2V7YA

Crystal structure of the molecular chaperone dnak from geobacillus kaustophilus hta426 in post-atp hydrolysis state
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
504
structure length
504
Chain Sequence
MSKIIGIDLGTTNSCVAVLEGGEVKVIPNPEGNRTTPSVVAFKNGERLVGEVAKRQAITNPNTIISIKRHMGTDYKVEIEGKQYTPQEISAIILQYLKSYAEDYLGEPVTRAVITVPAYFNDAQRQATKDAGRIAGLEVERIINEPTAAALAYGLDKEEDQTILVYDLGGGTFDVSILELGDGVFEVKATAGDNHLGGDDFDQVIIDYLVNQFKQEHGIDLSKDKMALQRLKDAAEKAKKELSGVTQTQISLPFISANENGPLHLEMTLTRAKFEELSAHLVERTMGPVRQALQDAGLTPADIDKVILVGGSTRIPAVQEAIKRELGKEPHKGVNPDEVVAIGAAIQGGVIAGEVKDVVLLDVTPLSLGIETMGGVFTKLIERNTTIPTSKSQVFTTAADNQTTVDIHVLQGERPMAADNKSLGRFQLTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGIVHVRAKDLGTNKEQSITIKSSSGLSEEEIQRMIKEAEENAEADRKRKEAAEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal Structures of the 70-kDa Heat Shock Proteins in Domain Disjoining Conformation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHAPERONE PROTEIN DNAK
source organism Geobacillus kaustophilus hta426
molecule tags Chaperone
total genus 116
structure length 504
sequence length 504
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.34.10 Mainly Beta Sandwich Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 2v7yA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2v7yA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2v7yA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2v7yA03
5E84A 3MN9A 2P9SA 2ZWHA 5LJWA 4EZZA 5AZJB 4F01A 4BC3A 5EXWA 4CI6A 3LDLA 1CKRA 4EIAA 4JWEA 3QFUA 5KPTA 4B1UB 4R5IA 2HF4A 5AQZA 5ADXH 5AQLA 3H46O 4B9QA 3QMLA 3H3OB 1GLDG 1NGGA 2V7ZA 2A3ZA 4R5GA 2QWRA 4A2AA 4H5NA 1YAGA 2AA4A 3VETA 5AR0A 2ZGYA 5ELZA 5AQSA 1MA9B 4BG9A 4Z94A 3VF2A 5BPNA 1HPMA 3HI0A 5TKYA 3WQTA 2FF6A 2VCPA 2QXLA 2DPNA 4RWTA 3ZEUA 1IJJA 