2VLVA

Crystal structure of barley thioredoxin h isoform 2 in partially radiation-reduced state
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
111
structure length
111
Chain Sequence
AEVISVHSLEQWTMQIEEANTAKKLVVIDFTASWCGPCRIMAPVFADLAKKFPNAVFLKVDVDELKPIAEQFSVEAMPTFLFMKEGDVKDRVVGAIKEELTAKVGLHAAAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Barley Thioredoxin H Isoforms Hvtrxh1 and Hvtrxh2 Reveal Features Involved in Protein Recognition and Possibly in Discriminating the Isoform Specificity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Hordeum vulgare var. distichum
molecule keywords THIOREDOXIN H ISOFORM 2.
total genus 33
structure length 111
sequence length 111
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2008-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2vlvA01
5AN1A 1GUKA 4NWYA 1PGTA 1Z6NA 2P31A 3F9UA 4PGTA 2JADA 5IPGA 2YWOA 2JSZA 2QKEA 2LKUA 4BL7A 2RM5A 2L6CA 3TRXA 4EC0A 1EGOA 4N30A 2DMMA 2GT5A 1AC1A 2IJYA 2VM2A 4HEA2 2ALBA 4QL7A 1NSWA 11GSA 5J5NA 2R4VA 1OE8A 3F4RA 1O73A 1V2AA 2LRTA 4HU9A 2FHEA 4MDCA 5EL8A 5IO0A 5DCGA 1KEBA 4ECJA 4CDOA 2OJLA 5F8BA 2B6MA 2ZNMA 4I97A 4Q5QA 4JBBA 2JZTA 1JZOA 5KN1A 3VI7A 1MD3A 2BTOT 4GXZA 2LV3A 1JLVA 4GTUA 1G6WA 4WBRD 4V2MA 4RUVA 2A2RA 2C0GA 2EIRA 3APQA 2K9FA 5B6MA 1HNCA 4MF7A 2WFCA 3UBKA 1V9WA 4FYBA 4EDZA 2R2JA 1GSEA 4KCAA 3L9SA 1PX7A 1GTAA 3L9VA 2LNTA 3F3QA 3KMNA 2NDOA 1EOHA 1FB6A 2C3TA 2GDRA 13GSA 1XWCA 2IIYA 3HYPA 3S9FA 2KP2A 2N5BA 3VWWA 2C0FA 5ECSA 3HA9A 3VPTA 2DJ1A 3TOUA 3GURA 1T7PB 2PMTA 3HDCA 5DJLA 1MTCA 1O6JA 3VWVA 5AISA 1ZMAA 4GRFA 4KUNA 3OR5A 3NZNA 4WF4A 3UVHA 3VI5A 3L0HA 1BEDA 6GSTA 3QMXA 1FB0A 3KD0A 4KAEA 4PQHA 1TRSA 4L0WA 5G31A 1TDIA 3RHCA 