2V7YA

Crystal structure of the molecular chaperone dnak from geobacillus kaustophilus hta426 in post-atp hydrolysis state
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
504
structure length
504
Chain Sequence
MSKIIGIDLGTTNSCVAVLEGGEVKVIPNPEGNRTTPSVVAFKNGERLVGEVAKRQAITNPNTIISIKRHMGTDYKVEIEGKQYTPQEISAIILQYLKSYAEDYLGEPVTRAVITVPAYFNDAQRQATKDAGRIAGLEVERIINEPTAAALAYGLDKEEDQTILVYDLGGGTFDVSILELGDGVFEVKATAGDNHLGGDDFDQVIIDYLVNQFKQEHGIDLSKDKMALQRLKDAAEKAKKELSGVTQTQISLPFISANENGPLHLEMTLTRAKFEELSAHLVERTMGPVRQALQDAGLTPADIDKVILVGGSTRIPAVQEAIKRELGKEPHKGVNPDEVVAIGAAIQGGVIAGEVKDVVLLDVTPLSLGIETMGGVFTKLIERNTTIPTSKSQVFTTAADNQTTVDIHVLQGERPMAADNKSLGRFQLTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGIVHVRAKDLGTNKEQSITIKSSSGLSEEEIQRMIKEAEENAEADRKRKEAAEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords CHAPERONE PROTEIN DNAK
publication title Crystal Structures of the 70-kDa Heat Shock Proteins in Domain Disjoining Conformation.
pubmed doi rcsb
source organism Geobacillus kaustophilus hta426
molecule tags Chaperone
total genus 116
structure length 504
sequence length 504
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.34.10 Mainly Beta Sandwich Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 2v7yA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2v7yA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2v7yA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2v7yA03
4DQ8A 4EZUA 4L3QA 1DKXA 3U9DA 5JLFA 5AQLA 4CZFA 4ISGA 1ATSA 3MN7A 3VERA 5AQUA 4M7XA 5BPNA 2E2QA 4XEIA 4WQ5A 3UKUA 3ZX0A 4MO4A 3HM8A 1BPRA 4JWIA 4B1XB 1BDGA 2FSJA 3UKRB 3WQTA 1U00A 3D2FB 3IDHA 2YJFA 1GLFO 3W0LA 4EZNA 2E20A 1KXPA 1K8KB 2Q36A 5AQGA 4Z94A 2E2OA 3M6GA 4BR9A 4BRQA 2ASMA 4BR0A 3LDNA 3WXIA 1X3MA 2YHWA 4XH4A 5AFUH 4M63C 5AQVA 2GEMA 4BGBA 4BGAA 3EKUA 2FF3B 3IUCA 1LCUA 3ZETB 1ZXOA 2HOEA 1ATRA 4AM6A 4WYBA 2PBDA 3OHRA 1LOTB 3U9ZA 4LC9B 3D2EA 3UKUB 3EN9A 3QB0A 5CE3A 3WEEB 2QW9A 1TYQB 3QNJA 3I33A 3WXLA 5LJVA 2P9NA 1X3NA 3O80A 2GTDA 3MMVA 1X9JA 1E4GT 3ZEUB 1P8ZA 1RGIA 5FPMA 4PO2A 