2V93A

Equillibrium mixture of open and partially-closed species in the apo state of maltodextrin-binding protein by paramagnetic relaxation enhancement nmr
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
309
structure length
149
Chain Sequence
GKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPCKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Open-to-Closed Transition in Apo Maltose-Binding Protein Observed by Paramagnetic NMR.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
total genus 122
structure length 149
sequence length 309
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v93A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v93A01
2DP8A 4XXUA 3QSLA 4KFQA 1QW0A 4NF8B 2V25A 3G3JA 3OO7A 4O3BA 1MH4A 3RGYA 3O29A 3MZ1A 1EZ9A 2G29A 1NFTA 2ANJA 3RTFB 1DTZA 4PFYA 1LGBC 3PPQA 2GHBA 3RQTA 1R9LA 2QS3A 1DSNA 4MLVA 3EF7A 3JZJA 2H98A 2O7IA 3OEKA 1SYIA 1FTLA 4JSDA 1GGGA 2Y7PA 2O1MA 3LSFB 3PV0E 4C0RA 4IY5A 2I6EA 4QSEA 4OXVA 4GXSB 1JETA 2ZNTA 3MJNA 4OESA 1MY0A 4P0IA 2PT1A 1OIBA 4F1UA 1SW4A 5TPAB 3TMGA 2F7AA 5L9MA 5EYFA 1MQDA 1YTVA 2I3WA 1ELJA 3EN3A 4EQ9A 1UQWA 2QMXA 4KHZE 3QIMA 4H8IA 4X9TA 3U1OA 1QUJA 4FE8A 1B58A 3D4GA 4U1OA 4R73A 4U4XA 2F7BA 3C33A 3KGCA 4ESWA 5H8HB 4BDMA 3B6TA 3W9WA 1VSOA 2XXTA 3GLBA 3KN8A 4GFRA 2RCAA 1NKXA 1SW5A 5KZTA 1R1NA 2P1SA 3VE1B 1TXFA 2Z22A 4BDOA 3O66A 3PU5A 5ITPA 4ZEDA 4ZDMA 1PB8A 4F2OA 4HCYA 1TFDA 3OMBA 4MF3A 4DDDA 5AA2A 5HBCA 4ZEBA 3CI8A 1IUDA 4ZS9A 1RYXA 4WXJA 2Q89A 3U92A 2B3BA 5CM6A 4FATA 2E0SA 3V83A 3OSQA 4RYAA 4F3GA 3FXRA 4R75A 2I4CA 1B9JA 2NWJA 1A55A 1P1OA 3LBSA 2AYSA 4WKMA 5B70A 5H8NA 1NNKA 4YMAA 2KLFA 3MP6A 3PUYE 1JEUA 2FYIA 1L5TA 4DCXA 3TUSA 3IO6A 2WKYA 5CMMA 3U94A 3T66A 3SEUA 3FVOA 3BKIB 1MRPA 4LQ5A 1MXXA 3ONMA 