The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
|
sequence length |
58
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structure length |
58
|
Chain Sequence |
GPTYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGACHGQTGMFPRNYVTAVN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Distinct Binding Modes of Two Epitopes in Gab2 that Interact with the Sh3C Domain of Grb2.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
GROWTH FACTOR RECEPTOR-BOUND PROTEIN 2
|
| total genus |
13
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| structure length |
58
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| sequence length |
58
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-10-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1JU5 C; 1S1N A; 3PVL A; 2RNA A; 2EGC A; 2RF0 A; 4J9C A; 2MOX A; 2JM9 A; 3ZL7 C; 2JXB A; 3H0I A; 4Z8A A; 2L3Q A; 1X27 A; 4OMQ A; 1SHG A; 3I5S A; 3O5Z A; 1AWX A; 4LUD A; 2HCK A; 2CT4 A; 1RLQ C; 4DEX A; 1UFF A; 4J9F A; 4JJB A; 3UA7 A; 4RTW A; 1UGV A; 1MV0 B; 1SPK A; 1AOJ A; 3RNJ A; 1XOV A; 1B3Q A; 4RTX A; 2EKH A; 2A36 A; 1I1J A; 1UHC A; 3VRY A; 2DL5 A; 3VRZ A; 1H3H A; 2C0I A; 2X3W D; 3EHR A; 3PE0 A; 1G83 A; 2RQV A; 4K11 A; 4M4Z A; 5FW9 A; 1WDX A; 5FWB A; 1BK2 A; 2FRW A; 1ZX6 A; 2O2O A; 2CUB A; 1W6X A; 3M0R A; 1VYV A; 2A28 A; 2IIM A; 1WIE A; 2CRE A; 2EYW A; 2GTO A; 1JEG A; 1YWP A; 2DE0 X; 2P4R A; 2K9G A; 5GJW B; 2CT3 A; 4HVW A; 2DL7 A; 2RQU A; 2RPN A; 3C0C A; 1NLP C; 2KXD A; 3ULR B; 1E6H A; 2H8H A; 3I5R A; 3EG3 A; 2DBM A; 5IH2 A; 2JS2 A; 2EYZ A; 2VKN A; 1ZLM A; 1IO6 A; 2AZS A; 1BBZ A; 5EC7 A; 2J05 A; 3EG2 A; 2LNH B; 4HCK A; 2AZV A; 1H8K A; 3QWY A; 2VWF A; 1PRM C; 1UG1 A; 2NWM A; 3NGP A; 1U06 A; 1ZUU A; 2QDL A; 4LE9 A; 3M0U A; 3TSZ A; 4RUG A; 2RQW A; 1WI7 A; 4AG1 C; 4OMO A; 1E7O A; 2MCN A; 1UTI A; 1PWT A; 4E6R A; 