3W3DA 4IZ9A 3F9MA 3R8EA 4BRFA 3CQYA 4CD1A 4JNFA 1S3XA 3DXKB 3H3OB 4CZHA 4HYBA 2VCPA 3CJ1A 5F2RA 4EZPA 2H3GX 3ULEA 2D1KA 2QWMA 2J4RA 4B1WB 4A2BA 5FPEA 4EZWA 3WXJA 4PL7A 2P9KA 3DXMB 2I7NA 3H3NO 4H0PA 4FPBA 3L6QA 3C7NA 5KQ8A 1T6DA 1Q18A 4BRNA 4FOEA 4H0TB 4CZGA 1NGDA 1RFQA 2W40A 3BP8A 5BREA 3D2EB 2CGLA 3FR0A 3DOBA 3FGUA 1R59O 4O5FA 4PKGA 5AQSA 4EFHA 2QWPA 5EX5A 4B1ZA 4FPAA 3VEZA 4K25A 2P9IA 3UE5A 3LM2A 2D0PA 3HBTA 2DPNA 1NGBA 2CGKA 4R5KA 3LM9A 4XH1A 4H03B 3L0QA 4JWCA 1KAYA 3SK3A 3ZX2A 5ELZA 4EZOA 3M3ZA 4EHTA 4EZZA 4JHDA 5FPDA 3ATUA 5E26A 4WQ5C 4YDUA 3ULEB 3VPZA 4BRPA 1SQKA 3AAPA 3EZWA 3JS6A 4F9OA 4H0OA 5AFUA 5BRDA 1D4XA 1TUUA 4NB4A 3BF3A 1XQSC 3BF1A 3GL1A 1HPMA 4IJAA 4Y0WA 5JMVA 3CJCA 2YJEA 2P9PB 4B1UB 4FWNA 3RSEB 1QQOA 4H5TA 4BRMA 2HF3A 4HWIA 2QM1A 2QWNA 3D7EO 5BPMA 1HKBA 4RWTA 3O08A 3O1WA 2P9UB 5LJWA 4FWSA 1QQMA 2V51B 3QBWA 2VWBA 3A0IX 3DPPA 5AZJB 3VGLA 3A5NC 4BRGA 1NGHA 2D4WA 3GBTA 1BO5O 3CETA 1NWKA 2GWJA 1NBWA 3CJ9A 1MWKA 4CZKA 2IVPA 4F01A 2ZWHA 5AQYA 4JD2B 1HLUA 3GE1A 2BTFA 2E2NA 4H5RA 2AP1A 2ZGZA 3FFKB 5BR9A 1SZ2A 2E88A 1YVNA 2IIRA 4QS7A 1WUAA 1MDUB 3H6EA 1NLVA 1Y64A 4FWRA 3FZHA 5AQPA 4BRHA 3I8BA 2A5XA 5AQRA 4GY2B 3U4LA 1OKJA 3QFPA 3HSCA 3BEXA 1YAGA 2FXUA 3LDQA 3FZKA 3QFUA 2I7PA 3CI5A 1XC3A 5AQXA 3H0XA 3B8AX 3CHWA 4H5NA 2F9TA 1EQYA 4FWKA 3CJBA 1RDWX 2Q2RA 1DKGD 1BUPA 5EVZA 4BRIA 1HX1A 4EZVA 1H1VA 4BRKA 2OANA 4EIAA 5BRHA 3A5OC 4R5LA 1IJJA 3KVGA 3ATVA 3M1FA 2YHYA 3R9PA 3VF4A 1GLLO 1YXQA 4BG9A 2BPRA 2FLOA 3VEXA 4WQ4C 1QZ5A 5KQDA 4A2AA 4MLHA 2AA4A 2P9SA 1ESVA 3L4IA 1NGFA 4YDUC 2V7YA 4B9QA 1QQNA 2YHXA 2P9LA 2E2PA 4BC2A 1U2VA 2CGJA 2FF6A 4IJNA 4CBWA 3DAWA 4BR2A 2Q97A 4CZMA 4EHUA 4XH5A 3QBXA 1GLAG 3IMXA 2IVNA 3MCPA 3WUHA 3O4WA 5KPTA 1MWMA 4BQLA 5KPRA 1J6ZA 2YI1A 4BRDA 1U6ZA 1ATNA 4JAXA 4EZTA 1T44A 2P9NB 2Q31A 5I9EB 1XUPO 2ZGYA 1JCFA 2NLXA 4R5GA 2Q1NA 1WOQA 1NGIA 4CD3A 5AQHA 4IWVA 4CJ7A 4FWPA 2ASOA 3KZBA 3VF2A 3CJAA 2ZF5O 2IVOA 3ENHA 4BVOA 4H5WA 4IO8A 4WQ4A 3C0BA 5ADXA 1DKZA 5AQQA 4H0XB 4BR4A 3IFRA 4JN4A 2BUPA 4CZJA 3U8XA 4BREA 3ID8A 4I6MA 3JXUA 1GLBG 5BN9A 