2VLTA

Crystal structure of barley thioredoxin h isoform 2 in the oxidized state
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
111
structure length
111
Chain Sequence
AEVISVHSLEQWTMQIEEANTAKKLVVIDFTASWCGPCRIMAPVFADLAKKFPNAVFLKVDVDELKPIAEQFSVEAMPTFLFMKEGDVKDRVVGAIKEELTAKVGLHAAAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords THIOREDOXIN H ISOFORM 2.
publication title Crystal Structures of Barley Thioredoxin H Isoforms Hvtrxh1 and Hvtrxh2 Reveal Features Involved in Protein Recognition and Possibly in Discriminating the Isoform Specificity.
pubmed doi rcsb
source organism Hordeum vulgare var. distichum
molecule tags Oxidoreductase
total genus 32
structure length 111
sequence length 111
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2008-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2vltA01
1ZL9A 2PVQA 4HOJA 1F37A 4MF6A 2DJ0A 3GL3A 3GL5A 5F05A 1YF1A 2H8LA 4GRFA 1GSFA 1EWXA 4N30A 1SKRB 3V1WA 5HR3A 2FWHA 1F3AA 1G6YA 1KTEA 4KDYA 3UIWA 1ON4A 1SJ6A 4XRDA 3IE3A 1G0TA 3EU4A 1S3DA 4GCIA 3L9VA 5DJLA 1OC3A 1Z6NA 4G9HA 3D5JA 2H0GA 1K0CA 2NTOA 3CMIA 3FK8A 5DAKB 3ZVJD 1URMA 2IMKA 2GTUA 1AW9A 2KHPA 3Q74A 5COHA 1Y25A 2VLUA 3DWVA 4PXOA 4AF2A 4L5LA 4KCAA 3GTUA 3KH7A 4K7OA 2ZUPA 2HRNA 2L5OA 2GZZA 1QGVA 1ILOA 3KGKA 3G7IA 5ECPB 2BMXA 4EDZA 3BJ5A 3HZ8A 2LRNA 5AN1A 5A4UA 4DSRA 2GGTA 3LYPA 2WDUA 3M9JA 2CVKA 2I3YA 2YNXA 3UJ1A 4PQIA 4TKYA 2R6KA 4RUVA 2OE1A 2A4VA 2FHEA 4JBBA 2FWFA 1X9WB 4KA0A 2A2SA 4EF0A 3ZRDA 2HSYA 3M3MA 3P8WA 9GSSA 5ELAA 3KMOA 4GSTA 2H01A 2IFQA 1YDKA 2ON7A 1F2EA 5AGYA 2HT9A 1AIUA 4XTSA 5G31A 4FYCA 1EGRA 2JZSA 1T7PB 3BOAA 3GX0A 2ES7A 3F3QA 2GS3A 1TU7A 3GKKA 5JWQB 3IA1A 4GXZA 3UOMA 4HU7A 5D9TA 1G6WA 1B8XA 