2W0JA

Crystal structure of chk2 in complex with nsc 109555, a specific inhibitor
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
301
structure length
280
Chain Sequence
SVYPKALRDEYIMSKTLGSGEVKLAFERKTCKKVAIKIISKNVETEIEILKKLNHPCIIKIKNFFDAEDYYIVLELMEGGELFDKVVGNKRLKEATCKLYFYQMLLAVQYLHENGIIHRDLKPENVLLSSQEEDCLIKITDFGHSKILTSLMRTLCGTPTYLAPEVLVSVGTAGYNRAVDCWSLGVILFICLSGYPPFSEHRTQVSLKDQITSGKYNFIPEVWAEVSEKALDLVKKLLVVDPKARFTTEEALRHPWLQDEDMKRKFQDLLSEENETALPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of Checkpoint Kinase 2 in Complex with Nsc 109555, a Potent and Selective Inhibitor
pubmed doi rcsb
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK2
total genus 88
structure length 280
sequence length 301
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2w0jA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2w0jA01
4AUAA 1OMWA 2WXVA 5EDRA 2BRMA 3DXPA 3ENHA 4JIKA 4KS8A 4RJ8A 4U3ZA 3ZU7A 5F4NA 3H10A 5AV1A 3F7ZA 2CNQA 4O86A 3HV7A 5IMEA 3QKKA 3ZRLA 5CI6A 1ZYCA 4BL1A 4H3BA 2PMOX 4G2FA 4F9AA 4XMOA 5AUTA 2Z7SA 2O8YA 4LMNA 4BKJA 2CKOA 3R8MA 1UNHA 3E8EA 3EQRA 2Y6MA 3DFAA 3I60A 4XV1A 2WTCA 1B39A 2FSMX 3TL8A 3DJ6A 2PVLA 3NUPA 5CTPA 1IA8A 3ROYA 2XYNA 4H58A 3ZLWA 1LEZA 4KUJA 1HCLA 1OIYA 3K2LA 2GSFA 5D1JA 1J1BA 4YJNA 1OBGA 4NK9A 2O5KA 4IB3A 1UA2A 3EZVA 3UOHA 5M08A 2O0UA 2CSNA 3C4CA 5BMMA 2UZBA 3O2MA 4C37A 3UNZA 4JAJA 3UG2A 3WE4A 5C26A 4FC0A 1O6LA 1Q3DA 1CKPA 2VTMA 4FKLA 4I6FA 5D9HA 4AXAA 4FZAB 4LRJA 5E9EA 4W8DA 4XP2A 1BL7A 4MXXA 3ELJA 4U6RA 2IW8A 5CX9A 3ZS5A 4BIDA 1WBVA 3Q6WA 4E7WA 3L9PA 3R8ZA 3HMIA 4FEXA 1VR2A 4FOCA 3VULA 3G33A 1BLXA 3F5XA 5GZAA 3GFEA 4UMUA 3PJ8A 2IVTA 3ZSIA 4FKRA 1Q8UA 1TKIA 3VUGA 4GT5A 4FKOA 4QO9A 2A19B 2E9OA 1W7HA 3QHWA 4JX7A 2VTPA 3BRBA 3QGYA 3JVRA 2OJFE 4RGJA 4GSBA 1CKJA 4JRNA 4KRCA 5D7VA 3NW5A 4CFUA 4ZK5A 4RPVA 5AR8A 3DBCA 5E7RA 3ATSA 