4KW6A 3KM6A 1BQ7A 1TW9A 3A5WA 2H66A 1F3AA 4EKZA 3JCML 3FK8A 1FHEA 2WCIA 2C80A 1DSBA 2HYXA 5DBQA 5ECPB 3CTFA 5HFKA 2YCDA 3DGQA 3H1NA 1WJKA 3GTUA 1FVJA 5GSTA 1XXUA 4JU5A 1JZRA 1K3YA 3RPNA 6GSXA 5LCZA 2FCHA 3M0FA 1F2EA 3IA1A 2JACA 3VPQA 3UIWA 1EEJA 2E2MA 3IBHA 2C0EA 2CVDA 2AAWA 3LEFA 3D0ZA 2L4QA 2LRCA 3FW2A 3HVXA 1ABAA 2JZSA 1Z5YE 4ZL9A 2VLTA 2XPDA 4ML6A 3EMPA 4GCIA 5CNWA 3TCOA 1W89A 3KXOA 2HT9A 1SKSB 2ON5A 3GA4A 2KOKA 2LEGA 3ZVJA 1M7TA 5KN3A 4F0CA 5DVBA 3TKPA 4IJIA 5IPHA 1GTIA 2WJUA 1RW1A 3QR6A 3QFBC 1ILOA 3HKRA 2VCXA 3MNGA 5J41A 4FYUA 2XBIA 3TKSC 5ECHB 4KDXA 3I9V2 3KGKA 1OC9B 1OAZA 5B8AA 2H6ZA 2GQMA 4MMMA 1SD8A 2DJJA 4LMVA 1J08A 1MDIA 3ZIVA 1T1VA 2MMAA 3QOUA 2FWGA 4PXOA 3ZLPA 4EF0A 3I6AA 1WIKA 2VD0A 3HZ4A 4XS6A 5ECLB 5IMZA 4IGJA 2RUFA 4IQ1A 2I81A 2GSSA 3ED3A 6GSSA 2M72A 3ME8A 1SD9A 1M2AA 3PR8A 8GSSA 4Q5FA 4MH2A 3Q6OA 2CA8A 4LMWA 2YV9A 2IFQB 1ZOFA 5LNKe 5JCWA 4IHUA 2N5FA 3FKFA 3APSA 4HS1A 3QDNA 4K7OA 4JE1A 2H30A 2GTUA 3TJGA 4TXOB 3GUSA 3NIVA 3E0UA 4MZWA 3C71A 3DXBA 5IMDA 5IMAA 4TR4A 5J3RA 1XVWA 2OA7A 2H1BA 2OADA 1PQNA 3FY7A 1MEKA 1TI3A 4V2LA 3ZYWA 1URMA 1XOBA 5CP1A 1SL0B 1GL8A 5B7CA 1M9AA 2Z9SA 1WMJA 2GZZA 1GLQA 2KHPA 1XW6A 1M0UA 1F3BA 4NXIA 4NHWA 3WGEA 3H4KA 2PUKC 2TRCP 3ZRDA 5G1LA 4G2EA 1TI1A 1XBSA 3DYRA 3ZFBA 3EU3A 3HZ8A 1ZCPA 2GT6A 5DDLA 5IQYA 4OFMA 1V98A 1K3LA 3DMLA 2L59A 1PMTA 5FWGA 4ZB8A 3V1WA 5D9WA 1MD4A 1XWBA 2NVLA 1OC9A 5IOWA 4HQZA 3W8SA 3N9JA 3KJYA 4OFNA 1HNAA 3RHBA 4ZIJA 5J9BA 4K0GA 1UA5A 1PSQA 3D21A 3EC3A 3IE3A 4LL4B 2XPEA 1HYUA 1T4YA 3U5RE 3KIJA 4KX4A 10GSA 1GRXA 1X5EA 4O92A 2H19A 3GHAA 3DRNA 3CXGA 1G7EA 2BMXA 2IFQA 2YZHA 4IVFA 1GLPA 1DBYA 2K6VA 2F8FA 4BVXA 3HD5A 5KN2A 1CQGA 1TK8B 2XC2A 4XRDA 4ECCA 4N10A 