4HWIA 1DKXA 1TUUA 1BO5O 3DPOA 1ATSA 3EKSA 1BDGA 5FPNA 2HF3A 5F2RA 3MDQA 2Q2RA 4BVPA 3CHWA 3QB0A 2BPRA 5AQIA 2FSJA 1MWMA 3UB5A 3CJ7A 3ZX2A 4FWOA 4CBWA 3IMXA 3CJ9A 4H0XB 4XH1A 2F9WA 4BVOA 3D2EA 5JMVA 1DEJA 3WXIA 1LOTB 1K8KA 4H0TB 4KBOA 4L3QA 4JHDB 4IZ9A 1NMDA 3EO3A 4CD3A 5AZJA 3VEWA 3KZBA 3VERA 4JWIA 5BPLA 2ASMA 5EVZA 2GUPA 5B8HA 3ATUA 1HKCA 3GL1A 2VYPA 2ZF5O 3HTVA 4RCHA 3FZMA 2IVOA 2CH5A 4BGBA 5LJVA 1H1VA 3WQUA 1JCFA 5E26A 4EZTA 1BG3A 4GY2B 3O6WA 2BTFA 5AZIB 1DKGD 1ESVA 1E4GT 4M7YA 4MLHA 1QHAA 1YXQA 3OHRA 3RSEB 4FWKA 3WUHA 4EZXA 3M1FA 3CJBA 2ASOA 2I7NA 2FF3B 3EL2A 3HBTA 3H0XA 2YHXA 2FLOA 3DWLA 4JD2B 1NGBA 1ZC6A 3A5NC 1LCUA 3C7NA 3FFKB 1NGHA 3VEOA 2P9KB 3FZFA 3CJCA 5AQFA 5JLHA 5FPMA 1WUAA 4J8FA 3ZX3A 2CGJA 4JHDA 3AARA 4H5WA 1J6ZA 4IJAA 3BF1A 2P9UA 1KAZA 4K42A 3ZEUB 2VWBA 4H0YB 3D2FA 4H0OA 5EX5A 3JXUA 4O5FA 4WQ5C 1HJOA 4O8KA 5JLFA 4I6MA 3O5BA 2NRHA 3MMVA 5AFUH 1QZ6A 4R5KA 1NGIA 3BP8A 4BQZA 4WQ4A 3W3DA 3DPPA 2I7PA 4CZKA 3SMSA 3A5LC 3LDNA 4R5JA 1HKGA 4HYBA 1NWKA 3EN9A 3QNJA 3A0IX 3R8EA 2H3GX 3D2EB 1DG4A 2GELA 1K8KB 4EZQA 4IWVA 3WXLA 3RSEA 1NGAA 3H45C 3GOIA 1HUXA 3A8YA 4B1VA 3HM8A 5BREA 4CBUA 1GLAG 5AQRA 4H0VB 3SK3A 5BPMA 2P9PB 4JD2A 4JAXA 4BR0A 4CJ7A 1NLVA 2FSKA 2CGKA 3L4IA 4BC4A 3AY9A 5I9EB 2QWLA 2P9KA 2UYTA 4BRHA 3IFRA 5AQUA 4BROA 3UKRB 4BREA 3CIPA 4Y0WA 4FO0A 4MO5A 4M63C 5AQMA 4JNEA 2QWOA 3O1WA 3TU5A 1BOTO 4AM7A 3MCPA 1C0GA 4CZJA 2V52B 2WUSA 1RDWX 4WV5A 2AP1A 1U6ZA 1XUPO 2YJFA 3DOBA 3ATVA 4WQ5A 4EZRA 4YDUA 3C7NB 1BPRA 1ZXOA 2QWMA 4FOIA 4BRNA 1U2VB 3B8AX 1QZ5A 5FPDA 2QM1A 1BUPA 3CI5A 1HLUA 2E1YA 4FSVA 2P9NB 2QW9A 3ENOA 4IJNA 2P9UB 3LM2A 4JWDA 4LC9B 3S41A 3VF4A 3VGKA 3O80A 3D2FB 3DPQA 2P9PA 4WQ4C 3VEYA 4A2BA 4EZPA 4BC2A 4BR4A 5AQTA 1GLLO 4I6MB 5BRFA 4QS8A 4BRPA 1YVNA 4BRQA 5KQDA 3WEEB 1WOQA 3LL3A 5AFUA 2P9IA 4WV7A 2Q0RA 1YUWA 