2P9KB 4BR5A 1BA0A 3G25A 3C7NB 2ITMA 4BRCA 4WV7A 2Q0RA 3MN6A 3R6MA 1NGEA 2GWKA 1NM1A 3LDOA 1IG8A 2FSNA 2Q0UA 1ZBSA 3MDQA 2P9IB 2HMPA 3LDPA 3ENOA 3AY9A 3QMLA 4JWEA 3UKRA 3VETA 2V52B 5AQOA 4JNEA 3D2FA 3FZFA 1JCEA 4FO0A 3WXKA 4DCHA 3P4IA 4E1JA 4EZRA 2A40A 1K8KA 1BG3A 4WV5A 1DEJA 3VGKA 4GNIA 3ZX3A 5AQKA 4EZYA 4JHDB 3UB5A 2A3ZA 4CBXA 4HTLA 5ADXH 3MK6A 3H45C 1S22A 4PKIA 3VEVA 3ZETA 3WT0A 4BC5A 5BRFA 4FWOA 4K41A 5AQWA 2NZTA 4BG8A 1HKCA 1Z05A 1G99A 2VYPA 2CH5A 4R5JA 3H46O 3HZ6A 2ASPA 1QZ6A 4EZSA 3J8AA 4PL8A 3WEEA 2WUSA 3HI0A 1TYQA 3DPOA 4J8FA 4E81A 4MO5A 2E1YA 4A61A 2QWRA 5TKYA 4BRAA 3DJCA 5EOYA 4O8KA 4RCHA 1T6CA 3EO3A 3CQXA 3CIPA 5AQFA 3ZEUA 1NGAA 3A8YA 3SMPA 1GLJO 4BQZA 4C23A 1DG4A 4AM7A 3CERA 4EZQA 1KAXA 3DXKA 3LDLA 1BU6O 3FZLA 4FWMA 5F1XA 1E4FT 1NGJA 1Z6RA 2E8AA 4IXCA 5AQJA 4K43A 4HY9A 2GUPA 4QS9A 5AQTA 3SJHA 3DXMA 1GLEG 2QWLA 4M7YA 3FLCO 2D0OA 5FPNA 3FZMA 1DKYA 4EAHD 1ZC6A 4BC4A 4CZEA 3LL3A 2QWQA 1SAZA 7HSCA 1GLCG 3MN9A 2E1ZA 3VEOA 2A41A 5AQIA 2YCHA 3O6WA 3VF6A 1NGGA 1CKRA 4CI6A 1GLDG 2QXLA 4FOIA 5E84A 3N8EA 4H0YB 4EZXA 1DGKN 2F9WA 2NRHA 3AAQA 5AQMA 3CJ7A 4DHYA 3MN5A 3WQUA 4ISEA 1V4SA 3DQGA 4K42A 4CZIA 4R5IA 1BWFO 4PKHA 5EY4A 3DPQA 2EWSA 3VESA 4BVPA 1C0FA 2FSKA 1MA9B 2V7ZA 1C0GA 1HKGA 4BROA 3KHYA 4BC3A 3VEYA 3GDQA 3O5BA 1JCGA 3TPQA 5JLHA 3SLCA 4FWLA 3H1QA 3VENA 2CH6A 5AZIA 1YUWA 2P9SB 3S41A 1BOTO 3BUZB 1Q5LA 5EXWA 2HF4A 2KHOA 2P9LB 2P9PA 3RSEA 1U2VB 4JWDA 4H5VA 3FE1A 5B8HA 4F00A 5AQNA 3VEWA 4CBUA 2QWOA 2P9UA 3GOIA 3TU5A 1NMDA 4FWQA 5AR0A 3GG4A 4H0VB 2OP6A 4MLEA 2W41A 1HJOA 3A5LC 5AZJA 1TUYA 4RTFD 3O8MA 3QICA 3VGMA 5AQZA 4BRLA 3AARA 4FSVA 3O1BA 5F0XA 2GELA 4BR7A 4A62A 5JICA 5KPZA 3VOVA 4CZLA 2UYTA 4JD2A 4DB3A 5BPLA 1HUXA 4KBOA 4FL9A 3DWLA 2A42A 3H1VX 2PAVA 5LY3A 4NO7A 4QS8A 5AZIB 3HTVA 1NGCA 3QDKA 3SMSA 4B1VA 4I6MB 3EL2A 1QHAA 4B1YB 5BN8A 1CZAN 3A5MC 1KAZA 3EKSA 2A6AA 1V4TA 1BA1A 4ISFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CHYA 5HRRA 3VERA 5CHIA 3K0SA 4XEIA 3KTQA 4JI6K 3UKUA 4MO4A 1HYVA 2Z1JA 3KWIA 4B1XB 3K5LA 2O8FA 3D2FB 3W0LA 4EZNA 4JKAA 1Q82O 