3VS4 A; 1T3S A; 1A0N B; 5FWC A; 1K0X A; 2DRM A; 1N5Z A; 2DBK A; 2JW4 A; 1T3L A; 4EIK A; 1U5S A; 2W10 A; 1SRM A; 1FMK A; 2AKL A; 2BTT A; 2FPF A; 1X43 A; 4JJD A; 1OPL A; 1ABQ A; 1QKX A; 1VYU A; 4CC7 A; 1YN8 A; 4GBQ A; 4JPB W; 1UJ0 A; 1AZE A; 2FO0 A; 3VS1 A; 1WA7 A; 2CUD A; 2EVR A; 2SEM A; 2LJ1 A; 2DNU A; 4OML A; 1UE9 A; 1GCQ C; 4J9I A; 2A08 A; 2L2P A; 2J06 A; 1RLP C; 2FG0 A; 2PNI A; 2DVJ A; 2DM1 A; 1I0C A; 5IXB A; 2NUZ A; 1WXB A; 2DYB A; 1NYG A; 2EGE A; 1UUE A; 2GQI A; 3NPF A; 4JJC A; 1NEB A; 2C0O A; 1PKT A; 3NHN A; 3CQT A; 3UAT A; 4D8D A; 3I35 A; 2DX1 A; 4J9G A; 1SEM A; 1SHF A; 2CSI A; 2KGT A; 3EHQ A; 1X69 A; 1W70 A; 2D0N A; 4D8K A; 1H92 A; 1JXM A; 1SRL A; 4RTT A; 3H0H A; 3JV3 A; 2KRO A; 1Y57 A; 2RQT A; 4Y92 A; 1K4U S; 4ORZ A; 2RMO A; 1HSQ A; 2CSQ A; 2EGA A; 2K2M A; 2FRY A; 2F2X A; 1VA7 A; 3SEM A; 4R0K A; 4OMN A; 2M51 A; 1V1C A; 2M0Y A; 2B86 A; 2V1Q A; 3REB B; 4OMM A; 1PHT A; 2GTJ A; 2AK5 A; 3M0Q A; 3U23 A; 1ZUY A; 2ABL A; 2E5K A; 3UF4 A; 1QWE A; 4AG2 C; 2CH4 W; 2KYB A; 1AZG B; 4AFU C; 2JS0 A; 1WLP B; 2GGR A; 2RQR A; 2YT6 A; 2LP5 A; 2RN8 A; 1BB9 A; 2YSQ A; 2YUP A; 1X6B A; 1T0H A; 1WXT A; 2J6F A; 2DL3 A; 2YUN A; 3M0T A; 3TVT A; 1CSK A; 1TUC A; 1Y0M A; 3PVQ A; 2G6F X; 1QWF A; 2LX7 A; 1TUD A; 3VS2 A; 1AWW A; 2AKK A; 3EG0 A; 2HSP A; 1GFD A; 3KFV A; 2DIL A; 4DEY A; 2ECZ A; 3LH5 A; 3H0F A; 1GRI A; 5I22 A; 1UJY A; 5L23 A; 1X2K A; 1ABO A; 1CKA A; 2ROT A; 1X2Q A; 1GCQ A; 1FYN A; 1OEB A; 1MUZ A; 1SSH A; 2F2V A; 2FPD A; 4J9B A; 1YNZ A; 3RBB B; 1J3T A; 1M8M A; 1OPK A; 4Z89 A; 4J9H A; 2LJ3 A; 4RTY A; 1AWJ A; 2KXC A; 2O9S A; 1K1Z A; 1QLY A; 5IHI A; 4GLM A; 3GBQ A; 3VS0 A; 1WFW A; 1NM7 A; 2GBQ A; 1Z9Z A; 2L3S A; 2LMJ A; 1AVZ C; 5ECA A; 1LCK A; 4F14 A; 4QT7 A; 3M0P A; 1UHF A; 1PKS A; 1UDL A; 1ZSG A; 2L0A A; 2DJQ A; 2EW3 A; 1CKB A; 1M3B A; 4JZ3 A; 1WYX A; 2J6O A; 2FEI A; 1BU1 A; 2JMA