3UKRA 3WXJA 3LM9A 4BR5A 3VENA 2W41A 3L6QA 4M7XA 2V51B 4EAHD 1QQNA 7HSCA 2E88A 5AQPA 4PKIA 2FSNA 1NGFA 1NBWA 3U9DA 2D0PA 3FLCO 3FE1A 5KPRA 3BEXA 1Q18A 2YJEA 3CQYA 4BGAA 1NGJA 3O1BA 2GTDA 4FWSA 2IIRA 4FOEA 3QICA 1BU6O 4JWCA 3VOVA 4PL7A 5AQHA 4BRIA 1U2VA 3VEXA 2BUPA 3HSCA 4A61A 3H6EA 3D7EO 3O4WA 4EZVA 1Z6RA 3BF3A 4CZGA 4ISGA 2P9NA 3TPQA 2PAVA 4JNFA 1RFQA 4CZLA 1SZ2A 3I8BA 4YDUC 3O08A 4HY9A 1JCEA 3H1QA 5F0XA 3WEEA 2P9LB 1HX1A 3AAPA 1NGCA 4B1YB 5JICA 4E1JA 1BA1A 1T6DA 2F9TA 1U00A 3DXKA 3LDQA 2QWPA 2ITMA 4C23A 1TYQB 5AQXA 4PO2A 5BRDA 2CH6A 1XC3A 2QWQA 4ISEA 4K25A 3F9MA 2GWJA 2QWNA 4IO8A 5BR9A 3MN7A 4CZFA 1Q5LA 1G99A 1OKJA 3GBTA 4BRDA 3CJAA 4RTFD 4K43A 4BRGA 4BG8A 3G25A 2Q1NA 3W0LA 5CE3A 2E1ZA 4CBXA 4FPAA 3QFPA 1SQKA 1T6CA 2P9IB 4H0PA 4F9OA 2J4RA 3EKUA 3O8MA 1X9JA 5BRHA 3BUZB 3DAWA 4CZHA 4EZYA 2D1KA 3DXMB 1S22A 2W40A 4HTLA 3VEVA 1GLEG 3L0QA 1MWKA 3VPZA 4XEIA 1V4SA 3P4IA 1X3NA 4DCHA 4MLEA 1QQMA 1Z05A 1V4TA 2CGLA 1GLJO 3WXKA 3ZX0A 1TUYA 2D4WA 2P9LA 3GE1A 1NGDA 4GNIA 4QS7A 2E2PA 1QQOA 1R59O 2YCHA 3VF6A 4PL8A 5KQ8A 2Q0UA 3MN5A 5AQVA 3UE5A 1TYQA 4DQ8A 2YHWA 1P8ZA 4FPBA 4NO7A 2E2NA 2FXUA 4BRAA 1JCGA 4BR7A 2E2QA 3CERA 2Q97A 1GLBG 4BC5A 3M3ZA 3FZLA 3ULEB 3GDQA 3FZKA 3VEZA 3MK6A 4BRLA 1E4FT 4B1WB 2ASPA 1ZBSA 1KXPA 4A62A 2D0OA 4AM6A 2OANA 2PBDA 3DJCA 5AQOA 5AQQA 1S3XA 3DXMA 2A41A 4B1ZA 3MN6A 5EY4A 4EHUA 5KPZA 3DXKB 4H5TA 3UKUB 5BN9A 4FL9A 3FGUA 3LDPA 5F1XA 1GLCG 2E8AA 4R5LA 3J8AA 2HOEA 3CETA 4H03B 4EZNA 4CZMA 4JN4A 4EFHA 1KAYA 3U9ZA 3AAQA 4WYBA 2KHOA 4EZWA 3FR0A 4FWRA 3U4LA 5FPEA 4EZUA 2Q31A 4FWPA 3VGLA 1C0FA 3HZ6A 3U8XA 3A5MC 3QBXA 3ID8A 5AQGA 4BR9A 2ZGZA 2NLXA 3I33A 4XH5A 4F00A 3LDOA 3M6GA 4PKHA 2A42A 1MDUB 5AQWA 4BRKA 4PKGA 3KVGA 4FWQA 1ATRA 3ENHA 5AQYA 2IVNA 1ATNA 2YHYA 4CZEA 3ZETB 1NM1A 1Y64A 3KHYA 2HMPA 2GEMA 2NZTA 2P9SB 4B1XB 4EZSA 2V7YA 