4WR4A 2R5GA 3KH9A 2VO4A 3HXSA 4L0WA 1PX6A 1SD9A 2P0GA 1YJ6A 1T1VA 1K0AA 4NV5A 2LRTA 5CRHA 1MTCA 1YKAA 2GZPA 1BAYA 5GZZB 3A2VA 1BQ7A 2JZTA 5DALB 4BWQA 1MDKA 1A8LA 2V41A 2NVLA 4FO5A 1ZZYA 4POLA 3A5WA 2GT6A 1SL1B 2R2JA 5IQYA 1Q4JA 3KMNA 1LBKA 2IL3A 5ECIB 6GSUA 4HUAA 4F82A 1O7UA 4IP1A 2JADA 1Z7PA 2HZFA 1KBNA 3TJJA 4ACSA 1XZOA 1O81A 1XWCA 1JZWA 1R4WA 2PVOC 5HR2A 4AJ8A 3EVIA 2GSTA 4KAEA 2YV7A 3DD3A 1SD8A 3N5OA 3QR6A 2L5LA 5D9XA 22GSA 5G5EA 2CQ9A 4K7IA 3CRUA 1QMVA 4LL1B 4CW9A 1THXA 2VL2C 4IVFA 3UAPA 2YPMA 4POKA 10GSA 2MMOA 1EEJA 3Q18A 4KB3A 3QAWA 2LQQA 2H71A 2VL9A 1V2AA 2PWJA 3A2WA 3P2AA 5F07A 2DMLA 4O7HA 3VPQA 1KNGA 4N11A 5B7CA 4J56E 1EV4A 1J9BA 2YANA 5CAXA 1X5CA 1R5PA 4MJCA 1FW1A 2VLVA 4GSSA 1AAZA 4XS4B 1ZMAA 2RUFA 2O85A 3FW2A 5D73A 5E4WA 1NSWA 2K8SA 3C1SA 5LNKe 3KCMA 1XOAA 1OC9B 2FWEA 5AISA 3MAKA 3RDWA 2GQMA 1SU9A 1V98A 3L9SA 2JSYA 4FIWA 3WGDA 4AJ6A 8GSSA 4GQCA 3LGCA 2I1UA 4JR6A 1PX7A 2B5XA 1WWJA 2KOKA 3KD0A 4ZBDA 4HZ4A 4DSQA 2H76A 5DCGA 3EE2A 4K7NA 1TW9A 2QGVA 2GZYA 1XVQA 4EUYA 1B48A 3GYKA 4MJAA 3KXOA 2H72A 4JRRA 2DJ1A 3HD5A 2VLTA 4WR5A 1PRXA 1Z6MA 6GSVA 4X1UA 1XW6A 4PURA 4MF7A 5CNWA 4TRXA 17GSA 5FT3A 3EURA 2MZCA 4HZ2A 2KLXA 4WEYA 1GLQA 2H74A 1FB6A 5ID2A 2MMZA 3L78A 4I8BA 3U5RE 1V57A 3DVXA 1X5DA 4WXTA 2GSQA 1PL1A 1U6TA 3IC4A 3GKMA 4GQFA 2PBJA 3HKRA 4N0ZA 2V2GA 1DSBA 3F0IA 1AUCA 1A2LA 1FAAA 1SJZA 3CTGA 1GTBA 1VF3A 2D2ZA 3TRQA 3FEUA 2WFCA 4BVXA 3VURA 3TJBA 3VWXA 3KEBA 1N8JA 5G2ZA 4F2IA 3RBTA 3FZ5A 3QFAC 4Q5NA 1OYJA 1Q98A 2DIZA 1G7EA 1TRSA 2GQLA 4RQRA 3P7XA 4ID0A 3QAVA 1TP9A 5ECQB 3CSJA 4Q5RA 2J23A 5JCWA 2V6KA 3PH9A 3CTFA 4OCEA 4G10A 3CXGA 2KUCA 1M2BA 1TRVA 3VPTA 4EXJA 1E2YA 2N5BA 2L57A 1XWBA 4GLTA 4ZL7A 2HRFA 2PU9C 1GTAA 3GFKA 