1Y20A 3DELB 3IJOB 4JSDA 2XHDA 2F5XA 4OMBA 5H8FB 4DDDA 3Q28A 4U2RA 2Z8EA 4G8HA 2F6PA 4IGRA 2GRVA 4Z0IA 4XKPA 3PMVA 3FV2A 3OEMA 4QSDA 3DP6A 5M2VA 3FD3A 4OWDA 2OLBA 2QS4A 3R7XA 2XD2A 1GVCA 4EQ9A 3K6VA 3FJMA 2F36A 5EYFA 1T0KA 3S9NC 1JETA 3CRBA 5BUUA 4YMAA 2ABHA 1B3HA 3CFZA 2QS2A 5ITPA 4X1BA 1JW1A 3MZBA 2Y7PA 4YB5A 2QSXA 4KD5A 3RUMA 5AA2B 3N26A 2HXWA 4R74A 4PFWA 2B65A 4DXCA 3M3KA 4U22A 3H3GA 1B52A 1B4ZA 4F31B 3A3CA 3P7IA 2GH9A 4G2ZA 4DCXA 1LFHA 4RK9A 3PUYE 3TQLA 1JW5A 1ZIUA 1MQJA 4Q30B 2ONKE 4POXA 3V5AA 3SKPA 4BDQA 5FHMA 2UYEA 4ZECA 5A5XB 2V3TA 3N5LA 3DLNA 5J1DA 1O7TA 3FVGA 2I3WA 2A5TB 1FW0A 4WEPA 2QL3A 1Y4CA 2RC7A 2XXUA 4QFKA 4ZE8A 3K1MA 1D9YA 3G3HA 1PC3A 4BDOA 2OZZA 4EQBA 4XIGQ 4LATA 4I8CA 3QXMA 2FYIA 3LSWA 3IR1A 1FTKA 1P1NA 4ZEIA 4XKNA 1SQYA 3O28A 3UGWA 1US4A 1TWYA 1QUKA 3G7WA 4H8IA 5KDTB 1IXHA 1SI1A 4GF8A 4FATA 3SEVA 2REGA 4YKKA 2UVHA 3Q29A 4RXLA 4YB7A 4IY6A 4WKMA 3EF7A 3BFUA 2I3VA 1LGBC 1CE2A 5AA2A 4IY5A 4MFIA 3K4UA 5I57B 4IB2A 3R26A 4PE5B 1FCKA 4KYSA 1OLCA 2O69A 3OO9A 3LSFB 2OK2A 3C9HA 4JB7A 3MBPA 1II5A 2PBWA 3IOVA 3JZJA 3OEKA 3TDJA 4TLLB 2I6EA 3C34A 4FECA 2GFEA 3K1PA 2GHBA 1HSJA 1VR5A 4OTEA 5A5XA 1B5IA 4Q5TA 1MY1A 2A5TA 4KYEA 1NKXA 4ELPA 1LLSA 4ZDMA 4LZ7A 4NWDA 2Z8FA 3GLBA 1HSEA 3SETA 3Q27A 3QSLA 1N7XA 2QRYA 1NNTA 1QUJA 1PDAA 4GLIA 2D3IA 4F3GA 3O6IA 3THIA 1XHYA 5KDTA 3S9LC 3RT8A 1H3DA 2H25A 4DE8A 1B3LA 4I1DA 2B3BA 3W9VA 3GZGA 1M5DA 2DXRA 3HN0A 1B4HA 1B1HA 1LFGA 2DWAA 4LP2B 1YCJA 3RPWA 3HHFA 4F2QA 3JV9A 1P1OA 4G68B 4FEBA 3T9XB 1TXFA 1L5TA 5I57A 1AIVA 3K1NA 3MUQA 1MXYA 5HBCA 1O64A 2H99A 1URSA 3CI8A 3B6WA 4KCDA 3VFJA 2RC8A 3IK6B 4LZ5A 3SESA 4RA1A 4DXUA 4GXAA 5JEIA 2I4BA 3PPNA 5F1QA 4R72A 3K2DA 1NNPA 1LCFA 2FNCA 2Q8JA 3CG3A 4IO3A 1SYIA 4DCYA 1ZJLA 3FXRA 2PYYA 2W7YA 2DP8A 4TLMB 4U23A 1LSTA 2HAUA 4G77A 3F11A 1MRPA 4G8MA 5TP9B 3FVNA 1NMUA 3E13X 4IO7A 2XXWA 2XXRA 1B46A 3MQ9A 3OMBA 4C0RA 1SBPA 1LCTA 2Y84A 3TFLA 4KHZE 4RPOA 4FORA 3EHSA 3EQ1A 1R6ZA 4EXKA 2P1SA 2Q9TA 1N84A 5I2NB 3DM0A 1LB9A 1NNKA 4G68A 1GV8A 3IOTA 3HHGA 4MF3A 3TEPA 