4GV1A 1LUFA 3LQ5A 4BDDA 4JG6A 1IAHA 3BHYA 4N0SA 5AR7A 5AMNA 5FDXA 3DQWA 3GCQA 4G5JA 2X8EA 1ZYSA 2J2IB 1WBOA 2FH9A 3ZXZA 3A7JA 3IGOA 3W2RA 5JZNA 5IQHA 3QXPA 3RHKA 2JIVA 4JX3A 5JSMA 3KQ7A 3DJ5A 3UP2A 4L01A 3V5LA 5CASA 3UC3A 3FL4A 3MIAA 2XJ1A 4L68A 4M3QA 2OU7A 4C3FA 4ACDA 3CJGA 2VTIA 4LOPA 3SHEA 5IA4A 3HGKA 4EQUA 3UVPA 3EFKA 2Y4IB 3LMIA 2WB8A 3AQVA 2XIZA 2CGUA 3OHTA 4ANNA 1ZRZA 4L53A 3ORIA 3SG9A 4NFNA 5TR6A 3WZJA 4FTOA 3FJQE 5GJDA 2YIRA 5I5ZA 4R3PA 4UWYA 2ZMDA 4UBAA 2JAMA 2VX1A 4DLIA 1ZY4A 3TDVA 1DAYA 4RX9A 1ATPE 3OCSA 4W4VA 2XRWA 4IVBA 4XUFA 3W8QA 5HX6A 4BY9E 2OO8X 2PMIA 3TT0A 3EN6A 4EOJA 2Z02A 3FC1X 2GTNA 3OROA 3UYTA 3ALNA 3OC1A 3OUNB 4K77A 2PMLX 1OKVA 2QOLA 5AP1A 2O3PA 4KSQA 4WNKA 5HESA 2BRHA 2YM8A 5CEIA 3MJ2A 2GS6A 4OTPA 2QOFA 1ZMWA 5L2IA 2WELA 2YCQA 3DAEA 4F0FA 5HZNA 3BQRA 2OICA 2WTKB 4RFMA 5HHWA 3NYOA 4BCQA 1JWHA 4IX4A 2ITVA 3OOGA 4O2ZA 5BVKA 4OTIA 4RIXB 1M2QA 1ZXEA 1F0QA 4O21A 4FK3A 4CNHA 1ZAOA 4BWXA 4ZMFA 5EHLA 2WTDA 3ERKA 3GC8A 3LCSA 3VW6A 4HVHA 1PMUA 3FQHA 1YXSA 4CKJA 4X3FB 3GNIB 3GU6A 2BRNA 2QD9A 2FVDA 3D5UA 3RZBA 1JKLA 4YTIA 3T9TA 5ICPA 2OXDA 4C34A 2Q83A 4XG6A 3VIDA 1Z9XA 2Y6OA 4P2KA 3NVKI 1RDQE 3PA4A 2JBPA 4CT2A 4NL0A 4RX7A 5DG5A 2GDOA 3D7ZA 2NPQA 2YFXA 2CJMA 5J95A 4QMNA 4IZYA 2I40A 4AZVA 4R1YA 3MIYA 4IANA 4F6SA 4NU1A 5ACKA 1H24A 4GFGA 3O7LD 4XRJA 5IKWA 5CAUA 2ERZE 2HAKA 2EXMA 3E5AA 3IO7A 4IZ7A 4I5PA 5FBNC 1L3RE 3DK6A 2V22A 3RKBA 3HYHA 4DGGA 4ANQA 3LMHA 5IU2A 5KHXA 2C4GA 3ORLA 4U5JA 1QPJA 4U44A 4F1MA 3GCUA 3CP9A 2ITOA 4IC7A 5H8GA 4WIHA 3IDPA 5H8BA 2ZB0A 2BAQA 2VWVA 4QP2A 2X4ZA 4BDHA 1ZMUA 3ATTA 3FZ1A 5CSPA 5DE2A 1SNUA 2YCSA 3CEKA 3PXQA 3KC3A 4EL9A 4NM0A 1H01A 1SM2A 5KCVA 4KIPA 1P4OA 3W55A 2B4SB 1YI4A 4YZMA 5AAEA 2OIBA 5CT7A 1M2RA 3JR1A 3ZUUA 3BHUA 1LP4A 3C7QA 1QPDA 2WTKC 4BTMA 4EK5A 5E91A 5HBHA 4F1OA 5L6WL 5DYJA 5A46A 2CCHA 1JSTA 1FPUA 2FSTX 