A; 2C0T A; 2DL8 A; 2KE9 A; 4IIM A; 4JZ4 A; 2O31 A; 4J9D A; 2KT1 A; 3VS5 A; 2D8H A; 2J7I A; 1NG2 A; 2XMF A; 4CC3 A; 4LN2 A; 2LQN A; 2FPE A; 4AFQ C; 2ESW A; 2HBW A; 2K3B A; 1QCF A; 1I07 A; 2BZ8 A; 1K0S A; 2DRK A; 4HVU A; 2EQI A; 4HVV A; 1ARK A; 2KR3 A; 2JT4 A; 2BZY A; 2JMC A; 1Z9Q A; 5GJV B; 2LQW A; 2JM8 A; 3R6N A; 2LZ6 B; 2X3X D; 2J6K A; 1M3A A; 4RTZ A; 3VS6 A; 1VYT A; 1KJW A; 4HXJ A; 3EGU A; 2KEA A; 2KYM A; 2YUO A; 2PTK A; 1WX6 A; 1K76 A; 1OV3 A; 5I11 A; 4J9E A; 2HEQ A; 4WCI A; 4F17 A; 1NLO C; 2L3P A; 2A37 A; 2O9V A; 4AFZ C; 3QWX X; 1MV3 A; 4A63 B; 2K6D A; 2DLP A; 2ED0 A; 3TSW A; 1EFN A; 2O88 A; 3FJ5 A; 2HDA A; 3VS3 A; 1YCS B; 1M27 C; 1KIK A; 1GBQ A; 4LNP A; 1OOT A; 1JQQ A; 3SHW A; 2KT8 A; 4LUE A; 2EBP A; 3THK A; 2EYX A; 4AFS C; 4RTV A; 1PRL C; 2DL4 A; 2K79 A; 1M30 A; 2YDL A; 4Z88 A; 2YUQ A; 1GL5 A; 2W0Z A; 3NMZ C; 2ROL A; 5IHN A; 3EG1 A; 1E6G A; 3REA B; 1NEG A; 5IXF A; 1GFC A; 2CH4 A; 1NYF A; 2ED1 A; 2PZ1 A; 2KRS A; 2I0N A; 2KRN A; 1M3C A; 2JTE A; 1WXU A; 4FSS A; 1B07 A; 2LJ0 A; 1KFZ A; 2EYY A; 4ZNX A; 2DA9 A; 3H41 A; 2SRC A; 4RTU A; 1AWO A; 1UEC A; 1YP5 A; 2KNB B; 2V1R A; 2GNC A; 3A98 A; 2MIO A; 1JO8 A; 1RUW A; 1YWO A; 1AEY A; 3I9Q A; 1W1F A; 2OI3 A; 3IQL A; 2K7A A; 5IHK A; 2DMO A; 1KSW A; 2DF6 A; 2VVK A; 4CC4 B; 1GBR A; 3VS7 A; 4CC2 A; 1T0J A; 3M0S A; 1U3O A; 2D1X A; 2D8J A; 1RI9 A; 2F2W A; 4IIO A; 1HD3 A; 4ESR A; 4OMP A; 5HCK A; 2BZX A; 2OAW A; 4X1V A; 1G2B A; 1PNJ A; 1QKW A; 1X6G A; 1HJD A; 2EPD A; 1AD5 A; 2KRM A; 1K9A A; 1JXO A; 2ENM A; 1TG0 A; 1GCP A; 1ZBJ A; 4F16 A; 1ZUK A; 4KRT A; 3UA6 A; 2LCS A; 2KBT A; 2OJ2 A; 2CDT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1JU5 C; 3A8M B; 3M9Q A; 2EGC A; 2K5I A; 4BUG A; 4J9C A; 2OTJ T; 2YRC A; 2COZ A; 2YRD A; 3MEW A; 5LJ3 j; 4F7U G; 3H0I A; 2EFI A; 1X27 A; 4C8Q G; 3G4S T; 3I5S A; 1YFN A; 4AT1 B; 4HCB A; 3E1S