2V7YA

Crystal structure of the molecular chaperone dnak from geobacillus kaustophilus hta426 in post-atp hydrolysis state
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
504
structure length
504
Chain Sequence
b'MSKIIGIDLGTTNSCVAVLEGGEVKVIPNPEGNRTTPSVVAFKNGERLVGEVAKRQAITNPNTIISIKRHMGTDYKVEIEGKQYTPQEISAIILQYLKSYAEDYLGEPVTRAVITVPAYFNDAQRQATKDAGRIAGLEVERIINEPTAAALAYGLDKEEDQTILVYDLGGGTFDVSILELGDGVFEVKATAGDNHLGGDDFDQVIIDYLVNQFKQEHGIDLSKDKMALQRLKDAAEKAKKELSGVTQTQISLPFISANENGPLHLEMTLTRAKFEELSAHLVERTMGPVRQALQDAGLTPADIDKVILVGGSTRIPAVQEAIKRELGKEPHKGVNPDEVVAIGAAIQGGVIAGEVKDVVLLDVTPLSLGIETMGGVFTKLIERNTTIPTSKSQVFTTAADNQTTVDIHVLQGERPMAADNKSLGRFQLTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGIVHVRAKDLGTNKEQSITIKSSSGLSEEEIQRMIKEAEENAEADRKRKEAAEL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords CHAPERONE PROTEIN DNAK
publication title Crystal Structures of the 70-kDa Heat Shock Proteins in Domain Disjoining Conformation.
pubmed doi rcsb
source organism Geobacillus kaustophilus hta426
molecule tags Chaperone
total genus 116
structure length 504
sequence length 504
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.34.10 Mainly Beta Sandwich Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 2v7yA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2v7yA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2v7yA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2v7yA03
1HKBA 4BQZA 4FOIA 3DOBA 4BG9A 4EZNA 1XQSC 4F9OA 3SLCA 1ATNA 1NBWA 3CQXA 5F2RA 3MN5A 4F00A 4JAXA 1QQNA 4C23A 4A2BA 1T44A 5AQUA 5CE3A 3O4WA 1V4TA 2FXUA 2D0OA 4R5GA 3VEOA 4FPAA 4RWTA 1D4XA 2P9SA 1SQKA 5ELZA 3AY9A 3ZX3A 4FWKA 4H5NA 3AAQA 5AQGA 4JN4A 1X3NA 3UKUA 2P9IB 1DKYA 4JNFA 4B1XB 2EWSA 1OKJA 2P9PB 2GTDA 3VEZA 4BC5A 2IIRA 4CZKA 4DB3A 5LJWA 4JWIA 1DKGD 3WQTA 