4PPBA 4MAOA 2O65A 2HY0A 1PYEA 3UO5A 3ULZA 3KXHA 5DT3A 3CQWA 4ZSAA 5IQCA 3RWQA 3IW6A 4ACCA 3Q9WA 4X3FC 1NY3A 3FQSA 1CKIA 5GNKA 3SQQA 3TTJA 5JKGA 4F4PA 1OI9A 2R3KA 4G3EA 2UW4A 4JVGA 3DKFA 4TWCA 1IRKA 3Q96A 3U54A 5EH0A 3UOJA 5AJQA 4PQNA 2O64A 5LVMA 3Q5IA 2BIKB 4FZFB 3C4EA 2BFXA 4MXYA 4U43A 4R8QA 5CQWA 5EI2A 4UYAA 5CVGA 3CY2A 3IW7A 3LJ2A 1J91A 5AUVA 4XH6A 3WF9A 2WFYA 4QTCA 5D7AA 3MA3A 2PVNA 4AN2A 3A7IA 2XZSA 4M8TA 5EM8A 1WBTA 3BLRA 4I41A 4X2JA 5G6VA 1AD5A 2R3QA 3FMMA 2VO0A 4PNIA 2VTNA 2XRUA 2OI4X 2WU6A 3CLYA 4PX6A 3A61A 3FHRA 1KOAA 5GHVA 1G8AA 4J96A 3PE2A 3QTZA 4FTTA 1RE8A 3AD5A 4FG8A 4FT5A 4GJ2A 2IN6A 3GC0A 3DTCA 4AACA 1Y8YA 2RL5A 4AGDA 5B7VA 5JGBA 3ZBXA 2PUUA 3K54A 2G1TA 4V0GA 3BV3A 4IZ5A 2GQGA 1V0PA 5L2SA 3F2AA 2C30A 3AC4A 5GZ8A 2PU8A 3QRJA 3TV4A 4QP4A 5AR3A 3BCEA 1SNXA 4IAZA 5DI1A 3OTUA 4JIAA 4Y85A 4J8MA 5CANA 5J7BA 3SVVA 2CKQA 1P5EA 2QONA 4FV5A 3Q3BA 3A4PA 4WNMA 5DA3A 4Q5HA 5FXSA 3EHAA 4HPTE 2R3PA 4J8NA 3G9LX 4IWDA 3KK9A 5CVFA 2I1MA 4O1OA 4JJRA 3FMKA 2QURA 3AMAA 3EFLA 3EQPA 5AUZA 2F9GA 3N4VA 4IWPA 4O27B 2UW7A 4F08A 4AGWA 1TQMA 2XIXA 3EYGA 3PA3A 4LUDA 2UW3A 2BKZA 3POOA 4BCMA 2BFYA 3PUPA 4IXPA 4EBWA 3H4JA 5CZIA 4EH7A 2UZEA 1YWVA 4E8AA 4DTBA 2EB2A 3FZPA 3Q04A 4Y46A 5E92A 2W5HA 3GVUA 1R39A 4EOLA 4BFMA 4BF2A 5LMKC 2OJ9A 2UZOA 3MPTA 4ASZA 4M0ZA 3UC4A 2JFLA 2RIOA 2X6DA 3FMLA 4DEAA 3C13A 5J9YA 4O7LA 4RA4A 4YPSA 1YDSE 1QL6A 3V5WA 1E9HA 1M7QA 2PZIA 3DKCA 4XJ0A 3FMEA 3I7CA 4IVDA 4YSMA 4YP8A 3UIBA 3ZCLA 2NRYA 5J8IA 2WNTA 4I3ZA 2H96A 4V01A 3MTLA 3EL7A 1M52A 5AA8A 4FZ6A 2JKOA 5EQPA 1YHWA 4O7TA 3MA6A 5CXHA 5HD7A 3DDQA 3E87A 1AQ1A 1O9UA 4MK0A 4KIKB 5EG3A 4G3FA 2NO3A 4MH7A 4G3CA 1DM2A 2ETKA 1Z5MA 2WTWA 3LFCA 4FTIA 3RAIA 3MESA 3BPRA 5HVKA 3BQCA 4ZY4A 4YNOA 3QX4A 2OBJA 3D7TA 3R2BA 3KULA 3NIZA 4NWMA 4BI2A 3VS7A 4YUQA 4E5BA 5EQYA 3UOKA 4RIWA 5KZ0A 2YCRA 3LJ0A 3KVXA 3MY0A 