A; 1PD0 A; 4PFO A; 1NPR A; 3A5Z B; 4RTW A; 2DZC A; 1UGV A; 2V8I A; 3OYH A; 2QEX T; 3BDU A; 3VUZ A; 2CYZ B; 5GAN f; 1AOJ A; 1K73 C; 5IT9 E; 4RTX A; 2EKH A; 2MMP A; 3V7C A; 1UHC A; 3VRY A; 3CCV Q; 4OB3 B; 3EHR A; 3QYG B; 1LJO A; 5FW9 A; 2O2O A; 2CUB A; 1B34 A; 1NBE B; 3MEU A; 1X75 C; 3QYH B; 2EYQ A; 4M78 C; 1YJN T; 2EYW A; 5CKE A; 3VUB A; 4OGE A; 2M9U A; 5GJW B; 2JZ2 A; 3CCE Q; 2RQU A; 2RPN A; 2KXD A; 2H8H A; 3LLR A; 2H3J A; 3H9N A; 2JS2 A; 2VKN A; 1BIA A; 3ZBD A; 1YI2 A; 1IHV A; 2P0K A; 5EC7 A; 3EG2 A; 2XDD A; 1VQO T; 4M77 C; 2LNH B; 4C92 B; 3VKI A; 3BFM A; 1YBY A; 2VWF A; 3CXC S; 5LJ3 g; 1PRM C; 1UG1 A; 2O4X A; 3P8H A; 4EMK C; 1U06 A; 3RER A; 1WJQ A; 3HSB A; 3D7S B; 4X34 A; 4AG1 C; 1KD1 R; 4OMO A; 4FYW B; 3OYI A; 1PWT A; 2RO0 A; 1PCX A; 1WHG A; 1A0N B; 4NS5 A; 1K0X A; 2DBK A; 1K9M R; 1KQ2 A; 1T3L A; 2E3I A; 3C95 A; 4LDX A; 4EIK A; 4B9W A; 1VQN T; 3OYL A; 4JUV A; 1SRM A; 2Y4X A; 2MI6 A; 2V26 A; 2EJF A; 4J7I A; 1EZZ B; 4JJD A; 1M2V B; 3DKM A; 2GFU A; 1ABQ A; 3CCR A; 5EG2 A; 4BE1 A; 1WA7 A; 2FZG B; 1M90 U; 2HQH A; 1WHL A; 3PGG A; 2L8D A; 4ZTF A; 1OYX A; 1ZSZ A; 2J06 A; 3CME T; 3CCV A; 2R57 A; 4LD9 K; 1RLP C; 1JJ2 P; 1IRE B; 2NUZ A; 2WAC A; 3V8J A; 4FYY B; 1QCO A; 5GAN 3; 1PKT A; 3JB9 D; 3UAT A; 2DX1 A; 2VGN A; 1SEM A; 1SHF A; 3FRN A; 2QQA A; 2KGT A; 4FM4 B; 2QA4 Q; 5FU6 C; 4BDZ A; 3V8L A; 5CKF A; 4C0G A; 1JXM A; 3CCE A; 1WHJ A; 3SWN A; 1IGQ A; 1ZHI A; 2RJE A; 3JCM h; 1MMD A; 2EJG A; 1Y57 A; 3ZFJ A; 3JCM J; 3G4S Q; 5CKD A; 2FRY A; 2F2X A; 5I2S A; 1ZA2 B; 4DBF A; 1VQ7 A; 4OMN A; 2M51 A; 2RK1 A; 2B86 A; 3CCJ A; 3REB B; 4Z02 A; 2GTJ A; 2AK5 A; 2F69 A; 2VV5 A; 5KYW A; 2H3E B; 2M16 A; 3CCQ A; 3CC4 Q; 2E5K A; 1TS9 A; 4OB2 B; 6AT1 B; 4RG2 A; 2RQR A; 2RN8 A; 1H3Z A; 1RI0 A; 2DJZ A; 1YJN Q; 2YUP A; 4E7I A; 1SG5 A; 3NTK A; 2J6F A; 2HSE B; 2YUN A; 4M78 D; 2QAZ A; 1VQ5 A; 3TVT A; 