4Z94A 4JI7K 1IG9A 4BGBA 3RR8A 4LFCK 3KK3A 3VQ6A 1GOAA 3T3FA 1ZXOA 4LF5K 1YJWN 1QSSA 4LFAK 1Q81O 3TSPA 4JKGA 4WYBA 1KFDA 3HRGA 3QETA 3K59A 1ASUA 4LC9B 4HHTA 3EN9A 3WEEB 4CJSA 5LJVA 3QNJA 3PX6A 3O80A 4IOAL 1MU2A 1E4GT 3ZEUB 2QI2A 3ASMA 1VQ6N 1P8ZA 1RGIA 3MAQA 4BE1A 1RBUA 3NF9A 1ZBLA 2WOMA 2YKMA 3ZT2A 3AVNA 3LALA 1UAXA 2D1KA 2DFEA 2QWMA 4CJQA 2WC9A 3SAGA 1NJZA 4B08A 4FPBA 4GKKK 2JWLA 1VQ8N 1T6DA 4TSXA 1RT5A 4FOEA 1NGDA 1RT1A 2CGLA 4DSEA 3DOBA 4O5FA 3KK1A 3JAMO 5EX5A 4FPAA 4B3OA 1YIJN 2P9IA 3V9XA 4KREA 4CFAA 1NG9A 4FJ7A 4R5KA 4J2EA 4FJ8A 4LF8K 1RT6A 3L0QA 3SK3A 3ID6A 3HL8A 2RPIA 3ZSRA 3CXCM 4N41A 1IH7A 4A5AA 4EZZA 4ILJA 4JHDA 3ATUA 4WQ5C 3ULEB 2BGGA 4DWIA 1N6QA 3KLIA 4EP5A 3T7ZA 1D4XA 1JXEA 4DU1A 5C10A 4FYDA 3BF1A 3GL1A 3E9PA 5C15A 4DSFA 5JMVA 2P9PB 5M1OA 4FWNA 3SCXA 4ILIA 4H5TA 1RDCA 3D7EO 3PV8A 4FK0A 3OW2M 4AH9A 3O1WA 5KGWA 3MCAB 3TTCA 4RW4A 3A0IX 1N32K 5FROA 3SQ1A 3A5NC 1N5YA 3LP0A 5J2NA 4FJGA 2GWJA 1NBWA 1VSLA 4CGGA 4CZKA 4X66K 1RT4A 3THXB 1FKOA 2ZWHA 5AQYA 4JD2B 1HQUA 2VG7A 2E2NA 2AP1A 1JL2A 5AJ3K 3HPGA 1YVNA 3VTHA 4DUYK 4DS5A 5EU7A 3FZHA 1XNRK 4M42A 4KRFA 4GY2B 3F73A 2HBLA 1IO2A 3C6AA 1KSPA 4CHQA 3B8AX 4H5NA 2P5OA 1DTTA 1UA0A 4CJ3A 3EE8A 4BRIA 3L4QA 4V19S 4KAZA 3V9SA 3A5OC 5K14A 5M1QA 4J2DA 3O4QA 4R5LA 3KVGA 3ATVA 4UQGA 4OGCA 3C94A 1TK5A 3PO5A 1TKXA 3L3VA 3AVLA 4WQ4C 5KQDA 3SQ0A 4MLHA 3NF6A 2AA4A 3F9KA 4A57A 4YDUC 4B9QA 1BCOA 2E2PA 3CCMN 3LP3A 4BC2A 2CGJA 1N8RO 2NNWA 4IJNA 3DAWA 2F8TA 3SUQA 1WSHA 1J54A 4H4OA 4CJWA 3IMXA 2PZSA 1C0MA 1BISA 2IVNA 4E72A 2KFNA 1RILA 3KKSA 2YI1A 2OPQA 4CGFA 4DTXA 3HO1A 4EZTA 5J1EA 3PX0A 2O4IA 4NXNK 2EX3A 2ZQBA 3NF7A 2HHHK 2EHGA 2UXCK 2Q1NA 4CHZA 1NGIA 1NKCA 3VQBA 5MLCQ 4OPAA 1SKSA 4CJ7A 2ASOA 2HBMA 1VRTA 3DLEA 3FFIA 4BVOA 4IO8A 4CVNE 4YFUA 3HSTB 2O4GA 5AQQA 4H0XB 4R79A 3KLHA 4ICLA 4IEEA 1KRPA 3U6FA 3CF5L 5BN9A 1M90O 2G8WA 3ZEFA 1KD1O 2YHAA 3OYAA 3ITHA 2ITMA 1NK6A 3NVKA 3EYZA 4PHTX 2Q0RA 2GWKA 1S1UA 1IG8A 2Q0UA 1ZBSA 1RBSA 2G8IA 1SL1A 3MDQA 4KHYA 2HMPA 4JK8A 4JWEA 2V52B 4JNEA 3D2FA 4FO0A 1HNWK 4YOXA 4JI5K 4EZRA 4OLBA 3OYFA 