2V52B 1TYQB 3VESA 1BA1A 1R59O 3DWLA 3EKUA 2E8AA 2W40A 1CKRA 3GL1A 4IWVA 3KHYA 1Z05A 1DEJA 2GWKA 3G25A 2ZWHA 3DPPA 2CH6A 5AQFA 2Q0RA 3U9DA 4H5RA 4BR0A 4EZUA 2P9UA 3A5MC 1YAGA 4GNIA 2QWOA 1MWKA 2NRHA 2QW9A 3O08A 3WUHA 4CZMA 1LCUA 4CBXA 4BR2A 3DQGA 1QHAA 1ZBSA 3WT0A 5BPNA 1ATRA 1BUPA 3RSEA 1NGFA 1Q18A 4BRHA 5JICA 2PAVA 4FWMA 3LDLA 4GY2B 2PBDA 3SMSA 3UKUB 4M63C 2ITMA 1YVNA 4R5JA 2GWJA 2Q2RA 4BQLA 3U8XA 1NGAA 2P9KB 5AQMA 4CD1A 5AQSA 1HX1A 4XH4A 3ZEUB 3L6QA 5AQLA 1HPMA 1NGCA 1NGEA 3D2FA 3C0BA 1T6DA 5AQNA 5BRHA 4BRDA 1ZC6A 2YJFA 4FWQA 5AZJB 3UB5A 4H0OA 3VENA 4FWRA 2P9UB 2YHWA 3HZ6A 3CI5A 3F9MA 3VEYA 4CBUA 2CH5A 1BDGA 1MA9B 1U6ZA 5BPLA 4E1JA 4ISFA 2FSNA 4FWSA 3MMVA 3LDNA 3VF4A 1YXQA 1X9JA 4H0XB 1IJJA 2FF3B 3DXMA 2IVNA 4BRIA 3LDOA 1DKXA 1DG4A 1QZ6A 1KAXA 4EZVA 2FLOA 4EZSA 4BRAA 3R8EA 5BN9A 1IG8A 2I7NA 4LC9B 2Q0UA 1ESVA 1RFQA 4K25A 2AA4A 4PKIA 2QWNA 4IO8A 5EX5A 5FPNA 2P9IA 3U9ZA 4BVOA 3A5LC 4F01A 2P9PA 4HTLA 5EOYA 5BR9A 1GLCG 2HF3A 1NGHA 1TYQA 2QWRA 4H0VB 1KAZA 4AM6A 2V51B 2F9TA 1NGBA 4A62A 1HLUA 2I7PA 3MN6A 4HWIA 3SMPA 3ZX0A 1G99A 5AFUA 5FPMA 5AQHA 5AQKA 3IMXA 1NM1A 1BU6O 1HJOA 2P9NB 5AFUH 2KHOA 1QQMA 3TU5A 3JS6A 1BA0A 5AQVA 4A61A 4NB4A 4R5LA 4CZJA 4PO2A 4K41A 4JHDA 4Z94A 3DXMB 3HTVA 3VEVA 4DQ8A 2IVPA 1QQOA 3QICA 3MN7A 2QXLA 1YUWA 1RGIA 2OP6A 4MO4A 4JWEA 3O5BA 4CJ7A 1LOTB 2A3ZA 4BRMA 4EZZA 4AM7A 3L4IA 4BRKA 3VGKA 2D4WA 2Q31A 2YJEA 3BP8A 3M1FA 3O1WA 2IVOA 2P9KA 3UE5A 3M6GA 1XUPO 3ZEUA 3CQYA 3P4IA 4XH5A 4BRGA 1V4SA 2E20A 1Z6RA 3MCPA 3VERA 3LM9A 1P8ZA 3OHRA 5AZJA 3VEXA 5AZIA 4RTFD 3IDHA 1MWMA 4H03B 4O8KA 4BGBA 3MDQA 4ISEA 4IZ9A 4BC2A 2FF6A 1WUAA 3BF3A 3R9PA 3DXKB 3O80A 2E2PA 3GG4A 3KVGA 1X3MA 2VYPA 3H45C 4JHDB 3CETA 1BO5O 2ZGYA 1NGIA 3CJ9A 3MN9A 5AQXA 3WEEB 4B1UB 1DKZA 2E88A 5E26A 2DPNA 2NLXA 4FPBA 1KXPA 3I8BA 1H1VA 2QWPA 3H6EA 4BRQA 4EHUA 