1YZXA 3M9KA 4MJAA 3C1SA 3P7XA 5CYYA 2WB9A 2YN1A 1NHYA 3RPPA 1V57A 1FO5A 4G10A 5IIZA 4YQVA 4MJBA 1R7HA 4WEYA 5D9VA 2CQ9A 4J56E 4MJCA 4I2UA 4EUYA 2O87A 2VUPA 2V41A 1YJ6A 4J2FA 1ZL9A 1B9YC 4ZBAA 3FEUA 5C00A 1GULA 4QL9A 3SWLA 2AV4A 2QGVA 3EVIA 4RQRA 4OFTA 3UVTA 4MA9A 1GSUA 2CVKA 4HJMA 3ERFA 3D4TA 3CRUA 2B7KA 4TR0A 3EE2A 1VF4A 4HJ2A 4HDEA 5H5QA 2X99A 1ST9A 1A0RP 5F07A 1SL1B 5F0GA 2V1MA 2VD1A 1A8LA 3I69A 5INYA 5ECIB 3CYNA 1RQMA 5FT3A 3GTUB 2KLXA 4HU7A 4F9ZA 2H0GA 1JHBA 2I9HA 2H76A 4MPFA 3LORA 5J4UA 1AAZA 3KTBA 4MZBA 2V2GA 4PQ1A 2GS3A 1WOUA 2HXKA 3ZFLA 4I5QA 1G6YA 2H72A 3P8WA 4D73A 1J0FA 4V1Ap 2L5OA 3TUEA 1YF1A 1TOFA 5AIXA 5ID2A 4GLTA 4GQCA 4X0XA 1AQVA 1X5CA 2DC5A 2FLSA 1B4PA 1T8EB 4MF6A 2YV7A 5ABRA 2MMOA 3GL5A 2AJQB 1AQXA 4ZB9A 1XCCA 1KTEA 2HZFA 4IP1A 3BOAA 4XCSA 2GSTA 3C73A 3GH6A 1QXHA 4HQSA 2HNLA 2L57A 2YNXA 2MBTA 1EWXA 5EPFA 3IR4A 4XS4A 1PD21 1BJXA 5D93A 4HUAA 4HZ2A 3RAZA 1X9SB 1FG4A 1TRVA 5CRGA 1XWKA 1AIUA 1V58A 4WKWA 2L4CA 2VCVA 1EEMA 3P2AA 2DJ0A 3RDWA 4N0ZA 3EURA 4V1Ag 3LYPA 3DD3A 1H75A 3VFIA 1OE7A 2IMKA 2C4JA 4K0NA 2AB6A 3UBLA 2GSRA 2M80A 2C0DA 5G1KA 4PUAA 1LBKA 5GAND 3GIXA 5DAKA 3HVVA 1TK5B 1JLWA 3DEXA 4GF0A 1SJIA 3GKMA 3VLNA 2JU5A 3GH9A 4RI7A 1YQ1A 4OCEA 4G19A 1GH2A 4K9ZA 3CTGA 3LYKA 1K0NA 1C72A 4OD7A 4HI7A 4K7IA 1Q98A 2NPBA 2ZUPA 1U88A 4I6XA 4MH3A 2DMLA 2HRFA 4WR5A 2LJAA 2PVOC 4F2IA 4FO5A 1R5PA 4ULXA 2DIZA 4KNDA 2JL4A 14GSA 2C1YA 2H70A 1WWJA 9GSSA 5D9TA 4O5RA 5LD0A 1XWAA 4YAPA 3CSHA 1OKTA 1I5GA 4TKYA 1SYXA 3ZZXA 3C8EA 3IAM2 5DCHA 1M2BA 1GNWA 2VCWA 2CAQA 2YWNA 3M9JA 1Z3EA 5HFIA 2GLRA 4PNGA 3TJKA 2CX3A 3FR9A 4TN8A 4NPBA 1TKDB 4TR3A 1SK2A 3VK9A 1S3DA 4MP4A 4L8EA 4TW5A 3MWHA 2PPTA 4MLYA 5EVOA 3FZAA 3IOSA 3E9JB 4YQUA 