4NV2A 2LV3A 2CVBA 4LL4B 2P5RA 3O6TA 3TRPA 5G1KA 1XIYA 3M8NA 4GWRA 4H86A 4MDCA 5IPGA 5KN2A 2JU5A 2B7JA 2L4QA 3I69A 1RK4A 1SKSB 4AGSA 1SK1A 3DYRA 4KSOA 1GNWA 1A0FA 1TK0B 2HNLA 1MD4A 1BJXA 2HSHA 3HA9A 2JZRA 2L4CA 3IK7A 4L8EA 1K3YA 1TDIA 3GA4A 3W6GA 1VF2A 2LJKA 1TTZA 4PX1A 3P90A 2F9SA 2FWGA 1T3BA 2YV9A 2JL4A 4NAXA 3FR9A 4X0XA 5F0GA 2EC4A 3VFIA 5E59A 1WJKA 3GH6A 3IV4A 5JWOB 4NWYA 3FZ9A 2DSAA 2TRXA 3DIEA 4V1Ag 5ECMB 3ZMKA 3PINA 2L59A 3BBYA 4I97A 3H8QA 3QD9A 3H93A 3IRAA 4IN0A 1DUGA 5G30A 4MK3A 3WYWA 1UA5A 3UL3A 2N5AA 3D22A 5J41A 4TR1B 5HFGA 1SL0B 1THOA 3GSTA 4HQSA 5B8AA 3ZREA 5D96A 1B9YC 2R3XA 1O8WA 3U6VA 2RUEA 1T8EB 1R26A 3SWLA 1RQMA 2A2RA 1YEXA 2H30A 3KM6A 1VGLA 2J9HA 1Z5YE 3GUSA 4LA1A 2IFQB 4Q5FA 5IMFA 2LTKA 3KIJA 2B7KA 3GH9A 4IS0A 1U3AA 2V32A 3TOTA 2VL3A 3TGZA 1USBA 5H5SA 3W8SA 5FWGA 2DC5A 5AIVA 1HQOA 1JHBA 2RLIA 2IMDA 1YQ1A 1EOGA 1PSQA 4GSNA 1U88A 1O6JA 1R7HA 5CYYA 3E9JB 4JR4A 1X9MB 4N10A 1JLVA 1J08A 1SENA 4OFNA 2HI7A 1BX9A 1XWAA 2JSZA 4NHZA 2C0FA 5IMCA 3ISOA 5H5QA 1I5GA 4TN8A 2YOIA 4BA7A 18GSA 4AJ7A 2IJYA 2K9FA 4IHUA 4ECIA 3MDKA 2QC7A 4NHWA 5IPHA 3F6FA 1F3BA 3LJRA 1EEMA 2MBSA 3PGTA 2H66A 5D93A 4JEDA 4MH3A 2WGRA 1XCCA 4KDUA 5D9VA 2C0DA 1GULA 3UARA 3VI5A 1T4ZA 5HQPA 3FZ4A 3W8JA 3J7Yk 2H75A 3KJYA 1AQVA 1H75A 3CYNA 2R4VA 3ZIJA 3TJFA 1PD21 3VWUA 3I6AA 4OO5A 4CDOA 3ERWA 1EGOA 4PQ1A 3I43A 2HZEB 2FGXA 2YWNA 3IPZA 3GV1A 3APOA 4TXVA 2EIQA 2YN1A 1DE1A 3G7YA 2R37A 3BCIA 1PN9A 5D8IA 2P5QA 2X8HA 2AUVA 3APQA 4ZB9A 1QK8A 1GSYA 2MMAA 2MYGA 3F4TA 2BJXA 3ZTLA 3J7Yb 2AHEA 2MMNA 1ML6A 2H6ZA 3DMLA 3EYTA 5J4UA 1V40A 2HYXA 4MPGA 4ULXA 5EVOA 3ZLPA 4KE3A 2OBIA 5ENUA 4RI6A 3BCKA 3WGEA 2FLSA 3GMFA 3DKSA 3ZZXA 5DAKA 4P3YB 4DSSB 2XBIA 2N5FA 4CHSA 2LQOA 