2ZYNA 2YPNA 3PUVE 4Q8RA 1IXIA 3HHFA 5H8NB 2PBWA 1UTHB 3HCQA 4EQ7A 5BWJA 4YMBA 2QRYA 3SEYA 3V89B 1IXGA 1XOCA 1NH8A 3UK4A 2M8CA 3T96B 3CVGA 2A5TA 1MPBA 2FNCA 3WAFA 4KR5A 1LBBA 1UIVA 4DE8A 3Q27A 2XX9A 2XXUA 2O84X 2VHAA 3ODBA 1LCTA 2ONRA 3F11A 2ESNA 2VD2A 1JW5A 2X7PA 4H0WA 5DVIA 1BIYA 3CSGA 1EZPA 2Q8JA 2HFBA 1JVYA 4DXBA 4EXLA 4OFJA 4YAHX 1B6HA 4WEDA 2Z8FA 2A5TB 1S50A 2QS1A 1SW1A 3R26A 3HO7A 2NXOA 4OERA 3K6WA 2F36A 4WEPA 5ELVA 3OD7A 3PPPA 1FQCA 3SESA 1MQJA 1FTMA 4F22A 4ESXA 4H5GA 4ELPA 1WDNA 3ZS6A 1B0LA 3GBBA 1H76A 3FVKA 4M4GA 3TZAA 5H8FA 1H45A 2W7YA 2Z8EA 5M2VA 1B3HA 4EQBA 1D3KA 2Q2CA 1FQAA 4I8CA 1B3LA 3H7MA 1VFDA 1Y3NA 1AOVA 5AA4B 1B40A 1QULA 1PBPA 3TTNA 3OXNA 4DIGA 4F39A 4EF1A 3H4ZA 4EDPA 1M5CA 5FTHA 2P2AA 3RPWA 1XVXA 2HXWA 4C1TA 5DVFA 1NNFA 3FASA 4U22A 4JDFA 5TP9A 3B6QA 4JWOA 4ND9A 1B3EA 2RCBA 3G7WA 1P99A 2XHDA 2I3VA 1A40A 4G8MA 4ELRA 3A09A 1XC1A 3UGWA 4U1ZA 4F1VA 4LONB 3LSXA 2CMOA 3N94A 1AMFA 4O3CA 1MM6A 2V3TA 3M3LA 5AA3A 4Z7EA 1I69A 1B3GA 4QSDA 1AH5A 2QL3A 1LLSA 3DM0A 2O1LA 2HAUA 4MBPA 5J1DA 4X1BA 2YLNA 1CB6A 2LAOA 3Q29A 1B3FA 3EHUA 5AA2D 2ONKE 1MDP1 2F35A 3MPKA 4EF2A 1ANFA 1IIWA 4QHQA 3TEPA 3O2AA 4DXUA 3ZSFA 3TTKA 3E3KA 3FZVA 1JW4A 2DE2A 1LFHA 1GV8A 2REJA 3MVZA 3CFXA 1R9QA 1NMUA 4IO6A 3T9VA 3QUFA 1ZLQA 1J1NA 2Z8DA 4GLIA 2YJPA 2REGA 5DVJA 5I58A 1P1QA 4R2FA 1RYOA 2Y7RA 1TFAA 1TT1A 1OLCA 4LA9A 4OEVA 5KDTB 4POXA 1MM7A 1LAGE 3MVYA 1JEVA 4OTEA 2XXPA 1Y9UA 2F97A 5F1QA 1VFEA 1MY4A 1LCFA 1OLAA 2H4IA 3OENA 2Q2AA 3TDJA 4Q5TA 5I58B 4DCYA 3K6UA 2DOJA 3K01A 4JSOA 5H8QA 2AL5A 1B1HA 3OO8A 3PUZE 4G77A 4ZEIA 1HSEA 4O3AA 4LZ5A 3N6TA 3K1MA 1MY3A 1I6BA 4NF6B 3G3GA 1MPDA 1GTKA 4PETA 1EZOA 2DQVA 1DPPA 4TLMB 4PFUA 3EHSA 5H8QB 4UACA 5CBSA 3LSWA 5JEIA 2ONSA 2F8DA 4YB5A 2GRVA 4HW8A 3KJ7A 