1U2VA 4B9QA 3EL2A 1JCEA 1BG3A 3I33A 1BOTO 2D1KA 5JLFA 3N8EA 3VF2A 4BRCA 2HF4A 1ZXOA 3TPQA 4XH1A 5AQIA 5EY4A 5TKYA 1NLVA 4H0TB 4CZLA 3EO3A 4WQ5A 3SJHA 3FR0A 3EKSA 3LL3A 2BTFA 3ZX2A 3CHWA 3FZHA 5AQZA 1K8KB 4R5KA 3GE1A 5AZIB 2E1YA 3LDQA 2YI1A 5AQWA 1S3XA 4WYBA 4BVPA 4QS9A 2P9NA 3BEXA 7HSCA 3H3NO 3WQUA 5B8HA 3FZKA 3GOIA 4WV5A 2UYTA 2ASPA 2Q36A 1NWKA 4O5FA 3S41A 4BC3A 4JWDA 1HKGA 4IJNA 1RDWX 1QZ5A 4HY9A 4FWNA 3VF6A 3FE1A 1SZ2A 4BR5A 3ULEA 2HMPA 3CJ7A 4L3QA 1U2VB 4CI6A 1Y64A 3A0IX 3QBWA 4DCHA 1J6ZA 1WOQA 4YDUA 2GUPA 3IUCA 3CERA 1NGGA 4CBWA 2A5XA 2GEMA 5FPEA 3DJCA 4EIAA 1JCFA 5AR0A 5KPTA 1ATSA 4CD3A 1CZAN 1HUXA 1GLBG 2YHXA 3WXJA 2Q1NA 5AQTA 4ISGA 3FZFA 1XC3A 4BR9A 3B8AX 3VEWA 2P9LA 3H0XA 4FL9A 2D0PA 5AQOA 4IJAA 4H0YB 4EAHD 3GDQA 3J8AA 4K42A 2H3GX 3W0LA 3CJCA 5LJVA 3ENOA 3LM2A 1TUUA 3FGUA 4B1VA 1GLFO 3DXKA 4WQ4C 2CGLA 3CJBA 4EZPA 3FZLA 5E84A 5KQDA 4E81A 2F9WA 4JD2B 3WEEA 2AP1A 3ULEB 4H5WA 4FO0A 2BPRA 5KPZA 2NZTA 5AQQA 3ZETB 3DAWA 3HBTA 3H3OB 2ASMA 4H5TA 3D2EB 5BN8A 5AQJA 3FFKB 4MLHA 3D7EO 3QNJA 1MDUB 3U4LA 4BGAA 5AQYA 3O1BA 5AQRA 4HYBA 4WQ4A 2A42A 3HM8A 2QWQA 5I9EB 1NGDA 4QS7A 2CGJA 4WV7A 1BWFO 1HKCA 1GLEG 2P9LB 3GBTA 3WXLA 1DGKN 1K8KA 3W3DA 5EXWA 4EZQA 3DPOA 3CJ1A 2A41A 4BRLA 3UKRB 4XEIA 3ATUA 5BPMA 4BG8A 4CZGA 1TUYA 2ASOA 1GLLO 3C7NB 1T6CA 4CZIA 2FSKA 2W41A 3A8YA 1NGJA 2VCPA 4WQ5C 4A2AA 4KBOA 3VGMA 3QFPA 2ZF5O 2HOEA 4I6MB 3AARA 4NO7A 3QBXA 3BF1A 3VPZA 4EZXA 5BRFA 1GLJO 4PL7A 4FWPA 3ENHA 4CZEA 4BC4A 4IXCA 3O8MA 3HI0A 5KPRA 4MLEA 1E4GT 4H0PA 2BUPA 2E2OA 1U00A 2V7YA 4PKGA 2A6AA 5KQ8A 2VWBA 3H1QA 3LDPA 4H5VA 3IFRA 3VOVA 4Y0WA 1GLAG 2P9SB 1C0FA 4BRNA 2GELA 3CIPA 4B1ZA 4EZOA 1NMDA 4YDUC 2V7ZA 3EZWA 4QS8A 4M7YA 3FLCO 3QB0A 4EFHA 3CJAA 3A5NC 5LY3A 3HSCA 3R6MA 3QMLA 5EVZA 5ADXA 3ATVA 4B1YB 3H46O 3VETA 5F0XA 2FSJA 4R5IA 5FPDA 4JD2A 4FOEA 5ADXH 3O6WA 