2OE0A 5HFKA 4BL7A 1T00A 5ECNB 3ERGA 3NIVA 1AC1A 4MABA 1MEKA 1T4YA 2LS5A 2TIRA 4NPBA 4DVCA 3C1RA 1HYUA 1EP7A 2CAIA 2KP2A 1SKWB 4MCUA 2O7KA 4RI7A 5FHIA 1XFLA 4WETA 2IMEA 2B5YA 2O8VB 3A3TA 5J9CA 1S3AA 1JFUA 2C0GA 2VCTA 3ZYWA 4EE0A 3K8NA 5CREA 3BD2A 4J57E 3KP8A 2VL2A 4NXIA 4K1FA 1UC7A 4HU9A 1PKZA 1OKDA 3M9KA 4ZIJA 3UVTA 1OKTA 3TRXA 6GSXA 1FB0A 2F51A 3QAGA 4IELA 2ALBA 2X99A 1A2MA 4EO3A 2DJKA 4LMVA 2VUPA 4MZWA 1B9XC 5ECSA 3CBUA 1W4VA 4YQVA 6GSYA 2QKEA 1AQWA 1N2AA 2CT6A 1XVWA 4V1Ap 2H19A 2C4JA 2B1LA 2K6VA 4ZBAA 3LSZA 5L71A 3HVVA 1GUHA 5H5RA 4V2LA 2OADA 3JCML 1A24A 2FD3A 4K2DA 3VWWA 1GUMA 2IMIA 4MPFA 3DVWA 4L0UA 2C0EA 3ZMLA 3ZITA 3L4NA 2FA4A 5ECOB 4MJBA 4I5QA 4TXOB 5DALA 1F6MC 3HJMA 2VCZA 3FKFA 5EY6A 4ZB6A 4OFMA 3CSHA 3LORA 3IAS2 1A8YA 2X8GA 5HR0A 4XS6A 1B4PA 4HI7A 5GAPD 2GVPA 5B6MA 1W89A 1BYEA 3EMXA 4G19A 2O89A 4HDEA 2OKAA 1GNEA 2VM1A 3RPPA 3WD6A 3D21A 2AYTA 11GSA 3GX8A 1R5AA 1YF0A 3NOFA 2XBQA 1NHOA 1TOFA 3GKNA 3HYPA 4WKWA 3QMXA 1U87A 2H1AA 4QL7A 3LWAA 5KEJA 3O3TA 4KDXA 4N0VA 5B8BA 4KCEA 2ZCTA 2HLSA 1EZKA 4K9ZA 1ERUA 5CRWA 2VCVA 3APSA 1TKDB 19GSA 2DLXA 3LXTA 2XC2A 1ERTA 2OBKA 2LKUA 1YEPA 4LLRA 4XS4A 3F6DA 3G7JA 4I2TA 3L9UA 4YH2A 4MZCA 3ED3A 3UBKA 3F4SA 1M9BA 2YJHA 2PGTA 5C04A 5J3RA 3US3A 1FO5A 5HR1A 5J5NA 4ECBA 5GAND 4KSMA 1JZDA 1PA3A 1HNCA 4F0BA 1I9DA 2WZ9A 3F8UA 2C1YA 1TJDA 1HD2A 5IM9A 4F9ZA 1WMJA 5DJMA 1NW2A 4GTUA 3GIXA 3H79A 4FYBA 3MNGA 1V9WA 4ZB8A 2X8CA 2TRCP 2C3NA 4OO4A 5CP1A 2M72A 1TK5B 5ABRA 1A2JA 1AXDA 1WIKA 1FVKA 3GRXA 1QUWA 1PQNA 2K18A 2H73A 5DVBA 1XBSA 2F8AA 1HNAA 2VCXA 5DCHA 3DGQA 2KP1A 1K3OA 1RW1A 5A4VA 3R2QA 2VCQA 4POBA 5IOXA 1V58A 1OVNA 2FCHA 3FYGA 7GSSA 4KGIA 3FR6A 5B6NA 2RM6A 4KUNA 2JACA 1MDJA 2V6OA 2AJQB 5JCUA 