3SD4 A; 4M7D A; 1CSK A; 1UGS B; 1TUC A; 2ATC B; 3RKY A; 2CP5 A; 1QWF A; 3C4S A; 2DK3 A; 4PJO F; 2AKK A; 4KUL A; 4DEY A; 2PU9 B; 4FYV B; 2ECZ A; 3LH5 A; 2QI2 A; 1GRI A; 5HY6 A; 1VQO Q; 5L23 A; 3JB9 H; 4FW2 A; 1PM3 A; 1X2Q A; 4M77 D; 2E4H A; 1RAF B; 3BDL A; 4M7A E; 4KGZ B; 3MHX A; 1OPK A; 1TU0 B; 2LJ3 A; 3UT1 A; 1AWJ A; 3S6W A; 2QA4 A; 5IHI A; 1VUB A; 4M7A G; 1VQP A; 3VS0 A; 4M75 C; 4E7J A; 1Z9Z A; 2LCL A; 2RHU A; 2LMJ A; 1SSF A; 2GCX A; 4F7U A; 3CMA A; 3GIB A; 5C0M A; 1PKS A; 2WSE E; 1ZSG A; 4PJN A; 2L0A A; 2DJQ A; 2EW3 A; 5KH6 A; 5CK9 A; 1CKB A; 3RKX A; 4C8Q A; 1M3B A; 1IRX A; 2HAX A; 2J6O A; 3G71 A; 4J6W A; 2FEI A; 2KVQ G; 2PVO B; 2C0T A; 3QHS A; 2KMT A; 3CCS T; 3VS5 A; 3RR6 A; 3OW2 P; 5J3B A; 4ZGE B; 4L5G A; 5GMK l; 2XMF A; 4PLL A; 3CME Q; 3CC4 A; 1G3S A; 3E2U A; 2ESW A; 1WQW A; 2HBW A; 1K0S A; 3R6O A; 1Q82 C; 1K8A C; 2YWW A; 4E7S A; 1WGS A; 2JM8 A; 3MEV A; 2X3X D; 4DA4 A; 1VYT A; 1KJW A; 1QP2 A; 4HXJ A; 2HD0 A; 1K76 A; 3JCM b; 1YJW T; 3AHU A; 2LQ8 A; 3BE3 A; 4XQ3 A; 1VQ6 T; 2L3P A; 2K57 A; 2O9V A; 2X9H A; 3QWX X; 2M1H A; 4A63 B; 1RAC B; 3PFS A; 3GP8 A; 2ED0 A; 3C12 A; 1EFN A; 1I81 A; 3ME9 A; 4HT8 A; 4RCC A; 1BIB A; 1QVG A; 4KGV B; 1OOT A; 2LC4 A; 4LDV A; 2KT8 A; 3THK A; 5HK0 A; 4RTV A; 1PRL C; 5CO7 A; 2K79 A; 4IUT A; 5FU7 C; 5GAN 5; 3NMZ C; 1D09 B; 2ROL A; 3I55 A; 3BW1 A; 4M77 B; 3REA B; 1NEG A; 3MO8 A; 3HFO A; 2IVW A; 5CR2 A; 2CH4 A; 2KRS A; 2I0N A; 2XID A; 2E3H A; 3OS1 A; 5GAN d; 2DTH A; 2LDM A; 2LJ0 A; 2P4T A; 2DA9 A; 3X20 B; 1AWO A; 3S3O A; 3V7R A; 4N0A C; 3A98 A; 2MIO A; 3CEY A; 1YWO A; 3OMC A; 1B7T A; 1M1K R; 4FSX A; 3CPW A; 1BI3 A; 2DO3 A; 1G3T A; 2K7A A; 2DMO A; 1KSW A; 1WQ7 A; 3QII A; 2VVK A; 4NL3 A; 5LJ3 e; 2JVV A; 1YJ9 Q; 1Y07 A; 4WF2 A; 3EFO B; 3EGD A; 2D1X A; 5A0G A; 2F2W A; 4IIO A; 2X4J A; 1YI2 T; 1WHK A; 4D6W A; 2OAW A; 3OQ5 A; 4X1V A; 1U1S A; 