1T44A 4H5VA 4EHTA 3H3NO 1KAXA 1NGEA 4MO4A 1BA0A 4DHYA 3DQGA 3SLCA 3H1VX 2GWKA 5ADXA 3ULEA 4DB3A 1CZAN 3VESA 1IG8A 1DGKN 4CZIA 1HKBA 3IDHA 1GLFO 2A40A 2YI1A 3QDKA 1D4XA 3VGMA 3R6MA 5AQJA 2E20A 5BN8A 4H5RA 5AQNA 4K41A 5AQKA 3GG4A 4CD1A 3C0BA 2EWSA 3UKUA 3QBWA 2OP6A 3SMPA 3SJHA 3CJ1A 2A5XA 1BWFO 1EQYA 1RGIA 4FWNA 4FWLA 3R9PA 4QS9A 3N8EA 3A5OC 3IUCA 1SAZA 4NB4A 4BRCA 4E81A 1XQSC 2IVPA 3CQXA 1X3MA 4BQLA 4ISFA 2A6AA 4BRFA 1DKYA 3WT0A 5EOYA 3JS6A 4IXCA 3FZHA 3EZWA 5AZIA 1DKZA 2E2OA 2Q36A 4XH4A 5LY3A 4EZOA 4BRMA 4FWMA 4BR2A 3ZETA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FK4A 3U3YA 4GKJK 2ZWHA 2E4LA 2W42A 4EIAA 5KPTA 4R5IA 2HF4A 5ADXH 4PWDA 3MAQA 4QAGA 3MEGA 1GLDG 4KO0A 5C12A 3MECA 1BHLA 2A3ZA 4R5GA 3K0SA 1REVA 1K6YA 4YOUA 4DR6K 4M3ZA 2AA4A 4J2EA 4O8UA 5AQSA 1MA9B 3VF2A 3LPUA 1RT3A 3FFIA 4KV8A 1M1KO 4CERA 4ILHB 3KD5E 4F4KA 1ZBHA 3QINA 1SL2A 1HNIA 2FF6A 2VCPA 3M5RA 4DUZK 3ZEUA 1ZBLA 4W5RA 1TUUA 2JWLA 3C94A 3QEXA 3N4QA 4YORA 3K5OA 5FPNA 3ID6A 5F2RA 1J9AA 3THWB 1E3MA 2BPRA 3UB5A 4KB0A 2ZJRL 4N76A 3O3GA 4DTMA 3IMXA 3ENBA 4H0XB 4JEPA 4XH1A 2F9WA 3D2EA 4KHNA 1DEJA 4IDKA 4B3SK 1NMDA 2O4IA 2P51A 3NGIA 1IG9A 3VEWA 3VERA 1ASVA 4JWIA 3VQCA 3ZSQA 3HYFA 3SCXA 2ASMA 5EVZA 4BDYA 1HKCA 4DTNA 1ITGA 3GL1A 4FW1A 2ATQA 4IDHA 4B3MK 1B9DA 4DU3A 3MWPA 4ILIA 1JCFA 5HBMA 4DTOA 5HRPA 4JKGB 1RT6A 4OPJA 4E7LA 5AZIB 4DS5A 4JYAK 3CM5A 4MLHA 1NKBA 3OS0A 4U67L 4JI5K 4CK1A 3WUHA 3LAMA 3ZYYX 4EZXA 3CJBA 3THVA 1XMOK 1YTAA 2VG5A 4C8KA 3G71N 3C7NA 4LD0A 2OA8A 1EX4A 3RMBA 1FJGK 3CJCA 3LZJA 1RT7A 5HLFA 1WUAA 5SWMA 1X9SA 3QO9A 1HNVA 1J6ZA 4DTUA 3O9UA 2OPQA 3ZEUB 2D0CA 3D2FA 5EX5A 3E9OA 1HJOA 3TANA 4LF7K 4FLXA 4YOYA 3OBYA 2EHGA 1K9MO 2I7PA 3KK3A 1HKGA 4RG8A 1NWKA 3T1AA 3D2EB 3TSQA 4EZQA 1CXUA 4E1NA 3M8PA 4OO1J 1LWEA 3TAQA 3P38A 4H0VB 3DMJA 4CJ4A 2QWLA 2P9KA 