3M0FA 2E7PA 2LRCA 3IK9A 1M2DA 2WRTA 4JZQA 2C8UA 2YJ7A 4I2UA 3TKSC 1PL2A 4ZILA 2XPDA 6GSWA 1XOBA 2PN8A 2PMTA 1JZOA 3VI7A 4YAPA 3MSZA 3QCPA 4OD7A 3GTUB 4POMA 4PNFA 4BPYA 4O92A 4MF5A 3FR3A 4OFTA 4ZBBA 3I9V2 1UVZA 2CZ3A 3GNJA 3Q6OA 3AY8A 2PERA 2IPAA 4TR3A 2CX4A 2FY6A 3C73A 4K0NA 2DMMA 2YZUA 4HS1A 1XPVA 5CRDA 5KN3A 1GUKA 2AB6A 3EINA 4D73A 1J0FA 1MD3A 2YCDA 2X64A 3GSSA 6GSSA 1YKCA 4MMMA 2LUSA 3D4TA 3TKQA 1C72A 1S3CA 13GSA 3UVHA 1DE2A 2K8VA 3LQ7A 4L5OA 4F0CA 4WF4A 2B3SA 1K0MA 2AAWA 2VD1A 4PNGA 1A23A 1A0RP 4YQUA 2GSRA 4KW6A 1EP8A 1ZCPA 5JWRB 3RHBA 1U3IA 2DJ3A 2IN3A 3LXZA 5IIZA 1CQHA 4X43A 2B1KA 2OJLA 4ECCA 2E2MA 5JCGA 3DEXA 1SK2A 4HEA2 1K0NA 3SBCA 3D6IA 5IO2A 4DEJA 1XWGA 4XIHA 1K0BA 1Z7RA 2I81A 2OA7A 4BWSA 1YY7A 4EDYA 5DQYA 2YZHA 4GF0A 4NMUA 2MBTA 1WOUA 4PUFC 5ECKB 2WULA 3HY2A 2BTOT 1BEDA 1ACVA 5HFIA 4MP4A 1IYIA 1TXXA 6GSTA 5GSSA 4IQ1A 1ZGNA 4KH7A 2DBCA 4EC0A 1O85A 1GSUA 4IKHA 3TJKA 4PGTA 2L6CA 3F4RA 3F3RA 1DBYA 2DJ2A 4BVYA 4OMVA 5ECLB 4KNDA 2H6YA 3KTBA 1OE8A 5CO3A 2YWOA 2G0FA 3MWHA 3DRNA 2RM5A 2VAFA 1XXUA 1TI3A 1ZOFA 4TR1A 1WPIA 2CX3A 1OAZA 5G1LA 2LSTA 3GHAA 3D0ZA 5IMVA 3RHCA 4ZXGA 2E0QA 2IMFA 4QQ7A 3KP9A 4TR0A 2ON5A 1OC8A 1TU8A 1XW9A 3EU3A 3H4KA 1JZRA 1EV9A 1VF1A 2VCWA 3WGXA 1K0DA 1OE7A 2M80A 2DJJA 5J9BA 1ABAA 1WP0A 3S9FA 5DDLA 3QFBC 1GWCA 4TOPA 1PKWA 2WB9A 1JLWA 5D9WA 3FHKA 1ERVA 4ILFA 1EOHA 4XHMA 3GN3A 3ME8A 2IWTA 1O8XA 5ECRB 3ZVJA 1FOVA 1O73A 3HVXA 1K3LA 1FHEA 2CZ2A 1PGTA 3CSIA 1GSDA 2GQKA 3C8EA 3IAM2 4EKZA 1GRXA 3QPMA 2LNTA 4V2NA 2P31A 3TKRA 5IMZA 3ZL5A 2VOCA 5KN0A 2C3QA 1K0OA 5IMAA 1HNBA 2VD0A 3N9JA 4XRAA 5IOWA 3LYKA 2CV4A 4XCSA 3C7MA 2CVDA 2HZEA 3HHVA 5G5FA 2E2GA 4MJEA 2H0IA 5ID2B 3CRTA 2XPEA 2C3TA 2LJRA 3G9BA 5IMDA 2GLRA 