2V7YA

Crystal structure of the molecular chaperone dnak from geobacillus kaustophilus hta426 in post-atp hydrolysis state
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
504
structure length
504
Chain Sequence
MSKIIGIDLGTTNSCVAVLEGGEVKVIPNPEGNRTTPSVVAFKNGERLVGEVAKRQAITNPNTIISIKRHMGTDYKVEIEGKQYTPQEISAIILQYLKSYAEDYLGEPVTRAVITVPAYFNDAQRQATKDAGRIAGLEVERIINEPTAAALAYGLDKEEDQTILVYDLGGGTFDVSILELGDGVFEVKATAGDNHLGGDDFDQVIIDYLVNQFKQEHGIDLSKDKMALQRLKDAAEKAKKELSGVTQTQISLPFISANENGPLHLEMTLTRAKFEELSAHLVERTMGPVRQALQDAGLTPADIDKVILVGGSTRIPAVQEAIKRELGKEPHKGVNPDEVVAIGAAIQGGVIAGEVKDVVLLDVTPLSLGIETMGGVFTKLIERNTTIPTSKSQVFTTAADNQTTVDIHVLQGERPMAADNKSLGRFQLTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGIVHVRAKDLGTNKEQSITIKSSSGLSEEEIQRMIKEAEENAEADRKRKEAAEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal Structures of the 70-kDa Heat Shock Proteins in Domain Disjoining Conformation.
pubmed doi rcsb
source organism Geobacillus kaustophilus hta426
molecule tags Chaperone
molecule keywords CHAPERONE PROTEIN DNAK
total genus 116
structure length 504
sequence length 504
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.34.10 Mainly Beta Sandwich Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 2v7yA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2v7yA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2v7yA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2v7yA03
5AQYA 3W3DA 1T44A 1Z6RA 3WT0A 4EZRA 3O4WA 4IJNA 4WQ5C 4BRAA 3CQYA 4XH4A 5ADXH 4E81A 2QWOA 4WV5A 2CGJA 2Q1NA 3G25A 3WXIA 4XEIA 1X3MA 1G99A 2P9UB 2Q2RA 2V51B 1ZXOA 3EZWA 3L0QA 5FPEA 5I9EB 5JICA 5EXWA 2FSJA 3C7NA 3O08A 1YVNA 2E88A 4F01A 2PAVA 1V4SA 2I7NA 4H0XB 3LDOA 3FZLA 3L6QA 5AQMA 3IMXA 4BRKA 2D4WA 5F2RA 3UKUB 4H0VB 4QS9A 3DQGA 3IUCA 3VEZA 3VPZA 4WV7A 3R9PA 4JN4A 1KAXA 3P4IA 2BPRA 4PL7A 1E4GT 3VGLA 4CZMA 1U00A 1HPMA 4PKIA 3H1VX 5E84A 3RSEA 1IJJA 3JXUA 2CH5A 2QWMA 2FLOA 1BA1A 1YAGA 4H0PA 4FSVA 3VEOA 2YHXA 2GELA 3J8AA 4BRPA 4BR2A 3AAQA 1R59O 5KQDA 4XH1A 2QXLA 3VENA 1WOQA 3GOIA 3WXLA 1DKYA 