3CM6A 3IFRA 2HMIA 3TSPA 1BL3A 4DU1A 4L8RB 2O8FA 5DM6L 4FJMA 4CHYA 3CIPA 1QS4A 3C6TA 2XY8A 1Q86O 3L3UA 4M63C 2DFEA 2HBMA 2QWOA 3TU5A 1W97L 3ZSYA 1U4BA 1T3VA 1BOTO 4EZ9A 3MCPA 3DYAA 5JS2A 3K5MA 2V52B 4LH4A 4YOWA 3CG7A 2AP1A 3IRXA 4W5TA 2G8WA 3ZSWA 2YJFA 3VN5A 3DOBA 4EZRA 3C7NB 1BPRA 4FOIA 1ILYA 3IKMA 3CCRN 1SKRA 3DLBA 1T05A 4IFVA 2QM1A 4AQYK 2XY7A 1KFSA 1BUPA 2DFFA 3CI5A 1VQMN 5FROA 4DS4A 4CHNA 4DLEA 2BH1A 1C1AA 3VF4A 1UAXA 3SQ1A 3C65A 3D2FB 3VEYA 4A2BA 1SL0A 3SUOA 1YTUA 1YVNA 5AFUA 2Q0RA 4B08A 5LMUK 1YUWA 3WXJA 4FYDA 3KK7A 3EZ5A 3CCSN 5GADP 1SS6A 1WSIA 3ISNC 1QSYA 4M7XA 4DFMA 1LAWA 1KLMA 7HSCA 5AQPA 5M1QA 4DLGA 1WNSA 2F7TA 3BEXA 1Q18A 3CQYA 5C10A 3CXCM 4BGAA 4FWSA 3MWTA 1HYZA 3KTQA 1IKXA 4CJSA 3C6AA 3QIPA 3TAEA 4OPHA 3RR8A 1DTQA 4BEBA 2O8FB 1U2VA 4A61A 4V19S 3H6EA 1Z6RA 4RW7A 1K8AO 2HBJA 4ISGA 1BGXT 2PAVA 3NDKA 1NJYA 1QTMA 2O8BA 4CIFA 4ILGA 4CIGA 1WB9A 3O3HA 4FLYA 3AAPA 3VTHA 1XNRK 5JICA 4E1JA 1BA1A 1T6DA 2RPIA 3OS2A 4YOTA 3CMEN 2E5LK 3DXKA 4CJ3A 4WFBL 2FC0A 4I7FA 1RDCA 5BRDA 1XC3A 3NF8A 3VQEA 4K25A 3CFRA 2QK9A 2QWNA 4Q0BA 3TAFA 4CZFA 2YNHA 2VQFK 1HRHA 4BRGA 1C0TA 1UA1A 2Q1NA 4ICLA 1VSKA 3ZCMA 4CJUA 2RKIA 1T6CA 4DR3K 1S1VA 4X65K 3DAWA 3JAMO 4F3TA 1I39A 4Z4IA 4C1NK 4FJNA 5M1KA 3R3LA 4HTLA 4O55A 3L0QA 5JS1A 1VRTA 2NNWA 3DRSA 4LH5A 1T7PA 3PO4A 1G15A 4K8XA 2ZQBA 1Z05A 5BR8K 2X78A 3ZX0A 1TUYA 4OKJA 2D4WA 1XHXA 4OKEA 2O4GA 5KQ8A 1KLNA 3ZT0A 3MN5A 1YJNN 4N5SA 3DM2A 3DOKA 3UE5A 4DQ8A 4NXMK 4FPBA 4DR5K 3QNOA 4BR7A 4J2BA 2E2QA 1EO1A 2Q97A 2O8BB 4ILGB 3ULEB 1U49A 3VEZA 3MK6A 2YX6A 2KQ2A 1JLQA 3SBTA 1KXPA 2HBKA 3TR8A 3CF5L 2OANA 2R7YA 3DJCA 3J81O 4OLBA 3BGRA 5AQQA 4E0DA 1EXQA 4DR4K 4K0KK 5KI6A 3DXKB 4H5TA 5GAHP 1N33K 4FL9A 2RE2A 3HRGA 3AA4A 4B9LA 4R5LA 2HOEA 3CETA 1KAYA 4WYBA 1TL3A 4CEEA 3ZSOA 4CF1A 3AO3A 4FWRA 3U4LA 3O9QA 3M8QA 2HW3A 4FWPA 