2QWMA 3KZBA 3ZETA 4EHTA 1SAZA 4BR4A 4BRPA 2WUSA 3FZMA 3JXUA 3L0QA 3QFUA 3D2EA 4CZHA 2E2QA 4DHYA 3WXIA 2QM1A 2J4RA 4EZTA 4JNEA 1KAYA 4BROA 4MO5A 4EZYA 4B1WB 3H1VX 3RSEB 5JLHA 2OANA 3M3ZA 4PL8A 3BUZB 2ZGZA 2YHYA 1EQYA 5JMVA 4CZFA 3VGLA 3EN9A 3QDKA 1C0GA 4M7XA 3SK3A 5BRDA 1JCGA 3MK6A 5F1XA 3UKRA 4RCHA 4EZRA 1S22A 3DPQA 3ID8A 2A40A 4EZWA 2QWLA 4JWCA 3C7NA 1BPRA 4BREA 1E4FT 3D2FB 3AAPA 4BR7A 4PKHA 5AQPA 2E1ZA 2YCHA 4FWOA 2CGKA 4I6MA 2E2NA 4K43A 5BREA 3WXKA 3A5OC 2Q97A 4FSVA 1Q5LA 4FWLA 4J8FA 1GLDG 4BRFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FKOA 2Z1HA 3CQXA 4KAZA 5F2RA 3DLBA 1S6QA 4QCLA 1QQNA 2O8FA 3J81O 2ITGA 3O4WA 1V4TA 2E6MA 2OPRA 3VMFB 1D4XA 4JI7K 4H4OA 2P9SA 3THWB 5C12A 3AY9A 4H5NA 3KWGA 4KH5A 3G6EN 1X3NA 5JENA 1IKWA 1RTDA 1C0MA 4B1XB 3HPHA 4JEPA 2WBNA 5JS2A 2IIRA 4CZKA 4DB3A 2RHKA 4OKKA 4HUFA 4JKBA 3TAQA 1CZBA 3VQ5A 3GL1A 3KHYA 1XMQK 4B8CA 1Z05A 4PA1A 1QHTA 1KFDA 4WFAL 4O4GA 4PUOA 1ITGA 3DPPA 4WFBL 4BE1A 4M42A 1K6YA 1RNHA 1QE1A 4AHTA 2PYLA 2QWOA 4RW6A 2NRHA 1KVCA 2VGMA 1NK7A 4WF9L 4CZMA 1LCUA 3AVGA 3C6TA 3TTDA 3WT0A 5BPNA 5C10A 4B9VA 1NGFA 1Q18A 3QLHA 4FWMA 3AVIA 3K2PA 2G8KA 4M63C 2ITMA 4O44A 1RT3A 3AO3A 4Z4IA 2NRZA 3P5JA 5C15A 1UA1A 3U8XA 4KHYA 4CF2A 2P9KB 5AQSA 3MAQA 4IDKA 4I9QA 1QSYA 2YNGA 2JWKA 3C0BA 4BRDA 2Q3SA 4FWQA 5AZJB 3UB5A 4R5PA 3NH0A 4JLHA 1ASWA 3C6UA 4FWRA 4BDPA 1C0TA 1NKEA 2YHWA 3CI5A 1IH7A 4B9NA 4CBUA 1VRTA 3CCQN 2HBKA 1BDGA 1U6ZA 1BL3A 1J54A 4E1JA 2FSNA 1W97L 4FW1A 1RBUA 1JLQA 4JKAA 4H0XB 3HRGA 1IJJA 2FF3B 1XI1A 3V1QA 3LDOA 1X9MA 4FJ9A 1DKXA 5LMNK 3TAGA 3D45A 1DG4A 4F8RA 1KAXA 3LALA 2FLOA 4EZSA 4O0JA 4E7IA 4W5NA 3KK1A 3CFOA 4LC9B 2Q0UA 1LAVA 1RFQA 3PIOL 4F01A 4HTLA 5EOYA 5LL6Z 5BR9A 4W5RA 3LAMA 2UUBK 2QWRA 2F9TA 3MEEA 1HNIA 1HLUA 2I7PA 3QO9A 4Z0UA 3MN6A 3QNOA 1LWCA 3WNGA 3PLAA 3K58A 3CF5L 4CGGA 4I43A 