4GQFA 2P0GA 2VL2C 2ZCTA 5A4WA 2WGRA 2DJKA 3TDGA 3ZMLA 3Q74A 4BVYA 2LS5A 3PGTA 2ON7A 4IP6A 4ZB6A 2JSYA 2YPMA 3FHKA 1GSYA 1PN9A 2H71A 1T00A 3CSIA 3CSJA 4RQXA 2QSIA 3DVXA 2VL2A 1PA3A 1EV4A 4KH7A 3TJJA 1LU4A 2GZYA 3UEMA 1B9XC 1DUGA 4GSNA 3UJ1A 5E4WA 2P5QA 2HZEA 4JZQA 2P5RA 3TB2A 1K0OA 3KEBA 4K7NA 2V6OA 5COHA 2GVPA 2DLXA 2N5AA 4WXTA 5KN0A 3HJMA 3BJ5A 3GKKA 4IBPA 2VAFA 2X8HA 1SKRB 1B8XA 3MDKA 2F3MA 1YY7A 2OBIA 3O6TA 1OC8A 2CVBA 4GWRA 1U3AA 3GL3A 1S3AA 3J7Yk 1THOA 5G5FA 3GN3A 4K8MA 2FWEA 3IPZA 2PN8A 5ELAA 4ML1A 1USBA 4Q5RA 4PNFA 1R26A 1ERWA 3WYWA 1X0RA 3LG6A 4GSSA 3TJFA 2MYGA 2O7KA 1TRUA 1EGRA 2HLSA 2PU9C 5IMFA 4LL1B 4AJ6A 2I4AA 1Y25A 1PKZA 4BWQA 1QMVA 1GWCA 2AYTA 2CZ2A 2IL3A 2LNSA 1H4OA 2HE3A 4TRXA 3GYKA 4NV2A 1ON4A 1BX9A 3HJPA 5HR1A 1FAAA 4NAXA 1NM3A 1SENA 3I43A 1E6BA 3HHVA 4IELA 4P3YB 3G9BA 1EOGA 2E0QA 4Z7XA 4FYCA 4ILFA 4MJEA 3KH7A 4OO4A 1JZDA 1SL2B 4EE0A 1OVNA 4JR6A 2C3QA 2J9HA 2VL3A 22GSA 2WRTA 3LJRA 1GSFA 4F82A 1O8XA 3LGCA 2F51A 2A4VA 1ERUA 6GSUA 2EIOA 6GSYA 2X8CA 3DVWA 2NTOA 1KNGA 1AQWA 4AF2A 5ECKB 5C04A 3ERGA 1A2LA 1Z6MA 19GSA 3O76A 2HI7A 1T4ZA 3ZTLA 4O32A 3F6FA 5DQSA 2H0IA 3ERWA 3DIEA 1K0CA 1PKWA 4KDYA 1GP1A 4OWYA 2PVQA 4EXJA 4ZBDA 3D4MA 3D6IA 4ECIA 3ISOA 2K8VA 5DJMA 2H1GA 2FNOA 2MMZA 3GKNA 1QFNA 5B8BA 4D73B 5GZZB 2C3NA 4HOJA 5ID2B 2YP6A 4X43A 3BCKA 4MF5A 1KBNA 3GKXA 3GNJA 3VWXA 1HD2A 2LRNA 1ZYQB 2VCQA 5GSSA 5CRWA 5AGYA 4WF5A 3EU4A 5KEJA 5JCUA 4CHSA 2R6KA 4XS4B 1YEXA 2DIYA 5EY6A 4YH2A 2DJ3A 4X1UA 2OKAA 1TU7A 1QK8A 1TTZA 4NMUA 1F37A 4AJ7A 2DSAA 4L5LA 1GNEA 3R2QA 1J9BA 1QGVA 5A4VA 2QC7A 1HNBA 2YZUA 2DBCA 1QUWA 4E8EA 5CAXA 1B4QA 4JRRA 2M46A 4OCFA 5FHIA 4WBJA 1AXDA 3C1RA 3KP8A 3LQ7A 2LJRA 1PX6A 3A2VA 3GV1A 4JR4A 2FA4A 1M2DA 