3VEVA 1DKGD 1NWKA 3UKUA 4EHTA 1BOTO 4IXCA 3C7NB 2FXUA 3MN9A 2D1KA 4WQ5A 5BN9A 4FWPA 1Z05A 5B8HA 3I33A 4CZFA 4BQLA 5JMVA 1ZC6A 1GLBG 4CBXA 1SAZA 2P9IA 4IWVA 3O1BA 1HLUA 4BC4A 2WUSA 3O8MA 1C0GA 1ZBSA 3I8BA 1QQMA 5CE3A 2F9WA 4BC5A 2Q97A 4XH5A 3SK3A 1BA0A 2KHOA 3H6EA 4WYBA 4BG9A 4BR5A 3CJAA 4JWDA 4JHDB 3GG4A 3CIPA 4R5GA 2E2PA 5ADXA 3QB0A 4NO7A 4EAHD 3W0LA 1EQYA 1JCFA 1NGDA 3WUHA 3D2EA 5AFUH 1MWKA 1C0FA 2AP1A 4FWNA 1WUAA 2ASPA 5EVZA 3FGUA 5BPMA 3A5NC 4H5TA 2HF4A 3CQXA 1RGIA 3FZMA 1GLEG 3GL1A 3AY9A 3LDQA 4BRNA 5BPNA 3H45C 3OHRA 4JWIA 4BGBA 4BQZA 1HKCA 4I6MA 2P9SA 5KPZA 3DPQA 1BPRA 5TKYA 2QWNA 1BWFO 3ENOA 5AQPA 3U9DA 4H5WA 4BR4A 4CZEA 4EZQA 2CH6A 4BRDA 4JD2B 5BRFA 2BTFA 3EKSA 4AM6A 3TPQA 1NGAA 2DPNA 1TYQA 2I7PA 3VESA 2W40A 2FF6A 4NB4A 3DXMA 3DXKB 3JS6A 1GLCG 3WQUA 3MN7A 4CBWA 1Q5LA 1D4XA 5AQXA 3ID8A 3UKRB 3UB5A 3VGMA 1GLLO 4JWCA 2A41A 4WQ4C 3QFUA 4FOEA 1QQNA 5KPTA 1GLFO 5AQTA 3BF1A 4PL8A 2IVPA 3H3NO 4IZ9A 3LDLA 4FWOA 4BC2A 2E1ZA 3M1FA 5FPMA 1ATNA 2GWJA 3DPPA 4O8KA 1ESVA 1J6ZA 3QICA 3ENHA 1RFQA 2A40A 2ASMA 3CJ7A 1DG4A 4R5KA 4BRMA 1DKXA 3O5BA 4MO4A 4BGAA 4K43A 4CD3A 1HJOA 1TYQB 1NGJA 1SZ2A 2NLXA 3GBTA 5AQRA 2HMPA 2VYPA 3HZ6A 3ATVA 4EZSA 1K8KA 3VF6A 1CKRA 4WQ4A 4H0TB 3CI5A 3EKUA 3ZEUA 4EZTA 4M63C 1E4FT 2QWLA 1T6DA 4K25A 3BP8A 4R5JA 3CJCA 2QWRA 3H3OB 3VEWA 5AR0A 5AQIA 3A5MC 1LCUA 3A5LC 3UE5A 4BRCA 2J4RA 5AQSA 3RSEB 3VERA 4IJAA 2YHYA 3KVGA 3VEYA 1ATSA 5BR9A 5F1XA 1SQKA 3HBTA 3ZX3A 4DCHA 4JAXA 5KPRA 4RCHA 1X9JA 3FLCO 4K42A 3FZHA 4B9QA 5AQOA 4B1YB 1NGFA 5AFUA 1U2VB 4PO2A 4GY2B 1BDGA 4BC3A 4RWTA 5AQZA 3M6GA 5LJVA 2P9PB 1T6CA 4EZXA 1MDUB 2UYTA 1GLAG 2IIRA 3QBWA 4DHYA 2QM1A 1XC3A 2HOEA 5AQUA 4BR7A 1KAYA 4HYBA 2D0PA 4BR0A 4BG8A 4J8FA 2OP6A 3N8EA 3WEEB 5JLHA 5AQHA 2P9IB 4H5NA 4L3QA 2P9KA 4CZGA 2FSNA 5EY4A 5EX5A 1DKZA 4R5IA 4MO5A 2P9LA 2Q36A 3D2FB 3DJCA 5AQJA 2Q0RA 1BUPA 5ELZA 4B1ZA 4BRFA 1U2VA 2Q0UA 2GTDA 4YDUA 4IO8A 2OANA 3DOBA 3AAPA 3FZKA 1X3NA 3CJ9A 3FZFA 4B1WB 2W41A 3ZEUB 3FE1A 4DQ8A 4FWQA 4GNIA 4K41A 3ZETB 1MWMA 2V7YA 3O80A 1GLJO 1HKBA 1KXPA 4MLEA 2P9KB 1NMDA 3A0IX 