3VVFA 4H1XA 1Z7NE 3I6VA 3K6WA 1FTMA 4OQOA 4FAJA 3IB1A 2RCAA 1ELJA 4DXBA 3QIMA 2G29A 1M5CA 2REJA 2IA4A 2XX8A 3HV1A 2XD3A 2O7UA 2DVCA 1SI0A 4LA9A 4QHQA 3EN3A 3IX1A 3FATA 4QFOA 3VLVA 1A54A 2UYFA 2I4CA 3OENA 3K0VA 3Q26A 1SW2A 3SDFA 1WDNA 2O51A 4FIMA 5CBSA 3USDA 3ZKKA 2OCUA 4GL0A 4U4SA 4THIA 5B7DA 5DT6A 3D4CA 3HPIA 3KJ7A 3PGFA 4WEDA 1Q35A 3A3UA 5AA3A 1SVXB 3S2VA 1Q1KA 3GBAA 5AE4A 4G8NA 2OWSA 3KN7A 4ISUA 4PFUA 5TP9A 3PV0E 5CM6A 3Q25A 2V84A 1N3WA 1ZKBA 1MPCA 4AQ4A 1ZMGA 4YZZA 4I9DA 4ZEBA 1WVJA 1IIWA 2DQVA 1N0TA 2XXVA 1MY0A 5CRYA 5I2NA 1B58A 4JXIA 1R1NA 5FTIA 1OQHA 3OSQA 1MXWA 2DXYA 3HCQA 3KSXA 5ELVA 1MPBA 4IGTA 1LAHE 4ELRA 4DIGA 1F9BA 4ELQA 2QMWA 3O6GA 3U72A 1MY2A 2F78A 5LOMA 2Y7IA 1FTLA 3PMXA 1PBPA 2X7QA 2QS3A 4BDNA 3K02A 3KEIA 3C4MA 2O1LA 2H98A 3RLFE 3QK6A 5I56B 3KOTA 4C1UA 5L8DA 2XXXA 1QVSA 3DP4A 3ILTB 2ZNSA 3K00A 2IEEA 2HCAA 3C33A 1AOVA 1QUIA 1Y1ZA 2PX1A 1LBCA 1SYHA 2PT1A 3O2AA 3T66A 3U92A 5CMKA 3G3JA 3C32A 4R9FA 2KLFA 3MZ1A 1JVXA 3KJTA 4O3AA 3SERA 2GHAA 1TFAA 1M5FA 4QSCA 1RKMA 5K2YA 3LUYA 5DYHA 1NNFA 2F7CA 4R9GA 4YMBA 4NTLA 2PT2A 3CIJA 1NL5A 5DEXA 3VVEA 3ZKLA 3OO8A 1D3KA 1Z7ME 1B40A 1P99A 5TU0A 1AMFA 1MQIA 2PVUA 2F6GA 4OZ9A 3RQTA 1B7UA 4P0IA 4F19A 3UIFA 2I58A 4EUOA 4XKRA 3O66A 2ESNA 3SEYA 2HQ0A 3T9VA 3WAFA 1M5BA 3TMGA 2ZYKA 3TTNA 2NOOA 1POY1 3IB2A 2DE3A 1S7YA 3PPPA 4X9TA 2VP1A 3MAMA 5TPAB 3MP6A 1B3EA 3IO4A 4JSOA 4F29A 3L6GA 3TODA 1GGGA 4G68C 2Q89A 1UTBB 4P11A 2ZNTA 1Y1MA 1XT8A 3VV5A 2O68A 2XX7A 1B3GA 1KWHA 5I56A 1JEVA 2YLNA 4KFQA 4KQPA 3M3LA 3KG2A 1B5JA 3SEXA 3TZAA 3QAXA 3V89B 4DZ1A 3C36A 4OESA 1SW4A 2V3UA 1YTVA 3MZ9A 4H6DA 3FXQA 3VXCA 2X7PA 1D4NA 1ATGA 4GVOA 4OEVA 2NWJA 4XTCQ 2ONRA 3MVXA 2RCBA 2XXYA 2V3QA 3FUZA 4OHNA 2OBGA 1URGA 5CC2A 4PQJA 3TCHA 4OEUA 3SEWA 3MW0A 1USYE 5CMMA 1POTA 3PPOA 2VD2A 4OFLA 3VLUA 1DPEA 4GL8A 4XKQA 4OXVA 2LAOA 1Y9UA 2F7BA 3BFTA 4GFRA 3FGSA 5EHMA 2XXIA 3CFXA 1CB6A 1ZBMA 4ZE9A 2UXAA 2UVGA 3HSTA 4F3SA 4H65A 1IUDA 1LAFE 1VE4A 2I0CA 3T93B 5ISUA 2XXQA 4IO5A 2HZKA 1B0LA 4U1ZA 2P2AA 4QRZA 3VDFA 5TPAA 3MVYA 