1P1WA 4H6DA 3LC8A 2D21A 2QS4A 1SVXB 2A5SA 1QJMA 5AE4A 3TELA 3N26A 5CRYA 2VP1A 2DVCA 3K6XA 2PYYA 4ZEKA 2XXYA 3RTWB 3L6HA 4JB7A 4POWA 2AIXA 4F3PA 1B46A 3S9NC 3V8XB 2XXQA 1URDA 3U8QA 5H8SA 3FV2A 4MFIA 3FD3A 2NVUB 4XKNA 4EUOA 4IO2A 5FHOA 3MZ9A 3LR1A 1B4ZA 1D9VA 1URGA 2D3IA 4Q30B 3S2VA 1MPCA 5L9SA 2RC7A 1O64A 2HAVA 1MG1A 4TOZA 4G8NA 4RY1A 4U21A 1B51A 2QJEA 4YKKA 3OO6A 1VE4A 4BDQA 2H5YA 1UTBA 2ZYMA 2H99A 4R2BA 4QFKA 2XD3A 1S9TA 1QVSA 4NWDA 1QUIA 4OEUA 3FATA 2X7QA 3TTMA 1PDAA 3G3KA 5FTIA 1MXYA 1BKAA 3IOVA 3PD9A 3O28A 3C31A 4AB5A 1IEJA 1A7LA 3FJGA 3AXFA 2OZZA 3IK6B 2ZYOA 3KEIA 5BUUA 1SQYA 3JYRA 3PD8A 4N6PA 1Y4CA 3N6UA 2UVGA 2DS9A 4NWCA 3P7IA 3VLVA 4P11A 1UTBB 3PPOA 1M5EA 4X1DA 4F1YA 3BFUA 1N84A 1SDXA 4F3SA 2G93A 5AA2B 2PMSA 4H67A 3H6UA 2DXRA 2HEUA 4KYEA 3KBRA 4ZZEA 3PGFA 3C35A 1PB9A 3GBAA 4NMYA 4JWYA 4FJPA 4F2QA 4GD5A 2QSXA 5DEXA 2Q88A 1US4A 3UP9A 3TCFA 1JW1A 2RKMA 1LFGA 5A5XA 3S9EA 1Q1KA 3MVXA 4OYVA 3RT8A 2XX8A 1Q35A 2ABHA 3TTRA 2THIA 4OHNA 4BDNA 4LQ2A 3H06B 1DPEA 1P1UA 4BLAA 4N13A 4NE4A 4NF4A 4ZE8A 5I84A 2O69A 4XKRA 3K02A 2DVZA 3SERA 2DE3A 4DLDA 1MS7A 4U2RA 3FJ7A 5DEXB 4GL8A 3MZBA 1MXWA 4G2ZA 1O63A 3TCHA 2ZXTA 2ZNSA 3O9PA 5L8DA 1GR2A 3CSBA 2DYXA 3MP8A 3KOSA 4JBZA 1IZ1A 3HV1A 5HPQA 5ICQA 3IO4A 1LFIA 1USYH 4OWDA 5I2NA 4HCWA 5EHMA 1FQDA 3ILTB 3TYHA 2UVHA 5ITOA 1MH3A 4G68A 3VV5A 3BFTA 3A3CA 3C34A 3LSLA 3CIJA 2OK2A 3T9UA 1ZKBA 1FW0A 4YKIA 4Q0CA 4H65A 4OENA 3VXBA 4C1UA 1MQHA 2BJJX 1XS5A 5I2KA 2HQ0A 2UVJA 4IO3A 3ZKLA 2RC9A 2DWJA 3G3FA 3KFMA 5I2NB 3TQLA 3ILUB 2I0BA 1Y20A 3DELB 4G68B 2ZMBA 3PPRA 2Y7KA 2DWHA 4PP0A 1D9YA 2PT2A 4IB2A 3TTLA 1POTA 2XXIA 3E4RA 3U93A 5H8FB 1A8FA 3D4CA 4GXAA 3DP8A 3UIFA 1M5FA 3V5AA 4YICA 3PPNA 1B52A 3B6WA 2V84A 2I58A 4F18A 3GZGA 4RK2A 1MDQA 2I4BA 1IITA 1VR5A 