2EWSA 1U6ZA 4F00A 4JD2A 2A3ZA 1XQSC 4FOIA 1V4TA 3A5OC 2ZGZA 4EZUA 3C0BA 4EZYA 4EHUA 3QFPA 3HI0A 1NGGA 3ATUA 2NRHA 3WXJA 1QZ5A 3MDQA 4FWKA 1MA9B 2P9UA 5F0XA 3SMSA 1Q18A 3U4LA 4B1VA 2IVNA 4M7XA 4QS8A 4FPAA 3SJHA 1BU6O 3LL3A 5AZIA 5BRHA 4FO0A 4EZZA 1NLVA 1QQOA 3FR0A 1QHAA 3BEXA 1ATRA 5LJWA 4HY9A 1BG3A 4FWLA 5AQFA 3QBXA 5LY3A 1BO5O 3ZX2A 3EO3A 1DGKN 3L4IA 2QWQA 1S3XA 4A2BA 2ITMA 4FL9A 3MMVA 3MK6A 4O5FA 4CZIA 3DXMB 3FFKB 1CZAN 2YHWA 5AQVA 3QNJA 3MN5A 2Q31A 4E1JA 2E2QA 3D2FA 2P9NA 3VF4A 4JWEA 4H5RA 3IDHA 4A62A 1H1VA 4CBUA 1IG8A 5BN8A 1S22A 4LC9B 1KAZA 4ISEA 4RTFD 4CJ7A 3O1WA 1OKJA 4BRLA 3GDQA 2VWBA 3H0XA 5AQQA 1HKGA 5BREA 4A61A 2ZGYA 4HTLA 2F9TA 2QWPA 2E2NA 5AZIB 2A42A 3B8AX 3TU5A 3R8EA 1Y64A 2QW9A 3MCPA 5AQWA 2HF3A 2V52B 2FF3B 4BRQA 4BVPA 3QDKA 2GUPA 2VCPA 3KHYA 2E8AA 2YJEA 3A8YA 4CI6A 4B1UB 4M7YA 5AQGA 2GWKA 4F9OA 2PBDA 3HSCA 4H5VA 4EZVA 1K8KB 4BVOA 4CZHA 1NBWA 3CETA 4CZJA 4EFHA 3H1QA 7HSCA 1RDWX 4BREA 3HM8A 3ULEA 1HUXA 3O6WA 5FPNA 3VEXA 3VETA 4BRIA 1P8ZA 4JNFA 3DPOA 5AQKA 4CZLA 4YDUC 4Z94A 5AZJA 4DB3A 5KQ8A 3DWLA 4JHDA 1NGHA 2E20A 3VF2A 1NGIA 4EZPA 3SLCA 3VGKA 2ZF5O 4AM7A 4EIAA 3F9MA 3BUZB 4FWMA 1TUUA 3D2EB 4H03B 3WXKA 2ASOA 3SMPA 3U8XA 4KBOA 4PKHA 4BROA 2AA4A 3IFRA 3LDNA 5E26A 4C23A 4H0OA 2V7ZA 4FPBA 4HWIA 5EOYA 2BUPA 2YCHA 4BRHA 2P9NB 4FWRA 2IVOA 2A5XA 2FSKA 4JNEA 3CHWA 1LOTB 4B1XB 2P9PA 4I6MB 1GLDG 3ZX0A 1XUPO 2YJFA 3EL2A 1DEJA 2NZTA 2E1YA 3EN9A 3WEEA 3U9ZA 4ISFA 1YUWA 2CGKA 3H46O 4MLHA 1JCEA 4ISGA 4BRGA 5FPDA 1NGEA 2ZWHA 1NGBA 2P9LB 3CJBA 3HTVA 2D0OA 5AQNA 3DAWA 4H0YB 1TUYA 1YXQA 2GEMA 3ULEB 4EZWA 2CGLA 3CERA 3DXKA 3AARA 2E2OA 3GE1A 5AQLA 4R5LA 3LDPA 4Y0WA 3UKRA 4EZNA 2P9SB 3M3ZA 5BRDA 4QS7A 5AZJB 3LM2A 3LM9A 5JLFA 1JCGA 3CJ1A 3ZETA 2A6AA 2H3GX 4PKGA 4CD1A 3WQTA 1NM1A 4FWSA 3S41A 4BR9A 5BPLA 3BF3A 2YI1A 3MN6A 4CZKA 3QMLA 3VOVA 3R6MA 1HX1A 1NGCA 3D7EO 4EZOA 3KZBA 1QZ6A 4A2AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V9SA 4FVUA 3OYHA 3V6DA 3O4WA 2Z1GA 1SS6A 1SUQA 3T7ZA 4BRAA 1IV0A 5ADXH 4IDHA 1VQPN 1D9DA 3S3NA 1TAUA 3C6TA 4IOXA 4DTNA 4Q5VA 