4QP1A 1CMKE 4DFUA 3D14A 4BI1A 1CSNA 3COHA 4M0YA 3W32A 3ZLXA 1Q61A 5IA5A 4BCJA 2P2IA 2R3RA 4WRGA 3KGAA 4XX9A 4RG0A 3RCJA 5AP2A 1A9UA 4G6OA 1ZARA 1OBDA 1FGKA 3AD4A 3M1SA 4ZOGA 4S30A 4BC6A 3QX2A 4IB0A 2BROA 4A06A 3BX5A 5IQAA 2QKWB 4V04A 2WMXA 3V5TA 2OG8A 4JR3A 2GU8A 5AP3A 3CQEA 4JBPA 4PDOA 4FE2A 4IW0A 1Q24A 5C01A 3C4ZA 3SA0A 2XNBA 2EXCX 3T8OA 2AC3A 3SW7A 3PJCA 4ZS4A 4MD9E 3EIDA 4HCTA 4TL0A 2W1HA 3OW3A 1FVRA 4FT9A 1U5QA 5ETCA 4C4GA 2VWZA 4DC2A 3OOMA 1U46A 3MDYA 3RCDA 1PXNA 2PY3A 4JQ8A 3NW6A 4CTBA 3GXLA 2YWPA 5E90A 1OITA 2GNLA 4I93A 3KVWA 3QXOA 4UEUA 4LFIA 5M4CA 3H3CA 3FI4A 2GS2A 3CD3A 2PVRA 3VQUA 3MV5A 2WIPA 3ZEPA 4DA5A 3DY7A 2G9XA 4FTUA 5ANKA 3C1XA 3PPKA 4WT6A 5E8UA 4E4NA 1OL5A 3D0EA 3RK5A 4EK8A 3U9CA 4ZP5A 2VTOA 4H1MA 5HCXA 4U79A 1RJBA 2J51A 3QKLA 2R3FA 4OTHA 2YJSA 4DCEA 5J87A 5CEKA 4QMOA 1DI8A 4PY1A 1BI8A 5IUGA 5BMSA 5HI2A 2XK7A 2VO6A 5HG9A 3ORKA 4EORA 2HIWA 2ZVAA 1PMNA 3QQLA 3RM7A 2AYPA 4R3CA 5BVEA 2CLXA 5T6KA 4FV3A 5A6NA 3Q4ZA 4CLJA 4WUNA 2CN5A 4USEA 3CTQA 5F1ZA 2HW7A 4L7SA 3PP0A 3HMNA 3DB6A 2WMSA 4QOXA 1XH8A 4C3RA 4KAOA 4LGHA 4PL4A 2DYLA 4GYIA 4BCPA 4DEGA 4HGLA 3NUUA 2A27A 5FP5A 1XBCA 3LXLA 4NYEA 1GZOA 3VS5A 4EONA 4RX5A 4MQ1A 1ZYDA 1YW2A 2ESMA 3D94A 3U8WA 3N4UA 3HVCA 4MD8E 4XV3A 4ZJJA 5AV0A 4AOTA 4PV0A 5DHJA 4FTCA 4N6ZA 3TM0A 4BTJA 3G6GA 3CKWA 2YIWA 2F7XE 3GB2A 3OWLA 3ZFMA 4F99A 2H34A 4E6AA 5LWMA 3NYNA 3AC1A 3H9FA 5TE0A 2RGPA 3NIEA 3ORTA 3QZHA 4WUAA 5FP6A 1WFCA 1FBNA 1A06A 3FLYA 3QCXA 5JZJA 2IG7A 4I22A 3EH9A 5ANGA 5HVYA 1PMEA 4HYIA 3RALA 4AZEA 1H1WA 1AGWA 2BZIB 3ZRMA 3UQCA 4PMPA 5ANJA 3UJGA 4FIGA 3SAYA 3GCVA 3PSCA 4YJQA 3ORPA 2X0GA 4K1BA 3B2TA 4UWCA 2QOBA 4CFNA 3HRBA 4ZEGA 4FV7A 3E93A 4ANLA 3FE3A 4AX8A 4BYIA 2CGXA 3QL8A 3ROCA 2VWIA 2XNGA 1M7NA 1ZWSA 4RRVA 5AUYA 5FLFA 1JKTA 2WQEA 3L8XA 4DBXA 4X3JA 4RJ6A 1XJDA 1MRVA 1F3MC 3EN5A 3HV6A 3NX8A 3QQGA 5JH6A 2G2HA 