3CRTA 4DSQA 2WS2A 4NV5A 3VWUA 1A2MA 5DAKB 3SBCA 2FWHA 4DVCA 2H1DA 2VCZA 2IPAA 3KZQA 1XOAA 2LSTA 2FGXA 3LXZA 4MCUA 1K0DA 4Q5NA 2HSHA 4YAVA 3GFKA 4IQAA 2CZ3A 1LJRA 1AUCA 3WT2A 4KSOA 3WD6A 3FRCA 3TRPA 1F6MC 1E2YA 2EC4A 4KDUA 2EIQA 3J7Yb 2VO4A 3IK7A 4LA1A 3GSSA 2G2QA 5JWRB 2PGTA 3O3TA 3TKQA 1SYRA 3TGZA 1K0MA 1XPVA 5HQPA 3RBTA 4POLA 4XIHA 5G2ZA 2KUCA 3Q18A 1K0AA 1ERVA 4OMVA 5F06A 4YQMA 2GQLA 3TKRA 3KH9A 3ME7A 5A5KA 1ML6A 4TXVA 7GSSA 2FD3A 4EDYA 3WGXA 5JWOB 3TRQA 4IW9A 5F05A 3GX0A 2OACA 2REMA 2AUVA 2WZ9A 4NHZA 3W8JA 3MSZA 3AY8A 4EL1A 1A8YA 4K1FA 1T3BA 2PWJA 3L9UA 3TKSE 1OKDA 1VF3A 1I9DA 3M1GA 2B1LA 2V6KA 2RLIA 1MDKA 2FUG2 4ECBA 3QPMA 2H73A 2CT6A 3G7IA 2BJXA 1SJ6A 2H0HA 3EWLA 2H74A 5JCGA 3GX8A 2OE0A 5G5EA 2ES7A 2RUEA 3D5JA 2HZEB 2J23A 2LJKA 2B5XA 2KP1A 2B7JA 4AJ8A 4L0UA 1X9WB 1SK1A 1BAYA 1GSSA 3QCPA 3IDVA 4DSSB 1IYIA 2LQQA 2DJ2A 3A2WA 1G7OA 5D73A 1GSDA 4TR1A 2LQOA 3FYGA 1M9BA 2XBQA 3A3TA 3IXRA 4V2NA 1XW5A 3F3RA 1U3IA 4F03A 5IOXA 4G9HA 18GSA 1Z9HA 4WR4A 4BPYA 2YANA 3H8QA 5HR0A 3UARA 4KB3A 2JZRA 2VIMA 1THXA 2H01A 5J9CA 2R37A 4IJ3A 4POMA 1HQOA 1TRWA 3M3MA 2IMEA 1F9MA 2IMDA 3KTLA 2I1UA 3WT1A 3Q19A 1GUHA 3FR3A 2HRNA 1XVQA 3A2XA 1ZZYA 2FY6A 2YWIA 5H5SA 1VRSD 1YF0A 3BBYA 1TXXA 3HVSA 3ZL5A 3DWVA 3PH9A 5CRHA 1QQ2A 4ZBBA 4XS1A 4OO5A 4POBA 17GSA 16GSA 5D9XA 4AGSA 4XRAA 2MMNA 1AW9A 4WETA 2H8LA 3D22A 1M99A 4K6XA 1TJDA 2IMIA 1UVZA 2PERA 4N0VA 5ELGA 4O7HA 4MPGA 3WGDA 3L78A 2H1AA 2IWTA 4DSRA 2F8AA 5DALB 5HR3A 2VM1A 3F4SA 3APOA 5A4UA 1XW9A 3CBUA 4IS0A 4EO3A 3G7JA 4ISDA 2VLVA 4BWSA 1MDJA 2L5LA 3L4NA 3VURA 3IAS2 1SJZA 3M8NA 5G30A 1CQHA 1GUMA 6GSVA 1OYJA 3ZITA 2K8SA 1S3CA 2NBSA 2GGTA 4ZXGA 3IRAA 3CMIA 1O85A 5ECNB 2D2ZA 2GQKA 5H5RA 2I3YA 2VL9A 