2AL5A 3CG1A 4QSEA 2M8CA 4F3BA 5I59B 3IO6A 4KR5A 1UTBA 3U1OA 3O6HA 1B7ZA 4F1UA 1IEJA 3S9MC 3IOWA 4MLVA 3PUVE 1P1WA 3O97A 2F35A 5B70A 1JVYA 4HCYA 1VFEA 2QS1A 2R9JA 3D4GA 3MVWA 1MPDA 2V25A 4MLQA 4ZEFA 4H5GA 4RNSA 4H67A 2O1MA 3PPRA 1R9LA 2ZYMA 3CVGA 2AYSA 3N6UA 4GD5A 1XVXA 2E1SA 1B0HA 2AL4A 5HM4B 3OO7A 4H0WA 3H7MA 3ZS6A 5FTHA 3CSBA 3GXAA 4LUBA 5AA1A 1MDQA 3IL1B 3C35A 3FJ7A 5H8SA 3BKIB 4ELOA 4IO4A 4OFJA 2Q88A 4P0GA 2E0SA 3FVOA 2Z23A 1LAGE 2Q2CA 2R6GE 2NXOA 1QULA 4QF9A 4MBPA 4M4GA 4LQ5A 2P0SA 3LR1A 5I59A 4R6KA 4NF5B 2RKMA 2WKYA 3G3KA 4K3FA 3EHUA 5DVIA 1JEUA 4ZEKA 3FJGA 3LSXA 1EZ9A 4RJZA 4F22A 3K6XA 1VSOA 1P1UA 2VOZA 4RYAA 1QKBA 1OIBA 5CI5A 5I2KB 3RNNA 2DE4A 3H06B 1OLAA 4FE8A 2HFBA 1ANFA 4Q8RA 2B3FA 1I6QA 3KBRA 2Z22A 5K2XA 1J1NA 1N3XA 4IO2A 2D21A 4F3PA 1OVBA 4G4PA 2O6AA 4LZ8A 3S9EA 5DVFA 1H45A 4MH5A 2F7AA 3RT6B 3MPKA 4F39A 4OERA 3FASA 4RY1A 3CR9A 5L9OA 4U21A 1SDXA 1MXVA 4QFPA 5AA4B 2THIA 1MDP1 2CMOA 2R71A 3W9WA 1B32A 1A8EA 3PUXE 3IOUA 1A55A 1RYOA 1QKAA 4PFYA 2ONSA 4JWYA 1ZLQA 1SW1A 2UVIA 5ICQA 5L9SA 1N7WA 2ZXTA 3EPEA 3K01A 3ONMA 4R2FA 1IXIA 3N94A 4NF5A 3OXNA 3QYTA 1BKAA 4RK2A 3T96B 4F1YA 1N04A 2G93A 4EXLA 2XXHA 4UA8A 3UA8A 2I48A 2DYXA 3TTLA 1TT1A 5DEXB 4NWCA 4GWOA 3TKDA 1LFIA 3E4RA 1LB8A 1WODA 3H4ZA 1DTZA 3MVZA 5AA2D 1JQFA 3CFLA 5I2KA 1A99A 3ODBA 1XOCA 4O3BA 3H6VA 3PD9A 4QFLA 4FJPA 4GOTA 3T9UA 1DTGA 3KN8A 3K6UA 1MH4A 3QUJA 4YKIA 3LSLA 4GRKA 2UVJA 4N13A 2A5SA 2ALUA 4FEDA 1D9VA 5ITOA 3UN6A 1S50A 4AB5A 5AA4A 2XX9A 1FQFA 4POWA 3R6UA 1MM6A 3I3VA 1MY3A 4HS7A 2RINA 1LBBA 4Q0CA 3H6UA 4BDLA 1MXZA 3BBRA 4UACA 1ZTYA 2NUVA 5CBRA 5BWJA 3U8QA 1YPNA 4NF8A 2I0BA 2RF1A 1R9QA 4N6PA 3TTKA 4BDRA 3O9PA 2CZLA 3MJNA 3KN3A 2DWHA 2F97A 3OD7A 3TQWA 4YAHX 2RC9A 3TCGA 5CMBA 3U94A 1FQBA 4I62A 1MS7A 4HCWA 1I69A 1ZU0A 3H6TA 3RTFB 4NF4B 1MG1A 2DS9A 2HAVA 2OJTA 1MM7A 5H8FA 1USYH 2XXTA 1UTHB 4F18A 1HSLA 1IQ7A 1JW4A 4KCCA 1BP5A 2ZYOA 1IZ1A 2DOJA 3TPAA 4YICA 1FTJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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