4CJQA 3G25A 3CCSN 3EZWA 2FSJA 1JLBA 3EZ5A 3O08A 2KQ2A 3MX5A 1ZBLA 4CK2A 1LWEA 3SUOA 1V4SA 4H0XB 3LDOA 5AQMA 3L6QA 1W2BM 5F2RA 3DQGA 3VPZA 4KHNA 4N76A 4CHNA 3L4QA 4W5TA 2BPRA 3HJFA 4BACA 4PKIA 3RSEA 1ZBUA 3JXUA 4B9UA 2B4JA 1I39A 1YAGA 4CJWA 4FSVA 4Z4FA 4IEEA 2YHXA 1XMOK 1NK4A 3AAQA 3K5NA 1VQ7N 4XH1A 1A5WA 1DKGD 3IKMA 1VQ6N 3C7NB 1U45A 3MN9A 4BECA 4DR4K 5JENA 1Z05A 4C8KA 3ZCMA 3CCJN 3P38A 3I33A 4CZFA 1YIJN 1VSLA 4FJHA 2XRIA 1HLUA 4C8OA 3O8MA 1NK6A 3SUQA 4DV0K 3PX6A 1QQMA 5CE3A 3TAFA 4OLBA 3SK3A 5C24A 2KHOA 1O13A 3QO9A 4JWDA 2WTUA 2PFUA 3G0ZA 4R5GA 2YX6A 4FLXA 1RTIA 3CF5L 1TK5A 3K5MA 2G8KA 4EAHD 3MEDA 1EQYA 3ZT0A 1JCFA 1NGDA 3WUHA 3D2EA 1IG9A 1MWKA 4HHTA 5CHIA 5HROA 1VSJA 4H5TA 2HF4A 1RGIA 2I5JA 3L3UA 3K58A 1EX4A 3AGRA 2OPPA 3AY9A 4BRNA 4FLYA 1HNVA 4JWIA 1WSEA 2P9SA 3U6FA 2E5LK 4H5WA 3L2RA 1XNQK 1LW2A 4IO9L 2CH6A 3CD6N 3CFPA 1B92A 2O8EB 1NGAA 2I7PA 3CM6A 3IAYA 3HK2A 3AV9A 3DXKB 4B9TA 1VQNN 1GLCG 2RPIA 3MN7A 4CBWA 3QEIA 3I56N 2BH1A 4EP4A 3UB5A 3VGMA 4FJMA 1GLLO 4QAGA 4KHPK 3K9JA 1BQMA 2BANA 3SBSA 1Q8IA 3CCRN 1YTUA 2KTQA 3CXCM 3BF1A 2OPRA 3ISNC 4PL8A 4DTMA 3I0SA 3HM9A 3TAGA 4BC2A 5FPMA 1ATNA 4TSXA 4O8KA 4GMJB 4OKEA 2HBLA 3LDSA 1RFQA 3DLEA 2IDOA 4FJLA 2ASMA 1VQLN 1DKXA 3O5BA 4BGAA 4L8RB 1EETA 1HJOA 4RW9A 1SZ2A 5AQRA 1XNRK 2HMPA 2FBYA 3HZ6A 5T7BA 1A5VA 3CPEA 3PUFA 4DLGA 3VF6A 5LMUK 4WQ4A 4OPKA 4C8LA 3ID6A 4WF9L 3ZEUA 1HQEA 1W7AA 4DSIA 3VEWA 2F8SA 1HNXK 3A5MC 3ZSOA 2P51A 3UE5A 4BRCA 3HPOA 4FLUA 3VQBA 1JL1A 2J4RA 5AQSA 3DRRA 5C42A 3HL8A 2YNGA 3KVGA 3VEYA 2UU9K 1C6VA 1TKDA 3LANA 5BR9A 5F1XA 1SQKA 3HBTA 3ZX3A 5KPRA 3QESA 4RCHA 2YNFA 4CEZA 3FLCO 1IKXA 3FZHA 4DFMA 1NGFA 1OVQA 5AFUA 1EXQA 5KGWA 3DRPA 1S1VA 5FLXO 4PO2A 2PY5A 4I43A 5AQZA 3M6GA 4V19S 1T6CA 4MQDA 4LH4A 1RBVA 3AVHA 2W6LA 3F9KA 4JKEA 4BR0A 4HYBA 3WEEB 4X66K 5AQHA 5CY4A 2UXDK 2P9KA 4CZGA 4BE1A 5EY4A 1DKZA 2P9LA 4JS5A 1NK5A 5CZ2A 2Q0RA 4CESA 3DYAA 4DLEA 4B1ZA 1RDAA 4LFBK 2F96A 4DS4A 3R3LA 3CQ8A 2WOMA 3KLGA 1JLAA 1RT6A 2GTDA 3AAPA 4FM2A 3ENBA 1BI4A 2LSNA 4YOTA 2KFNA 4FZXC 4NLBA 4HCBA 3KTQA 2V7YA 3O80A 1GLJO 