4QSCA 3KG2A 2HZKA 4RNSA 1LAHE 1ZU0A 5IKBA 1A99A 4JXIA 2FA7A 3UORA 3OEMA 4KYDA 5CMBA 4L17A 1H43A 4PQJA 1XHYA 4HTGA 4U23A 1ZJLA 3PUXE 5TP9B 3MQ9A 1QKBA 3PUWE 3M3FA 4LVQA 3IAZA 2F5XA 1SW2A 1USYE 3M3KA 1N3XA 2B65A 1FTKA 1OMPA 4YKJA 4ONYA 3SEXA 3TAJA 4ELQA 5CMKA 3MW0A 3IL1B 4LZ8A 1N76A 1DTGA 3IB2A 5I57A 4PFTA 2UYFA 1RKMA 1TWYA 3RT6B 3C9HA 2OWSA 3KJTA 5CI5A 2OJTA 4QFPA 2OWTA 4QRZA 3MVWA 5JTYA 2OLBA 2PVUA 3KSJA 1PB7A 2Y7WA 2XXVA 3CG1A 2Y84A 5I57B 1FQEA 3RNNA 3ZKKA 3IJXB 3T9HB 3RLFE 3TKDA 4IY6A 3GXAA 4R6YA 3EPEA 4OMBA 3K1PA 3CFLA 3B7DA 1ZIUA 4RK9A 3C32A 1M5BA 4YKPA 4R6HA 5HM4B 5JTYB 3SEVA 2V93A 2GH9A 4P0GA 4RXLA 4GF8A 1Y3PA 3MWBA 4XKQA 3K4UA 1LAXA 4F29A 2D5WA 1SI1A 3N5LA 2UXAA 3HHGA 1YAEA 3T22A 4KI0E 4M1VA 1MY2A 2O51A 1MQIA 4GQOA 2F7CA 1DMBA 1HSLA 4TQUQ 4RPOA 4GIZA 4G4PA 2B3FA 3QAXA 1WVJA 3VLUA 4FIMA 1A54A 4GOTA 3KSXA 1MXZA 5DTBA 1S7YA 3IX1A 4KCCA 3K00A 5TPAA 2DXYA 3IORA 4KYSA 4HS7A 3QK6A 2Y7IA 2VOZA 3IB0A 2ALUA 3QYTA 5JK4A 1Y1ZA 3KN7A 3QUJA 3HN0A 3TCGA 1NNPA 3R6UA 3IOWA 4F3BA 4I62A 1MY1A 2IA4A 1A8EA 1NL5A 2P0SA 5FHMA 2NOOA 4DZ1A 3K0VA 3H6TA 2RF1A 3RN8A 5H8HA 3TODA 1F9BA 3WAEA 1QUKA 1CE2A 1B7ZA 2DSFA 2NUVA 4EXKA 4BDRA 3FXQA 3U72A 2O6AA 3S4UA 4H1XA 4X48A 2GFEA 3VLWA 5CC2A 1BLFA 1PBQA 3CR9A 3W15C 1N0TA 2QS2A 5DT6A 1OQGA 2RINA 1ZBMA 3K6VA 1HSJA 4R74A 3M8UA 4IGRA 1I6AA 3TFLA 3KZGA 3SDFA 2GHAA 2RC8A 3OSRA 4OETA 2XXXA 3O6IA 5K2YA 5B7DA 1LBCA 4FAJA 3CRBA 3IOTA 1AL3A 3PMWA 1BP5A 1N7XA 2F6PA 3KOTA 3DLNA 3SETA 2ZYKA 4RJZA 4FEBA 4ZE9A 3Q26A 4R6KA 1IXCA 1ATGA 2X26A 1EU8A 2XXWA 1P1NA 4QFLA 1LSTA 1FTJA 1KWHA 3DP6A 4LP2B 4U4SA 4YZZA 1LAFE 1YPNA 4LUBA 1PEBA 1B1XA 3A3UA 2DE4A 1FQFA 1JNFA 3O97A 3Q25A 2V3QA 1Y3QA 4RA1A 1B4HA 2UVIA 1UTHA 4GRKA 1Y4TA 4QFNA 4GVOA 3E9XA 1B05A 4FEDA 3E13X 2PX1A 