5LL6Z 4KHPK 3ZX3A 4F3TA 4OX9K 1NMNA 3J81O 3K5OA 4HTLA 5ADXH 3MK6A 3H45C 1EKEA 1S22A 4A5BA 1HYSA 3VEVA 3E9OA 3NFAA 3WT0A 1T05A 5BRFA 4FM0A 3HVTA 2HHXA 1JLEA 1Z05A 3TR8A 1RT2A 1G99A 2VYPA 2CH5A 3H46O 1I94K 3VQ8A 4HVJA 2ASPA 1QZ6A 2UUAK 2O8CA 3J8AA 4N56A 4PL8A 3WEEA 3HJFA 3HYFA 4A59A 4CHOA 4A61A 4I9QA 4MO5A 4DR6K 4BRAA 3HOTA 3TSQA 4RCHA 4F8RA 1BIZA 4JKHA 3ZSOA 3ZEUA 1C0UA 4CE9A 3VN5A 1GLJO 4BE7B 4AM7A 2IGIA 1KAXA 3AA2A 3TSUA 5T7BA 4FJ5A 1NJXA 4IEIA 2P51A 4FWMA 3I55N 4JI8K 4RW8A 4DSJA 5F1XA 3N4PA 1NGJA 4AILC 1NJIO 2GUPA 1Z25A 4IKFA 3L2RA 4M7YA 4CEAA 1RTJA 2QWQA 7HSCA 5AQIA 2YCHA 4G9ZA 2FBXA 1CLQA 4XIUA 3CCUN 4M3UA 2HBJA 2IOCA 1W2BM 4E7HA 1GLDG 5E84A 2D0BA 4IO9L 3V4IA 2NRHA 3KJVA 5C24A 3AAQA 4DHYA 1LV5A 3MEEA 4DSKA 1RDUA 2G8FA 1BWFO 3DPQA 4AHRA 4OJRA 3LP2A 1TK8A 1NK0A 4CJUA 1C0GA 4N76A 4BC3A 1NK8A 4LY7A 3VEYA 3LPTA 3VQ5A 1JCGA 4CESA 3SLCA 2RN2A 3H1QA 4Z0UA 1TV6A 3E1YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4CHY A;  5HRR A;  3VER A;  5CHI A;  3K0S A;  4XEI A;  3KTQ A;  4JI6 K;  3UKU A;  4MO4 A;  1HYV A;  2Z1J A;  3KWI A;  4B1X B;  3K5L A;  2O8F A;  3D2F B;  3W0L A;  4EZN A;  4JKA A;  1Q82 O;  4Z94 A;  4JI7 K;  1IG9 A;  4BGB A;  3RR8 A;  4LFC K;  3KK3 A;  3VQ6 A;  1GOA A;  3T3F A;  1ZXO A;  4LF5 K;  1YJW N;  1QSS A;  4LFA K;  1Q81 O;  3TSP A;  4JKG A;  4WYB A;  1KFD A;  3HRG A;  3QET A;  3K59 A;  1ASU A;  4LC9 B;  4HHT A;  3EN9 A;  3WEE B;  4CJS A;  5LJV A;  3QNJ A;  3PX6 A;  3O80 A;  4IOA L;  1MU2 A;  1E4G T;  3ZEU B;  2QI2 A;  3ASM A;  1VQ6 N;  1P8Z A;  1RGI A;  3MAQ A;  4BE1 A;  1RBU A;  3NF9 A;  1ZBL A;  2WOM A;  2YKM A;  3ZT2 A;  3AVN A;  3LAL A;  1UAX A;  2D1K A;  2DFE A;  2QWM A;  4CJQ A;  2WC9 A;  3SAG A;  1NJZ A;  4B08 A;  4FPB A;  4GKK K;  2JWL A;  1VQ8 N;  1T6D A;  4TSX A;  1RT5 A;  4FOE A;  1NGD A;  1RT1 A;  2CGL A;  4DSE A;  3DOB A;  4O5F A;  3KK1 A;  3JAM O;  5EX5 A;  4FPA A;  4B3O A;  1YIJ N;  2P9I A;  3V9X A;  4KRE A;  4CFA A;  1NG9 A;  4FJ7 A;  4R5K A;  4J2E A;  4FJ8 A;  4LF8 K; 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