2P9KB 3CG7A 5KRTA 3VQPA 2EWSA 4FZYA 1NJXA 1UOCA 4JD2A 3D0PA 4I2QA 3QEPA 3Q7CA 4EZUA 5M1QA 5J2QA 3G6EN 4EHUA 3HI0A 1NGGA 3VQCA 3ZT2A 4F2SA 2IAJA 4FWKA 5DM7L 1SL0A 3AVFA 2P9UA 1RT3A 5F0XA 4Z4CA 2IVNA 3G10A 4I7FA 5EU7A 1MU2A 4QS8A 4E19A 2C1GA 3LL3A 3THWA 4J2DA 1NLVA 4AF1A 1QQOA 1QHAA 1WBBA 3SQ0A 3OYNA 3L4IA 2QWQA 3OYCA 4ELUA 2OZSA 1KLNA 2UXBK 3MK6A 4O5FA 4EZ9A 3FFKB 3S3OA 2YHWA 3QIOA 4E1JA 1HYSA 2ZD1A 4A62A 1G15A 1IG8A 5BN8A 2HNDA 2C1IA 4LC9B 5BR8K 1XWLA 3RMAA 3O1WA 3RVCA 4BRLA 3NF9A 2WC9A 1HKGA 5BREA 1WSIA 4HTLA 4MQ3A 1NK8A 1K8AO 5AQWA 5JVGL 1ILYA 2Z1JA 2HF3A 5M1KA 4JS4A 3SBGA 3RRHA 5GIOA 3QNOA 2VGNA 1KTQA 4M3ZA 2FF3B 3P5JA 3S3MA 1VSIA 4Y1DA 3QDKA 4FM1A 3DRSA 2VCPA 3A8YA 4CI6A 1E3MA 2E4LA 1QVGM 2YHBA 1FKOA 2PZSA 2PBDA 1RTHA 1S5JA 3MWTA 4YOYA 4BVOA 3HT3A 3WNEA 4BREA 3HOTA 3ULEA 4LFAK 4C1NK 3CC2N 1HUXA 2RKIA 3CCMN 3AVKA 4JNFA 4DTSA 5CYQA 4E7KA 4CZLA 3MWPA 4DB3A 1NGHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3V9S A;  4FVU A;  3OYH A;  3V6D A;  3O4W A;  2Z1G A;  1SS6 A;  1SUQ A;  3T7Z A;  4BRA A;  1IV0 A;  5ADX H;  4IDH A;  1VQP N;  1D9D A;  3S3N A;  1TAU A;  3C6T A;  4IOX A;  4DTN A;  4Q5V A;  4CJQ A;  3G25 A;  3CCS N;  3EZW A;  2FSJ A;  1JLB A;  3EZ5 A;  3O08 A;  2KQ2 A;  3MX5 A;  1ZBL A;  4CK2 A;  1LWE A;  3SUO A;  1V4S A;  4H0X B;  3LDO A;  5AQM A;  3L6Q A;  1W2B M;  5F2R A;  3DQG A;  3VPZ A;  4KHN A;  4N76 A;  4CHN A;  3L4Q A;  4W5T A;  2BPR A;  3HJF A;  4BAC A;  4PKI A;  3RSE A;  1ZBU A;  3JXU A;  4B9U A;  2B4J A;  1I39 A;  1YAG A;  4CJW A;  4FSV A;  4Z4F A;  4IEE A;  2YHX A;  1XMO K;  1NK4 A;  3AAQ A;  3K5N A;  1VQ7 N;  4XH1 A;  1A5W A;  1DKG D;  3IKM A;  1VQ6 N;  3C7N B;  1U45 A;  3MN9 A;  4BEC A;  4DR4 K;  5JEN A;  1Z05 A;  4C8K A;  3ZCM A;  3CCJ N;  3P38 A;  3I33 A;  4CZF A;  1YIJ N;  1VSL A;  4FJH A;  2XRI A;  1HLU A;  4C8O A;  3O8M A;  1NK6 A;  3SUQ A;  4DV0 K;  3PX6 A;  1QQM A;  5CE3 A;  3TAF A;  4OLB A;  3SK3 A;  5C24 A;  2KHO A;  1O13 A;  3QO9 A;  4JWD A;  2WTU A;  2PFU A;  3G0Z A; 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