1NK0A 4YY3K 3G0ZA 1WSIA 3TU5A 4DSJA 5EU7A 4A61A 4CEOA 4K41A 3HTVA 1MU2A 1BI4B 4N56A 3MN7A 2QXLA 2VQFK 1YI2N 3TSPA 4JWEA 3N4PA 4FW2A 2QA4N 4C8NA 2G8WA 2E4LA 1VQLN 4JRQA 3KTQA 2HBJA 5DM7L 3QIOA 2Q31A 4RG8A 3BP8A 3O1WA 2PFUA 3ZEUA 3P4IA 4XH5A 4BRGA 3JAMO 2NUBA 2E20A 2WFBA 3G10A 1Q82O 3OHRA 3SBTA 4AH9A 2JLEA 3IDHA 4H03B 4BGBA 3RMCA 1IG9A 3QEPA 4IZ9A 2OZMA 1CXQA 3R9PA 3O80A 1HNWK 1S1WA 1RBVA 3GG4A 3KVGA 3V9WA 3CETA 1BO5O 4CHZA 4HVJA 1NGIA 4M3UA 3CJ9A 4UY8O 3SUQA 4B1UB 2E88A 1RTIA 1C1CA 4LFAK 1KXPA 3I8BA 1VSJA 4CJEA 1VQ9N 5HRRA 4DR1K 3K9KA 3I33A 5JLFA 1BOTO 3VQ4A 2P5OA 4IO9L 1HQUA 1YVUA 4C1NI 1ZXOA 4CFAA 2UU9K 4IKFA 3RR8A 2PZSA 4B9TA 4CZLA 3M8QA 3SJHA 3EKSA 2NRRA 2NRWA 1NK5A 3CHWA 3SBTB 2RPIA 4W5OA 2HVHA 3BEXA 3H3NO 5B8HA 4J2BA 2ASPA 4O5FA 4JWDA 3K5MA 3DLKA 1S6PA 3ZT2A 4HY9A 1UWBA 3EE9A 3FE1A 3VF6A 1L3VA 3SZ2A 3CD6N 4I7FA 3SUPA 4KTQA 1OH7A 4FM2A 1WSGA 2HHTA 4DCHA 4YDUA 4IFVA 2D0CA 2XY7A 3CERA 1JXEA 4DSLA 3ZSRA 5FPEA 5KGXA 4B8AB 5J2PA 4EIAA 3BDPA 1FKPA 1CZAN 1HUXA 1GLBG 2YHXA 5GINA 5SWMA 5AQTA 3FZFA 3KKRA 1XC3A 4G9ZA 3KLEA 1XWLA 2D0PA 1VQ4N 4FJGA 1JL1A 4H0YB 4FLVA 4V19S 3GDQA 5J2NA 3MXJA 3DRPA 3FGUA 4JKGB 3O9SA 3O9RA 5LMUK 4EZPA 3S3MA 3AA2A 3T69A 1WBBA 3DMJA 5KQDA 3SQ1A 4E81A 3SAGA 4KH6A 4FK4A 2KZMA 4FK0A 3TAPA 3G71N 3HBTA 3D2EB 3EY1A 1WNSA 3U4LA 5AQYA 1J9AA 3TTCA 4M3ZA 2KKZA 4HYBA 4CJUA 1NGDA 3HVTA 4QS7A 4IDHA 2CGJA 4WV7A 3O9TA 4DV5K 1HKCA 5DMRA 3GBTA 3MCAB 3WXLA 4NXMK 5EXWA 3DPOA 1S9EA 4DQIA 2OPPA 4JK9A 4KHUA 1RBRA 2DY4A 4FJNA 1EKEA 4IBNA 1KC8O 2VCPA 2X6SA 4KBOA 3VGMA 3QFPA 4I6MB 2VGNA 3T1HK 3SCXA 1YITN 1HNXK 4NO7A 1SL2A 3BF1A 3VPZA 4EZXA 3NMUA 2WOMA 4KTZA 4FWPA 4CESA 2ZE2A 4IXCA 4YOYA 3O8MA 3HI0A 3TARA 3K5NA 4H0PA 3TR8A 1U00A 3HYFA 1QQCA 4R79A 4E7HA 3H1QA 4KHSA 1LV5A 3WXMB 3SNNA 4Y0WA 1GLAG 2GBZA 3LPTA 4CK3A 2F8TA 3OYKA 2KFZA 3PO4A 1UA0A 