2XF0A 2YLFA 3AT4A 4IVAA 2OW3A 5AADA 2OZOA 3LAUA 3KU2A 3QCSA 4EH5A 4LOOA 2UZDA 3LCKA 4W9WA 3R1YA 5HD4A 3W18A 2BRGA 4QPMA 1GIHA 2Z8CA 3DBQA 2VTJA 3EZRA 4FEVA 3C50A 4I5CA 2VNYA 3GC7A 3WIGA 2WPAA 4MF0A 2RFEA 4CYJA 4EWQA 2ITUA 1KE6A 4I21A 4FGRA 5FGKA 3V3VA 2IO6A 3W2QA 4D0XA 2XCHA 3E7VA 4L6QA 3LXPA 5AFVA 4DN5A 5CVHA 2UW9A 2XBAA 4DTKA 4KA3A 5CENA 3D5XA 4UALA 2I0EA 4RIOA 3A4OX 2JKKA 4HCVA 4OTRA 1F5QA 2WMBA 4Q2AA 4DH7A 4DEIA 4OTFA 1H27A 2XKCA 2QG5A 3P0MA 4MNEA 5HO7A 4RFYA 4R7IA 3C5IA 3GC9A 5H2UA 3PVWA 1SMHA 3NDMA 3HMOA 3O17A 3R01A 3CC6A 3L8PA 4YJSA 5CSWA 3EYHA 3VS0A 1PXKA 4L3PA 4BCFA 5I9WA 3OBGA 4QMPA 4X2NA 3W33A 3CE3A 3HDMA 1BUHA 3PY1A 4QTBA 2HXQA 5BVWA 4YTHA 2YIXA 4QT1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4AUA A;  1OMW A;  2WXV A;  5EDR A;  2BRM A;  3DXP A;  3ENH A;  4JIK A;  4KS8 A;  4RJ8 A;  4U3Z A;  3ZU7 A;  5F4N A;  3H10 A;  5AV1 A;  3F7Z A;  2CNQ A;  4O86 A;  3HV7 A;  5IME A;  3QKK A;  3ZRL A;  5CI6 A;  1ZYC A;  4BL1 A;  4H3B A;  3W0P A;  2PMO X;  4G2F A;  4F9A A;  4XMO A;  5AUT A;  2AQX A;  2Z7S A;  2O8Y A;  4LMN A;  4BKJ A;  2CKO A;  3R8M A;  1UNH A;  3E8E A;  3EQR A;  2Y6M A;  3DFA A;  3I60 A;  4O4C A;  2WTC A;  1B39 A;  4XV1 A;  2FSM X;  3TL8 A;  3DJ6 A;  2PVL A;  3NUP A;  5CTP A;  1IA8 A;  3ROY A;  2XYN A;  4H58 A;  3ZLW A;  1LEZ A;  4KUJ A;  1HCL A;  1OIY A;  3K2L A;  2GSF A;  5D1J A;  1J1B A;  4YJN A;  1OBG A;  4NK9 A;  2O5K A;  4IB3 A;  1UA2 A;  3EZV A;  3UOH A;  5M08 A;  2O0U A;  2CSN A;  3C4C A;  5BMM A;  2UZB A;  3O2M A;  4C37 A;  3UNZ A;  4JAJ A;  3UG2 A;  3WE4 A;  5C26 A;  4FC0 A;  1O6L A;  1Q3D A;  1CKP A;  2VTM A;  4FKL A;  4I6F A;  5D9H A;  4AXA A;  4FZA B;  4LRJ A;  5E9E A;  4W8D A;  4XP2 A;  1BL7 A;  4MXX A;  3ELJ A;  4U6R A;  2IW8 A;  5CX9 A;  3ZS5 A;  4BID A;  1WBV A; 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