3I3VA 1M5DA 5K2XA 3H3GA 4FECA 1B2HA 3JV9A 4NEDA 4ELOA 2ZNUA 4ZEFA 2DWAA 3T93B 3IR1A 3OO9A 2QMWA 3LUYA 1D4NA 1WODA 3VVDA 2QPQA 1US5A 4ECFA 3VFJA 5CBRA 2F78A 5IAIA 4R9GA 3CFZA 4KQPA 4YB7A 2F6GA 4XTCQ 3IOUA 5A5XB 1ZMGA 4R72A 3UA8A 1OVTA 2OBGA 5I56A 1I6QA 4QF9A 1UIUA 5LOMA 3SKPA 3KN3A 1IXHA 4NF4B 2CZLA 1Z7ME 3FJMA 2XXHA 4OVJA 1N3WA 3I6VA 3Q28A 3G3IA 3C36A 1NH7A 3MP1A 3FGSA 3QXMA 2E1SA 4GWOA 1B5HA 1Y1MA 5CMCA 3T9XB 5AA4A 4G8HA 4IO5A 1FQBA 3H6WA 5I56B 5F7VA 3RUMA 3DP4A 1XVYA 4R9FA 3UN6A 3W9VA 2O68A 1LB9A 5DYHA 4QFOA 2HZLA 2I49A 4K3FA 2I48A 3RY3A 3FVNA 4OQOA 2XD2A 3MAMA 3VDFA 4OZ9A 3USDA 1PC3A 5I59A 1N7WA 2DWIA 4IO4A 4XKPA 1II5A 3VXCA 4OFLA 4G68C 1QKAA 4LATA 1MXVA 1OQHA 3IB1A 1EH3A 5I2KB 4MH5A 2R71A 3EQ1A 1MQGA 1OVBA 2H9BA 3K2DA 4Z0IA 3FXUA 3I5OA 1NNTA 1FCKA 5TU0A 4DXCA 5FHNA 1YCJA 4F31B 2O7UA 1B7HA 4I9DA 2F34A 3HSTA 4NF5A 5I59B 4YB6A 4IO7A 2Q9TA 1AIVA 2UYEA 3S9MC 3MPLA 4KPTA 3VVFA 4YU0A 4AB6A 1DOTA 2I0CA 3C4MA 1LB8A 1H3DA 3K1NA 1FTOA 4N07A 4XIGQ 4NTLA 2AL4A 3FUZA 4RPNA 1POY1 4E0XA 4KCDA 1BTJA 4KD5A 3FV1A 1O7TA 3ECRA 2V3UA 1B5IA 2OCUA 3HPIA 5KCJA 5ICTA 1B0HA 4NF5B 3H6VA 3SEWA 4H5FA 3OOAA 1SD3A 4H8JA 3IJOB 1SBPA 3G3HA 3BBRA 3FVGA 4AQ4A 3THIA 4IGTA 4FORA 2VGQA 3O6GA 3VVEA 5ISUA 2HCAA 4E0WA 1B32A 4LZ7A 4ZECA 3MUQA 1T0KA 4OFOA 5KDTA 3R7XA 4GL0A 1ZTYA 4PFWA 5KCJB 1MXUA 1JQFA 5L9OA 4JWXA 1URSA 3TPAA 3L6GA 3OELA 3FIRA 2H25A 2XX7A 1N04A 3TQWA 3H03A 1B5JA 3MC2A 2R9JA 1GVCA 2Z23A 3O6HA 2IEEA 1H44A 4NF8A 1SI0A 4I1DA 3PMXA 3S9LC 1IQ7A 1XT8A 4ZZAA 2R6GE 1JVXA 4PE5B 4TLLB 3PMVA 5AA1A 2XXRA 4NF6A 5EHSA 1Z7NE 3CG3A 1R6ZA 1B7UA 3MBPA 4F19A 2VD3A 4UA8A 1SYHA 4THIA 4BDLA 4MLQA 3EHTA 4ISUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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