3ZT4A 4YDUC 3SBGA 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 4B1W B;  3H1V X;  3RSE B;  5JLH A;  2OAN A;  3M3Z A;  4PL8 A;  3BUZ B;  2ZGZ A;  2YHY A;  1EQY A;  5JMV A;  4CZF A;  3VGL A;  3EN9 A;  3QDK A;  1C0G A;  4M7X A;  3SK3 A;  5BRD A;  1JCG A;  3MK6 A;  5F1X A;  3UKR A;  4RCH A;  4EZR A;  1S22 A;  3DPQ A;  3ID8 A;  2A40 A;  4EZW A;  2QWL A;  4JWC A;  3C7N A;  1BPR A;  4BRE A;  1E4F T;  3D2F B;  3AAP A;  4BR7 A;  4PKH A;  5AQP A;  2E1Z A;  2YCH A;  4FWO A;  2CGK A;  4I6M A;  2E2N A;  4K43 A;  5BRE A;  3WXK A;  3A5O C;  2Q97 A;  4FSV A;  1Q5L A;  4FWL A;  4J8F A;  1GLD G;  4BRF A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1FKO A;  2Z1H A;  3CQX A;  4KAZ A;  5F2R A;  3DLB A;  1S6Q A;  4QCL A;  1QQN A;  2O8F A;  3J81 O;  2ITG A;  3O4W A;  1V4T A;  2E6M A;  2OPR A;  3VMF B;  1D4X A;  4JI7 K;  4H4O A;  2P9S A;  3THW B;  5C12 A;  3AY9 A;  4H5N A;  3KWG A;  4KH5 A;  3G6E N;  1X3N A;  5JEN A;  1IKW A;  1RTD A;  1C0M A;  4B1X B;  3HPH A;  4JEP A;  2WBN A;  5JS2 A;  2IIR A;  4CZK A;  4DB3 A;  2RHK A;  4OKK A;  4HUF A;  4JKB A;  3TAQ A;  1CZB A;  3VQ5 A;  3GL1 A;  3KHY A;  1XMQ K;  4B8C A;  1Z05 A;  4PA1 A;  1QHT A;  1KFD A;  4WFA L;  4O4G A;  4PUO A;  1ITG A;  3DPP A;  4WFB L;  4BE1 A;  4M42 A;  1K6Y A;  1RNH A;  1QE1 A;  4AHT A;  2PYL A;  2QWO A;  4RW6 A;  2NRH A;  1KVC A;  2VGM A;  1NK7 A;  4WF9 L;  4CZM A;  1LCU A;  3AVG A;  3C6T A;  3TTD A;  3WT0 A;  5BPN A;  5C10 A;  4B9V A;  1NGF A;  1Q18 A;  3QLH A;  4FWM A;  3AVI A;  3K2P A;  2G8K A;  4M63 C;  2ITM A;  4O44 A;  1RT3 A;  3AO3 A;  4Z4I A;  2NRZ A;  3P5J A;  5C15 A;  1UA1 A;  3U8X A;  4KHY A;  4CF2 A;  2P9K B;  5AQS A;  3MAQ A;  4IDK A;  4I9Q A;  1QSY A;  2YNG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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