3BCIA 3EMXA 2GSQA 4BA7A 4DSSA 4ID0A 4IN0A 1EP8A 3U6VA 4IKHA 5HFGA 2VCTA 3TKSA 3H79A 2A2SA 2B5EA 4L5OA 1JZWA 3HY2A 4KSMA 1SKWB 4MK3A 1UC7A 2R3XA 5L71A 4JEDA 1V40A 3UOMA 2VOCA 4F0BA 1VF1A 3QD9A 1A2JA 3QAVA 1X5DA 2HFDA 3IHQA 3HXSA 4PQIA 4ACSA 2VLUA 4KA0A 3IV4A 3PINA 1ACVA 3F4TA 2H75A 2MZCA 3UL3A 3HJOA 2IN3A 5D8IA 1R5AA 1Y6EA 1TP9A 6GSWA 1IYHA 3K8NA 4ZL8A 1RK4A 5IM9A 1X9MB 3TOTA 3F0IA 1FW1A 2OBKA 2PBJA 1ERTA 1N8JA 2TRXA 5HR2A 3UAPA 2YWMA 5IMCA 3IC4A 1FOVA 2MBSA 1WRYA 3F6DA 2O89A 4FH8A 2E7PA 3FZ4A 4TOPA 3FR6A 3ZIJA 1XFLA 4PUFC 3LSZA 2TIRA 1A23A 2H6YA 2O8VB 1R4WA 3H93A 1O7UA 2XHFA 1PL1A 5GAPD 3LFLA 12GSA 2E2GA 1XWGA 2CAIA 3E3EA 4RI6A 1VF2A 2B1KA 3HCZA 5DALA 4I2TA 1PRXA 1JFUA 1K3OA 3G7YA 1BG5A 1WPIA 1A0FA 4CW9A 1ZYEA 1Z7PA 1EZKA 2AHEA 5ECRB 2WULA 3IK9A 5AIVA 4J57E 1TU8A 5IMVA 1FVKA 3MAKA 5ECOB 4POKA 3QFAC 1EV9A 2CX4A 5ECMB 2L6DA 1XIYA 2R5GA 1WP0A 4TVEA 2CV4A 3FZ9A 2X64A 4K2DA 2HSYA 3TJBA 1GTBA 3LXTA 5CRDA 3EYTA 3C7MA 2K18A 4E8HA 2F9SA 4PX1A 4XHMA 2FA8A 1YDKA 1G0TA 1YEPA 3F8UA 1U6TA 3GMFA 1N2AA 3KP9A 4KGIA 3UMAA 2X8GA 5E59A 2GZPA 2C8UA 2YOIA 4GSTA 1EP7A 1XZOA 1O8WA 2IMFA 2O85A 1VGLA 4MABA 3W6GA 5CO3A 5IO2A 4N11A 5JWQB 1NW2A 1W4VA 1Q4JA 1U87A 3DKSA 3LWAA 1B48A 3KCMA 5ECQB 3ZREA 4EVMA 2H6XA 2FWFA 4KCEA 4TXOA 2B3SA 1ZGNA 5D96A 1O81A 20GSA 4HZ4A 4ZL7A 1TK0B 2RIIA 3F63A 4QQ7A 5ENUA 3US3A 3QAWA 1K0BA 1NHOA 1UN2A 5B6NA 1YKCA 4DEJA 1SU9A 1DE2A 4PURA 2YJ7A 3ZMKA 3FZ5A 3GSTA 2LTKA 2WDUA 3KMOA 4H86A 5DQYA 1OC3A 3P90A 1WE0A 4KE3A 1GSQA 4TR1B 3ZVJD 1Z7RA 1A24A 2G0FA 3NOFA 3GRXA 1BYEA 2B5YA 2YJHA 3QAGA 4XTSA 1GTUA 2LUSA 3BD2A 2OE1A 2OE3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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