1VSMA 3A5MC 5AQGA 3ZT1A 2XO7A 1SUQA 4XH5A 5MLCQ 4BECA 3SAFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3R6M A;  5AQJ A;  2E20 A;  5BN8 A;  4H5R A;  5AQN A;  4K41 A;  5AQK A;  3GG4 A;  4CD1 A;  3C0B A;  2EWS A;  3UKU A;  3QBW A;  2OP6 A;  3SMP A;  3SJH A;  3CJ1 A;  2A5X A;  1BWF O;  1EQY A;  1RGI A;  4FWN A;  4FWL A;  3R9P A;  4QS9 A;  3N8E A;  3A5O C;  3IUC A;  1SAZ A;  4NB4 A;  4BRC A;  4E81 A;  1XQS C;  2IVP A;  3CQX A;  1X3M A;  4BQL A;  4ISF A;  2A6A A;  4BRF A;  1DKY A;  3WT0 A;  5EOY A;  3JS6 A;  4IXC A;  3FZH A;  3EZW A;  5AZI A;  1DKZ A;  2E2O A;  2Q36 A;  4XH4 A;  5LY3 A;  4EZO A;  4BRM A;  4FWM A;  4BR2 A;  3ZET A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4FK4 A;  3U3Y A;  4GKJ K;  2ZWH A;  2E4L A;  2W42 A;  4EIA A;  5KPT A;  4R5I A;  2HF4 A;  5ADX H;  4PWD A;  3MAQ A;  4QAG A;  3MEG A;  1GLD G;  4KO0 A;  5C12 A;  3MEC A;  1BHL A;  2A3Z A;  4R5G A;  3K0S A;  1REV A;  1K6Y A;  4YOU A;  4DR6 K;  4M3Z A;  2AA4 A;  4J2E A;  4O8U A;  5AQS A;  1MA9 B;  3VF2 A;  3LPU A;  1RT3 A;  3FFI A;  4KV8 A;  1M1K O;  4CER A;  4ILH B;  3KD5 E;  4F4K A;  1ZBH A;  3QIN A;  1SL2 A;  1HNI A;  2FF6 A;  2VCP A;  3M5R A;  4DUZ K;  3ZEU A;  1ZBL A;  4W5R A;  1TUU A;  2JWL A;  3C94 A;  3QEX A;  3N4Q A;  4YOR A;  3K5O A;  5FPN A;  3ID6 A;  5F2R A;  1J9A A;  3THW B;  1E3M A;  2BPR A;  3UB5 A;  4KB0 A;  2ZJR L;  4N76 A;  3O3G A;  4DTM A;  3IMX A;  3ENB A;  4H0X B;  4JEP A;  4XH1 A;  2F9W A;  3D2E A;  4KHN A;  1DEJ A;  4IDK A;  4B3S K;  1NMD A;  2O4I A;  2P51 A;  3NGI A;  1IG9 A;  3VEW A;  3VER A;  1ASV A;  4JWI A;  3VQC A;  3ZSQ A;  3HYF A;  3SCX A;  2ASM A;  5EVZ A;  4BDY A;  1HKC A;  4DTN A;  1ITG A;  3GL1 A;  4FW1 A;  2ATQ A;  4IDH A;  4B3M K;  1B9D A;  4DU3 A;  3MWP A; 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