3HZ4A 1SK0A 4ECJA 2RIIA 5INYA 2O87A 3D4MA 1M9AA 2GT5A 1QQ2A 4F03A 3ZIVA 4I6XA 2F8FA 1YZXA 3L0HA 3HDCA 1Y6EA 2VIMA 1GSQA 5CRGA 2YWIA 3TKPA 1TI1A 3UBLA 4RQXA 3KZQA 3IOSA 3IXRA 4YAVA 1QXHA 1KEBA 5A4WA 2HE3A 4ZL9A 2ZNMA 4JU5A 4ML1A 4DSSA 2I4AA 2QSIA 4WF5A 4YQMA 5KN1A 2C80A 2LNSA 3A2XA 3ERFA 3TUEA 3QDNA 2FUG2 3LEFA 1QFNA 3EWLA 3LFLA 4MLYA 3QOUA 2FNOA 1LU4A 1SL2B 3F9UA 1VRSD 4FH8A 1GTIA 2FA8A 1B4QA 3TCOA 3ZFBA 5EPFA 3TJGA 2I9HA 2H1BA 2M46A 4IBPA 1XW5A 3HVSA 2NDOA 4OCFA 4MZBA 5DBQA 3RPNA 3E3EA 3EMPA 16GSA 4EL1A 3ZFLA 4IJIA 1ZYEA 2OACA 1FVJA 5IO0A 4J2FA 1LJRA 1CQGA 3PR8A 5LCZA 3FZAA 3GKXA 3TDGA 5C00A 2HXKA 2H0HA 1GSSA 1TRUA 4FYUA 2LJAA 2EIOA 4IQAA 1M7TA 3VWVA 4O32A 3OR5A 3H1NA 2XHFA 4KX4A 1GSEA 3WT2A 2EIRA 2AV4A 3E0UA 1TRWA 3WT1A 4E8HA 1G7OA 2IIYA 4E8EA 1ZYQB 3IDVA 4K6XA 4Q5QA 5LD0A 1TK8B 2WJUA 1IYHA 4HJMA 4V2MA 1X9SB 3DXBA 3TOUA 4Z7XA 4HJ2A 12GSA 1AQXA 5ECHB 3TB2A 2CA8A 4G2EA 4O5RA 1ERWA 1PMTA 3C71A 5EL8A 2HFDA 4ISDA 4IW9A 1WRYA 1Z3EA 2WS2A 3VK9A 1OC9A 4OWYA 2B5EA 4IP6A 4TVEA 2F3MA 1GP1A 4HQZA 1GL8A 4IGJA 4JE1A 20GSA 1BG5A 1SYXA 3UMAA 2PUKC 3EC3A 4TXOA 1H4OA 1SYRA 4WBRD 1FG4A 3ME7A 3RAZA 3IR4A 4D73B 1WE0A 2H70A 1GLPA 2NPBA 2G2QA 1VF4A 2YWMA 4WBJA 2OE3A 2V1MA 5F8BA 4TR4A 3Q19A 4QL9A 4EVMA 3NZNA 5GSTA 4TW5A 3FY7A 2H1DA 1NM3A 3HJOA 3KTLA 1F9MA 3FRCA 2VM2A 5AIXA 2YP6A 3F63A 3O76A 1GTUA 1M2AA 3GURA 3IHQA 3TKSA 3UEMA 5F06A 2LEGA 4ML6A 2L6DA 5DQSA 1M99A 2DIYA 1M0UA 4MH2A 1SJIA 3HJPA 4PUAA 3VLNA 3HCZA 4MA9A 4K8MA 1X0RA 5A5KA 1GH2A 1XWKA 2B6MA 3TKSE 2REMA 4LMWA 2CAQA 4K0GA 1X5EA 2Z9SA 3M1GA 3IBHA 2NBSA 5ELGA 1NHYA 2PPTA 4IJ3A 3LG6A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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