1BCO A; 2LRQ A; 1VQ4 A; 1KC8 C; 1Q7Y R; 1YCY A; 5GMK i; 5GAN 6; 4XTX A; 2E1H A; 1ZBJ A; 4M75 D; 4KRT A; 3I56 Q; 2XU8 A; 2MWO A; 2LNV A; 5CKB A; 4ZN3 A; 2RF0 A; 1WHH A; 2JN0 A; 3PIO A; 1O9S A; 2RA2 A; 5KYY B; 4WTO B; 3FDR A; 1LVK A; 1NJI R; 2L3Q A; 2DER A; 1GXI E; 4OMQ A; 4LUD A; 5DLQ E; 1Y7X A; 3VV0 A; 5M9O A; 4XTZ A; 3CD6 T; 3CCR T; 5CKH A; 4A4K A; 2XDB A; 2DKG A; 5KYX B; 1D1B A; 2X4W A; 1MMA A; 1H3H A; 1I1J A; 3VRZ A; 1G83 A; 2RQV A; 2VAS A; 2FVU A; 1BK2 A; 2FRW A; 4FIB A; 2VYT A; 3L2U A; 2K3X A; 3EAE A; 2IIM A; 5IN1 A; 1P92 A; 2GTO A; 5D6W A; 2DE0 X; 2CP6 A; 2CT3 A; 1VIF A; 1C6V X; 1M8V A; 4BI4 A; 5DM7 R; 3INZ A; 3ULR B; 5FRN A; 1E6H A; 4O6J A; 1YJ9 A; 1N9S A; 3X26 B; 2EYZ A; 2VGM A; 3MP1 A; 1ZLM A; 2AZS A; 1BBZ A; 3GLX A; 3ER0 A; 2LT1 A; 1D1C A; 2AZV A; 5LJ5 f; 1VQ7 T; 4B6M A; 4M7D F; 3JCM e; 2NWM A; 3NGP A; 2QQS A; 1ZUU A; 5GAN 2; 3CCJ T; 3OYF A; 3CCM T; 2RQW A; 3FJP A; 3PT9 A; 1E7O A; 2MCN A; 1VQ8 Q; 4M7A A; 1OU8 A; 2CP7 A; 1Q86 C; 4E6R A; 3VS4 A; 4II1 A; 3I56 A; 2JNG A; 1N5Z A; 3OYY A; 1WJR A; 2CP2 A; 2BKD N; 4C5I A; 3HRT A; 2W10 A; 2RI2 A; 9ATC B; 1K73 R; 4M75 B; 2X51 A; 2DZ9 A; 4XTW A; 5GMK j; 4Q5W A; 1VQ5 T; 1UGQ B; 2AIR B; 1OPL A; 4J83 A; 2E6N A; 1FX7 A; 4BI3 A; 3DB3 A; 1QKX A; 1Q81 U; 2Y90 A; 4CC7 A; 4JPB W; 1AZE A; 4FL6 A; 4HCC A; 2DNU A; 3OBY A; 1UE9 A; 1GCQ C; 2QQR A; 1WHM A; 2L2P A; 2JOY A; 1N8R U; 2FG0 A; 2F5T X; 1V29 B; 2DVJ A; 1I0C A; 4F7U F; 1WXB A; 1NYG A; 1O75 A; 3NTI A; 4JJC A; 4C8Q F; 1NEB A; 1JJ2 A; 2NUT A; 3CQT A; 3QKJ A; 4D8D A; 2K4Y A; 1YHQ T; 3QXE B; 3FC3 A; 4LDU A; 4ZGJ B; 4PFZ A; 5GMK h; 2E12 A; 1M2O A; 1S72 Q; 5KCO A; 3WXM B; 1X69 A; 1W70 A; 4D8K A; 3FIF A; 5GAO q; 2RB6 A; 3H0H A; 3X25 B; 3L2V A; 3JV3 A; 1PG5 B; 1ZSZ B; 2KRO A; 4GY5 A; 4ORZ A; 2ZPH B; 1HSQ A; 2CSQ A; 2EGA A; 1TSF A; 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